Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A1 F361 I0 R1
|
1353 |
250.7 |
8230166 |
96.0% |
7900959 |
148.9 |
Breseq alignment
BRESEQ :: Evidence
|
| evidence |
seq id |
position |
mutation |
freq |
annotation |
gene |
description |
| RA |
CP009273 |
1,875,096 |
G→T |
100% |
intergenic (‑80/+47) |
leuE ← / ← dmlR |
leucine efflux protein/transcriptional activator of dmlA |
|
| |
seq id |
position |
ref |
new |
freq |
score (cons/poly) |
reads |
annotation |
genes |
product |
| * | CP009273 | 1,875,096 | 0 | G | T | 98.2%
| 714.2
/ 3.0
| 221 | intergenic (‑80/+47) | leuE/dmlR | leucine efflux protein/transcriptional activator of dmlA |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (4/0); new base T (98/119); total (102/119) |
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 4.39e-02 |
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.89e-01 |
| Rejected as polymorphism: Frequency below/above cutoff threshold. |
| Rejected as polymorphism: Variant not supported by required number of reads on each strand. |
Only 100 of 221 total aligned reads displayed.
CCAACACAATAAAAATGGCCCCAACCAGATAGGTCCAGTAATTCAGAACCCCGTATTCAGCGAACACATTAACCTCTTTAATTATCTTTCGATCATGCGCGATTAAAGGTGAATATGCTAACCAATCTGTAGCGGCTTAGAAAGGAGAAAATCAGGTTTTAACCTGATATCAACCCGATAATTGAATCATTAATCAGGCATGCTCCAGTGAAAAATTCGGGTAGTGCTCGGCAAAATACTGGCGTAAAAATTCTACCGTTATCCGCACTTTCGCTGACGTCGCCAGCCTTGA > CP009273/1874950‑1875241
|
ccAACACAATAAAAATGGCCCCAACCAGATAGGTCCAGTAATTCAGAACCCCGTATTCAGCGAACACATTAACCTCTTTAATTATCTTTCGATCATGCGCGATTAAAGGTGAATATGCTAACCAATCTGTAGCGGCTTAGAAAGGATaa > 2:1976123/1‑149 (MQ=255)
cAACACAATAAAAATGGCCCCAACCAGATAGGTCCAGTAATTCAGAACCCCGTATTCAGCGAACACATTAACCTCTTTAATTATCTTTCGATCATGCGCGATTAAAGGTGAATATGCTAACCAATCTGTAGCGGCTTAGAAAGGATaaa < 1:2975416/149‑1 (MQ=255)
aaCACAATAAAAATGGCCCCAACCAGATAGGTCCAGTAATTCAGAACCCCGTATTCAGCGAACACATTAACCTCTTTAATTATCTTTCGATCATGCGCGATTAAAGGTGAATATGCTAACCAATCTGTAGCGGCTTAGAAAGGATaaaa > 1:1440468/1‑149 (MQ=255)
aaCACAATAAAAATGGCCCCAACCAGATAGGTCCAGTAATTCAGAACCCCGTATTCAGCGAACACATTAACCTCTTTAATTATCTTTCGATCATGCGCGATTAAAGGTGAATATGCTAACCAATCTGTAGCGGCTTAGAAAGGATaaaa < 2:553311/149‑1 (MQ=255)
acacAATAAAAATGGCCCCAACCAGATAGGTCCAGTAATTCAGAACCCCGTATTCAGCGAACACATTAACCTCTTTAATTATCTTTCGATCATGCGCGATTAAAGGTGAATATGCTAACCAATCTGTAGCGGCTTAGAAAGGATAAAAt > 2:183666/1‑149 (MQ=255)
cacaATAAAAATGGCCCCAACCAGATAGGTCCAGTAATTCAGAACCCCGTATTCAGCGAACACATTAACCTCTTTAATTATCTTTCGATCATGCGCGATTAAAGGTGAATATGCTAACCAATCTGTAGCGGCTTAGAAAGGATAAAATc < 1:3405271/149‑1 (MQ=255)
caATAAAAATGGCCCCAACCAGATAGGTCCAGTAATTCAGAACCCCGTATTCAGCGAACACATTAACCTCTTTAATTATCTTTCGATCATGCGCGATTAAAGGTGAATATGCTAACCAATCTGTAGCGGCTTAGAAAGGATAAAATCAg > 1:3044042/1‑149 (MQ=255)
caATAAAAATGGCCCCAACCAGATAGGTCCAGTAATTCAGAACCCCGTATTCAGCGAACACATTAACCTCTTTAATTATCTTTCGATCATGCGCGATTAAAGGTGAATATGCTAACCAATCTGTAGCGGCTTAGAAAGGATAAAATCAg < 2:561350/149‑1 (MQ=255)
caATAAAAATGGCCCCAACCAGATAGGTCCAGTAATTCAGAACCCCGTATTCAGCGAACACATTAACCTCTTTAATTATCTTTCGATCATGCGCGATTAAAGGTGAATATGCTAACCAATCTGTAGCGGCTTAGAAAGGATAAAATCAg < 2:2019757/149‑1 (MQ=255)
caATAAAAATGGCCCCAACCAGATAGGTCCAGTAATTCAGAACCCCGTATTCAGCGAACACATTAACCTCTTTAATTATCTTTCGATCATGCGCGATTAAAGGTGAATATGCTAACCAATCTGTAGCGGCTTAGAAAGGATAAAATCAg < 2:2776950/149‑1 (MQ=255)
acaaaTGGCCACAACCAGTTAGTTCCAGTAATTCATAACCCCGTATTCATCTAACACATTAACCTCTTTAATTATCTTTCGATCTTGAGCGATTAATTGTGATTATGCTTACCTATCTGTATAGGCTTAGAAAGGATAATATCTTGttt < 2:3709043/147‑1 (MQ=255)
aaaaaTGGCCCCACCCAGATAGGTCCAGTAATTCAGAACCCCGTATTCAGCGAACACATTAACCTCTTTAATTATCTTTCGATCATGCGCGATTAAAGGTGAATATGCTAACCAATCTGTAGCGGCTTAGAAAGGATAAAATCAGGttt < 2:839842/149‑1 (MQ=255)
aaaaTGGCCCCAACCAGATAGGTCCAGTAATTCAGAACCCCGTATTCAGCGAACACATTAACCTCTTTAATTATCTTTCGATCATGCGCGATTAAAGGTGAATATGCTAACCAATCTGTAGCGGCTTAGAAAGGATAAAATCAGGtttt < 2:693467/149‑1 (MQ=255)
aaaTGGCCCCAACCAGATAGGTCCAGTAATTCAGAACCCAGTATTCAGCGAACACATTAACCTCTTTAATTATCTTTCGATCATGCGCGATTAAAGGTGAATATGCTAACCAATCTGTAGCGGCTTAGAAAGGATAAAATCAGGTTTTa > 1:4011442/1‑149 (MQ=255)
aaTGGCCCCAACCAGATAGGTCCAGTAATTCAGAACCCCGTATTCAGCGAACACATTAACCTCTTTAATTATCTTTCGATCATGCGCGATTAAAGGTGAATATGCTAACCAATCTGTAGCGGCTTAGAAAGGATAAAATCAGGTTTTaa < 2:2658908/149‑1 (MQ=255)
aaTGGCCCCAACCAGATAGGTCCAGTAATTCAGAACCCCGTATTCAGCGAACACATTAACCTCTTTAATTATCTTTCGATCATGCGCGATTAAAGGTGAATATGCTAACCAATCTGTAGCGGCTTAGAAAGGATAAAATCAGGTTTTaa > 1:614916/1‑149 (MQ=255)
aTGGCCCCAACCAGATAGGTCCAGTAATTCAGAACCCCGTATTCAGCGAACACATTAACCTCTTTAATTATCTTTCGATCATGCGCGATTAAAGGTGAATATGCTAACCAATCTGTAGCGGCTTAGAAAGGATAAAATCAGGTTTTAAc < 1:733455/149‑1 (MQ=255)
tGGCCCCAACCAGATAGGTCCAGTAATTCAGAACCCCGTATTCAGCGAACACATTAACCTCTTTAATTATCTTTCGATCATGCGCGATTAAAGGTGAATATGCTAACCAATCTGTAGCGGCTTAGAAAGGATAAAATCAGGTTTTAAcc < 2:449869/149‑1 (MQ=255)
tGGCCCCAACCAGATAGGTCCAGTAATTCAGAACCCCGTATTCAGCGAACACATTAACCTCTTTAATTATCTTTCGATCATGCGCGATTAAAGGTGAATATGCTAACCAATCTGTAGCGGCTTAGAAAGGATAAAATCAGGTTTTAAcc < 1:2583448/149‑1 (MQ=255)
ccccAACCAGATAGGTCCAGTAATTCAGAACCCCGTATTCAGCGAACACATTAACCTCTTTAATTATCTTTCGATCATGCGCGATTAAAGGTGAATATGCTAACCAATCTGTAGCGGCTTAGAAAGGATAAAATCAGGTTTTAACCTGa < 2:2688674/149‑1 (MQ=255)
ccccAACCAGATAGGTCCAGTAATTCAGAACCCCGTATTCAGCGAACACATTAACCTCTTTAATTATCTTTCGATCATGCGCGATTAAAGGTGAATATGCTAACCAATCTGTAGCGGCTTAGAAAGGATAAAATCAGGTTTTAACCTGa > 1:2188175/1‑149 (MQ=255)
ccccAACCAGATAGGTCCAGTAATTCAGAACCCCGTATTCAGCGAACACATTAACCTCTTTAATTATCTTTCGATCATGCGCGATTAAAGGTGAATATGCTAACCAATCTGTAGCGGCTTAGAAAGGATAAAATCAGGTTTTAACCTGa < 1:1564913/149‑1 (MQ=255)
ccAACCAGATAGGTCCAGTAATTCAGAACCCCGTATTCAGCGAACACATTAACCTCTTTAATTATCTTTCGATCATGCGCGATTAAAGGTGAATATGCTAACCAATCTGTAGCGGCTTAGAAAGGATAAAATCAGGTTTTAACCTGata < 2:335669/149‑1 (MQ=255)
ccAACCAGATAGGTCCAGTAATTCAGAACCCCGTATTCAGCGAACACATTAACCTCTTTAATTATCTTTCGATCATGCGCGATTAAAGGTGAATATGCTAACCAATCTGTAGCGGCTTAGAAAGGATAAAATCAGGTTTTAACCTGata < 1:57524/149‑1 (MQ=255)
ccAACCAGATAGGTCCAGTAATTCAGAACCCCGTATTCAGCGAACACATTAACCTCTTTAATTATCTTTCGATCATGCGCGATTAAAGGTGAATATGCTAACCAATCTGTAGCGGCTTAGAAAGGATAAAATCAGGTTTTAACCTGata < 2:1310240/149‑1 (MQ=255)
cAACCAGATAGGTCCAGTAATTCAGAACCCCGTATTCAGCGAACACATTAACCTCTTTAATTATCTTTCGATCATGCGCGATTAAAGGTGAATATGCTAACCAATCTGTAGCGGCTTAGAAAGGATAAAATCAGGTTTTAACCTGatat < 2:1032014/149‑1 (MQ=255)
aaCCAGATAGGTCCATTAATTCAGAACCCCGTATTCAGCGAACACATTAACCTCTTTAATTATCTTTCGATCATGCGCGATTAAAGGTGAATATGCTAACCAATCTGTAGCGGCTTAGAAAGGATAAAATCAGGTTTTAACCTGATATc < 2:1649086/149‑1 (MQ=255)
aGATAGGTCCAGTAATTCAGAACCCCGTATTCAGCGAACACATTAACCTCTTTAATTATCTTTCGATCATGCGCGATTAAAGGTGAATATGCTAACCAATCTGTAGCGGCTTAGAAAGGATAAAATCAGGTTTTAACCTGATATCAAcc < 1:2666908/149‑1 (MQ=255)
ggTCCAGTAATTCAGAACCCCGTATTCAGCGAACACATTAACCTCTTTAATTATCTTTCGATCATGCGCGATTAAAGGTGAATATGCTAACCAATCTGTAGCGGCTTAGAAAGGATAAAATCAGGTTTTAACCTGATATCAACCCGATa > 2:4035901/1‑149 (MQ=255)
tCCAGTAATTCAGAACCCCGTATTCAGCGAACACATTAACCTCTTTAATTATCTTTCGATCATGCGCGATTAAAGGTGAATATGCTAACCAATCTGTAGCGGCTTAGAAAGGATAAAATCAGGTTTTAACCTGATATCAACCCGATAAt < 1:2326271/149‑1 (MQ=255)
tCCAGTAATTCAGAACCCCGTATTCAGCGAACACATTAACCTCTTTAATTATCTTTCGATCATGCGCGATTAAAGGTGAATATGCTAACCAATCTGTAGCGGCTTAGAAAGGATAAAATCAGGTTTTAACCTGATATCAACCCGATAAt < 2:2862789/149‑1 (MQ=255)
cAGTAATTCAGAACCCCGTATTCAGCGAACACATTAACCTCTTTAATTATCTTTCGATCATGCGCGATTAAAGGTGAATATGCTAACCAATCTGTAGCGGCTTAGAAAGGATAAAATCAGGTTTTAACCTGATATCAACCCGATAATTg > 2:61705/1‑149 (MQ=255)
gTAATTCAGAACCCCGTATTCAGCGAACACATTAACCTCTTTAATTATCTTTCGATCATGCGCGATTAAAGGTGAATATGCTAACCAATCTGTAGCGGCTTAGAAAGGATAAAATCAGGTTTTAACCTGATATCAACCCGATAATTGaa < 1:1804783/149‑1 (MQ=255)
aTTCAGAACCCCGTATTCAGCGAACACATTAACCTCTTTAATTATCTTTCGATCATGCGCGATTAAAGGTGAATATGCTAACCAATCTGTAGCGGCTTAGAAAGGATAAAATCAGGTTTTAACCTGATATCAACCCGATAATTGAATCa < 1:869976/149‑1 (MQ=255)
aTTCAGAACCCCGTATTCAGCGAACACATTAACCTCTTTAATTATCTTTCGATCATGCGCGATTAAAGGTGAATATGCTAACCAATCTGTAGCGGCTTAGAAAGGATAAAATCAGGTTTTAACCTGATATCAACCCGATAATTGAATCa < 1:31911/149‑1 (MQ=255)
aTTCAGAACCCCGTATTCAGCGAACACATTAACCTCTTTAATTATCTTTCGATCATGCGCGATTAAAGGTGAATATGCTAACCAATCTGTAGCGGCTTAGAAAGGATAAAATCAGGTTTTAACCTGATATCAACCCGATAATTGAATCa > 1:211353/1‑149 (MQ=255)
ttCAGAACCCCGTATTCAGCGAACACATTAACCTCTTTAATTATCTTTCGATCATGCGCGATTAAAGGTGAATATGCTAACCAATCTGTAGCGGCTTAGAAAGGATAAAATCAGGTTTTAACCTGATATCAACCCGATAATTGAATCAt < 2:947469/149‑1 (MQ=255)
gAACCCCGTATTCAGCGTACACATTAAACTCTTTAATTTTATTTCGATCATGCGCGATTAAAGGTGAATATGCTAACCAATCTGTAGCGGCTTAGAAAGGATAAAATCAGGTTTTAACCTGATATCAACCCGATAATTGAATCATTAAt < 1:2401099/149‑1 (MQ=255)
cccGTATTCAGCGAACACATTAACCTCTTTAATTATCTTTCGATCATGCGCGATTAAAGGTGAATATGCTAACCAATCTGTAGCTGCTTAGAAAGGATAAAATCAGGTTTTAACCTGATATCAACCCGATAATTGAATCATTAATCAgg > 2:2229649/1‑149 (MQ=255)
cccGTATTCAGCGAACACATTAACCTCTTTAATTATCTTTCGATCATGCGCGATTAAAGGTGAATATGCTAACCAATCTGTAGCGGCTTAGAAAGGATAAAATCAGGTTTTAACCTGATATCAACCCGATAATTGAATCATTAATCAgg < 1:1173440/149‑1 (MQ=255)
cccGTATTCAGCGAACACATTAACCTCTTTAATTATCTTTCGATCATGCGCGATTAAAGGTGAATATGCTAACCAATCTGTAGCGGCTTAGAAAGGATAAAATCAGGTTTTAACCTGATATCAACCCGATAATTGAATCATTAATCAgg < 1:2752426/149‑1 (MQ=255)
ccGTATTCAGCGAACACATTAACCTCTTTAATTATCTTTCGATCATGCGCGATTAAAGGTGAATATGCTAACCAATCTGTAGCGGCTTAGAAAGGATAAAATCAGGTTTTAACCTGATATCAACCCGATAATTGAATCATTAATCAGGc > 1:1967439/1‑149 (MQ=255)
aGCGAACACATTAACCTCTTTAATTATCTTTCGATCATGCGCGATTAAAGGTGAATATGCTAACCAATCTGTAGCGGCTTAGAAAGGATAAAATCAGGTTTTAACCTGATATCAACCCGATAATTGAATCATTAATCAGGCATGCTCCa < 1:2695053/149‑1 (MQ=255)
gCGAACACATTAACCTCTTTAATTATCTTTCGATCATGCGCGATTAAAGGTGAATATGCTAACCAATCTGTAGCGGCTTAGAAAGGATAAAATCAGGTTTTAACCTGATATCAACCCGATAATTGAATCATTAATCAGGCATGCTCCAg > 1:2572181/1‑149 (MQ=255)
gCGAACACATTAACCTCTTTAATTATCTTTCGATCATGCGCGATTAAAGGTGAATATGCTAACCAATCTGTAGCGGCTTAGAAAGGATAAAATCAGGTTTTAACCTGATATCAACCCGATAATTGAATCATTAATCAGGCATGCTCCAg < 1:1517337/149‑1 (MQ=255)
cGAACACATTAACCTCTTTAATTATCTTTCGATCATGCGCGATTAAAGGTGAATATGCTAACCAATCTGTAGCGGCTTAGAAAGGATAAAATCAGGTTTTAACCTGATATCAACCCGATAATTGAATCATTAATCAGGCATGCTCCAGt < 1:433097/149‑1 (MQ=255)
caTTAACCTCTTTAATTATCTTTCGATCATGCGCGATTAAAGGTGAATATGCTAACCAATCTGTAGCGGCTTAGAAAGGATAAAATCAGGTTTTAACCTGATATCAACCCGATAATTGAATCATTAATCAGGCATGCTCCAGTGaaaaa > 1:3567290/1‑149 (MQ=255)
ttAACCTCTTTAATTATCTTTCGATCATGCGCGATTAAAGGTGAATATGCTAACCAATCTGTAGCGGCTTAGAAAGGATAAAATCAGGTTTTAACCTGATATCAACCCGATAATTGAATCATTAATCAGGCATGCTCCAGTGAAAAAtt < 1:3770019/149‑1 (MQ=255)
tAACCTCTTTAATTATCTTTCGATCATGCGCGATTAAAGGTGAATATGCTAACCAATCTGTAGCGGCTTAGAAAGGATAAAATCAGGTTTTAACCTGATATCAACCCGATAATTGAATCATTAATCAGGCATGCTCCAGTGAAAAATTc < 1:2075840/149‑1 (MQ=255)
aaCCTCTTTAATTATCTTTCGATCATGCGCGATTAAAGGTGAATATGCTAACCAATCTGTAGCGGCTTAGAAAGGATAAAATCAGGTTTTAACCTGATATCAACCCGATAATTGAATCATTAATCAGGCATGCTCCAGTGAAAAATTCg > 2:2323812/1‑149 (MQ=255)
tccTCTTTAATTATCTTTCGATCATGCGCGATTAAAGGTGAATATGCTAACCAATCTGTAGCGGCTTAGAAAGGATAAAATCAGGTTTTAACCTGATATCAACCCGATAATTGAATCATTAATCAGGCATGCTCCAGTGAAAAATTCgg < 1:1122996/148‑1 (MQ=255)
