Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A1 F204 I0 R1
|
1155 |
255.8 |
8356456 |
95.7% |
7997128 |
150.0 |
Breseq alignment
BRESEQ :: Evidence
|
| evidence |
seq id |
position |
mutation |
freq |
annotation |
gene |
description |
| RA |
CP009273 |
2,668,994 |
C→A |
35.0% |
D43Y (GAT→TAT) |
yphC ← |
putative Zn‑dependent NAD(P)‑binding oxidoreductase |
|
| |
seq id |
position |
ref |
new |
freq |
score (cons/poly) |
reads |
annotation |
genes |
product |
| * | CP009273 | 2,668,994 | 0 | C | A | 35.0%
| 357.6
/ 212.3
| 222 | D43Y (GAT→TAT) | yphC | putative Zn‑dependent NAD(P)‑binding oxidoreductase |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (55/89); new base A (32/46); total (87/135) |
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 7.73e-01 |
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 |
Only 100 of 223 total aligned reads displayed.
GCGGTCGCCCTCTTTAAAATGGCGGCAGCCTTGCCCCATCGCCACAATCTGCCCGCACGGTTCATGACCGTTGATAAAGCCCTGGTATAACGGTTTATCGGGTGCCGCCGCTGTGGCACGGTGTTGATGATAGATATAGTGGACATCGCTTCCGCAAATCCCGGAGGATTTCATTTTGATCAGTACCTGGTTAATCCCCGGCGTCGGCACCGCAACTTCCCGCAGATCGACGGTCGAATTTCCTGGTAAATAAGCTGCCAGCATCGTTTTCATAAATCCCTCATTAACAATACGAT > CP009273/2668848‑2669143
|
gCCCTCTTTAAAATGGCGGCAGCCTTGCCCCATCGCCACAATCTGCCCGCACGGTTCATGACCGTTGATAAAGCCCTGGTATAACGGTTTATCGGGTGCCGCCGCTGTGGCACGGTGTTGATGATAGATATAGTGGACATCGCTTCCGCa > 2:3904745/1‑150 (MQ=255)
gCCCTCTTTAAAATGGCGGCAGCCTTGCCCCATCGCCACAATCTGCCCGCACGGTTCATGACCGTTGATAAAGCCCTGGTATAACGGTTTATCGGGTGCCGCCGCTGTGGCACGGTGTTGATGATAGATATAGTGGACATAGCTTCCGCa > 1:114390/1‑150 (MQ=255)
ccTCTTTAAAATGGCGGCAGCCTTGCCCCATCGCCACAATCTGCCCGCACGGTTCATGACCGTTGATAAAGCCCTGGTATAACGGTTTATCGGGTGCCGCCGCTGTGGCACGGTGTTGATGATAGATATAGTGGACATCGCTTCCGCaaa > 1:318359/1‑150 (MQ=255)
ctctTTAAAATGGCGGCAGCCTTGCCCCATCGCCACAATCTGCCCGCACGGTTCATGACCGTTGATAAAGCCCTGGTATAACGGTTTATCGGGTGCCGCCGCTGTGGCACGGTGTTGATGATAGATATAGTGGACATCGCTTCCGCAAAt > 2:3627629/1‑150 (MQ=255)
tttAAAATGGCGGCAGCCTTGCCCCATCGCCACAATCTGCCCGCACGGTTCATGACCGTTGATACAGCCCTGGTATAACGGTTTATCGGGTGCCGCCGCTGTGGCACGGTGTTGATGATAGATATAGTGGACATCGCTTCCGCAAATccc < 1:17042/150‑1 (MQ=255)
tttAAAATGGCGGCAGCCTTGCCCCATCGCCACAATCTGCCCGCACGGTTCATGACCGTTGATAAAGCCCTGGTATAACGGTTTATCGGGTGCCGCCGCTGTGGCACGGTGTTGATGATAGATATAGTGGACATAGCTTCCGCAAATccc < 1:1209433/150‑1 (MQ=255)
tAAAATGGCGGCAGCCTTGCCCCATCGCCACAATCTGCCCGCACGGTTCATGACCGTTGATAAAGCCCTGGTATAACGGTTTATCGGGTGCCGCCGCTGTGGCACGGTGTTGATGATAGATATAGTGGACATCGCTTCCGCAAATCCCgg > 1:481393/1‑150 (MQ=255)
