Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
A0 F0 I1 R1
|
253 |
508.7 |
22197442 |
99.2% |
22019862 |
150.0 |
Breseq alignment
BRESEQ :: Evidence
|
evidence |
seq id |
position |
mutation |
annotation |
gene |
description |
RA |
NC_008463 |
4,167,196 |
Δ1 bp |
intergenic (+41/‑131) |
PA14_RS19010 → / → PA14_RS19015 |
VOC family protein/MFS transporter |
|
seq id |
position |
ref |
new |
freq |
score (cons/poly) |
reads |
annotation |
genes |
product |
* | NC_008463 | 4,167,194 | 0 | G | . | 99.7%
| 1692.2
/ ‑2.0
| 343 | intergenic (+39/‑133) | PA14_RS19010/PA14_RS19015 | VOC family protein/MFS transporter |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (1/0); new base . (132/210); total (133/210) |
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 3.88e-01 |
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.88e-01 |
Only 100 of 350 total aligned reads displayed.
GGCGGCTCGGTCCAGATGCCGCTGGGCCCGACCTTCTGGGCGGCGAGCTTCGGCATGTTCACCGACCGCTTCGGCGTGGCCTGGATGGTCAACTGCGAGCAGGACCGGTAGCGTCCGCTACGCGGGCCCGCCGCCAGGTGTGAATCGGCGGGCGGGCCCGCGTTCCGCTGTGCGCGAGTCGCGATCGATAGACGCACTGCCGCGATAATTTAAGTTGCATTTTAAAACCAAAATTCCTAGCCTCCGCATAGTTTCATATTGAAACCTTACGGAGCGCTTCGCATGCCATCCTCGC > NC_008463/4167045‑4167339
|
ggcggcTCGGTCCAGATGCCGCTGGGCCCGACCTTCTGGGCGGCGAGCTTCGGCATGTTCACCGACCGCTTCGGCGTGGCCTGGATGGTCAACTGCGAGCAGGACCGGTAGCGTCCGCTACGCGGGCCCGCCGCCAGGTGTGAATcggcg < 1:9876950/150‑1 (MQ=255)
gcggcTCGGTCCAGATGCCGCTGGGCCCGACCTTCTGGGCGGCGAGCTTCGGCATGTTCACCGACCGCCTCGGCGTGGCCTGGATGGTCAACTGCGAGCAGGACCGGTAGCGTCCGCTACGCGGGCCCGCCGCCAGGTGTGAATcggcgg < 2:10456806/150‑1 (MQ=255)
cGGTCCAGATGCCGCTGGGCCCGACCTTCTGGGCGGCGAGCTTCGGCATGTTCACCGACCGCTTCGGCGTGGCCTGGATGGTCAACTGCGAGCAGGACCGGTAGCGTCCGCTACGCGGGCCCGCCGCCAGGTGTGAATCGGC‑GGCGGGcc < 2:5454529/150‑1 (MQ=255)
ggTCCAGATGCCGCTGGGCCCGACCTTCTGGGCGGCGAGCTTCGGCATGTTCACCGACCGCTTCGGCGTGGCCTGGATGGTCAACTGCGAGCAGGACCGGTAGCGTCCGCTACGCGGGCCCGCCGCCAGGTGTGAATCGGC‑GGCGGGccc > 2:10639785/1‑150 (MQ=255)
gTCCAGATGCCGCTGGGCCCGACCTTCTGGGCGGCGAGCTTCGGCATGTTCACCGACCGCTTCGGCGTGGCCTGGATGGTCAACTGCGAGCAGGACCGGTAGCGTCCGCTACGCGGGCCCGCCGCCAGGTGTGACTCGGC‑GGCGGGCCcg > 2:10723161/1‑150 (MQ=255)
gTCCAGATGCCGCTGGGCCCGACCTTCTGGGCGGCGAGCTTCGGCATGTTCACCGACCGCTTCGGCGTGGCCTGGATGGTCAACTGCGAGCAGGACCGGTAGCGTCCGCTACGCGGGCCCGCCGCCAGGGGTGAATCGGC‑GGCGGGCCcg > 1:6441933/1‑150 (MQ=255)
aGATGCCGCTGGGCCCGACCTTCTGGGCGGCGAGCTTCGGCATGTTCACCGACCGCTTCGGCGTGGCCTGGATGGTCAACTGCGAGCAGGACCGGTAGCGTCCGCTACGCGGGCCCGCCGCCAGGTGTGAATCGGC‑GGCGGGCCCGCGtt > 2:8270162/1‑150 (MQ=255)
tGCCGCTGGGCCCGACCTTCTGGGCGGCGAGCTTCGGCATGTACCCCGACCGCTTCGGCGTGGCCTGGATGGTCAACTGCGCGCAGGACCGGTCGCGTCCGCTACGCGGGCCCGCCGCCAGGTGTGACTCGGC‑GGCGGGCCCGCGTTCCg < 1:2623617/150‑1 (MQ=255)
gCTGGGCCCGACCTTCTGGGCGGCGAGCTTCGGCATGTTCACCGACCGCTTCGGCGTGGCCTGGATGGTCAACTGCGAGCAGGACCGGTAGCGTCCGCTACGCGGGCCCGCCGCCAGGTGTGAATCGGC‑GGCGGGCCCGCGTTCCGCtgt > 2:9224819/1‑150 (MQ=255)