tttAATTATCTTTCGATCATGCGCGATTAAAGGTGAATATGCTAACCAATCTGTAGCGGCTTAGAAAGGATAAAATCAGGTTTTAACCTGATATCAACCCGATAATTGAATCATTAATCAGGCATGCTCCAGTGAAAAATTCGGGTAGt > 1:354852/1‑149 (MQ=255)
tttAATTATCTTTCGATCATGCGCGATTAAAGGTGAATATGCTAACCAATCTGTAGCGGCTTAGAAAGGATAAAATCAGGTTTTAACCTGATATCAACCCGATAATTGAATCATTAATCAGGCATGCTCCAGTGAAAAATTCGGGTAGt < 2:2048670/149‑1 (MQ=255)
aaTTATCTTTCGATCATGCGCGATTAAAGGTGAATATGCTAACCAATCTGTAGCGGCTTAGAAAGGATAAAATCAGGTTTTAACCTGATATCAACCCGATAATTGAATCATTAATCAGGCATGCTCCAGTGAAAAATTCGGGTAGTGCt < 2:3180526/149‑1 (MQ=255)
aTTATCTTTCGATCATGCGCGATTAAAGGTGAATATGCTAACCAATCTGTAGCGGCTTAGAAAGGATAAAATCAGGTTTTAACCTGATATCAACCCGATAATTGAATCATTAATCAGGCATGCTCCAGTGAAAAATTCGGGTAGTGCTc > 1:1499971/1‑149 (MQ=255)
aTTATCTTTCGATCAAGCGCGATTAAAGGTTAATATGCTAACCAATCTGTAGCGGCTTAGAAAGGATAAAAACAGGTTTTAACCTGATATCAACACGATAATAGAATCATTAATCAGGCATGATCCAGAGAAAAATTCGGTTAGTGCTc > 1:62786/1‑149 (MQ=255)
ttATCTTTCGATCATGCGCGATTAAAGGTGAATATGCTAACCAATCTGTAGCGGCTTAGAAAGGATAAAATCAGGTTTTAACCTGATATCAACCCGATAATTGAATCATTAATCAGGCATGCTCCAGTGAAAAATTCGGGTAGTGCTCg > 2:2814717/1‑149 (MQ=255)
ttATCTTTCGATCATGCGCGATTAAAGGTGAATATGCTAACCAATCTGTAGCGGCTTAGAAAGGATAAAATCAGGTTTTAACCTGATATCAACCCGATAATTGAATCATTAATCAGGCATGCTCCAGTGAAAAATTCGGGTAGTGCTCg > 2:1251255/1‑149 (MQ=255)
ttATCTTTCGATCATGCGCGATTAAAGGTGAAGATGCTAACCAATCTGTCGCGGCTTAGAAAGGATAAAATCAGGTTTTAACCTGATATCAACCCGATAATTGAATCATTAATCAGGCATGCTCCAGTGCAACATTCGGGTAGTGCTCg > 2:2575156/1‑149 (MQ=255)
tCTTTCGATCATGCGCGATTAAAGGTGAATATGCTAACCAATCTGTAGCGGCTTAGAAAGGATAAAATCAGGTTTTAACCTGATATCAACCCGATAATTGAATCATTAATCAGGCATGCTCCAGTGAAAAATTCGGGTAGTGCTCGGCa > 2:121443/1‑149 (MQ=255)
tttCGATCATGCGCGATTAAAGGTGAATATGCTAACCAATCTGTAGCGGCTTAGAAAGGATAAAATCAGGTTTTAACCTGATATCAACCCGATAATTGAATCATTAATCAGGCATGCTCCAGTGAAAAATTCTGGTAGTGCTCGGCaaa > 2:3001421/1‑149 (MQ=255)
gATCATGCGCGATTAAAGGTGAATATGCTAACCAATCTGTAGCGGCTTAGAAAGGATAAAATCAGGTTTTAACCTGATATCAACCCGATAATTGAATCATTAATCAGGCATGCTCCAGTGAAAAATTCGGGTAGTGCTCGGCAAAATAc < 1:3213609/149‑1 (MQ=255)
gATCATGCGCGATTAAAGGTGAAGATGCTAACCAATCTGTAGCGGCTTAGAAAGGATAAAATCAGGTTTTAACCTGATATCAACCCGATAATTGAATCATTAATCAGGCATGCTCCAGTGAAAAATTCGGGTAGTGCTCGGCAAAATAc < 2:2880870/149‑1 (MQ=255)
gATAATGCGCGAATAAAGGTGTATATGCTAACCACTCCGTAGCGGCTTAGAAATTATAAAATCAGGTTTTCACCTGATATCAACCCGATAATTGAATCATTAATCAGGGATGCTCCAGTTTAAACTTCGGGTAGTGCTCGGCAAAATAc < 2:3309484/149‑1 (MQ=255)
aTCATGCGCGATTAAAGGTGAATATGCTAACCAATCTGTAGCGGCTTAGAAAGGATAAAATCAGGTTTTAACCTGATATCAACCCGATAATTGAATCATTAATCAGGCATGCTCCAGTGAAAAATTCGGGTAGTGCTCGGCAAAATACt > 2:1888528/1‑149 (MQ=255)
aTCATGCGCGATTAAAGGTGAATATGCTAACCAATCTGTAGCGGCTTAGAAAGGATAAAATCAGGTTTTAACCTGATATCAACCCGATAATTGAATCATTAATCAGGCATGCTCCAGTGAAAAATTCGGGAAGTGCTCGGAAAAATACt > 2:3291527/1‑149 (MQ=255)
tCATGCGCGATTAAATGTGAATATGCTAACCAATCTGTAGCGGCTTAGAAAGGATAAAATCAGGTTTTAACCTGATATCAACCCGATAATTGAATCATTAATCAGGCATGCTCCAGTGAAAAATTCGGGTAGTGCTCGGCAAAATACTg < 2:4011442/149‑1 (MQ=255)
tGCGCGATTAAAGGTGAATATGCTAACCAATCTGTAGCGGCTTATAAAGGATAAAATCAGGTTTTAACCTGATATCAACCCGATAATTGAATCATTAATCAGGCATGCTCCAGTGAAAAATTCGGGTAGTGCTCGGAAAAATACTGGCg < 2:3576075/149‑1 (MQ=255)
gcgATTAAAGGTGAATATGCTAACCAATCTGTAGCGGCTTAGAAAGGATAAAATCAGGTTTTAACCTGATATCAACCCGATAATTGAATCATTAATCAGGCATGCTCCAGTGAAAAATTCGGGTAGTGCTCGGCAAAATACTGGCGTaa > 1:1748329/1‑149 (MQ=255)
ttAAAGGTGAATATGCTAACCAATCTGTAGCGGCTTAGAAAGGATAAAATCAGGTTTTAACCTGATATCAACCCGATAATTGAATCATTAATCAGGCATGCTCCAGTGAAAAATTCGGGTAGTGCTCGGCAAAATACTGGCGTAAAAAt > 1:2819305/1‑149 (MQ=255)
ttAAAGGTGAATATGCTAACCAATCTGTAGCGGCTTAGAAAGGATAAAATCAGGTTTTAACCTGATATCAACCCGATAATTGAATCATTAATCAGGCATGCTCCAGTGAAAAATTCGGGTAGTGCTCGGCAAAATACTGGCGTAAAAAt < 2:463380/149‑1 (MQ=255)
aaaGGTGAATATGCTAACCAATCTGTAGCGGCTTAGAAAGGATAAAATCAGGTTTTAACCTGATATCAACCCGATAATTGAATCATTAATCAGGCATGCTCCAGTGAAAAATTCGGGTAGTGCTCGGCAAAATACTGGCGTAAAAATTc < 2:2621287/149‑1 (MQ=255)
aGGTGAATATGCTAACCAATCTGTAGCGGCTTAGAAAGGATAAAATCAGGTTTTAACCTGATATCAACCCGATAATTGAATCATTAATCAGGCATGCTCCAGTGAAAAATTCGGGTAGTGCTCGGCAAAATACTGGCGTAAAAATTCTa > 1:1784718/1‑149 (MQ=255)
gTGAATATGCTAACCAATCTGTAGCGGCTTAGAAAGGATAAAATCAGGTTTTAACCTGATATCAACCCGATAATTGAATCATTAATCAGGCATGCTCCAGTGAAAAATTCGGGTAGTGCTCGGCAAAATACTGGCGTAAAAATTCTAcc > 1:636341/1‑149 (MQ=255)
gTGAATATGCTAACCAATCTGTAGCGGCTTAGAAAGGATAAAATCAGGTTTTAACCTGATATCAACCCGATAATTGAATCATTAATCAGGCATGCTCCAGTGAAAAATTCGGGTAGTGCTCGGCAAAATACTGGCGTAAAAATTCTAcc < 2:3409390/149‑1 (MQ=255)
gAATATGCTAACCAATCTGTAGCGGCTTAGAAAGGATAATATCAGGTTTTAACCTGATATCAACCCGATAATTGAATCATTAATCAGGCATGCTACAGTGAAAAATTCGGGTAGTGCTCGGCAAAATACTGGCGTAAAAATTCTACCGt < 1:730815/149‑1 (MQ=255)
aaTATGCTAACCAATCTGTAGCGGCTTAGAAAGGATAAAATCAGGTTTTAACCTGATATCAACCCGATAATTGAATCATTAATCAGGCATGCTCCAGTGAAAAATTCGGGTAGTGCTCGGCAAAATACTGGCGTAAAAATTCTACCGtt < 1:2147853/149‑1 (MQ=255)
aaTATGCTAACCAATCTGTAGCGGCTTAGAAAGGATAAAATCAGGTTTTAACCTGATATCAACCCGATAATTGAATCATTAATCAGGCATGCTCCAGTGAAAAATTCGGGTAGTGCTCGGCAAAATACTGGCGTAAAAATTCTACCGtt < 1:4043681/149‑1 (MQ=255)
tGCTAACCAATCTGTAGCGGCTTAGAAAGGATAAAATCAGGTTTTAACCTGATATCAACCCGATAATTGAATCATTAATCAGGCATGCTCCAGTGAAAAATTCGGGTAGTGCTCGGCAAAATACTGGCGTAAAAATTCTACCGTTATcc > 1:3093668/1‑149 (MQ=255)
tGCTAACCAATCTGTAGCGGCTTAGAAAGGATAAAATCAGGTTTTAACCTGATATCAACCCGATAATTGAATCATTAATCAGGCATGCTCCAGTGAAAAATTCGGGTAGTGCTCGGCAAAATACTGGCGTAAAAATTCTACCGTTATcc > 1:669997/1‑149 (MQ=255)
gCTAACCAATCTGTAGCGGCTTAGAAAGGATAAAATCAGGTTTTAACCTGATATCAACCCGATAATTGAATCATTAATCAGGCATGCTCCAGTGAAAAATTCGGGTAGTGCTCGGCAAAATACTGGCGTAAAAATTCTACCGTTATCCg > 2:1864917/1‑149 (MQ=255)
cTAACCAATCTGTAGCGGCTTAGAAAGGATAAAATCAGGTTTTAACCTGATATCAACCCGATAATTGAATCATTAATCAGGCATGCTCCAGTGAAAAATTCGGGTAGTGCTCGGCAAAATACTGGCGTAAAAATTCTACCGTTATCCGc > 1:163100/1‑149 (MQ=255)
cTAAACAATCTGTAGCGGCTTAGAAAGCATAAAATCAGGATTTAACCTGATATCAACCCGATAAATGAATCATTAATCAGTCATGCTCCAGAGAAAAATACGGGTAGTGATCTGCAAAATACTGGCTTAAAAATTATACCGTTATCCGc > 2:137689/1‑149 (MQ=255)
tAACCAATCTGTAGCGGCTTAGAAAGGATAAAATCAGGTTTTAACCTGATATCAACCCGATAATTGAATCATTAATCAGGCATGCTCCAGTGAAAAATTCGGGTAGTGCTCGGCAAAATACTGGCGTAAAAATTCTACCGTTATCCGCa < 2:614916/149‑1 (MQ=255)
tAACCAATCTGTAGCGGCTTAGAAAGGATAAAATCAGGTTTTAACCTGATATCAACCCGATAATTGAATCATTAATCAGGCATGCTCCAGTGAAAAATTCGGGTAGTGCTCGGCAAAATACTGGCGTAAAAATTCTACCGTTATCCGCa > 1:892203/1‑149 (MQ=255)
aaCCAATCTGTAGCGGCTTAGAAAGGATAAAATCAGGTTTTAACCTGATATCAACCCGATAATTGAATCATTAATCAGGCATGCTCCAGTGAAAAATTCGGGTAGTGCTCGGCAAAATACTGGCGTAAAAATTCTACCGTTATCCGCAc > 1:3093986/1‑149 (MQ=255)
aCCAATCTGTAGCGGCTTAGAAAGGATAAAATCAGGTTTTAACCTGATATCAACCCGATAATTGAATCATTAATCAGGCATGCTCCAGTGAAAAATTCGGGTAGTGCTCGGCAAAATACTGGCGTAAAAATTCTACCGTTATCCGCACt > 1:1292587/1‑149 (MQ=255)
aCCAATCTGTAGCGGCTTAGAAAGGATAAAATCAGGTTTTAACCTGATATCAACCCGATAATTGAATCATTAATCAGGCATGCTCCAGTGAAAAATTCGGGTAGTGCTCGGCAAAATACTGGCGTAAAAATTCTACCGTTATCCGCACt > 1:3582284/1‑149 (MQ=255)
tGTAGCGGCTTAGAAAGGATAAAATCAGGTTTTAACCTGATATCAACCCGATAATTGAATCATTAATCAGGCATGCTCCAGTGAAAAATTCGGGTAGTGCTCGGCAAAATACTGGCGTAAAAATTCTACCGTTATCCGCACTTTCGCTg < 1:1877279/149‑1 (MQ=255)
tGTAGCGGCTTAGAAAGGAGAAAATTAGGTTTTAACCCGATATCAACCCGATAATTGAATAATTAATCAGGCATGCTCCAGTGAAAAATTCGGGTAGTGCTCGGCAAAATACTGGCGTAAAAATTCTACCGTTATCCGCACTTTCGCTg > 2:2717573/1‑149 (MQ=255)
gTAGCGGCTTAGAAAGGATAAAATCAGGTTTTAACCTGATATCAACCCGATAATTGAATCATTAATCAGGCATGCTCCAGTGAAAAATTCGGGTAGTGCTCGGCAAAATACTGGCGTAAAAATTCTACCGTTATCCGCACTTTCGCTGa < 2:2401743/149‑1 (MQ=255)
aGCGGCTTAGAAAGGATAAAATCAGGTTTTAACCTGATATCAACCCGATAATTGAATCATTAATCAGGCATGCTCCAGTGAAAAATTCGGGTAGTGCTCGGCAAAATACTGGCGTAAAAATTCTACCGTTATCCGCACTTTCGCTGACg > 1:1404938/1‑149 (MQ=255)
aGCGGCTTAGAAAGGATAAAATCAGGTTTTAACCTGATATCAACCCGATAATTGAATCATTAATCAGGCATGCTCCAGTGAAAAATTCGGGTAGTGCTCGGCAAAATACTGGCGTAAAAATTCTACCGTTATCCGCACTTTCGCTGACg > 1:1033586/1‑149 (MQ=255)
gCTTAGAAAGGATAAAATCAGGTTTTAACCTGATATCAACCCGATAATTGAATCATTAATCAGGCATGCTCCAGTGAAAAATTCGGGTAGTGCTCGGCAAAATACTGGCGTAAAAATTCTACCGTTATCCGCACTTTCGCTGACGTCGc > 2:4052248/1‑149 (MQ=255)
gCTTAGAAAGGATAAAATCAGGTTTTAACCTGATATCAACCCGATAATTGAATCATTAATCAGGCATGCTCCAGTGAAAAATTCGGGTAGTGCTCGGCAAAATACTGGCGTAAAAATTCTACCGTTATCCGCACTTTCGCTGACGTCGc > 2:85073/1‑149 (MQ=255)
cTTAGAAAGGATAAAATCAGGTTTTAACCTGATATCAACCCGATAATTGAATCATTAATCAGGCATGCTCCAGTGAAAAATTCGGGTAGTGCTCGGCAAAATACTGGCGTAAAAATTCTACCGTTATCCGCACTTTCGCTGACGTCGcc > 2:2208099/1‑149 (MQ=255)
cTTAGAAAGGATAAAATCAGGTTTTAACCTGATATCAACCCGATAATTGAATCATTAATCAGGCATGCTCCAGTGAAAAATTCGGGTAGTGCTCGGCAAAATACTGGCGTAAAAATTCTACCGTTATCCGCACTTTCGCTGACGTCGcc < 2:930209/149‑1 (MQ=255)
ttAGAAAGGATAAAATCAGGTTTTAACCTGATATCAACCCGATAATTGAATCATTAATCAGGCATGCTCCAGTGAAAAATTCGGGTAGTGCTCGGCAAAATACTGGCGTAAAAATTCTACCGTTATCCGCACTTTCGCTGACGTCGCCa > 2:3973999/1‑149 (MQ=255)
ttAGAAAGGATAAAATCAGGTTTTAACCTGATATCAACCCGATAATTGAATCATTAATCAGGCATGCTCCAGTGAAAAATTCGGGTAGTGCTCGGCAAAATACTGGCGTAAAAATTCTACCGTTATCCGCACTTTCGCTGACGTCGCCa < 1:1977278/149‑1 (MQ=255)
gAAAGGATAAAATCAGGTTTTAACCTGATATCAACCCGATAATTGAATCATTAATCAGGCATGCTCCAGTGAAAAATTCGGGTAGTGCTCGGCAAAATACTGGCGTAAAAATTCTACCGTTATCCGCACTTTCGCTGACGTCGCCAGcc > 1:3454129/1‑149 (MQ=255)
|
CCAACACAATAAAAATGGCCCCAACCAGATAGGTCCAGTAATTCAGAACCCCGTATTCAGCGAACACATTAACCTCTTTAATTATCTTTCGATCATGCGCGATTAAAGGTGAATATGCTAACCAATCTGTAGCGGCTTAGAAAGGAGAAAATCAGGTTTTAACCTGATATCAACCCGATAATTGAATCATTAATCAGGCATGCTCCAGTGAAAAATTCGGGTAGTGCTCGGCAAAATACTGGCGTAAAAATTCTACCGTTATCCGCACTTTCGCTGACGTCGCCAGCCTTGA > CP009273/1874950‑1875241
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 11 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
GATK/CNVnator alignment
BRESEQ :: bam2aln output
GCACCAACACAATAAAAATGGCCCCAACCAGATAGGTCCAGTAATTCAGAACCCCGTATTCAGCGAACACATTAACCTCTTTAATTATCTTTCGATCATGCGCGATTAAAGGTGAATATGCTAACCAATCTGTAGCGGCTTAGAAAGGAGAAAATCAGGTTTTAACCTGATATCAACCCGATAATTGAATCATTAATCAGGCATGCTCCAGTGAAAAATTCGGGTAGTGCTCGGCAAAATACTGGCGTAAAAATTCTACCGTTATCCGCACTTTCGCTGACGTCGCCAGCCTTGAAA > CP009273/1874947‑1875243
|
GCACCAACACAATAAAAATGGCCCCAACCAGATAGGTCCAGTAATTCAGAACCCCGTATTCAGCGAACACATTAACCTCTTTAATTATCTTTCGATCATGCGCGATTAAAGGTGAATATGCTAACCAATCTGTAGCGGCTTAGAAAGGAT < SRR19973068.533393/150‑1 (MQ=60)
CCAACACAATAAAAATGGCCCCAACCAGATAGGTCCAGTAATTCAGAACCCCGTATTCAGCGAACACATTAACCTCTTTAATTATCTTTCGATCATGCGCGATTAAAGGTGAATATGCTAACCAATCTGTAGCGGCTTAGAAAGGATAAA < SRR19973068.4051401/150‑1 (MQ=60)
CCAACACAATAAAAATGGCCCCAACCAGATAGGTCCAGTAATTCAGAACCCCGTATTCAGCGAACACATTAACCTCTTTAATTATCTTTCGATCATGCGCGATTAAAGGTGAATATGCTAACCAATCTGTAGCGGCTTAGAAAGGATAAA < SRR19973068.824203/150‑1 (MQ=60)
CAACACAATAAAAATGGCCCCAACCAGATAGGTCCAGTAATTCAGAACCCCGTATTCAGCGAACACATTAACCTCTTTAATTATCTTTCGATCATGCGCGATTAAAGGTGAATATGCTAACCAATCTGTAGCGGCTTAGAAAGGATAAAA < SRR19973068.2993836/150‑1 (MQ=60)
CAACACAATAAAAATGGCCCCAACCAGATAGGTCCAGTAATTCAGAACCCCGTATTCAGCGAACACATTAACCTCTTTAATTATCTTTCGATCATGCGCGATTAAAGGTGAATATGCTAACCAATCTGTAGCGGCTTAGAAAGGATAAAA > SRR19973068.1449902/1‑150 (MQ=60)