aaaTGGCGGCAGCCTTGCCCCATCGCCACAATCTGCCCGCACGGTTCATGACCGTTGATAAAGCCCTGGTATAACGGTTTATCGGGTGCCGCCGCTGTGGCACGGTGTTGATGATAGATATAGTGGACATCGCTTCCGCAAATCCCggag < 1:546378/150‑1 (MQ=255)
aaaTGGCGGCAGCCTTGCCCCATCGCCACAATCTGCCCGCACGGTTCATGACCGTTGATAAAGCCCTGGTATAACGGTTTATCGGGTGCCGCCGCTGTGGCACGGTGTTGATGATAGATATAGTGGACATCGCTTCCGCAAATCCCggag < 1:2341530/150‑1 (MQ=255)
aaTGGCGGCAGCCTTGCCCCATCGCCACAATCTGCCCGCACGGTTCATGACCGTTGATAAAGCCCTGGTATAACGGTTTATCGGGTGCCGCCGCTGTGGCACGGTGTTGATGATAGATATAGTGGACATCGCTTCCGCAAATCCCggagg < 2:3081051/150‑1 (MQ=255)
gcggcAGCCTTGCCCCATCGCCACAATCTGCCCGCACGGTTCATGACCGTTGATAAAGCCCTGGTATAACGGTTTATCGGGTGCCGCCGCTGTGGCACGGTGTTGATGATAGATATAGTGGACATCGCTTCCGCAAATCCCGGAGGAttt < 1:1089023/150‑1 (MQ=255)
cggcAGCCTTGCCCCATCGCCACAATCTGCCCGCACGGTTCATGACCGTTGATAAAGCCCTGGTATAACGGTTTATCGGGTGCCGCCGCTGTGGCACGGTGTTGATGATAGATATAGTGGACATAGCTTCCGCAAATCCCGGAGGATTTc > 2:3906491/1‑150 (MQ=255)
cggcAGCCTTGCCCCATCGCCACAATCTGCCCGCACGGTTCATGACCGTTGATAAAGCCCTGGTATAACGGTTTATCGGGTGCCGCCGCTGTGGCACGGTGTTGATGATAGATATAGTGGACATAGCTTCCGCAAATCCCGGAGGATTTc < 1:2373074/150‑1 (MQ=255)
cAGCCTTGCCCCATCGCCACAATCTGCCCGCACGGTTCATGACCGTTGATAAAGCCCTGGTATAACGGTTTATCGGGTGCCGCCGCTGTGGCACGGTGTTGATGATAGATATAGTGGACATCGCTTCCGCAAATCCCGGAGGATTTCAtt > 2:3010136/1‑150 (MQ=255)
cAGCCTTGCCCCATCGCCACAATCTGCCCGCACGGTTCATGACCGTTGATAAAGCCCTGGTATAACGGTTTATCGGGTGCCGCCGCTGTGGCACGGTGTTGATGATAGATATAGTGGACATCGCTTCCGCAAATCCCGGAGGATTTCAtt > 1:2182701/1‑150 (MQ=255)
aGCCTTGCCCCATCGCCACAATCTGCCCGCACGGTTCATGACCGTTGATAAAGCCCTGGTATAACGGTTTATCGGGTGCCGCCGCTGTGGCACGGTGTTGATGATAGATATAGTGGACATCGCTTCCGCAAATCCCGGAGGATTTCAttt < 1:1952441/150‑1 (MQ=255)
ccTTGCCCCATCGCCACAATCTGCCCGCACGGTTCATGACCGTTGATAAAGCCCTGGTATAACGGTTTATCGGGTGCCGCCGCTGTGGCACGGTGTTGATGATAGATATAGTGGACATCGCTTCCGCAAATCCCGGAGGATTTCATtgtg > 2:2200710/1‑150 (MQ=255)
ttGCCCCATCGCCACAATCTGCCCGCACGGTTCATGACCGTTGATAAAGCCCTGGTATAACGGTTTATCGGGTGCCGCCGCTGTGGCACGGTGTTGATGATAGATATAGTGGACATAGCTTCCGCAAATCCCGGAGGATTTCATTTTGAt > 2:3391089/1‑150 (MQ=255)
ccccATCGCCACAATCTGCCCGCACGGTTCATGACCGTTGATAAAGCCCTGGTATAACGGTTTATCGGGTGCCGCCGCTGTGGCACGGTGTTGATGATAGATATAGTGGACATCGCTTCCGCAAATCCCGGAGGATTTCATTTTGATCAg < 2:461543/150‑1 (MQ=255)
ccccATCGCCACAATCTGCCCGCACGGTTCATGACCGTTGATAAAGCCCTGGTATAACGGTTTATCGGGTGCCGCCGCTGTGGCACGGTGTTGATGATAGATATAGTGGACATCGCTTCCGCAAATCCCGGAGGATTTCATTTTGATCAg < 1:2415437/150‑1 (MQ=255)
