Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A4 F9 I0 R1
|
260 |
102.5 |
2178490 |
93.2% |
2030352 |
226.0 |
Breseq alignment
BRESEQ :: Evidence
|
| evidence |
seq id |
position |
mutation |
freq |
annotation |
gene |
description |
| RA |
NC_000913 |
976,672 |
T→G |
17.0% |
V116G (GTG→GGG) |
mukB → |
chromosome condensin MukBEF, ATPase and DNA‑binding subunit |
|
| |
seq id |
position |
ref |
new |
freq |
score (cons/poly) |
reads |
annotation |
genes |
product |
| * | NC_000913 | 976,672 | 0 | T | G | 17.0%
| 195.4
/ 3.1
| 92 | V116G (GTG→GGG) | mukB | chromosome condensin MukBEF, ATPase and DNA‑binding subunit |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (34/38); new base G (14/5); total (49/43) |
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 6.88e-02 |
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 |
GGGGCGGGTAAATCCACCACCATGGCGGCGTTCGTTACGGCGCTGATCCCCGACCTGACCCTGCTGCATTTCCGTAACACTACGGAAGCCGGGGCCACCAGCGGTTCGCGCGATAAAGGTCTGCACGGTAAGCTGAAAGCGGGTGTCTGTTATTCGATGCTCGACACCATTAACTCGCGCCACCAGCGCGTGGTGGTCGGTGTGCGT‑CTGCAACAGGTTGCCGGACGCGATCGTAAAGTGGATATCAAGCCGTTTGCCATTCAGGGACTGCCGATGTCGGTGCAGCCGACACAGCTGGTGACCGAAACCCTGAACGAACGCCAGGCGCGCGTGCTGCCGCTTAACGAGCTGAAAGACAAGCTCGAGGCGATGGAAGGCGTGCAGTTTAAACAGTTCA‑ACTCCATTACTGATTACCACTCGCTGATGTTCGATCTGGGCATCATCGCGCGTCGTCTGCGCTCCGCATCTGACC > NC_000913/976434‑976905
|
ggggCTGGTAAACCCCCCACCATGGCGGCTTTCGTTACGGCGCCGATCCCCGACCGGACCCTGCTGCATTTCCGTAACACTACGGAAGCCGGGGCCACCAGCGGTTCGCGCGATAAAGGTCTGCACGGTAAGCTGAAAGCGGGTGTCTGTTATTCGATGCTCGACACCATTAACTCGCGCCACCAGCGCGTGGTGGTCGGTGTGCGT‑CTGCAACAGGTTGCCGGACGCGATCGTAAAGt < 2:492645/239‑1 (MQ=255)
tCCCCCCCCTTGGCGGCGTGCGTTGCGGGGCTGATCCCCGCCCTTACCCTGCGGCATTTCCTTAACACTACGGCAGCCGGGGCCGCCAGCGGTTCGCGCGATAAAGGTCTGCAGGGTAAGCTGAAAGCGGGTGTCTGTTATTCGATGCTCGCAACCATTAACTCGCGCCACCAGCGCGTGGTGGTAGGTGTGCGT‑CTGCAACAGGTTGCCGGACGCGATCGTAAAGTGGATATCAAGcc < 2:632341/239‑1 (MQ=255)
cccaccaTGGCGGCCTTCGTTTCGGCGCTGATCCCCGCCCTGACCCTGCTGCATTTCCGTAACCCTACGGAAGCCGGGGCCACCAGCGGTTCGCGCGATAAAGGTCTGCACGGTAAGCTGAAAGCGGGTGTCTGTTATTCGATGCTCGACACCATTAACTCGCGCCACCAGCGCGTGGTGGTCGGTGTGCGT‑CTGCAACAGGTTGCCGGACGCGATCGTAAAGTGGATATCAAGCCGtt < 2:829648/238‑1 (MQ=255)
cccccaTGGCGGCGTTCGTTCCGGCGCTGATCCCCGACCGGACCCTGCTGCATTTCCGTAACACTACGGAAGCCGGGGCCACCAGCGGTTCGCGCGATAAAGGTCTGCACGGTAAGCTGAAAGCGGGTGTCTGTTATTCGATGCTCGACACCATTAACTCGCGCCACCAGCGCGTGGTGGTCGGTGTGCGT‑CTGCAACAGGTTGCCGGACGCGATCGTAAAGTGGATATCAAGCCGttt < 1:2064/236‑1 (MQ=255)
ccaccaTGGCGGCGTTCGTTACGGCGCTGATCCCCGACCTGACCCTGCTGCATTTCCGTAACACTACGGAAGCCGGGGCCACCAGCGGTTCGCGCGATAAAGGTCTGCACGGTAAGCTGAAAGCGGGTGTCTGTTATTCGATGCTCGACACCATTAACTCGCGCCACCAGCGCGTGGTGGTCGGTGTGCGT‑CTGCACAAGGTTGCCGGACCCGCTCGCAAAGGGGAAAAAAAGCCGttt > 2:2064/1‑239 (MQ=255)
caccaTGGCGGCGTTCGTTACGGCGCTGATCCCCGACCTGACCCTGCTGCATTTCCGTAACACTACGGAAGCCGGGGCCACCAGCGGTTCGCGCGCTAAAGGTCTGCACGGTAAGCTGAAAGCGGGTGTCTGTTATTCGATGCTCGACACCATTAACTCGCGCCACCAGCGCGTGGTGGTCGGTGTGCGT‑CTGCAACAGGGTGCCGGACGCGATCGTAAAGGGGATATCAAGCCGttt > 1:261420/1‑238 (MQ=255)
caccaTGGCGGCGTTCGTTACGGCGCTGATCCCCGACCTGACCCTGCTGCATTTCCGTAACACTACGGAAGCCGGGGCCACCAGCGGTTCGCGCGATAAAGGTCTGCCCGGTAAGCGGAAAGCGGGTGCCTGTTATTCGATGCTCGACACCATTAACTCGCGCCACCAGCGCGGGGGGGTCGGGTGGGGC‑CTGCAACAGGTTGCCGGGCGCGACCGGAAAGGGGGAAACAAGCCGttg > 2:631881/1‑237 (MQ=255)
caccaTGGCGGCGTTCGTTACGGCGCTGATCCCCGACCTGACCCTGCTGCATTTCCGTAACACTACGGAAGCCGGGGCCACCAGCGGTTCGCGCGATAAAGGTCTGCACGGTAAGCTGAAAGCGGGTGGCTGGTATTCGATGCCCGACACCATTAACTCGCGCCACCAGCCCGGGGGGGCCGGGGTGCGT‑CTGCAACAGGTTTCCGGACGCGATCGTAAAGGGGAAATCAAGCCGttt > 2:304368/1‑238 (MQ=255)
tGGCGGCGTTCGTTACGGCGCTGATCCCCGACCTGACCCTGCTGCATTTCCGTAACACTACGGAAGCCGGAGCCACCAGCGGTTCGCGCGATAACGGTCTGCACGGTAAGCTGAAAGCGGGTGTCTGTTATTCGATGCTCGACACCATTAACTCGCGCACCCAGCGCGTGGTGGTCGGGGTGCGT‑CTGCAAAAGGGTCCCGGCCGCGTTCGTAAAGGGGATAACAAACCGGTTTCCAt > 2:410465/1‑238 (MQ=255)
ttcgttACGGCGCTGATCCCCGACCTGACCCTGCTGCATTTCCGTAACACTACGGAAGCCGGGGCCACCAGCGGTTCGCGCGATAAAGGTCTGCCCGGTAAGCTGAAAGCGGGTGTCTGTTATTCGATGCTCGACCCCATTAACCGGCCCCACCAGCGCGTGGTGGTC‑GTGTTGGTGTTGCCACAGGTTGCCGGCCGCGATCGGAAAGTGGATATAAACCCCTTTTCCATTcgtgaac > 2:383242/1‑232 (MQ=255)
ttcgttACGGCGCTGATCCCCGACCTGACCCTGCTGCATTTCCGTAACACTACGGAAGCCGGGGCCACCAGCGGTTCGCGCGATAAAGGTCTGCACGGTAAGCTGAAAGCGGGGGTCTGTTATTCCATGCCCGACACCATTAACTCGCGCCCCCAGCCCGTGGGGGTCGGTGGGCGT‑CTGCAAACGGTTTCCGGCCGCCACCGGAAAGAGGGAATCAAGCCGTTTGCCGTTCCGGGAcg > 2:813217/1‑238 (MQ=255)
ttcgttACGGCGCTGATCCCCGACCTGACCCTGCTGCATTTCCGTAACACTACGGAAGCCGGGGCCACCAGCGGTTCGCGCGATAAAGGTCTGCACGGTAACCTGAAAGCGGGGGGCTGTTATTCCATGCTTGACACCATTCACCCCCGCCCCCAGCCCGGGGTGGTCGGTGTGGCG‑CTGCAACAGGCTGCCGGACGCGCGCGTAAAGGGGAAATCAAACCGGTTGCCATTCCgggggc > 2:275655/1‑236 (MQ=255)
tCCCCGACCCGACCCTGCTGCATTTCCGTAACACGACGGAAGCCGGGGCCACCAGCGGTTCGGGCGATAAAGGTCTGCACGGTAAGCTGAAAGCGGGTGTCTGTTATTCGATGCTCGACACCATTAACTCGCGCCACCAGCGCGTGGTGGTCGGTGTGCGT‑CTGCAACAGGTTGCCGGACGCGATCGTAAAGTGGATATCAAGCCGTTTGCCATTCAGGGACTGCCGATGTCGGTGCa < 1:1003210/238‑1 (MQ=255)
ccctcccccTTCTTCATTTCCATAACCCTAGGGAAGCCGGGGCCCCCGGCGGTTCGGGCGATAAAGGTCTGCACGGTAAGCGGAAAGCGGGTGGCTGTTATTCGATGCTCGACACCATTAACGCGCGCCACCAGCGCGTGGTGGTCGGTGTGCGT‑CTGCAACAGGTTGCCGGACGCGATCGTAAAGTGGATATCAAGCCGTTTGCCATTCAGGGACTGCCGATGTCGGTGCAGCCGaca < 2:1071412/233‑1 (MQ=255)
tGACCCTGCTGCATTTCCGTAACACTACGGAAGCCGGGGCCACCAGCGGTTCGCGCGATAAAGGTCTGCACGGTAAGCTGAAAGCGGGTGTCTGTTATTCGATGCTCGACACCATTAACTCGCGCCACCAGCGCGTGGTGGTCGGTGTGCGT‑CTGCAACAGGTTGCCGGACGCGATCGTAAAGGGGATATCAAGCCGTTTGCCATTCAGGGACTGCCGATGTCGGGGCAGCCGACACAg > 1:1018253/1‑239 (MQ=255)
tGACCCTGCTGCATTTCCGTAACACTACGGAAGCCGGGGCCACCAGCGGTTCGCGCGATAAAGGTCTGCACGGTAAGCTGAAAGCGGGTGTCTGTTATTCGATGCTCGACACCATTAACTCGCGCCACCAGCGCGTGGGGGTCGGTGTTCGT‑CTGCAACAGGTTGCCGGACGCGTACGTAAAGTGGATATCAAGCCGTTTGCCATTCAGGGACTACCGGTGCAGGTGAAGCCGAcacac > 1:229793/1‑238 (MQ=255)
aCCCTGCTGCATTTCCGTAACACTACGGAAGCCGGGGCCACCAGCGGTTCGCGCGATAAAGGTCTGCACGGTAAGCTGAAAGCGGGTGTCTGTTATTCGATGCTCGACACCATTAACTCGCGCCACCAGCGCGTGGTGGTCGGTGTGCGT‑CTGCAACAGGTTGCCGGACGCGATCGTAAAGTGGATATCAACCCGTTTGCCATTCAGGGACTGCCGATGTCGGGGCAGCCGCcaca > 1:305786/1‑236 (MQ=255)
aCCCTGCTGCATTTCCGTAACACTACGGAAGCCGGGGCCACCAGCGGTTCGCGCGATAAAGGTCTGCACGGTAAGCTGAAAGCGGGTGTCTGTTATTCGATGCTCGACACCATTAACTCGCGCCACCAGCGCGGGGTGGTCGGTGTGCGT‑CTGCAACAGTTTGCCGGACGCGGCCGTAAAGGGGATACCAAGCCGTTGGCAGTTCGGGGACTGCCGATGTCGGTGCGGCCGaacaagtg > 2:1085372/1‑232 (MQ=255)
cgtctgcATTTCCGTAACCCTACGGAAGCCGGGGCCACCAGCGGTTCGCGCGAAAAAGGTCTGCACGGTAAGCTGAAAGCGGGTGGCTGTTATTCGATGCTCGACACCATTAACGCGCGCCACCAGCGCGTGGTGGTCGGTGTGCGT‑CTGCAACAGGTTGCCGGACGCGATCGTAAAGTGGATATCAAGCCGTTTGCCATTCAGGGACTGCCGATGTCGGTGCAGCCGACACAGCTGGt < 1:476896/236‑1 (MQ=255)
ctgcATTTCCGTAACACTACGGAAGCCGGGGCCACCAGCGGTTCGCGCGATAAAGGTCTGCACGGTAAGCTGAAAGCGGGTGTCTGTTATTCGATGCTCGACACCATTAACTCGCGCCACCAGCGCGTGGTGGTCGGTGTGCGG‑CTGCAACAGGTTGCCGGACGCGATCGTACAGTGGATATCAAGCCGTTTGCCATTCAGGGACTGCCGATTCCGGGCCAGCCGGCCCACCTgtgga > 1:749887/1‑234 (MQ=255)
ctgcATTTCCGTAACACTACGGAAGCCGGGGCCACCAGCGGTTCGCGCGATAAAGGTCTGCACGGTAAGCTGAAAGCGGGTGTCTGTTATTCGATGCTCGACACCATTAACTCGCGCCACCAGCGCGTGGTGGTCGGTGTGAGT‑CTGCAACAGGGTGCCGGACGCGCTCGTAAAGGGGACATCAAGCCGTTTGCCATTTAGGGACTGGCGAGTTCGGGGCAGCCGACACAGCgggggc > 2:120838/1‑235 (MQ=255)
ctgcATTTCCGTAACACTACGGAAGCCGGGGCCACCAGCGGTTCGCGCGATAAAGGTCTGCACGGTAAGCTGAAAGCGGGTGTCTGTTATTCGATGCTCGACACCATTAACTCGCGCCACCAGCACGTGGTGGTCGGTGTGCGT‑CTGCAAAAGGTTGCCGGACGCCATCGTAACGGGGATATAAAGCCGTTTGCCCTTCAGGGCCTGCCGATGTCGGTTCCGCCGaccaaactgggca > 2:208324/1‑227 (MQ=255)
gcATTTCCGTAACACTACGGAAGCCGGGGACACCAGCGGTTCGCGCGATAAAGGTCTGCCCGGTAAGCTGAAAGCGGGTGTCTGTTATTCGATGCTCGACACCATTAACTCGCGCCACCAGCGCGTGGTGGTCGGTGTGCGT‑CTGCAACAGGTTGCCGGACGCGATCGTAAAGTGGATATCAAGCCGTTTGCCATTCAGGGACTGCCGATGTCGGTGCAGCCGACACAGCTGGTGACCg < 1:699775/239‑1 (MQ=255)
cATTTCCGTAACACGTCGGAAGCCGGGGCCACCAGCGGTTCGCGCGATAAAGGTCTGCACGGTAAGCTGAAAGCGGGTGTCTGTTATTCGATGCTCGACACCATTAACTCGCGCCACCAGCGCGTGGTGGTCGGTGTGCGT‑CTGCAACAGGTTGCCGGACGCGATCGTAAAGTGGATATCAAGCCGTTTGCCATTCAGGGACTGCCGATGTCGGTGCAGCCGACACAGCTGGTGACCg < 1:285758/238‑1 (MQ=255)
aTTTCCGTAACACTACGGAAGCCGGGGCCACCAGCGGTTCGCGCGATAAAGGTCTGCACGGTAAGCTGAAAGCGGGTGTCTGTTATTCGATGCTCGACACCATTAACTCGCGCCACCAGCGCGTGGTGGTCGGTGTGCGT‑CTGCAACAGGTTGCCGGACGCGATCGTAAAGGGGATATCAAGCCGTTTGGCATTCAGGGACTGCCGATGTCGGTGCAGCCGACACAGCTGGTGACCGaa > 1:877301/1‑239 (MQ=255)
tttCCGTAACACTACGGAAGCCGGGGCCACCAGCGGTTCGCGCGATAAAGGTCTGCACGGTAAGCTGAAAGCGGGTGTCTGTTATTCGATGCTCGACACCATTAACTCGCGCCACCAGCGCGTGGTGGTCGGTGTGCGT‑CTGCAACAGGTTGCCGGACGCGATCGTAAAGTGGATATCAAGCCGTTTg < 1:218527/188‑1 (MQ=255)
tttCCGTAACACTACGGAAGCCGGGGCCACCAGCGGTTCGCGCGATAAAGGTCTGCACGGTAAGCTGAAAGCGGGTGTCTGTTATTCGATGCTCGACACCATTAACTCGCGCCACCAGCGCGTGGTGGTCGGTGTGCGT‑CTGCAACAGGTTGCCGGACGCGATCGTAAAGTGGATATCAAGCCGTTTg > 2:218527/1‑188 (MQ=255)
ccGTAACTCTTGGGAAGCGGGGGCTCGCGGGGGTTGGCGCGAAAAAGGACGTGAAGGTAAGCTGAAAGCGGGGGTTTGTTATTCGATGCTCGACCCCATTAACTCGCGCCACCAGCGCGTGGTGGTCGGTGTGCGT‑CTGCAACAGGTTGCCGGACGCGATCGTAAAGTGGATATCAAGCCGTTTGCCATTCAGGGACTGCCGATGTCGGTGCAGCCGACACAGCTGGTGACCGAAAccc < 2:261420/239‑1 (MQ=255)
ccGTAACACTACGGAATCCGGGGCCACCAGCGGTTCGCGCGATAAAGGGCTGCACGGTCAGCTGAAAGCGGGTGTCTATTATTCGATGCTCGCCACCATGAACTCGCGCCACCAGCGCGTGGTGGTCGGTGTTCTT‑CCGCACCCGGTTGCCCGCAGCGAGCGTAAATGGGATATCAATCCGTTTGCCATCCAGGGACTGCCGCTGTCCGTGCAGCCGaccacgccggttcctgaacccc > 2:287189/1‑219 (MQ=255)
ctcTACGGGAGCCGGGGCCCCCCGGGGTTGCGGGGATAAAGGTCTGCCCGGTAAGCTGAAAGCGGGTGTCTGTTATTCGATGCTCGACACCATTAACTCGCGCCACCAGCGCGTGGTGGTCGGTGTGCGT‑CTGCAACAGGTTGCCGGACGCGATCGTAAAGTGGATATCAAGCCGTTTGCCATTCAGGGACTGCCGATGTCGGTGCAGCCGACACAGCTGGTGACCGAAACCCTgaacg < 2:29272/237‑1 (MQ=255)
ctcTACGGAAGGCGGGGCCACCAGCGGTTCGGGATATAAAGGTCTGCACGGTAAGCTGAAAGCGGGTGTCTGTTATTCGATGCCCGACGCCATTAACTCGCGCCACCAGCGCGTGGTGGTCGGTGTGCGT‑CTGCAACAGGTTGCCGGACGCGATCGTAAAGTGGATATCAAGCCGTTTGCCATTCAGGGACTGCCGATGTCGGTGCAGCCGACACAGCTGGTGACCGAAACCCTgaacg < 1:131018/237‑1 (MQ=255)
ccctcggggaGCCGGGGCCACCGGCGGTTCGCGCGATAAAGGTCTGCCCGGTAAGCTGAAAGCGGGTTTCTGTTATTCGATGCTCGACACCATTAACTCGCGCCACCAGCGCGTGGTGGTCGGTGTGCGT‑CTGCAACAGGTTGCCGGACGCGATCGTAAAGTGGATATCAAGCCGTTTGCCATTCAGGGACTGCCGATGTCGGTGCAGCCGACACAGCTGGTGACCGAAACCCTgaacg < 2:473218/230‑1 (MQ=255)
tACGGAAGCCGGGGCCACCAGCGGTTCGCGCGATAAAGGTCTGCACGGTAAGCTGAAAGCGGGTGTCTGTTATTCGATGCTCGACACCATTAACTCGCGCCACCAGCGCGTGGTGGTCGGTGTGCGT‑CTGCAACAGGTTGCCGGACGCGATCGTAAAGGGGAAATCAAGCCGTTTGCCATTCAGGGACTGCCGATGTCGGTGCAGCCGACCCACCGGGGGACCGAAACCCTgaacgaaa > 2:270109/1‑238 (MQ=255)
gCCGGGGCCACCAGCGGTTCGCGCGATAAAGGTCTGCACGGTAAGCTGAAAGCGGGTGTCTGTTATTCGATGCTCGACACCATTAACTCGCGCCACCAGCGCGTGGTGGTCGGTGTGCGT‑CTGCAACAGGTTGCCGGACGCGATCGTAAAGTGGATATCAAGCCGTTTGCCATTCAGGGACTGCCGATGTCGGTGCAGCCGACACAGCTGGGGACCGAAACCCTGAACGAACCCCAGgc > 1:655660/1‑239 (MQ=255)
ggggCCACCAGCGGTTCGCGCGATAAAGGTCTGCACGGTAAGCTGAAAGCGGGTGTCTGTTATTCGATGCTCGACACCATTAACTCGCGCCACCAGCGCGTGGTGGTCGGTGTGCGT‑CTGCAACAGGTTGCCGGACGCGATCGTAAAGTGGATATCAAGCCGTTTGCCGTTCAGGGACTGCCGAGGTCGGTGCAGCCGACACAGCTGGGGACCGGAACCCTGAAAGAACGACAGccgag > 1:29375/1‑237 (MQ=255)
gCCACCAGCGGTTCGCGCGATAAAGGTCTGCACGGTAAGCTGAAAGCGGGTGTCTGTTATTCGATGCTCGACACCATTAACTCGCGCCACCAGCGCGTGGTGGTCGGTGTGCGT‑CTGCAACAGGTTGCCGGACGCGATCGTAAAGGGGATATCAACCCGTTTGCCATTCAGGGACTGCCAATATCGGTGCACCCGACACAGCGCGTGACCGAAACCCTGAACGAACACCAcgcgcgcgg > 2:635569/1‑238 (MQ=255)
caccaGGGGTTCGCGCGATAAAGGTCTGCACGGTAAGCTGAAAGCGGGTGTCTGTTATTCGATGCTCGACACCATTAACTCGCGCCACCAGCGCGTGGTGGTCGGTGTGCGT‑CTGCAACAGGTTGCCGGACGCGATCGTAAAGTGGATATCAAGCCGTTTGCCATTCAGGGACTGCCGATGTCGGTGCAGCCGACACAGCTGGTGACCGAAACCCTGAACGAACGCCAGGCGCGCGtg < 1:304368/238‑1 (MQ=255)
cgcgcgATAAAGGTCTGCACGGTAAGCTGAAAGCGGGTGTCTGTTATTCGATGCTCGACACCATTAACTCGCGCCACCAGCGCGTGGTGGTCGGTGTGCGT‑CTGCAACAGGTTGCCGGACGCGATCGTAAAGTGGATATCAAGCCGTTTGCCATTCAGGGACTGCCGATTTCGGTGCACCCGACACAGCTGGGGCCCGAAACCCTGAACAAACCCCAGGGGCGCGGGCGGCCGCCTAAc > 2:1039131/1‑239 (MQ=255)
gcgcgATAAAGGTCTGCACGGTAAGCTGAAAGCGGGTGTCTGTTATTCGATGCTCGACCCCATTAACTCGCGCCACCAGCGCGTGGTGGTCGGTGTGCGT‑CTGCAACAGGTTGCCGGACGCGATCGTAAAGTGGATATCAAGCCGTTTGCCATTCAGGGACTGCCGATGTCGGTGCAGCCGACACAGCTGGTGACCGAAACCCTGAACGAACGCCAGGCGCGCGTGCTGCCGCTTAACg < 1:993168/239‑1 (MQ=255)
cgcgATAAAGGTCTGCACGGTAAGCTGAAAGCGGGTGTCTGTTATTCGATGCTCGACACCATTAACTCGCGCCACCAGCGCGTGGTGGTCGGTGTGCGT‑CTGCAACAGGTTGCCGGACGCGATCGTAAAGTGGATATCAAGCCGTTTGCCATTCAGGGACGGCCGATGTCGGTGCAGCCGACACAGCTGGTGACCGAAACCCTGAACGAACCCCAGCCGCCCGGGCGGCCCCtaacggg > 2:582363/1‑233 (MQ=255)
gTCTGCACGGTAAGCTGAAAGCGGGTTGCTGTTATTCGATGCCCGACCCCATTAACTCGGGCCACCAGGGCGTGGTGGTCGGTGTGCGT‑CTGCAACAGGTTGCCGGACGCGATCGTAAAGTGGATATCAAGCCGTTTGCCATTCAGGGACTGCCGATGTCGGTGCAGCCGACACAGCTGGTGACCGAAACCCTGAACGAACGCCAGGCGCGCGTGCTGCCGCTTAACGAGCTGAAAGa < 1:742913/238‑1 (MQ=255)
tGCACGGTAAGCTGAAAGCGGGTGTCTGTTATTCGATGCTCGACACCATTAACTCGCGCCACCAGCGCGTGGTGGTCGGTGTGCGT‑CTGCAACAGGTTGCCGGACGCGATCGTAAAGTGGATATCAAGCCGTTTGCCATTCAGGGACTGCCGATGTCGGTGCAGCCGACACAGCTGGTGACCGAAACCCTGAACGAACGCCAGGCGCGCGTGCTGCCGCTTAACGAGCTGCAAGaaaa > 1:572616/1‑238 (MQ=255)
tGCACGGTAAGCTGAAAGCGGGTGTCTGTTATTCGATGCTCGACACCATTAACTCGCGCCACCAGCGCGTGGTGGTCGGTGTGCGT‑CTGCAACAGGTTGCCGGACGCGATCGTAAAGTGGATATCAAGCCGTTTGCCATTCAGGGACTGCCGATGTCGGGGCCGCCGCCACACCCGGGGACCGAAACCCTGAACGAACCCCAGGGCCGCGTGCGACCGCTTACCGGGCTaaaaacaaca > 2:804174/1‑233 (MQ=255)
cACGGTAAGCTGAAAGCGGGTGTCTGTTATTCGATGCTCGACACCATTAACTCGCGCCACCAGCGCGTGGTGGTCGGTGTGCGT‑CTGCAACAGGTTGCCGGACGCGATCGTAAAGTGGATATCAAGCCGTTTGCCATTCAGGGACTGCCGATGTCGGTGCAGCCGACACAGCTGGTGACCGAAACCCTGAACGAACGCCAGGCGCGCGTGCTGCCGCTTAACGAGCTGAAAGACAAGc > 1:776612/1‑238 (MQ=255)
cACGGTAAGCTGAAAGCGGGTGTCTGTTATTCGATGCTCGACACCATTAACTCGCGCCACCAGCGCGTGGTGGTCGGTGTGCGT‑CTGCAACAGGTTGCCGGACGCGATCGTAAAGTGGATATCAAGCCGTTTGCCATTCAGGGACTGCCGATGTCGGTGCAGCCGACACAGCTGGTGACCGAAACCCTGAACGAAAGCCAGGCGCGCGGGCTGCCGCTTAACGGGCTGAAAGACAAGc > 1:782095/1‑238 (MQ=255)
taaagtGAATGCGGGTGTGTGTTATTCGATGCGTGACACCATTAACTGGCGGGACCAGCGGGTGGTGGGCGGTTTGCGT‑CGGCATCAGGTTGCCGGACGCGATGGTAAAGTGGATATCAAGCCGTTTGCCATTCAGGGACTGCCGATGTCGGTGCAGCCGACACAGCTGGTGACCGAAACCCTGAACGAACGCCAGGCGCGCGTGCTGCCGCTTAACGAGCTGAAAGACAAGCTCGAg < 1:335302/233‑1 (MQ=255)
tAAGCTGAAAGCGGGTGTCTGTTATTCGATGCTCGACACCATTAACTCGCGCCACCAGCGCGTGGTGGTCGGTGTGCGT‑CTGCAACAGGTTGCCGGACGCGATCGTAAAGTGGATATCAAGCCGTTTGCCATTCAGGGACTGCCGATGTCGGTGCAGCCGACACAGCTGGTGACCGAAACCCTGAACGAACGCCCGGCGCGCGGGCTGCCGCTTCACGAGCTGAAAGACCAGCCCGaag > 2:381471/1‑237 (MQ=255)
tAAGCTGAAAGCGGGTGTCTGTTATTCGATGCTCGACACCATTAACTCGCGCCACCAGCGCGTGGTGGTCGGTGTGCGT‑CTGCAACAGGTTGCCGGACGCGATCGTAAAGTGGATATCAAGCCGTTTGCCATTCAGGGACTGCCGATGTCGGTGCAGCCGACACAGCTGGTGACCGAAACCCTGAACGAACGCCAGGCGCGCGTGCTGCCGCTTAACGAGCTGAAAGACAAGCTCGAg > 1:965847/1‑238 (MQ=255)
tAAGCTGAAAGCGGGTGTCTGTTATTCGATGCTCGACACCATTAACTCGCGCCACCAGCGCGTGGTGGTCGGTGTGCGT‑CTGCAACAGGTTGCCGGACGCGATCGTAAAGTGGATATCAAGCCGTTTGCCATTCAGGGACTGCCGATGTCGGTGCAGCCGACACAGCTGGTGACCGAAACCCTGAACGAACCCCAGGCCCGCGGGCTGCCCCTTAACGAGCGGaaaaaaaaacccaggg > 2:519970/1‑226 (MQ=255)
tAAGCTGAAAGCGGGTGTCTGTTATTCGATGCTCGACACCATTAACTCGCGCCACCAGCGCGTGGTGGTCGGTGTGCGT‑CTGCAACAGGTTGCCGGACGCGATCGTAAAGTGGATATCAAGCCGTTTGCCATTCAGGGACTGCCGATGTCGGGGCAGCCGACCACGCTGGTGACCGAACCCCTGAACGAACGCCCGgc > 2:839092/1‑198 (MQ=255)
tAAGCTGAAAGCGGGTGTCTGTTATTCGATGCTCGACACCATTAACTCGCGCCACCAGCGCGTGGTGGTCGGTGTGCGT‑CTGCAACAGGTTGCCGGACGCGATCGTAAAGTGGATATCAAGCCGTTTGCCATTCAGGGACTGCCGACGTCGGTGCAGCCGACACAGCTGGGAACCGAAACCCTGAACAAACGCCGGGCGCGCGGGCTCCAGCTGAACGAGATGAAAAAAAAACCCGAgg > 2:955247/1‑239 (MQ=255)
tAAGCTGAAAGCGGGTGTCTGTTATTCGATGCTCGACACCATTAACTCGCGCCACCAGCGCGTGGTGGTCGGTGTGCGT‑CTGCAAAAGGTTGCCGGACGCGATCGTAAAGTGGATATCAAGCCGTTTGCCATTCCGGGACGCCCGATGTCGGTGAAGCCGCCACAGCTCGTGACCGAAACCCTGCACAAAGCCCAGGCCCGCGGGCGGCCCTTTAAAGAACGGAAAAACaaaccccagg > 2:1047078/1‑231 (MQ=255)
tGAAAGCGGGTGTCTGTTATTCGATGCTCGACACCATTAACTCGCGCCACCAGCGCGTGGTGGTCGGTGTGCGT‑CTGCAACAGGTTGCCGGACGCGATCGTAAAGTGGATATCAAGCCGTTTGCCATTCAGGGACTGCCGATGTCGGTGCAGCCGACACAGCTGGTGACCGGAACCCTGAACGAAAGCCAGGCCCGCGTGCTCCCGCTTAACGAGCTGAAAGCCAAGCTCGAGGCGagg > 1:676299/1‑237 (MQ=255)
aaGCGGGTGTCTGTTATTCGATGCTCGACACCATTAACTCGCGCCACCAGCGCGTGGTGGTCGGTGTGCGT‑CTGCAACAGGTTGCCGGACGCGATCGTAAAGTGGATATCAAGCCGTTTGCCATTCAGGGACTGCCGATGTCGGTGCAGCCGACACAGCTGGTGACCGAAACCCTGAACGAACGCCAGGCGCGCGCGCGGCCGCTTAACGAGCTGAAAAACAAGCCCGAGGCGACggca > 1:123888/1‑237 (MQ=255)
gtttCTGTTATTCGATGCTCGACACCATTAACCCGCGCCACCAGCGCGTGGTGGTCGGTGTGCGT‑CTGCAACAGGTTGCCGGACGCGATCGTAAAGTGGATATCAAGCCGTTTGCCATTCAGGGACTGCCGATGTCGGTGCAGCCGACACAGCTGGTGACCGAAACCCTGAACGAACGCCAGGCGCGCGTGCTGCCGCTTAACGAGCTGAAAGACAAGCTCGAGGCGATGGAAGGCGt < 1:312396/235‑1 (MQ=255)
gtgtCTGTTATTCGATGCTCGACACCATTAACTCGCGCCACCAGCGCGTGGTGGTCGGTGTGCGT‑CTGCAACAGGTTGCCGGACGCGATCGTAAAGTGGATATCAAGCCGTTTGCCATTCAGGGACTGCCGATGTCGGTGCAGCCGACACAGCTGGTGACCGAAACCCTGAACGAACGCCAGGCGCGCGTGCTGCCGCTTAACGAGCTGAAAGACAAGCTCGAGGCGATGGAAGGCGt < 1:582363/238‑1 (MQ=255)
gtgtCTGTTATTCGATGCCCGACACCATTAACTCGCGCCCCCAGCGCGTGGTGGTCGGTGTGCGT‑CTGCAACAGGTTGCCGGACGCGATCGTAAAGTGGATATCAAGCCGTTTGCCATTCAGGGACTGCCGATGTCGGTGCAGCCGACACAGCTGGTGACCGAAACCCTGAACGAACGCCAGGCGCGCGTGCTGCCGCTTAACGAGCTGAAAGACAAGCTCGAGGCGATGGAAGGCGt < 1:383242/238‑1 (MQ=255)
tttttGTTTTTTGGTGCTCGACCCCTTTACCTCGCGCCACCAGCGCGTGGTGGTCGGTGTGCGT‑CTGCAACAGGTTGCCGGACGGGTTCGTAAAGTGGATATCAAGCCGTTTGCCATTCAGGGACTGCCGATGGCGGTGCAGCCGACACAGCTGGTGACCGAAACCCTGAACGAACGCCAGGCGCGCGTGCTGCCGCTTAACGAGCTGAAAGACAAGCTCGAGGCGATGGAAGGCGTg < 2:462942/234‑1 (MQ=255)
ttCGATGCTCGACACCATTAACTCGCGCCACCAGCGCGTGGTGGTCGGTGTGCGT‑CTGCAACAGGTTGCCGGACGCGATCGTAAAGTGGATATCAAGCCGTTTGCCATTCAGGGACTGCCGATGTCGGTGCAGCCGACACAGCTGGTGACCGAAACCCTGAACGAACGCCAGGCGCGCGTGCTGCCGCTTAACGAGCTGAAAGCAAAGCCCGAGGGGAGGGAAGGGGGGCAGTTTAAAc > 2:723180/1‑239 (MQ=255)
tgctcgcacccATTAACTCGCGCCACCCGCGTGGGGTGGTCGGTGTGCTT‑CTGCACCAGGTTGCCGGACGCGATCGTAAAGTGGATATCAAGCCGTTTGCCATCCAGGGACTGCCGATGTCGGTGCAGCCGACACAGCTGGTGACCGAAACCCTGAACGAACGCCAGGCGCGCGTGCTGCCGCTTAACGAGCTGAAAGACAAGCTCGAGGCGATGGAAGGCGTGCAGTTTAAACAGTTc < 1:177041/230‑1 (MQ=255)
tGCTCGACTCCATTAACTCGCGCCACCAGCGCGGGGTGGTCGGTGTGCGT‑CTGCAACAGGTTGCCGGACGGGATCGTAAAGGGGATATCAAGCCGTTTGCCATTCAGGGCCTGCCGATGTCGGTGCAGCCGACACAGCTGGTGACCGAAACCCTGAACGAACGCCAGGCGCGCGTGCTGCCGCTTAACGAGCTGAAAGACAAGCTCGAGGCGATGGAAGGCGTGCAGTTTAAACAGTTc < 1:635569/239‑1 (MQ=255)
tGCTCGACACCATTAACTCGCGCCACCAGCGCGTGGTGGTCGGTGTGCGT‑CTGCAACAGGTTGCCGGACGCGATCGTAAAGTGGATATCAAGCCGTTTGCCATTCAGGGACTGCCGATGTCGGTGCAGCCGACACAGCTGGTGACCGAAACCCTGAACGAACGCCAGGCGCGCGTGCTGCCGCTTAACGAGCTGAAAGACAAGCTCGAGGCGATGGAAGGCGGGCAGGTGAAACAGGTc > 2:381777/1‑239 (MQ=255)
ggCTCGACACCATTAACTCGCGCCACCAGCGGGTGGTGGTCGGTGTGCGT‑CTGCAACAGGTTGCCGGACGCGATCGTAAAGTGGATATCAAGCCGTTTGCCATTCAGGGACTGCCGATGTCGGTGCAGCCGACACAGCTGGTGACCGAAACCCTGAACGAACGCCAGGCGCGCGTGCTGCCGCTTAACGAGCTGAAAGACAAGCTCGAGGCGATGGAAGGCGTGCAGTTTAAACAGTTc < 1:519970/238‑1 (MQ=255)
tcTCGACACCATTACCTCGCGCCCCCAGCGCGTGGTGGTCGGTGTGCGT‑CTGGAACAGGTTGCCGGACGCGAGCGTAAAGTGGATATCAAGCCGTTTGCCATTCAGGGACTGCCGATGTCGGTGCAGCCGACACAGCTGGTGACCGAAACCCTGAACGAACGCCAGGCGCGCGTGCTGCCGCTTAACGAGCTGAAAGACAAGCTCGAGGCGATGGAAGGCGTGCAGTTTAAACAGTTc < 1:698102/237‑1 (MQ=255)
gcccGACACCATTAACTCGCGCCAACAGGGCGTGGTGGTCGGTGTGCGT‑CTGCAACAGGTTGCCGGACGCGATCGTAAAGTGGATATCAAGCCGTTTGCCCTTCAGGGACTGCCGATGTCGGTGCAGCCGACACAGCTGGTGACCGAAACCCTGAACGAACGCCAGGCGCGCGTGCTGCCGCTTAACGAGCTGAAAGACAAGCTCGAGGCGATGGAAGGCGTGCAGTTTAAACAGTTc < 1:528940/235‑1 (MQ=255)
gCTCGCCCCCATTAACGCCCGCCCCCAGCGGGTGGGGGTCGGGGTGCGT‑CGGCACCAGGTTGCCGGACGCGATCGTAAAGTGGATATCAAGCCGTTTGCCATTCAGGGACTGCCGATGTCGGTGCAGCCGACACAGCTGGTGACCGAAACCCTGAACGAACGCCAGGCGCGCGTGCTGCCGCTTAACGAGCTGAAAGACAAGCTCGAGGCGATGGAAGGCGTGCAGTTTAAACAGTTc < 2:554593/238‑1 (MQ=255)
cccccccccatttACCTCGCCCCACGGGCG‑GTGGTGGTTGTTGTGGCT‑CTGCAACAGGTTGCCGGACGCGATCGTAAAGTGGATATCAAGCCGTTTGCCATTCAGGGACTGCCGATGTCGGTGCAGCCGACACAGCTGGTGACCGAAACCCTGAACGAACGCCAGGCGCGCGTGCTGCCGCTTAACGAGCTGAAAGACAAGCTCGAGGCGATGGAAGGCGTGCAGTTTAAACAGTTCa‑a < 2:381321/228‑1 (MQ=255)
acCATTAACCCGGTGCACCAGCGGGTGGTGGTCGGTGTGCGT‑CTGCAACAGGTTGCCGGACGCGATCGTAAAGTGGATATCAAGCCGGTTGCCATTCAGGGACTGCCGATGTCGGTGCAGCCGACACAGCTGGTGACCGAAACCCTGAACGAACGCCAGGCGCGCGTGCTGCCGCTTAACGAGCTGAAAGACAAGCTCGAGGCGATGGAAGGCGTGCAGTTTAAACAGTTCA‑ACTCCa < 1:265989/238‑1 (MQ=255)
aaTTAACCCGCGCCACCAGGGCGTGGTGGTCGGTGTGCGT‑CTGCAACAGGTTGCCGGACGCGATCGTAAAGTGGATATCAAGCCGTTTGCCATTCAGGGACTGCCGATGTCGGTGCAGCCGACACAGCTGGTGACCGAAACCCTGAACGAACGCCAGGCGCGCGTGCTGCCGCTTAACGAGCTGAAAGACAAGCTCGAGGCGATGGAAGGCGTGCAGTTTAAACAGTTCA‑ACTCCATTa < 1:381777/238‑1 (MQ=255)
ttAACTCGCGCCACCAGCGCGTGGTGGTCGGTGTGCGT‑CTGCAACAGGTTGCCGGACGCGATCGTAAAGTGGATATCAAGCCGTTTGCCATTCAGGGACTGCCGATGTCGGTGCAGCCGACACAGCTGGTGACCGAAACCCTGAACGAACGCCAGGCGCGCGTGCTGCCGCTTAACGAGCTGAAAGACAAGCTCGAGGCGCTGGAAGGCGTGCAGTTTAAACAATTCA‑ACTCCATTACt > 1:378148/1‑239 (MQ=255)
acttcgcccaccgGTGGGTGGTGGTCGGTGTGCGT‑CTGAACCAGGTTGGCGGACGCGTTGTGAAAGGGGATATCAAGCCGTTTGCCATTCAGGGACTGCCGATGTCGGGGCAGCCGACACAGCTGGTGACCGAAACCCTGAACGAACGCCAGGCGCGCGTGCTGCCGCTTAACGAGCTGAAAGACAAGCTCGAGTCGATGGAAGGCGTGCAGTTTAAACAGTTCA‑ACTCCATTACTGAt < 2:640209/232‑1 (MQ=255)
gggccccccaccggtggtgGGCGGTGTGCGT‑CAGCAACAGGTTGCCGGACGCGATCGTAAAGTGGATATCAAGCCGTTTGCCATTCAGGGACTGCCGATGTCGGTGCAGCCGACACAGCTGGTGACCGAAACCCTGAACGAACGCCAGGCGCGCGTGCTGCCGCTTAACGAGCTGAAAGACAAGCTCGAGGCGATGGAAGGCGTGCAGTTTAAACAGTTCA‑ACTCCATTACTGATTAcc < 1:1085372/226‑1 (MQ=255)
cgcCACCAGCGCGTGGTGGTCGGTGTGCGT‑CTGCAACAGGTTGCCGGACGCGATCGTAAAGTGGATATCAAGCCGTTTGCCATTCAGGGACTGCCGATGTCGGTGCAGCCGACACAGCTGGTGACCGAAACCCTGAACGAACGCCAGGCGCGCGtg > 1:113806/1‑156 (MQ=255)
cgcCACCAGCGCGTGGTGGTCGGTGTGCGT‑CTGCAACAGGTTGCCGGACGCGATCGTAAAGTGGATATCAAGCCGTTTGCCATTCAGGGACTGCCGATGTCGGTGCAGCCGACACAGCTGGTGACCGAAACCCTGAACGAACGCCAGGCGCGCGtg < 2:113806/156‑1 (MQ=255)
tccaccaGCGCGTGGTGGTCGGTGGGCGT‑CTGCAACAGGTTGCCGGACGCGATCGTAAAGTGGATATCAAGCCGTTAGCCATTCAGGGACTGCCGATGTCGGTGCAGCCGACACAGCTGGTGACCGAAACCCTGAACGAACGCCAGGCGCGCGTGCTGCCGCTTAACGAGCTGAAAGACAAGCTCGAGGCGATGGAAGGCGTGCAg < 1:495588/205‑1 (MQ=255)
gcCCCCAGCGCGTGGTGGTCGGTTTGCGT‑CTGCAACAGGTTGCCGGACGCGATCGTAAAGTGGATATCAAGCCGTTTGCCATTCAGGGACTGCCGATGTCGGTGCAGCCGACACAGCTGGTGACCGAAACCCTGAACGAACGCCAGGCGCGCGTGCTGCCGCTTAACGAGCTGAAAGACAAGCTCGAGGCGATGGAAGGCGTGCAGTTTAAACAGTTCA‑ACTCCATTACTGATTACCa < 1:270109/238‑1 (MQ=255)
cacgaGCGCGTGGGTGTCGGTGTGCGT‑CTGCAACAGGTAGCCGGACGCGATCGTAAAGTGGATATCAAGCCGTTTGCCATTCAGGGACTGCCGATGTCGGTGCAGCCGACACAGCTGGTGACCGAAACCCTGAACGAACGCCAGGCGCGCGTGCTGCCGCTTAACGAGCTGAAAGACAAGCTCGAGGCGATGGAAGGCGTGCAGTTTAAACAGTTCA‑ACTCCATTACTGATTACCACt < 1:208324/238‑1 (MQ=255)
gtggtgGTCGGTGTGCGT‑CTGCAACAGGGTGCCGGGCGAGATGGGAAAGGGGATAACAAGCCGGTTGCCATTCAGGGACTGCCGATGTCGGTGCAGCCGACACAGCTGGTGACCGAAACCCTGAACGAACGCCAGGCGCGCGTGCTGCCGCTTAACGAGCTGAAAGACAAGCTCGAGGCGATGGAAGGCGTGCAGTTTAAACAGTTCA‑ACTCCATTACTGATTACCACTCGCTGATGt < 1:498132/238‑1 (MQ=255)
ggggtggtTGGTTTGCGT‑CTGCAACAGGTTGCCGGACGCGATCGTAAAGTGGATATCAAGCCGTTTGCCATTCAGGGACTGCCGATGTCGGTGCAGCCGACACAGCTGGTGACCGAAACCCTGAACGAACGCCAGGCGCGCGTGCTGCCGCTTAACGAGCTGAAAGACAAGCTCGAGGCGATGGAAGGCGTGCAGTTTAAACAGTTCA‑ACTCCATTACTGATTACCACTCGCTGATGt < 1:631881/236‑1 (MQ=255)
gggggggggggTGTGC‑T‑TTGAAACCGGTTGCCGGACGGGATCGTAAAGGTGATATCAAGCCTTTTGCCATTCAGGGACTGCCGATGTCGGTGCAGCCGACACAGCTGGTGACCGAAACCCTGAACGAACGCCAGGCGCGCGTGCTGCCGCTTAACGAGCTGAAAGACAAGCTCGAGGCGATGGAAGGCGTGCAGTTTAAACAGTTCA‑ACTCCATTACTGATTACCACTCGCTGATGtt < 2:1018253/229‑1 (MQ=255)
gtgggtctggggggCGT‑GTGCAACTGGTTGCCGGCAGGGAGTGTAAAGTGGATATCAAGCCGTTTGCCATTCAGGGACTGCCGATGTCGGTGCAGCCGACACAGCTGGTGACCGAAACCCTGAACGAACGCCAGGCGCGCGTGCTGCCGCTTAACGAGCTGAAAGACAAGCTCGAGGCGATGGAAGGCGTGCAGTTTAAACAGTTCA‑ACTCCATTACTGATTACCACTCGCTGATGtt < 2:229793/225‑1 (MQ=255)
tCGGTGTGCGT‑CTGCAACAGGTTGCCGGACGCGATCGTAAAGTGGATATCAAGCCGTTTGCCATTCAGGGACTGCCGATGTCGGTGCAGCCGACACAGCTGGTGACCGa > 1:90623/1‑109 (MQ=255)
tCGGTGTGCGT‑CTGCAACAGGTTGCCGGACGCGATCGTAAAGTGGATATCAAGCCGTTTGCCATTCAGGGACTGCCGATGTCGGTGCAGCCGACACAGCTGGTGACCGa < 2:90623/109‑1 (MQ=255)
cGGTGTGCGT‑CTGCAACAGGTTGCCGGACGCGATCGTAAAGTGGATATCAAGCCGTTTGCCATTCAGGGACTGCCGATGTCGGTGCAGCCGACACAGCTGGTGACCGAAACCCTGAACGAACGCCAGGCGCGCGGGCTGCCGCTTAACGAGCTGAAAGACAAGGTCGAGGCGATGGAAGGCGGGCGGTTTAAACAGTTCA‑ACTCCATTAATGATAAACACCCGcggggggtgaacctgg > 2:537651/1‑224 (MQ=255)
gCGT‑CTGCAACAGGTTGCCGGACGCGATCGTAAAGTGGATATCAAGCCGTTTGCCATTCAGGGACTGCTGATGTCGGTGCAGCCGACACAGCTGGTGACCGAAACCCTGAACGAACGCCAGGCGCGCGTGCTGCCGCTTAACGAGCTGAAAGACAAGCTCGAGGCGATGGAAGGCGTGCAGTTTAAACAGTTCA‑ACTCCATTACTGATTACCACTCGCTGATGTTCGATCTGGGcatc > 1:174140/1‑238 (MQ=255)
gT‑CTGCAACAGGTTGCCGGACGCGATCGTAAAGTGGATATCAAGCCGTTTGCCATTCAGGGACTGCCGATGTCGGTGCAGCCGACACAGCTGGTGACCGAAACCCTGAACGAACGCCAGGCGCGCGTGCTGCCGCTTAACGAGCTGAAAGACAAGCTCCAGGCGATGGAAGGCGGGCAGTTTAAACAGTTCA‑ACTCCATTACTGATTACCACACGCTGATTTTCCATATGGGcataacc > 2:690431/1‑235 (MQ=255)
tGCAACAGGTTGCCGGACGCGATCGTAAAGTGGATATCAAGCCGTTTGCCATTCAGGGACTGCCGATGTCGGTGCAGCCGACACAGCTGGTGACCGAAACCCTGAACGAACGCCAGGCGCGCGTGCTGCCGCTTAACGAGCTGAAAGACAAGCTCGAGGCGATGGAGGGCGTGCAGTTTAAACAGTTCA‑CCTCCATTACTGATTCCCCCTCCCCGGTGTTCGACCTGGGCaccatcccc > 2:1008536/1‑236 (MQ=255)
gCAACAGGTTGCCGGACGGGATCGTAAAGTGGATATCAAGCCGTTTGCCATTCAGGGACTGCCGATGTCGGTGCAGCCGACACAGCTGGTGACCGAAACCCTGAACGAACGCCAGGCGCGCGTGCTGCCGCTTAACGAGCTGAAAGACAAGCTCGAGGCGATGGAAGGCGTGCAGTTTAAACAGTTCA‑ACTCCATTACTGATTACCACTCGCTGATGTTCGATCTGGGCATCATcgcgc < 1:275655/239‑1 (MQ=255)
cAACAGGTTGCCGGACGCGATCGTAACGTGGATATCAAGCCGTTTGCCATTCAGGGACTGCCGATGTCGGTGCAGCCGACACAGCTGGTGACCGAAACCCTGAACGAACGCCAGGCGCGCGTGCTACCGCTTAACGAGCCGAAAGACAAACACGAGTCGCGGGAAGGCGTGCAGTTTAAACAGTTGACACTCC‑TTAATAATTACCACCCCCCGATGTTCGATCTGGGCATCATcgcgcg > 2:949763/1‑239 (MQ=255)
cAACAGGTTGCCGGACGCGATCGTAAAGTGGATATCAAGCCGTTTGCCATTCAGGGACTGCCGATGTCGGTGCAGCCGACACAGCTGGTGACCGAAACCCTGAACGAACGCCAGGCGCGCGTGCTGCCGCTTAACGAGCTGAAAGACAACCCCGAGGCGATGGAGGGCGGGCAGTTTAAACAGTTCA‑ACTCCATTACTGAGTACCACTCCCCGGTGTTCAATCTgggattcacccgcgg > 2:808278/1‑227 (MQ=255)
gTTGCCGGACGCGATCGTAAAGTGGATATCAAGCCGTTTGCCATTCAGGGACTGCCGATGTCGGTGCAGCCGACACAGCTGGTGACCGAAACCCTGAACGAACGCCAGGCGCGCGTGCTGCCGCTTAACGAGCTGAAAGACAAGCTCGAGGCGATGGAAGGCGTGCAGTTTAAACAGTTCA‑ACTCCATTACTGATTACCACTCGCTGATGTTCGATCTGGGCATCATCGCGCgtcgtc > 1:274479/1‑238 (MQ=255)
aTCGTAAAGTGGATATCAAGCCGTTTGCCATTCAGGGACTGCCGATGTCGGTGCAGCCGACACAGCTGGTGACCGAAACCCTGAACGAACGCCAGGCGCGCGTGCTGCCGCTTAACGAGCTGAAAGACAAGCTCGAGGCGATGGAAGGCGTGCAGTTTAAACAGTTCA‑ACTCCCTTACTGATTACCACTCGCTGATGTTCGATCTGGGCATCATCCCGCGTCGTCTG‑GCTcccgct > 1:763299/1‑232 (MQ=255)
tAAAGGGGATTGCAAGCCGTTTGCCCTTCAGGGCCTCCCGATGTCGGTGCAGCCGACCCCGCTGGGTACCGAAACCCTGAACGAACGCCAGGCGCGCGTGCTGCCGCTTAACGAGCTGAAAGACAAGCTCGAGGCGATGGAAGGCGTGCAGTTTAAACAGTTCA‑ACTCCATTACTGATTACCACTCGCTGATGTTCGATCTGGGCATCATCGCGCGTCGTCTGCGCTCCGCATCTGAcc < 2:572616/239‑1 (MQ=255)
|
GGGGCGGGTAAATCCACCACCATGGCGGCGTTCGTTACGGCGCTGATCCCCGACCTGACCCTGCTGCATTTCCGTAACACTACGGAAGCCGGGGCCACCAGCGGTTCGCGCGATAAAGGTCTGCACGGTAAGCTGAAAGCGGGTGTCTGTTATTCGATGCTCGACACCATTAACTCGCGCCACCAGCGCGTGGTGGTCGGTGTGCGT‑CTGCAACAGGTTGCCGGACGCGATCGTAAAGTGGATATCAAGCCGTTTGCCATTCAGGGACTGCCGATGTCGGTGCAGCCGACACAGCTGGTGACCGAAACCCTGAACGAACGCCAGGCGCGCGTGCTGCCGCTTAACGAGCTGAAAGACAAGCTCGAGGCGATGGAAGGCGTGCAGTTTAAACAGTTCA‑ACTCCATTACTGATTACCACTCGCTGATGTTCGATCTGGGCATCATCGCGCGTCGTCTGCGCTCCGCATCTGACC > NC_000913/976434‑976905
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 13 ≤ ATCG/ATCG < 26 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
GATK/CNVnator alignment
N/A
