Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A2 F9 I0 R1
|
142 |
103.7 |
2603848 |
81.8% |
2129947 |
227.3 |
Breseq alignment
BRESEQ :: Evidence
|
| evidence |
seq id |
position |
mutation |
freq |
annotation |
gene |
description |
| RA |
NC_000913 |
830,865 |
A→G |
19.8% |
intergenic (‑222/‑7) |
ybiH ← / → rhlE |
DUF1956 domain‑containing tetR family putative transcriptional regulator/ATP‑dependent RNA helicase |
|
| |
seq id |
position |
ref |
new |
freq |
score (cons/poly) |
reads |
annotation |
genes |
product |
| * | NC_000913 | 830,865 | 0 | A | G | 19.8%
| 146.6
/ 4.4
| 83 | intergenic (‑222/‑7) | ybiH/rhlE | DUF1956 domain‑containing tetR family putative transcriptional regulator/ATP‑dependent RNA helicase |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (22/37); new base G (16/2); total (44/39) |
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.20e-04 |
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 |
AGTCCATTCTTAATCAAATGATTGATTAAGATTATGACTCCATAGGGGAGTTGTCCAGTATGGCTAAGAATTTTAGCAACGCCAGTCACAGGGATAATTTATGCGCTGCGTCACAAAAACTGCTACACTCCGCTCCCTCATGACATTGTGGTTTTTGTCATTTTCCTTTTCAGTATCTCCCTGAAAACTACACCGGTAACGGTCGGGGC‑GGTTCGGAGT‑A‑GTTATGT‑CTTTCGATTCTTTGGGTTTAAG‑CCCTGATATCCTG‑CGCGCCGTTGCCGAGCAGGGTTACCGT‑GAACCCACCCCTATTCAGCAGCAGGCGATCCCTGCGGTGCTGGAAGGCCGCGACCTGATGGCTAGCGCCCAGACCGGCAC‑CGGCAAAACAGCGGGCTTTACGCTGCCGCTGTTGCAACACCTGATCACTCGCCAGCCGCACGCCAAAGGGCGTCGTCCGGTACG > NC_000913/830649‑831101
|
aGTCCATTCTTAATCAACTGATTGATTAAGATTATGACTCCATAGGGGAGTTGTCCAGTATGGCTAAGAATTTTAGCAACGCCAGTCACAGGGATAATTTATGCGCTGCGTCACAAAAACTGCTACACTCCGCGCCCTCATGACATTGTGGTTTTTGTCATTTTCCTTTTCAGATTCTCCCTGAAAACTACACCGGTAAAGGTCGGGCC‑GGTTTGGAGA‑G‑GTTAttgtttccgattttt > 1:379629/1‑225 (MQ=255)
aGTCCATTCTTAATCAAATGATTGATTAAGATTATGACTCCATAGGGGAGTTGTCCAGTATGGCTAAGAATTTTAGCAACGCCAGTCACAGGGATAATTTATGCGCTGCGCCACAAAAACTGCTACACTCCGCTCCCTCATGGCATTGTGGTTTTTGCCATTTTCCTTTTCAGTATTTCCCTGAAAACTACACCGTTAACGGTCGGGGC‑GGTTCGGGGT‑A‑GTTTTGT‑TTTTTGAATCtt > 1:239310/1‑239 (MQ=255)
tAATCAAATGATTGATTAAGATTATGACTCCATAGGGGAGTTGTCCAGTATGGCTAAGAATTTTAGCAACGCCAGTCACAGGGATAATTTATGCGCTGCGTCACAAAAACTGCTACACTCCGCTCCCTCATGACATTGTGGTTTTTGTCATTTTCCTTTTCAGTATCTCCCTGAAAACTACACCGGTAACGGTCGGGGC‑GGTTCGGAGT‑A‑GTTATGT‑CTTTCGATTCTTTGGGTTTAAg < 2:760110/239‑1 (MQ=255)
tAATCAAATGATTGATTAAGATTATGACTCCATAGGGGAGTTGTCCAGTATGGCTAAGAATTTTAGCAACGCCAGTCACAGGGATAATTTATGCGCTGCGTCACAAAAACTGCTACACTCCGCTCCCTCATGACATTGTGGTTTTTGTCATTTTCCTTTTCAGTATCTCCCTGAAAACTACACCGGTAACGGTCGGGGC‑GGTTCGGAGT‑A‑GTTATGT‑CTTTCGATTCTTTGGGTTTAAg < 2:1151401/239‑1 (MQ=255)
tAATCAAATGAATGATTAAAGTTATGACTCCATAGGGGAGTTGTCCAGTATGGCTAAGAATTTTAGCAACGCCAGTCACAGGGATAATTTATGCGCTGCGTCACAAAAACTGCTACACTCCGCTCCCTCATGACATTGTGGTTTTTGTCATTTTCCTTTTCAGTATCTCCCTGAAAACTACACCGGTAACGGTCGGGGC‑GGTTCGGAGT‑A‑GTTATGT‑CTTTCGATTCTTTGGGTTTAAg < 2:769112/239‑1 (MQ=255)
tAATCAAATAATTGATTAAGGTTATGACTCCATAGGGGGGTTGTCCGGTATGGCTAAGAATGTTAGCAACGCCAGTCACAGGGATAATTGACGCGCTGCGTCACAAAAACTGCTACACTCCGCTCCCTCAGGACATTGTGGTTTTTGTCATTTTCCTTTTCAGTATCTCCCTGAAAACTACACCGGTAACGGTCGGGGC‑GGTTCGGAGT‑A‑GTTATGT‑CTTGCGATTCTGTGGGTTTAAg < 1:89580/239‑1 (MQ=255)
attaaaTGTTTTATTAAGATTTTGCCTCCTTGGGGGGGTTTGCCAGTATGGGTAAGAATTTTAGCAACGCCAGTCAAAGGGATAATTTATGCGCTGCGTCACAAAAACTGCTACACTCCGCTCCCTCATGACATTGTGGTTTTTGTCATTTTCCTTTTCAGTATCTCCCTGAAAACTACACCGGTAACGGTCGGGGC‑GGTTCGGAGT‑A‑GTTATGT‑CTTTCGATTCTTTGGGTTTAAG‑cc < 1:1251093/236‑1 (MQ=255)
aTCAAATGATTGATTAAGGTTATGACCCCATAGGGGAGTTGTCCAGTTGGGCTAAGAATTTTAGCAACGCCAGTCACAGGGATAATTTATGCGCTGCGTCACAAAAACTGCTACACTCCGCTCCCTCATGACATTGTGGTTTTTGTCATTTTCCTTTGCAGTATCTCCCTGAAAACTACACCGGTAACGGTCGGGGC‑GGTTCGGAGT‑A‑GTTATGT‑CTTTCGATTCTTTGGGTTTAAG‑cc < 2:740528/239‑1 (MQ=255)
aTCAAATGATTGATTAAGATTATGACTTCATAGGGGAGTTGTCCAGTATGGCTAAGAATTTTAGCAACGCCAGTCACAGGGATAATTTATGCGCTGCGTCACAAAAACTGCTACACTCCGCTCCCTCATGACATTGTGGTTTTTGTCATTTTCCTTTTCAGTATCTCCCTGAAAACTACACCGGTAACGGTCGGGGC‑GGTTCGGAGT‑A‑GTTATGT‑CTTTCGATTCTTTGGGTTTAAG‑cc < 2:878150/239‑1 (MQ=255)
aTCAAATGATTGATTAAGATTATGACTCCATAGGGGAGTTGTCCAGTATGGCTAAGAATTTTAGCAACGCCAGTCCCAGGGATAATTTATGCGCTGCGTCACAAAAACTGCTACACTCCGCTCCCTCCTGCCATTGTGGTTTTTGTCATTTTCCTTTTCAGTATCTCCCTGAACACTACACCGGTAAAGGTCGTGCA‑GGTTCGGGGC‑T‑GTTTTTG‑TTTTTGATTTTTTTGGTTTTAG‑c > 1:555345/1‑238 (MQ=255)
aTCAAATGATTGATTAAGATTATGACTCCATAGGGGAGTTGTCCAGTATGGCTAAGAATTTTAGCAACGCCAGTCACAGGGATAATTTATGCGCTGCGTCACAAAAACTGCTACACTCCGCTCCCTCATGACCTTGGGGTTTTTGTAATTTTCCTTTTCAGTATCTCCCTGCAAACTAACCCGCTAACGGTCGGGGC‑GGTTCGGGGG‑G‑GTTTTGT‑CTTTTGGTCTTTTGGGGTTaaag > 1:1301858/1‑236 (MQ=255)
aTCAAATGATTGATTAAGATTATGACTCCATAGGGGAGTTGTCCAGTATGGCTAAGAATTTTAGCAACGCCAGTCACAGGGATAATTTATGCGCTGCGTCACAAAAACTGCTACACTCCGCTCCCTCATGACATTGTGGTTTTTGTCATTTTCCTTTTCAGTATCTCCCTGAAAACTACACCGGTAACGGTCGGGGCGGGTTCGG‑GT‑A‑GTTATGG‑CTTTTGGTTCTTTGGGGTTTAgg > 2:763296/1‑237 (MQ=255)
aTCAAATGATTGATTAAGATTATGACTCCATAGGGGAGTTGTCCAGTATGGCTAAGAATTTTAGCAACGCCAGTCACAGGGATAATTTATGCGCTGCGTCACAAAAACTGCTACACTCCGCTCCCTCATGACATTGTGGTTTTTGTCATTTTCCTTTTCAGTATCTCCCTGAAAACTACACCGGTAACGGTCGGGGC‑GGTTTGGAGT‑A‑GTTATTT‑TTTTCGATTTTTTGGGGTTAAG‑c > 1:254345/1‑238 (MQ=255)
aTCAAATGATTGATTAAGATTATGACTCCATAGGGGAGTTGTCCAGTATGGCTAAGAATTTTAGCAACGCCAGTCACAGGGATAATTTATGCGCTGCGTCACAAAAACTGCTACACTCCGCTCCCTCATGACATTGTGGTTTTTGTCATTTTCCTTTTCAGTATCTCCCTGAAAACTACACCGGTAACGGTCGGGGC‑GGTTCGGGGT‑A‑GTTATTG‑CTTTCGATTCTTTGGGGTTAAG‑c > 2:302643/1‑238 (MQ=255)
aTCAAATGATTGATTAAGATTATGACTCCATAGGGGAGTTGTCCAGTATGGCTAAGAATTTTAGCAACGCCAGTCACAGGGATAATTTATGCGCTGCGTCACAAAAACTGCTACACTCCGCTCCCTCATGACATTGTGGTTTTTGTCATTTTCCTTTTCAGTATCTCCCTGAAAACTACACCGGTAACGGTCGGGGC‑GGTTCGGGGA‑A‑GTTATGG‑CTTTTAATTCTTTAGGTTTaaac > 1:190749/1‑236 (MQ=255)
aTCAAATGATTGATTAAGATTATGACTCCATAGGGGAGTTGTCCAGTATGGCTAAGAATTTTAGCAACGCCAGTCACAGGGATAATTTATGCGCTGCGTCACAAAAACTGCTACACTCCGCTCCCTCATGACATTGTGGTTTTTGTCATTTTCCTTTTCAGTATCTCCCTGAAAACTACACCGGTAACGGTCGGGGC‑GGTTCGGCGT‑A‑GTTATGT‑CTTTCGAATCTTTGGGttttaac > 2:841402/1‑234 (MQ=255)
aaTGATTGATTAAGATTATGACTCCATAGGGGAGTTGTCCAGTATGGCTAAGAATTTTAGCAACGCCAGTCACAGGAATAATTTATGCGCTGCGTCACAAAAACTGCTACACTCCGCTCCGCATTGACCTTGTGGGTTTTGTACTTTTCCTTTTCAGAATCCCCCTGAAAACTACACCGGTAACGGTCAGGGC‑GGTTTCGAGT‑A‑GTTATTT‑TCTTCCATCACTTGAGTTTAAG‑cccgta > 1:538779/1‑236 (MQ=255)
aTGATTGATTAAGATTATGACTCCATAGGGGAGTTGTCCAGTATGGCTAAGAATTTTAGCAACGCCAGTCACAGGGATAATTTATGCGCTGCGTCACAAAAACTGCTACACTCCGCTCCCTCATGACATTGTGGTTTTTGTCATTTTCCTTTTCAGTATCTCCCTGAAAACTACACCGGTAACGGTCGGGGC‑GGTTCGGGGG‑A‑GTTATGT‑CTTTCGATTCTTTGGGGTTAAG‑CCCTggt > 2:1251093/1‑237 (MQ=255)
aTGATTGATTAAGATTATGACTCCATAGGGGAGTTGTCCAGTATGGCTAAGAATTTTAGCAACGCCAGTCACAGGGATAATTTATGCGCTGCGTCACAAAAACTGCTACACTCCGCTCCCTCATGACATTGTGGTTTTTGTCATTTTCCTTTTCAGTATCTCCCTGAAAACTACACCGGTAACGGTCGGGGC‑GGTTCGGAGT‑A‑GTTATGT‑CTTTCGATTCTTTGGGTTTAAG‑CCCTGat < 2:900871/239‑1 (MQ=255)
gagtAAGATTATGACTCCATAGGGGAGTTGTCCAGTATGGCTAAGAATTTTAGCAACGCCAGTCACAGGGATAATTTATGCGCTGCGTCACAAAAACTGCTACACTCCGCTCCCTCATGACATTGTGGTTTTTGTCATTTTCCTTTTCAGTATCTCCCTGAAAACTACACCGGTAACGGTCGGGGC‑GGTTCGGAGT‑A‑GTTATGT‑CTTTCGATTCTTTGGGTTTAAG‑CCCTGATATCCTg < 2:555345/236‑1 (MQ=255)
ttAAGTTTTTGACCCCATGGGGGGGTTTTCCAGTATGGCTAAAAATTTTAACAACGCCAGTCACAGGGATAATTTATGCGCTGCGTCACAAAAACTGCTACACTCCGCTCCCTCATGACATTGTGGTTTTTGTCATTTTCCTTTTCAGTATCTCCCTGAAAACTACACCGGTAACGGTCGGGGC‑GGTTCGGAGT‑A‑GTTATGT‑CTTTCGATTCTTTGGGTTTAAG‑CCCTGATATCCTg‑cg < 1:841402/239‑1 (MQ=255)
ttAAGATTATGACTCCATAGGGGAGTTGTCCAGTATGGCTAAGAATTTTAGCAACGCCAGTCACAGGGATAATTTATGCGCTGCGTCACAAAAACTGCTACACTCCGCTCCCTCATGACATTGTGGTTTGTGTCATTTTCCTTTTCAGTATCTCCCTGAAAACTACACCGGTAACGGTCGGGGC‑GGTTCGGAGT‑A‑GTTATGT‑CTTTCGATTCTTTGGGTTTAAG‑CCCTGATATCCTg‑cg < 2:319105/239‑1 (MQ=255)
tGACTCCATAGGGGAGTTGTCCAGTATGGCTAAGAATTTTAGCAACGCCAGTCACAGGGATAATTTATGCGCTGCGTCACAAAAACTGCTACACTCCGCTCCCTCATGACATTGTGGTTTTTGTCATTTTCCTTTTCAGTATCTCCCTGAAAACTACACCGGTAACGGTCGGGGC‑GGTTCGGAGG‑A‑GGTATGT‑CTTTCACTTCTTTGGGTTTAAG‑CCCTGATAACCTT‑CGCGCCGTTg > 2:556955/1‑238 (MQ=255)
tataTAGGGGATTTGTAAAGTAGGGATAAGAATTTTCACAACCCCACTCACAGGTATAATTAATGCCGTGAGTCCGGAAATCTGGTAGCCCCCGAGCCCTCATGGCATTGGGGTTGTTTTAATTTTCCTTTTCAGTATCCCCCTGAACACTCCTCCGTGAAGGGGCGGGGC‑GGTTCTGAGT‑A‑GTTATGT‑CTTTCGATTCTTTGGGTTGAAG‑CCCGGATATCCTG‑CGCGCCGTTGCCGAg < 1:722925/236‑1 (MQ=255)
tCCATAGGGGAGTTGTCCAGTATGGCTAAGAATTTTAGCAACGCCAGTCACAGGGATAATTTATGCGCTGCGTCACAAAAACTGCTACACTCCGCTCCCTCATGACATTGTGGTTTTTGTCATTTTCCTTTTCAGTATCTCCCTGAAAACTACACCGGTAACGGTCGGGGC‑GGTTCGGAGT‑A‑GTTATGT‑CTTTCGATTCTTTGGGTTTAAG‑CCCTGATATCCTG‑CGCGCCGTTGCCGAg < 2:254345/239‑1 (MQ=255)
cATAGGGGAGTTGTCCAGTATGGCTAAGAATTTTAGCAACGCCAGTCACAGGGATAATTTATGCGCTGCGTCACAAAAACTGCTACACTCCGCTCCCTCATGACATTGTGGTTTTTGTCATTTTCCTTTTCACTATATCCCTGAAAACTACACCGGTAACGGTCGGGGT‑GGTTCGGGTT‑T‑GTGCTTG‑CTTCCAATTCCTTGGGTTTTAA‑CCCGGATAATCTGACGC‑CCGTTGCCggcag > 1:1277370/1‑235 (MQ=255)
cATAGGGGAGTTGTCCAGTATGCCTAAGAATTTTAGCAACGTCAGTCACAGGGTTCATCTATGCGCTGCGTAACAAAAACTGCTACACTCCGCTCCCTCATCACATTGTGGTTTTTGTCATTTTCATTTTCAGTATCTCCCTGCAACCTACCCCGGTAACGCTTGGTGC‑GGTTTCGGGC‑A‑GCTATGT‑CTTTCCGTTTCTTAGGTTTAAG‑CCCCACTGTCCCT‑CGCCCCGTTGCCGAgac > 1:225088/1‑237 (MQ=255)
aGTTGTCCAGTATGGCTAAGAATTTTAGCAACGCCAGTCACAGGGATAATTTATGCGCTGCGTCACAAAAACTGCTCCACTCCGCTCCCTCATGACATTGTGGTTTTTGTCATTTTCCTTTTCAGATTCTCCCTGAACACTACACCGGTAACGGTCGGGGC‑GGTTCGGGGG‑ACGTTTTG‑‑ATTTCGCTTCTTTGGGTTTTCA‑CCCCGTTTCCCTT‑CTCGCCCTTGGCGAGCAggggttcc > 1:1285365/1‑234 (MQ=255)
