Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A3 F1 I1 R1
|
256 |
517.8 |
22465524 |
99.2% |
22285799 |
151.0 |
Breseq alignment
BRESEQ :: Evidence
|
| evidence |
seq id |
position |
mutation |
annotation |
gene |
description |
| RA |
NC_008463 |
2,001,809 |
T→G |
D65E (GAT→GAG) |
pgl → |
6‑phosphogluconolactonase |
|
| |
seq id |
position |
ref |
new |
freq |
score (cons/poly) |
reads |
annotation |
genes |
product |
| * | NC_008463 | 2,001,809 | 0 | T | G | 100.0%
| 1618.9
/ NA
| 406 | D65E (GAT→GAG) | pgl | 6‑phosphogluconolactonase |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (0/0); new base G (198/208); total (198/208) |
Only 100 of 408 total aligned reads displayed.
GCAGCGCCGCCGAGCAGGCCCGCGGCCTGGCCGCCGAGGTCGCCGGCCGGTTGCGCTCGGCGCTGGCCGAGCAGGGCCAGGCGCTGCTGGTGGTGTCCGGTGGGCGCAGTCCGGTGGCCTTCCTCGAAGCCTTGAGCGAGGATCAGGTGGACTGGTCGCGGATCACCCTCAGCCTGGCCGACGAGCGCTGGGTGCCGGAGTCGCATGCCGATAGCAACGCCGGCCTGGTTCGCCGCCACCTGCTCCGTGGCGAGGCGGCGAAGGCGCGCTTCATCGGCCTCTACCAGC > NC_008463/2001667‑2001954
|
gCAGCGCCGCCGAGCAGGCCCGCGGCCTGGCCGCCGAGGTCGCCGGCCGGTTGCGCTCGGCGCTGGCCGAGCAGGGCCAGGCGCTGCTGGTGGTGTCCGGTGGGCGCAGTCCGGTGGCCTTCCTCGAAGCCTTGAGCGAGGAGCCGCTGGa > 1:2149584/1‑151 (MQ=255)
cAGCGCCGCCGAGCAGGCCCGCGGCCTGGCCGCCGAGGTCGCCGGCCGGTTGCGCTCGGCGCTGGCCGAGCAGGGCCAGGCGCTGCTGGTGGTGTCCGGTGGGCGCAGTCCGGTGGCCTTCCTCGAAGCCTTGAGCGAGGAGCCGCTGGAc < 1:10957539/151‑1 (MQ=255)
aGCGCCGCCGAGCAGGCCCGCGGCCTGGCCGCCGAGGTCGCCGGCCGGTTGCGCTCGGCGCTGGCCGAGCAGGGCCAGGCGCTGCTGGTGGTGTCCGGTGGGCGCAGTCCGGTGGCCTTCCTCGAAGCCTTGAGCGAGGAGCCGCTGGACt < 1:2935051/151‑1 (MQ=255)
gcgcCGCCGAGCAGGCCCGCGGCCTGGCCGCCGAGGTCGCCGGCCGGGTGCGCTCGGCGCTGGCCGAGCAGGGCCAGGCGCTGCTGGTGGTGTCCGGTGGGCGCAGTCCGGTGGCCTTCCTCGAAGCCTTGAGCGAGGAGCCGCTGGACTg > 1:557259/1‑151 (MQ=255)
cgccgAGCAGGCCCGCGGCCTGGCCGCCGAGGTCGCCGGCCGGTTGCGCTCGGCGCTGGCCGAGCAGGGCCAGGCGCTGCTGGTGGTGTCCGGTGGGCGCAGTCCGGTGGCCTTCCTCGAAGCCTTGAGCGAGGAGCCGCTGGACTGGTcg > 2:10861463/1‑151 (MQ=255)
cgccgAGCAGGCCCGCGGCCTGGCCGCCGAGGTCGCCGGCCGGTTGCGCTCGGCGCTGGCCGAGCAGGGCCAGGCGCTGCTGGTGGTGTCCGGTGGGCGCAGTCCGGTGGCCTTCCTCGAAGCCTTGAGCGAGGAGCCGCTGGACTGGTcg > 1:2761297/1‑151 (MQ=255)
cgAGCAGGCCCGCGGCCTGGCCGCCGAGGTCGCCGGCCGGTTGCGCTCGGCGCTGGCCGAGCAGGGCCAGGCGCTGCTGGTGGTGTCCGGTGGGCGCAGTCCGGTGGCCTTCCTCGAAGCCTTGAGCGAGGAGCCGCTGGACTGGTCGCgg < 2:104331/151‑1 (MQ=255)
cgAGCAGGCCCGCGGCCTGGCCGCCGAGGTCGCCGGCCGGTTGCGCTCGGCGCTGGCCGAGCAGGGCCAGGCGCTGCTGGTGGTGTCCGGTGGGCGCAGTCCGGTGGCCTTCCTCGAAGCCTTGAGCGAGGAGCCGCTGGACTGGTCGCgg > 2:8064013/1‑151 (MQ=255)
ggCCCGCGGCCTGGCCGCCGAGGTCGCCGGCCGGTTGCGCTCGGCGCTGGCCGAGCAGGGCCAGGCGCTGCTGGTGGTGTCCGGTGGGCGCAGTCCGGTGGCCTTCCTCGAAGCCTTGAGCGAGGAGCCGCTGGACTGGTCGCGGATCAcc > 2:6672509/1‑151 (MQ=255)
ggCCCGCGGCCTGGCCGCCGAGGTCGCCGGCCGGTTGCGCTCGGCGCTGGCCGAGCAGGGCCAGGCGCTGCTGGTGGTGTCCGGTGGGCGCAGTCCGGTGGCCTTCCTCGAAGCCTTGAGCGAGGAGCCGCTGGACTGGTCGCGGATCAcc < 2:641074/151‑1 (MQ=255)
cccGCGGCCTGGCCGCCGAGGTCGCCGGCCGGTTGCGCTCGGCGCTGGCCGAGCAGGGCCAGGCGCTGCTGGTGGTGTCCGGTGGGCGCAGTCCGGTGGCCTTCCTCGAAGCCTTGAGCGAGGAGCCGCTGGACTGGTCGCGGATCACCCt > 2:5041339/1‑151 (MQ=255)
ccGCGGCCTGGCCGCCGAGGTCGCCGGCCGGTTGCGCTCGGCGCTGGCCGAGCAGGGCCAGGCGCTGCTGGTGGTGTCCGGTGGGCGCAGTCCGGTGGCCTTCCTCGAAGCCTTGAGCGAGGAGCCGCTGGACTGGTCGCGGATCACCCTc > 1:5250800/1‑151 (MQ=255)
cgcgGCCTGGCCGCCGAGGTCGCCGGGCTGTTGCGCTCGGCGCTGGCCGAGCATGGCCAGGCGCTGCGGTTGGTGTCCGGTGTGAGCAGTCCGGTGGCCTTCCTCGATGCCTTGAGCGAGGAGGCGCTGGACTGGTCGCGGATCACCCTCa < 2:4307933/151‑1 (MQ=255)
gcgGCCGGGCCGCCGAGGTCGCCGGCCGGTTGCGCTCGGCGCTGGCCGAGCAGGGCCAGGCGCTGCTGGTGGTGTCCGGTGGGCGCAGTCCGGTGGCCTTCCTCGAAGCCTTGAGCGAGGAGCCGCTGGACTGGTCGCGGATCACCCTCAg < 2:209796/151‑1 (MQ=255)
cgGCCTGGCCGCCGAGGTCGCCGGCCGGTTGCGCTCGGCGCTGGCCGAGCAGGGCCAGGCGCTGCTGGTGGTGTCCGGTGGGCGCAGTCCGGTGGCCTTCCTCGAAGCCTTGAGCGAGGAGCCGCTGGACTGGTCGCGGATCACCCTCAGc > 2:2589541/1‑151 (MQ=255)
ggCCTGGCCGCCGAGGTCGCCGGCCGGTTGCGCTCGGCGCTGGCCGAGCAGGGCCAGGCGCTGCTGGTGGTGTCCGGTGGGCGCAGTCCGGTGGCCTTCCTCGAAGCCTTGAGCGAGGAGCCGCTGGACTGGTCGCGGATCACCCTCAGcc > 1:9294841/1‑151 (MQ=255)
gCCTGGCCGCCGAGGTCGCCGGCCGGTTGCGCTCGGCGCTGGCCGAGCAGGGCCAGGCGCTGCTGGTGGTGTCCGGTGGGCGCAGTCCGGTGGCCTTCCTCGAAGCCTTGAGCGAGGAGCCGCTGGACTGGTCGCGGATCACCCTCAGCCt > 2:1398323/1‑151 (MQ=255)
gCCTGGCCGCCGAGGTCGCCGGCCGGGTGCGCTCGGCGCTGGCCGAGCAGGGCCAGGCGCTGCTGGTGGTGTCCGGTGGGCGCAGTCCGGTGGCCTTCCTCGAAGCCTTGAGCGAGGAGCCGCTGGACTGGTCGCGGATCACCCTCAGCCt < 2:6216336/151‑1 (MQ=255)
ccTGGCCGCCGAGGTCGCCGGCCGGTTGCGCTCGGCGCTGGCCGAGCAGGGCCAGGCGCTGCTGGTGGTGTCCGGTGGGCGCAGTCCGGTGGCCTTCCTCGAAGCCTTGAGCGAGGAGCCGCTGGACTGGTCGCGGATCACCCTCAGCCTg < 2:4879158/151‑1 (MQ=255)
ccTGGCCGCCGAGGTCGCCGGCCGGTTGCGCTCGGCGCTGGCCGAGCAGGGCCAGGCGCTGCGGGTGGTGTCCGGTGGGCGCAGTCCGGTGGCCTTCCTCGAAGCCTTGAGCGAGGAGCCGCTGGACTGGTCGCGGATCACCCTCAGCCTg < 2:9739716/151‑1 (MQ=255)
cTGGCCGCCGAGGTCGCCGGCCGGTTGCGCTCGGCGCTGGCCGAGCAGGGCCAGGCGCTGCTGGTGGTGTCCGGTGGGCGCAGTCCGGTGGCCTTCCTCGAAGCCTTGAGCGAGGAGCCGCTGGACTGGTCGCGGATCACCCTCAGCCTgg < 1:1944730/151‑1 (MQ=255)
tGGCCGCCGAGGTCGCCGGCCGGTTGCGCTCGGCGCTGGCCGAGCAGGGCCAGGCGCTGCTGGTGGTGTCCGGTGGGCGCAGTCCGGTGGCCTTCCTCGAAGCCTTGAGCGAGGAGCCGCTGGACTGGTCGCGGATCACCCTCAGCCTGGc > 1:7114182/1‑151 (MQ=255)
ggCCGCCGAGGTCGCCGGCCGGTTGCGCTCGGCGCTGGCCGAGCAGGGCCAGGCGCTGCTGGTGGTGTCCGGTGGGCGCAGTCCGGTGGCCTTCCTCGAAGCCTTGAGCGAGGAGCCGCTGGACTGGTCGCGGATCACCCTCAGCCTGGcc < 1:1151212/151‑1 (MQ=255)
ccgAGGTCGCCGGCCGGTTGCGCTCGGCGCTGGCCGAGCAGGGCCAGGCGCTGCTGGTGGTGTCCGGTGGGCGCAGTCCGGTGGCCTTCCTCGAAGCCTTGAGCGAGGAGCCGCTGGACTGGTCGCGGATCACCCTCAGCCTGGCcgacga < 2:2877096/151‑1 (MQ=255)
cgAGGTCGCCGGCCGGTTGCGCTCGGCGCTGGCCGAGCAGGGCCAGGCGCTGCTGGTGGTGTCCGGTGGGCGCAGTCCGGTGGCCTTCCTCGAAGCCTTGAGCGAGGAGCCGCTGGACTGGTCGCGGATCACCCTCAGCCTGGCCGACGAg < 2:6784646/151‑1 (MQ=255)
cgAGGTCGCCGGCCGGTTGCGCTCGGCGCTGGCCGAGCAGGGCCAGGCGCTGCTGGTGGTGTCCGGTGGGCGCAGTCCGGTGGCCTTCCTCGAAGCCTTGAGCGAGGAGCCGCTGGACTGGTCGCGGATCACCCTCAGCCTGGCCGACGAg > 2:7675119/1‑151 (MQ=255)
cgAGGTCGCCGGCCGGTTGCGCTCGGCGCTGGCCGAGCAGGGCCAGGCGCTGCTGGTGGTGTCCGGTGGGCGCAGTCCGGTGGCCTTCCTCGAAGCCTTGAGCGAGGAGCCGCTGGACTGGTCGCGGATCACCCTCAGCCTGGCCGACGAg < 2:8522839/151‑1 (MQ=255)
cgAGGTCGCCGGCCGGTTGCGCTCGGCGCTGGCCGAGCAGGGCCAGGCGCTGCTGGTGGTGTCCGGTGGGCGCAGTCCGGTGGCCTTCCTCGAAGCCTTGAGCGAGGAGCCGCTGGACTGGTCGCGGATCACCCTCAGCCTGGCCGACGAg > 1:10095418/1‑151 (MQ=255)
gAGGTCGCCGGCCGGTTGCGCTCGGCGCTGGCCGAGCAGGGCCAGGCGCTGCTGGTGGTGTCCGGTGGGCGCAGTCCGGTGGCCTTCCTCGAAGCCTTGAGCGAGGAGCCGCTGGACTGGTCGCGGATCACCCTCAGCCTGGCCGACGAgc < 2:242879/151‑1 (MQ=255)
gAGGTCGCCGGCCGGTTGCGCTCGGCGCTGGCCGAGCAGGGCCAGGCGCTGCTGGTGGTGTCCGGTGGGCGCAGTCCGGTGGCCTTCCTCGAAGCCTTGAGCGAGGAGCCGCTGGACTGGTCGCGGATCACCCTCAGCCTGGCCGACGAgc > 1:6838646/1‑151 (MQ=255)
gTCGCCGGCCGGTTGCGCTCGGCGCTGGCCGAGCAGGGCCAGGCGCTGCTGGTGGTGTCCGGTGGGCGCAGTCCGGTGGCCTTCCTCGAAGCCTTGAGCGAGGAGCCGCTGGACTGGTCGCGGATCACCCTCAGCCTGGCCGACGAGCGCt < 2:2965206/151‑1 (MQ=255)
tCGCCGGCCGGTTGCGCTCGGCGCTGGCCGAGCAGGGCCAGGCGCTGCGGGTGGTGTCCGGTGGGCGCAGTCCGGTGGCCTTCCTCGAAGCCTTGAGCGAGGAGCCGCTGGACTGGTCGCGGATCACCCTCAGCCTGGCCGACGAGCGCTg < 2:5376057/151‑1 (MQ=255)
gccggccgGTTGCGCTCGGCGCTGGCCGAGCAGGGCCAGGCGCTGCTGGTGGTGTCCGGTGGGCGCAGTCCGGTGGCCTTCCTCGAAGCCTTGAGCGAGGAGCCGCTGGACTGGTCGCGGATCACCCTCAGCCTGGCCGACGAGCGCTggg < 1:4462538/151‑1 (MQ=255)
ccggccggTTGCGCTCGGCGCTGGCCGAGCAGGGCCAGGCGCTGCTGGTGGTGTCCGGTGGGCGCAGTCCGGTGGCCTTCCTCGAAGCCTTGAGCGAGGAGCCGCTGGACTGGTCGCGGATCACCCTCAGCCTGGCCGACGAGCGCTGGGt < 1:5810190/151‑1 (MQ=255)
ccggccggTTGCGCTCGGCGCTGGCCGAGCAGGGCCAGGCGCTGCTGGTGGTGTCCGGTGGGCGCAGTCCGGTGGCCTTCCTCGAAGCCTTGAGCGAGGAGCCGCTGGACTGGTCGCGGATCACCCTCAGCCTGGCCGACGAGCGCTGGGt < 1:10846885/151‑1 (MQ=255)
ggccggTTGCGCTCGGCGCTGGCCGAGCAGGGCCAGGCGCTGCGGGTGGTGTCCGGTGGGCGCAGTCCGGTGGCCTTCCTCGAAGCCTTGAGCGAGGAGCCGCTGGACTGGTCGCGGATCACCCTCAGCCTGGCCGACGAGCGCTGGGTGc < 2:11143454/151‑1 (MQ=255)
cggTTGCGCTCGGCGCTGGCCGAGCAGGGCCAGGCGCTGCTGGTGGTGTCCGGTGGGCGCAGTCCGGTGGCCTTCCTCGAAGCCTTGAGCGAGGAGCCGCTGGACTGGTCGCGGATCACCCTCAGCCTGGCCGACGAGCGCTGGGTGCCgg > 1:7306031/1‑151 (MQ=255)
ggTTGCGCTCGGCGCTGGCCGAGCAGGGCCAGGCGCTGCTGGTGGTGTCCGGTGGGCGCAGTCCGGTGGCCTTCCTCGAAGCCTTGAGCGAGGAGCCGCTGGACTGGTCGCGGATCACCCTCAGCCTGGCCGACGAGCGCTGGGTGCCGGa < 1:6379831/151‑1 (MQ=255)
ggTTGCGCTCGGCGCTGGCCGAGCAGGGCCAGGCGCTGCTGGTGGTGTCCGGTGGGCGCAGTCCGGTGGCCTTCCTCGAAGCCTTGAGCGAGGAGCCGCTGGACTGGTCGCGGATCACCCTCAGCCTGGCCGACGAGCGCTGGGTGCCGGa > 1:600462/1‑151 (MQ=255)
gTTGCGCTCGGCGCTGGCCGAGCAGGGCCAGGCGCTGCTGGTGGTGTCCGGTGGGCGCAGTCCGGTGGCCTTCCTCGAAGCCTTGAGCGAGGAGCCGCTGGACTGGTCGCGGATCACCCTCAGCCTGGCCGACGAGCGCTGGGTGCCGGAg > 2:3973846/1‑151 (MQ=255)
tGCGCTCGGCGCTGGCCGAGCAGGGCCAGGCGCTGCTGGTGGTGTCCGGTGGGCGCAGTCCGGGGGCCTTCCTCGAAGCCTTGAGCGAGGAGCCGCTGGACTGGTCGCGGATCACCCTCAGCCTGGCCGACGAGCGCTGGGTGCCGGAGTc < 1:3321446/151‑1 (MQ=255)
