Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A4 F1 I1 R1
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255 |
512.9 |
22377240 |
99.2% |
22198222 |
150.0 |
Breseq alignment
N/A
GATK/CNVnator alignment
BRESEQ :: bam2aln output
Only 200 of 243 total aligned reads displayed.
GCGGTGATGCTGCCGAAAAGCGCCGCGCAATTGGTCGCGGTGATCGGCATCCTCCAGGCCGGCGCAGCCTATGTGCCGGTGGACATCCGCCAGCCGCCGCTGCGGCGCCAGGCGATCCTCGCCAGCCCCGAAGTGGTCGCCTGGGTCTGCCTGGAAAGCGATGTCCCGAACGCCGGCTGCGCCTGCGTGGCCATCGACCGGCTGGCCGCCGACAGCGCCTGGCCGCCACCGCCCGCGGCGGAGGTGGCGGCGGACGACCTCGCCTACGTGATCTACACCTCCGGCTCCACCGGC > NC_008463/791722‑792015
|
GCGGTGATGCTGCCGAAAAGCGCCGCGCAATTGGTCGCGGTGATCGGCATCCTCCAGGCCGGCGCAGCCTATGTGCCGGTGGACATCCGCCAGCCGCCGCTGCGGCGCCAGGCGATCCTCGCCAGCGCCGAAGTGGTCGCGCTGGTCTGCC > SRR18135092.9941354/1‑151 (MQ=60)
GCGGTGATGCTGCCGAAAAGCGCCGCGCAATTGGTCGCGGTGATCGGCATCCTCCAGGCCGGCGCAGCCTATGTGCCGGTGGACATCCGCCAGCCGCCGCTGCGGCGCCAGGCGATCCTCGCCAGCGCCGAAGTGGTCGCGCTGGTCTGCC > SRR18135092.488972/1‑151 (MQ=60)
GCGGTGATGCTGCCGAAAAGCGCCGCGCAATTGGTCGCGGTGATCGGCATCCTCCAGGCCGGCGCAGCCTATGTGCCGGTGGACATCCGCCAGCCGCCGCTGCGGCGCCAGGCGATCCTCGCCAGCGCCGAAGTGGTCGCGCTGGTCTGCC > SRR18135092.6673440/1‑151 (MQ=60)
CGGTGATGCTGCCGAAAAGCGCCGCGCAATTGGTCGCGGTGATCGGCATCCTCCAGGCCGGCGCAGCCTATGTGCCGGTGGACATCCGCCAGCCGCCGCTGCGGCGCCAGGCGATCCTCGCCAGCGCCGAAGTGGTCGCGCTGGTCTGCCT < SRR18135092.11050810/151‑1 (MQ=60)
CGGTGATGCTGCCGAAAAGCGCCGCGCAATTGGTCGCGGTGATCGGCATCCTCCAGGCCGGCGCAGCCTATGTGCCGGTGGACATCCGCCAGCCGCCGCTGCGGCGCCAGGCGATCCTCGCCAGCGCCGAAGTGGTCGCGCTGGTCTGCCT < SRR18135092.11050747/151‑1 (MQ=60)
CGGTGATGCTGCCGAAAAGCGCCGCGCAATTGGTCGCGGTGATCGGCATCCTCCAGGCCGGCGCAGCCTATGTGCCGGTGGACATCCGCCAGCCGCCGCTGCGGCGCCAGGCGATCCTCGCCAGCGCCGAAGTGGTCGCGCTGGTCTGCCT > SRR18135092.10156912/1‑151 (MQ=60)
GGTGATGCTGCCGAAAAGCGCCGCGCAATTGGTCGCGGTGATCGGCATCCTCCAGGCCGGCGCAGCCTATGTGCCGGTGGACATCCGCCAGCCGCCGCTGCGGCGCCAGGCGATCCTCGCCAGCGCCGAAGTGGTCGCGCTGGTCTGCCTG > SRR18135092.10320513/1‑151 (MQ=60)
GGTGATGCTGCCGAAAAGCGCCGCGCAATTGGTCGCGGTGATCGGCATCCTCCAGGCCGGCGCAGCCTATGTGCCGGTGGACATCCGCCAGCCGCCGCTGCGGCGCCAGGCGATCCTCGCCAGCGCCGAAGTGGTCGCGCTGGTCTGCCTG > SRR18135092.8391767/1‑151 (MQ=60)
GTGATGCTGCCGAAAAGCGCCGCGCAATTGGTCGCGGTGATCGGCATCCTCCAGGCCGGCGCAGCCTATGTGCCGGTGGACATCCGCCAGCCGCCGCTGCGGCGCCAGGCGATCCTCGCCAGCGCCGAAGTGGTCGCGCTGGTCTGCCTGG > SRR18135092.9481592/1‑151 (MQ=60)
GTGATGCTGCCGAAAAGCGCCGCGCAATTGGTCGCGGTGATCGGCATCCTCCAGGCCGGCGCAGCCTATGTGCCGGTGGACATCCGCCAGCCGCCGCTGCGGCGCCAGGCGATCCTCGCCAGCGCCGAAGTGGTCGCGCTGGTCTGCCTGG > SRR18135092.9359135/1‑151 (MQ=60)
TGATGCTGCCGAAAAGCGCCGCGCAATTGGTCGCGGTGATCGGCATCCTCCAGGCCGGCGCAGCCTATGTGCCGGTGGACATCCGCCAGCCGCCGCTGCGGCGCCAGGCGATCCTCGCCAGCGCCGAAGTGGTCGCGCTGGTCTGCCTGGA > SRR18135092.9906232/1‑151 (MQ=60)
TGATGCTGCCGAAAAGCGCCGCGCAATTGGTCGCGGTGATCGGCATCCTCCAGGCCGGCGCAGCCTATGTGCCGGTGGACATCCGCCAGCCGCCGCTGCGGCGCCAGGCGATCCTCGCCAGCGCCGAAGTGGTCGCGCTGGTCTGCCTGGA > SRR18135092.5122024/1‑151 (MQ=60)
TGATGCTGCCGAAAAGCGCCGCGCAATTGGTCGCGGTGATCGGCATCCTCCAGGCCGGCGCAGCCTATGTGCCGGTGGACATCCGCCAGCCGCCGCTGCGGCGCCAGGCGATCCTCGCCAGCGCCGAAGTGGTCGCGCTGGTCTGCCTGGA > SRR18135092.1720921/1‑151 (MQ=60)
TGATGCTGCCGAAAAGCGCCGCGCAATTGGTCGCGGTGATCGGCATCCTCCAGGCCGGCGCAGCCTATGTGCCGGTGGACATCCGCCAGCCGCCGCTGCGGCGCCAGGCGATCCTCGCCAGCGCCGAAGTGGTCGCGCTGGTCTGCCTGGA > SRR18135092.8938007/1‑151 (MQ=60)
GATGCTGCCGAAAAGCGCCGCGCAATTGGTCGCGGTGATCGGCATCCTCCAGGCCGGCGCAGCCTATGTGCCGGTGGACATCCGCCAGCCGCCGCTGCGGCGCCAGGCGATCCTCGCCAGCGCCGAAGTGGTCGCGCTGGTCTGCCTGGAA < SRR18135092.11020295/151‑1 (MQ=60)
ATGCTGCCGAAAAGCGCCGCGCAATTGGTCGCGGTGATCGGCATCCTCCAGGCCGGCGCAGCCTATGTGCCGGTGGACATCCGCCAGCCGCCGCTGCGGCGCCAGGCGATCCTCGCCAGCGCCGAAGTGGTCGCGCTGGTCTGCCTGGAAA > SRR18135092.4429492/1‑151 (MQ=60)
TGCTGCCGAAAAGCGCCGCGCAATTGGTCGCGGTGATCGGCATCCTCCAGGCCGGCGCAGCCTATGTGCCGGTGGACATCCGCCAGCCGCCGCTGCGGCGCCAGGCGATCCTCGCCAGCGCCGAAGTGGTCGCGCTGGTCTGCCTGGAAAG > SRR18135092.6157713/1‑151 (MQ=60)
AGCTGCCGAAAAGCGCCGCGCAAGTGGTCGCGGTGATCGGCATCCTCCAGGCCGGCGCAGCCTATGTGCCGGTGGTCAACCGCCAGCCGCCGCTGCGGCGCCAGGCGATCCTCGCCAGCGCCGAAGTGGTCGCGCTGGTCTGCCTGGAAAG < SRR18135092.7314606/151‑1 (MQ=60)
GCTGCCGTAAAGCGCCGCGCAATTGGTCGCGGTGATCGGCATCCTCCAGGCCGGCGCAGCCTATGTGCCGGTGGACATCCGCCAGCCGCCGCTGCGGCGCCAGGCGATCCTCGCCAGCGCCGAAGTGGTCGCGCTGGTCTGCCTGGAAAGC > SRR18135092.10111996/1‑151 (MQ=60)
CTGCCGAAAAGCGCCGCGCAATTGGTCGCGGTGATCGGCATCCTCCAGGCCGGCGCAGCCTATGTGCCGGTGGACATCCGCCAGCCGCCGCTGCGGCGCCAGGCGATCCTCGCCAGCGCCGAAGTGGTCGCGCTGGTCTGCCTGGAAAGCG < SRR18135092.6053994/151‑1 (MQ=60)
CTGCCGAAAAGCGCCGCGCAATTGGTCGCGGTGATCGGCATCCTCCAGGCCGGCGCAGCCTATGTGCCGGTGGACATCCGCCAGCCGCCGCTGCGGCGCCAGGCGATCCTCGCCAGCGCCGAAGTGGTCGCGCTGGTCTGCCTGGAAAGCG > SRR18135092.7594209/1‑151 (MQ=60)
TGCCGAAAAGCGCCGCGCAATTGGTCGCGGTGATCGGCATCCTCCAGGCCGGCGCAGCCTATGTGCCGGTGGACATCCGCCAGCCGCCGCTGCGGCGCCAGGCGATCCTCGCCAGCGCCGAAGTGGTCGCGCTGGTCTGCCTGGAAAGCGA < SRR18135092.6924275/151‑1 (MQ=60)
GCCGAAAAGCGCCGCGCAATTGGTCGCGGTGATCGGCATCCTCCAGGCCGGCGCAGCCTATGTGCCGGTGGACATCCGCCAGCCGCCGCTGCGGCGCCAGGCGATCCTCGCCAGCGCCGAAGTGGTCGCGCTGGTCTGCCTGGAAAGCGAT > SRR18135092.7984658/1‑151 (MQ=60)
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CGAAAAGCGCCGCGCAATTGGTCGCGGTGATCGGCATCCTCCAGGCCGGCGCAGCCTATGTGCCGGTGGACATCCGCCAGCCGCCGCTGCGGCGCCAGGCGATCCTCGCCAGCGCCGAAGTGGTCGCGCTGGTCTGCCTGGAAAGCGATGT > SRR18135092.6619694/1‑151 (MQ=60)
CGAAAAGCGCCGCGCAATTGGTCGCGGTGATCGGCATCCTCCAGGCCGGCGCAGCCTATGTGCCGGTGGACATCCGCCAGCCGCCGCTGCGGCGCCAGGCGATCCTCGCCAGCGCCGAAGTGGTCGCGCTGGTCTGCCTGGAAAGCGATGT > SRR18135092.6679341/1‑151 (MQ=60)
CGAAAAGCGCCGCGCAATTGGTCGCGGTGATCGGCATCCTCCAGGCCGGCGCAGCCTATGTGCCGGTGGACATCCGCCAGCCGCCGCTGCGGCGCCAGGCGATCCTCGCCAGCGCCGAAGTGGTCGCGCTGGTCTGCCTGGAAAGCGATGT > SRR18135092.6617944/1‑151 (MQ=60)
GAAAAGCGCCGCGCAATTGGTCGCGGTGATCGGCATCCTCCAGGCCGGCGCAGCCTATGTGCCGGTGGACATCCGCCAGCCGCCGCTGCGGCGCCAGGCGATCCTCGCCAGCGCCGAAGTGGTCGCGCTGGTCTGCCTGGAAAGCGATGTC < SRR18135092.8262628/151‑1 (MQ=60)
GAAAAGCGCCGCGCAATTGGTCGCGGTGATCGGCATCCTCCAGGCCGGCGCAGCCAATGTGCCGGTGGACATCCGCCAGCCGCCGCAGCGGCGCCAGGCGATCCTCGCCAGCGCCGAAGTGGTCGCGCTGGTCTGCCTGGAAAGCGATGTC < SRR18135092.7627438/151‑1 (MQ=60)
AAAAGCGCCGCGCAATTGGTCGCGGTGATCGGCATCCTCCAGGCCGGCGCAGCCTATGTGCCGGTGGACATCCGCCAGCCGCCGCTGCGGCGCCAGGCGATCCTCGCCAGCGCCGAAGTGGTCGCGCTGGTCTGCCTGGAAAGCGATGTCC > SRR18135092.10823515/1‑151 (MQ=60)
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AAGCGCCGCGCAATTGGTCGCGGTGATCGGCATCCTCCAGGCCGGCGCAGCCTATGTGCCGGTGGACATCCGCCAGCCGCCGCTGCGGCGCCAGGCGATCCTCGCCAGCGCCGAAGTGGTCGCGCTGGTCTGCCTGGAAAGCGATGTCCCG > SRR18135092.4345200/1‑151 (MQ=60)
AGCGCCGCGCAATTGGTCGCGGTGATCGGCATCCTCCAGGCCGGCGCAGCCTATGTGCCGGTGGACATCCGCCAGCCGCCGCTGCGGCGCCAGGCGATCCTCGCCAGCGCCGAAGTGGTCGCGCTGGTCTGCCTGGAAAGCGATGTCCCGG > SRR18135092.7788077/1‑151 (MQ=60)
GCGCCGCGCAATTGGTCGCGGTGATCGGCATCCTCCAGGCCGGCGCAGCCTATGTGCCGGTGGACATCCGCCAGCCGCCGCTGCGGCGCCAGGCGATCCTCGCCAGCGCCGAAGTGGTCGCGCTGGTCTGCCTGGAAAGCGATGTCCCGGA > SRR18135092.3913801/1‑151 (MQ=60)
CGCCGCGCAATTGGTCGCGGTGATCGGCATCCTCCAGGCCGGCGCAGCCTATGTGCCGGTGGACATCCGCCAGCCGCCGCTGCGGCGCCAGGCGATCCTCGCCAGCGCCGAAGTGGTCGCGCTGGTCTGCCTGGAAAGCGATGTCCCGGAC > SRR18135092.2015206/1‑151 (MQ=60)
GCCGCGCACTTGGTCGCGGTGATCGGCATCCTCCAGGCCGGCGCAGCCTATGTGCCGGTGGACATCCGCCAGCCGCCGCTGCGGCGCCAGGCGATCCTCGCCAGCGCCGAAGTGGTCGCGCTGGTCTGCCTGGAAAGCGATGTCCCGGACG > SRR18135092.275449/1‑151 (MQ=60)
GCCGCGCAATTGGTCGCGGTGATCGGCATCCTCCAGGCCGGCGCAGCCTATGTGCCGGTGGACATCCGCCAGCCGCCGCTGCGGCGCCAGGCGATCCTCGCCAGCGCCGAAGTGGTCGCGCTGGTCTGCCTGGAAAGCGATGTCCCGGACG > SRR18135092.255919/1‑151 (MQ=60)
GCCGCGCAATTGGTCGCGGTGATCGGCATCCTCCAGGCCGGCGCAGCCTATGTGCCGGTGGACATCCGCCAGCCGCCGCTGCGGCGCCAGGCGATCCTCGCCAGCGCCGAAGTGGTCGCGCTGGTCTGCCTGGAAAGCGATGTCCCGGACG > SRR18135092.10637841/1‑151 (MQ=60)
CCGCGCAATTGGTCGCGGTGATCGGCATCCTCCAGGCCGGCGCAGCCTATGTGCCGGTGGACATCCGCCAGCCGCCGCTGCGGCGCCAGGCGATCCTCGCCAGCGCCGAAGTGGTCGCGCTGGTCTGCCTGGAAAGCGATGTCCCGGACGC > SRR18135092.9632544/1‑151 (MQ=60)
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CGCGCAATTGGTCGCGGTGATCGGCATCCTCCAGGCCGGCGCAGCCTATGTGCCGGTGGACATCCGCCAGCCGCCGCTGCGGCGCCAGGCGATCCTCGCCAGCGCCGAAGTGGTCGCGCTGGTCTGCCTGGAAAGCGATGTCCCGGACGCC < SRR18135092.7099764/151‑1 (MQ=60)
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CGCGCAATTGGTCGCGGTGATCGGCATCCTCCAGGCCGGCGCAGCCTATGTGCCGGTGGACATCCGCCAGCCGCCGCTGCGGCGCCAGGCGATCCTCGCCAGCGCCGAAGTGGTCGCGCTGGTCTGCCTGGAAAGCGATGTCCCGGACGCC > SRR18135092.1655280/1‑151 (MQ=60)
CGCGCAATTGGTCGCGGTGATCGGCATCCTCCAGGCCGGCGCAGCCTATGTGCCGGTGGACATCCGCCAGCCGCCGCTGCGGCGCCAGGCGATCCTCGCCAGCGCCGAAGTGGTCGCGCTGGTCTGCCTGGAAAGCGATGTCCCGGACGCC < SRR18135092.7765820/151‑1 (MQ=60)
GCGCAATTGGTCGCGGTGATCGGCATCCTCCAGGCCGGCGCAGCCTATGTGCCGGTGGACATCCGCCAGCCGCCGCTGCGGCGCCAGGCGATCCTCGCCAGCGCCGAAGTGGTCGCGCTGGTCTGCCTGGAAAGCGATGTCCCGGACGCCG < SRR18135092.10752365/151‑1 (MQ=60)
GCGCAATTGGTCGCGGTGATCGGCATCCTCCAGGCCGGCGCAGCCTATGTGCCGGTGGACATCCGCCAGCCGCCGCTGCGGCGCCAGGCGATCCTCGCCAGCGCCGAAGTGGTCGCGCTGGTCTGCCTGGAAAGCGATGTCCCGGACGCCG < SRR18135092.7105566/151‑1 (MQ=60)
CGCAATTGGTCGCGGTGATCGGCATCCTCCAGGCCGGCGCAGCCTATGTGCCGGTGGACATCCGCCAGCCGCCGCTGCGGCGCCAGGCGATCCTCGCCAGCGCCGAAGTGGTCGCGCTGGTCTGCCTGGAAAGCGATGTCCCGGACGCCGG > SRR18135092.721452/1‑151 (MQ=60)
GCAATTGGTCGCGGTGATCGGCATCCTCCAGGCCGGCGCAGCCTATGTGCCGGTGGACATCCGCCAGCCGCCGCTGCGGCGCCAGGCGATCCTCGCCCGCGCCGAAGTGGTCGCGCTGGTCTGCCTGGAAAGCGATGTCCCGGACGCCGGC > SRR18135092.4808991/1‑151 (MQ=60)
GCAATTGGTCGCGGTGATCGGCATCCTCCAGGCCGGCGCAGCCTATGTGCCGGTGGACATCCGCCAGCCGCCGCTGCGGCGCCAGGCGATCCTCGCCAGCGCCGAAGTGGTCGCGCTGGTCTGCCTGGAAAGCGATGTCCCGGACGCCGGC > SRR18135092.4809255/1‑151 (MQ=60)
CAATTGGTCGCGGTGATCGGCATCCTCCAGGCCGGCGCAGCCTATGTGCCGGTGGACATCCGCCAGCCGCCGCTGCGGCGCCAGGCGATCCTCGCCAGCGCCGAAGTGGTCGCGCTGGTCTGCCTGGAAAGCGATGTCCCGGACGCCGGCT < SRR18135092.7730115/151‑1 (MQ=60)
AATTGGTCGCGGTGATCGGCATCCTCCAGGCCGGCGCAGCCTATGTGCCGGTGGACATCCGCCAGCCGCCGCTGCGGCGCCAGGCGATCCTCGCCAGCGCCGAAGTGGTCGCGCTGGTCTGCCTGGAAAGCGATGTCCCGGACGCCGGCTG > SRR18135092.1753098/1‑151 (MQ=60)
AATTGGTCGCGGTGATCGGCATCCTCCAGGCCGGCGCAGCCTATGTGCCGGTGGACATCCGCCAGCCGCCGCTGCGGCGCCAGGCGATCCTCGCCAGCGCCGAAGTGGTCGCGCTGGTCTGCCTGGAAAGCGATGTCCCGGACGCCGGCTG > SRR18135092.9682745/1‑151 (MQ=60)
ATTGGTCGCGGTGATCGGCATCCTCCAGGCCGGCGCAGCCTATGTGCCGGTGGACATCCGCCAGCCGCCGCTGCGGCGCCAGGCGATCCTCGCCAGCGCCGAAGTGGTCGCGCTGGTCTGCCTGGAAAGCGATGTCCCGGACGCCGGCTGC > SRR18135092.2317671/1‑151 (MQ=60)
TTGGTCGCGGTGATCGGCATCCTCCAGGCCGGCGCAGCCTATGTGCCGGTGGACATCCGCCAGCCGCCGCTGCGGCGCCAGGCGATCCTCGCCAGCGCCGAAGTGGTCGCGCTGGTCTGCCTGGAAAGCGATGTCCCGGACGCCGGCTGCG < SRR18135092.8079908/151‑1 (MQ=60)
GGTCGCGGTGATCGGCATCCTCCAGGCCGGCGCAGCCTATGTGCCGGTGGACATCCGCCAGCCGCCGCTGCGGCGCCAGGCGATCCTCGCCAGCGCCGAAGTGGTCGCGCTGGTCTGCCTGGAAAGCGATGTCCCGGACGCCGGCTGCGCC < SRR18135092.3509453/151‑1 (MQ=60)
GTCGCGGTGATCGGCATCCTCCAGGCCGGCGCAGCCTATGTGCCGGTGGACATCCGCCAGCCGCCGCTGCGGCGCCAGGCGATCCTCGCCAGCGCCGAAGTGGTCGCGCTGGTCTGCCTGGAAAGCGATGTCCCGGACGCCGGCTGCGCCT > SRR18135092.10434899/1‑151 (MQ=60)
GTCGCGGTGATCGGCATCCTCCAGGCCGGCGCAGCCTATGTGCCGGTGGACATCCGCCAGCCGCCGCTGCGGCGCCAGGCGATCCTCGCCAGCGCCGAAGTGGTCGCGCTGGTCTGCCTGGAAAGCGATGTCCCGGACGCCGGCTGCGCCT < SRR18135092.1003886/151‑1 (MQ=60)
TCGCGGTGATCGGCATCCTCCAGGCCGGCGCAGCCTATGTGCCGGTGGACATCCGCCAGCCGCCGCTGCGGCGCCAGGCGATCCTCGCCAGCGCCGAAGTGGTCGCGCTGGTCTGCCTGGAAAGCGATGTCCCGGACGCCGGCTGCGCCTG < SRR18135092.8737764/151‑1 (MQ=60)
CGCGGTGATCGGCATCCTCCAGGCCGGCGCAGCCTATGTGCCGGTGGACATCCGCCAGCCGCCGCTGCGGCGCCAGGCGATCCTCGCCAGCGCCGAAGTGGTCGCGCTGGTCTGCCTGGAAAGCGATGTCCCGGACGCCGGCTGCGCCTGC < SRR18135092.1201208/151‑1 (MQ=60)
CGCGGTGATCGGCATCCTCCAGGCCGGCGCAGCCTATGTGCCGGTGGACATCCGCCAGCCGCCGCTGCGGCGCCAGGCGATCCTCGCCAGCGCCGAAGTGGTCGCGCTGGTCTGCCTGGAAAGCGATGTCCCGGACGCCGGCTGCGCCTGC < SRR18135092.1202977/151‑1 (MQ=60)
GCGGTGATCGGCATCCTCCAGGCCGGCGCAGCCTATGTGCCGGTGGACATCCGCCAGCCGCCGCTGCGGCGCCAGGCGATCCTCGCCAGCGCCGAAGTGGTCGCGCTGGTCTGCCTGGAAAGCGATGTCCCGGACGCCGGCTGCGCCTGCG > SRR18135092.9354847/1‑151 (MQ=60)
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GCGGTGATCGGCATCCTCCAGGCCGGCGCAGCCTATGTGCCGGTGGACATCCGCCAGCCGCCGCTGCGGCGCCAGGCGATCCTCGCCAGCGCCGAAGTGGTCGCGCTGGTCTGCCTGGAAAGCGATGTCCCGGACGCCGGCTGCGCCTGCG < SRR18135092.917023/151‑1 (MQ=60)
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GCGGTGATCGGCATCCTCCAGGCCGGCGCAGCCTATGTGCCGGTGGACATCCGCCAGCCGCCGCTGCGGCGCCAGGCGATCCTCGCCAGCGCCGAAGTGGTCGCGCTGGTCTGCCTGGAAAGCGATGTCCCGGACGCCGGCTGCGCCTGCG < SRR18135092.911966/151‑1 (MQ=60)
CGGTGATCGGCATCCTCCAGGCCGGCGCAGCCTATGTGCCGGTGGACATCCGCCAGCCGCCGCTGCGGCGCCAGGCGATCCTCGCCAGCGCCGAAGTGGTCGCGCTGGTCTGCCTGGAAAGCGATGTCCCGGACGCCGGCTGCGCCTGCGT < SRR18135092.10494749/151‑1 (MQ=60)
GATCGGCATCCTCCAGGCCGGCGCAGCCTATGTGCCGGTGGACATCCGCCAGCCGCCGCTGCGGCGCCAGGCGATCCTCGCCAGCGCCGAAGTGGTCGCGCTGGTCTGCCTGGAAAGCGATGTCCCGGACGCCGGCTGCGCCTGCGTGGCC > SRR18135092.6194746/1‑151 (MQ=60)
ATCGGCATCCTCCAGGCCGGCGCAGCCTATGTGCCGGTGGACATCCGCCAGCCGCCGCTGCGGCGCCAGGCGATCCTCGCCAGCGCCGAAGTGGTCGCGCTGGTCTGCCTGGAAAGCGATGTCCCGGACGCCGGCTGCGCCTGCGTGGCCA > SRR18135092.5130094/1‑151 (MQ=60)
ATCGGCATCCTCCAGGCCGGCGCAGCCTATGTGCCGGTGGACATCCGCCAGCCGCCGCTGCGGCGCCAGGCGATCCTCGCCAGCGCCGAAGTGGTCGCGCTGGTCTGCCTGGAAAGCGATGTCCCGGACGCCGGCTGCGCCTGCGTGGCCA < SRR18135092.4898231/151‑1 (MQ=60)
ATCGGCATCCTCCAGGCCGGCGCAGCCTATGTGCCGGTGGACATCCGCCAGCCGCCGCTGCGGCGCCAGGCGATCCTCGCCAGCGCCGAAGTGGTCGCGCTGGTCTGCCTGGAAAGCGATGTCCCGGACGCCGGCTGCGCCTGCGTGGCCA < SRR18135092.6485514/151‑1 (MQ=60)
CGGCATCCTCCAGGCCGGCGCAGCCTATGTGCCGGTGGACATCCGCCAGCCGCCGCTGCGGCGCCAGGCGATCCTCGCCAGCGCCGAAGTGGTCGCGCTGGTCTGCCTGGAAAGCGATGTCCCGGACGCCGGCTGCGCCTGCGTGGCCATC > SRR18135092.427741/1‑151 (MQ=60)
CGGCATCCTCCAGGCCGGCGCAGCCTATGTGCCGGTGGACATCCGCCAGCCGCCGCTGCGGCGCCAGGCGATCCTCGCCAGCGCCGAAGTGGTCGCGCTGGTCTGCCTGGAAAGCGATGTCCCGGACGCCGGCTGCGCCTGCGTGGCCATC < SRR18135092.3317008/151‑1 (MQ=60)
GCATCCTCCAGGCCGGCGCAGCCTATGTGCCGGTGGACATCCGCCAGCCGCCGCTGCGGCGCCAGGCGATCCTCGCCAGCGCCGAAGTGGTCGCGCTGGTCTGCCTGGAAAGCGATGTCCCGGACGCCGGCTGCGCCTGCGTGGCCATCGA > SRR18135092.5757496/1‑151 (MQ=60)
GCATCCTCCAGGCCGGCGCAGCCTATGTGCCGGTGGACATCCGCCAGCCGCCGCTGCGGCGCCAGGCGATCCTCGCCAGCGCCGAAGTGGTCGCGCTGGTCTGCCTGGAAAGCGATGTCCCGGACGCCGGCTGCGCCTGCGTGGCCATCGA > SRR18135092.4019074/1‑151 (MQ=60)
GCATCCTCCAGGCCGGCGCAGCCTATGTGCCGGTGGACATCCGCCAGCCGCCGCTGCGGCGCCAGGCGATCCTCGCCAGCGCCGAAGTGGTCGCGCTGGTCTGCCTGGAAAGCGATGTCCCGGACGCCGGCTGCGCCTGCGTGGCCATCGA > SRR18135092.5145173/1‑151 (MQ=60)
CATCCTCCAGGCCGGCGCAGCCTATGTGCCGGTGGACATCCGCCAGCCGCCGCTGCGGCGCCAGGCGATCCTCGCCAGCGCCGAAGTGGTCGCGCTGGTCTGCCTGGAAAGCGATGTCCCGGACGCCGGCTGCGCCTGCGTGGCCATCGAC < SRR18135092.9947851/151‑1 (MQ=60)
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GCCAGGCGATCCTCGCCAGCGCCGAAGTGGTCGCGCTGGTCTGCCTGGAAAGCGATGTCCCGGACGCCGGCTGCGCCTGCGTGGCCATCGACCGGCTGGCCGCCGACAGCGCCTGGCCGCCACCGCCCGCGGCGGAGGTGGCGGCGGACGA > SRR18135092.9534485/1‑151 (MQ=60)
CCAGGCGATCCTCGCCAGCGCCGAAGTGGTCGCGCTGGTCTGCCTGGAAAGCGATGTCCCGGACGCCGGCTGCGCCTGCGTGGCCATCGACCGGCTGGCCGCCGACAGCGCCTGGCCGCCACCGCCCGCGGCGGAGGTGGCGGCGGACGAC > SRR18135092.11051573/1‑151 (MQ=60)
AGGCTATCCACGCCAGCGCCGAAGTTGTCGCGCTGGTCTGCCGGGAAAGCGATGTCCCGGACGCCGGCTGCGCCTTCGTGGCCATCGACCGGCTGGCCGCCGACAGCGCCTGGCCGCCACCGCCCGCGGCGGAGGTGTCGGCGGACGACCT < SRR18135092.7741281/151‑1 (MQ=60)
GGCGATCCTCGCCAGCGCCGAAGTGGTCGCGCTGGTCTGCCTGGAAAGCGATGTCCCGGACGCCGGCTGCGCCTGCGTGGCCATCGACCGGCTGGCCGCCGACAGCGCCTGGCCGCCACCGCCCGCGGCGGAGGTGGCGGCGGACGACCTC < SRR18135092.8563524/151‑1 (MQ=60)
GATCCTCGCCAGCGCCGAAGTGGTCGCGCTGGTCTGCCTGGAAAGCGATGTCCCGGACGCCGGCTGCGCCTGCGTGGCCATCGACCGGCTGGCCGCCGACAGCGCCTGGCCGCCACCGCCCGCGGCGGAGGTGGCGGCGGACGACCTCGCC > SRR18135092.2668226/1‑151 (MQ=60)
CCTCGCCAGCGCCGAAGTGGTCGCGCTGGTCTGCCTGGAAAGCGATGTCCCGGACGCCGGCTGCGCCTGCGTGGCCATCGACCGGCTGGCCGCCGACAGCGCCTGGCCGCCACCGCCCGCGGCGGAGGTGGCGGCGGACGACCTCGCCTAC > SRR18135092.9561423/1‑151 (MQ=60)
CTCGCCAGCGCCGAAGTGGTCGCGCTGGTCTGCCTGGAAAGCGATGTCCCGGACGCCGGCTGCGCCTGCGTGGCCATCGACCGGCTGGCCGCCGACAGCGCCTGGCCGCCACCGCCCGCGGCGGAGGTGGCGGCGGACGACCTCGCCTACG > SRR18135092.4475129/1‑151 (MQ=60)
TCGCCAGCGCCGAAGTGGTCGCGCTGGTCTGCCTGGAAAGCGATGTCCCGGACGCCGGCTGCGCCTGCGTGGCCATCGACCGGCTGGCCGCCGACAGCGCCTGGCCGCCACCGCCCGCGGCGGAGGTGGCGGCGGACGACCTCGCCTACGT > SRR18135092.4720362/1‑151 (MQ=60)
CGCCAGCGCCGAAGTGGTCGCGCTGGTCTGCCTGGAAAGCGATGTCCCGGACGCCGGCTGCGCCTGCGTGGCCATCGACCGGCTGGCCGCCGACAGCGCCTGGCCGCCACCGCCCGCGGCGGAGGTGGCGGCGGACGACCTCGCCTACGTG < SRR18135092.530255/151‑1 (MQ=60)
CGCCAGCGCCGAAGTGGTCGCGCTGGTCTGCCTGGAAAGCGATGTCCCGGACGCCGGCTGCGCCTGCGTGGCCATCGACCGGCTGGCCGCCGACAGCGCCTGGCCGCCACCGCCCGCGGCGGAGGTGGCGGCGGACGACCTCGCCTACGTG > SRR18135092.10591262/1‑151 (MQ=60)
GCCAGCGCCGAAGTGGTCGCGCTGGTCTGCCTGGAAAGCGATGTCCCGGACGCCGGCTGCGCCTGCGTGGCCATCGACCGGCTGGCCGCCGACAGCGCCTGGCCGCCACCGCCCGCGGCGGAGGTGGCGGCGGACGACCTCGCCTACGTGA > SRR18135092.9843799/1‑151 (MQ=60)
GCCAGCGCCGAAGTGGTCGCGCTGGTCTGCCTGGAAAGCGATGTCCCGGACGCCGGCTGCGCCTGCGTGGCCATCGACCGGCTGGCCGCCGACAGCGCCTGGCCGCCACCGCCCGCGGCGGAGGTGGCGGCGGACGACCTCGCCTACGTGA > SRR18135092.9210934/1‑151 (MQ=60)
CAGCGCCGAAGTGGTCGCGCTGGTCTGCCTGGAAAGCGATGTCCCGGACGCCGGCTGCGCCTGCGTGGCCATCGACCGGCTGGCCGCCGACAGCGCCTGGCCGCCACCGCCCGCGGCGGAGGTGGCGGCGGACGACCTCGCCTACGTGATC < SRR18135092.1098582/151‑1 (MQ=60)
AGCGCCGAAGTGGTCGCGCTGGTCTGCCTGGAAAGCGATGTCCCGGACGCCGGCTGCGCCTGCGTGGCCATCGACCGGCTGGCCGCCGACAGCGCCTGGCCGCCACCGCCCGCGGCGGAGGTGGCGGCGGACGACCTCGCCTACGTGATCT > SRR18135092.841154/1‑151 (MQ=60)
AGCGCCGAAGTGGTCGCGCTGGTCTGCCTGGAAAGCGATGTCCCGGACGCCGGCTGCGCCTGCGTGGCCATCGACCGGCTGGCCGCCGACAGCGCCTGGCCGCCACCGCCCGCGGCGGAGGTGGCGGCGGACGACCTCGCCTACGTGATCT > SRR18135092.7723262/1‑151 (MQ=60)
GCGCCGAAGTGGTCGCGCTGGTCTGCCTGGAAAGCGATGTCCCGGACGCCGGCTGCGCCTGCGTGGCCATCGACCGGCTGGCCGCCGACAGCGCCTGGCCGCCACCGCCCGCGGCGGAGGTGGCGGCGGACGACCTCGCCTACGTGATCTA < SRR18135092.4539749/151‑1 (MQ=60)
CGCCGAAGTGGTCGCGCTGGTCTGCCTGGAAAGCGATGTCCCGGACGCCGGCTGCGCCTGCGTGGCCATCGTCCGGCTGGCCGCCGACAGCGCCTGGCCGCCACCGCCCGCGGCGGAGGTGGCGGCGGACGACCTCGCCTACGTGATCTAC > SRR18135092.5558792/1‑151 (MQ=60)
CGCCGAAGTGGTCGCGCTGGTCTGCCTGGAAAGCGATGTCCCGGACGCCGGCTGCGCCTGCGTGGCCATCGACCGGCTGGCCGCCGACAGCGCCTGGCCGCCACCGCCCGCGGCGGAGGTGGCGGCGGACGACCTCGCCTACGTGATCTAC < SRR18135092.501858/151‑1 (MQ=60)
CGCCGAAGTGGTCGCGCTGGTCTGCCTGGAAAGCGATGTCCCGGACGCCGGCTGCGCCTGCGTGGCCATCGACCGGCTGGCCGCCGACAGCGCCTGGCCGCCACCGCCCGCGGCGGAGGTGGCGGCGGACGACCTCGCCTACGTGATCTAC > SRR18135092.426889/1‑151 (MQ=60)
CCGAAGTGGTCGCGCTGGTCTGCCTGGAAAGCGATGTCCCGGACGCCGGCTGCGCCTGCGTGGCCATCGACCGGCTGGCCGCCGACAGCGCCTGGCCGCCACCGCCCGCGGCGGAGGTGGCGGCGGACGACCTCGCCTACGTGATCTACAC < SRR18135092.9093095/151‑1 (MQ=60)
CCGAAGTGGTCGCGCTGGTCTGCCTGGAAAGCGATGTCCCGGACGCCGGCTGCGCCTGCGTGGCCATCGACCGGCTGGCCGCCGACAGCGCCTGGCCGCCACCGCCCGCGGCGGAGGTGGCGGCGGACGACCTCGCCTACGTGATCTACAC < SRR18135092.2816711/151‑1 (MQ=60)
CGAAGTGGTCGCGCTGGTCTGCCTGGAAAGCGATGTCCCGGACGCCGGCTGCGCCTGCGTGGCCATCGACCGGCTGGCCGCCGACAGCGCCTGGCCGCCACCGCCCGCGGCGGAGGTGGCGGCGGACGACCTCGCCTACGTGATCTACACC > SRR18135092.7882054/1‑151 (MQ=60)
GAAGTGGTCGCGCTGGTCTGCCTGGAAAGCGATGTCCCGGACGCCGGCTGCGCCTGCGTGGCCATCGACCGGCTGGCCGCCGACAGCGCCTGGCCGCCACCGCCCGCGGCGGAGGTGGCGGCGGACGACCTCGCCTACGTGATCTACACCT > SRR18135092.10179807/1‑151 (MQ=60)
GAAGTGGTCGCGCTGGTCTGCCTGGAAAGCGATGTCCCGGACGCCGGCTGCGCCTGCGTGGCCATCGACCGGCTGGCCGCCGACAGCGCCTGGCCGCCACCGCCCGCGGCGGAGGTGGCGGCGGACGACCTCGCCTACGTGATCTACACCT > SRR18135092.249206/1‑151 (MQ=60)
GTGGTCGCGCTGGTCTGCCTGGAAAGCGATGTCCCGGACGCCGGCTGCGCCTGCGTGGCCATCGACCGGCTGGCCGCCGACAGCGCCTGGCCGCCACCGCCCGCGGCGGAGGTGGCGGCGGACGACCTCGCCTACGTGATCTACACCTCCG < SRR18135092.7089691/151‑1 (MQ=60)
GTGGTCGCGCTGGTCTGCCTGGAAAGCGATGTCCCGGACGCCGGCTGCGCCTGCGTGGCCATCGACCGGCTGGCCGCCGACAGCGCCTGGCCGCCACCGCCCGCGGCGGAGGTGGCGGCGGACGACCTCGCCTACGTGATCTACACCTCCG > SRR18135092.1866147/1‑151 (MQ=60)
GTGGTCGCGCTGGTCTGCCTGGAAAGCGATGTCCCGGACGCCGGCTGCGCCTGCGTGGCCATCGACCGGCTGGCCGCCGACAGCGCCTGGCCGCCACCGCCCGCGGCGGAGGTGGCGGCGGACGACCTCGCCTACGTGATCTACACCTCCG < SRR18135092.1691340/151‑1 (MQ=60)
GTGGTCGCGCTGGTCTGCCTGGAAAGCGATGTCCCGGACGCCGGCTGCGCCTGCGTGGCCATCGACCGGCTGGCCGCCGACAGCGCCTGGCCGCCACCGCCCGCGGCGGAGGTGGCGGCGGACGACCTCGCCTACGTGATCTACACCTCCG > SRR18135092.8531318/1‑151 (MQ=60)
