Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A7 F17 I0 R1
|
124 |
155.2 |
3079696 |
98.3% |
3027341 |
226.1 |
Breseq alignment
BRESEQ :: Evidence
|
| evidence |
seq id |
position |
mutation |
freq |
annotation |
gene |
description |
| RA |
NC_000913 |
4,488,189 |
A→G |
13.0% |
M291V (ATG→GTG) |
lptG → |
lipopolysaccharide export ABC permease |
|
| |
seq id |
position |
ref |
new |
freq |
score (cons/poly) |
reads |
annotation |
genes |
product |
| * | NC_000913 | 4,488,189 | 0 | A | G | 13.0%
| 279.5
/ 7.1
| 108 | M291V (ATG→GTG) | lptG | lipopolysaccharide export ABC permease |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (29/63); new base G (13/2); total (43/65) |
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 7.51e-05 |
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 |
Only 100 of 111 total aligned reads displayed.
ATCTGATCTGACCAATCCGAAACAGATTACCGGTTCGCAGACGGTGAGCGGCACCTGGAAAACCAACCTCACGCCGGACAAACTGGGCGTGGTGGCGCTGGACCCGGATGCACTCTCTATCAGCGGTTTGCACAACTATGTGAAGTATCTGAAGTCGAGCGGTCAGGATGCCGGACGTTATCAGCTCAACATGTGGAGCAAAATCTTCCAGCCGCTATCTGTGGCGGTGATGATGCTGATGGCGCTGTCGTTCATCTTTGGCCCACTGCGTAGCGTACCGATGGGCGTGCGTGTGGTCACCGGTATCAGTTTCGG‑TTTTGTCTTCTACGTACTGGACCAGATCTTCGGCCCGCTGACGTTGGTTTATGGCATCCCGCCGATCATCGGCGCACTGTTGCCAAGCGCCAG‑CTTCTTCTTAATCAGCCTGTGGCTGTTAATGAGAAAATCGTAACCGAATGAACGAATAAAGG > NC_000913/4487951‑4488420
|
atctgatctgACCAATCCGAAACAGATTACCGGTTCGCAGACGGTGAGCGGCACCTGGAAAACCAACCTCACGCCGGACAAACTGGGCGTGGTGGCGCTGGACCCGGATGCACTCTCTATCAGCGGTTTGCACAACTATGTGAAGTATCTGAAGTCGAGCGGTCAGGATGCCGGACGTTATCAGCTCAACATGTGGAGCAAAATCTTCCAGCCGCTATCTGTGGCGGTGATGATGCTGa < 2:1260556/239‑1 (MQ=255)
atctgatctgACCAATCCGAAACAGATTACCGGTTCGCAGACGGTGAGCGGCACCTGGAAAACCAACCTCACGCCGGACAAACTGGGCGTGGTGGCGCTGGACCCGGATGCACTCTCTATCAGCGGTTTGCACAACTATGTGAAGTATCTGAAGTCGAGCGGTCAGGATGCCGGACGTTATCAGCTCAACATGTGGAGCAAAATCTTCCAGCCGCTATCTGTGGCGGTGATGATGCTGa < 1:1387333/239‑1 (MQ=255)
atctgatctgACCAATCCGAAACAGATTACCGGTTCGCAGACGGTGAGCGGCACCTGGAAAACCAACCTCACGCCGGACAAACTGGGCGTGGTGGCGCTGGACCCGGATGCACTCTCTATCAGCGGTTTGCACAACTATGTGAAGTATCTGAAGTCGAGCGGTCAGGATGCCGGACGTTATCAGCTCAACATGTGGAGCAAAATCTTCCAGCCGCTATCTGTGGCGGTGATGATGCTGa < 2:841594/239‑1 (MQ=255)
tctgaCCAATCCGAAACAGATTACCGGTTCGCAGACGGTGAGCGGCACCTGGAAAACCAACCTCACGCCGGACAAACTGGGCGTGGTGGCGCTGGACCCGGATGCACTCTCTATCAGCGGTTTGCACAACTATGTGAAGTATCTGAAGTCGAGCGGTCAGGATGCCGGACGTTATCAGCTCAACATGTGGAGCAAAATCTTCCAGCCGCTATCTGTGGCGGTGATGATGCTGATGgcgc < 1:104165/239‑1 (MQ=255)
tctgaCCAATCCGAAACAGATTACCGGTTCGCAGACGGTGAGCGGCACCTGGAAAACCAACCTCACGCCGGACAAACTGGGCGTGGTGGCGCTGGACCCGGATGCACTCTCTATCAGCGGTTTGCACAACTATGTGAAGTATCTGAAGTCGAGCGGTCAGGATGCCGGACGTTATCAGCTCAACATGTGGAGCAAAATCTTCCAGCCGCTATCTGTGGCGGTGATGATGCTGATGgcgc < 1:1308508/239‑1 (MQ=255)
tctgaCCAATCCGAAACAGATTACCGGTTCGCAGACGGTGAGCGGCACCTGGAAAACCAACCTCACGCCGGACAAACTGGGCGTGGTGGCGCTGGACCCGGATGCACTCTCTATCAGCGGTTTGCACAACTATGTGAAGTATCTGAAGTCGAGCGGTCAGGATGCCGGACGTTATCAGCTCAACATGTGGAGCAAAATCTTCCAGCCGCTATCTGTGGCGGTGATGATGCTGATGgcg < 2:207141/238‑1 (MQ=255)
gaCCAATCCGAAACAGATTACCGGTTCGCAGACGGTGAGCGGCACCTGGAAAACCAACCTCACGCCGGACAAACTGGGCGTGGTGGCGCTGGACCCGGATGCACTCTCTATCAGCGGTTTGCACAACTATGTGAAGTATCTGAAGTCGAGCGGTCAGGATGCCGGACGTTATCAGCTCAACATGTGGAGCAAAATCTTCCAGCCGCTATCTGTGGCGGTGATGATGCTGATGGCGCTGt < 1:564495/239‑1 (MQ=255)
aTCCGAAACAGATTACCGGTTCGCAGACGGTGAGCGGCACCTGGAAAACCAACCTCACGCCGGACAAACTGGGCGTGGTGGCGCTGGACCCGGATGCACTCTCTATCAGCGGTTTGCACAACTATGTGAAGTATCTGAAGTCGAGCGGTCAGGATGCCGGACGTTATCAGCTCAACATGTGGAGCAAAATCTTCCAGCCGCTATCTGTGGCGGTGATGATGCTGATGGCGCTGTCGTTc < 1:209929/239‑1 (MQ=255)
tCCGAAACAGATTACCGGTTCGCAGACGGTGAGCGGCACCTGGAAAACCAACCTCACGCCGGACAAACTGGGCGTGGTGGCGCTGGACCCGGATGCACTCTCTATCAGCGGTTTGCACAACTATGTGAAGTATCTGAAGTCGAGCGGTCAGGATGCCGGACGTTATCAGCTCAACATGTGGAGCAAAATCTTCCAGCCGCTATCTGTGGCGGTGGTGATGCTGGTGGAGCTTTCGtctt > 2:1492619/1‑236 (MQ=255)
tCCGAAACAGATTACCGGTTCGCAGACGGTGAGCGGCACCTGGAAAACCAACCTCACGCCGGACAAACTGGGCGTGGTGGCGCTGGACCCGGATGCACTCTCTATCAGCGGTTTGCACAACTATGTGAAGTATCTGAAGTCGAGCGGTCAGGATGCCGGACGTTATCAGCTCAACATGTGGAGCAAAATCTTCCAGCCGCTATCTGTGGCGGTGGTGATGCTGAttggggttgcggtca > 1:1252554/1‑225 (MQ=255)
tCCGAAACAGATTACCGGTTCGCAGACGGTGAGCGGCACCTGGAAAACCAACCTCACGCCGGACAAACTGGGCGTGGTGGCGCTGGACCCGGATGCACTCTCTATCAGCGGTTTGCACAACTATGTGAAGTATCTGAAGTCGAGCGGTCAGGATGCCGGACGTTATCAGCTCAACATGTGGAGCAAAATCTTCCAGCCGCTATCTGTGGCGGTGATTATGGTGATGGCGCCGTCGtt > 1:192125/1‑237 (MQ=255)
tCCGAAACAGATTACCGGTTCGCAGACGGTGAGCGGCACCTGGAAAACCAACCTCACGCCGGACAAACTGGGCGTGGTGGCGCTGGACCCAGATGCACTCTCTATCAGCGGTTTGCACAACTATGTGAAGTATCTGAAGTCGAGCGGTCAGGATGCCGGACGTTATCAGCTCAACATGTGGAGCAAAATCTTCCCGCCGCTATCTGTGGCGGTGGTGATGATGGTGGGGCTGTctgg > 2:1342248/1‑234 (MQ=255)
ccGAAACAGATTACCGGTTCGCAGACGGTGAGCGGCACCTGGAAAACCAACCTCACGCCGGACAAACTGGGCGTGGTGGCGCTGGACCCGGATGCACTCTCTATCAGCGGTTTGCACAACTATGTGAAGTATCTGAAGTCGAGCGGTCAGGATGCCGGACGTTATCAGCTCAACATGTGGAGCAAAATCTTCCAGCCGCTATCTGTGGCGGTGATGATGCTGATGGCGCTGTCGTTCAt < 1:1516490/239‑1 (MQ=255)
aaCAGATTACCGGTTCGCAGACGGTGAGCGGCACCTGGAAAACCAACCTCACGCCGGACAAACTGGGCGTGGTGGCGCTGGACCCGGATGCACTCTCTATCAGCGGTTTGCACAACTATGTGAAGTATCTGAAGTCGAGCGGTCAGGATGCCGGACGTTATCAGCTCAACATGTGGAGCAAAATCTTCCAGCCGCTATCTGTGGCGGCGTTGAGGCTGATGGGGGTGTCGTTCATGttt > 1:185624/1‑239 (MQ=255)
aCAGATTACCGGTTCGCAGACGGTGAGCGGCACCTGGAAAACCAACCTCACGCCGGACAAACTGGGCGTGGTGGCGCTGGACCCGGATGCACTCTCTATCAGCGGTTTGCACAACTATGTGAAGTATCTGAAGTCGAGCGGTCAGGATGCCGGACGTTATCAGCTCAACATGTGGAGCAAAATCTTCCAGCCGCTATCTGTGGCGGTGATGATGCTGATGGCGCTGTCGTTCATCTTTg < 2:623457/239‑1 (MQ=255)
aTTACCGGTTCGCAGACGGTGAGCGGCACCTGGAAAACCAACCTCACGCCGGACAAACTGGGCGTGGTGGCGCTGGACCCGGATGCACTCTCTATCAGCGGTTTGCACAACTATGTGAAGTATCTGAAGTCGAGCGGTCAGGATGCCGGACGTTATCAGCTCAACATGTGGAGCAAAATCTTCCAGCCGCTATCTGTGGCGGTGATGTTGCTGATGGCGCTGTTGGTCATCTTTGGcc > 1:1449719/1‑238 (MQ=255)
aTTACCGGTTCGCAGACGGTGAGCGGCACCTGGAAAACCAACCTCACGCCGGACAAACTGGGCGTGGTGGCGCTGGACCCGGATGCACTCTCTATCAGCGGTTTGCACAACTATGTGAAGTATCTGAAGTCGAGCGGTCAGGATGCCGGACGTTATCAGCTCAACATGTGGAGCAAAATCTTCCAGCCGCTATCTGTGGCGGTGATGATGCTGGTGGCGCTGTCGTTCATTTTTGGcc > 1:577371/1‑238 (MQ=255)
ttACCTGTTCGCAGACGGTGAGCGGCACCTGGAAAACCAGCCTCACGCCGGACAAACTGGGCGTGGTGGCGCTGGACCCGGATGCACTCTCTATCAGCGGTTTGCACAACTATGTGAAGTATCTGAAGTCGAGCGGTCAGGATGCCGGACGTTATCAGCTCAACATGTGGAGCAAAATCTTCCAGCCGCTATCTGTGGCGGTGATGATGCTGATGGCGCTGTCGTTCATCTTTGGCCCa < 1:1236844/239‑1 (MQ=255)
ttACCGGTTCGCAGACGGTGAGCGGCACCTGGAAAACCAACCTCACGCCGGACAAACTGGGCGTGGTGGCGCTGGACCCGGATGCACTCTCTATCAGCGGTTTGCACAACTATGTGAAGTATCTGAAGTCGAGCGGTCAGGATGCCGGACGTTATCAGCTCAACATGTGGAGCAAAATCTTCCAGCCGCTATCTGTGGCGGTGATGATGCTGATGGCGCTTTCGTTCATCTTTGGc < 1:749164/236‑1 (MQ=255)
ttACCGGTTCGCAGACGGTGAGCGGCACCTGGAAAACCAACCTCACGCCGGACAAACTGGGCGTGGTGGCGCTGGACCCGGATGCACTCTCTATCAGCGGTTTGCACAACTATGTGAAGTATCTGAAGTCGAGCGGTCAGGATGCCGGACGTTATCAGCTCAACATGTGGAGCAAAATCTTCCAGCCGCTATCTGTGGCGGTGATGATGCTGATGGCGCTGTCGTTCATCTTTGGcc < 2:711430/237‑1 (MQ=255)
ttACCGGTTCGCAGACGGTGAGCGGCACCTGGAAAACCAACCTCACGCCGGACAAACTGGGCGTGGTGGCGCTGGACCCGGATGCACTCTCTATCAGCGGTTTGCACAACTATGTGAAGTATCTGAAGTCGAGCGGTCAGGATGCCGGACGTTATCAGCTCAACATGTGGAGCAAAATCTTCCAGCCGCTATCTGTGGCGGTGATGATGCTGATGGCGCTGTCGTTCATCTTTGGcc < 1:1114658/237‑1 (MQ=255)
ttACCGGTTCGCAGACGGTGAGCGGCACCTGGAAAACCAACCTCACGCCGGACAAACTGGGCGTGGTGGCGCTGGACCCGGATGCACTCTCTATCAGCGGTTTGCACAACTATGTGAAGTATCTGAAGTCGAGCGGTCAGGATGCCGGACGTTATCAGCTCAACATGTGGAGCAAAATCTTCCAGCCGCTATCTGTGGCGGTGATGATGCTGATGGCGCTGTCGTTCATCTTTGGCCCa < 1:269678/239‑1 (MQ=255)
ttACCGGTTCGCAGACGGTGAGCGGCACCTGGAAAACCAACCTCACGCCGGACAAACTGGGCGTGGTGGCGCTGGACCCGGATGCACTCTCTATCAGCGGTTTGCACAACTATGTGAAGTATCTGAAGTCGAGCGGTCAGGATGCCGGACGTTATCAGCTCAACATGTGGAGCAAAATCTTCCAGCCGCTATCTGTGGCGGTGATGATGCTGATGGCGCTGTCGTTCATCTTTGGCCCa < 1:1417101/239‑1 (MQ=255)
ttACCGGTGCGCAGACGGTGAGCGGCACCGGGAAAGCCAACCGCACGCCGGACAAACTGGGCGTGGTGGCGCTGGACCCGGATGCACTCTCTATCAGCGGTTTGCACAACTATGTGAAGTATCTGAAGTCGAGCGGTCAGGATGCCGGACGTTATCAGCTCAACATGTGGAGCAAAATCTTCCAGCCGCTATCTGTGGCGGTGATGATGCTGATGGCGCTGTCGTTCATCTTTGGCCCa < 2:1252554/239‑1 (MQ=255)
tcacaggTTCGCAGCCGGGGGGCGGAACGTGGAAACCCAACCTCACGCCGGACAAACTGGGCGTGGTGGCGCTGGACCCGGATGCACTCTCTATCAGCGGTGTGCACAACTATGTGAAGTATCTGAAGTCGAGCGGTCAGGATGACGGCCGTTACCAGCTCAACAGGTGGAGCAAAATCTTCCAGCCGCTATCTGTGGCGGTGATGATGCTGATGGCGCTGTCGTTCATCTTTGGcc < 2:899306/232‑1 (MQ=255)
ggTTCGCAGACGGTGGCCGGGACCTGGAAACCCAACCCCACGCCGGACAAACTGGGCGTGGGGGCGCTGGACCCGGATGCACTCTCTATCAGCGGTTTGCACAACTATGTGAAGTATCTGAAGTCGAGCGGTCAGGATGCCGGACGTTATCAGCTCAACATGTGGAGCAAAATCTTCCAGCCGCTATCTGTGGCGGTGATGATGCTGATGGCGCTGTCGTTCATCTTTGGCCCACTgcg < 2:603805/239‑1 (MQ=255)
ggTTCGCAGACGGTGAGCGGCACCTGGAAAACCAACCTCACGCCGGACAAACTGGGCGTGGGGGCGCTGGACCCGGATGCCCTCTCTATCAGCGGTTTGCACAACTATGTGAAGTATCTGAAGTCGAGCGGTCAGGATGCCGGACGTTATCAGCTCAACATGGGGAGCAAAATCTTCCAGCCGCTATCTGTGGCGGTGATGATGCTGATGGCGCTGTCGTTCATCTTTGGCCCACTgcg < 2:889224/239‑1 (MQ=255)
cGCAGACGGTGAGCGGCACCTGGAAAACCAACCTCACGCCGGACAAACTGGGCGTGGTGGCGCTGGACCCGGATGCACTCTCTATCAGCGGTTTGCACAACTATGTGAAGTATCTGAAGTCGAGCGGTCAGGATGCCGGACGTTATCAGCTCAACATGTGGAGCAAAATCTTCCAGCCGCTATCTGTGGCGGTGATGATGCTGATGGCGCTGTCGTTCATCTTTGGCCCACTgcgtagc > 1:1048210/1‑239 (MQ=255)
gTGAGCGGCACCTGGAAAACCAACCTCACGCCGGACAAACTGGGCGTGGTGGCGCTGGACCCGGATGCACTCTCTATCAGCGGTTTGCACAACTATGTGAAGTATCTGAAGTCGAGCGGTCAGGATGCCGGACGTTATCAGCTCAACATGTGGAGCAAAATCTTCCAGCCGCTATCTGTGGCGGTGATGATGCTGGTGGCGCTGTGGTTCATCTTTTGGCCCCCGCGCTGCGTAcc > 2:1218283/1‑236 (MQ=255)
tGAGCGGCACCTGGAAAACCAACCTCACGCCGGACAAACTGGGCGTGGTGGCGCTGGACCCGGATGCACTCTCTATCAGCGGTTTGCACAACTATGTGAAGTATCTGAAGTCGAGCGGTCAGGATGCCGGACGTTATCAGCTCAACATGTGGAGCAAAATCTTCCAGCCGCTATCTGTGGCGGTGATGATGCTGATGGCGCTGTCGTTCATCTTTGGCCCACTGCGTAGCGTACCGAt < 1:935331/238‑1 (MQ=255)
aGCGGCACCTGGAAAACCAACCTCACGCCGGACAAACTGGGCGTGGTGGCGCTGGACCCGGATGCACTCTCTATCAGCGGTTTGCACAACTATGTGAAGTATCTGAAGTCGAGCGGTCAGGATGCCGGACGTTATCAGCTCAACATGTGGAGCAAAATCTTCCAGCCGCTATCTGTGGCGGTGGTGATGCTGGTGGGGCTGGCGGTCTTCTTTTGCCCACTTGGTGGCGCACCGGTggg > 2:210887/1‑239 (MQ=255)
ggCACCTGGAAAACCAACCTCACGCCGGACAAACTGGGCGTGGTGGCGCTGGACCCGGATGCACTCTCTATCAGCGGTTTGCACAACTATGTGAAGTATCTGAAGTCGAGCGGTCAGGATGCCGGACGTTATCAGCTCAACATGTGGAGCAAAATCTTCCAGCCGCTATCTGTGGCGGTGATGATGCTGATGGCGCTGTCGTTCATCTTTGGCCCACTGCGTAGCGTACCGATGGgcg < 1:632034/238‑1 (MQ=255)
aCCTGGAAAACCAACCTCACGCCGGACAAACTGGGCGTGGTGGCGCTGGACCCGGATGCACTCTCTATCAGCGGTTTGCACAACTATGTGAAGTATCTGAAGTCGAGCGGTCAGGATGCCGGACGTTATCAGCTCAACATGTGGAGCAAAATCTTCCAGCCGCTATCTGTGGCGGTGGTGATGCGGATGGGGCAGTCGTTTCTCCTTTGCCCACTGCGTAGCGTACCGACggggggggg > 2:1258010/1‑233 (MQ=255)
cTGGAAAACCAACCTCACGCCGGACAAACTGGGCGTGGTGGCGCTGGACCCGGATGCACTCTCTATCAGCGGTTTGCACAACTATGTGAAGTATCTGAAGTCGAGCGGTCAGGATGCCGGACGTTATCAGCTCAACATGTGGAGCAAAATCTTCCAGCCGCTATCTGTGGCGGTGATGAAGCTGATGGCGCTGTCGTTCATCTTTGGGCCACTGCGGAGCGTACCGGTGGgcgtgcggg > 1:686916/1‑237 (MQ=255)
ggAAAACCAACCTCACGCCGGACAAACTGGGCGTGGTGGCGCTGGACCCGGATGCACTCTCTATCAGCGGTTTGCACAACTATGTGAAGTATCTGAAGTCGAGCGGTCAGGATGCCGGACGTTATCAGCTCAACATGTGGAGCAAAATCTTCCAGCCGCTATCTGTGGCGGTGATGATGCTGGTGGCGCTGTCGTTCATCTTTGGTCCCCTGCGTTGCGTACCGATTGGCGTGCGtgtg > 1:996438/1‑239 (MQ=255)
aaaaCCAACCTCACGCCGGACAAACGGGGCGTGGTGGCGCTGGACCCGGATGCACTCTCTATCAGCGGTTTGCACAACTATGTGAAGTATCTGAAGTCGAGCGGTCAGGATGCCGGACGTTATCAGCTCAACATGTGGAGCAAAATCTTCCAGCCGCTATCTGTGGCGGTGATGATGCTGATGGCGCTGTCGTTCATCTTTGGCCCACTGCGTAGCGTACCGAt < 1:1361787/224‑1 (MQ=255)
aaaCCAACCTCCCGCCGGACAAACTGGGCGTGGTGGCGGTGGACCGGGATGCATTCTCTAACAGGGGTTTGCACAACTATGTGAAGTATCTGAAGGCGAGCGGTCAGGATGCCGGACGTTATCAGCTCAACATGTGGAGCAAAATCTTCCAGCCGCTATCTGTGGCGGTGATGATGCTGATGGCGCTGTCGTTCATCTTTGGCCCACTGCGTAGCGTACCGATGGGCGTGCGTGTGGt < 1:1517105/238‑1 (MQ=255)
ggtccagtacgtagaagACAAACTGGGCGTGGTGGCGCTGGACCCGGATGCACTCTCTATCAGCGGTTTGCACAACTATGTGAAGTATCTGAAGTCGAGCGGTCAGGATGCCGGACGTTATCAGCTCAACATGTGGAGCAAAATCTTCCAGCCGCTATCTGTGGCGGTGATGATGCTGATGGCGCTGTCGTTCATCTTTGGCCCACTGCGTAGCGTACCGATGGGCGTGCGTGTGGTCa < 2:601971/223‑1 (MQ=255)
aaccTCACGCCGGACAAACTGGGCGTGGTGGCGCTGGACCCGGATGCACTCTCTATCAGCGGTTTGCACAACTATGTGAAGTATCTGAAGTCGAGCGGTCAGGATGCCGGACGTTATCAGCTCAACATGTGGAGCAAAATCTTCCAGCCGCTATCTGTGGCGGTGATGATGCTGATGGCGCTGTTGTTCATCTTTGGCCCCCTGCGTAGCGTACCGCTGGGGGGGCGGGTGGTCCCCgg > 1:874038/1‑239 (MQ=255)
accTCACGCCGGACAAACTGGGCGTGGTGGCGCTGGACCCGGATGCACTCTCTATCAGCGGTTTGCACAACTATGTGAAGTATCTGAAGTCGAGCGGTCAGGATGCCGGACGTTATCAGCTCAACATGTGGAGCAAAATCTTCCAGCCGCTATCTGTGGCGGTGATGATGCTGATGGCGCTGTCGTTCATCTTTTGCCCACTGCGTAGCGTACCGCTGGGCGGGCGGGGGGGCCCCggg > 1:155464/1‑238 (MQ=255)
ccTCACGCCGGACAAACTGGGCGTGGTGGCGCTGGACCCGGATGCACTCTCTATCAGCGGTTTGCACAACTATGTGAAGTATCTGAAGTCGAGCGGTCAGGATGCCGGACGTTATCAGCTCAACATGTGGAGCAAAATCTTCCAGCCGCTATCTGTGGCGGTGATGATGCTGATGGCGCTTTCGTTTATCTTTGGCCCACTGGGTAGCGTACCGCTGGGCGTGCGCGTGGGCACCggga > 1:1524997/1‑237 (MQ=255)
tCACGCCGGACAAACTGGGCGTGGTGGCGCTGGACCCGGATGCACTCTCTATCAGCGGTTTGCACAACTATGTGAAGTATCTGAAGTCGAGCGGTCAGGATGCCGGACGTTATCAGCTCAACATGTGGAGCAAAATCTTCCAGCCGCTATCTGTGGCGGTGATGATGTAGAGGGGCGTGTCGCTCTTCTTTGTCCCCCTGCCGAGCGTGCCGATCGGGGCGCGTgggggtcccgggat > 2:14472/1‑228 (MQ=255)
tCACGCCGGACAAACTGGGCGTGGTGGCGCTGGACCCGGATGCACTCTCTATCAGCGGTTTGCACAACTATGTGAAGTATCTGAAGTCGAGCGGTCAGGATGCCGGACGTTATCAGCTCAACATGTGGAGCAAAATCTTCCAGCCGCTATCTGTGGCGGTGATGATGCTGATGGGGCTGTCGGTCATCTTTGGGCCCCTGCGGAGCGGACCGATGGGGGTGCGGGTGGTGACCgggaac > 2:784107/1‑235 (MQ=255)
tCACGCCGGACAAACTGGGCGTGGTGGCGCTGGACCCGGATGCACTCTCTATCAGCGGTTTGCACAACTATGTGAAGTATCTGAAGTCGAGCGGTCAGGATGCCGGACGTTATCAGCTCAACATGTGGAGCAAAATCTTCCAGCCGCTATCTGTGGCGGGGATGATGCTGGCGGCGCTGTCGTTCATCTTTTTCCCCCTCCGGTGGGTACCGGTGGgggggcgggctgtctcttttta > 2:1361787/1‑223 (MQ=255)
cGCCGGACAAACTGGGCGTGGTGGCGCTGGACCCGGATGCACTCTCTATCAGCGGTTTGCACAACTATGTGAAGTATCTGAAGTCGAGCGGTCAGGATGCCGGACGTTATCAGCTCAACATGTGGAGCAAAATCTTCCAGCCGCTATCTGTGGCGGTGATGATGCTGATGgcg < 1:931987/173‑1 (MQ=255)
cGGCCAAAGTGGGCGTGGGGGCGCTGGACCTGGAGTCCCTCTCTAGCAGCGGTTTGCACAACTATGTGAAGTATCTGAAGTCGAGCGGTCAGGAGGCCGGACGTGATCAGCACAACATGTGGAGCAAAATCTTCCAGCCGCTCTCTGTGGCGGTGATGATGCTGATGGCGCTGTCGTTCATCTTTGGCCCACTGCGTAGCGTACCGATGGGCGTGCGTGTGGTCACCGGTATCAGttt < 2:1063875/238‑1 (MQ=255)
aCTGGGCGTGGTGGCGCTGGACCCGGATGCACTCTCTATCAGCGGTTTGCACAACTATGTGAAGTATCTGAAGTCGAGCGGTCAGGATGCCGGACGTTATCAGCTCAACATGTGGAGCAAAATCTTCCAGCCGCTATCTGTGGCGGTGATGATGGTGGTGGGGGTGTCGTTCa > 2:931987/1‑173 (MQ=255)
gCGTGGTGGCGCTGGACCCGGATGCACTCTCTATCAGCGGTTTGCACAACTATGTGAAGTATCTGAAGTCGAGCGGTCAGGATGCCGGACGTTATCAGCTCAACATGTGGAGCAAAATCTTCCAGCCGCTATCTGTGGCGGTGATGATGCTGATGGCGCTGTGGTTCGTCTTTTGCCCCCTGCGGTGCGTTCCGATGGGCGTGCGGGTGGTCACCGGTATCCGTTTCGG‑gttttttt > 2:1168715/1‑233 (MQ=255)
gCGTGGTGGCGCTGGACCCGGATGCACTCTCTATCAGCGGTTTGCACAACTATGTGAAGTATCTGAAGTCGAGCGGTCAGGATGCCGGACGTTATCAGCTCAACATGTGGAGCAAAATCTTCCAGCCGCTATCTGTGGCGGTGATGAATCTGATCGCGCTGTCGTTCATCTTTTGCCCCCCCCGTGGCGGACCCATGGGCGGGCGGGTGGGCCACGCGGTCAGCTTCGG‑TTTTGtcttt > 2:1263060/1‑238 (MQ=255)
ggCGCTGGACCCGGATGCACTCTCTATCAGCGGTTTGCACAACTATGTGAAGTATCTGAAGTCGAGCGGTCAGGATGCCGGACGTTATCAGCTCAACATGTGGAGCAAAATCTTCCAGCCGCTATCTGTGGCGGTGATGATGCTGATGGCGCTGTCGTTCATCTTTGGCCCACTGCGTAGCGTACCGATGGGCGTGCGTGTGGTCACCGGTATCAGTTTCGG‑TTTTGTCTTCTACGTa < 1:1258010/238‑1 (MQ=255)
ggCGCTGGACCCGGATGCACTCTCTATCAGCGGTTTGCACAACTATGTGAAGTATCTGAAGTCGAGCGGTCAGGATGCCGGACGTTATCAGCGCAACATGTGGAGCAAAATCTTCCAGCCGCTATCTGTGGCGGTGATGATGCTGATGGCGCTGTCGTTCATCTTTGGCCCACTGCGTAGCGTACCGATGGGCGTGCGTGTGGTCACCGGTATCAGTTTCGG‑TTTTGTCTTCTACGTAc < 1:806251/239‑1 (MQ=255)
ggCGCTGGACCCCGATGCACTCTCTATCATCGGTTTGCACAACTATGTGAAGTATCTGAAGTCGAGCGGTCAGCATGCCGGACGTTATCAGCTCAACATGTGGAGCAAAATCTTCCAGCCGCTATCTGTGGCGGTGATGATGCTGATGGCGCTGTCGTTCATCTTTGGCCCACTGCGTAGCGTACCGATGGGCGTGCGTGTGGTCACCGGTATCAGTTTCGG‑TTTTGTCTTCTACGTa < 1:279603/238‑1 (MQ=255)
gcTGGACCCGGATGCACTCTCTATCAGCGGTTTGCACAACTATGTGAAGTATCTGAAGTCGAGCGGTCAGGATGCCGGACGTTATCAGCTCAACATGTGGAGCAAAATCTTCCAGCCGCTATCTGTGGCGGTGATGATGCTGATGGCGCTGTCGTTCATCTTTGGCCCACTGCGTAGCGTACCGATGGGCGTGCGTGTGGTCACCGGTATCAGTTTCGG‑TTTTGTCTTCTACGTACTg < 2:703483/238‑1 (MQ=255)
cTGGACCCGGATGCACTCTCTATCAGCGGTTTGCACAACTATGTGAAGTATCTGAAGTCGAGCGGTCAGGATGCCGGACGTTATCAGCTCAACATGTGGAGCAAAATCTTCCAGCCGCTATCTGTGGCGGTGATGGTGCTGGTGGCGCTGTCGTTCCTCTTTTGCCCCCTCCGTAGCGTACCCATGGGGGGGCGGGTGGTCACCCGGATCAGCTTTGG‑GTTTGTCTTTTACGTACttg > 2:184463/1‑236 (MQ=255)
aCCCGGATGCACTCTCTATCAGCGGTTTGCACAACTATGTGAAGTATCTGAAGTCGAGCGGTCAGGATGCCGGACGTTATCAGCTCAACATGTGGAGCAAAATCTTCCAGCCGCTATCTGTGGCGGTGATGATGCTGATGGCGCTGTCGTTCATCTTTGGCCCACTGCGTAGCGTACCGATGGGCGTGCGTGTGGTCACCGGTATCAGTTTCGG‑TTTTGTCTTCTACGTACTGGACCa < 1:198823/238‑1 (MQ=255)
tCAGCGGTTTGCACAACTATGTGAAGTATCTGAGGTCGAGCGGTCAGGATGCCGGACGTTATCAGCTCAACATGTGGAGCAAAATCTTCCAGCCGCTATCTGTGGCGGTGATGATGCTGATGGCGCTGTCGTTCATCTTTGGCCCACTGCGTAGCGTACCGATGGGCGTGCGTGTGGTCACCGGTATCAGTTTCGG‑TTTTGTCTTCTACGTACTGGACCAGATCTTCGGCCCGCTGACg < 2:1388080/239‑1 (MQ=255)
tCAGCGGTTTGCACAACTATGTGAAGTATCTGAAGTCGGGCGGTCAGGATGCCGGACGTTATCAGCTCAACATGTGGAGCAAAATCTTCCAGCCGCTATCTGTGGCGGTGATGATGCTGATGGCGCTGTCGTTCATCTTTGGCCCACTGCGTAGCGTACCGATGGGCGTGCGTGTGGTCACCGGTATCAGTTTCGG‑TTTTGTCTTCTACGTACTGGACCAGATCTTCGGCCCGCTGACg < 1:1342248/239‑1 (MQ=255)
tCAGCGGTTTGCACAACTATGTGAAGTATCTGAAGTCGAGCGGTCAGGATGCCGGACGTTATCAGCTCAACATGTGGAGCAAAATCTTCCAGCCGCTATCTGTGGCGGTGATGATGCTGATGGCGCTGTCGTTCATCTTTGGCCCACTGCGTAGCGTACCGATGGGCGTGCGTGTGGTCACCGGTATCAGTTTCGG‑TTTTGTCTTCTACGTACTGGACCAGATCTTCGGCCCGCTGACg < 1:1168715/239‑1 (MQ=255)
tCAGCGGTTTGCACAACTAGGGGAAGTATCTGAAGTCGAGCGGTCAGGATGCCGGACGTTAGCAGCTCAACATGTGGAGCAAAATCTTCCAGCCGCTATCTGTGGCGGTGATGATGCTGATGGCGCTGTCGTTCATCTTTGGCCCACTGCGTAGCGTACCGATGGGCGTGCGTGTGGTCACCGGTATCAGTTTCGG‑TTTTGTCTTCTACGTACTGGACCAGATCTTCGGCCCGCTGACg < 2:783133/239‑1 (MQ=255)
cAGCGGTTTGCACAACTATGTGAAGTATCTGAAGTCGAGCGGTCAGGATGCCGGACGTGATCAGCTCAACTTGTGGACCAAAATCTTCCAGCCGCTATCTGTGGCGGTGATGATGCTGATGGCGCTGTCGTTCATCTTTGGCCCACTGCGTAGCGTACCGATGGGCGTGCGTGTGGTCACCGGTATCAGTTTCGG‑TTTTGTCTTCTACGTACTGGACCAGATCTTCGGCCCGCTGACGt < 2:1023242/239‑1 (MQ=255)
cGGTTTGCACAACTATGTGAAGTATCTGAAGTCGAGCGGTCAGGATGCCGGACGTTATCAGCTCAACATGTGGAGCAAAATCTTCCAGCCGCTATCTGTGGCGGTGATGGTGCTGATGGCGCTGTCGTTCATCTTTGGCCCCCTGCGTAGCGTACCCATGGGCGTGCGTGTGGGCACCGGTATCAGTTTCGG‑TTTTGTCTTCTACGGACTGGGCCAGATCTTCCGCCCGCTGGCGTTgg > 1:510173/1‑239 (MQ=255)
cGGTTTGCACAACTATGTGAAGTATCTGAAGTCGAGCGGTCAGGATGCCGGACGTTATCAGCTCAACATGTGGAGCAAAATCTTCCAGCCGCTATCTGTGGCGGTGATGATGCTTGTGGCGCTGTCGTTCATCTTTGGCCCCCTGCGTAGCGTACCGATGGGGGGGCGGGGGGGCACCGGGATCAGTTTCGG‑GTTTGTTTTTTTCGTACTGGGCCAGATCTTTGGCCCCCTGACggttg > 1:623034/1‑235 (MQ=255)
ttGCACAACTATGTGAAGTATCTGAAGTCGAGCGGTCAGGATGCCGGACGTTATCAGCTCAACATGTGGAGCAAAATCTTCCAGCCGCTATCTGTGGCGGTGATGATGCTGATGGCGCTGTCGTTCATCTTTGGCCCACTGCGTAGCGTACCGATGGGCGTGCGTGTGGTCACCGGTATCAGTTTCGG‑TTTTGTCTTCTACGTACTGGACCAGATCTTCGGCCCGCTGACGTTGGTTTa < 1:14472/239‑1 (MQ=255)
tGCACAACTATGTGAAGTATCTGAAGTCGAGCGGTCAGGATGCCGGACGTTATCAGCTCAACATGTGGAGCAAAATCTTCCAGCCGCTATCTGTGGCGGTGATGATGCTGATGGCGCTGTCGTTCATCTTTGGCCCACTGCGTAGCGTACCGATGGGCGTGCGTGTGGTCACCGGTATCAGTTTCGG‑TTTTGTCTTCTACGTACTGGACCa < 1:613061/211‑1 (MQ=255)
aaCTATGTGAAGTATCTGAAGTCGAGCGGTCAGGATGCCGGACGTTATCAGCTCAACATGTGGAGCAAAATCTTCCAGCCGCTATCTGTGGCGGTGATGATGCTGATGGCGCTGTCGTTCATCTTTGGCCCACTGCGTAGCGTACCGATGGGCGTGCGTGTGGTCACCGGTATCAGTTTCGG‑TTTTGtcttct < 1:745430/193‑1 (MQ=255)
cTATGTGAAGTATCTGAAGTCGAGCGGTCAGGATGCCGGACGTTATCAGCTCAACATGTGGAGCAAAATCTTCCAGCCGCTATCTGTGGCGGTGGTGATGGTGGTGGCGCCGGTGTTCATCTTTTGGCCCCCGCGTAGGGGACCGATGGGCGGGGGGGTGGTCTCCGGTGTACGTTTTGG‑GTTTTGCTTCTTCGTTCTGGGACGGGCCTTCGGCCCGCTGCCGGTGGTTTTTGGGATc > 2:39298/1‑238 (MQ=255)
tgtgAAGTATCTGAAGTCGAGCGGTCAGGATGCCGGACGTTATCAGCTCAACATGTGGAGCAAAATCTTCCAGCCGCTATCTGTGGCGGTGATGATGGTGGTGGGGCCGTCGGTTATCTTTGGCCCCCCGCGGATCGTACCGTCGGGGGTGCGTGTTGTTACCGGGATTAGTTTCGG‑TTTTTTCTTCTACGGACTGGGCCAGATCTTCTGGCCCCTGTCGTTGGTTTATGGGCTcccc > 2:626632/1‑237 (MQ=255)
tATCTGAAGTCGAGCGGTCAGGATGCCGGACGTTATCAGCTCAACATGTGGAGCAAAATCTTCCAGCCGCTATCTGTGGCGGTGATGATGCTTATGGCGCTGTCGTTCCTCTTTGGCCCCCCGCGTAGCGGACCGGTGGGGGGGCGGGTGGTCCCCGGGATGCGTTTTGGTTTTTGTTTTTTAGGT‑CTTGGCCAGATCCTTGGGCCGTCTACGGTTGTTTATGGCATtcctcctctca > 2:924163/1‑233 (MQ=255)
tATCTGAAGTCGAGCGGTCAGGATGCCGGACGTTATCAGCTCAACATGTGGAGCAAAATCTTCCAGCCGCTATCTGTGGCGGTGATGATGCTGATGGCGCTGTCGGTTATCTTTGGCCCACCGCGTAGCGTACCGATGGGGGGGGGGGTGGTTCCCGGTTTCCGTTTCGG‑TTTTGTCTTTTTCGGACTGGGGCAGGTCTTCGGCCCGTCGGCGGTGGTTTTTGGCCTCccgccggaca > 2:545549/1‑234 (MQ=255)
tCTGAAGTCGAGCGGTCAGGATGCCGGACGTTATCAGCTCAACATGTGGAGCAAAATCTTCCAGCCGCTATCTGTGGCGGTGGAGATGCTGATGGGGCTGTCGTTTCTCTTTTGCCCCCTGCGGAGCGTACCGGGTGGCGGGCGTGTGGGCACCCGGATCCCTTTCGG‑GTTTTTTCTCTTCGGTCTGGACCCGATCTTCGGCCCCCTTTCGGTTGTTTTTTGCATTCCGCCCGTCATCg > 2:9750/1‑239 (MQ=255)
tCTGAAGTCGAGCGGTCAGGATGCCGGACGTTATCAGCTCAACATGTGGAGCAAAATCTTCCAGCCGCTATCTGTGGCGGTGATGATGCTGATGGCGCTGTCGTTCATCTTTGGCCCACTGCGTAGCGTACCGATGGGCGTGCGTGTGGTCACCGGTATCAGTTTCGG‑GTTTGTCTTCTACGTACTGGACCAGATCTTCGGCCCCCTGCCGTTGGTTTTTGGCATCCCGGCCGTCATCg > 1:643355/1‑239 (MQ=255)
cGAGCGGTCAGGATGCCGGACGTTATCAGCTCAACATGTGGAGCAAAATCTTCCAGCCGCTATCTGTGGCGGTGATGATGCTGATGGCGCTGTCGTTCATCTTTGGCCCACTGCGTAGCGTACCCATGGGCGTGCGTGTGGTCACCGGTATCAGTTTCGG‑TTTTGTCTTCTACGTACTGGACCAGATCTTCGGCCCGCTGACGTTGGTTTATGGCATCCCGCCGATCATCGgcgc > 1:1334131/1‑235 (MQ=255)
aGGATGCCGGACGTTATCAGCTCAACATGTGGAGCAAAATCTTCCAGCCGCTATCTGTGGCGGTGATGATGCTGATGGGGCCGTCGTTCCTCTTTTGCCCCCACCGTCGGGGACCGATGGGGGGGGGGGTGGGCGCCGGTATTCGGTTTGG‑GTTTGTCTTCCTCGTCCTGGGCCAGATCTTCGGCCCCCTGTCGTTGGGTTATGGTCTCCCCCCGCCAATCCGCGCCCTGtgtccacg > 2:1191121/1‑231 (MQ=255)
aTGCCGGGCGTTATCAGCTCAACATGTGGAGCAAAATCTTCCAGCCCGTTTCTGGGGCGGGGATGATGCTGGTGGGGCTGTCGTTCATCTTTGGCCCACTGCGTAGCGTACCGATGGGCGTGCGTGTGGTCACCGGTATCAGTTTCGG‑TTTTGTCTTCTACGTACTGGACCAGATCTTCGGCCCGCTGACGTTGGTTTATGGCATCCCGCCGATCATCGGCGCACTGTTGCCAAgcg < 2:155464/237‑1 (MQ=255)
cgtaCGTAATCAGCTCAACATGTGGAGCAAAATCTTCCAGCCGCTATCTGTGGCGGTGATGATGCTGATGGGGCTGTCGTTCATCTTTGGCCCACTGCGTAGCGTACCGTTGGGCGTGCGTGTGGTCACCGGTATCAGTTTCGG‑TTTTGTCTTCTACGTACTGGACCAGATCTTCGGCCCGCTGACGTTGGTTTATGGCATCCCGCCGATCATCGGCGCACTGTTGCCAAGCGCCAG‑ct < 1:1079334/236‑1 (MQ=255)
