Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A2 F1 I1 R1
|
274 |
511.2 |
22276341 |
99.2% |
22098130 |
150.0 |
Breseq alignment
BRESEQ :: Evidence
|
| evidence |
seq id |
position |
mutation |
annotation |
gene |
description |
| RA |
NC_008463 |
3,711,791 |
G→C |
V51L (GTG→CTG) |
cobA → |
uroporphyrinogen‑III C‑methyltransferase |
|
| |
seq id |
position |
ref |
new |
freq |
score (cons/poly) |
reads |
annotation |
genes |
product |
| * | NC_008463 | 3,711,791 | 0 | G | C | 100.0%
| 1930.8
/ NA
| 495 | V51L (GTG→CTG) | cobA | uroporphyrinogen‑III C‑methyltransferase |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (0/0); new base C (288/207); total (288/207) |
Only 100 of 508 total aligned reads displayed.
AGCGGTAAGGTCTGGCTGGTGGGTGCGGGTCCCGGCGATCCGGAACTGTTGACCCTGAAGGCAGTTCGCGCCCTGCAGGACGCGGATGTGGTGATGGTCGACGATTTGGTCAACCCGAGCATACTGGAGCACTGTCCGTCCGCCCGGGTGGTCCGGGTCGGCAAACGCGGCGGCTGCCGCTCCACACCGCAGGACTTCATCCAGCGCCTGATGCTGCGGCATGCCCGCCAGGGACGCAGCGTGGTGCGCCTGAAAGGCGGCGATCCATGCATCTTCGGCCGCGCCGGCGAAGAA > NC_008463/3711644‑3711937
|
gCGGTAAGGTCTGGCTGGTGGGTGCGGGTCCCGGCGATCCGGAACTGTTGACCCTGAAGGCAGTTCGCGCCCTGCAGGACGCGGATGTGGTGATGTTCGACGATCTGGTCAACCCGAGCATACTGGAGCACTGTCCGTCCGCCCGgctgg > 1:2253422/1‑150 (MQ=255)
cGGTAAGGTCTGGCTGGTGGGTGCGGGTCCCGGCGATCCGGAACTGTTGACCCTGAAGGCAGTTCGCGCCCTGCAGGACGCGGATGTGGTGATGGTCGACGATCTGGTCAACCCGAGCATACTGGAGCACTGTCCGTCCGCCCGgctggt < 2:8373691/150‑1 (MQ=255)
gTAAGGTCTGGCTGGTGGGTGCGGGTCCCGGCGATCCGGAACTGTTGACCCTGAAGGCAGTTCGCGCCCTGCAGGACGCGGATGTGGTGATGGTCGACGATCTGGTCAACCCGAGCATACTGGAGCACTGTCCGTCCGCCCGGCTGGTcc > 2:1700426/1‑150 (MQ=255)
gTAAGGTCTGGCTGGTGGGTGCGGGTCCCGGCGATCCGGAACTGTTGACCCTGAAGGCAGTTCGCGCCCTGCAGGACGCGGATGTGGTGATGGTCGACGATCTGGTCAACCCGAGCATACTGGAGCACTGTCCGTCCGCCCGGCTGGTcc > 1:964986/1‑150 (MQ=255)
tctcaggctggTGGCTGCTGGACCAGGCGAACCTGAACAGTTGACCCAGAAGGCACTTCCAGCCCTGCAGGACGCGGATGTGGAGAAGGTCGACGATCTGGTCAACCCGCGCATACTTGAGCACTGTCCGACCGCCCGGCGGGTCCgtgt > 2:578498/6‑150 (MQ=255)
ggTCGGGCTGGTGGGTGCGGGTCCCGGCGATCCGGAACTGTTGACCCTGAAGGCAGTTCGCGCCCTGCAGGACGCGGATGTGGTGATGGTCGACGATCTGGTCAACCCGAGCATACTGGAGCACTGTCCGTCCGCCCGGCTGGTCCGGGt < 2:3579088/150‑1 (MQ=255)
ggctggTGGGTGCGGGTCCCGGCGATCCGGAACTGTTGACCCTGAAGGCAGTTCGCGCCCTGCAGGACGCGGATGTGGTGATGGTCGACGATCTGGTCAACCCGAGCATACTGGAGCACTGTCCGTCCGCCCGGCTGGTCCGGGTCGGCa > 1:3923859/1‑150 (MQ=255)
ctggTGGGTGCGGGTCCCGGCGATCCGGAACTGTTGACCCTGAAGGCAGTTCGCGCCCTGCAGGACGCGGATGTGGTGATGGTCGACGATCTGGTCAACCCGAGCATACTGGAGCACTGTCCGTCCGCCCGGCTGGTCCGGGTCGGCaaa > 1:2597302/1‑150 (MQ=255)
gtgggtgCGGGTCCCGGCGATCCGGAACTGTTGACCCTGAAGGCAGTTCGCGCCCTGCAGGACGCGGATGTGGTGATGGTCGACGATCTGGTCAACCCGAGCATACTGGAGCACTGTCCGTCCGCCCGGCTGGTCCGGGTCGGCAAAcgc > 1:11010586/1‑150 (MQ=255)
gtgggtgCGGGTCCCGGCGATCCGGAACTGTTGACCCTGAAGGCAGGTCGCGCCCTGCAGGACGCGGATGTGGTGATGGTCGACGATCTGGTCAACCCGAGCATACTGGAGCACTGTCCGTCCGCCCGGCTGGTCCGGGTCGGCAAAcgc < 2:10725999/150‑1 (MQ=255)
gCGGGTCCCGGCGATCCGGAACTGTTGACCCTGAAGGCAGTTCGCGCCCTGCAGGACGCGGATGTGGTGATGGTCGACGATCTGGTCAACCCGAGCATACTGGAGCACTGTCCGTCCGCCCGGCTGGTCCGGGTCGGCAAACGCggcggc < 1:9288109/150‑1 (MQ=255)
gggTCCCGGCGATCCGGAACTGTTGACCCTGAAGGCAGTTCGCGCCCTGCAGGACGCGGATGTGGTGATGGTCGACGATCTGGTCAACCCGAGCATACTGGAGCACTGTCCGTCCGCCCGGCTGGTCCGGGTCGGCAAACGCGGCGGCTg < 1:7277508/150‑1 (MQ=255)
cccGGCGATCCGGAACTGTTGACCCTGAAGGCAGTTCGCGCCCTGCAGGACGCGGATGTGGTGATGGTCGACGATCTGGTCAACCCGAGCATACTGGAGCACTGTCCGTCCGCCCGGCTGGTCCGGGTCGGCAAACGCGGCGGCTGCCGc < 2:9852106/150‑1 (MQ=255)
cGGCGATCCGGAACTGTTGACCCTGAAGGCAGTTCGCGCCCTGCAGGACGCGGATGTGGTGATGGTCGACGATCTGGTCAACCCGAGCATACTGGAGCACTGTCCGTCCGCCCGGCTGGTCCGGGTCGGCAAACGCGGCGGCTGCCGCTc < 2:6386602/150‑1 (MQ=255)
cGATCCGGAACTGTTGACCCTGAAGGCAGTTCGCGCCCTGCAGGACGCGGATGTGGTGATGGTCGACGATCTGGTCAACCCGAGCATACTGGAGCACTGTCCGTCCGCCCGGCTGGTCCGGGTCGGCAAACGCGGCGGCTGCCGCTCcac < 1:7867627/150‑1 (MQ=255)
aTCCGGAACTGTTGACCCTGAAGGCAGTTCGCGCCCTGCAGGACGCGGATGTGGTGATGGTCGACGATCTGGTCAACCCGAGCATACTGGAGCACTGTCCGTCCGCCCGGCTGGTCCGGGTCGGCAAACGCGGCGGCTGCCGCTCCacac > 1:10935066/1‑150 (MQ=255)
tCCGGAACTGTTGACCCTGAAGGCAGTTCGCGCCCTGCAGGACGCGGATGTGGTGATGGTCGACGATCTGGTCAACCCGAGCATACTGGAGCACTGTCCGTCCGCCCGGCTGGTCCGGGTCGGCAAACGCGGCGGCTGCCGCTCCACAcc < 1:353677/150‑1 (MQ=255)
cGGAACTGTTGACCCTGAAGGCAGTTCGCGCCCTGCAGGACGCGGATGTGGTGATGGTCGACGATCTGGTCAACCCGAGCATACTGGAGCACTGTCCGTCCGCCCGGCTGGTCCGGGTCGGCAAACGCGGCGGCTGCCGCTCCACACCGc < 2:4331054/150‑1 (MQ=255)
gAACTGTTGACCCTGAAGGCAGTTCGCGCCCTGCAGGACGCGGATGTGGTGATGGTCGACGATCTGGTCAACCCGAGCATACTGGAGCACTGTCCGTCCGCCCGGCTGGTCCGGGTCGGCAAACGCGGCGGCTGCCGCTCCACACCGCAg < 1:5833753/150‑1 (MQ=255)
gAACTGTTGACCCTGAAGGCAGTTCGCGCCCTGCAGGACGCGGATGTGGTGATGGTCGACGATCTGGTCAACCCGAGCATACTGGAGCACTGTCCGTCCGCCCGGCTGGTCCGGGTCGGCAAACGCGGCGGCTGCCGCTCCACACCGCAg < 2:4083287/150‑1 (MQ=255)
aCTGTTGACCCTGAAGGCAGTTCGCGCCCTGCAGGACGCGGATGTGGTGATGGTCGACGATCTGGTCAACCCGAGCATACTGGAGCACTGTCCGTCCGCCCGGCTGGTCCGGGTCGGCAAACGCGGCGGCTGCCGCTCCACACCGCAGGa > 1:9120121/1‑150 (MQ=255)
aCTGTTGACCCTGAAGGCAGTTCGCGCCCTGCAGGACGCGGATGTGGTGATGGTCGACGATCTGGTCAACCCGAGCATACTGGAGCACTGTCCGTCCGCCCGGCTGGTCCGGGTCGGCAAACGCGGCGGCTGCCGCTCCACACCGCAGGa > 2:1125044/1‑150 (MQ=255)
aCTGTTGACCCTGAAGGCAGTTCGCGCCCTGCAGGACGCGGATGTGGTGATGGTCGACGATCTGGTCAACCCGAGCATACTGGAGCACTGTCCGTCCGCCCGGCTGGTCCGGGTCGGCAAACGCGGCGGCTGCCGCTCCACACCGCAGGa < 2:5607179/150‑1 (MQ=255)
aCTGTTGACCCTGAAGGCAGTTCGCGCCCTGCAGGACGCGGATGAGGTGATGGTCGACGATCTGGTCAACCCGAGCATACTGGAGCACTGTCCGTCCGCCCTGCTGGTCCGGGTCGGCAAACGCGGCGGCTGCCGCTCCACACCGCAGGa > 1:7018340/1‑150 (MQ=255)
cTGTTGACCCTGAAGGCAGTTCGCGCCCTGCAGGACGCGGATGTGGTGATGGTCGACGATCTGGTCAACCCGAGCATACTGGAGCACTGTCCGTCCGCCCGGCTGGTCCGGGTCGGCAAACGCGGCGGCTGCCGCTCCACACCGCAGGAc > 2:1346884/1‑150 (MQ=255)
gTTGACCCTGAAGGCAGTTCGCGCCCTGCAGGACGCGGATGTGGTGATGGTCGACGATCTGGTCAACCCGAGCATACTGGAGCACTGTCCGTCCGCCCGGCTGGTCCGGGTCGGCAAACGCGGCGGCTGCCGCTCCACACCGCAGGACtt < 2:8171841/150‑1 (MQ=255)
tGACCCTGAAGGCAGTTCGCGCCCTGCAGGACGCGGATGTGGTGATGGTCGACGATCTGGTCAACCCGAGCATACTGGAGCACTGTCCGTCCGCCCGGCTGGTCCGGGTCGGCAAACGCGGCGGCTGCCGCTCCACACCGCAGGACTTCa > 1:10434180/1‑150 (MQ=255)
aCCCTGAAGGCAGTTCGCGCCCTGCAGGACGCGGATGTGGTGATGGTCGACGATCTGGTCAACCCGAGCATACTGGAGCACTGTCCGTCCGCCCGGCTGGTCCGGGTCGGCAAACGCGGCGGCTGCCGCTCCACACCGCAGGACTTCATc > 1:10000573/1‑150 (MQ=255)
cccTGAAGGCAGTTCGCGCCCTGCAGGACGCGGATGTGGTGATGGTCGACGATCTGGTCAACCCGAGCATACTGGAGCACTGTCCGTCCGCCCGGCTGGTCCGGGTCGGCAAACGCGGCGGCTGCCGCTCCACACCGCAGGACTTCATcc < 1:8310393/150‑1 (MQ=255)
ccTGAAGGCAGTTCGCGCCCTGCAGGACGCGGATGTGGTGATGGTCGACGATCTGGTCAACCCGAGCATACTGGAGCACTGTCCGTCCGCCCGGCTGGTCCGGGTCGGCAAACGCGGCGGCTGCCGCTCCACACCGCAGGACTTCATCCa > 1:849230/1‑150 (MQ=255)
tGAAGGCAGTTCGCGCCCTGCAGGACGCGGATGTGGTGATGGTCGACGATCTGGTCAACCCGAGCATACTGGAGCACTGTCCGTCCGCCCGGCTGGTCCGGGTCGGCAAACGCGGCGGCTGCCGCTCCACACCGCAGGACTTCATCCAgc < 1:2760500/150‑1 (MQ=255)
gAAGGCAGTTCGCGCCCTGCAGGACGCGGATGTGGTGATGGTCGACGATCTGGTCAACCCGAGCATACTGGAGCACTGTCCGTCCGCCCGGCTGGTCCGGGTCGGCAAACGCGGCGGCTGCCGCTCCACACCGCAGGACTTCATCCAgcg > 1:4266042/1‑150 (MQ=255)
aaGGCAGTTCGCGCCCTGCAGGACGCGGATGTGGTGATGGTCGACGATCTGGTCAACCCGAGCATACTGGAGCACTGTCCGTCCGCCCGGCTGGTCCGGGTCGGCAAACGCGGCGGCTGCCGCTCCACACCGCAGGACTTCATCCAgcgc > 1:5496754/1‑150 (MQ=255)
aGGCAGTTCGCGCCCTGCAGGACGCGGATGTGGTGATGGTCGACGATCTGGTCAACCCGAGCATACTGGAGCACTGTCCGTCCGCCCGGCTGGTCCGGGTCGGCAAACGCGGCGGCTGCCGCTCCTCACCGCAGGACTTCATCCAGCGcc > 1:7774262/1‑150 (MQ=255)
ggCAGTTCGCGCCCTGCAGGACGCGGATGTGGTGATGGTCGACGATCTGGTCAACCCGAGCATACTGGAGCACTGTCCGTCCGCCCGGCTGGTCCGGGTCGGCAAACGCGGCGGCTGCCGCTCCACACCGCAGGACTTCATCCAGCGCCt < 2:8567212/150‑1 (MQ=255)
ggCAGGTCGCGCCCTGCAGGACGCGGATGTGGTGATGGTCGACGATCTGGTCAACCCGAGCATACTGGAGCACTGTCCGTCCGACCGGCTGGTCCGGGTCGGCAAACGCGGCGGCTGCCGCTCCACACCGCAGGACTTCATCCAGCGCCt > 2:5353670/1‑150 (MQ=255)
gCAGTTCGCGCCCTGCAGGACGCGGATGTGGTGATGGTCGACGATCTGGTCAACCCGAGCATACTGGAGCACTGTCCGTCCGCCCGGCTGGTCCGGGTCGGCAAACGCGGCGGCTGCCGCTCCACACCGCAGGACTTCATCCAGCGCCTg < 2:503153/150‑1 (MQ=255)
gTTCGCGCCCTGCAGGACGCGGATGTGGTGATGGTCGACGATCTGGTCAACCCGAGCATACTGGAGCACTGTCCGTCCGCCCGGCTGGTCCGGGTCGGCAAACGCGGCGGCTGCCGCTCCACACCGCAGGACTTCATCCAGCGCCTGAtg > 2:4550571/1‑150 (MQ=255)
cgcgCCCTGCAGGACGCGGATGTGGTGATGGTCGACGATCTGGTCAACCCGAGCATACTGGAGCACTGTCCGTCCGCCCGGCTGGTCCGGGTCGGCAAACGCGGCGGCTGCCGCTCCACACCGCAGGACTTCATCCAGCGCCTGAtgctg > 2:9352367/1‑150 (MQ=255)
gcCCTGCAGGACGCGGATGTGGTGATGGTCGACGATCTGGTCAACCCGAGCATACTGGAGCACTGTCCGTCCGCCCGGCTGGTCCGGGTCGGCAAACGCGGCGGCTGCCGCTCCACACCGCAGGACTTCATCCAGCGCCTGATGCTGCgg < 1:7513239/150‑1 (MQ=255)
tGCAGGACGCGGATGTGGTGATGGTCGACGATCTGGTCAACCCGAGCATACTGGAGCACTGTCCGTCCGCCCGGCTGGTCCGGGTCGGCAAACGCGGCGGCTGCCGCTCCACACCGCAGGACTTCATCCAGCGCCTGATGCTGCGGCATg > 2:9554513/1‑150 (MQ=255)
tGCAGGACGCGGATGTGGTGATGGTCGACGATCTGGTCAACCCGAGCATACTGGAGCACTGTCCGTCCGCCCGGCTGGTCCGGGTCGGCAAACGCGGCGGCTGCCGCTCCACACCGCAGGACTTCATCCAGCGCCTGATGCTGCGGCATg > 2:767020/1‑150 (MQ=255)
tGCAGGACGCGGATGTGGTGATGGTCGACGATCTGGTCAACCCGAGCATACTGGAGCACTGTCCGTCCGCCCGGCTGGTCCGGGTCGGCAAACGCGGCGGCTGCCGCTCCACACCGCAGGACGTCATCCAGCGCCTGATGCTGCGGCATg > 1:6572792/1‑150 (MQ=255)
gCAGGACGCGGATGTGGTGATGGTCGACGATCTGGTCAACCCGAGCATACTGGAGCACTGTCCGTCCGCCCGGCTGGTCCGGGTCGGCAAACGCGGCGGCTGCCGCTCCACACCGCAGGACTTCATCCAGCGCCTGATGCTGCGGCATGc > 1:9874787/1‑150 (MQ=255)
gCAGGACGCGGATGTGGTGATGGTCGACGATCTGGTCAACCCGAGCATACTGGAGCACTGTCCGTCCGCCCGGCTGGTCCGGGTCGGCAAACGCGGCGGCTGCCGCTCCACACCGCAGGACTTCATCCAGCGCCTGATGCTGCGGCAGGc < 2:10537264/150‑1 (MQ=255)
cAGGACGCGGATGTGGTGATGGTCGACGATCTGGTCAACCCGAGCATACTGGAGCACTGTCCGTCCGCCCGGCTGGTCCGGGTCGGCAAACGCGGCGGCTGCCGCTCCACACCGCAGGACTTCATCCAGCGCCTGATGCTGCGGCATGcc > 2:3981139/1‑150 (MQ=255)
cAGGACGCGGATGTGGTGATGGTCGACGATCTGGTCAACCCGAGCATACTGGAGCACTGTCCGTCCGCCCGGCTGGTCCGGGTCGGCAAACGCGGCGGCTGCCGCTCCACACCGCAGGACTTCATCCAGCGCCTGATGCTGCGGCATGcc < 1:2016154/150‑1 (MQ=255)
gcgGATGTGGTGATGGTCGACGATCTGGTCAACCCGAGCATACTGGAGCACTGTCCGTCCGCCCGGCTGGTCCGGGTCGGCAAACGCGGCGGCTGCCGCTCCACACCGCAGGACTTCATCCAGCGCCTGATGCTGCGGCATGCCCGCCAg > 1:1193224/1‑150 (MQ=255)
ggATGTGGTGATGGTCGACGATCTGGTCAACCCGAGCATACTGGAGCACTGTCCGTCCGCCCGGCTGGTCCGGGTCGGCAAACGCGGCGGCTGCCGCTCCACACCGCAGGACTTCATCCAGCGCCTGATGCTGCGGCATGCCCGCCAggg < 1:10732665/150‑1 (MQ=255)
ggATGTGGTGATGGTCGACGATCTGGTCAACCCGAGCATACTGGAGCACTGTCCGTCCGCCCGGCTGGTCCGGGTCGGCAAACGCGGCGGCTGCCGCTCCACACCGCAGGACTTCATCCAGCGCCTGATGCTGCGGCATGCCCGCCAggg > 1:2807756/1‑150 (MQ=255)
ggATGTGGTGATGGTCGACGATCTGGTCAACCCGAGCATACTGGAGCACTGTCCGTCCGCCCGGCAGGTCCGGGTCGGCAAACGCGGCGGCTGCCGCTCCACACCGCAGGACTTCATCCAGCGCCTGATGCTGCGGCATGCCCGCCAggg < 2:3349081/150‑1 (MQ=255)
gATGTGGTGATGGTCGACGATCTGGTCAACCCGAGCATACTGGAGCACTGTCCGTCCGCCCGGCTGGTCCGGGTCGGCAAACGCGGCGGCTGCCGCTCCACACCGCAGGACTTCATCCAGCGCCTGATGCTGCGGCATGCCCGCCAGGGa > 2:7185647/1‑150 (MQ=255)
gATGTGGTGATGGTCGACGATCTGGTCAACCCGAGCATACTGGAGCACTGTCCGTCCGCCCGGCTGGTCCGGGTCGGCAAACGCGGCGGCTGCCGCTCCACACCGCAGGACTTCATCCAGCGCCTGATGCTGCGGCATGCCCGCCAGGGa > 2:1615813/1‑150 (MQ=255)
tggtgATGGTCGACGATCTGGTCAACCCGAGCATACTGGAGCACTGTCCGTCCGCCCGGCTGGTCCGGGTCGGCAAACGCGGCGGCTGCCGCTCCACACCGCAGGACTTCATCCAGCGCCTGATGCTGCGGCATGCCCGCCAGGGACGCa < 1:509995/150‑1 (MQ=255)
tggtgATGGTCGACGATCTGGTCAACCCGAGCATACTGGAGCACTGTCCGTCCGCCCGGCTGGTCCGGGTCGGCAAACGCGGCGGCTGCCGCTCCACACCGCAGGACTTCATCCAGCGCCTGATGCTGCGGCATGCCCGCCAGGGACGCa > 2:2489597/1‑150 (MQ=255)
ggtgATGGTCGACGATCTGGTCAACCCGAGCATACTGGAGCACTGTCCGTCCGCCCGGCTGGTCCGGGTCGGCAAACGCGGCGGCTGCCGCTCCACACCGCAGGACTTCATCCAGCGCCTGATGCTGCGGCATGCCCGCCAGGGACGCAg < 1:6806226/150‑1 (MQ=255)
gtgATGGTCGACGATCTGGTCAACCCGAGCATACTGGAGCACTGTCCGTCCGCCCGGCTGGTCCGGGTCGGCAAACGCGGCGGCTGCCGCTCCACACCGCAGGACTTCATCCAGCGCCTGATGCTGCGGCATGCCCGCCAGGGACGCAGc > 2:6270761/1‑150 (MQ=255)
tgATGGTCGACGATCTGGTCAACCCGAGCATACTGGAGCACTGTCCGTCCGCCCGGCTGGTCCGGGTCGGCAAACGCGGCGGCTGCCGCTCCACACCGCAGGACTTCATCCAGCGCCTGATGCTGCGGCATGCCCGCCAGGGACGCAGCg > 2:9741676/1‑150 (MQ=255)
gATGGTCGACGATCTGGTCAACCCGAGCATACTGGAGCACTGTCCGTCCGCCCGGCTGGTCCTGGTCGGCAAACGCCGCGGCTGCCGCTCCACACCGCAGGACTTCAACCAGCGCCTGATGCTGCGGCATGCCCGCCAGGGACGCAGCgt < 2:4754111/150‑1 (MQ=255)
aTGGTCGACGATCTGGTCAACCCGAGCATACTGGAGCACTGTCCGTCCGCCCGGCTGGTCCGGGTCGGCAAACGCGGCGGCTGCCGCTCCACACCGCAGGACTTCATCCAGCGCCTGATGCTGCGGCATGCCCGCCAGGGACGCAGCgtg > 2:6131237/1‑150 (MQ=255)
tGGTCGACGATCTGGTCAACCCGAGCATACTGGAGCACTGTCCGTCCGCCCGGCTGGTCCGGGTCGGCAAACGCGGCGGCTGCCGCTCCACACCGCAGGACTTCATCCAGCGCCTGATGCTGCGGCATGCCCGCCAGGGACGCAGCgtgg < 2:8954134/150‑1 (MQ=255)
tGGTCGACGATCTGGTCAACCCGAGCATACTGGAGCACTGTCCGTCCGCCCGGCTGGTCCGGGTCGGCAAACGCGGCGGCTGCCGCTCCACACCGCAGGACTTCATCCAGCGCCTGATGCTGCGGCATGCCCGCCAGGGACGCAGCgtgg < 2:2929670/150‑1 (MQ=255)
ggTCGACGATCTGGTCACCCCGAGCATACTGGCGCACGGTCCGTCCGCCCGGCTGGTCCGGGTCGGCAAACGCGGCGGCTGCCGCTCCACACCGCAGGACTTCAGCCAGCGCCTGATGCTGCGGCATGCCCGCCAGGGACGCAGCgtggt < 2:5944718/150‑1 (MQ=255)
ggTCGACGATCTGGTCAACCCGAGCATACTGGAGCACTGTCCGTCCGCCCGGCTGGTCCGGGTCGGCAAACGCGGCGGCTGCCGCTCCACACCGCAGGACTTCATCCAGCGCCTGATGCTGCGGCATGCCCGCCAGGGACGCAGCgtggt < 2:2694225/150‑1 (MQ=255)
ggTCGACGATCTGGTCAACCCGAGCAGACTGGAGCACTGTCCGTCCGCCCGGCTGGTCCGGGTCGGCAAACGCGGCGGCTGCCGCTCCACACCGCAGGACTTCATCCAGCGCCTGATGCTGCGGCATGCCCGCCAGGGACGCAGCgtggt < 2:10944587/150‑1 (MQ=255)
tCGACGATCTGGTCAACCCGAGCATACTGGAGCACTGTCCGTCCGCCCGGCTGGTCCGGGTCGGCAAACGCGGCGGCTGCCGCTCCACACCGCAGGACTTCATCCAGCGCCTGATGCTGCGGCATGCCCGCCAGGGACGCAGCGTGGTgc > 2:10152025/1‑150 (MQ=255)
cgaTCTGGTCAACCCGAGCATACTGGAGCACTGTCCGTCCGCCCGGCTGGTCCGGGTCGGCAAACGCGGCGGCTGCCGCTCCACACCGCAGGACTTCATCCAGCGCCTGATGCTGCGGCATGCCCGCCAGGGACGCAGCGTGGTGCGCCt < 1:3303873/150‑1 (MQ=255)
gaTCTGGTCAACCCGAGCATACTGGAGCACTGTCCGTCCGCCCGGCTGGTCCGGGTCGGCAAACGCGGCGGCTGCCGCTCCACACCGCAGGACTTCATCCAGCGCCTGATGCTGCGGCATGCCCGCCAGGGACGCAGCGTGGTGCGCCTg < 2:1211731/150‑1 (MQ=255)
gaTCTGGTCAACCCGAGCATACTGGAGCACTGTCCGTCCGCCCGGCTGGTCCGGGTCGGCAAACGCGGCGGCTGCCGCTCCACACCGCAGGACTTCATCCAGCGCCTGATGCTGCGGCATGCCCGCCAGGGACGCAGCGTGGTGCGCCTg > 1:10322071/1‑150 (MQ=255)
ctGGTCAACCCGAGCATACTGGAGCACTGTCCGTCCGCCCGGCTGGTCCGGGTCGGCAAACGCGGCGGCTGCCGCTCCACACCGCAGGACTTCATCCAGCGCCTGATGCTGCGGCATGCCCGCCAGGGACGCAGCGTGGTGCGCCTGaaa > 1:1733316/2‑150 (MQ=255)
ctGGTCAACCCGAGCATACTGGAGCACTGTCCGTCCGCCCGGCTGGTCCGGGTCGGCAAACGCGGCGGCTGCCGCTCCACACCGCAGGACTTCATCCAGCGCCTGATGCTGCGGCATGCCCGCCAGGGACGCAGCGTGGTGCGCCTGaaa < 1:646298/149‑1 (MQ=255)
ggTCAACCCGAGCATACTGGAGCACTGTCCGTCCGCCCGGCTGGTCCGGGTCGGCAAACGCGGCGGCTGCCGCTCCACACCGCAGGACTTCATCCAGCGCCTGATGCTGCGGCATGCCCGCCAGGGACGCAGCGTGGTGCGCCTGAAAgg < 2:8685657/150‑1 (MQ=255)
ggTCAACCCGAGCATACTGGAGCACTGTCCGTCCGCCCGGCTGGTCCGGGTCGGCAAACGCGGCGGCTGCCGCTCCACACCGCAGGACTTCATCCAGCGCCTGATGCTGCGGCATGCCCGCCAGGGACGCAGCGTGGTGCGCCTGAAAgg > 2:11027624/1‑150 (MQ=255)
gTCAACCCGAGCATACTGGAGCACTGTCCGTCCGCCCGGCTGGTCCGGGTCGGCAAACGCGGCGGCTGCCGCTCCACACCGCAGGACTTCATCCAGCGCCTGATGCTGCGGCATGCCCGCCAGGGACGCAGCGTGGTGCGCCTGAAAggc < 1:8699666/150‑1 (MQ=255)
gTCAACCCGAGCATACTGGAGCACTGTCCGTCCGCCCGGCTGGTCCGGGTCGGCAAACGCGGCGGCTGCCGCTCCACACCGCAGGACTTCATCCAGCGCCTGATGCTGCGGCATGCCCGCCAGGGACGCAGCGTGGTGCGCCTGAAAggc > 1:1276213/1‑150 (MQ=255)
gTCAACCCGAGCATACTGGAGCACTGTCCGTCCGCCCGGCTGGTCCGGGTCGGCAAACGCGGCGGCTGCCGCTCCACACCGCAGGACTTCATCCAGCGCCTGATGCTGCGGCATGCCCGCCAGGGACGCAGCGTGGTGCGCCTGAAAggc > 1:2461726/1‑150 (MQ=255)
cAACCCGAGCATACTGGAGCACTGTCCGTCCGCCCGGCTGGTCCGGGTCGGCAAACGCGGCGGCTGCCGCTCCACACCGCAGGACTTCATCCAGCGCCTGATGCTGCGGCATGCCCGCCAGGGACGCAGCGTGGTGCGCCTGAAAggcgg > 1:6159103/1‑150 (MQ=255)
cccGAGCATACTGGAGCACTGTCCGTCCGCCCGGCTGGTCCGGGTCGGCAAACGCGGCGGCTGCCGCTCCACACCGCAGGACTTCATCCAGCGCCTGATGCTGCGGCATGCCCGCCAGGGACGCAGCGTGGTGCGCCTGAAAGGCGGCGa < 1:1404584/150‑1 (MQ=255)
gCATACTGGAGCACTGTCCGTCCGCCCGGCTGGTCCGGGTCGGCAACCGCGGCGGCTGCCGCTCCACACCGCAGGACTTCATCCAGCGCCTGATGCTGCGGCATGCCCGCCAGGGACGCAGCGTGGTGCGCCTGAAAGGCGGCGATCCAt > 1:3130134/1‑150 (MQ=255)
gCATACTGGAGCACTGTCCGTCCGCCCGGCTGGTCCGGGTCGGCAAACGCGGCGGCTGCCGCTCCACACCGCCGGACTTCATCCAGCGCCTGATGCTGCGGCATGCCCGCCAGGGACGCAGCGTGGTGCGCCTGAAAGGCGGCGATCCAt > 2:6636114/1‑150 (MQ=255)
gCATACTGGAGCACTGTCCGTCCGCCCGGCTGGTCCGGGTCGGCAAACGCGGCGGCTGCCGCTCCACACCGCAGGACTTCATCCAGCGCATGATGCTGCGGCAAACCCGCCAGCGACTCAGCTTCGAGCGCCTGAAATGCGGCGATCCaa > 2:9605895/1‑149 (MQ=255)
cATACTGGAGCACTGTCCGTCCGCCCGGCTGGTCCGGGTCGGCAAACGCGGCGGCTGCCGCTCCACACCGCAGGACTTCATCCAGCGCCTGATGCTGCGGCATGCCCGCCAGGGACGCAGCGTGGTGCGCCTGAAAGGCGGCGATCCATg > 1:9416625/1‑150 (MQ=255)
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TCAACCCGAGCATACTGGAGCACTGTCCGTCCGCCCGGCTGGTCCGGGTCGGCAAACGCGGCGGCTGCCGCTCCACACCGCAGGACTTCATCCAGCGCCTGATGCTGCGGCATGCCCGCCAGGGACGCAGCGTGGTGCGCCTGAAAGGCGG > SRR18135098.6188191/1‑151 (MQ=60)
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ATGAGCGGTAAGGTCTGGCTGGTGGGTGCGGGTCCCGGCGATCCGGAACTGTTGACCCTGAAGGCAGTTCGCGCCCTGCAGGACGCGGATGTGGTGATGGTCGACGATTTGGTCAACCCGAGCATACTGGAGCACTGTCCGTCCGCCCGGGTGGTCCGGGTCGGCAAACGCGGCGGCTGCCGCTCCACACCGCAGGACTTCATCCAGCGCCTGATGCTGCGGCATGCCCGCCAGGGACGCAGCGTGGTGCGCCTGAAAGGCGGCGATCCATGCATCTTCGGCCGCGCCGGCGAAGAAGCCG > NC_008463/3711641‑3711941
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| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 0 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