GTGGTCGCGCTGGTCTGCCTGGAAAGCGATGTCCCGGACGCCGGCTGCGCCTGCGTGGCCATCGACCGGCTGGCCGCCGACAGCGCCTGGCCGCCACCGCCCGCGGCGGAGGTGGCGGCGGACGACCTCGCCTACGTGATCTACACCTCCG < SRR18135092.8169355/151‑1 (MQ=60)
tggtcgcgctGGTCTGCCTGGAAAGCGATGTCCCGGACGCCGGCTGCGCCTGCGTGGCCATCGACCGGCTGGCCGCCGACAGCGCCTGGCCGCCACCGCCCGCGGCGGAGGTGGCGGCGGACGACCTCGCCTACGTGATCTACACCTCCGG < SRR18135092.6272270/141‑1 (MQ=60)
cgcgctGGTCTGCCTGGAAAGCGATGTCCCGGACGCCGGCTGCGCCTGCGTGGCCATCGACCGGCTGGCCGCCGACAGCGCCTGGCCGCCACCGCCCGCGGCGGAGGTGGCGGCGGACGACCTCGCCTACGTGATCTACACCTCCGGCTCC < SRR18135092.805787/145‑1 (MQ=60)
cgctGGTCTGCCTGGAAAGCGATGTCCCGGACGCCGGCTGCGCCTGCGTGGCCATCGACCGGCTGGCCGCCGACAGCGCCTGGCCGCCACCGCCCGCGGCGGAGGTGGCGGCGGACGACCTCGCCTACGTGATCTACACCTCCGGCTCCAC > SRR18135092.9132415/5‑151 (MQ=60)
cgctGGTCTGCCTGGAAAGCGATGTCCCGGACGCCGGCTGCGCCTGCGTGGCCATCGACCGGCTGGCCGCCGACAGCGCCTGGCCGCCACCGCCCGCGGCGGAGGTGGCGGCGGACGACCTCGCCTACGTGATCTACACCTCCGGCTCCAC > SRR18135092.3006742/5‑151 (MQ=60)
gctGGTCTGCCTGGAAAGCGATGTCCCGGACGCCGGCTGCGCCTGCGTGGCCATCGACCGGCTGGCCGCCGACAGCGCCTGGCCGCCACCGCCCGCGGCGGAGGTGGCGGCGGACGACCTCGCCTACGTGATCTACACCTCCGGCTCCACC > SRR18135092.11220523/4‑151 (MQ=60)
ctGGTCTGCCTGGAAAGCGATGTCCCGGACGCCGGCTGCGCCTGCGTGGCCATCGACCGGCTGGCCGCCGACAGCGCCTGGCCGCCACCGCCCGCGGCGGAGGTGGCGGCGGACGACCTCGCCTACGTGATCTACACCTCCGGCTCCACCG > SRR18135092.6243444/3‑151 (MQ=60)
TGGTCTGCCTGGAAAGCGATGTCCCGGACGCCGGCTGCGCCTGCGTGGCCATCGACCGGCTGGCCGCCGACAGCGCCTGGCCGCCACCGCCCGCGGCGGAGGTGGCGGCGGACGACCTCGCCTACGTGATCTACACCTCCGGCTCCACCGG < SRR18135092.10787517/151‑1 (MQ=60)
TGGTCTGCCTGGAAAGCGATGTCCCGGACGCCGGCTGCGCCTGCGTGGCCATCGACCGGCTGGCCGCCGACAGCGCCTGGCCGCCACCGCCCGCGGCGGAGGTGGCGGCGGACGACCTCGCCTACGTGATCTACACCTCCGGCTCCACCGG > SRR18135092.4195464/1‑151 (MQ=60)
TGGTCTGCCTGGAAAGCGATGTCCCGGACGCCGGCTGCGCCTGCGTGGCCATCGACCGGCTGGCCGCCGACAGCGCCTGGCCGCCACCGCCCGCGGCGGAGGTGGCGGCGGACGACCTCGCCTACGTGATCTACACCTCCGGCTCCACCGG < SRR18135092.9686594/151‑1 (MQ=60)
TGGTCTGCCTGGAAAGCGATGTCCCGGACGCCGGCTGCGCCTGCGTGGCCATCGACCGGCTGGCCGCCGACAGCGCCTGGCCGCCACCGCCCGCGGCGGAGGTGGCGGCGGACGACCTCGCCTACGTGATCTACACCTCCGGCTCCACCGG > SRR18135092.4195483/1‑151 (MQ=60)
GGTCTGCCTGGAAAGCGATGTCCCGGACGCCGGCTGCGCCTGCGTGGCCATCGACCGGCTGGCCGCCGCCAGCGCCTGGCCGCCACCGCCCGCGGCGGAGGTGGCGGCGGACGACCTCGCCTACGTGATCTACACCTCCGGCTCCACCGGC < SRR18135092.1954132/151‑1 (MQ=60)
|
GCGGTGATGCTGCCGAAAAGCGCCGCGCAATTGGTCGCGGTGATCGGCATCCTCCAGGCCGGCGCAGCCTATGTGCCGGTGGACATCCGCCAGCCGCCGCTGCGGCGCCAGGCGATCCTCGCCAGCCCCGAAGTGGTCGCCTGGGTCTGCCTGGAAAGCGATGTCCCGAACGCCGGCTGCGCCTGCGTGGCCATCGACCGGCTGGCCGCCGACAGCGCCTGGCCGCCACCGCCCGCGGCGGAGGTGGCGGCGGACGACCTCGCCTACGTGATCTACACCTCCGGCTCCACCGGC > NC_008463/791722‑792015
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 0 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