ccccATCGCCACAATCTGCCCGCACGGTTCATGACCGTTGATAAAGCCCTGGTATAACGGTTTATCGGGTGCCGCCGCTGTGGCACGGTGTTGATGATAGATATAGTGGACATAGCTTCCGCAAATCCCGGAGGATTTCATTTTGATCAg < 1:1370417/150‑1 (MQ=255)
aTCGCCACAATCTGCCCGCACGGTTCATGACCGTTGATAAAGCCCTGGTATAACGGTTTATCGGGTGCCGCCGCTGTGGCACGGTGTTGATGATAGATATAGTGGACATCGCTTCCGCAAATCCCGGAGGATTTCATTTTGATCAGTAcc > 2:1745164/1‑150 (MQ=255)
tCGCCACAATCTGCCCGCACGGTTCATGACCGTTGATAAAGCCCTGGTATAACGGTTTATCGGGTGCCGCCGCTGTGGCACGGTGTTGATGATAGATATAGTGGACATCGCTTCCGCAAATCCCGGAGGATTTCATTTTGATCAGTACCt < 2:287002/150‑1 (MQ=255)
cGCCACAATCTGCCCGCACGGTTCATGACCGTTGATAAAGCCCTGGTATAACGGTTTATCGGGTGCCGCCGCTGTGGCACGGTGTTGATGATAGATATAGTGGACATAGCTTCCGCAAATCCCGGAGGATTTCATTTTGATCAGTACCTg < 2:2570306/150‑1 (MQ=255)
cGCCACAATCTGCCCGCACGGTGCATGACCGTTGATAAAGCCCTGGTATACCGGTTTATCGGGTGCCGCCGCTGTGGCACGGTGTTGATGATAGATATAGTGGACATAGCTTCCGCAAATCCCGGAGGATTTCATTTTGATCAGTACCTg < 2:482847/150‑1 (MQ=255)
ccACAATCTGCCCGCACGGTTCATGACCGTTGATAAAGCCCTGGTATAACGGTTTATCGGGTGCCGCCGCTGTGGCACGGTGTTGATGATAGATATAGTGGACATCGCTTCCGCAAATCCCGGAGGATTTCATTTTGATCAGTACCTGGt > 2:368416/1‑150 (MQ=255)
cacaATCTGCCCGCACGGTTCATGACCGTTGATAAAGCCCTGGTATAACGGTTTATCGGGTGCCGCCGCTGTGGCACGGTGTTGATGATAGATATAGTGGACATCGCTTCCGCAAATCCCGGAGGATTTCATTTTGATCAGTACCTGGtt > 1:1856652/1‑150 (MQ=255)
cacaATCTGCCCGCACGGTTCATGACCGTTGATAAAGCCCTGGTATAACGGTTTATCGGGTGCCGCCGCTGTGGCACGGTGTTGATGATAGATATAGTGGACATCGCTTCCGCAAATCCCGGAGGATTTCATTTTGATCAGTACCTGGtt < 2:3429446/150‑1 (MQ=255)
acaATCTGCCCGCACGGTTCATGACCGTTGATAAAGCCCTGGTATAACGGTTTATCGGGTGCCGCCGCTGTGGCACGGTGTTGATGATAGATATAGTGGACATCGCTTCCGCAAATCCCGGAGGATTTCATTTTGATCAGTACCTGGTTa < 2:1921338/150‑1 (MQ=255)
aTCTGCCCGCACGGTTCATGACCGTTGATAAAGCCCTGGTATAACGGTTTATCGGGTGCCGCCGCTGTGGCACGGTGTTGATGATAGATATAGTGGACATCGCTTCCGCAAATCCCGGAGGATTTCATTTTGATCAGTACCTGGTTAATc < 1:1975433/150‑1 (MQ=255)
aTCTGCCCGCACGGTTCATGACCGTTGATAAAGCCCTGGTATAACGGTTTATCGGGTGCCGCCGCTGTGGCACGGTGTTGATGATAGATATAGTGGACATAGCTTCCGCAAATCCCGGAGGATTTCATTTTGATCAGTACCTGGTTAATc > 1:3169088/1‑150 (MQ=255)
tGCCCGCACGGTTCATGACCGTTGATAAAGCCCTGGTATAACGGTTTATCGGGTGCCGCCGCTGTGGCACGGTGTTGATGATAGATATAGTGGACATCGCTTCCGCAAATCCCGGAGGATTTCATTTTGATCAGTACCTGGTTAATcccc < 1:2107600/150‑1 (MQ=255)
cccGCACGGTTCATGACCGTTGATAAAGCCCTGGTATAACGGTTTATCGGGTGCCGCCGCTGTGGCACGGTGTTGATGATCGATATAGTGGACATCGCTTCCGCAAATCCCGGAGGATGTCATTTTGATCAGTACCTGGTTAATCCCCgg > 1:283023/1‑150 (MQ=255)
cccGCACGGTTCATGACCGTTGATAAAGCCCTGGTATAACGGTTTATCGGGTGCCGCCGCTGTGGCACGGTGTTGATGATAGATATAGTGGACATCGCTTCCGCAAATCCCGGAGGATTTCATTTTGATCAGTACCTGGTTAATCCCCgg > 2:2711042/1‑150 (MQ=255)
