Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A4 F1 I1 R1
|
255 |
512.9 |
22377240 |
99.2% |
22198222 |
150.0 |
Breseq alignment
BRESEQ :: Evidence
|
| evidence |
seq id |
position |
mutation |
annotation |
gene |
description |
| RA |
NC_008463 |
393,904 |
(G)5→6 |
coding (1135/2280 nt) |
ptsP → |
phosphoenolpyruvate‑‑protein phosphotransferase |
| |
seq id |
position |
ref |
new |
freq |
score (cons/poly) |
reads |
annotation |
genes |
product |
| * | NC_008463 | 393,899 | 1 | . | G | 98.5%
| 2027.5
/ 15.7
| 517 | coding (1130/2280 nt) | ptsP | phosphoenolpyruvate‑‑protein phosphotransferase |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base . (3/5); new base G (219/290); total (222/295) |
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 |
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 |
Only 100 of 571 total aligned reads displayed.
GGAGCAGACCATCATCGTCAGCGAGGAGCTGTCGCCGGCGATGCTCGGCGAGGTGCCGGAAGGGCGCCTGGTCGGCCTGGTCTCGGTGCTCGGCTCGGGCAACTCGCACGTGGCGATCCTCGCCCGTGCCATGGGCATCCCCACGGTGA‑T‑GGGGGCGGTCGACCTGCCGTACTCCAAGGTCGACGGTATCGACCTGATCGTCGATGGCTACCACGGCGAGGTCTACACCAACCCCTCCGCCGAGCTGGTGCGCCAGTACAGCGACGTGGTCGCCGAGGAGCGCGAGCTGAGCAA > NC_008463/393750‑394043
|
aGCAGACCATCATCGTCAGCGAGGAGCTGTCGCCGGCGATGCTCGGCGAGGTGCCGGAAGGGCGCCTGGTCGGCCTGGTCTCGGTGCTCGGCTCGGGCAACTCGCACGTGGCGATCCTCGCCCGTGCCATGGGCCTCCCCACGGTGC‑T‑gg > 1:6212833/1‑150 (MQ=255)
cAGACCATCATCGTCAGCGAGGAGCTGTCGCCGGCGATGCTCGGCGAGGTGCCGGAAGGGCGCCTGGTCGGCCTGGTCTCGGTGCTCGGCTCGGGCAACTCGCACGTGGCGATCCTCGCCCGTGCCATGGGCATCCCCACGGTGA‑T‑gggg > 2:8370988/1‑150 (MQ=255)
aGACCATCCTCGTCAGCGAGGCGCTGTCGCCGGCGCTGCTCGGCGAGGTGCCGGACGGGCGCCTGGTCGGCCTGGTCTCGGTGCTCGGCTCGGGCAACTCGCACGTGGCGATCCTCGCCCGTGCCATGGGCATCCCCACGGTGA‑T‑ggggg < 2:556156/150‑1 (MQ=255)
aGACCATCATCGTCAGCGAGGAGCTGTCGCCGGCGATGCTCGGCGAGGTGCCGGAAGGGCGCCTGGTCGGCCTGGTCTCGGTGCTCGGCTCGGGCAACTCGCACGTGGCGATCCTCGCCCGTGCCATGGGCATCCCCACGGTGA‑T‑ggggg < 1:2496080/150‑1 (MQ=255)
gACCATCATCGTCAGCGAGGAGCTGTCGCCGGCGATGCTCGGCGAGGTGCCGGAAGGGCGCCTGGTCGGCCTGGTCTCGGTGCTCGGCTCGGGCAACTCGCACGTGGCGATCCTCGCCCGTGCCATGGGCATCCCCACGGTGA‑T‑gggggg > 1:3235516/1‑149 (MQ=255)
ccATCATCGTCAGCGAGGAGCTGTCGCCGGCGATGCTCGGCGAGGTGCCGGAAGGGCGCCTGGTCGGCCTGGTCTCGGTGCTCGGCTCGGGCAACTCGCACGTGGCGATCCTCGCCCGTGCCATGGGCATCCCCACGGTGA‑T‑ggggggcg < 2:11105051/150‑4 (MQ=255)
atcGTCAGCGAGGAGCTGTCGCCGGCGATGCTCGGCGAGGTGCCGGAAGGGCGCCTGGTCGGCCTGGTCTCGGTGCTCGGCTCGGGCAACTCGCACGTGGCGATCCTCGCCCGTGCCATGGGCATCCCCACGGTGA‑TGGGGGGCGGTCGa > 2:5350095/1‑150 (MQ=255)
tcGTCAGCGAGGAGCTGTCGCCGGCGATGCTCGGCGAGGTGCCGGAAGGGCGCCTGGTCGGCCTGGTCTCGGTGCTCGGCTCGGGCATCTCGCACGTGGCGATCCTCGCCCGTGCCATGGGCATCCCCACGGTGC‑TGGGGGGCGGTCGAc > 2:7474862/1‑150 (MQ=255)
tcGTCAGCGAGGAGCTGTCGCCGGCGATGCTCGGCGAGGTGCCGGAAGGGCGCCTGGTCGGCCTGGTCTCGGTGCTCGGCTCGGGCAACTCGCACGTGGCGATCCTCGCCCGTGCCATGGGCATCCCCACGGTGA‑TGGGGGGCGGTCGAc < 1:5479270/150‑1 (MQ=255)
gTCAGCGAGGAGCTGTCGCCGGCGATGCTCGGCGAGGTGCCGGAAGGGCGCCTGGTCGGCCTGGTCTCGGTGCTCGGCTCGGGCAACTCGCACGTGGCGATCCTCGCCCGTGCCATGGGCATCCCCACGGTGA‑TGGGGGGCGGTCGACCt < 2:10624696/150‑1 (MQ=255)
tCAGCGAGGAGCTGTCGCCGGCGATGCTCGGCGAGGTGCCGGAAGGGCGCCTGGTCGGCCTGGTCTCGGTGCTCGGCTCGGGCAACTCGCACGTGGCGATCCTCGCCCGTGCCATGGGCATCCCCACGGTGA‑TGGGGGGCGGTCGACCTg < 1:7402608/150‑1 (MQ=255)
gCGAGGAGCTGTCGCCGGCGATGCTCGGCGAGGTGCCGGCAGGGCGCCTGGGCGGCCTGGTCTCGGTGCTCGGCTCGGGCAACTCGCACGTGGCGATCCTCGCCCGTGCCATGGGCATCCCCACGGTGA‑TGGGGGGCGGTCGACCTGCCg < 2:976701/150‑1 (MQ=255)
aggagCTGTCGCCGGCGATGCTCGGCGAGGTGCCGGAAGGGCGCCTGGTCGGCCTGGTCTCGGTGCTCGGCTCGGGCAACTCGCACGTGGCGATCCTCGCCCGTGCCATGGGCATCCCCACGGTGA‑TGGGGGGCGGTCGACCTGCCGTAc < 2:6569708/150‑1 (MQ=255)
aggagCTGTCGCCGGCGATGCTCGGCGAGGTGCCGGAAGGGCGCCTGGTCGGCCTGGTCTCGGTGCTCGGCTCGGGCAACTCGCACGTGGCGATCCTCGCCCGTGCCATGGGCATCCCCACGGTGA‑TGGGGGGCGGTCGACCTGCCGTAc > 1:6047936/1‑150 (MQ=255)
aggagCTGTCGCCGGCGATGCTCGGCGAGGTGCCGGAAGGGCGCCTGGTCGGCCTGGTCTCGGGGCTCGGCTCGGGCAACTCGCACGTGGCGATCCTCGCCCGTGCCATGGGCATCCCCACGGTGA‑TGGGGGGCGGTCGACCTGCCGTAc > 1:2705835/1‑150 (MQ=255)
ggagCTGTCGCCGGCGATGCTCGGCGAGGTGCCGGAAGGGCGCCTGGTCGGCCTGGTCTCGGTGCTCGGCTCGGGCAACTCGCACGTGGCGATCCTCGCCCGTGCCATGGGCATCCCCACGGTGA‑TGGGGGGCGGTCGACCTGCCGTACt > 1:130213/1‑150 (MQ=255)
gagCTGTCGCCGGCGCTGCTCGGCGAGGTGCCGGAAGGGCGCCTGGTCGGCCTGGTCTCGGTGCTCGGCTCGGGCAACTCGCACGTGGCGATCCTCGCCCGTGCCATGGGCATCCCCACGGTGA‑TGGGGGGCGGTCGACCTGCCGTACTc < 2:3107234/150‑1 (MQ=255)
agCTGTCGCCGGCGATGCTCGGCGAGGTGCCGGAAGGGCGCCTGGTCGGCCTGGTCTCGGTGCTCGGCTCGGGCAACTCGCACGTGGCGATCCTCGCCCGTGCCATGGGCATCCCCACGGTGA‑TGGGGGGCGGTCGACCTGCCGTACTcc < 1:2917842/150‑1 (MQ=255)
gCTGTCGCCGGCGATGCTCGGCGAGGTGCCGGAAGGGCGCCTGGTCGGCCTGGTCTCGGTGCTCGGCTCGGGCAACTCGCACGTGGCGATCCTCGCCCGTGCCATGGGCATCCCCACGGTGA‑TGGGGGGCGGTCGACCTGCCGTACTCCa < 1:1420091/150‑1 (MQ=255)
tGTCGCCGGCGATGCTCGGCGAGGTGCCGGAAGGGCGCCTGGTCGGCCTGGTCTCGGTGCTCGGCTCGGGCAACTCGCACGTGGCGATCCTCGCCCGTGCCATGGGCATCCCCACGGTGA‑TGGGGGGCGGTCGACCTGCCGTACTCCAAg < 1:3654077/150‑1 (MQ=255)
tGTCGCCGGCGATGCTCGGCGAGGTGCCGGAAGGGCGCCTGGTCGGCCTGGTCTCGGTGCTCGGCTCGGGCAACTCGCACGTGGCGATCCTCGCCCGTGCCATGGGCATCCCCACGGTGA‑TGGGGGGCGGTCGACCTGCCGTACTCCAAg > 2:2018634/1‑150 (MQ=255)
tGTCGCCGGCGATGCTCGGCGAGGTGCCGGAAGGGCGCCTGGTCGGCCTGGTCTCGGTGCTCGGCTCGGGCAACTCGCACGTGGCGATCCTCGCCCGTGCCATGGGCATCCCCACGGTGA‑TGGGGGGCGGTCGACCTGCCGTACTCCAAg > 2:7596885/1‑150 (MQ=255)
tGTCGCCGGCGATGCTCGGCGAGGTGCCGGAAGGGCGCCTGGTCGGCCTGGACTCGGTGCTCGGCTCGGGCAACTCGCACGTGGCGATCCTCGCCCGTGCCATGGGCATCCCCACGGTGA‑TGGGGGGCGGTCGCGCTGCCGTACTCCacg > 2:6452201/1‑148 (MQ=255)
gTCGCCGGCGATGCTCGGCGAGGTGCCGGAAGGGCGCCTGGTCGGCCTGGTCTCGGTGCTCGGCTCGGGCAACTCGCACGTGGCGATCCTCGCCCGTGCCATGGGCATCCCCACGGTGA‑TGGGGGGCGGTCGACCTGCCGTACTCCAAgg < 1:10021776/150‑1 (MQ=255)
tCGCCGGCGATGCTCGGCGAGGTGCCGGAAGGGCGCCTGGTCGGCCTGGTCTCGGTGCTCGGCTCGGGCAACTCGCACGTGGCGATCCTCGCCCGTGCCATGGGCATCCCCACGGTGA‑TGGGGGGCGGTCGACCTGCCGTACTCCAAGGt > 1:6486813/1‑150 (MQ=255)
ccGGCGATGCTCGGCGAGGTGCCGGAAGGGCGCCTGGTCGGCCTGGTCTCGGTGCTCGGCTCGGGCAACTCGCACGTGGCGATCCTCGCCCGTGCCATGGGCATCCCCACGGTGA‑TGGGGGGCGGTCGACCTGCCGTACTCCAAGGTCGa > 1:1063151/1‑150 (MQ=255)
ccGGCGATGCTCGGCGAGGTGCCGGAAGGGCGCCTGGTCGGCCTGGTCTCGGTGCTCGGCTCGGGCAACTCGCACGTGGCGATCCTCGCCCGTGCCATGGGCATCCCCACGGTGA‑TGGGGGGCGGTCGACCTGCCGTACTCCAAGGTCGa > 1:7173236/1‑150 (MQ=255)
ccGGCGATGCTCGGCGAGGTGCCGGAAGGGCGCCTGGTCGGCCTGGTCTCGGTGCTCGGCTCGGGCAACTCGCACGTGGCGATCCTCGCCCGTGCCATGGGCATCCCCACGGTGA‑TGGGGGGCGGTCGACCTGCCGTACTCCAAGGTCGa < 1:9700722/150‑1 (MQ=255)
ccGGCGATGCTCGGCGAGGTGCCGGAAGGGCGCCTGGTCGGCCTGGTCTCGGTGCTCGGCTCGGGCAACTCGCACGTGGCGATCCTCGCCCGTGCCATGGGCATCCCCACGGTGA‑TGGGGGGCGGTCGACCTGCCGTACTCCAAGGACGa < 1:11163688/150‑1 (MQ=255)
cGGCGATGCTCGGCGAGGTGCCGGAAGGGCGCCTGGTCGGCCTGGTCTCGGTGCTCGGCTCGGGCAACTCGCACGTGGCGATCCTCGCCCGTGCCATGGGCATCCCCACGGTGA‑TGGGGGGCGGTCGACCTGCCGTACTCCAAGGTCGAc < 1:6553072/150‑1 (MQ=255)
cGGCGATGCTCGGCGAGGTGCCGGAAGGGCGCCTGGTCGGCCTGGTCTCGGTGCTCGGCTCGGGCAACTCGCACGTGGCGATCCTCGCCCGTGCCATGGGCATCCCCACGGTGA‑TGGGGGGCGGTCGACCTGCCGTACTCCAAGGTCGAc < 1:6889125/150‑1 (MQ=255)
cGGCGATGCTCGGCGAGGTGCCGGAAGGGCGCCTGGTCGGCCTGGTCTCGGTGCTCGGCTCGGGCAACTCGCACGTGGCGATCCTCGCCCGTGCCATGGGCATCCCCACGGTGA‑TGGGGGGCGGTCGACCTGCCGTACTCCAAGGTCGAc < 1:803802/150‑1 (MQ=255)
ggCGATGCTCGGCGAGGTGCCGGAAGGGCGCCTGGTCGGCCTGGTCTCGGTGCTCGGCTCGGGCAACTCGCACGTGGCGATCCTCGCCCGTGCCATGGGCATCCCCACGGTGA‑TGGGGGGCGGTCGACCTGCCGTACTCCAAGGTCGACg > 1:9385747/1‑150 (MQ=255)
gATGCTCGGCGAGGTGCCGGAAGGGCGCCTGGTCGGCCTGGTCTCGGTGCTCGGCTCGGGCAACTCGCACGTGGCGATCCTCGCCCGTGCCATGGGCATCCCCACGGTGA‑TGGGGGGCGGTCGACCTGCCGTACTCCAAGGTCGACGGTa < 1:4607589/150‑1 (MQ=255)
gATGCTCGGCGAGGTGCCGGAAGGGCGCCTGGTCGGCCTGGTCTCGGTGCTCGGCTCGGGCAACTCGCACGTGGCGATCCTCGCCCGTGCCATGGGCATCCCCACGGTGA‑TGGGGGGCGGTCGACCTGCCGTACTCCAAGGTCGACGGTa < 2:317284/150‑1 (MQ=255)
gATGCTCGGCGAGGTGCCGGAAGGGCGCCTGGTCGGCCTGGTCTCGGTGCTCGGCTCGGGCAACTCGCACGTGGCGATCCTCGCCCGTGCCATGGGCATCCCCACGGTGA‑TGGGGGGCGGTCGACCTGCCGTACTCCAAGGTCGACGGTa < 1:1095071/150‑1 (MQ=255)
aTGCTCGGCGAGGTGCCGGAAGGGCGCCTGGTCGGCCTGGTCTCGGTGCTCGGCTCGGGCAACTCGCACGTGGCGATCCTCGCCCGTGCCATGGGCATCCCCACGGTGA‑TGGGGGGCGGTCGACCTGCCGTACTCCAAGGTCGACGGTAt > 2:3840257/1‑150 (MQ=255)
cTCGGCGAGGTGCCGGAAGGGCGCCTGGTCGGCCTGGTCTCGGTGCTCGGCTCGGGCAACTCGCACGTGGCGATCCTCGCCCGTGCCATGGGCATCCCCACGGTGA‑TGGGGGGCGGTCGACCTGCCGTACTCCAAGGTCGACGGTATCGa > 1:8444024/1‑150 (MQ=255)
tCGGCGAGGTGCCGGAAGGGCGCCTGGTCGGCCTGGTCTCGGTGCTCGGCTCGGGCAACTCGCACGTGGCGATCCTCGCCCGTGCCATGGGCATCCCCACGGTGA‑TGGGGGGCGGTCGACCTGCCGTACTCCAAGGTCGACGGTATCGAc > 1:3372076/1‑150 (MQ=255)
ggCGAGGTGCCGGAAGGGCGCCTGGTCGGCCTGGTCTCGGTGCTCGGCTCGGGCAACCCGCACGTGGCGATCCTCGCCCGTGCCATGGGCATCCCCACGGTGA‑TGGGGGGCGGTCGACCTGCCGTACTCCAAGGTCGACGGTATCGACCt < 1:5987196/150‑1 (MQ=255)
gCGAGGTGCCGGAAGGGCGCCTGGTCGGCCTGGTCTCGGTGCTCGGCTCGGGCAACTCGCACGTGGCGATCCTCGCCCGTGCCATGGGCATCCCCACGGTGA‑TGGGGGGCGGTCGACCTGCCGTACTCCAAGGTCGACGGTATCGACCTg > 2:4885550/1‑150 (MQ=255)
gCGAGGTGCCGGAAGGGCGCCTGGTCGGCCTGGTCTCGGTGCTCGGCTCGGGCAACTCGCACGTGGCGATCCTCGCCCGTGCCATGGGCATCCCCACGGTGA‑TGGGGGGCGGTCGACCTGCCGTACTCCAAGGTCGACGGTATCGACCTg < 1:10243348/150‑1 (MQ=255)
gAGGTGCCGGAAGGGCGCCTGGTCGGCCTGGTCTCGGTGCTCGGCTCGGGCAACTCGCACGTGGCGTTCCTCGCCCGTGCCATGGGCATCCCCACGGTGA‑TGGGGGGCGGTCGACCTGCCGTACTCCAAGGTCGACGGTATCGACCTGAt > 2:6038346/1‑150 (MQ=255)
gAGGTGCCGGAAGGGCGCCTGGTCGGCCTGGTCTCGGTGCTCGGCTCGGGCAACTCGCACGTGGCGATCCTCGCCCGTGCCATGGGCATCCCCACGGTGA‑TGGGGGGCGGTCGACCTGCCGTACTCCAAGGTCGACGGTATCGACCTGAt < 1:9007913/150‑1 (MQ=255)
tGCCGGAAGGGCGCCTGGTCGGCCTGGTCTCGGTGCTCGGCTCGGGCAACTCGCACGTGGCGATCCTCGCCCGTGCCATGGGCATCCCCACGGTGA‑TGGGGGGCGGTCGACCTGCCGTACTCCAAGGTCGACGGTATCGACCTGAtcgtc < 1:4261363/150‑1 (MQ=255)
ggAAGGGCGCCTGGTCGGCCTGGTCTCGGTGCTCGGCTCGGGCAACTCGCACGTGGCGATCCTCGCCCGTGCCATGGGCATCCCCACGGTGA‑TGGGGGGCGGTCGACCTGCCGTACTCCAAGGTCGACGGTATCGACCTGATCGTCGATg < 2:5846578/150‑1 (MQ=255)
ggAAGGGCGCCTGGTCGGCCTGGTCTCGGTGCTCGGCTCGGGCAACTCGCACGTGGCGATCCTCGCCCGTGCCATGGGCATCCCCACGGTGA‑TGGGGGGCGGTCGACCTGCCGTACTCCAAGGTCGACGGTATCGACCTGATCGTCGATg < 1:7439732/150‑1 (MQ=255)
ggAAGGGCGCCTGGTCGGCCTGGTCTCGGTGCTCGGCTCGGGCAACTCGCACGTGGCGATCCTCGCCCGTGCCATGGGCATCCCCACGGTGA‑TGGGGGGCGGTCGACCTGCCGTACTCCAAGGTCGACGGTATCGACCTGATCGTCGATg < 1:5901796/150‑1 (MQ=255)
gggCGCCTGGTCGGCCTGGTCTCGGTGCTCGGCTCGGGCAACTCGCACGTGGCGATCCTCGCCCGTGCCATGGGCATCCCCACGGTGA‑TGGGGGGCGGTCGACCTGCCGTACTCCAAGGTCGACGGTATCGACCTGATCGTCGATGGCTa > 1:2197320/1‑150 (MQ=255)
cgcCTGGTCGGCCTGGTCTCGGTGCTCGGCTCGGGCAACTCGCACGTGGCGATCCTCGCCCGTGCCATGGGCATCCCCACGGTGA‑TGGGGGGCGGTCGACCTGCCGTACTCCAAGGTCGACGGTATCGACCTGATCGTCGATGGCTACCa > 2:4264270/1‑150 (MQ=255)
gcCTGGTCGGCCTGGTCTCGGTGCTCGGCTCGGGCAACTCGCACGTGGCGATCCTCGCCCGTGCCATGGGCATCCCCACGGTGA‑TGGGGGGCGGTCGACCTGCCGTACTCCAAGGTCGACGGTATCGACCTGATCGTCGATGGCTACCAc < 1:1698560/150‑1 (MQ=255)
ggTCGGCCTGGTCTCGGTGCTCGGCTCGGGCAACTCGCACGTGGCGATCCTCGCCCGTGCCATGGGCATCCCCACGGTGA‑TGGGGGGCGGTCGACCTGCCGTCCTCCAAGGTCGACGGTATCGACCTGATCGTCGATGGCTACCACGGCg > 2:7109739/1‑150 (MQ=255)
gTCGGCCTGGTCTCGGTGCTCGGCTCGGGCAACTCGCACGTGGCGATCCTCGCCCGTGCCATGGGCATCCCCACGGTGA‑TGGGGGGCGGTCGACCTGCCGTACTCCAAGGTCGACGGTATCGACCTGATCGTCGATGGCTACCACGGCGa > 1:9878220/1‑150 (MQ=255)
cGGCCTGGTCTCGGTGCTCGGCTCGGGCAACTCGCACGTGGCGATCCTCGCCCGTGCCATGGGCATCCCCACGGTGA‑TGGGGGGCGGTCGACCTGCCGTACTCCAAGGTCGACGGTATCGACCTGATCGTCGATGGCTACCACGGCGAgg > 2:1772195/1‑150 (MQ=255)
tGGTCTCGGTGCTCGGCTCGGGCAACTCGCACGTGGCGATCCTCGCCCGTGCCATGGGCATCCCCACGGTGA‑TGGGGGGCGGTCGACCTGCCGTACTCCAAGGTCGACGGTATCGACCTGATCGTCGATGGCTACCACGGCGAGGTCTac > 2:7828105/1‑150 (MQ=255)
gTCTCGGTGCTCGGCTCGGGCAACTCGCACGTGGCGATCCTCGCCCGTGCCATGGGCATCCCCACGGTGA‑TGGGGGGCGGTCGACCTGCCGTACTCCAAGGTCGACGGTATCGACCTGATCGTCGATGGCTACCACGGCGAGGTCTacac < 1:826234/150‑1 (MQ=255)
gTCTCGGTGCTCGGCTCGGGCAACTCGCACGTGGCGATCCTCGCCCGTGCCATGGGCATCCCCACGGTGA‑TGGGGGGCGGTCGACCTGCCGTACTCCAAGGTCGACGGTATCGACCTGATCGTCGATGGCTACCACGGCGAGGTCTacac > 1:3328473/1‑150 (MQ=255)
ctcGGTGCTCGGCTCGGGCAACTCGCACGTGGCGATCCTCGCCCGTGCCATGGGCATCCCCACGGTGA‑TGGGGGGCGGTCGACCTGCCGTACTCCAAGGTCGACGGTATCGACCTGATCGTCGATGGCTACCACGGCGAGGTCTACACCa < 1:4916437/150‑1 (MQ=255)
tcGGTGCTCGGCTCGGGCAACTCGCACGTGGCGATCCTCGCCCGTGCCATGGGCATCCCCACGGTGA‑TGGGGGGCGGTCGACCTGCCGTACTCCAAGGTCGACGGTATCGACCTGATCGTCGATGGCTACCACGGCGAGGTCTACACCaa < 2:6729546/150‑1 (MQ=255)
tGCTCGGCTCGGGCAACTCGCACGTGGCGATCCTCGCCCGTGCCATGGGCATCCCCACGGTGA‑TGGGGGGCGGTCGACCTGCCGTACTCCAAGGTCGACGGTATCGACCTGATCGTCGATGGCTACCACGGCGAGGTCTACACCAAcccc > 2:10147439/1‑150 (MQ=255)
gctcggctcgGGCACCTCGCCCGTGGCGATCCTCGCCCGTCCCCTGGGCATCCCCACGGTGA‑TGGGGGGCGGTCGCCCTGCCGTACTCCACGGGCGACGGTATCGACCTGATCGTCGATTGCTACCACGGCGAGGTCTACACCAACCCCt < 2:693887/150‑1 (MQ=255)
ctcggctcggGCAACTCGCACGTGGCGATCCTCGCCCGTGCCATGGGCATCCCCACGGTGA‑TGGGGGGCGGTCGACCTGCCGTACTCCAAGGTCGACGGTATCGACCTGATCGTCGATGGCTACCACGGCGAGGTCTACACCAACCCCTc > 2:4462507/1‑150 (MQ=255)
ctcggctcggGCAACTCGCACGTGGCGATCCTCGCCCGTGCCATGGGCATCCCCACGGTGA‑TGGGGGGCGGTCGACCTGCCGTACTCCAAGGTCGACGGTATCGACCTGATCGTCGATGGCTACCACGGCGAGGTCTACACCAACCCCTc < 2:8853984/150‑1 (MQ=255)
ctcggctcggGCAACTCGCACGGGGCGATCCTCGCCCGTGCCATGGGCATCCCCACGGTGAGG‑GGGGGCGGTCGACCTGCCGTACTCCACGGTCGACGGTCTCGACCTGATCGTAGATGGCTCCCACTGCGAGGTCTACACCAACCCCTc < 2:250103/150‑1 (MQ=255)
tcggctcggGCAACTCGCACGTGGCGATCCTCGCCCGTGCCATGGGCATCCCCACGGTGA‑TGGGGGGCGGTCGACCTGCCGTACTCCAAGGTCGACGGTATCGACCTGATCGTCGATGGCTACCACGGCGAGGTCTACACCAACCCCTcc > 2:3542933/1‑150 (MQ=255)
gctcggGCAACTCGCACGTGGCGATCCTCGCCCGTGCCATGGGCATCCCCACGGTGA‑TGGGGGGCGGTCGACCTGCCGTACTCCAAGGTCGACGGTCTCGACCTGATCGTCGATGGCTACCACGGCGAGGTCTACACCAACCCCTccgcc > 2:3265112/1‑150 (MQ=255)
gctcggGCAACTCGCACGTGGCGATCCTCGCCCGTGCCATGGGCATCCCCACGGTGA‑TGGGGGGCGGTCGACCTGCCGTACTCCAAGGTCGACGGTATCGACCTGATCGTCGATGGCTACCACGGCGAGGTCTACACCAACCCCTccgcc < 1:4396812/150‑1 (MQ=255)
tcggGCAACTCGCACGTGGCGATCCTCGCCCGTGCCATGGGCATCCCCACGGTGA‑TGGGGGGCGGTCGACCTGCCGTACTCCAAGGTCGACGGTATCGACCTGATCGTCGATGGCTACCACGGCGAGGTCTACACCAACCCCTCCGCCGa < 1:5632433/150‑1 (MQ=255)
ggCGACTCGCACGTGGCGATCCTCGCCCGTGCCATGGGCATCCCCACGGTGA‑TGGGGGGCGGTCGACCTGCCGTACTCCAAGGTCGACGGTATCGACCTGATCGTCGATGGCTACCACGGCGAGGTCTACACCAACCCCTCCGCCGAGCt > 1:1912658/1‑150 (MQ=255)
ggCAACTCGCACGTGGCGATCCTCGCCCGTGCCATGGGCATCCCCACGGTGA‑TGGGGGGCGGTCGACCTGCCGTACTCCAAGGTCGACGGTATCGACCTGATCGTCGATGGCTACCACGGCGAGGTCTACACCAACCCCTCCGCCGAGCt > 1:8794711/1‑150 (MQ=255)
cAACTCGCACGTGGCGATCCTCGCCCGTGCCATGGGCATCCCCACGGTGA‑TGGGGGGCGGTCGACCTGCCGTACTCCAAGGTCGACGGTATCGACCTGATCGTCGATGGCTACCACGGCGAGGTCTACACCAACCCCTCCGCCGAGCTgg < 2:9436240/150‑1 (MQ=255)
cAACTCGCACGTGGCGATCCTCGCCCGTGCCATGGGCATCCCCACGGTGA‑TGGGGGGCGGTCGACCTGCCGTACTCCAAGGTCGACGGTATCGACCTGATCGTCGATGGCTACCACGGCGAGGTCTACACCAACCCCTCCGCCGAGCTgg < 2:237234/150‑1 (MQ=255)
aCTCGCACGTGGCGATCCTCGCCCGTGCCATGGGCATCCCCACGGTGA‑TGGGGGGCGGTCGACCTGCCGTACTCCAAGGACGACGGTATCGACCTGATCGTCGATGGCTACCACCGCGAGGTCTACACCAACCCCTCCGCCGAGCTGGTg < 2:473930/150‑1 (MQ=255)
cGCACGTGGCGATCCTCGCCCGTGCCATGGGCATCCCCACGGTGA‑TGGGGGGCGGTCGACCTGCCGTACTCCAAGGTCGACGGTATCGACCTGATCGTCGATGGCTACCACGGCGAGGTCTACACCAACCCCTGCGCCGAGCTGGTgcgc < 2:863090/150‑1 (MQ=255)
gCACGTGGCGATCCTCGCCCGTGCCATGGGCATCCCCACGGTGA‑TGGGGGGCGGTCGACCTGCCGTACTCCAAGGTCGACGGTATCGACCTGATCGTCGATGGCTACCACGGCGAGGTCTACACCAACCCCTCCGCCGAGCTGGTGCGcc > 1:3484234/1‑150 (MQ=255)
cACGTGGCGATCCTCGCCCGTGCCATGGGCATCCCCACGGTGA‑TGGGGGGCGGTCGACCTGCCGTACTCCAAGGTCGACGGTATCGACCTGATCGTCGATGGCTACCACGGCGAGGTCTACACCAACCCCTCCGCCGAGCTGGTGCGCCa < 1:3923270/150‑1 (MQ=255)
aCGTGGCGATCCTCGCCCGTGCCATGGGCATCCCCACGGTGA‑TGGGGGGCGGTCGACCTGCCGTACTCCAAGGTCGACGGTATCGACCTGATCGTCGATGGCTACCACGGCGAGGTCTACACCAACCCCTCCGCCGAGCTGGTGCGCCAg < 1:10846506/150‑1 (MQ=255)
cGTGGCGATCCTCGCCCGTGCCATGGGCATCCCCACGGTGA‑TGGGGGGCGGTCGACCTGCCGTACTCCAAGGTCGACGGTATCGACCTGATCGTCGATGGCTACCACGGCGAGGTCt < 1:7592584/117‑1 (MQ=255)
cGTGGCGATCCTCGCCCGTGCCATGGGCATCCCCACGGTGA‑TGGGGGGCGGTCGACCTGCCGTACTCCAAGGTCGACGGTATCGACCTGATCGTCGATGGCTACCACGGCGAGGTCTACACCAACCCCTCCGCCGAGCTGGTGCGCCAGt < 2:10827062/150‑1 (MQ=255)
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tGGCGATCCTCGCCCGTGCCATGGGCATCCCCACGGTGA‑TGGGGGGCGGTCGACCTGCCGTACTCCAAGGTCGCCGGTATCGACCTGATCGTCGATGGCTACCACGGCGAGGTCTACACCAACCCCTCCGCCGAGCTGGTGCGCCAGTAc < 2:2834810/150‑1 (MQ=255)
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CAACTCGCACGTGGCGATCCTCGCCCGTGCCATGGGCATCCCCACGGTGATGGGGGGCGGTCGACCTGCCGTACTCCAAGGTCGACGGTATCGACCTGATCGTCGATGGCTACCACGGCGAGGTCTACACCAACCCCTCCGCCGAGCTGGT < SRR18135092.7438545/151‑1 (MQ=60)
CAACTCGCACGTGGCGATCCTCGCCCGTGCCATGGGCATCCCCACGGTGATGGGGGGCGGTCGACCTGCCGTACTCCAAGGTCGACGGTATCGACCTGATCGTCGATGGCTACCACGGCGAGGTCTACACCAACCCCTCCGCCGAGCTGGT > SRR18135092.467339/1‑151 (MQ=60)
CTCGCACGTGGCGATCCTCGCCCGTGCCATGGGCATCCCCACGGTGATGGGGGGCGGTCGACCTGCCGTACTCCAAGGTCGACGGTATCGACCTGATCGTCGATGGCTACCACGGCGAGGTCTACACCAACCCCTCCGCCGAGCTGGTGCG < SRR18135092.9186618/151‑1 (MQ=60)
CTCGCACGTGGCGATCCTCGCCCGTGCCATGGGCATCCCCACGGTGATGGGGGGCGGTCGACCTGCCGTACTCCAAGGTCGACGGTATCGACCTGATCGTCGATGGCTACCACGGCGAGGTCTACACCAACCCCTCCGCCGAGCTGGTGCG > SRR18135092.7052263/1‑151 (MQ=60)
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ACGTGGCGATCCTCGCCCGTGCCATGGGCATCCCCACGGTGATGGGGGGCGGTCGACCTGCCGTACTCCAAGGTCGACGGTATCGACCTGATCGTCGATGGCTACCACGGCGAGGTCTACACCAACCCCTCCGCCGAGCTGGTGCGCCAGT < SRR18135092.5277238/151‑1 (MQ=60)
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CATCCCCACGGTGATGGGGGGCGGTCGACCTGCCGTACTCCAAGGTCGACGGTATCGACCTGATCGTCGATGGCTACCACGGCGAGGTCTACACCAACCCCTCCGCCGAGCTGGTGCGCCAGTACAGCGACGTGGTCGCCGAGGAGCGCGA < SRR18135092.6756103/151‑1 (MQ=60)
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atgGGGGGCGGTCGACCTGCCGTACTCCAAGGTCGACGGTATCGACCTGATCGTCGATGGCTACCACGGCGAGGTCTACACCAACCCCTCCGCCGAGCTGGTGCGCCAGTACAGCGACGTGGTCGCCGAGGAGCGCGAGCTGAGCAAGGGC > SRR18135092.5897140/4‑151 (MQ=60)
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G‑GGGGGCGGTCGACCTGCCGTACTCCAAGGTCGACGGTATCGACCTGATCGTCGATGGCTACCACGGCGAGGTCTACACCAACCCCTCCGCCGAGCTGGTGCGCCAGTACAGCGACGTGGTCGCCGAGGAGCGCGAGCTGAGCAAGGGCCT < SRR18135092.6451754/151‑1 (MQ=60)
GGGGCGGTCGACCTGCCGTACTCCAAGGTCGACGGTATCGACCTGATCGTCGATGGCTACCACGGCGAGGTCTACACCAACCCCTCCGCCGAGCTGGTGCGCCAGTACAGCGACGTGGTCGCCGAGGAGCGCGAGCTGAGCAAGGGCCTGG < SRR18135092.10779642/151‑1 (MQ=60)
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GGCGGTCGACCTGCCGTACTCCAAGGTCGACGGTATCGACCTGATCGTCGATGGCTACCACGGCGAGGTCTACACCAACCCCTCCGCCGAGCTGGTGCGCCAGTACAGCGACGTGGTCGCCGAGGAGCGCGAGCTGAGCAAGGGCCTGGCG < SRR18135092.4963272/151‑1 (MQ=60)
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CAGACCATCATCGTCAGCGAGGAGCTGTCGCCGGCGATGCTCGGCGAGGTGCCGGAAGGGCGCCTGGTCGGCCTGGTCTCGGTGCTCGGCTCGGGCAACTCGCACGTGGCGATCCTCGCCCGTGCCATGGGCATCCCCACGGTGAT‑GGGGGCGGTCGACCTGCCGTACTCCAAGGTCGACGGTATCGACCTGATCGTCGATGGCTACCACGGCGAGGTCTACACCAACCCCTCCGCCGAGCTGGTGCGCCAGTACAGCGACGTGGTCGCCGAGGAGCGCGAGCTGAGCAAGGGCCTGGCG > NC_008463/393754‑394053
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| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 0 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |