Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A4 F17 I0 R1
|
160 |
98.0 |
2214160 |
89.0% |
1970602 |
222.7 |
Breseq alignment
BRESEQ :: Evidence
|
| evidence |
seq id |
position |
mutation |
freq |
annotation |
gene |
description |
| RA |
NC_000913 |
4,143,144 |
A→G |
15.0% |
I206V (ATT→GTT) |
frwC → |
putative enzyme IIC component of PTS |
| |
seq id |
position |
ref |
new |
freq |
score (cons/poly) |
reads |
annotation |
genes |
product |
| * | NC_000913 | 4,143,144 | 0 | A | G | 15.0%
| 179.5
/ 4.1
| 80 | I206V (ATT→GTT) | frwC | putative enzyme IIC component of PTS |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (27/38); new base G (11/2); total (39/41) |
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 5.79e-03 |
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 |
TTCTGCGCTCGGTGATGCCTATCTTCATTATTCCTATCGTCGGCACACTGATTACCGCAGGCATCATGATGTGGGGCTTGGGCGAGCCTGTAGGGGCGTTGACCAACAGCCTGACTCAGTGGCTTCAGGGGATGCAGCAGGGCAGCATTGTTATGCTGGCGGTGAT‑CATGGGTCTGATGCTGGCGTTCGATATGGGC‑GGTCCGGTT‑AACAAAGTGGCCTATGCC‑TTCATGCTGATTTGCGTTGCTCAGGGTGTTTATACCG‑TGGTGG‑CCATCGCTGCCGTG‑GGTATTTGTATCCCGC‑CGCTGGGGATGGGGCTGGCGACGCTGATTGGTCGTAAAAATTTCTCCGCAGAAGAGCGCGAAACCGGCAAAGCGGCACTGGTGATGGGCTGT‑GTTGGCGTTACTGAAGGGGCGATTCCTTTCGCCGCTGCCGATCCGCTGCGTGTCATTCCTTCCATCATGGTCGGTTCAGT > NC_000913/4142911‑4143379
|
ttctggccgcgggtgtgtcttttttCATTTTTCCTGCCGGCGGCAGACTGATTCCCGGAGGCATGGTTGTGCGGCGCTTGGGCGAGCCTGTAGGGGCGTTGACCAACAGCCTGACTCAGTGGCTTCAGGGGATGCAGCAGGGCAGCATTGTTATGCTGGCGGTGAT‑CATGGGTCTGATGCTGGCGTTCGATATGGGC‑GGTCCGGTT‑AACAAAGTGGCCTATGCC‑TTCATGCTGATTTGc < 2:800819/216‑1 (MQ=255)
tCTGCGCTCGGTGATGCCTATCTTCATTATTCCTATCGTCGGCACACTGATTACCGCAGGCATCATGATGTGGGGCTTGGGCGAGCCTGTAGGGGCGTTGACCAACAGCCTGACTCAGTGGCTTCAGGGGATGCAGCAGGGCAGCATTGTTATGCTGGCGGTGAT‑CATGGGTCTGATGCTGGCGTTCGATATGGGC‑GGTCCGGTT‑AACAAAGTGGCCTATGCC‑TTCATGCTGATTTGc < 1:156968/238‑1 (MQ=255)
gcgcTCGGTGATGCCTATCTTCATTATTCCTATCGTCGGCACACTGATTACCGCAGGCATCATGATGTGGGGCTTGGGCGAGCCTGTAGGGGCGTTGACCAACAGCCTGACTCAGTGGCTTCAGGGGATGCAGCAGGGCAGCATTGTTATGCTGGCGGGGTA‑CATGGGTTCTATCCTGGCGTTCGCTATGGGCGGGCCCGTTT‑AACAAA‑TGGCCCTTGCC‑TTCAAGGTGGTTTTCGtt > 1:477281/1‑238 (MQ=255)
ggTGATGCCTATTTTCATTGTTCCTATCGGCGGCACACTGATTACCGCAGGCATCATGATGGGGGGCTTGGGCGAGCCTGTAGGGGCGTTGACCAACAGCCTGACTCAGTGGCTTCAGGGGATGCAGCAGGGCAGCATTGTTATGCTGGCGGTGAT‑CATGGGTCTGATGCTGGCGTTCGATATGGGC‑GGTCCGGTT‑AACAAAGTGGCCTATGCC‑TTCATGCTGATTTGCGTTGCTc < 2:462343/236‑1 (MQ=255)
ggTGATGCCTATCTTCATTATTCCTATCGTCGGCACACTGATTACCGCAGGCATCATGATGTGGGGCTTGGGCGAGCCTGTAGGGGCGTTGACCAACAGCCTGACTCAGTGGCTTCAGGGGATGCAGCAGGGCAGCATTGTTATGCTGGCGGTGGT‑CCATGGTCTGGTGCCTGGGTTCGATATGGGG‑GGCCCGGTT‑AACAAAGGGGCCCAGTCC‑TTCATGTCGATTTGGGtttgtccgg > 2:156968/1‑232 (MQ=255)
ggTGATGCCTATCTTCATTATTCCTATCGTCGGCACACTGATTACCGCAGGCATCATGATGTGGGGCTTGGGCGAGCCTGTAGGGGCGTTGACCAACAGCCTGACTCAGTGGCTTCAGGGGATGCAGCAGGGCAGCATTGTTATGCTGGCGGTGAT‑CATGGGGCTGATGCTGTCGTTCGATATGGGC‑GGTCCGGTT‑TACAAAGTGGCCTATTCC‑TTACTGTTGGTTTTCGTTGCTCAgg > 1:468214/1‑239 (MQ=255)
gtgctgcttttttttatttttCCTTTCGTGGGCACCCTGATTACCGCAGGCATCATGATGTGGGGCTTGGGCGAGCCTGTAGGGGCGTTGACCAACAGCCTGACTCAGTGGCTTCAGGGGATGCAGCAGGGCAGCATTGTTATGCTGGCGGTGAT‑CATGGGTCTGATGCTGGCGTTCGATATGGGC‑GGTCCGGTT‑AACAAAGTGGCCTATGCC‑TTCATGCTGATTTGCGTTGCTCAggg < 2:451797/224‑1 (MQ=255)
ttaTGCCTATCTTCATTATTCCTATCGTCGGCACACTGATTACCGCAGGCATCATGATGTGGGGCTTGGGCGAGCCTGTAGGGGCGTTGACCAACAGCCTGACTCAGTGGCTTCAGGGGATGCAGCAGGGCAGCATTGTTATGCTGGCGGTGAT‑CATGGGTCTGATGCTGGCGTTCGATATGGGC‑GGTCCGGTT‑AACAAAGTGGCCTATGCC‑TTCATGCTGATTTGCGTTGCTCAggg < 1:825670/236‑1 (MQ=255)
tGATCCCTAGCTTCATTATTCCTATCGGCGGCACACGGATTACCGCAGGCAACATGATGTGGGGCTTGGGCGAGCCTGTAGGGGCGTTGACCAACAGCCTGACTCAGTGGCTTCAGGGGATGCAGCAGGGCAGCATTGTTATGCTGGCGGTGAT‑CATGGGTCTGATGCTGGCGTTCGATATGGGC‑GGTCCGGTT‑AACAAAGTGGCCTATGCC‑TTCATGCTGATTTGCGTTGCTCAggg < 1:669403/238‑1 (MQ=255)
tgcttttttttatttttCTTTTCGTCGGCCCACTGATTACCGCAGGCATAATGATTGGGGGCTTGGGCGAGCCTGTAGGGGCGTTGACCAACAGCCTGACTCAGTGGCTTCAGGGGATGCAGCAGGGCAGCATTGTTATGCTGGCGGTGAT‑CATGGGTCTGATGCTGGCGTTCGATATGGGC‑GGTCCGGTT‑AACAAAGTGGCCTATGCC‑TTCATGCTGATTTGCGTTGCTCAGGgtgt < 2:53663/227‑1 (MQ=255)
aTCTTCATTATTCCTATCGTCGGCACACTGATTACCGCAGGCATCATGATGTGGGGCTTGGGCGAGCCTGTAGGGGCGTTGACCAACAGCCTGACTCAGTGGCTTCAGGGGATGCAGCAGGGCAGCATTGTTATGCTGGCGGGGAT‑CATGGGTCTGATGCTGGCGTTCGATATGGGC‑GGGCCGGGT‑AACAAAATGGCCTATGCC‑TTCATGCTGATTTGCGTTGCGCGGGGGGtttt > 1:462343/1‑235 (MQ=255)
ttCCTATCGTCGGCACACTGATTACCGCAGGCATCATGATGTGGGGCTTGGGCGAGCCTGTAGGGGCGTTGACCAACAGCCTGACTCAGTGGCTTCAGGGGATGCAGCAGGGCAGCATTGTTATGCTGGCGGTGAT‑CATGGGTCTGATGCTGGCGTTCGATATGGGC‑GGTCCGGTT‑AACAAAGTGGCCTATGCC‑TTCATGCTGATTTGCGTTGCTCAGGgtgt < 1:166671/223‑1 (MQ=255)
ccTATCGTCGGCACACTGATTACCGCAGGCATCATGATGTGGGGCTTGGGCGAGCCTGTAGGGGCGTTGACCAACAGCCTGACTCAGTGGCTTCAGGGGATGCAGCAGGGCAGCATTGTTATGCTGGCGGTGAT‑CATGGGGCTGCTGCTGGCGTTCGATATGGGC‑GGTCCGGTT‑AACAAAAGGGCCTATGCC‑CTCTTTCTTGTTTGCTTTGCTCAGGGGGTTTATACCG‑TGGTGG‑CCa > 1:450141/1‑238 (MQ=255)
cTATCGTCGGCACACTGATTACCGCAGGCATCATGATGTGGGGCTTGGGCGAGCCTGTAGGGGCGTTGACCAACAGCCTGACTCAGTGGCTTCAGGGGATGCAGCAGGGCAGCATTGTTATGCTGGCGGTGAT‑CATGGGTCTGATGCTGGCGTTCGATATTGGC‑GGTCCGGTT‑AACAAATGTGCCTATGCC‑TTCATCCTGCTTTGCGTTGCTCCGGGGGTTTTATCCG‑GGGTGG‑CCAt > 1:197646/1‑238 (MQ=255)
tATGGTGGGCACACGGAGTGCCGCAGGCATCGTGATGGGGGGCTTGGGCGAGCCTGTGGGGGCGTTGACCAACAGCCTGACTCAGTGGCTTCAGGGGATGCAGCAGGGCAGCATTGTTATGCTGGCGGTGAT‑CATGGGTCTGATGCTGGCGTTCGATATGGGC‑GGTCCGGTT‑AACAAAGTGGCCTATGCC‑TTCATGCTGATTTGCGTTGCTCAGGGTGTTTATACCG‑TGGTGG‑CCATCg < 2:82962/239‑1 (MQ=255)
aTCGTCGGCACACTGATTACCGCAGGCATCATGATGTGGGGCTTGGGCGAGCCTGTAGGGGCGTTGACCAACAGCCTGACTCAGTGGCTTCAGGGGATGCAGCAGGGCAGCATTGTTATGCTGGCGGTGGT‑CCTGGGGCCGGTGCTGGCGTTCGATATGGTG‑GGTCCGGTT‑GAAAAAAGGGCCTAAGCC‑TTCATGCTGGGTTTCGGTGCTTAGGGGGTTTTTACCG‑GGGGGG‑GCATCGc > 2:838243/1‑239 (MQ=255)
cggcggtacctttgttACCGCAGGCATTGTGGTGTGGGGCTTGGGCGAGCCTGTAGGGGCGTTGACCAACAGTCTGACTCAGTGGCTTCAGGGGATGCAGCAGGGCAGCATTGTTATGCTGGCGGTTAT‑CATGGGTCTGATGCTGGCGTTCGATATGGGC‑GGTCCGGTT‑AACAAAGTGGCCTATGCC‑TTCATGCTGATTTGCGTTGCTCAGGGTGTTTATACCG‑TGGTGG‑CCATCGCTg < 2:1019191/225‑1 (MQ=255)
tcgGCACACTGATTTCCGCAGGCATCCTGATGTGGGGATTGGGCGAGCCTGTAGGGGCGTTGACCAACAGCCTGACTCAGTGGCTTCAGGGGATGCAGCAGGGCAGCATTGTTATGCTGGCGGTGAT‑CATGGGTCTGATGCTGGCGTTCGATATGGGC‑GGTCCGGTT‑AACAAAGTGGCCTATGCC‑TTCATGCTGATTTGCGTTGCTCAGGGTGTTTATACCG‑TGGTGG‑CCATCGCTGcc < 1:312823/239‑1 (MQ=255)
cgGCACACTGATTACCGCAGGCATCATGATGTGGGGCTTGGGCGAGCCTGTAGGGGCGTTGACCAACAGCCTGACTCAGTGGCTTCAGGGGATGCAGCAGGGCAGCATTGTTATGCTGGCGGTGGT‑CCTGGGGCTGGTGCTGGGGGTCGGTATGGGG‑GGTCCGGTT‑AACAAAAGTGCCTATGGC‑TTTATGCTTATTTGCGGTGCTCCGGGGGTTTATACCg‑tgggtggctcttataca > 2:166671/1‑224 (MQ=255)
ccttGATTACCGAAGGCATCATGAGGTGGGGCTTGGGCGAGCCTGTAGGGGAGTTGACCAACAGCCTGACTCAGTGGCTTCAGGGGATGCAGCAGGGCAGCATTGTTATGCTGGCGGTGAT‑CATGGGTCTGATGCTGGCGTTCGATATGGGC‑GGTCCGGTT‑AACAAAGTGGCCTATGCC‑TTCATGCTGATTTGCGTTGCTCAGGGTGTTTATACCG‑TGGTGG‑CCATCGCTGCCGTg‑gg < 1:94613/235‑1 (MQ=255)
ggCATCATGCAGTGGGGCTTGGGCGAGCCTGTAGGGGCGTTGACCAACAGCCTGGCTCAGTGGCTTCAGGGGATGCAGGAGGGCAGCATTGTTATGCTGGCGGTGAT‑CATGGGTCTGATGCTGGCGTTCGATATGGGC‑GGTCCGGTT‑AACAAAGTGGCCTATGCC‑TTCATGCTGATTTGCGTTGCTCAGGGTGTTTATACCG‑TGGTGG‑CCATCGCTGCCGTG‑GGTATTTGTATCccgc < 1:205526/238‑1 (MQ=255)
gCATCATGATGTGGGGCTTGGGCGAGCCTGTAGGGGCGTTGACCAACAGCCTGACTCAGTGGCTTCAGTGGATGCAGCAGGGCAGCATTGTTATGCTGGCGGTGGA‑TATTGGTCTCAAGACGGGGGTCGGTAAGGGC‑GGGTCGGTT‑TCACAAGGGGCCCATGCG‑TTCAGTCTAGTTTTGGTTGCACCCGGGGTTTATACCGAGGGTGG‑CC‑CAGCTGCCGTG‑GGGAttgagaggcgccac > 2:928908/1‑227 (MQ=255)
attgtgtggtgGGGGTTGGGCGAGCCTGTAGGGGCGTTGACCAACGGCCTTGTTCAGTGGCTTCAGGGGATGCAGCAGGGCAGCATTGTGATGCTGGGGGTGAT‑CATGGGTCGGATGCTGGCGTTCGATATGGGC‑GGTCCGGTT‑AACAAAGTGGCCTATGCC‑TTCATGCTGATTTGCGTTGCTCAGGGTGTTTATACCG‑TGGTGG‑CCATCGCTGCCGTG‑GGTATTTGTATCCCGC‑CGCt < 2:661101/231‑1 (MQ=255)
gtggggggTTTGGGGGGGCCTGTGGGGGGGGTGACCAACAGCCGTACTCAGTGGCTTCAGGGGAGGCAGCAGGGCAGGATTGTTATGCTGGCGGTGAT‑CATGGGTCTGAGGCTGGCGTTCGATATGGGC‑GGTCCGGTT‑AACAAAGTGGCCTATGCC‑TTCATGCTGATTTGCGTTGCTCAGGGTGTTTATACCG‑TGGTGG‑CCATCGCTGCCGTG‑GGTATTTGTATCCCGC‑CGCTGGGGAt < 2:840244/235‑1 (MQ=255)
tgGGGCTTGGGCGAGCCTGTAGGGGCGTTGACCAACAGCCTGACTCAGTGGCTTCAGGGGATGCAGCAGGGCAGCATTGTTATGCTGGCGGTGAT‑CATGGGTCTGATGCTGGCGTTCGATATGGGC‑GGTCCGGTT‑AACAAAGTGGCCTATGCC‑TTCATGCTGATTTTCGTTGCTCAGGGGGTTTATACCG‑TGGTGG‑CCATCGCTGCCGCG‑GGGATTTGTATCCCGC‑CCCCTGGGTTggg > 1:923792/1‑239 (MQ=255)
gggCTTGGGCGAGCCTGTAGGGGCGTTGACCAACAGCCTGACTCAGTGGCTTCAGGGGATGCAGCAGGGCAGCATTGTTATGCTGGCGGTGAT‑CATGGGGCTGATGCTGGCGTTCGATATGGGC‑GGTCCGGTT‑AACAAAGTGGCCTATGCC‑TTCATGCTGATTTGCGTTGCTCCGGGGGTTTTTACCC‑GGGTGG‑GCATCGCTGCCGTG‑GGTATTTTGATCCCCC‑CGCTGGGGATggggg > 1:928451/1‑238 (MQ=255)
gCTTGGGCGAGCCTGTAGGGGCGTTGACCAACAGCCTGACTCAGTGGCTTCAGGGGATGCAGCAGGGCAGCATTGTTATGCTGGCGGTGAT‑CATGGGGCTGATGCTGGGGTTCGATCTGGGC‑GGGCCGGGT‑AACAAAGGGGGCTATGGC‑TTCCTGCTGGTTTGCGTTGCTCAGGGTGTTTATAACG‑TGGCGGCCCCCCGCTCCCG‑G‑GGGATTTGGATACCGC‑CCGGGGGGGTggggggg > 2:421429/1‑236 (MQ=255)
tGGGCGAGCCTGTAGGGGCGTTGACCAACAGCCTGACTCAGTGGCTTCAGGGGATGCAGCAGGGCAGCATTGTTATGCTGGCGGTGAT‑CATGGGTCTGATGCTGGCGTTCGATATGGGC‑GGTCCGGTT‑AACAAAGTGGCCTATGCC‑TTCATGCTGATTTTCGTTGCTCCGGGGGTTTTTACCG‑TGGTGG‑CCCTCGCTGCCGTG‑GGGATTTGTATCCCGC‑CCCTGGGGATGGGGGTgggg > 1:296746/1‑237 (MQ=255)
tGGGCGAGCCTGTAGGGGCGTTGACCAACAGCCTGACTCAGTGGCTTCAGGGGATGCAGCAGGGCAGCATTGTTATGCTGGCGGGGGG‑CATGGGGCTGGGGCCGGGGTTCGATATTGGC‑GGGCCGGTT‑CACAAAGGGGCCTATGCC‑TTCATGCTGGTTTGCGGTGCTCAGGGGGTTTTTACCC‑GGGTGG‑CCATCGCGGCCGGG‑GGGGTTTGTATCccgc‑ccgcggggggggggggggcg > 2:111619/1‑220 (MQ=255)
gggcggtccttgaGGGGCGTTGACCAACAGCCTGCCTCAGTGGCTTGGGGGGAGGCAGCAGGGCAGCATTGTTATGCTGGGGTTGAC‑AATGGGTCTGATGCGGGCGTTCGATATGGGC‑GGTCCGGTT‑AACAAAGTGGCCTATGCC‑TTCATGCTGATTTGCGTTGCTCAGGGTGTTTATACCG‑TGGTGG‑CCATCGCTGCCGTG‑GGTATTTGTATCCCGC‑CGCTGGGGATGGGGCTGGCGa < 2:610741/227‑1 (MQ=255)
aGCCTGTAGGGGCGTTGACCAACAGCCTGACTCAGTGGCTTCAGGGGCTGCAGGAGGGCAGCATTGTTCTGCTGGCGGGGAT‑CATGCGGCCGATTTTGGAGTTCGGTATGGGG‑CGTGCGGTTCCGCAATGGGGCC‑ATTCC‑TACAGGCCGGTTTGATGTGGCCAGGGGGTTTATACCG‑TTGTGG‑CCCT‑GCTGCCCCGCGGTCTTTGTTTCCCGCGCTCTGGGGGTggcgggggcagcgtg > 2:681296/1‑226 (MQ=255)
aGCCTGTAGGGGCGTTGACCAACAGCCTGACTCAGTGGCTTCAGGGGATGCAGCAGGGCAGCATTGTTATGCTGGCGGTGAT‑CATGGGTCTGATGCTGGCGTTCGATATGGGC‑GGTCCGGTT‑AACAAAGTGGCCTATGCC‑TTCATGCTGATTTGCGTTGCTc > 1:276634/1‑162 (MQ=255)
aGCCTGTAGGGGCGTTGACCAACAGCCTGACTCAGTGGCTTCAGGGGATGCAGCAGGGCAGCATTGTTATGCTGGCGGTGAT‑CATGGGTCTGATGCTGGCGTTCGATATGGGC‑GGTCCGGTT‑AACAAAGTGGCCTATGCC‑TTCATGCTGATTTGCGTTGCTc < 2:276634/162‑1 (MQ=255)
tAGGGGCGTTGACCAACAGCCTGACTCAGTGGCTTCAGGGGATGCAGCAGGGCAGCATTGTTATGCTGGCGGTGAT‑CATGGGTCTGATGCTGGCGTTCGATATGGGC‑GGTCCGGTT‑AACAAAGTGGCCTATGCC‑TTCATGCTGATTTGCGTTGCTCAGGGTGTTTATACCG‑TGGTGG‑CCATCGCTGCCGTg‑gg < 1:869815/193‑1 (MQ=255)
tAGGGGCGTTGACCAACAGCCTGACTCAGTGGCTTCAGGGGATGCAGCAGGGCAGCATTGTTATGCTGGCGGTGAT‑CATGGGTCTGATGCTGGCGTTCGATATGGGC‑GGTCCGGTT‑AACAAAGGGGCCTATGCC‑TTCATGCTGATTTGCGTTGCTCAGGGGGGTTTTACCG‑GGGGGG‑CCATCGCTGCCGTG‑GGGATTTGTATCCCGC‑CGCTGGGGTGGGGGCTgggcgccctggttggt > 1:176122/1‑225 (MQ=255)
gTTGACCAACAGCCTGACTCAGTGGCTTCAGGGGATGCAGCAGGGCAGCATTGTTATGCTGGCGGTGAT‑CATGGGGCTGATGCTGGCGTTCGATATGGGC‑GGTCCGGTT‑AACAAAATGGCCTATGCC‑TTCATGCTGATTTGCGTTGCTCAGGGTGTTTTTACCG‑TGGTGG‑CCATCGCTGCCGTG‑GGGATTTGTATTCCGC‑CGCTGGGGGTGGGGCTGGGGACGCTGCTTggcgggcaaa > 1:395337/1‑231 (MQ=255)
ttGACCAACAGCCTGACTCAGTGGCTTCAGGGGATGCAGCAGGGCAGCATTGTTATGCTGGCGGTGAT‑CCTGGGGCTGATGCTGGCGTTCGATATGGGC‑GGTCCGGTT‑TACAAAATGGCCTTTGCC‑TTCATGCTTGTTTGCGTTGCTCCGGGGGTTTATACCC‑TGGTGG‑CCATCCGCCCCGTG‑GGTTATTGTATTCCCC‑CGCGGGGGGTGGGCCTGGGGGCGCTGTTTGGGGGTaaaaa > 2:93076/1‑239 (MQ=255)
aCTCAGTGGCTTCAGGGGATGCAGCAGGGCAGCATTGTTATGCTGGCGGGGAT‑CATGGGTCTGATGCTGGCGTTCGATATGGGC‑GGTCCGGTT‑AAAAAAGTGGGCTATGCC‑TTCATGCTGGTTTGCGTTGCTCAGGGGGTTTATACCG‑TGGTGG‑CCCTCGCGGCCGGG‑GGGTTTTGTTTCCCGC‑CGCTGGGGATGGGGGGGGCGACGCTGGGTGGTCGTAAAAATTTCGCCGCggacgg > 2:1053488/1‑236 (MQ=255)
aGTGGCTTCAGGGGATGCAGCAGGGCAGCATTGTTATGCTGGCGGTGAT‑CATGGGTCTGATGCTGGCGTTCGATATGGGC‑GGTCCGGTT‑AACAAAGTGGCCTATGCC‑TTCATGCTGATTTGCGTTGCTCAGGGGGTTTATACCG‑TGGTGG‑CCATCGCTGCCGTG‑GGGATTTGTATCCCGC‑CGCTGGGGATGGGGCTGGCGACGCTGATTGGTCGGAAAAATTTCTCCCCAGCAGAgcgg > 1:168912/1‑238 (MQ=255)
tGGCTTCAGGGGATGCAGCAGGGCAGCATTGTTATGCTGGCGGTGAT‑CATGGGTCTGATGCTGGCGTTCGATATGGGC‑GGTCCGGGT‑AACAAAGTGGCCTATGCC‑TTCATGCTGGTTTGCGTTGCTCAGGGGGTTTATACCG‑TGGTGG‑CCATCGCTGCCGTG‑GGTATTTGTATCCCGC‑CGCTGGGGATGGGGCTGGCGACGCCGGTTGGTCGGAAAAATTTCTCCGCAGAAGAGcgcgg > 1:204745/1‑238 (MQ=255)
aggggggttggcgggggAAGGATTTTTTTGCGGGGGGTGAT‑CAGGGGTCTGATGCTGGGGTTGGATATGGGG‑GGTCCGTTT‑AACAAAGTGGCCTATGCC‑TTCATGCTGATTTGCGTTGCTCAGGGGGTTTATACCG‑TGGTGG‑CCATCGCTGCCGTG‑GGTATTTGTATCCCGC‑CGCTGGGGATGGGGCTGGCGACGCTGATTGGTCGTAAAAATTTCTCCGCAGAAGAGCGCGAAACCgg < 2:197646/225‑1 (MQ=255)
gcaggaGGGCAGCATTGTTATGTTGGCGGTGAT‑CATGGGTTTGATGCTGGCGTTCGATATGGGC‑GGTCCGGTT‑AACAAAGTGGCCTATGCC‑TTCATGCTGATTTGCGTTGCTCAGGGTGTTTATACCG‑TGGTGG‑CCATCGCTGCCGTG‑GGTATTTGTATCCCGC‑CGCTGGGGATGGGGCTGGCGACGCTGATTGGTCGTAAAAATTTCTCCGCAGAAGAGCGCGAAACCGGCAAAGCgg < 1:525300/239‑1 (MQ=255)
gcagcaGGGCAGCATTGTTATGCTGGCGGTGAT‑CATGGGTCTGATGCTGGCGTTCGATATGGGC‑GGTCCGGTT‑AACAAAGTGGCCTATGCC‑TTCATGCTGATTTGCGTTGCTCAGGGGGTTTATACCG‑TGGTGG‑CCATCGCTGCCGTG‑GGGATTTGTATCCCGC‑CGCTGGGGCTGGGGCTGGCGACGCTGATTGGTCGTAAAAATTTTTCCCCAGAAGAGCGCGGAACCGGCAAACCg > 1:155293/1‑238 (MQ=255)
agcagGGCAGCATTGTTATGCTGGCGGTGAT‑CATGGGTCTGATGCTGGCGTTCGATATGGGC‑GGTCCGGTT‑AACAAAGTGGCCTATGCC‑TTCATGCTGATTTGCGTTGCTCAGGGTGTTTATACCG‑TGGTGG‑CCATCGCTGCCGTg‑gg < 1:835746/148‑1 (MQ=255)
tggggtgggaTTGTTATGCTGGAGGTGAT‑CATGGGTTTGATGCGTGCGTTCGATATGGGC‑GGTCCGGTT‑AACAAAGTGGCCTATGCC‑TTCATGCTGATTGGCGTTGCTCAGGGTGTTTATACCG‑TGGTGG‑CCATCGCTGCCGTG‑GGTATTTGTATCCCGC‑CGCTGGGGATGGGGCTGGCGACGCTGATTGGTCGTAAAAATTTCTCCGCAGAAGAGCGCGAAACCGGCAAAGCGGCAc < 1:397078/229‑1 (MQ=255)
cagGGCGGTATTGTTATTTTGG‑GGGGATATATGAGTTTGAGGATGGCGTTTGAGATGGGT‑GTTCCGGTT‑AAGAAGGTTGCCTAGGCC‑TTAATGTTGATTGGCGTTGCACAGGGTGTTGATGCCG‑TGGTGG‑CCATCGCTGCCGTG‑GGTATTTGTACCCCGC‑CGCTGGGGATGGGGCTGGCGACGCTGATTGGTCGTAAAAATTTCTCCGCAGAAGAGCGCGAAACCGGCAAAGCGGCAc < 2:477281/238‑1 (MQ=255)
caTTGTTATGCTGGCGGTGAT‑CATGGGTCTGATGCTGGCGTTCGATATGGGC‑GGTCCGGTT‑AACAAAGTGGCCTATGCC‑TTCATGCTGATTTGCGTTGCTCAGGGTGTTTATACCG‑TGGTGG‑CCATCGCTGCCGTG‑GGGATTTGTATCCCGC‑CGCTGGGGGTGGGGCTGGCGACGCTGGTTGGGCGTAAAAATTTCTCCGCAGAAGAGCGCGGAACCGGCAAAGCGGCACTgggtacgg > 1:905834/1‑233 (MQ=255)
ttAGGCTGGCGGTGAT‑CATGGGTCTGATGCTGGCGTTCGATATGGGC‑GGTCCGGTT‑AACAAAGGGGCCTATGCC‑TTCATGCTGATTTGCGTTGCTCAGGGTGTTTATACCG‑TGGTGG‑CCATCGCTGCCGTG‑GGTATTTGTATCCCGC‑CGCTGGGGATGGGGCTGGCGACGCTGATTGGTCGTAAAAATTTCTCCGCAGAAGAGCGCGAAACCGGCAAAGCGGCACTGGTGATggg < 1:757257/235‑1 (MQ=255)
tGCTGGCGGTGAT‑CATGGGTCTGATGCTGGCGTTCGATATGGGC‑GGTCCGGTT‑AACAAAGTGGCCTATGCC‑TTCATGCTGATTTGCGTTGCTCAGGGTGTTTATACCG‑TGGTGG‑CCATCGCTGCCGt > 1:889835/1‑127 (MQ=255)
tGCTGGCGGTGAT‑CATGGGTCTGATGCTGGCGTTCGATATGGGC‑GGTCCGGTT‑AACAAAGTGGCCTATGCC‑TTCATGCTGATTTGCGTTGCTCAGGGTGTTTATACCG‑TGGTGG‑CCATCGCTGCCGt < 2:889835/127‑1 (MQ=255)
aagagaatgggtatctggggTGTGATGCTGGCGTTCGATGTGGGG‑GTTTCGGTT‑AACAAAGTGGCCGTTGCT‑TTCAGGCTGATTTGCGTTGCTCAGGTTGTTTATACCG‑TGGTGG‑CCATCGCGGCCGTG‑GGTATTGGTATCCCGC‑CGCTGGGGATGGGGCTGGCGACGCTGATTGGTCGTAAAAATGTCTCCGCAGAAGAGCGCGAAACCGGCAAAGCGGCACTGGTGATGGGCTgt‑gt < 2:749589/222‑1 (MQ=255)
cTGGCGGTGAT‑CATGGGTCTGATGCTGGCGTTCGATATGGGC‑GGTCCGGTT‑AACAAAGGGGCCTATGCC‑CTCATGCTGATTTTGGGTGCCCAGGGGGTTTATACCG‑GTGTGG‑GCATTGCTGCCGTG‑GGGATTTTTATCCCGC‑CGCTGGGGGTGGGGCTGGGGACGCTGTTTTGGCGGAAAAATTTTCCCGCCGAAGAGGGCGAAACCGGCGAAGGGGCCCGGGGGGTGGGGtgt‑ggggg > 2:680229/1‑235 (MQ=255)
ggTGAT‑CATGGGTCTGATGCTGGCGTTCGATATGGGC‑GGTCCGGTT‑AACAAAGTGGCCTATGCC‑TTCATGCTGATTTGGGTTGCTCCGGGGGTTTAAACCG‑GGGGGG‑CCCTCGCTGCCGGG‑GGGATTTGTATCCCGC‑CGCTGGGGGTGGGGCTGGCGGCGGTGATTGGGCGGAAAAAATTCTTCCGAGAACGACGGGCAAACGGCAAAGCGGCCCTgggggagggggggtttgggggta > 2:644549/1‑218 (MQ=255)
t‑CATGGTTCTGATGCGGGCATTCGATATGGGC‑GGTCCGGTT‑AACAAAGTGGCCTATGCC‑TTCATGCTGAGTTGCGTGGCTCAGGGTGTTTATACCG‑TGGTGG‑CCATCGCTGCCGTG‑GGTATTTGTATCCCGC‑CGCTGGGGATGGGGCTGGCGACGCTGATTGGTCGTAAAAATTTCTCCGCAGAAGAGCGCGAAACCGGCAAAGCGGCACTGGTGATGGGCTGT‑GTTGGCGTTACTGa < 1:1074874/238‑1 (MQ=255)
tGGGTCTGATGCTGGCGTTCGATATGGGC‑GGTCCGGTT‑AACAAAGTGGCCTATGCC‑TTCATGCTGATTTGCGTTGCTCAGGGTGTTTATACCG‑TGGTGG‑CCATCGCTGCCGTG‑GGTATTTGTATCCCGC‑CGCTGGGGATGGGGCTGGCGACGCGGATGGGTCGTAAAAATTTCTCGCCGGAAGAGGGCGAAACCGGCCAGGCGGCACTGGGGTTGGGCGGG‑TTGGGGGTTAAGGAAggg > 2:853870/1‑239 (MQ=255)
tttGAGGCTGGGCTTCGTTATGGGC‑GGTCCGGTT‑AACAAAGTGGCCTTGGCC‑TTCATGCTGATTTGCGTTGCTCAGGGTGTTTATACCG‑TGGTGG‑CCATCGCTGCCGTG‑GGTATTTGTATCCCGC‑CGCTGGGGATGGGGCTGGCGACGCTGATTGGTCGTAAAAATTTCTCCGCAGAAGAGCGCGAAACCGGCAAAGCGGCACTGGTGATGGGCTGT‑GTTGGCGTTACTGAAGGGGCg < 1:850336/236‑1 (MQ=255)
tCTGATGCTGGCGTTCGATATGGGC‑GGTCCGGTT‑AACAAAGTGGCCTATGCC‑TTCATGCTGATTTGCGTTGCTCAGGGTGTTTATACCG‑TGGTGG‑CCATCGCTGCCGTG‑GGTATTTGTATCCCGC‑CGCTGGGGATGGGGCTGGCGACGCTGATTGGTCGTAAAAATTTCTCCGCAGAAGAGCGCGAAACCGGCAAAGCGGCACTGGTGATTGGCTGT‑GTTGGCGttctt > 1:749589/1‑226 (MQ=255)
tGATGCTGGCGTTCGATATGGGC‑GGTCCGGTT‑AACAAAGTGGCCTATGCC‑TTCATGCTGATTTGCGTTGCTCAGGGTGTTTATACCG‑TGGTGG‑CCATCGCTGCCGTG‑GGTATTTGTATCCCGC‑CGCTGGGGATGGGGCTGGCGACGCTGATTGGTCGTAAAAATTTCTCCGCAGAAGAGCGCGACACGGGCAAGGGGGCACTGGGGATGGGCTGTGGTTGGGGAT‑CTAAAGGGGCgta > 2:625021/1‑236 (MQ=255)
aTGCTGGCGTTCGATATGGGC‑GGTCCGGTT‑AACAAAGTGGCCTCTGCC‑TTCATGCTGATTTGCGTTGCTCAGGGTGTTTATACCG‑TGGTGG‑CCATCGCTGCCGTG‑GGTATTTGTATCCCGC‑CGCTGGGGATGGGGCTGGCGACGCTGATGGGTCGTAAAAATTTCTCCGCGGAAGAGGGCGACACCGGCAAGGAGGCCCTGGGGATGGGCGGT‑GTTGGGGTTACTAAAGGGGCgtgt > 2:828241/1‑234 (MQ=255)
aTGCTGGCGTTCGATATGGGC‑GGTCCGGTT‑AACAAAGTGGCCTATGCC‑TTCATGCTGATTTGCGTTGCTCAGGGTGTTTATACCG‑TGGTGG‑CCATCGCTGCCGTG‑GGTATTTGTATCCCGC‑CGCTGGGGAt > 1:648207/1‑131 (MQ=255)
aTGCTGGCGTTCGATATGGGC‑GGTCCGGTT‑AACAAAGTGGCCTATGCC‑TTCATGCTGATTTGCGTTGCTCAGGGTGTTTATACCG‑TGGTGG‑CCATCGCTGCCGTG‑GGTATTTGTATCCCGC‑CGCTGGGGAt < 2:648207/131‑1 (MQ=255)
aTGCTGGCGTTCGATATGGGC‑GGTCCGGTT‑AACAAAGTGGCCTATGCC‑TTCATGCTGATTTGCGTTGCTCAGGGTGTTTATACCG‑TGGTGG‑CCATCGCTGCCGTG‑GGTATTTGTATCCCGC‑CGCTGGGGATGGGGCTGGCGACGCTGATTGGTCGTAAAAATTTCTCCGCAGAAGAGCGCGAAACCGGCAAAGCGGCACTGGTGATGGGCTGT‑GTTGGCGTTACTGAAGGGGCGAtt > 1:881107/1‑237 (MQ=255)
gtccGATATGGGC‑GGTCCGGTT‑ACCAAAGTGGCCTATGCC‑TTCATGCTGATTTGCGTTGCTCGGGTTGTTTATACCG‑TGGTGG‑CCATCGCTGCCGTG‑GGTATTTGTATCCCGC‑CGCTGGGGATGGGGCTGGCGACGCTGATTGGTCGTAAAAATTTCTCCGCAGAAGAGCGCGAAACCGGCAAAGCGGCACTGGTGATGGGCTGT‑GTTGGCGTTACTGAAGGGGCGATTCCTTTcgcc < 1:696965/235‑1 (MQ=255)
gTTCGATATGGGC‑GGTCCGGTT‑AACAAAGTGGCCTATGCC‑TTCATGCTGATTTGCGTTGCTCAGGGGGTTTATACCG‑TGGTGG‑CCATCGCTGCCGTG‑GGGATTTGTATCCCGC‑CGCTGGGGATGGGGCTGGCGACGCTGATTGGTCGTAAAAATTTCTCCGCAGAAGAGCGCGAAACCGGCAAAGCGGCACTGGTGATGGGCTGT‑GTTGGCGTTACTGACGGGGCGATTCCTTTcgccg > 1:921758/1‑239 (MQ=255)
gTCGGGTG‑AAAAAGGTGGCCT‑TGCCTTTCACGCGTGTTTGGGTTGGACGGGTTGTTTATGCCG‑GGGGGG‑CCATCGCTGCGGTG‑TGTTTTTGGACACCGC‑CGCGGGGGATGGGGCTGTCGACGCTGATTGGTCGTAAAAATTTCTCCGCAGAAGAGCGCGAAACCGGCAAAGCGGCACTGGTGATGGGCTGT‑GTTGGCGTTACTGAAGGGGCGATTCCTTTCGCCGCTGCCGATCCGCt < 2:671999/238‑1 (MQ=255)
gTCCTGTT‑AACAAGGTGGCCTATGCC‑TTCATGCTGATTTGCGTTGCTCAGGGTGTTTATCCCG‑TGGGGG‑CCATCGCTGCCGTG‑GGTATTTGTACCCCGC‑CGCTGGGGATGGGGCTGGCGACGCTGATTGGTCGTAAAAATTTCTCCGCAGAAGAGCGCGAAACCGGCAAAGCGGCACTGGTGATGGGCTGT‑GTTGGCGTTACTGAAGGGGCGATTCCTTTCGCCGCTGCCGATCCGCt < 1:928908/238‑1 (MQ=255)
gTCCGGTT‑AACAAAGTGGCCTATGCC‑TTCATGCTGATTTGCGTTGCTCAGGGTGTTTATACCG‑TGGTGG‑CCATCGCTGCCGTG‑GGTATTTGTATCCCGC‑CGCt < 1:729739/103‑1 (MQ=255)
gTCCGGTT‑AACAAAGTGGCCTATGCC‑TTCATGCTGATTTGCGTTGCTCAGGGTGTTTATACCG‑TGGTGG‑CCATCGCTGCCGTG‑GGTATTTGTATCCCGC‑CGCt > 2:729739/1‑103 (MQ=255)
gTCCGGTT‑AACAAAGGGGCCTATGCC‑TTCATGCTGATTTGCGTTGCTCAGGGTGTTTATCCCG‑TGGTGG‑CCATCGCTGCCGTG‑GGTATTTGTATCCCGC‑CGCTGGGGATGGGGCTGGCGACGCTGATTGGTCGTAAAAATTTCTCCGCAGAAGAGCGCGAAACCGGCAAAGCGGCACTGGTGATGGGCTGT‑GTTGGCGTTACTGAAGGGGCGATTCCTTTCGCCGCTGCCGATCCGCt < 1:848740/238‑1 (MQ=255)
cgttt‑AACAAATTGGCCTATGCC‑TTCATGCTGATTTGCGTTGCTCAGGGTGTTTATACCG‑TGGTGG‑CCATCGCTGCCGTG‑GGTATTTGTATCCCGC‑CGCTGGGGATGGGGCTGGCGACGCTGATTGGTCGTAAAAATTTCTCCGCAGAAGAGCGCGAAACCGGCAAAGCGGCACTGGTGATGGGCTGT‑GTTGGCGTTACTGAAGGGGCGATTCCTTTCGCCGCTGCCGATCCGCTGCgt < 1:111619/236‑1 (MQ=255)
cGGTT‑AACAAAGTGGCCTTTGCC‑TTCATGCTGATTTGCGTTGCTCAGGGTGTTTATCCCG‑TGGTGG‑CCATCGCTGCCGTG‑GGTATTTGTATCCCGC‑CGCTGGGGATGGGGCTGGCGACGCTGATTGGTCGTAAAAATTTCTCCGCAGAAGAGCGCGAAACCGGCAAAGCGGCACTGGTGATGGGCTGT‑GTTGGCGTTACTGAAGGGGCGATTCCTTTCGCCGCTGCCGATCCGCTGCgt < 1:421429/239‑1 (MQ=255)
cGGTT‑AACAAAGGGGCCTATGCC‑TTCATGCTGATTTGCGTTGCTCAGGGTGTTTATACCG‑TGGTGG‑CCATCGCTGCCGTG‑GGTATTTGTATCCCGC‑CGCTGGGGATGGGGCTGGCGACGCTGATTGGTCGTAAAAATTTCTCCGCAGAAGAGCGCGAAACCGGCAAAGCGGCACTGGTGATGGGCTGT‑GTTGGCGTTACTGAAGGGGCGATTCCTTTCGCCGCTGCCGATCCGCTGCgt < 1:93076/239‑1 (MQ=255)
aaGTGGCCTATGCC‑TTCATGCTGATTGGCGTTGCTCGGGGTGTTTATACCG‑TGGTGG‑CCATCGCTGCCGTG‑GGTATTTGTATCCCGC‑CGCTGGGGATGGGGCTGGCGACGCTGATTGGTCGTAAAAATTTCTCCGCAGAAGAGCGCGAAACCGGCAAAGCGGCACTGGTGATGGGCTGT‑GTTGGCGTTACTGAAGGGGCGATTCCTTTCGCCGCTGCCGATCCGCTGCGTGTCAttcct < 1:625021/239‑1 (MQ=255)
tGGCCTATGCC‑TTCATGCTGATTTGCGTTGCTCAGGGTGTTTATACCG‑TGGTGG‑CCATCGCTGCCGTG‑GGTATTTGTATCCCGC‑CGCTGGGGATGGGGCTGGCGACGCTGATTGGTCGTAAAAATTTCTCCGCAGAAGAGCGCGAAACCGGCAAAGCGGCACTGGTGATGGGCGGG‑GTTGGCGTTACGGAAGGGGAGAGTCCTTTCGCCGCTGCCGGTCCCCTGCGTGTGCttccttga > 2:492693/1‑237 (MQ=255)
tGGCCTATGCC‑TTCATGCTGATTTGCGTTGCTCAGGGTGTTTATACCG‑TGGTCG‑CCATCGCTGCCGTG‑GGTATTTGTATCCCGC‑CGCTGGGGATGGGGCTGGCGACGCTGATTGGTCGTAAAAATTTCTCCGCAGAAGACCGCGAAACCGGCAAAGAGGCACTGGTGATGGGCTGT‑GTTGCCGTTCCTAGAGGGCCGCTTCCTTTTGCCGGTGCCGATCCGCGGCGTGTCAtccttgcc > 2:630912/1‑232 (MQ=255)
gCC‑TTCATGCTGTTTTTCGGTGCTAAGGGGTTTTATACCG‑TGGTGG‑CCATCGCTGCCGTG‑GGTATTTGTATCCCGC‑CGCTGGGGATGGGGCTGGCGACGCTGATTGGTCGTAAAAATTTCTCCGCAGAAGAGCGCGAAACCGGCAAAGCGGCACTGGTGATGGGCTGT‑GTTGGCGTTACTGAAGGGGCGATTCCTTTCGCCGCTGCCGATCCGCTGCGTGTCATTCCTTCCATCATGGt < 1:630912/239‑1 (MQ=255)
gCC‑TTCATGCTGGTTTGCGTTGCTCAGGGGGTTAATGCCG‑GGGTGG‑CCATCGTGGCCGGG‑GGTATTTGTAGCCCGC‑CGCTGGGGATGGGGCTGGCGACGCTGATTGGTCGTAAAAATTTCTCCGCAGAAGAGCGCGAAACCGGCAAAGCGGCACTGGTGATGGGCTGT‑GTTGGCGTTACTGAAGGGGCGATTCCTTTCGCCGCTGCCGATCCGCTGCGTGTCATTCCTTCCATCATGGt < 1:237526/239‑1 (MQ=255)
gCC‑TTCATGCTGATTTGCGTTGCTAAGGGTTTTTATACCG‑TGGTGG‑CCATCGCTGCCGTG‑GGTATTTGTATCCCGC‑CGCTGGGGATGGGGCTGGCGACGCTGATTGGTCGTAAAAATTTCTCCGCAGAAGAGCGCGAAACCGGCAAAGCGGCACTGGTGATGGGCTGT‑GTTGGCGTTACTGAAGGGGCGATTCCTTTCGCCGCTGCCGATCCGCTGCGTGTCATTCCTTCCATCATGGt < 1:32944/239‑1 (MQ=255)
tCATGCTGATTTGCGTTGCTCAGGGTGTTTATACCG‑TGGTGG‑CCATCGCTGCCGTG‑GGTATTTGTATCCCGC‑CGCTGGGGATGGGGCTGGCGACGCTGATTGGTCGTAAAAATTTCTCCGCAGAAGAGCGCGAAACCGGCAAAGCGGCACTGGTGATGGGCTGT‑GTTGGCGTTACTGaa > 1:629938/1‑179 (MQ=255)
cTGATTTGCGTTGCTCAGGGTGTTTATACCG‑TGGTGG‑CCATCGCTGCCGTG‑GGTATTTGTATCCCGC‑CGCTGGGGATGGGGCTGGCGACGCTGATTGGTCGTAAAAATTTCTCCGCAGAAGAGCGCGAAACCGGCAAAGCGGCACTGGTGATGGGCTGT‑GTTGGCGGTACGGAAGGGGCGATTCCTTTCGCCGCTGCCGATCCGCGGCGGGCCATGCCTTCCATCATGGTCGGGTCGGt > 2:32944/1‑239 (MQ=255)
aTTTGCGTTGCTCAGGGTGTTTATACCG‑TGGTGG‑CCATCGCTGCCGTG‑GGTATTTGTATCCCGC‑CGCTGGGGATGGGGCTGGCGACGCTGATTGGTCGTAAAAATTTCTCCGCAGAAGAGCGCGAAACCGGCAAAGCGGCACTGGTGATGGGCTGT‑GTTGGCGt > 2:614546/1‑164 (MQ=255)
aTTTGCGTTGCTCAGGGTGTTTATACCG‑TGGTGG‑CCATCGCTGCCGTG‑GGTATTTGTATCCCGC‑CGCTGGGGATGGGGCTGGCGACGCTGATTGGTCGTAAAAATTTCTCCGCAGAAGAGCGCGAAACCGGCAAAGCGGCACTGGTGATGGGCTGT‑GTTGGCGt < 1:614546/164‑1 (MQ=255)
|
TTCTGCGCTCGGTGATGCCTATCTTCATTATTCCTATCGTCGGCACACTGATTACCGCAGGCATCATGATGTGGGGCTTGGGCGAGCCTGTAGGGGCGTTGACCAACAGCCTGACTCAGTGGCTTCAGGGGATGCAGCAGGGCAGCATTGTTATGCTGGCGGTGAT‑CATGGGTCTGATGCTGGCGTTCGATATGGGC‑GGTCCGGTT‑AACAAAGTGGCCTATGCC‑TTCATGCTGATTTGCGTTGCTCAGGGTGTTTATACCG‑TGGTGG‑CCATCGCTGCCGTG‑GGTATTTGTATCCCGC‑CGCTGGGGATGGGGCTGGCGACGCTGATTGGTCGTAAAAATTTCTCCGCAGAAGAGCGCGAAACCGGCAAAGCGGCACTGGTGATGGGCTGT‑GTTGGCGTTACTGAAGGGGCGATTCCTTTCGCCGCTGCCGATCCGCTGCGTGTCATTCCTTCCATCATGGTCGGTTCAGT > NC_000913/4142911‑4143379
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 13 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
GATK/CNVnator alignment
N/A