Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A7 F28 I0 R1
|
140 |
172.9 |
3477528 |
97.9% |
3404499 |
226.2 |
Breseq alignment
BRESEQ :: Evidence
|
| evidence |
seq id |
position |
mutation |
freq |
annotation |
gene |
description |
| RA |
NC_000913 |
2,040,088 |
A→T |
13.8% |
Y204F (TAT→TTT) |
yedY → |
membrane‑anchored, periplasmic TMAO, DMSO reductase |
|
| |
seq id |
position |
ref |
new |
freq |
score (cons/poly) |
reads |
annotation |
genes |
product |
| * | NC_000913 | 2,040,088 | 0 | A | T | 13.8%
| 185.1
/ 3.8
| 82 | Y204F (TAT→TTT) | yedY | membrane‑anchored, periplasmic TMAO, DMSO reductase |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (16/53); new base T (9/3); total (25/57) |
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 8.76e-04 |
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 |
ATGACTTAACCCGTCGCTTCCCGCTGGAAGAGCGTATTTATCGTATGCGCTGCGTGGAAGCGTGGTCGATGGTGGTGCCGTGGATTGGTTTTCCGCTGCACAAATTGCTGGCGCTTGCCGAACCTACCAGCAATGC‑GAAGTATGTCGCTTTCGAAACAATTTATGCACCGGAACAGATGCCA‑GGCCAGCAGGACCGCTTT‑ATCGGCGGTGGGCTGAAATATCCTTATGTCGAAGGATTGCGTCTC‑GACGAAGCAATGCATCCGCTCACACTGA‑TGACCGTAGGTG‑TTTATGGCAAGGCGTTACCGCCACAAAATGGCGCGCCGGTGCGACTGATTGTGCCGTGGAAATATGGCTTTAAAGGGATTAAATCGATAGTCAGTATTAAGCTGACCCGCGAGCGTCCGCCAACCACCTGGAATCTGGCAGCGCCTGACGAATACGGTTTTTACGCCAACGTTAATCCG > NC_000913/2039863‑2040326
|
atgaCTTAACCCGTCGCTTCCCGCTGGAAGAGCGTATTTATCGTATGCGCTGCGTGGAAGCGTGGTCGATGGTGGTGCCGTGGATTGGTTTTCCGCTGCACAAATTGCTGGCGCTTGCCGAACCTACCAGCAATGC‑GAAGTATGTCGCTTTCGAAACAATTTATGCACCGGAACAGATGCCA‑GGCCAGCAGGACCGCTTT‑ATCGGCGGTGGGCGGAAATATTCTTATTTCGAAGGAttt > 2:1645912/1‑238 (MQ=255)
aCTTAACCCGTCGCTTCCCGCTGGAAGAGCGTATTTATCGTATGCGCTGCGTGGAAGCGTGGTCGATGGTGGTGCCGTGGATTGGTTTTCCGCTGCACAAATTGCTGGCGCTTGCCGAACCTACCAGCAATGC‑GAAGTATGTCGCTTTCGAAACAATTTATGCACCGGAACAGATGCCA‑GGCCAGCAGGACCGCTTT‑ATCGGCGGGGGGGTGGAATATCCTTTTCTCGGAGGAGTgggg > 1:1091456/1‑236 (MQ=255)
cTTAACCCGTCGCTTCCCGCTGGAAGAGCGTATTTATCGTATGCGCTGCGTGGAAGCGTGGTCGATGGTGGTGCCGTGGATTGGTTTTCCGCTGCACAAATTGCTGGCGCTTGCCGAACCTACCAGCAATGC‑GAAGTATGTCGCTTTCGAAACAATTTATGCACCGGAACAGATGCCA‑GGCCAGCAGGACCGCTTT‑ATCGGCGGTGGGCTGAAATATCCTTATGTCGAAGGATTGCGt < 2:131145/238‑1 (MQ=255)
ttAACCCGTCGCTTCCCGCTGGAAGAGCGTATTTATCGTATGCGCTGCGTGGAAGCGTGGTCGATGGTGGTGCCGTGGATTGGTTTTCCGCTGCACAAATTGCTGGCGCTTGCCGAACCTACCAGCAATGC‑GAAGTATGTCGCTTTCGAAACAATTTATGCACCGGAACAGATGCCA‑GGCCAGCAGGACCGCTTT‑ATCGGCGGTGGGGGGAAATATCCTTTTGTCGAAGGAGTGCGtc > 2:74301/1‑238 (MQ=255)
ttAACCCGTCGCTTCCCGCTGGAAGAGCGTATTTATCGTATGCGCTGCGTGGAAGCGTGGTCGATGGTGGTGCCGTGGATTGGTTTTCCGCTGCACAAATTGCTGGCGCTTGCCGAACCTACCAGCAATGC‑GAAGTATGTCGCTTTCGAAACAATTTATGCACCGGAACAGATGCCA‑GGCCAGCAGGACCGCTTT‑ATCGGCGGGAGGCTGGTATATACGATTTTCGAAGGagttgttg > 1:113557/1‑231 (MQ=255)
aCCCGTCGCTTCCCGCTGGAAGAGCGTATTTATCGTATGCGCTGCGTGGAAGCGTGGTCGATGGTGGTGCCGTGGATTGGTTTTCCGCTGCACAAATTGCTGGCGCTTGCCGAACCTACCAGCAATGC‑GAAGTATGTCGCTTTCGAAACAATTTATGCACCGGAACAGATGCCA‑GGCCAGCAGGACCGCTTT‑ATCGGCGGTGGGGTGTAATATCCTTTTGTCGGAGGAATgtgtgccg > 2:1024379/1‑234 (MQ=255)
cccGTCGCTTCCCGCTGGAAGAGCGTATTTATCGTATGCGCTGCGTGGAAGCGTGGTCGATGGTGGTGCCGTGGATTGGTTTTCCGCTGCACAAATTGCTGGCGCTTGCCGAACCTACCAGCAATGC‑GAAGTATGTCGCTTTCGAAACAATTTATGCACCGGAACAGATGCCA‑GGCCAGCAGGACCGCTTT‑ATCGGCGGGGGGGTGAGATAACCTTATGTTGAAGGATTGCGGCTc‑gac > 2:848956/1‑239 (MQ=255)