gcTCGGCGCTGGCCGAGCAGGGCCAGGCGCTGCTGGTGGTGTCCGGTGGGCGCAGTCCGGTGGCCTTCCTCGAAGCCTTGAGCGAGGAGCCGCTGGACTGGTCGCGGATCACCCTCAGCCTGGCCGACGAGCGCTGGGTGCCGGAGTCGCa > 1:10348783/1‑151 (MQ=255)
cTCGGCGCTGGCCGAGCAGGGCCAGGCGCTGCTGGTGGTGTCCGGTGGGCGCAGTCCGGTGGCCTTCCTCGAAGCCTTGAGCGAGGAGCCGCTGGACTGGTCGCGGATCACCCTCAGCCTGGCCGACGAGCGCTGGGTGCCGGAGTCGCAt < 1:1987583/151‑1 (MQ=255)
ggCGCTGGCCGAGCAGGGCCAGGCGCTGCTGGTGGTGTCCGGTGGGCGCAGTCCGGTGGCCTTCCTCGAAGCCTTGAGCGAGGAGCCGCTGGACTGGTCGCGGATCACCCTCAGCCTGGCCGACGAGCGCTGGGTGCCGGAGTCGCATGcc > 1:803381/1‑151 (MQ=255)
gcTGGCCGAGCAGGGCCAGGCGCTGCTGGTGGTGTCCGGTGGGCGCAGTCCGGTGGCCTTCCTCGAAGCCTTGAGCGAGGAGCCGCTGGACTGGTCGCGGATCACCCTCAGCCTGGCCGACGAGCGCTGGGTGCCGGAGTCGCATGCCGAt > 1:771215/1‑151 (MQ=255)
cTGGCCGAGCAGGGCCAGGCGCTGCTGGTGGTGTCCGGTGGGCGCAGTCCGGTGGCCTTCCTCGAAGCCTTGAGCGAGGAGCCGCTGGACTGGTCGCGGATCACCCTCAGCCTGGCCGACGAGCGCTGGGTGCCGGAGTCGCATGCCGATa < 2:5690284/151‑1 (MQ=255)
cTGGCCGAGCAGGGCCAGGCGCTGCTGGTGGTGTCCGGTGGGCGCAGTCCGGTGGCCTTCCTCGAAGCCTTGAGCGAGGAGCCGCTGGACTGGTCGCGGATCACCCTCAGCCTGGCCGACGAGCGCTGGGTGCCGGAGTCGCATGCCGATa < 1:7450096/151‑1 (MQ=255)
tGGCCGAGCAGGGCCAGGCGCTGCTGGTGGTGTCCGGTGGGCGCAGTCCGGTGGCCTTCCTCGAAGCCTTGAGCGAGGAGCCGCTGGACTGGTCGCGGATCACCCTCAGCCTGGCCGACGAGCGCTGGGTGCCGGAGTCGCATGCCGATAg < 1:2110896/151‑1 (MQ=255)
ggCCGAGCAGGGCCAGGCGCTGCTGGTGGTGTCCGGTGGGCGCAGTCCGGTGGCCTTCCTCGAAGCCTTGAGCGAGGAGCCGCTGGACTGGTCGCGGATCACCCTCAGCCTGGCCGACGAGCGCTGGGTGCCGGAGTCGCATGCCGATAGc > 2:737268/1‑151 (MQ=255)
cGAGCAGGGCCAGGCGCTGCTGGTGGTGTCCGGTGGGCGCAGTCCGGTGGCCTTCCTCGAAGCCTTGAGCGAGGAGCCGCTGGACTGGTCGCGGATCACCCTCAGCCTGGCCGACGAGCGCTGGGTGCCGGAGTCGCATGCCGATCGCAAc > 2:1139866/1‑151 (MQ=255)
gAGCAGGGCCAGGCGCTGCTGGTGGTGTCCGGTGGGCGCAGTCCGGTGGCCTTCCTCGAAGCCTTGAGCGAGGAGCCGCTGGACTGGTCGCGGATCACCCTCAGCCTGGCCGACGAGCGCTGGGTGCCGGAGTCGCATGCCGATAGCAACg > 2:7165124/1‑151 (MQ=255)
gCAGGGCCAGGCGCTGCTGGTGGTGTCCGGTGGGCGCAGTCCGGTGGCCTTCCTCGAAGCCTTGAGCGAGGAGCCGCTGGACTGGTCGCGGATCACCCTCAGCCTGGCCGACGAGCGCTGGGTGCCGGAGTCGCATGCCGATAGCAACGcc > 2:9604020/1‑151 (MQ=255)
aGGGCCAGGCGCTGCTGGTGGTGTCCGGTGGGCGCAGTCCGGTGGCCTTCCTCGAAGCCTTGAGCGAGGAGCCGCTGGACTGGTCGCGGATCACCCTCAGCCTGGCCGACGAGCGCTGGGTGCCGGAGTCGCATGCCGATAGCAACGCCgg < 1:878126/151‑1 (MQ=255)
gggCCAGGCGCTGCTGGTGGTGTCCGGTGGGCGCAGTCCGGTGGCCTTCCTCGAAGCCTTGAGCGAGGAGCCGCTGGACTGGTCGCGGATCACCCTCAGCCTGGCCGACGAGCGCTGGGTGCCGGAGTCGCATGCCGATAGCAACGCCGGc < 1:7908124/151‑1 (MQ=255)
cAGGCGCTGCTGGTGGTGTCCGGTGGGCGCAGTCCGGTGGCCTTCCTCGAAGCCTTGAGCGAGGAGCCGCTGGACTGGTCGCGGATCACCCTCAGCCTGGCCGACGAGCGCTGGGTGCCGGAGTCGCATGCCGATAGCAACGCCGGCCTgg > 1:8164377/1‑151 (MQ=255)
aGGCGCTGCTGGTGGTGTCCGGTGGGCGCAGTCCGGTGGCCTTCCTCGAAGCCTTGAGCGAGGAGCCGCTGGACTGGTCGCGGATCACCCTCAGCCTGGCCGACGAGCGCTGGGTGCCGGAGTCGCATGCCGATAGCAACGCCGGCCTGGt > 1:2404849/1‑151 (MQ=255)
gctgctGGTGGTGTCCGGTGGGCGCAGTCCGGTGGCCTTCCTCGAAGCCTTGAGCGAGGAGCCGCTGGACTGGTCGCGGATCACCCTCAGCCTGGCCGACGAGCGCTGGGTGCCGGAGTCGCATGCCGATAGCAACg > 2:4549452/1‑137 (MQ=255)
gctgctGGTGGTGTCCGGTGGGCGCAGTCCGGTGGCCTTCCTCGAAGCCTTGAGCGAGGAGCCGCTGGACTGGTCGCGGATCACCCTCAGCCTGGCCGACGAGCGCTGGGTGCCGGAGTCGCATGCCGATAGCAACGCCGGCCTGGTTcgc > 1:3713192/1‑151 (MQ=255)
tgctgGTGGTGTCCGGTGGGCGCAGTCCGGTGGCCTTCCTCGAAGCCTTGAGCGAGGAGCCGCTGGACTGGTCGCGGATCACCCTCAGCCTGGCCGACGAGCGCTGGGTGCCGGAGTCGCATGCCGATAGCAACGCCGGCCTGGTTcgccg > 1:9725688/1‑151 (MQ=255)
ctgGTGGTGTCCGGTGGGCGCAGTCCGGTGGCCTTCCTCGAAGCCTTGAGCGAGGAGCCGCTGGACTGGTCGCGGATCACCCTCAGCCTGGCCGACGAGCGCTGGGTGCCGGAGTCGCATGCCGATAGCAACGCCGGCCTGGTTCgccgcc < 2:9195427/151‑1 (MQ=255)
gtggtgTCCGGTGGGCGCAGTCCGGTGGCCTTCCTCGAAGCCTTGAGCGAGGAGCCGCTGGACTGGTCGCGGATCACCCTCAGCCTGGCCGACGAGCGCTGGGTGCCGGAGTCGCATGCCGATAGCAACGCCGGCCTGGTTCGCCGCCAcc < 1:2263008/151‑1 (MQ=255)
tggtgTCCGGTGGGCGCAGTCCGGTGGCCTTCCTCGAAGCCTTGAGCGAGGAGCCGCTGGACTGGTCGCGGATCACCCTCAGCCTGGCCGACGAGCGCTGGGTGCCGGAGTCGCATGCCGATAGCAACGCCGGCCTGGTTCGCCGCCACCt < 2:5275671/151‑1 (MQ=255)
tggtgTCCGGTGGGCGCAGTCCGGTGGCCTTCCTCGAAGCCTTGAGCGAGGAGCCGCTGGACTGGTCGCGGATCACCCTCAGCCTGGCCGACGAGCGCTGGGTGCCGGAGTCGCATGCCGATAGCAACGCCGGCCTGGTTCGCCGCCACCt < 1:4205442/151‑1 (MQ=255)
ggtgTCCGGTGGGCGCAGTCCGGTGGCCTTCCTCGAAGCCTTGAGCGAGGAGCCGCTGGACTGGTCGCGGATCACCCTCAGCCTGGCCGACGAGCGCTGGGTGCCGGAGTCGCATGCCGATAGCAACGCCGGCCTGGTTCGCCGCCACCTg < 1:5176593/151‑1 (MQ=255)
gtgtCCGGTGGGCGCAGTCCGGTGGCCTTCCTCGAAGCCTTGAGCGAGGAGCCGCTGGACTGGTCGCGGATCACCCTCAGCCTGGCCGACGAGCGCTGGGTGCCGGAGTCGCATGCCGATAGCAACGCCGGCCTGGTTCGCCGCCACCTGc > 2:1685177/1‑151 (MQ=255)
gtgtCCGGTGGGCGCAGTCCGGTGGCCTTCCTCGAAGCCTTGAGCGAGGAGCCGCTGGACTGGTCGCGGATCACCCTCAGCCTGGCCGACGAGCGCTGGGTGCCGGAGTCGCATGCCGATAGCAACGCCGGCCTGGTTCGCCGCCACCTGc < 1:6520567/151‑1 (MQ=255)
tgtCCGGTGGGCGCAGTCCGGTGGCCTTCCTCGAAGCCTTGAGCGAGGAGCCGCTGGACTGGTCGCGGATCACCCTCAGCCTGGCCGACGAGCGCTGGGTGCCGGAGTCGCATGCCGATAGCAACGCCGGCCTGGTTCGCCGCCACCTGCt > 1:9050006/1‑151 (MQ=255)
tCCGGTGGGCGCAGTCCGGTGGCCTTCCTCGAAGCCTTGAGCGAGGAGCCGCTGGACTGGTCGCGGATCACCCTCAGCCTGGCCGACGAGCGCTGGGTGCCGGAGTCGCATGCCGATAGCAACGCCGGCCTGGTTCGCCGCCACCTGCTcc > 1:10022321/1‑151 (MQ=255)
ccGGTGGGCGCAGTCCGGTGGCCTTCCTCGAAGCCTTGAGCGAGGAGCCGCTGGACTGGTCGCGGATCACCCTCAGCCTGGCCGACGAGCGCTGGGTGCCGGAGTCGCATGCCGATAGCAACGCCGGCCTGGTTCGCCGCCACCTGCTCCg > 2:2747602/1‑151 (MQ=255)
cGGTGGGCGCAGTCCGGTGGCCTTCCTCGAAGCCTTGAGCGAGGAGCCGCTGGACTGGGCGCGGATCACCCTCAGCCTGGCCGACGAGCGCTGGGTGCCGGAGTCGCATGCCGATAGCTACGCCGGCCGGGTTCGCCGCCACCTGCTCCGt > 2:11204820/1‑151 (MQ=255)
ggTGGGCGCAGTCCGGTGGCCTTCCTCGAAGCCTTGAGCGAGGAGCCGCTGGACTGGTCGCGGATCACCCTCAGCCTGGCCGACGAGCGCTGGGTGCCGGAGTCGCATGCCGATAGCAACGCCGGCCTGGTTCGCCGCCACCTGCTCCGTg > 1:10211116/1‑151 (MQ=255)
tGGGCGCAGTCCGGTGGCCTTCCTCGAAGCCTTGAGCGAGGAGCCGCTGGACTGGTCGCGGATCACCCTCAGCCTGGCCGACGAGCGCTGGGTGCCGGAGTCGCATGCCGATAGCAACGCCGGCCTGGTTCGCCGCCACCTGCTCCGTGGc < 2:3336626/151‑1 (MQ=255)
tGGGCGCAGTCCGGTGGCCTTCCTCGAAGCCTTGAGCGAGGAGCCGCTGGACTGGTCGCGGATCACCCTCAGCCTGGCCGACGAGCGCTGGGTGCCGGAGTCGCATGCCGATAGCAACGCCGGCCTGGTTCGCCGCCACCTGCTCCGTGGc < 1:17278/151‑1 (MQ=255)
gggCGCAGTCCGGTGGCCTTCCTCGAAGCCTTGAGCGAGGAGCCGCTGGACTGGTCGCGGATCACCCTCAGCCTGGCCGACGAGCGCTGGGTGCCGGAGTCGCATGCCGATAGCAACGCCGGCCTGGTTCGCCGCCACCTGCTCCGTGGCg > 2:5527954/1‑151 (MQ=255)
gggCGCAGTCCGGTGGCCTTCCTCGAAGCCTTGAGCGAGGAGCCGCTGGACTGGTCGCGGATCACCCTCAGCCTGGCCGACGAGCGCTGGGTGCCGGAGTCGCATGCCGATAGCAACGCCGGCCTGGTTCGCCGCCACCTGCTCCGTGGCg > 1:827182/1‑151 (MQ=255)
cAGTCCGGTGGCCTTCCTCGAAGCCTTGAGCGAGGAGCCGCGGGACTGGTCGCGGATCACCCTCAGCCTGGCCGACGAGCGCTGGGTGCCGGAGTCGCATGCCGATAGCAACGCCGGCCTGGTTCGCCGCCACCTGCTCCGTGGCGAggcg < 1:10576740/151‑1 (MQ=255)
aGTCCGGTGGCCTTCCTCGAAGCCTTGAGCGAGGAGCCGCTGGACTGGTCGCGGATCACCCTCAGCCTGGCCGACGAGCGCTGGGTGCCGGAGTCGCATGCCGATAGCAACGCCGGCCTGGTTCGCCGCCACCTGCTCCGTGGCGAggcgg > 1:3821459/1‑151 (MQ=255)
aGTCCGGTGGCCTTCCTCGAAGCCTTGAGCGAGGAGCCGCTGGACTGGTCGCGGATCACCCTCAGCCTGGCCGACGAGCGCTGGGTGCCGGAGTCGCATGCCGATAGCAACGCCGGCCTGGTTCGCCGCCACCTGCTCCGTGGCGAggcgg > 2:10633109/1‑151 (MQ=255)
aGTCCGGTGGCCTTCCTCGAAGCCTTGAGCGAGGAGCCGCTGGACTGGTCGCGGATCACCCTCAGCCTGGCCGACGAGCGCTGGGTGCCGGAGTCGCATGCCGATAGCAACGCCGGCCTGGTTCGCCGCCACCTGCTCCGTGGCGAggcgg < 1:1872543/151‑1 (MQ=255)
ccGGTGGCCTTCCTCGAAGCCTTGAGCGAGGAGCCGCTGGACTGGTCGCGGATCACCCTCAGCCTGGCCGACGAGCGCTGGGTGCCGGAGTCGCATGCCGATAGCAACGCCGGCCTGGTTCGCCGCCACCTGCTCCGTGGCGAGGCGGCGa < 2:8970537/151‑1 (MQ=255)
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GAGCGAGGAGCCGCTGGACTGGTCGCGGATCACCCTCAGCCTGGCCGACGAGCGCTGGGTGCCGGAGTCGCATGCCGATAGCAACGCCGGCCTGGTTCGCCGCCACCTGCTCCGTGGCGAGGCGGCGAAGGCGCGCTTCATCGGCCTCTAC > SRR18135093.1288714/1‑151 (MQ=60)
GAGCGAGGAGCCGCTGGACTGGTCGCGGATCACCCTCAGCCTGGCCGACGAGCGCTGGGTGCCGGAGTCGCATGCCGATAGCAACGCCGGCCAGGTTCGCCGCCACCTGCTCCGTGGCGAGGCGGCGAAGGCGCGATTCATCGGCCTCTAC > SRR18135093.5660181/1‑151 (MQ=60)
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AGCGAGGAGCCGCTGGACTGGTCGCGGATCACCCTCAGCCTGGCCGACGAGCGCTGGGTGCCGGAGTCGCATGCCGATAGCAACGCCGGCCTGGTTCGCCGCCACCTGCTCCGTGGCGAGGCGGCGAAGGCGCGCTTCATCGGCCTCTACC > SRR18135093.8392603/1‑151 (MQ=60)
GCGAGGAGCCGCTGGACTGGTCGCGGATCACCCTCAGCCTGGCCGACGAGCGCTGGGTGCCGGAGTCGCATGCCGATAGCAACGCCGGCCTGGTTCGCCGCCACCTGCTCCGTGGCGAGGCGGCGAAGGCGCGCTTCATCGGCCTCTACCA < SRR18135093.6372745/151‑1 (MQ=60)
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GTCTGGGGCAGCGCCGCCGAGCAGGCCCGCGGCCTGGCCGCCGAGGTCGCCGGCCGGTTGCGCTCGGCGCTGGCCGAGCAGGGCCAGGCGCTGCTGGTGGTGTCCGGTGGGCGCAGTCCGGTGGCCTTCCTCGAAGCCTTGAGCGAGGATCAGGTGGACTGGTCGCGGATCACCCTCAGCCTGGCCGACGAGCGCTGGGTGCCGGAGTCGCATGCCGATAGCAACGCCGGCCTGGTTCGCCGCCACCTGCTCCGTGGCGAGGCGGCGAAGGCGCGCTTCATCGGCCTCTACCA > NC_008463/2001660‑2001952
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 0 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
