| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | CP000730 | 68659 = | 131 (0.690) | 11 (0.070) | 11/260 | 12.4 | 8.7% | coding (775/852 nt) | USA300HOU_0065 | transposase |
| ? | CP000730 | = 68655 | 115 (0.690) | coding (771/852 nt) | USA300HOU_0065 | transposase | |||||
| Rejected: Coverage evenness skew score above cutoff. | |||||||||||
| Rejected: Frequency below/above cutoff threshold. | |||||||||||
TTTAGTTCAATTACCTTTATAAACAAAAGAGCCTATAATCCTAGGGCACTGAACCCTTAAAACGGGAACTTAATAAAAACACCATGTTCTAGGCTATTAATTCTCTGTATTTTACAGGGGATAAGTAGCCTAGTTTTTG‑TTGAATTCGATTATTATTATTATTATT‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ < CP000730/68824‑68659‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑attattattattattattGTTTTTAATGTACTTTTCGACAATATCTATTACAATGTGATTAGAGTGATTAAGCTCATTATTGATGTAAAAAGTTTCAGACTTTAGCGAGGAATGGAAACTTTCTATCGGGGCGTTATCGGCAGGTGTTCCCTTTCGGGACATACTT < CP000730/68655‑68508 cTTAGTTCAGTTACCTTTATAAACAAAAGGGCCTATAATCCTAGGGCACCGAACCCTTAAAACGGGAACTTAATAAAAACACCATGTTCTAGGCTATTAATTCTCTGTATTTTACAGGGGACAAGTAGCCTAGTTTTTG‑TTGAATTCGA < 1:1568623/148‑1TTTAGTTCAATTACCTTTATAAACAAAAGAGCCTATAATCCTAGGGCACTGATCCCTTAAAACGGGAACTTAATAAAAACACCATGTTCTAGGCTATTAATTCTCTGTATTTTACAGGGGATAAGTAGCCTAGTTTTTG‑TTGAATTCGA < 2:1555519/149‑1TTTAGTTCAATTACCTTTATAAACAAAAGAGCCTATAATCCTAGGGCACTGAACCCTTAAAACGGGAACTTAATAAAAACACCATGTTCTAGGCTATTAATTCTCTGTATTTTACAGGGGATAAGTAGCCTAGTTTTTG‑TTGAATTCGA > 1:456932/1‑149TTTAGTTCAATTAACTTTATAAACAAAAGAGCCTATAATCCTAGGGCACTGAACCCTTAAAACGGGAACTTAATAAAAACACCATGTTCTAGGCTATTAATTCTCTGTATTTTACAGGGGATAAGTAGCCTAGTTTTTG‑TTGAATTCGA < 2:1735593/149‑1 TTAGTTCAATTACCTTTATAAACAAAAGAGCCTATAATCCTAGGGCACTGAACCCTTAAAACGGGAACTTAATAAAAACACCATGTTCTAGGCTATTAATTCTCTGTATTTTACAGGGGATAAGTAGCCTAGTTTTTG‑TTGAATTCGAT > 2:915286/1‑149 TTAGTTCAATTACCTTTATAAACAAAAGAGCCTATAATCCTAGGGCACTGAACCCTTAAAACGGGAACTTAATAAAAACACCATGTTCTAGGATATTAATGCTCTGTATTTTACAGGGGATATGTTGCCTAGTTTTTG‑TTGATTTCGAT > 2:1303717/1‑149 TTAGTTCAATTACCTTTATAAACAAAAGAGCCTATAATCCTAGGGCACTGAACCCTTAAAACGGCAACTTAATAAAAACACCATGTTCTAGGCTATTAATTCTCTGTATTTTACAGGGGATAAGTCGCCTAGTTTTTT‑TGGAATTCGAT > 2:168501/1‑149 aacTCAATTACCTTTATAAACAAAAGAGCCTATAATCCTAGGGCACTGAACCCTTAAAACGGGAACTTAATAAAACCACCATGTTCTAGGCTATTAATTCTCTGTATTTTACAGGGGATAAGTAGCCTAGTTTTTG‑TTGAATTCGATTA < 1:1314223/146‑1 gtaCAATTACCTTTATAAACAAAAGAGCCTATAATCCTAGGGCACTGAACCCTTAAAACGGGAACTTAATAAAAACACCATGTTCTAGGCTATTAATTCTCTGTATTTTACAGGGGATAAGTAGCCTAGTTTTTG‑TTGAATTCGATTAT < 2:221268/146‑1 GTTCAATTACCTTTATAAACAAAAGAGCCTATAATCCTAGGGCACTGAACCCTTAAAACGGGAACTTAATAAAAACACCATGTTCTAGGCTATTAATTCTCTGTATTTTACAGGGGATAAGTAGCCTAGTTTTTG‑TTGAATTCGATTAT > 2:1382085/1‑149 GTTCAATTACCTTTATAAACAAAAGAGCCTATAATCCTAGGGCACTGAACCCTTAAAACGGGAACTTAATAAAAACACCATGTTCTAGGCTATTAATTCTCTGTATTTTACAGGGGATAAGTAGCCTAGTTTTTG‑TTGAATTCGATTAT < 1:1827648/149‑1 GTTCAATTACCTTTATAAACAAAAGAGCCTATAATCCTAGGGCACTGAACCCTTAAAACGGGAACTTAATAAAAACACCATGTTCTAGGCTATTAATTCTCTGTATTTTAACGTTGATAAGTAGCCTAGTTTTTG‑TTGAATTCGATTAT < 1:478067/149‑1 TTCAATTACCTTTATAAACAAAAGAGCCTATAATCCTAGGGCACTGAACCCTTAAAACGGGAACTTAATAAAAACACCATGTTCTAGGCTATTAATTCTNTGTATTTTACAGGGGATAAGTAGCCTAGTTTTTG‑TTGAATTCGATTATT > 1:1724548/1‑149 TTCAATTACCTTTATAAACAAAAGAGCCTATAATCCTAGGGCACTGAACCCTTAAAACGGGAACTTAATAAAAACACCATGTTCTAGGCTATTAATTCTCTGTATTTTACAGGGGATAAGTAGCCTAGTTTTTG‑TTGAATTCGATTATT > 1:954239/1‑149 CAATTACCTTTATAAACAAAAGAGCCTATAATCCTAGGGTACTGAACCCTTAAAACGGGAACTTAATAAAAACACCATGTTCTAGGCTATTAATTCTCTGTATTTTACAGGGGATAAGTAGCCTAGTTTTTG‑TTGAATTCGATTATTAT < 1:370720/149‑1 CAATTACCTTTATAAACAAAAGAGCCTATAATCCTAGGGCACTGAACCCTTAAAACGGGAACTTAATAAAAACACCATGTTCTAGGCTATTAATTCTCTGTATTTTACAGGGGATAAGTAGCCTAGTTTTTG‑TTGAATTCGATTATTAT < 2:1957757/149‑1 CAATTACCTTTATAAACAAAAGAGCCTATAATCCTAGGGCACTGAACCCTTAAAACGGGAACTTAATAAAAACACCATGTTCTAGGCTATTAATTCTCTGTATTTTACAGGGGATAAGTAGCCTAGTTTTTG‑TTGAATTCGATTATTAT < 1:1823525/149‑1 CAATTACCTTTATAAACAAAAGAGCCTATAATCCTAGGGCACTGAACCCTTAAAACGGGAACTTAATAAAAACACCATGTTCTAGGCTATTAATTCTCTGTATTTTACAGGGGATAAGTAGCCTAGTTTTTG‑TTGAATTCGATTATTAT < 2:1687964/149‑1 CAATTACCTTTATAAACAAAAGAGCCTATAATCCTAGGGCACTGAACCCTTAAAACGGGAACTTAATAAAAACACCATGTTCTAGGCTATTAATTCTCTGTATTTTACAGGGGATAAGTAGCCTAGTTTTTG‑TTGAATTCGATTATTAT < 1:1911675/149‑1 AATTACCTTTATAAACAAAAGAGCCTATAATCCTAGGGCACTGAACCCTTAAAACGGGAACTTAATAAAAACACCATGTTCTAGGCTATTAATTCTCTGTATTTTACAGGGGATAAGTAGCCTAGTTTTTG‑TTGAATTCGATTATTATT < 1:1175572/149‑1 AATTACCTTTATAAACAAAAGAGCCTATAATCCTAGGGCACTGAACCCTTAAAAAGGGAACTTAATAAAAAGACCATGTTCTAGGCTATTAATTCTCACTATTTTACAGGGACTAGGAAGTCT‑GTTTTGGTTTGAATTCGATTGTTATT > 2:1563566/1‑149 ATTACCTTTATAAACAATAGCGCCTATAATCCTAGGGCACTGAAACCTTATAACGGGAACTTAATAAAAACACCATGTTCTAGGCTATTAATTCGCTGTATTTTACAGTGGATGAGTAGCCTAGTTTTTG‑TTGAATTCGATTATTATTA < 2:1237368/149‑1 ATTACCTTTATAAACAAAAGAGCCTATTATCCTAGGGCACTGAACCCTTAAAACTGGAACTTAATAAAAACACCATGTTCTAGGCTATTAATTCTCTGTATTTTACAGGGGATAAGTAGCCTAGTTTTTG‑TTGAATTCGATTATTATTA < 2:1817523/149‑1 ATTACCTTTATAAACAAAAGAGCCTATAATCCTAGGGAACTGAACCCTTAAAAAGGGGACTTAATAAACACACCATGTTCTAGGCTATTAATTCTCTGTATTTTACAGGGGATAAGTAGCCTAGTTTTTG‑TGGAAGTCGATTATGATTA > 2:393253/1‑149 ATTACCTTTATAAACAAAAGAGCCTATAAGCCTAGTGCACTGAACCCTTAAAACGGGAACTTAATAAAAACACCATGTTCTAGGCTATTAATTCTCTGTATTTTACAGGGGATAAGTAGCCTAGTTTTTG‑TTGAATTCGATTATTATTA < 2:1817928/149‑1 ATTAACTTTATAAACAAAAGAGCCTATAATCCTAGGGCACTGAACCCTTAAAACGGGAACTTAATAAAAACACCATGTTCTAGGCTATTAATTCTCTGTATTTTACAGGGGATAAGTAGCCTAGTTTTTG‑TTGAATTCGATTATTATTA < 2:1652395/149‑1 TTACCTTTATAAACAAAAGAGCCTATAATCCTAGGGCACTGAACCCTTAAAACGGGAACTTAATAAAAACACCATGTTCTAGGCTATTAATTCTCTGTATTTTACAGGGGATAAGTAGCCTAGTTTTTG‑TTGAATTCGATTATTATTAT < 1:1011768/149‑1 TTACCTTTATAAACAAAAGAGCCTATAATCCTAGGGCACTGAACCCTTAAAACGGGAAATTAATAAAAACACCATGTTCTAGGCTATTAATTGTCTGTATTGTACAGGGGATAAGTAGCCTAGTTTTTG‑TTGAATTCGAGTAGTAGTAT > 1:759626/1‑149 ACCTTTATAAACAAAAGACCCTATAATCCTAGGGCACTGAACCCTTAAAACGGGAACTTAATAAAAACACCATGTTCTAGGCTATTAATTCTCTGTATTTTACAGGGGATAAGTAGCCTAGTTTTTG‑TTGAATTCGATTATTATTATTA < 1:1235484/149‑1 CCTTTATAAACAAAAGAGCCTATAATCCTAGGGCACTGAACCCTTAAAACGGGAACTTAATAAAACCACCATGTTCTAGGCTATTAATTCTCTGTATTTTACAGGGGATAAGTAGCCTAGTTTTTG‑TTGAATTCGATTATTATTATTAT > 2:1166312/1‑149 CCTTTATAAACAAAAGAGCCTATAATCCTAGGGCACTGAACCCTTAAAACGGGAACTTAATAAAAACACCATGTTCTAGGCTATTAATTCTCTGTATTTTACAGGGGATAAGTAGCCTAGTTTTTG‑TTGAATTCGATTATTATTATTAT > 2:583831/1‑149 CCTTTATAAACAAAAGAGCCTATAATCCTAGGGCACTGAACCCTTAAAACGGGAACTTAATAAAAACACCATGTTCTAGGCTATTAATTCTCTGTATTTTACAGGGGATAAGTAGCCTAGTTTTTG‑TTGAATTCGATTATTATTATTAT > 1:86147/1‑149 CCTTTATAAACAAAAGAGCCTATAATCCTAGGGCACTGAACCCTTAAAACGGGAACTTAATAAAAACACCATGTTCTAGGCTATTAATTCTCTGTATTTTACAGGGGATAAGTAGCCTAGTTTTTG‑TTGAAGTCGATTATTATTATTAT > 1:310489/1‑149 CTTTATAAACAAAAGAGCCTATAATCCTAGGGCACTGAACCCTTGAAACGGGAACTTAATAAAAACACCATGTTCTAGGCTATTAATTCTCTGAATTTTACAGGGGATAAGTAGCCGAGTTTTGG‑TGGAATGCAGTTATTCTTATTATT > 2:184125/1‑149 CTTTATAAACAAAAGAGCCTATAATCCTAGGGCACTGAACCCTTAAAACGGGAACTTAATAAAAACATCATGTTCTAGGCTATTAATTCTCTGTATTTTACAGGGGATAAGTAGCCTAGTTTTTG‑TTGAATCCGATTATTATTATGATT > 2:1340411/1‑149 CTTTATAAACAAAAGAGCCTATAATCCTAGGGCACTGAACCCTTAAAACGGGAACTTAATAAAAACACCATGTTCTAGGCTATTAATTCTCTGTATTTTACAGGGGATAAGTAGCCTAGTTTTTG‑TTGATTTCGATTATTATTCTTATT > 2:66581/1‑149 CTTTATAAACAAAAGAGCCTATAATCCTAGGGCACTGAACCCTTAAAACGGGAACTTAATAAAAACACCATGTTCTAGGCTATTAATTCTCTGTATTTTACAGGGGATAAGTAGCCTAGTTTTTG‑TTGAATTCGATTATTATTATTATT > 1:313046/1‑149 TATAAACAAAAGAGCCTATAATCCTAGGGCACTGAACCCTTAAAACGGGAACTTAATAAAAACACCATGTTCTAGGCTATTAATTCTCTGTATTTTACAGGGGATAAGTAGCCTAGTTTTTG‑TTGAATTCGATTATTATTATTATTATT > 2:1142902/1‑149 ATAAACAAAAGAGCCTATAATCCTAGGGCACTGAACCCTTAAAACGGGAACTTAATAAAAACACCATGTTCTAGGCTATTAATTCTCTGTATTTTACAGGGGATAAGTAGCCTAGTTTTTG‑TTGAATTCGTTTATTATTATTATTATTt > 2:1266457/1‑148 ATAAACAAAAGAGCCTATAATCCTAGGGCACTGAACCCTTAAAAAGGGAACTTAATAAAAACACCATGTTCTAGGCTATTAATTCTCTGTATTTTACAGGGGATAAGTAGCCTAGTTTTTG‑TTGAATTCGATTATTATTATTATTATTt > 1:43556/1‑148 ACAAAAGAGCCTATAATGGTATTGCTCGGAACCCTTAAAACGGGAACTTACTAAAAACACCATGTTCTAGGCTATTAATTCTCTGTATTTTACAGGGGATAAGTAGCCTAGTTTTTG‑TTTAATTCGATTATTATTCTTATTATTGTTTT > 2:926963/1‑149 AATCCTAGGGCACTGAACCCTTAAAACGGGAACTTAATAAAAACACCATGTTCTAGGCTATTAATTCTCTGTATTTTACAGGGGATAAGTAGCCTAGTTTTTG‑TTGAATTCGATTATTATTATTATTATTGTTTTTAATGTACTTTTCG < 1:167193/149‑1 CCTCGGGCACTGAACCCTTAAAACGTGAACTTAACAAAAACACCATGTTCTAGGCTATTAATTCTCTGTTTTTTACAGGGGATAAGTAGCCTAGTTTTTG‑TTGAATTCGATTATTATTATTATTATTGTTTTTAATGTACTTTTCGACA < 1:568852/149‑1 GGGCACTGAACCCTTAAAACGGGAACTTAATAAAAACACCATGTTCTAGGCTATTAATTCTCTGTATTTTACAGGGGATAAGTAGCCTAGTTTTTG‑TTGAATTCGATTATTATTATTATTATTGTTTTTAATGTACTTTTCGACAATAT < 1:1765233/149‑1 AAACGGGAACTTAATAAAAACACCATGTTCTAGGCTATTAATTCTCTGTATTTTACAGGGGATAAGTAGCCTAGTTTTTG‑TTGAATTCGATTATTATTATTATTATTGTTTTTAATGTACTTTTCGACAATATCTATTACAATGTGATT > 1:418809/1‑149 CACCATGTTCTAGGCTATTAATTCTCTGTATTTTACAGGGGATAAGTAGCCTAGTTTTTG‑TTGAATTCGATTATTATTATTATTATTGTTTTTAATGTACTTTTCGACAATATCTATTACAATGTGATTAGTGTGATTAAGCTCATTAT > 2:1769209/1‑149 GGCTATTAATTCTCTGTATTTTACAGGGGATAAGTAGCCTAGTTTTTG‑TTGAGTTCGATTATTATTATTATTATTGTTTTTACTGTACTTATCGAAACTAAGTATTACAATGTGATTCGAGTGATTAAGCTCATTATTGATGTAAAAAG > 2:209495/1‑149 TATTTTACAGGGGATAAGTAGCCTAGTTTTTG‑TTGAATTCGATTATTATTATTATTATTGTTTTTAATGTACTTTTCGACAATATCTATTACAATGTGATTAGAGTGATTAAGCTCATTATTGATGTAACAAGTTTCAGACTTTAGCGA > 1:584804/1‑149 AGGGGATAAGTAGCCTAGTTTTTG‑TTGAATTCGATTATTATTATTATTATTGTTTTTAATGTACTTTTCGACAATATCTATTACAATGTGATTAGAGTGATTAAGCGCATTATTGATGTAAAAAGTTTCAGACTTTAACGAGGAATGta > 1:882933/1‑147 TAGCCTAGTTTTTG‑TTGAATTCGATTATTATTATTATTATTGTTTTTAATGTACTTTTCGACAATATCTATTACAATGTGATTAGAGTGATTAAGCTCATTATTGATGTAAAAAGTTTCAGACTTTAGCGAGGAATGGAAACTTTCTAT > 1:772652/1‑149 TAGTTTTTG‑TTGAATTCCATTATTATTATTATTATTGTTTTTAATGTACTTTTCGACAATATCTATTACAATGTGATTAGAGTGATTAAGCTCATTATTGATGTAAAAAGTTTCAGACTTTAGCGAGGAATGGAAACTTTCTATCGGGG < 1:926963/149‑1 ttTTATTATTATTATTATTGTTTTTGATGTACTTTTCGACTATATCTATTACAATGTGATTAGAGTGATTAAGCTCATTATTGATGTAAAAAGTTTCAGACTTTAGCGAGGAATGGAAACTTTCTATCGGGGCGTTATCGGCAGGTGTT < 2:1402522/147‑1 ttTTATTATTATTATTATTGTTTTTAATGTACTTTTCGACAATATCTATTACAATGTGATTAGAGTGATTAAGCTCATTATTGATGTAAAAAGTTTCAGACTTTAGCGAGGAATGGAAACTTTCTATCGGGGCGTTATCGGCAGGTGTT < 2:793832/147‑1 tTTATTATTATTTTTTTTAATGTACTTTTCGACAATATCTATTACAATGTGATTAGAGTGATTAAGCTCATTATTGATGTAAAAAGTTTCAGACTTTAACGAGGAATGGAAACTTTCTATCGGGGCGTTATCGGCAGGTGTTCCCTTTC < 1:1563566/148‑1 TATTATTATTGTTTTTAATGTACTTTTCGACAATATCTATTACAATGTGATTAGAGTGATTAAGCTCATTATTGATGTAAAAAGTTTCAGACTTTAGCGAGGAATGGAAACTTTCTATCGGGGCGTTATCGGCAGGTGTTCCCTTTCGG > 2:1596936/1‑149 TTATTATTGTTTTTAATGTACTTTTCGACAATATCTATTACAATGTGATTAGAGTGATTAAGCTCATTATTGATGTAAAAAGTTTCAGACTTTAGCGAGGAATGGAAACTTTCTATCGGGGCGTTATCGGCAGGTGTTCCCTTTCGGGA > 2:657325/1‑149 TATTATTGTTTTTAATGTACTTTTCGACAATATCTATTACAATGTGATTAGAGTGATTAAGCTCATTATTGATGTAAAAAGTTTCAGACTTTAGCGAGGAATGGAAACTTTCTATCGGGGCGTTATCGGCAGGTGTTCCCTTTCGGGAC > 1:318742/1‑149 TATTATTGTTTTTAATGTACTTCTCGACAATATCTATTACAATGTGATTAGAGTGATTAAGCTCATTATTGATGTAAAAAGTTTCAGACTTTAGCGAGGAATGGAAACTTTCTATCGGGGCGTTATCGGCAGGTGTTCCCTTTCGGGAC > 2:1881577/1‑149 tTTATTGTTTTTAATGTACTTTTCGACCTTATCTATTACAATGTGATTAGAGTGATTAAGCTCATTATTGATGTAAAAAGTTTCAGACTTTAGCGAGGAATGGAAACTTTCTATCGGGGCGTTATCGGCAGGTGTTCCCTTTCGGGACA < 2:1818293/148‑1 ATTGTTTTTAATGTACTTTTCGACAATATCTATTACAATGTGATTAGAGTGATTAAGCTCATTATTGATGTAAAAAGTTTCAGACTTTAGCGAGGAATGGAAACTTTCTATCGGGGCGTTATCGGCAGGTGTTCCCTTTCGGGACATAC > 1:529974/1‑149 ATTGTTTTTAATGTACTTTTCGACAATATCTATTACAATGTGATTAGAGTGATTAAGCTCATTATTGATGTAAAAAGTTTCAGACTTTAGCGAGGAATGGAAACTTTCTATCGGGGCGTTATCGGCAGGTGTTCCCTTTCGGGACATAC > 2:1878751/1‑149 ATTGTTTTTAATGTACTTTTCGACAATATCTATTACAATGTGATTAGAGTGATTAAGCTCATTATTGATGTAAAAAGTTTCAGACTTTAGCGAGGAATGGAAACTTTCTATCGGGGCGTTATCGGCAGGTGTTCCCTTTCGGGACATAC > 2:1252173/1‑149 ATTGTTTTTAATGTACTTTTCGACAATATCTATTACAATGTGATTAGAGTGATTAAGCTCATTATTGATGTAAAAAGTTTCAGACTTTAGCGAGGAATGGAAACTTTCTATCGGGGCGTTATCGCCAGGTGTTCCCTTTCGGGACATAC > 2:1252166/1‑149 TGTTTTTAATGTACTTTTCGACAATATCTATTACAATGTGATTAGAGTGATTAAGCTCATTATTGATGTAAAAAGTTTCAGACTTTAGCGAGGAATGGAAACTTTCTATCGGGGCGTTATCGGCAGGTGTTCCCTTTCGGGACATGCTT > 2:435216/1‑149 TGTTTTTAATGTACTTTTCGACAATATCTATTACAATGTGATTAGAGTGATTAAGCTCATTATTGATGTAAAAAGTTTCAGACTTTAGCGAGGAATGGAAACTTTCTATCGGGGCGTTATCGGCAGGTGTTCCCTTTCGGGACATACTT > 2:625301/1‑149 TGTTTTTAATGTACTTTTCGACAATATCTATTACAATGTGATTAGAGTGATTAAGCTCATGATTGATGTAAACAGTTTCAGACTTTAGCGAGGAATGGAAACTTTCTATCGGGGCGTTATCGGCAGGTGTTCCCTTTCGGGACATGCTT > 2:536365/1‑149 TGTTTTTAATGTACTTTTCGACAATATCTATTACAAGGTGGTTAGAGTGATTAAGCCCAAAATTGAAGTAAAAAGTTTCAGACTTTAGCGAGGAATGGAAACTTTTTATCGGGGCGTTATCGGCAGGTGTTCCCTTTCGGGACATACTT > 1:58538/1‑149 TTTAGTTCAATTACCTTTATAAACAAAAGAGCCTATAATCCTAGGGCACTGAACCCTTAAAACGGGAACTTAATAAAAACACCATGTTCTAGGCTATTAATTCTCTGTATTTTACAGGGGATAAGTAGCCTAGTTTTTG‑TTGAATTCGATTATTATTATTATTATT‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ < CP000730/68824‑68659‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑attattattattattattGTTTTTAATGTACTTTTCGACAATATCTATTACAATGTGATTAGAGTGATTAAGCTCATTATTGATGTAAAAAGTTTCAGACTTTAGCGAGGAATGGAAACTTTCTATCGGGGCGTTATCGGCAGGTGTTCCCTTTCGGGACATACTT < CP000730/68655‑68508 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 13 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |