Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A1 F218 I0 R1
|
1506 |
278.7 |
9275112 |
94.5% |
8764980 |
150.0 |
Breseq alignment
BRESEQ :: Evidence
|
| evidence |
seq id |
position |
mutation |
freq |
annotation |
gene |
description |
| RA |
CP009273 |
1,698,343 |
C→A |
53.2% |
D75Y (GAT→TAT) |
ydgJ ← |
putative oxidoreductase |
|
| |
seq id |
position |
ref |
new |
freq |
score (cons/poly) |
reads |
annotation |
genes |
product |
| * | CP009273 | 1,698,343 | 0 | C | A | 53.2%
| 45.0
/ inf
| 259 | D75Y (GAT→TAT) | ydgJ | putative oxidoreductase |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (57/64); new base A (65/73); total (122/137) |
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 |
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.83e-01 |
Only 100 of 260 total aligned reads displayed.
ACGGTTATGGAATACAGACAGCACACGCCCCAGGCTTTTTGCCAGCGCATCCAGCTCTCGCGCTTGTGACAGTGTCACGGTAAAGGGTTTATCAACGACCACATGTTTACCCGCCTCAAGCGCCGCTTTGGCTAACGGGAAATGGGTATCGTTGGGTGTAGGAATGACAATCAGGTCTATGTTGGGATCGTTAAACAGATGCTTCGGCTCAGAGACAACCGTAACCGTTGGCCAGTCGGCTTTTACTTTTGTTTCATCACTGCTGGAGATTACCGCCAGTTCCTGCCCGGGCGTGCCC > CP009273/1698194‑1698491
|
aCGGTTATGGAATACAGACAGCACACGCCCCAGGCTTTTTGCCAGCGCATCCAGCTCTCGCGCTTGTGACAGTGTCACGGTAAAGGGTTTATCAACGACCACATGTTTACCCGCCTCAAGCGCCGCTTTGGCTAACGGGAAATGGGTATc > 2:4099450/1‑150 (MQ=255)
cGGTTATGGAATACAGACAGCACACGCCCCAGGCTTTTTGCCAGCGCATCCAGCTCTCGCGCTTGTGACAGTGTCACGGTAAAGGGTTTATCAACGACCACATGTTTACCCGCCTCAAGCGCCGCTTTGGCTAACGGGAAATGGGTCTCg > 1:2612468/1‑150 (MQ=255)
cGGTTATGGAATACAGACAGCACACGCCCCAGGCTTTTTGCCAGCGCATCCAGCTCTCGCGCTTGTGACAGTGTCACGGTAAAGGGTTTATCAACGACCACATGTTTACCCGCCTCAAGCGCCGCTTTGGCTAACGGGAAATGGGTATCg > 1:3603581/1‑150 (MQ=255)
ggTTATGGAATACAGACAGCACACGCCCCAGGCTTTTTGCCAGCGCATCCAGCTCTCGCGCTTGTGACAGTGTCACGGTAAAGGGTTTATCAACGACCACATGTTTACCCGCCTCAAGCGCCGCTGTGGCTAACGGGAAATGGGTATCGt > 2:2770396/1‑150 (MQ=255)
tATGGAATACAGACAGCACACGCCCCAGGCTTTTTGCCAGCGCATCCAGCTCTCGCGCTTGTGACAGTGTCACGGTAAAGGGTTTATCAACGACCACATGTTTACCCGCCTCAAGCGCCGCTTTGGCTAACGGGAAATGGGTATCGTTgg > 1:350825/1‑150 (MQ=255)
aTGGAATACAGACAGCACACGCCCCAGGCTTTTTGCCAGCGCATCCAGCTCTCGCGCTTGTGACAGTGTCACGGTAAAGGGTTTATCAACGACCACATGTTTACCCGCCTCAAGCGCCGCTTTGGCTAACGGGAAATGGGTATCGTTggg < 1:48116/150‑1 (MQ=255)
tGGAATACAGACAGCACACGCCCCAGGCTTTTTGCCAGCGCATCCAGCTCTCGCGCTTGTGACAGTGTCACGGTAAAGGGTTTATCAACGACCACATGTTTACCCGCCTCAAGCGCCGCTTTGGCTAACGGGAAATGGGTATCGTTGGgt > 2:3451618/1‑150 (MQ=255)
gAATACAGACAGCACACGCCCCAGGCTTTTTGCCAGCGCATCCAGCTCTCGCGCTTGTGACAGTGTCACGGTAAAGGGTTTATCAACGACCACATGTTTACCCGCCTCAAGCGCCGCTTTGGCTAACGGGAAATGGGTATCGTTGGgtgt < 1:2196648/150‑1 (MQ=255)
aaTACAGACAGCACACGCCCCAGGCTTTTTGCCAGCGCATCCAGCTCTCGCGCTTGTGACAGTGTCACGGTAAAGGGTTTATCAACGACCACATGTTTACCCGCCTCAAGCGCCGCTTTGGCTAACGGGAAATGGGTCTAGTTGGGGGTa > 2:2287546/1‑150 (MQ=255)
aaTACAGACAGCACACGCCCCAGGCTTTTTGCCAGCGCACCCAGCTCTCGCGCTTGTGACAGTGTCACGGTAAAGGGTTTATCAACGACCACATGTTTACCCGCCTCAAGCGCCGCTTTGGCTAACGGGAAATGGGTATCGTTGGGTGTa > 1:1581415/1‑150 (MQ=255)
cagacagCACACGCCCCAGGCTTTTTGCCAGCGCATCCAGCTCTCGCGCTTGTGACAGTGTCACGGTAAAGGGTTTATCAACGACCACATGTTTACCCGCCTCAAGCGCCGCTTTGGCTAACGGGAAATGGGTATAGTTGGGTGTAGGaa < 1:118673/150‑1 (MQ=255)
cagacagCACACGCCCCAGGCTTTTTGCCAGCGCATCCAGCTCTCGCGCTTGTGACAGTGTCACGGTAAAGGGTTTATCAACGACCACATGTTTACCCGCCTCAAGCGCCGCTTTGGCTAACGGGAAATGGGTATAGTTGGGTGTAGGaa > 2:3215599/1‑150 (MQ=255)
cagacagCACACGCCCCAGGCTTTTTGCCAGCGCATCCAGCTCTCGCGCTTGTGACAGTGTCACGGTAAAGGGTTTATCAACGACCACATGTTTACCCGCCTCAAGCGCCGCTTTGGCTAACGGGAAATGGGTATAGTTGGGTGTAGGaa < 2:2781888/150‑1 (MQ=255)
agCACACGCCCCAGGCTTTTTGCCAGCGCATCCAGCTCTCGCGCTTGTGACAGTGTCACGGTAAAGGGTTTATCAACGACCACATGTTTACCCGCCTCAAGCGCCGCTTTGGCTAACGGGAAATGGGTATCGTTGGGTGTAGGAATGACa > 2:3580396/1‑150 (MQ=255)
agCACACGCCCCAGGCTTTTTGCCAGCGCATCCAGCTCTCGCGCTTGTGACAGTGTCACGGTAAAGGGTTTATCAACGACCACATGTTTACCCGCCTCAAGCGCCGCTTTGGCTAACGGGAAATGGGTATCGTTGGGTGTAGGAATGACa < 1:3109290/150‑1 (MQ=255)
agCACACGCCCCAGGCTTTTTGCCAGCGCATCCAGCTCTCGCGCTTGTGACAGTGTCACGGTAAAGGGTTTATCAACGACCACATGTTTACCCGCCTCAAGCGCCGCTTTGGCTAACGGGAAATGGGTATAGTTGGGTGTAGGAATGACa < 2:4161878/150‑1 (MQ=255)
gCACACGCCCCAGGCTTTTTGCCAGCGCATCCAGCTCTCGCGCTTGTGACAGTGTCACGGTAAAGGGTTTATCAACGACCACATGTATACCCGCCTCAAGCGCCGCTTTGGCTAACGGGAAATGGGTATCGTTGGGTGTAGGACTGACaa > 2:2643699/1‑150 (MQ=255)
cacaCGCCCCAGGCTTTTTGCCAGCGCATCCAGCTCTCGCGCTTGTGACAGTGTCACGGTAAAGGGTTTATCAACGACCACATGTTTACCCGCCTCAAGCGCCGCTTTGGCTAACGGGAAATGGGTATAGTTGGGTGTAGGAATGACAAt < 1:3120059/150‑1 (MQ=255)
acacGCCCCAGGCTTTTTGCCAGCGCATCCAGCTCTCGCGCTTGTGACAGTGTCACGGTAAAGGGTTTATCAACGACCACATGTTTACCCGCCTCAAGCGCCGCTTTGGCTAACGGGAAATGGGTATAGTTGGGTGTAGGAATGACAATc < 1:548321/150‑1 (MQ=255)
cGCCCCAGGCTTTTTGCCAGCGCATCCAGCTCTCGCGCTTGTGACAGTGTCACGGTAAAGGGTTTATCAACGACCACATGTTTACCCGCCTCAAGCGCCGCTTTGGCTAACGGGAAATGGGTATCGATGGGTGTAGGAATGACAATCAgg > 2:714987/1‑150 (MQ=255)
gCCCCAGGCTTTTTGCCAGCGCATCCAGCTCTCGCGCTTGTGACAGTGTCACGGTAAAGGGTTTATCAACGACCACATGTTTACCCGCCTCAAGCGCCGCTTTGGCTAACGGGAAATGGGTATAGTTGGGTGTAGGAATGACAATCAGGt > 1:3153062/1‑150 (MQ=255)
ccccAGGCTTTTTGCCAGCGCATCCAGCTCTCGCGCTTGTGACAGTGTCACGGTAAAGGGTTTATCAACGACCACATGTTTACCCGCCTCAAGCGCCGCTTTGGCTAACGGGAAATGGGTATAGTTGGGTGTAGGAATGACAATCAGGTc < 1:916860/150‑1 (MQ=255)
ccAGGCTTTTTGCCAGCGCATCCAGCTCTCGCGCTTGTGACAGTGTCACGGTAAAGGGTTTATCAACGACCACATGTTTACCCGCCTCAAGCGCCGCTTTGGCTAACGGGAAATGGGTATAGTTGGGTGTAGGAATGACAATCAGGTCTa > 2:2887435/1‑150 (MQ=255)
cAGGCTTTTTGCCAGCGCATCCAGCTCTCGCGCTTGTGACAGTGTCACGGTAAAGGGTTTATCAACGACCACATGTTTACCCGCCTCAAGCGCCGCTTTGGCTAACGGGAAATGGGTATAGTTGGGTGTAGGAATGACAATCAGGTCTAt > 1:1507894/1‑150 (MQ=255)
ggCTTTTTGCCAGCGCATCCAGCTCTCGCGCTTGTGACAGTGTCACGGTAAAGGGTTTATCAACGACCACATGTTTACCCGCCTCAAGCGCCGCTTTGGCTAACGGGAAATGGGTATAGTTGGGTGTAGGAATGACAATCAGGTCTATgc < 2:3696101/150‑2 (MQ=255)
ggCTTTTTGCCAGCGCATCCAGCTCTCGCGCTTGTGACAGTGTCACGGTAAAGGGTTTATCAACGACCACATGTTTACCCGCCTCAAGCGCCGCTTTGGCTAACGGGAAATGGGTATAGTTGGGTGTAGGAATGACAATCAGGTCTATGt < 1:3964708/150‑1 (MQ=255)
cTTTTTGCCAGCGCATCCAGCTCTCGCGCTTGTTTCAGTGTCACGGTTAAGGGTTTATCAACGACCTCTTGTTTACCCGCCTCAAGCGCCGCTTTGGCTAACGGGAAATGGGTATAGTTGGGTGTAGGAATGACAATCAGGTCTATGTTg < 2:2587039/150‑1 (MQ=255)
tttttGCCAGCGCATCCAGCTCTCGCGCTTGTGACAGTGTCACGGTAAAGGGTTTATCAACGACCACATGTTTACCCGCCTCAAGCGCCGCTTTGGCTAACGGGAAATGGGTATAGTTGGGTGTAGGAATGACAATCAGGTCTATGTTgg > 2:1080652/1‑150 (MQ=255)
ttGCCAGCGCATCCAGCTCTCGCGCTTGTGACAGTGTCACGGTAAAGGGTTTATCAACGACCACATGTTTACCCGCCTCAAGCGCCGCTTTGGCTAACGGGAAATGGGTATAGTTGGGTGTAGGAATGACAATCAGGTCTATGTTGGGAt > 1:357706/1‑150 (MQ=255)
tGCCAGCGCATCCAGCTCTCGCGCTTGTGACAGTGTCACGGTAAAGGGTTTATCAACGACCACATGTTTACCCGCCTCAAGCGCCGCTTTGGCTAACGGGAAATGGGTCACCAAGGGTGTAGGAATGACAATCAGGTCTATGTTGGGATc > 2:1887486/1‑150 (MQ=255)
tGCCAGCGCATCCAGCTCTCGCGCTTGTGACAGTGTCACGGTAAAGGGTTTATCAACGACCACATGTTTACCCGCCTCAAGCGCCGCTTTGGCTAACGGGAAATGGGTATCGTTGGGTGTAGGAATGACAATCAGGTCTATGTTGGGATc < 2:1050422/150‑1 (MQ=255)
cAGCGCATCCAGCTCTCGCGCTTGTGACAGTGTCACGGTAAAGGGTTTATCAACGACCACATGTTTACCCGCCTCAAGCGCCGCTTTGGCTAACGGGAAATGGGTATCGTTGGGTGTAGGAATGACAATCAGGTCTATGTTGGGATCGtt > 1:601128/1‑150 (MQ=255)
cAGCGCATCCAGCTCTCGCGCTTGTGACAGTGTCACGGTAAAGGGTTTATCAACGACCACATGTTTACCCGCCTCAAGCGCCGCTTTGGCTAACGGGAAATGGGTATAGTTGGGTGTAGGAATGACAATCAGGTCTATGTTGGGATCGtt > 2:2312781/1‑150 (MQ=255)
aGCGCATCCAGCTCTCGCGCTTGTGACAGTGTCACGGTAAAGGGTTTATCAACGACCACATGTTTACCCGCCTCAAGCGCCGCTTTGGCTAACGGGAAATGGGTATAGTTGGGTGTAGGAATGACAATCAGGTCTATGTTGGGATCGTTa > 1:3493641/1‑150 (MQ=255)
aTCCAGCTCTCGCGCTTGTGACAGTGTCACGGTACAGGGTTTATCAACGACCACATGTTTACCCGCCTCAAGCGCCGCTTTGGCTAACGGGAAATGGGTATCGTTGGGTGTAGGAATGACAATCAGGTCTATGTTGGGATCGTTAAACAg < 1:1900093/150‑1 (MQ=255)
aTCCAGCTCTCGCGCTTGTGACAGTGTCACGGTAAAGGGTTTATCAACGACCACATGTTTACCCGCCTCAAGCGCCGCTTTGGCTAACGGGAAATGGGTATCGTTGGGTGTAGGAATGACAATCAGGTCTATGTTGGGATCGTTAAACAg < 2:2202561/150‑1 (MQ=255)
aTCCAGCTCTCGCGCTTGTGACAGTGTCACGGTAAAGGGTTTATCAACGACCACATGTTTACCCGCCTCAAGCGCCGCTTTGGCTAACGGGAAATGGGTATCGTTGGGTGTAGGAATGACAATCAGGTCTATGTTGGGATCGTTAAACAg < 1:2773749/150‑1 (MQ=255)
aTCCAGCTCTCGCGCTTGTGACAGTGTCACGGTAAAGGGTTTATCAACGACCACATGTTTACCCGCCTCAAGCGCCGCTTTGGCTAACGGGAAATGGGTATCGTTGGGTGTAGGAATGACAATCAGGTCTATGTTGGGATCGTTAAACAg < 2:2775806/150‑1 (MQ=255)
aGCTCTCGCGCTTGTGACAGTGTCACGGTAAAGGGTTTATCAACGACCACATGTTTACCCGCCTCAAGCGCCGCTTTGGCTAACGGGACATGGGTATAGTTGGGTGTAGGAATGACAATCAGGTCTATGTTGGGATCGTTAAACAGATGc > 1:336354/1‑150 (MQ=255)
gCTCTCGCGCTTGTGACAGTGTCACGGTAAAGGGTTTATCAACGACCACATGTTTACCCGCCTCAAGCGCCGCTTTGGCTAACGGGAAATGGGTATCGTTGGGTGTAGGAATGACAATCAGGTCTATGTTGGGATCGTTAAACAGATGCt > 1:949340/1‑150 (MQ=255)
gCTCTCGCGCTTGTGACAGTGTCACGGTAAAGGGTTTATCAACGACCACATGTTTACCCGCCTCAAGCGCCGCTTTGGCTAACGGGAAATGGGTATAGTTGGGTGTAGGAATGACAATCAGGTCTATGTTGGGATCGTTAAACAGATGCt > 2:4043112/1‑150 (MQ=255)
ctctCGCGCTTGTGACAGTGTCACGGTAAAGGGTTTATCAACGACCACATGTTTACCCGCCTCAAGCGCCGCTTTGGCTAACGGGAAATGGGTATAGTTGGGTGTAGGAATGACAATCAGGTCTATGTTGGGATCGTTAAACAGATGCtt < 1:1923917/150‑1 (MQ=255)
ctcGCGCTTGTGACAGTGTCACGGTAAAGGGTTTATCAACGACCACATGTTTACCCGCCTCAAGCGCCGCTTTGGCTAACGGGAAATGGGTATAGTTGGGTGTAGGAATGACAATCAGGTCTATGTTGGGATCGTTAAACAGATGCTTCg > 1:4348162/1‑150 (MQ=255)
tcGCGCTTGTGACAGTGTCACGGTAAAGGGTTTATCAACGACCACATGTTTACCCGCCTCAAGCGCCGCTTTGGCTAACGGGAAATGGGTATAGTTGGGTGTAGGAATGACAATCAGGTCTATGTTGGGATCGTTAAACAGATGCTTCgg > 2:2019151/1‑150 (MQ=255)
tcGCGCTTGTGACAGTGTCACGGTAAAGGGTTTATCAACGACCACATGTTTACCCGCCTCAAGCGCCGCTTTGGCTAACGGGAAATGGGTATAGTTGGGTGTAGGAATGACAATCAGGTCTATGTTGGGATCGTTAAACAGATGCTTCgg < 1:3855206/150‑1 (MQ=255)
cgcgCTTGTGACAGTGTCACGGTAAAGGGTTTATCAACGACCACATGTTTACCCGCCTCAAGCGCCGCTTTGGCTAACGGGAAATGGGTATAGTTGGGTGTAGGAATGACAATCAGGTCTATGTTGGGATCGTTAAACAGATGCTTCGGc > 1:4032904/1‑150 (MQ=255)
cgcTAGTGACAGTGTCACGTTAAAGGGTTTATCAACGACCACATGTTTACCCGCCTCAAGCGCCGCTTTGGCTAACCGGAAATGGGTAGCGTGGGGGGTAGGAATGACAATCAGGTCTATGTTGGGATCGTTAAACAGAAGCTTCGGATc > 2:589763/1‑150 (MQ=255)
tgACAGTGTCACGGTAAAGGGTTTATCAACGACCACATGTTTACCCGCCTCAAGCGCCGCTTTGGCTAACGGGAAATGGGTATCGTTGGGTGTAGGAATGACAATCAGGTCTATGTTGGGATCGTTTATCAGATGCTTCGGCTCAGAGAc < 2:3363066/150‑1 (MQ=255)
tgACAGTGTCACGGTAAAGGGTTTATCAACGACCACATGTTTACCCGCCTCAAGCGCCGCTTTGGCTAACGGGAAATGGGTATCGTTGGGTGTAGGAATGACAATCAGGTCTATGTTGGGATCGTTAAACAGATGCTTCGGCTCAGAGAc > 1:1845168/1‑150 (MQ=255)
aGTGTCACGGTAAAGGGTTTATCAACGACCACATGTTTACCCGCCTCAAGCGCCGCTTTGGCTAACGGGAAATGGGTATCGTTGGGTGTAGGAATGACAATCAGGTCTATGTTGGGATCGTTAAACAGATGCTTCGGCTCAGAGACaacc < 1:1383734/150‑1 (MQ=255)
aGTGTCACGGTAAAGGGTTTATCAACGACCACATGTTTACCCGCCTCAAGCGCCGCTTTGGCTAACGGGAAATGGGTATCGTTGGGTGTAGGAATGACAATCAGGTCTATGTTGGGATCGTTAAACAGATGCTTCGGCTCAGAGACaacc < 1:1383548/150‑1 (MQ=255)
gtCACGGTAAAGGGTTTATCAACGACCACATGTTTACCCGCCTCAAGCGCCGCTTTGGCTAACGGGAAATGGGTATCGTTGGGTGTAGGAATGACAATCAGGTCTATGTTGGGATCGTTAAACAGATGCTTCGGCTCAGAGACaaccgta > 2:61415/1‑150 (MQ=255)
tCACGGTAAAGGGTTTATCAACGACCACATGTTTACCCGCCTCAAGCGCCGCTTTGGCTAACGGGAAATGGGTATAGTTGGGTGTAGGAATGACAATCAGGTCTATGTTGGGATCGTTAAACAGATGCTTCGGCTCAGAGACaaccgtaa < 1:2523673/150‑1 (MQ=255)
aCGGTAAAGGGTTTATCACCGACCACTTGTTTACCCGCCTCAAGCGCCGCTTTGGCTAACGGGAATTGGGTATCGTTGGGTGTAGGAATGACAATCAGGTCTATGTTGGGATCGTTAAACAGATGCTTCGGCTCAGAGACaaccgtaacc < 1:2254186/150‑1 (MQ=255)
cGGTAAAGGGTTTATCAACGACCACATGTTTACCCGCCTCAAGCGCCGCTTTGGCTAACGGGAAATGGGTATCGTTGGGTGTAGGACTGACAATCAGGTCTATGTTGGGATCGTTAAACAGATGCTTCGGCTCAGAGACaaccgtaaccg > 1:802898/1‑150 (MQ=255)
ggTAAAGGGTTTATCAACGACCACATGTTTACCCGCCTCAAGCGCCGCTTTGGCTAACGGGAAATGGGTATCGTTGGGTGTAGGAATGACAATCAGGTCTATGTTGGGATCGTTAAACAGATGCTTCGGCTCAGAGACaaccgtaaccgt > 1:1465985/1‑150 (MQ=255)
gTAAAGGGTTTATCAACGACCACATGTTTACCCGCCTCAAGCGCCGCTTTGGCTAACGGGAAATGGGTATCGTTGGGTGTAGGAATGACAATCAGGTCTATGTTGGGATCGTTAAACAGATGCTTCGGCTCAGAGACAACCGTAACCGtt > 1:3814432/1‑150 (MQ=255)
aaGGGTTTATCAACGACCACATGTTTACCCGCCTCAAGCGCCGCTTTGGCTAACGGGAAATGGGTATAGTTGGGTGTAGGAATGACAATCAGGTCTATGTTGGGATCGTTAAACAGATGCTTCGGCTCAGAGACAACCGTAACCGTTGGc < 1:428997/150‑1 (MQ=255)
aaGGGTTTATCAACGACCACATGTTTACCCGCCTCAAGCGCCGCTTTGGCTAACGGGAAATGGGTATAGTTGGGTGTAGGAATGACAATCAGGTCTATATTGGGATCGTTAAACAGATGCTTCGGCTCAGAGACAACCGTAACCGTTGGc > 2:1637274/1‑150 (MQ=255)
aGGGTTTATCAACGACCACATGTTTACCCGCCTCACGCGCCGCTTTGGCTAACGGGAAATGGGTATCGTTGGGTGTAGGAATGACAATCAGGTCTATGTTGGGATCGTTAAACAGATGCTTCGGCTCAGAGACAACCGTAACCGTTGGcc < 2:3079252/150‑1 (MQ=255)
aGGGTTTATCAACGACCACATGTTTACCCGCCTCAAGCGCCGCTTTGGCTAACGGGAAATGGGTATCGTTGGGTGTAGGAATGACAATCAGGTCTATGTTGGGATCGTTAAACAGATGCTTCGGCTCAGAGACAACCGTAACCGTTGGcc > 2:2101823/1‑150 (MQ=255)
aGGGTTTATCAACGACCACATGTTTACCCGCCTCAAGCGCCGCTTTGGCTAACGGGAAATGGGTATAGTTGGGTGTAGGAATGACAATCAGGTCTATGTTGGGATCGTTAAACAGATGCTTCGGCTCAGAGACAACCGTAACCGTTGGcc < 1:2058747/150‑1 (MQ=255)
gTTTATCAACGACCACATGTTTACCCGCCTCAAGCGCCGCTTTGGCTAACGGGAAATGGGTATAGTTGGGTGTAGGAATGACAATCAGGTCTATGTTGGGATCGTTAAACAGATGCTTCGGCTCAGAGACAACCGTAACCGTTGGCCAGt < 2:3481524/150‑1 (MQ=255)
tttATCAACGACCACATGTTTACCCGCCTCAAGCGCCGCTTTGGCTAACGGGAAATGGGTATAGTTGGGTGTAGGAATGACAATCAGGTCTATGTTGGGATCGTTAAACAGATGCTTCGGCTCAGAGACAACCGTAACCGTTGGCCAGTc > 2:1204144/1‑150 (MQ=255)
aTCAACGACAACATGTTTACCCGCCTCAAGCGCCGCTTTGGCAAACGGGAAATGGGTATAGTTGGGGGTAGGAATTACAATCAGGTATATCTTGGGATCGTTAAACAGATCCTTCGGCTCAGAGAAAACCGTAACCGATGTCAAGTCGGc > 2:1678094/1‑150 (MQ=255)
cAACGACCACATGTTTACCCGCCTCAAGCGCCGCTTTGGCTAACGGGAAATGGGTATCGTTGGGTGTAGGAATGACAATCAGGTCTATGTTGGGATCGTTAAACAGATGCTTCGGCTCAGAGACAACCGTAACCGTTGGCCAGTCGGCtt < 1:4570348/150‑1 (MQ=255)
gACCACATGTTTACCCGCCTCAAGCGCCGCTTTGGCTAACGGGAAATGGGTATAGTTGGGTGTAGGAATGACAATCAGGTCTATGTTGGGATCGTTAAACAGATGCTTCGGCTCAGAGACAACCGTAACCGTTGGCCAGTCGGCTTTTAc < 2:1898786/150‑1 (MQ=255)
gACCACATGTTTACCCGCCTCAAGCGCCGCTTTGGCTAACGGGAAATGGGTATAGTTGGGTGTAGGAATGACAATCAGGTCTATGTTGGGATCGTTAAACAGATGCTTCGGCTCAGAGACAACCGTAACCGTTGGCCAGTCGGCTTTTAc > 2:4609056/1‑150 (MQ=255)
gACCACATGTTTACCCGCCTCAAGCGCCGCTTTGGCTAACGGGAAATGGGTATAGTTGGGTGTAGGAATGACAATCAGGTCTATGATGGGATCGTTAAACAGATGCTTCGGCTCAGAGACAACCGTAACCGTTGGCCAGTCGGCTTTTAc < 1:853431/150‑1 (MQ=255)
acaTGTTTACCCGCCTCAAGCGCCGCTTTGGCTAACGGGAAATGGGTATCGTTGGGTGTAGGAATGACAATCAGGTCTATGTTGGGATCGTTAAACAGATGCTTCGGCTCAGAGACAACCGTAACCGTTGGCCAGTCGGCTTTTACtttt < 1:1226744/150‑1 (MQ=255)
aTGTTTACCCGCCTCAAGCGCCGCTTTGGCTAACGGGAAATGGGTATAGTTGGGTGTAGGAATGACAATCAGGTCTATGTTGGGATCGTTAAACAGATGCTTCGGCTCAGAGACAACCGTAACCGTTGGCCAGTCGGCTTTTACTTTTGt > 1:1015132/1‑150 (MQ=255)
tttACCCGCCTCAAGCGCCGCTTTGGCTAACGGGAAATGGGTATAGTTGGGTGTAGGAATGACAATCAGGTCTATGTTGGGATCGTTAAACAGATGCTTCGGCTCAGAGACAACCGTAACCGTTGGCCAGTCGGCTTTTACTTTTGTTtc < 2:3869375/150‑1 (MQ=255)
tttACCCGCCTCAAGCGCCGCTTTGGCTAACGGGAAATGGGTATAGTTGGGTGTAGGAATGACAATCAGGTCTATGTTGGGATCGTTAAACAGATGCTTCGGCTCAGAGACAACCGTAACCGTTGGCCAGTCGGCTTTTACTTTTGTTtc < 2:1546412/150‑1 (MQ=255)
cccGCCTCAAGCGCCGCTTTGGCTAACGGGAAATGGGTATAGTTGGGTGTAGGAATGACAATCAGGTCTATGTTGGGATCGTTAAACAGATGCTTCGGCTCAGAGACAACCGTAACCGTTGGCCAGTCGGCTTTTACTTTTGTTtcatca > 1:2672793/1‑150 (MQ=255)
ccTCAAGCGCCGCTTTGGCTAACGGGAAATGGGTATCGTTGGGTGTAGGAATGACAATCAGGTCTATGTTGGGATCGTTAAACAGATGCTTCGGCTCAGAGACAACCGTAACCGTTGGCCAGTCGGCTTTTACTTTTGTTTCATCActgc > 2:751606/1‑150 (MQ=255)
ccTCAAGCGCCGCTTTGGCTAACGGGAAATGGGTATAGTTGGGTGTAGGAATGACAATCAGGTCTATGTTGGGATCGTTAAACAGATGCTTCGGCTCAGAGACAACCGTAACCGTTGGCCAGTCGGCTTTTACTTTTGTTTCATCActgc < 1:1979155/150‑1 (MQ=255)
aaGCGCCGCTTTGGCTAACGGGAAATGGGTATAGTTGGGTGTAGGAATGACAATCAGGTCTATGTTGGGATCGTTAAACAGATGCTTCGGCTCAGAGACAACCGTAACCGTTGGCCAGTCGGCTTTTACTTTTGTTTCATCACTGCTGga > 1:2719402/1‑150 (MQ=255)
aGCGCCGCTTTGGCTAACGGGAAATGGGTATAGTTGGGTGTAGGAATGACAATCAGGTCTATGTTGGGATCGTTAAACAGATGCTTCGGCTCAGAGACAACCGTAACCGTTGGCCAGTCGGCTTTTACTTTTGTTTCATCACTGCTGgag > 2:770019/1‑150 (MQ=255)
cgccgcTTTGGCTAACGGGAAATGGGTATCGTTGGGTGTAGGAATGACAATCAGGTCTATGTTGGGATCGTTAAACAGATGCTTCGGCTCAGAGACAACCGTAACCGTTGGCCAGTCGGCTTTTACTTTTGTTTCATCACTGCTGGAGAt < 2:3139637/150‑1 (MQ=255)
gccgcTTTGGCTAACGGGAAATGGGTATCGTTGGGTGTAGGAATGACAATCAGGTCTATGTTGGGATCGTTAAACAGATGCTTCGGCTCAGAGACAACCGTAACCGTTGGCCAGTCGGCTTTTACTTTTGTTTCATCACTGCTGGGGAtt < 1:1200821/150‑1 (MQ=255)
ccgcTTTGGCTAACGGGAAATGGGTATAGTTGGGTGTAGGAATGACAATCAGGTCTATGTTGGGATCGTTAAACAGATGCTTCGGCTCAGAGACAACCGTAACCGTTGGCCAGTCGGCTTTTACTTTTGTTTCATCACTGCTGGAGATTa < 2:2549456/150‑1 (MQ=255)
cgcTTTGGCTAACGGGAAATGGGTATAGTTGGGTGTAGGAATGACAATCAGGTCTATGTTGGGATCGTTAAACAGATGCTTCGGCTCAGAGACAACCGTAACCGTTGGCCAGTCGGCTTTTACTTTTGTTTCATCACTGCTGGAGATTAc > 1:933200/1‑150 (MQ=255)
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CTCGCGCTTGTGACAGTGTCACGGTAAAGGGTTTATCAACGACCACATGTTTACCCGCCTCAAGCGCCGCTTTGGCTAACGGGAAATGGGTATAGTTGGGTGTAGGAATGACAATCAGGTCTATGTTGGGATCGTTAAACAGATGCTTCG > SRR19973073.4356864/1‑150 (MQ=60)
CTCGCGCTTGTGACAGTGTCACGGTAAAGGGTTTATCAACGACCACATGTTTACCCGCCTCAAGCGCCGCTTTGGCTAACGGGAAATGGGTATAGTTGGGTGTAGGAATGACAATCAGGTCTATGTTGGGATCGTTAAACAGATGCTTCG > SRR19973073.4356866/1‑150 (MQ=60)
TCGCGCTTGTGACAGTGTCACGGTAAAGGGTTTATCAACGACCACATGTTTACCCGCCTCAAGCGCCGCTTTGGCTAACGGGAAATGGGTATCGTTGGGTGTAGGAATGACAATCAGGTCTATGTTGGGATCGTTAAACAGATGCTTCGG < SRR19973073.701154/150‑1 (MQ=60)
TCGCGCTTGTGACAGTGTCACGGTAAAGGGTTTATCAACGACCACATGTTTACCCGCCTCAAGCGCCGCTTTGGCTAACGGGAAATGGGTATAGTTGGGTGTAGGAATGACAATCAGGTCTATGTTGGGATCGTTAAACAGATGCTTCGG < SRR19973073.3862847/150‑1 (MQ=60)
CGCGCTTGTGACAGTGTCACGGTAAAGGGTTTATCAACGACCACATGTTTACCCGCCTCAAGCGCCGCTTTGGCTAACGGGAAATGGGTATAGTTGGGTGTAGGAATGACAATCAGGTCTATGTTGGGATCGTTAAACAGATGCTTCGGC > SRR19973073.4040973/1‑150 (MQ=60)
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TGACAGTGTCACGGTAAAGGGTTTATCAACGACCACATGTTTACCCGCCTCAAGCGCCGCTTTGGCTAACGGGAAATGGGTATCGTTGGGTGTAGGAATGACAATCAGGTCTATGTTGGGATCGTTAAACAGATGCTTCGGCTCAGAGAC > SRR19973073.1848987/1‑150 (MQ=60)
TGACAGTGTCACGGTAAAGGGTTTATCAACGACCACATGTTTACCCGCCTCAAGCGCCGCTTTGGCTAACGGGAAATGGGTATCGTTGGGTGTAGGAATGACAATCAGGTCTATGTTGGGATCGTTAAACAGATGCTTCGGCTCAGAGAC > SRR19973073.1848967/1‑150 (MQ=60)
TGACAGTGTCACGGTAAAGGGTTTATCAACGACCACATGTTTACCCGCCTCAAGCGCCGCTTTGGCTAACGGGAAATGGGTATAGTTGGGTGTAGGAATGACAATCAGGTCTATGTTGGGATCGTTAAACAGATGCTTCGGCTCAGAGAC > SRR19973073.121139/1‑150 (MQ=60)
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AAAGGGTTTATCAACGACCACATGTTTACCCGCCTCAAGCGCCGCTTTGGCTAACGGGAAATGGGTATCGTTGGGTGTAGGAATGACAATCAGGTCTATGTTGGGATCGTTAAACAGATGCTTCGGCTCAGAGACAACCGTAACCGTTGG < SRR19973073.3005555/150‑1 (MQ=60)
AAGGGTTTATCAACGACCACATGTTTACCCGCCTCAAGCGCCGCTTTGGCTAACGGGAAATGGGTATAGTTGGGTGTAGGAATGACAATCAGGTCTATGTTGGGATCGTTAAACAGATGCTTCGGCTCAGAGACAACCGTAACCGTTGGC < SRR19973073.429858/150‑1 (MQ=60)
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AATGGGTATCGTTGGGTGTAGGAATGACAATCAGGTCTATGTTGGGATCGTTAAACAGATGCTTCGGCTCAGAGACAACCGTAACCGTTGGCCAGTCGGCTTTTACTTTTGTTTCATCACTGCTGGAGATTACCGCCAGTTCCTGCCCGG < SRR19973073.146628/150‑1 (MQ=60)
ATGGGTATAGTTGGGTGTAGGAATGACAATCAGGTCTATGTTGGGATCGTTAAACAGATGCTTCGGCTCAGAGACAACCGTAACCGTTGGCCAGTCGGCTTTTACTTTTGTTTCATCACTGCTGGAGATTACCGCCAGTTCCTGCCCGGG > SRR19973073.1678262/1‑150 (MQ=60)
TAGTTGGGTGTAGGAATGACAATCAGGTCTATGTTGGGATCGTTAAACAGATGCTTCGGCTCAGAGACAACCGTAACCGTTGGCCAGTCGGCTTTTACTTTTGTTTCATCACTGCTGGAGATTACCGCCAGTTCCTGCCCGGGCGTGCCC > SRR19973073.4431304/1‑150 (MQ=60)
|
CGGTTATGGAATACAGACAGCACACGCCCCAGGCTTTTTGCCAGCGCATCCAGCTCTCGCGCTTGTGACAGTGTCACGGTAAAGGGTTTATCAACGACCACATGTTTACCCGCCTCAAGCGCCGCTTTGGCTAACGGGAAATGGGTATCGTTGGGTGTAGGAATGACAATCAGGTCTATGTTGGGATCGTTAAACAGATGCTTCGGCTCAGAGACAACCGTAACCGTTGGCCAGTCGGCTTTTACTTTTGTTTCATCACTGCTGGAGATTACCGCCAGTTCCTGCCCGGGCGTGCCC > CP009273/1698195‑1698491
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 0 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
