Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A3 F1 I1 R1
|
256 |
517.8 |
22465524 |
99.2% |
22285799 |
151.0 |
Breseq alignment
BRESEQ :: Evidence
|
| evidence |
seq id |
position |
mutation |
annotation |
gene |
description |
| RA |
NC_008463 |
5,198,405 |
T→C |
intergenic (+31/+37) |
PA14_RS23800 → / ← mdpA |
ABC transporter substrate‑binding protein/metallopeptidase MdpA |
|
| |
seq id |
position |
ref |
new |
freq |
score (cons/poly) |
reads |
annotation |
genes |
product |
| * | NC_008463 | 5,198,405 | 0 | T | C | 99.8%
| 1708.9
/ NA
| 439 | intergenic (+31/+37) | PA14_RS23800/mdpA | ABC transporter substrate‑binding protein/metallopeptidase MdpA |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (0/0); major base C (198/240); minor base A (0/1); total (198/241) |
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 |
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 |
Only 100 of 441 total aligned reads displayed.
GATGCCCTGGTTGCCGCTGGCGCATCCGTTGATGTTCGACGCGCAACGCAAGAACGTCAGCGGCTACCGCATGAGCCCGATGTCGGCGCGGGACTTTTCGCGGGTGAAGCTGGACTGATCGCTGCGCCGCACGCGGGAAGCCCTGGCCTTTGCCTTCCCGCGTGCGGCGTTATCGTTCGGCCGGCTCAGCCGCCGAGGCCGAAGGGATCGTCGATGGACGGACTCGGTTGGGTGAACCAGCGTGGTCCTTCCTCCGTCATGTAGAAGTGATCCTCCAGGCGAATGCCGAACTCGCC > NC_008463/5198257‑5198552
|
gATGCCCTGGTTGCCGCTGGCGCATCCGTTGATGTTCGACGCGCAACGCAAGAACGTCAGCGGCTACCGCATGAGCCCGATGTCGGCGCGGGACTTTTCGCGGGTGAAGCTGGACTGATCGCTGCGCCGCACGCGGGAAGCCCTGGCCctt < 2:4824339/151‑1 (MQ=255)
aTGCCCTGGTTGCCGCTGGCGCATCCGTTGATGTTCGACGCGCAACGCAAGAACGTCAGCGGCTACCGCATGAGCCCGATGTCGGCGCGGGACTTTTCGCGGGTGAAGCTGGACTGATCGCTGCGCCGCACGCGGGAAGCCCTGGCCCTTg < 1:2130176/151‑1 (MQ=255)
gCCCTGGTTGCCGCTGGCGCATCCGTTGATGTTCGACGCGCAACGCAAGAACGTCAGCGGCTACCGCATGAGCCCGATGTCGGCGCGGGACTTTTCGCGGGTGAAGCTGGACTGATCGCTGCGCCGCACGCGGGAAGCCCTGGCCCTTGcc < 1:1916377/151‑1 (MQ=255)
cccTGGTTGCCGCTGGCGCATCCGTTGATGTTCGACGCGCAACGCAAGAACGTCAGCGGCTACCGCATGAGCCCGATGTCGGCGCGGGACTTTTCGCGGGTGAAGCTGGACTGATCGCTGCGCCGCACGCGGGAAGCCCTGGCCCTTGCCt > 1:386952/1‑151 (MQ=255)
cccTGGTTGCCGCTGGCGCATCCGTTGATGTTCGACGCGCAACGCAAGAACGTCAGCGGCTACCGCATGAGCCCGAGGTCGGCGCGGGACTTTTCGCGGGTGAAGCTGGACTGATCGCTGCGCCGCACGCGGGAAGCCCTGGCCCTTGccg > 2:8891275/1‑150 (MQ=255)
cTGGTTGCCGCTGGCGCATCCGTTGATGTTCGACGCGCAACGCAAGCACGTCAGCGGCTACCGCATGAGCCCGATGTCGGCGCGGGCCTGTTCGCGGGTGAAGCTGGACTGATCGCTGCGCCGCTCGCGGGAAGCCCTGGCCCTTGCCTTc > 2:4497554/1‑151 (MQ=255)
cTGGTTGCCGCTGGCGCATCCGTTGATGTTCGACGCGCAACGCAAGAACGTCAGCGGCTACCGCATGAGCCCGATGTCGGCGCGGGACTTTTCGCGGGTGAAGCTGGACTGATCGCTGCGCCGCACGCGGGAAGCCCTGGCCCTTGCCTTc < 1:9748506/151‑1 (MQ=255)
ggTTGCCGCTGGCGCATCCGGTGATGTTCGACGCGCAACGCAAGACCGTCAGCGGCTACCGCATGAGCCCGATGTCGGCGCGGGACTTGTAGCGGGTGAAGCTGGACTGATCGCTGCGCCGCACGCGGGACGCCCTGGCCCTTGCCTTccc > 2:6089636/1‑151 (MQ=255)
gTTGCCGCTGGCGCATCCGTTGATGTTCGACGCGCAACGCAAGAACGTCAGCGGCTACCGCATGAGCCCGATGTCGGCGCGGGACTTTTCGCGGGTGAAGCTGGACTGATCGCTGCGCCGCACGCGGGAAGCCCTGGCCCTTGCCTTCCcg < 1:1254337/151‑1 (MQ=255)
gTTGCCGCTGGCGAATCCGTTGATGTTCGACGCGCAACGCAAGAACGTCAGCGGCTACCGCATGAGCCCGATGTAGGCGCGGGACTATTCGCGGGTGAAGCTGTACTGATCGCTGCGCCGCACGAGGGAAGCCCTGGCCCTGGCCTTCCcg > 2:8652687/1‑151 (MQ=255)
ttGCCGCTGGCGCATCCGTTGATGTTCGACGCGCAACGCAAGAACGTCAGCGGCTACCGCATGAGCCCGATGTCGGCGCGGGACTTTTCGCGGGTGAAGCTGGACTGATCGCTGCGCCGCACGCGGGAAGCCCTGGCCCTTGCCTTCCcgc < 2:3598196/151‑1 (MQ=255)
tGCCGCTGGCGCATCCGTTGATGTTCGACGCGCAACGCAAGAACGTCAGCGGCTACCGCATGAGCCCGATGTCGGCGCGGGACTTTTCGCGGGTGAAGCTGGACTGATCGCTGCGCCGCACGCGGGAAGCCCTGGCCCTTGCCTTCCcgcg < 1:530313/151‑1 (MQ=255)
cGCTGGCGCATCCGTTGATGTTCGACGCGCAACGCAAGAACGTCAGCGGCTACCGCATGAGCCCGATGTCGGCGCGGGACTTTTCGCGGGTGAAGCTGGACTGATCGCTGCGCCGCACGCGGGAATCCCTGGCCCTTGCCTTCCCGCGTgc > 1:2295259/1‑151 (MQ=255)
gCTGGCGCATCCGTTGATGTTCGACGCGCAACGCAAGAACGTCAGCGGCTACCGCATGAGCCCGATGTCGGCGCGGGACTTTTCGCGGGTGAAGCTGGACTGATCGCTGCGCCGCACGCGGGAAGCCCTGGCCCTTGCCTTCCCGCGTgcg > 1:1786712/1‑151 (MQ=255)
cTGGCGCATCCGTTGATGTTCGACGCGCAACGCAAGAACGTCAGCGGCTACCGCATGAGCCCGATGTCGGCGCGGGACTTTTCGCGGGTGAAGCTGGACTGATCGCTGCGCCGCACGCGGGAAGCCCTGGCCCTTGCCTTCCCGCGTgcgg > 1:7210319/1‑151 (MQ=255)
cTGGCGCATCCGTTGATGTTCGACGCGCAACGCAAGAACGTCAGCGGCTACCGCATGAGCCCGATGTCGGCGCGGGACTTTTCGCGGGTGAAGCTGGACTGATCGCTGCGCCGCACGCGGGAAGCCCTGGCCCTTGCCTTCCCGCGTgcgg < 1:8647868/151‑1 (MQ=255)
ggCGCATCCGTTGATGTTCGACGCGCAACGCAAGAACGTCAGCGGCTACCGCATGAGCCCGATGTCGGCGCGGGACTTTTCGCGGGTGAAGCTGGACTGATCGCTGCGCCGCACGCGGGAAGCCCTGGCCCTTGCCTTCCCGCGTgcggcg < 1:2688793/151‑1 (MQ=255)
cATCCGTTGATGTTCGACGCGCAACGCAAGAACGTCAGCGGCTACCGCATGAGCCCGATGTCGGCGCGGGACTTTTCGCGGGTGAAGCTGGACTGATCGCTGCGCCGCACGCGGGAAGCCCTGGCCCTTGCCTTCCCGCGTGCGGCGTTAt > 2:6829028/1‑151 (MQ=255)
