Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A3 F1 I1 R1
|
256 |
517.8 |
22465524 |
99.2% |
22285799 |
151.0 |
Breseq alignment
BRESEQ :: Evidence
|
| evidence |
seq id |
position |
mutation |
annotation |
gene |
description |
| RA |
NC_008463 |
96,393 |
A→C |
pseudogene (241/723 nt) |
tagH ← |
type VI secretion system‑associated FHA domain protein TagH |
| |
seq id |
position |
ref |
new |
freq |
score (cons/poly) |
reads |
annotation |
genes |
product |
| * | NC_008463 | 96,393 | 0 | A | C | 99.8%
| 2345.2
/ NA
| 591 | pseudogene (241/723 nt) | tagH | type VI secretion system‑associated FHA domain protein TagH |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (0/1); new base C (278/312); total (278/313) |
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 |
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 |
Only 100 of 598 total aligned reads displayed.
GCAGCAGGAGCAGCATGGCTTCGTCGACGTTCGGCGCGAACTTCAGCGGGTTGTTCTGCACAGGCTGGATCATGGTCTGCGCCATGCGGAACTCGCCCTTCAGGTTGTCCAGCGTGCGCAGCACGTCCACCAGTCCTTCCACCAGACAGCGATAGGTGCGTCGGATGGCTTCCATCTGCGCTTCGGCGCCGGCCGGGTCGACCTTC‑A‑CTGGGTCATGCCGGCGCCGCGCAGGAACGCCTGCAGCAGGTCGCCGCCGGCCGTCGCGGCGGCGCTTGCCGGGGGCGTCGGCGC > NC_008463/96246‑96536
|
gcagcaGGAGCAGCATGGCTTCGTCGACGTTCGGCGCGAACTTCAGCGGGTTGTTCTGCACCGGCTGGATCATGGTCTGCGCCATGCGGAACTCGCCCTTCAGGCTGGCCCGCGCGCGCAGCACGTCCACCAGTCCTTCCACCAGGCcgcg < 1:5770567/151‑1 (MQ=255)
gcagcaGGAGCAGCATGGCTTCGTCGACGTTCGGCGCGAACTTCAGCGGGTTGTTCTGCACCGGCTGGATCATGGTCTGCGCCATGCGGAACTCGCCCTTCAGGCTGGCCCGCGCGCGCAGCACGTCCACCAGTCCTTCCACCAGGCcgcg > 1:9043359/1‑151 (MQ=255)
cagcagGAGCAGCATGGCTTCGTCGACGTTCGGCGCGAACTTCAGCGGGTTGTTCTGCACCGGCTGGATCATGGTCTGCGCCATGCGGAACTCGCCCTTCAGGCTGGCCCGCGCGCGCAGCACGTCCACCAGTCCTTCCACCAGGCCGCGa < 1:3675043/151‑1 (MQ=255)
agcagGAGCAGCATGGCTTCGTCGACGTTCGGCGCGAACTTCAGCGGGTTGTTCTGCACCGGCTGGATCATGGTCTGCGCCATGCGGAACTCGCCCTTCAGGCTGGCCCGCGCGCGCAGCACGTCCACCAGTCCTTCCACCAGGCCGCGAt < 1:11003736/151‑1 (MQ=255)
cagGAGCAGCATGGCTTCGTCGACGTTCGGCGCGAACTTCAGCGGGTTGTTCTGCACCGGCTGGATCATGGTCTGCGCCATGCGGAACTCGCCCTTCAGGCTGGCCCGCGCGCGCAGCACGTCCACCAGTCCTTCCACCAGGCCGCGATAg > 1:8856601/1‑151 (MQ=255)
cagGAGCAGCATGGCTTCGTCGACGTTCGGCGCGAACTTCAGCGGGTTGTTCTGCACCGGCTGGATCATGGTCTGCGCCATGCGGAACTCGCCCTTCAGGCTGGCCCGCGCGCGCAGCACGTCCACCAGTCCTTCCACCAGGCCGCGATAg < 1:10807162/151‑1 (MQ=255)
agtagcagcATGTCTTCGTCGACGTTCGGCGCGAACTACAGAGGGTTGTTCTGCACAGGCTGGATCATTGACTGCGCCATGCGGAACTATCCCTTCAGGCTTGCCCGCGAGCGCAGCACGTCCACCAGTCCTTCCAACAGGCCGCGATAgc > 2:343747/4‑150 (MQ=255)
agGAGCAGCATGGCTTCGTCGACGTTCGGCGCGAACTTCAGCGGGTTGTTCTGCACCGGCTGGATCATGGTCTGCGCCATGCGGAACTCGCCCTTCAGGCTGGCCCGCGCGCGCAGCACGTCCACCAGTCCTTCCACCAGGCCGCGATAgc < 2:9117353/151‑2 (MQ=255)
agGAGCAGCATGGCTTCGTCGACGTTCGGCGCGAACTTCAGCGGGTTGTTCTGCACCGGCTGGATCATGGTCTGCGCCATGCGGAACTCGCCCTTCAGGCTGGCCCGCGCGCGCAGCACGTCCACCAGTCCTTCCACCAGGCCGCGATAgc > 2:1922119/1‑150 (MQ=255)
gAGCAGCATGGCTTCGTCGACGTTCGGCGCGAACTTCAGCGGGTTGTTCTGCACCGGCTGGATCATGGTCTGCGCCATGCGGAACTCGCCCTTCAGGCTGGCCCGCGCGCGCAGCACGTCCACCAGTCCTTCCACCAGGCCGCGATAGCTg > 1:10595423/1‑151 (MQ=255)
gAGCAGCATGGCTTCGTCGACGTTCGGCGCGAACTTCAGCGGGTTGTTCTGCACCGGCTGGATCATGGTCTGCGCCATGCGGAACTCGCCCTTCAGGCTGGCCCGCGCGCGCAGCACGTCCACCAGTCCTTCCACCAGGCCGCGATAGCTg < 2:2744631/151‑1 (MQ=255)
gcagcaTGGCTTCGTCGACGTTCGGCGCGAACTTCAGCGGGTTGTTCTGCACCGGCTGGATCATGGTCTGCGCCATGCGGAACTCGCCCTTCAGGCTGGCCCGCGCGCGCAGCACGTCCACCAGTCCTTCCACCAGGCCGCGATAGCTGCg < 2:9539839/151‑1 (MQ=255)
cagcaTGGCTTCGTCGACGTTCGGCGCGAACTTCAGCGGGTTGTTCTGCACCGGCTGGATCATGGTCTGCGCCATGCGGAACTCGCCCTTCAGGCTGGCCCGCGCGCGCAGCACGTCCACCAGTCCTTCCACCAGGCCGCGATAGCTGCgg < 2:3010520/151‑2 (MQ=255)
aTGGCTTCGTCGACGTTCGGCGCGAACTTCAGCGGGTTGTTCTGCACCGGCTGGATCATGGTCTGCGCCATGCGGAACTCGCCCTTCAGGCTGGCCCGCGCGCGCAGCACGTCCACCAGTCCTTCCACCAGGCCGCGATAGCTGCggccga < 2:6604482/151‑6 (MQ=255)
tGGCTTCGTCGACGTTCGGCGCGAACTTCAGCGGGTTGTTCTGCACCGGCTGGATCATGGTCTGCGCCATGCGGAACTCGCCCTTCAGGCTGGCCCGCGCGCGCAGCACGTCCACCAGTCCTTCCACCAGGCCGCGATAGCTGCGGCCGAt > 1:688404/1‑151 (MQ=255)
tGGCTTCGTCGACGTTCGGCGCGAACTTCAGCGGGTTGTTCTGCACCGGCTGGATCATGGTCTGCGCCATGCGGAACTCGCCCTTCAGGCTGGCCCGCGCGCGCAGCACGTCCACCAGTCCTTCCACCAGGCCGCGATAGCTGCGGCCGAt > 1:2888285/1‑151 (MQ=255)
ggCTTCGTCGACGTTCGGCGCGAACTTCAGCGGGTTGTTCTGCACCGGCTGGATCATGGTCTGCGCCATGCGGAACTCGCCCTTCAGGCTGGCCCGCGCGCGCAGCACGTCCACCAGTCCTTCCACCAGGCCGCGATAGCTGCGGCCGATg > 1:329297/1‑151 (MQ=255)
ttCGTCGACGTTCGGCGCGAACTTCAGCGGGTTGTTCTGCACCGGCTGGATCATGGTCTGCGCCATGCGGAACTCGCCCTTCAGGCTGGCCCGCGCGCGCAGCACGTCCACCAGTCCTTCCACCAGGCCGCGATAGCTGCGGCCGATGGCt < 1:6350804/151‑1 (MQ=255)
tcgtcgACGTTCGGCGCGAACTTCAGCGGGTTGTTCTGCACCGGCTGGATCATGGTCTGCGCCATGCGGAACTCGCCCTTCAGGCTGGCCCGCGCGCGCAGCACGTCCACCAGTCCTTCCACCAGGCCGCGATAGCTGCGGCCGATGGCtt < 2:5805072/151‑1 (MQ=255)
gtcgACGTTCGGCGCGAACTTCAGCGGGTTGTTCTGCACCGGCTGGATCATGGTCTGCGCCATGCGGAACTCGCCCTTCAGGCTGGCCCGCGCGCGCAGCACGTCCACCAGTCCTTCCACCAGGCCGCGATAGCTGCGGCCGATGGCTTcc > 2:10588937/1‑151 (MQ=255)
cGTTCGGCGCGAACTTCAGCGGGTTGTTCTGCACCGGCTGGATCATGGTCTGCGCCATGCGGAACTCGCCCTTCCGGCTGGCCCGCGCGCGCAGCACGTCCACCAGTCCTTCCACCAGGCCGCGATAGCTGCGGCCGATGGCTTCCATCTg < 2:515915/151‑1 (MQ=255)
gTTCGGCGCGAACTTCAGCGGGTTGTTCTGCACCGGCTGGATCATGGTCTGCGCCATGCGGAACTCGCCCTTCAGGCTGGCCCGCGCGCGCAGCACGTCCACCAGTCCTTCCACCAGGCCGCGATAGCTGCGGCCGATGGCTTCCATCTgc > 2:5504783/1‑151 (MQ=255)
gtCGGCGCGAACTTCAGCGGGGTGTTCTGGACCGGCTGGATCATGGTCGGCGCCTTGCGGAACTCGCCCTTCAGGCTGGCCCGCGCGCGCTGCACGTCCACCAGTCCTTCCACCAGGCCGCGATAGCTGCGGCCGATGGCTTCCATCTgcg < 2:5444194/150‑1 (MQ=255)
cGGCGCGAACTTCAGCGGGTTGTTCTGCACCGGCTGGATCATTGTCTGCGCCATGCGGAACTCGCCCTTCAGGCTGGCCCGCGCGCGCAGCACGTCCACCAGTCCTTCCACCAGGCCGCGATAGCTGCGGCCGATGGCTTCCATCTGCGCt < 1:8023833/151‑1 (MQ=255)
cGGCGCGAACTTCAGCGGGTTGTTCTGCACCGGCTGGATCATGGTCTGCGCCATGCGGAACTCGCCCTTCAGGCTGGCCCGCGCGCGCAGCACGTCCACCAGTCCTTCCACCAGGCCGCGATAGCTGCGGCCGATGGCTTCCATCTGCGCt < 2:11081392/151‑1 (MQ=255)
gcgcGAACTTCAGCGGGTTGTTCTGCACCGGCTGGATCATGGTCTGCGCCATGCGGAACTCGCCCTTCAGGCTGGCCCGCGCGCGCAGCACGTCCACCAGTCCTTCCACCAGGCCGCGATAGCTGCGGCCGATGGCTTCCATCTGCGCTTc < 2:10347389/151‑1 (MQ=255)
gcgcGAACTTCAGCGGGTTGTTCTGCACCGGCTGGATCATGGTCTGCGCCATGCGGAACTCGCCCTTCAGGCTGGCCCGCGCGCGCAGCACGTCCACCAGTCCTTCCACCAGGCCGCGATAGCTGCGGCCGATGGCTTCCATCTGCGCTTc < 2:8546793/151‑1 (MQ=255)
cgcgAACTTCAGCGGGTTGTTCTGCACCGGCTGGATCATGGTCTGCGCCATGCGGAACTCGCCCTTCAGGCTGGCCCGCGCGCGCAGCACGTCCACCAGTCCTTCCACCAGGCCGCGATAGCTGCGGCCGATGGCTTCCATCTGCGCTTCg < 1:1686366/151‑1 (MQ=255)
cgcgAACTTCAGCGGGTTGTTCTGCACCGGCTGGATCATGGTCTGCGCCATGCGGAACTCGCCCTTCAGGCTGGCCCGCGCGCGCAGCACGTCCACCAGTCCTTCCACCAGGCCGCGATAGCTGCGGCCGATGGCTTCCATCTGCGCTTCg > 1:7512659/1‑151 (MQ=255)
gAACTTCAGCGGGTTGTTCTGCACCGGCTGGATCATGGTCTGCGCCATGCGGAACTCGCCCTTCAGGCTGGCCCGCGCGCGCAGCACGTCCACCAGTCCTTCCACCAGGCCGCGATAGCTGCGGCCGATGGCTTCCATCTGCGCTTCGgcg > 1:10058328/1‑151 (MQ=255)
gAACTTCAGCGGGTTGTTCTGCACCGGCTGGATCATGGTCTGCGCCATGCGGAACTCGCCCTTCAGGCTGGCCCGCGCGCGCAGCACGTCCACCAGTCCTTCCACCAGGCCGCGATAGCTGCGGCCGATGGCTTCCATCTGCGCTTCGgcg > 1:8705114/1‑151 (MQ=255)
aaCTTCAGCGGGTTGTTCTGCACCGGCTGGATCATGGTCTGCGCCATGCGGAACTCGCCCGTCAGGCTGGCCCGCGCGCGCAGCACGTCCACCAGTCCTTCCACCCGGCCGCGATAGCTGCGGCCGATGGCTTCCATCTGCGCTTCGgcgc < 1:2181279/151‑1 (MQ=255)
cTTCAGCGGGTTGTTCTGCACCGGCTGGATCATGGTCTGCGCCATGCGGAACTCGCCCTTCAGGCTGGCCCGCGCGCGCAGCACGTCCACCAGTCCTTCCACCAGGCCGCGATAGCTGCGGCCGATGGCTTCCATCTGCGCTTCGGCgccg < 1:782095/151‑1 (MQ=255)
cTTCAGCGGGTTGTTCTGCACCGGCTGGATCATGGTCTGCGCCATGCGGAACTCGCCCTTCAGGCTGGCCCGCGCGCGCAGCACGTCCACCAGTCCTTCCACCAGGCCGCGATAGCTGCGGCCGATGGCTTCCATCTGCGCTTCGGCgccg > 2:2354957/1‑151 (MQ=255)
ttCAGCGGGTTGTTCTGCACCGGCTGGATCATGGTCTGCGCCATGCGGAACTCGCCCTTCAGGCTGGCCCGCGCGCGCAGCACGTCCACCAGTCCTTCCACCAGGCCGCGATAGCTGCGGCCGATGGCTTCCATCTGCGCTTCGGCgccgg < 1:8074274/151‑1 (MQ=255)
tCAGCGGGTTGTTCTGCACCGGCTGGATCATGGTCTGCGCCATGCGGAACTCGCCCTTCAGGCTGGCCCGCGCGCGCAGCACGTCCACCAGTCCTTCCACCAGGCCGCGATAGCTGCGGCCGATGGCTTCCATCTGCGCTTCGGCgccggc < 2:6327555/151‑1 (MQ=255)
aGCGGGTTGTTCTGCACCGGCTGGATCATGGTCTGCGCCATGCGGAACTCGCCCTTCAGGCTGGCCCGCGCGCGCAGCACGTCCACCAGTCCTTCCACCAGGCCGCGATAGCTGCGGCCGATGGCTTCCATCTGCGCTTCGGCgccggccg > 1:4305383/1‑151 (MQ=255)
aGCGGGTTGTTCTGCACCGGCTGGATCATGGTCTGCGCCATGCGGAACTCGCCCTTCAGGCTGGCCCGCGCGCGCAGCACGTCCACCAGTCCTTCCACCAGGCCGCGATAGCTGCGGCCGATGGCTTCCATCTGCGCTTCGGCgccggccg < 1:8346873/151‑1 (MQ=255)
aGCGGGTTGTTCTGCACCGGCTGGATCATGGTCTGCGCCATGCGGAACTCGCCCTTCAGGCCGGCCCGCGCGCGCAGCACGTCCACCAGTCCTTCCACCAGGCCGCGATAGCTGCGGCCGATGGCTTCCATCTGCGCTTCGGCgccggccg < 2:649186/151‑1 (MQ=255)
cGGGTTGTTCTGCACCGGCTGGATCATGGTCTGCGCCATGCGGAACTCGCCCTTCAGGCTGGCCCGCGCGCGCAGCACGTCCACCAGTCCTTCCACCAGGCCGCGATAGCTGCGGCCGATGGCTTCCATCTGCGCTTCGGCGCCGGCCggg > 2:5691997/1‑151 (MQ=255)
cGGGTTGTTCTGCACCGGCTGGATCATGGTCTGCGCCATGCGGAACTCGCCCTTCAGGCTGGCCCGCGCGCGCAGCACGTCCACCAGTCCTTCCACCAGGCCGCGATAGCTGCGGCCGATGGCTTCCATCTGCGCTTCGGCGCCGGCCggg < 1:9707798/151‑1 (MQ=255)
ggTTGTTCTGCACCGGCTGGATCATGGTCTGCGCCATGCGGAACTCGCCCTTCAGGCTGGCCCGCGCGCGCAGCACGTCCACCAGTCCTTCCACCAGGCCGCGATAGCTGCGGCCGATGGCTTCCATCTGCGCTTCGGCGCCGGCCGGGTc < 2:10675021/151‑1 (MQ=255)
ggTTGTTCTGCACCGGCTGGATCATGGTCTGCGCCATGCGGAACTCGCCCTTCAGGCTGGCCCGCGCGCGCAGCACGTCCACCAGTCCTTCCACCAGGCCGCGATAGCTGCGGCCGATGGCTTCCATCTGCGCTTCGGCGCCGGCCGGGTc < 2:3908742/151‑1 (MQ=255)
gttgttCTGCACCGGCTGGATCATGGTCTGCGCCATGCGGAACTCGCCCTTCAGGCTGGCCCGCGCGCGCAGCACGTCCACCAGTCCTTCCACCAGGCCGCGATAGCTGCGGCCGATGGCTTCCATCTGCGCTTCGGCGCCGGCCGGGTCg > 2:7282680/1‑151 (MQ=255)
tCTGCACCGGCTGGATCATGGTCTGCGCCATGCGGAACTCGCCCTTCAGGCTGGCCCGCGCGCGCAGCACGTCCACCAGTCCTTCCACCAGGCCGCGATAGCTGCGGCCGATGGCTTCCATCTGCGCTTCGGCGCCGGCCGGGTCGACCtt > 1:5264719/1‑151 (MQ=255)
caccGGCTGGATCATGGTCTGCGCCATGCGGAACTCGCCCTTCAGGCTGGCCCGCGCGCGCAGCACGTCCACCAGTCCTTCCACCAGGCCGCGATAGCTGCGGCCGATGGCTTCCATCTGCGCTTCGGCGCCGGCCGGGTCGACCTTC‑aac > 1:2248345/1‑149 (MQ=255)
ggCTGGATCATGGTCTGCGCCATGCGGAACTCGCCCTTCAGGCTGGCCCGCGCGCGCAGCACGTCCACCAGTCCTTCCACCAGGCCGCGATAGCTGCGGCCGATGGCTTCCATCTGCGCTTCGGCGCCGGCCGGGTCGACCTTCAA‑CTggg > 1:4527184/1‑151 (MQ=255)
cTGGATCATGGTCTGCGCCATGCGGAACTCGCCCTTCAGGCTGGCCCGCGCGCGCAGCACGTCCACCAGTCCTTCCACCAGGCCGCGATAGCTGCGGCCGATGGCTTCCATCTGCGCTTCGGCGCCGGCCGGGTCGACCTTCAA‑CTGGGTc > 2:1469290/1‑151 (MQ=255)
tGGATCATGGTCTGCGCCATGCGGAACTCGCCCTTCAGGCTGGCCCGCGCGCGCAGCACGTCCACCAGTCCTTCCACCAGGCCGCGATAGCTGCGGCCGATGGCTTCCATCTGCGCTTCGGCGCCGGCCGGGTCGACCTTCAA‑CTGGGTCa > 2:10100457/1‑151 (MQ=255)
tGGATCATGGTCTGCGCCATGCGGAACTCGCCCTTCAGGCTGGCCCGCGCGCGCAGCACGTCCACCAGTCCTTCCACCAGGCCGCGATAGCTGCGGCCGATGGCTTCCATCTGCGCTTCGGCGCCGGCCGGGTCGACCTTCAA‑CTGGGTCa > 2:4478899/1‑151 (MQ=255)
ggATCATGGTCTGCGCCATGCGGAACTCGCCCTTCAGGCTGGCCCGCGCGCGCAGCACGTCCACCAGTCCTTCCACCAGGCCGCGATAGCTGCGGCCGATGGCTTCCATCTGCGCTTCGGCGCCGGCCGGGTCGACCTTCAA‑CTGGGTCAt < 1:2441967/151‑1 (MQ=255)
ggATCATGGTCTGCGCCATGCGGAACTCGCCCTTCAGGCTGGCCCGCGCGCGCAGCACGTCCACCAGTCCTTCCACCAGGCCGCGATAGCTGCGGCCGATGGCTTCCATCTGCGCTTCGGCGCCGGCCGGGTCGACCTTCAA‑CTGGGTCAt < 1:1920125/151‑1 (MQ=255)
gATCATGGTCTGCGCCATGCGGAACTCGCCCTTCAGGCTGGCCCGCGCGCGCAGCACGTCCACCAGTCCTTCCACCAGGCCGCGATAGCTGCGGCCGATGGCTTCCATCTGCGCTTCGGCGCCGGCCGGGTCGACCTTCAA‑CTGGGTCATg < 1:1016588/151‑1 (MQ=255)
gATCATGGTCTGCGCCATGCGGAACTCGCCCTTCAGGCTGGCCCGCGCGCGCAGCACGTCCACCAGTCCTTCCACCAGGCCGCGATAGCTGCGGCCGATGGCTTCCATCTGCGCTTCGGCGCCGGCCGGGTCGACCTTCAA‑CTGGGTCATg < 2:7962035/151‑1 (MQ=255)
tGGTCTGCGCCATGCGGAACTCGCCCTTCAGGCTGGCCCGCGCGCGCAGCACGTCCACCAGTCCTTCCACCAGGCCGCGATAGCTGCGGCCGATGGCTTCCATCTGCGCTTCGGCGCCGGCCGGGTCGACCTTCAA‑CTGGGTCATGCCGgc < 1:2549636/151‑1 (MQ=255)
gcCATGCGGAACTCGCCCTTCAGGCTGGCCCGCGCGCGCAGCACGTCCACCAGTCCTTCCACCAGGCCGCGATAGCTGCGGCCGATGGCTTCCATCTGCGCTTCGGCGCCGGCCGGGTCGACCTTCAA‑CTGGGTCATGCCGGCGCCgcgcc > 2:4976945/1‑150 (MQ=255)
gcCATGCGGAACTCGCCCTTCAGGCTGGCCCGCGCGCGCAGCACGTCCACCAGTCCTTCCACCAGGCCGCGATAGCTGCGGCCGATGGCTTCCATCTGCGCTTCGGCGCCGGCCGGGTCGACCTTCAA‑CTGGGTCATGCCGGCGCCGCGCa > 1:4808949/1‑151 (MQ=255)
aTGCGGAACTCGCCCTTCAGGCTGGCCCGCGCGCGCAGCACGTCCACCAGTCCTTCCACCAGGCCGCGATAGCTGCGGCCGATGGCTTCCATCTGCGCTTCGGCGCCGGCCGGGTCGACCTTCAA‑CTGGGTCATGCCGGCGCCGCGCAGGa > 2:3675903/1‑151 (MQ=255)
aTGCGGAACTCGCCCTTCAGGCTGGCCCGCGCGCGCAGCACGTCCACCAGTCCTTCCACCAGGCCGCGATAGCTGCGGCCGATGGCTTCCATCTGCGCTTCGGCGCCGGCCGGGTCGACCTTCAA‑CTGGGTCATGCCGGCGCCGCGCAGGa < 1:5578869/151‑1 (MQ=255)
aTGCGGAACTCGCCCTTCAGGCTGGCCCGCGCGCGCAGCACGTCCACCAGTCCTTCCACCAGGCCGCGATAGCTGCGGCCGATGGCTTCCATCTGCGCTTCGGCGCCGGCCGGGTCGACCTTCAA‑CTGGGTCATGCCGGCGCCGCGCAGGa < 2:6943916/151‑1 (MQ=255)
tGCGGAACTCGCCCTTCAGGCTGGCCCGCGCGCGCAGCACGTCCACCAGTCCTTCCACCAGGCCGCGATAGCTGCGGCCGATGGCTTCCATCTGCGCTTCGGCGCCGGCCGGGTCGACCTTCAA‑CTGGGTCATGCCGGCGCCGCGCAGGaa > 1:2620064/1‑151 (MQ=255)
ggAACTCGCCCTTCAGGCTGGCCCGCGCGCGCAGCACGTCCACCAGTCCTTCCACCAGGCCGCGATAGCTGCGGCCGATGGCTTCCATCTGCGCTTCGGCGCCGGCCGGGTCGACCTTCAA‑CTGGGTCATGCCGGCGCCGCGCAGGAACGc < 1:5179891/151‑1 (MQ=255)
gAACTCGCCCTTCAGGCTGGCCCGCGCGCGCAGCACGTCCACCAGTCCTTCCACCAGGCCGCGATAGCTGCGGCCGATGGCTTCCATCTGCGCTTCGGCGCCGGCCGGGTCGACCTTCAA‑CTGGGTCATGCCGGCGCCGCGCAGGAACGcc > 2:7559845/1‑151 (MQ=255)
gAACTCGCCCTTCAGGCTGGCCCGCGCGCGCAGCACGTCCACCAGTCCTTCCACCAGGCCGCGATAGCTGCGGCCGATGGCTTCCATCTGCGCTTCGGCGCCGGCCGGGTCGACCTTCAA‑CTGGGTCATGCCGGCGCCGCGCAGGAACGcc > 2:10882156/1‑151 (MQ=255)
aaCTCGCCCTTCAGGCTGGCCCGCGCGCGCAGCACGTCCACCAGTCCTTCCACCAGGCCGCGATAGCTGCGGCCGATGGCTTCCATCTGCGCTTCGGCGCCGGCCGGGTCGACCTTCAA‑CTGGGTCATGCCGGCGCCGCGCAGGAACGCCt > 1:3990845/1‑151 (MQ=255)
gCCCTTCAGGCTGGCCCGCGCGCGCAGCACGTCCACCAGTCCTTCCACCAGGCCGCGATAGCTGCGGCCGATGGCTTCCATCTGCGCTTCGGCGCCGGCCGGGTCGACCTTCAA‑CTGGGTCATGCCGGCGCCGCGCAGGAACGCCTgcagc < 2:2560336/151‑1 (MQ=255)
gCCCTTCAGGCTGGCCCGCGCGCGCAGCACGTCCACCAGTCCTTCCACCAGGCCGCGATAGCTGCGGCCGATGGCTTCCATCTGCGCTTCGGCGCCGGCCGGGTCGACCTTCAA‑CTGGGTCATGCCGGCGCCGCGCAGGAACGCCTgcagc > 1:1335304/1‑151 (MQ=255)
gCCCTTCAGGCTGGCCCGCGCGCGCAGCACGTCCACCAGTCCTTCCACCAGGCCGCGATAGCTGCGGCCGATGGCTTCCATCTGCGCTTCGGCGCCGGCCGGGTCGACCTTCAA‑CTGGGTCATGCCGGCGCCGCGCAGGAACGCCTgcagc > 1:7105978/1‑151 (MQ=255)
cccTTCAGGCTGGCCCGCGCGCGCAGCACGTCCACCAGTCCTTCCACCAGGCCGCGATAGCTGCGGCCGATGGCTTCCATCTGCGCTTCGGCGCCGGCCGGGTCGACCTTCAA‑CTGGGTCATGCCGGCGCCGCGCAGGAACGCCTgcagca < 1:6489789/151‑1 (MQ=255)
ccTTCAGGCTGGCCCGCGCGCGCAGCACGTCCACCAGTCCTTCCACCAGGCCGCGATAGCTGCGGCCGATGGCTTCCATCTGCGCTTCGGCGCCGGCCGGGTCGACCTTCAA‑CTGGGTCATGCCGGCGCCGCGCAGGAACGCCTGcagcag < 2:8726941/151‑1 (MQ=255)
ccTTCAGGCTGGCCCGCGCGCGCAGCACGTCCACCAGTCCTTCCACCAGGCCGCGATAGCTGCGGCCGATGGCTTCCATCTGCGCTTCGGCGCCGGCCGGGTCGACCTTCAA‑CTGGGTCATGCCGGCGCCGCGCAGGAACGCCTGcagcag > 1:1406896/1‑151 (MQ=255)
cTTCAGGCTGGCCCGCGCGCGCAGCACGTCCACCAGTCCTTCCACCAGGCCGCGATAGCTGCGGCCGATGGCTTCCATCTGCGCTTCGGCGCCGGCCGGGTCGACCTTCAA‑CTGGGTCATGCCGGCGCCGCGCAGGAACGCCTGCAGCAgg < 1:6730397/151‑1 (MQ=255)
tCAGGCTGGCCCGCGCGCGCAGCACGTCCACCAGTCCTTCCACCAGGCCGCGATAGCTGCGGCCGATGGCTTCCATCTGCGCTTCGGCGCCGGCCGGGTCGACCTTCAA‑CTGGGTCATGCCGGCGCCGCGCAGGAACGCCTGCAGCAGGTc < 1:984565/151‑1 (MQ=255)
aGGCTGGCCCGCGCGCGCAGCACGTCCACCAGTCCTTCCACCAGGCCGCGATAGCTGCGGCCGATGGCTTCCATCTGCGCTTCGGCGCCGGCCGGGTCGACCTTCAA‑CTGGGTCATGCCGGCGCCGCGCAGGAACGCCTGCAGCAGGTcgc < 1:5007542/151‑1 (MQ=255)
ctggcccgcgcgcgcAGCACGTCCACCAGTCCTTCCACCAGGCCGCGATAGCTGCGGCCGATGGCTTCCATCTGCGCTTCGGCGCCGGCCGGGTCGACCTTCAA‑CTGGGTCATGCCGGCGCCGCGCAGGAACGCCTGCAGCAGGTcgccgc > 2:10195764/8‑151 (MQ=255)
tggcccgcgcgcgcAGCACGTCCACCAGTCCTTCCACCAGGCCGCGATAGCTGCGGCCGATGGCTTCCATCTGCGCTTCGGCGCCGGCCGGGTCGACCTTCAA‑CTGGGTCATGCCGGCGCCGCGCAGGAACGCCTGCAGCAGGTCgccgcc > 1:8577853/7‑151 (MQ=255)
gcccgcgcgcgcAGCACGTCCACCAGTCCTTCCACCAGGCCGCGATAGCTGCGGCCGATGGCTTCCATCTGCGCTTCGGCGCCGGCCGGGTCGACCTTCAA‑CTGGGTCATGCCGGCGCCGCGCAGGAACGCCTGCAGCAGGTCGCCgccgg < 2:2078068/147‑1 (MQ=255)
ccgcgcgcgcAGCACGTCCACCAGTCCTTCCACCAGGCCGCGATAGCTGCGGCCGATGGCTTCCATCTGCGCTTCGGCGCCGGCCGGGTCGACCTTCAA‑CTGGGTCATGCCGGCGCCGCGCAGGAACGCCTGCAGCAGGTCGCCgccggcc > 2:785931/3‑151 (MQ=255)
gcgcgcgcAGCACGTCCACCAGTCCTTCCACCAGGCCGCGATAGCTGCGGCCGATGGCTTCCATCTGCGCTTCGGCGCCGGCCGGGTCGACCTTCAA‑CTGGGTCATGCCGGCGCCGCGCAGGAACGCCTGCAGCAGGTCGCCGCCGGCCGt < 2:9314271/151‑1 (MQ=255)
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CGAACTTCAGCGGGTTGTTCTGCACCGGCTGGATCATGGTCTGCGCCATGCGGAACTCGCCCTTCAGGCTGGCCCGCGCGCGCAGCACGTCCACCAGTCCTTCCACCAGGCCGCGATAGCTGCGGCCGATGGCTTCCATCTGCGCTTCGGC < SRR18135093.10126713/151‑1 (MQ=60)
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TCGCCCTTCAGGCTGGCCCGCGCGCGCAGCACGTCCACCAGTCCTTCCACCAGGCCGCGATAGCTGCGGCCGATGGCTTCCATCTGCGCTTCGGCGCCGGCCGGGTCGACCTTCAACTGGGTCATGCCGGCGCCGCGCAGGAACGCCTGCA > SRR18135093.9700113/1‑151 (MQ=60)
TCGCCCTTCAGGCTGGCCCGCGCGCGCAGCACGTCCACCAGTCCTTCCACCACGCCGCGATAGCTGCGGCCGATGGCTTCCATCTGCGCTTCGGCGCCGGCCGGGTCGACCTTCAACTGGGTCATGCCGGCGCCGCGCAGGAACGCCTGCA < SRR18135093.5790768/151‑1 (MQ=60)
GCCCTTCAGGCTGGCCCGCGCGCGCAGCACGTCCACCAGTCCTTCCACCAGGCCGCGATAGCTGCGGCCGATGGCTTCCATCTGCGCTTCGGCGCCGGCCGGGTCGACCTTCAACTGGGTCATGCCGGCGCCGCGCAGGAACGCCTGCAGC > SRR18135093.7138518/1‑151 (MQ=60)
CCCTTCAGGCTGGCCCGCGCGCGCAGCACGTCCACCAGTCCTTCCACCAGGCCGCGATAGCTGCGGCCGATGGCTTCCATCTGCGCTTCGGCGCCGGCCGGGTCGACCTTCAACTGGGTCATGCCGGCGCCGCGCAGGAACGCCTGCAGCA < SRR18135093.6519767/151‑1 (MQ=60)
CCTTCAGGCTGGCCCGCGCGCGCAGCACGTCCACCAGTCCTTCCACCAGGCCGCGATAGCTGCGGCCGATGGCTTCCATCTGCGCTTCGGCGCCGGCCGGGTCGACCTTCAACTGGGTCATGCCGGCGCCGCGCAGGAACGCCTGCAGCAG > SRR18135093.2207919/1‑151 (MQ=60)
CCTTCAGGCTGGCCCGCGCGCGCAGCACGTCCACCAGTCCTTCCACCAGGCCGCGATAGCTGCGGCCGATGGCTTCCATCTGCGCTTCGGCGCCGGCCGGGTCGACCTTCAACTGGGTCATGCCGGCGCCGCGCAGGAACGCCTGCAGCAG > SRR18135093.1413591/1‑151 (MQ=60)
ctacaggctggcccgcgcGCGCAGCACGTCCACCAGTCCTTCCACCAGGCCGCGATAGCTGCGGCCGATGGCTTCCATCTGCGCTTCGGCGCCGGCCGGGTCGACCTTCAACTGGGTCATGCCGGCGCCGCGCAGGAACGCCTGCAGCAGG < SRR18135093.8241760/133‑1 (MQ=60)
TCAGGCTGGCCCGCGCGCGCAGCACGTCCACCAGTCCTTCCACCAGGCCGCGATAGCTGCGGCCGATGGCTTCCATCTGCGCTTCGGCGCCGGCCGGGTCGACCTTCAACTGGGTCATGCCGGCGCCGCGCAGGAACGCCTGCAGCAGGTC < SRR18135093.989288/151‑1 (MQ=60)
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ggctggcccgcgcGCGCAGCACGTCCACCAGTCCTTCCACCAGGCCGCGATAGCTGCGGCCGATGGCTTCCATCTGCGCTTCGGCGCCGGCCGGGTCGACCTTCAACTGGGTCATGCCGGCGCCGCGCAGGAACGCCTGCAGCAGGTCGCC < SRR18135093.9868953/138‑1 (MQ=60)
ggctggcccgcgcGCGCAGCACGTCCACCAGTCCTTCCACCAGGCCGCGATAGCTGCGGCCGATGGCTTCCATCTGCGCTTCGGCGCCGGCCGGGTCGACCGTCAACTGGGTCATGCCGGCGCCGCGCAGGAACGCCTGCAGCAGGTCGCC > SRR18135093.11095540/14‑151 (MQ=60)
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tggcccgcgcGCGCAGCACGTCCACCAGTCCTTCCACCAGGCCGCGATAGCTGCGGCCGATGGCTTCCATCTGCGCTTCGGCGCCGGCCGGGTCGACCTTCAACTGGGTCATGCCGGCGCCGCGCAGGAACGCCTGCAGCAGGTCGCCGCC > SRR18135093.8599529/11‑151 (MQ=60)
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CCGCGCGCGCAGCACGTCCACCAGTCCTTCCACCAGGCCGCGATAGCTGCGGCCGATGGCTTCCATCTGCGCTTCGGCGCCGGCCGGGTCGACCTTCAACTGGGTCATGCCGGCGCCGCGCAGGAACGCCTGCAGCAGGTCGCCGCCGGCC < SRR18135093.2403276/151‑1 (MQ=60)
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CAGGCCGCGATAGCTGCGGCCGATGGCTTCCATCTGCGCTTCGGCGCCGGCCGGGTCGACCTTCAACTGGGTCATGCCGGCGCCGCGCAGGAACGCCTGCAGCAGGTCGCCGCCGGCCGTCGCGGCGGCGCTTGCCGGGGGCGTCGGCGCC < SRR18135093.2115368/151‑1 (MQ=60)
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GCAGCAGGAGCAGCATGGCTTCGTCGACGTTCGGCGCGAACTTCAGCGGGTTGTTCTGCACAGGCTGGATCATGGTCTGCGCCATGCGGAACTCGCCCTTCAGGTTGTCCAGCGTGCGCAGCACGTCCACCAGTCCTTCCACCAGACAGCGATAGGTGCGTCGGATGGCTTCCATCTGCGCTTCGGCGCCGGCCGGGTCGACCTTC‑ACTGGGTCATGCCGGCGCCGCGCAGGAACGCCTGCAGCAGGTCGCCGCCGGCCGTCGCGGCGGCGCTTGCCGGGGGCGTCGGCGCCGCCAC > NC_008463/96246‑96542
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 0 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |