Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A3 F1 I1 R1
|
256 |
517.8 |
22465524 |
99.2% |
22285799 |
151.0 |
Breseq alignment
BRESEQ :: Evidence
|
| evidence |
seq id |
position |
mutation |
annotation |
gene |
description |
| RA |
NC_008463 |
757,697 |
A→T |
Q678L (CAG→CTG) |
fusA → |
elongation factor G |
|
| |
seq id |
position |
ref |
new |
freq |
score (cons/poly) |
reads |
annotation |
genes |
product |
| * | NC_008463 | 757,697 | 0 | A | T | 99.5%
| 1777.6
/ NA
| 416 | Q678L (CAG→CTG) | fusA | elongation factor G |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (1/0); major base T (179/234); minor base G (1/1); total (181/235) |
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 |
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 |
Only 100 of 416 total aligned reads displayed.
GACTACATGGGTGACGTGATGGGCGACCTGAACCGTCGTCGTGGTCTGATTCAGGGGATGGAGGACACGGTTTCCGGTAAGGTTATTCGTGCCGAGGTTCCGCTGGGTGAGATGTTCGGTTATGCGACCGACGTGCGTTCCATGTCCCAGGGTCGCGCGAGCTACTCCATGGAATTCTCCAAATACGCCGAAGCTCCGTCGAACATCGTCGAAGCGCTGGTTAAAAAACAAGGTTGATTCAGCCCTTTAAGTAAGAGGTTTACTGTCGTGGCTAAGGAAAAATTCGAACGTAACAA > NC_008463/757549‑757844
|
tACATGGGTGACGTGATGGGCGACCTGAACCGTCGTCGTGGTCTGATTCAGGGGATGGAGGACACGGTTTCCGGTAAGGTTATTCGTGCCGAGGTTCCGCTGGGTGAGATGTTCGGTTATGCGACCGACGTGCGTTCCATGTCCCTGGGTc < 1:923743/151‑1 (MQ=255)
cATGGGTGACGTGATGGGCGACCTGAACCGTCGTCGTGGTCTGATTCAGGGGATGGAGGACACGGTTTCCGGTAAGGTTATTCGTGCCGAGGTTCCGCTGGGTGAGATGTTCGGTTATGCGACCGACGTGCGTTCCATGTCCCTGGGTcgc > 2:5033862/1‑151 (MQ=255)
gACGTGATGGGCGACCTGAACCGTCGTCGTGGTCTGATTCAGGGGATGGAGGACACGGTTTCCGGTAAGGTTATTCGTGCCGAGGTTCCGCTGGGTGAGATGTTCGGTTATGCGACCGACGTGCGTTCCATGTCCCTGGGTCGCGCGAGCt < 2:1679946/151‑1 (MQ=255)
gATGGGCGACCTGAACCGTCGTCGTGGTCTGATTCAGGGGATGGAGGACACGGTTTCCGGTAAGGTTATTCGTGCCGAGGTTCCGCTGGGTGAGATGTTCGGTTATGCGACCGACGTGCGTTCCATGTCCCTGGGTCGCGCGAGCTACTcc < 1:10363074/151‑1 (MQ=255)
aTGGGCGACCTGAACCGTCGTCGTGGTCTGATTCAGGGGATGGAGGACTCGGTTTCCGGTAAGGTTATTCGTGCAGAGGTTCCGCTGGGTGAGATGTTCGGTTATGCGACCGACGTGCGTTCCATGTCCCTGGGTCGCGCGAGCTACTCCa < 2:193381/151‑1 (MQ=255)
gggCGACCTGAACCGTCGTCGTGGTCTGATTCAGGGGATGGAGGACACGGTTTCCGGTAAGGTTATTCGTGCCGAGGTTCCGCTGGGTGAGATGTTCGGTTATGCGACCGACGTGCGTTCCATGTCCCTGGGTCGCGCGAGCTACTCCATg < 1:11105860/151‑1 (MQ=255)
gCGACCTGAACCGTCGTCGTGGTCTGATTCAGGGGATGGAGGACACGGTTTCCGGTAAGGTTATTCGTGCCGAGGTTCCGCTGGGTGAGATGTTCGGTTATGCGACCGACGTGCGTTCCATGTCCCTGGGTCGCGCGAGCTACTCCATGGa < 2:5348457/151‑1 (MQ=255)
cGACCTGAACCGTCGTCGTGGTCTGATTCAGGGGATGGAGGACACGGTTTCCGGTAAGGTTATTCGTGCCGAGGTTCCGCTGGGTGAGATGTTCGGTTATGCGACCGACGTGCGTTCCATGTCCCTGGGTCGCGCGAGCTACTCCATGGaa > 2:3240814/1‑151 (MQ=255)
cGACCTGAACCGTCGTCGTGGTCTGATTCAGGGGATGGAGGACACGGTTTCCGGTAAGGTTATTCGTGCCGAGGTTCCGCTGGGTGAGATGTTCGGTTATGCGACCGACGTGCGTTCCATGTCCCTGGGTCGCGCGAGCTACTCCATGGaa < 1:5507664/151‑1 (MQ=255)
ccTGAACCGTCGTCGTGGTCTGATTCAGGGGATGGAGGACACGGTTTCCGGTCAGGTTATTCGTGCCGAGGTTCCGCTGGGTGAGATGTTCGGTTATGCGACCGACGTGCGTTCCATGTCCCTGGGTCGCGCGAGCTACTCCATGGAATtc > 1:570148/1‑151 (MQ=255)
ccTGAACCGTCGTCGTGGTCTGATTCAGGGGATGGAGGACACGGTTTCCGGTAAGGTTATTCGTGCCGAGGTTCCGCTGGGTGAGATGTTCGGTTATGCGACCGACGTGCGTTCCATGTCCCTGGGTCGCGCGAGCTACTCCATGGAATtc > 1:4824278/1‑151 (MQ=255)
ccTGAACCGTCGTCGTGGTCTGATTCAGGGGATGGAGGACACGGTTTCCGGTAAGGTTATTCGTGCCGAGGTTCCGCTGGGTGAGATGTTCGGTTATGCGACCGACGTGCGTTCCATGTCCCTGGGTCGCGCGAGCTACTCCATGGAATtc > 1:8699598/1‑151 (MQ=255)
ccTGAACCGTCGTCGTGGTCTGATTCAGGGGATGGAGGACACGGTGTCCGGTAAGGTTATTCGTGCCGAGGTTCCGCTGGGTGAGATGTTCGGTTATGCGACCGACGTGCGTTCCATGTCCCTGGGTCGCGCGAGCTACTCCATGGAATtc < 2:7718713/151‑1 (MQ=255)
gAACCGTCGTCGTGGTCTGATTCAGGGGATGGAGGACACGGTTTCCGGTAAGGTTATTCGTGCCGAGGTTCCGCTGGGTGAGATGTTCGGTTATGCGACCGACGTGCGTTCCATGTCCCTGGGTCGCGCGAGCTACTCCATGGAATTCTcc > 1:10850153/1‑151 (MQ=255)
aaCCGTCGTCGTGGTCTGATTCAGGGGATGGAGGACACGGTTTCCGGTAAGGTTATTCGTGCCGAGGTTCCGCTGGGTGAGATGTTCGGTTATGCGACCGACGTGCGTTCCATGTCCCTGGGTCGCGCGAGCTACTCCATGGAATTCTCCa > 2:9409839/1‑151 (MQ=255)
aCCGTCGTCGTGGTCTGATTCAGGGGATGGAGGACACGGTTTCCGGTAAGGTTATTCGTGCCGAGGTTCCGCTGGGTGAGATGTTCGGTTATGCGACCGACGTGCGTTCCATGTCCCTGGGTCGCGCGAGCTACTCCATGGAATTCTCCaa < 1:1205770/151‑1 (MQ=255)
ccGTCGTCGTGGTCTGATTCAGGGGATGGAGGACACGGTTTCCGGTAAGGTTATTCGTGCCGAGGTTCCGCTGGGTGAGATGTTCGGTTATGCGACCGACGTGCGTTCCATGTCCCTGGGTCGCGCGAGCTACTCCATGGAATTCTCCaaa < 2:7973239/151‑1 (MQ=255)
cgtcgtGGTCTGATTCAGGGGATGGAGGACACGGTTTCCGGTAAGGTTATTCGTGCCGAGGTTCCGCTGGGTGAGATGTTCGGTTATGCGACCGACGTGCGTTCCATGTCCCTGGGTCGCGCGAGCTACTCCATGGAATTCTCCAAATACg > 2:6203445/1‑151 (MQ=255)
gtcgtGGTCTGATTCAGGGGATGGAGGACACGGTTTCCGGTAAGGTTATTCGTGCCGAGGTTCCGCTGGGTGAGATGTTCGGTTATGCGACCGACGTGCGTTCCATGTCCCTGGGTCGCGCGAGCTACTCCATGGAATTCTCCAAATACGc > 2:10930634/1‑151 (MQ=255)
cgtGGTCTGATTCAGGGGATGGAGGACACGGTTTCCGGTAAGGTTATTCGTGCCGAGGTTCCGCTGGGTGAGATGTTCGGTTATGCGACCGACGTGCGTTCCATGTCCCTGGGTCGCGCGAGCTACTCCATGGAATTCTCCAAATACGCCg < 2:6398390/151‑1 (MQ=255)
gtGGTCTGATTCAGGGGATGGAGGACACGGTTTCCGGTAAGGTTATTCGTGCCGAGGTTCCGCTGGGTGCGATGTTCGGTTATGCGACCGACGTGCGTTCCATGTCCCTGGGTCGCGCGAGCTACTCCATGGAATTCTCCAAATACGCCGa < 2:10677326/151‑1 (MQ=255)
gtGGTCTGATTCAGGGGATGGAGGACACGGTTTCCGGTAAGGTTATTCGTGCCGAGGTTCCGCTGGGTGAGATGTTCGGTTATGCGACCGACGTGCGTTCCATGTCCCTGGGTCGCGCGAGCTACTCCATGGAATTCTCCAAATACGCCGa > 1:3411238/1‑151 (MQ=255)
gTCTGATTCAGGGGATGGTGGACACGGTTTCCTGTAAGGTGATTCGTGCCGAGGTTCCGCTGGGTGAGATGTTCGGTTATGCGACAGACGTGCGTTCCATGTCCCTGGGTCGCGCGAGCTACTCCATGGAATTCTCCAAATACGCCGAAGc < 2:8857187/151‑1 (MQ=255)
tCTGATTCAGGGGATGGAGGACACGGTTTCCGGTAAGGTTATTCGTGCCGAGGTTCCGCTGGGTGAGATGTTCGGTTATGCGACCGACGTGCGTTCCATGTCCCTGGGTCGCGCGAGCTACTCCATGGAATTCTCCAAATACGCCGAAGCt > 2:9156993/1‑151 (MQ=255)
tGATTCAGGGGATGGAGGACACGGTTTCCGGTAAGGTTATTCGTGCCGAGGTTCCGCTGGGTGAGATGTTCGGTTATGCGACCGACGTGCGTTCCATGTCCCTGGGTCGCGCGAGCTACTCCATGGAATTCTCCAAATACGCCGAAGCTcc < 1:9643938/151‑1 (MQ=255)
gATTCAGGGGATGGAGGACACGGTTTCCGGTAAGGTTATTCGTGCCGAGGTTCCGCTGGGTGAGATGTTCGGTTATGCGACCGACGTGCGTTCCATGTCCCTGGGTCGCGCGAGCTACTCCATGTAATTCTCCAAATACGCCGAAGCTCCg > 2:10409021/1‑151 (MQ=255)
aTTCAGGGGATGGAGGACACGGTTTCCGGTAAGGTTATTCGTGCCGAGGTTCCGCTGGGTGAGATGTTCGGTTATGCGACCGACGTGCGTTCCATGTCCCTGGGTCGCGCGAGCTACTCCATGGAATTCTCCAAATACGCCGAAGCTCCGt < 1:6226886/151‑1 (MQ=255)
ttCAGGGGATGGAGGACACGGTTTCCGGTAAGGTTATTCGTGCCGAGGTTCCGCTGGGTGAGATGTTCGGTTATGCGACCGACGTGCGTTCCATGTCCCTGGGTCGCGCGAGCTACTCCATGGAATTCTCCAAATACGCCGAAGCTCCGTc < 1:1445350/151‑1 (MQ=255)
ggggATGGAGGACACGGTTTCCGGTAAGGTTATTCGTGCCGAGGTTCCGCTGGGTGAGATGTTCGGTTATGCGACCGACGTGCGTTCCATGTCCCTGGGTCGCGCGAGCTACTCCATGGAATTCTCCAAATACGCCGAAGCTCCGTCGAAc < 2:8409361/151‑1 (MQ=255)
aTGGAGGACACGGTTTCCGGTAAGGTTATTCGTGCCGAGGTTCCGCTGGGTGAGATGTTCGGTTATGCGACCGACGTGCGTTCCATGTCCCTGGGTCGCGCGAGCTACTCCATGGAATTCTCCAAATACGCCGAAGCTCCGTCGAACAtcg > 1:7121600/1‑151 (MQ=255)
aTGGAGGACACGGTTTCCGGTAAGGTTATTCGTGCCGAGGTTCCGCTGGGTGAGATGTTCGGTTATGCGACCGACGTGCGTTCCATGTCCCTGGGTCGCGCGAGCTACTCCATGGAATTCTCCAAATACGCCGAAGCTCCGTCGAACAtcg > 2:10162008/1‑151 (MQ=255)
gaggaCACGGTTTCCGGTAAGGTTATTCGTGCCGAGGTTCCGCTGGGTGAGATGTTCGGTTATGCGACCGACGTGCGTTCCATGTCCCTGGGTCGCGCGAGCTACTCCATGGAATTCTCCAAATACGCCGAAGCTCCGTCGAACAtcgtcg > 1:6161444/1‑151 (MQ=255)
gaggaCACGGTTTCCGGTAAGGTTATTCGTGCCGAGGTTCCGCTGGGTGAGATGTTCGGTTATGCGACCGACGTGCGTTCCATGTCCCTGGGTCGCGCGAGCTACTCCATGGAATTCTCCAAATACGCCGAAGCTCCGTCGAACAtcgtcg > 1:2856734/1‑151 (MQ=255)
gaggaCACGGTTTCCGGTAAGGTTATTCGTGCCGAGGTTCCGCTGGGTGAGATGTTCGGTTATGCGACCGACGTGCGTTCCATGTCCCTGGGTCGCGCGAGCTACTCCAAGGAATTCTCCAAATACGCCGAAGCTCCGACGAACAtcgtcg > 2:2375403/1‑151 (MQ=255)
aggaCACGGTTTCCGGTAAGGTTATTCGTGCCGAGGTTCCGCTGGGTGAGATGTTCGGTTATGCGACCGACGTGCGTTCCATGTCCCTGGGTCGCGCGAGCTACTCCATGGAATTCTCCAAATACGCCGAAGCTCCGTCGAACATCGTCGa < 2:7340237/151‑1 (MQ=255)
acGGTTTCCGGTAAGGTTATTCGTGCCGAGGTTCCGCTGGGTGAGATGTTCGGTTATGCGACCGACGTGCGTTCCATGTCCCTGGGTCGCGCGAGCTACTCCATGGAATTCTCCAAATACGCCGAAGCTCCGTCGAACATCGTCGAAgcgc < 2:363598/151‑1 (MQ=255)
cGGTTTCCGGTAAGGTTATTCGTGCCGAGGTTCCGCTGGGTGAGATGTTCGGTTATGCGACCGACGTGCGTTCCATGTCCCTGGGTCGCGCGAGCTACTCCATGGAATTCTCCAAATACGCCGAAGCTCCGTCGAACATCGTCGAAGCGCt < 1:414964/151‑1 (MQ=255)
ggTTTCCGGTAAGGTTATTCGTGCCGAGGTTCCGCTGGGTGAGATGTTCGGTTATGCGACCGACGTGCGTTCCATGTCCCTGGGTCGCGCGAGCTACTCCATGGAATTCTCCAAATACGCCGAAGCTCCGTCGAACATCGTCGAAGCGCTg < 2:3859040/151‑1 (MQ=255)
ttCCGGTAAGGTTATTCGTGCCGAGGTTCCGCTGGGTGAGATGTTCGGTTATGCGACCGACGTGCGTTCCATGTCCCTGGGTCGCGCGAGCTACTCCATGGAATTCTCCAAATACGCCGAAGCTCCGTCGAACATCGTCGAAGCGCTGGtt < 1:8829717/151‑1 (MQ=255)
ttCCGGTAAGGTTATTCGTGCCGAGGTTCCGCTGGGTGAGATGTTCGGTTATGCGACCGACGTGCGTTCCATGTCCCTGGGTCGCGCGAGCTACTCCATGGAATTCTCCAAATACGCCGAAGCTCCGTCGAACATCGTCGAAGCGCTGGtt < 1:10679210/151‑1 (MQ=255)
tCCGGTAAGGTTATTCGTGCCGAGGTTCCGCTGGGTGAGAGGTTCGGTTATGCGACCGACGTGCGTTCCTTGTCCCTGGGTCGCGCGAGCTACTCCATGGAATTCTCCAAATACGCCGAAGCTCCGTCGAACATCGTCGAAGCGCTGGTTa < 2:2645053/151‑1 (MQ=255)
cGGTAAGGTTATTCGTGCCGAGGTTCCGCTGGGTGAGATGTTCGGTTATGCGACCGACGTGCGTTCCATGTCCCTGGGTCGCGCGAGCTACTCCATGGAATTCTCCAAATACGCCGAAGCTCCGTCGAACATCGTCGAAGCGCTGGTTaaa > 1:2358915/1‑151 (MQ=255)
cGGTAAGGTTATTCGTGCCGAGGTTCCGCTGGGTGAGATGTTCGGTTATGCGACCGACGTGCGTTCCATGTCCCTGGGTCGCGCGAGCTACTCCATGGAATTCTCCAAATACGCCGAAGCTCCGTCGAACATCGTCGAAGCGCTGGTTaaa > 1:7641290/1‑151 (MQ=255)
gTAAGGTTATTCGTGCCGAGGTTCCGCTGGGTGAGATGTTCGGTTATGCGACCGACGTGCGTTCCATGTCCCTGGGTCGCGCGAGCTACTCCATGGAATTCTCCAAATACGCCGAAGCTCCGTCGAACATCGTCGAAGCGCTGGTTaaaaa < 1:7913501/151‑1 (MQ=255)
tAAGGTTATTCGTGCCGAGGTTCCGCTGGGTGAGATGTTCGGTTATGCGACCGACGTGCGTTCCATGTCCCTGGGTCGCGCGAGCTACTCCATGGAATTCTCCAAATACGCCGAAGCTCCGTCGAACATCGTCGAAGCGCTGGTTaaaaaa < 2:8619637/151‑1 (MQ=255)
tAAGGTTATTCGTGCCGAGGTTCCGCTGGGTGAGATGTTCGGTTATGCGACCGACGTGCGTTCCATGTCCCTGGGTCGCGCGAGCTACTCCATGGAATTCTCCAAATACGCCGAAGCTCCGTCGAACATCGTCGAAGCGCTGGTTaaaaaa < 1:2085063/151‑1 (MQ=255)
aaGGTTATTCGTGCCGAGGTTCCGCTGGGTGAGATGATCGGTTATGCGACCGACGTGCGTTCCATGTCCCTGGGTCGCGCGAGCTACTCCATGGAAGTCTCCAAATACGCCGAAGCTCCGTCGAACATCGTCGAAGCGCTGGTTAAAAAAc > 2:7448186/1‑151 (MQ=255)
aGGTTATTCGTGCCGAGGTTCCGCTGGGTGAGATGTTCGGTTATGCGACCGACGTGCGTTCCATGTCCCTGGGTCGCGCGAGCTACTCCATGGAATTCTCCAAATACGCCGAAGCTCCGTCGAACATCGTCGAAGCGCTGGTTAAAAAACa < 1:3166122/151‑1 (MQ=255)
aGGTTATTCGTGCCGAGGTTCCGCTGGGTGAGATGTTCGGTTATGCGACCGACGTGCGTTCCATGTCCCTGGGTCGCGCGAGCTACTCCATGGAATTCTCCAAATACGCCGAAGCTCCGTCGAACATCGTCGAAGCGCTGGTTAAAAAACa < 1:5966659/151‑1 (MQ=255)
ttATTCGTGCCGAGGTTCCGCTGGGTGAGATGTTCGGTTATGCGACCGAAGTGCGTTCCATGTCCCTGGGTCGCGCGAGCTACTCCATGGAATTCTCCAAATACGCCGAAGCTCCGTCGAACATCGTCGAAGCGCTGGTTAAAATACAAgg > 2:1031084/1‑151 (MQ=255)
ttCGTGCCGAGGTTCCGCTGGGTGAGATGTTCGGTTATGCGACCGACGTGCGTTCCATGTCCCTGGGTCGCGCGAGCTACTCCATGGAATTCTCCAAATACGCCGAAGCTCCGTCGAACATCGTCGAAGCGCTGGTTAAAAAACAAGGTTg < 2:2289159/151‑1 (MQ=255)
tCGTGCCGAGGTTCCGCTGGGTGAGATGTTCGGTTATGCGACCGACGTGCGTTCCATGTCCCTGGGTCGCGCGCGCTACTCCATGGAATTCTCCAAATACGCCGAAGCTCCGTCGAACATCGTCGAAGCGCTGGTTAAAAAACAAGGTTGa < 2:7059920/151‑1 (MQ=255)
cGTGCCGAGGTTCCGCTGGGTGAGATGTTCGGTTATGCGACCGACGTGCGTTCCATGTCCCTGGGTCGCGCGAGCTACTCCATGTAATTCTCCAAATACGACGAAGCTCCGTCGAACATCGTCGAAGCGCTGGTGAAAAAACAAGGTTGAt > 2:5859271/1‑151 (MQ=255)
tGCCGAGGTTCCGCTGGGTGAGATGTTCGGTTATGCGACCGACGTGCGTTCCATGTCCCTGGGTCGCGCGAGCTACTCCATGGAATTCTCCAAATACGCCGAAGCTCCGTCGAACATCGTCGAAGCGCTGGTTAAAAAACAAGGTTGATTc < 2:5267638/151‑1 (MQ=255)
tGCCGAGGTTCCGCTGGGTGAGATGTTCGGTTATGCGACCGACGTGCGTTCCATGTCCCTGGGTCGCGCGAGCTACTCCATGGAATTCTCCAAATACGCCGAAGCTCCGTCGAACATCGTCGAAGCGCTGGTTAAAAAACAAGGTTGATTc < 2:3452002/151‑1 (MQ=255)
gCCGAGGTTCCGCTGGGTGAGATGTTCGGTTATGCGACCGACGTGCGTTCCATGTCCCTGGGTCGCGCGAGCTACTCCATGGAATTCTCCAAATACGCCGAAGCTCCGTCGAACATCGTCGAAGCGCTGGTTAAAAAACAAGGTTGATTCa > 2:4692549/1‑151 (MQ=255)
gCCGAGGTTCCGCTGGGTGAGATGTTCGGTTATGCGACCGACGTGCGTTCCATGTCCCTGGGTCGCGCGAGCTACTCCATGGAATTCTCCAAATACGCCGAAGCTCCGTCGAACATCGTCGAAGCGCTGGTTAAAAAACAAGGTTGATTCa > 2:1290545/1‑151 (MQ=255)
cGAGGTTCCGCTGGGTGAGATGTTCGGTTATGCGACCGACGTGCGTTCCATGTCCCTGGGTCGCGCGAGCTACTCCATGGAATTCTCCAAATACGCCGAAGCTCCGTCGAACATCGTCGAAGCGCTGGTTAAAAAACAAGGTTGATTCAGc > 1:3060741/1‑151 (MQ=255)
cGAGGTTCCGCTGGGTGAGATGTTCGGTTATGCGACCGACGTGCGTTCCATGTCCCTGGGTCGCGCGAGCTACTCCATGGAATTCTCCAAATACGCCGAAGCTCCGTCGAACATCGTCGAAGCGCTGGTTAAAAAACAAGGTTGATTCAGc > 2:7148359/1‑151 (MQ=255)
gggtCCGCTGGGTGAGATGTTCGGTTATGCGACCGACGTGCGTTCCATGTCCCTGGGTCGCGCGAGCTACGCCATGGAATTCTCCAAATACGCCGAAGCTCCGTCGAACATCGTCGAAGCGCTGGTTAAAAAACAAGGTTGATTCAGCCCt < 2:10588863/148‑1 (MQ=255)
ggTTCCGCTGGGTGAGATGTTCGGTTATGCGACCGACGTGCGTTCCATGTCCCTGGGTCGCGCGAGCTACTCCATGGAATTCTCCAAATACGCCGAAGCTCCGTCGAACATCGTCGAAGCGCTGGTTAAAAAACAAGGTTGATTCAGCCCt < 1:409565/151‑1 (MQ=255)
ggTTCCGCTGGGTGAGATGTTCGGTTATGCGACCGACGTGCGTTCCATGTCCCTGGGTCGCGCGAGCTACTCCATGGAATTCTCCAAATACGCCGAAGCTCCGTCGAACATCGTCGAAGCGCTGGTTAAAAAACAAGGTTGATTCAGCCCt < 2:6089914/151‑1 (MQ=255)
ttCCGCTGGGTGAGATGTTCGGTTATGCGACCGACGTGCGTTCCATGTCCCTGGGTCGCGCGAGCTACTCCATGGAATTCTCCAAATACGCCGAAGCTCCGTCGAACATCGTCGAAGCGCTGGTTAAAAAACAAGGTTGATTCAGCCCttt < 2:1112944/151‑1 (MQ=255)
ttCCGCTGGGTGAGATGTTCGGTTATGCGACCGACGTGCGTTCCATGTCCCTGGGTCGCGCGAGCTACTCCATGGAATTCTCCAAATACGCCGAAGCTCCGTCGAACATCGTCGAAGCGCTGGTTAAAAAACAAGGTTGATTCAGCCCttt < 2:3107428/151‑1 (MQ=255)
ccGCTGGGTGAGATGTTCGGTTATGCGACCGACGTGCGTTCCATGTCCCTGGGTCGCGCGAGCTACTCCATGGAATTCTCCAAATACGCCGAAGCTCCGTCGAACATCGTCGAAGCGCTGGTTAAAAAACAAGGTTGATTCAGCCCTTtaa < 1:4585255/151‑1 (MQ=255)
gCTGGGTGAGATGTTCGGTTATGCGACCGACGTGCGTTCCATGTCCCTGGGTCGCGCGAGCTACTCCATGGAATTCTCCAAATACGCCGAAGCTCCGTCGAACATCGTCGAAGCGCTGGTTAAAAAACAAGGTTGATTCAGCCCTTtaagt > 1:3764517/1‑151 (MQ=255)
cTGGGTGAGATGTTCGGTTATGCGACCGACGTGCGTTCCATGTCCCTGGGTCGCGCGAGCTACTCCATGGAATTCTCCAAATACGCCGAAGCTCCGTCGAACATCGTCGAAGCGCTGGTTAAAAAACAAGGTTGATTCAGCCCTTtaagta < 2:1105629/151‑1 (MQ=255)
tGGGTGAGATGTTCGGTTATGCGACCGACGTGCGTTCCATGTCCCTGGGTCGCGCGAGCTACTCCATGGAATTCTCCAAATACGCCGAAGCTCCGTCGAACATCGTCGAAGCGCTGGTTAAAAAACAAGGTTGATTCAGCCCTTtaagtaa > 1:1589007/1‑151 (MQ=255)
tGGGTGAGATGTTCGGTTATGCGACCGACGTGCGTTCCATGTCCCTGGGTCGCGCGAGCTACTCCATGGAATTCTCCAAATACGCCGAAGCTCCGTCGAACATCGTCGAAGCGCTGGTTAAAAAACAAGGTTGATTCAGCCCTTtaagtaa < 2:2985056/151‑1 (MQ=255)
tGGGTGAGATGTTCGGTTATGCGACCGACGTGCGTTCCATGTCCCTGGGTCGCGCGAGCTACTCCATGGAATTCTCCAAATACGCCGAAGCTCCGTCGAACATCGTCGAAGCGCTGGTTAAAAAACAAGGTTGATTCAGCCCTTtaagtaa < 1:10514810/151‑1 (MQ=255)
tGAGATGTTCGGTTATGCGACCGACGTGCGTTCCATGTCCCTGGGTCGCGCGAGCTACTCCATGGAATTCTCCAAATACGCCGAAGCTCCGTCGAACATCGTCGAAGCGCTGGTTAAAAAACAAGGTTGATTCAGCCCTTTAAGTAAGAgg > 1:8455135/1‑151 (MQ=255)
gagaTGTTCGGTTATGCGACCGACGTGCGTTCCATGTCCCTGGGTCGCGCGAGCTACTCCATGGAATTCTCCAAATACGCCGAAGCTCCGTCGAACATCGTCGAAGCGCTGGTTAAAAAACAAGGTTGATTCAGCCCTTTAAGTAAGAGGt > 2:9053727/1‑151 (MQ=255)
gagaTGTTCGGTTATGCGACCGACGTGCGTTCCATGTCCCTGGGTCGCGCGAGCTACTCCATGGAATTCTCCAAATACGCCGAAGCTCCGTCGAACATCGTCGAAGCGCTGGTTAAAAAACAAGGTTGATTCAGCCCTTTAAGTAAGAGGt < 2:1367722/151‑1 (MQ=255)
gagaTGTTCGGTTATGCGACCGACGTGCGTTCCATGTCCCTGGGTCGCGCGAGCTACTCCATGGAATTCTCCAAATACGCCGAAGCTCCGTCGAACATCGTCGAAGCGCTGGTTAAAAAACAAGGTTGATTCAGCCCTTTAAGTAAGAGGt > 1:9398991/1‑151 (MQ=255)
aTGTTCGGTTATGCGACCGACGTGCGTTCCATGTCCCTGGGTCGCGCGAGCTACTCCATGGAATTCTCCAAATACGCCGAAGCTCCGTCGAACATCGTCGAAGCGCTGGTTAAAAAACAAGGTTGATTCAGCCCTTTAAGTAAGAGGTTTa < 1:8555975/151‑1 (MQ=255)
gTTCGGTTATGCGACCGACGTGCGTTCCATGTCCCTGGGTCGCGCGAGCTACTCCATGGAATTCTCCAAATACGCCGAAGCTCCGTCGAACATCGTCGAAGCGCTGGTTAAAAAACAAGGTTGATTCAGCCCTTTAAGTAAGAGGTTTACt < 1:10072342/151‑1 (MQ=255)
ttCGGTTATGCGACCGACGTGCGTTCCATGTCCCTGGGTCGCGCGAGCTACTCCATGGAATTCTCCAAATACGCCGAAGCTCCGTCGAACATCGTCGAAGCGCTGGTTAAAAAACAAGGTTGATTCAGCCCTTTAAGTAAGAGGTTTACTg < 1:4264182/151‑1 (MQ=255)
gTTATGCGACCGACGTGCGTTCCATGTCCCTGGGTCGCGCGAGCTACTCCATGGAATTCTCCAAATACGCCGAAGCTCCGTCGAACATCGTCGAAGCGCTGGTTAAAAAACAAGGTTGATTCAGCCCTTTAAGTAAGAGGTTTACTGTCGt < 1:9948114/151‑1 (MQ=255)
tGCGACCGACGTGCGTTCCATGTCCCTGGGTCGCGCGAGCTACTCCATGGAATTCTCCAAATACGCCGAAGCTCCGTCGAACATCGTCGAAGCGCTGGTTAAAAAACAAGGTTGATTCAGCCCTTTAAGTAAGAGGTTTACTGTCGTGGCt > 1:2026498/1‑151 (MQ=255)
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GCTGGGTGAGATGTTCGGTTATGCGACCGACGTGCGTTCCATGTCCCTGGGTCGCGCGAGCTACTCCATGGAATTCTCCAAATACGCCGAAGCTCCGTCGAACATCGTCGAAGCGCTGGTTAAAAAACAAGGTTGATTCAGCCCTTTAAGT > SRR18135093.2372547/1‑151 (MQ=60)
GCTGGGTGAGATGTTCGGTTATGCGACCGACGTGCGTTCCATGTCCCTGGGTCGCGCGAGCTACTCCATGGAATTCTCCAAATACGCCGAAGCTCCGTCGAACATCGTCGAAGCGCTGGTTAAAAAACAAGGTTGATTCAGCCCTTTAAGT > SRR18135093.3782060/1‑151 (MQ=60)
CTGGGTGAGATGTTCGGTTATGCGACCGACGTGCGTTCCATGTCCCTGGGTCGCGCGAGCTACTCCATGGAATTCTCCAAATACGCCGAAGCTCCGTCGAACATCGTCGAAGCGCTGGTTAAAAAACAAGGTTGATTCAGCCCTTTAAGTA > SRR18135093.6785714/1‑151 (MQ=60)
CTGGGTGAGATGTTCGGTTATGCGACCGACGTGCGTTCCATGTCCCTGGGTCGCGCGAGCTACTCCATGGAATTCTCCAAATACGCCGAAGCTCCGTCGAACATCGTCGAAGCGCTGGTTAAAAAACAAGGTTGATTCAGCCCTTTAAGTA > SRR18135093.7751655/1‑151 (MQ=60)
CTGGGTGAGATGTTCGGTTATGCGACCGACGTGCGTTCCATGTCCCTGGGTCGCGCGAGCTACTCCATGGAATTCTCCAAATACGCCGAAGCTCCGTCGAACATCGTCGAAGCGCTGGTTAAAAAACAAGGTTGATTCAGCCCTTTAAGTA > SRR18135093.8529184/1‑151 (MQ=60)
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ATGTTCGGTTATGCGACCGACGTGCGTTCCATGTCCCTGGGTCGCGCGAGCTACTCCATGGAATTCTCCAAATACGCCGAAGCTCCGTCGAACATCGTCGAAGCGCTGGTTAAAAAACAAGGTTGATTCAGCCCTTTAAGTAAGAGGTTTA < SRR18135093.2990744/151‑1 (MQ=60)
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CGGTTATGCGACCGACGTGCGTTCCATGTCCCTGGGTCGCGCGAGCTACTCCATGGAATTCTCCAAATACGCCGAAGCTCCGTCGAACATCGTCGAAGCGCTGGTTAAAAAACAAGGTTGATTCAGCCCTTTAAGTAAGAGGTTTACTGTC < SRR18135093.4306722/151‑1 (MQ=60)
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AGGACTACATGGGTGACGTGATGGGCGACCTGAACCGTCGTCGTGGTCTGATTCAGGGGATGGAGGACACGGTTTCCGGTAAGGTTATTCGTGCCGAGGTTCCGCTGGGTGAGATGTTCGGTTATGCGACCGACGTGCGTTCCATGTCCCAGGGTCGCGCGAGCTACTCCATGGAATTCTCCAAATACGCCGAAGCTCCGTCGAACATCGTCGAAGCGCTGGTTAAAAAACAAGGTTGATTCAGCCCTTTAAGTAAGAGGTTTACTGTCGTGGCTAAGGAAAAATTCGAACGTAACAAACC > NC_008463/757547‑757847
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 0 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