tCCGTTGATGTTCGACGCGCAACGCAAGAACGTCAGCGGCTACCGCATGAGCCCGATGTCGGCGCGGGACTTTTCGCGGGTGAAGCTGGACTGATCGCTGCGCCGCACGCGGGAAGCCCTGGCCCTTGCCTTCCCGCGTGCGGCGTTATCg > 2:2247409/1‑151 (MQ=255)
ccGTTGATGTTCGACGCGCAACGCAAGAACGTCAGCGGCTACCGCATGAGCCCGATGTCGGCGCGGGACTTTTCGCGGGTGAAGCTGGACTGATCGCTGCGCCGCACGCGGGAAGCCCTGGCCCTTGCCTTCCCGCGTGCGGCGTTATCGt > 2:6554959/1‑151 (MQ=255)
cGTTGATGTTCGACGCGCAACGCAAGAACGTCAGCGGCTACCGCATGAGCCCGATGTCGGCGCGGGACTTTTCGCGGGTGAAGCTGGACTGATCGCTGCGCCGCACGCGGGAAGCCCTGGCCCTTGCCTTCCCGCGTGCGGCGTTATCGtt < 1:3413140/151‑1 (MQ=255)
cGTTGATGTTCGACGCGCAACGCAAGAACGTCAGCGGCTACCGCATGAGCACGATGTCGGCGCGGGACTTTTCGCGGGTGAAGCTGGACTGATCGCTGCGCCGCACGCGGGAAGCCCTGGCCCTTGCCTTCCCGCGTGCGGCGTTATCGtt < 2:2933528/151‑1 (MQ=255)
gTTGATGTTCGACGCGCAACGCAAGAACGTCAGCGGCTACCGCATGAGCCCGATGTCGGCGCGGGACTTTTCGCGGGTGAAGCTGGACTGATCGCTGCGCCGCACGCGGGAAGCCCTGGCCCTTGCCTTCCCGCGTGCGGCGTTATCGTTc > 1:9069037/1‑151 (MQ=255)
gTTGATGTTCGACGCGCAACGCAAGAACGTCAGCGGCTACCGCATGAGCCCGATGTCGGCGCGGGACTTTTCGCGGGTGAAGCTGGACTGATCGCTGCGCCGCACGCGGGAAGCCCTGGCCCTTGCCTTCCCGCGTGCGGCGTTATAGTTc > 1:4080384/1‑151 (MQ=255)
gTTCGACGCGCAACGCAAGAACGTCAGCGGCTACCGCATGAGCCCGATGTCGGCGCGGGACTTTTCGCGGGTGAAGCTGGACTGATCGCTGCGCCGCACGCGGGAAGCCCTGGCCCATGCCTTCCCGCGTGCGGCGGTATCGTTcggccgg > 1:9623690/1‑151 (MQ=255)
cGACGCGCAACGCAAGAACGTCAGCGGCTACCGCATGAGCCCGATGTCGGCGCGGGACTTTTCGCGGGTGAAGCTGGACTGATCGCTGCGCCGCACGCGGGAAGCCCTGGCCCTTGCCTTCCCGCGTGCGGCGTTATCGTTCGGCCGGCTc < 2:7644886/151‑1 (MQ=255)
cGACGCGCAACGCAAGAACGTCAGCGGCTACCGCATGAGCCCGATGTCGGCGCGGGACTTTTCGCGGGTGAAGCTGGACTGATCGCTGCGCCGCACGCGGGAAGCCCTGGCCCTTGCCTTCCCGCGTGCGGCGTTATCGTTCGGCCGGCTc < 2:128503/151‑1 (MQ=255)
cGACGCGCAACGCAAGAACGTCAGCGGCTACCGCATGAGCCCGATGTCGGCGCGGGACTTTTCGCGGGTGAAGCTGGACTGATCGCTGCGCCGCACGCGGGAAGCCCTGGCCCTTGCCTTCCCGCGTGCGGCGTTATCGGTCGGCCGGCTc > 1:298577/1‑151 (MQ=255)
gACGCGCAACGCAAGAACGTCAGCGGCTACCGCATGAGCCCGATGTCGGCGCGGGACTTTTCGCGGGTGAAGCTGGACTGATCGCTGCGCCGCACGCGGGAAGCCCTGGCCCTTGCCTTCCCGCGTGCGGCGTTATCGTTCGGCCGGCTCa < 1:9586147/151‑1 (MQ=255)
gACGCGCAACGCAAGAACGTCAGCGGCTACCGCATGAGCCCGATGTCGGCGCGGGACTTTTCGCGGGTGAAGCTGGACTGATCGCTGCGCCGCACGCGGGAAGCCCTGGCCCTTGCCTTCCCGCGTGCGGCGTTATCGTTCGGCCGGCTCa < 2:8101007/151‑1 (MQ=255)
aCGCGCAACGCAAGAACGTCAGCGGCTACCGCATGAGCCCGATGTCGGCGCGGGACTTTTCGCGGGTGAAGCTGGACTGATCGCTGCGCCGCACGCGGGAAGCCCTGGCCCTTGCCTTCCCGCGGGCGGCGTTATCGTTCGGCCGGCTccg > 1:688894/1‑149 (MQ=255)
gcgcAACGCAAGAACGTCAGCGGCTACCGCATGAGCCCGATGTCGGCGCGGGACTTTTCGCGGGTGAAGCTGGACTGATCGCTGCGCCGCACGCGGGAAGCCCTGGCCCTTGCCTTCCCGCGTGCGGCGTTATCGTTCGGCCGGCTCAgcc < 2:7516834/151‑1 (MQ=255)
caacgcaaGAACGTCAGCGGCTACCGCATGAGCCCGATGTCGGCGCGGGACTTTTCGCGGGTGAAGCTGGACTGATCGCTGCGCCGCACGCGGGAAGCCCTGGCCCTTGCCTTCCCGCGTGCGGCGTTATCGTTCGGCCGGCTCAgccgcc < 1:10341156/151‑1 (MQ=255)
aacgcaaGAACGTCAGCGGCTACCGCATGAGCCCGATGTCGGCGCGGGACTTTTCGCGGGTGAAGCTGGACTGATCGCTGCGCCGCACGCGGGAAGCCCTGGCCCTTGCCTTCCCGCGTGCGGCGTTATCGGTCGGCCGGCTCAGccgccg > 1:6181603/1‑151 (MQ=255)
gcaaGAACGTCAGCGGCTACCGCATGAGCCCGATGTCGGCGCGGGACTTTTCGCGGGTGAAGCTGGACTGATCGCTGCGCCGCACGCGGGAAGCCCTGGCCCTTGCCTTCCCGCGTGCGGCGTTATCGTTCGGCCGGCTCAGCCGCCGCgg > 1:1683138/1‑151 (MQ=255)
gcaaGAACGTCAGCGGCTACCGCATGAGCCCGATGTCGGCGCGGGACTTTTCGCGGGTGAAGCTGGACTGATCGCTGCGCCGCACGCGGGAAGCCCTGGCCCTTGCCTTCCCGCGTGCGGCGTTATCGTTCGGCCGGCTCAGCCGCCGAgg < 1:2428494/151‑1 (MQ=255)
caaGAACGTCAGCGGCTACCGCATGAGCCCGATGTCGGCGCGGGACTTTTCGCGGGTGAAGCTGGACTGATCGCTGCGCCGCACGCGGGAAGCCCAGGGCCGTGCCGTCCCGCGTGCGGGGGTTTAGTTAGGGCGGCGCAGCCGCCGAGGc > 1:8423013/1‑151 (MQ=255)
gAACGTCAGCGGCTACCGCATGAGCCCGATGTCGGCGCGGGACTTTTCGCGGGTGAAGCTGGACTGATCGCTGCGCCGCACGCGGGAAGCCCTGGCCCTTGCCTTCCCGCGTGCGGCGTTATCGTTCGGCCGGCTCAGCCGCCGAGGCCGa < 1:5490788/151‑1 (MQ=255)
aCGTCAGCGGCTACCGCATGAGCCCGATGTCGGCGCGGGACTTTTCGCGGGTGAAGCTGGACTGATCGCTGCGCCGCACGCGGGAAGCCCTGGCCCTTGCCTTCCCGCGTGCGGCGTTATCGTTCGGCCGGCTCAGCCGCCGAGGCCGAAg > 2:7346504/1‑151 (MQ=255)
cGTCAGCGGCTACCGCATGAGCCCGATGTCGGCGCGGGACTTTTCGCGGGTGAAGCTGGACTGATCGCTGCGCCGCACGCGGGAAGCCCTGGCCCTTGCCTTCCCGCGTGCGGCGTTATCGTTCGGCCGGCTCAGCCGCCGAGGCCGAAgg < 1:7472816/151‑1 (MQ=255)
aGCGGCTACCGCATGAGCCCGATGTCGGCGCGGGACTTTTCGCGGGTGAAGCTGGACTGATCGCTGCGCCGCACGCGGGAAGCCCTGGCCCTTGCCTTCCCGCGTGCGGCGTTATCGTTCGGCCGGCTCAGCCGCCGAGGCCGAAGGGAtc < 2:10758724/151‑1 (MQ=255)
aGCGGCTACCGCATGAGCCCGATGTCGGCGCGGGACTTTTCGCGGGTGAAGCTGGACTGATCGCTGCGCCGCACGCGGGAAGCCCTGGCCCTTGCCTTCCCGCGTGCGGCGTTATCGTTCGGCCGGCTCAGCCGCCGAGGCCGAAGGGAtc > 1:9988134/1‑151 (MQ=255)
aGCGGCTACCGCATGAGCCCGATGTCGGCGCGGGACTTTTCGCGGGTGAAGCTGGACTGATCGCTGCGCCGCACGCGGGAAGCCCTGGCCCTTGCCTTCCCGCGTGCGGCGTTATCGTTCGGCCGGCTCAGCCGCCGAGGCCGAAGGGAtc < 2:9368501/151‑1 (MQ=255)
gCTACCGCATGAGCCCGATGTCGGCGCGGGACTTTTCGCGGGTGAAGCTGGACTGATCGCTGCGCCGCACGCGGGAAGCCCTGGCCCTTGCCTTCCCGCGTGCGGCGTTATCGTTCGGCCGGCTCAGCCGCCGAGGCCGAAGGGAtcgtcg < 1:2844016/151‑1 (MQ=255)
tACCGCATGAGCCCGATGTCGGCGCGGGACTTTTCGCGGGTGAAGCTGGACTGATCGCTGCGCCGCACGCGGGAAGCCCTGGCCCTTGCCTTCCCGCGTGCGGCGTTATCGTTCGGCCGGCTCAGCCGCCGAGGCCGAAGGGATCGTCGAt < 1:10587815/151‑1 (MQ=255)
ccGCATGAGCCCGATGTCGGCGCGGGACTTTTCGCGGGTGAAGCTGGACTGATCGCTGCGCCGCACGCGGGAAGCCCTGGCCCTTGCCTTCCCGCGTGCGGCGTTATCGTTCGGCCGGCTCAGCCGCCGAGGCCGAAGGGATCGTCGATgg < 1:4270902/151‑1 (MQ=255)
gCATGAGCCCGATGTCGGCGCGGGACTTTTCGCGGGTGAAGCTGGACTGATCGCTGCGCCGCACGCGGGAAGCCCTGGCCCTTGCCTTCCCGCGTGCGGCGTTATCGTTCGGCCGGCTCAGCCGCCGAGGCCGAAGGGATCGTCGATggac < 2:10390551/151‑1 (MQ=255)
aTGAGCCCGATGTCGGCGCGGGACTTTTCGCGGGTGAAGCTGGACTGATCGCTGCGCCGCACGCGGGAAGCCCTGGCCCTTGCCTTCCCGCGTGCGGCGTTATCGTTCGGCCGGCTCAGCCGCCGAGGCCGAAGGGATCGTCGATggacgg < 2:4124830/151‑1 (MQ=255)
gAGCCCGATGTCGGCGCGGGACTTTTCGCGGGTGAAGCTGGACTGATCGCTGCGCCGCCCGCGGGAAGCCCTGGCCCTTGCCTTCCCGCGTGCGGCGTTATCGTTCGGCCGGCTCAGCCGCCGAGGCCGAAGGGATCGTCGATggacggac < 2:8398530/151‑1 (MQ=255)
gATGTCGGCGCGGGACTTTTCGCGGGTGAAGCTGGACTGATCGCTGCGCCGCACGCGGGAAGCCCTGGCCCTTGCCTTCCCGCGTGCGGCGTTATCGTTCGGCCGGCTCAGCCGCCGAGGCCGAAGGGATCGTCGATGGACGGACTCgggt > 1:10208028/1‑149 (MQ=255)
aTGTCGGCGCGGGACTTTTCGCGGGTGAAGCTGGACTGATCGCTGCGCCGCACGCGGGAAGCCCTGGCCCTTTCCTTCCCGCGTGCGGCGTTATCGTTCGGCCGGCTCTGCCGCCGAGGCCGAAGGGATCGTCGATGGACGGACTCGGTTg > 1:11113861/1‑151 (MQ=255)
tGTCGGCGCGGGACTTTTCGCGGGTGAAGCTGGACTGATCGCTGCGCCGCACGCGGGAAGCCCTGGCCCTTGCCTTCCCGCGTGCGGCGTTATCGTTCGGCCGGCTCAGCCGCCGAGGCCGAAGGGATCGTCGATGGACGGACTCGGTTgg < 2:11222052/151‑1 (MQ=255)
gTCGGCGCGGGACTTTTCGCGGGTGAAGCTGGACTGATCGCTGCGCCGCACGCGGGAAGCCCTGGCCCTTGCCTTCCCGCGTGCGGCGTTATCGTTCGGCCGGCTCAGCCGCCGAGGCCGAAGGGATCGTCGATGGACGGACTCGGTTggg < 1:7114843/151‑1 (MQ=255)
tCGGCGCGGGACTTTTCGCGGGTGAAGCTGGACTGATCGCTGCGCCGCACGCGGGAAGCCCTGGCCCTTGCCTTCCCGCGTGCGGCGTTATCGTTCGGCCGGCTCAGCCGCCGAGGCCGAAGGGATCGTCGATGGACGGACTCGGTTGGGt < 1:5789557/151‑1 (MQ=255)
cGGCGCGGGACTTTTCGCGGGTGAAGCTGGACTGATCGCTGCGCCGCACGCGGGAAGCCCTGGCCCTTGCCTTCCCGCGTGCGGCGTTATCGTTCGGCCGGCTCAGCCGCCGAGGCCGAAGGGATCGTCGATGGACGGACTCGGTTGGGTg > 2:11108062/1‑151 (MQ=255)
ggCGCGGGACTTTTCGCGGGTGAAGCTGGACTGATCGCTGCGCCGCACGCGGGAAGCCCTGGCCATTGCCTTCCCGCGTGCGGCGTTATCGTTCGGCCGGCTCAGCCGCCGAGGCCGAAGGGATCGTCGATGGACGGACTCGGTTGGGTGa < 2:1867081/151‑1 (MQ=255)
ggCGCGGGACTTTTCGCGGGTGAAGCTGGACTGATCCCTGCGCCGCACGCGGGAAGCCCTGGCCCTTGCCTTCCCGCGTGCGGCGTTATCGTTCGGCCGGCGCAGCCGCCGAGGCCGAAGGGATCGGCGATGGACGGACTCGGGTGGGTGa > 2:4257418/1‑151 (MQ=255)
cgcgGGACTTTTCGCGGGTGAAGCTGGACTGATCGCTGCGCCGCACGCGGGAAGCCCTGGCCCTTGCCTTCCCGCGTGCGGCGTTATCGTTCGGCCGGCTCAGCCGCCGAGGCCGAAGGGATCGTCGATGGACGGACTCGGTTGGGTGAAc < 2:9187996/151‑1 (MQ=255)
ggACTTTTCGCGGGTGAAGCTGGACTGATCGCTGCGCCGCACGCGGGAAGCCCTGGCCCTTGCCTTCCCGCGTGCGGCGTTATCGTTCGGCCGGCTCAGCCGCCGAGGCCGAAGGGATCGTCGATGGACGGACTCGGTTGGGTGAACCAGc < 2:8193645/151‑1 (MQ=255)
ggACTTTTCGCGGGTGAAGCTGGACTGATCGCTGCGCCGCACGCGGGAAGCCCTGGCCCTTGCCTTCCCGCGTGCGGCGTTATCGTTCGGCCGGCTCAGCCGCCGAGGCCGAAGGGATCGTCGATGGACGGACTCGGTTGGGTGAACCAGc < 1:7593939/151‑1 (MQ=255)
aCTTTTCGCGGGTGAAGCTGGACTGATCGCTGCGCCGCACGCGGGAAGCCCTGGCCCTTGCCTTCCCGCGTGCGGCGTTATCGTTCGGCCGGCTCAGCCGCCGAGGCCGAAGGGATCGTCGATGGACGGACTCGGTTGGGTGAACCAGCGt < 1:6503422/151‑1 (MQ=255)
tgttCGCGGGTGAAGCTGGACTGATCGCTGCGCCTCACGCGGGAAGCCCTTGCCCTTGCCTTCCCGCGTGCGGCGTTATCGTTCGGCCGGCTCAGCCGCCGAGGCCGAAGGGATCGTCGATGGACGGACTCGGTTGGGTGAACCAGCGTgg < 2:3274723/149‑1 (MQ=255)
tttCGCGGGTGAAGCTGGACTGATCGCTGCGCCGCACGCGGGAAGCCCTGGCCCTTGCCTTCCCGCGTGCGGCGTTATCGTTCGGCCGGCTCAGCCGCCGAGGCCGAAGGGATCGTCGATGGACGGACTCGGGTGGGTGAACCAGCGTGGt > 2:7078255/1‑151 (MQ=255)
gcgGGTGAAGCTGGACTGATCGCTGCGCCGCACGCGGGAAGCCCTGGCCCTTGCCTTCCCGCGTGCGGCGTTATCGTTCGGCCGGCTCAGCCGCCGAGGCCGAAGGGATCGTCGATGGACGGACTCGGTTGGGTGAACCAGCGTGGtccgt > 2:5781626/1‑149 (MQ=255)
gggTGAAGCTGGACTGATCGCTGCGCCGCCCGCGGGAAGCCCTGGCCCTTGCCTTCCCGCGTGCGGCGGTATCGGTCGGGCGGCTCAGCCGCCGAGGCCGCAGGGATCGTCGATGGACGGACTCGGGTGGGTGAACCAGCGGGGtccttcc > 2:6643460/1‑151 (MQ=255)
gggTGAAGCTGGACTGATCGCTGCGCCGCACGCGGGAAGCCCTGGCCCTTGCCTTCCCGCGTGCGGCGTTATCGTTCGGCCGGCTCAGCCGCCGAGGCCGAAGGGATCGTCGATGGACGGACTCGGTTGGGTGAACCAGCGTGGtccttcc < 2:6154407/151‑1 (MQ=255)
gggTGAAGCTGGACTGATCGCTGCGCCGCACGCGGGAAGCCCTGGCCCTTGCCTTCCCGCGTGCGGCGTTATCGTTCGGCCGGCTCAGCCGCCGAGGCCGAAGGGATCGTCGATGGACGGACTCGGTTGGGTGAACCAGCGTGGtccttcc < 1:9380834/151‑1 (MQ=255)
ggTGAAGCTGGACTGATCGCTGCGCCGCACGCGGGAAGCCCTGGCCCTTGCCTTCCCGCGTGCGGCGTTATCGTTCGGCCGGCTCAGCCGCCGAGGCCGAAGGGATCGTCGATGGACGGACTCGGTTGGGTGAACCAGCGTGGtccttcct < 2:5516246/151‑1 (MQ=255)
ggTGAAGCTGGACTGATCGCTGCGCCGCACGCGGGAAGCCCTGGCCCTTGCCTTCCCGCGTGCGGCGGTATCGTTCGGCCGGCTCAGCCGCCGAGGCCGATGGGATCGGCGATGGACGGACGCGGTTGGGTGAACCAGCGTGGtccttcct > 2:4613789/1‑151 (MQ=255)
gTGAAGCTGGACTGATCGCTGCGCCGCACGCGGGAAGCCCTGGCCCTTGCCTTCCCGCGTGCGGCGTTATCGTTCGGCCGGCTCAGCCGCCGAGGCCGAAGGGATCGTCGATGGACGGACTCGGTTGGGTGAACCAGCGTGGTCCTtcctc < 1:3755083/151‑1 (MQ=255)
gTGAAGCTGGACTGATCGCTGCGCCGCACGCGGGAAGCCCTGGCCCTTGCCTTCCCGCGTGCGGCGTTATCGTTCGGCCGGCTCAGCCGCCGAGGCCGAAGGGATCGTCGATGGACGGACTCGGTTGGGTGAACCAGCGTGGTCCTtcctc < 2:9562221/151‑1 (MQ=255)
gAAGCTGGACTGATCGCTGCGCCGCACGCGGGAAGCCCTGGCCCTTGCCTTCCCGCGTGCGGCGTTATCGTTCGGCCGGCTCAGCCGCCGAGGCCGAAGGGATCGTCGATGGACGGACTCGGTTGGGTGAACCAGCGTGGTCCTTCCTCCg < 2:5590114/151‑1 (MQ=255)
aGCTGGACTGATCGCTGCGCCGCACGCGGGAAGCCCTGGCCCTTGCCTTCCCGCGTGCGGCGTTATCGTTCGGCCGGCTCAGCCGCCGAGGCCGAAGGGATCGTCGATGGACGGACTCGGTTGGGTGAACCAGCGTGGTCCTTCCTCCGTc < 1:6762967/151‑1 (MQ=255)
ggACTGATCGCTGCGCCGCACGCGGGAAGCCCTGGCCCTTGCCTTCCCGCGTGCGGCGTTATCGTTCGGCCGGCTCAGCCGCCGAGGCCGAAGGGATCGTCGATGGACGGACTCGGTTGGGTGAACCAGCGTGGTCCTTCCTCCGTCATGt < 1:7756942/151‑1 (MQ=255)
tGATCGCTGCGCCGCACGCGGGAAGCCCTGGCCCTTGCCTTCCCGCGTGCGGCGTTATCGTTCGGCCGGCTCAGCCGCCGAGGCCGAAGGGATCGTCGATGGACGGACTCGGTTGGGTGAACCAGCGTGGTCCTTCCTCCGTCATGTAGaa < 1:3086316/151‑1 (MQ=255)
tGATCGCTGCGCCGCACGCGGGAAGCCCTGGCCCTTGCCTTCCCGCGAGCGGCGTTATCGTTCGGCCGGCTCAGCCGCCGAGGCCGAAGGGATCGTCGATGGACGGACTCGGTTGGGTGAACCAGCGTGGTCCTTCCTCCGTCATGTAGaa < 2:9830520/151‑1 (MQ=255)
tGATCGCTGCGCCGCACGCGGGAAGCCCTGGCCCTTGCCGTCCCGCGTGCGGCGTTATCGTTCGGCCGGCTCAGCCGCCGAGGCCGAAGGGATCGTCGATGGACGGACTCGGTTGGGTGAACCAGCGTGGTCCTTCCTCCGTCATGTAGaa < 1:4923599/151‑1 (MQ=255)
cGCTGCGCCGCACGCGGGAAGCCCTGGCCCTTGCCTTCCCGCGTGCGGCGTTATCGTTCGGCCGGCTCAGCCGCCGAGGCCGATGGGATCGTCGATGGACGGACTCGGTTGGGTGAACCAGCGTGGTCCTTCCTCCGTCATGTAGAAGTGa < 1:5859169/151‑1 (MQ=255)
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cGCTGCGCCGCACGCGGGAAGCCCAGGCCCATGCCATACCGCGTGCGGCGTTATCGTTCGGCCGGCTCAGCCGCCGAGGCCCAAGGGCACGTCGATGGACCGACACGGGTGGGTGAACCAGCGTGGTCCGTCCGCCGTCATGTAGAAGTGa > 1:9139354/1‑151 (MQ=255)
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CAACGCAAGAACGTCAGCGGCTACCGCATGAGCCCGATGTCGGCGCGGGACTTTTCGCGGGTGAAGCTGGACTGATCGCTGCGCCGCACGCGGGAAGCCCTGGCCCTTGCCTTCCCGCGTGCGGCGTTATCGTTCGGCCGGCTCAGCCGCC < SRR18135093.10386595/151‑1 (MQ=60)
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ACGCAAGACCGTCAGCGGCTACCGCCTGAGCCCGATGTCGGCGCGGGACTTTTCGCGGGTGAAGCTGGACTGATCGCTGCGCCGCACGCGGGAAGCCCTGGCCCTTGCCTTCCCGCGTGCGGCGTTATCGTTCGGCCGGCTCAGCCGCCGA < SRR18135093.6915377/151‑1 (MQ=60)
ACGCAAGAACGTCAGCGGCTACCGCATGAGCCCGATGTCGGCGCGGGACTTTTCGCGGGTGAAGCTGGACTGATCGCTGCGCCGCACGCGGGAAGCCCTGGCCCTTGCCTTCCCGCGTGCGGCGTTATCGTTCGGCCGGCTCAGCCGCCGA < SRR18135093.4670137/151‑1 (MQ=60)
GCAAGAACGTCAGCGGCTACCGCATGAGCCCGATGTCGGCGCGGGACTTTTCGCGGGTGAAGCTGGACTGATCGCTGCGCCGCACGCGGGAAGCCCTGGCCCTTGCCTTCCCGCGTGCGGCGTTATCGTTCGGCCGGCTCAGCCGCCGAGG < SRR18135093.2439820/151‑1 (MQ=60)
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CCGCATGAGCCCGATGTCGGCGCGGGACTTTTCGCGGGTGAAGCTGGACTGATCGCTGCGCCGCACGCGGGAAGCCCTGGCCCTTGCCTTCCCGCGTGCGGCGTTATCGTTCGGCCGGCTCAGCCGCCGAGGCCGAAGGGATCGTCGATGG < SRR18135093.4290941/151‑1 (MQ=60)
CGCATGAGCCCGATGTCGGCGCGGGACTTTTCGCGGGTGAAGCTGGACTGATCGCTGCGCCGCACGCGGGAAGCCCTGGCCCTTGCCTTCCCGCGTGCGGCGTTATCGTTCGGCCGGCTCAGCCGCCGAGGCCGAAGGGATCGTCGATGGA < SRR18135093.140881/151‑1 (MQ=60)
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TGAAGCTGGACTGATCGCTGCGCCGCACGCGGGAAGCCCTGGCCCTTGCCGTCCCGCGTGCGGCGTTATCGTTCGGCCGGCTCAGCCGCCGAGGCCGAAGGGATCGTCGATGGACGGACTCGGTTGGGTGAACCAGCGTGGTCCTTCCTCC < SRR18135093.10971873/151‑1 (MQ=60)
GAAGCTGGACTGATCGCTGCGCCGCCCGCGGGAAGCCCTGGCCCTTGCCTTCCCGCGTGCGGCGTTATCGTTCGGCCGGCTCAGCCGCCGAGGCCGAAGGGATCGTCGATGGACGGACTCGGTTGGGTGAACCAGCGTGGTCCTTCCTCCG < SRR18135093.2326401/151‑1 (MQ=60)
AAGCTGGACTGATCGCTGCGCCGCACGCGGGTAGCCCAGGCCCATGCCTTACCCCGTGCGGCGTTATCGTTAGGCCGGCTCAGCCGCCCAGGCCGGAGGGGTCGTCGATGGACGGACGCGGGTTGGTGAACCAGCGTGGTCCTTacgcccg > SRR18135093.5542922/1‑144 (MQ=60)
AAGCTGGACTGATCGCTGCGCCGCACGCGGGAAGCCCGGGCCCGTGCCTTCCCCCGGGCGGCGTTATAGTTCGGCCGGCTCAGCCGCCGAGGCCCACGGGCTCGTCGATGGACGGACTCGGTTGGGTGTACCAGCGTGGTCCTTCCTCCCT > SRR18135093.10721763/1‑151 (MQ=60)
AGCTGGACTGATCGCTGCGCCGCACGCGGGGAGCCCCGGCCCATGCCTTCCCGCGGGCGGCGGGATAGTTCGGGCGGCTCAGCCGCCGAGGCCGGAGGGGTAGTCGGTGGACGGACTCGGGTGGGTGtaaccgcggggtgcgtgctccggc > SRR18135093.7870433/1‑127 (MQ=55)
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| Alignment Legend |
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Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 0 ≤ ATCG/ATCG < 11 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
