Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A3 F1 I1 R1
|
9 |
310.3 |
8311092 |
97.9% |
8136559 |
149.9 |
Breseq alignment
BRESEQ :: Evidence
|
| evidence |
seq id |
position |
mutation |
annotation |
gene |
description |
| RA |
AP012306 |
2,791,735 |
+A |
intergenic (‑113/‑235) |
metY ← / → argG |
tRNA‑Met/argininosuccinate synthetase |
| |
seq id |
position |
ref |
new |
freq |
score (cons/poly) |
reads |
annotation |
genes |
product |
| * | AP012306 | 2,791,734 | 1 | . | A | 98.7%
| 1564.8
/ 8.3
| 396 | intergenic (‑112/‑236) | metY/argG | tRNA‑Met/argininosuccinate synthetase |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base . (2/3); new base A (190/201); total (192/204) |
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 |
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 8.87e-01 |
Only 100 of 410 total aligned reads displayed.
TTATGAGCCCGACGAGCTACCAGGCTGCTCCACCCCGCGCCTGAAACGTGGCAAATTCTACTCGTTTTGGGTAAAAAATGCAAATACTGCTGGGATTTGGTGTACCGAGACGGGACGTAAAATCTGCAGGCATTATAGTGATCCACGCCAC‑ATTTTGTCAACGTTTATTGCTAATCATGTGAATGAATATCCAGTTCACTTTCATTTGTTGAATACTTTTGCCTTCTCCTGCTCTCCCTTAAGCGCATTATTTTACAAAAAACACACTAAACTCTTCCTGTCTCCGATAAAAGAT > AP012306/2791584‑2791878
|
tATGAGCCCGACGAGCTACCAGGCTGCTCCACCCCGCGCCTGAAACGTGGCAAATTCTACTCGTTTTGGGTAAAAAATGCAAATCCTGCTGGGATTTGGTGTACCGAGACGGGACGTAAAATCTGCAGGCATTATAGTGATCCACGCcac < 2:555470/150‑1 (MQ=255)
tATGAGCCCGACGAGCTACCAGGCTGCTCCACCCCGCGCCTGAAACGTGGCAAATTCTACTCGTTTTGGGTAAAAAATGCAAATACTGCTGGGATTTGGTGTACCGAGACGGGACGTAAAATCTGCAGGCATTATAGTGATCCACGCcac > 2:2201087/1‑150 (MQ=255)
gAGCCAGACGAGCTACCAGGCTGCTCCCCCCCGCGCCTGAAACGTGGCAAATGCTACTCGTTTGGGGTAAAAAATGAAAATACTGCTGGGATTTGGTGTCCCGAGACGGGACGTAAAATCTGCAGGCATTATAGTGATCCACGCcac‑aat < 2:1675075/150‑3 (MQ=255)
gacgaGCTACCAGGCTGCTCCACCCCGCGCCTGAAACGTGGCAAATTCTACTCGTTTTGGGTAAAAAATGCAAATACTGCTGGGATTTGGTGTACCGAGACGGGACGTAAAATCTGCAGGCATTATAGTGATCCACGCCACAATTTTGTc > 1:70453/1‑150 (MQ=255)
gacgaGCTACCAGGCTGCTCCACCCCGCGCCTGAAACGTGGCAAATTCTACTCGTTTTGGGTAAAAAATGCAAATACTGCTGGGATTTGGTGTACCGAGACGGGACGTAAAATCTGCAGGCATTATAGTGATCCACGCCACAATTTTGTc < 1:607752/150‑1 (MQ=255)
cgaGCTACCAGGCTGCTCCACCCCGCGCCTGAAACGTGGCAAATTCTACTCGTTTTGGGTAAAAAATGCAAATACTGCTGGGATTTGGTGTACCGAGACGGGACGTAAAATCTGCAGGCATTATAGTGATCCACGCCACAATTTTGTCaa > 2:882173/1‑150 (MQ=255)
cgaGCTACCAGGCTGCTCCACCCCGCGCCTGAAACGTGGCAAATTCTACTCGTTTTGGGTAAAAAATGCAAATACTGCTGGGATTTGGTGTACCGAGACGGGACGTAAAATCTGCAGGCATTATAGTGATCCACGCCACAATTTTGTCaa < 2:3209194/150‑1 (MQ=255)
gaGCTACCAGGCTGCTCCACCCCGCGCCTGAAACGTGGCAAATTCTACTCGTTTTGGGTAAAAAATGCAAATACTGCTGGGATTTGGTGTACCGAGACGGGACGTAAAATCTGCAGGCATTATAGTGATCCACGCCACAATTTTGTCAAc < 1:665378/150‑1 (MQ=255)
cTACCAGGCTGCTCCACCCCGCGCCTGAAACGTGGCAAATTCTACTCGTTTTGGGTAAAAAATGCAAATACTGCTGGGATTTGGTGTACCGAGACGGGACGTAAAATCTGCAGGCATTATAGTGATCCACGCCACAATTTTGTCAACGtt < 1:1242366/150‑1 (MQ=255)
ccAGGCTGCTCCACCCCGCGCCTGAAACGTGGCAAATTCTACTCGTTTTGGGTAAAAAATGCAAATACTGCTGGGATTTGGTGTACCGAGACGGGACGTAAAATCTGCAGGCATTATAGTGATCCACGCCACAATTTTGTCAACGTTTAt < 1:1677449/150‑1 (MQ=255)
aGGCTGCTCCCCCCCGCGCCTGAAACGTGGCAAATTCTCCTCGTTTTGGGTAAAAAATGCAAATACTGCTGGGATTTGGTGTACCGAGACGGGACGTAAAATCTGCAGGCATTATAGTGATCCACGCCACAATTTTGTCAACGTTTATTg < 2:341729/150‑1 (MQ=255)
aGGCTGCTCCACCCCGCGCCTGAAACGTGGCAAATTCTACTCGTTTTGGGTAAAAAATGCAAATACTGCTGGGATTTGGTGTACCGAGACGGGACGTAAAATCTGCAGGCATTATAGTGATCCACGCCACAATTTTGTCAACGTTTATTg > 1:1280953/1‑150 (MQ=255)
aGGCTGCTCCACCCCGCGCCTGAAACGTGGCAAATTCTACTCGTTTTGGGTAAAAAATGCAAATACTGCTGGGATTTGGTGTACCGAGACGGGACGTAAAATCTGCAGGCATTATAGTGATCCACGCCACAATTTTGTCAACGTTTATTg < 2:476643/150‑1 (MQ=255)
gctgctCCACCCCGCGCCTGAAACGTGGCAAATTCTACTCGTTTTGGGTAAAAAATGCAAATACTGCTGGGATTTGGTGTACCGAGACGGGACGTAAAATCTGCAGGCATTATAGTGATCCACGCCACAATTTTGTCAACGTTTATTGCt < 2:2038009/150‑1 (MQ=255)
ctgctCCACCCCGCGCCTGAAACGTGGCAAATTCTACTCGTTTTGGGTAAAAAATGCAAATACTGCTGGGATTTGGTGTACCGAGACGGGACTTAAAATCTGCAGGCATTATAGTGATCCACGCCACAATTTTGTCAACGTTTATTGCTa < 2:2133937/150‑1 (MQ=255)
ctgctCCACCCCGCGCCTGAAACGTGGCAAATTCTACTCGTTTTGGGTAAAAAATGCAAATACTGCTGGGATTTGGTGTACCGAGACGGGACGTAAAATCTGCAGGCATTATAGTGATCCACGCCACAATTTTGTCAACGTTTATTGCTa > 2:3963571/1‑150 (MQ=255)
tCCACCCCGCGCCTGAAACGTGGCAAATTCTACTCGTTTTGGGTAAAAAATGCAAATCCTGCTGGGATTTGGTGTACCGAGACGGGACGTAAAATCTGCAGGCATTATAGTGATCCACGCCACAATTTTGTCAACGTTTATTGCTAATCa < 2:2537422/150‑1 (MQ=255)
tCCACCCCGCGCCTGAAACGTGGCAAATTCTACTCGTTTTGGGTAAAAAATGCAAATACTGCTGGGATTTGGTGTACCGAGACGGGACGTAAAATCTGCAGGCATTATAGTGATCCACGCCACAATTTTGTCAACGTTTATTGCTAATCa < 2:1158734/150‑1 (MQ=255)
cACCCCGCGCCTGAAACGTGGCAAATTCTACTCGTTTTGGGCAAAAAATGCAAATACTGCTGGGATTTGGTGTACCGAGACGGGACGTAAAATCTGCAGGCATTATAGTGATCCACGCCACAATTTTGTCAACGGTTATTGCTAATCAtg > 2:246676/1‑150 (MQ=255)
gcCTGAAACGTGGCAAATTCTACTCGTTTTGGGTAAAAAATGCAAATACTGCTGGGATTTGGTGTACCGAGACGGGACGTAAAATCTGCAGGCATTATAGTGATCCACGCCACAATTTTGTCAACGTTTATTGCTAATCATGtgaatgaa > 1:3433375/1‑150 (MQ=255)
gcCTGAAACGTGGCAAATTCTACTCGTTTTGGGTAAAAAATGCAAATACTGCTGGGATTTGGTGTACCGAGACGGGACGTAAAATCTGCAGGCATTATAGTGATCCACGCCACAATTTTGTCAACGTTTATTGCTAATCATGtgaatgaa > 1:4136160/1‑150 (MQ=255)
gcCAGAAACGTGGCAAATTCTACTCGTTTGGGGTAAAAAATGCAAATACTGCTGGGATTTGGTGTACCGAGACGGGACGTAAAATCTGCAGGCATTATAGTGATCCACGCCACAATTTTGTCAACGTTTATTGCTAATCATGtgaatgaa < 2:1204844/150‑1 (MQ=255)
ccTGAAACGTGGCAAATTCTACTCGTTTTGGGTAAAAAATGCAAATACTGCTGGGATTTGGTGTACCGAGACGGGACGTAAAATCTGCAGGCATTATAGTGATCCACGCCACAATTTTGTCAACGTTTATTGCTAATCATGTgaatgaat > 1:511450/1‑150 (MQ=255)
ccTGAAACGTGGCAAATTCTACTCGTTTTGGGTAAAAAATGCAAATACTGCTGGGATTTGGTGTACCGAGACGGGACGTAAAATCTGCAGGCATTATAGTGATCCACGCCACAATTTTGTCAACGTTTATTGCTAATCATGTgaatgaat < 1:2840212/150‑1 (MQ=255)
ccTGAAACGTGGCAAATTCTACTCGTTTTGGGTAAAAAATGCAAATACTGCTGGGATTTGGTGTACCGAGACGGGACGTAAAATCTGCAGGCATTATAGTGATCCACGCCACAATTTTGTCAACGTTTATTGCTAATCATGTgaatgaat < 1:1494257/150‑1 (MQ=255)
ccTGAAACGTGGCAAATTCTACTCGTTTTGGGTAAAAAATGCAAATACTGCTGGGATTTGGTGTACCGAGACGGGACGTAAAATCTGCAGGCATTATAGTGATCCACGCCACAATTTTGTCAACGTTTATTGCTAATCATGTgaatgaat > 2:3006612/1‑150 (MQ=255)
cTGAAACGTGGCAAATTCTACTCGTTTTGGGTAAAAAATGCAAATACTGCTGGGATTTGGTGTACCGAGACGGGACGTAAAATCTGCAGGCATTATAGTGATCCACGCCACAATTTTGTCAACGTTTATTGCTAATCATGTGAATGAata > 2:1442597/1‑150 (MQ=255)
tGAAACGTGGCAAATTCTACTCGTTTTGGGTAAAAAATGCAAATACTGCTGGGATTTGGTGTACCGAGACGGGACGTAAAATCTGCAGGCATTATAGTGATCCACGCCACAATTTTGTCAACGTTTATTGCTAATCATGTGAATGAatat > 2:2965033/1‑150 (MQ=255)
tGAAACGTGGCAAATTCTACTCGTTTTGGGTAAAAAATGCAAATACTGCTGGGATTTGGTGTACCGAGACGGGACGTAAAATCTGCAGGCATTATAGTGATCCACGCCACAATTTTGTCAACGTTTATTGCTAATCATGTGAATGAatat < 1:3877249/150‑1 (MQ=255)
gAACCGTGGCAAATTCTACTCGTTTTGGGTAAAAAATGCAAATCCTGCTGGGATTTGGTGTACCGAGACGGGACGTAAAATCTGCAGGCATTATAGTGATCCACGCCACAATTTTGTCAACGTTTATTGCTAATCATGTGAATGAATATc < 2:273268/150‑1 (MQ=255)
gAAACGTGGCAAATTCTACTCGTTTTGGGTAAAAAATGCAAATCCTGCTGGAATTTGGTGTCCCGAGACGGGAGGTAAAATCTGCAGCCATTATAGTGATCCACGCCACAATTTTGTCAACGTTTATTGCTAATCATGTGAATGAATATc < 2:539064/150‑1 (MQ=255)
gAAACGTGGCAAATTCTACTCGTTTTGGGTAAAAAATGCAAATACTGCTGGGATTTGGTGTACCGAGACGGGACGTAAAATCTGCAGGCATTATAGTGATCCACGCCACAATTTTGTCAACGTTTATTGCTAATCATGTGAATGAATATc > 2:1301094/1‑150 (MQ=255)
aaCGTGGCAATTTCTACTTGTTTGGGTAAAAAAATGAAAATACTGCTGGATTTTGGTGTACCGAGACGGGACGTAAAATCTGCAGGCATTATAGTGATCCACGCCACAATTTTGTCAACGTTTATTGCTAATCATGTGAATGAATATCCa < 2:3077776/150‑1 (MQ=255)
aCGTGGCAAATTCTACTCGTTTTGGGTAAAAAATGCAAATACTGCTGGGATTTGGTGTACCGAGACGGGACGTAAAATCTGCAGGCATTATAGTGATCCACGCCACAATTTTGTCAACGTTTATTGCTAATCATGTGAATGAATATCCAg > 1:83798/1‑150 (MQ=255)
aCGTGGCAAATTCTACTCGTTTTGGGTAAAAAATGCAAATACTGCTGGGATTTGGTGTACCGAGACGGGACGTAAAATCTGCAGGCATTATAGTGATCCACGCCACAATTTTGTCAACGTTTATTGCTAATCATGTGAATGAATATCCAg < 1:3379379/150‑1 (MQ=255)
cGTGGCAAATTCTACTCGTTTTGGGTAAAAAATGCAAATACTGCTGGGATTTGGTGTACCGAGACGGGACGTAAAATCTGCAGGCATTATAGTGATCCACGCCACAATTTTGTCAACGTTTATTGCTAATCATGTGAATGAATATCCAGt > 1:2772570/1‑150 (MQ=255)
tGGCAAATTCTACTCGTTTTGGGTAAAAAATGCAAATACTGCTGGGATTTGGTGTACCGAGACGGGACGTAAAATCTGCAGGCATTATAGTGATCCACGCCACAATTTTGTCAACGTTTATTGCTAATCATGTGAATGAATATCCAGTTc > 1:3581401/1‑150 (MQ=255)
tGGCAAATTCTACTCGTTTTGGGTAAAAAATGCAAATACTGCTGGGATTTGGTGTACCGAGACGGGACGTAAAATCTGCAGGCATTATAGTGATCCACGCCACAATTTTGTCAACGTTTATTGCTAATCATGTGAATGAATATCCAGTTc < 1:875302/150‑1 (MQ=255)
gCAAATTCTACTCGTTTTGGGTAAAAAATGCAAATACTGCTGGGATTTGGTGTACCGAGACGGGACGTAAAATCTGCAGGCATTATAGTGATCCACGCCACAATTTTGTCAACGTTTATTGCTAATCATGTGAATGAATATCCAGTTCAc < 1:921876/150‑1 (MQ=255)
cAAATTCTACTCGTTTTGGGTAAAAAATGCAAATACTGCTGGGATTTGGTGTACCGAGACGGGACGTAAAATCTGCAGGCATTATAGTGATCCACGCCACAATTTTGTCAACGTTTATTGCTAATCATGTGAATGAATATCCAGTTCACt > 1:379713/1‑150 (MQ=255)
aTTCTACTCGTTTTGGGTAAAAAATGCAAATACTGCTGGGATTTGGTGTACCGAGACGGGACGTAAAATCTGCAGGCATTATAGTGATCCACGCCACAATTTTGTCAACGTTTATTGCTAATCATGTGAATGAATATCCAGTTCACTTTc < 2:712840/150‑1 (MQ=255)
ttCTACTCGTTTTGGGTAAAAAATGCAAATACTGCTGGGATTTGGTGTACCGAGACGGGACGTAAAATCTGCAGGCATTATAGTGATCCACGCCACAATTTTGTCAACGTTTATTGCTAATCATGTGAATGAATATCCAGTTCACTTTCa > 1:959689/1‑150 (MQ=255)
cTCGTTTTGGGTAAAAAATGCAAATACTGCTGGGATTTGGTGTACCGAGACGGGACGTAAAATCTGCAGGCATTATAGTGATCCACGCCACAATTTTGTCAACGTTTATTGCTAATCATGTGAATGAATATCCAGTTCACTTTCATttgt > 2:1525079/1‑150 (MQ=255)
gTTTTGGGTAAAAAATGCAAATACTGCTGGGATTTGGTGTACCGAGACGGGACGTAAAATCTGCAGGCATTATAGTGATCCACGCCACAATTTTGTCAACGTTTATTGCTAATCATGTGAATGAATATCCAGTTCACTTTCATTTGTTGa < 1:3557661/150‑1 (MQ=255)
gTTTTGGGTAAAAAATGCAAATACTGCTGGGATTTGGTGTACCGAGACGGGACGTAAAATCTGCAGGCATTATAGTGATCCACGCCACAATTTTGTCAACGTTTATTGCTAATCATGTGAATGAATATCCAGTTCACTTTCATTTGTTGa < 1:1404356/150‑1 (MQ=255)
ttggggTAAAAAATGCAAATACTGCTGGGATTTGGTGTACCGAGACGGGACGTAAAATCTGCAGGCATTATAGTGATCCACGCCACAATTTTGTCAACGTTTATTGCTAATCATGTGAATGAATATCCAGTTCACTTTCATTTGTTGAAt < 2:649335/147‑1 (MQ=255)
ttGGGTAAAAAATGCAAATACTGCTGGGATTTGGTGTACCGAGACGGGACGTAAAATCTGCAGGCATTATAGTGATCCACGCCACAATTTTGTCAACGTTTATTGCTAATCATGTGAATGAATATCCAGTTCACTTTCATTTGTTGAATa > 1:991448/1‑150 (MQ=255)
tGGGTAAAAAATGCAAATACTGCTGGGATTTGGTGTACCGAGACGGGACGTAAAATCTGCAGGCATTATAGTGATCCACGCCACAATTTTGTCAACGTTTATTGCTAATCATGTGAATGAATATCCAGTTCACTTTCATTTGTTGAATAc > 2:3541592/1‑150 (MQ=255)
gggTAAAAAATGCAAATACTGCTGGGATTTGGTGTACCGAGACGGGACGTAAAATCTGCAGGCATTATAGTGATCCACGCCACAATTTTGTCAACGTTTATTGCTAATCATGTGAATGAATATCCAGTTCACTTTCATTTGTTGAATACt < 1:1790612/150‑1 (MQ=255)
ggTAAAAAATGCAAATACTGCTGGGATTTGGTGTACCGAGACGGGACGTAAAATCTGCAGGCATTATAGTGATCCACGCCACAATTTTGTCAACGTTTATTGCTAATCATGTGAATGAATATCCAGTTCACTTTCATTTGTTGAATACtt < 1:2969281/150‑1 (MQ=255)
ggTAAAAAATGCAAATACTGCTGGGATTTGGTGTACCGAGACGGGACGTAAAATCTGCAGGCATTATAGTGATCCACGCCACAATTTTGTCAACGTTTATTGCTAATCATGTGAATGAATATCCAGTTCACTTTCATTTGTTGAATACtt > 1:1196347/1‑150 (MQ=255)
tAAAAAATGCAAATACTGCTGGGATTTGGTGTACCGAGACGGGACGTAAAATCTGCAGGCATTATAGTGATCCACGCCACAATTTTGTCAACGTTTATTGCTAATCATGTGAATGAATATCCAGTTCACTTTCATTTGTTGAATACtttt < 2:762902/150‑1 (MQ=255)
tAAAAAATGCAAATACTGCTGGGATTTGGTGTACCGAGACGGGACGTAAAATCTGCAGGCATTATAGTGATCCACGCCACAATTTTGTCAACGTTTATTGCTAATCATGTGAATGAATATCCAGTTCACTTTCATTTGTTGAATACtttt < 1:2019110/150‑1 (MQ=255)
aaaaaaTGCAAATACTGCTGGGATTTGGTGTACCGAGACGGGACGTAAAATCTGCAGGCATTATAGTGATCCACGCCACAATTTTGTCAACGTTTATTGCTAATCATGTGAATGAATATCCAGTTCACTTTCATTTGTTGAATACTTTTg < 2:1724768/150‑1 (MQ=255)
aaaaaTGCAAATACTGCTGGGATTTGGTGTACCGAGACGGGACGTAAAATCTGCAGGCATTATAGTGATCCACGCCACAATTTTGTCAACGTTTATTGCTAATCATGTGAATGAATATCCAGTTCACTTTCATTTGTTGAATACTTTTGc > 2:4030029/1‑150 (MQ=255)
aaaaaTGCAAATACTGCTGGGATTTGGTGTACCGAGACGGGACGTAAAATCTGCAGGCATTATAGTGATCCACGCCACAATTTTGTCAACGTTTATTGCTAATCATGTGAATGAATATCCAGTTCACTTTCATTTGTTGAATACTTTCGc < 1:2078752/150‑1 (MQ=255)
aaaTGCAAATACTGCTGGGATTTGGTGTACCGAGACGGGACGTAAAATCTGCAGGCATTATAGTGATCCACGCCACAATTTTGTCAACGTTTATTGCTAATCATGTGAATGAATATCCAGTTCACTTTCATTTGTTGAATACTTTTGCCt > 1:3615874/1‑150 (MQ=255)
aTGCAAATACTGCTGGGATTTGGTGTACCGAGACGGGACGTAAAATCTGCAGGCATTATAGTGATCCACGCCACAATTTTGTCAACGTTTATTGCTAATCATGTGAATGAATATCCAGTTCACTTTCATTTGTTGAATACTTTTGCCTtc > 1:1977401/1‑150 (MQ=255)
aaaTACTGCTGGGATTTGGTGTACCGAGACGGGACGTAAAATCTGCAGGCATTATAGTGATCCACGCCACAATTTTGTCAACGTTTATTGCTAATCATGTGAATGAATATCCAGTTCACTTTCATTTGTTGAATACTTTTGCCTTCTCCt > 1:2361406/1‑150 (MQ=255)
tACTGCTGGGATTTGGTGTACCGAGACGGGACGTAAAATCTGCAGGCATTATAGTGATCCACGCCACAATTTTGTCAACGTTTATTGCTAATCATGTGAATGAATATCCAGTTCACTTTCATTTGTTGAATACTTTTGCCTTCTCCTGct > 2:1839553/1‑150 (MQ=255)
ctgctgGGATTTGGTGTACCGAGACGGGACGTAAAATCTGCAGGCATTATAGTGATCCACGCCACAATTTTGTCAACGTTTATTGCTAATCATGTGAATGAATATCCAGTTCACTTTCATTTGTTGAATACTTTTGCCTTCTCCTGctct > 1:1938307/1‑150 (MQ=255)
gctgGGATTTGGTGTACCGAGACGGGACGTAAAATCTGCAGGCATTATAGTGATCCACGCCACAATTTTGTCAACGTTTATTGCTAATCATGTGAATGAATATCCAGTTCACTTTCATTTGTTGAATACTTTTGCCTTCTCCTGCTCTcc > 2:3671396/1‑150 (MQ=255)
ctgGGATTTGGTGTACCGAGACGGGACGTAAAATCTGCAGGCATTATAGTGATCCACGCCACAATTTTGTCAACGTTTATTGCTAATCATGTGAATGAATATCCAGTTCACTTTCATTTGTTGAATACTTTTGCCTTCTCCTGCTCTccc > 1:2254056/1‑150 (MQ=255)
tgGGATTTGGTGTACCGAGACGGGACGTAAAATCTGCAGGCATTATAGTGATCCACGCCACAATTTTGTCAACGTTTATTGCTAATCATGTGAATGAATATCCAGTTCACTTTCATTTGTTGAATACTTTTGCCTTCTCCTGCTCTCCCt < 2:290682/150‑1 (MQ=255)
aTTTGGTGTACCGAGACGGGACGTAAAATCTGCAGGCATTATAGTGATCCACGCCACAATTTTGTCAACGTTTATTGCTAATCATGTGAATGAATATCCAGTTCACTTTCATTTGTTGAATACTTTTGCCTTCTCCTGCTCTCCCTTAAg < 2:348210/150‑1 (MQ=255)
tgtACCGAGACGGGACGTAAAATCTGCAGGCATTATAGTGATCCACGCCACAATTTTGTCAACGTTTATTGCTAATCATGTGAATGAATATCCAGTTCACTTTCATTTGTTGAATACTTTTGCCTTCTCCTGCTCTCCCTTAAGCGCatt > 2:3697716/1‑150 (MQ=255)
gtACCGAGACGGGACGTAAAATCTGCAGGCATTATAGTGATCCACGCCACAATTTTGTCAACGTTTATTGCTAATCATGTGAATGAATATCCAGTTCACTTTCATTTGTTGAATACTTTTGCCTTCTCCTGCTCTCCCTTAAGCGCatta < 1:733334/150‑1 (MQ=255)
ccGAGACGGGACGTAAAATCTGCAGGCATTATAGTGATCCACGCCACAATTTTGTCAACGTTTATTGCTAATCATGTGAATGAATATCCAGTTCACTTTCATTTGTTGAATACTTTTGCCTTCTCCTGCTCTCCCTTAAGCGCATTAttt < 2:3364313/150‑1 (MQ=255)
ccGAGACGGGACGTAAAATCTGCAGGCATTATAGTGATCCACGCCACAATTTTGTCAACGTTTATTGCTAATCATGTGAATGAATATCCAGTTCACTTTCATTTGTTGAATACTTTTGCCTTCTCCTGCTCTCCCTTAACCGCATTAttt > 2:1081515/1‑150 (MQ=255)
cGAGACGGGACGTAAAATCTGCAGGCATTATAGTGATCCACGCCACAATTTTGTCAACGTTTATTGCTAATCATGTGAATGAATATCCAGTTCACTTTCATTTGTTGAATACTTTTGCCTTCTCCTGCTCTCCCTTAAGCGCATTAtttt < 1:758007/150‑1 (MQ=255)
aggcGGGACGTAAAATCTGCAGGCATTATAGTGATCCACGCCACAATTTTGTCAACGTTTATTGCTAATCATGTGAATGAATATCCAGTTCACTTTCATTTGTTGAATACTTTTGCCTTCTCCTGCTCTCCCTTAAGCGCATTATTTTAc < 2:4081818/147‑1 (MQ=255)
agaCGGGACGTAAAATCTGCAGGCATTATAGTGATCCACGCCACAATTTTGTCAACGTTTATTGCTAATCATGTGAATGAATATCCAGTTCACTTTCATTTGTTGAATACTTTTGCCTTCTCCTGCTCTCCCTTAAGCGCATTATTTTAc > 1:3138544/1‑150 (MQ=255)
agaCGGGACGTAAAATCTGCAGGCATTATAGTGATCCACGCCACAATTTTGTCAACGTTTATTGCTAATCATGTGAATGAATATCCAGTTCACTTTCATTTGTTGAATACTTTTGCCTTCTCCTGCTCTCCCTTAAGCGCATTATTTTAc < 1:1017621/150‑1 (MQ=255)
gaCGGGACGTAAAATCTGCAGGCATTATAGTGATCCACGCCACAATTTTGTCAACGTTTATTGCTAATCATGTGAATGAATATCCAGTTCACTTTCATTTGTTGAATACTTTTGCCTTCTCCTGCTCTCCCTTAAGCGCATTATTTTACa < 2:3846697/150‑1 (MQ=255)
gaCGGGACGTAAAATCTGCAGGCATTATAGTGATCCACGCCACAATTTTGTCAACGTTTATTGCTAATCATGTGAATGAATATCCAGTTCACTTTCATTTGTTGAATACTTTTGCCTTCTCCTGCTCTCCCTTAAGCGCATTATTTTACa > 2:2008697/1‑150 (MQ=255)
gaCGGGACGTAAAATCTGCAGGCATTATAGTGATCCACGCCACAATTTTGTCAACGTTTATTGCTAATCATGTGAATGAATATCCAGTTCACTTTCATTTGTTGAATACTTTTGCCTTCTCCTGCTCTCCCTTAAGCGCATTATTTTACa < 2:1950288/150‑1 (MQ=255)
gACGTAAAATCTGCAGGCATTATAGTGATCCACGCCACAATTTTGTCAACGTTTATTGCTAATCATGTGAATGAATATCCAGTTCACTTTCATTTGTTGAATACTTTTGCCTTCTCCTGCTCTCCCTTAAGCGCATTATTTTACaaaaaa < 1:3719159/150‑1 (MQ=255)
gACGTAAAATCTGCAGGCATTATAGTGATCCACGCCACAATTTTGTCAACGTTTATTGCTAATCATGTGAATGAATATCCAGTTCACTTTCATTTGTTGAATACTTTTGCCTTCTCCTGCTCTCCCTTAAGCGCATTATTTTACaaaaaa < 1:2574011/150‑1 (MQ=255)
aCGTAAAATCTGCAGGCATTATAGTGATCCACGCCACAATTTTGTCAACGTTTATTGCTAATCATGTGAATGAATATCCAGTTCACTTTCATTTGTTGAATACTTTTGCCTTCTCCTGCTCTCCCTTAAGCGCATTATTTTACAAAAAac > 2:664707/1‑150 (MQ=255)
aaaaTCTGCAGGCATTATAGTGATCCACGCCACAATTTTGTCAACGTTTATTGCTAATCATGTGAATGAATATCCAGTTCACTTTCATTTGTTGAATACTTTTGCCTTCTCCTGCTCTCCCTTAAGCGCATTATTTTACAAAAAacacac > 2:3129899/1‑150 (MQ=255)
aaaTCTGCAGGCATTATAGTGATCCACGCCACAATTTTGTCAACGTTTATTGCTAATCATGTGAATGAATATCCAGTTCACTTTCATTTGTTGAATACTTTTGCCTTCTCCTGCTCTCCCTTAAGCGCATTATTTTACAAAAAACACACt > 2:2608245/1‑150 (MQ=255)
aaTCTGCAGGCATTATAGTGATCCACGCCACAATTTTGTCAACGTTTATTGCTAATCATGTGAATGAATATCCAGTTCACTTTCATTTGTTGAATACTTTTGCCTTCTCCTGCTCTCCCTTAAGCGCATTATTTTACAAAAAACACACTa > 2:61444/1‑150 (MQ=255)
tCTGCAGGCATTATAGTGATCCACGCCACAATTTTGTCAACGTTTATTGCTAATCATGTGAATGAATATCCAGTTCACTTTCATTTGTTGAATACTTTTGCCTTCTCCTGCTCTCCCTTAAGCGCATTATTTTACAAAAAACACACTaaa > 1:1111119/1‑150 (MQ=255)
cTGCAGGCATTATAGTGATCCACGCCACAATTTTGTCAACGTTTATTGCTAATCATGTGAATGAATATCCAGTTCACTTTCATTTGTTGAATACTTTTGCCTTCTCCTGCTCTCCCTTAAGCGCATTATTTTACAAAAAACACACTAAAc > 1:2115038/1‑150 (MQ=255)
tGCAGGCATTATAGTGATCCACGCCACAATTTTGTCAACGTTTATTGCTAATCATGTGAATGAATATCCAGTTCACTTTCATTTGTTGAATACTTTTGCCTTCTCCTGCTCTCCCTTAAGCGCATTATTTTACAAAAAACACACTAAAct > 1:3324547/1‑150 (MQ=255)
aGGCATTATAGTGATCCACGCCACAATTTTGTCAACGTTTATTGCTAATCATGTGAATGAATATCCAGTTCACTTTCATTTGTTGAATACTTTTGCCTTCTCCTGCTCTCCCTTAAGCGCATTATTTTACAAAAAACACACTAAACTCtt > 1:1630153/1‑150 (MQ=255)
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TCTGCAGGCATTATAGTGATCCACGCCACAATTTTGTCAACGTTTATTGCTAATCATGTGAATGAATATCCAGTTCACTTTCATTTGTTGAATACTTTTGCCTTCTCCTGCTCTCCCTTAAGCGCATTATTTTACAAAAAACACACTAAA > DRR075726.1139024/1‑150 (MQ=60)
CTGCAGGCATTATAGTGATCCACGCCACAATTTTGTCAACGTTTATTGCTAATCATGTGAATGAATATCCAGTTCACTTTCATTTGTTGAATACTTTTGCCTTCTCCTGCTCTCCCTTAAGCGCATTATTTTACAAAAAACACACTAAAC > DRR075726.2168800/1‑150 (MQ=60)
TGCAGGCATTATAGTGATCCACGCCACAATTTTGTCAACGTTTATTGCTAATCATGTGAATGAATATCCAGTTCACTTTCATTTGTTGAATACTTTTGCCTTCTCCTGCTCTCCCTTAAGCGCATTATTTTACAAAAAACACACTAAACT > DRR075726.3407965/1‑150 (MQ=60)
TGCAGGCATTATAGTGATCCACGCCACAATTTTGTCAACGTTTATTGCTAATCATGTGAATGAATATCCAGTTCACTTTCATTTGTTGAATACTTTTGCCTTCTCCTGCTCTCCCTTAAGCGCATTATTTTACAAAAAACACACTAAACT > DRR075726.2277566/1‑150 (MQ=60)
TGCAGGCATTATAGTGATCCACGCCACAATTTTGTCAACGTTTATTGCTAATCATGTGAATGAATATCCAGTTCACTTTCATTTGTTGAATACTTTTGCCTTCTCCTGCTCTCCCTTAAGCGCATTATTTTACAAAAAACACACTAAACT < DRR075726.1541380/150‑1 (MQ=60)
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CAGGCATTATAGTGATCCACGCCACAATTTTGTCAACGTTTATTGCTAATCATGTGAATGAATATCCAGTTCACTTTCATTTGTTGAATACTTTTGCCTTCTCCTGCTCTCCCTTAAGCGCATTATTTTACAAAAAACACACTAAACTCT > DRR075726.1699428/1‑150 (MQ=60)
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CACAATTTTGTCAACGTTTATTGCTAATCATGTGAATGAATATCCAGTTCACTTTCATTTGTTGAATACTTTTGCCTTCTCCTGCTCTCCCTTAAGCGCATTATTTTACAAAAAACACACTAAACTCTTCCTGTCTCCGATAAAAGATGA < DRR075726.3999313/150‑1 (MQ=60)
caATTTTGTCAACGTTTATTGCTAATCATGTGAATGAATATCCAGTTCACTTTCATTTGTTGAATACTTTTGCCTTCTCCTGCTCTCCCTTAAGCGCATTATTTTACAAAAAACACACTAAACTCTTCCTGTCTCCGATAAAAGATGATT < DRR075726.109528/148‑1 (MQ=60)
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caATTTTGTCAACGTTTATTGCTAATCATGTGAATGAATATCCAGTTCACTTTCATTTGTTGAATACTTTTGCCTTCTCCTGCTCTCCCTTAAGCGCATTATTTTACAAAAAACACACTAAACTCTTCCTGTCTCCGATAAAAGATGATT < DRR075726.3237137/148‑1 (MQ=60)
A‑ATTTTGTCAACGTTTATTGCTAATCATGTGAATGAATATCCAGTTCACTTTCATTTGTTGAATACTTTTGCCTTCTCCTGCTCTCCCTTAAGCGCATTATTTTACAAAAAACACACTAAACTCTTCCTGTCTCCGATAAAAGATGATTA > DRR075726.3419946/1‑150 (MQ=60)
A‑ATTTTGTCAACGTTTATTGCTAATCATGTGAATGAATATCCAGTTCACTTTCATTTGTTGAATACTTTTGCCTTCTCCTGCTCTCCCTTAAGCGCATTATTTTACAAAAAACACACTAAACTCTTCCTGTCTCCGATAAAAGATGATTA < DRR075726.3914346/150‑1 (MQ=60)
A‑ATTTTGTCAACGTTTATTGCTAATCATGTGAATGAATATCCAGTTCACTTTCATTTGTTGAATACTTTTGCCTTCTCCTGCTCTCCCTTAAGCGCATTATTTTACAAAAAACACACTAAACTCTTCCTGTCTCCGATAAAAGATGATTA > DRR075726.2553364/1‑150 (MQ=60)
ATTTTGTCAACGTTTATTGCTAATCATGTGAATGAATATCCAGTTCACTTTCATTTGTTGAATACTTTTGCCTTCTCCTGCTCTCCCTTAAGCGCATTATTTTACAAAAAACACACTAAACTCTTCCTGTCTCCGATAAAAGATGATTAA < DRR075726.555331/150‑1 (MQ=60)
|
ATGAGCCCGACGAGCTACCAGGCTGCTCCACCCCGCGCCTGAAACGTGGCAAATTCTACTCGTTTTGGGTAAAAAATGCAAATACTGCTGGGATTTGGTGTACCGAGACGGGACGTAAAATCTGCAGGCATTATAGTGATCCACGCCAC‑ATTTTGTCAACGTTTATTGCTAATCATGTGAATGAATATCCAGTTCACTTTCATTTGTTGAATACTTTTGCCTTCTCCTGCTCTCCCTTAAGCGCATTATTTTACAAAAAACACACTAAACTCTTCCTGTCTCCGATAAAAGATGATTAA > AP012306/2791586‑2791884
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 0 ≤ ATCG/ATCG < 8 ≤ ATCG/ATCG < 29 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |