Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A1 F204 I0 R1
|
1155 |
255.8 |
8356456 |
95.7% |
7997128 |
150.0 |
Breseq alignment
BRESEQ :: Evidence
|
| evidence |
seq id |
position |
mutation |
freq |
annotation |
gene |
description |
| RA |
CP009273 |
1,937,083 |
A→T |
15.8% |
T55T (ACA→ACT) |
znuC → |
zinc transporter subunit: ATP‑binding component of ABC superfamily |
|
| |
seq id |
position |
ref |
new |
freq |
score (cons/poly) |
reads |
annotation |
genes |
product |
| * | CP009273 | 1,937,083 | 0 | A | T | 15.8%
| 659.5
/ 100.1
| 233 | T55T (ACA→ACT) | znuC | zinc transporter subunit: ATP‑binding component of ABC superfamily |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (96/100); new base T (22/15); total (118/115) |
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 2.84e-01 |
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 |
Only 100 of 237 total aligned reads displayed.
CTGGAAAATGTCTCGGTTTCTTTTGGCCAACGCCGCGTCCTCTCTGATGTGTCGCTGGAACTTAAACCTGGAAAAATTTTGACTTTACTTGGGCCAAATGGCGCAGGTAAGTCGACACTGGTACGGGTAGTGCTCGGGCTGGTAACACCCGATGAAGGGGTTATCAAGCGCAACGGAAAACTGCGCATCGGCTATGTACCGCAGAAGCTGTATCTCGACACCACGTTGCCACTGACCGTAAACCGTTTTTTACGCTTACGCCCTGGTACACATAAAGAAGATATTTTGCCTGCACT > CP009273/1936937‑1937232
|
cTGGAAAATGTCTCGGTTTCTTTTGGCCAACGCCGCGTCCTCTCTGATGTGTCGCTGGAACTTAAACCTGGAAAAATTTTGACTTTACTTGGGCCAAATGGCGCAGGTAAGTCGACACTGGTACGGGTAGTGCTCGGGCTGGTAACAccc > 2:1493004/1‑150 (MQ=255)
cTGGAAAATGTCTCGGTTTCTTTTGGCCAACGCCGCGTCCTCTCTGATGTGTCGCTGGAACTTAAACCTGGAAAAATTTTGACTTTACTTGGGCCAAATGGCGCAGGTAAGTCGACACTGGTACGGGGAGTGCTCGGGCTGGTAACAccc > 2:1833790/1‑150 (MQ=255)
aaaTGTCTCGGTTTCTTTTGGCCAACGCCGCGTCCTCTCTGATGTGTCGCTGGAACTTAAACCTGGAAAAATTTTGACTTTACTTGGGCCAAATGGCGCAGGTAAGTCGACACTGGTACGGGTAGTGCTCGGGCTGGTAACACCCGATGa < 1:902392/150‑1 (MQ=255)
aTGTCTCGGTTTCTTTTGGCCAACGCCGCGTCCTCTCTGATGTGTCGCTGGAACTTAAACCTGGAAAAATTTTGACTTTACTTGGGCCAAATGGCGCAGGTAAGTCGACACTGGTACGGGTAGTGCTCGGGCTGGTAACACCCGATGAAg < 2:546392/150‑1 (MQ=255)
tctcGGTTTCTTTTGGCCAACGCCGCGTCCTCTCTGATGTGTCGCTGGAACTTAAACCTGGAAAAATTTTGACTTTACTTGGGCCAAATGGCGCAGGTAAGTCGACACTGGTACGGGTAGTGCTCGGGCTGGTAACACCCGATGAAgggg > 2:3612290/1‑150 (MQ=255)
ctcGGTTTCTTTTGGCCAACGCCGCGTCCTCTCTGATGTGTCGCTGGAACTTAAACCTGGAAAAATTTTGACTTTACTTGGGCCAAATGGCGCAGGTAAGTCGACACTGGTACGGGTAGTGCTCGGGCTGGTAACACCCGATGAAGGGGt > 1:4076999/1‑150 (MQ=255)
tcGGTTTCTTTTGGCCAACGCCGCGTCCTCTCTGATGTGTCGCTGGAACTTAAACCTGGAAAAATTTTGACTTTACTTGGGCCAAATGGCGCAGGTAAGTCGACACTGGTACGGGTAGTGCTCGGGCTGGTAACTCCCGATGAAGGGGtt < 1:1677298/150‑1 (MQ=255)
tcGGTTTCTTTTGGCCAACGCCGCGTCCTCTCTGATGTGTCGCTGGAACTTAAACCTGGAAAAATTTTGACTTTACTTGGGCCAAATGGCGCAGGTAAGTCGACACTGGTACGGGTAGTGCTCGGGCTGGTAACACCCGATGAAGGGGtt < 2:2932897/150‑1 (MQ=255)
cGGTTTCTTTTGGCCAACGCCGCGTCCTCTCTGATGTGTCGCTGGAACTTAAACCTGGAAAAATTTTGACTTTACTTGGGCCAAATGGCGCAGGTAAGTCGACACTGGTACGGGTAGTGCTCGGGCTGGTAACACCCGATGAAGGGGTTa < 2:2573268/150‑1 (MQ=255)
gTTTCTTTTGGCCAACGCCGCGTCCTCTCTGATGTGTCGCTGGAACTTAAACCTGGCAATATTTTGACTTTACTTGGGCCAAATGGCGCAGGTAAGTCGACACTGGTACGGGTAGTGCTCGGGCTGGTAACACCCGATGAAGGGGTTATc > 2:2727729/1‑150 (MQ=255)
gTTTCTTTTGGCCAACGCCGCGTCCTCTCTGATGTGTCGCTGGAACTTAAACCTGGAAAAATTTTGACTTTACTTGGGCCAAATGGCGCAGGTAAGTCGACACTGGTACGGGTAGTGCTCGGGCTGGTAACACCCGATGAAGGGGTTATc < 1:627173/150‑1 (MQ=255)
tttCTTTTGGCCAACGCCGCGTCCTCTCTGATGTGTCGCTGGAACTTAAACCTGGAAAAATTTTGACTTTACTTGGGCCAAATGGCGCAGGTAAGTCGACACTGGTACGGGTAGTGCTCGGGCTGGTAACACCCGATGAAGGGGTTATCa > 2:3777370/1‑150 (MQ=255)
ttCTTTTGGCCAACGCCGCGTCCTCTCTGATGTGTCGCTGGAACTTAAACCTGGAAAAATTTTGACTTTACTTGGGCCAAATGGCGCAGGTAAGTCGACACTGGTACGGGTAGTGCTCGGGCTGGTAACACCCGATGAAGGGGTTATCaa < 2:1595986/150‑1 (MQ=255)
tCTTTTGGCCAACGCCGCGTCCTCTCTGATGTGTCGCTGGAACTTAAACCTGGAAAAATTTTGACTTTACTTGGGCCAAATGGCGCAGGTAAGTCGACACTGGTACGGGTAGTGCTCGGGCTGGTAACACCCGATGAAGGGGTTATCAAg > 2:1971729/1‑150 (MQ=255)
ttttGGCCAACGCCGCGTCCTCTCTGATGTGTCGCTGGAACTTAAACCTGGAAAAATTTTGACTTTACTTGGGCCAAATGGCGCAGGTAAGTCGACACTGGTACGGGTAGTGCTCGGGCTGGTAACACCCGATGAAGGGGTTATCAAgcg < 1:1975180/150‑1 (MQ=255)
ttGGCCAACGCCGCGTCCTCTCTGATGTGTCGCTGGAACTTAAACCTGGAAAAATTTTGACTTTACTTGGGCCAAATGGCGCAGGTAAGTCGACACTGGTACGGGTAGTGCTCGGGCTGGTAACACCCGATGAAGGGGTTATCAAGCGCa < 1:538015/150‑1 (MQ=255)
gCCAACGCCGCGTCCTCTCTGATGTGTCGCTGGAACTTAAACCTGGAAAAATTTTGACTTTACTTGGGCCAAATGGCGCAGGTAAGTCGACACTGGTACGGGTAGTGCTCGGGCTGGTAACACCCGATGAAGGGGTTATCAAGCGCAACg > 2:3207110/1‑150 (MQ=255)
ccAACGCCGCGTCCTCTCTGATGTGTCGCTGGAACTTAAACCTGGAAAAATTTTGACTTTACTTGGGCCAAATGGCGCAGGTAAGTCGACACTGGTACGGGTAGTGCTCGGGCTGGTAACTCCCGAGGAAGGGGTTATCAAGCGCAACgg > 2:3577749/1‑150 (MQ=255)
aaCGCCGCGTCCTCTCTGATGTGTCGCTGGAACTTAAACCTGGAAAAATTTTGACTTTACTTGGGCCAAATGGCGCAGGTAAGTCGACACTGGTACGGGTAGTGCTCGGGCTGGTAACACCCGATGAAGGGGTTATCAAGCGCAACGGaa < 1:3434927/150‑1 (MQ=255)
ccgcGTCCTCTCTGATGTGTCGCTGGAACTTAAACCTGGAAAAATTTTGACTTTACTTGGGCCAAATGGCGCAGGTAAGTCGACACTGGTACGGGTAGTGCTCGGGCTGGTAACACCCGATGAAGGGGTTATCAAGCGCAACGGAAAACt < 1:2442459/150‑1 (MQ=255)
cgcgTCCTCTCTGATGTGTCGCTGGAACTTAAACCTGGAAAAATTTTGACTTTACTTGGGCCAAATGGCGCAGGTAAGTCGACACTGGTACGGGTAGTGCTCGGGCTGGTAACACCCGATGAAGGGGTTATCAAGCGCAACGGAAAACTg > 1:3595011/1‑150 (MQ=255)
cgcgTCCTCTCTGATGTGTCGCTGGAACTTAAACCTGGAAAAATTTTGACTTTACTTGGGCCAAATGGCGCAGGTAAGTCGACACTGGTACGGGTAGTGCTCGGGCTGGTAACACCCGATGAAGGGGTTATCAAGCGCAACGGAAAACTg > 1:3051826/1‑150 (MQ=255)
gTCCTCTCTGATGTGTCGCTGGAACTTAAACCTGGAAAAATTTTGACTTTATTTGGGCCAAATGGCGCAGGTACGTCGACACTGGTACGGGTAGTGCTCGGGCTGGTAACTCCCGATGAAGGGGTTATCAAGCGCAACGGAAAACTgcgc > 2:882217/1‑150 (MQ=255)
ccTCTCTGATGTGTCGCTGGAACTTAACCCTGGAAAAATTTTGACTTTACTTGGGCCAAATGGCGCAGGTAAGTCGACACTGGTACGGGTAGTGCTCGGGCTGGTAACACCCGATGAAGGGGTTATCAAGCGCAACGGAAAACTGCGCAt < 1:22143/150‑1 (MQ=255)
ctGATGTGTCGCTGGAACTTAAACCTGGAAAAATTTTGACTTTACTTGGGCCAAATGGCGCAGGTAAGTCGACACTGGTACGGGTAGTGCTCGGGCTGGTAACACCCGATGAAGGGGTTATCAAGCGCAACGGAAAACTGCGCATCGGCt < 1:1243167/150‑1 (MQ=255)
ctGATGTGTCGCTGGAACTTAAACCTGGAAAAATTTTGACTTTACTTGGGCCAAATGGCGCAGGTAAGTCGACACTGGTACGGGTAGTGCTCGGGCTGGTAACACCCGATGAAGGGGTTATCAAGCGCAACGGAAAACTGCGCATCGGCt < 2:2208879/150‑1 (MQ=255)
ctGATGTGTCGCTGGAACTTAAACCTGGAAAAATTTTGACTTTACTTGGGCCAAATGGCGCAGGTAAGTCGACACTGGTACGGGTAGTGCTCGGGCTGGTAACACCCGATGAAGGGGTTATCAAGCGCAACGGAAAACTGCGCATCGGCt < 2:686398/150‑1 (MQ=255)
gATGTGTCGCTGGAACTTAAACCTGGAAAAATTTTGACTTTACTTGGGCCAAATGGCGCAGGTAAGTCGACACTGGTACGGGTAGTGCTCGGGCTGGTAACACCCGATGAAGGGGTTATCAAGCGCAACGGAAAACTGCGCATCGGCTAt < 1:3942368/150‑1 (MQ=255)
aTGTGTCGCTGGAACTTAAACCTGGAAAAATTTTGACTTTACTTGGGCCAAATGGCGCAGGTAAGTCGACACTGGTACGGGTAGTGCTCGGGCTGGTAACTCCCGATGTAGGGGTTATCAAGCGCAACGGAAAACTGCGCATCGGCTATg > 2:3064410/1‑150 (MQ=255)
aTGTGTCGCTGGAACTTAAACCTGGAAAAATTTTGACTTTACTTGGGCCAAATGGCGCAGGTAAGTCGACACTGGTACGGGTAGTGCTCGGGCTGGTAACACCCGATGAAGGGGTTATCAAGCGCAACGGAAAACTGCGCATCGGCTATg > 1:3251568/1‑150 (MQ=255)
tgtgTCGCTGGAACTTAAACCTGGAAAAATTTTGACTTTACTTGGGCCAAATGGCGCAGGTAAGTCGACACTGGTACGGGTAGTGCTCGGGCTGGTAACACCCGATGAAGGGGTTATCAAGCGCAACGGAAAACTGCGCATCGGCTATGt > 2:1071173/1‑150 (MQ=255)
gCTGGAACTTAAACCTGGAAAAATTTTGACTTTACTTGGGCCAAATGGCGCAGGTAAGTCGACACTGGTACGGGTAGTGCTCGGGCTGGTAACACCCGATGAAGGGGTTATCAAGCGCAACGGAAAACTGCGCATCGGCTATGTACCGCa > 1:1489129/1‑150 (MQ=255)
tGGAACTTAAACCTGGAAAAATTTTGACTTTACTTGGGCCAAATGGCGCAGGTAAGTCGACACTGGTACGGGTAGTGCTCGGGCTGGTAACACCCGATGAAGGGGTTATCAAGCGCAACGGAAAACTGCGCATCGGCTATGTACCGCAGa > 2:3740697/1‑150 (MQ=255)
aaCTTAAACCTGGAAAAATTTTGACTTTACTTGGGCCAAATGGCGCAGGTAAGTCGACACTGGTACGGGTAGTGCTCGGGCTGGTAACACCCGATGAAGGGGTTATCAAGCGCAACGGAAAACTGCGCATCGGCTATGTACCGCAGAAGc > 1:551728/1‑150 (MQ=255)
aCTTAAACCTGGAAAAATTTTGACTTTACTTGGGCCAAATGGCGCAGGTAAGTCGACACTGGTACGGGTAGTGCTCGGGCTGGTAACTCCCGATGAAGGGGTTATCAAGCGCAACGGAAAACTGCGCATCGGCTATGTACCGCAGAAGCt > 1:3866050/1‑150 (MQ=255)
cTTAAACCTGGAAAAATTTTGACTTTACTTGGGCCAAATGGCGCAGGTAAGTCGACACTGGTACGGGTAGTGCTCGGGCTGGTAACTCCCGATGAAGGGGTTATCAAGCGCAACGGAAAACTGCGCATCGGCTATGTACCGCAGAAGCTg < 2:244366/150‑1 (MQ=255)
cTTAAACCTGGAAAAATTTTGACTTTACTTGGGCCAAATGGCGCAGGTAAGTCGACACTGGTACGGGTAGTGCTCGGGCTGGTAACACCCGATGACGGGGTTATCAAGCGCAACGGAAAACTGCGCATCGGCTATGTACCGCAGAAGCTg > 2:3378482/1‑150 (MQ=255)
cTTAAACCTGGAAAAATTTTGACTTTACTTGGGCCAAATGGCGCAGGTAAGTCGACACTGGTACGGGTAGTGCTCGGGCTGGTAACACCCGATGAAGGGGTTATCAAGCGCAACGGAAAACTGCGCATCGGCTATGTACCGCAGAAGCTg > 2:3378506/1‑150 (MQ=255)
ttAAACCTGGAAAAATTTTGACTTTACTTGGGCCAAATGGCGCAGGTAAGTCGACACTGGTACGGGTAGTGCTCGGGCTGGTAACACCCGATGAAGGGGTTATCAAGCGCAACGGAAAACTGCGCATCGGCTATGTACCGCAGAAGCTGt < 2:3674062/150‑1 (MQ=255)
tAAACCTGGAAAAATTTTGACTTTACTTGGGCCAAATGGCGCAGGTAAGTCGACACTGGTACGGGTAGTGCTCGGGCTGGTAACACCCGATGAAGGGGTTATCAAGCGCAACGGAAAACTGCGCATCGGCTATGTACCGCAGAAGCTGTa > 2:789856/1‑150 (MQ=255)
aCCTGGAAAAATTTTGACTTTACTTGGGCCAAATGGCGCAGGTAAGTCGACACTGGTACGGGTAGTGCTCGGGCTGGTAACTCCCGATGAAGGGGTTATCAAGCGCAACGGAAAACTGCGCATCGGCTATGTACCGCAGAAGCTGTAtct < 2:1355007/150‑1 (MQ=255)
aCCTGGAAAAATTTTGACTTTACTTGGGCCAAATGGCGCAGGTAAGTCGACACTGGTACGGGTAGTGCTCGGGCTGGTAACACCCGATGAAGGGGTTATCAAGCGCAACGGAAAACTGCGCATCGGCTATGTACCGCAGAAGCTGTAtct > 2:32826/1‑150 (MQ=255)
ccTGGAAAAATTTTGACTTTACTTGGGCCAAATGGCGCAGGTAAGTCGACACTGGTACGGGTAGTGCTCGGGCTGGTAACACCCGATGAAGGGGTTATCAAGCGCAACGGAAAACTGCGCATCGGCTATGTACCGCAGAAGCTGTAtctc > 1:626268/1‑150 (MQ=255)
aaaaaTTTTGACTTTACTTGGGCCAAATGGCGCAGGTAAGTCGACACTGGTACGGGTAGTGCTCGGGCTGGTAACTCCCGATGAAGGGGTTATCAAGCGCAACGGAAAACTGCGCATCGGCTATGTACCGCAGAAGCTGTATCTCGacac < 1:3156675/150‑1 (MQ=255)
aaaaaTTTTGACTTTACTTGGGCCAAATGGCGCAGGTAAGTCGACACTGGTACGGGTAGTGCTCGGGCTGGTAACACCCGATGAAGGGGTTATCAAGCGCAACGGAAAACTGCGCATCGGCTATGTACCGCAGAAGCTGTATCTCGacac < 2:2279160/150‑1 (MQ=255)
aaaTTTTGACTTTACTTGGGCCAAATGGCGCAGGTAAGTCGACACTGGTACGGGTAGTGCTCGGGCTGGTAACACCCGATGAAGGGGTTATCAAGCGCAACGGAAAACTGCGCATCGGCTATGTACCGCAGAAGCTGTATCTCGAcacca < 1:4040895/150‑1 (MQ=255)
aaTTTTGACTTTACTTGGGCCAAATGGCGCAGGTAAGTCGACACTGGTACGGGTAGTGCTCGGGCTGGTAACACCCGATGAAGGGGTTATCAAGCGCAACGGAAAACTGCGCATCGGCTATGTACCGCAGAAGCTGTATCTCGAcaccac > 2:2054026/1‑150 (MQ=255)
aTTTTGACTTTACTTGGGCCAAATGGCGCAGGTAAGTCGACACTGGTACGGGTAGTGCTCGGGCTGGTAACACCCGATGAAGGGGTTATCAAGCGCAACGGAAAACTGCGCATCGGCTATGTACCGCAGAAGCTGTATCTCGACACCACg > 2:35158/1‑150 (MQ=255)