CAACACAATAAAAATGGCCCCAACCAGATAGGTCCAGTAATTCAGAACCCCGTATTCAGCGAACACATTAACCTCTTTAATTATCTTTCGATCATGCGCGATTAAAGGTGAATATGCTAACCAATCTGTAGCGGCTTAGAAAGGATAAAA > SRR19973068.1449860/1‑150 (MQ=60)
AACACAATAAAAATGGCCCCAACCAGATAGGTCCAGTAATTCAGAACCCCGTATTCAGCGAACACATTAACCTCTTTAATTATCTTTCGATCATGCGCGATTAAAGGTGAATATGCTAACCAATCTGTAGCGGCTTAGAAAGGATAAAAT > SRR19973068.3031936/1‑150 (MQ=60)
AACACAATAAAAATGGCCCCAACCAGATAGGTCCAGTAATTCAGAACCCCGTATTCAGCGAACACATTAACCTCTTTAATTATCTTTCGATCATGCGCGATTAAAGGTGAATATGCTAACCAATCTGTAGCGGCTTAGAAAGGATAAAAT > SRR19973068.3035607/1‑150 (MQ=60)
ACACAATAAAAATGGCCCCAACCAGATAGGTCCAGTAATTCAGAACCCCGTATTCAGCGAACACATTAACCTCTTTAATTATCTTTCGATCATGCGCGATTAAAGGTGAATATGCTAACCAATCTGTAGCGGCTTAGAAAGGATAAAATC < SRR19973068.2057531/150‑1 (MQ=60)
CACAATAAAAATGGCCCCAACCAGATAGGTCCAGTAATTCAGAACCCCGTATTCAGCGAACACATTAACCTCTTTAATTATCTTTCGATCATGCGCGATTAAAGGTGAATATGCTAACCAATCTGTAGCGGCTTAGAAAGGATAAAATCA < SRR19973068.225368/150‑1 (MQ=60)
CACAATAAAAATGGCCCCAACCAGATAGGTCCAGTAATTCAGAACCCCGTATTCAGCGAACACATTAACCTCTTTAATTATCTTTCGATCATGCGCGATTAAAGGTGAATATGCTAACCAATCTGTAGCGGCTTAGAAAGGATAAAATCA < SRR19973068.3425856/150‑1 (MQ=60)
ACAATAAAAATGGCCCCAACCAGATAGGTCCAGTAATTCAGAACCCCGTATTCAGCGAACACATTAACCTCTTTAATTATCTTTCGATCATGCGCGATTAAAGGTGAATATGCTAACCAATCTGTAGCGGCTTAGACAGGATAAAATCAG > SRR19973068.3597797/1‑150 (MQ=60)
ACAATAAAAATGGCCCCAACCAGATAGGTCCAGTAATTCAGAACCCCGTATTCAGCGAACACATTAACCTCTTTAATTATCTTTCGATCATGCGCGATTAAAGGTGAATATGCTAACCAATCTGTAGCGGCTTAGAAAGGATAAAATCAG > SRR19973068.3062704/1‑150 (MQ=60)
ACAATAAAAATGGCCCCAACCAGATAGGTCCAGTAATTCAGAACCCCGTATTCAGCGAACACATTAACCTCTTTAATTATCTTTCGATCATGCGCGATTAAAGGTGAATATGCTAACCAATCTGTAGCGGCTTAGAAAGGATAAAATCAG < SRR19973068.4113877/150‑1 (MQ=60)
ATAAAAATGGCCCCAACCAGATAGGTCCAGTAATTCAGAACCCCGTATTCAGCGAACACATTAACCTCTTTAATTATCTTTCGATCATGCGCGATTAAAGGTGAATATGCTAACCAATCTGTAGCGGCTTAGAAAGGATAAAATCAGGTT > SRR19973068.3303939/1‑150 (MQ=60)
AAAATGGCCCCAACCAGATAGGTCCAGTAATTCAGAACCCAGTATTCAGCGAACACATTAACCTCTTTAATTATCTTTCGATCATGCGCGATTAAAGGTGAATATGCTAACCAATCTGTAGCGGATTAGAAAGGATAAAATCAGGTTTTA > SRR19973068.4035672/1‑150 (MQ=60)
AAATGGCCCCAACCAGATAGGTCCAGTAATTCAGAACCCCGTATTCAGCGAACACATTAACCTCTTTAATTATCTTTCGATCATGCGCGATTAAAGGTGAATATGCTAACCAATCTGTAGCGGCTTAGAAAGGATAAAATCAGGTTTTAA > SRR19973068.619018/1‑150 (MQ=60)
AAATGGCCCCAACCAGATAGGTCCAGTAATTCAGAACCCCGTATTCAGCGAACACATTAACCTCTTTAATTATCTTTCGATCATGCGCGATTAAAGGTGAATATGCTAACCAATCTGTAGCGGCTTAGAAAGGATAAAATCAGGTTTTAA > SRR19973068.619394/1‑150 (MQ=60)
ATGGCCCCAACCAGATAGGTCCAGTAATTCAGAACCCCGTATTCAGCGAACACATTAACCTCTTTAATTATCTTTCGATCATGCGCGATTAAAGGTGAATATGCTAACCAATCTGTAGCGGCTTAGAAAGGATAAAATCAGGTTTTAACC < SRR19973068.738304/150‑1 (MQ=60)
ATGGCCCCAACCAGATAGGTCCAGTAATTCAGAACCCCGTATTCAGCGAACACATTAACCTCTTTAATTATCTTTCGATCATGCGCGATTAAAGGTGAATATGCTAACCAATCTGTAGCGGCTTAGAAAGGATAAAATCAGGTTTTAACC < SRR19973068.738179/150‑1 (MQ=60)
TGGCCCCAACCAGATAGGTCCAGTAATTCAGAACCCCGTATTCAGCGAACACATTAACCTCTTTAATTATCTTTCGATCATGCGCGATTAAAGGTGAATATGCTAACCAATCTGTAGCGGCTTAGAAAGGATAAAATCAGGTTTTAACCT < SRR19973068.2599775/150‑1 (MQ=60)
TGGCCCCAACCAGATAGGTCCAGTAATTCAGAACCCCGTATTCAGCGAACACATTAACCTCTTTAATTATCTTTCGATCATGCGCGATTAAAGGTGAATATGCTAACCAATCTGTAGCGGCTTAGAAAGGATAAAATCAGGTTTTAACCT < SRR19973068.2602845/150‑1 (MQ=60)
GCCCCAACCAGATAGGTCCAGTAATTCAGAACCCCGTATTCAGCGAACACATTAACCTCTTTAATTATCTTTCGATCATGCGCGATTAAAGGTGAATATGCTAACCAATCTGTAGCGGCTTAGAAAGGATAAAATCAGGTTTTAACCTGA > SRR19973068.2202489/1‑150 (MQ=60)
CCCCAACCAGATAGGTCCAGTAATTCAGAACCCCGTATTCAGCGAACACATTAACCTCTTTAATTATCTTTCGATCATGCGCGATTAAAGGTGAATATGCTAACCAATCTGTAGCGGCTTAGAAAGGATAAAATCAGGTTTTAACCTGAT < SRR19973068.1665736/150‑1 (MQ=60)
CCCCAACCAGATAGGTCCAGTAATTCAGAACCCCGTATTCAGCGAACACATTAACCTCTTTAATTATCTTTCGATCATGCGCGATTAAAGGTGAATATGCTAACCAATCTGTAGCGGCTTAGAAAGGATAAAATCAGGTTTTAACCTGAT < SRR19973068.1666474/150‑1 (MQ=60)
CCCCAACCAGATAGGTCCAGTAATTCAGAACCCCGTATTCAGCGAACACATTAACCTCTTTAATTATCTTTCGATCATGCGCGATTAAAGGTGAATATGCTAACCAATCTGTAGCGGCTTAGAAAGGATAAAATCAGGTTTTAACCTGAT < SRR19973068.1575208/150‑1 (MQ=60)
CCCCAACCAGATAGGTCCAGTAATTCAGAACCCCGTATTCAGCGAACACATTAACCTCTTTAATTATCTTTCGATCATGCGCGATTAAAGGTGAATATGCTAACCAATCTGTAGCGGCTTAGAAAGGATAAAATCAGGTTTTAACCTGAT < SRR19973068.1569655/150‑1 (MQ=60)
CCAACCAGATAGGTCCAGTAATTCAGAACCCCGTATTCAGCGAACACATTAACCTCTTTAATTATCTTTCGATCATGCGCGATTAAAGGTGAATATGCTAACCAATCTGTAGCGGCTTAGAAAGGATAAAATCAGGTTTTAACCTGATAT < SRR19973068.58207/150‑1 (MQ=60)
AACCAGATAGGTCCAGTAATTCAGAACCCCGTATTCAGCGAACACATTAACCTCTTTAATTATCTTTCGATCATGCGCGATTAAAGGTGAATATGCTAACCAATCTGTAGCGGCTTAGAAAGGATAAAATCAGGTTTTAACCTGATATCA < SRR19973068.323290/150‑1 (MQ=60)
AGATAGGTCCAGTAATTCAGAACCCCGTATTCAGCGAACACATTAACCTCTTTAATTATCTTTCGATCATGCGCGATTAAAGGTGAATATGCTAACCAATCTGTAGCGGCTTAGAAAGGATAAAATCAGGTTTTAACCTGATATCAACCC < SRR19973068.2683650/150‑1 (MQ=60)
AGATAGGTCCAGTAATTCAGAACCCCGTATTCAGCGAACACATTAACCTCTTTAATTATCTTTCGATCATGCGCGATTAAAGGTGAATATGCTAACCAATCTGTAGCGGCTTAGAAAGGATAAAATCAGGTTTTAACCTGATATCAACCC < SRR19973068.2683560/150‑1 (MQ=60)
AGATAGGTCCAGTAATTCAGAACCCCGTATTCAGCGAACACATTAACCTCTTTAATTATCTTTCGATCATGCGCGATTAAAGGTGAATATGCTAACCAATCTGTAGCGGCTTAGAAAGGATAAAATCAGGTTTTAACCTGATATCAACCC > SRR19973068.673432/1‑150 (MQ=60)
AGATAGGTCCAGTAATTCAGAACCCCGTATTCAGCGAACACATTAACCTCTTTAATTATCTTTCGATCATGCGCGATTAAAGGTGAATATGCTAACCAATCTGTAGCGGCTTAGAAAGGATAAAATCAGGTTTTAACCTGATATCAACCC > SRR19973068.2335602/1‑150 (MQ=60)
AGGTCCAGTAATTCAGAACCCCGTATTCAGCGAACACATTAACCTCTTTAATTATCTTTCGATCATGCGCGATTAAAGGTGAATATGCTAACCAATCTGTAGCGGCTTAGAAAGGATAAAATCAGGTTTTAACCTGATATCAACCCGATA < SRR19973068.1168797/150‑1 (MQ=60)
TCCAGTAATTCAGAACCCCGTATTCAGCGAACACATTAACCTCTTTAATTATCTTTCGATCATGCGCGATTAAAGGTGAATATGCTAACCAATCTGTAGCGGCTTAGAAAGGATAAAATCAGGTTTTAACCTGATATCAACCCGATAATT < SRR19973068.2341254/150‑1 (MQ=60)
CAGTAATTCAGAACCCCGTATTCAGCGAACACATTAACCTCTTTAATTATCTTTCGATCATGCGCGATTAAAGGTGAATATGCTAACCAATCTGTAGCGGCTTAGAAAGGATAAAATCAGGTTTTAACCTGATATCAACCCGATAATTGA < SRR19973068.213494/150‑1 (MQ=60)
GTAATTCAGAACCCCGTATTCAGCGAACACATTAACCTCTTTAATTATCTTTCGATCATGCGCGATTAAAGGTGAATATGCTAACCAATCTGTAGCGGCTTAGAAAGGATAAAATCAGGTTTTAACCTGATATCAACCCGATAATTGAAT < SRR19973068.1816612/150‑1 (MQ=60)
AATTCAGAACCCCGTATTCAGCGAACACATTAACCTCTTTAATTATCTTTCGATCATGCGCGATTAAAGGTGAATATGCTAACCAATCTGTAGCGGCTTAGAAAGGATAAAATCAGGTTTTAACCTGATATCAACCCGATAATTGAATCA > SRR19973068.212957/1‑150 (MQ=60)
ATTCAGAACCCCGTATTCAGCGAACACATTAACCTCTTTAATTATCTTTCGATCATGCGCGATTAAAGGTGAATATGCTAACCAATCTGTAGCGGCTTAGAAAGGATAAAATCAGGTTTTAACCTGATATCAACCCGATAATTGAATCAT < SRR19973068.875883/150‑1 (MQ=60)
ATTCAGAACCCCGTATTCAGCGAACACATTAACCTCTTTAATTATCTTTCGATCATGCGCGATTAAAGGTGAATATGCTAACCAATCTGTAGCGGCTTAGAAAGGATAAAATCAGGTTTTAACCTGATATCAACCCGATAATTGAATCAT < SRR19973068.875896/150‑1 (MQ=60)
ATTCAGAACCCCGTATTCAGCGAACACATTAACCTCTTTAATTATCTTTCGATCATGCGCGATTAAAGGTGAATATGCTAACCAATCTGTAGCGGCTTAGAAAGGATAAAATCAGGTTTTAACCTGATATCAACCCGATAATTGAATCAT < SRR19973068.32336/150‑1 (MQ=60)
TCAGAACCCCGTATTCAGCGAACACATTAACCTCTTTAATTATCTTTCGATCATGCGCGATTAAAGGTGAATATGCTAACCAATCTGTAGCGGCTTAGAAAGGATAAAATCAGGTTTTAACCTGATATCAACCCGATAATTGAATCATTA < SRR19973068.185271/150‑1 (MQ=60)
CAGAACCCCGTATTCAGCGAACACATTAACCTCTTTAATTATCTTTCGATCATGCGCGATTAAAGGTGAATATGCTAACCAATCTGTAGCGGCTTAGAAAGGATAAAATCAGGTTTTAACCTGATATCAACCCGATAATTGAATCATTAA < SRR19973068.727466/150‑1 (MQ=60)
AGAACCCCGTATTCAGCGAACACATTAACCTCTTTAATTATCTTTCGATCATGCGCGATTAAAGGTGAATATGCTAACCAATCTGTAGCGGCTTAGAAAGGATAAAATCAGGTTTTAACCTGATATCAACCCGATAATTGAATCATTAAT > SRR19973068.1049012/1‑150 (MQ=60)
GAACCCCGTATTCAGCGTACACATTAAACTCTTTAATTTTATTTCGATCATGCGCGATTAAAGGTGAATATGCTAACCAATCTGTAGCGGCTTAGAAAGGATAAAATCAGGTTTTAACCTGATATCAACCCGATAATTGAATCATTAATC < SRR19973068.2416357/150‑1 (MQ=60)
AACCCCGTATTCAGCGAACACATTAACCTCTTTAATTATCTTTCGATCATGCGCGATTAAAGGTGAATATGCTAACCAATCTGTAGCGGCTTAGAAAGGATAAAATCAGGTTTTAACCTGATATCAACCCGATAATTGAATCATTAATCA < SRR19973068.3762022/150‑1 (MQ=60)
CCCGTATTCAGCGAACACATTAACCTCTTTAATTATCTTTCGATCATGCGCGATTAAAGGTGAATATGCTAACCAATCTGTAGCGGCTTAGAAAGGATAAAATCAGGTTTTAACCTGATATCAACCCGATAATTGAATCATTAATCAGGC < SRR19973068.1181291/150‑1 (MQ=60)
CCCGTATTCAGCGAACACATTAACCTCTTTAATTATCTTTCGATCATGCGCGATTAAAGGTGAATATGCTAACCAATCTGTAGCGGCTTAGAAAGGATAAAATCAGGTTTTAACCTGATATCAACCCGATAATTGAATCATTAATCAGGC < SRR19973068.2769340/150‑1 (MQ=60)
CCCGTATTCAGCGAACACATTAACCTCTTTAATTATCTTTCGATCATGCGCGATTAAAGGTGAATATGCTAACCAATCTGTAGCGGCTTAGAAAGGATAAAATCAGGTTTTAACCTGATATCAACCCGATAATTGAATCATTAATCAGGC < SRR19973068.2769335/150‑1 (MQ=60)
CCCGTATTCAGCGAACACATTAACCTCTTTAATTATCTTTCGATCATGCGCGATTAAAGGTGAATATGCTAACCAATCTGTAGCGGCTTAGAAAGGATAAAATCAGGTTTTAACCTGATATCAACCCGATAATTGAATCATTAATCAGGC > SRR19973068.1981751/1‑150 (MQ=60)
CCCGTATTCAGCGAACACATTAACCTCTTTAATTATCTTTCGATCATGCGCGATTAAAGGTGAATATGCTAACCAATCTGTAGCGGCTTAGAAAGGATAAAATCAGGTTTTAACCTGATATCAACCCGATAATTGAATCATTAATCAGGC > SRR19973068.1980481/1‑150 (MQ=60)
CCGTATTCAGCGAACACATTAACCTCTTTAATTATCTTTCGATCATGCGCGATTAAAGGTGAATATGCTAACCAATCTGTAGCGGCTTAGAAAGGATAAAATCAGGTTTTAACCTGATATCAACCCGATAATTGAATCATTAATCAGGCA < SRR19973068.1775135/150‑1 (MQ=60)
CCGTATTCAGCGAACACATTAACCTCTTTAATTATCTTTCGATCATGCGCGATTAAAGGTGAATATGCTAACCAATCTGTAGCGGCTTAGAAAGGATAAAATCAGGTTTTAACCTGATATCAACCCGATAATTGAATCATTAATCAGGCA < SRR19973068.2652265/150‑1 (MQ=60)
CCGTATTCAGCGAACACATTAACCTCTTTAATTATCTTTCGATCATGCGCGATTAAAGGTGAATATGCTAACCAATCTGTAGCGGCTTAGAAAGGATAAAATCAGGTTTTAACCTGATATCAACCCGATAATTGAATCATTAATCAGGCA < SRR19973068.572206/150‑1 (MQ=60)
GTATTCAGCGAACACATTAACCTCTTTAATTATCTTTCGATCATGCGCGATTAAAGGTGAATATGCTAACCAATCTGTAGCGGCTTAGAAAGGATAAAATCAGGTTTTAACCTGATATCAACCCGATAATTGAATCATTAATCAGGCATG < SRR19973068.2125350/150‑1 (MQ=60)
TTCAGCGAACACATTAACCTCTTTAATTATCTTTCGATCATGCGCGATTAAAGGTGAATATGCTAACCAATCTGTAGCGGCTTAGAAAGGATAAAATCAGGTTTTAACCTGATATCAACCCGATAATTGAATCATTAATCAGGCATGCTC < SRR19973068.1964124/150‑1 (MQ=60)
AGCGAACACATTAACCTCTTTAATTATCTTTCGATCATGCGCGATTAAAGGTGAATATGCTAACCAATCTGTAGCGGCTTAGAAAGGATAAAATCAGGTTTTAACCTGATATCAACCCGATAATTGAATCATTAATCAGGCATGCTCCAG < SRR19973068.2711802/150‑1 (MQ=60)
AGCGAACACATTAACCTCTTTAATTATCTTTCGATCATGCGCGATTAAAGGTGAATATGCTAACCAATCTGTAGCGGCTTAGAAAGGATAAAATCAGGTTTTAACCTGATATCAACCCGATAATTGAATCATTAATCAGGCATGCTCCAG > SRR19973068.2588707/1‑150 (MQ=60)
AGCGAACACATTAACCTCTTTAATTATCTTTCGATCATGCGCGATTAAAGGTGAATATGCTAACCAATCTGTAGCGGCTTAGAAAGGATAAAATCAGGTTTTAACCTGATATCAACCCGATAATTGAATCATTAATCAGGCATGCTCCAG > SRR19973068.2588460/1‑150 (MQ=60)
GCGAACACATTAACCTCTTTAATTATCTTTCGATCATGCGCGATTAAAGGTGAATATGCTAACCAATCTGTAGCGGCTTAGAAAGGATAAAATCAGGTTTTAACCTGATATCAACCCGATAATTGAATCATTAATCAGGCATGCTCCAGT < SRR19973068.1527320/150‑1 (MQ=60)
CGAACACATTAACCTCTTTAATTATCTTTCGATCATGCGCGATTAAAGGTGAATATGCTAACCAATCTGTAGCGGCTTAGAAAGGATAAAATCAGGTTTTAACCTGATATCAACCCGATAATTGAATCATTAATCAGGCATGCTCCAGTG < SRR19973068.436168/150‑1 (MQ=60)
ACATTAACCTCTTTAATTATCTTTCGATCATGCGCGATTAAAGGTGAATATGCTAACCAATCTGTAGCGGCTTAGAAAGGATAAAATCAGGTTTTAACCTGATATCAACCCGATAATTGAATCATTAATCAGGCATGCTCCAGTGAAAAA > SRR19973068.3588961/1‑150 (MQ=60)
TTAACCTCTTTAATTATCTTTCGATCATGCGCGATTAAAGGTGAATATGCTAACCAATCTGTAGCGGCTTAGAAAGGATAAAATCAGGTTTTAACCTGATATCAACCCGATAATTGAATCATTAATCAGGCATGCTCCAGTGAAAAATTC < SRR19973068.3172699/150‑1 (MQ=60)
TTAACCTCTTTAATTATCTTTCGATCATGCGCGATTAAAGGTGAATATGCTAACCAATCTGTAGCGGCTTAGAAAGGATAAAATCAGGTTTTAACCTGATATCAACCCGATAATTGAATCATTAATCAGGCATGCTCCAGTGAAAAATTC < SRR19973068.3792523/150‑1 (MQ=60)
TAACCTCTTTAATTATCTTTCGATCATGCGCGATTAAAGGTGAATATGCTAACCAATCTGTAGCGGCTTAGAAAGGATAAAATCAGGTTTTAACCTGATATCAACCCGATAATTGAATCATTAATCAGGCATGCTCCAGTGAAAAATTCG < SRR19973068.2089279/150‑1 (MQ=60)
TCCTCTTTAATTATCTTTCGATCATGCGCGATTAAAGGTGAATATGCTAACCAATCTGTAGCGGCTTAGAAAGGATAAAATCAGGTTTTAACCTGATATCAACCCGATAATTGAATCATTAATCAGGCATGCTCCAGTGAAAAATTCGGG < SRR19973068.1130502/150‑1 (MQ=60)
CTTTAATTATCTTTCGATCATGCGCGATTAAAGGTGAATATGCTAACCAATCTGTAGCGGCTTAGAAAGGATAAAATCAGGTTTTAACCTGATATCAACCCGATAATTGAATCATTAATCAGGCATGCTCCAGTGAAAAATTCGGGTAGT > SRR19973068.357169/1‑150 (MQ=60)
TTTAATTATCTTTCGATCATGCGCGATTAAAGGTGAATATGCTAACCAATCTGTAGCGGCTTAGAAAGGATAAAATCAGGTTTTAACCTGATATCAACCCGATAATTGAATCATTAATCAGGCATGCTCCAGTGAAAAATTCGGGTAGTG < SRR19973068.1491925/150‑1 (MQ=60)
AATTATCTTTCGATCATGCGCGATTAAAGGTGAATATGCTAACCAATCTGTAGCGGCTTAGAAAGGATAAAATCAGGTTTTAACCTGATATCAACCCGATAATTGAATCATTAATCAGGCATGCTCCAGTGAAAAATTCGGGTAGTGCTC > SRR19973068.1509838/1‑150 (MQ=60)
AATTATCTTTCGATCATGCGCGATTAAAGGTGAATATGCTAACCAATCTGTAGCGGCTTAGAAAGGATAAAATCAGGTTTTAACCTGATATCAACCCGATAATTGAATCATTAATCAGGCATGCTCCAGTGAAAAATTCGGGTAGTGCTC > SRR19973068.3566418/1‑150 (MQ=60)
AATTATCTTTCGATCAAGCGCGATTAAAGGTTAATATGCTAACCAATCTGTAGCGGCTTAGAAAGGATAAAAACAGGTTTTAACCTGATATCAACACGATAATAGAATCATTAATCAGGCATGATCCAGAGAAAAATTCGGTTAGTGCTC > SRR19973068.63517/1‑150 (MQ=60)
TATCTTTCGATCATGCGCGATTAAAGGTGAATATGCTAACCAATCTGTAGCGGCTTAGAAAGGATAAAATCAGGTTTTAACCTGATATCAACCCGATAATTGAATCATTAATCAGGCATGCTCCAGTGAAAAATTCGGGTAGTGCTCGGC > SRR19973068.2737771/1‑150 (MQ=60)
CGATCATGCGCGATTAAAGGTGAATATGCTAACCAATCTGTAGCGGCTTAGAAAGGATAAAATCAGGTTTTAACCTGATATCAACCCGATAATTGAATCATTAATCAGGCATGCTCCAGTGAAAAATTCGGGTAGTGCTCGGCAAAATAC > SRR19973068.1798065/1‑150 (MQ=60)
GATCATGCGCGATTAAAGGTGAATATGCTAACCAATCTGTAGCGGCTTAGAAAGGATAAAATCAGGTTTTAACCTGATATCAACCCGATAATTGAATCATTAATCAGGCATGCTCCAGTGAAAAATTCGGGTAGTGCTCGGCAAAATACT < SRR19973068.3233361/150‑1 (MQ=60)
TCATGCGCGATTAAAGGTGAATATGCTAACCAATCTGTAGCGGCTTAGAAAGGATAAAATCAGGTTTTAACCTGATATCAACCCGATAATTGAATCATTAATCAGGCATGCTCCAGTGAAAAATTCGGGTAGTGCTCGGCAAAATACTGG > SRR19973068.358165/1‑150 (MQ=60)
CGCGATTAAAGGTGAATATGCTAACCAATCTGTAGCGGCTTAGAAAGGATAAAATCAGGTTTTAACCTGATATCAACCCGATAATTGAATCATTAATCAGGCATGCTCCAGTGAAAAATTCGGGTAGTGCTCGGCAAAATACTGGCGTAA > SRR19973068.1759501/1‑150 (MQ=60)
ATTAAAGGTGAATATGCTAACCAATCTGTAGCGGCTTAGAAAGGATAAAATCAGGTTTTAACCTGATATCAACCCGATAATTGAATCATTAATCAGGCATGCTCCAGTGAAAAATTCGGGTAGTGCTCGGCAAAATACTGGCGTAAAAAT > SRR19973068.2836844/1‑150 (MQ=60)
AAAGGTGAATATGCTAACCAATCTGTAGCGGCTTAGAAAGGATAAAATCAGGTTTTAACCTGATATCAACCCGATAATTGAATCATTAATCAGGCATGCTCCAGTGAAAAATTCGGGTAGTGCTCGGCAAAATACTGGCGTAAAAATTCT < SRR19973068.2402384/150‑1 (MQ=60)
AAGGTGAATATGCTAACCAATCTGTAGCGGCTTAGAAAGGATAAAATCAGGTTTTAACCTGATATCAACCCGATAATTGAATCATTAATCAGGCATGCTCCAGTGAAAAATTCGGGTAGTGCTCGGCAAAATACTGGCGTAAAAATTCTA > SRR19973068.1796353/1‑150 (MQ=60)
GGTGAATATGCTAACCAATCTGTAGCGGCTTAGAAAGGATAAAATCAGGTTTTAACCTGATATCAACCCGATAATTGAATCATTAATCAGGCATGCTCCAGTGAAAAATTCGGGTAGTGCTCGGCAAAATACTGGCGTAAAAATTCTACC > SRR19973068.640405/1‑150 (MQ=60)
GGTGAATATGCTAACCAATCTGTAGCGGCTTAGAAAGGATAAAATCAGGTTTTAACCTGATATCAACCCGATAATTGAATCATTAATCAGGCATGCTCCAGTGAAAAATTCGGGTAGTGCTCGGCAAAATACTGGCGTAAAAATTCTACC > SRR19973068.640532/1‑150 (MQ=60)
GAATATGCTAACCAATCTGTAGCGGCTTAGAAAGGATAATATCAGGTTTTAACCTGATATCAACCCGATAATTGAATCATTAATCAGGCATGCTACAGTGAAAAATTCGGGTAGTGCTCGGCAAAATACTGGCGTAAAAATTCTACCGTT < SRR19973068.735645/150‑1 (MQ=60)
AATATTCTAACCAATCTGTAGCGGCTTAGAAAGGATAAAATCAGGTTTTAACCTGATATCAACCCGATAATTGAATCATTAATCAGGCATGCTCCAGTGAAAAATTCGGGTAGTGCTCGGCAAAATACTGGCGTAAAAATTCTACCGTTA < SRR19973068.1989205/150‑1 (MQ=60)
AATATGCTAACCAATCTGTAGCGGCTTAGAAAGGATAAAATCAGGTTTTAACCTGATATCAACCCGATAATTGAATCATTAATCAGGCATGCTCCAGTGAAAAATTCGGGTAGTGCTCGGCAAAATACTGGCGTAAAAATTCTACCGTTA < SRR19973068.2161919/150‑1 (MQ=60)
AATATGCTAACCAATCTGTAGCGGCTTAGAAAGGATAAAATCAGGTTTTAACCTGATATCAACCCGATAATTGAATCATTAATCAGGCATGCTCCAGTGAAAAATTCGGGTAGTGCTCGGCAAAATACTGGCGTAAAAATTCTACCGTTA < SRR19973068.4068042/150‑1 (MQ=60)
AATATGCTAACCAATCTGTAGCGGCTTAGAAAGGATAAAATCAGGTTTTAACCTGATATCAACCCGATAATTGAATCATTAATCAGGCATGCTCCAGTGAAAAATTCGGGTAGTGCTCGGCAAAATACTGGCGTAAAAATTCTACCGTTA < SRR19973068.2970323/150‑1 (MQ=60)
ATGCTAACCAATCTGTAGCGGCTTAGAAAGGATAAAATCAGGTTTTAACCTGATATCAACCCGATAATTGAATCATTAATCAGGCATGCTCCAGTGAAAAATTCGGGTAGTGCTCGGCAAAATACTGGCGTAAAAATTCTACCGTTATCC > SRR19973068.674277/1‑150 (MQ=60)
ATGCTAACCAATCTGTAGCGGCTTAGAAAGGATAAAATCAGGTTTTAACCTGATATCAACCCGATAATTGAATCATTAATCAGGCATGCTCCAGTGAAAAATTCGGGTAGTGCTCGGCAAAATACTGGCGTAAAAATTCTACCGTTATCC > SRR19973068.3112370/1‑150 (MQ=60)
ATGCTAACCAATCTGTAGCGGCTTAGAAAGGATAAAATCAGGTTTTAACCTGATATCAACCCGATAATTGAATCATTAATCAGGCATGCTCCAGTGAAAAATTCGGGTAGTGCTCGGCAAAATACTGGCGTAAAAATTCTACCGTTATCC > SRR19973068.3112490/1‑150 (MQ=60)
