Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A1 F204 I0 R1
|
1155 |
255.8 |
8356456 |
95.7% |
7997128 |
150.0 |
Breseq alignment
BRESEQ :: Evidence
|
| evidence |
seq id |
position |
mutation |
freq |
annotation |
gene |
description |
| RA |
CP009273 |
3,068,854 |
C→A |
42.5% |
E230* (GAG→TAG) |
yggF ← |
fructose 1,6 bisphosphatase isozyme |
|
| |
seq id |
position |
ref |
new |
freq |
score (cons/poly) |
reads |
annotation |
genes |
product |
| * | CP009273 | 3,068,854 | 0 | C | A | 42.5%
| 332.7
/ inf
| 324 | E230* (GAG→TAG) | yggF | fructose 1,6 bisphosphatase isozyme |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (111/75); new base A (72/66); total (183/141) |
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 2.13e-01 |
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 |
Only 100 of 326 total aligned reads displayed.
AAGAGGATATCGTTCCCCCTCACCAGTTCATCGAGCGAGTACACACGGTTAACGTCAACGCCCATTGCCTTGCAACGCTTGCGCTCCTGCTCTGCAATCTGCCGATTTTCCGTGTAATCCCCTTTAGCCTGGCAAAAGTCAATCAGCTCGGCCTGCATATCCCCGCCTAATGCTTTAACGGCACAGGCAGAAATCACGCCTTCTGGCGCACCGCCGATGGTGTACATCACATCGTAAGGATTATCCTGCCAGCAGGTCAGCACGCTGGCGGCGACATCGCCATCCGGCAGGGCAAAAA > CP009273/3068706‑3069003
|
gATATCGTTCCCCCTCACCAGTTCATCGAGCGAGTACACACGGTTAACGTCAACGCCCATTGCCTTGCAACGCTTGCGCTCCTGCTCTGCAATCTGCCGATTTTCCGTGTAATCCCCTTTAGCCTGGCAAAAGTCAATCAGCTAGGCCTg < 2:485853/150‑1 (MQ=255)
tatCGTTCCCCCTCACCAGTTCATCGAGCGAGTACACACGGTTAACGTCAACGCCCATTGCCTTGCAACGCTTGCGCTCCTGCTCTGCAATCTGCCGATTTTCCGTGTAATCCCCTTTAGCCTGGCAAAAGTCAATCAGCTCGGCCTGCa > 1:1070183/1‑150 (MQ=255)
atCGTTCCCCCTCACCAGTTCATCGAGCGAGTACACACGGTTAACGTCAACGCCCATTGCCTTGCAACGCTTGCGCTCCTGCTCTGCAATCTGCCGATTTTCCGTGTAATCCCCTTTAGCCTGGCAAAAGTCAATCAGCTCGGCCTGCat > 2:1150603/1‑150 (MQ=255)
cGTTCCCCCTCACCAGTTCATCGAGCGAGTACACACGGTTAACGTCAACGCCCATTGCCTTGCAACGCTTGCGCTCCTGCTCTGCAATCTGCCGATTTTCCGTGTAATCCCCTTTAGCCTGGCAAAAGTCAATCAGCTCGGCCTGCatat < 1:73634/150‑1 (MQ=255)
gTTCCCCCTCACCAGTTCATCGAGCGAGTACACACGGTTAACGTCAACGCCCATTGCCTTGCAACGCTTGCGCTCCTGCTCTGCAATCTGCCGATTTTCCGTGTAATCCCCTTTAGCCTGGCAAAAGTCAATCAGCTCGGCCTGCATATc > 1:2714262/1‑150 (MQ=255)
ttCCCCCTCACCAGTTCATCGAGCGAGTACACACGGTTAACGTCAACGCCCATTGCCTTGCAACGCTTGCGCTCCTGCTCTGCAATCTGCCGATTTTCCGTGTAATCCCCTTTAGCCTGGCAAAAGTCAATCAGCTCGGCCTGCATATcc > 2:976561/1‑150 (MQ=255)
cccccTCACCAGTTCATCGAGCGAGTACACACGGTTAACGTCAACGCCCATTGCCTTGCAACGCTTGCGCTCCTGCTCTGCAATCTGCCGATTTTCCGTGTAATCCCCTTTAGCCTGGCAAAAGTCAATCAGCTAGGCCTGCATATcccc < 1:3300620/150‑1 (MQ=255)
ccccTCACCAGTTCATCGAGCGAGTACACACGGTTAACGTCAACGCCCATTGCCTTGCAACGCTTGCGCTCCTGCTCTGCAATCTGCCGATTTTCCGTGTAATCCCCTTTAGCCTGGCAAAAGTCAATCAGCTAGGCCTGCATATCCCCg > 2:2380072/1‑150 (MQ=255)
cccTCACCAGTTCATCGAGCGAGTACACACGGTTAACGTCAACGCCCATTGCCTTGCAACGCTTGCGCTCCTGCTCTGCAATCTGCCGATTTTCCGTGTAATCCCCTTTAGCCTGGCAAAAGTCAATCAGCTCGGCCTGCATATCCCCGc > 1:369339/1‑150 (MQ=255)
tCACCAGTTCATCGAGCGAGTACACACGGTTAACGTCAACGCCCATTGCCTTGCAACGCTTGCGCTCCTGCTCTGCAATCTGCCGATTTTCCGTGTAATCCCCTTTAGCCTGGCAAAAGTCAATCAGCTCGGCCTGCATATCCCCGCCTa > 1:48430/1‑150 (MQ=255)
cACCAGTTCATCGAGCGAGTACACACGGTTAACGTCAACGCCCATTGCCTTGCAACGCTTGCGCTCCTGCTCTGCAATCTGCCGATTTTCCGTGTAATCCCCTTTAGCCTGGCAAAAGTCAATCAGCTAGGCCTGCATATCCCCGCCTaa > 1:2338555/1‑150 (MQ=255)
cAGTTCATCGAGCGAGTACACACGGTTAACGTCAACGCCCATTGCCTTGCAACGCTTGCGCTCCTGCTCTGCAATCTGCCGATTTTCCGTGTAATCCCCTTTAGCCTGGCAAAAGTCAATCAGCTCGGCCTGCATATCCCCGCCTAATGc < 1:1964249/150‑1 (MQ=255)
cAGTTCATCGAGCGAGTACACACGGTTAACGTCAACGCCCATTGCCTTGCAACGCTTGCGCTCCTGCTCTGCAATCTGCCGATTTTCCGTGTAATCCCCTTTAGCCTGGCAAAAGTCAATCAGCTCGGCCTGCATATCCCCGCCTAATGc > 1:2387312/1‑150 (MQ=255)
aGTTCATCGAGCGAGTACTCACGGTTAACGTCAACGCCCATTGCCTTGCTACGCTTGCGCTCCTGCTCTGCAATCTGACGATTTTCCGTGTAATCCCCTTTAGCCTGGCAAAAGTCAATCAGATCGGCCTGCATTTCACCGCCTAATGCt < 2:354623/150‑1 (MQ=255)
ttCATCGAGCGAGTACACACGGTTAACGTCAACGCCCATTGCCTTGCAACGCTTGCGCTCCTGCTCTGCAATCTGCCGATTTTCCGTGTAATCCCCTTTAGCCTGGCAAAAGTCAATCAGCTAGGCCTGCATATCCCCGCCTAATGCttt < 2:602318/150‑1 (MQ=255)
tCATCGAGCGAGTACACACGGTTAACGTCAACGCCCATTGCCTTGCAACGCTTGCGCTCCTGCTCTGCAATCTGCCGATTTTCCGTGTAATCCCCTTTAGCCTGGCAAAAGTCAATCAGCTCGGCCTGCATATCCCCGCCTAATGCTNTa < 1:2111524/150‑1 (MQ=255)
cATCGAGCGAGTACACACGGTTAACGTCAACGCCCATTGCCTTGCAACGCTTGCGCTCCTGCTCTGCAATCTGCCGATTTTCCGTGTAATCCCCTTTAGCCTGGCAAAAGTCAATCAGCTCGGCCTGCATATCCCCGCCTAATGCTTTaa > 2:4059192/1‑150 (MQ=255)
cATCGAGCGAGTACACACGGTTAACGTCAACGCCCATTGCCTTGCAACGCTTGCGCTCCTGCTCTGCAATCTGCCGATTTTCCGTGTAATCCCCTTTAGCCTGGCAAAAGTCAATCAGCTAGGCCTGCATATCCCCGCCTAATGCTTTaa > 2:3651076/1‑150 (MQ=255)
aTCGAGCGAGTACACACGGTTAACGTCAACGCCCATTGCCTTGCAACGCTTGCGCTCCTGCTCTGCAATCTGCCGATTTTCCGTGTAATCCCCTTTAGCCTGGCAAAAGTCAATCAGCTAGGCCTGCATATCCCCGCCTAATGCTTTAAc > 1:3821822/1‑150 (MQ=255)
cgagcgagTACACACGGTTAACGTCAACGCCCATTGCCTTGCAACGCTTGCGCTCCTGCTCTGCAATCTGCCGATTTTCCGTGTAATCCCCTTTAGCCTGGCAAAAGTCAATCAGCTAGGCCTGCATATCCCCGCCTAATGCTTTAACgg > 2:3986334/1‑150 (MQ=255)
agcgagTACACCCGGTTAACGTCAACGCCCATTGCCTTGCAACGCTTGCGCTCCTGCTCTGCAATCTGCCGATTTTCCGTGTAATCCCCTTTAGCCTGGCAAAAGTCAATCAGCTCGGCCTGCATATCCCCGCCTAATGCTTTAACGGca < 2:2147121/150‑1 (MQ=255)
cgagTACACACGGTTAACGTCAACGCCCATTGCCTTGCAACGCTTGCGCTCCTGCTCTGCAATCTGCCGATTTTCCGTGTAATCCCCTTTAGCCTGGCAAAAGTCAATCAGCTAGGCCTGCATATCCCCGCCTAATGCTTTAACGGcaca < 2:2703840/150‑1 (MQ=255)
gagTACACACGGTTAACGTCAACGCCCATTGCCTTGCAACGCTTGCGCTCCTGCTCTGCAATCTGCCGATTTTCCGTGTAATCCCCTTTAGCCTGGCAAAAGTCAATCAGCTCGGCCTGCATATCCCCGCCTAATGCTTTAACGGCACAg > 1:2861479/1‑150 (MQ=255)
gagTACACACGGTTAACGTCAACGCCCATTGCCTTGCAACGCTTGCGCTCCTGCTCTGCAATCTGCCGATTTTCCGTGTAATCCCCTTTAGCCTGGCAAAAGTCAATCAGCTCGGCCTGCATATCCCCGCCTAATGCTTTAACGGCACAg > 2:1875788/1‑150 (MQ=255)
gagTACACACGGTTAACGTCAACGCCCATTGCCTTGCAACGCTTGCGCTCCTGCTCTGCAATCTGCCGATTTTCCGTGTAATCCCCTTTAGCCTGGCAAAAGTCAATCAGCTAGGCCTGCATATCCCCGCCTAATGCTTTAACGGCACAg < 2:3745530/150‑1 (MQ=255)
agTACACACGGTTAACGTCAACGCCCATTGCCTTGCAACGCTTGCGCTCCTGCTCTGCAATCTGCCGATTTTCCGTGTAATCCCCTTTAGCCTGGCAAAAGTCAATCAGCTCGGCCTGCATATCCCCGCCTAATGCTTTAACGGCACAgg > 1:3119090/1‑150 (MQ=255)
agTACACACGGTTAACGTCAACGCCCATTGCCTTGCAACGCTTGCGCTCCTGCTCTGCAATCTGCCGATTTTCCGTGTAATCCCCTTTAGCCTGGCAAAAGTCAATCAGCTAGGCCTGCATATCCCCGCCTAATGCTTTAACGGCACAgg < 1:1292708/150‑1 (MQ=255)
gTACACACGGTTAACGTCAACGCCCATTGCCTTGCAACGCTTGCGCTCCTGCTCTGCAATCTGCCGATTTTCCGTGTAATCCCCTTTAGCCTGGCAAAAGTCAATCAGCTCGGCCTGCATATCCCCGCCTAATGCTTTAACGGCACAGGc > 1:3184988/1‑150 (MQ=255)
gTACACACGGTTAACGTCAACGCCCATTGCCTTGCAACGCTTGCGCTCCTGCTCTGCAATCTGCCGATTTTCCGTGTAATCCCCTTTAGCCTGGCAAAAGTCAATCAGCTCGGCCTGCATATCCCCGCCTAATGCTTTAACGGCACAGGc > 1:1196450/1‑150 (MQ=255)
tACACACGGTTAACGTCAACGCCCATTGCCTTGCAACGCTTGCGCTCCTGCTCTGCAATCTGCCGATTTTCCGTGTAATCCCCTTTAGCCTGGCAAAAGTCAATCAGCTAGGCCTGCATATCCCCGCCTAATGCTTTAACGGCACAGGCa < 1:536669/150‑1 (MQ=255)
acacacGGTTAACGTCAACGCCCATTGCCTTGCAACGCTTGCGCTCCTGCTCTGCAATCTGCCGATTTTCCGTGTAATCCCCTTTAGCCTGGCAAAAGTCAATCAGCTAGGCCTGCATATCCCCGCCTAATGCTTTAACGGCACAGGCAg < 2:526658/150‑1 (MQ=255)
acacGGTTAACGTCAACGCCCATTGCCTTGCAACGCTTGCGCTCCTGCTCTGCAATCTGCCGATTTTCCGTGTAATCCCCTTTAGCCTGGCAAAAGTCAATCAGCTCGGCCTGCATATCCCCGCCTAATGCTTTAACGGCACAGGCAGaa < 2:1739547/150‑1 (MQ=255)
acacGGTTAACGTCAACGCCCATTGCCTTGCAACGCTTGCGCTCCTGCTCTGCAATCTGCCGATTTTCCGTGTAATCCCCTTTAGCCTGGCAAAAGTCAATCAGCTCGGCCTGCATATCCCCGCCTAATGCTTTAACGGCACAGGCAGaa > 2:759833/1‑150 (MQ=255)
acGGTTAACGTCAACGCCCATTGCCTTGCAACGCTTGCGCTCCTGCTCTGCAATCTGCCGATTTTCCGTGTAATCCCCTTTAGCCTGGCAAAAGTCAATCAGCTAGGCCTGCATATCCCCGCCTAATGCTTTAACAGCACAGGCAGAAAt < 2:3421295/150‑1 (MQ=255)
gTTAACGTCAACGCCCATTGCCTTGCAACGCTTGCGCTCCTGCTCTGCAATCTGCCGATTTTCCGTGTAATCCCCTTTAGCCTGGCAAAAGTCAATCAGCTCGGCCTGCATATCCCCGCCTAATGCTTTAACGGCACAGGCAGAAATCAc < 2:28192/150‑1 (MQ=255)
tAACGTCAACGCCCATTGCCTTGCAACGCTTGCGCTCCTGCTCTGCAATCTGCCGATTTTCCGTGTAATCCCCTTTAGCCTGGCAAAAGTCAATCAGCTAGGCCTGCATATCCCCGCCTAATGCTTTAACGGCACAGGCAGAAATCACGc > 1:3729459/1‑150 (MQ=255)
aaCGTCAACGCCCATTGCCTTGCAACGCTTGCGCTCCTGCTCTGCAATCTGCCGATTTTCCGTGTAATCCCCTTTAGCCTGGCAAAAGTCAATCAGCTCGGCCTGCATATCCCCGCCTAATGCTTTAACGGCACAGGCAGAAATCACGcc > 1:915586/1‑150 (MQ=255)
cGTCAACGCCCATTGCCTTGCAACGCTTGCGCTCCTGCTCTGCAATCTGCCGATTTTCCGTGTAATCCCCTTTAGCCTGGCAAAAGTCAATCAGCTCGGCCTGCATATCCCCGCCTAATGCTTTAACGGCACAGGCAGAAATCACGCCtt > 2:1476915/1‑150 (MQ=255)
gTCAACGCCCATTGCCTTGCAACGCTTGCGCTCCTGCTCTGCAATCTGCCGATTTTCCGTGTAATCCCCTTTAGCCTGGCAAAAGTCAATCAGCTAGGCCTGCATATCCCCGCCTAATGCTTTAACGGCACAGGCAGAAATCACGCCTTc > 1:1485054/1‑150 (MQ=255)
cAACGCCCATTGCCTTGCAACGCTTGCGCTCCTGCTCTGCAATCTGCCGATTTTCCGTGTAATCCCCTTTAGCCTGGCAAAAGTCAATCAGCTCGGCCTGCATATCCCCGCCTAATGCTTTAACGGCACAGGCAGAAATCACGCCTTCTg > 2:258637/1‑150 (MQ=255)
cAACGCCCATTGCCTTGCAACGCTTGCGCTCCTGCTCTGCAATCTGCCGATTTTCCGTGTAATCCCCTTTAGCCTGGCAAAAGTCAATCAGCTAGGCCTGCATATCCCCGCCTAATGCTTTAACGGCACAGGCAGAAATCACGCCTTCTg > 2:321149/1‑150 (MQ=255)
cccATTGCCTTGCAACGCTTGCGCTCCTGCTCTGCAATCTGCCGATTTTCCGTGTAATCCCCTTTAGCCTGGCAAAAGTCAATCAGCTAGGCCTGCATATCCCCGCCTAATGCTTTAACGGCACAGGCAGAAATCACGCCTTCTGGCGCa > 1:3056315/1‑150 (MQ=255)
ccATTGCCTTGCAACGCTTGCGCTCCTGCTCTGCAATCTGCCGATTTTCCGTGTAATCCCCTTTAGCCTGGCAAAAGTCAATCAGCTCGGCCTGCATATCCCCGCCTAATGCTTTAACGGCACAGGCAGAAATCACGCCTTCTGGCGCAc > 2:3274369/1‑150 (MQ=255)
tGCCTTGCAACGCTTGCGCTCCTGCTCTGCAATCTGCCGATTTTCCGTGTAATCCCCTTTAGCCTGGCAAAAGTCAATCAGCTAGGCCTGCATATCCCCGCCTAATGCTTTAACGGCACAGGCAGAAATCACGCCTTCTGGCGCAccgcc < 1:1336933/150‑1 (MQ=255)
gCCTTGCAACGCTTGCGCTCCTGCTCTGCAATCTGCCGATTTTCCGTGTAATCCCCTTTAGCCTGGCAAAAGTCAATCAGCTCGGCCTGCATATCCCCGCCTAATGCTTTAACGGCACAGGCAGAAATCACGCCTTCTGGCGCAccgccg > 2:91745/1‑150 (MQ=255)
cTTGCAACGCTTGCGCTCCTGCTCTGCAATCTGCCGATTTTCCGTGTAATCCCCTTTAGCCTGGCAAAAGTCAATCAGCTCGGCCTGCATATCCCCGCCTAATGCTTTAACGGCACAGGCAGAAATCACGCCTTCTGGCGCACCGCCGAt < 2:266940/150‑1 (MQ=255)
cTTGCAACGCTTGCGCTCCTGCTCTGCAATCTGCCGATTTTCCGTGTAATCCCCTTTAGCCTGGCAAAAGTCAATCAGCTCGGCCTGCATATCCCCGCCTAATGCTTTAACGGCACAGGCAGAAATCACGCCTTCTGGCGCACCGCCGAt < 2:3826416/150‑1 (MQ=255)
tGCAACGCTTGCGCTCCTGCTCTGCAATCTGCCGATTTTCCGTGTAATCCCCCTTAGCCTGGCAAAAGTCAATCAGCTAGGCCTGCATATCCCCGCCTAATGCTTTAACGGCACAGGCAGAAATCACGCCTTCTGGCGCACCGCCGATgg > 1:3728440/1‑150 (MQ=255)
gCAACGCTTGCGCTCCTGCTCTGCAATCTGCCGATTTTCCGTGTAATCCCCTTTAGCCTGGCAAAAGTCAATCAGCTCGGCCTGCATATCCCCGCCTAATGCTTTAACGGCACAGGCAGAAATCACGCCTTCTGGCGCACCGCCGATGgt > 2:2562327/1‑150 (MQ=255)
gCAACGCTTGCGCTCCTGCTCTGCAATCTGCCGATTTTCCGTGTAATCCCCTTTAGCCTGGCAAAAGTCAATCAGCTAGGCCTGCATATCCCCGCCTAATGCTTTAACGGCACAGGCAGAAATCACGCCTTCTGGCGCACCGCCGATGgt < 1:3992762/150‑1 (MQ=255)
cAACGCTTGCGCTCCTGCTCTGCAATCTGCCGATTTTCCGTGTAATCCCCTTTAGCCTGGCAAAAGTCAATCAGCTCGGCCTGCATATCCCCGCCTAATGCTTTAACGGCACAGGCAGAAATCACGCCTTCTGGCGCACCGCCGATGgtg > 1:1995032/1‑150 (MQ=255)
cAACGCTTGCGCTCCTGCTCTGCAATCTGCCGATTTTCCGTGTAATCCCCTTTAGCCTGGCAAAAGTCAATCAGCTCGGCCTGCATATCCCCGCCTAATGCTTTAACGGCACAGGCAGAAATCACGCCTTCTGGCGCACCGCCGATGgtg > 1:4067356/1‑150 (MQ=255)
cAACGCTTGCGCTCCTGCTCTGCAATCTGCCGATTTTCCGTGTAATCCCCTTTAGCCTGGCAAAAGTCAATCAGCTAGGCCTGCATATCCCCGCCTAATGCTTTAACGGCACAGGCAGAAATCACGCCTTCTGGCGCACCGCCGATGgtg < 1:3000270/150‑1 (MQ=255)
aaCGCTTGCGCTCCTGCTCTGCAATCTGCCGATTTTCCGTGTAATCCCCTTTAGCCTGGCAAAAGTCAATCAGCTAGGCCTGCATATCCCCGCCTAATGCTTTAACGGCACAGGCAGAAATCACGCCTTCTGGCGCACCGCCGATGgtgt > 1:2681211/1‑150 (MQ=255)
aaCGCTTGCGCTCCTGCTCTGCAATCTGCCGATTTTCCGTGTAATCCCCTTTAGCCTGGCAAAAGTCAATCAGCTAGGCCTGCATATCCCCGCCTAATGCTTTAACGGCACAGGCAGAAATCACGCCTTCTGGCGCACCGCCGATGgtgt > 1:1382827/1‑150 (MQ=255)
aCGCTTGCGCTCCTGCTCTGCAATCTGCCGATTTTCCGTGTAATCCCCTTTAGCCTGGCAAAAGTCAATCAGCTAGGCCTGCATATCCCCGCCTAATGCTTTAACGGCACAGGCAGAAATCACGCCTTCTGGCGCACCGCCGATGGTGTa > 2:691942/1‑150 (MQ=255)
ttGCGCTCCTGCTCTGCAATCTGCCGATTTTCCGTGTAATCCCCTTTAGCCTGGCAAAAGTCAATCAGCTCGGCCTGCATATCCCCGCCTAATGCTTTAACGGCACAGGCAGAAATCACGCCTTCTGGCGCACCGCCGATGGTGTacatc < 1:823238/150‑1 (MQ=255)
cgcTCCTGCTCTGCAATCTGCCGATTTTCCGTGTAATCCCCTTTAGCCTGGCAAAAGTCAATCAGCTAGGCCTGCATATCCCCGCCTAATGCTTTAACGGCACAGGCAGAAATCACGCCTTCTGGCGCACCGCCGATGGTGTacatcaca > 2:1686786/1‑150 (MQ=255)
gcTCCTGCTCTGCAATCTGCCGATTTTCCGTGTAATCCCCTTTAGCCTGGCAAAAGTCAATCAGCTCGGCCTGCATATCCCCGCCTAATGCTTTAACGGCACAGGCAGAAATCACGCCTTCTGGCGCACCGCCGATGGTGTacatcacat < 1:3351064/150‑1 (MQ=255)
gcTCCTGCTCTGCAATCTGCCGATTTTCCGTGTAATCCCCTTTAGCCTGGCAAAAGTCAATCAGCTAGGCCTGCATATCCCCGCCTAATGCTTTAACGGCACAGGCAGAAATCACGCCTTCTGGCGCACCGCCGATGGTGTacatcacat > 2:2468513/1‑150 (MQ=255)
tCCTGCTCTGCAATCTGCCGATTTTCCGTGTAATCCCCTTTAGCCTGGCAAAAGTCAATCAGCTAGGCCTGCATATCCCCGCCTAATGCTTTAACGGCACAGGCAGAAATCACGCCTTCTGGCGCACCGCCGATGGTGTACATCACATCg > 2:3141224/1‑150 (MQ=255)
gCTCTGCAATCTGCCGATTTTCCGTGTAATCCCCTTTAGCCTGGCAAAAGTCAATCAGCTAGGCCTGCATATCCCCGCCTAATGCTTTAACGGCACAGGCAGAAATCACGCCTTCTGGCGCACCGCCGATGGTGTACATCACATCGTAAg < 1:688435/150‑1 (MQ=255)
ctctGCAATCTGCCGATTTTCCGTGTAATCCCCTTTAGCCTGGCAAAAGTCAATCAGCTAGGCCTGCATGTCCCCGCCTAATGCTTTAACGGCACAGGCAGAAATCACGCCTTCTGGCGCACCGCCGATGGTGTACATCACATCGTAAgg < 1:3083522/150‑1 (MQ=255)
ctctGCAATCTGCCGATTTTCCGTGTAATCCCCTTTAGCCTGGCAAAAGTCAATCAGCTAGGCCTGCATATCCCCGCCTAATGCTTTAACGGCACAGGCAGAAATCACGCCTTCTGGCGCACCGCCGATGGTGTACATCACATCGTAAgg < 1:1035113/150‑1 (MQ=255)
tctGCAATCTGCCGATTTTCCGTGTAATCCCCTTTAGCCTGGCAAAAGTCAATCAGCTCGGCCTGCATATCCCCGCCTAATGCTTTAACGGCACAGGCAGAAATCACGCCTTCTGGCGCACCGCCGATGGTGTACATCACATCGTAAGGa < 1:2742986/150‑1 (MQ=255)
cAATCTGCCGATTTTCCGTGTAATCCCCTTTAGCCTGGCAAAAGTCAATCAGCTAGGCCTGCATATCCCCGCCTAATGCTTTAACGGCACAGGCAGAAATCACGCCTTCTGGCGCACCGCCGATGGTGTACATCACATCGTAAGGATTAt > 1:2427469/1‑150 (MQ=255)
aTCTGCCGATTTTCCGTGTAATCCCCTTTAGCCTGGCAAAAGTCAATCAGCTCGGCCTGCATATCCCCGCCTAATGCTTTAACGGCACAGGCAGAAATCACGCCTTCTGGCGCACCGCCGATGGTGTACATCACATCGTAAGGATTATcc < 2:1096252/150‑1 (MQ=255)
cTGCCGATTTTCCGTGTAATCCCCTTTAGCCTGGCAAAAGTCAATCAGCTAGGCCTGCATATCCCCGCCTAATGCTTTAACGGCACAGGCAGAAATCACGCCTTCTGGCGCACCGCCGATGGTGTACATCACATCGTAAGGATTATCCTg < 2:1424663/150‑1 (MQ=255)
tttCCGTGTAATCCCCTTTAGCCTGGCAAAAGTCAATCAGCTCGGCCTGCATATCCCCGCCTAATGCTTTAACGGCACAGGCAGAAATCACGCCTTCTGGCGCACCGCCGATGGTGTACATCACATCGTAAGGATTATCCTGCCAGCAgg > 1:2177980/1‑150 (MQ=255)
tttCCGTGTAATCCCCTTTAGCCTGGCAAAAGTCAATCAGCTAGGCCTGCATATCCCCGCCTAATGCTTTAACGGCACAGGCAGAAATCACGCCTTCTGGCGCACCGCCGATGGTGTACATCACATCGTAAGGATTATCCTGCCAGCAgg > 2:630211/1‑150 (MQ=255)
tCCGTGTAATCCCCTTTAGCCTGGCAAAAGTCAATCAGCTCGGCCTGCATATCCCCGCCTAATGCTTTAACGGCACAGGCAGAAATCACGCCTTCTGGCGCACCGCCGATGGTGTACATCACATCGTAAGGATTATCCTGCCAGCAGGTc > 1:2081627/1‑150 (MQ=255)
cGTGTAATCCCCTTTAGCCTGGCAAAAGTCAATCAGCTCGGCCTGCATATCCCCGCCTAATGCTTTAACGGCACAGGCAGAAATCACGCCTTCTGGCGCACCGCCGATGGTGTACATCACATCGTAAGGATTATCCTGCCAGCAGGTCAg > 1:1538136/1‑150 (MQ=255)
tAATCCCCTTTAGCCTGGCAAAAGTCAATCAGCTCGGCCTGCATATCCCCGCCTAATGCTTTAACGGCACAGGCAGAAATCACGCCTTCTGGCGCACCGCCGATGGTGTACATCACATCGTAAGGATTATCCTGCCAGCAGGTCAGCACg < 2:1638911/150‑1 (MQ=255)
aaTCCCCTTTAGCCTGGCAAAAGTCAATCAGCTCGGCCTGCATATCCCCGCCTAATGCTTTAACGGCACAGGCAGAAATCACGCCTTCTGGCGCACCGCCGATGGTGTACATCACATCGTAAGGATTATCCTGCCAGCAGGTCAGCACGc > 2:877212/1‑150 (MQ=255)
aTCCCCTTTAGCCTGGCAAAAGTCAATCAGCTCGGCCTGCATATCCCCGCCTAATGCTTTAACGGCACAGGCAGAAATCACGCCTTCTGGCGCACCGCCGATGGTGTACATCACATCGTAAGGATTATCCTGCCAGCAGGTCAGCACGCt > 2:3854806/1‑150 (MQ=255)
tCCCCTTTAGCCTGGCAAAAGTCAATCAGCTAGGCCTGCATATCCCCGCCTAATGCTTTAACGGCACAGGCAGAAATCACGCCTTCTGGCGCACCGCCGATGGTGTACATCACATCGTAAGGATTATCCTGCCAGCAGGTCAGCACGCTg < 2:536220/150‑1 (MQ=255)
tCCCCTTTAGCCTGGCAAAAGTCAATCAGCTAGGCCTGCATATCCCCGCCTAATGCTTTAACGGCACAGGCAGAAATCACGCCTTCTGGCGCACCGCCGATGGTGTACATCACATCGTAAGGATTATCCTGCCAGCAGGTCAGCACGCTg < 2:2618763/150‑1 (MQ=255)
ttAGCCTGGCAAAAGTCAATCAGCTAGGCCTGCATATCCCCGCCTAATGCTTTAACGGCACAGGCAGAAATCACGCCTTCTGGCGCACCGCCGATGGTGTACATCACATCGTAAGGATTATCCTGCCAGCAGGTCAGCACGCTGgcggcg < 1:426860/150‑1 (MQ=255)
ttAGCCTGGCAAAAGTCAATCAGCTAGGCCTGCATATCCCCGCCTAATGCTTTAACGGCACAGGCAGAAATCACGCCTTCTGGCGCACCGCCGATGGTGTACATCACATCGTAAGGATTATCCTGCCAGCAGGTCAGCACGCTGgcggcg > 2:1009462/1‑150 (MQ=255)
tAGCCTGGCAAAAGTCAATCAGCTCGGCCTGCATATCCCCGCCTAATGCTTTAACGGCACAGGCAGAAATCACGCCTTCTGGCGCACCGCCGATGGTGTACATCACATCGTAAGGATTATCCTGCCAGCAGGTCAGCACGCTGGCGGCGa > 2:2989698/1‑150 (MQ=255)
tAGCCTGGCAAAAGTCAATCAGCTCGGCCTGCATATCCCCGCCTAATGCTTTAACGGCACAGGCAGAAATCACGCCTTCTGGCGCACCGCCGATGGTGTACATCACATCGTAAGGATTATCCTGCCAGCAGGTCAGCACGCTGGCGGCGa < 2:818784/150‑1 (MQ=255)
aGCCTGGCAAAAGTCAATCAGCTAGGCCTGCATATCCCCGCCTAATGCTTTAACGGCACAGGCAGAAATCACGCCTTCTGGCGCACCGCCGATGGTGTACATCACATCGTAAGGATTATCCTGCCAGCAGGTCAGCACGCTGGCGGCGAc > 1:365285/1‑150 (MQ=255)
gCCTGGCAAAAGTCAATCAGCTAGGCCTGCATATCCCCGCCTAATGCTTTAACGGCACAGGCAGAAATCACGCCTTCTGGCGCACCGCCGATGGTGTACATCACATCGTAAGGATTATCCTGCCAGCAGGTCAGCACGCTGGCGGCGACa > 1:1786678/1‑150 (MQ=255)
ccTGGCAAAAGTCAATCAGCTCGGCCTGCATATCCCCGCCTAATGCTTTAACGGCACAGGCAGAAATCACGCCTTCTGGCGCACCGCCGATGGTGTACATCACATCGTAAGGATTATCCTGCCAGCAGGTCAGCACGCTGGCGGCGACAt > 2:3300303/1‑150 (MQ=255)
cTGGCAAAAGTCAATCAGCTAGGCCTGCATATCCCCGCCTAATGCTTTAACGGCACAGGCAGAAATCACGCCTTCTGGCGCACCGCCGATGGTGTACATCACATCGTAAGGATTATCCTGCCAGCAGGTCAGCACGCTGGCGGCGACATc < 1:3451421/150‑1 (MQ=255)
ggCAAAAGTCAATCAGCTCGGCCTGCATATCCCCGCCTAATGCTTTAACGGCACAGGCAGAAATCACGCCTTCTGGCGCACCGCCGATGGTGTACATCACATCGTAAGGATTATCCTGCCAGCAGGTCAGCACGCTGGCGGCGACATCGc > 1:167767/1‑150 (MQ=255)
aaaGTCAATCAGCTCGGCCTGCATATCCCCGCCTAATGCTTTAACGGCACAGGCAGAAATCACGCCTTCTGGCGCACCGCCGATGGTGTACATCACATCGTAAGGATTATCCTGCCAGCAGGTCAGCACGCTGGCGGCGACATCGCCATc < 1:2238359/150‑1 (MQ=255)
aaaGTCAATCAGCTAGGCCTGCATATCCCCGCCTAATGCTTTAACGGCACAGGCAGAAATCACGCCTTCTGGCGCACCGCCGATGGTGTACATCACATCGTAAGGATTATCCTGCCAGCAGGTCAGCACGCTGGCGGCGACATCGCCATc > 2:2941331/1‑150 (MQ=255)
aaGTCAATCAGCTCGGCCTGCATATCCCCGCCTAATGCTTTAACGGCACAGGCAGAAATCACGCCTTCTGGCGCACCGCCGATGGTGTACATCACATCGTAAGGATTATCCTGCCAGCAGGTCAGCACGCTGGCGGCGACATCGCCATcc < 2:1241050/150‑1 (MQ=255)
aaGTCAATCAGCTAGGCCTGCATATCCCCGCCTAATGCTTTAACGGCACAGGCAGAAATCACGCCTTCTGGCGCACCGCCGATGGTGTACATCACATCGTAAGGATTATCCTGCCAGCAGGTCAGCACGCTGGCGGCGACATCGCCATcc < 2:2869205/150‑1 (MQ=255)
aGTCAATCAGCTAGGCCTGCATATCCCCGCCTAATGCTTTAACGGCACAGGCAGAAATCACGCCTTCTGGCGCACCGCCGATGGTGTACATCACATCGTAAGGATTATCCTGCCAGCAGGTCAGCACGCTGGCGGCGACATCGCCATCCg < 2:2718746/150‑1 (MQ=255)
aGTCAATCAGCTAGGCCTGCATATCCCCGCCTAATGCTTTAACGGCACAGGCAGAAATCACGCCTTCTGGCGCACCGCCGATGGTGTACATCACATCGTAAGGATTATCCTGCCAGCAGGTCAGCACGCTGGCGGCGACATCGCCATCCg > 1:1600830/1‑150 (MQ=255)
gTCAATCAGCTCGGCCTGCATATCCCCGCCTAATGCTTTAACGGCACAGGCAGAAATCACGCCTTCTGGCGCACCGCCGATGGTGTACATCACATCGTAAGGATTATCCTGCCAGCAGGTCAGCACGCTGGCGGCGACATCGCCATCCgg > 2:210764/1‑150 (MQ=255)
tCAATCAGCTCGGCCTGCATATCCCCGCCTAATGCTTTAACGGCACAGGCAGAAATCACGCCTTCTGGCGCACCGCCGATGGTGTACATCACATCGTAAGGATTATCCTGCCAGCAGGTCAGCACGCTGGCGGCGACATCGCCATCCGGc < 2:4158904/150‑1 (MQ=255)
cAATCAGCTCGGCCTGCATATCCCCGCCTAATGCTTTAACGGCACAGGCAGAAATCACGCCTTCTGGCGCACCGCCGATGGTGTACATCACATCGTAAGGATTATCCTGCCAGCAGGTCAGCACGCTGGCGGCGACATCGCCATCCGGCa < 2:733159/150‑1 (MQ=255)
cAATCAGCTCGGCCTGCATATCCCCGCCTAATGCTTTAACGGCACAGGCAGAAATCACGCCTTCTGGCGCACCGCCGATGGTGTACATCACATCGTAAGGATTATCCTGCCAGCAGGTCAGCACGCTGGCGGCGACATCGCCATCCGGCa > 1:753731/1‑150 (MQ=255)
tCAGCTCGGCCTGCATATCCCCGCCTAATGCTTTAACGGCACAGGCAGAAATCACGCCTTCTGGCGCACCGCCGATGGTGTACATCACATCGTACGGATTATCCTGCCAGCCGGTCAGCACGCTGGCGGCGACATCGCCATCCGGCAggg > 1:2927502/1‑150 (MQ=255)
aGCTCGGCCTGCATATCCCCGCCTAATGCTTTAACGGCACAGGCAGAAATCACGCCTTCTGGCGCACCGCCGATGGTGTACATCACATCGTAAGGATTATCCTGCCAGCAGGTCAGCACGCTGGCGGCGACATCGCCATCCGGCAGGGCa > 1:2576659/1‑150 (MQ=255)
aGCTAGGCCTGCATATCCCCGCCTAATGCTTTAACGGCACAGGCAGAAATCACGCCTTCTGGCGCACCGCCGATGGTGTACATCACATCGTAAGGATTATCCTGCCAGCAGGTCAGCACGCTGGCGGCGACATCGCCATCCGGCAGGGCa > 2:4004691/1‑150 (MQ=255)
cTCGGCCTGCATATCCCCGCCTAATGCTTTAACGGCACAGGCAGAAATCACGCCTTCTGGCGCACCGCCGATGGTGTACATCACATCGTAAGGATTATCCTGCCAGCAGGTCAGCACGCTGGCGGCGACATCGCCATCCGGCAGGGCaaa > 2:1287327/1‑150 (MQ=255)
|
AAGAGGATATCGTTCCCCCTCACCAGTTCATCGAGCGAGTACACACGGTTAACGTCAACGCCCATTGCCTTGCAACGCTTGCGCTCCTGCTCTGCAATCTGCCGATTTTCCGTGTAATCCCCTTTAGCCTGGCAAAAGTCAATCAGCTCGGCCTGCATATCCCCGCCTAATGCTTTAACGGCACAGGCAGAAATCACGCCTTCTGGCGCACCGCCGATGGTGTACATCACATCGTAAGGATTATCCTGCCAGCAGGTCAGCACGCTGGCGGCGACATCGCCATCCGGCAGGGCAAAAA > CP009273/3068706‑3069003
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
GATK/CNVnator alignment
N/A