tttGACTTTACTTGGGCCAAATGGCGCAGGTAAGTCGACACTGGTACGGGTAGTGCTCGGGCTGGTAACACCCGATGAAGGGGTTATCAAGCGCAACGGAAAACTGCGCATCGGCTATGTACCGCAGAAGCTGTATCTCGACACCACGtt < 2:1939910/150‑1 (MQ=255)
ttGACTTTACTTGGGCCAAATGGCGCAGGTAAGTCGACACTGGTACGGGTAGTGCTCGGGCTGGTAACACCCGATGAAGGGGTTATCAAGCGCAACGGAAAACTGCGCATCGGCTATGTACCGCAGAAGCTGTATCTCGACACCACGTTg < 1:631306/150‑1 (MQ=255)
tttACTTGGGCCAAATGGCGCAGGTAAGTCGACACTGGTACGGGTAGTGCTCGGGCTGGTAACACCCGATGAAGGGGTTATCAAGCGCAACGGAAAACTGCGCATCGGCTATGTACCGCAGAAGCTGTATCTCGACACCACGTTGCCACt > 1:1099771/1‑150 (MQ=255)
tttACTTGGGCCAAATGGCGCAGGTAAGTCGACACTGGTACGGGTAGTGCTCGGGCTGGTAACACCCGATGAAGGGGTTATCAAGCGCAACGGAAAACTGCGCATCGGCTATGTACCGCAGAAGCTGTATCTCGACACCACGTTGCCACt < 2:2236776/150‑1 (MQ=255)
ttACTTGGGCCAAATGGCGCAGGTAAGTCGACACTGGTACGGGTAGTGCTCGGGCTGGTAACTCCCGATGAAGGGGTTATCAAGCGCAACGGAAAACTGCGCATCGGCTATGTACCGCAGAAGCTGTATCTCGACACCACGTTGCCACTg > 2:2714235/1‑150 (MQ=255)
ttACTTGGGCCAAATGGCGCAGGTAAGTCGACACTGGTACGGGTAGTGCTCGGGCTGGTAACTCCCGATGAAGGGGTTATCAAGCGCAACGGAAAACTGCGCATCGGCTATGTACCGCAGAAGCTGTATCTCGACACCACGTTGCCACTg > 2:1138752/1‑150 (MQ=255)
ttACTTGGGCCAAATGGCGCAGGTAAGTCGACACTGGTACGGGTAGTGCTCGGGCTGGTAACACCCGATGAAGGGGTTATCAAGCGCAACGGAAAACTGCGCATCGGCTATGTACCGCAGAAGCTGTATCTCGACACCACGTTGCCACTg > 2:2635996/1‑150 (MQ=255)
ttACTTGGGCCAAATGGCGCAGGTAAGTCGACACTGGTACGGGTAGTGCTCGGGCTGGTAACACCCGATGAAGGGGTTATCAAGCGCAACGGAAAACTGCGCATCGGCTATGTACCGCAGAAGCTGTATCTCGACACCACGTTGCCACTg < 1:1408775/150‑1 (MQ=255)
cTTGGGCCAAATGGCGCAGGTAAGTCGACACTGGTACGGGTAGTGCTCGGGCTGGTAACACCCGATGAAGGGGTTATCAAGCGCAACGGAAAACTGCGCATCGGCTATGTACCGCAGAAGCTGTATCTCGACACCACGTTGCCACTGAcc < 2:1763481/150‑1 (MQ=255)
cTTGGGCCAAATGGCGCAGGTAAGTCGACACTGGTACGGGTAGTGCTCGGGCTGGTAACACCCGATGAAGGGGTTATCAAGCGCAACGGAAAACTGCGCATCGGCTATGTACCGCAGAAGCTGTATCTCGACACCACGTTGCCACTGAcc > 2:2651787/1‑150 (MQ=255)
gggCCAAATGGCGCAGGTACGTCGACACTGGTACGGGTAGTGCTCGGGCTGGTAACACCCGATGAAGGGGTTATCAAGCGCAACGGAAAACTGCGCATCGGCTATGTACCGCAGAAGCTGTATCTCGACACCACGTTGCCACTGACCGTa > 1:2262290/1‑150 (MQ=255)
gggCCAAATGGCGCAGGTAAGTCGACACTGGTACGGGTAGTGCTCGGGCTGGTAACTCCCGATGAAGGGGTTATCAAGCGCAACGGAAAACTGCGCATCGGCTATGTACCGCAGAAGCTGTATCTCGACACCACGTTGCCACTGACCGTa > 1:837055/1‑150 (MQ=255)
gggCCAAATGGCGCAGGTAAGTCGACACTGGTACGGGTAGTGCTCGGGCTGGTAACACCCGATGAAGGGGTTATCAAGCGCAACGGAAAACTGCGCATCGGCTATGTACCGCAGAAGCTGTATCTCGACACCACGTTGCCACTGACCGTa > 1:3445502/1‑150 (MQ=255)
ccAAATGGCGCAGGTAAGTCGACACTGGTACGGGTAGTGCTCGGGCTGGTAACACCCGATGAAGGGGTTATCAAGCGCAACGGAAAACTGCGCATCGGCTATGTACCGCAGAAGCTGTATCTCGACACCACGTTGCCACTGACCGTAAAc > 1:2122154/1‑150 (MQ=255)
aaaTGGCGCAGGTAAGTCGACACTGGTACGGGTAGTGCTCGGGCTGGTAACTCCCGATGAAGGGGTTATCAAGCGCAACGGAAAACTGCGCATCGGCTATGTACCGCAGAAGCTGTATCTCGACACCACGTTGCCACTGACCGTAAACCg > 1:2894779/1‑150 (MQ=255)
aaaTGGCGCAGGTAAGTCGACACTGGTACGGGTAGTGCTCGGGCTGGTAACACCCGATGAAGGGGTTATCAAGCGCAACGGAAAACTGCGCATCGGCTATGTACCGCAGAAGCTGTATCTCGACACCACGTTGCCACTGACCGTAAACCg < 1:597013/150‑1 (MQ=255)
aaTGGCGCAGGTAAGTCGACACTGGTACGGGTAGTGCTCGGGCTGGTAACACCCGATGAAGGGGTTATCAAGCGCAACGGAAAACTGCGCATCGGCTATGTACCGCAGAAGCTGTATCTCGACACCACGTTGCCACTGACCGTAAACCGt > 1:3040233/1‑150 (MQ=255)
cAGGTAAGTCGACACTGGTACGGGTAGTGCTCGGGCTGGTAACTCCCGATGAAGGGGTTATCAAGCGCAACGGAAAACTGCGCATCGGCTATGTACCGCAGAAGCTGTATCTCGACACCACGTTGCCACTGACCGTAAACCGTTTTttac > 2:1999639/1‑150 (MQ=255)
cAGGTAAGTCGACACTGGTACGGGTAGTGCTCGGGCTGGTAACACCCGATGAAGGGGTTATCAAGCGCAACGGAAAACTGCGCATCGGCTATGTACCGCAGAAGCTGTATCTCGACACCACGTTGCCACTGACCGTAAACCGTTTTttac < 2:3882110/150‑1 (MQ=255)
aGGTAAGTCGACACTGGTACGGGTAGTGCTCGGGCTGGTAACACCCGATGAAGGGGTTATCAAGCGCAACGGAAAACTGCGCATCGGCTATGTACCGCAGAAGCTGTATCTCGACACCACGTTGCCACTGACCGTAAACCGTTTTttacg < 1:3911041/150‑1 (MQ=255)
ggTAAGTCGACACTGGTACGGGTAGTGCTCGGGCTGGTAACACCCGATGAAGGGGTTATCAAGCGCAACGGAAAACTGCGCATCGGCTATGTACCGCAGAAGCTGTATCTCGACACCACGTTGCCACTGACCGTAAACCGTTTTttacgc > 1:4046263/1‑150 (MQ=255)
gTAAGTCGACACTGGTACGGGTAGTGCTCGGGCTGGTAACACCCGATGAAGGGGTTATCAAGCGCAACGGAAAACTGCGCATCGGCTATGTACCGCAGAAGCTGTATCTCGACACCACGTTGCCACTGACCGTAAACCGTTTTttacgct > 1:1802014/1‑150 (MQ=255)
gTAAGTCGACACTGGTACGGGTAGTGCTCGGGCTGGTAACACCCGATGAAGGGGTTATCAAGCGCAACGGAAAACTGCGCATCGGCTATGTACCGCAGAAGCTGTATCTCGACACCACGTTGCCACTGACCGTAAACCGTTTTttacgct > 1:1515551/1‑150 (MQ=255)
gTAAGTCGACACTGGTACGGGTAGTGCTCGGGCTGGTAACACCCGATGAAGGGGTTATCAAGCGCAACGGAAAACTGCGCATCGGCTATGTACCGCAGAAGCTGTATCTCGACACCACGTTGCCACTGACCGTAAACCGTTTTttacgct > 2:59424/1‑150 (MQ=255)
tAAGTCGACACTGGTACGGGTAGTGCTCGGGCTGGTAACTCCCGATGAAGGGGTTATCAAGCGCAACGGAAAACTGCGCATCGGCTATGTACCGCAGAAGCTGTATCTCGACACCACGTTGCCACTGACCGTAAACCGTTTTttacgctt > 1:329332/1‑150 (MQ=255)
aaGTCGACACTGGTACGGGTAGTGCTCGGGCTGGTAACACCCGATGAAGGGGTTATCAAGCGCAACGGAAAACTGCGCATCGGCTATGTACCGCAGAAGCTGTATCTCGACACCACGTTGCCACTGACCGTAAACCGTTTTttacgctta > 2:917904/1‑150 (MQ=255)
aaGTCGACACTGGTACGGGTAGTGCTCGGGCTGGTAACACCCGATGAAGGGGTTATCAAGCGCAACGGAAAACTGCGCATCGGCTATGTACCGCAGAAGCTGTATCTCGACACCACGTTGCCACTGACCGTAAACCGTTTTttacgctta > 2:1544034/1‑150 (MQ=255)
aGTCGACACTGGTACGGGTAGTGCTCGGGCTGGTAACACCCGATGAAGGGGTTATCAAGCGCAACGGAAAACTGCGCATCGGCTATGTACCGCAGAAGCTGTATCTCGACACCACGTTGCCACTGACCGTAAACCGTTTTttacgcttac < 2:402285/150‑1 (MQ=255)
aGTCGACACTGGTACGGGTAGTGCTCGGGCTGGTAACACCCGATGAAGGGGTTATCAAGCGCAACGGAAAACTGCGCATCGGCTATGTACCGCAGAAGCTGTATCTCGACACCACGTTGCCACTGACCGTAAACCGTTTTttacgcttac < 1:2037844/150‑1 (MQ=255)
gTCGACACTGGTACGGGTAGTGCTCGGGCTGGTAACACCCGATGAAGGGGTTATCAAGCGCAACGGAAAACTGCGCATCGGCTATGTACCGCAGAAGCTGTATCTCGACACCACGTTGCCACTGACCGAAAACCGTTTTttacgcttacg > 1:2518469/1‑150 (MQ=255)
gTCGACACTGGTACGGGTAGTGCTCGGGCTGGTAACACCCGATGAAGGGGTTATCAAGCGCAACGCAAAACTGCGCATCGGCTATGTACCGCAGAAGCTGTATCTCGACACCACGTAGCCACAGACCGTAAACCGTATTttacgcttacg > 1:2574242/1‑150 (MQ=255)
cacTGGTACGGGTAGTGCTCGGGCTGGTAACTCCCGATGAAGGGGTTATCAAGCGCAACGGAAAACTGCGCATCGGCTATGTACCGCAGAAGCTGTATCTCGACACCACGTTGCCACTGACCGTAAACCGTTTTTTACGCTTACGCCCTg < 1:473194/150‑1 (MQ=255)
gTACGGGTAGTGCTCGGGCTGGTAACACCCGATGAAGGGGTTATCAAGCGCAACGGAAAACTGCGCATCGGCTATGTACCGCAGAAGCTGTATCTCGACACCACGTTGCCACTGACCGTAAACCGTTTTTTACGCTTACGCCCTGGTaca > 1:4145046/1‑150 (MQ=255)
gTACGGGTAGTGCTCGGGCTGGTAACACCCGATGAAGGGGTTATCAAGCGCAACGGAAAACTGCGCATCGGCTATGTACCGCAGAAGCTGTATCTCGACACCACGTTGCCACTGACCGTAAACCGTTTTTTACGCTTACGCCCTGGTaca < 1:2687189/150‑1 (MQ=255)
tACGGGTAGTGCTCGGGCTGGTAACACCCGTTGAAGGGGTTATCAAGCGCAACGGAAAACTGCGCATCGGCTATGTACCGCAGAAGCTGTATCTCGACACCACGTTGCCACTGACCGTAAACCGTTTTTTACGCTTACGCCCTGGTacac < 2:521208/150‑1 (MQ=255)
cGGGTAGTGCTCGGGCTGGTAACACCCGATGAAGGGGTTATCAAGCGCAACGGAAAACTGCGCATCGGCTATGTACCGCAGAAGCTGTATCTCGACACCACGTTGCCACTGACCGTAAACCGTTTTTTACGCTTACGCCCTGGTACACAt < 1:4159972/150‑1 (MQ=255)
cGGGTAGTGCTCGGGCTGGTAACACCCGATGAAGGGGTTATCAAGCGCAACGGAAAACTGCGCATCGGCTATGTACCGCAGAAGCTGTATCTCGACACCACGTTGCCACTGACCGTAAACCGTTTTTTACGCTTACGCCCTGGTACACAt < 1:2305806/150‑1 (MQ=255)
cGGGTAGTGCTCGGGCTGGTAACACCCGATGAAGGGGTTATCAAGCGCAACGGAAAACTGCGCATCGGCTATGTACCGCAGAAGCTGTATCTCGACACCACGTTGCCACTGACCGTAAACCGTTTTTTACGCTTACGCCCTGGTACACAt < 2:2139727/150‑1 (MQ=255)
gggTAGTGCTCGGGCTGGTAACACCCGATGAAGGGGTTATCAAGCGCAACGGAAAACTGCGCATCGGCTATGTACCGCAGAAGCTGTATCTCGACACCACGTTGCCACTGACCGTAAACCGTTTTTTACGCTTACGCCCTGGTACACATa < 1:2931699/150‑1 (MQ=255)
aGTGCTCGGGCTGGTAACACCCGATGAAGGGGTTATCAAGCGCAACGGAAAACTGCGCATCGGCTATGTACCGCAGAAGCTGTATCTCGACACCACGTTGCCACTGACCGTAAACCGTTTTTTACGCTTACGCCCTGGTACACATAaaga > 1:1355507/1‑150 (MQ=255)
gTGCTCGGGCTGGTAACACCCGATGAAGGGGTTATCAAGCGCAACGGAAAACTGCGCATCGGCTATGTACCGCAGAAGCTGTATCTCGACACCACGTTGCCACTGACCGTAAACCGTTTTTTACGCTTACGCCCTGGTACACATAaagaa > 1:1555885/1‑150 (MQ=255)
cTCGGGCTGGTAACACCCGATGAATGGGTTATCAAGCGCAACGGAAAACTGCGCATCGGCTATGTACCGCAGAAGCTGTATCTCGACACCACGTTGCCACTGACCGTAAACCGTTTTTTACGCTTACGCCCTGGTACACATAAAGAAGat < 1:1159547/150‑1 (MQ=255)
cTCGGGCTGGTAACACCCGATGAAGGGGTTATCAAGCGCAACGGACAACTGCGCATCGGCTATGGACCGCAGAAGCTGTATCTCGACACCACGTTGCCACTGACCGTAAAACGTTTTTTACGCTTACGCCCTGGTACACATAAAGAAGat < 1:1159458/150‑1 (MQ=255)
cTCGGGCTGGTAACACCCGATGAAGGGGTTATCAAGCGCAACGGAAAACTGCGCATCGGCTATGTACCGCAGAAGCTGTATCTCGACACCACGTTGCCACTGACCGTAAACCGTTTTTTACGCTTACGCCCTGGTACACATAAAGAAGat < 2:4043280/150‑1 (MQ=255)
tCGGGCTGGTAACACCCGATGAAGGGGTTATCAAGCGCAACGGAAAACTGCGCATCGGCTATGTACCGCAGAAGCTGTATCTCGACACCACGTTGCCACTGACCGTAAACCGTTTTTTACGCTTACGCCCTGGTACACATAAAGAAGata < 1:2503016/150‑1 (MQ=255)
tCGGGCTGGTAACACCCGATGAAGGGGTTATCAAGCGCAACGGAAAACTGCGCATCGGCTATGTACCGCAGAAGCTGTATCTCGACACCACGTTGCCACTGACCGTAAACCGTTTTTTACGCTTACGCCCTGGTACACATAAAGAAGata < 2:2858093/150‑1 (MQ=255)
cGGGCTGGTAACACCCGATGAAGGGGTTATCAAGCGCAACGGAAAACTGCGCATCGGCTATGTACCGCAGAAGCTGTATCTCGACACCACGTTGCCACTGACCGTAAACCGTTTTTTACGCTTACGCCCTGGTACACATAAAGAAGatat > 1:2914329/1‑150 (MQ=255)
tGGTAACACCCGATGAAGGGGTTATCAAGCGCAACGGAAAACTGCGCATCGGCTATGTACCGCAGAAGCTGTATCTCGACACCACGTTGCCACTGACCGTAAACCGTTTTTTACGCTTACGCCCTGGTACACATAAAGAAGATATTTTGc > 2:3527688/1‑150 (MQ=255)
gTAACACCCGATGAAGGGGTTATCAAGCGCAACGGAAAACTGCGCATCGGCTATGTACCGCAGAAGCTGTATCTCGACACCACGTTGCCACTGACCGTAAACCGTTTTTTACGCTTACGCCCTGGTACACATAAAGAAGATATTTTGCCt < 2:626268/150‑1 (MQ=255)
aaCACCCGATGAAGGGGTTATCAAGCGCAACGGAAAACTGCGCATCGGCTATGTACCGCAGAAGCTGTATCTCGACACCACGTTGCCACTGACCGTAAACCGTTTTTTACGCTTACGCCCTGGTACACATAAAGAAGATATTTTGCCTGc > 2:2069465/1‑150 (MQ=255)
acacCCGATGAAGGGGTTATCAAGCGCAACGGAAAACTGCGCATCGGCTATGTACCGCAGAAGCTGTATCTCGACACCACGTTGCCACTGACCGTAAACCGTTTTTTACGCTTACGCCCTGGTACACATAAAGAAGATATTTTGCCTGCa > 2:2129788/1‑150 (MQ=255)
cacCCGATGAAGGGGTTATCAAGCGCAACGGAAAACTGCGCATCGGCTATGTACCGCAGAAGCTGTATCTCGACACCACGTTGCCACTGACCGTAAACCGTTTTTTACGCTTACGCCCTGGTACACATAAAGAAGATATTTTGCCTGCAc < 2:2822187/150‑1 (MQ=255)
|
CTGGAAAATGTCTCGGTTTCTTTTGGCCAACGCCGCGTCCTCTCTGATGTGTCGCTGGAACTTAAACCTGGAAAAATTTTGACTTTACTTGGGCCAAATGGCGCAGGTAAGTCGACACTGGTACGGGTAGTGCTCGGGCTGGTAACACCCGATGAAGGGGTTATCAAGCGCAACGGAAAACTGCGCATCGGCTATGTACCGCAGAAGCTGTATCTCGACACCACGTTGCCACTGACCGTAAACCGTTTTTTACGCTTACGCCCTGGTACACATAAAGAAGATATTTTGCCTGCACT > CP009273/1936937‑1937232
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
GATK/CNVnator alignment
N/A