cGTCGCTGCCCGCAGGAAGAGCTGATTTAGGGTATGCGGGGCTTGGAAGCGTGGTCGATGGTGGTGCCGGGGATTGGTTTTCCGCTGCACAAATTGCTGGCGCTTGCCGAATCTACCAGCAATGC‑GAGGTAGGTCGCTTTCGAAACAATTTATGCTCCGGAACAGATGCCA‑GGCCAGCAGGACCGCTTT‑ATCGGCGGTGGGCTGAAATATCCTTATGTCGAAGGCTTGCGTCTc‑gacga < 1:1220740/239‑1 (MQ=255)
tCGCTTCCCGCTGGAAGAGCGTATTTATCGTATGCGCTGCGTGGAAGCGTGGTCGATGGTGGTGCCGTGGATTGGTTTTCCGCTGCACAAATTGCTGGCGCTTGCCGAACCTACCAGCAATGC‑GAAGTATGTCGCTTTCGAAACAATTTATGCACCGGAACAGATGCCA‑GGCCAGCAGGACCGCTTT‑ATCGGCGGCGGGGTGCAATATACTTATGTCGAAAGAGAGCGACTc‑gacgag > 2:1119209/1‑237 (MQ=255)
gCTTCCCGCTGGAAGAGGGTATTTATCGTAGGCGCTGCGTGGAAGCGTGGTCGATGGTGGTGCCGTGGATTGGTTTTCCGCTGCACAAATTGCTGGCGCTTGCCGAACCTACCAGCAATGC‑GAAGTATGTCGCTTTCGAAACAATTTATGCACCGGAACAGATGCCA‑GGCCAGCAGGACCGCTTT‑ATCGGCGGTGGGCTGAAATATCCTTATGTCGAAGGATTGCGTCTC‑GACGAAGc < 1:1011486/238‑1 (MQ=255)
gCTTCCCGCTGGAAGAGCGTATTTATCGTATGCGCTGCGTGGAAGCGTGGTCGATGGTGGTGCCGTGGATTGGTTTTCCGCTGCACAAATTGCTGGCGCTTGCCGAACCTACCAGCAATGC‑GAAGTATGTCGCTTTCGAAACAATTTATGCACCGGAACAGATGCCA‑GGCCAGCAGGACCGCTTT‑ATCGGCGGTGGGCTGAAATATCCTTATGTCGAAGGATTGCGTCTC‑GACGAAGCa < 2:369025/239‑1 (MQ=255)
ttCCCGCTGGAAGAGCGTATTTATCGTATGCGCTGCGTGGAAGCGTGGTCGATGGTGGTGCCGTGGATTGGTTTTCCGCTGCACAAATTGCTGGCGCTTGCCGAACCTACCAGCAATGC‑GAAGTATGTCGCTTTCGAAACAATTTATGCACCGGAACAGATGCCA‑GGCCAGCAGGACCGCTTT‑ATCGGCGGTGGGCTGAAATATCCTTATGTCGAAGGATTGCGTCTC‑GACGAAGCaa < 2:733824/238‑1 (MQ=255)
tgcccGCCGGAAGAGCGTATTTATCGTATGCGGTGCGTGGAAGTGTGGTCGATGGTGGTGCCGTGGATTGGTTTTCCGCTGCACAAATTGCTGGCGCTTGCCGAACCTACCAGCAATGC‑GATGTATGTCGCTTTCGAAACAATTTATGCACCGGAACAGATGCCA‑GGCCAGCAGGACCGCTTT‑ATCGGCGGTGGGCTGAAATATCCTTATGTCGGAGGATTGCGTCTC‑GACGAAGCaa < 2:1152064/236‑1 (MQ=255)
ccGCTGGAAGAGCGTATTTATCGTATGCGCTGCGTGGAAGCGTGGTCGATGGTGGTGCCGTGGATTGGTTTTCCGCTGCACAAATTGCTGGCGCTTGCCGAACCTACCAGCAATGC‑GAAGTATGTCGCTTTCGAAACAATTTATGCACCGGAACAGATGCCA‑GGCCAGCAGGACCGCTTT‑ATCGGCGGTGGGCTGAAATGTCCTTATGTCGAAGGATTGCGTCTC‑GACGAAGCAATGCa < 1:303945/239‑1 (MQ=255)
ccGCTGGAAGAGCGTATTTATCGTATGCGCTGCGTGGAAGCGTGGTCGATGGTGGTGCCGTGGATTGGTTTTCCGCTGCACAAATTGCTGGCGCTTGCCGAACCTACCAGCAATGC‑GAAGTATGTCGCTTTCGAAACAATTTATGCACCGGAACAGATGCCA‑GGCCAGCAGGACCGCTTT‑ATCGGCGGTGGGCTGAAATATCCTTATGTCGAAGGATTGCGTCTC‑GACGAAGCAATGCa < 1:1464842/239‑1 (MQ=255)
ccGCTGGAAGAGCGTATTTAGCGGATGGGCTGCCTGGAATCGTGGTCGATGGTGGTGCCGTGGATTGGTTTTCCGCTGCACAAACTGCTGGCGCTTGCCGAACCTACCAGCAATGC‑GAAGTACGTCGCTTTCGAAACAAGTTATGCACCGGAACAGATGCCA‑GGCCAGCAGGCCCGCTTT‑ATCGGCGGTGGGCTGAAATATCCTTATGTCGAAGGATTGCGTCGC‑GACGAAGCAATGCa < 1:1026168/239‑1 (MQ=255)
agagCGTATTTATCGTATGCGCTGCGTGGAAGCGTGGTCGATGGTGGTGCCGTGGATTGGTTTTCCGCTGCACAAATTGCTGGCGCTTGCCGAACCTACCAGCAATGC‑GAAGTATGTCGCTTTCGAAACAATTTATGCACCGGAACAGATGCCA‑GGCCAGCAGGACCGCTTT‑ATCGGCGGTGGGCTGAAATATCCTTATGTCGAAGGATTGCGTCTC‑GACGAAGCAATGCATCCGCTc < 1:1723583/238‑1 (MQ=255)
gCGTATTTATCGTATGCGCTGCGTGGAAGCGTGGTCGATGGTGGTGCCGTGGATTGGTTTTCCGCTGCACAAATTGCTGGCGCTTGCCGAACCTACCAGCAATGC‑GAAGTATGTCGCTTTCGAAACAATTTATGCACCGGAACAGATGCCA‑GGCCAGCAGGACCGCTTT‑ATCGGCGGTGGGCTGAAATATCCTTATGTCGAAGGATTGCGTCTC‑GACGAAGCAATGCATCCGCTcaca < 1:735325/238‑1 (MQ=255)
gCGTATTTATCGTATGCGCTGCGTGGAAGCGTGGTCGATGGTGGTGCCGTGGATTGGTTTTCCGCTGCACAAATTGCTGGCGCTTGCCGAACCTACCAGCAATGC‑GAAGTATGTCGCTTTCGAAACAATTTATGCACCGGAACAGATGCCA‑GGCCAGCAGGACCGCTTT‑ATCGGCGGTGGGCTGAAATATCCTTATGTCGAAGGATTGCGTCTC‑GACGAAGCAATGCATCCGCTcaca < 1:478394/238‑1 (MQ=255)
gCGTATTTATCGTATGCGCTGCGTGGAAGCGTGGTCGATGGTGGTGCCGTGGATTGGTTTTCCGCTGCACAAATTGCTGGCGCTTGCCGAACCTACCAGCAATGC‑GAAGTATGTCGCTTTCGAAACAATTTATGCACCGGAACAGATGCCA‑GGCCAGCAGGACCGCTTT‑ATCGGCGGTGGGCTGAAATATCCTTATGTCGAAGGATTGCGTCTC‑GACGAAGCAATGCATCCGCTcaca < 2:549348/238‑1 (MQ=255)
cGTATTTATCGTATGCGCTGCGTGGAAGCGTGGTCGATGGTGGTGCCGTGGATTGGTTTTCCGCTGCACAAATTGCTGGCGCTTGCCGAACCTACCAGCAATGC‑GAAGTATGTCGCTTTCGAAACAATTTATGCACCGGAACAGATGCCA‑GGCCAGCAGGACCGCTTT‑ATCGGCGGTGGGGTTGAATATCCTTATTTCGGAGGAGTGCGTCTC‑CACGAAGCAAAGCCACCGCCCccac > 2:1711736/1‑238 (MQ=255)
cGTATTTATCGTATGCGCTGCGTGGAAGCGTGGTCGATGGTGGTGCCGTGGATTGGTTTTCCGCTGCACAAATTGCTGGCGCTTGCCGAACCTACCAGCAATGC‑GAAGTATGTCGCTTTCGAAACAATTTATGCACCGGAACAGATGCCA‑GGCCAGCAGGACCGCTTT‑ATCGGCGGTGGGCTGAAATATTCTTATGTTGACGGAGTTGGTCTC‑GACGAAGCAAAGCATCCGCTcaccc > 2:1389380/1‑236 (MQ=255)
aTTTATCGTATGCGCTGCGTGGAAGCGTGGTCGATGGTGGTGCCGTGGATTGGTTTTCCGCTGCACAAATTGCTGGCGCTTGCCGAACCTACCAGCAATGC‑GAAGTATGTCGCTTTCGAAACAATTTATGCACCGGAACAGATGCCA‑GGCCAGCAGGACCGCTTT‑ATCGGCGGTGGGCTGAAATATCCTTATGTCGAAGGATTGCGTCTC‑GACGAAGCAATGCATCCGCTCACACtga‑t < 2:1207521/239‑1 (MQ=255)
tttATCGTATGCGCGTCGTGGAAGCGTGGTCGATGGTGGTGCCGTGGATTGGTTTTCCGCTGCACAAATTGCTGGCGCTTGCCGAACCTACCAGCAATGC‑GAAGTATGTCGCTTTCGAAACAATTTATGCACCGGAACAGATGCCA‑GGCCAGCAGGACCGCTTT‑ATCGGCGGTGGGCTGAAATATCCTTATGTCGAAGGATTGCGTCTC‑GACGAAGCAATGCATCCGCTCACACtga‑tg < 1:97781/239‑1 (MQ=255)
tCGTATGCGCTGCGTGGAAGCGTGGTCGATGGTGGTGCCGTGGATTGGTTTTCCGCTGCACAAATTGCTGGCGCTTGCCGAACCTACCAGCAATGC‑GAAGTATGTCGCTTTCGAAACAATTTATGCACCGGAACAGATGCCA‑GGCCAGCAGGACCGCTTT‑ATCGGCGGTGGGCTGAAAGATCCTTTTGTCGAAGGAGTGCGTCTCGGGCGAGACAA‑GCATACGCCCCCAATGA‑TGAcc > 2:163510/1‑238 (MQ=255)
gTATGCTGTGCGGGGAAGCTGAGTCGATGGTGGTGCCGTGGATTGGTTTTCCGCTGAACAAATTGCTGTCGCTTGCCGAACCTACCTTCAATGC‑GAAGTATGTAGCTTTCGAAACAATTTATGCACCGGAACAGATGCCA‑GGGCAGCAGGACCGCTTT‑ATCGGCGGTGGGATGAAATATCCTTATGTCGAAGGATTGCGTCTC‑GACGTAGCAATGCATCCGCTCACACTGA‑TGGCCGTa < 1:533226/239‑1 (MQ=255)
gTATGCGCTGCGTGGAAGCGTGGTCGATGGTGGTGCCGTGGATTGGTTTTCCGCTGCACAAATTGCTGGCGCTTGCCGAACCTACCAGCAATGC‑GAAGTATGTCGCTTTCGAAACAATTTATGCACCGGAACAGATGCCA‑GGCCAGCAGGACCGCTTT‑ATCGGCGGTGGGGTGAAAAATCCTTATTTTCAGGGATTGGGACTT‑GACGCAGCAATGCATCCGCGCCCACTGA‑TGGCCGtc > 2:1387066/1‑238 (MQ=255)
gTATGCGCTGCGTGGAAGCGTGGTCGATGGTGGTGCCGTGGATTGGTTTTCCGCTGCACAAATTGCTGGCGCTTGCCGAACCTACCAGCAATGC‑GAAGTATGTCGCTTTCGAAACAATTTATGCACCGGAACAGATGCCA‑GGCCAGCAGGACCGCTTT‑ATCGGCGGTGGGCTGAAATATCCTTATGTCGAAGGATTGCGTCTC‑GACGAAGCAATGCATCCGCTCACACTGA‑TGACCGTa < 2:1482078/239‑1 (MQ=255)
gtGCGCTGCGTTGAAGCGTGGTCGATGGTGGTGCCGTTGATTGGTTTTCCGCTCCACAAATTGCTGGCGCTTGCCGAACCTACCAGCAATGC‑GAAGTATGTCGCTTTCGAAACAATTTATGCACCGGAACAGATGCCA‑GGCCAGCAGGACCGCTTT‑ATCGGCGGTGGGCTGAAATATCCTTATGTCGAAGGATTGCGTCTC‑GACGAAGCAATGCATCCGCTCACACTGA‑TGACCGTAg < 1:112161/237‑1 (MQ=255)
aTGCGCTGCGTGGAAGCGTGGTCGATGGTGGTGCCGTGGATTGGTTTTCCGCTGCACAAATTGCTGGCGCTTGCCGAACCTACCAGCAATGC‑GAAGTATGTCGCTTTCGAAACAATTTATGCACCGGAACAGATGCCA‑GGCCAGCAGGACCGCTTT‑ATCGGCGGTGGGCTGAAATATCCTTATGTCGAAGGATTGCGTCTC‑GACGAAGCAATGCATCCGCTCACACTGA‑TGACCGTAg < 2:1403803/238‑1 (MQ=255)
aTGCGCTGCGTGGAAGCGTGGTCGATGGTGGTGCCGTGGATTGGTTTTCCGCTGCACAAATTGCTGGCGCTTGCCGAACCTACCAGCAATGC‑GAAGTATGTCGCTTTCGAAACAATTTATGCACCGGAACAGATGCCA‑GGCCAGCAGGACCGCTTT‑ATCGGCGGTGGGCTGAAATATCCTTATGTCGAAGGATTGCGTCTC‑GACGAAGCAATGCATCCGCTCACACTGA‑TGACCGTAg < 1:334473/238‑1 (MQ=255)
aTGCGCTGCGTGGAAGCGTGGTCGATGGTGGTGCCGTGGATTGGTTTTCCGCTGCACAAATTGCTGGCGCTTGCCGAACCTACCAGCAATGC‑GAAGTATGTCGCTTTCGAAACAATTTATGCACCGGAACAGATGCCA‑GGCCAGCAGGACCGCTTT‑ATCGGCGGTGGGCTGAAATATCCTTATGTCGAAGGATTGCGTCTC‑GACGAAGCAATGCATCCGCTCACACTGA‑TGACCGTAg < 2:255500/238‑1 (MQ=255)
tGCGCTGCGTGGAAGCGTGGTCGATGGTGGTGCCGTGGATTGGTTTTCCGCTGCACAAATTGCTGGCGCTTGCCGAACCTACCAGCAATGC‑GAAGTATGTCGCTTTCGAAACAATTTATGCACCGGAACAGATGCCA‑GGCCAGCAGGACCGCTTT‑ATCGGCGGTGGGGGGAAATATCCTTTTTTCGGAGGATTGGGGCTC‑GGCGGAGCAATGCATTCGCCCACACCGG‑TGACCGTAggg > 2:987077/1‑238 (MQ=255)
tGCGCTGCGTGGAAGCGTGGTCGATGGTGGTGCCGTGGATTGGTTTTCCGCTGCACAAATTGCTGGCGCTTGCCGAACCTACCAGCAATGC‑GAAGTATGTCGCTTTCGAAACAATTTATGCACCGGAACAGATGCCA‑GGCCAGCAGGACCGCTTT‑ATCGGCGGGGGGCTGGAATATCCTTTTTTCGGAAGATTGCGTTCC‑GACGAAGCAATGCATCCGCTCACACCGA‑TGACCgctggg > 2:771873/1‑234 (MQ=255)
gCGTGGAAGCGTGGTCGATGGTGGTGCCGTGGATTGGTTTTCCGCTGCACAAATTGCTGGCGCTTGCCGAACCTACCAGCAATGC‑GAAGTATGTCGCTTTCGAAACAATTTATGCACCGGAACAGATGCCA‑GGCCAGCAGGACCGCTTT‑ATCGGCGGTGGGGCGGGATATCCTTATGTCGAAGGGATGCGTCTC‑TACGAAGAAAAGCATCCGCCCAACCTCA‑TGAACGTacggggtgat > 1:1434448/1‑230 (MQ=255)
gTGGAAGCGTGGTCGATGGTGGTGCCGTGGATTGGTTTTCCGCTGCACAAATTGCTGGCGCTTGCCGAACCTACCAGCAATGC‑GAAGTATGTCGCTTTCGAAACAATTTATGCACCGGAACAGATGCCA‑GGCCAGCAGGACCGCTTT‑ATCGGCGGTGGGCTGGAAAATCCTTATGTCGAAGGATTGCGTTTC‑GACGGAGGAATGCATCCCCTCCCACCGA‑TGACCGTAGGGG‑tttttt > 2:997386/1‑235 (MQ=255)
ggAAGCGTGGTCGATGGTGGTGCCGTGGATTGGTTTTCCGCTGCACAAATTGCTGGCGCTTGCCGAACCTACCAGCAATGC‑GAAGTATGTCGCTTTCGAAACAATTTATGCACCGGAACAGATGCCA‑GGCCAGCAGGACCGCTTT‑ATCGGCGGTGGGCTGAAATATCCTTATGTCGAAGGATTGCGTCTC‑GACGAAGCAATGCATCCGCTCACACTGA‑TGACCGTAGGTG‑TTTATGGCa < 2:1404875/239‑1 (MQ=255)
tggATGGTGGGGCGGGGGATTGTTTTTCCGCTGCAAAAATGGCTGGGGCTTGCCGACCCGACCGGCAAGGC‑GAAGTATGTCGCTTTCGAAACAATTTAGGCCCGGGAACAGATGCCA‑GCCCAGCAGACCCCCTTT‑ATCGGCGGTGGGCTAAAATATCTTTAGGTCGAAGGATTGCGTCTC‑GAGGAAGCAATGCACCCGCTCACACTGA‑TGACCGTAGGTG‑TTTATGGCAAGGCTTTAc < 1:378991/236‑1 (MQ=255)
tgCCGTGGATTGGTTTTCCGCTGCACAAATTGCTGGCGCTTGCCGAACCTACCAGCAATGC‑GAAGTATGTCGCTTTCGAAACAATTTATGCACCGGAACAGATGCCA‑GGCCAGCAGGACCGCTTT‑ATCGGCGGTGGGCTGAAATATTCTTATTTCGAAGGATTTCGTCTC‑GACCACGCAATGCATTCGCCCACACTGA‑TGACCGTAGGTG‑TTTTTTGCAAGGCGTTACCGCCCCaaaaa > 2:1175848/1‑238 (MQ=255)
ggATTGGTTTTCCGCTGCACAAATTGCTGGCGCTTGCCGACCCTACCAGCAATGC‑GAAGTATGTCGCTTTCGAAACAATTTATGCACCGGAACAGATGCCA‑GGCCAGCAGGACCGCTTT‑ATCGGCGGTGGGCTGAAATATCCTTATGTCGAAGGATTGCGTCTC‑GACGAAGCAATGCATCCGCTCACACTGA‑TGACCGTAGGTG‑TTTATGGCAAGGCGTTACCGCCACAAAATGgcgc < 2:1442495/238‑1 (MQ=255)
ttGGTTTCCCGCTGCAAAAATCGCTGGCGCTTGCCGAACCTACGAGAAGGGC‑GAAGTGTGTCGTTTTCGAAAAAATTTATGCACCGGAACAGATGCCA‑GGCCAGCAGGACCGCTTT‑AGCGGCGGTGGGCTAAAATATCTTTATGTCGAAGGATTGCGTCTC‑GACGAAGCAATGCATCCGCTCACACTGA‑TGACCGTGGGTG‑TTTATGGCAAGGCGTTACCGCCACAAAATGGCGCGCCg < 1:32148/239‑1 (MQ=255)
tgtCCGCTGCACAAATTGTGGGCGTTTCCCGACCCTACCAGCAATGC‑GAAGTATGTCGCTTTCAAAACAATTTATGCACCGGAACAGATGCCA‑GGCCAGCAGGACCGTTTT‑ATCGGCGGTGGGCTGAAATATCCTTATGTCGAAGGATTGCGTCTC‑GACGAAGCAATGCACCCGCTCACACTGA‑TGACCGTGGGTG‑TTTAGGGAAAGGCGTTACCGCCACAAAATGGCGCGCCGGTGCg < 1:1242235/237‑1 (MQ=255)
gtgccaaaaTTGCTGGCGCTTGCCGAACCTACCAGCAATGC‑GAAGTATGTCGCTTTCGAAACAATTTATGCCCCGGAACAGATGCCA‑GGCCAGCAGGACCGCTTT‑ATCGGCGGTGGGCTGAAATATCCTTATGTCGAAGGATTGCGTCTC‑GACGAAGCAATGCATCCGCTCACACTGA‑TGACCGTAGGTG‑TTTATGGCAAGGCGTTACCGCCACAAAATGGCGCGCCGGTGCGACTGAt < 2:1091456/233‑1 (MQ=255)
gCACAAATTGCTGGCGCTTGCCGAACCTACCAGCAATGC‑GAAGTATGTCGCTTTCGAAACAATTTATGCACCGGAACAGATGCCA‑GGCCAGCAGGACCGCTTT‑ATCGGCGGTGGGGTGGAATATCCTTTTTTCGAAGGATTGCGGCTC‑GGCGCAGCAATGCAACCCCTCCCACCGA‑TTACCGCAGGGGTTTTATGGGAAGG‑GGTACCCCCCCACAAAGGGCCGCCgggggggctgggtg > 1:909004/1‑227 (MQ=255)
acaAATTGCTGGTGGTTCCCGAACGTCCAAGAAATGC‑GAAGTATGGCGTTTTAGAAACAATTTATGCACGGGAACAAGTGCCA‑GGCCAGCAGGACCGTTTT‑ATCGGCGGTGGGTTAAAATTTCTTTATGTCGAAGGATTGCGTCTC‑GACGAAGAAATGCACCCGCTCACACTGA‑TGGCCGTGGGTT‑TTTATGGCAAGGCTTTACCGCCACAAAATGGCGCGCCGGTGCGACTGATtgtg < 1:848956/239‑1 (MQ=255)
aaTTGGTGGCGCTTGCCGAACCTACCAGC‑ATGCGGAAGTTTGTCGTGTTCGAAACAATTGTGGCCCCGAACCAGATGCCC‑GCCCCGCA‑GACAGGTTTGACCGTCGATGGCCTCAAATATGCTTATGTAGAGGGTTTTCTTATC‑GAGGAGGCAATGCGCCCGCACACACTGG‑GGAGTGAGGGTG‑TTGAGGGCAGGGCTTTCCCGCCACAAAATGGCGCGCCGGTGCGACTGATTGTGCCg < 1:352130/239‑1 (MQ=255)
aaTTGCTGGCGCTTGCCGAACCTACAAGCAATGC‑GAGGTATGTCGTTTTCAAAAAAATTTAGGCACCGGAACAGATGCCG‑GGCCAGCAGGACCTCTTT‑ATCGGGGGTGGGCTGAAATATCCTTATGTCGAAGGTTTGCGTCTC‑GAGGAAGCAATGCACCCGCTCCCACTGA‑GGACGGTGGGGG‑TTTAGGGCAGGGCGTTACCGCCACAAAATGGCGCGCCGGTGCGACTGATTGTGCCg < 1:555454/239‑1 (MQ=255)
cgcTTGCCGAACCTACCAGCAATGC‑GAAGTATGTCGCTTTCGAAACAATTTATGCCCCGGAACAGATGCCA‑GGCCAGCAGGACCGTTTT‑ATGGGCGGTGGGCTGAAATATCCTTATGTCGAAGGATGGCGTCTC‑GACGAAGCAATGCATCCGCTCACACTGA‑TGCCCGTAGGTG‑TTTATGGCAAGGCGTTACCGCCACAAAATGGCGCGCCGGTGCGACTGATTGTGCCGTGGAAata < 2:1483185/238‑1 (MQ=255)
cgcTTGCCGAACCTACCAGCAATGC‑GAAGTATGTCGCTTTCAAAACAATTTATGCACCGGAACAGATGCCG‑GGCCAGCAGGACCGCTTT‑ACCGGCGGTGGGCTGAAATATCCTTATGTCGAAGGATTGCGTCTC‑GACGAAGCAATGCACCCGCTCACACTGA‑TGACCGTAGGTG‑TTTATGGCAAGGCGTTACCGCCACAAAATGGCGCGCCGGTGCGACTGATTGTGCCGTGGAAata < 2:551757/238‑1 (MQ=255)
aaaCCTACCAGAAAGGG‑GAAGTATGTCGCTTTCGAAACAATTTATGCACGGGAAAAGATGCCA‑GGCCAGCAGGCCCGCTTT‑AGCGGGGGGGGGTTGAAATATCCTTATGTCGAAGGATTGCGTCTC‑GACGAAGCAATGCATCCGCTCACACTGA‑TGACGGTGGGTG‑TTTAGGGAAAGGCGTTACCGCCACAAAATGGCGCGCCGGTGCGACTGATTGTGCCGTGGAAATATGGCTTTaa < 1:1711736/238‑1 (MQ=255)
accctaccacaaagggaaaGTATGTCGCTGGCAAAACAAGTGATGCACGAGAAGAGAGGCCA‑GGCCAGCAGGCCCTTTTT‑ACCGGCGGTGGGCTGAAATATCCTTTTGTCGAGGCTTGGCTTATG‑AACGAAGAAATGCACCAGCTCAAACGGA‑TGACGGTAGTTT‑TTTATGGCAAGGCTTTACCGCCACAAAATGGCGCGCCGGTGCGACTGATTGTGCCGTGGAAATATGGCTTTaaa < 1:771873/222‑1 (MQ=255)
aCCAGCAATGC‑GAAGTATGTCGCTTTCGAAACAATTTATGCACCGGAACAGATGCCA‑GGCCAGCAGGACCGCTTT‑ATCGGCGGTGGGCTGGAATATCCTTTTGTTGAAGGATTTCGTCTC‑GCCGAAGGAATGCATCCGCCCACACTGA‑TGACCGTAGGGG‑TTTATTGCAAGGCGTTACCGCCACAAAAAGGCGCGCCGGGGCGACTGATTTTTCCGTGGGAATATGGCTTTTAAGGGAt > 2:318491/1‑239 (MQ=255)
aTGC‑GAAGTATGTCGCTTTCGAAACAATTTATGCACCGGAACAGATGCCA‑GGCCAGCAGGACCGCTTT‑ATCGGCGGTTGGGTGAAAAATTCTTATTTCGGAAGATTTCGTCTC‑GACGAAGCAAAGCATCCCCCCCCCCCTC‑TGACCCGGGGGG‑TTTTTTGGAAGGCGGTAACGCCCCAAAAAAGGGGGCCGGGGGGGCTGGTTGTTTCGTGGTAAAATGGCCTTTAAGGGGTTaaaaag > 1:1152361/1‑236 (MQ=255)
aTGC‑GAAGGATGTCGCTTTCAAAACAATTGAAGCCCCGGAAAAGATGCCG‑GGCCAGGGGGACCGCTTT‑ATCGGCGGTGGGCTGAAATATCCTTAGGTCGAAGGGTTGGGTCTC‑GACGAAGCAATGCATCCGCCCCCACTGA‑GGCCGGTGGTTG‑TTTATGGAAAGGCGTTACCGCCACAAAATGGCGCGCCGGTGCGACTGATTGTGCCGTGGAAATATGGCTTTAAAGGGATTAAATCg < 1:387593/239‑1 (MQ=255)
tGC‑GAAGTATGTCGCTTTCGAAACAATTTATGCACCGGAACAGATGCCA‑GGCCAGCAGGACCGCTTT‑ATCGGCGGTGGGCTGAAAAATCCTTATGTCGGAGGATTGCGTCTC‑GCCGGAGGAATGCATCCGCTCCCACTTA‑TGAACGTAGGGG‑GTTATTGCAAAGCGGTACCGCCCCCAAAAGGCGCGCCGGCGCGAGTGATTGTTCCGGGGGAAAATGGCTTTTAAAGGGTTAAATCGa > 2:358252/1‑239 (MQ=255)
c‑GAAGTATGGCGCTTCCGAAACAATTTATGCACCGGAACAGATGCCG‑GGCCAGCAGGACCGCTTT‑AGCGGCGGTGGGTTGAAATATCCTTATGTCGAAGGATTGCGTCTC‑GACGAAGCAATGCATCCGCTCACACGGA‑TGCCCGTAGGTG‑TTTAGGGAAGGGCGTTACCGCCACAAAATGGCGCGCCGGTGCGACTGATTGTGCCGTGGAAATATGGCTTTAAAGGGATTAAATCGa < 2:778521/237‑1 (MQ=255)
aaGTATGTCGTTTTCGAAAAAATTTATGCCCCGGAACAGATGCCA‑GGCCAGCAGGACCGTTTT‑ATGGGCGGTGGGTTAAAATATCCTTATGTCGAAGGATTGCGTCTC‑GAAGAAGCAATGCATCCGCTCACACTGA‑TGACCGTAGGTG‑TTTAGGGCAAGGCTTTACCGCCACAAAATGGCGCGCCGGTGCGACTGATTGTGCCGTGGAAATATGGCTTTAAAGGGATTAAATCGATAGt < 2:1152361/239‑1 (MQ=255)
attATGTCGCTTTCGAAACAATTTATGCACCGAAACAGATGCCA‑GGCAAGCAGGACCGTTTT‑ATCGGGGGGGGGCTAAAATATCCTTATGTAAAAGGTTGGCGTATC‑GACGAAGCAATGCACCCGCCAACACTGA‑TGACGGTAGGTG‑TTTAGGGCAAGGCGTTACCGCCACAAAATGGCGCGCCGGTGCGACTGATTGTGCCGTGGAAATATGGCTTTAAAGGGATTAAATCGATAGt < 1:1175848/236‑1 (MQ=255)
attATGTCGCTTTCGAAAAAATTTGTGCACCGGAACAGTGGCCA‑GGCCAGCAGGCCCGTTTT‑ACCGGCGGTGGGCTGAATTATCTTTATGTCGAAGGATTGCGTCTC‑GCCGAAGCAATGCACCCGCTCACACTGA‑TGACCGTAGGTT‑TTTATGGCAGGGCGTTACCGCCACAAAATGGCGCGCCGGTGCGACTGATTGTGCCGTGGAAATATGGCTTTAAAGGGATTAAATCGATAGt < 1:318491/236‑1 (MQ=255)
agtagttCGCTTTCGAAAAAATTTATGCCCCGGAACAGATGCCA‑GGCCAGCAGGCCCGCTTT‑ATCGGCGGTGGGCTAAAATATCCTTATGGCGAAGGATGGCGTCTC‑GACGAAGCAATGCATCCGCTCACACTGA‑TGACCGTAGGTG‑TTTATGGCAAGGCGTTACCGCCACAAAATGGCGCGCCGGTGCGACTGATTGTGCCGTGGAAATATGGCTTTAAAGGGATTAAATCGATAGt < 2:1184080/232‑1 (MQ=255)
aggatgcctctttgaaaaCAATGTATCCCCCGGAACAGAGGCCA‑GCCCAGCAGGCCCTCTTT‑ACGGGGGGGGGGCTGAAATATCCTTTTGTGGAAGGTTTGCGTCTC‑GCCGAAGCAAGCCTCCCGCTCACGCTGA‑GGACGGTAGGTT‑TTTAGGGAAGGGCTTTACCGCCACAAAATGGCGCGCCGGTGCGACTGATTGTGCCGTGGAAATATGGCTTTAAAGGGATTAAATCGATAGt < 1:1554119/223‑1 (MQ=255)
agaaggccgttttCAAAACAATTGAGGCACCGGAAAAGA‑GCCAGGGCGAGAGGGACTGCTTT‑AGGGGGGGGGGGTGAAAATATCCTTAGGTCGAAGGATGGCGTCTC‑AACGAAGAAATGCACCCGCTCACACGGA‑GGACGGTGGGTG‑TTTATGGAAGGGCGTTACCGCCACAAAATGGCGCGCCGGTGCGACTGATTGTGCCGTGGAAATATGGCTTTAAAGGGATTAAATCGATAGt < 1:280836/228‑1 (MQ=255)
aGTATGTCTCTTTCGAAACAATTTATGCACCGGAACAGATGCCA‑GGCCAGCAGGACCGCTTT‑ATCGGCGGTGGGCTGAAATATCCTTATGTCGAAGGATTGCGTCTC‑GACGAAGCAATGCATCCGCTCACACTGA‑TGACCGTAGGTG‑TTTATGGCAAGGCGTTACCGCCACAAAATGGCGCGCCGGTGCGACTGATTGTGCCGTGGAAATATGGCTTTAAAGGGATTAAATCGATAGt < 2:996744/238‑1 (MQ=255)
aGTATGTCGTTTTCGAAACAATTTATGCACCGGAACAGATGCCA‑GGCCAGCAGGACCGCTTT‑ATCGGCGGTGGGCTGAAATATCCTTATGTCGAAGGATTGCGTCTC‑GACGAAGCAATGCATCCGCTCACACTGA‑TGACCGTGGGTG‑TTTATGGAAAGGCGTTACCGCCACAAAATGGCGCGCCGGTGCGACTGATTGTGCCGTGGAAATATGGCTTTAAAGGGATTAAATCGATAGt < 2:802311/238‑1 (MQ=255)
aGTATGTCGTTTTCAAAACAATTTATGCCCCGGAACAGATGCCG‑GGCCAGCAGGACCGCTTT‑ATCGGCGGTGGGCTAAAATATCCTTATGTCGAAGGATTGCGTCTC‑GACGAAGCAATGCATCCGCTCACACTGA‑TGACCGTAGGTG‑TTTATGGCAAGGCGTTACCGCCACAAAATGGCGCGCCGGTGCGACTGATTGTGCCGTGGAAATATGGCTTTAAAGGGATTAAATCGATAGt < 2:1735898/238‑1 (MQ=255)