cGGCCGTTATCAGCTCAACATGTGGAGCAAAATCTTCCAGCCGCTATCTGTGGCGGTGATGATGCTGATGGCGCTGTCGTTCATCTTTGGCCCACTGCGTAGCGTACCGATGGGCGTGCGTGTGGTCACCGGTATCAGTTTCGG‑TTTTGTCTTCTACGTACTGGACCAGATCTTCGGCCCGCTGACGTTGGTTTATGGCATCCCGCCGATCATCGGCGCACTGTTGCCAAGCGCCAG‑ct < 1:39298/239‑1 (MQ=255)
aCGTTATCAGCTCAACATGTGGAGCAAAATCTTCCAGCCGCTATCTGTGGCGGTGATGATGCTGATGGCGCTGTCGTTCATCTTTGGCCCACTGCGTAGCGTACCGATGGGCGTGCGTGTGGTCACCGGTATCAGTTTCGG‑TTTTGTCTTCTACGTACTGGACCAGATCTTCGGCCCGCTGACGTTGGTTTATGGCATCCCGCCGATCATCGGCGCACTGTTGCCAAGCGCCAG‑cttc < 1:784107/238‑1 (MQ=255)
cGTTATCAGCTCAACATGTGGAGCAAAATCTTCCAGCCGCTATCTGTGGCGGTGATGATGCTGATGGCGCTGTCGTTCATCTTTGGCCCACTGCGTAGCGTACCGATGGGCGTGCGTGTGGTCACCGGTATCAGTTTCGG‑TTTTGTCTTCTACGTACTGGACCAGATCTTCGGCCCGCTGACGTTGGTTTATGGCATCCCGCCGATCATCGGCGCACTGTTGCCAAGCGCCAG‑cttctt < 1:545549/239‑1 (MQ=255)
cGTTATCAGCTCAACATGTGGAGCAAAATCTTCCAGCCGCTATCTGTGGCGGTGATGATGCTGATGGCGCTGTCGTTCATCTTTGGCCCACTGCGTAGCGTACCGATGGGCGTGCGTGTGGTCACCGGTATCAGTTTCGG‑TTTTGTCTTCTACGTACTGGACCAGATCTTCGGCCCGCTGACGTTGGTTTATGGCATCCCGCCGATCATCGGCGCACTGTTGCCAAGCGCCAG‑cttctt < 1:1218283/239‑1 (MQ=255)
gTTATCAGCTCAACATGTGGAGCAAAATCTTCCAGCCGCTATCTGTGGCGGTGGCGATGCTGGTGGCGCCGTCGTTCCTCTTTGGCCCACTGCGTAGCGTACCGATGGGGGTGCGTGTGGTTCCCGGCATTCGTTTTGG‑TTTTTTCTTCTACGTACTGGACCCGATCTTCGGCCCCCCGGCGGTGGTTTTTTGGCTCCCCCCGGTCCTCCGCGCCCTGGTGCCAAGCGCCAC‑cttcttt > 2:1304354/1‑238 (MQ=255)
gTTATCAGCCAAACAGGTGGGGAAAAATCTTCAGGCCGGTAGCGGTGGCGGTGATGATGCTGATGGCGCTGTCGTTCATCTTTGGCCCACTGCGTAGCGTACCGATGGGCGGGCGTGTGGTCACCGGTATCAGTTTCGG‑TTTTGTCTTCTACGTACTGGACCAGATCTTCGGCCCGCTGACGTTGGTTTATGGCATCCCGCCGATCATCGGCGCACTGTTGCCAAGCGCCAG‑cttctt < 2:139871/238‑1 (MQ=255)
gagccagactgggggAGCAAAACTTCCCATCCGCTATCGGTGGCGGTGATGATGCGGATGGCGTTGTCGTTCATCTTTGGCCCACTGCGTGGCGTACCGATGGGCGTGCGGGTGGTCCCCGGTATCAGTTTCGG‑TTTTGTCTTCTACGTCCTGGACCAGATCTTCGGCCCGCTGACGTTGGTTTATGGCATCCCGCCGATCATCGGCGCACTGTTGCCAAGCGCCAG‑CTTCTTCTTAAt < 2:823332/226‑1 (MQ=255)
cggcctacattggggAGCAAATTCTTCCAGCCGCTATCTGTGGCGGTGAGTATGCTGATGGCGCTGTCTTTCATCTTTGTCCCACTGCGTAGCGTACCGATGGGCGTGTGTTTGGTCACCGGTATCATTTTCGT‑TTTTGTCTTCTACGTCCTGGACCAGATCTTCGGCCCGCTGACGTTGGTTTATGGCATCCCGCCGATCATCGGCGCACTGTTGCCAAGCGCCAG‑CTTCTTCTTAAt < 2:723694/226‑1 (MQ=255)
cAGCTCAACATGTGGAGCAAAATCTTCCAGCCGCTATCTGTGGCGGTGATGATGCTGATGGCGCTGTCGTTCATCTTTGGCCCACTGCGTAGCGTACCGATGGGCGTGCGTGTGGTCACCGGTATCAGTTTCGG‑TTTTGTCTTCTACGTACTGGACCAGATCTTCGGCCCGCTGACGTTGGTTTATGGCATCCCGCCGATCATCGGCGCACTGTTGCCAAGCGCCAG‑CTTCTTCTTAAt < 1:1219435/239‑1 (MQ=255)
cTCAACATGTGGAGCAAAATCTTCCAGCCGCTATCTGTGGCGGTGATGATGCTGATGGCGCTGTCGTTCATCTTTGGCCCACTGCGTAGCGTACCGATGGGCGTGCGTGTGGTCAc < 1:941631/116‑1 (MQ=255)
cATGTGGAGCAAAATCTTCCAGCCGCTATCTGTGGCGGTGATGATGCTGATGGCGCTGTCGTTCATCTTTGGCCCACTGCGTAGCGTACCGATGGGCGTGCGTGTGGTCACCGGTATCAGTTTCGG‑TTTTGTCTTCTACGTACTGGACCAGATCTTCGGCCCGCTGACGTTGGTTTATGGCATCCCGCCGATCATCGGCGCACTGTTGCCAAGCGCCAG‑CTTCTTCTTAATCAGCCtgt < 1:26489/239‑1 (MQ=255)
tggggAGCAAACTTTGCCAGCCGCTATCTGTGGCGGGGATGATGCTGATGGCGCGGTCGTTCATCTTTGGCCCACTGCGTAGCGTACCGATGGGCGTGCGTGTGGTCACCGGTATCAGTTTCGG‑TTTTGTCTTCTACGTACTGGACCAGATCTTCGGCCCGCTGACGTTGGTTTATGGCATCCCGCCGATCATCGGCGCACTGTTGCCAAGCGCCAG‑CTTCTTCTTAATCAGCCTGTgg < 2:1503018/236‑1 (MQ=255)
gtgGAGCAAAATCTTCCAGCCGCTATCTGTGGCGGTGATGATGCTGATGGCGCTGTCGTTCATCTTTTGCCCACTGCGTCGCGGACCGATGGGGGGGCGGGTGGGCACCGGGGTCAGTTTCGG‑GTTTTTCTTCTTCGTACTGGACCCGGTCTTCGGCCCGCTGACGTTGGTTTTTTGCATCCCCCCGCTCATCGGCGCCCTGTTTCCAAGCGCCAG‑CTTTTTCTTTAACAACCTGTggg > 2:307794/1‑238 (MQ=255)
tgGAGCAAAATCTTCCAGCCGCTATCTGTGGCGGTGATGATGCTGATGGCGCTGTCGTTCATCTTTGGCCCACt < 1:393586/74‑1 (MQ=255)
gcaaattgccccaccctacctCTGCGGCGGTTATGATCCTGATGGCGCTGTCGTTCACCTTTGGCCCACTGCGTTGCGTGCCGATGGGCGTGCTTGTGTTCACCGGTATCGGTTTCGG‑TTTTTTCTTCTACGTACTGGACCACATCTTCGGCCCGCTGACGTTGGTGTATTGCATCCCGCCGATCTTCGGCGCACTGTTGCCAAGCGCCAG‑CTTCTTCTTAATCAGCCTGTGGCTGtt < 2:242911/218‑1 (MQ=255)
gCAAAATCTTCCAGCCGCTATCTGTGGCGGTGCTGATGCTGATGGCGCTGTCGTTCATCTTTTGCCCACTGCGGAGCGGACCGCTGGGGGTGCGTGGGGTCCCCGGTGTCAGTTTCGG‑TTTTTTCTTCTACGTTACGGGCCAAATCTTCCGCCCCCTGCCCGTGGTTTATTGCATTCCGCCCGTCATCTGCGCCCTGTTGCCCAGCGCCCGACTTC‑TCTTAATCAGccctgggccgtta > 2:1135501/1‑228 (MQ=255)
ccGCTATCTGTGGCGGTGATGATGCTGATGGCGCTGTCGTTCCTCTTTTGCCCCCTGCGGAGCGTACCGATGGGCGGGCGTGTGGTCACCGGTATCAGTTTCGG‑GTTTGTCTTCTACGTACTGGACCAGATCTTCGGCCCCCTGACGTTGGTTTTTGGCATCCCGCCGGTCCTCCGCGCCCCGTTGTCCAACGCCAG‑CCTCTTCCTTATCCGCCTGTGGCTGGTTATGGGgaaaatgta > 2:26210/1‑234 (MQ=255)
cGCTATCTGTGGCGGTGATGATGCTGATGGCGCTGTCGTTCATCTTTGGCCCACTGCGTAGCGTACCGATGGGCGTGCGTGTGGTCACCGGTATCAGTTTCGG‑TTTTGTCTTCTACGTACTGGACCAGATCTTCGGCCCGCTGACGTTGGTTTATGGCATCCCGCCGATCATCGGCGCACTGTTGCCAAGCGCCAG‑CTTCTTCTTAATCAGCCTGTGGCTGTTAATGAGAAAATCGTa < 1:307794/238‑1 (MQ=255)
ttgGCGGGGATGATGCTGGTGGCGCTGTCTTTCATCGTTGGCCCTCGGCGGAGCGTACCGAGGGGCGGGCGTGTAGTAGCCGGTATCAGTTTCGG‑TTTTGTCTGTTACGTACTGGTACAGATCTTCGGCCGGCTCACGTTGGTTTAAGACATCCCGCGGATCATCGGCGCACGGTTGCCAAGCGCCAG‑CTGCTTCTTAATCAGCCTGTGGCTGTTAATGAGAAAATCGTAACAGAATg < 2:192125/237‑1 (MQ=255)
tggggTGTTGATGTGGATGGCGCTGTCGTTCATCTTTGGCCCTGTGGGTAGCGTTCCGATGGTCGTGGGTGTGGTCACCGGTTTCAGTTTCGG‑TTTTGTTTTCTACGTACTGGACAAGTTCTGCGGCCCGCTGACGTTGGTTTATGGCATCCCGCCGATCATCGGCGCACTGTTGCCAAGCGCCAG‑CTTCTTCTTAATCAGCCTGTGGCTGTTAATGAGAAAATCGTAACCGAATGaa < 2:502274/235‑1 (MQ=255)
ggCGGTGATGATGCTGATGGCGCTGTCGTTCATCTTTGGCCCACTGCGTAGCGTACCGATGGGCGTGCGTGTGGTCACCGGTATCAGTTTCGG‑TTTTGTCTTCTACGTACTGGACCAGATCTTCGGCCCGCTGACGTTGGTTTATGGCATCCCGCCGATCATCGGCGCACTGTTGCCAAGCGCCAG‑CTTCTTCTTAATCAGCCTGTGGCTGTTAATGAGAAAATCGTAACCGAATGaa < 1:486844/238‑1 (MQ=255)
ggCGGTAATGATGCTGATGGCGCTGTCGTTCATCTTTGGCCCACTGCGTAGCGTACCGATGGGCGTGCGTGTGGTCACCGGTATCAGTTTCGG‑TTTTGTCTTCTACGTACTGGACCAGATCTTCGGCCCGCTGACGTTGGTTTATGGCATCCCGCCGATCATCGGCGCACTGTTGCCAAGCGCCAG‑CTTCTTCTTAATCAGCCTGTGGCTGTTAATGAGAAAATCGTAACCGAATGaa < 1:1416474/238‑1 (MQ=255)
ggCGGGGATGATGCTGATGGCGCTGTCGTTCATCTTTGGCCCACTGCGTAGCGTACCGATGGGCGTGCGTGTGGTCACCGGTATCAGTTTCGG‑TTTTGTCTTCTACGTACTGGACCAGATCTTCGGCCCGCTGACGTTGGTTTATGGCATCCCGCCGATCATCGGCGCACTGTTGCCAAGCGCCAG‑CTTCTTCTTAATCAGCCTGTGGCTGTTAATGAGAAAATCGTAACCGAATGaa < 1:184463/238‑1 (MQ=255)
tgattaTGCTGATGGCGCTGTCGTTCATCTTTGGCCCACTGCGTAGCGTACCGATGGGCGGGCGGGTGGGCCCCCGGATCAGTTTCGG‑TTTTGTCTTTTAAGTACTGGACCAGATCTTTGGCCCCCCTGCGTTTGTTTTTGGCATACCCCCGCTCAACCGCGCCCTGGTGCCCAGCGCCAG‑CCTCTTCTTTATCAGCCCCTGGCCGTTTATGTGAAAAACGCAAACGaaataaacaaaa > 2:179436/1‑229 (MQ=255)
gatgCTGATGGCGCTGTCGTTCATCTTTGGCCCACTGCGTAGCGTACCGATGGGCGTGCGTGTGGTCACCGGTATCAGTTTCGG‑TTTTGTCTTCTACGTACTGGACCAGATCTTCGGCCCGCTGACGTTGGTTTATGGCATCCCGCCGATCATCGGCGCACTGTTGCCAAGCGCCAG‑CTTCTTCTTAATCCGCCTGTGGCTGTTAATGAGAAAATCGTAACCGGATTAACGAATAAAgg > 2:1033562/1‑239 (MQ=255)
|
ATCTGATCTGACCAATCCGAAACAGATTACCGGTTCGCAGACGGTGAGCGGCACCTGGAAAACCAACCTCACGCCGGACAAACTGGGCGTGGTGGCGCTGGACCCGGATGCACTCTCTATCAGCGGTTTGCACAACTATGTGAAGTATCTGAAGTCGAGCGGTCAGGATGCCGGACGTTATCAGCTCAACATGTGGAGCAAAATCTTCCAGCCGCTATCTGTGGCGGTGATGATGCTGATGGCGCTGTCGTTCATCTTTGGCCCACTGCGTAGCGTACCGATGGGCGTGCGTGTGGTCACCGGTATCAGTTTCGG‑TTTTGTCTTCTACGTACTGGACCAGATCTTCGGCCCGCTGACGTTGGTTTATGGCATCCCGCCGATCATCGGCGCACTGTTGCCAAGCGCCAG‑CTTCTTCTTAATCAGCCTGTGGCTGTTAATGAGAAAATCGTAACCGAATGAACGAATAAAGG > NC_000913/4487951‑4488420
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 31 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
GATK/CNVnator alignment
N/A
