Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A2 F1 I1 R1
|
254 |
498.2 |
21552474 |
99.3% |
21401606 |
151.0 |
Breseq alignment
BRESEQ :: Evidence
|
| evidence |
seq id |
position |
mutation |
annotation |
gene |
description |
| RA |
NC_008463 |
5,103,259 |
T→G |
M262L (ATG→CTG) |
ftsZ ← |
cell division protein FtsZ |
|
| |
seq id |
position |
ref |
new |
freq |
score (cons/poly) |
reads |
annotation |
genes |
product |
| * | NC_008463 | 5,103,259 | 0 | T | G | 99.8%
| 1970.1
/ NA
| 498 | M262L (ATG→CTG) | ftsZ | cell division protein FtsZ |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (1/0); new base G (273/223); total (275/223) |
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 |
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 |
Only 100 of 516 total aligned reads displayed.
ACGGTGACGTGCAGCTCATCGCGCATGTCCGCGTCGATCACGGTGCCCACCTTCACAGTGGCGTGCTCGGAAGCGAACTGTTCGATGATGTTGCCGACATCGGAGTACTCGCCAGGGGACAGGTCCGGACCCGCGGTGATGTTCACCATGATGCCGCGCGCGCCCTGCAGGTTGACGTCTCCCAGCAGCGGGGTGCGGATTGCCGCCTCGGGGGCCTCGCGGGCACGGTTCGGACCGCTGGCGCAGCCGGTACCCATCATCGCCATGCCCATTTCGCTCATGACGGTCTTCACGTC > NC_008463/5103111‑5103406
|
cGGTGACGTGCAGCTCATCGCGCATGTCCGCGTCGATCACGGTGCCCACCTTCACAGTGGCGTGCTCGGAAGCGAACTGTTCGATGATGTTGCCGACATCGGAGTACTCGCCCAGGGACAGGTCCGGACCCGCGGTGATGTTCACCaggat < 2:6477319/151‑1 (MQ=255)
cGGTGACGTGCAGCTCATCGCGCATGTCCGCGTCGATCACGGTGCCCACCTTCACAGTGGCGTGCTCGGAAGCGAACTGTTCGATGATGTTGCCGACATCGGAGTACTCGCCCAGGGACAGGTCCGGACCCGCGGTGATGTTCACCaggat > 1:3537697/1‑151 (MQ=255)
ggTGACGTGCAGCTCATCGCGCATGTCCGCGTCGATCACGGTGCCCACCTTCACAGTGGCGTGCTCGGAAGCGAACTGTTCGATGATGTTGCCGACATCGGAGTACTCGCCCAGGGACAGGTCCGGACCCGCGGTGATGTTCACCaggatg < 2:6743365/151‑1 (MQ=255)
ggTGACGTGCAGCTCATCGCGCATGTCCGCGTCGATCACGGTGCCCACCTTCACAGTGGCGTGCTCGGAAGCGAACTGTTCGATGATGTTGCCGACATCGGAGTACTCGCCCAGGGACAGGTCCGGACCCGCGGTGATGTTCACCaggatg > 1:4311209/1‑151 (MQ=255)
ggTGACGTGCAGCTCATCGCGCATGTCCGCGTCGATCACGGTGCCCACCTTCACAGTGGCGTGCTCGGAAGCGAACTGTTCGATGATGTTGCCGACATCGGAGTACTCGCCCAGGGACAGGTCCGGACCCGCGGTGATGTTCACCaggatg > 1:2349684/1‑151 (MQ=255)
gctGACGTGCAGCTCATCGCGCATGTCCGCGTCGATCACGGTGCCCACCTTCACAGTGGCGTGCTCGGAAGCGAACTGTTCGATGATGTTGCCGACATCGGAGTACTCGCCCAGGGACAGGTCCGGACCCGCGGTGATGTTCACCaggatg > 1:650323/3‑151 (MQ=255)
tGACGTGCAGCTCATCGCGCATGTCCGCGTCGATCACGGTGCCCACCTTCACAGTGGCGTGCTCGGAAGCGAACAGTTCGATGATGTTGCCGACATCGGAGTACTCGCCCAGGGACAGGTCCGGACCCGCGGTGATGTTCACCAGGTTGcc > 2:10157592/1‑151 (MQ=255)
aCGTGCAGCTCATCGCGCATGTCCGCGTCGATCACGGTGCCCACCTTCACAGTGGCGTGCTCGGAAGCGAACTGTTCGATGATGTTGCCGACATCGGAGTACTCGCCCAGGGACAGGTCCGGACCCGCGGTGATGTTCACCAGGATGCcgc < 2:6233538/151‑1 (MQ=255)
gTGCAGCTCATCGCTCATGTCCGAGTCGAAAACGGTGACCACCTTCACAGTGTCTTGCTCGGAAGCGAACTGTTCGATGATTTAGCAGACATCGGAGTACTCGCCCAGGGACAGGTCCGGACCCGCGGTGATGTTCACCAGGATGCcgcgc > 2:5044692/1‑151 (MQ=255)
tGCAGCTCATCGCGCATGTCCGCGTCGATCACGGTGCCCACCTTCACAGTGGCGTGCTCGGAAGCGAACTGTTCGATGATGTTGCCGACATCGGAGTACTCGCCCAGGGACAGGTCCGGACCCGCGGTGATGTTCACCAGGATGCcgcgcg > 1:1676301/1‑151 (MQ=255)
tGCAGCTCATCGCGCATGTCCGCGTCGATCACGGTGCCCACCTTCACAGTGGCGTGCTCGGAAGCGAACTGTTCGATGATGTTGCCGACATCGGAGTACTCGCCCAGGGACAGGTCCGGACCCGCGGTGATGTTCACCAGGATGCcgcgcg > 1:3283638/1‑151 (MQ=255)
aTCGCGCATGTCCGCGTCGATCACGGTGCCCACCTTCACAGTGGCGTGCTCGGAAGCGAACTGTTCGATGATGTTGCCGACATCGGAGTACTCGCCCAGGGACAGGTCCGGACCCGCGGTGATGTTCACCAGGATGCCGCGCGCGCCCTGc > 1:2972352/1‑151 (MQ=255)
cgcgCATGTCCGCGTCGATCACGGTGCCCACCTTCACAGTGGCGTGCTCGGAAGCGAACTGTTCGATGATGTTGCCGACATCGGAGTACTCGCCCAGGGACAGGTCCGGACCCGCGGTGCTGTTCACCAGGATGCCGCGCGCGCCCTGCAg > 2:5946467/1‑151 (MQ=255)
cgcATGTCCGCGTCGATCACGGTGCCCACCTTCACAGTGGCGTGCTCGGAAGCGAACTGTTCGATGATGTTGCCGACATCGGAGTACTCGCCCAGGGACAGGTCCGGACCCGCGGTGATGTTCACCAGGATGCCGCGCGCGCCCTGCAGGt > 1:5112403/1‑151 (MQ=255)
gcATGTCCGCGTCGATCACGGTGCCCACCTTCACAGTGGCGTGCTCGGAAGCGAACTGTTCGATGAGGTTGCCGACATCGGAGTACTCGCCCAGGGACAGGTCCGGACCCGCGGTGATGTTCACCAGGATGCCGCGCGCGCCCTGCCGGtt > 2:6353542/1‑151 (MQ=255)
gTCCGCGTCGATCACGGTGCCCACCTTCACAGTGGCGTGCTCGGAAGCGAACTGTTCGATGATGTTGCCGACATCGGAGTACTCGCCCAGGGACAGGTCCGGACCCGCGGTGATGTTCACCAGGATGCCGCGCGCGCCCTGCAGGTTGACg < 2:1570310/151‑1 (MQ=255)
gTCCGCGTCGATCACGGTGCCCACCTTCACAGTGGCGTGCTCGGAAGCGAACTGTTCGATGATGTTGCCGACATCGGAGTACTCGCCCAGGGACAGGTCCGGACCCGCGGTGATGTTCACCAGGATGCCGCGCGCGCCCTGCAGGTTGACg > 1:3061557/1‑151 (MQ=255)
tCCGCGTCGATCACGGTGCCCACCTTCACAGTGGCGTGCTCGGAAGCGAACTGTTCGATGATGTTGCCGACATCGGAGTACTCGCCCAGGGACAGGTCCGGACCCGCGGTGATGTTCACCAGGATGCCGCGCGCGCCCTGCAGGTTGACGt < 1:9318947/151‑1 (MQ=255)
cgcgTCGATCACGGTGCCCACCTTCACAGTGGCGTGCTCGGAAGCGAACTGTTCGATGATGTTGCCGACATCGGAGTACTCGCCCAGGGACAGGTCCGGACCCGCGGTGATGTTCTCCAGGATGCCGCGCGCGCCCTGCAGGTTGACGtct < 2:1373355/151‑1 (MQ=255)
cgcgTCGATCACGGTGCCCACCTTCACAGTGGCGTGCTCGGAAGCGAACTGTTCGATGATGTTGCCGACATCGGAGTACTCGCCCAGGGACAGGTCCGGACCCGCGGTGATGTTCACCAGGATGCCGCGCGCGCCCTGCAGGTTGACGtct > 2:6864445/1‑151 (MQ=255)
cgcgTCGATCACGGTGCCCACCTTCACAGTGGCGTGCTCGGAAGCGAACTGTTCGATGATGTTGCCGACATCGGAGTACTCGCCCAGGGACAGGTCCGGACCCGCGGTGATGTTCACCAGGATGCCGCGCGCGCCCTGCAGGTTGACGtct > 1:2041080/1‑151 (MQ=255)
tCGATCACGGTGCCCACCTTCACAGTGGCGTGCTCGGAAGCGAACTGTTCGATGATGTTGCCGACATCGGAGTACTCGCCCAGGGACAGGTCCGGACCCGCGGTGATGTTCACCAGGATGCCGCGCGCGCCCTGCAGGTTGACGTCTTCca < 1:3830504/151‑1 (MQ=255)
cGATCACGGTGCCCACCTTCACAGTGGCGTGCTCGGAAGCGAACTGTTCGATGATGTTGCCGACATCGGAGTACTCGCCCAGGGACAGGTCCGGACCCGCGGTGATGTTCACCAGGATGCCGCGCGCGCCCTGCAGGTTGACGTCTTCcag > 1:6715317/1‑151 (MQ=255)
cGATCACGGTGCCCACCTTCACAGTGGCGTGCTCGGAAGCGAACTGTTCGATGATGTTGCCGACATCGGAGTACTCGCCCAGGGACAGGTCCGGACCCGCGGTGATGTTCACCAGGATGCCGCGCGCGCCCTGCAGGTTGACGTCTTCcag > 1:5713656/1‑151 (MQ=255)
gATCACGGTGCCCACCTTCACAGTGGCGTGCTCGGAAGCGAACTGTTCGATGATGTTGCCGACATCGGAGTACTCGCCCAGGGACAGGTCCGGACCCGCGGTGATGTTCACCAGGATGCCGCGCGCGCCCTGCAGGTTGACGTCTTCcagc < 1:9004873/151‑1 (MQ=255)
gATCACGGTGCCCACCTTCACAGTGGCGTGCTCGGAAGCGAACTGTTCGATGATGTTGCCGACATCGGAGTACTCGCCCAGGGACAGGTCCGGACCCGCGGTGATGTTCACCAGGATGCCGCGCGCGCACTGCAGGTTGACGTCTTCcagc > 2:939191/1‑151 (MQ=255)
aTCACGGTGCCCACCTTCACAGTGGCGTGCTCGGAAGCGAACTGTTCGATGATGTTGCCGACATCGGAGTACTCGCCCAGGGACAGGTCCGGACCCGCGGTGATGTTCACCAGGATGCCGCGCGCGCCCTGCAGGTTGACGTCTTCcagca > 1:10367050/1‑151 (MQ=255)
aCGGTGCCCACCTTCACAGTGGCGTGCTCGGAAGCGAACTGTTCGATGATGTTGCCGACATCGGAGTACTCGCCCAGGGACAGGTCCGGACCCGCGGTGATGTTCACCAGGATGCCGCGCGCGCCCTGCAGGTTGACGTCTTCCAGCAGCg > 1:2145978/1‑151 (MQ=255)
cGGTGCCCACCTTCACAGTGGCGTGCTCGGAAGCGAACTGTTCGATGATGTTGCCGACATCGGAGTACTCGCCCAGGGACAGGTCCGGACCCGCGGTGATGTTCACCAGGATGCCGCGCGCGCCCTGCAGGTTGACGTCTTCCAGCAGCgg < 2:2274906/151‑1 (MQ=255)
gTGCCCACCTTCACAGTGGCGTGCTCGGAAGCGAACTGTTCGATGATGTTGCCGACATCGGAGTACTCGCCCAGGGACAGGTCCGGACCCGCGGTGATGTTCACCAGGCTGCCGCGCGCGCCCTGCAGGTTGACGTCTTCCAGCAGCgggt > 2:5556478/1‑150 (MQ=255)
gTGCCCACCTTCACAGTGGCGTGCTCGGAAGCGAACTGTTCGATGATGTTGCCGACATCGGAGTACTCGCCCAGGGACAGGTCCGGACCCGCGGTGATGTTCACCAGGATGCCGCGCGCGCCCTGCAGGTTGACGTCTTCCAGCAGCgggt > 2:1077750/1‑150 (MQ=255)
cccACCTTCACAGTGGCGTGCTCGGAAGCGAACTGTTCGATGATGTTGCCGACATCGGAGTACTCGCCCAGGGACAGGTCCGGACCCGCGGTGATGTTCACCAGGATGCCGCGCGCGCCCTGCAGGTTGACGTCTTCCAGCAGCGGGTTGc > 1:122529/1‑151 (MQ=255)
cccACCTTCACAGTGGCGTGCTCAGAAGCGAACTGTTCGATGATGTTGCCGACATCGGAGTACTCGCCCAGGGACAGGTCCGGACCCGCGGTGATGTTCACCAGGATGCCGCGCGCGCCCTGCAGGTTGACGTCTTCCAGCAGCGGGTTGc > 1:3709014/1‑151 (MQ=255)
cACCTTCACAGTGGCGTGCTCGGAAGCGAACTGTTCGATGATGTTGCCGACATCGGAGTACTCGCCCAGGGACAGGTCCGGACCCGCGGTGATGTTCACCAGGATGCCGCGCGCGCCCTGCAGGTTGACGTCTTCCAGCAGCGGGTTGCgg > 1:1859395/1‑151 (MQ=255)
cACCTTCACAGTGGCGTGCTCGGAAGCGAACTGTTCGATGATGTTGCCGACATCGGAGTACTCGCCCAGGGACAGGTCCGGACCCGCGGTGATGTTCACCAGGATGCCGCGCGCGCCCTGCAGGTTGACGTCTTCCAGCAGCGGGTTGCgg > 1:6874615/1‑151 (MQ=255)
cTTCACAGTGGCGTGCTCGGAAGCGAACTGTTCGATGATGTTGCCGACATCGGAGTACTCGCCCAGGGACAGGTCCGGACCCGCGGTGATGTTCACCAGGATGCCGCGCGCGCCCTGCAGGTTGACGTCTTCCAGCAGCGGGTTGCGGAtt < 1:7016552/151‑1 (MQ=255)
tCACAGTGGCGTGCTCGGAAGCGAACTGTTCGATGATGTTGCCGACATCGGAGTACTCGCCCAGGGACAGGTCCGGACCCGCGGTGATGTTCACCAGGATGCCGCGCGCGCCCTGCAGGTTGACGTCTTCCAGCAGCGGGTTGCGGATTgc > 2:2947152/1‑151 (MQ=255)
cacaGTGGCGTGCTCGGAAGCGAACTGTTCGATGATGTTGCCGACATCGGAGTACTCGCCCAGGGACAGGTCCGGACCCGCGGTGATGTTCACCAGGATGCCGCGCGCGCCCTGCAGGTTGACGTCTTCCAGCAGCGGGTTGCGGATTgcc > 2:2506644/1‑151 (MQ=255)
aGTGGCGTGCTCGGAAGCGAACTGTTCGATGATGTTGCCGACATCGGAGTACTCGCCCAGGGACAGGTCCGGACCCGCGGTGATGTTCACCAGGATGCCGCGCGCGCCCTGCAGGTTGACGTCTTCCAGCAGCGGGTTGCGGATTgccgcc < 1:874316/151‑1 (MQ=255)
aGTGGCGTGCTCGGAAGCGAACTGTTCGATGATGTTGCCGACATCGGAGTACTCGCCCAGGGACAGGTCCGGACCCGCGGTGATGTTCACCAGGATGCCGCGCGCGCCCTGCAGGTTGACGTCTTCCAGCAGCGGGTTGCGGATTgccgcc < 2:10555209/151‑1 (MQ=255)
gTGGCGTGCTCGGAAGCGAACTGTTCGATGATGTTGCCGACATCGGAGTACTCGCCCAGGGACAGGTCCGGACCCGCGGTGATGTTCACCAGGATGCCGCGCGCGCCCTGCAGGTTGACGTCTTCCAGCAGCGGGTTGCGGATTGCCGCCt < 2:4747659/151‑1 (MQ=255)
gTGGCGTGCTCGGAAGCGAACTGTTCGATGATGTTGCCGACATCGGAGTACTCGCCCAGGGACAGGTCCGGACCCGCGGTGATGTTCACCAGGATGCCGCGCGCGCCCTGCAGGTTGACGTCTTCCAGCAGCGGGTTGCGGATTGCCGCCt < 1:4053068/151‑1 (MQ=255)
ggCGTGCTCGGAAGCGAACTGTTCGATGATGTTGCCGACATCGGAGTACTCGCCCAGGGACAGGTCCGGACCCGCGGTGATGTTCACCAGGATGCCGCGCGCGCCCTGCAGGTTGACGTCTTCCAGCAGCGGGTTGCGGATTGCCGCCTCg > 2:8182187/1‑151 (MQ=255)
cGTGCTCGGAAGCGAACTGTTCGATGATGTTGCCGACATCGGAGTACTCGCCCAGGGACAGGTCCGGACCCGCGGTGATGTTCACCAGGATGCCGCGCGCGCCCTGCAGGTTGACGTCTTCCAGCAGCGGGTTGCGGATTGCCGCCTCggt < 1:5042543/151‑2 (MQ=255)
cGTGCTCGGAAGCGAACTGTTCGATGATGTTGCCGACATCGGAGTACTCGCCCAGGGACAGGTCCGGACCCGCGGTGATGTTCACCAGGATGCCGCGCGCGCCCTGCAGGTTGACGTCTTCCAGCAGCGGGTTGCGGATTGCCGCCTCggt > 1:1378919/1‑150 (MQ=255)
cTCCGAAGCGAACTTTTCGATGATGTTGCCGAAATCGTATTACTCGCCCTGGGACAGGTCCGGACCCGCGGTGATGAACACCACTATGCCGCGCGCGACCTGAAGGTTGACGTCTTCCAGCAGCGGGTTGCGGATTGAAGACTCggtggag > 2:9229766/1‑149 (MQ=255)
tCGGAAGCGAACTGTTCGATGATGTTGCCGACATCGGAGTACTCGCCCAGGGACAGGTCCGGACCCGCGGTGATGTTCACCAGGATGCCGCGCGCGCCCTGCAGGTTGACGTCTTCCAGCAGCGGGTTGCGGATTGCCGCCTCGGTGGCCt > 1:8227863/1‑151 (MQ=255)
cGGAAGCGAACTGTTCGATGATGTTGCCGACATCGGAGTACTCGCCCAGGGACAGGTCCGGACCCGCGGTGATGTTCACCAGGATGCCGCGCGCGCCCTGCAGGTTGACGTCTTCCAGCAGCGGGTTGCGGATTGCCGCCTCGGTGGCCTc > 2:5210872/1‑151 (MQ=255)
cGGAAGCGAACTGTTCGATGATGTTGCCGACATCGGAGTACTCGCCCAGGGACAGGTCCGGACCCGCGGTGATGTTCACCAGGATGCCGCGCGCGCCCTGCAGGTTGACGTCTTCCAGCAGCGGGTTGCGGATTGCCGCCTCGGTGGCCTc < 1:3447231/151‑1 (MQ=255)
ggAAGCGAACTGTTCGATGATGTTGCCGACATCGGAGTACTCGCCCAGGGACAGGTCCGGACCCGCGGTGATGTTCACCAGGATGCCGCGCGCGCCCTGCAGGTTGACGTCTTCCAGCAGCGGGTTGCGGATTGCCGCCTCGGTGGCCTcg < 2:3772419/151‑1 (MQ=255)
gAAGCGAACTGTTCGATGATGTTGCCGACATCGGAGTACTCGCCCAGGGACAGGTCCGGACCCGCGGTGATGTTCACCAGGATGCCGCGCGCGCCCTGCAGGTTGACGTCTTCCAGCAGCGGGTTGCGGATTGCCGCCTCGGTGGCCTcgc < 1:10038509/151‑1 (MQ=255)
aaGCGAACTGTTCGATGATGTTGCCGACATCGGAGTACTCGCCCAGGGACAGGTCCGGACCCGCGGTGATGTTCACCAGGATGCCGCGCGCGCCCTGCAGGTTGACGTCTTCCAGCAGCGGGTTGCGGATTGCCGCCTCGGTGGCCTcgcg > 1:4662062/1‑151 (MQ=255)
gCGAACTGTTCGATGATGTTGCCGACATCGGAGTACTCGCCCAGGGACAGGTCCGGACCCGCGGTGATGTTCACCAGGATGCCGCGCGCGCCCTGCAGGTTGACGTCTTCCAGCAGCGGGTTGCGGATTGCCGCCTCGGTGGCCTCGCggg > 2:8587466/1‑151 (MQ=255)
gAACTGTTCGATGATGTTGCCGACATCGGAGTACTCGCCCAGGGACAGGTCCGGACCCGCGGTGATGTTCACCAGGATGCCGCGCGCGCCCTGCAGGTTGACGTCTTCCAGCAGCGGGTTGCGGATTGCCGCCTCGGTGGCCTCGCGGGCa > 2:8340502/1‑151 (MQ=255)
aaCTGTTCGATGATGTTGCCGACATCTGAGTACTCGCCCCGGGACAGGTCCTGACCCGCGGTGAAGTTCAACATGATGCCGCGCGCGACATTCAGGTTGACGTCTTCCAGCAGCGGGTTGAGGATTGCCGCCTCGGAGTCCTCGCGGGCAc > 2:778188/1‑151 (MQ=255)
aaCTGTTCGATGATGTTGCCGACATCGGAGTACTCGCCCAGGGACAGGTCCGGACCCGCGGTGATGTTCACCAGGATGCCGCGCGCGCCCTGCAGGTTGACGTCTTCCAGCAGCGGGTTGCGGATTGCCGCCTCGGTGGCCTCGCGGGCAc < 2:8748467/151‑1 (MQ=255)
tGTTCGATGATGTTGCCGACATCGGAGTACTCGCCCAGGGACAGGTCCGGACCCGCGGTGATGTTCACCAGGATGCCGCGCGCGCCCTGCAGGTTGACGTCTTCCAGCAGCGGGTTGCGGATTGCCGCCTCGGTGGCCTCGCGGGCACGGt < 1:7707051/151‑1 (MQ=255)
gatgatGTTGCCGACATCGGAGTACTCGCCCAGGGACAGGTCCGGACCCGCGGTGATGTTCACCAGGATGCCGCGCGCGCCCTGCAGGTTGACGTCTTCCAGCAGCGGGTTGCGGATTGCCGCCTCGGTGGCCTCGCGGGCACGGTTCGGa < 1:5320805/151‑1 (MQ=255)
gatgatGTTGCCGACATCGGAGTACTCGCCCAGGGACAGGTCCGGACCCGCGGTGATGTTCACCAGGATGCCGCGCGCGCCCTGCAGGTTGACGTCTTCCAGCAGCGGGTTGCGGATTGCCGCCTCGGTGGCCTCGCGGGCACGGTTCGGa > 1:9100272/1‑151 (MQ=255)
gatgTTGCCGACATCGGAGTACTCGCCCAGGGACAGGTCCGGACCCGCGGTGATGTTCACCAGGATGCCGCGCGCGCCCTGCAGGTTGACGTCTTCCAGCAGCGGGTTGCGGATTGCCGCCTCGGTGGCCTCGCGGGCACGGTTCGGACCg < 1:7239405/151‑1 (MQ=255)
tgTTGCCGACATCGGAGTACTCGCCCAGGGACAGGTCCGGACCCGCGGTGCTGTTCACCAGGATGCCGCGCGCGCCCTGCAGGTTGACGTCTTCCAGCAGCGGGTTGCGGATTGCCGCCTCGGTGGCCTCGCGGGCACGGTTCGGACCGCt > 1:9494167/1‑151 (MQ=255)
tgTTGCCGACATCGGAGTACTCGCCCAGGGACAGGTCCGGACCCGCGGTGATGTTCACCAGGATGCCGCGCGCGCCCTGCAGGTTGACGTCTTCCAGCAGCGGGTTGCGGATTGCCGCCTCGGTGGCCTCGCGGGCACGGTTCGGACCGCt > 2:7989057/1‑151 (MQ=255)
gTTGCCGACATCGGAGTACTCGCCCAGGGACAGGTCCGGACCCGCGGTGATGTTCACCAGGATGCCGCGCGCGCCCTGCAGGTTGACGTCTTCCAGCAGCGGGTTGCGGATTGCCGCCTCGGTGGCCTCGCGGGCACGGTTCGGACCGCTg < 2:5767075/151‑1 (MQ=255)
tGCCGACATCGGAGTACTCGCCCAGGGACAGGTCCGGACCCGCGGTGATGTTCACCAGGATGCCGCGCGCGCCCTGCAGGTTGACGTCTTCCAGCAGCGGGTTGCGGATTGCCGCCTCGGTGGCCTCGCGGGCACGGTTCGGACCGCTGgc > 2:3044759/1‑151 (MQ=255)
ccGACATCGGAGTACTCGCCCAGGGACAGGTCCGGACCCGCGGTGATGTTCACCAGGATGCCGCGCGCGCCCTGCAGGTTGACGTCTTCCAGCAGCGGGTTGCGGATTGCCGCCTCGGTGGCCTCGCGGGCACGGTTCGGACCGCTGgcgc > 2:2117140/1‑151 (MQ=255)
ccGACATCGGAGTACTCGCCCAGGGACAGGTCCGGACCCGCGGTGATGTTCACCAGGATGCCGCGCGCGCCCTGCAGGTTGACGTCTTCCAGCAGCGGGTTGCGGATTGCCGCCTCGGTGGCCTCGCGGGCACGGTTCGGACCGCTGgcgc > 2:7167752/1‑151 (MQ=255)
gACATCGGAGTACTCGCCCAGGGACAGGTCCGGACCCGCGGTGATGTTCACCAGGATGCCGCGCGCGCCCTGCAGGTTGACGTCTTCCAGCAGCGGGTTGCGGATTGCCGCCTCGGTGGCCTCGCGGGCACGGTTCGGACCGCTGGCGCAg > 2:10706754/1‑151 (MQ=255)
cGGAGTACTCGCCCAGGGACAGGTCCGGACCCGCGGTGATGTTCACCAGGATGCCGCGCGCGCCCTGCAGGTTGACGTCTTCCAGCAGCGGGTTGCGGATTGCCGCCTCGGTGGCCTCGCGGGCACGGTTCGGACCGCTGGCGCAGCCGGt < 2:7666889/151‑1 (MQ=255)
aGTACTCGCCCAGGGACAGGTCCGGACCCGCGGTGATGTTCACCAGGATGCCGCGCGCGCCCTGCAGGTTGACGTCTTCCAGCAGCGGGTTGCGGATTGCCGCCTCGGTGGCCTCGCGGGCACGGTTCGGACCGCTGGCGCAGCCGGTAcc > 2:3442982/1‑151 (MQ=255)
aCTCGCCCAGGGACAGGTCCGGACCCGCGGTGATGTTCACCAGGATGCCGCGCGCGCCCTGCAGGTTGACGTCTTCCAGCAGCGGGTTGCGGATTGCCGCCTCGGTGGCCTCGCGGGCACGGTTCGGACCGCTGGCGCAGCCGGTACCcat > 1:2865633/1‑151 (MQ=255)
cagggACAGGTCCGGACCCGCGGTGATGTTCACCAGGATGCCGCGCGCGCCCTGCAGGTTGACGTCTTCCAGCAGCGGGTTGCGGATTGCCGCCTCGGTGGCCTCGCGGGTACGGTTCGGACCGCTGGCGCAGCCGGTACCCATCATCGcc < 2:2784128/149‑1 (MQ=255)
agggACAGGTCCGGACCCGCGGTGATGTTCACCAGGATGCCGCGCGCGCCCTGCAGGTTGACGTCTTCCAGCAGCGGGTTGCGGATTGCCGCCTCGGTGGCCTCGCGGGCACGGTTCGGACCGCTGGCGCAGCCGGTACCCATCATCGCCa < 1:8043197/150‑1 (MQ=255)
gggACAGGTCCGGACCCGCGGTGATGTTCACCAGGATGCCGCGCGCGCCCTGCAGGTTGACGTCTTCCAGCAGCGGGTTGCGGATTGCCGCCTCGGTGGCCTCGCGGGCACGGTTCGGACCGCTGGCGCAGCCGGTACCCATCATCGCCAt > 1:2473371/1‑151 (MQ=255)
ggACAGGTCCGGACCCGCGGTGATGTTCACCAGGATGCCGCGCGCGCCCTGCAGGTTGACGTCTTCCAGCAGCGGGTTGCGGATTGCCGCCTCGGTGGCCTCGCGGGCACGGTTCGGACCGCTGGCGCAGCCGGTACCCATCATCGCCATg > 1:6350633/1‑151 (MQ=255)
ggACAGGTCCGGACCCGCGGTGATGTTCACCAGGATGCCGCGCGCGCCCTGCAGGTTGACGTCTTCCAGCAGCGGGTTGCGGATTGCCGCCTCGGTGGCCTCGCGGGCACGGTTCGGACCGCTGGCGCAGCCGGTACCCATCATCGCCATg > 1:610372/1‑151 (MQ=255)
ggACAGGTCCGGACCCGCGGTGATGTTCACCAGGATGCCGCGCGCGCCCTGCAGGTTGACGTCTTCCAGCAGCGGGTTGCGGATTGCCGCCTCGGTGGCCTCGCGGGCACGGTTCGGACCGCTGGCGCAGCCGGTACCCATCATCGCCATg > 1:6247852/1‑151 (MQ=255)
ggACAGGTCCGGACCCGCGGTGATGTTCACCAGGATGCCGCGCGCGCCCTGCAGGTTGACGTCTTCCAGCAGCGGGTTGCGGATTGCCGCCTCGGTGGCCTCGCGGGCACGGTTCGGACCGCTGGCGCAGCCGGTACCCATCATCGCCATg < 2:3217736/151‑1 (MQ=255)
ggACAGGTCCGGACCCGCGGTGATGTTCACCAGGATGCCGCGCGCGCCCTGCAGGTTGACGTCTTCCAGCAGCGGGTTGCGGATTGCCGCCTCGGTGGCCTCGCGGGCACGGTTCGGACCGCTGGCGCAGCCGGTACCCATCATCGCCATg > 2:1464260/1‑151 (MQ=255)
gACAGGTCCGGACCCGCGGTGATGTTCACCAGGATGCCGCGCGCGCCCTGCAGGTTGACGTCTTCCAGCAGCGGGTTGCGGATTGCCGCCTCGGTGGCCTCGCGGGCACGGTTCGGACCGCTGGCGCAGCCGGTACCCATCATCGCCATGc < 1:142092/151‑1 (MQ=255)
gACAGGTCCGGACCCGCGGTGATGTTCACCAGGATGCCGCGCGCGCCCTGCAGGTTGACGTCTTCCAGCAGCGGGTTGCGGATTGCCGCCTCGGTGGCCTCGCGGGCACGGTTCGGACCGCTGGCGCAGCCGGTACCCAGCATCGCCATGc > 2:9020385/1‑151 (MQ=255)
aCAGGTCCGGACCCGCGGTGATGTTCACCAGGATGCCGCGCGCGCCCTGCAGGTTGACGTCTTCCAGCAGCGGGTTGCGGATTGCCGCCTCGGTGGCCTCGCGGGCACGGTTCGGACCGCTGGCGCAGCCGGTACCCATCATCGCCATGcc > 2:9747565/1‑151 (MQ=255)
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ATCACGGTGCCCACCTTCACAGTGGCGTGCTCGGAAGCGAACTGTTCGATGATGTTGCCGACATCGGAGTACTCGCCCAGGGACAGGTCCGGACCCGCGGTGATGTTCACCAGGATGCCGCGCGCGCCCTGCAGGTTGACGTCTTCCAGCA > SRR18135094.10409940/1‑151 (MQ=60)
TCACGGTGCCCACCTTCACAGTGGCGTGCTCGGAAGCGAACTGTTCGATGATGTTGCCGACATCGGAGTACTCGCCCAGGGACAGGTCCGGACCCGCGGTGATGTTCACCAGGATGCCGCGCGCGCCCTGCAGGTTGACGTCTTCCAGCAG > SRR18135094.4534780/1‑151 (MQ=60)
ACGGTGCCCACCTTCACAGTGGCGTGCTCGGAAGCGAACTGTTCGATGATGTTGCCGACATCGGAGTACTCGCCCAGGGACAGGTCCGGACCCGCGGTGATGTTCACCAGGATGCCGCGCGCGCCCTGCAGGTTGACGTCTTCCAGCAGCG > SRR18135094.1695577/1‑151 (MQ=60)
ACGGTGCCCACCTTCACAGTGGCGTGCTCGGAAGCGAACTGTTCGATGATGTTGCCGACATCGGAGTACTCGCCCAGGGACAGGTCCGGACCCGCGGTGATGTTCACCAGGATGCCGCGCGCGCCCTGCAGGTTGACGTCTTCCAGCAGCG < SRR18135094.706968/151‑1 (MQ=60)
CGGTGCCCACCTTCACAGTGGCGTGCTCGGAAGCGAACTGTTCGATGATGTTGCCGACATCGGAGTACTCGCCCAGGGACAGGTCCGGACCCGCGGTGATGTTCACCAGGATGCCGCGCGCGCCCTGCAGGTTGACGTCTTCCAGCAGCGG < SRR18135094.4074822/151‑1 (MQ=60)
CGGTGCCCACCTTCACAGTGGCGTGCTCGGAAGCGAACTGTTCGATGATGTTGCCGACATCGGAGTACTCGCCCAGGGACAGGTCCGGACCCGCGGTGATGTTCACCAGGATGCCGCGCGCGCCCTGCAGGTTGACGTCTTCCAGCAGCGG < SRR18135094.2501347/151‑1 (MQ=60)
CCCACCTTCACAGTGGCGTGCTCGGAAGCGAACTGTTCGATGATGTTGCCGACATCGGAGTACTCGCCCAGGGACAGGTCCGGACCCGCGGTGATGTTCACCAGGATGCCGCGCGCGCCCTGCAGGTTGACGTCTTCCAGCAGCGGGTTGC > SRR18135094.123198/1‑151 (MQ=60)
CCCACCTTCACAGTGGCGTGCTCAGAAGCGAACTGTTCGATGATGTTGCCGACATCGGAGTACTCGCCCAGGGACAGGTCCGGACCCGCGGTGATGTTCACCAGGATGCCGCGCGCGCCCTGCAGGTTGACGTCTTCCAGCAGCGGGTTGC > SRR18135094.3725466/1‑151 (MQ=60)
CCACCTTCACAGTGGCGTGCTCGGAAGCGAACTGTTCGATGATGTTGCCGACATCGGAGTACTCGCCCAGGGACAGGTCCGGACCCGCGGTGATGTTCACCAGGATGCCGCGCGCGCCCTGCAGGTTGACGTCTTCCAGCAGCGGGTTGCG > SRR18135094.10146200/1‑151 (MQ=60)
CCACCTTCACAGTGGCGTGCTCGGAAGCGAACTGTTCGATGATGTTGCCGACATCGGAGTACTCGCCCAGGGACAGGTCCGGACCCGCGGTGATGTTCACCAGGATGCCGCGCGCGCCCTGCAGGTTGACGTCTTCCAGCAGCGGGTTGCG > SRR18135094.7649680/1‑151 (MQ=60)
CCACCTTCACAGTGGCGTGCTCGGAAGCGAACTGTTCGATGATGTTGCCGACATCGGAGTACTCGCCCAGGGACAGGTCCGGACCCGCGGTGATGTTCACCAGGATGCCGCGCGCGCCCTGCAGGTTGACGTCTTCCAGCAGCGGGTTGCG < SRR18135094.2665764/151‑1 (MQ=60)
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CTTCACAGTGGCGTGCTCGGAAGCGAACTGTTCGATGATGTTGCCGACATCGGAGTACTCGCCCAGGGACAGGTCCGGACCCGCGGTGATGTTCACCAGGATGCCGCGCGCGCCCTGCAGGTTGACGTCTTCCAGCAGCGGGTTGCGGATT < SRR18135094.5198871/151‑1 (MQ=60)
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CACAGTGGCGTGCTCGGAAGCGAACTGTTCGATGATGTTGCCGACATCGGAGTACTCGCCCAGGGACAGGTCCGGACCCGCGGTGATGTTCACCAGGATGCCGCGCGCGCCCTGCAGGTTGACGTCTTCCAGCAGCGGGTTGCGGATTGCC < SRR18135094.2550982/151‑1 (MQ=60)
CACAGTGGCGTGCTCGGAAGCGAACTGTTCGATGATGTTGCCGACATCGGAGTACTCGCCCAGGGACAGGTCCGGACCCGCGGTGATGTTCACCAGGATGCCGCGCGCGCCCTGCAGGTTGACGTCTTCCAGCAGCGGGTTGCGGATTGCC > SRR18135094.8251577/1‑151 (MQ=60)
ACAGTGGCGTGCTCGGAAGCGAACTGTTCGATGATGTTGCCGACATCGGAGTACTCGCCCAGGGACAGGTCCGGACCCGCGGTGATGTTCACCAGGATGCCGCACGCGCCCTGCAGGTTGACGTCTTCCAGCAGCGGGTTGCGGATTGCCG < SRR18135094.6909381/151‑1 (MQ=60)
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CAGTGGCGTGCTCGGAAGCGAACTGTTCGATGATGTTGCCGACATCGGAGTACTCGCCCAGGGACAGGTCCGGACCCGCGGTGATGTTCACCAGGATGCCGCGCGCGCCCTGCAGGTTGACGTCTTCCAGCAGCGGGTTGCGGATTGCCGC > SRR18135094.9488833/1‑151 (MQ=60)
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CGTGCTCGGAAGCGAACTGTTCGATGATGTTGCCGACATCGGAGTACTCGCCCAGGGACAGGTCCGGACCCGCGGTGATGTTCACCAGGATGCCGCGCGCGCCCTGCAGGTTGACGTCTTCCAGCAGCGGGTTGCGGATTGCCGCCTCGGT > SRR18135094.1385202/1‑151 (MQ=60)
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CGGAAGCGAACTGTTCGATGATGTTGCCGACATCGGAGTACTCGCCCAGGGACAGGTCCGGACCCGCGGTGATGTTCACCAGGATGCCGCGCGCGCCCTGCAGGTTGACGTCTTCCAGCAGCGGGTTGCGGATTGCCGCCTCGGTGGCCTC < SRR18135094.4585052/151‑1 (MQ=60)
GGAAGCGAACTGTTCGATGATGTTGCCGACATCGGAGTACTCGCCCAGGGACAGGTCCGGACCCGCGGTGATGTTCACCAGGATGCCGCGCGCGCCCTGCAGGTTGACGTCTTCCAGCAGCGGGTTGCGGATTGCCGCCTCGGTGGCCTCG > SRR18135094.1347490/1‑151 (MQ=60)
GAAGCGAACTGTTCGATGATGTTGCCGACATCGGAGTACTCGCCCAGGGACAGGTCCGGACCCGCGGTGATGTTCACCAGGATGCCGCGCGCGCCCTGCAGGTTGACGTCTTCCAGCAGCGGGTTGCGGATTGCCGCCTCGGTGGCCTCGC < SRR18135094.10080103/151‑1 (MQ=60)
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GACATCGGAGTACTCGCCCAGGGACAGGTCCGGACCCGCGGTGATGTTCACCAGGATGCCGCGCGCGCCCTGCAGGTTGACGTCTTCCAGCAGCGGGTTGCGGATTGCCGCCTCGGTGGCCTCGCGGGCACGGTTCGGACCGCTGGCGCTG < SRR18135094.1439592/151‑1 (MQ=60)
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GACATCGGAGTACTCGCCCAGGGACAGGTCCGGACCCGCGGTGATGTTCACCAGGATGCCGCGCGCGCCCTGCAGGTTGACGTCTTCCAGCAGCGGGTTGCGGATTGCCGCCTCGGTGGCCTCGCGGGCACGGTTCGGACCGCTGGCGCAG > SRR18135094.8998683/1‑151 (MQ=60)
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CTACGGTGACGTGCAGCTCATCGCGCATGTCCGCGTCGATCACGGTGCCCACCTTCACAGTGGCGTGCTCGGAAGCGAACTGTTCGATGATGTTGCCGACATCGGAGTACTCGCCAGGGGACAGGTCCGGACCCGCGGTGATGTTCACCATGATGCCGCGCGCGCCCTGCAGGTTGACGTCTCCCAGCAGCGGGGTGCGGATTGCCGCCTCGGGGGCCTCGCGGGCACGGTTCGGACCGCTGGCGCAGCCGGTACCCATCATCGCCATGCCCATTTCGCTCATGACGGTCTTCACGTCGG > NC_008463/5103109‑5103408
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 0 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