aGTATGTCGCTTTCGAAAAAATTTATGCACCGGAACAGATGCCA‑GGCCAGCAGGACCGCTTT‑ACCGGGGGTGGGCTGAAATATCCTTATGTCGAAGGATTGCGTCTC‑GACGAAGCAATGCATCCGCTCACACTGA‑TGACCGTAGGTG‑TTTATGGCAAGGCGTTACCGCCACAAAATGGCGCGCCGGTGCGACTGATTGTGCCGTGGAAATATGGCTTTAAAGGGATTAAATCGATAGTc < 2:909004/239‑1 (MQ=255)
aGTATGTCGCTTTCAAAAATATTTAGGCCCCGGAACAGATCCCG‑GGCCAGCAGGACCGCTTT‑ATCGGCGGGGGGATGAAATATCCTTATGTCGAAGGATTGCGTCGC‑GACGAAGCATTGCATCCGCTCACACTGA‑TGCCCGTAGGTG‑TTTATGGAAAGGCGTTACCGCCACAAAATGGCGCGCCGGTGCGACTGATTGTGCCGTGGAAATATGGCTTTAAAGGGATTAAATCGATAGt < 1:1645912/238‑1 (MQ=255)
aGTATGTCGCTTGCGAAACAATTTATGCACCGGAACAGATGCCA‑GGCCAGCAGGACCGTTTT‑ATCGGCGGTGGGCTGAAATATCCTTATGTCGAAGGATTGCGTCTC‑GACGAAGCAATGCATCCGCTCACACTGA‑TGCCCGTAGGTG‑TTTATGGCAAGGCGTTACCGCCACAAAATGGCGCGCCGGTGCGACTGATTGTGCCGTGGAAATATGGCTTTAAAGGGATTAAATCGATAGt < 2:44506/238‑1 (MQ=255)
aGTACGTCGCTTTCGAAACAATTTATGCACCGAAACAGATGCCG‑GGCAAGCAGGACCGCTTT‑ATCGGCGGTGGGCTGAAATATCTTTATGTCGAAGGATGGCGTCTC‑GACGAAGAAATGCACCCGCTCACACTGA‑GGCCGGTAGGTG‑TTTATGGCAGGGCGTTACCGCCACAAAATGGCGCGCCGGTGCGACTGATTGTGCCGTGGAAATATGGCTTTAAAGGGATTAAATCGATAGt < 1:38909/238‑1 (MQ=255)
aggTCGCTTTCGAAACAATTTATGCACCGGAACAGATGCCA‑GGCCAGCAGGGCCGCTTT‑ATCGGCGGTGGGCTGAAATATCCTTATGGCGAAGGATTGCGTCCC‑GACGAAGCAATGCATCCGCTCACACTGA‑TGACCGTAGGTG‑TTTATGGCAAGGCGTTACCGCCACAAAATGGCGCGCCGGTGCGACTGATTGTGCCGTGGAAATATGGCTTTAAAGGGATTAAATCGATAGTCa < 2:456458/235‑1 (MQ=255)
tCGAAACAATTTATGCACCGGAACAGATGCCA‑GGCCAGCAGGACCGCTTT‑ATCGGCGGTGGGGTGGAATATTCGTATTTCGCAGGGTTGGGGCTC‑GGCGAAGCAATGTCTCCGCTCTCACTGATTGACCG‑AGGGG‑GTTTTTGCAAGGCGGTACCGCCACAAAATGGCGCGGCGGGGCGGCTGAGTCGGGCGGGGAAATATGGGTTTTAAAGGGTTAAAACGATAGTGAGTGTTAAACTg > 1:1566115/1‑239 (MQ=255)
aaaagagGCCA‑GGCCAGCAGGACCGCTTT‑AGCGGGGGTGGGCTGAAATATCTTAATGTGGAAGGATTGCGTCTC‑GACGAAGCAATGCATCCGCTCACACTGA‑TGACCGTGGGTG‑TTTATGGCAAGGCGTTACCGCCACAAAATGGCGCGCCGGTGCGACTGATTGTGCCGTGGAAATATGGCTTTAAAGGGATTAAATCGATAGTCAGTATTAAGCTGACCCGCGAGCGTCCGCCAac < 2:113557/235‑1 (MQ=255)
aGATGCCG‑GGCCAGCAGGACCGTTTT‑ATCGGCGGTGGGTTAAAATCTCCTTGTGTCGAAGGATTGCGTCTC‑GACGAAGCATTGCATCCGCTCACACTGA‑GGACCGTAGGTT‑TTTATGGCAAGGCGTTACCGCCACAAAATGGCGCGCCGGTGCGACTGATTGTGCCGTGGAAATATGGCTTTAAAGGGATTAAATCGATAGTCAGTATTAAGCTGACCCGCGAGCGTCCGCCAaccacc < 1:997386/239‑1 (MQ=255)
cagcagGGCCGCTTT‑ACCGGCGGGGGGTTGAAATATCCTTATGGCAAAGGTTGGCGTCCC‑GACGAAGCAATGCACCCGCTCCCACTGA‑TGACCGTAGGTG‑TTTAGGGCAGGGCGTTGCCGCCACAAAATGGCGCGCCGGTGCGACTGATTGTGCCGTGGAAATATGGCTTTAAAGGGATTAAATCGATAGTCAGTATTAAGCTGACCCGCGAGCGTCCGCCAACCACCTGGAATCTGGc < 1:987077/239‑1 (MQ=255)
gactcgttt‑ATGGGCGGGGGGTTGAAATTTCTTTATGGTGAGGGTTTGTGTCTC‑GCCGAGGCAATGCTTCCCCTCACA‑TGAGGGACGATGGTTT‑TTTACGGCAGGGCGTTACCGCCACAAAATGGCGCGCCGGTGCGACTGATTGTGCCGTGGAAATATGGCTTTAAAGGGATTAAATCGATAGTCAGTATTAAGCTGACCCGCGAGCGTCCGCCAACCACCTGGAATCTGGCAgcgc < 1:1387066/232‑1 (MQ=255)
aTCGGCGGGGGGATGAAATATCCTTATGGCGAAGGAGTGCGTCTC‑GACGAAGAAATGCAGCCGCTCACACTGA‑TGACCGTAGGTG‑TTTAGGGTAGGGCGTTACCGCCACAAAATGGCGCGCCGGTGCGACTGATTGTGCCGTGGAAATATGGCTTTAAAGGGATTAAATCGATAGTCAGTATTAAGCTGACCCGCGAGCGTCCGCCAACCACCTGGAATCTGGCAGCGCCTGACGAATa < 1:1389380/239‑1 (MQ=255)
gCTGAAATATCCTTATGTCGAAGGATTGCGTCTC‑GACGAAGCAATGCATCCGCTCACACTGA‑TGACCGTAGGGG‑TTTATGGCAAGGCGTTACCGCCACAAAATGGCGCGCCGGTGCGACTGATTGTGCCGTGGAAATATGGCTTTAAAGGGATTAAATCGATAGTCAGTATTAAACTGACCCGCGAGCGTCCGCCAACCACCCGGAATCTTGCAGCGCCTGACGAATACGGTTTTTAc > 2:1318062/1‑238 (MQ=255)
taaaattcccTTATGTCGAAGGTTGGCGTCGC‑GACGAAGCAAGGCACCCCCTCACACTGA‑GGACGGGAGGTG‑TTTAGGGCAAGGCGTTACCGCCACAAAATGGCGCGCCGGTGCGACTGATTGTGCCGTGGAAATATGGCTTTAAAGGGATTAAATCGATAGTCAGTATTAAGCTGACCCGCGAGCGTCCGCCAACCACCTGGAATCTGGCAGCGCCTGACGAATACGGTTTTTACGc < 1:1318062/230‑1 (MQ=255)
taaaaTATCCTTTGGTCGAAGGATTGCTCCCC‑GACGAGGCAATGCATCCCCTCACACTGA‑TGACCGGGGGTG‑TTTAGGGCAGGGTGTTACCGCCACAAAATGGCGCGCCGGTGCGACTGATTGTGCCGTGGAAATATGGCTTTAAAGGGATTAAATCGATAGTCAGTATTAAGCTGACCCGCGAGCGTCCGCCAACCACCTGGAATCTGGCAGCGCCTGACGAATACGGTTTTTACGc < 2:1321087/236‑1 (MQ=255)
tCCTTATGTCGAAGGATTGCGTCTC‑GACGAAGCAATGCATCCGCTCACACTGA‑TGACCGTAGGTG‑TTTATGGCAAGGCGTTACCGCCACAAAATGGCGCGCCGGTGCGACTGATTGTGCCGTGGAAATATGGCTTTAAAGGGATTAAATCGATAGTCAGTATTAAGCTGACCCGCGAGCGTCCGCCAACCACCTGGAATCTGGCAGCGCCTGACGAATACGGTTTTTACGCCAACGTTa > 2:1527007/1‑239 (MQ=255)
ccTTATGTCGAAGGATTGCGTCTC‑GACGAAGCAATGCATCCGCTCACACTGA‑TGACCGTAGGTG‑TTTATGGCAAGGCGTTACCGCCACAAAATGGCGCGCCGGTGCGACTGATTGTGCCGTGGAAATATGGCTTTAAAGGGATTAAATCGATAGTCAGTATTAAGCTGACCCGCGAGCGTCCGCCAACCACCTGGAATCTGGCAGCGCCTGACGAATACGGTTTTTACGCCAACGTTaa > 1:1105940/1‑239 (MQ=255)
ttATGTCGAAGGATTGCGTCTC‑GACGAAGCAATGCATCCGCTCACACTGA‑TGACCGTAGGTG‑TTTATGGCAAGGCGTTACCGCCACAAAATGGCGCGCCGGTGCGACTGATTGTGCCGTGGAAATATGGCTTTAAAGGGATTAAATCGATAGTCAGTATTAAGCTGACCCGCGAGCGTCCGCCAACCACCTGGAATCTGGCAGCGCCTGACGAATACGGTTTTTACGCCAACGTTAAt > 1:1525282/1‑238 (MQ=255)
aTGTCGAAGGATTGCGTCTC‑GACGAAGCAATGCATCCGCTCACACTGA‑TGACCGTAGGTG‑TTTATGGCAAGGCGTTACCGCCACAAAATGGCGCGCCGGTGCGACTGATTGTGCCGTGGAAATATGGCTTTAAAGGGATTAAATCGATAGTCAGTATTAAGCTGACCCGCGAGCGTCCGCCAACCACCTGGAATCTGGCAGCGCCTGACGAATACGGTTTTTACGCCAACGTTAATCCg > 2:1367041/1‑239 (MQ=255)
aTGTCGAAGGATTGCGTCTC‑GACGAAGCAATGCATCCGCTCACACTGA‑TGACCGTAGGTG‑TTTATGGCAAGGCGTTACCGCCACAAAATGGCGCGCCGGTGCGACTGATTGTGCCGTGGAAATATGGCTTTAAAGGGATTAAATCGATAGTCAGTATTAAGCTGACCCGCGAGCGTCCGCCAACCACCTGGAATCTGGCAGCGCCTGACGAATACGGTTTTTACGCCAACGTTAATCCg > 2:1590441/1‑239 (MQ=255)
aTGTCGAAGGATTGCGTCTC‑GACGAAGCAATGCATCCGCTCACACTGA‑TGACCGTAGGTG‑TTTATGGCAAGGCGTTACCGCCACAAAATGGCGCGCCGGTGCGACTGATTGTGCCGTGGAAATATGGCTTTAAAGGGATTAAATCGATAGTCAGTATTAAGCTGACCCGCGAGCGTCCGCCAACCACCTGGAATCTGGCAGCGCCTGACGAATACGGTTTTTACGCCAACGTTAATCCg > 1:237130/1‑239 (MQ=255)
aTGTCGAAGGATTGCGTCTC‑GACGAAGCAATGCATCCGCTCACACTGA‑TGACCGTAGGTG‑TTTATGGCAAGGCGTTACCGCCACAAAATGGCGCGCCGGTGCGACTGATTGTGCCGTGGAAATATGGCTTTAAAGGGATTAAATCGATAGTCAGTATTAAGCTGACCCGCGAGCGTCCGCCAACCACCTGGAATCAGGCAGCGCCTGACGAATACGGTTTTTACGCCAACGTCAATCCg > 1:1287529/1‑239 (MQ=255)
|
ATGACTTAACCCGTCGCTTCCCGCTGGAAGAGCGTATTTATCGTATGCGCTGCGTGGAAGCGTGGTCGATGGTGGTGCCGTGGATTGGTTTTCCGCTGCACAAATTGCTGGCGCTTGCCGAACCTACCAGCAATGC‑GAAGTATGTCGCTTTCGAAACAATTTATGCACCGGAACAGATGCCA‑GGCCAGCAGGACCGCTTT‑ATCGGCGGTGGGCTGAAATATCCTTATGTCGAAGGATTGCGTCTC‑GACGAAGCAATGCATCCGCTCACACTGA‑TGACCGTAGGTG‑TTTATGGCAAGGCGTTACCGCCACAAAATGGCGCGCCGGTGCGACTGATTGTGCCGTGGAAATATGGCTTTAAAGGGATTAAATCGATAGTCAGTATTAAGCTGACCCGCGAGCGTCCGCCAACCACCTGGAATCTGGCAGCGCCTGACGAATACGGTTTTTACGCCAACGTTAATCCG > NC_000913/2039863‑2040326
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 13 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
GATK/CNVnator alignment
N/A