gCTGGGCCCGACCTTCTGGGCGGCGAGCTTCGGCATGTTCACCGACCGCTTCGGCGTGGCCTGGATGGTCAACTGCGAGCAGGACCGGTAGCGTCCGCTACGCGGGCCCGCCGCCAGGTGTGAATCGGC‑GGCGGGCCCGCGTTCCGCagt > 1:1690282/1‑150 (MQ=255)
gggCCCGACCTTCTGGGCGGCGAGCTTCGGCATGTTCACCGACCGCTTCGGCGTGGCCTGGATGGTCAACTGCGAGCAGGACCGGTAGCGTCCGCTACGCGGGCCCGCCGCCAGGTGTGAATCGGC‑GGCGGGCCCGCGTTCCGCTGTgcg > 1:10044051/1‑150 (MQ=255)
gggCCCGACCTTCTGGGCGGCGAGCTTCGGCATGTTCACCGACCGCTTCGGCGTGGCCTGGATGGTCAACTGCGAGCAGGACCGGTAGCGTCCGCTACGCGGGCCCGCCGCCAGGTGTGAATCGGC‑GGCGGGCCCGCGTTCCGCTGTgcg > 2:694894/1‑150 (MQ=255)
ccGACCTTCTGGGCGGCGAGCTTCGGCATGTTCACCGACCGCTTCGGCGTGGCCTGGATGGTCAACTGCGAGCAGGACCGGTAGCGTCCGCTACGCGGGCCCGCCGCCAGGTGTGAATCGGC‑GGCGGGCCCGCGTTCCGCTGTGcgcgcg > 1:2980127/1‑148 (MQ=255)
ccTTCTGGGCGGCGAGCTTCGGCATGTTCACCGACCGCTTCGGCGTGGCCTGGATGGTCAACTGCGAGCAGGACCGGTAGCGTCCGCTACGCGGGCCCGCCGCCAGGTGTGAATCGGC‑GGCGGGCCCGCGTTCCGCTGTGCGCGAGTcgc > 2:8031589/1‑150 (MQ=255)
cTTCTGGGCGGCGAGCTTCGGCATGTTCACCGACCGCTTCGGCGTGGCCTGGATGGTCAACTGCGAGCAGGACCGGTAGCGTCCGCTACGCGGGCCCGCCGCCAGGTGTGAATCGGC‑GGCGGGCCCGCGTTCCGCTGTGCGCGAGTcgcg > 1:3106843/1‑150 (MQ=255)
ttCTGGGCGGCGCGCTTCGGCATGTTCACCGACCGCTTCGGCGGGGCCTGGATGGTCACCGGCGCGCAGGACCGGTAGCGTCCGCTACGCGGGCCCGCCGCCAGGTGTGAATCGGC‑GGCGGGCCCGCGTTCCGCTGTGCGCGAGTCGcga < 1:2762672/150‑1 (MQ=255)
tCTGGGCGGCGAGCTTCGGCATGTTCACCGACCGCTTCGGCGTGGCCTGGATGGTCAACTGCGAGCAGGACCGGTAGCGTCCGCTACGCGGGCCCGCCGCCAGGTGTGAATCGGC‑GGCGGGCCCGCGTTCCGCTGTGCGCGAGTCGcgat < 1:2463428/150‑1 (MQ=255)
tCTGGGCGGCGAGCTTCGGCATGTTCACCGACCGCTTCGGCGTGGCCTGGATGGTCAACTGCGAGCAGGACCGGTAGCGTCCGCTACGCGGGCCCGCCGCCAGGTGTGAATCGGC‑GGCGGGCCCGCGTTCCGCTGTGCGCGAGTCGcgat < 1:8093038/150‑1 (MQ=255)
tCTGGGCGGCGAGCTTCGGCATGTTCACCGACCGCTTCGGCGTGGCCTGGATGGTCAACTGCGAGCAGGACCGGTAGCGTCCGCTACGCGGGCCCGCCGCCAGGTGTGAATCGGC‑GGCGGGCCCGCGTTCCGCTGTGCGCGAGTCGcgat > 1:1252941/1‑150 (MQ=255)
tCTGGGCGGCGAGCTTCGGCATGTTCACCGACCGCTTCGGCGTGGCCTGGATGGTCAACTGCGAGCAGGACCGGTAGCGTCCGCTACGCGGGCCCGCCGCCAGGGGTGAATCGGC‑GGCGGGCCCGCGTTCCGCTGTGCGCGAGTCGcgat > 2:9450973/1‑150 (MQ=255)
gggCGGCGAGCTTCGGCATGTTCCCCGACCGCTTCGGCGTGGCCTGGATGGTCAACTGCGAGCAGGACCGGTAGCGTCCGCTACGCGGGCCCGCCGCCAGGTGTGAATCGGC‑GGCGGGCCCGCGTTCCGCTGTGCGCGAGTCGcgatcga < 2:6088624/150‑1 (MQ=255)
gcggcgAGCTTCGGCATGTTCACCGACCGCTTCGGCGTGGCCTGGATGGTCAACTGCGTGCAGGACCGGTAGCGTCCGCTACGCGGGCCCGCCGCCAGGGGTGAATCGGC‑GGCGGGCCCGCGTTCGGCTGTGCGCGAGTCGcgatcgatc > 2:478545/1‑149 (MQ=255)
ggcgAGCTTCGGCATGTTCACCGACCGCTTCGGCGTGGCCTGGATGGTCAACTGCGAGCAGGACCGGTAGCGTCCGCTACGCGGGCCCGCCGCCAGGTGTGAATCGGC‑GGCGGGCCCGCGTTCCGCTGTGCGCGAGTCGCGATCGATAGa > 2:8493806/1‑150 (MQ=255)
ggcgAGCTTCGGCATGTTCACCGACCGCTTCGGCGTGGCCTGGATGGTCAACGGCGAGCAGGACCGGTAGCGTCCGCTACGCGGGCCCGCCGCCAGGTGTGAATCGGC‑GGCGGGCCCGCGTTCCGCTGTGCGCGAGTCGCGATCGATAGa < 1:9045513/150‑1 (MQ=255)
ggcgAGCTTCGGCATGTTCACCGACCGCTTCGGCGTGGCCTGGAGGGTCAACTGCGAGCAGGACCGGTAGCGTCCGCTACGCGGGCCCGCCGCCAGGTGTGAATCGGC‑GGCGGGCCCGCGTTCCGCTGTGCGCGAGTCGCGATCGATAGa < 2:7918619/150‑1 (MQ=255)
gcgAGCTTCGGCATGTTCACCGACCGCTTCGGCGTGGCCTGGATGGTCAACTGCGAGCAGGACCGGTAGCGTCCGCTACGCGGGCCCGCCGCCAGGTGTGAATCGGC‑GGCGGGCCCGCGTTCCGCTGTGCGCGAGTCGCGATCGATAGAc > 2:4664888/1‑150 (MQ=255)
cgAGCTTCGGCATGTTCACCGACCGCTTCGGCGTGGCCTGGATGGTCAACTGCGAGCAGGACCGGTAGCGTCCGCTACGCGGGCCCGCCGCCAGGTGTGAATCGGC‑GGCGGGCCCGCGTTCCGCTGTGCGCGAGTCGCGATCGATAGACg < 2:6010071/150‑1 (MQ=255)
gAGCTTCGGCATGTTCCCCGACCGCTTCGGCGTGGCCTGGATGGTCAACTGCGAGCAGGACCGGTAGCGTCCGCTACGCGGGCCCGCCGCCAGGTGTGAATCGGC‑GGCGGGCCCGCGTTCCGCTGTGCGCGAGTCGCGATCGATAGACGc < 2:270924/150‑1 (MQ=255)
aGCTTCGGCATGTTCACCGACCGCTTCGGCGTGGCCTGGATGGTCAACTGCGAGCAGGACCTTTAGCGTCCGCTACGCGGTCCCGCCGCCAGGTGTGAATCGGC‑GGCGGGCCCGCGTTCCGCTGTGCGCGAGTCGCGATCGATAGACGCa > 1:2681030/1‑150 (MQ=255)
aGCTTCGGCATGTTCACCGACCGCTTCGGCGTGGCCTGGATGGTCAACTGCGAGCAGGACCGGTAGCGTCCGCTACGCGGGCCCGCCGCCAGGTGTGAATCGGC‑GGCGGGCCCGCGTTCCGCTGTGCGCGAGTCGCGATCGATAGACGCa < 1:3369543/150‑1 (MQ=255)
tCGGCATGTTCACCGACCGCTTCGGCGTGGCCTGGATGGTCAACTGCGAGCTGGCCCGGTAGCGTCCGCTACGCGGGCCCGCCGCCTGGTGTGATGCGGC‑GGCGGGCCCGCGTTCCGCTGTGCGCGAGTCGCGATCGATAGACGCACTGc < 1:2117701/150‑1 (MQ=255)
tCGGCATGTTCACCGACCGCTTCGGCGTGGCCTGGATGGTCAACTGCGAGCAGGACCGGTAGCGTCCGCTACGCGGGCCCGCCGCCAGGTGTGAATCGGC‑GGCGGGCCCGCGTTCCGCTGTGCGCGAGTCGCGATCGATAGACGCACTGc < 2:1515688/150‑1 (MQ=255)
gCATGTTCACCGACCGCTTCGGCGTGGCCTGGATGGTCAACTGCGAGCAGGACCGGTAGCGTCCGCTACGCGGGCCCGCCGCCAGGTGTGAATCGGC‑GGCGGGCCCGCGTTCCGCTGTGCGCGAGTCGCGATCGATAGACGCACTGCcgc > 1:10229003/1‑150 (MQ=255)
gCATGTTCACCGACCGCTTCGGCGGGGCCTGGATGGTCAACTGCGAGCAGGACCGGTAGCGTCCGCTACGCGGGCCCGCCGCCAGGTGTGAATCGGC‑GGCGGGCCCGCGTTCCGCTGTGCGCGAGTCGCGATCGATAGACGCACTGCcgc < 1:6272335/150‑1 (MQ=255)
tGTTCACCGACCGCTTCGGCGTGGCCTGGATGGTCAACTGCGAGCAGGACCGGTAGCGTCCGCTACGCGGGCCCGCCGCCAGGTGTGAATCGGC‑GGCGGGCCCGCGTTCCGCTGTGCGCGAGTCGCGATCGATAGACGCACTGCCGCGAt < 2:3456780/150‑1 (MQ=255)
ttCACCGCCCGCTTCGGCGTGGCCTGGATGGTCAACTGCGAGCAGGACCGGTAGCGTCCGCTCCGCGGGCCCGCCGCCAGGTGTGAATCGGC‑GGCGGGCCCGCGTTCCGCTGTGCGCGAGTCGCGATCGATAGACGCACTGCCGCGATaa < 2:7327869/150‑1 (MQ=255)
ttCACCGACCGCTTCGGCGTGGCCTGGATGGTCACCTGCGAGCAGGACCGGTAGCGTCCGCTACGCGGGCCCGCCGCCAGGTGTGAATCGGC‑GGCGGGCCCGCGTTCCGCTGTGCGCGAGTCGCGATCGATAGACGCACTGCCGCGATaa < 2:3999766/150‑1 (MQ=255)
ttCACCGACCGCTTCGGCGTGGCCTGGATGGTCAACTGCGAGCAGGACCGGTAGCGTCCGCTACGCGGGCCCGCCGCCAGGTGTGAATCGGC‑GGCGGGCCCGCGTTCCGCTGTGCGCGAGTCGCGATCGATAGACGCACTGCCGCGATaa < 1:8179896/150‑1 (MQ=255)
cgaccgCTTCGGCGTGGCCTGGATGGTCAACTGCGAGCAGGACCGGTAGCGTACGCTACGCGGGCCCGCCGCCAGGTGTGAATCGGC‑GGCGGGCCCGCGTTCCGCTGTGCGCGAGGCGCGATCGATAGACGCACTGCCGCGATAATTTac > 2:3347924/1‑149 (MQ=255)
accgCTTCGGCGTGGCCTGGATGGTCAACTGCGAGCAGGACCGGTAGCGTCCGCTACGCGGGCCCGCCGCCAGGTGTGAATCGGC‑GGCGGGCCCGCGTTCCGCTGTGCGCGAGTCGCGATCGATAGACGCACTGCCGCGATAATTTAAGt > 1:6568659/1‑150 (MQ=255)
accgCTTCGGCGGGGCCTGGAGGGTCAACGGCGAGCAGGACCGGGAGCGTCCGCTACGCGGGCCCGCCGCCAGGTGTGAATCGGC‑GGCGGGCCCGCGTTCCGCTGTGCGCGAGTCGCGATCGATAGACGCACTGCCGCGATAATTTAAgg < 2:7171851/150‑2 (MQ=255)
ccgCTTCGGCGTGGCCTGGTTGGTCAACGGCGAGCAGGACCGGTTGCGTCCGCTACGCGGGCCCGCCGCCAGGTGTGAATGGGC‑GGCGGGCCCGCGTTCCGCTGTGCGCGAGTCGCGATCGATAGACGCACTGCCGCGATAATTTAAGtt < 1:9406932/150‑1 (MQ=255)
cGGCGTGGCCTGGATGGGCAACTGCGAGCAGGACCGGTAGCGTCCGCTACGCGGGCCCGCCGCCAGGTGTGAATCGGC‑GGCGGGCCCGCGTTCCGCTGTGCGCGAGTCGCGATCGATAGACGCACTGCCGCGATAATTTAAGTTGCAttt < 2:7747891/150‑1 (MQ=255)
cGTGGCCTGGATGGTCAACTGCGAGCAGGACCGGTAGCGTCCGCTACGCGGGCCCGCCGCCCGGTGTGAATCGGC‑GGCGGGCCCGCGTTCCGCTGTGCGCGAGTCGCGATCGATAGACGCACTGCCGCGATAATTTAAGTTGCATTTTaa > 1:4017577/1‑150 (MQ=255)
tGGCCTGGATGGTCAACTGCGAGCAGGACCGGTAGCGTCCGCTACGCGGGCCCGCCGCCAGGTGTGAATCGGC‑GGCGGGCCCGCGTTCCGCTGTGCGCGAGTCGCGCTCGATAGACGCACTGCCGCGATAATTTAAGTTGCATTTTaaaa > 2:516094/1‑150 (MQ=255)
tGGCCTGGATGGTCAACTGCGAGCAGGACCGGTAGCGTCCGCTACGCGGGCCCGCCGCCAGGTGTGAATCGGC‑GGCGGGCCCGCGTTCCGCTGTGCGCGAGTCGCGATCGATAGACGCACTGCCGCGATAATTTAAGTTGCATTTTaaaa < 2:2331904/150‑1 (MQ=255)
tGGCCTGGATGGTCAACTGCGAGCAGGACCGGTAGCGTCCGCTACGCGGGCCCGCCGCCAGGTGTGAATCGGC‑GGCGGGCCCGCGTTCCGCTGTGCGCGAGTCGCGATCGATAGACGCACTGCCGCGATAATTTAAGTTGCATTTTaaaa < 1:6373681/150‑1 (MQ=255)
cTGGATGGTCAACTGCGAGCAGGACCGGTAGCGTCCGCTACGCGGGCCCGCCGCCAGGTGTGAAGCGGC‑GGCGGGCCCGCGTTCCGCTGTGCGCGAGTCGCGATCGATAGACGCACTGCCGCGATAATTTAAGTTGCATTTTAAAACCaa < 1:9629973/150‑1 (MQ=255)
tGGATGGTCACCTGCTAGCAGGACCGGTCGCGTCCGCTACGAGGGCCCGCCGCCAGGTGTGAATCGGC‑GGCGGGCCCGCGTTCCGCTGTGAGCGAGTCGCGATCGATAGACGCACTGCCTCGATACTTTAAGTTGCATTTTAAAACCaca < 2:1025463/150‑3 (MQ=255)
ggATGGTCAACTGCGAGCAGGACCGGTAGCGTCCGCTACGCGGGCCCGCCGCCAGGTGTGAATCGGC‑GGCGGGCCCGCGTTCCGCTGTGCGCGAGTCGCGATCGATAGACGCACTGCCGCGATAATTTAAGTTGCATTTTAAAACCaaaa < 2:6033808/150‑1 (MQ=255)
gATGTTCAAATGCTAGCTGGACCGGTAGCGTCCGCTACGCGGGCCCGCCGCCAGGTGTGAATCGGC‑GGCGGGCCCGCGTTCCGCTGTGCGCGAGTCGCGATCGATAGACGCACTGCCGCGATAATTTAAGTTGCATTTTAAAACCAAAAt < 1:1847222/150‑1 (MQ=255)
aTGGTCAACTGCGAGCAGGACCGGTAGCGTCCGCTACGCGGGCCCGCCGCCAGGTGTGAATCGGC‑GGCGGGCCCGCGTTCCGCTGTGCGCGAGTCGCGATCGATAGACGCACTGCCGCGATAATTTAAGTTGCATTTTAAAACCAAAAtt < 2:1294990/150‑1 (MQ=255)
tGGTCAACTGCGAGCAGGACCGGTAGCGTCCGCTACGCGGGCCCGCCGCCAGGTGTGAATCGGC‑GGCGGGCCCGCGGTCCGCTGTGCGCGAGTCGCGATCGATAGACGCACTGCCGCGATAATTTAAGTTGCATTTTAAAACCAAAATTc > 2:7465509/1‑150 (MQ=255)
gTCAACTGCGAGCAGGACCGGTAGCGTCCGCTCCGCGGGCCCGCCGCCAGGGGTGAATCGGC‑GGCGGGCCCGCGTTCCGCTGTGCGCGAGTCGCGATCGATAGACGCACTGCCGCGATAATTTAAGTTGCATTTTAAAACCAAAATTCCt < 1:2004160/150‑1 (MQ=255)
gTCAACTGCGAGCAGGACCGGTAGCGTCCGCTACGCGGGCCCGCCGCCAGGTGTGAATCGGC‑GGCGGGCCCGCGTTCCGCTGTGCGCGAGTCGCGATCGATAGACGCACTGCCGCGATAATTTAAGTTGCATTTTAAAACCAAAATTCCt < 1:3721227/150‑1 (MQ=255)
gTCAACTGCGAGCAGGACCGGTAGCGTCCGCTACGCGGGCCCGCCGCCAGGTGTGAATCGGC‑GGCGGGCCCGCGTTCCGCTGTGCGCGAGTCGCGATCGATAGACGCACTGCCGCGATAATTTAAGTTGCATTTTAAAACCAAAATTCCt > 1:1385210/1‑150 (MQ=255)
gTCAACTGCGAGCAGGACCGGTAGCGTCCGCTACGCGGGCCCGCCGCCAGGTGTGAATCGGC‑GGCGGGCCCGCGTTCCGCTGTGCGCGAGTCGCGATCGATAGACGCACTGCCGCGATAAGTTAAGTTGCATTTTAAAACCCAAATTCCt > 2:7523249/1‑150 (MQ=255)
aaCTGCGAGCAGGACCGGTAGCGTCCGCTACGCGGGCCCGCCGCCAGGTGTGAATCGGC‑GGCGGGCCCGCGTTCCGCTGTGCGCGAGTCGCGATCGATAGACGCACTGCCGCGATAATTTAAGTTGCATTTTAAAACCAAAATTCCTAGc < 1:7366915/150‑1 (MQ=255)
aCTGCGAGCAGGACCGGTAGCGTCCGCTACGCGGGCCCGCCGCCAGGTGTGAATCGGC‑GGCGGGCCCGCGTTCCGCTGTGCGCGAGTCGCGATCGATAGACGCACTGCCGCGATAATTTAAGTTGCATTTTAAAACCAAAATTCCTAGcc > 2:8131511/1‑150 (MQ=255)
gCGAGCAGGACCGGTAGCGTCCGCTACGCGGGCCCGCCGCCAGGTGTGAATCGGC‑GGCGGGCCCGCGTTCCGCTGTGCGCGAGTCGCGATCGATCGACGCACTGCCGCGATCATTTAAGTTGCTTTTTAAAACCAAAATTCCTAGCCTcc > 2:8793631/1‑150 (MQ=255)
gCGAGCAGGACCGGTAGCGTCCGCTACGCGGGCCCGCCGCCAGGTGTGAATCGGC‑GGCGGGCCCGCGTTCCGCTGTGCGCGAGTCGCGATCGATAGACGCACTGCCGCGATAATTTAAGTTGCATTTTAAAACCAAAATTCCTAGCCTcc < 1:8662597/150‑1 (MQ=255)
gCGAGCAGGACCGGTAGCGTCCGCTACGCGGGCCCGCCGCCAGGTGTGAATCGGC‑GGCGGGCCCGCGTTCCGCTGTGCGCGAGTCGCGATCGATAGACGCACTGCCGCGATAATTTAAGTTGCATTTTAAAACCAAAATTCCTAGCCTcc < 1:452383/150‑1 (MQ=255)
gCAGGACCGGTAGCGTCCGCTACGCGGGCCCGCCGCCAGGTGTGAATCGGC‑GGCGGGCCCGCGTTCCGCTGTGCGCGAGTCGCGATCGATAGACGCACTGCCGCGATAATTTAAGTTGCATTTTAAAACCAAAATTCCTAGCCTCCGCAt > 2:9767838/1‑150 (MQ=255)
cAGGACCGGGAGCGTCCGCTACGCGGGCCCGCCGCCAGGTGTGAATCGGC‑GGCGGGCCCGCGTTCCGCGGTGCGCGAGTCGCGATCGATAGACGCACTGCCGCGATAATTTAAGTTGCATTTTAAAACCAAAATTCCTAGCCTCCGCATa < 2:8599414/150‑1 (MQ=255)
aGGACCGGTAGCGTCCGCTACGCGGGCCCGCCGCCAGGTGTGAATCGGC‑GGCGGGCCCGCGTTCCGCTGTGCGCGAGTCGCGATCGATAGACGCACTGCCGCGATAATTTAAGTTGCATTTTAAAACCAAAATTCCTAGCCTCCGCATAg < 2:2170160/150‑1 (MQ=255)
ggACCGGTAGCGTCCGCTACGCGGGCCCGCCGCCAGGTGTGAATCGGC‑GGCGGGCCCGCGTTCCGCTGTGCGCGAGTCGCGATCGATAGACGCACTGCCGCGATAATTTAAGTTGCATTTTAAAACCAAAATTCCTAGCCTCCGCATAGt < 1:5550901/150‑1 (MQ=255)
aCCGGTAGCGTCCGCTACGCGGGCCCGCCGCCAGGTGTGAATCGGC‑GGCGGGCCCGCGTTCCGCTGTGCGCGAGTCGCGATCGATAGACGCACTGCCGCGATAATTTAAGTTGCATTTTAAAACCAAAATTCCTAGCCTCCGCATAGttt > 1:7643142/1‑150 (MQ=255)
aGCGTCCGCTACGCGGGCCCGCCGCCAGGTGTGAATCGGC‑GGCGGGCCCGCGTTCCGCTGTGCGCGAGTCGCGATCGATAGACGCACTGCCGCGATAATTTAAGTTGCATTTTAAAACCAAAATTCCTAGCCTCCGCATAGTTTCATAtt < 2:3190618/150‑1 (MQ=255)
aGCGTCCGCTACGCGGGCCCGCCGCCAGGTGTGAATCGGC‑GGCGGGCCCGCGTTCCGCTGTGCGCGAGTCGCGATCGATAGACGCACTGCCGCGATAATTTAAGTTGCATTTTAAAACCAAAATTCCTAGCCTCCGCATAGTTTCATAtt < 2:5608412/150‑1 (MQ=255)
aGCGTCCGCTACGCGGGCCCGCCGCCAGGTGTGAATCGGC‑GGCGGGCCCGCGTTCCGCTGTGCGCGAGTCGCGATCGATAGACGCACTGCCGCGATAAGTTAAGTTGCATTTTAAAACCACAATTCCTAGCCTCCGCATAGTTTCATAtt > 2:5720488/1‑150 (MQ=255)
gCGTCCGCTACGCGGGCCCGCCGCCAGGTGTGAATCGGC‑GGCGGGCCCGCGTTCCGCTGTGCGCGAGTCGCGATCGATAGACGCACTGCCGCGATAATTTAAGTTGCATTTTAAAACCAAAATTCCTAGCCTCCGCATAGTTTCATATTg < 2:2513136/150‑1 (MQ=255)
cGTCCGCTACGCGGGCCCGCCGCCAGGTGTGAATCGGC‑GGCGGGCCCGCGTTCCGCTGTGCGCGAGTCGCGATCGATAGACGCACTGCCGCGATAATTTAAGTTGCATTTTAAAACCAAAATTCCTAGCCTCCGCATAGTTTCATATTGa < 1:4398303/150‑1 (MQ=255)
cGTCCGCTACGCGGGCCCGCCGCCAGGTGTGAATCGGC‑GGCGGGCCCGCGTTCCGCTGTGCGCGAGTCGCGATCGATAGACGCACTGCCGCGATAATTTAAGTTGCATTTTAAAACCAAAATTCCTAGCCTCCGCATAGTTTCATATTGa < 1:5823314/150‑1 (MQ=255)
gTCCGCTACGCGGGCCCGCCGCCAGGTGTGAATCGGC‑GGCGGGCCCGCGTTCCGCTGTGCGCGAGTCGCGATCGATAGACGCACTGCCGCGATAATTTAAGTTGCATTTTAAAACCAAAATTCCTAGCCTCCGCATAGTTTCATATTGaa < 1:10827127/150‑1 (MQ=255)
ccGCTACGCGGGCCCGCCGCCAGGTGTGAATCGGC‑GGCGGGCCCGCGTTCCGCTGTGCGCGAGTCGCGATCGATAGACGCACTGCCGCGATAATTTAAGTTGCATTTTAAAACCAAACTTCCTAGCCTCCGCATAGTTTCATATTGAAAc > 2:6639043/1‑150 (MQ=255)
cGCTACGCGGGCCCGCCGCCAGGTGTGAATCGGC‑GGCGGGCCCGCGTTCCGCTGTGCGCGAGTCGCGATCGATAGACGCACTGCCGCGATAATTTAAGTTGCATTTTAAAACCAAAATTCCTAGCCTCCGCATAGTTTCATATTGAAAcc < 1:7806792/150‑1 (MQ=255)
gCTACGCGGGCCCGCCGCCAGGTGTGAATCGGC‑GGCGGGCCCGCGTTGCGCTGTGCGCGAGTCGCGATCGATAGACGCACTGCCGCGATAATTTAAGTTGCATTTTAATACCAAAATTCCTAGCCTCCGCATAGTGTCATATTGAAACCt > 2:29631/1‑150 (MQ=255)
gCTACGCGGGCCCGCCGCCAGGTGTGAATCGGC‑GGCGGGCCCGCGTTCCGCTGTGCGCGAGTCGCGATCGATAGACGCACTGCCGCGATAATTTAAGTTGCATTTTAAAACCAAAATTCCTAGCCTCCGCATAGTTTCATATTGAAACCt > 2:5356396/1‑150 (MQ=255)
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cTACGCGGGCCCGCCGCCAGGTGTGAATCGGC‑GGCGGGCCCGCGTTCCGCTGTGCGCGTGTCGCGATCGATAGACGCACTGCCGCGATACTTTTAGGTGCAGTTTAAAACCACAATTCCTAGCCTCCGCCTAGTGTCATATTGAAACCtt > 2:6846629/1‑150 (MQ=255)
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TACGCGGGCCCGCCGCCAGGTGTGAATCGGC‑GGCGGGCCCGCGTTCCGCTGTGCGCGAGTCGCGATCGATAGACGCACTGCCGCGATAATTTAAGTTGCATTTTAAAACCAAAATTCCTAGCCTCCGCATAGTTTCATATTGAAACCTTAC < SRR18135100.688561/151‑1 (MQ=60)
GCGGGCCCGCCGCCAGGTGTGAATCGGC‑GGCGGGCCCGCGTTCCGCTGTGCGCGAGTCGCGATCGATAGACGCACTGCCGCGATAATTTAAGTTGCATTTTAAAACCAAAATTCCTAGCCTCCGCATAGTTTCATATTGAAACCTTACGGA < SRR18135100.1908478/151‑1 (MQ=60)
CGGGCCCGCCGCCAGGTGTGAATCGGC‑GGCGGGCCCGCGTTCCGCTGTGCGCGAGTCGCGATCGATAGACGCACTGCCGCGATAATTTAAGTTGCATTTTAAAACCAAAATTCCTAGCCTCCGCATAGTTTCATATTGAAACCTTACGGAG < SRR18135100.265079/151‑1 (MQ=60)
GGGCCCGCCGCCAGGTGTGAATCGGC‑GGCGGGCCCGCGTTCCGCTGTGCGCGAGTCGCGATCGATAGACGCACTGCCGCGATAATTTAAGTTGCATTTTAAAACCAAAATTCCTAGCCTCCGCATAGTTTCATATTGAAACCTTACGGTGC > SRR18135100.1401635/1‑151 (MQ=60)
GCCCGCCGCCAGGTGTGAATCGGC‑GGCGGGCCCGCGTTCCGCTGTGCGCGAGTCGCGATCGATAGACGCACTGCCGCGATAATTTAAGTTGCATTTTAAAACCAAAATTCCTAGCCTCCGCATAGTTTCATATTGAAACCTTACGGAGCGC > SRR18135100.8514943/1‑151 (MQ=60)
CCCGCCGCCAGGTGTGAATCGGC‑GGCGGGCCCGCGTTCCGCTGTGCGCGAGTCGCGATCGATAGACGCACTGCCGCGATAATTTAAGTTGCATTTTAAAACCAAAATTCCTAGCCTCCGCATAGTTTCATATTGAAACCTTACGGAGCGCT < SRR18135100.2686552/151‑1 (MQ=60)
CCCGCCGCCAGGTGTGAATCGGC‑GGCGGGCCCGCGTTCCGCTGTGCGCGAGTCGCGATCGATAGACGCACTGCCGCGATAATTTAAGTTGCATTTTAAAACCAAAATTCCTAGCCTCCGCATAGTTTCAGATTGAAACCTTACGGAGCGCT > SRR18135100.2604492/1‑151 (MQ=60)
CCCGCCGCCAGGTGTGAATCGGC‑GGCGGGCCCGCGTTCCGCTGTGCGCGAGTCGCGATCGATAGACGCACTGCCGCGATAATTTAAGTTGCATTTTAAAACCAAAATTCCTAGCCTCCGCATAGTTTCAGATTGAAACCTTACGGAGCGCT > SRR18135100.5420496/1‑151 (MQ=60)
CCGCCGCCAGGTGTGATTAGGC‑GGCGGGACGGCGTTCCGCTGTGCGCGAGTCTCGATCGATAGACGCACTGCCGCGTTAATTTAAGTTGGCTTTTACAACAAATATTCCTAGACTCCGCATAGTTTCATATTGTAACCTTACGGAGCGCTT < SRR18135100.8165565/151‑1 (MQ=60)
CCGCCGCCAGCTGTGAATCGGC‑GGCGGGCCCGCGTTCCGCTGTGCGCGAGTCGCGATCGATAGACGCACTGCCGCGATAATTTAAGTTGCATTTTAAAACCAAAATTCCTAGCCTCCGCATAGTTTCATATTGAAACCTTACGGAGCGCTT < SRR18135100.10807521/151‑1 (MQ=60)
CGCCGCCAGGTGTGAATCGGC‑GGCGGGCCCGCGTTCCGCTGTGCGCGAGTCGCGATCGATAGACGCACTGCCGCGATAATTTAAGTTGCATTTTAAAACCAAAATTCCTAGCCTCCGCATAGTTTCATATTGAAACCTTACGGAGCGCTTC < SRR18135100.6259145/151‑1 (MQ=60)
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GCCAGGTGTGAATCGGC‑GGCGGGCCCGCGTTCCGCTGTGCGCGAGTCGCGATCGATAGACGCACTGCCGCGATAATTTAAGTTGCATTTTAAAACCAAAATTCCTAGCCTCCGCATAGTTTCATATTGAAACCTTACGGAGCGCTTCGCAT > SRR18135100.2004299/1‑151 (MQ=60)
GCCAGGTGTGAATCGGC‑GGCGGGCCCGCGTTCCGCTGTGCGCGAGTCGCGATCGATAGACGCACTGCCGCGATAATTTAAGTTGCATTTTAAAACCAAAATTCCTAGCCTCCGCATAGTTTCATATTGAAACCTTACGGAGCGCTTCGCAT > SRR18135100.5239688/1‑151 (MQ=60)
CAGGTGTGACTCGGC‑GGCGGGCCCGCGTTCCGCTGTGCGCGAGTCGCGATCGATAGACGCACTGCCGCGATAATTTAAGTTGCATTTTAAAACCAAAATTCCTAGCCTCCGCATAGTTTCATATTGAAACCTTACGGAGCGCTTCGCATGC < SRR18135100.7164232/151‑1 (MQ=60)
CAGGTGTGAATCGGC‑GGCGGGCCCGCGTTCCGCTGTGCGCGAGTCGCGATCGATAGACGCACTGCCGCGATAATTTAAGTTGCATTTTAAAACCAAAATTCCTAGCCTCCGCATAGTTTCATATTGAAACCTTACGGAGCGCTTCGCATGC > SRR18135100.7437967/1‑151 (MQ=60)
AGGTGTGAATCGGC‑GGCGGGCCCGCGTTCCGCTGTGCGCGAGTCGCGATCGATAGACGCACTGCCGCGATAATTTAAGTTGCATTTTAAAACCAAAATTCCTAGCCTCCGCATAGTTTCATATTGAAACCTTACGGAGCGCTTCGCATGCC > SRR18135100.5145983/1‑151 (MQ=60)
GGTGTGAATCGGC‑GGCGGGCCCGCGTTCCGCTGTGCGCGAGTCGCGATCGATAGACGCACTGCCGCGATAATTTAAGTTGCATTTTAAAACCAAAATTCCTAGCCTCCGCATAGTTTCATATTGAAACCTTACGGAGCGCTTCGCATGCCA < SRR18135100.3422117/151‑1 (MQ=60)
GGTGTGAATCGGC‑GGCGGGCCCGCGTTCCGCTGTGCGCGAGTCGCGATCGATAGACGCACTGCCGCGATAATTTAAGTTGCATTTTAAAACCAAAATTCCTAGCCTCCGCATAGTTTCATATTGAAACCTTACGGAGCGCTTCGCATGCCA > SRR18135100.4482846/1‑151 (MQ=60)
GGAGTGAATCGGC‑GGCGGGCCCGCGTTCCGCTGTGCGCGAGTCGCGATCGATAGACGCACTGCCGCGATACTTTAAGTTGAATTTTAAAACCAAAATTCCTAGCCTCCGCATAGTTTCATATTGAAACCTTACGGAGCGCTTCGCATGCCA < SRR18135100.5164194/151‑1 (MQ=60)
GTGTGAATCGGC‑GGCGGGCCCGCGTTCCGCTGTGCGCGAGTCGCGATCGATAGACGCACTGCCGCGATAATTTAAGTTGCATTTTAAAACCAAAATTCCTAGCCTCCGCATAGTTTCATATTGAAACCTTACGGAGCGCTTCGCATGCCAT < SRR18135100.5982853/151‑1 (MQ=60)
TGAATCGGC‑GGCGGGCCCGCGTTCCGCTGTGCGCGAGTCGCGATCGATAGACGCACTGCCGCGATAATTTAAGTTGCATTTTAAAACCAAAATTCCTAGCCTCCGCATAGTTTCATATTGAAACCTTACGGAGCGCTTCGCATGCCATCCT > SRR18135100.9054282/1‑151 (MQ=60)
TGAATCGGC‑GGCGGGCCCGCGTTCCGCTGTGCGCGAGTCGCGATCGATAGACGCACTGCCGCGATAATTTAAGTTGCATTTTAAAACCAAAATTCCTAGCCTCCGCATAGTTTCATATTGAAACCTTACGGAGCGCTTCGCATGCCATCCT < SRR18135100.10615484/151‑1 (MQ=60)
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TGAATCGGC‑GGCGGGCCCGCGTTCCGCTGTGCGCGAGTCGCGATCGAGAGACGCACTGCCGCGATAATTTAAGTTGCATTTTAAAACCAAAATTCCTAGCCTCCGCATAGTTTCATATTGAAACCTTACGGAGCGCTTCGCATGCCATCCT < SRR18135100.4957176/151‑1 (MQ=60)
GAATCGGC‑GGCGGGCCCGCGTTCCGCTGTGCGCGAGTCGCGATCGATAGACGCACTGCCGCGATAATTTAAGTTGCATTTTAAAACCAAAATTCCTAGCCTCCGCATAGTTTCATATTGAAACCTTACGGAGCGCTTCGCATGCCATCCTC < SRR18135100.6219424/151‑1 (MQ=60)
GAATCGGC‑GGCGGGCCCGCGTTCCGCTGTGCGCGAGTCGCGATCGATAGACGCACTGCCGCGATAATTTAAGTTGCATTTTAAAACCAAAATTCCTAGCCTCCGCATAGTTTCATATTGAAACCTTACGGAGCGCTTCGCATGCCATCCTC > SRR18135100.10401226/1‑151 (MQ=60)
AATCGGC‑GGCGGGCCCGCGTTCCGCTGTGCGCGAGTCGCGATCGATAGACGCACTGCCGCGATAATTTAAGTTGCATTTTAAAACCAAAATTCCTAGCCTCCGCATAGTTTCATATTGAAACCTTACGGAGCGCTTCGCATGCCATCCTCG < SRR18135100.10645297/151‑1 (MQ=60)
ATCGGC‑GGCGGGCCCGCGTTCCGCTGTGCGCGAGTCGCGATCGATAGACGCACTGCCGCGATAATTTAAGTTGCATTTTAAAACCAAAATTCCTAGCCTCCGCATAGTTTCATATTGAAACCTTACGGAGCGCTTCGCATGCCATCCTCGC > SRR18135100.10351768/1‑151 (MQ=60)
ATCGGC‑GGCGGGCCCGCGTTCCGCTGTGCGCGAGTCGCGATCGATAGACGCACTGCCGCGATAATTTAAGTTGCATTTTAAAACCAAAATTCCTAGCCTCCGCATAGTTTCATATTGAAACCTTACGGAGCGCTTCGCATGCCATCCTCGC > SRR18135100.2355452/1‑151 (MQ=60)
TCGGC‑GGCGGGCCCGCGTTCCGCTGTGCGCGAGTCGCGATCGATAGACGCACTGCCGCGATAATTTAAGTTGCATTTTAAAACCAAAATTCCTAGCCTCCGCATAGTTTCATATTGAAACCTTACGGAGCGCTTCGCATGCCATCCTCGCC < SRR18135100.7919922/151‑1 (MQ=60)
TCGGC‑GGCGGGCCCGCGTTCCGCTGTGCGCGAGTCGCGATCGATAGACGCACTGCCGCGATAATTTAAGTTGCATTTTAAAACCAAAATTCCTAGCCTCCGCATAGTTTCATATTGAAACCTTACGGAGCGCTTCGCATGCCATCCTCGCC < SRR18135100.3577128/151‑1 (MQ=60)
TCGGC‑GGCGGGCCCGCGTTCCGCTGTGCGCGAGTCGCGATCGATAGACGCACTGCCGCGATAATTTAAGTTGCATTTTAAAACCAAAATTCCTAGCCTCCGCATAGTTTCATATTGAAACCTTACGGAGCGCTTCGCATGCCATCCTCGCC < SRR18135100.6338809/151‑1 (MQ=60)
TCGGC‑GGCGGGCCCGCGTTCCGCTGTGCGCGAGTCGCGATCGATAGACGCACTGCCGCGATAAATTAAGTTTCATTTTAAAACCAAAAGTCCTAGCCTCCGCATAGTTTCATATTGAAACCTTACGGAGCGCTTCGCATGCCATCCTCGCC < SRR18135100.5343084/151‑1 (MQ=60)
GGC‑GGCGGGCCCGCGTTCCGCTGTGCGCGAGTCGCGATCGATAGACGCACTGCCGCGATAATTTAAGTTGCATTTTAAAACCAAAATTCCTAGCCTCCGCATAGTTTCATATTGAAACCTTACGGAGCGCTTCGCATGCCATCCTCGCCAT > SRR18135100.10560580/1‑151 (MQ=60)
gcGGCGGGCCCGCGTTCCGCTGTGCGCGAGTCGCGATCGATAGACGCACTGCCGCGATAATTTAAGTTGCATTTTAAAACCAAAATTCCTAGCCTCCGCATAGTTTCATATTGAAACCTTACGGAGCGCTTCGCATGCCATCCTCGCCATC > SRR18135100.4417135/3‑151 (MQ=60)
gcGGCGGGCCCGCGTTCCGCTGTGCGCGAGTCGCGATCGATAGACGCACTGCCGCGATAATTTAAGTTGCATTTTAAAACCAAAATTCCTAGCCTCCGCATAGTTTCATATTGAAACCTTACGGAGCGCTTCGCATGCCATCCTCGCCATC > SRR18135100.3986173/3‑151 (MQ=60)
gcGGCGGGCCCGCGTTCCGCTGTGCGCGAGTCGCGATCGATAGACGCACTGCCGCGATAATTTAAGTTGCATTTTAAAACCAAAATTCCTAGCCTCCGCATAGTTTCATATTGAAACCTTACGGAGCGCTTCGCATGCCATCCTCGCCATC > SRR18135100.5347643/3‑151 (MQ=60)
GCGGGCCCGCGTTCCGCTGTGCGCGAGTCGCGATCGATAGACGCACTGCCGCGATAATTTAAGTTGCATTTTAAAACCAAAATTCCTAGCCTCCGCATAGTTTCATATTGAAACCTTACGGAGCGCTTCGCATGCCATCCTCGCCATCCTC > SRR18135100.10607966/1‑151 (MQ=60)
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GCGGCTCGGTCCAGATGCCGCTGGGCCCGACCTTCTGGGCGGCGAGCTTCGGCATGTTCACCGACCGCTTCGGCGTGGCCTGGATGGTCAACTGCGAGCAGGACCGGTAGCGTCCGCTACGCGGGCCCGCCGCCAGGTGTGAATCGGCGGGCGGGCCCGCGTTCCGCTGTGCGCGAGTCGCGATCGATAGACGCACTGCCGCGATAATTTAAGTTGCATTTTAAAACCAAAATTCCTAGCCTCCGCATAGTTTCATATTGAAACCTTACGGAGCGCTTCGCATGCCATCCTCGCCATCCTC > NC_008463/4167046‑4167346
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Alignment Legend |
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Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 0 ≤ ATCG/ATCG < 11 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |