Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A1 F18 I0 R1
|
274 |
115.5 |
2655328 |
86.7% |
2302169 |
226.6 |
Breseq alignment
BRESEQ :: Evidence
|
| evidence |
seq id |
position |
mutation |
freq |
annotation |
gene |
description |
| RA |
NC_000913 |
99,078 |
A→T |
12.6% |
I226F (ATC→TTC) |
ftsW → |
putative lipid II flippase, integral membrane protein, FtsZ ring stabilizer |
|
| |
seq id |
position |
ref |
new |
freq |
score (cons/poly) |
reads |
annotation |
genes |
product |
| * | NC_000913 | 99,078 | 0 | A | T | 12.6%
| 205.4
/ 3.4
| 83 | I226F (ATC→TTC) | ftsW | putative lipid II flippase, integral membrane protein, FtsZ ring stabilizer |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (33/37); new base T (10/2); total (43/40) |
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 2.79e-02 |
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 |
CCAGCCTGCGGAGCTGACAAAACTGTCGCTGTTTTGCTATATCGCCAACTATCTGGTGCGTAAAGGCGACGAAGTACGTAATAACCTGCGCGGCTTCCTGAAACCGATGGGCGTGATTCTGGTGTTGGCAGTGTTACTGCTGGCAC‑AGCCAGACCTTGGTACGGTGGTGGTGTTGTTTGTGACTACGCT‑GGCGATGTTGTTCCTGGCGGGAGCGAAATTGT‑GGCAGTTCATTGCCATTATCGGTATGGGCATTTCAGCGGTTGTG‑TTGC‑TGA‑TACTCGCCGAACCGTACCGTATCCGCC‑GTGTTACCGCATTCTGGAACCCGTGGGAAGA‑TCCCTTTGGCAGCGGCTATCAGTTAACGCAAT‑CGCTG‑ATGGCGTTTGGTCGCGGCGAACTTTGGGGGCAAGGTTTAGGTAACTCGGTACAAAAACTGGAGTATCTGCCGGAAGCGCACACTGACTTTATTTTCGCCATTATCGGCGA > NC_000913/98840‑99316
|
ccagccttgtggtcTGACCAAACTGTCGCTTTTTTGCTATATCGCCAACTATCTGGTGCGTAAAGGCGACGAAGTACGTAATAACCTGCGGGGCTTCCTGAAACCGATGGGCGTGATTCTGGTGTTGGCAGTGTTACTGCTGGCAC‑AGCCAGACCTTGGTACGGTGGTGGTGTTGTTTGTGACTACGCT‑GGCGATGTTGTTCCTGGCGGGAGCGAAATTGT‑GGCAGTTCATTGCCATTa < 1:1307881/226‑1 (MQ=255)
ccgctgggttGACAAAACTGTCTCGTTTTTGCTTATTCGCCAGCTGTCTGGTGCGTAAAGGCTACGAAGGACGTAATAACCTGCGCTGCTTCCTTAAACCGATGGGCGTGATTCTGGTGTTGGCAGTGTTACTGCTGGCAC‑AGCCAGACCTTGGTACGGTGGTGGTGTTGTTTGTGACTACGCT‑GGCGATGTTGTTCCTGGCGGGAGCGAAATTGT‑GGCAGTTCATTGCCATTATCGGt < 1:1052661/230‑1 (MQ=255)
cTGCGGAGCTGACAAAACTGTCGCTGTTTTGCTATATCGCCAACTATCTGGTGCGTAAAGGCGACGAAGTACGTAATAACCTGCGCGGCTTCCTGAAACCGATGGGCGTGATTCTGGTGTTGGCAGTGTTACTGCTGGCAC‑AGCCAGACCTTGGTACGGTGGTGGTGTTGTTTGTGACTACGCT‑GGCGATGTTGTTCCTGGCGGGAGCGAAATTGT‑GGCAGTTCATTGCCATTATCGGt < 2:177148/239‑1 (MQ=255)
aGCTGAAAAAACTGTCCCTGTTTTGCTATATCGCTAACTATCTGGTGCGTAAAGGCGACGAAGTACGTAATAACCTGCGCGGCTTCCTGAAACCGATGGGCGTGATTCTGGTGTTGGCAGTGTTACTGCTGGCAC‑AGCCAGACCTTGGTACGGTGGTGGTGTTGTTTGTGACTACGCT‑GGCGATGTTGTTCCTGGCGGGAGCGAAATTGT‑GGCAGTTCATTGCCATTATCGGTATggg < 2:225993/238‑1 (MQ=255)
aCTGTCGCTGTTTTGCTATATCGCCAACTATCTGGTGCGTAAAGGCGACGAAGTACGTAATAACCTGCGCGGCTTCCTGAAACCGATGGGCGTGATTCTGGTGTTGGCAGTGTTACTGCTGGCAC‑AGCCAGACCTTGGTACGGTGGTGGTGTTGTTTGTGACTACGCT‑GGCGATGTTGTTCCTGGCGGGAGCGAAATTGG‑GGCAGTTCATTGGCATTTTCGGTATGGGCATTTCAGCgg > 2:401607/1‑239 (MQ=255)
tttctttttttttttattTCTCCACCTTTCTGGTGTGTAAAGGCGACGAAGTACGTATTAACCTGGCGGGGTTCCTGAAACCGGTGGGGTTGATTCGGGTGTTGGCAGTGTTCCTGCTGGCAC‑AGCCAGACCTTGGTACGGTGGTGGTGTTGTTTGTGACTACGCT‑GGAGATGTTGTTCCTGGCGGGAGCGAAATTGT‑GGCAGTTCATTGCCATTATCGGTATGGGCATTTCAGCGGtt < 1:499144/225‑1 (MQ=255)
cGCTTTTTTGCTATATCGCCAACTATCTGGTGCGTAAAGGCGACGAAGTACGTAATAACCTGCGCGGCTTCCTGAAGACGATGGGCGTGATTCTGGTGTTGGCAGTGTTACTGCTGGCAC‑AGCCAGTCCTTGGTACGGTGGTGGTGTTGTTTGTGACTACGCT‑GGCGATGTTGTTCCTGGCGGGAGCGAAATTGT‑GGCAGTTCATTGCCATTATCGGTATGGGCATTGCAGCGGTtgtg < 2:1314531/239‑1 (MQ=255)
cGCTGTTTTGCTATATCGCCAACTATCTGGTGCGTAAAGGCGACGAAGTACGTAATAACCTGCGCGGCTTCCTGAAACCGATGGGCGTGATTCTGGTGTTGGCAGTGTTACTGCTGGCAC‑AGCCAGACCTTGGTACGGTGGTGGTGTTGTTTGTGACTACGCT‑GGCGATGTTGTTCCTGGCGGGAGCGAAATTGT‑GGCAGTTCATTTCCCTTATCGGTATGGGCATTTCAGCGGTtgtg > 2:678859/1‑239 (MQ=255)
cGCTGTTTTGCTATATCGCCAACTATCTGGGGCGTAAAGGCGACGAAGGACGTAATACCCTGCGCGGCTTCCTGAAACCGATGGGCGTGATTCTGGTGTTGGCAGTGTTACTGCTGGCAC‑AGCCAGACCTTGGTACGGTGGTGGTGTTGTTTGTGACTACGCT‑GGCGATGTTGTTCCTGGCGGGAGCGAAATTGT‑GGCAGTTCATTGCCATTATCGGTATGGGCATTTCAGCGGTtgtg < 2:1242525/239‑1 (MQ=255)
ttttttttcgccattctttgtgggCGTAAAGGGGTCGAAGGACGTAATACCCTGCGCGGTTTCCTGAACCCGTTGGGCGTGTGTTTGGTGTTGGCAGTGTTACGGTTGGCAC‑AGCCAGACCTTGGTGCGGTGGTGGTGTTGTTTGTGACTACGCT‑GGCGATGTTGTTCCTGGCGGGAGCGAAATTGT‑GGCAGTTCATTGCCATTATCGGTATGGGCATTTCAGCGGTTGTG‑TTGC‑TGA‑t < 1:691799/216‑1 (MQ=255)
ttcttattCGCCCACTATTGGGGGGGTAAAGGCGGCGAGGTTAGTAATAACCTGCGCTGCTTCCTGAAACCGATGGGCGTGATTGTGGTGTTGGCAGTTTTACTGCTGGCAC‑AGCCAGACCTTGGTACGGTGGTGGTGTTGTTTGTGACTACGCT‑GGCGATGTTGTTCCTGGCGGGAGCGAAATTGT‑GGCAGTTCATTGCCATTATCGGTATGGGCATTTCAGCGGTTGTG‑TTGC‑TGA‑t < 1:574458/232‑1 (MQ=255)
tgcttttgcGCCCACTATCGGGTGCGTAAAGGGCACGAAGTACGTAATATCCTGCGCGGCTTCCTGAAACCGAGTGGCGTTATTCTGGTGTTGGCAGTGTTACTGCTGGCCC‑GGCCAGACCTTGGTTCGGTGGTGGTGTTGTTTGTGACTACGCT‑GGCGATGTTGTTCCTGGCGGTAGCGAAATTGT‑GGCAGTTCATTGCCATTATCGGTATGGGCATTTCAGCGGTTGTG‑TTGC‑TGA‑t < 1:968579/231‑1 (MQ=255)
tGCTATTTCGCCAACTATCTGGTGCGTAAAGGCGACGAAGTACGTAATAACCTGCGCGGCTTCCTGAAACCGATGGGCGTGATTCTGGTGTTGGCAGTGTTACTGCTGGCAC‑AGCCAGACCTTGGTACGGTGGTGGTGTTGTTTGTGACTACGCT‑GGCGATGTTGTTCCTGGCGGGAGCGAAATTGT‑GGCAGTTCATTGCCATTATCGGTATGGGCATTTCAGCGGTTGTG‑TTGC‑TGA‑t < 2:502810/239‑1 (MQ=255)
gCTATATCGCCAACTAGCTGGTGCGTAAAGGCGACGAAGTACGTAATAACCTGCGCGGCTTCCTGAAACCGATGGGCGTGATTCTGGTGTTGGCAGTGTTACTGCTGGCAC‑AGCCAGACCTTGGTACGGTGGTGGTGTTGTTTGTGACTACGCT‑GGCGATGTTGTTCCTGGCGGGAGCGAAATTGT‑GGCAGTTCATTGCCATTATCGGTATGGGCATTTCAGCGGTTGTG‑TTGC‑TGA‑Ta < 2:763406/239‑1 (MQ=255)
tatCGTCAACTATCCGGTGGGTAAAGGGGACGGAGGACGTAATGACCTGGGCGGCTTCCTGAACCCGATGGGCGTGATTCTGGTGTTGGCAGTGTTACTGCTGGCAC‑AGCCAGACCTTGGTACGGTGGTGGTGTTGTTTGTGACTACGCT‑GGCGATGTTGTTCCTGGCGGGAGCGAAATTGT‑GGCAGTTCATTGCCATTATCGGTATGGGCATTTCAGCGGTTGTG‑TTGC‑TGA‑TACTCg < 2:533541/239‑1 (MQ=255)
tCGCCAACTATCTGGTGCGTAAAGGCGACGAAGTACGTAATAACCTGCGCGGCTTCCTGAAACCGATGGGCGTGATTCTGGTGTTGGCAGTGTTACTGCTGGCAC‑AGCCAGACCTTGGTACGGTGGTGGTGTTGTTTGTGACTACGCT‑GGCGATGTTGTTCCTGGCGGGAGCGAAATTGT‑GGCAGTTCATTGCCATTATCGGTATGGGCATTTCAGCGGTTGTG‑TTGC‑TGA‑TATTCGcc > 2:170759/1‑239 (MQ=255)
aaCTATCTGGTGCGTAAAGGCGACGAAGTACGTAATAACCTGCGCGGCTTCCTGAAACCGATGGGCGTGATTCTGGTGTTGGCAGTGTTACTGCTGGCAC‑AGCCAGACCTTGGTACGGTGGTGGTGTTGTTTGTGACTACGCT‑GGCGATGTTGTTCCTGGCGGGAGCGAAATTGT‑GGCAGTTCATTGCCATTATCGGTCTGGGCATTTCACCGGTTGGG‑TTGC‑TGT‑AACTCTCCGAccc > 2:758206/1‑239 (MQ=255)
tttcaggTGCGTAAAGGCGACGAATGTGGGAGTAACGGGGCCGGTTTCCTGAAACCGGTGGGCGGGATTCTGGTGTTGGCAGTGTTACTGACGGCAT‑AGGCAGTCTGTGGTACGGTGGTGGTGTTGTTTGGGACTACGCT‑GGAGATGTTGTTCCTGGCGGGAGCGAAATTGT‑GGCAGTTCATTGCCATTATCGGTATGGGCATTTCAGCGGTTGTG‑TTGC‑TGA‑TACTCGCCGAaccgta < 1:1084599/234‑1 (MQ=255)
cGTAAAGGCGACGAAGTACGTAATAACCTGCGCGGCTTCCTGAAACCGATGGGCGTGATTCTGGTGTTGGCAGTGTTACTGCTGGCAC‑AGCCAGACCTTGGTACGGTGGTGGTGTTGTTTGTGACTACGCT‑GGCGATGTTGTTCCTGGCGGGAGCGACATTGT‑GGCAGTTCATTGCCATTATCGGTATGGGGATTTCAGCGGTTGTG‑GTGC‑TGT‑TACTCGCCGAACCGTACCGTATcc > 2:1168916/1‑238 (MQ=255)
cGTAAAGGCGACGAAGTACGTAATAACCTGCGCGGCTTCCTGAAACCGATGGGCGTGATTCTGGTGTTGGCAGTGTTACTGCTGGCAC‑AGCCAGACCTTGGTACGGTGGTGGTGTTGTTTGTGACTACGCT‑GGCGATGTTGTTCCTGGCGGGAGCGAAATTGT‑GGCAGTTCATTGCCATTATCGGTATGGGCATTTCAGCGGTTGGG‑TTGC‑TGG‑AAATCCCCGAacctgaccggttcc > 2:351861/1‑233 (MQ=255)
cGTAAAGGCGACGAAGTACGTAATAACCTGCGCGGCTTCCTGAAACCGATGGGCGTGATTCTGGTGTTGGCAGTGTTACTGCTGGCAC‑AGCCAGACCTTGGTACGGTGGTGGTGTTGTTTGTGACTACGCT‑GGCGATGTTGTTCCTGGCGGGAGCGAAATTGG‑GGCAGTTCATTGCCATTATCGGTATGGGCATTTCAGCGGTTGTG‑TTGC‑TGG‑TCATCGCCGAACCGTACCGTATcc > 2:658946/1‑238 (MQ=255)
cGTAAAGGCGACGAAGTACGTAATAACCTGCGCGGCTTCCTGAAACCGATGGGCGTGATTCTGGTGTTGGCAGTGTTACTGCTGGCAC‑AGCCAGACCTTGGTACGGTGGTGGTGTTGTTTGGGCCTACGCT‑GGCGATGTTGTTCCTGGCGGGGGCGGAATTGT‑GGCAGTTCATTGTCCTTTTCGGTAGGGGCGTTTCTCCGGGAGTG‑GTGC‑GGC‑TAACCGCCTAAACGGAACGAATccg > 1:77993/1‑239 (MQ=255)
gTAAAGGCGACGAAGTACGTAATAACCTGCGCGGCTTCCTGAAACCGATGGGCGTGATTCTGGTGTTGGCAGTGTTACTGCTGGCAC‑AGCCAGACCTTGGTACGGTGGTGGTGTTGTTTGTGACTACGCT‑GGCGATGTTGTTCCTGGCGGGAGCGAAATTGT‑GGCAGTTCATTGCCATTATCGGTATGGGCCTTTCAACGGTTGTG‑TTGC‑TGA‑TACTCGCCCAACCGTACCGTAcccc > 2:388330/1‑237 (MQ=255)
aaaGGCGACGAAGTACGTAATAACCTGCGCGGCTTCCTGAAACCGATGGGCGTGATTCTGGTGTTGGCAGTGTTACTGCTGGCAC‑AGCCAGACCTTGGTACGGTGGTGGTGTTGTTTGTGACTACGCT‑GGCGATGTTGTTCCTGGCGGGAGCGAAATTGT‑GGCAGTTCATTGCCATTATCGGGATGGGCATTTCAGCGGTTGGG‑TTGC‑TAG‑TACTCGCCGGACCGTACCCAATccgccc > 2:738595/1‑238 (MQ=255)
acgaAGTACGTAATAACCTGCGCGGCTTCCTGAAACCGATGGGCGTGATTCTGGTGTTGGCAGTGTTACTGCTGGCAC‑AGCCAGACCTTGGTACGGTGGTGGTGTTGTTTGTGACTACGCT‑GGCGATGTTGTTCCTGGCGGGAGCGAAATTGT‑GGCAGTTCATTGCCATTATCGGTATGGGCATTTCAGCGGTTGTG‑TTGC‑TGA‑TACTCGCCTAACCGTACCCTTTCCCCC‑GTGTTAc > 2:118560/1‑238 (MQ=255)
acgaAGTACGTAATAACCTGCGCGGCTTCCTGAAACCGATGGGCGTGATTCTGGTGTTGGCAGTGTTACTGCTGGCAC‑AGCCAGACCTTGGTACGGTGGTGGTGTTGTTTGTGACTACGCT‑GGCGATGTTGTTCCTGGCGGGAGCGAAATTGT‑GGCAGTTCATTGCCATTATCGGTATGGGCATTTCAGCGGTTGGG‑TTGC‑TGG‑TACTCGCCGAACCGGACCGTATCCGCC‑CGGTTAc > 2:1226942/1‑238 (MQ=255)
acgaAGTACGTAATAACCTGCGCGGCTTCCTGAAACCGATGGGCGTGATTCTGGTGCTGGCAGTGTTACTGCTGGCAC‑AGCCAGACCTTGGTACGGTGGTGGTGTTGTTTGTGACTACGCT‑GGCGATGTTGTTCCTGGCGGGAGCGAAATTGT‑GGCAGTTCATTGCCATTTTCGGGCTGGGCATTTCAGCGGTTTGG‑TTGG‑TGG‑TATCCGCCCAACCGTACCGTTtcctcccggtttc > 2:1138220/1‑231 (MQ=255)
tttttatccTGCGGGGTTTCTTGAACCCGAGGGGCGTGATTGTGGTGTTGGCAGTGTTAGGGCGGGCCC‑AGCCAGTCCTGGGTACGGGGGTGGTGTTGTTTGTGACTACGCG‑GGCGATTTTGTTCCTGGCGGGAGCGAAATTGT‑GGCAGTTCATTGCCATTATCGGTATGGGCATTTCAGCGGTTGTG‑TTGC‑TGA‑TACTCGCCGAACCGTACCGTATCCGCC‑GTGTTACCGCATTCTgg < 1:351861/232‑1 (MQ=255)
gTAATAACCTGCGCGGTTTCCTGAAACCGATGGGCGTGATTCTGGTGTTGGCAGTTTTACTGCTGGCAC‑AGCCAGACCTTGGTACGGTGGTGGTGTTGTTTGTGACTACGCT‑GGCGATGTTGTTCCTGGCGGGAGCGAAATTGT‑GGCAGTTCATTGCCATTATCGGTATGGGCATTTCAGCGGTTGTG‑TTGC‑TGA‑TACTCGCCGAACCGTACCGTATCCGCC‑GTGTTACCGCATTCTgg < 2:1067317/239‑1 (MQ=255)
attgccgtgggggCTCCCTGACACCGGTGGGGTTGATTTTGGTGTGGGCGGTTGTGC‑GTGGGGACAAGGCAGACCGTGGTTGGGTGGTGGTGTTGTTTGTGACTACGCG‑TGAGAGGTTGTGCCTGGCGGGAGGGAAATTGG‑GGCAGTTCATTGCCTTTAACGGTATGGGTATTTCAGCGGTTGTG‑TTGC‑TGA‑TACTCGCCGAACCGTACCGTATCCGCC‑GTGTTACCGCATTCTGGaa < 1:1089971/227‑1 (MQ=255)
atacCCTGCGCGGCTTCCTGAAACCGATGGTGGTGATTCGGGTGTGGGCAGTGTTACTGCTGGCAC‑AGCCAGACCTTGGTACGGTGGTGGTGTTGTTTGTGACTACGCT‑GGCGATGTTGTTCCTGGCGGGAGCGAAATTGT‑GGCAGTTCATTGCCATTATCGGTATGGGCATTTCAGCGGTTGTG‑TTGC‑TGA‑TACTCGCCGAACCGTACCGTATCCGCC‑GTGTTACCGCATTCTGGAAc < 2:173203/239‑1 (MQ=255)
ccTGCGCGGCTTCCTGAAACCGATGGGCGTGATTCTGGTGTTGGCAGTGTTACTGCTGGCAC‑AGCCAGACCTTGGTATGGTGGTGGTGTTGTTTGTGACTACGCT‑GGCGATGTTGTTCCTGGCGGGAGCGAAATTGT‑GGCAGTTCATTGCCATTATCGGTATGGGCATTTTAGCGGTTGCG‑TTGC‑TGA‑TACTCGCCGAACCGTACCGTATTCGCC‑GTGTTACAGCATTCTGGGACCCGt > 2:1181194/1‑239 (MQ=255)
ccTGCGCGGCTTCCTGAAACCGATGGGCGTGATTCTGGTGTTGGCAGTGTTACTGCTGGCAC‑AGCCAGACCTTGGTACGGTGGTGGTGTTGTTTGTGACTACGCT‑GGCGATGTTGTTCCTGGCGGGAGCGAAATTGT‑GGCAGTTCATTGCCATTATCGGTATGGGCATTTCAg < 1:1011773/173‑1 (MQ=255)
ccTGCGCGGCTTCCTGAAACCGATGGGCGTGATTCTGGTGTTGGCAGTGTTACTGCTGGCAC‑AGCCAGACCTTGGTACGGTGGTGGTGTTGTTTGTGACTACGCT‑GGCGATGTTGTTCCTGGCGGGAGCGAAATTGT‑GGCAGTTCATTGCCATTATCGGTATGGGCATTTCAg > 2:1011773/1‑173 (MQ=255)
ccTGCGCGGCTTCCTGAAACCGATGGGCGTGATTCTGGTGTTGGCAGTGTTACTGCTGGCAC‑AGCCAGACCTTGGTACGGCGGTGGCGTTGTTTGTGCCTACGCT‑GGCGATGTTTTTCCTGGCGGGAGCGGAATTTG‑GGCAGGTCATTGCCCTATACGGAATGGGCGTTTCCGGCGTTGGG‑TGTG‑TGATTATTCTCC‑AACCACACCGTTACCGCCGGTGTTCCCGCTTTTTGGAAcccc > 1:1035573/1‑238 (MQ=255)
tGCGCGGCTTCCTGAAACCGATGGGCGTGATTCTGGTGTTGGCAGTGTTACTGCTGGCAC‑AGCCAGACCTTGGTACGGTGGTGGTGTTGTTTGTGACTACGCT‑GGCGATGTTGTTCCTGGCGGGAGCGAAATTGT‑GGCAGTTCATTGCCATTATCGGTATGGGCATTTCAGGGGTTGTG‑TTGC‑TGG‑TAATCGCCGAACCGGACCGGATCCGCC‑GTGTTTCCGCCTTCTGGAAccccgtg > 2:1164428/1‑235 (MQ=255)
tGCGCGGCTTCCTGAAACCGATGGGCGTGATTCTGGTGTTGGCAGTGTTACTGCTGGCAC‑AGCCAGACCTTGGTACGGTGGTGGTGTTGTTTGTGACTACGCT‑GGCGATGTTGTTCCTGGCGGGAGCGAAATTGT‑GGCAGTTCATTGCCATTATCGGTATGGGCATTTCAGCGGTTGTG‑TTGC‑TGA‑TACTCGCCGGAACGGACCGGATCCCGC‑GTGTTACCGCATTCTGGAACCCGttg > 2:509870/1‑237 (MQ=255)
cgcgGCTTCCTGAAACCGATGGGCGTGATTCTGGTGTTGGCAGTGTTACTGCTGGCAC‑AGCCAGACCTTGGTACGGTGGTGGTGTTGTTTGTGACTACGCT‑GGCGATGTTGTTCCTGGCGGGAGGGAAATTGT‑GGCAGTTCATTGCCCTTATCGGTATGGGCATTTCAGCGGTTGGG‑TTGC‑TGT‑TACTCGCCGAAACGTACCGGCTCCCCC‑GTGTTTCCCCAATCTGGAAACCCTgggc > 2:28514/1‑238 (MQ=255)
cgcgGCTTCCTGAAACCGATGGGCGTGATTCTGGTGTTGGCAGTGTTACTGCTGGCAC‑AGCCAGACCTTGGTACGGTGGTGGTGTTGTTTGTGACTACGCT‑GGCGATGTTGTTCCTGGCGGGAGCGAAATTGT‑GGCAGTTCATTGCCCTTTTCGGTATGGGCATTTCAGCGGTTGTG‑TTGC‑TGA‑TACTCGCCGAACCGTACCGTATCCCCC‑GTGTTACGCCATTCTGGAACCCGCGGGa > 2:52858/1‑239 (MQ=255)
cgcgGCTTCCTGAAACCGATGGGCGTGATTCTGGTGTTGGCAGTGTTACTGCTGGCAC‑AGCCAGACCTTGGTACGGTGGTGGTGTTGTTTGTGACTACGCT‑GGCGATGTTGTTCCTGGCGGGAGCGAAATTGT‑GGCAGTTCATTGCCATTATCGGTATGGGCATTTCAGCGGTTGTG‑TTGC‑TGA‑TACTCGCCGAACCGTACCGTATCCGCC‑GTGTTACCGCATTTTGGAACCCCTGGGa > 2:384702/1‑239 (MQ=255)
gggCTTCCTGAATCCTGTGGGGGTGTTTCTGGTGTTGGGGGGTTTACTGCTGGCCC‑AGCCTGACCTTGGTTGGGTGGTGGTGTTGTTTGTGACTCCGCT‑GGCGATGTTGTTCCTGGCGGGAGCGAAATTGT‑GGCAGTTCATTGCCATTATCGGTATGGGCATTTCAGCGGTTGTG‑TTGC‑TGA‑TACTCGCCGAACCGTACCGTATCCGCC‑GTGTTACCGCATTCTGGAACCCGTGGGAAg < 1:909605/238‑1 (MQ=255)
tgCTTCCTGAATCCGAGGGGCGTGATTCTGGTGTTTGCAGTTTTACTGCTGGCAC‑AGCCAGACCTTGGTACGGTGGTGGTGTTGTTTGTGCCTACGCT‑GGCGATGTTGTTCCTGGCGGGAGCGAAATTGT‑GGCAGTTCATTGCCATTATCGGTATGGGCATTTCAGCGGTTGTG‑TTGC‑TGA‑TACTCGCCGAACCGTACCGTATCCGCC‑GTGTTACCGCATTCTGGAACCCGTGGGAAg < 2:715954/237‑1 (MQ=255)
ggtttCCTGAAACCGATGGGCGTGATTCTGGTGTTGGCAGTGTTACTGCTGGCAC‑AGCCAGACCTTGGTACGGTGGTGGTGTTGTTTGGGACTACGCT‑GGCGATGTTGTTCCTGGCGGGAGCGAAATTGT‑GGCAGTTCATTGCCATTATCGGTATGGGCATTTCAGCGGTTGTG‑TTGC‑TGA‑TACTCGCCGAACCGTACCGTATCCGCC‑GTGTTACCGCATTCTGGAACCCGTGGGAAg < 2:550798/235‑1 (MQ=255)
ggCTTCCTGAAACCGAGGGGCGTGATTCGGGTGTAGGCAGTGTTACTGCTGGCAC‑AGCCAGACCTTGGTACGGTGGTGGTGTTGTTTGTGACTACGCT‑GGCGATGTTGTTCCTGGCGGGAGCGAAATTGT‑GGCAGTTCATTGCCATTATCGGTATGGGCATTTCAGCGGTTGTG‑TTGC‑TGA‑TACTCGCCGAACCGTACCGTATCCGCC‑GTGTTACCGCATTCTGGAACCCGTGGGAAg < 2:897546/238‑1 (MQ=255)
cTTCCTGAAACCGATGGGCGTGATTCTGGTGTTGGCAGTGTTACTGCTGGCAC‑AGCCAGACCTTGGTACGGTGGTGGTGTTGTTTGTGACTACGCT‑GGCGATGTTGTTCCTGGCGGGAGCGAAATTGT‑GGCAGTTCATTGCCATTTTCGGTATGGGCCTTTCAGCGGTTGTG‑TTGC‑TGA‑TACTCGCCGAACCGTACCGTATCCGCC‑GTGTTTCCGCCTTTTGGATCCCGTGGGCAGA‑t > 2:505810/1‑238 (MQ=255)
accggggggggtgtttggggTGTTGGGTGGGTTCCTGGTGGCAA‑GGCCGGTCCTGGGTACGGGGGTGGGGTTGTTTGGGACTGCGCT‑GGGGAGGTGGTTCCTGGGGGGAGCGAAATTGT‑GGAAGTTCATTGCCATTTTCGGTATGGGCAGTTCAGCGGTTGTG‑TTGC‑TGA‑TACGCGCCGAACCGTACCGTATCCGCC‑GTGTTACCGCATTCTGGAACCCGTGGGAAGA‑TCCCTTTGGCa < 1:555250/221‑1 (MQ=255)
cGATGGGCGTGATTCTGGTGTTGGCAGTGTTACTGCTGGCAC‑AGCCAGACCTTGGTACGGTGGTGGTGTTGTTTGTGACTACGCT‑GGCGATGTTGTTCCTGGCGGGAGCGAAATTGT‑GGCAGTTCATTGCCATTATCGGTATGGGCATTTCAGCGGTTGTG‑TTGC‑TGA‑TACTCGCCGAACCGTACCGTATCCGCC‑GTGTTACCGCATTCTGGAACCCGTGGGAAGA‑TCCCTTTGGCAGc < 2:1161637/239‑1 (MQ=255)
tttGGTGTTGGACGTTTTCCGGTGGGCAC‑AGCCGGGCGTTGGTGGGTGGGGGGTGTTGTGGGGGCCCAGGCT‑GGCGATGTTGTTCCTGGGGGGGGGGAAGTGGG‑GGAGGTTCATTGCCATTATCGGTATGGGCATTGCAGGGGTTGTG‑TTGC‑TGA‑TACTCGCCGAACCGTACCGTCTCCGCC‑GTGTTACCGCATTCTGGAACCCGTGGGAAGA‑TCCCTTTGGCAGCGGCTATCAGTTa < 1:1138220/236‑1 (MQ=255)
ggtttgggtttttttgtgctgGCCC‑GGCCATGCTTTGGGTCGGGGGGTGTTTTGTTTGGGGTTTGGCT‑GGCGAGGTTGTTCCGGGGGGGAGCGAAATTGT‑GGCATTTCATTGCCATTATCGGTATGGGCATTTCAGCGGTTGTG‑TTGC‑TGA‑TACTCGACGAACCGTACCGTATCCGCC‑GTGTTACCGCATTCTGGAACCCGTGGGAAGA‑TCCCTTTGGCAGCGGCTATCAGTTAACGCa < 1:118560/223‑1 (MQ=255)
ggCAGTGTTACTGCTGGCAC‑AGCCAGACCTTGGTACGGTGGTGGTGTTGTTTGTGACTACGCT‑GGCGATGTTGTTCCTGGCGGGAGCGAAATTGT‑GGCAGTTCATTGCCATTTTCGGTATGGGCATTTCAACGGTTGTG‑TTGC‑TGA‑TATTCGCCGAACCGTACCGGATCCGCC‑CTGTTACCGCCTTTTTGAACCCGTTGGCAGA‑TCCCTTTGCACGCGGCTATCCGTTTACGAAAT‑c > 2:801078/1‑237 (MQ=255)
ggCAGTGTTACTGCTGGCAC‑AGCCAGACCTTGGTACGGTGGTGGTGTTGTTTGTGACTACGCT‑GGCGATGTTGTTCCTGGCGGGAGCGAAATTGT‑GGCAGTTCATTGCCATTATCGGTATGGGCATTTCCGCGGTTGTG‑TTGC‑TGG‑TACTCGCCGAACCGTACCGTATCCGCC‑TGGTTACCGCATTCTGGAACCCGTGGGAAGA‑TCCCTTTGGCAGCGGCCTTCAGTTAACGCAAT‑CGc > 2:922988/1‑239 (MQ=255)
ggCAC‑AGCCAGACCTTGGTACGGTGGTGGTGTTGTTTGTGACTACGCT‑GGCGATGTTGTTCCTGGCGGGAGCGAAATTGT‑GGCAGTTCATTGCCATTATCGGTATGGGCATTTCAGCGGTTGTG‑TTGC‑TGA‑TACTCGCCGAACCGTACCGTATCCGCC‑GTGTTACCGCATTCTGGAACCCGTGGGAAGA‑TCCCTTTGGCAGCGGCTATCAGTTAACGCAAT‑CGCTG‑TTGGCGTTTGGTc > 2:487913/1‑239 (MQ=255)
tgccccgcgggtcttttgtcgggtggtggtTTTTTTTGTGACTACGCT‑GGCGATGTTGTTCCGGGCGGGAGCGAAATTGT‑GGCAGTTCATTGCCATTATCGGTATGGGCATTTCAGCGGTTGTG‑TTGC‑TGA‑TACTCGCCGAACCGTACCGTATCCGCC‑GTGTTACCGCATTCTGGAACCCGTGGGAAGA‑TCCCTTTGGCAGCGGCTATCAGTTAACGCAAT‑CGCTG‑ATGGCGTTTGGTc < 1:487913/218‑1 (MQ=255)
cAGACCTTGGTACGGTGGTGGTTTTGTTTGTGACTACGCT‑GGCGATGTTGTTCCTGGCGGGAGCGAAATTGT‑GGCAGTTCATTGCCATTATCGGTATGGGCATTTCAGCGGTTGTG‑TTGC‑TGA‑TACTCGCCGAACCGTACCGTATCCGCC‑GTGTTACCGCATTCTGGAACCCGTGGGAAGA‑TCCCTTTGGCAGCGGCTATCAGTTAACGCAAT‑CGCTG‑ATGGCGTTTGGTCgcggcg < 2:1183945/237‑1 (MQ=255)
gtggggggggggtgTTG‑TGGTGACGTCGTT‑GGCGATTTTGTGCC‑GGGGGGGGCGAAATTTTGGGCAGTTCATTGCCATTACGGGTATGGGCAGTTCGGGGGTTGTG‑TTCG‑GGA‑TACTCGCCGAACCGTACCGTTTCCGCC‑GTGTTACCGCATTCTGGAACCCGTGGGAAGA‑TCCCTTTGGCAGCGGCTATCAGTTAACGCAAT‑CGCTG‑ATGGCGTTTGGTCGCGGCGAACTTTGGGGGc < 1:758206/229‑1 (MQ=255)
gTACGGTGGTGGTGTTGTTTGTGACTACGCT‑GGCGATGTTGTTCCTGGCGGGAGCGAAATTGT‑GGCAGTTCCTTGCCATTATCGGTATGGGCCTTTCCGCGGTTGTG‑TTGC‑TGA‑TACTCGCCGAACCGTACCGGTTCCCCC‑GGGTTACCGCCTTCTGGAAACCCTGGGGAGA‑TCCCTTTGGCCGCGGCTTTCAGTTACACCAAT‑CGCTGCAGGGGGTTGGGTCG‑GGCGCACTTTggggg > 1:286694/1‑239 (MQ=255)
gTACGGTGGTGGTGTTGTTTGTGACTACGCT‑GGCGATGTTGTTCCTGGCGGGAGCGAAATTGT‑GGCAGTTCATTGCCATTATCGGTATGGGCATTTCAGCGGTTGTG‑TTGC‑TGA‑TACTCGCCGAACCGTACCGTATCCGCC‑GTGTTACCGCATTCTGGAACCCGTGGGAAGA‑TCCCTTTGGCAGCGGCTATCAGTTAACGCAAA‑CGCTG‑ATGGCGTTTGGTCGCGGCGGACTTTggggg > 2:761204/1‑239 (MQ=255)
gTACGGTGGTGGTGTTGTTTGTGACTACGCT‑GGCGATGTTGTTCCTGGCGGGAGCGAAATTGT‑GGAAGTTCCTTGCCATTTTCGGGATGGGGGATTCAGCGGGTTGG‑TTGCGTGA‑TATTC‑CCGAACCGGAACGGAGTCTCC‑GTGTTTACGGCTTCTGGAACCCATGGGGAGA‑ACACTTTGTCCTGGGGTATCCGTGAACGCAAC‑AGCAG‑ATGGCGTTTGTTGGGGGGGAACATTggggg > 1:654271/1‑239 (MQ=255)
tagggtggtggtGTTGTTTGGGACGTCGCT‑GGCGATGTTGTTCCTGGCGGGAGGGAAATTGT‑GGAAGTTCATTGCCATTATCGGTATGGGCATTTCAGCGGTTGTG‑TTGC‑TGA‑TACTCGCCGAACCGTACCGTATCCGCC‑GTGTTACCGCATTCTGGAACCCGTGGGAAGA‑TCCCTTTGGCAGCGGCTATCAGTTAACGCAAT‑CGCTG‑ATGGCGTTTGGTCGCGGCGAACTTTGGGGGc < 2:77993/236‑1 (MQ=255)
gtgggtggtggtGTTTTTTGGGCCTACGGT‑GGCGATGTTGTTCCTGGCGGGAGCGAAATTGT‑GGCAGTTCATTGCCATTATCGGTATGGGCATTTCAGCGGTTTTG‑TTGC‑TGA‑TACTCGCCGAACCGTACCGTATCCGCC‑GTGTTACCGCATTCTGGAACCCGTGGGAAGA‑TCCCTTTGGCAGCGGCTATCAGTTAACGCAAT‑CGCTG‑ATGGCGTTTGGTCGCGGCGAACTTTGGGGGc < 2:627477/236‑1 (MQ=255)
agtgttgtggttTTGTTTGGGACTTCTGT‑GGCTGGTTTGTTCCTGGGGGGGGCTAAATTGT‑GGCAGTTTATTCCCATCATGTGTTAGGGCATTTCAGCGGTTTTG‑TTGC‑TGA‑TACTCGCCGAACCTTACCGTTTCCGCC‑GTGTTACCGCATTCTGGAACCCGTGGGAAGA‑TCCCTTTGGCAGCGGCTATCAGTTAACGCAAT‑CGCTG‑ATGGCGTTTGGTCGCGGCGAACTTTGGGGGc < 1:1181194/232‑1 (MQ=255)
ggggggtggtgTTTTTTGTGTCTTCGGTGGGCGGT‑TTTTGTCTGGGGGGGGCGAAATTTG‑GGCGGTTCATTGCCATTATCTGTTGGGGCATTTCAGCGGTTGGG‑TTGC‑TGA‑TACTCGCCGAACCGTACCGTATCCGCC‑GTGTTACCGCATTCTGGAACCCGTGGGAAGA‑TCCCTTTGGCAGCGGCTATCAGTTAACGCAAT‑CGCTG‑ATGGCGTTTGGTTGCGGCGAACTTTGGGGGCa < 1:384702/234‑1 (MQ=255)
tgttgtgtTGTTTGGGCCTGCTGG‑GGCGTTTTTGTTCCTGGGGGGAACGAAATTTT‑GGCAGTTCATTCCCATTATCGGTTTGGTCTTTTCAGGGGTTGTG‑TTGC‑TGA‑TACTCGCCGAACCGTCCCGTATCCGCC‑GTGTTACCGCATTCTGGAACCCGTGGGAAGA‑TCCCTTTGGCAGCGGCTATCAGTTAACGCAAT‑CGCTG‑ATGGCGTTTGGTCGCGGCGAACTTTGGGGGCAAGGt < 1:838004/234‑1 (MQ=255)
ggtggtgTTGTTTGTGACTACGCT‑GGCGATGTTGTTCCTGGCGGGAGCGAAATTGT‑GGCAGTTCATTGCCATTTTCGGTATGGGCATTTCCGCGGTTGTG‑TTGC‑TGG‑TACTCGCCGAACCGTACCGTATCCGCC‑GTGTTACCTCATTCTGGAACCCCTGGGAAGA‑TCCCTTTGGCAGCGGCTATCCGTTTACGCAATCCGCGG‑TGGGTGTTT‑GTCGCGGCGAGATTTGGGGGCAAgggt > 1:1112937/1‑237 (MQ=255)
gtgtTGTTTGTGACTACGCT‑GGCGATGTTGTTCCTGGCGGGAGCGAAATTGT‑GGCAGTTCATTGCCATTATCGGTATGGGCATTTCAGCGGTTGGG‑TTGC‑TGA‑TACTCGCCGAACCGTACCGTATCCGCC‑GTGTTACCGCATTCTGGAACCCGTGGGAAGA‑TCCCTTTGGCAGCGGCTATCAGTTAACGCAAT‑TGCTG‑ATGGCGGTTGGTCGCGGCGAACTTTGGGGGCAAGGTTTAgg > 2:1262348/1‑239 (MQ=255)
gtgtTGTTTGTGACTACGCT‑GGCGATGTTGTTCCTGGCGGGAGCGAAATTGT‑GGCAGTTCATTGCCATTATCGGGATGGGCATTTCAGCGGTTGGG‑TTGC‑TGA‑TACTCGCCGAACCGTACCGTATCCGCC‑GTGTTACCGCATTCTGGGACCCGTGGGAAGA‑TCCCTTTGGCAGCGGCTATCAGTTAACGCAAT‑CGCTG‑ATGGCGTTTGGGCGCGGGGGCATTTGGGGGCAAGGGTTggg > 2:275932/1‑239 (MQ=255)
gtttgtGACTACGCT‑GGCGATGTTGTTCCTGGCGGGAGCGAAATTGT‑GGCAGTTCATTGCCATTTTTGGTATGGGCCTTTGAGCGGTTGTT‑GTGC‑TGA‑TACTCGCCGAACCGTACCGTATCCCCC‑GCGTTCCCCCCTTTTGGAAACTCTGGGAAGA‑TCCCCTTGGGAGCGGCTATCCGTTAAGCAAAT‑CGCTG‑ATGGCGTTTTGGCTGGGGGACATTTGGGGGCAAAGTTTAgcaaatc > 1:333855/1‑233 (MQ=255)
ttgtGACTACGCT‑GGCGATGTTGGTCCTGGCGGGAGCGAAATTGT‑GGCAGTTCATTGCCATTATCGGGATGGGCCATTCAGCGGTTGGG‑TTGC‑TGA‑TAATCGCCGAACCGTACCGGATCCCAC‑GGGTTTCCCGCTTCTTGAACCCCTCGGAAAACTCCCTTTGCCA‑CGGCCTACATGTTACGCAAC‑CCCTG‑GTTGGGTTTGTGTGCGGGGAAATTTgggggaaggggttgaggcacatg > 1:921021/1‑221 (MQ=255)
gACTACGCT‑GGCGATGTTGTTCCTGGCGGGAGCGAAATTGT‑GGCAGTTCATTGCCATTATCGGTATGGGCATTTCAGCGGTTGGG‑TTGC‑TGA‑TACTCGCCGAACCGTACCGTATCCGCC‑GTGTTACCGCATTCTGGAACCCGTGGGAAGA‑TCCCTTTGGCAGCGGCTATCAGTTAACGCAAT‑CGCTG‑ATGGCGTTTGGTCGCGGCGAACTTTGGGGGCAAGGTTTAGGTAACTCGGTAc > 2:1105652/1‑239 (MQ=255)
gCGATGTTGTTCCTGGCGGGAGCGAAATTGT‑TGCAGTTCATTGCCATTATCGGTATGGGCATTTCAGCGGTtg > 1:517015/1‑73 (MQ=255)
gCGATGTTGTTCCTGGCGGGAGCGAAATTGT‑GGCAGTTCATTGCCATTATCGGTATGGGCATTTCAGCGGTtg < 2:517015/73‑1 (MQ=255)
cGATGTTGTTCCTGGCGGGAGCGAAATTGT‑GGCAGTTCATTGCCATTATCGGTATGGGCATTTCAGCGGTTGTG‑TTGC‑TGA‑TACTCGCCGAACCGTACCGTATCCGCC‑GTGTTACCGCACTCTGGAACCCGTGGGAAGA‑TCCCTTTGGCAGCGGCTATCAGTTAACGCAAT‑CGCTG‑ATGGCGTTTGGTCGCGGCGAACTTTGGGGGCAAGGTTTAGGTAACCCGGTACAAAAAATgggg > 2:1282303/1‑237 (MQ=255)
ttttttttcgggggggggGCGAAATTGT‑GGAAGTTCATTGCCATTATCGGTATGGGCGTTCCAGGGGTTGTG‑TTCC‑TGA‑TACTCGCCGACCCGTACCGTATCCGCC‑GTGTTACCGCATTCTGGAACCCGTGGGAAGA‑GCCCGTTGGCAGCGGCTATCAGTTAACGCAAT‑CGCTG‑ATGGCGTTTGGTCGCGGCGAACTTTGGGGGCAAGGTTTAGGTAACTCGGTACAAAAACTGGAGTa < 1:761204/225‑1 (MQ=255)
tCCTGGCGGGAGCGAAATTGT‑GGCAGTTCATTGCCATTATCGGTATGGGCATTTCAGCGGTTGTG‑TTGC‑TGA‑TACTCGCCGAACCGTACCGTATCCGCC‑GTGTTACCGCATTCTGGAACCCGTGGGAAGA‑TCCCTTTGGCAGCGGCTATCAGTTAACGCAAT‑CGCTG‑GTGGCGTTTGGTCGCGGCGGACTTTTGGGGCAAGGTTTAGGTAATCCGGACCAAAAACTGGAggtacttccg > 2:1012238/1‑230 (MQ=255)
tCCTGGCGGGAGCGAAATTGT‑GGCAGTTCATTGCCATTATCGGTATGGGCATTTCAGCGGTTGTG‑TTGC‑TGA‑TACTCGCCGAACCGTACCGTATCCGCC‑GTGTTACCGCATTCTGGAACCCGTGGGAAGA‑TCCCTTTGGCAGCGGCTATCAGTTAACGCAAT‑CGCTG‑ATGGCGTTTGGTCGCGGCGAACTTTGGGGGCAAGGTTTAg > 2:882799/1‑207 (MQ=255)
ggCGGGAGCGAAATTGT‑GGCAGTTCATTGCCATTATCGGTCTGGGCATTTCAGCGGTTGTG‑TTGC‑TTA‑TACTCGCCGAACAGGACCGCATCCGCC‑GGGTTTCCGCATTCTGGAACCCGTTGGCAGA‑TCCCTTTGGCAGGGGCGCTCAGTTAACGCAAA‑CCTTG‑ATGGCGTTTGGTCGCGGCGCACTTTGGGTGAGTGGATTGGGTAACCCGGTCTAAAAAccgacgaatttgcggggag > 1:1081465/1‑221 (MQ=255)
aGCGAAATTGT‑GGCAGTTCATTGCCATTATCGGTATGGGCATTTCAGCGGTTGTG‑TTGC‑TGA‑TACTCGCCGAACCGTACCGTATCCGCC‑GTGTTACCGCATTCTGGAACCCGTGGGAAGA‑TCCCTTTGGCAGCGGCTATCAGTTAACGCAAT‑CGCTG‑ATGGCGTTTGGTCGCGGCGACCTTTTGGGGCAAGGGTTAGGTAACTCGGTACCAAAACTGGGGTATCTGCCGGAAgccgcc > 2:9992/1‑234 (MQ=255)
gCGAATTTTT‑GGCGTTTCTTTGCTATTTGCTGTATGGGCTTTCTAGGGGTTGGG‑TGTC‑TGA‑TACGCGCCGAATCGTGCGTTTACCGCC‑GTTTTACCGAATTCTGGAACCCGTGGGAAGG‑TCCCTTTGGCAGGGGCGAGCAGTTAACGCAAT‑TGCCG‑ATGGCGTTTGGTCGCGGCGAACTTAGGGGGCAAGGTTTAGGTAACTCGGTACAAAAACTGGAGGATCCGCCGGAAGAGcaca < 1:592288/238‑1 (MQ=255)
gtgaattttttgcttttgtttGCCTTTCTCGGT‑TGGGCCTTTTACTGGTTTTGTTTGC‑TTA‑TGCCCCGCGAACCGTACCTTATCCGCC‑GTGTTACCGCATTCTGGAACCCGTGGGAAGC‑TCCCTGTGGCAGCGGCTATCAGTTAACGCAAT‑CGCTG‑ATGGCGTTTGGTCGCGGCGAACTTTGGGGGCAAGGTTTAGGTAACTCGGTACAAAAACTGGAGTATCTGCCGGAAGCGCacac < 1:97484/220‑1 (MQ=255)
gTTCATTGCCATTATCGGTATGGGCATTTCAGCGGTTGTG‑TTGC‑TGA‑TACTCGCCGAACCGTACCGTATCCGCC‑GTGTTACCGCATTCTGGAACCCGTGGGAAGA‑TCCCTTTGGCAGCGGCTATCAGTTAACGCAAT‑CGCTG‑ATGGCGTTTGGTCGCGGCGAACTTTGGGGGCAAGGTTTAGGTAACTCGGTACAAAAACTGGAGTATATGCCGGAAGCGCACACTGACTTTATTTTc > 2:122276/1‑238 (MQ=255)
ttCATTGCCATTATCGGTATGGGCATTTCAGCGGTTGTG‑TTGC‑TGA‑TACTCGCCGAACCGTACCGTATCCGCC‑GTGTTACCGCATTCTGGAACCCGTGGGAAGA‑TCCCTTTGGCAGCGGCTATCAGTTAACGCAAT‑CGCTG‑ATGGCGTTTGGTCGCGGCGAACTTTGGGGGCAAGGTTTAGGTAACTCGGTACAAAAACTGGAGTATCTGCCGGAAGCGCACACTGACTTTATTTTTGc > 2:356293/1‑239 (MQ=255)
ttGCCATTATCGGTATGGGCATTTCAGCGGTTGTG‑TTGC‑TGA‑TACTCACCGAACCGTACCGTATCCGCC‑GTGTTACCGCCTTCTGGAACCCCTGGGAAGC‑TCCCTTTGGCAGCGGCTATCAGTTAACGCAAT‑CGCTG‑ATGGCGTTTGGTCGCGGCGGACTTTTGGGGCCAGGGTTTGGTAAATCGGTCAAAAAACCGGGATAGCTGACGGGGGGGCCCCATGACtttttttttcccctt > 1:1193896/1‑232 (MQ=255)
gctcttATGGGTATGGGCGTTTCAGGGGTTTGG‑TTGT‑GGG‑ATCTCGCCAGACCGTACCGTTCCGGCC‑GTGTTCCCGCATTCTGGACACCGTGGGAAGA‑TCCCTTTGGCAGCGGCTACCAGTTAACGCAAT‑CGCTG‑ATGGCGTTTGGTCGCGGCGAACTTTGGGGGCAAGGTTTAGGTAACTCGGTACAAAAACTGGAGTATCTGCCGGAAGCGCACACTGACTTTATTTTCGCCATTAt < 1:1224447/235‑1 (MQ=255)
tatgggtatgggCATTTCAGGGGGTGTG‑TTGC‑TGA‑TAATCGCCGAACCGTACCGTATCCGCC‑GTGTTACCGCATTCTGGAACCCGTGGGAAGA‑TCCCTTTGGCAGCGGCTATCAGTTAACGCAAT‑CGCTG‑ATGGCGTTTGGTCGCGGCGAACTTTGGGGGCAAGGTTTAGGTAACTCGGTACAAAAACTGGAGTATCTGCCGGAAGCGCACACTGACTTTATTTTCGCCATTATCGGCg < 2:967190/239‑1 (MQ=255)
tATCGGTAGGGGCATTTCAGCGGTTGTG‑TTGC‑TGA‑TACTCGCCGAACCGTACCGTATCCGCC‑GTGTTACCGCATTCTGGAACCCGTGGGAAGA‑TCCCTTTGGCAGCGGCTATCAGTTAACGCAAT‑CGCTG‑ATGGCGTTTGGTCGCGGCGAACTTTGGGGGCAAGGTTTAGGTAACTCGGTACAAAAACTGGAGTATCTGCCGGAAGCGCACACTGACTTTATTTTCGCCATTATCGGCg < 2:203006/239‑1 (MQ=255)
aTCGGTATGGGCATTTCAGCGGTTGTG‑TTGC‑TGA‑TACTCGCCGAACCGTACCGTATCCGCC‑GTGTTACCGCATTCTGGAACCCGTGGGAAGA‑TCCCTTTGGCAGCGGCTATCAGTTAACGCAAT‑CGCTG‑ATGGCGTTTGGTCGCGGCGACCTTTGGGGGCAAGGTTTAGGTAACTCGGTACAAAAACTGGAGTATCTGCCGGAAGAGCACACGGACCTTATTTTCTCCATTAACGGGga > 1:56351/1‑239 (MQ=255)
|
CCAGCCTGCGGAGCTGACAAAACTGTCGCTGTTTTGCTATATCGCCAACTATCTGGTGCGTAAAGGCGACGAAGTACGTAATAACCTGCGCGGCTTCCTGAAACCGATGGGCGTGATTCTGGTGTTGGCAGTGTTACTGCTGGCAC‑AGCCAGACCTTGGTACGGTGGTGGTGTTGTTTGTGACTACGCT‑GGCGATGTTGTTCCTGGCGGGAGCGAAATTGT‑GGCAGTTCATTGCCATTATCGGTATGGGCATTTCAGCGGTTGTG‑TTGC‑TGA‑TACTCGCCGAACCGTACCGTATCCGCC‑GTGTTACCGCATTCTGGAACCCGTGGGAAGA‑TCCCTTTGGCAGCGGCTATCAGTTAACGCAAT‑CGCTG‑ATGGCGTTTGGTCGCGGCGAACTTTGGGGGCAAGGTTTAGGTAACTCGGTACAAAAACTGGAGTATCTGCCGGAAGCGCACACTGACTTTATTTTCGCCATTATCGGCGA > NC_000913/98840‑99316
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 13 ≤ ATCG/ATCG < 24 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
GATK/CNVnator alignment
N/A
