Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A1 F247 I0 R1
|
1496 |
299.8 |
9582018 |
97.8% |
9371213 |
149.0 |
Breseq alignment
BRESEQ :: Evidence
|
| evidence |
seq id |
position |
mutation |
freq |
annotation |
gene |
description |
| RA |
CP009273 |
1,952,575 |
T→C |
21.0% |
intergenic (‑186/+202) |
torY ← / ← cutC |
TMAO reductase III (TorYZ), cytochrome c‑type subunit/copper homeostasis protein |
|
| |
seq id |
position |
ref |
new |
freq |
score (cons/poly) |
reads |
annotation |
genes |
product |
| * | CP009273 | 1,952,575 | 0 | T | C | 21.0%
| 543.0
/ 153.5
| 250 | intergenic (‑186/+202) | torY/cutC | TMAO reductase III (TorYZ), cytochrome c‑type subunit/copper homeostasis protein |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (104/93); new base C (30/22); total (134/116) |
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 6.39e-01 |
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.85e-01 |
Only 100 of 263 total aligned reads displayed.
GTATAATTAAATATACAACGAATTAACCGCTTGCATAATTAGGCACAACACTGCCTGAAACAATCGATAAAGAATATGATTTATTACAATGTAATCATTAATTGCTAAGGAATAACCCAGTTGCTATTTAGAATATATATTTATCAGTTTTAGTAATTTAAATCCCATAATTAATGTGAATATATACAATATTTTTAGCACAACGCTATGCGCACTGTCACCCGCTCAACAGATCACGGTTATCGTTCGTTTTTTATACTGTTCAGGGATAAAAAAAGGCCCCTGTTGAAATTGCA > CP009273/1952428‑1952723
|
ttataATTAAATATACAACGAATTAACCGCTTGCATAATTAGGCACAACACTGCCTGAAACAATCGATAAAGAATATGATTTATTACAATGTAATCATTAATTGCTAAGGAATAACCCAGTTGCTATTTAGAATATATATTTATCAGtt < 1:3786570/148‑1 (MQ=255)
tataATTAAATATACAACGAATTAACCGCTTGCATAATTAGGCACAACACTGCCTGAAACAATCGATAAAGAATATGATTTATTACAATGTAATCATTAATTGCTAAGGAATAACCCAGTTGCTATTTAGAATATATATTTATCAGttt < 2:2995114/149‑1 (MQ=255)
ataATTAAATATACAACGAATTAACCGCTTGCATAATTAGGCACAACACTGCCTGAAACAATCGATAAAGAATATGATTTATTACAATGTAATCATTAATTGCTAAGGAATAACCCAGTTGCTCTTTAGAATATATATTTATCAGtttt > 1:3431112/1‑149 (MQ=255)
ataATTAAATATACAACGAATTAACCGCTTGCATAATTAGGCACAACACTGCCTGAAACAATCGATAAAGAATATGATTTATTACAATGTAATCATTAATTGCTAAGGAATAACCCAGTTGCTATTTAGAATATATATTTATCAGtttt < 1:2159421/149‑1 (MQ=255)
ataATTAAATATACAACGAATTAACCGCTTGCATAATTAGGCACAACACGGCCTGAAACAATCGATAAAGAATATGATTTATTACAATGTAATCATTAATTGCTAAGGAATAACCCAGTTGCTATTTAGAATATATATTTATCAGtttt < 2:300314/149‑1 (MQ=255)
aaTTAAATATACAACGAATTAACCGCTTGCATAATTAGGCACAACACTGCCTGAAACAATCGATAAAGAATATGATTTATTACAATGTAATCATTAATTGCTAAGGAATAACCCAGTTGCTATTTAGAATATATATTTATCAGCTTTAg > 1:563726/1‑149 (MQ=255)
aTTAAATATACAACGAATTAACCGCTTGCATAATTAGGCACAACACTGCCTGAAACAATCGATAAAGAATATGATTTATTACAATGTAATCATTAATTGCTAAGGAATAACCCAGTTGCTATTTAGAATATATATTTATCAGTTTTAGt < 2:1999586/149‑1 (MQ=255)
aTTAAATATACAACGAATTAACCGCTTGCATAATTAGGCACAACACTGCCTGAAACAATCGATAAAGAATATGATTTATTACAATGTAATCATTAATTGCTAAGGAATAACCCAGTTGCTATTTAGAATATATATTTATCAGCTTTAGt < 1:1197372/149‑1 (MQ=255)
aaaTATACAACGAATTAACCGCTTGCATAATTAGGCACAACACTGCCTGAAACAATCGATAAAGAATATGATTTATTACAATGTAATCATTAATTGCTAAGGAATAACCCAGTTGCTATTTAGCATATATATTTTTCAGTTTTAGTGAt > 2:4686972/1‑149 (MQ=255)
aaaTATACAACGAATTAACCGCTTGCATAATTAGGCACAACACTGCCTGAAACAATCGATAAAGAATATGATTTATTACAATGTAATCATTAATTGCTAAGGAATAACCCAGTTGCTATTTAGAATATATATTTATCAGCTTTAGTAAt > 2:2304843/1‑149 (MQ=255)
tataCAACGAATTAACCGCTTGCATAATTAGGCACAACACTGCCTGAAACAATCGATAAAGAATATGATTTATTACAATGTAATCATTAATTGCTAAGGAATAACCCAGTTGCTATTTAGAATATATATTTATCAGCTTTAGTAATTTa > 1:2535409/1‑149 (MQ=255)
ataCAACGAATTAACCGCTTGCATAATTAGGCACAACACTGCCTGAAACAATCGATAAAGAATATGATTTATTACAATGTAATCATTAATTGCTAAGGAATAACCCAGTTGCTATTTAGAATATATATTTATCAGTTTTAGTAATTTaa < 2:717672/149‑1 (MQ=255)
ataCAACGAATTAACCGCTTGCATAATTAGGCACAACACTGCCTGAAACAATCGATAAAGAATATGATTTATTACAATGTAATCATTAATTGCTAAGGAATAACCCAGTTGCTATTTAGAATATATATTTATCAGCTTTAGTAATTTaa > 1:253863/1‑149 (MQ=255)
taCAACGAATTAACCGCTTGCATAATTAGGCACAACACTGCCTGAAACAATCGATAAAGAATATGATTTATTACAATGTAATCATTAATTGCTAAGGAATAACCCAGTTGCTATTTAGAATATATATTTATCAGTTTTAGTAATTTaaa < 1:880285/149‑1 (MQ=255)
taCAACGAATTAACCGCTTGCATAATTAGGCACAACACTGCCTGAAACAATCGATAAAGAATATGATTTATTACAATGTAATCATTAATTGCTAAGGAATAACCCAGTTGCTATTTAGAATATATATTTATCAGTTTTAGTAATTTaaa < 1:4315556/149‑1 (MQ=255)
aaCGAATTAACCGCTTGCATAATTAGGCACAACACTGCCTGAAACAATCGATAAAGAATATGATTTATTACAATGTAATCATTAATTGCTAAGGAATAACCCAGTTGCTATTTAGAATATATATTTATCAGTTTTAGTAATTTAAATcc > 1:2826492/1‑149 (MQ=255)
aCGAATTAACCGCTTGCATAATTAGGCACAACACTGCCTGAAACAATCGATAAAGAATATGATTTATTACAATGTAATCATTAATTGCTAAGGAATAACCCAGTTGCTATTTAGAATATATATTTATCAGCTTTAGTAATTTAAATccc < 1:2461362/149‑1 (MQ=255)
gAATTAACCGCTTGCATAATTAGGCACAACACTGCCTGAAACAATCGATAAAGAATATGATTTATTACAATGTAATCATTAATTGCTAAGGAATAACCCAGTTGCTATTTAGAATATATATTTATCAGTTTTAGTAATTTAAATCCCAt > 1:4782665/1‑149 (MQ=255)
aTTAACCGCTTGCATAATTAGGCACAACACTGCCTGAAACAATCGATAAAGAATATGATTTATTACAATGTAATCATTAATTGCTAAGGAATAACCCAGTTGCTATTTAGAATATATATTTATCAGTTTTAGTAATTTAAATCCCAtaa > 2:2765399/1‑149 (MQ=255)
aaCCGCTTGCATAATTAGGCACAACACTGCCTGAAACAATCGATAAAGAATATGATTTATTACAATGTAATCATTAATTGCTAAGGAATAACCCAGTTGCTATTTAGAATATATATTTATCAGTTTTAGTAATTTAAATCCCAtaatta > 1:4670254/1‑149 (MQ=255)
aCCGCTTGCATAATTAGGCACAACACTGCCTGAAACAATCGATAAAGAATATGATTTATTACAATGTAATCATTAATTGCTAAGGAATAACCCAGTTGCTATTTAGAATATATATTTATCAGTTTTAGTAATTTAAATCACAtaattaa > 2:4170998/1‑149 (MQ=255)
gCTTGCATAATTAGGCACAACACTGCCTGAAACAATCGATAAAGAATATGATTTATTACAATGTAATCATTAATTGCTAAGGAATAACCCAGTTGCTATTTAGAATATATATTTATCAGTTTTAGTAATTTAAATCCCATAATTAAtgt < 2:2429730/149‑1 (MQ=255)
gCTTGCATAATTAGGCACAACACTGCCTGAAACAATCGATAAAGAATATGATTTATTACAATGTAATCATTAATTGCTAAGGAATAACCCAGTTGCTATTTAGAATATATATTTATCAGCTTTAGTAATTTAAATCCCATAATTAAtgt < 2:373676/149‑1 (MQ=255)
aTAATTAGGCACAACACTGCCTGAAACAATCGATAAAGAATATGATTTATTACAATGTAATCATTAATTGCTAAGGAATAACCCAGTTGCTATTTAGAATATATATTTATCAGTTTTAGTAATTTAAATCCCATAATTAATGTGAatat > 1:3331686/1‑149 (MQ=255)
tAATTAGGCACAACACTGCCTGAAACAATCGATAAAGAATATGATTTATTACAATGTAATCATTAATTGCTAAGGAATAACCCAGTTGCTATTTAGAATATATATTTATCAGTTTTAGTAATTTAAATCCCATAATTAATGTGAatata < 2:1491890/149‑1 (MQ=255)
tAATTAGGCACAACACTGCCTGAAACAATCGATAAAGAATATGATTTATTACAATGTAATCATTAATTGCTAAGGAATAACCCAGTTGCTATTTAGAATATATATTTATCAGTTTTAGTAATTTAAATCCCATAATTAATGTGAatata > 1:4471185/1‑149 (MQ=255)
tAATTAGGCACAACACTGCCTGAAACAATCGATAAAGAATATGATTTATTACAATGTAATCATTAATTGCTAAGGAATAACCCAGTTGCTATTTAGAATATATATTTATCAGTTTTAGTAATTTAAATCCCATAATTAATGTGAatata > 1:2072130/1‑149 (MQ=255)
aaTTAGGCACAACACTGCCTGAAACAATCGATAAAGAATATGATTTATTACAATGTAATCATTAATTGCTAAGGAATAACCCAGTTGCTATTTAGAATATATATTTATCAGTTTTAGTAATTTAAATCCCATAATTAATGTGAatatat > 1:487175/1‑149 (MQ=255)
aTTAGGCACAACACTGCCTGAAACAATCGATAAAGAATATGATTTATTACAATGTAATCATTAATTGCTAAGGAATAACCCAGTTGCTATTTAGAATATATATTTATCAGTTTTAGTAATTTAAATCCCATAATTAATGTGAAtatata < 2:1518065/149‑1 (MQ=255)
aTTAGGCACAACACTGCCTGAAACAATCGATAAAGAATATGATTTATTACAATGTAATCATTAATTGCTAAGGAATAACCCAGTTGCTATTTAGAATATATATTTATCAGCTTTAGTAATTTAAATCCCATAATTAATGTGAAtatata > 1:3283731/1‑149 (MQ=255)
ttAGGCACAACACTGCCTGAAACAATCGATAAAGAATATGATTTATTACAATGTAATCATTAATTGCTAAGGAATAACCCAGTTGCTATTTAGAATATATATTTATCAGTTTTAGTAATTTAAATCCCATAATTAATGTGAATATATAc > 2:3983279/1‑149 (MQ=255)
caacaCTGCCTGAAACAATCGATAAAGAATATGATTTATTACAATGTAATCATTAATTGCTAAGGAATAACCCAGTTGCTATTTAGAATATATATTTATCAGTTTTAGTAATTTAAATCCCATAATTAATGTGAATATATACAATAttt < 1:2876339/149‑1 (MQ=255)
cacTGCCTGAAACAATCGATAAAGAATATGATTTATTACAATGTAATCATTAATTGCTAAGGAATAACCCAGTTGCTATTTAGAATATATATTTATCAGTTTTAGTAATTTAAATCCCATAATTAATGTGAATATATACAATATTTTTa < 1:4087169/149‑1 (MQ=255)
acggCCTGAAACAATCGATAAAGAATATGATTTATTACAATGTAATCATTAATTGCTAAGGAATAACCCAGTTGCTATTTAGAATATATATTTATCAGTTTTAGTAATTTAAATCCCATAATTAATGTGAATATATACAATATTTTTAg < 1:959298/146‑1 (MQ=255)
tGAAACAATCGATAAAGAATATGATTTATTACAATGTAATCATTAATTGCTAAGGAATAACCCAGTTGCTATTTAGAATATATATTTATCAGCTTTAGTAATTTAAATCCCATAATTAATGTGAATATATACAATATTTTTAGCACAAc < 1:1689398/149‑1 (MQ=255)
gAAACAATCGATAAAGAATATGATTTATTACAATGTAATCATTAATTGCTAAGGAATAACCCAGTTGCTATTTAGAATATATATTTATCAGCTTTAGTAATTTAAATCCCATAATTAATGTGAATATATACAATATTTTTAGCACAACg > 1:3455158/1‑149 (MQ=255)
gAAACAATCGATAAAGAATATGATTTATTACAATGTAATCATTAATTGCTAAGGAATAACCCAGTTGCTATTTAGAATATATATTTATCAGCTTTAGTAATTTAAATCCCATAATTAATGTGAATATATACAATATTTTTAGCACAACg > 1:1065976/1‑149 (MQ=255)
aaaCAATCGATAAAGAATATGATTTATTACAATGTAATCATTAATTGCTAAGGAATAACCCAGTTGCTATTTAGAATATATATTTATCAGTTTTAGTAATTTAAATCCCATAATTAATGTGAATATATACAATATTTTTAGCACAACGc < 1:3042437/149‑1 (MQ=255)
aaCAATCGATAAAGAATATGATTTATTACAATGTAATCATTAATTGCTAAGGAATAACCCAGTTGCTATTTAGAATATATATTTATCAGTTTTAGTAATTTAAATCCCATAATTAATGTGAATATATACAATATTTTTAGCACAACGCt > 1:392828/1‑149 (MQ=255)
aaCAATCGATAAAGAATATGATTTATTACAATGTAATCATTAATTGCTAAGGAATAACCCAGTTGCTATTTAGAATATATATTTATCAGTTTTAGTAATTTAAATCCCATAATTAATGTGAATATATACAATATTTTTAGCACAACGCt > 1:2021250/1‑149 (MQ=255)
aaCAATCGATAAAGAATATGATTTATTACAATGTAATCATTAATTGCTAAGGAATAACCCAGTTGCTATTTAGAATATATATTTATCAGTTTTAGTAATTTAAATCCCATAATTAATGTGAATATATACAATATGTTTAGCACAACGCt > 2:2534972/1‑149 (MQ=255)
cAATCGATAAAGAATATGATTTATTACAATGTAATCATTAATTGCTAAGGAATAACCCAGTTGCTATTTAGAATATATATTTATCAGTTTTAGTAATTTAAATCCCATAATTAATGTGAATATATACAATATTTTTAGCACAACGCTAt < 1:2691536/149‑1 (MQ=255)
tAAAGAATATGATTTATTACAATGTAATCATTAATTGCTAAGGAATAACCCAGTTGCTATTTAGAATATATATTTATCAGCTTTAGTAATTTAAATCCCATAATTAATGTGAATATATACAATATTTTTAGCACAACGCTATGCGCACt > 1:4745833/1‑149 (MQ=255)
aaGAATATGATTTATTACAATGTAATCATTAATTGCTAAGGAATAACCCAGTTGCTATTTAGAATATATATTTATCAGTTTTAGTAATTTAAATCCCATAATTAATGTGAATATATACAATATTTTTAGCACAACGCTATGCGCACTGt > 1:3507231/1‑149 (MQ=255)
aaTATGATTTATTACAATGTAATCATTAATTGCTAAGGAATAACCCAGTTGCTATTTAGAATATATATTTATCAGTTTTAGTAATTTAAATCCCATAATTAATGTGAATATATACAATATTTTTAGCACAACGCTATGCGCACTGTCAc < 2:882248/149‑1 (MQ=255)
aaTATGATTTATTACAATGTAATCATTAATTGCTAAGGAATAACCCAGTTGCTATTTAGAATATATATTTATCAGTTTTAGTAATTTAAATCCCATAATTAATGTGAATATATACAATATTTTTAGCACAACGCTATGCGCACTGTCAc < 1:493934/149‑1 (MQ=255)
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tGATTTATTACAATGTAATCATTAATTGCTAAGGAATAACCCAGTTGCTATTTAGAATATATATTTATCAGCTTTAGTAATTTAAATCCCATAATTAATGTGAATATATACAATATTTTTAGCACAACGCTATGCGCACTGTCACCCGc < 1:437713/149‑1 (MQ=255)
gATTTATTACAATGTAATCATTAATTGCTAAGGAATAACCCAGTTGCTATTTAGAATATATATTTATCAGCTTTAGTAATTTAAATCCCATAATTAATGTGAATATATACAATATTTTTATCTCAACGCTATGCGCACTGTCACCCGCt > 2:4748393/1‑149 (MQ=255)
gATTTATTACAATGTAATCATTAATTGCTAAGGAATAACCCAGTTGCTATTTAGAATATATATTTATCAGCTTTAGTAATTTAAATCCCATAATTAATGTGAATATATACAATATTTTTAGCACAACGCTATGCGCACTGTCACCCGCt > 1:1870255/1‑149 (MQ=255)
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ttattaCAATGTAATCATTAATTGCTAAGGAATAACCCAGTTGCTATTTAGAATATATATTTATCAGTTTTAGTAATTTAAATCCCATAATTAATGTGAATATATACAATATTTTTAGCACAACGCTATGCGCACTGTCACCCGCTCaa > 1:300453/1‑149 (MQ=255)
tattaCAATGTAATCATTAATTGCTAAGGAATAACCCAGTTGCTATTTAGAATATATATTTATCAGCTTTAGTAATTTAAATCCCATAATTAATGTGAATATATACAATATTTTTAGCACAACGCTATGCGCACTGTCACCCGCTCAAc < 2:58476/149‑1 (MQ=255)
attaCAATGTAATCATTAATTGCTAAGGAATAACCCAGTTGCTATTTAGAATATATATTTATCATCTTTAGTAATTTAAATCCCATAATTAATGTGAATATATACAATATTTTTAGCACAACGCTATGCGCACTGTCACCCGCTCAACa < 1:922010/149‑1 (MQ=255)
attaCAATGTAATCATTAATTGCTAAGGAATAACCCAGTTGCTATTTAGAATATATATTTATCAGTTTTAGTAATTTAAATCCCATAATTAATGTGAATATATACAATATTTTTAGCACAACGCTATGCGCACTGTCACCCGCTCAACa > 2:1922408/1‑149 (MQ=255)
aCAATGTAATCATTAATTGCTAAGGAATAACCCAGTTGCTATTTAGAATATATATTTATCAGTTTTAGTAATTTAAATCCCATAATTAATGTGAATATATACAATATTTTTAGCACAACGCTATGCGCACTGTCACCCGCTCAACAGAt > 1:442809/1‑149 (MQ=255)
aCAATGTAATCATTAATTGCTAAGGAATAACCCAGTTGCTATTTAGAATATATATTTATCAGTTTTAGTAATTTAAATCCCATAATTAATGTGAATATATACAATATTTTTAGCACAACGCTATGCGCACTGTCACCCGCTCAACAGAt > 2:2932470/1‑149 (MQ=255)
aTGTAATCATTAATTGCTAAGGAATAACCCAGTTGCTATTTAGAATATATATTTATCAGCTTTAGTAATTTAAATCCCATAATTAATGTGAATATATACAATATTTTTAGCACAACGCTATGCGCACTGTCACCCGCTCAACAGATCAc < 2:465264/149‑1 (MQ=255)
tAATCATTAATTGCTAAGGAATAACCCAGTTGCTATTTAGAATATATATTTATCAGTTTTAGTAATTTAAATCCCATAATTAATGTGAATATATACAATATTTTTAGCACAACGCTATGCGCACTGTCACCCGCTCAACAGATCACGGt > 2:1077337/1‑149 (MQ=255)
aTCATTAATTGCTAAGGAATAACCCAGTTGCTATTTAGAATATATATTTATCAGCTTTAGTAATTTAAATCCCATAATTAATGTGAATATATACAATATTTTTAGCACAACGCTATGCGCACTGTCACCCGCTCAACAGATCACGGTTa < 2:1771239/149‑1 (MQ=255)
tCATTAATTGCTAAGGAATAACCCAGTTGCTATTTAGAATATATATTTATCAGTTTTAGTAATTTAAATCCCATAATTAATGTGAATATATACAATATTTTTAGCACAACGCTATGCGCACTGTCACCCGCTCAACAGATCACGGTTAt < 1:3913212/149‑1 (MQ=255)
cATTAATTGCTAAGGAATAACCCAGTTGCTATTTAGAATATATATTTATCAGTTTTAGTAATTTAAATCCCATAATTAATGTGAATATATACAATATTTTTAGCACAACGCTATGCGCACTGTCACCCGCTCAACAGATCACGGTTAtc > 2:2599590/1‑149 (MQ=255)
cATTAATTGCTAAGGAATAACCCAGTTGCTATTTAGAATATATATTTATCAGTTTTAGTAATTTAAATCCCATAATTAATGTGAATATATACAATATTTTTAGCACAACGCTATGCGCACTGTCACCCGCTCAACAGATCACGGTTAtc < 1:2939539/149‑1 (MQ=255)
aaTTGCTAAGGAATAACCCAGTTGCTATTTAGAATATATATTTATCAGTTTTAGTAATTTAAATCCCATAATTAATGTGAATATATACAATATTTTTAGCACAACGCTATGCGCACTGTCACCCGCTCAACAGATCACGGTTAtcgttc > 2:3602154/1‑149 (MQ=255)
aTTGCTAAGGAATAACCCAGTTGCTATTTAGAATATATATTTATCAGTTTTAGTAATTTAAATCCCATAATTAATGTGAATATATACAATATTTTTAGCACAACGCTATGCGCACTGTCACCCGCTCAACAGATCACGGTTAtcgttcg > 1:2747709/1‑149 (MQ=255)
aTTGCTAAGGAATAACCCAGTTGCTATTTAGAATATATATTTATCAGTTTTAGTAATTTAAATCCCATAATTAATGTGAATATATACAATATTTTTAGCACAACGCTATGCGCACTGTCACCCGCTCAACAGATCACGGTTAtcgttcg > 1:1741991/1‑149 (MQ=255)
aTTGCTAAGGAATAACCCAGTTGCTATTTAGAATATATATTTATCAGTTTTAGTAATTTAAATCCCATAATTAATGTGAATATATACAATATTTTTAGCACAACGCTATGCGCACTGTCACCCGCTCAACAGATCACGGTTAtcgttcg > 1:370164/1‑149 (MQ=255)
ttGCTAAGGAATAACCCAGTTGCTATTTAGAATATATATTTATCAGTTTTAGTAATTTAAATCCCATAATTAATGTGAATATATACAATATTTTTAGCACAACGCTATGCGCACTGTCACCCGCTCAACAGATCACGGTTAtcgttcgt > 1:4612251/1‑149 (MQ=255)
ttGCTAAGGAATAACCCAGTTGCTATTTAGAATATATATTTATCAGTTTTAGTAATTTAAATCCCATAATTAATGTGAATATATACAATATTTTTAGCACAACGCTATGCGCACTGTCACCCGCTCAACAGATCACGGTTAtcgttcgt < 2:4044720/149‑1 (MQ=255)
ttGCTAAGGAATAACCCAGTTGCTATTTAGAATATATATTTATCAGCTTTAGTAATTTAAATCCCATAATTAATGTGAATATATACAATATTTTTAGCACAACGCTATGCGCACTGTCACCCGCTCAACAGATCACGGTTAtcgttcgt > 2:2382845/1‑149 (MQ=255)
tGCTAAGGAATAACCCAGTTGCTATTTAGAATATATATTTATCAGTTTTAGTAATTTAAATCCCATAATTAATGTGAATATATACAATATTTTTAGCACAACGCTATGCGCACTGTCACCCGCTCAACAGATCACGGTTATcgttcgtt > 2:3198281/1‑149 (MQ=255)
aaGGAATAACCCAGTTGCTATTTAGAATATATATTTATCAGTTTTAGTAATTTAAATCCCATAATTAATGTGAATATATACAATATTTTTAGCACAACGCTATGCGCACTGTCACCCGCTCAACAGATCACGGTTATCGTTCGtttttt < 2:3402487/149‑1 (MQ=255)
ggAATAACCCAGTTGCTATTTAGAATATATATTTATCAGTTTTAGTAATTTAAATCCCATAATTAATGTGAATATATACAATATTTTTAGCACAACGCTATGCGCACTGTCACCCGCTCAACAGATCACGGTTATCGTTCGTTTTTtat < 2:2175907/149‑1 (MQ=255)
ggAATAACCCAGTTGCTATTTAGAATATATATTTATCAGTTTTAGTAATTTAAATCCCATAATTAATGTGAATATATACAATATTTTTAGCACAACGCTATGCGCACTGTCACCCGCTCAACAGATCACGGTTATCGTTCGTTTTTtat < 2:208073/149‑1 (MQ=255)
ggAATAACCCAGTTGCTATTTAGAATATATATTTATCAGTTTTAGTAATTTAAATCCCATAATTAATGTGAATATATACAATATTTTTAGCACAACGCTATGCGCACTGTCACCCGCTCAACAGATCACGGTTATCGTTCGTTTTTtat < 1:4220457/149‑1 (MQ=255)
ggAATAACCCAGTTGCTATTTAGAATATATATTTATCAGTTTTAGTAATTTAAATCCCATAATTAATGTGAATATATACAATATTTTTAGCACAACGCTATGCGCACTGTCACCCGCTCAACAGATCACGGTTATCGTTCGTTTTTtat < 2:2705363/149‑1 (MQ=255)
ggAATAACCCAGTTGCTATTTAGAATATATATTTATCAGTTTTAGTAATTTAAATCCCATAATTAATGTGAATATATACAATATTTTTAGCACAACGCTATGCGCACTGTCACCCGCTCAACAGATCACGGTTATCGTTCGTTTTTtat < 2:3331053/149‑1 (MQ=255)
gAATAACCCAGTTGCTATTTAGAATATATATTTATCAGTTTTAGTAATTTAAATCCCATAATTAATGTGAATATATACAATATTTTTAGCACAACGCTATGCGCACTGTCACCCGCTCAACAGATCACGGTTATCGTTCGTTTTTtata < 1:1483928/149‑1 (MQ=255)
aaTAACCCAGTTGCTATTTAGAATATATATTTATCAGCTTTAGTAATTTAAATCCCATAATTAATGTGAATATATACAATATTTTTAGCACAACGCTATGCGCACTGTCACCCGCTCAACAGATCACGGTTATCGTTCGTTTTTTATAc < 2:253863/149‑1 (MQ=255)
aTAACCCAGTTGCTATTTAGAATATATATTTATCAGTTTTAGTAATTTAAATCCCATAATTAATGTGAATATATACAATATTTTTAGCACAACGCTATGCGCACTGTCACCCGCTCAACAGATCACGGTTATCGTTCGTTTTTTATACt > 1:4461635/1‑149 (MQ=255)
aCCCATTTGCTATTTAGAATATATATTTATCAGTTTTAGTAATTTAAATCCCATAATTAATGTGAATATATACAATATTTTTAGCACAACGCTATGCGCACTGTCACCCGCTCAACAGATCACGGTTATCGTTCGTTTTTTATACTGtt < 2:4545850/149‑1 (MQ=255)
cccAGTTGCTATTTAGAATATATATTTATCAGTTTTAGTAATTTAAATCCCATAATTAATGTGAATATATACAATATTTTTAGCACAACGCTATGCGCACTGTCACCCGCTCAACAGATCACGGTTATCGTTCGTTTTTTATACTGTTc > 2:434529/1‑149 (MQ=255)
cccAGTTGCTATTTAGAATATATATTTATCAGCTTTAGTAATTTAAATCCCATAATTAATGTGAATATATACAATATTTTTAGCACAACGCTATGCGCACTGTCACCCGCTCAACAGATCACGGTTATCGTTCGTTTTTTATACTGTTc < 2:2114209/149‑1 (MQ=255)
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tatTTATCAGTTTTAGTAATTTAAATCCCATAATTAATGTGAATATATACAATATTTTTAGCACAACGCTATGCGCACTGTCACCCGCTCAACAGAACACGGTTATCGTTCGTTTTTTATACTGTTCAGGGATAAAAAAAGGCCCCTGt < 1:3612525/149‑1 (MQ=255)
tttATCAGCTTTAGTAATTTAAATCCCATAATTAATGTGAATATATACAATATTTTTAGCACAACGCTATGCGCACTGTCACCCGCTCAACAGATCACGGTTATCGTTCGTTTTTTATACTGTTCAGGGATAAAAAAAGGCCCCTGTTg > 1:320197/1‑149 (MQ=255)
ttttAGTAATTTAAATCCCATAATTAATGTGAATATATACAATATTTTTAGCACAACGCTATGCGCACTGTCACCCGCTCAACAGATCACGGTTATCGTTCGTTTTTTATACTGTTCAGGGATAAAAAAAGGCCCCTGTTGAAATTGCa > 2:126343/1‑149 (MQ=255)
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GTATAATTAAATATACAACGAATTAACCGCTTGCATAATTAGGCACAACACTGCCTGAAACAATCGATAAAGAATATGATTTATTACAATGTAATCATTAATTGCTAAGGAATAACCCAGTTGCTATTTAGAATATATATTTATCAGTTTTAGTAATTTAAATCCCATAATTAATGTGAATATATACAATATTTTTAGCACAACGCTATGCGCACTGTCACCCGCTCAACAGATCACGGTTATCGTTCGTTTTTTATACTGTTCAGGGATAAAAAAAGGCCCCTGTTGAAATTGCA > CP009273/1952428‑1952723
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
GATK/CNVnator alignment
N/A