aGTTGTCCAGTATGGCTAAGAATTTTAGCAACGCCAGTCACAGGGATAATTTATGCGCTGCGTCACAAAAACTGCTACACTCCGCTCCCTCATGACATTGTGGTTTTTGTCATTTTCCTTTTCAGTATCTCCCTGAAAACTACACCGGTAACGGTCGGGGC‑GGTTCGGAGT‑A‑GTTATTT‑CTTTCGATTCTTTGGGTTTAAG‑CCCTGATATCCTG‑CCGGCCGTTGCCCAGCAGGGGTAcc > 2:336758/1‑239 (MQ=255)
ttGTCCAGTATGGCTAAGAATTTTAGCAACGCCAGTCACAGGGATAATTTATGCGCTGCGTCACAAAAACTGCTACACTCCGCTCCCTCATGACATTGTGGTTTTTGTCATTTTCCTTTTCAGTATCTCCCTGAAAACTACACCGGTAACGGTCGTGGC‑GGGTCGGGGT‑G‑GTTATGT‑CATTCGATTCTTTGGGTTTTAG‑GCCTGATATCCTG‑CGGCGCGATGCCGAGCAGGGTTACCgg > 1:647834/1‑238 (MQ=255)
ttGTCCAGTATGGCTAAGAATTTTAGCAACGCCAGTCACAGGGATAATTTATGCGCTGCGTCACAAAAACTGCTACACTCCGCTCCCTCATGACATTGTGGTTTTTGTCATTTTCCTTTTCAGTATCTCCCTGAAAACTACACCGGTAACGGTCGGGGC‑GGTTCGGGGT‑A‑GTTATGT‑CTTTCGATTCTTTGGGTTTAAG‑CCCTGATATCCTG‑CGCGCCGTTGCCGAGCAGGGGTACCGt > 2:149168/1‑239 (MQ=255)
ttGTCCACTATGGCTAAGAATTTTAGCAACGCCAGTCACAGGGATAATTTATGCGCTGCGTCACAAAAACTGCTACACTCCGCTCCCTCATGACATTGTGGTTTTTGTCATTTTCCTTTTCAGTATCTCCCTGAAAACTACACCGGTCACGGTCGGGGC‑GGCTCGGAGT‑A‑GTTTCGT‑CTTTCGATTTTTTGGGGTTAAG‑CCCTGATTCACCG‑CGCCCCCGTCCCGGGGCGGGTTACCGt > 1:291284/1‑239 (MQ=255)
gTCCAGTATGGCTAAGAATTTTAGCAACGCCAGTCACAGGGATAATTTATGCGCTGCGTCACAAAAACTGCTACACTCCGCTCCCTCATGACATTGTGGTTTTTGTCATTTTCCTTTTCCGTATCTCCCTGAAAACTAAACCGGAAACGGTCGGGCC‑GGTTCTGTAT‑T‑GGTTTGT‑TTTTCGCTTTTTTGGGTTTAAG‑CCCCTACATCCTT‑CGCGCCCTTTCCGCGCACGGGTAcctgtt > 1:243124/1‑235 (MQ=255)
gTCCAGTATGGCTAAGAATTTTAGCAACGCCAGTCACAGGGATAATTTATGCGCTGCGTCACAAAAACTGCTACACTCCGCTCCCTCATGACATTGTGGTTTTTGTCATTTTCCTTTTCAGTATCTCCCTGAAAACTACACCGGTAACGGTCGGGGC‑GGTTCGGGGT‑A‑GTTATGT‑CCTTCGATTCTTTGGGTTTAAG‑CCCTGATATc > 2:1295915/1‑207 (MQ=255)
gTCCAGTATGGCTAAGAATTTTAGCAACGCCAGTCACAGGGATAATTTATGCGCTGCGTCACAAAAACTGCTACACTCCGCTCCCTCATGACATTGTGGTTTTTGTCATTTTCCTTTTCAGTATCTCCCTGAAAACTACACCGGTAACGGTCGGGCC‑GGTTCGGAGT‑A‑GTTATGT‑TTTTCGATTCTTTTGGTTTAAG‑ACCTGTAATCCTC‑CGCCCCGTTGCCGAGCAGGGTTAcctgga > 2:565773/1‑235 (MQ=255)
cAGTATGGCTAAGAATTTTAGCAACGCCAGTCACAGGGATAATTTATGCGCTGCGTCACAAAAACTGCTTCACTCCGCTCCCTTATGACATTGTGGTTTTTGTCATTTTCCTTTTCAGTATCTCCCTGAAAACTACACCGGTAACGGTCGGGGC‑GGTTCGGAGT‑A‑GTTATGT‑CTTTCGATTCTTTGGGTTTAAG‑CCCTGATATCCTG‑CGCGCCGTTGCCGAGCAGGGTTACCGT‑GAacc < 2:1189744/239‑1 (MQ=255)
aTGGCTAAGAATTTTAGCAACGCCAGTCACAGGGATAATTTATGCGCTGCGTCACAAAAACTGCTACACTCCGCTCCCTCATGACATTGTGGTTTTTGTCATTTTCCTTTTCAGTATCTCCCTGAAAACTACACCGGTAACGGTCGGGGC‑GGTTCGGAGT‑A‑GTTATGT‑CTTTCGATTCTTTGGGTTTAAG‑CCCTGATATCCTG‑CGCGCCGTTGCCGAGCAGGGTTACCGT‑GAacccac < 2:190749/238‑1 (MQ=255)
aTGGCTAAGAATGTTAGCAACGCCAGTCACAGGGATAATTTATGCGCTGCTGCACAAAAACTGCTACACTCCGCGCCCTCATGACATTGTGGTGTTTGTCATTTTCCTTTTCAGTATCCCCCTGAAAACTACACCGGTAACGGTCGGGGC‑GGTTCGGAGT‑A‑GTTATGT‑CTTTCGATTCTTTGGGTTTAAG‑CCCTGATATCCTG‑CGCGCCGTTGCCGAGCAGGGTTACCGT‑GAacccac < 2:1267747/238‑1 (MQ=255)
tGGCTAAGAATTTTAGCAACGGCAGTCACAGGGATAATTTATGCGCTGCGTCACAAAAACTGCTACACTCCGCTCCCTCATGACATTGTGGTTTTTGTCATTTTCCTTTTCAGTATCTCCCTGAAAACTACACCGGTAACGGTCGGGGC‑GGTTCGGAGT‑A‑GTTATGT‑CTTTCGATTCTTTGGGTTTAAG‑CCCTGATATCCTG‑CGCGCCGTTGCCGAGCAGGGTTACCGT‑GAacccaccc < 2:243124/239‑1 (MQ=255)
tGGCTAAGAATTTTAGCAACGCCAGTCACAGGGATAATTTATGCGCTGCGTCACAAAAACTGCTACACTCCGCTCCCTCATGACATTGTGGTTTTTGTCATTTTCCTTTTCAGTATCTCCCTGAAAACTACACCGGTAACGGTCGGGGC‑GGTTCGGAGT‑A‑GTTATGT‑CTTTCGATTCTTTGGGTTTAAG‑CCCTGATATCCTG‑CGCGCCGTTGCCGAGCAGGGTTACCGT‑GAacccaccc < 2:468219/239‑1 (MQ=255)
cTAAGAATTTTAGCAACGCCAGTCACAGGGATAATTTATGCGCTGCGTCACAAAAACTGCTACACTCCGCTCCCTCATGAACTTGTGGTTTTTGTCATTTTCCTTTTCAGTATCTCCCTGAAAACTACACCGGTAACGGTCGGGGC‑GGTTCGGAGT‑A‑GTTATGT‑CTTTCGATTATTTGTGGTTAAA‑CCCCGAGATCCTG‑CGAGCCGTGTCCGGGCAGGGTGTCCCG‑GAAACCACCCCTa > 1:500696/1‑239 (MQ=255)
aGAATTTTAGCAACGCCAGTCACAGGGATAATTTATGCGCTGCGTCACAAAAACTGCTACACTCCGCTCCCTCATGACATTGTGGTTTTTGTCATTTTCCTTTTCAGTATCTCCCTGAAAACTACACCGGTAACGGTCGGGGC‑GGTTCGGAGT‑A‑GTTCTTT‑CTTTCGATTCTTTTGGGTTAAG‑CCCTGATATCCTG‑CGCGCCGTTGCCCAGCCCGGTTACCGTGGAacccaccctatt > 2:785671/1‑234 (MQ=255)
aaTTTTAGCAACGCCAGTCACAGGGATAATTTATGCGCTGCGTCACAAAAACTGCTACACTCCGCTCCCTCATGACATTGTGGTTTTTGTCATTTTCCTTTTCAGTATCTCCCTGAAAACTACACCGGTAACGGTCGGGGC‑GGTTCGGAGT‑A‑GTTATGT‑CTTTCGATTCTTTGGGGTTAAG‑CCCTGGTATCCTG‑CGCGCCGTTGCCGAGCAGGGTTACCGT‑TAACCCACCCCTCTTcac > 2:432823/1‑238 (MQ=255)
aTTTAAGCAACGCCAGTCACAGGGATAATTTATGCGCTGCGTCACAAAAACTGCTACACTCCGCTCCCTCATGACATTGTGGTTTTTGTCATTTTCCTTTTCAGTATCTCCCTGAAAACTACACCGGTAACGGTCGGGGC‑GGTTCGGAGT‑A‑GTTATGT‑CTTTCGATTCTTTGGGTTTAAG‑CCCTGATATCCTG‑CGCGCCGTTGCCGAGCAGGGTTACCGT‑GAACCCACCCCTATTcagc < 2:291284/239‑1 (MQ=255)
tgtAGCAACGCAAGTCCCAGGGATAATTTAGTGGCTGCGTCACAAAACCTGCTACCCCCCGCTCCCTCATGACATTGTGGTTTTTGTCATTTTCCTTTTCAGTATCTCCCTGAAAACTACACCGGTAACGGTCGGGGC‑GGTTCGGAGT‑A‑GTTATGT‑CTTTCGATTCTTTGGGTTTAAG‑CCCTGATATCCTG‑CGCGCCGTTGCCGAGCAGGGTTACCGT‑GAACCCACCCCTATTcagcag < 2:1196641/237‑1 (MQ=255)
aaCGCCAGTCACAGGGATAATTTATGCGCTGCGTCACAAAAACTGCTACACTCCGCTCCCTCATGACATTGTGGTTTTTGTCATTTTCCTTTTCAGTATCTCCCTGAAAACTACACCGGTAACGGTCGGGGC‑GGTTCGGAGT‑A‑GTTATGT‑CTTTCGATTCTTTGGGTTTAAG‑CCCTGATATCCTG‑CGCGCCGTTGCCGAGCAGGGTTACCGT‑GAACCCACCCCTATTCAGCAGCAGGc < 2:706009/238‑1 (MQ=255)
cGCCAGTCACAGGGATAATTTATGCGCTGCGTCACAAAAACTGCTACACTCCGCTCCCTCATGACATTGTGGTTTTTGTCATTTTCCTTTTCAGTATCTCCCTGAAAACTACACCGGTAACGGTCGGGGC‑GGTTCGGAGT‑A‑GTTATGT‑CTTTCGATTCTTTGGGTTTAAG‑CCCTGATATCCTG‑CGCGCCGTTGCCGGCCAGGGTTACCGG‑GAACCCACCCCCTTTCAGCAGCAGGCGa > 2:346812/1‑238 (MQ=255)
tttATGCGCTGCGTCACAAAAACTGCTACACTCCGCTCCCTCATGACATTGTGGTTTTTGTCATTTTCCTTTTCAGTATCTCCCTGAAAACTACACCGGTAACGGTCGGGGC‑GGTTCGGAGT‑A‑GTTATGT‑CTTTCGATTCTTTGGGGTTAAG‑CCCGGATATCCTT‑CGCGCCCTTGCCGAGCCAGGTGTCCGG‑GAACCCACCCCTATTCAGAAACAGGCGATCCCCGCGGGGCTGGAAg > 2:560635/1‑238 (MQ=255)
tgcgctgcgcCACAACAACTGCTACACTCCGCTCCCTCATGACATTGTGGTTTTTGTCATTTTCCTTTTCAGTAGCTCCCTGAAAACTACCCCGGTAACGGTCGGGGC‑GGTTTGGAGG‑A‑GTTATGT‑CTTTCGACTCTCTGGGTTTGAG‑CCCGTGTATTCTG‑CGCGCCCTTTCCGGCGAAGGGTACCGT‑GAACACACCCCAATTAAATACCACGCCTTCCCGGCGGTGCTTGAAGGcccc > 1:786052/1‑237 (MQ=255)
tGCGCTGCGTCACAAAAACTGCTACACTCCGCTCCCTCATGACATTGTGGTTTTTGTCATTTTCCTTTTCAGTATCTCCCTGAAAACTACACCGGTAACGGTCGGGGC‑GGTTCGTAGT‑A‑GTTATGT‑CTTTTGATCCTTTTGGTTTAAGCCCCTTAT‑TCCTC‑TCCGCCGTTGCCGAGCAGGGTTTACGT‑GAACCCACCCCTATTCACCACCAGGGCATCCCCACGGTGCTGGaaaaccc > 1:524573/1‑233 (MQ=255)
tGCGCTGCATCACAAAAACTGCTACACTCCGCTCCCTCATGACATTGTGGTTTTTGTCATTTTCCTTTTCAGTATCTCCCTGAACACTACACCGGTAACGGTCGTGGC‑GGGTCGGGGTCA‑TTTAGGT‑GTTTC‑ATTCTTTGGGCTTAAG‑CCCTCGTATACGT‑CGCGACGCTGTCGACCCGGGGGTGCGG‑CGACCCCCCCCTATCACACAGCATGCGATCCCCGGCGTGCCGGGAGGCcgc > 1:853784/1‑239 (MQ=255)
tcgcTGCGTTACAAAATCTGCTTCTCTCCGCTCCCTCATGACATTGTGGTTTTTGGCATTTTCCTTTTCAGTATCTCCCTGAAAACTACACCGGTAACGGTCGGGGC‑GGTTCGGAGT‑A‑GTTATGT‑CTTTCGATTCTTTGGGTTTAAG‑CCCTGATATCCTG‑CGCGCCGTTGCCGAGCAGGGTTACCGT‑GAACCCACCCCTATTCAGCAGCAGGCGATCCCTGCGGTGCTGGAAGGCcgcg < 1:621132/238‑1 (MQ=255)
tGCGTCACAAAAACTGCTACACTCAGCTCCCTCATGACATTGTGGTTTTTGTCATTTTCCTTTTCAGTATCTCCCTGAAAACTACACCGGTAACCGTCGGGGC‑GGTTCGGAGT‑A‑GTTCTTTCCTTTCTA‑TCTTTTGATTTAAG‑CCCGTCTATCCTT‑CGCGCCCTTGCCTACCAAGGTTACCGG‑TAACCACCACCTCTTCACAAGCAGCGGAACCCTCAGCTGCCGGAAGCGCCCGAccc > 1:777190/1‑238 (MQ=255)
gCTACACTCCGCTCCCTCATGACATTGTGGTTTTTGTCATTTTCCTTTTCAGTATCTCCCTGAAAACTACACCGGTAACGGTCGGGGC‑GGTTCGGCGT‑A‑GTTTTGT‑CTTTAGATTCTTTTGGTTTAAG‑CCCTGATATCCTT‑CCCTCCCGTGCCGAGCAGGCTTACCCT‑GGAACCACCACCATTCACCACCCAGCGCTCCCCACGGTGATGAGAGGCCGCGAccccaagggacgagccca > 1:88896/1‑223 (MQ=255)
tCCGCTCCCTCAGTACATTGTGGTTTTTGTCATTTTCCTTTTCAGTAACTCCCTGAAAACTACACCGGTAACGGTCGGGGC‑GGTTCGGAGT‑A‑GTTATGT‑CTTTCGATTCTTTGGGTTTAAG‑CCCTGATATCCTG‑CGCGCCGTTGCCGAGCAGGGTTACCGT‑GAACCCACCCCTATTCAGCAGCAGGCGATCCCTGCGGTGCTGGAAGGCCGCGACCTGATGGCTAGCGCCCAGaccggc < 2:1285365/239‑1 (MQ=255)
cGCTCCCTCATGACATTGTGGTTTTTGTCATTTTCCTTTTCAGTATCTCCCTGAAAACTACACCGGTAACGGTCGGGGC‑GGTTCGGGGT‑A‑GTTATGT‑CTTTCGATTCTTTTGGTTTAAG‑CCCTGATATCCTG‑CGCGCCGTTGCCGAGCAGGGTTACCGT‑GAACCCACCCCTATTCAGCACCCGGCGATCCCTTCGGGGCTGGAAGGCCGCGACCTTAAGGCTTGGGCCCGAaccggcc > 2:439701/1‑237 (MQ=255)
cGCTCCCTCATGACATTGTGGTTTTTGTCATTTTCCTTTTCAGTATCTCCCTGAAAACTACACCGGTAACGGTCGGGGC‑GGTTCGGAGT‑A‑GTTATGT‑CTTTCGATTCTTTGGGTTTAAG‑CCCTGATATCCTG‑CGCGCCGTTGCCGAg > 2:304863/1‑147 (MQ=255)
cGCTCCCTCATGACATTGTGGTTTTTGTCATTTTCCTTTGCAGTATCTCCCTGAAAACTACACCGGTAACGGTCGGGGC‑GGTTCGGAGT‑A‑GTTATGT‑CTTTCGATTCTTTGGGTTTAAG‑CCCTGATATCCTG‑CGCGCCGTTGCCGAg < 1:304863/147‑1 (MQ=255)
cTCCCTCATGACATTGTGGTTTTTGTCATTTTCCTTTTCAGTATCTCCCTGAAAACTACACCGGTAACGGTCGGGGC‑GGTTCGGGGG‑A‑GTTATTT‑CTTTTGATTCTTTGGGTTTAAG‑CCCTGTGATCCTG‑CTCGCCGTTGCCGGGCAGGGGTACCGT‑GGACCCCCCCCACTTCAGCAACAGGGGGTCCCCGCGGGGGCGGAAAGCCCCACACGGATGGCCAACGCCCAGacccgccc‑cg > 1:744907/1‑239 (MQ=255)
cTCCCTCATGACATTGTGGTTTTTGTCATTTTCCTTTTCAGTATCTCCCTGAAAACTACACCGGTAACGGTCGGGGC‑GGTTCGGAGT‑A‑GTTATGT‑CTTTCGATTCTTTTGGTTTAAG‑CCCTGATATCCTG‑CGCGCCGTTGCCGAGCAGGGTTACCGT‑GAACCCACCCCTATTCAGCAGCAGGc > 2:333657/1‑183 (MQ=255)
cTCCCTCATGACATTGTGGTTTTTGTCATTTTCCTTTTCAGTATCTCCCTGAAAACTACACCGGTAACGGTCGGGGC‑GGTTCGGAGT‑A‑GTTATGT‑CTTTCGATTCTTTGGGTTTAAG‑CCCTGATATCCTG‑CGCGCCGTTGCCGGGCAGGGGTACCGT‑GAACCCACCCCTATTCAGCAGCAGGCGATTCCTTCGGGGCTGGAAGGCCGCGGCCTGATGGCTAGCGCCCAGgaccgcac‑cg > 2:1072062/1‑239 (MQ=255)
cTCCCTCATGACATTGTGGTTTTTGTCATTTTCCTTTTCAGTATCTCCCTGAAAACTACACCGGTAACGGTCGGGGC‑GGTTCGGAGT‑A‑GTTATGT‑CTTTCGATTCTTTGGGTTTAAG‑CCCTGATATCCTG‑CGCGCCGTTGCCGAGCAGGGTTACCGT‑GAACCCACCCCTATTCAGCAGCAGGc < 1:333657/183‑1 (MQ=255)
tGACATTGTGGTTTTTGTCATTTTCCTTTTCAGTATCTCCCTGAAAACTACACCGGTAACGGTCGGGGC‑GGTTCGGAGT‑A‑GGTATGT‑CTTTCGATTCTTTGGGTTTAAG‑CCCTGATATCCTG‑CGCGCCGTTGCCGAGCAGGGTTACCGT‑GAACCCACCCCTATTCAGCAGCAGGCGATCCCTGCGGTGCTGGAAGGCCCCGACCTGATGGCCAGCGCCCCGACCGGCCC‑CGGCcaaaaa > 2:800196/1‑237 (MQ=255)
tGACATTGTGGTTTTTGTCATTTTCATTTTCAGTATCTCCCTTACAACTACACCGGTAACGGTCGGGGC‑GGTTCGGCGT‑A‑GTTATGG‑CTTTCACTTCTCTGGCGCTAAC‑CCCTGAGATACTT‑AGCGCCGTTTCCCAGGAGGGGTATCGT‑TAACACAACACCCTCTAGCCGCACGCGGTACCGGCGGCGCTGCAAGTACCCAACCTGCTAGCTAGCCCCCAGACCAGAACACGGCaaaaa > 1:194401/1‑238 (MQ=255)
gtgctttGTGGTTTTTTTCTTTTTCCTTTTCTGTATCTCCGTTAAACTCACACCGGTAACGGTCGGTGC‑GTTTCGGAGT‑A‑GTTATGT‑CTTTCGATTCTTTGGGTTTAAG‑CCCTGATATCCTG‑CGCGCCGTTACCGAGCATGGTTTCCGT‑GAACCCACCCCTATTCAGCATCAGGCGATCCCTGCGGTGCTGGAAGGCCGCGACCTGATGGCTAGCGCCCAGACCGGCAC‑CGGCAAAACa < 1:406869/234‑1 (MQ=255)
accttggtgTTTTTGTCATTTTCCTTTTCAGTAACTCCCTGAAAACTACACCGGTAACGGTCGGGGC‑GGTTCGGAGT‑A‑GTTATGT‑CTTTCGATTCTTTGGGTTTAAG‑CCCTGATATCCTG‑CGCGCCGTTGCCGAGCAGGGTTACCGT‑GAACCCACCCCTATTCAGCAGCAGGCGATCCCTGCGGTGCTGGAAGGCCGCGACCTGATGGCTAGCGCCCAGACCGGCAC‑CGGCAAAACAGc < 2:258976/231‑1 (MQ=255)
ttGTGGTTTTTGTCATTTTCCTTTTCAGTATCTCCCTGAAAACTACACCGGTAACGGTCGGGGC‑GGTTTGGCGG‑A‑GTTATGT‑CTTTTGATTCTTTGGGGTTAAT‑CCCTGATATCCTG‑CGCGCCGTTGTCCAGCAGGGTTAACGG‑GAACCCCACCCTCTTCAGCAGCAGGGGATCCCTCCGTGGCTCGAAAGCCGCGACCCGCGGGCCAGCGCCCCAaccggcac‑cccgaaaaaaagggg > 1:348861/1‑225 (MQ=255)
gTTTTTGTCATTTGCCTTGTCAGTATCTCCTAGAAAACTACACCGGTAACGGTCGGGGC‑GGTTCGGAGT‑A‑GTTATGT‑CTTTCGATTCTTTGGGTTTAAG‑CCCTGATATCCTG‑CGCGCCGTTGCCGAGCAGGGTTACCGT‑GAACCCACCCCTATTCAGCAGCAGGCGATCCCTGCGGTGCTGGAAGGCCGCGACCTGATGGCTAGCGCCCAGACCGGCAC‑CGGCAAAACAGCGGGCTTTa < 2:463719/239‑1 (MQ=255)
tttGTCTTTTTCTTTTTCTTTCTC‑CCCTGAAAACCTCACCGGTAAGGGTCGGGGC‑GGTTCGGGGT‑T‑GTTATGT‑CTTTCGATTCTTTGGGTTTAAG‑CCCTGATATCCTG‑CGCGCCGTTGCCGAGCAGGGTTACCGT‑GACCCCACCCCTATTCAGCAGCAGGCGATCCCTGCGGTGCTGGAAGGCCGCGACCTGATGGCTAGCGCCCAGACCGGCAC‑CGGCAAAACAGCGGGCTTTACGCt < 1:149168/239‑1 (MQ=255)
tttGTCATTTTCCTTTTCAGTATCTCCCTGAAAACTACACCGGTAACGGTCGGGGC‑GGTTCGGAGT‑A‑GTTATGT‑CTTTCGATTCTTTGGGTTTAAG‑CCCTGATATCCTG‑CGCGCCGTTGCCGAGCAGGGTTACCGT‑GAACCCACCCCTATTCAGCAGCAGGCGATCCCTGCGGTGCTGGAAGGCCGCGACCTGATGGCTAGCGCCCAGACCGGCAC‑CGGCAAAAAAGCGGGCTTTACg > 2:753507/1‑238 (MQ=255)
cATTTTCCTTTTCAGTATCTCCCTGAAAACTACACCGGTAACGGTCGGGGC‑GGTTCGGAGT‑A‑GTTATGT‑CTTTCGATTCTTTGGGTTTAAG‑CCCTGATATCCTG‑CGCGCCGTTGCCGAGCAGGGTTACCGT‑GAACCCACCCCTAtt < 2:573692/146‑1 (MQ=255)
tttttCTTTTTCAGTTTCTCCCTGAACACTTCACCTGTAGCTGTCGGGGC‑GGTTCGGAGT‑A‑GTTATTG‑CTTGCGATTCTTTGGGTTTAAG‑CCCTGATATCCTG‑CGCGCCGGTGCCGAGCAGGGTTACCGT‑GAACCCACCCCTATTCAGCAGCAGGCGATCCCTGCGGTGCTGGAAGGCCGCGACCTGATGGCTAGCGCCCAGACCGGCAC‑CGGCAAAACAGCGGGCTTTACGCTGCCGc < 1:245472/238‑1 (MQ=255)
tttCAGTATCTCCCTGAAAACTACACCGGTAACGGTCGGGGC‑GGTTCGGAGT‑A‑GTTATGT‑CTTTCGATTCTTTGGGTTTAAG‑CCCTGATATCCTG‑CGCGCCGTTGCCGAGCAGGGGTACCGT‑GAACCCACCCCTATTCAGCAGCAGGCGATCCCTGCGGTGCTGGAAGGCCGCGACCTGCTGGCTAGCGCCCAGACCGGCAC‑CGGCAAAACACCGGGCTTTACGCTGCCCCCGTTGCac > 2:131678/1‑238 (MQ=255)
tttCAGTATCTCCCTGAAAACTACACCGGTAACGGTCGGGGC‑GGTTCGGAGG‑A‑GGTATGT‑CTTTCGATTCTTTGGGTTTAAG‑CCCTGATATCCTG‑CGCGCCGTTGCCGAGCAGGGTTACCGT‑GAACCCACCCCTATTCAGCAGCAGGCGATCCCTGCGGTGCTGGAAGGCCGCGACCTGATGGCTAGCGCCCAGACCGGCAC‑CGGCAAAACAGCGGGCTTTACGCTGCCGCTGTTGCaa < 2:561541/239‑1 (MQ=255)
