Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A4 F1 I1 R1
|
260 |
537.2 |
23268138 |
99.2% |
23081992 |
151.0 |
Breseq alignment
BRESEQ :: Evidence
|
| evidence |
seq id |
position |
mutation |
annotation |
gene |
description |
| RA |
NC_008463 |
4,078,476 |
T→C |
N596S (AAC→AGC) |
mexN ← |
multidrug efflux RND transporter permease subunit MexN |
|
| |
seq id |
position |
ref |
new |
freq |
score (cons/poly) |
reads |
annotation |
genes |
product |
| * | NC_008463 | 4,078,476 | 0 | T | C | 99.8%
| 2445.2
/ NA
| 624 | N596S (AAC→AGC) | mexN | multidrug efflux RND transporter permease subunit MexN |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (0/0); major base C (273/350); minor base A (1/0); total (274/350) |
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 4.39e-01 |
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 |
Only 100 of 624 total aligned reads displayed.
CATGATTCCCGGCACCTTGGCCAGTTGCGGGCGCAGCCGGTCGATGAACTCGCCGACCGAGACATCGCGCTCGCCACGGTCCTTGAGGACGATCCAGAAACGCCCGTTGGCCAGGCTCTGGCTACCGCCGGTGACGCCCACCGCATGGTTGTAGCTCTGCACCGCCGGGTCGCTGGCGATGATCTCGGCCAGTTGCCGGTGCTTGGCGACCATGTCGTCGTAGGAGATATCCTCGGCAGCCTGGCTCGTGCCGAAGACGAAGGCGGTGTCCTGCAAGGGGAAGAAACCCTTGGGAA > NC_008463/4078328‑4078623
|
ttCCCGGCACCTTGGCCAGTTGCGGGCGCAGCCGGTCGATGAACTCGCCGACCGAGACATCGCGCTCGCCACGGTCCTTGAGGACGATCCAGAAACGCCCGTTGGCCAGGCTCTGGCTACCGCCGGTGACGCCCACCGCATGGCTGTAGct < 1:11457389/151‑1 (MQ=255)
cccGGCACCTTGGCCAGTTGCGGGCGCAGCCGGTCGATGAACTCGCCGACCGAGACATCGCGCTCGCCTCGGTCCTTGAGGACGATCCAGAAACGCCCGTTGGCCAGGCTCTGGCTACCGCCGGTGACGCCCACCGCATGGCTGTAGctct < 2:3708310/151‑1 (MQ=255)
ccGGCACCTTGGCCAGTTGCGGGCGCAGCCGGTCGATGAACTCGCCGACCGAGACATCGCGCTCGCCACGGTCCTTGAGGACGATCCAGAAACGCCCGTTGGCCAGGCTCTGGCTACCGCCGGTGACGCCCACCGCATGGCTGTAGCTCTg > 1:5768160/1‑151 (MQ=255)
ccGGCACCTTGGCCAGTTGCGGGCGCAGCCGGTCGATGAACTCGCCGACCGAGACATCGCGCTCGCCACGGTCCTTGAGGACGATCCAGAAACGCCCGTTGGCCAGGCTCTGGCTACCGCCGGTGACGCCCACCGCATGGCTGTAGCTCTg < 1:1377449/151‑1 (MQ=255)
cGGCACCTTGGCCAGTTGCGGGCGCAGCCGGTCGATGAACTCGCCGACCGAGACATCGCGCTCGCCACGGTCCTTGAGGACGATCCAGAAACGCCCGTTGGCCAGGCTCTGGCTACGGCCGGTGACGCCCACCGCATGGCTGTAGCTCTGc < 2:10529326/151‑1 (MQ=255)
cGGCACCTTGGCCAGTTGCGGGCGCAGCCGGTCGATGAACTCGCCGACCGAGACATCGCGCTCGCCACGGTCCTTGAGGACGATCCAGAAACGCCCGTTGGCCAGGCTCTGGCTACCGCCGGTGACGCCCACCGCATGGCTGTAGCTCTGc > 1:11544793/1‑151 (MQ=255)
cGGCACCTTGGCCAGTTGCGGGCGCAGCCGGTCGATGAACTCGCCGACCGAGACATCGCGCTCGCCACGGTCCTTGAGGACGATCCAGAAACGCCCGTTGGCCAGGCTCTGGCTACCGCCGGTGACGCCCACCGCATGGCTGTAGCTCTGc > 2:10648797/1‑151 (MQ=255)
gCACCTTGGCCAGTTGCGGGCGCAGCCGGTCGATGAACTCGCCGACCGAGACATCGCGCTCGCCACGGTCCTTGAGGACGATCCAGAAACGCCCGTTGGCCAGGCTCTGGCTACCGCCGGTGACGCCCACCGCATGGCTGTAGCTCTGCAc < 1:10881943/151‑1 (MQ=255)
aCCTTGGCCAGTTGCGGGCGCAGCCGGTCGATGAACTCGCCGACCGAGACATCGCGCTCGCCACGGTCCTTGAGGACGATCCAGAAACGCCCGTTGGCCAGGCTCTGGCTACCGCCGGTGACGCCCACCGCATGGCTGTAGCTCTGCAccg > 1:1060787/1‑151 (MQ=255)
ccTTGGCCAGTTGCGGGCGCAGCCGGTCGATGAACTCGCCGACCGAGACATCGCGCTCGCCACGGTCCTTGAGGACGATCCAGAAACGCCCGTTGGCCAGGCTCTGGCTACCGCCGGTGACGCCCACCGCATGGCTGTAGCTCTGCAccgc > 2:7313233/1‑151 (MQ=255)
cTTGGCCAGTTGCGGGCGCAGCCGGTCGATGAACTCGCCGACCGAGACATCGCGCTCGCCACGGTCCTTGAGGACGATCCAGAAACGCCCGTTGGCCAGGCTCTGGCTACCGCCGGTGACTCCCACCGCATGGCTGTAGCTCTGCAccgcc > 2:3053789/1‑151 (MQ=255)
cTTGGCCAGTTGCGGGCGCAGCCGGTCGATGAACTCGCCGACCGAGACATCGCGCTCGCCACGGTCCTTGAGGACGATCCAGAAACGCCCGTTGGCCAGGCTCTGGCTACCGCCGGTGACGCCCACCGCATGGCTGTAGCTCTGCAccgcc < 2:4388196/151‑1 (MQ=255)
tGGCCAGTTGCGGGCGCAGCCGGTCGATGAACTCGCCGACCGAGACATCGCGCTCGCCACGGTCCTTGAGGACGATCCAGAAACGCCCGTTGGCCAGGCTCTGGCTACCGCCGGTGACGCCCACCGCATGGCTGTAGCTCTGCACCGCCgg < 1:7071518/151‑1 (MQ=255)
ccAGTTGCGGGCGCAGCCGGTCGATGAACTCGCCGACCGAGACATCGCGCTCGCCACGGTCCTTGAGGACGATCCAGAAACGCCCGTTGGCCAGGCTCTGGCTACCGCCGGTGACGCCCACCGCATGGCTGTAGCTCTGCACCGCCGGGTc < 1:11499035/151‑1 (MQ=255)
ccAGTTGCGGGCGCAGCCGGTCGATGAACTCGCCGACCGAGACATCGCGCTCGCCACGGTCCTTGAGGACGATCCAGAAACGCCCGTTGGCCAGGCTCTGGCTACCGCCGGTGACGCCCACCGCATGGCTGTAGCTCTGCACCGCCGGGTc > 1:4616545/1‑151 (MQ=255)
ttGCGGGCGCAGCCGGTCGATGAACTCGCCGACCGAGACATCGCGCTCGCCACGGTCCTTGAGGACGATCCAGAAACGCCCGTTGGCCAGGCTCTGGCTACCGCCGGTGACGCCCACCGCATGGCTGTAGCTCTGCACCGCCGGGTCGCTg < 2:1981598/151‑1 (MQ=255)
ttGCGGGCGCAGCCGGTCGATGAACTCGCCGACCGAGACATCGCGCTCGCCACGGTCCTTGAGGACGATCCAGAAACGCCCGTTGGCCAGGCTCTGGCTACCGCCGGTGACGCCCACCGCATGGCTGTAGCTCTGCACCGCCGGGTCGCTg < 1:2920035/151‑1 (MQ=255)
tGCGGGCGCAGCCGGTCGATGAACTCGCCGACCGAGACATCGCGCTCGCCACGGTCCTTGAGGACGCTCCAGAAACGCCCGTTGGCCAGGCTCTGGCTACCGCCGGTGACGCCCACCGCATGGCTGTAGCTCTGCACCGCCGGGTCGCTgg < 2:4892927/151‑1 (MQ=255)
cGGGCGCAGCCGGTCGATGAACTCGCCGACCGAGACATCGCGCTCGCCACGGTCCTTGAGGACGATCCAGAAACGCCCGTTGGCCAGGCTCTGGCTACCGCCGGTGACGCCCACCGCATGGCTGTAGCTCTGCACCGCCGGGTCGCTGGCg > 2:3413289/1‑151 (MQ=255)
gcAGCCGGTCGATGAACTCGCCGACCGAGACATCGCGCTCGCCACGGTCCTTGAGGACGATCCAGAACCGCCCGTTGGCCAGGCTCTGGCTACCGCCGGTGACGCCCACCGCATGGCTGTAGCTCTGCACCGCCGGGTCGCTGGCgatgat < 1:5452277/151‑1 (MQ=255)
aGCCGGTCGATGAACTCGCCGACCGAGACATCGCGCTCGCCACGGTCCTTGAGGACGATCCAGAAACGCCCGTTGGCCAGGCTCTGGCTACCGCCGGTGACGCCCACCGCATGGCTGTAGCTCTGCACCGCCGGGTCGCTGGCGATGAtct < 2:5043473/151‑1 (MQ=255)
aGCCGGTCGATGAACTCGCCGACCGAGACATCGCGCTCGCCACGGTCCTTGAGGACGATCCAGAAACGCCCGTTGGCCAGGCTCTGGCTACCGCCGGTGACGCCCACCGCATGGCTGTAGCTCTGCACCGCCGGGTCGCTGGCGATGAtct > 2:4140475/1‑151 (MQ=255)
aGCCGGTCGATGAACTCGCCGACCGAGACATCGCGCTCGCCACGGTCCTTGAGGACGATCCAGAAACGCCCGTTGGCCAGGCTCTGGCTACCGCCGGTGACGCCCACCGCATGGCTGTAGCTCTGCACCGCCGGGTCGCTGGCGATGAtct > 1:8407897/1‑151 (MQ=255)
cGGTCGATGAACTCGCCGACCGAGACATCGCGCTCGCCACGGTCCTTGAGGACGATCCAGAAACGCCCGTTGGCCAGGCTCTGGCTACCGCCGGTGACGCCCACCGCATGGCTGTAGCTCTGCACCGCCGGGTCGCTGGCGATGATCTCgg < 1:1656978/151‑1 (MQ=255)
ggTCGATGAACTCGCCGACCGAGACATCGCGCTCGCCACGGTCCTTGAGGACGATCCAGAAACGCCCGTTGGCCAGGCTCTGGCTACCGCCGGTGACGCCCACCGCATGGCTGTAGCTCTGCACCGCCGGGTCGCTGGCGATGATCTCGGc < 2:11185494/151‑1 (MQ=255)
ggTCGATGAACTCGCCGACCGAGACATCGCGCTCGCCACGGTCCTTGAGGACGATCCAGAAACGCCCGTTGGCCAGGCTCTGGCTACCGCCGGTGACGCCCACCGCATGGCTGTAGCTCTGCACCGCCGGGTCGCTGGCGATGATCTCGGc > 2:1343723/1‑151 (MQ=255)
gAACTCGCCGACCGAGACATCGCGCTCGCCACGGTCCTTGAGGACGATCCAGAAACGCCCGTTGGCCAGGCTCTGGCTACCGCCGGTGACGCCCACCGCATGGCTGTAGCTCTGCACCGCCGGGTCGCTGGCGATGATCTCGGCCAGTTGc > 2:6837268/1‑151 (MQ=255)
cTCGCCGACCGAGACATCGCGCTCGCCACGGTCCTTGAGGACGATCCAGAAACGCCCGTTGGCCAGGCTCTGGCTACCGCCGGTGACGCCCACCGCATGGCTGTAGCTCTGCACCGCCGGGTCGCTGGCGATGATCTCGGCCAGTTGCCgg < 1:10075518/151‑1 (MQ=255)
tCGCCGACCGAGACATCGCGCTCGCCACGGTCCTTGAGGACGATCCAGAAACGCCCGTTGGCCAGGCTCTGGCTACCGCCGGTGACGCCCACCGCATGGCTGTAGCTCTGCACCGCCGGGTCGCTGGCGATGATCTCGGCCAGTTGCCGGt < 2:1791523/151‑1 (MQ=255)
tCGCCGACCGAGACATCGCGCTCGCCACGGTCCTTGAGGACGATCCAGAAACGCCCGTTGGCCAGGCTCTGGCTACCGCCGGTGACGCCCACCGCATGGCTGTAGCTCTGCACCGCCGGGTCGCTGGCGATGATCTCGGCCAGTTGCCGGt < 1:2517644/151‑1 (MQ=255)
cGCCGACCGAGACATCGCGCTCGCCACGGTCCTTGAGGACGATCCAGAAACGCCCGTTGGCCAGGCTCTGGCTACCGCCGGTGACGCCCACCGCATGGCTGTAGCTCTGCACCGCCGGGTCGCTGGCGATGATCTCGGCCAGTTGCCGGTg < 1:9091068/151‑1 (MQ=255)
gCCGACCGAGACATCGCGCTCGCCACGGTCCTTGAGGACGATCCAGAAACGCCCGTTGGCCAGGCTCTGGCTACCGCCGGTGACGCCCACCGCATGGCTGTAGCTCTGCACCGCCGGGTCGCTGGCGATGATCTCGGCCAGTTGCCGGTGc > 2:3353268/1‑151 (MQ=255)
ccgaccgaGACATCGCGCTCGCCACGGTCCTTGAGGACGATCCAGAAACGCCCGTTGGCCAGGCTCTGGCTACCGCCGGTGACGCCCACCGCATGGCTGTAGCTCTGCACCGCCGGGTCGCTGGCGATGATCTCGGCCAGTTGCCGGTGCt < 2:3964451/151‑1 (MQ=255)
ccgaccgaGACATCGCGCTCGCCACGGTCCTTGAGGACGATCCAGAAACGCCCGTTGGCCAGGCTCTGGCTACCGCCGGTGACGCCCACCGCATGGCTGTAGCTCTGCACCGCCGGGTCGCTGGCGATGATCTCGGCCAGTTGCCGGTGCt > 2:1177128/1‑151 (MQ=255)
ccgaccgaGACATCGCGCTCGCCACGGTCCTTGAGGACGATCCAGAAACGCCCGTTGGCCAGGCTCTGGCTACCGCCGGTGACGCCCACCGCATGGCTGTAGCTCTGCACCGCCGGGTCGCTGGCGATGATCTCGGCCAGTTGCCGGTGCt > 1:11217465/1‑151 (MQ=255)
ccgaGACATCGCGCTCGCCACGGTCCTTGAGGACGATCCAGAAACGCCCGTTGGCCAGGCTCTGGCTACCGCCGGTGACGCCCACCGCATGGCTGTAGCTCTGCACCGCCGGGTCGCTGGCGATGATCTCGGCCAGTTGCCGGTGCTTGGc < 1:3741981/151‑1 (MQ=255)
ccgaGACATCGCGCTCGCCACGGTCCTTGAGGACGATCCAGAAACGCCCGTTGGCCAGGCTCTGGCTACCGCCGGTGACGCCCACCGCATGGCTGTAGCTCTGCACCGCCGGGTCGCTGGCGATGATCTCGGCCAGTTGCCGGTGCTTGGc < 1:7291903/151‑1 (MQ=255)
ccgaGACATCGCGCTCGCCACGGTCCTTGAGGACGATCCAGAAACGCCCGTTGGCCAGGCTCTGGCTACCGCCGGTGACGCCCACCGCATGGCTGTAGCTCTGCACCGCCGGGTCGCTGGCGATGATCTCGGCCAGTTGCCGGTGCTTGGc < 2:11071641/151‑1 (MQ=255)
ccgaGACATCGCGCTCGCCACGGTCCTTGAGGACGATCCAGAAACGCCCGTTGGCCAGGCTCTGGCTACCGCCGGTGACGCCCACCGCATGGCTGTAGCTCTGCACCGCCGGGTCGCTGGCGATGATCTCGGCCAGTTGCCGGTGCTTGGc < 2:9341349/151‑1 (MQ=255)
cgaGACATCGCGCTCGCCACGGTCCTTGAGGACGATCCAGAACCGCCCGTTGGCCAGGCTCTGGCTACCGCCGGTGACGCCCACCGCATGGCTGTAGCTCTGCACCGCCGGGTCGCTGGCGATGATCTCGGCCAGTTGCCGGTGCTTGGCg < 2:215798/151‑1 (MQ=255)
cgaGACATCGCGCTCGCCACGGTCCTTGAGGACGATCCAGAAACGCCCGTTGGCCAGGCTCTGGCTACCGCCGGTGACGCCCACCGCATGGCTGTAGCTCTGCACCGCCGGGTCGCTGGCGATGATCTCGGCCAGTTGCCGGTGCTTGGCg < 1:7802364/151‑1 (MQ=255)
gagaCATCGCGCTCGCCACGGTCCTTGAGGACGATCCAGAAACGCCCGTTGGCCAGGCTCTGGCTACCGCCGGTGACGCCCACCGCATGGCTGTAGCTCTGCACCGCCGGGTCGCTGGCGATGATCTCGGCCAGTTGCCGGTGCTTGGCGa > 1:9518426/1‑151 (MQ=255)
agaCATCGCGCTCGCCACGGTCCTTGAGGACGATCCAGAAACGCCCGTTGGCCAGGCTCTGGCTACCGCCGGTGACGCCCACCGCATGGCTGTAGCTCTGCACCGCCGGGTCGCTGGCGATGATCTCGGCCAGTTGCCGGTGCGTGGCGAc > 2:8830808/1‑151 (MQ=255)
aCATCGCGCTCGCCACGGTCCTTGAGGACGATCCAGAAACGCCCGTTGGCCAGGCTCTGGCTACCGCCGGTGACGCCCACCGCATGGCTGTAGCTCTGCACCGCCGGGTCGCTGGCGATGATCTCGGCCAGTTGCCGGTGCTTGGCGACCa < 2:5703312/151‑1 (MQ=255)
cATCGCGCTCGCCACGGTCCTTGAGGACGATCCAGAAACGCCCGTTGGCCAGGCTCTGGCTACCGCCGGTGACGCCCACCGCATGGCTGTAGCTCTGCACCGCCGGGTCGCTGGCGATGATCTCGGCCAGTTGCCGGTGCTTGGCGACCAt < 2:9742940/151‑1 (MQ=255)
tCGCGCTCGCCACGGTCCTTGAGGACGATCCAGAAACGCCCGTTGGCCAGGCTCTGGCTACCGCCGGTGACGCCCACCGCATGGCTGTAGCTCTGCACCGCCGGGTCGCTGGCGATGATCTCGGCCAGTTGCCGGTGCTTGGCGACCATgt < 1:8882604/151‑1 (MQ=255)
cgcgCTCGCCACGGTCCTTGAGGACGATCCAGAAACGCCCGTTGGCCAGGCTCTGGCTACCGCCGGTGACGCCCACCGCATGGCTGTAGCTCTGCACCGCCGGGTCGCTGGCGATGATCTCGGCCAGTTGCCGGTGCTTGGCGACCATgtc < 2:702382/151‑1 (MQ=255)
cgcgCTCGCCACGGTCCTTGAGGACGATCCAGAAACGCCCGTTGGCCAGGCTCTGGCTACCGCCGGTGACGCCCACCGCATGGCTGTAGCTCTGCACCGCCGGGTCGCTGGCGATGATCTCGGCCAGTTGCCGGTGCTTGGCGACCATgtc < 1:2112956/151‑1 (MQ=255)
cgcgCTCGCCACGGTCCTTGAGGACGATCCAGAAACGCCCGTTGGCCAGGCTCTGGCTACCGCCGGTGACGCCCACCGCATGGCTGTAGCTCTGCACCGCCGGGTCGCTGGCGATGATCTCGGCCAGTTGCCGGTGCTTGGCGACCATgtc > 2:8029966/1‑151 (MQ=255)
gcTCGCCACGGTCCTTGAGGACGATCCAGAAACGCCCGTTGGCCAGGCTCTGGCTACCGCCGGTGACGCCCACCGCATGGCTGTAGCTCTGCACCGCCGGGTCGCTGGCGATGATCTCGGCCAGTTGCCGGTGCTTGGCGACCATgtcgtc < 2:911261/151‑1 (MQ=255)
gcTCGCCACGGTCCTTGAGGACGATCCAGAAACGCCCGTTGGCCAGGCTCTGGCTACCGCCGGTGACGCCCACCGCATGGCTGTAGCTCTGCACCGCCGGGTCGCTGGCGATGATCTCGGCCAGTTGCCGGTGCTTGGCGACCATgtcgtc < 1:6334414/151‑1 (MQ=255)
cTCGCCACGGTCCTTGAGGACGATCCAGAAACGCCCGTTGGCCAGGCTCTGGCTACCGCCGGTGACGCCCACCGCATGGCTGTAGCTCTGCACCGCCGGGTCGCTGGCGATGATCTCGGCCAGTTGCCGGTGCTTGGCGACCATGtcgtcg < 1:8236136/151‑1 (MQ=255)
cGCCACGGTCCTTGAGGACGATCCAGAAACGCCCGTTGGCCAGGCTCTGGCTACCGCCGGTGACGCCCACCGCATGGCTGTAGCTCTGCACCGCCGGGTCGCTGGCGATGATCTCGGCCAGTTGCCGGTGCTTGGCGACCATGTCGTCGTa > 1:6815340/1‑151 (MQ=255)
cACGGTCCTTGAGGACGATCCAGAAACGCCCGTTGGCCAGGCTCTGGCTACCGCCGGTGACGCCCACCGCATGGCTGTAGCTCTGCACCGCCGGGTCGCTGGCGATGATCTCGGCCAGTTGCCGGTGCTTGGCGACCATGTCGTCGTAGga > 2:745951/1‑151 (MQ=255)
aCGGTCCTTGAGGACGATCCAGAAACGCCCGTTGGCCAGGCTCTGGCTACCGCCGGTGACGCCCACCGCATGGCTGTAGCTCTGCACCGCCGGGTCGCTGGCGATGATCTCGGCCAGTTGCCGGTGCTTGGCGACCATGTCGTCGTAGgag > 1:10790405/1‑151 (MQ=255)
ggTCCTTGAGGACGATCCAGAAACGCCCGTTGGCCAGGCTCTGGCTACCGCCGGTGACGCCCACCGCATGGCTGTAGCTCTGCACCGCCGGGTCGCTGGCGATGATCTCGGCCAGTTGCCGGTGCTTGGCGACCATGTCGTCGTAGGAGat > 2:5913823/1‑151 (MQ=255)
cagttaGGACGATCCAGAATCGCCCGTTGGCCAGGCTCTGGCTTCCTCCGGAGACTCCCAAAGATTGGCTGTTGCTCTGCACCGCAGGGTCGCTGGCGATGATCTCGTCCAGTTGCCGGTGATTGGCGACCATGTCGTCTTAGGAGTTATc < 2:2845209/146‑1 (MQ=255)
cTTGAGGACGATCCAGAAACGCCCGTTGGCCAGGCTCTGGCTACCGCCGGTGACGCCCACCGCATGGCTGTAGCTCTGCACCGCCGGGTCGCTGGCGATGATCTCGGCCAGTTGCCGGTGCTTGGCGACCATGTCGTCGTAGGAGATATcc < 1:2744079/151‑1 (MQ=255)
tGAGGACGATCCAGAAACGCCCGTTGGCCAGGCTCTGGCTACCGCCGGTGACGCCCACCGCATGGCTGTAGCTCTGCACCGCCGGGTCGCTGGCGATGATCTCGGCCAGTTGCCGGTGCTTGGCGACCATGTCGTCGTAGGAGATATCCTc > 1:7904417/1‑151 (MQ=255)
gAGGACGATCCAGAAACGCCCGTTGGCCAGGCTCTGGCTACCGCCGGTGTCGCACACCGCATGGCTGTAGCTCTGCACCGCCGGGTCGCTGGCGATGATCTCGGCCAGTTGCCGGTGCTTGGCGACCATGTCGTCGTAGGAGATATCCTCg < 2:6634258/151‑1 (MQ=255)
gAGGACGATCCAGAAACGCCCGTTGGCCAGGCTCTGGCTACCGCCGGTGACGCCCACCGCATGGCTGTAGCTCTGCACCGCCGGGTCGCTGGCGATGATCTCGGCCAGTTGCCGGTGCTTGGCGACCATGTCGTCGTAGGAGATATCCTCg > 2:8328595/1‑151 (MQ=255)
aGGACGATCCAGAAACGCCCGTTGGCCAGGCTCTGGCTACCGCCGGTGACGCCCACCGCATGGCTGTAGCTCTGCACCGCCGGGTCGCTGGCGATGATCTCGGCCAGTTGCCGGTGCTTGGCGACCATGTCGTCGTAGGAGATATCCTCgg < 1:4014875/151‑1 (MQ=255)
aGGACGATCCAGAAACGCCCGTTGGCCAGGCTCTGGCTACCGCCGGTGACGCCCACCGCATGGCTGTAGCTCTGCACCGCCGGGTCGCTGGCGATGATCTCGGCCAGTTGCCGGTGCTTGGCGACCATGTCGTCGTAGGAGATATCCTCgg < 2:10760082/151‑1 (MQ=255)
cGATCCAGAAACGCCCGTTGGCCAGGCTCTGGCTACCGCCGGTGACGCCCACCGCATGGCTGTAGCTCTGCACCGCCGGGTCGCTGGCGATGATCTCGGCCAGTTGCCGGTGCTTGGCGACCATGTCGTCGTAGGAGATATCCTCGGCAGc > 1:4351502/1‑151 (MQ=255)
tCCAGAAACGCCCGTTGGCCAGGCTCTGGCTACCGCCGGTGACGCCCACCGCATGGCTGTAGCTCTGCACCGCCGGGTCGCTGGCGATGATCTCGGCCAGTTGCCGGTGCTTGGCGACCATGTCGTCGTAGGAGATATCCTCGGCAGCCTg < 1:9753276/151‑1 (MQ=255)
cAGAAACGCCCGTTGGCCAGGCTCTGGCTACCGCCGGTGACGCCCACCGCATGGCTGTAGCTCTGCACCGCCGGGTCGCTGGCGATGATCTCGGCCAGTTGCCGGTGCTTGGCGACCATGTCGTCGTAGGAGATATCCTCGGCAGCCTGGc > 1:10296620/1‑151 (MQ=255)
gAAACGCCCGTTGGCCAGGCTCTGGCTACCGCCGGTGACGCCCACCGCATGGCTGTAGCTCTGCACCGCCGGGTCGCTGGCGATGATCTCGGCCAGTTGCCGGTGCTTGGCGACCATGTCGTCGTAGGAGATATCCTCGGCAGCCTGGCTc < 1:4942722/151‑1 (MQ=255)
gAAACGCCCGTTGGCCAGGCTCTGGCTACCGCCGGTGACGCCCACCGCATGGCTGTAGCTCTGCACCGCCGGGTCGCTGGCGATGATCTCGGCCAGTTGCCGGTGCTTGGCGACCATGTCGTCGTAGGAGATATCCTCGGCAGCCTGGCTc < 1:1800021/151‑1 (MQ=255)
aaCGCCCGTTGGCCAGGCTCTGGCTACCGCCGGTGACGCCCACCGCATGGCTGTAGCTCTGCACCGCCGGGTCGCTGGCGATGATCTCGGCCAGTTGCCGGTGCTTGGCGACCATGTCGTCGTAGGAGATATCCTCGGCAGCCTGGCTCGt < 2:1032887/151‑1 (MQ=255)
aCGCCCGTTGGCCAGGCTCTGGCTACCGCCGGTGACGCCCACCGCATGGCTGTAGCTCTGCACCGCCGGGTCGCTGGCGATGATCTCGGCCAGTTGCCGGTGCTTGGCGACCATGTCGTCGTAGGAGATATCCTCGGCAGCCTGGCTCGTg > 2:11398548/1‑151 (MQ=255)
gCCCGTTGGCCAGGCTCTGGCTACCGCCGGTGACGCCCACCGCATGGCTGTAGCTCTGCACCGCCGGGTCGCTGGCGATGATCTCGGCCAGTTGCCGGTGCTTGGCGACCATGTCGTCGTAGGAGATATCCTCGGCAGCCTGGCTCGTGcc > 2:6303878/1‑151 (MQ=255)
cccGTTGGCCAGGCTCTGGCTACCGCCGGTGACGCCCACCGCATGGCTGTAGCTCTGCACCGCCGGGTCGCTGGCGATGATCTCGGCCAGTTGCCGGTGCTTGGCGACCATGTCGTCGTAGGAGATATCCTCGGCAGCCTGGCTCGTGCCg < 1:8673238/151‑1 (MQ=255)
cGTTGGCCAGGCTCTGGCTACCGCCGGTGACGCCCACCGCATGGCTGTAGCTCTGCACCGCCGGGTCGCTGGCGATGATCTCGGCCAGTTGCCGGTGCTTGGCGACCATGTCGTCGTAGGAGATATCCTCGGCAGCCTGGCTCGTGCCGaa > 1:2366165/1‑151 (MQ=255)
gTTGGCCAGGCTCTGGCTACCGCCGGTGACGCCCACCGCATGGCTGTAGCTCTGCACCGCCGGGTCGCTGGCGATGATCTCGGCCAGTTGCCGGTGCTTGGCGACCATGTCGTCGTAGGAGATATCCTCGGCAGCCTGGCTCGTGCCGAAg < 2:3192088/151‑1 (MQ=255)
tGGCCAGGCTCTGGCTACCGCCGGTGACGCCCACCGCATGGCTGTAGCTCTGCACCGCCGGGTCGCTGGCGATGATCTCGGCCAGTTGCCGGTGCTTGGCGACCATGTCGTCGTAGGAGATATCCTCGGCAGCCTGGCTCGTGCCGAAGAc < 2:7373360/151‑1 (MQ=255)
tGGCCAGGCTCTGGCTACCGCCGGTGACGCCCACCGCATGGCTGTAGCTCTGCACCGCCGGGTCGCTGGCGATGATCTCGGCCAGTTGCCGGTGCTTGGCGACCATGTCGTCGTAGGAGATATCCTCGGCAGCCTGGCTCGTGCCGAAGAc > 1:7465808/1‑151 (MQ=255)
tGGCCAGGCTCTGGCTACCGCCGGTGACGCCCACCGCATGGCTGTAGCTCTGCACCGCCGGGTCGCTGGCGATGATCTCGGCCAGTTGCCGGTGCTTGGCGACCATGTCGTCGTAGGAGATATCCTCGGCAGCCTGGCTCGTGCCGAAGAc < 2:5768160/151‑1 (MQ=255)
ccAGGCTCTGGCTACCGCCGGTGACGCCCACCGCATGGCTGTAGCTCTGCACCGCCGGGTCGCTGGCGATGATCTCGGCCAGTTGCCGGTGCTTGGCGACCATGTCGTCGTAGGAGATATCCTCGGCAGCCTGGCTCGTGCCGAAGACGaa > 2:6109019/1‑151 (MQ=255)
cAGGCTCTGGCTACCGCCGGTGACGCCCACCGCATGGCTGTAGCTCTGCACCGCCGGGTCGCTGGCGATGATCTCGGCCAGTTGCCGGTGCTTGGCGACCATGTCGTCGTAGGAGATATCCTCGGCAGCCTGGCTCGTGCCGAAGACGAAg < 2:5220331/151‑1 (MQ=255)
aGGCTCTGGCTACCGCCGGTGACGCCCACCGCATGGCTGTAGCTCTGCACCGCCGGGTCGCTGGCGATGATCTCGGCCAGTTGCCGGTGCTTGGCGACCATGTCGTCGTAGGAGATATCCTCGGCAGCCTGGCTCGTGCCGAAGACGAAgg > 2:2699915/1‑151 (MQ=255)
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CGCCCGTTGGCCAGGCTCTGGCTACCGCCGGTGACGCCCACCGCATGGCTGTAGCTCTGCACCGCCGGGTCGCTGGCGATGATCTCGGCCAGTTGCCGGTGCTTGGCGACCATGTCGTCGTAGGAGATATCCTCGGCAGCCTGGCTCGTGC < SRR18135096.2786032/151‑1 (MQ=60)
CGCCCGTTGGCCAGGCTCTGGCTACCGCCGGTGACGCCCACCGCATGGCTGTAGCTCTGCACCGCCGGGTCGCTGGCGATGATCTCGGCCAGTTGCCGGTGCTTGGCGACCATGTCGTCGTAGGAGATATCCTCGGCAGCCTGGCTCGTGC < SRR18135096.2192662/151‑1 (MQ=60)
GCCCGTTGGCCAGGCTCTGGCTACCGCCGGTGACGCCCACCGCATGGCTGTAGCTCTGCACCGCCGGGTCGCTGGCGATGATCTCGGCCAGTTGCCGGTGCTTGGCGACCATGTCGTCGTAGGAGATATCCTCGGCAGCCTGGCTCGTGCC > SRR18135096.3019775/1‑151 (MQ=60)
CCCGTTGGCCAGGCTCTGGCTACCGCCGGTGACGCCCACCGCATGGCTGTAGCTCTGCACCGCCGGGTCGCTGGCGATGATCTCGGCCAGTTGCCGGTGCTTGGCGACCATGTCGTCGTAGGAGATATCCTCGGCAGCCTGGCTCGTGCCG < SRR18135096.8710830/151‑1 (MQ=60)
CCGTTGGCCAGGCTCTGGCTACCGCCGGTGACGCCCACCGCATGGCTGTAGCTCTGCACCGCCGGGTCGCTGGCGATGATCTCGGCCAGTTGCCGGTGCTTGGCGACCATGTCGTCGTAGGAGATATCCTCGGCAGCCTGGCTCGTGCCGA < SRR18135096.11021933/151‑1 (MQ=60)
CCGTTGGCCAGGCTCTGGCTACCGCCGGTGACGCCCACCGCATGGCTGTAGCTCTGCACCGCCGGGTCGCTGGCGATGATCTCGGCCAGTTGCCGGTGCTTGGCGACCATGTCGTCGTAGGAGATATCCTCGGCAGCCTGGCTCGTGCCGA > SRR18135096.1701500/1‑151 (MQ=60)
CGTTGGCCAGGCTCTGGCTACCGCCGGTGACGCCCACCGCATGGCTGTAGCTCTGCACCGCCGGGTCGCTGGCGATGATCTCGGCCAGTTGCCGGTGCTTGGCGACCATGTCGTCGTAGGAGATATCCTCGGCAGCCTGGCTCGTGCCGAA > SRR18135096.2377182/1‑151 (MQ=60)
GTTGGCCAGGCTCTGGCTACCGCCGGTGACGCCCACCGCATGGCTGTAGCTCTGCACCGCCGGGTCGCTGGCGATGATCTCGGCCAGTTGCCGGTGCTTGGCGACCATGTCGTCGTAGGAGATATCCTCGGCAGCCTGGCTCGTGCCGAAG < SRR18135096.9228335/151‑1 (MQ=60)
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GGCCAGGCTCTGGCTACCGCCGGTGACGCCCACCGCATGGCTGAAGCTCTGCACCGCCGGGTCGCTGGCGATGATCTCGGCCAGTAGCCGGTGCTTGGCGACCATGTCGTCGTAGGAGATATCCTCGGCAGCCTGGCTCGTGCCGAAGACG > SRR18135096.2635054/1‑151 (MQ=60)
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CAGGCTCTGGCTACCGCCGGTGACGCCCACCGCATGGCTGTAGCTCTGCACCGCCGGGTCGCTGGCGATGATCTCGGCCAGTTGCCGGTGCTTGGCGACCATGTCGTCGTAGGAGATATCCTCGGCAGCCTGGCTCGTGCCGAAGACGAAG < SRR18135096.6284124/151‑1 (MQ=60)
CTCTGGCTACCGCCGGTGACGCCCACCGCATGGCTGTAGCTCTGCACCGCCGGGTCGCTGGCGATGATCTCGGCCAGTTGCCGGTGCTTGGCGACCATGTCGTCGTAGGAGATATCCTCGGCAGCCTGGCTCGTGCCGAAGACGAAGGCGG > SRR18135096.6004739/1‑151 (MQ=60)
CTCTGGCTACCGCCGGTGACGCCCACCGCATGGCTGTAGCTCTGCACCGCCGGGTCGCTGGCGATGATCTCGGCCAGTTGCCGGTGCTTGGCGACCATGTCGTCGTAGGAGATATCCTCGGCAGCCTGGCTCGTGCCGAAGACGAAGGCGG > SRR18135096.6279747/1‑151 (MQ=60)
CTCTGGCTACCGCCGGTGACGCCCACCGCATGGCTGTAGCTCTGCACCGCCGGGTCGCTGGCGATGATCTCGGCCAGTTGCCGGTGCTTGGCGACCATGTCGTCGTAGGAGATATCCTCGGCAGCCTGGCTCGTGCCGAAGACGAAGGCGG > SRR18135096.6004656/1‑151 (MQ=60)
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TGGCTACCGCCGGTGACGCCCACCGCATGGCTGTAGCTCTGCACCGCCGGGTCGCTGGCGATGATCTCGGCCAGTTGCCGGTGCTTGGCGACCATGTCGTCGTAGGAGATATCCTCGGCAGCCTGGCTCGTGCCGAAGACGAAGGCGGTGT > SRR18135096.10021364/1‑151 (MQ=60)
TGGCTACCGCCGGTGACGCCCACCGCATGGCTGTAGCTCTGCACCGCCGGGTCGCTGGCGATGATCTCGGCCAGTTGCCGGTGCTTGGCGACCATGTCGTCGTAGGAGATATCCTCGGCAGCCTGGCTCGTGCCGAAGACGAAGGCGGTGT > SRR18135096.11662716/1‑151 (MQ=60)
TGGCTACCGCCGGTGACGCCCACCGCATGGCTGTAGCTCTGCACCGCCGGGTCGCTGGCGATGATCTCGGCCAGTTGCCGGTGCTTGGCGACCATGTCGTCGTAGGAGATATCCTCGGCAGCCTGGCTCGTGCCGAAGACGAAGGCGGTGT > SRR18135096.5515242/1‑151 (MQ=60)
GGCTACCGCCGGTGACGCCCACCGCATGGCTGTAGCTCTGCACCGCCGGGTCGCTGGCGATGATCTCGGCCAGTTGCCGGTGCTTGGCGACCATGTCGTCGTAGGAGATATCCTCGGCAGCCTGGCTCGTGCCGAAGACGAAGGCGGTGTC < SRR18135096.6641250/151‑1 (MQ=60)
CTACCGCCGGTGACGCCCACCGCATGGCTGTAGCTCTGCACCGCCGGGTCGCTGGCGATGATCTCGGCCAGTTGCCGGTGCTTGGCGACCATGTCGTCGTAGGAGATATCCTCGGCAGCCTGGCTCGTGCCGAAGACGAAGGCGGTGTCCT < SRR18135096.6551594/151‑1 (MQ=60)
CTACCGCCGGTGACGCCCACCGCATGGCTGTAGCTCTGCACCGCCGGGTCGCTGGCGATGATCTCGGCCAGTTGCCGGTGCTTGGCGACCATGTCGTCGTAGGAGATATCCTCGGCAGCCTGGCTCGTGCCGAAGACGAAGGCGGTGTCCT < SRR18135096.7475643/151‑1 (MQ=60)
CTACCGCCGGTGACGCCCACCGCATGGCTGTAGCTCTGCACCGCCGGGTCGCTGGCGATGATCTCGGCCAGTTGCCGGTGCTTGGCGACCATGTCGTCGTAGGAGATATCCTCGGCAGCCTGGCTCGTGCCGAAGACGAAGGCGGTGTCCT < SRR18135096.6203951/151‑1 (MQ=60)
TACCGCCGGTGACGCCCACCGCATGGCTGTAGCTCTGCACCGCCGGGTCGCTGGCGATGATCTCGGCCAGTTGCCGGTGCTTGGCGACCATGTCGTCGTAGGAGATATCCTCGGCAGCCTGGCTCGTGCCGAAGACGAAGGCGGTGTCCTG > SRR18135096.9848916/1‑151 (MQ=60)
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CGCCGGTGACGCCCACCGCATGGCTGTAGCTCTGCACCGCCGGGTCGCTGGCGATGATCTCGGCCAGTTGCCGGTGCTTGGCGACCATGTCGTCGTAGGAGATATCCTCGGCAGCCTGGCTCGTGCCGAAGACGAAGGCGGTGTCCTGCAA < SRR18135096.9239520/151‑1 (MQ=60)
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CGCCGGTGACGCCCACCGCATGGCTGTAGCTCTGCACCGCCGGGTCGCTGGCGATGATCTCGGCCAGTTGCCGGTGCTTGGCGACCATGTCGTCGTAGGAGATATCCTCGGCAGCCTGGCTCGTGCCGAAGACGAAGGCGGTGTCCTGCAA > SRR18135096.3393335/1‑151 (MQ=60)
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CGGTGACGCCCACCGCATGGCTGTAGCTCTGCACCGCCGGGTCGCTGGCGATGATCTCGGCCAGTTGCCGGTGCTTGGCGACCATGTCGTCGTAGGAGATATCCTCGGCAGCCTGGCTCGTGCCGAAGACGAAGGCGGTGTCCTGCAAGGG > SRR18135096.9197414/1‑151 (MQ=60)
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TGACGCCCACCGCATGGCTGTAGCTCTGCACCGCCGGGTCGCTGGCGATGATCTCGGCCAGTTGCCGGTGCTTGGCGACCATGTCGTCGTAGGAGATATCCTCGGCAGCCTGGCTCGTGCCGAAGACGAAGGCGGTGTCCTGCAAGGGGAA < SRR18135096.10911504/151‑1 (MQ=60)
TGACGCCCACCGCATGGCTGTAGCTCTGCACCGCCGGGTCGCTGGCGATGATCTCGGCCAGTTGCCGGTGCTTGGCGACCATGTCGTCGTAGGAGATATCCTCGGCAGCCTGGCTCGTGCCGAAGACGAAGGCGGTGTCCTGCAAGGGGAA < SRR18135096.10849577/151‑1 (MQ=60)
TGACGCCCACCGCATGGCTGTAGCTCTGCACCGCCGGGTCGCTGGCGATGATCTCGGCCAGTTGCCGGTGCTTGGCGACCATGTCGTCGTAGGAGATATCCTCGGCAGCCTGGCTCGTGCCGAAGACGAAGGCGGTGTCCTGCAAGGGGAA < SRR18135096.966074/151‑1 (MQ=60)
GACGCCCACCGCATGGCTGTAGCTCTGCACCGCCGGGTCGCTGGCGATGATCTCGGCCAGTTGCCGGTGCTTGGCGACCATGTCGTCGTAGGAGATATCCTCGGCAGCCTGGCTCGTGCCGAAGACGAAGGCGGTGTCCTGCAAGGGGAAG < SRR18135096.259819/151‑1 (MQ=60)
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CACCGCATGGCTGTAGCTCTGCACCGCCGGGTCGCTGGCGATGATCTCGGCCAGTTGCCGGTGCTTGGCGACCATGTCGTCGTAGGAGATATCCTCGGCAGCCTGGCTCGTGCCGAAGACGAAGGCGGTGTCCTGCAAGGGGAAGAAACCC > SRR18135096.11123795/1‑151 (MQ=60)
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AGCATGATTCCCGGCACCTTGGCCAGTTGCGGGCGCAGCCGGTCGATGAACTCGCCGACCGAGACATCGCGCTCGCCACGGTCCTTGAGGACGATCCAGAAACGCCCGTTGGCCAGGCTCTGGCTACCGCCGGTGACGCCCACCGCATGGTTGTAGCTCTGCACCGCCGGGTCGCTGGCGATGATCTCGGCCAGTTGCCGGTGCTTGGCGACCATGTCGTCGTAGGAGATATCCTCGGCAGCCTGGCTCGTGCCGAAGACGAAGGCGGTGTCCTGCAAGGGGAAGAAACCCTTGGGAATC > NC_008463/4078326‑4078625
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 0 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
