Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A7 F17 I0 R1
|
124 |
155.2 |
3079696 |
98.3% |
3027341 |
226.1 |
Breseq alignment
BRESEQ :: Evidence
|
| evidence |
seq id |
position |
mutation |
freq |
annotation |
gene |
description |
| RA |
NC_000913 |
4,488,193 |
C→G |
10.1% |
A292G (GCG→GGG) |
lptG → |
lipopolysaccharide export ABC permease |
|
| |
seq id |
position |
ref |
new |
freq |
score (cons/poly) |
reads |
annotation |
genes |
product |
| * | NC_000913 | 4,488,193 | 0 | C | G | 10.1%
| 261.6
/ 2.4
| 104 | A292G (GCG→GGG) | lptG | lipopolysaccharide export ABC permease |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (31/60); new base G (10/2); total (42/62) |
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.52e-03 |
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 |
Only 100 of 112 total aligned reads displayed.
TCTGACCAATCCGAAACAGATTACCGGTTCGCAGACGGTGAGCGGCACCTGGAAAACCAACCTCACGCCGGACAAACTGGGCGTGGTGGCGCTGGACCCGGATGCACTCTCTATCAGCGGTTTGCACAACTATGTGAAGTATCTGAAGTCGAGCGGTCAGGATGCCGGACGTTATCAGCTCAACATGTGGAGCAAAATCTTCCAGCCGCTATCTGTGGCGGTGATGATGCTGATGGCGCTGTCGTTCATCTTTGGCCCACTGCGTAGCGTACCGATGGGCGTGCGTGTGGTCACCGGTATCAGTTTCGG‑TTTTGTCTTCTACGTACTGGACCAGATCTTCGGCCCGCTGAC‑GTTGGTTTATGGCATCCCGCCGATCATCGGCGCACTGTTGCCAAGCGCCAG‑CTTCTTCTTAATCAGCCTGTGGCTGTTAATGAGAAAATCGTAACCGAATGAACGAATAAAGGGAGCGAAAG > NC_000913/4487957‑4488429
|
tctgaCCAATCCGAAACAGATTACCGGTTCGCAGACGGTGAGCGGCACCTGGAAAACCAACCTCACGCCGGACAAACTGGGCGTGGTGGCGCTGGACCCGGATGCACTCTCTATCAGCGGTTTGCACAACTATGTGAAGTATCTGAAGTCGAGCGGTCAGGATGCCGGACGTTATCAGCTCAACATGTGGAGCAAAATCTTCCAGCCGCTATCTGTGGCGGTGATGATGCTGATGgcgc < 1:104165/239‑1 (MQ=255)
tctgaCCAATCCGAAACAGATTACCGGTTCGCAGACGGTGAGCGGCACCTGGAAAACCAACCTCACGCCGGACAAACTGGGCGTGGTGGCGCTGGACCCGGATGCACTCTCTATCAGCGGTTTGCACAACTATGTGAAGTATCTGAAGTCGAGCGGTCAGGATGCCGGACGTTATCAGCTCAACATGTGGAGCAAAATCTTCCAGCCGCTATCTGTGGCGGTGATGATGCTGATGgcgc < 1:1308508/239‑1 (MQ=255)
gaCCAATCCGAAACAGATTACCGGTTCGCAGACGGTGAGCGGCACCTGGAAAACCAACCTCACGCCGGACAAACTGGGCGTGGTGGCGCTGGACCCGGATGCACTCTCTATCAGCGGTTTGCACAACTATGTGAAGTATCTGAAGTCGAGCGGTCAGGATGCCGGACGTTATCAGCTCAACATGTGGAGCAAAATCTTCCAGCCGCTATCTGTGGCGGTGATGATGCTGATGGCGCTGt < 1:564495/239‑1 (MQ=255)
tCCGAAACAGATTACCGGTTCGCAGACGGTGAGCGGCACCTGGAAAACCAACCTCACGCCGGACAAACTGGGCGTGGTGGCGCTGGACCCGGATGCACTCTCTATCAGCGGTTTGCACAACTATGTGAAGTATCTGAAGTCGAGCGGTCAGGATGCCGGACGTTATCAGCTCAACATGTGGAGCAAAATCTTCCAGCCGCTATCTGTGGCGGTGGTGGTGCTGTTGGCGCttgtgtt > 2:1290109/1‑231 (MQ=255)
tCCGAAACAGATTACCGGTTCGCAGACGGTGAGCGGCACCTGGAAAACCAACCTCACGCCGGACAAACTGGGCGTGGTGGCGCTGGACCCGGATGCACTCTCTATCAGCGGTTTGCACAACTATGTGAAGTATCTGAAGTCGAGCGGTCAGGATGCCGGACGTTATCAGCTCAACATGTGGAGCAAAATCTTCCAGCCGCTATCTGTGGCGGTGGTGATGCTGGTGGAGCTTTCGtctt > 2:1492619/1‑236 (MQ=255)
tCCGAAACAGATTACCGGTTCGCAGACGGTGAGCGGCACCTGGAAAACCAACCTCACGCCGGACAAACTGGGCGTGGTGGCGCTGGACCCGGATGCACTCTCTATCAGCGGTTTGCACAACTATGTGAAGTATCTGAAGTCGAGCGGTCAGGATGCCGGACGTTATCAGCTCAACATGTGGAGCAAAATCTTCCAGCCGCTATCTGTGGCGGTGATTATGGTGATGGCGCCGTCGtt > 1:192125/1‑237 (MQ=255)
tCCGAAACAGATTACCGGTTCGCAGACGGTGAGCGGCACCTGGAAAACCAACCTCACGCCGGACAAACTGGGCGTGGTGGCGCTGGACCCAGATGCACTCTCTATCAGCGGTTTGCACAACTATGTGAAGTATCTGAAGTCGAGCGGTCAGGATGCCGGACGTTATCAGCTCAACATGTGGAGCAAAATCTTCCCGCCGCTATCTGTGGCGGTGGTGATGATGGTGGGGCTGTctgg > 2:1342248/1‑234 (MQ=255)
ccGAAACAGATTACCGGTTCGCAGACGGTGAGCGGCACCTGGAAAACCAACCTCACGCCGGACAAACTGGGCGTGGTGGCGCTGGACCCGGATGCACTCTCTATCAGCGGTTTGCACAACTATGTGAAGTATCTGAAGTCGAGCGGTCAGGATGCCGGACGTTATCAGCTCAACATGTGGAGCAAAATCTTCCAGCCGCTATCTGTGGCGGTGATGATGCTGATGGCGCTGTCGTTCAt < 1:1516490/239‑1 (MQ=255)
aaCAGATTACCGGTTCGCAGACGGTGAGCGGCACCTGGAAAACCAACCTCACGCCGGACAAACTGGGCGTGGTGGCGCTGGACCCGGATGCACTCTCTATCAGCGGTTTGCACAACTATGTGAAGTATCTGAAGTCGAGCGGTCAGGATGCCGGACGTTATCAGCTCAACATGTGGAGCAAAATCTTCCAGCCGCTATCTGTGGCGGCGTTGAGGCTGATGGGGGTGTCGTTCATGttt > 1:185624/1‑239 (MQ=255)
aCAGATTACCGGTTCGCAGACGGTGAGCGGCACCTGGAAAACCAACCTCACGCCGGACAAACTGGGCGTGGTGGCGCTGGACCCGGATGCACTCTCTATCAGCGGTTTGCACAACTATGTGAAGTATCTGAAGTCGAGCGGTCAGGATGCCGGACGTTATCAGCTCAACATGTGGAGCAAAATCTTCCAGCCGCTATCTGTGGCGGTGATGATGCTGATGGCGCTGTCGTTCATCTTTg < 2:623457/239‑1 (MQ=255)
aTTACCGGTTCGCAGACGGTGAGCGGCACCTGGAAAACCAACCTCACGCCGGACAAACTGGGCGTGGTGGCGCTGGACCCGGATGCACTCTCTATCAGCGGTTTGCACAACTATGTGAAGTATCTGAAGTCGAGCGGTCAGGATGCCGGACGTTATCAGCTCAACATGTGGAGCAAAATCTTCCAGCCGCTATCTGTGGCGGTGATGTTGCTGATGGCGCTGTTGGTCATCTTTGGcc > 1:1449719/1‑238 (MQ=255)
aTTACCGGTTCGCAGACGGTGAGCGGCACCTGGAAAACCAACCTCACGCCGGACAAACTGGGCGTGGTGGCGCTGGACCCGGATGCACTCTCTATCAGCGGTTTGCACAACTATGTGAAGTATCTGAAGTCGAGCGGTCAGGATGCCGGACGTTATCAGCTCAACATGTGGAGCAAAATCTTCCAGCCGCTATCTGTGGCGGTGATGATGCTGGTGGCGCTGTCGTTCATTTTTGGcc > 1:577371/1‑238 (MQ=255)
ttACCTGTTCGCAGACGGTGAGCGGCACCTGGAAAACCAGCCTCACGCCGGACAAACTGGGCGTGGTGGCGCTGGACCCGGATGCACTCTCTATCAGCGGTTTGCACAACTATGTGAAGTATCTGAAGTCGAGCGGTCAGGATGCCGGACGTTATCAGCTCAACATGTGGAGCAAAATCTTCCAGCCGCTATCTGTGGCGGTGATGATGCTGATGGCGCTGTCGTTCATCTTTGGCCCa < 1:1236844/239‑1 (MQ=255)
ttACCGGTTCGCAGACGGTGAGCGGCACCTGGAAAACCAACCTCACGCCGGACAAACTGGGCGTGGTGGCGCTGGACCCGGATGCACTCTCTATCAGCGGTTTGCACAACTATGTGAAGTATCTGAAGTCGAGCGGTCAGGATGCCGGACGTTATCAGCTCAACATGTGGAGCAAAATCTTCCAGCCGCTATCTGTGGCGGTGATGATGCTGATGGCGCTTTCGTTCATCTTTGGc < 1:749164/236‑1 (MQ=255)
ttACCGGTTCGCAGACGGTGAGCGGCACCTGGAAAACCAACCTCACGCCGGACAAACTGGGCGTGGTGGCGCTGGACCCGGATGCACTCTCTATCAGCGGTTTGCACAACTATGTGAAGTATCTGAAGTCGAGCGGTCAGGATGCCGGACGTTATCAGCTCAACATGTGGAGCAAAATCTTCCAGCCGCTATCTGTGGCGGTGATGATGCTGATGGCGCTGTCGTTCATCTTTGGcc < 2:711430/237‑1 (MQ=255)
ttACCGGTTCGCAGACGGTGAGCGGCACCTGGAAAACCAACCTCACGCCGGACAAACTGGGCGTGGTGGCGCTGGACCCGGATGCACTCTCTATCAGCGGTTTGCACAACTATGTGAAGTATCTGAAGTCGAGCGGTCAGGATGCCGGACGTTATCAGCTCAACATGTGGAGCAAAATCTTCCAGCCGCTATCTGTGGCGGTGATGATGCTGATGGCGCTGTCGTTCATCTTTGGcc < 1:1114658/237‑1 (MQ=255)
ttACCGGTTCGCAGACGGTGAGCGGCACCTGGAAAACCAACCTCACGCCGGACAAACTGGGCGTGGTGGCGCTGGACCCGGATGCACTCTCTATCAGCGGTTTGCACAACTATGTGAAGTATCTGAAGTCGAGCGGTCAGGATGCCGGACGTTATCAGCTCAACATGTGGAGCAAAATCTTCCAGCCGCTATCTGTGGCGGTGATGATGCTGATGGCGCTGTCGTTCATCTTTGGCCCa < 1:1417101/239‑1 (MQ=255)
ttACCGGTTCGCAGACGGTGAGCGGCACCTGGAAAACCAACCTCACGCCGGACAAACTGGGCGTGGTGGCGCTGGACCCGGATGCACTCTCTATCAGCGGTTTGCACAACTATGTGAAGTATCTGAAGTCGAGCGGTCAGGATGCCGGACGTTATCAGCTCAACATGTGGAGCAAAATCTTCCAGCCGCTATCTGTGGCGGTGATGATGCTGATGGCGCTGTCGTTCATCTTTGGCCCa < 1:269678/239‑1 (MQ=255)
tcacaggTTCGCAGCCGGGGGGCGGAACGTGGAAACCCAACCTCACGCCGGACAAACTGGGCGTGGTGGCGCTGGACCCGGATGCACTCTCTATCAGCGGTGTGCACAACTATGTGAAGTATCTGAAGTCGAGCGGTCAGGATGACGGCCGTTACCAGCTCAACAGGTGGAGCAAAATCTTCCAGCCGCTATCTGTGGCGGTGATGATGCTGATGGCGCTGTCGTTCATCTTTGGcc < 2:899306/232‑1 (MQ=255)
ggTTCGCAGACGGTGAGCGGCACCTGGAAAACCAACCTCACGCCGGACAAACTGGGCGTGGGGGCGCTGGACCCGGATGCCCTCTCTATCAGCGGTTTGCACAACTATGTGAAGTATCTGAAGTCGAGCGGTCAGGATGCCGGACGTTATCAGCTCAACATGGGGAGCAAAATCTTCCAGCCGCTATCTGTGGCGGTGATGATGCTGATGGCGCTGTCGTTCATCTTTGGCCCACTgcg < 2:889224/239‑1 (MQ=255)
cGCAGACGGTGAGCGGCACCTGGAAAACCAACCTCACGCCGGACAAACTGGGCGTGGTGGCGCTGGACCCGGATGCACTCTCTATCAGCGGTTTGCACAACTATGTGAAGTATCTGAAGTCGAGCGGTCAGGATGCCGGACGTTATCAGCTCAACATGTGGAGCAAAATCTTCCAGCCGCTATCTGTGGCGGTGATGATGCTGATGGCGCTGTCGTTCATCTTTGGCCCACTgcgtagc > 1:1048210/1‑239 (MQ=255)
gTGAGCGGCACCTGGAAAACCAACCTCACGCCGGACAAACTGGGCGTGGTGGCGCTGGACCCGGATGCACTCTCTATCAGCGGTTTGCACAACTATGTGAAGTATCTGAAGTCGAGCGGTCAGGATGCCGGACGTTATCAGCTCAACATGTGGAGCAAAATCTTCCAGCCGCTATCTGTGGCGGTGATGATGCTGGTGGCGCTGTGGTTCATCTTTTGGCCCCCGCGCTGCGTAcc > 2:1218283/1‑236 (MQ=255)
tGAGCGGCACCTGGAAAACCAACCTCACGCCGGACAAACTGGGCGTGGTGGCGCTGGACCCGGATGCACTCTCTATCAGCGGTTTGCACAACTATGTGAAGTATCTGAAGTCGAGCGGTCAGGATGCCGGACGTTATCAGCTCAACATGTGGAGCAAAATCTTCCAGCCGCTATCTGTGGCGGTGATGATGCTGATGGCGCTGTCGTTCATCTTTGGCCCACTGCGTAGCGTACCGAt < 1:935331/238‑1 (MQ=255)
aGCGGCACCTGGAAAACCAACCTCACGCCGGACAAACTGGGCGTGGTGGCGCTGGACCCGGATGCACTCTCTATCAGCGGTTTGCACAACTATGTGAAGTATCTGAAGTCGAGCGGTCAGGATGCCGGACGTTATCAGCTCAACATGTGGAGCAAAATCTTCCAGCCGCTATCTGTGGCGGTGGTGATGCTGGTGGGGCTGGCGGTCTTCTTTTGCCCACTTGGTGGCGCACCGGTggg > 2:210887/1‑239 (MQ=255)
ggCACCTGGAAAACCAACCTCACGCCGGACAAACTGGGCGTGGTGGCGCTGGACCCGGATGCACTCTCTATCAGCGGTTTGCACAACTATGTGAAGTATCTGAAGTCGAGCGGTCAGGATGCCGGACGTTATCAGCTCAACATGTGGAGCAAAATCTTCCAGCCGCTATCTGTGGCGGTGATGATGCTGATGGCGCTGTCGTTCATCTTTGGCCCACTGCGTAGCGTACCGATGGgcg < 1:632034/238‑1 (MQ=255)
aCCTGGAAAACCAACCTCACGCCGGACAAACTGGGCGTGGTGGCGCTGGACCCGGATGCACTCTCTATCAGCGGTTTGCACAACTATGTGAAGTATCTGAAGTCGAGCGGTCAGGATGCCGGACGTTATCAGCTCAACATGTGGAGCAAAATCTTCCAGCCGCTATCTGTGGCGGTGGTGATGCGGATGGGGCAGTCGTTTCTCCTTTGCCCACTGCGTAGCGTACCGACggggggggg > 2:1258010/1‑233 (MQ=255)
ggAAAACCAACCTCACGCCGGACAAACTGGGCGTGGTGGCGCTGGACCCGGATGCACTCTCTATCAGCGGTTTGCACAACTATGTGAAGTATCTGAAGTCGAGCGGTCAGGATGCCGGACGTTATCAGCTCAACATGTGGAGCAAAATCTTCCAGCCGCTATCTGTGGCGGTGATGATGCTGGTGGCGCTGTCGTTCATCTTTGGTCCCCTGCGTTGCGTACCGATTGGCGTGCGtgtg > 1:996438/1‑239 (MQ=255)
aaaaCCAACCTCACGCCGGACAAACGGGGCGTGGTGGCGCTGGACCCGGATGCACTCTCTATCAGCGGTTTGCACAACTATGTGAAGTATCTGAAGTCGAGCGGTCAGGATGCCGGACGTTATCAGCTCAACATGTGGAGCAAAATCTTCCAGCCGCTATCTGTGGCGGTGATGATGCTGATGGCGCTGTCGTTCATCTTTGGCCCACTGCGTAGCGTACCGAt < 1:1361787/224‑1 (MQ=255)
aaaCCAACCTCCCGCCGGACAAACTGGGCGTGGTGGCGGTGGACCGGGATGCATTCTCTAACAGGGGTTTGCACAACTATGTGAAGTATCTGAAGGCGAGCGGTCAGGATGCCGGACGTTATCAGCTCAACATGTGGAGCAAAATCTTCCAGCCGCTATCTGTGGCGGTGATGATGCTGATGGCGCTGTCGTTCATCTTTGGCCCACTGCGTAGCGTACCGATGGGCGTGCGTGTGGt < 1:1517105/238‑1 (MQ=255)
ggtccagtacgtagaagACAAACTGGGCGTGGTGGCGCTGGACCCGGATGCACTCTCTATCAGCGGTTTGCACAACTATGTGAAGTATCTGAAGTCGAGCGGTCAGGATGCCGGACGTTATCAGCTCAACATGTGGAGCAAAATCTTCCAGCCGCTATCTGTGGCGGTGATGATGCTGATGGCGCTGTCGTTCATCTTTGGCCCACTGCGTAGCGTACCGATGGGCGTGCGTGTGGTCa < 2:601971/223‑1 (MQ=255)
aaccTCACGCCGGACAAACTGGGCGTGGTGGCGCTGGACCCGGATGCACTCTCTATCAGCGGTTTGCACAACTATGTGAAGTATCTGAAGTCGAGCGGTCAGGATGCCGGACGTTATCAGCTCAACATGTGGAGCAAAATCTTCCAGCCGCTATCTGTGGCGGTGATGATGCTGATGGCGCTGTTGTTCATCTTTGGCCCCCTGCGTAGCGTACCGCTGGGGGGGCGGGTGGTCCCCgg > 1:874038/1‑239 (MQ=255)
accTCACGCCGGACAAACTGGGCGTGGTGGCGCTGGACCCGGATGCACTCTCTATCAGCGGTTTGCACAACTATGTGAAGTATCTGAAGTCGAGCGGTCAGGATGCCGGACGTTATCAGCTCAACATGTGGAGCAAAATCTTCCAGCCGCTATCTGTGGCGGTGATGATGCTGATGGCGCTGTCGTTCATCTTTTGCCCACTGCGTAGCGTACCGCTGGGCGGGCGGGGGGGCCCCggg > 1:155464/1‑238 (MQ=255)
ccTCACGCCGGACAAACTGGGCGTGGTGGCGCTGGACCCGGATGCACTCTCTATCAGCGGTTTGCACAACTATGTGAAGTATCTGAAGTCGAGCGGTCAGGATGCCGGACGTTATCAGCTCAACATGTGGAGCAAAATCTTCCAGCCGCTATCTGTGGCGGTGATGATGCTGATGGCGCTTTCGTTTATCTTTGGCCCACTGGGTAGCGTACCGCTGGGCGTGCGCGTGGGCACCggga > 1:1524997/1‑237 (MQ=255)
tCACGCCGGACAAACTGGGCGTGGTGGCGCTGGACCCGGATGCACTCTCTATCAGCGGTTTGCACAACTATGTGAAGTATCTGAAGTCGAGCGGTCAGGATGCCGGACGTTATCAGCTCAACATGTGGAGCAAAATCTTCCAGCCGCTATCTGTGGCGGTGATGATGCTGATGGGGCTGTCGGTCATCTTTGGGCCCCTGCGGAGCGGACCGATGGGGGTGCGGGTGGTGACCgggaac > 2:784107/1‑235 (MQ=255)
tCACGCCGGACAAACTGGGCGTGGTGGCGCTGGACCCGGATGCACTCTCTATCAGCGGTTTGCACAACTATGTGAAGTATCTGAAGTCGAGCGGTCAGGATGCCGGACGTTATCAGCTCAACATGTGGAGCAAAATCTTCCAGCCGCTATCTGTGGCGGGGATGATGCTGGCGGCGCTGTCGTTCATCTTTTTCCCCCTCCGGTGGGTACCGGTGGgggggcgggctgtctcttttta > 2:1361787/1‑223 (MQ=255)
cGCCGGACAAACTGGGCGTGGTGGCGCTGGACCCGGATGCACTCTCTATCAGCGGTTTGCACAACTATGTGAAGTATCTGAAGTCGAGCGGTCAGGATGCCGGACGTTATCAGCTCAACATGTGGAGCAAAATCTTCCAGCCGCTATCTGTGGCGGTGATGATGCTGATGgcg < 1:931987/173‑1 (MQ=255)
cGGCCAAAGTGGGCGTGGGGGCGCTGGACCTGGAGTCCCTCTCTAGCAGCGGTTTGCACAACTATGTGAAGTATCTGAAGTCGAGCGGTCAGGAGGCCGGACGTGATCAGCACAACATGTGGAGCAAAATCTTCCAGCCGCTCTCTGTGGCGGTGATGATGCTGATGGCGCTGTCGTTCATCTTTGGCCCACTGCGTAGCGTACCGATGGGCGTGCGTGTGGTCACCGGTATCAGttt < 2:1063875/238‑1 (MQ=255)
aCTGGGCGTGGTGGCGCTGGACCCGGATGCACTCTCTATCAGCGGTTTGCACAACTATGTGAAGTATCTGAAGTCGAGCGGTCAGGATGCCGGACGTTATCAGCTCAACATGTGGAGCAAAATCTTCCAGCCGCTATCTGTGGCGGTGATGATGGTGGTGGGGGTGTCGTTCa > 2:931987/1‑173 (MQ=255)
gCGTGGTGGCGCTGGACCCGGATGCACTCTCTATCAGCGGTTTGCACAACTATGTGAAGTATCTGAAGTCGAGCGGTCAGGATGCCGGACGTTATCAGCTCAACATGTGGAGCAAAATCTTCCAGCCGCTATCTGTGGCGGTGATGATGCTGATGGCGCTGTGGTTCGTCTTTTGCCCCCTGCGGTGCGTTCCGATGGGCGTGCGGGTGGTCACCGGTATCCGTTTCGG‑gttttttt > 2:1168715/1‑233 (MQ=255)
gCGTGGTGGCGCTGGACCCGGATGCACTCTCTATCAGCGGTTTGCACAACTATGTGAAGTATCTGAAGTCGAGCGGTCAGGATGCCGGACGTTATCAGCTCAACATGTGGAGCAAAATCTTCCAGCCGCTATCTGTGGCGGTGATGAATCTGATCGCGCTGTCGTTCATCTTTTGCCCCCCCCGTGGCGGACCCATGGGCGGGCGGGTGGGCCACGCGGTCAGCTTCGG‑TTTTGtcttt > 2:1263060/1‑238 (MQ=255)
gtggtgGCGCTGGACCCGGATGCACTCTCTATCAGCGGTTTGCACAACTATGTGAAGTATCTGAAGTCGAGCGGTCAGGATGCCGGACGTTATCAGCTCAACATGTGGAGCAAAATCTTCCAGCCGCTATCTGTGGCGGTGATGATGCTGATGGCGCTGTCGTTCATCTTTGGCCCACTGCGTAGCGTACCGATGGGCGTGCGTGTGGTCACCGGTATCAGTTTCGG‑TTTTGtcttct < 1:210887/238‑1 (MQ=255)
ggCGCTGGACCCGGATGCACTCTCTATCAGCGGTTTGCACAACTATGTGAAGTATCTGAAGTCGAGCGGTCAGGATGCCGGACGTTATCAGCTCAACATGTGGAGCAAAATCTTCCAGCCGCTATCTGTGGCGGTGATGATGCTGATGGCGCTGTCGTTCATCTTTGGCCCACTGCGTAGCGTACCGATGGGCGTGCGTGTGGTCACCGGTATCAGTTTCGG‑TTTTGTCTTCTACGTa < 1:1258010/238‑1 (MQ=255)
ggCGCTGGACCCGGATGCACTCTCTATCAGCGGTTTGCACAACTATGTGAAGTATCTGAAGTCGAGCGGTCAGGATGCCGGACGTTATCAGCGCAACATGTGGAGCAAAATCTTCCAGCCGCTATCTGTGGCGGTGATGATGCTGATGGCGCTGTCGTTCATCTTTGGCCCACTGCGTAGCGTACCGATGGGCGTGCGTGTGGTCACCGGTATCAGTTTCGG‑TTTTGTCTTCTACGTAc < 1:806251/239‑1 (MQ=255)
ggCGCTGGACCCCGATGCACTCTCTATCATCGGTTTGCACAACTATGTGAAGTATCTGAAGTCGAGCGGTCAGCATGCCGGACGTTATCAGCTCAACATGTGGAGCAAAATCTTCCAGCCGCTATCTGTGGCGGTGATGATGCTGATGGCGCTGTCGTTCATCTTTGGCCCACTGCGTAGCGTACCGATGGGCGTGCGTGTGGTCACCGGTATCAGTTTCGG‑TTTTGTCTTCTACGTa < 1:279603/238‑1 (MQ=255)
gcgcTGGACCTGGATGCACTCTCTATCAGCGGTTTGCACAACTATGTGAAGTATCTGAAGTCGAGCGGTCAGGATGCCGGACGTTATCAGCTCAACATGTGGAGCAAAATCTTCCAGCCGCTATCTGTGGCGGTGATGATGCTGATGGCGCTGTCGTTCATCTTTGGCCCACTGCGTAGCGTACCGATGGGCGTGCGTGTGGTCACCGGTATCAGTTTCGG‑TTTTGTCTTCTACGTAc < 2:163008/238‑1 (MQ=255)
gcTGGACCCGGATGCACTCTCTATCAGCGGTTTGCACAACTATGTGAAGTATCTGAAGTCGAGCGGTCAGGATGCCGGACGTTATCAGCTCAACATGTGGAGCAAAATCTTCCAGCCGCTATCTGTGGCGGTGATGATGCTGATGGCGCTGTCGTTCATCTTTGGCCCACTGCGTAGCGTACCGATGGGCGTGCGTGTGGTCACCGGTATCAGTTTCGG‑TTTTGTCTTCTACGTACTg < 2:703483/238‑1 (MQ=255)
cTGGACCCGGATGCACTCTCTATCAGCGGTTTGCACAACTATGTGAAGTATCTGAAGTCGAGCGGTCAGGATGCCGGACGTTATCAGCTCAACATGTGGAGCAAAATCTTCCAGCCGCTATCTGTGGCGGTGATGGTGCTGGTGGCGCTGTCGTTCCTCTTTTGCCCCCTCCGTAGCGTACCCATGGGGGGGCGGGTGGTCACCCGGATCAGCTTTGG‑GTTTGTCTTTTACGTACttg > 2:184463/1‑236 (MQ=255)
aCCCGGATGCACTCTCTATCAGCGGTTTGCACAACTATGTGAAGTATCTGAAGTCGAGCGGTCAGGATGCCGGACGTTATCAGCTCAACATGTGGAGCAAAATCTTCCAGCCGCTATCTGTGGCGGTGATGATGCTGATGGCGCTGTCGTTCATCTTTGGCCCACTGCGTAGCGTACCGATGGGCGTGCGTGTGGTCACCGGTATCAGTTTCGG‑TTTTGTCTTCTACGTACTGGACCa < 1:198823/238‑1 (MQ=255)
tCAGCGGTTTGCACAACTATGTGAAGTATCTGAGGTCGAGCGGTCAGGATGCCGGACGTTATCAGCTCAACATGTGGAGCAAAATCTTCCAGCCGCTATCTGTGGCGGTGATGATGCTGATGGCGCTGTCGTTCATCTTTGGCCCACTGCGTAGCGTACCGATGGGCGTGCGTGTGGTCACCGGTATCAGTTTCGG‑TTTTGTCTTCTACGTACTGGACCAGATCTTCGGCCCGCTGAC‑g < 2:1388080/239‑1 (MQ=255)
tCAGCGGTTTGCACAACTATGTGAAGTATCTGAAGTCGGGCGGTCAGGATGCCGGACGTTATCAGCTCAACATGTGGAGCAAAATCTTCCAGCCGCTATCTGTGGCGGTGATGATGCTGATGGCGCTGTCGTTCATCTTTGGCCCACTGCGTAGCGTACCGATGGGCGTGCGTGTGGTCACCGGTATCAGTTTCGG‑TTTTGTCTTCTACGTACTGGACCAGATCTTCGGCCCGCTGAC‑g < 1:1342248/239‑1 (MQ=255)
tCAGCGGTTTGCACAACTATGTGAAGTATCTGAAGTCGAGCGGTCAGGATGCCGGACGTTATCAGCTCAACATGTGGAGCAAAATCTTCCAGCCGCTATCTGTGGCGGTGATGATGCTGATGGCGCTGTCGTTCATCTTTGGCCCACTGCGTAGCGTACCGATGGGCGTGCGTGTGGTCACCGGTATCAGTTTCGG‑TTTTGTCTTCTACGTACTGGACCAGATCTTCGGCCCGCTGAC‑g < 1:1168715/239‑1 (MQ=255)
tCAGCGGTTTGCACAACTATGTGAAGTATCTGAAGTCGAGCGGTCAGGATGCCGGACGTTATCAGCTCAACATGTGGAGCAAAATCTTCCAGCCGCTATCTGTGGCGGTGATGATGCTGATGGCGCTGTCGTTCATCTTTGGCCCACTGCGTAGCGTACCGATGGGCGTGCGTGTGGTCACCGGTATCAGTTTCGG‑TTTTGTCTTCTACGTACTGGACCAGATCTTCGGCCCGCTGAC‑g < 1:545592/239‑1 (MQ=255)
tCAGCGGTTTGCACAACTAGGGGAAGTATCTGAAGTCGAGCGGTCAGGATGCCGGACGTTAGCAGCTCAACATGTGGAGCAAAATCTTCCAGCCGCTATCTGTGGCGGTGATGATGCTGATGGCGCTGTCGTTCATCTTTGGCCCACTGCGTAGCGTACCGATGGGCGTGCGTGTGGTCACCGGTATCAGTTTCGG‑TTTTGTCTTCTACGTACTGGACCAGATCTTCGGCCCGCTGAC‑g < 2:783133/239‑1 (MQ=255)
cAGCGGTTTGCACAACTATGTGAAGTATCTGAAGTCGAGCGGTCAGGATGCCGGACGTGATCAGCTCAACTTGTGGACCAAAATCTTCCAGCCGCTATCTGTGGCGGTGATGATGCTGATGGCGCTGTCGTTCATCTTTGGCCCACTGCGTAGCGTACCGATGGGCGTGCGTGTGGTCACCGGTATCAGTTTCGG‑TTTTGTCTTCTACGTACTGGACCAGATCTTCGGCCCGCTGAC‑Gt < 2:1023242/239‑1 (MQ=255)
cGGTTTGCACAACTATGTGAAGTATCTGAAGTCGAGCGGTCAGGATGCCGGACGTTATCAGCTCAACATGTGGAGCAAAATCTTCCAGCCGCTATCTGTGGCGGTGATGGTGCTGATGGCGCTGTCGTTCATCTTTGGCCCCCTGCGTAGCGTACCCATGGGCGTGCGTGTGGGCACCGGTATCAGTTTCGG‑TTTTGTCTTCTACGGACTGGGCCAGATCTTCCGCCCGCTGGC‑GTTgg > 1:510173/1‑239 (MQ=255)
cGGTTTGCACAACTATGTGAAGTATCTGAAGTCGAGCGGTCAGGATGCCGGACGTTATCAGCTCAACATGTGGAGCAAAATCTTCCAGCCGCTATCTGTGGCGGTGATGATGCTTGTGGCGCTGTCGTTCATCTTTGGCCCCCTGCGTAGCGTACCGATGGGGGGGCGGGGGGGCACCGGGATCAGTTTCGG‑GTTTGTTTTTTTCGTACTGGGCCAGATCTTTGGCCCCCTGAC‑ggttg > 1:623034/1‑235 (MQ=255)
ttGCACAACTATGTGAAGTATCTGAAGTCGAGCGGTCAGGATGCCGGACGTTATCAGCTCAACATGTGGAGCAAAATCTTCCAGCCGCTATCTGTGGCGGTGATGATGCTGATGGCGCTGTCGTTCATCTTTGGCCCACTGCGTAGCGTACCGATGGGCGTGCGTGTGGTCACCGGTATCAGTTTCGG‑TTTTGTCTTCTACGTACTGGACCAGATCTTCGGCCCGCTGAC‑GTTGGTTTa < 1:14472/239‑1 (MQ=255)
tGCACAACTATGTGAAGTATCTGAAGTCGAGCGGTCAGGATGCCGGACGTTATCAGCTCAACATGTGGAGCAAAATCTTCCAGCCGCTATCTGTGGCGGTGATGATGCTGATGGCGCTGTCGTTCATCTTTGGCCCACTGCGTAGCGTACCGATGGGCGTGCGTGTGGTCACCGGTATCAGTTTCGG‑TTTTGTCTTCTACGTACTGGACCa < 1:613061/211‑1 (MQ=255)
aaCTATGTGAAGTATCTGAAGTCGAGCGGTCAGGATGCCGGACGTTATCAGCTCAACATGTGGAGCAAAATCTTCCAGCCGCTATCTGTGGCGGTGATGATGCTGATGGCGCTGTCGTTCATCTTTGGCCCACTGCGTAGCGTACCGATGGGCGTGCGTGTGGTCACCGGTATCAGTTTCGG‑TTTTGtcttct < 1:745430/193‑1 (MQ=255)
cTATGTGAAGTATCTGAAGTCGAGCGGTCAGGATGCCGGACGTTATCAGCTCAACATGTGGAGCAAAATCTTCCAGCCGCTATCTGTGGCGGTGGTGATGGTGGTGGCGCCGGTGTTCATCTTTTGGCCCCCGCGTAGGGGACCGATGGGCGGGGGGGTGGTCTCCGGTGTACGTTTTGG‑GTTTTGCTTCTTCGTTCTGGGACGGGCCTTCGGCCCGCTGCC‑GGTGGTTTTTGGGATc > 2:39298/1‑238 (MQ=255)
tgtgAAGTATCTGAAGTCGAGCGGTCAGGATGCCGGACGTTATCAGCTCAACATGTGGAGCAAAATCTTCCAGCCGCTATCTGTGGCGGTGATGATGGTGGTGGGGCCGTCGGTTATCTTTGGCCCCCCGCGGATCGTACCGTCGGGGGTGCGTGTTGTTACCGGGATTAGTTTCGG‑TTTTTTCTTCTACGGACTGGGCCAGATCTTCTGGCCCCTGTC‑GTTGGTTTATGGGCTcccc > 2:626632/1‑237 (MQ=255)
tgtgAAGTATCTGAAGTCGAGCGGTCAGGATGCCGGACGTTATCAGCTCAACATGTGGAGCAAAATCTTCCAGCCGCTATCTGTGGCGGTGATGATGCTGATGGCGCTGTCGTTCATCTTTGGCCCACTGCGTAGCGTACCGATGGGCGGGCGTGTGGTCACCGGGATCAGTTTCGG‑TTTTGTTTTTTTCGTACTGGGCCAAATCTTCGGCCCGCCTAC‑CTTGGTTTTTGGGTTCccg > 1:759502/1‑238 (MQ=255)
tgtgAAGTATCTGAAGTCGAGCGGTCAGGATGCCGGACGTTATCAGCTCAACATGTGGAGCAAAATCTTCCAGCCGCTATCTGTGGCGGCGGAGATGCTGATGGCGCTGTCGTTCATCTTTGGCCCACTGCGTAGCGTACCGATGGGCGGGCGTGTGGTCACCGGTATCAGTTTCGG‑CTTTTTCTTTTACGTACTGGGCCCGATCTTCCGCCCCCTGGCTGTTGG‑TTATGGGCTCccg > 2:1054510/1‑238 (MQ=255)
aGTATCTGAAGTCGAGCGGTCAGGATGCCGGACGTTATCAGCTCAACATGTGGAGCAAAATCTTCCAGCCGCTATCTGTGGCGGTGATGATGCTGATGGCGCTGTCGTTCATCTTTGGCCCACTGCGGAGCGTACCGATGGGCGTGCGGGTGGTCACCGGTGTCAGTTTCGG‑GTTTGGTTTCTACGTGCTGGa > 2:745430/1‑193 (MQ=255)
tATCTGAAGTCGAGCGGTCAGGATGCCGGACGTTATCAGCTCAACATGTGGAGCAAAATCTTCCAGCCGCTATCTGTGGCGGTGATGATGCTTATGGCGCTGTCGTTCCTCTTTGGCCCCCCGCGTAGCGGACCGGTGGGGGGGCGGGTGGTCCCCGGGATGCGTTTTGGTTTTTGTTTTTTAGGT‑CTTGGCCAGATCCTTGGGCCGTCTAC‑GGTTGTTTATGGCATtcctcctctca > 2:924163/1‑233 (MQ=255)
tATCTGAAGTCGAGCGGTCAGGATGCCGGACGTTATCAGCTCAACATGTGGAGCAAAATCTTCCAGCCGCTATCTGTGGCGGTGATGATGCTGATGGCGCTGTCGGTTATCTTTGGCCCACCGCGTAGCGTACCGATGGGGGGGGGGGTGGTTCCCGGTTTCCGTTTCGG‑TTTTGTCTTTTTCGGACTGGGGCAGGTCTTCGGCCCGTCGGC‑GGTGGTTTTTGGCCTCccgccggaca > 2:545549/1‑234 (MQ=255)
tCTGAAGTCGAGCGGTCAGGATGCCGGACGTTATCAGCTCAACATGTGGAGCAAAATCTTCCAGCCGCTATCTGTGGCGGTGGAGATGCTGATGGGGCTGTCGTTTCTCTTTTGCCCCCTGCGGAGCGTACCGGGTGGCGGGCGTGTGGGCACCCGGATCCCTTTCGG‑GTTTTTTCTCTTCGGTCTGGACCCGATCTTCGGCCCCCTTTC‑GGTTGTTTTTTGCATTCCGCCCGTCATCg > 2:9750/1‑239 (MQ=255)
tCTGAAGTCGAGCGGTCAGGATGCCGGACGTTATCAGCTCAACATGTGGAGCAAAATCTTCCAGCCGCTATCTGTGGCGGTGATGATGCTGATGGCGCTGTCGTTCATCTTTGGCCCACTGCGTAGCGTACCGATGGGCGTGCGTGTGGTCACCGGTATCAGTTTCGG‑GTTTGTCTTCTACGTACTGGACCAGATCTTCGGCCCCCTGCC‑GTTGGTTTTTGGCATCCCGGCCGTCATCg > 1:643355/1‑239 (MQ=255)
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tgagaccgcgggcggTTACCAGGTCACCATGTGGAGAAAATTCTTCCGGCAGCTATCGGGGGGGGTGATGATGCTGATGGCGTTGTCGTTCATCTTTGGCCCACTGCTTAGCGTACCGATGGGCGTGCGGGGTGTCGCCGGTATCAGTTGCGG‑TTTTGTCTTCTCCGTACTGGACCAGATCTTCGGGCCGCTGAC‑GTTGGTTTATGGCATCCCGCCGATCATCGGCGCACTGTTGCCa < 2:443002/224‑1 (MQ=255)
aGGATGCCGGACGTTATCAGCTCAACATGTGGAGCAAAATCTTCCAGCCGCTATCTGTGGCGGTGATGATGCTGATGGGGCCGTCGTTCCTCTTTTGCCCCCACCGTCGGGGACCGATGGGGGGGGGGGTGGGCGCCGGTATTCGGTTTGG‑GTTTGTCTTCCTCGTCCTGGGCCAGATCTTCGGCCCCCTGTC‑GTTGGGTTATGGTCTCCCCCCGCCAATCCGCGCCCTGtgtccacg > 2:1191121/1‑231 (MQ=255)
aTGCCGGGCGTTATCAGCTCAACATGTGGAGCAAAATCTTCCAGCCCGTTTCTGGGGCGGGGATGATGCTGGTGGGGCTGTCGTTCATCTTTGGCCCACTGCGTAGCGTACCGATGGGCGTGCGTGTGGTCACCGGTATCAGTTTCGG‑TTTTGTCTTCTACGTACTGGACCAGATCTTCGGCCCGCTGAC‑GTTGGTTTATGGCATCCCGCCGATCATCGGCGCACTGTTGCCAAgcg < 2:155464/237‑1 (MQ=255)
cgtaCGTAATCAGCTCAACATGTGGAGCAAAATCTTCCAGCCGCTATCTGTGGCGGTGATGATGCTGATGGGGCTGTCGTTCATCTTTGGCCCACTGCGTAGCGTACCGTTGGGCGTGCGTGTGGTCACCGGTATCAGTTTCGG‑TTTTGTCTTCTACGTACTGGACCAGATCTTCGGCCCGCTGAC‑GTTGGTTTATGGCATCCCGCCGATCATCGGCGCACTGTTGCCAAGCGCCAG‑ct < 1:1079334/236‑1 (MQ=255)
cGGCCGTTATCAGCTCAACATGTGGAGCAAAATCTTCCAGCCGCTATCTGTGGCGGTGATGATGCTGATGGCGCTGTCGTTCATCTTTGGCCCACTGCGTAGCGTACCGATGGGCGTGCGTGTGGTCACCGGTATCAGTTTCGG‑TTTTGTCTTCTACGTACTGGACCAGATCTTCGGCCCGCTGAC‑GTTGGTTTATGGCATCCCGCCGATCATCGGCGCACTGTTGCCAAGCGCCAG‑ct < 1:39298/239‑1 (MQ=255)
aCGTTATCAGCTCAACATGTGGAGCAAAATCTTCCAGCCGCTATCTGTGGCGGTGATGATGCTGATGGCGCTGTCGTTCATCTTTGGCCCACTGCGTAGCGTACCGATGGGCGTGCGTGTGGTCACCGGTATCAGTTTCGG‑TTTTGTCTTCTACGTACTGGACCAGATCTTCGGCCCGCTGAC‑GTTGGTTTATGGCATCCCGCCGATCATCGGCGCACTGTTGCCAAGCGCCAG‑cttc < 1:784107/238‑1 (MQ=255)
cGTTATCAGCTCAACATGTGGAGCAAAATCTTCCAGCCGCTATCTGTGGCGGTGATGATGCTGATGGCGCTGTCGTTCATCTTTGGCCCACTGCGTAGCGTACCGATGGGCGTGCGTGTGGTCACCGGTATCAGTTTCGG‑TTTTGTCTTCTACGTACTGGACCAGATCTTCGGCCCGCTGAC‑GTTGGTTTATGGCATCCCGCCGATCATCGGCGCACTGTTGCCAAGCGCCAG‑cttctt < 1:1218283/239‑1 (MQ=255)
cGTTATCAGCTCAACATGTGGAGCAAAATCTTCCAGCCGCTATCTGTGGCGGTGATGATGCTGATGGCGCTGTCGTTCATCTTTGGCCCACTGCGTAGCGTACCGATGGGCGTGCGTGTGGTCACCGGTATCAGTTTCGG‑TTTTGTCTTCTACGTACTGGACCAGATCTTCGGCCCGCTGAC‑GTTGGTTTATGGCATCCCGCCGATCATCGGCGCACTGTTGCCAAGCGCCAG‑cttctt < 1:545549/239‑1 (MQ=255)
gTTATCAGCTCAACATGTGGAGCAAAATCTTCCAGCCGCTATCTGTGGCGGTGGCGATGCTGGTGGCGCCGTCGTTCCTCTTTGGCCCACTGCGTAGCGTACCGATGGGGGTGCGTGTGGTTCCCGGCATTCGTTTTGG‑TTTTTTCTTCTACGTACTGGACCCGATCTTCGGCCCCCCGGC‑GGTGGTTTTTTGGCTCCCCCCGGTCCTCCGCGCCCTGGTGCCAAGCGCCAC‑cttcttt > 2:1304354/1‑238 (MQ=255)
gTTATCAGCCAAACAGGTGGGGAAAAATCTTCAGGCCGGTAGCGGTGGCGGTGATGATGCTGATGGCGCTGTCGTTCATCTTTGGCCCACTGCGTAGCGTACCGATGGGCGGGCGTGTGGTCACCGGTATCAGTTTCGG‑TTTTGTCTTCTACGTACTGGACCAGATCTTCGGCCCGCTGAC‑GTTGGTTTATGGCATCCCGCCGATCATCGGCGCACTGTTGCCAAGCGCCAG‑cttctt < 2:139871/238‑1 (MQ=255)
gagccagactgggggAGCAAAACTTCCCATCCGCTATCGGTGGCGGTGATGATGCGGATGGCGTTGTCGTTCATCTTTGGCCCACTGCGTGGCGTACCGATGGGCGTGCGGGTGGTCCCCGGTATCAGTTTCGG‑TTTTGTCTTCTACGTCCTGGACCAGATCTTCGGCCCGCTGAC‑GTTGGTTTATGGCATCCCGCCGATCATCGGCGCACTGTTGCCAAGCGCCAG‑CTTCTTCTTAAt < 2:823332/226‑1 (MQ=255)
cggcctacattggggAGCAAATTCTTCCAGCCGCTATCTGTGGCGGTGAGTATGCTGATGGCGCTGTCTTTCATCTTTGTCCCACTGCGTAGCGTACCGATGGGCGTGTGTTTGGTCACCGGTATCATTTTCGT‑TTTTGTCTTCTACGTCCTGGACCAGATCTTCGGCCCGCTGAC‑GTTGGTTTATGGCATCCCGCCGATCATCGGCGCACTGTTGCCAAGCGCCAG‑CTTCTTCTTAAt < 2:723694/226‑1 (MQ=255)
cAGCTCAACATGTGGAGCAAAATCTTCCAGCCGCTATCTGTGGCGGTGATGATGCTGATGGCGCTGTCGTTCATCTTTGGCCCACTGCGTAGCGTACCGATGGGCGTGCGTGTGGTCACCGGTATCAGTTTCGG‑TTTTGTCTTCTACGTACTGGACCAGATCTTCGGCCCGCTGAC‑GTTGGTTTATGGCATCCCGCCGATCATCGGCGCACTGTTGCCAAGCGCCAG‑CTTCTTCTTAAt < 1:1219435/239‑1 (MQ=255)
cATGTGGAGCAAAATCTTCCAGCCGCTATCTGTGGCGGTGATGATGCTGATGGCGCTGTCGTTCATCTTTGGCCCACTGCGTAGCGTACCGATGGGCGTGCGTGTGGTCACCGGTATCAGTTTCGG‑TTTTGTCTTCTACGTACTGGACCAGATCTTCGGCCCGCTGAC‑GTTGGTTTATGGCATCCCGCCGATCATCGGCGCACTGTTGCCAAGCGCCAG‑CTTCTTCTTAATCAGCCtgt < 1:26489/239‑1 (MQ=255)
tggggAGCAAACTTTGCCAGCCGCTATCTGTGGCGGGGATGATGCTGATGGCGCGGTCGTTCATCTTTGGCCCACTGCGTAGCGTACCGATGGGCGTGCGTGTGGTCACCGGTATCAGTTTCGG‑TTTTGTCTTCTACGTACTGGACCAGATCTTCGGCCCGCTGAC‑GTTGGTTTATGGCATCCCGCCGATCATCGGCGCACTGTTGCCAAGCGCCAG‑CTTCTTCTTAATCAGCCTGTgg < 2:1503018/236‑1 (MQ=255)
gtgGAGCAAAATCTTCCAGCCGCTATCTGTGGCGGTGATGATGCTGATGGCGCTGTCGTTCATCTTTTGCCCACTGCGTCGCGGACCGATGGGGGGGCGGGTGGGCACCGGGGTCAGTTTCGG‑GTTTTTCTTCTTCGTACTGGACCCGGTCTTCGGCCCGCTGAC‑GTTGGTTTTTTGCATCCCCCCGCTCATCGGCGCCCTGTTTCCAAGCGCCAG‑CTTTTTCTTTAACAACCTGTggg > 2:307794/1‑238 (MQ=255)
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gcaaattgccccaccctacctCTGCGGCGGTTATGATCCTGATGGCGCTGTCGTTCACCTTTGGCCCACTGCGTTGCGTGCCGATGGGCGTGCTTGTGTTCACCGGTATCGGTTTCGG‑TTTTTTCTTCTACGTACTGGACCACATCTTCGGCCCGCTGAC‑GTTGGTGTATTGCATCCCGCCGATCTTCGGCGCACTGTTGCCAAGCGCCAG‑CTTCTTCTTAATCAGCCTGTGGCTGtt < 2:242911/218‑1 (MQ=255)
gCAAAATCTTCCAGCCGCTATCTGTGGCGGTGCTGATGCTGATGGCGCTGTCGTTCATCTTTTGCCCACTGCGGAGCGGACCGCTGGGGGTGCGTGGGGTCCCCGGTGTCAGTTTCGG‑TTTTTTCTTCTACGTTACGGGCCAAATCTTCCGCCCCCTGCC‑CGTGGTTTATTGCATTCCGCCCGTCATCTGCGCCCTGTTGCCCAGCGCCCGACTTC‑TCTTAATCAGccctgggccgtta > 2:1135501/1‑228 (MQ=255)
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ttgGCGGGGATGATGCTGGTGGCGCTGTCTTTCATCGTTGGCCCTCGGCGGAGCGTACCGAGGGGCGGGCGTGTAGTAGCCGGTATCAGTTTCGG‑TTTTGTCTGTTACGTACTGGTACAGATCTTCGGCCGGCTCAC‑GTTGGTTTAAGACATCCCGCGGATCATCGGCGCACGGTTGCCAAGCGCCAG‑CTGCTTCTTAATCAGCCTGTGGCTGTTAATGAGAAAATCGTAACAGAATg < 2:192125/237‑1 (MQ=255)
tggggTGTTGATGTGGATGGCGCTGTCGTTCATCTTTGGCCCTGTGGGTAGCGTTCCGATGGTCGTGGGTGTGGTCACCGGTTTCAGTTTCGG‑TTTTGTTTTCTACGTACTGGACAAGTTCTGCGGCCCGCTGAC‑GTTGGTTTATGGCATCCCGCCGATCATCGGCGCACTGTTGCCAAGCGCCAG‑CTTCTTCTTAATCAGCCTGTGGCTGTTAATGAGAAAATCGTAACCGAATGaa < 2:502274/235‑1 (MQ=255)
ggCGGTGATGATGCTGATGGCGCTGTCGTTCATCTTTGGCCCACTGCGTAGCGTACCGATGGGCGTGCGTGTGGTCACCGGTATCAGTTTCGG‑TTTTGTCTTCTACGTACTGGACCAGATCTTCGGCCCGCTGAC‑GTTGGTTTATGGCATCCCGCCGATCATCGGCGCACTGTTGCCAAGCGCCAG‑CTTCTTCTTAATCAGCCTGTGGCTGTTAATGAGAAAATCGTAACCGAATGaa < 1:486844/238‑1 (MQ=255)
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ggCGGGGATGATGCTGATGGCGCTGTCGTTCATCTTTGGCCCACTGCGTAGCGTACCGATGGGCGTGCGTGTGGTCACCGGTATCAGTTTCGG‑TTTTGTCTTCTACGTACTGGACCAGATCTTCGGCCCGCTGAC‑GTTGGTTTATGGCATCCCGCCGATCATCGGCGCACTGTTGCCAAGCGCCAG‑CTTCTTCTTAATCAGCCTGTGGCTGTTAATGAGAAAATCGTAACCGAATGaa < 1:184463/238‑1 (MQ=255)
tgattaTGCTGATGGCGCTGTCGTTCATCTTTGGCCCACTGCGTAGCGTACCGATGGGCGGGCGGGTGGGCCCCCGGATCAGTTTCGG‑TTTTGTCTTTTAAGTACTGGACCAGATCTTTGGCCCCCCTGC‑GTTTGTTTTTGGCATACCCCCGCTCAACCGCGCCCTGGTGCCCAGCGCCAG‑CCTCTTCTTTATCAGCCCCTGGCCGTTTATGTGAAAAACGCAAACGaaataaacaaaa > 2:179436/1‑229 (MQ=255)
gatgCTGATGGCGCTGTCGTTCATCTTTGGCCCACTGCGTAGCGTACCGATGGGCGTGCGTGTGGTCACCGGTATCAGTTTCGG‑TTTTGTCTTCTACGTACTGGACCAGATCTTCGGCCCGCTGAC‑GTTGGTTTATGGCATCCCGCCGATCATCGGCGCACTGTTGCCAAGCGCCAG‑CTTCTTCTTAATCCGCCTGTGGCTGTTAATGAGAAAATCGTAACCGGATTAACGAATAAAgg > 2:1033562/1‑239 (MQ=255)
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|
TCTGACCAATCCGAAACAGATTACCGGTTCGCAGACGGTGAGCGGCACCTGGAAAACCAACCTCACGCCGGACAAACTGGGCGTGGTGGCGCTGGACCCGGATGCACTCTCTATCAGCGGTTTGCACAACTATGTGAAGTATCTGAAGTCGAGCGGTCAGGATGCCGGACGTTATCAGCTCAACATGTGGAGCAAAATCTTCCAGCCGCTATCTGTGGCGGTGATGATGCTGATGGCGCTGTCGTTCATCTTTGGCCCACTGCGTAGCGTACCGATGGGCGTGCGTGTGGTCACCGGTATCAGTTTCGG‑TTTTGTCTTCTACGTACTGGACCAGATCTTCGGCCCGCTGAC‑GTTGGTTTATGGCATCCCGCCGATCATCGGCGCACTGTTGCCAAGCGCCAG‑CTTCTTCTTAATCAGCCTGTGGCTGTTAATGAGAAAATCGTAACCGAATGAACGAATAAAGGGAGCGAAAG > NC_000913/4487957‑4488429
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 30 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
GATK/CNVnator alignment
N/A