ccGCACGGTTCATGACCGTTGATAAAGCCCTGGTATAACGGTTTATCGGGTGCCGCCGCTGTGGCACGGTGTTGATGATAGATATAGTGGACATCGCTTCCGCAAATCCCGGAGGATTTCATTTTGATCAGTACCTGGTTAATCCCCGGc < 2:322614/150‑1 (MQ=255)
cGCACGGTTCATGACCGTTGATAAAGCCCTGGTATAACGGTTTATCGGGTGCCGCCGCTGTGGCACGGTGTTGATGATAGATATAGTGGACATCGCTTCCGCAAATCCCGGAGGATTTCATTTTGATCAGTACCTGGTTAATCCCCGGCg < 2:3292438/150‑1 (MQ=255)
cACGGTTCATGACCGTTGATAAAGCCCTGGTATAACGGTTTATCGGGTGCCGCCGCTGTGGCACGGTGTTGATGATAGATATAGTGGACATCGCTTCCGCAAATCCCGGAGGATTTCATTTTGATCAGTACCTGGTTAATCCCCGGCGTc < 1:1499950/150‑1 (MQ=255)
cACGGTTCATGACCGTTGATAAAGCCCTGGTATAACGGTTTATCGGGTGCCGCCGCTGTGGCACGGTGTTGATGATAGATATAGTGGACATCGCTCCCGCAAATCCCGGAGGATTTCATTTTGATCAGTACCTGGTTAATCCCCGGCGTc < 2:1214383/150‑1 (MQ=255)
tGACCGTTGATAAAGCCCTGGTATAACGGTTTATCGGGTGCCGCCGCTGTGGCACGGTGTTGATGATAGATATAGTGGACATCGCTTCCGCAAATCCCGGAGGATTTCATTTTGATCAGTACCTGGTTAATCCCCGGCGTCGGCACCGCa > 2:1138139/1‑150 (MQ=255)
tGATAAAGCCCTGGTATAACGGTTTATCGGGTGCCGCCGCTGTGGCACGGTGTTGATGATAGATATAGTGGACATAGCTTCCGCAAATCCCGGAGGATTTCATTTTGATCAGTACCTGGTTAATCCCCGGCGTCGGCACCGCAACTTccc < 2:2800909/150‑1 (MQ=255)
aaGCCCTGGTATAACGGTTTATCGGGTGCCGCCGCTGTGGCACGGTGTTGATGATAGATATAGTGGACATCGCTTCCGCAAATCCCGGAGGATTTCATTTTGATCAGTACCTGGTTAATCCCCGGCGTCGGCACCGCAACTTCCCGCAGa < 2:2991614/150‑1 (MQ=255)
aGCCCTGGTATAACGGTTTATCGGGTGCCGCCGCTGTGGCACGGTGTTGATGATAGATATAGTGGACATCGCTTCCGCAAATCCCGGAGGATTTCATTTTGATCAGTACCTGGTTAATCCCCGGCGTCGGCACCGCAACTTCCCGCAGAt > 2:2241275/1‑150 (MQ=255)
gCCCTGGTATAACGGTTTATCGGGTGCCGCCGCTGTGGCACGGTGTTGATGATAGATATAGTGGACATCGCTTCCGCAAATCCCGGAGGATTTCATTTTGATCAGTACCTGGTTAATCCCCGGCGTCGGCACCGCAACTTCCCGCAGATc < 1:209733/150‑1 (MQ=255)
cccTGGTATAACGGTTTATCGGGTGCCGCCGCTGTGGCACGGTGTTGATGATAGATATAGTGGACATCGCTTCCGCAAATCCCGGAGGATTTCATTTTGATCAGTACCTGGTTAATCCCCGGCGTCGGCACCGCAACTTCCCGCAGATCg < 2:2301707/150‑1 (MQ=255)
cccTGGTATAACGGTTTATCGGGTGCCGCCGCTGTGGCACGGTGTTGATGATAGATATAGTGGACATAGCTTCCGCAAATCCCGGAGGATTTCATTTTGATCAGTACCTGGTTAATCCCCGGCGTCGGCACCGCAACTTCCCGCAGATCg < 2:19965/150‑1 (MQ=255)
cccTGGTATAACGGTTTATCGGGTGCCGCCGCTGTGGCACGGTGTTGATGATAGATATAGTGGACATAGCTTCCGCAAATCCCGGAGGATTTCATTTTGATCAGTACCTGGTTAATCCCCGGCGTCGGCACCGCAACTTCCCGCAGATCg > 2:3192318/1‑150 (MQ=255)
ccTGGTATAACGGTTTATCGGGTGCCGCCGCTGTGGCACGGTGTTGATGATAGATATAGTGGACATCGCTTCCGCAAATCCCGGAGGATTTCATTTTGATCAGTACCTGGTTAATCCCCGGCGTCGGCACCGCAACTTCCCGCAGATCGa > 1:3773286/1‑150 (MQ=255)
ccTGGTATAACGGTTTATCGGGTGCCGCCGCTGTGGCACGGTGTTGATGATAGATATAGTGGACATAGCTTCCGCAAATCCCGGAGGATTTCATTTTGATCAGTACCTGGTTAATCCCCGGCGTCGGCACCGCAACTTCCCGCAGATCGa < 2:3569834/150‑1 (MQ=255)
ccTGGTATAACGGTTTATCGGGTGCCGCCGCTGTGGCACGGTGTTGATGATAGATAGAGTGGACATCGCTTCCGCAAATCCCGGAGGATTTCATTTTGATCAGTACCTGGTTAATCCCCGGCGTCGGCACCGCAACTTCCCGCAGATCGa < 2:3378137/150‑1 (MQ=255)
cTGGTATAACGGTTTATCGGGTGCCGCCGCTGTGGCACGGTGTTGATGATAGATATAGTGGACATAGCTTCCGCAAATCCCGGAGGATTTCATTTTGATCAGTACCTGGTTAATCCCCGGCGTCGGCACCGCAACTTCCCGCAGATCGAc < 2:2952577/150‑1 (MQ=255)
tGGTATAACGGTTTATCGGGTGCCGCCGCTGTGGCACGGTGTTGATGATAGATATAGTGGACATCGCTTCCGCAAATCCCGGAGGATTTCATTTTGATCAGTACCTGGTTAATCCCCGGCGTCGGCACCGCAACTTCCCGCAGATCGACg < 2:1154785/150‑1 (MQ=255)
ggTATAACGGTTTATCGGGTGCCGCCGCTGTGGCACGGTGTTGATGATAGATATAGTGGACATAGCTTCCGCTAATCCCGGAGGATTTCATTTTGATCAGTACCTGGTTAATCCCCGGCGTCGTCTCCGCAACTTCCCGCAGATCGACgg < 1:1604569/150‑1 (MQ=255)
gTATAACGGTTTATCGGGTGCCGCCGCTGTGGCACGGTGTTGATGATAGATATAGTGGACATCGCTTCCGCAAATCCCGGAGGATTTCATTTTGATCAGTACCTGGTTAATCCCCGGCGTCGGCACCGCAACTTCCCGCAGATCGACGGt < 1:610301/150‑1 (MQ=255)
tataACGGTTTATCGGGTGCCGCCGCTGTGGCACGGTGTTGATGATAGATATAGTGGACATCGCTTCCGCAAATCCCGGAGGATTTCATTTTGATCAGTACCTGGTTAATCCCCGGCGTCGGCACCGCAACTTCCCGCAGATCGACGGTc < 2:2040003/150‑1 (MQ=255)
tataACGGTTTATCGGGTGCCGCCGCTGTGGCACGGTGTTGATGATAGATATAGTGGACATAGCTTCCGCAAATCCCGGAGGATTTCATTTTGATCAGTACCTGGTTAATCCCCGGCGTAGGCACCGCAACTTCCCGCAGATCGACGGTc < 1:1414563/150‑1 (MQ=255)
taACGGTTTATCGGGTGCCGCCGCTGTGGCACGGTGTTGATGATAGATATAGTGGACATAGCTTCCGCAAATCCCGGAGGATTTCATTTTGATCAGTACCTGGTTAATCCCCGGCGTCGGCACCGCAACTTCCCGCAGATCGACGGTCGa < 1:3692897/150‑1 (MQ=255)
cGGTTTATCGGGTGCCGCCGCTGTGGCACGGTGTTGATGATAGATATAGTGGACATCGCTTCCGCAAATCCCGGAGGATTTCATTTTGATCAGTACCTGGTTAATCCCCGGCGTCGGCANCGCAACTTCCCGCAGATCGACGGTCGAAtt < 1:3859469/150‑1 (MQ=255)
cGGTTTATCGGGTGCCGCCGCTGTGGCACGGTGTTGATGATAGATATAGTGGACATCGCTTCCGCAAATCCCGGAGGATTTCATTTTGATCAGTACCTGGTTAATCCCCGGCGTCGGCACCGCAACTTCCCGCAGATCGACGGTCGAAtt > 1:790325/1‑150 (MQ=255)
cGGTTTATCGGGTGCCGCCGCTGTGGCACGGTGTTGATGATAGATATAGTGGACATAGCTTCCGCAAATCCCGGAGGATTTCATTTTGATCAGTACCTGGTTAATCCCCGGCGTCGGCACCGCAACTTCCCGCAGATCGACGGTCGAAtt < 1:3433531/150‑1 (MQ=255)
ttATCGGGTGCCGCCGCTGTGGCACGGTGTTGATGATAGATATAGTGGACATCGCTTCCGCAAATCCCGGAGGATTTCATTTTGATCAGTACCTGGTTAATCCCCGGCGTCGGCACCGCAACTTCCCGCAGATCGACGGTCGAATTTCCt < 1:4057113/150‑1 (MQ=255)
aTCGGGTGCCGCCGCTGTGGCACGGTGTTGATGATAGATATAGTGGACATCGCTTCCGCAAATCCCGGAGGATTTCATTTTGATCAGTACCTGGTTAATCCCCGGCGTCGGCACCGCAACTTCCCGCAGATCGACGGTCGAATTTCCTgg > 2:1777238/1‑150 (MQ=255)
aTCGGGTGCCGCCGCTGTGGCACGGTGTTGATGATAGATATAGTGGACATAGCTTCCGCAAATCCCGGAGGATTTCATTTTGATCAGTACCTGGTTAATCCCCGGCGTCGGCACCGCAACTTCCCGCAGATCGACGGTCGAATTTCCTgg > 2:3523730/1‑150 (MQ=255)
tCGGGTGCCGCCGCTGTGGCACGGTGTTGATGATAGATATAGTGGACATCGCTTCCGCAAATCCCGGAGGATTTCATTTTGATCAGTACCTGGTTAATCCCCGGCGTCGGCACCGCAACTTCCCGCAGATCGACGGTCGAATTTCCTGGt < 1:3530833/150‑1 (MQ=255)
cGGGTGCCGCCGCTGTGGCACGGTGTTGATGATAGATATAGTGGACATCGCTTCCGCAAATCCCGGAGGATTTCATTTTGATCAGTACCTGGTTAATCCCCGGCGTCGGCACCGCAACTTCCCGCAGATCGACGGTCGAATTTCCTGGTa > 1:3139742/1‑150 (MQ=255)
gggTGCCGCCGCTGTGGCACGGTGTTGATGATAGATCTAGTGGACATCGCTTCCGCAAATCCCGGAGGATTTAATTTAGATCATTACCTGGATAAACCCCCGCGACGGCACCGCAACTTCCCGCAGAACGACGGTCGAATATCCTTGTaa > 2:2731988/1‑150 (MQ=255)
gTGCCGCCGCTGTGGCACGGTGTTGATGATAGATATAGTGGACATCGCTTCCGCAAATCCCGGAGGATTTCATTTTGATCAGTACCTGGTTAATCCCCGGCGTCGGCACCGCAACTTCCCGCAGATCGACGGTCGAATTTCCTGGTAAAt < 1:4109939/150‑1 (MQ=255)
gTGCCGCCGCTGTGGCACGGTGTTGATGATAGATATAGTGGACATAGCTTCCGCAAATCCCGGAGGATTTCATTTTGATCAGTACCTGGTTAATCCCCGGCGTCGGCACCGCAACTTCCCGCAGATCGACGGTCGAATTTCCTGGTAAAt < 2:1414671/150‑1 (MQ=255)
gTGCCGCCGCTGGGGCACGGTGTTGATGATAGATATAGTGGACATAGCTTCCGCAAATCCCGGAGGATTTCATTTTGATCAGTACCTGGTTAATCCCCGGCGTCGGCACCGCAACTTCCCGCAGATCGACGGTCGAATTTCCTGGTAAAt < 2:1414876/150‑1 (MQ=255)
ccgcTGTGGCACGGTGTTGATGATAGATATAGTGGACATCGCTTCCGCAAATCCCGGAGGATTTCATTTTGATCAGTACCTGGTTAATCCCCGGCGTCGGCACCGCAACTTCCCGCAGATCGACGGTCGAATTTCCTGGTAAATAAGCTg > 2:4123694/1‑150 (MQ=255)
cgcTGTGGCACGGTGTTGATGATAGATATAGTGGACATCGCTTCCGCAAATCCCGGATGATTTCATTTTGATCAGTACCTGGTTAATCCCCGGCGTCGGCACCGCAACTTCCCGCAGATCGACGGTCGAATTTCCTGGTAAATAAGCTGc > 2:3385446/1‑150 (MQ=255)
gcTGTGGCACGGTGTTGATGATAGATATTGTGGACATCGCTTCCGCATATCCCGGAGGATTTCTTTTTGATCAGTACCTGGTTAATCCCCGGCGTCGGCACCGCAACTTCCCGCAGATCGACGGTCGAATTTCCTTGTAAATAAGCTGcc < 1:1630688/150‑1 (MQ=255)
cTGTGGCACGGTGTTGATGATAGATATAGTGGACATCGCTTCCGCAAATCCCGGAGGATTTCATTTTGATCAGTACCTGGTTAATCCCCGGCGTCGGCACCGCAACTTCCCGCAGATCGACGGTCGAATTTCCTGGTAAATAAGCTGCCa < 1:2976495/150‑1 (MQ=255)
cTGTGGCACGGTGTTGATGATAGATATAGTGGACATCGCTTCCGCAAATCCCGGAGGATTTCATTTTGATCAGTACCTGGTTAATCCCCGGCGTCGGCACCGCAACTTCCCGCAGATCGACGGTCGAATTTCCTGGTAAATAAGCTGCCa < 1:92439/150‑1 (MQ=255)
cTGTGGCACGGTGTTGATGATAGATATAGTGGACATCGCTTCCGCAAATCCCGGAGGATTTCATTTTGATCAGTACCTGGTTAATCCCCGGCGTCGGCACCGCAACTTCCCGCAGATCGACGGTCGAATTTCCTGGTAAATAAGCTGCCa > 1:662420/1‑150 (MQ=255)
tgtgGCACGGTGTTGATGATAGATATAGTGGACATAGCTTCCGCAAATCCCGGAGGATTTCATTTTGATCAGTACCTGGTTAATCCCCGGCGTCGGCACCGCAACTTCCCGCAGATCGACGGTCGAATTTCCTGGTAAATAAGCTGCCAg > 1:2095581/1‑150 (MQ=255)
tgtgGCACGGTGTTGATGATAGATATAGTGGACATAGCTTCCGCAAATCCCCCAGGATTTCATTTTGATCAGTACCTGGTTAATCCCCGGCGTCGGCACCGCAACTTCCCGCAGATCGACGGTCGAATTTCCTGGTAAATAAGCTGCCAg > 1:3409951/1‑150 (MQ=255)
ggCACGGTGTTGATGATAGATATAGTGGACATAGCGTCCGCACATCCCGGAGGATTTCATTTTGATCAGTACCTGGTTAATCCCCGGCGTCGGCACCGCAACTTCCCGCAGATCGACGGTCGAATTTCCTGGTAAATAAGCTGCCAGCAt < 2:1272383/150‑1 (MQ=255)
gCACGGTGTTGATGATAGATATAGTGGACATCGCTTCCGCAAATCCCGGAGGATTTCATTTTGATCAGTACCTGGTTAATCCCCGGCGTCGGCACCGCAACTTCCCGCAGATCGACGGTCGAATTTCCTGGTAAATAAGCTGCCAGCATc > 1:3755469/1‑150 (MQ=255)
gCACGGTGTTGATGATAGATATAGTGGACATAGCTTCCGCAAATCCCGGAGGATTTCATTTTGATCAGTACCTGGTTAATCCCCGGCGTCGGCACCGCAACTTCCCGCAGATCGACGGTCGAATTTCCTGGTAAATAAGCTGCCAGCATc > 2:1127364/1‑150 (MQ=255)
aCGGTGTTGATGATAGATATAGTGGACATCGCTTCCGCAAATCCCGGAGGATTTCATTTTGATCAGTACCTGGTTAATCCCCGGCGTCGGCACCGCAACTTCCCGCAGATCGACGGTCGTATTTCCTGGTAAATAAGCTGCCAGCATCGt < 2:1527899/150‑1 (MQ=255)
aCGGTGTTGATGATAGATATAGTGGACATAGCTTCCGCAAATCCCGGAGGATTTCATTTTGATCAGTACCTGGTTAATCCCCGGCGTCGGCACCGCAACTTCCCGCAGATCGACGGTCGAATTTCCTGGTAAATAAGCTGCCAGCATCGt < 1:437298/150‑1 (MQ=255)
cGGTGTTGATGATAGATATAGTGGACATCGCTTCCGCAAATCCCGGAGGATTTCATTTTGATCAGTACCTGGTTAATCCCCGGCGTCGGCACCGCAACTTCCCGCAGATCGACGGTCGAATTTCCTGGTAAATAAGCTGCCAGCATCGtt < 2:686414/150‑1 (MQ=255)
ggTGTTGATGATAGATATAGTGGACATCGCTTCCGCAAATCCCGGAGGATTTCATTTTGATCAGTACCTGGTTAATCCCCGGCGTCGGCACCGCAACTTCCCGCAGATCGACGGTCGAATTTCCTGGTAAATAAGCTGCCAGCATCGttt > 2:1491578/1‑150 (MQ=255)
ggTGTTGATGATAGATATAGTGGACATAGCTTCCGCAAATCCCGGAGGATTTCATTTTGATCAGTACCTGGTTAATCCCCGGCGTCGGCACCGCAACTTCCCGCAGATCGACGGTCGAATTTCCTGGTAAATAAGCTGCCAGCATCGttt > 2:645342/1‑150 (MQ=255)
gtgtTGATGATAGATATAGTGGACATAGCTTCCGCAAATCCCGGAGGATTTCATTTTGATCAGTACCTGGTTAATCCCCGGCGTCGGCACCGCAACTTCCCGCAGATCGACGGTCGAATTTCCTGGTAAATAAGCTGCCAGCATCGtttt < 1:3911965/150‑1 (MQ=255)
tgtTGATGATAGATATAGTGGACATCGCTTCCGCAAATCCCGGAGGATTTCATTTTGATCAGTACCTGGTTAATCCCCGGCGTCGGCACCGCAACTTCCCGCAGATCGACGGTCGAATTTCCTGGTAAATAAGCTGCCAGCATCGTTTTc < 2:1322379/150‑1 (MQ=255)
gtTGATGATAGATATAGTGGACATCGCTTCCGCAAATCCCGGAGGATTTCATTTTGATCAGTACCTGGTTAATCCCCGGCGTCGGCACCGCAACTTCCCGCAGATCGACGGTCGAATTTCCTGGTAAATAAGCTGCCAGCATCGTTTTCa > 1:2073088/1‑150 (MQ=255)
ttGATGATAGATATAGTGGACATCGCTTCCGCAAATCCCGGAGGATTTCATTTTGATCAGTACCTGGTTAATCCCCGGCGTCGGCACCGCAACTTCCCGCAGATCGACGGTCGAATTTCCTGGTAAATAAGCTGCCAGCATCGTTTTCAt > 2:1072170/1‑150 (MQ=255)
atgatAGATATAGTGGACATAGCTTCCGCAAATCCCGGAGGATTTCATTTTGATCAGTACCTGGTTAATCCCCGGCGTCGGCACCGCAACTTCCCGCAGATCGACGGTCGAATTTCCTGGTAAATAAGCTGCCAGCATCGTTTTCATaaa < 2:2920774/150‑1 (MQ=255)
tgatAGATATAGTGGACATCGCTTCCGCAAATCCCGGAGGATTTCATTTTGATCAGTACCTGGTTAATCCCCGGCGTCGGCACCGCAACTTCCCGCAGATCGACGGTCGAATTTCCTGGTAAATAAGCTGCCAGCATCGTTTTCATAAAt < 2:3731097/150‑1 (MQ=255)
tgatAGATATAGTGGACATAGCTTCCGCAAATCCCGGAGGATTTCATTTTGATCAGTACCTGGTTAATCCCCGGCGTCGGCACCGCAACTTCCCGCAGATCGACGGTCGAATTTCCTGGTAAATAAGCTGCCAGCATCGTTTTCATAAAt < 1:2003866/150‑1 (MQ=255)
tgatAGATATAGTGGACATAGCTTCCGCAAATCCCGGAGGATTTCATTTTGATCAGTACCTGGTTAATCCCCGGCGTCGGCACCGCAACTTCCCGCAGATCGACGGTCGAATTTCCTGGTAAATAAGCTGCCAGCATCGTTTTCATAAAt < 1:2656906/150‑1 (MQ=255)
tgatAGATATAGTGGACATAGCTTCCGCAAATCCCGGAGGATTTCATTTTGATCAGTACCTGGTTAATCCCCGGCGTCGGCACCGCAACTTCCCGCAGATCGACGGTCGAATTTCCTGGTAAATAAGCTGCCAGCATCGTTTTCATAAAt < 1:3968307/150‑1 (MQ=255)
gatagataTAGTGGACATCGCTTCCGCAAATCCCGGAGGATTTCATTTTGATCAGTACCTGGTTAATCCCCGGCGTCGGCACCGCAACTTCCCGCAGATCGACGGTCGAATTTCCTGGTAAATAAGCTGCCAGCATCGTTTTCATAAATc < 1:2144658/150‑1 (MQ=255)
taGTGGACATCGCTTCCGCAAATCCCGGAGGATTTCATTTTGATCAGTACCTGGTTAATCCCCGGCGTCGGCACCGCAACTTCCCGCAGATCGACGGTCGAATTTACTGGTAAATAAGCTGCCAGCATCGTTTTCATAAATCCCTCATTa < 1:2720187/150‑1 (MQ=255)
gTGGACATCGCTTCCGCAAATCCCGGAGGATTTCATTTTGATCAGTACCTGGTTAATCCCCGGCGTCGGCACCGCAACTTCCCGCAGATCGACGGTCGAATTTCCTGGTAAATAAGCTGCCAGCATCGTTTTCATAAATCCCTCATTAAc < 2:399332/150‑1 (MQ=255)
tGGACATCGCTTCCGCAAATCCCGGAGGATTTCATTTTGATCAGTACCTGGTTAATCCCCGGCGTCGGCACCGCAACTTCCCGCAGATCGACGGTCGAATTTCCTGGTAAATAAGCTGCCAGCATCGTTTTCATAAATCCCTCATTAACa > 2:2311146/1‑150 (MQ=255)
ggACATCGCTTCCGCAAATCCCGGAGGATTTCATTTTGATCAGTACCTGGTTAATCCCCGGCGTCGGCACCGCAACTTCCCGCAGATCGACGGTCGAATTTCCTGGTAAATAAGCTGCCAGCATCGTTTTCATAAATCCCTCATTAACaa > 1:2635377/1‑150 (MQ=255)
aCATCGCTTCCGCAAATCCCGGAGGATTTCATTTTGATCAGTACCTGGTTAATCCCCGGCGTCGGCACCGCAACTTCCCGCAGATCGACGGTCGAATTTCCTGGTAAATAAGCTGCCAGCATCGTTTTCATAAATCCCTCATTAACAATa < 1:618961/150‑1 (MQ=255)
cGCTTCCGCAAATCCCGGAGGATTTCATTTTGATCAGTACCTGGTTAATCCCCGGCGTCGGCACCGCAACTTCCCGCAGATCGACGGTCGAATTTCCTGGTAAATAAGCTGCCAGCATCGTTTTCATAAATCCCTCATTAACAATACGAt > 1:2579741/1‑150 (MQ=255)
|
GCGGTCGCCCTCTTTAAAATGGCGGCAGCCTTGCCCCATCGCCACAATCTGCCCGCACGGTTCATGACCGTTGATAAAGCCCTGGTATAACGGTTTATCGGGTGCCGCCGCTGTGGCACGGTGTTGATGATAGATATAGTGGACATCGCTTCCGCAAATCCCGGAGGATTTCATTTTGATCAGTACCTGGTTAATCCCCGGCGTCGGCACCGCAACTTCCCGCAGATCGACGGTCGAATTTCCTGGTAAATAAGCTGCCAGCATCGTTTTCATAAATCCCTCATTAACAATACGAT > CP009273/2668848‑2669143
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
GATK/CNVnator alignment
N/A