ccTGAAAACTACACCGGTAACGGTCGGGGC‑GGTTCGGAGT‑A‑GTTATGT‑CTTTCGATTCTTTGGGTTTAAG‑CCCTGATATCCTG‑CGCGCCGTTGCCGAGCAGGGTTACCGT‑GAACCCACCCCTATTcagc < 1:1124768/129‑1 (MQ=255)
ccTGAAAACTACACCGGTAACGGTCGGGGC‑GGTTCGGAGT‑A‑GTTATGT‑CTTTCGATTCTTTGGGTTTAAG‑CCCTGATATCCTG‑CGCGCCGTTGCCGAGCAGGGTTACCGT‑GAACCCACCCCTATTcagc > 2:1124768/1‑129 (MQ=255)
gaaaaatcctcggtttgaggagggggC‑GGTTCGGGTC‑T‑GTTTTTT‑GTTTCGGTTGTTTGGGTTGAGC‑CGCTGGTGTCATG‑CGTGCAGTTGCCGAGCAGGCTTACCGT‑GAACCCCCCCCTTGTCAGCAGGAGGCGATCCCTGCGGTGCTGGGAGGCGGCGACCGTATGGCTAGAGCCAAGACCGGCAC‑CGGCAAAACAGCGGGCTTTACGCTGCCGCTGTTGCAACTCCTGTGCACTCGc < 1:921379/217‑1 (MQ=255)
accccGGTAACGGTCGGGGC‑GGTTCGGAGT‑A‑GTTATGG‑CTTTCGAATCTTTGGGTTTAAG‑CCCTGATATCCTG‑CGCGCCGTTGCCGAGCAGGGTTACCGT‑GAACCCACCCCTATTCAGCAGCAGGCGATCCCTGCGGTGCTGGAAGGCCGCGACCTGATGGCTAGCGCCCAGACCGGCAC‑CGGCAAAACAGCGGGCTTTACGCTGCCGCTGTTGCAACACCTGATCACTCGCCAGCCGc < 2:524573/236‑1 (MQ=255)
acacCGGTAACGGTCGGGGC‑GGTTCGGAGT‑A‑GTTATGT‑CTTTCGATTCTTTGGGTTTAAG‑CCCTGATATCCTG‑CGCGCCGTTGCCGAGCAGGGTTACCGT‑GAACCCACCCCTATTCAGCAGCAGGCGATCCCTGCGGTGCTGGAAGGCCGCGACCTGATGGCTAGCGCCCAGACCGGCAC‑CGGCAAAACAGCGGGCTTTACGCTGCCGCTGTTGCAACACCTGATCACTCGCCAGCCGc < 2:1173379/239‑1 (MQ=255)
cacCGGTAACGGTCGGGGC‑CGTTCGGAGT‑T‑GTTATGT‑CTTTCGATTCTTTGGGTTTAAG‑CCCTGATATCCTG‑CGCGCCGTTGCCGAGCAGGGTTACCGT‑GACCCCACCCCTATTCAGCAGCAGGCGATCCCTGCGGTGCTGGAAGGCCGCGACCTGATGGCTAGCGCCCAGACCGGCAC‑CGGCAAAACAGCGGGCTTTACGCTGCCGCTGTTGCAACACCTGATCACTCGCCAGCCGCa < 2:500696/239‑1 (MQ=255)
acCGGTAACGGTCGGGGC‑GGTTCGGGGT‑A‑GTTATGT‑CTTTCGATTCTTTGGGCTTAAG‑CCCCGATATCCTG‑CGCGGCGTTGCCGAGCAGGGTTACCGT‑GAACCCACCCCTATTCAGCAGCAGGGGATCCCCGCGGGGGTCGAAGGCAGCGGCCCGATGGCAAAGCCCCACACCGGCAC‑CGGCACAAAAACGGGGTGTACGCGGCCTCTGTGCGAACACCTGATCACCCGCCaacagccc > 1:356073/1‑232 (MQ=255)
ccGGTAACGGTCGGGGC‑GGTTCGGAGT‑A‑GTTATGT‑CTTTCGATTCTTTGGGTTTAAG‑CCCTGATATCCTG‑CGCGCCGTTGCCGAGCAGGGTTACCGT‑GAACCCACCCCTATTCAGCAGCAGGCGATCCCTGCGGTGCTGGAAGGCCGCGACCTGATGGCTAGCGCCCAGACCGGCAC‑CGGCAAAACAGCGGGCTTTACGCTGCCGCTGTTGCAACACCTGATCACTCGCCAGCCGCACg < 2:239310/239‑1 (MQ=255)
ggAGT‑A‑GTTATGT‑CTTTCGATTCTTTGGGTTTAAG‑CCCTGATATCCTG‑CGCGCCGTTGCCGAGCAGGGTTACCGT‑GAACCCACCCCTATTCAGCAGCAGGCGATCCCTGCGGTGCTGGAAGGCCGCGACCTGATGGCTAGCGCCCAGACCGGCAC‑CGGCAAAACAGCGGGCTTTACGCTGCCGCTGTTGCAACACCTGATCACTCGCCAGCCGCACGCCAAAGGGCGTCGTCCGGTACg < 2:348861/239‑1 (MQ=255)
|
AGTCCATTCTTAATCAAATGATTGATTAAGATTATGACTCCATAGGGGAGTTGTCCAGTATGGCTAAGAATTTTAGCAACGCCAGTCACAGGGATAATTTATGCGCTGCGTCACAAAAACTGCTACACTCCGCTCCCTCATGACATTGTGGTTTTTGTCATTTTCCTTTTCAGTATCTCCCTGAAAACTACACCGGTAACGGTCGGGGC‑GGTTCGGAGT‑A‑GTTATGT‑CTTTCGATTCTTTGGGTTTAAG‑CCCTGATATCCTG‑CGCGCCGTTGCCGAGCAGGGTTACCGT‑GAACCCACCCCTATTCAGCAGCAGGCGATCCCTGCGGTGCTGGAAGGCCGCGACCTGATGGCTAGCGCCCAGACCGGCAC‑CGGCAAAACAGCGGGCTTTACGCTGCCGCTGTTGCAACACCTGATCACTCGCCAGCCGCACGCCAAAGGGCGTCGTCCGGTACG > NC_000913/830649‑831101
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 13 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
GATK/CNVnator alignment
N/A
