Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A1 F247 I0 R1
|
1496 |
299.8 |
9582018 |
97.8% |
9371213 |
149.0 |
Breseq alignment
BRESEQ :: Evidence
|
| evidence |
seq id |
position |
mutation |
freq |
annotation |
gene |
description |
| RA |
CP009273 |
3,093,860 |
C→A |
28.5% |
V76V (GTG→GTT) |
ansB ← |
periplasmic L‑asparaginase 2 |
|
| |
seq id |
position |
ref |
new |
freq |
score (cons/poly) |
reads |
annotation |
genes |
product |
| * | CP009273 | 3,093,860 | 0 | C | A | 28.5%
| 626.7
/ 223.6
| 315 | V76V (GTG→GTT) | ansB | periplasmic L‑asparaginase 2 |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (112/113); new base A (44/46); total (156/159) |
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 9.01e-01 |
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.60e-01 |
Only 100 of 318 total aligned reads displayed.
CACCGTCAGGTCGAGGAAGTAAGCAGTTTCTTCCATCGTGTCGGTACCGTGGGTAATGACGAAGCCGTCGGTCTTATCGCAGTCGGTGTTAA‑TTTTTTTCGCCAGTGTCAGCCAGACATTATCGTTCATGTCCTGGGAGCCGATATTCACTACCTGCTCGCCTTTAACGTTCGCAATGTCTTTTAGTTGCGGCACCGCATTAACCAGATTTTCTACGCCAACTTTACCCACTGTGTAGTTAGATTTGGTTGCGGAGTCACCACCACCGGCAATGGTCCCGCCGGTTGCTAAAATGG > CP009273/3093713‑3094008
|
cACCGTCAGGTCGAGGAAGTAAGCAGTTTCTTCCATCGTGTCGGTACCGTGGGTAATGACGAAGCCGTCGGTCTTATCGCAGTCGGTGTTAA‑TTTTTTTCGCCAGTGTCAGCCAGACATTATCGTTCATGTCCTGGGAGCCGATATTCa > 2:628986/1‑149 (MQ=255)
aCCGTCAGGTCGAGGAAGTAAGCAGTTTCTTCCATCGTGTCGGTACCGTGGGTAATGACGAAGCCGTCGGTCTTATCGCAGTCGGTGTTAA‑TTTTTTTCGCCAGTGTCAGCCCGACATTATCGTTCATGTCCTGGGAGCCGATATTAAc > 1:853342/1‑149 (MQ=255)
ccGTCAGGTCGAGGAAGTAAGCAGTTTCTTCCATCGTGTCGGTACCGTGGGTAATGACGAAGCCGTCGGTCTTATCGCAGTCGGTGTTAA‑TTTTTTTCGCCAGTGTCAGCCAGACATTATCGTTCATGTCCTGGGAGCCGATATTCACt < 1:2114051/149‑1 (MQ=255)
ccGTCAGGTCGAGGAAGTAAGCAGTTTCTTCCATCGTGTCGGTACCGTGGGTAATGACGAAGCCGTCGGTCTTATCGCAGTCGGTGTTAA‑TTTTTTTCGCCAGTGTCAGCCAGACATTATCGTTCATGTCCTGGGAGCCGATATTAACt > 2:4481995/1‑149 (MQ=255)
tCAGGTCGAGGAAGTAAGCAGTTTCTTCCATCGTGTCGGTACCGTGGGTAATGACGAAGCCGTCGGTCTTATCGCAGTCGGTGTTAA‑TTTTTTTCGCCAGTGTCAGCCAGACATTATCGTTCATGTCCTGGGAGCCGATATTAACTAcc > 1:1126827/1‑149 (MQ=255)
tCAGGTCGAGGAAGTAAGCAGTGTCGTCCATCGTGTCGGTACCGTGGGTAATGACGAAGCCGTCGGTCTTATCGCAGTCGGTGTTAA‑TTTTTTTCGCCAGTGTCAGCCCGACATGATCGTTCATGTCCTGGGAGCCGATATTCACTAcc < 2:4012995/149‑1 (MQ=255)
aGGTCGAGGAAGTAAGCAGTTTCTTCCATCGTGTCGGTACCGTGGGTAATGACGAAGCCGTCGGTCTTATCGCAGTCGGTGTTAA‑TTTTTTTCGCCAGTGTCAGCCAGACATTATCGTTCATGTCCTGGGAGCCGATATTCACTACCTg > 2:476727/1‑149 (MQ=255)
ggTCGAGGAAGTAAGCAGTTTCTTCCATCGTGTCGGTACCGTGGGTAATGACGAAGCCGTCGGTCTTATCGCAGTCGGTGTTAA‑TTTTTTTAGCCCGTGTCAGCCAGACATTATCGTTCATGTCCTGGGAGCCGATATTCACTACCTGc > 1:814183/1‑149 (MQ=255)
gTCGAGGAAGTAAGCAGTTTCTTCCATCGTGTCGGTACCGTGGGTAATGACGAAGCCGTCGGTCTTATCGCAGTCGGTGTTAA‑TTTTTTTCGCCAGTGTCAGCCAGACATTATCGTTCATGTCCTGGGAGCCGATATTCACTACCTGCt > 1:3553832/1‑149 (MQ=255)
gTCGAGGAAGTAAGCAGTTTCTTCCATCGTGTCGGTACCGTGGGTAATGACGAAGCCGTCGGTCTTATCGCAGTCGGTGTTAA‑TTTTTTTCGCCAGTGTCAGCCAGACATTATCGTTCATGTCCTGGGAGCCGATATTCACTACCTGCt > 1:4174609/1‑149 (MQ=255)
gAGGAAGTAAGCAGTTTCTTCCATCGTGTCGGTACCGTGGGTAATGACGAAGCCGTCGGTCTTATCGCAGTCGGTGTTAATTTTTTTTCGCCAGTGTCAGCCAGACATTATCGTTCATGTCCTGGGAGCCGATATTAACTACCTGCTCg < 1:2251743/149‑1 (MQ=255)
gAGGAAGTAAGCAGTTTCTTCCATCGTGTCGGTACCGTGGGTAATGACGAAGCCGTCGGTCTTATCGCAGTCGGTGTTAA‑TTTTTTTCGCCAGTGTCAGCCAGACATTATCGTTCATGTCCTGGGAGCCGATATTCACTACCTGCTCGc > 2:1682897/1‑149 (MQ=255)
ggAAGTAAGCAGTTTCTTCCATCGTGTCGGTACCGTGGGTAATGACGAAGCCGTCGGTCTTATCGCAGTCGGTGTTAA‑TTTTTTTCGCCAGTGTCAGCCAGACATTATCGTTCATGTCCTGGGAGCCGATATTCACTACCTGCTCGCCt < 2:3749183/149‑1 (MQ=255)
ggAAGTAAGCAGTTTCTTCCATCGTGTCGGTACCGTGGGTAATGACGAAGCCGTCGGTCTTATCGCAGTCGGTGTTAA‑TTTTTTTAGCCAGTGTCAGCCAGACATTATCGTTCATGTCCTGGGAGCCGATATTCACTACCTGCTCGCCt > 1:1255477/1‑149 (MQ=255)
aaGTAAGCAGTTTCTTCCATCGTGTCGGTACCGTGGGTAATGACGAAGCCGTCGGTCTTATCGCAGTCGGTGTTAA‑TTTTTTTCGCCAGTGTCAGCCAGACATTATCGTTCATGTCCTGGGAGCCGATATTAACTACCTGCTCGCCttt < 1:4231142/149‑1 (MQ=255)
aGCAGTTTCTTCCATCGTGTCGGTACCGTGGGTAATGACGAAGCCGTCGGTCTTATCGCAGTCGGTGTTAA‑TTTTTTTCGCCAGTGTCAGCCAGACATTATCGTTCATGTCCTGGGAGCCGATATTAACTACCTGCTCGCCTTTAACGt > 2:3387352/1‑149 (MQ=255)
aGTTTCTTCCATCGTGTCGGTACCGTGGGTAATGACGAAGCCGTCGGTCTTATCGCAGTCGGTGTTAA‑TTTTTTTCGCCAGTGTCAGCCAGACATTATCGTTCATGTCCTGGGAGCCGATATTCACTACCTGCTCGCCTTTAACGTTCg < 1:593597/149‑1 (MQ=255)
ttcttcCATCGTGTCGGTACCGTGGGTAATGACGAAGCCGTCGGTCTTATCGCAGTCGGTGTTAA‑TTTTTTTCGCCAGTGTCAGCCAGACATTATCGTTCATGTCCTGGGAGCCGATATTCACTACCTGCTCGCCTTTAACGTTCGCaa < 2:1497805/149‑1 (MQ=255)
ttcttcCATCGTGTCGGTACCGTGGGTAATGACGAAGCCGTCGGTCTTATCGCAGTCGGTGTTAA‑TTTTTTTCGCCAGTGTCAGCCAGACATTATCGTTCATGTCCTGGGAGCCGATATTAACTACCTGCTCGCCTTTAACGTTCGCaa < 2:722390/149‑1 (MQ=255)
ttcttcCATCGTGTCGGTACCGTGGGTAATGACGAAGCCGTCGGTCTTATCGCAGTCGGTGTTAA‑ATTTTTTCGACAGTGTCAGCCAGACAATAAAGTTAATGTCCAGGGAGCCGATATTCACAACCAGCTCGCCAGTAAAGGTCGCaa > 1:4448530/1‑149 (MQ=255)
cttcCATCGTGTCGGTACCGTGGGTAATGACGAAGCCGTCGGTCTTATCGCAGTCGGTGTTAA‑TTTTTTTCGCCAGTGTCAGCCAGACATTATCGTTCATGTCCTGGGAGCCGATATTCACTACCTGCTCGCCTTTAACGTTCGCAATg < 2:3550012/149‑1 (MQ=255)
ttcCATCGTGTCGGTACCGTGGGTAATGACGAAGCCGTCGGTCTTATCGCAGTCGGTGTTAA‑TTTTTTTCGCCAGTGTCAGCCAGACATTATCGTTCATGTCCTGGGAGCCGATATTCACTACCTGCTCGCCTTTAACGTTCGCAATGt < 1:197722/149‑1 (MQ=255)
ttcCATCGTGTCGGTACCGTGGGTAATGACGAAGCCGTCGGTCTTATCGCAGTCGGTGTTAA‑TTTTTTTCGCCAGTGTCAGCCAGACATTATCGTTCATGTCCTGGGAGCCGATATTCACTACCTGCTCGCCTTTAACGTGCGCAATGt > 2:3009145/1‑149 (MQ=255)
ccATCGTGTCGGTACCGTGGGTAATGACGAAGCCGTCGGTCTTATCGCAGTCGGTGTTAA‑TTTTTTTCGCCAGTGTCAGCCAGACATTATCGTTCATGTCCTGGGAGCCGATATTCACTACCTGCTCGCCTTTAACGTTCGCAATGTCt > 1:1870911/1‑149 (MQ=255)
ccATCGTGTCGGTACCGTGGGTAATGACGAAGCCGTCGGTCTTATCGCAGTCGGTGTTAA‑TTTTTTTCGCCAGTGTCAGCCAGACATTATCGTTCATGTCCTGGGAGCCGATATTAACTACCTGCTCGCCTTTAACGTTCGCAATGTCt < 1:3989009/149‑1 (MQ=255)
cATCGTGTCGGTACCGTGGGTAATGACGAAGCCGTCGGTCTTATCGCAGTCGGTGTTAA‑TTTTTTTCGCCAGTGTCAGCCAGACATTATCGTTCATGTCCTGGGAGCCGATATTCACTACCTGCTCGCCTTTAACGTTCGCAATGTCtt > 2:84924/1‑149 (MQ=255)
cATCGTGTCGGTACCGTGGGTAATGACGAAGCCGTCGGTCTTATCGCAGTCGGTGTTAA‑TTTTTTTCGCCAGTGTCAGCCAGACATTATCGTTCATGTCCTGGGAGCCGATATTAACTACCTGCTCGCCTTTAACGTTCGCAATGTCtt < 1:996382/149‑1 (MQ=255)
tCGTGTCGGTACCGTGGGTAATGACGAAGCCGTCGGTCTTATCGCAGTCGGTGTAAA‑TTTTTTTCGCCAGTGTCAGCCAGACATTATCGTTCATGTCCTGGGAGCCGATATTCACTACCTGCTCGCCTTTAACGTTCGCAATGTCtttt < 2:4289458/149‑1 (MQ=255)
tCGTGTCGGTACCGTGGGTAATGAAGAAGCCGTCGGTCTTATCGCAGTCGGTGTTAA‑TTTTTTTCGCCAGTGTCAGCCAGACATTATCGTTCATGTCCTGGGAGCCGATATTCACTACCTGCTCGCCTTTAACGTTCGCAATGTCtttt < 2:4063625/149‑1 (MQ=255)
gtgtCGGTACCGTGGGTAATGACGAAGCCGTCGGTCTTATCGCAGTCGGTGTTAA‑TTTTTTTCGCCAGTGTCAGCCAGACATTATCGTTCATGTCCTGGGAGCCGATATTAACTACCAGCTCGCCTTTAACGTTCGCAATGTCTTTTAg > 1:2999754/1‑149 (MQ=255)
tgtCGGTACCGTGGGTAATGACGAAGCCGTCGGTCTTATCGCAGTCGGTGTTAA‑TTTTTTTCGCCAGTGTCAGCCAGACATTATCGTTCATGTCCTGGGAGCCGATATTCACTACCTGCTCGCCTTTAACGTTCGCAATGTCTTTTAGt < 1:4346789/149‑1 (MQ=255)
gtCGGTACCGTGGGTAATGACGAAGCCGTCGGTCTTATCGCAGTCGGTGTTAA‑TTTTTTTCGCCAGTGTCAGCCAGACATTATCGTTCATGTCCTGGGAGCCGATATTCACTACCTGCTCGCCTTTAACGTTCGCAATGTCTTTTAGtt > 1:2127396/1‑149 (MQ=255)
gTACCGTGGGTAATGACGAAGCCGTCGGTCTTATCGCAGTCGGTGTTAA‑TTTTTTTCGCCAGTGTCAGCCAGACATTATCGTTCATGTCCTGGGAGCCGATATTCACTACCTGCTCGCCTTTAACGTTCGCAATGTCTTTTAGTTGCgg < 2:4101539/149‑1 (MQ=255)
aCCGTGGGTAATGACGAAGCCGTCGGTCTTATCGCAGTCGGTGTTAA‑TTTTTTTCGCCAGTGTCAGCCAGACATTATCGTTCCTGTCCTGGGAGCCGATATTCACTACCTGCTCGCCTTTAACGTTCGCAATGTCTTTTAGTTGCGGCa > 2:3060990/1‑149 (MQ=255)
ggTAATGACGAAGCCGTTGGTCTTATCGCAGTCGGTGTTAA‑TTTTTTTCGCCAGTGTCAGCCAGACATTATCGTTCATGTCCTGGGAGCCGATATTAACTACCTGCTCGCCTTTAACGTTCGCAATGTCTTTTAGTTGCGGCACCGCAt > 2:2812268/1‑149 (MQ=255)
ggTAATGACGAAGCCGTCGGTCTTATCGCAGTCGGTGTTAA‑TTTTTTTCGCCAGTGTCAGCCAGACATTATCGTTCATGTCCTGGGAGCCGATATTCACTACCTGCTCGCCTTTAACGTTCGCAATGTCTTTTAGTTGCGGCACCGCAt < 2:178340/149‑1 (MQ=255)
ggTAATGACGAAGCCGTCGGTCTTATCGCAGTCGGTGTTAA‑TTTTTTTCGCCAGTGTCAGCCAGACATTATCGTTCATGTCCTGGGAGCCGATATTCACTACCTGCTCGCCTTTAACGTTCGCAATGTCTTTTAGTTGCGGCACCGCAt > 1:2330527/1‑149 (MQ=255)
ggTAATGACGAAGCCGTCGGTCTTATCGCAGTCGGTGTTAA‑TTTTTTTCGCCAGTGTCAGCCAGACATTATCGTTCATGTCCTGGGAGCCGATATTAACTACCTGCTCGCCTTTAACGTTCGCAATGTCTTTTAGTTGCGGCACCGCAt < 2:961158/149‑1 (MQ=255)
tGACGACGCCGTCGGTCTTATCGCAGTCGGTGTTAA‑TTTTTTTCGCCAGTGTCAGCCAGACATTATCGTTCATGTCCTGGGAGCCGATATTCACTACCTGCTCGCCTTTAACGTTCGCAATGTCTTTTAGTTGCGGCACCGCATTAAcc < 2:4580975/149‑1 (MQ=255)
tGACGAAGCCGTCGGTCTTATCGCAGTCGGTGTTAA‑TTTTTTTCGCCAGTGTCAGCCAGACATTATCGTTCATGTCCTGGGAGCCGATATTCACTACCTGCTCGCCTTTAACGTTCGCAATGTCTTTTAGTTTCGGCACCGCATTAAcc > 1:2469729/1‑149 (MQ=255)
gACGAAGCCGTCGGTCTTATCGCAGTCGGTGTTAA‑TTTTTTTCGCCAGTGTCAGCCAGACATTATCGTTCATGTCCTGGGAGCCGATATTAACTACCTGCTCGCCTTTAACGTTCGCAATGTCTTTTAGTTGCGGCACCGCATTAACCa < 1:3675015/149‑1 (MQ=255)
aCGAAGCCGTCGGTCTTATCGCAGTCGGTGTTAA‑TTTTTTTCGCCAGTGTCAGCCAGACATTATCGTTCATGTCCTGGGAGCCGATATTAACTACCTGCTCGCCTTTAACGTTCGCAATGTCTTTTAGTTGCGGCACCGCATTAACCAg > 1:1003827/1‑149 (MQ=255)
cGAAGCCGTCGGTCTTATCGCAGTCGGTGTTAA‑TTTTTTTCGCCAGTGTCAGCCAGACATTATCGTTCATGTCCTGGGAGCCGATATTAACTACCTGCTCGCCTTTAACGTTCGCAATGTCTTTTAGTTGCGGCACCGCATTAACCAGa < 2:1458515/149‑1 (MQ=255)
gAAGCCGTCGGTCTTATCGCAGTCGGTGTTAA‑TTTTTTTCGCCAGTGTCAGCCAGACATTATCGTTCATGTCCTGGGAGCCGATATTAACTACCTGCTCGCCTTTAACGTTCGCAATGTCTTTTAGTTGCGGCACCGCATTAACCAGAt < 2:556772/149‑1 (MQ=255)
aaGCCGTCGGTCTTATCGCAGTCGGTGTTAA‑TTTTTTTCGCCAGTGTCAGCCAGACATTATCGTTCATGTCCTGGGAGCCGATATTCACTACCTGCTCGCCTTTAACGTTCGCAATGTCTTTTAGTTGCGGCACCGCATTAACCAGAtt < 1:4561910/149‑1 (MQ=255)
aaGCCGTCGGTCTTATCGCAGTCGGTGTTAA‑TTTTTTTCGCCAGTGTCAGCCAGACATTATCGTTCATGTCCTGGGAGCCGATATTCACTACCTGCTCGCCTTTAACGTTCGCAATGTCTTTTAGTTGCGGCACCGCATTAACCAGAtt < 1:522046/149‑1 (MQ=255)
aaGCCGTCGGTCTTATCGCAGTCGGTGTTAA‑TTTTTTTCGCCAGTGTCAGCCAGACATTATCGTTCATGTCCTGGGAGCCGATATTCACTACCTGCTCGCCTTTAACGTTAGCAATGTCTTTTAGTTGCGGCACCGCATTAACCAGAtt < 1:1042896/149‑1 (MQ=255)
gCCGTCGGTCTTATCGCAGTCGGTGTTAA‑TTTTTTTCGCCAGTGTCAGCCAGACATTATCGTTCATGTCCTGGGAGCCGATATTAACTACCTGCTCGCCTTTAACGTTCGCAATGTCTTTTAGTTGCGGCACCGCATTAACCAGAtttt < 1:1996939/149‑1 (MQ=255)
gCCGTCGGTCTTATCGCAGTCGGTGTTAA‑TTTTTTTCGACAGTGTCAGACAGACATTATCGTTCATGTCCTGGGAGCCGATATTCACTACCTGCTCGCCTTTAAAGTTCGCAATGTCTTTTAGTTGCGGCACCGCATTAACCAGAtttt < 1:3645333/149‑1 (MQ=255)
tCGGTCTTATCGCAGTCGGTGTTAA‑TTTTTTTCGCCAGTGTCAGCCAGACATTATCGTTCATGTCCTGGGAGCCGATATTCACTACCTGCTCGCCTTTAACGTTCGCAATGTCTTTTAGTTGCGGCACCGCATTAACCAGATTTTCTAc < 1:2578375/149‑1 (MQ=255)
cGGTCTTATCGCAGTCGGTGTTAA‑TTTTTTTCGCCAGTGTCAGCCAGACATTATCGTTCATGTCCTGGGAGCCGATATTAACTACCTGCTCGCCTTTAACGTTCGCAATGTCTTTTAGTTGCGGCACCGCATTAACCAGATTTTCTACg > 2:2203938/1‑149 (MQ=255)
ggTCTTATCGCAGTCGGTGTTAA‑TTTTTTTCGCCAGTGTCAGCCAGACATTATCGTTCATGTCCTGGGAGCCGATATTAACTACCTGCTCGCCTTTAACGTTCGCAATGTCTTTTAGTTGCGGCACCGCATTAACCAGATTTTCTACGc > 2:2873611/1‑149 (MQ=255)
tCTTATCGCAGTCGGTGTTAA‑TTTTTTTCGCCAGTGTCAGCCAGACATTATCGTTCATGTCCTGGGAGCCGATATTAACTACCTGCTCGCCTTTAACGTTCGCAATGTCTTTTAGTTGCGGCACCGCATTAACCAGATTTTCTACGCCa < 1:3922791/149‑1 (MQ=255)
cTTATCGCAGTCGGTGTTAA‑TTTTTTTCGCCAGTGTCAGCCAGACATTATCGTTCATGTCCTGGGAGCCGATATTCACTACCTGCTCGCCTTTAACGTTCGCAATGTCTTTTAGTTGCGGCACCGCATTAACCAGATTTTCTACGCCaa > 2:209004/1‑149 (MQ=255)
gCAGTCGGTGTTAA‑TTTTTTTCGCCAGTGTCAGCCAGACATTATCGTTCATGTCCTGGGAGCCGATATTCACTACCTGCTCGCCTTTAACGTTCGCAATGTCTTTTAGTTGCGGCACCGCATTAACCAGATTTTCTACGCCAACTTTAc > 2:2052571/1‑149 (MQ=255)
aGTCGGTGTTAA‑TTTTTTTCGCCAGTGTCAGCCAGACATTATCGTTCATGTCCTGGGAGCCGATATTCACTACCTGCTCGCCTTTAACGTTCGCAATGTCTTTTAGTTGCGGCACCGCATTAACCAGATTTTCTACGCCAACTTTAccc > 2:1274618/1‑149 (MQ=255)
aGTCGGTGTTAA‑TTTTTTTCGCCAGTGTCAGCCAGACATTATCGTTCATGTCCTGGGAGCCGATATTCACTACCTGCTCGCCTTTAACGTTCGCAATGTCTTTTAGTTGCGGCACCGCATTAACCAGATTTTCTACGCCAACTTTAccc > 2:3284563/1‑149 (MQ=255)
gTCGGTGTTAA‑TTTTTTTCGCCAGTGTCAGCCAGACATTATCGTTCATGTCCTGGGAGCCGATATTCACTACCTGCTCGCCTTTAACGTTCGCAATGTCTTTTAGTTGCGGCACCGCATTAACCAGATTTTCTACGCCAACTTTACCCa < 2:2620/149‑1 (MQ=255)
gTCGGTGTTAA‑TTTTTTTCGCCAGTGTCAGCCAGACATTATCGTTCATGTCCTGGGAGCCGATATTAACTACCTGCTCGCCTTTAACGTTCGCAATGTCTTTTAGTTGCGGCACCGCATTAACCAGATTTTCTACGCCAACTTTACCCa < 1:4354313/149‑1 (MQ=255)
tCGGTGTTAA‑TTTTTTTCGCCAGTGTCAGCCAGACATTATCGTTCATGTCCTGGGAGCCGATATTCACTACCTGCTCGCCTTTAACGTTCGCAATGTCTTTTAGTTGCGGCACCGCATTAACCAGATTTTCTACGCCAACTTTACCCAc > 2:3561544/1‑149 (MQ=255)
tCGGTGTTAA‑TTTTTTTCGCCAGTGTCAGCCAGACATTATCGTTCATGTCCTGGGAGCCGATATTCACTACCTGCTCGCCTTTAACGTTCGCAATGTCTTTTAGTTGCGGCACCGCATTAACCAGATTTTCTACGCCAACTTTACCCAc > 1:752878/1‑149 (MQ=255)
ggTGTTAA‑TTTTTTTCGCCAGTGTCAGCCAGACATTATCGTTCATGTCCTGGGAGCCGATATTCACTACCTGCTCGCCTTTAACGTTCGCAATGTCTTTTAGTTGCGGCACCGCATTAACCAGATTTTCTACGCCAACTTTACCCACtg > 2:4051475/1‑149 (MQ=255)
gtTAA‑TTTTTTTCGCCAGTGTCAGCCAGACATTATCGTTCATGTCCTGGGAGCCGATATTAACTACCTGCTCGCCTTTAACGTTCGCAATGTCTTTTAGTTGCGGCACCGCATTAACCAGATTTTCTACGCCAACTTTACCCACTgtgt < 1:3422550/149‑1 (MQ=255)
a‑TTTTTTTCGCCAGTGTCAGCCAGACATTATCGTTCATGTCCTGGGAGCCGATATTCACTACCTGCTCGCCTTTAACGTTCGCAATGTCTTTTAGTTGCGGCACCGCATTAACCAGATTTTCTACGCCAACTTTACCCACTGTGTAGtt < 1:730035/149‑1 (MQ=255)
a‑TTTTTTTCGCCAGTGTCAGCCAGACATTATCGTTCATGTCCTGGGAGCCGATATTCACTACCTGCTCGCCTTTAACGTTCGCAATGTCTTTTAGTTGCGGCACCGCATTAACCAGATTTTCTACGCCAACTTTACCCACTGTGTAGtt < 1:3097668/149‑1 (MQ=255)
ttttttCGCCAGTGTCAGCCAGACATTATCGTTCATGTCCTGGGAGCCGATATTCACTACCTGCTCGCCTTTAACGTTCGCAATGTCTTTTAGTTGCGGCACCGCATTAACCAGATTTTCTACGCCAACTTTACCCACTGTGTAGTTAg > 2:790478/1‑149 (MQ=255)
ttttCGCCAGTGTCAGCCAGACATTATCGTTCATGTCCTGGGAGCCGATATTAACTACCTGCTCGCCTTTAACGTTCGCAATGTCTTTTAGTTGCGGCACCGCATTAACCAGATTTTCTACGCCAACTTTACCCACTGTGTAGTTAGAt > 2:2738683/1‑149 (MQ=255)
tttCGCCAGTGTCAGCCAGACATTATCGTTCATGTCCTGGGAGCCGATATTCACTACCTGCTCGCCTTTAACGTTCGCAATGTCTTTTAGTTGCGGCACCGCATTAACCAGATTTTCTACGCCAACTTTACCCACTGTGTAGTTAGAtt < 2:2523948/149‑1 (MQ=255)
gCCAGTGTCAGCCAGACATTATCGTTCATGTCCTGGGAGCCGATATTCACTACCTGCTCGCCTTTAACGTTCGCAATGTCTTTTAGTTGCGGCACCGCATTAACCAGATTTTCTACGCCAACTTTACCCACTGTGTAGTTAGATTTGGt < 1:1682897/149‑1 (MQ=255)
gtCAGCCAGACATTATCGTTCATGTCCTGGGAGCCGATATTAACTACCTGCTCGCCTTTAACGTTCGCAATGTCTTTTAGTTGCGGCACCGCATTAACCAGATTTTCTACGCCAACTTTACCCACTGTGTAGTTAGATTTGGTTGCGGa > 2:4339641/1‑149 (MQ=255)
tCAGCCAGACATTATCGTTCATGTCCTGGGAGCCGATATTCACTACCTGCTCGCCTTTAACGTTCGCAATGTCTTTTAGTTGCGGCACCGCATTAACCAGATTTTCTACGCCAACTTTACCCACTGTGTAGTTAGATTTGGTTGCGGAg > 2:812360/1‑149 (MQ=255)
cAGCCAGACATTATCGTTCATGTCCTGGGAGCCGATATTCACTACCTGCTCGCCTTTAACGTTCGCAATGTCTTTTAGTTGCGGCACCGCATTAACCAGATTTTCTACGCCAACTTTACCCACTGTGTAGTTAGATTTGGTTGCGGAGt < 1:2625649/149‑1 (MQ=255)
gCCAGACATTATCGTTCATGTCCTGGGAGCCGATATTCACTACCTGCTCGCCTTTAACGTTCGCAATGTCTTTTAGTTGCGGCACCGCATTAACCAGATTTTCTACGCCAACTTTACCCACTGTGTAGTTAGATTTGGTTGCGGAGTca > 2:488511/1‑149 (MQ=255)
ccAGACATTATCGTTCATGTCCTGGGAGCCGATATTCACTACCTGCTCGCCTTTAACGTTCGCAATGTCTTTTAGTTGCGGCACCGCATTAACCAGATTTTCTACGCCAACTTTACCCACTGTGTAGTTAGATTTGGTTGCGGAGTcac < 1:2865208/149‑1 (MQ=255)
ccAGACATTATCGTTCATGTCCTGGGAGCCGATATTCACTACCTGCTCGCCTTTAACGTTAGCAATGTCTTTTAGTTGCGGCACCGCATTAACCAGATTTTCTACGCCAACTTTACCCACTGTGTAGTTAGATTTGGTTGCGTAGTcac < 1:471509/149‑1 (MQ=255)
aGACATTATCGTTCATGTCCTGGGAGCCGATATTCACTACCTGCTCGCCTTTAACGTTCGCAATGTCTTTTAGTTGCGGCACCGCATTAACCAGATTTTCTACGCCAACTTTACCCACTGTGTAGTTAGATTTGGTTGCGGAGTcacca > 2:1047897/1‑149 (MQ=255)
aGACATTATCGTTCATGTCCTGGGAGCCGATATTCACTACCTGCTCGCCTTTAACGTTCGCAATGTCTTTTAGTTGCGGCACCGCATTAACCAGATTTTCTACGCCAACTTTACCCACTGTGTAGTTAGATTTGGTTGCGGAGTcacca < 2:1353884/149‑1 (MQ=255)
gACATTATCGTTCATGTCCTGGGAGCCGATATTCACTACCTGCTCGCCTTTAACGTTCGCAATGTCTTTTAGTTGCGGCACCGCATTAACCAGATTTTCTACGCCAACTTTACCCACTGTGTAGTTAGATTTGGTTGCGGAGTcaccac > 1:3721797/1‑149 (MQ=255)
aCATTATCGTTCATGTCCTGGGAGCCGATATTCACTACCTGCTCGCCTTTAACGTTCGCAATGTCTTTTAGTTGCGGCACCGCATTAACCAGATTTTCTACGCCAACTTTACCCACTGTGTAGTTAGATTTGGTTGCGGAGTcaccacc > 2:2943797/1‑149 (MQ=255)
ttATCGTTCATGTCCTGGGAGCCGATATTAACTACCTGCTCGCCTTTAACGTTCGCAATGTCTTTTAGTTGCGGCACCGCAATAACCAGATTTTCTACGCCAACTATACCCACTGTGTAGTTAGATTTGGTTGCGGAGTCaccaccacc > 1:3328661/1‑149 (MQ=255)
tCGTTCATGTCCTGGGAGCCGATATTCACTACCTGCTCGCCTTTAACGTTCGCAATGTCTTTTAGTTGCGGCACCGCATTAACCAGATTTTCTACGCCAACTTTACCCACTGTGTAGTTAGATTTGGTTGCGGAGTCACCACCACCGGc > 1:4108761/1‑149 (MQ=255)
tCGTTCATGTCCTGGGAGCCGATATTAACTACCTGCTCGCCTTTAACGTTCGCAATGTCTTTTAGTTGCGGCACCGCATTAACCAGATTTTCTACGCCAACTTTACCCACTGTGTAGTTAGATTTGGTTGCGGAGTCACCACCACCGGc > 2:140192/1‑149 (MQ=255)
gTTCATGTCCTGGGAGCCGATATTCACTACCTGCTCGCCTTTAACGTTCGCAATGTCTTTTAGTTGCGGCACCGCATTAACCAGATTTTCTACGCCAACTTTACCCACTGTGTAGTTAGATTTGGTTGCGGAGTCACCACCACCGGCaa < 2:3832385/149‑1 (MQ=255)
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ttCATGTCCTGGGAGCCGATATTCACTACCTGCTCGCCTTTAACGTTCGCAATGTCTTTTAGTTGCGGCACCGCATTAACCAGATTTTCTACGCCAACTTTACCCACTGTGTAGTTAGATTTGGTTGCGGAGTCACCACCACCGGCAAt < 1:2688414/149‑1 (MQ=255)
tGTCCTGGGAGCCGATATTCACTACCTGCTCGCCTTTAACGTTCGCAATGTCTTTTAGTTGCGGCACCGCATTAACCAGATTTTCTACGCCAACTTTACCCACTGTGGAGTTAGCTTTGGTGGCGGAGTCACCACCACCGGCAATGGTc > 2:3974218/1‑149 (MQ=255)
tGTCCTGGGAGCCGATATTAACTACCTGCTCGCCTTTAACGTTCGCAATGTCTTTTAGTTGCGGCACCGCATTAACCAGATTTTCTACGCCAACTTTACCCACTGTGTAGTTAGATTTGGTTGCGGAGTCACCACCACCGGCAATGGTc > 2:2458717/1‑149 (MQ=255)
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cGATATTCACTACCTGCTCGCCTTTAACGTTCGCAATGTCTTTTAGTTGCGGCACCGCATTAACCAGATTTTCTACGCCAACTTTACCCACTGTGTAGTTAGATTTGGTTGCGGAGTCACCACCACCGGCAATGGTCCCGCCGGTTGCt > 2:1587519/1‑149 (MQ=255)
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gATATTCACTACCTGCTCGCCTTTAACGTTCGCAATGTCTTTTAGTTGCGGCACCGCATTAACCAGATTTTCTACGCCAACTTTACCCACTGTGTAGTTAGATTTGGTTGCGGAGTCACCACCACCGGCAATGGTCCCGCCGGTTGCTa > 2:1894053/1‑149 (MQ=255)
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CACCGTCAGGTCGAGGAAGTAAGCAGTTTCTTCCATCGTGTCGGTACCGTGGGTAATGACGAAGCCGTCGGTCTTATCGCAGTCGGTGTTAA‑TTTTTTTCGCCAGTGTCAGCCAGACATTATCGTTCATGTCCTGGGAGCCGATATTCACTACCTGCTCGCCTTTAACGTTCGCAATGTCTTTTAGTTGCGGCACCGCATTAACCAGATTTTCTACGCCAACTTTACCCACTGTGTAGTTAGATTTGGTTGCGGAGTCACCACCACCGGCAATGGTCCCGCCGGTTGCTAAAATGG > CP009273/3093713‑3094008
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
GATK/CNVnator alignment
N/A