ATGCTAACCAATCTGTAGCGGCTTAGAAAGGATAAAATCAGGTTTTAACCTGATATCAACCCGATAATTGAATCATTAATCAGGCATGCTCCAGTGAAAAATTCGGGTAGTGCTCGGCAAAATACTGGCGTAAAAATTCTACCGTTATCC > SRR19973068.3112519/1‑150 (MQ=60)
GCTAACCAATCTGTAGCGGCTTAGAAAGGATAAAATCAGGTTTTAACCTGATATCAACCCGATAATTGAATCATTAATCAGGCATGCTCCAGTGAAAAATTCGGGTAGTGCTCGGCAAAATACTGGCGTAAAAATTCTACCGTTATCCGC > SRR19973068.164452/1‑150 (MQ=60)
CTAACCAATCTGTAGCGGCTTAGAAAGGATAAAATCAGGTTTTAACCTGATATCAACCCGATAATTGAATCATTAATCAGGCATGCTCCAGTGAAAAATTCGGGTAGTGCTCGGCAAAATACTGGCGTAAAAATTCTACCGTTATCCGCA > SRR19973068.1588493/1‑150 (MQ=60)
CTAACCAATCTGTAGCGGCTTAGAAAGGATAAAATCAGGTTTTAACCTGATATCAACCCGATAATTGAATCATTAATCAGGCATGCTCCAGTGAAAAATTCGGGTAGTGCTCGGCAAAATACTGGCGTAAAAATTCTACCGTTATCCGCA > SRR19973068.898234/1‑150 (MQ=60)
CTAACCAATCTGTAGCGGCTTAGAAAGGAGAAAATCAGGTTTTAACCTGATATCAACCCGATAATTGAATCATTAATCAGGCATGCTCCAGTGAAAAATTCGGGTAGTGCTCGGCAAAATACTGGCGTAAAAATTCTACCGTTATCCGCA > SRR19973068.3325336/1‑150 (MQ=60)
CTAACCAATCTGTAGCGGCTTAGAAAGGAGAAAATCAGGTTTTAACCTGATATCAACCCGATAATTGAATCATTAATCAGGCATGCTCCAGTGAAAAATTCGGGTAGTGCTCGGCAAAATACTGGCGTAAAAATTCTACCGTTATCCGCA > SRR19973068.1263134/1‑150 (MQ=60)
TAACCAATCTGTAGCGGCTTAGAAAGGATAAAATCAGGTTTTAACCTGATATCAACCCGATAATTGAATCATTAATCAGGCATGCTCCAGTGAAAAATTCGGGTAGTGCTCGGCAAAATACTGGCGTAAAAATTCTACCGTTATCCGCAC > SRR19973068.3112810/1‑150 (MQ=60)
AACCAATCTGTAGCGGCTTAGAAAGGATAAAATCAGGTTTTAACCTGATATCAACCCGATAATTGAATCATTAATCAGGCATGCTCCAGTGAAAAATTCGGGTAGTGCTCGGCAAAATACTGGCGTAAAAATTCTACCGTTATCCGCACT > SRR19973068.580482/1‑150 (MQ=60)
AACCAATCTGTAGCGGCTTAGAAAGGATAAAATCAGGTTTTAACCTGATATCAACCCGATAATTGAATCATTAATCAGGCATGCTCCAGTGAAAAATTCGGGTAGTGCTCGGCAAAATACTGGCGTAAAAATTCTACCGTTATCCGCACT > SRR19973068.1301076/1‑150 (MQ=60)
AACCAATCTGTAGCGGCTTAGAAAGGATAAAATCAGGTTTTAACCTGATATCAACCCGATAATTGAATCATTAATCAGGCATGCTCCAGTGAAAAATTCGGGTAGTGCTCGGCAAAATACTGGCGTAAAAATTCTACCGTTATCCGCACT > SRR19973068.3604046/1‑150 (MQ=60)
AATCTGTAGCGGCTTAGAAAGGATAAAATCAGGTTTTAACCTGATATCAACCCGATAATTGAATCATTAATCAGGCATGCTCCAGTGAAAAATTCGGGTAGTGCTCGGCAAAATACTGGCGTAAAAATTCTACCGTTATCCGCACTTTCG > SRR19973068.2426164/1‑150 (MQ=60)
ATCTGTAGCGGCTTAGAAAGGATAAAATCAGGTTTTAACCTGATATCAACCCGATAATTGAATCATTAATCAGGCATGCTCCAGTGAAAAATTCGGGTAGTGCTCGGCAAAATACTGGCGTAAAAATTCTACCGTTATCCGCACTTTCGC > SRR19973068.342826/1‑150 (MQ=60)
TGTAGCGGCTTAGAAAGGATAAAATCAGGTTTTAACCTGATATCAACCCGATAATTGAATCATTAATCAGGCATGCTCCAGTGAAAAATTCGGGTAGTGCTCGGCAAAATACTGGCGTAAAAATTCTACCGTTATCCGCACTTTCGCTNA < SRR19973068.2176341/150‑1 (MQ=60)
TGTAGCGGCTTAGAAAGGATAAAATCAGGTTTTAACCTGATATCAACCCGATAATTGAATCATTAATCAGGCATGCTCCAGTGAAAAATTCGGGTAGTGCTCGGCAAAATACTGGCGTAAAAATTCTACCGTTATCCGCACTTTCGCTGA < SRR19973068.1889711/150‑1 (MQ=60)
GTAGCGGCTTAGAAAGGATAAAATCAGGTTTTAACCTGATATCAACCCGATAATTGAATCATTAATCAGGCATGCTCCAGTGAAAAATTCGGGTAGTGCTCGGCAAAATACTGGCGTAAAAATTCTACCGTTATCCGCACTTTCGCTGAC < SRR19973068.4021262/150‑1 (MQ=60)
TAGCGGCTTAGAAAGGATAAAATCAGGTTTTAACCTGATATCAACCCGATAATTGAATCATTAATCAGGCATGCTCCAGTGAAAAATTCGGGTAGTGCTCGGCAAAATACTGGCGTAAAAATTCTACCGTTATCCGCACTTTCGCTGACG > SRR19973068.1040235/1‑150 (MQ=60)
TAGCGGCTTAGAAAGGATAAAATCAGGTTTTAACCTGATATCAACCCGATAATTGAATCATTAATCAGGCATGCTCCAGTGAAAAATTCGGGTAGTGCTCGGCAAAATACTGGCGTAAAAATTCTACCGTTATCCGCACTTTCGCTGACG > SRR19973068.1413986/1‑150 (MQ=60)
TAGCGGCTTAGAAAGGATAAAATCAGGTTTTAACCTGATATCAACCCGATAATTGAATCATTAATCAGGCATGCTCCAGTGAAAAATTCGGGTAGTGCTCGGCAAAATACTGGCGTAAAAATTCTACCGTTATCCGCACTTTCGCTGACG > SRR19973068.1413985/1‑150 (MQ=60)
TAGCGGCTTAGAAAGGATAAAATCAGGTTTTAACCTGATATCAACCCGATAATTGAATCATTAATCAGGCATGCTCCAGTGAAAAATTCGGGTAGTGCTCGGCAAAATACTGGCGTAAAAATTCTACCGTTATCCGCACTTTCGCTGACG > SRR19973068.1413960/1‑150 (MQ=60)
GGCTTAGAAAGGATAAAATCAGGTTTTAACCTGATATCAACCCGATAATTGAATCATTAATCAGGCATGCTCCAGTGAAAAATTCGGGTAGTGCTCGGCAAAATACTGGCGTAAAAATTCTACCGTTATCCGCACTTTCGCTGACGTCGC > SRR19973068.709749/1‑150 (MQ=60)
TTAGAAAGGATAAAATCAGGTTTTAACCTGATATCAACCCGATAATTGAATCATTAATCAGGCATGCTCCAGTGAAAAATTCGGGTAGTGCTCGGCAAAATACTGGCGTAAAAATTCTACCGTTATCCGCACTTTCGCTGACGTCGCCAG < SRR19973068.1990365/150‑1 (MQ=60)
TTAGAAAGGATAAAATCAGGTTTTAACCTGATATCAACCCGATAATTGAATCATTAATCAGGCATGCTCCAGTGAAAAATTCGGGTAGTGCTCGGCAAAATACTGGCGTAAAAATTCTACCGTTATCCGCACTTTCGCTGACGTCGCCAG > SRR19973068.3741455/1‑150 (MQ=60)
TAGAAAGGATAAAATCAGGTTTTAACCTGATATCAACCCGATAATTGAATCATTAATCAGGCATGCTCCAGTGAAAAATTCGGGTAGTGCTCGGCAAAATACTGGCGTAAAAATTCTACCGTTATCCGCACTTTCGCTGACGTCGCCAGC > SRR19973068.557777/1‑150 (MQ=60)
AGAAAGGATAAAATCAGGTTTTAACCTGATATCAACCCGATAATTGAATCATTAATCAGGCATGCTCCAGTGAAAAATTCGGGTAGTGCTCGGCAAAATACTGGCGTAAAAATTCTACCGTTATCCGCACTTTCGCTGACGTCGCCAGCC > SRR19973068.1523775/1‑150 (MQ=60)
AGAAAGGATAAAATCAGGTTTTAACCTGATATCAACCCGATAATTGAATCATTAATCAGGCATGCTCCAGTGAAAAATTCGGGTAGTGCTCGGCAAAATACTGGCGTAAAAATTCTACCGTTATCCGCACTTTCGCTGACGTCGCCAGCC > SRR19973068.3475011/1‑150 (MQ=60)
GATAAAATCAGGTTTTAACCTGATATCAACCCGATAATTGAATCATTAATCAGGCATGCTCCAGTGAAAAATTCGGGTAGTGCTCGGCAAAATACTGGCGTAAAAATTCTACCGTTATCCGCACTTTCGCTGACGTCGCCAGCCTTGAAA > SRR19973068.2724957/1‑150 (MQ=60)
|
GCACCAACACAATAAAAATGGCCCCAACCAGATAGGTCCAGTAATTCAGAACCCCGTATTCAGCGAACACATTAACCTCTTTAATTATCTTTCGATCATGCGCGATTAAAGGTGAATATGCTAACCAATCTGTAGCGGCTTAGAAAGGAGAAAATCAGGTTTTAACCTGATATCAACCCGATAATTGAATCATTAATCAGGCATGCTCCAGTGAAAAATTCGGGTAGTGCTCGGCAAAATACTGGCGTAAAAATTCTACCGTTATCCGCACTTTCGCTGACGTCGCCAGCCTTGAAA > CP009273/1874947‑1875243
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 0 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
