Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A19 F166 I1 R1
|
27 |
92.7 |
1999278 |
95.2% |
1903312 |
141.0 |
Breseq alignment
BRESEQ :: Evidence
|
| evidence |
seq id |
position |
mutation |
annotation |
gene |
description |
| RA |
CP000730 |
1,063,849 |
C→T |
D214N (GAC→AAC) |
brpA ← |
LytR family transcriptional regulator |
|
| |
seq id |
position |
ref |
new |
freq |
score (cons/poly) |
reads |
annotation |
genes |
product |
| * | CP000730 | 1,063,849 | 0 | C | T | 98.5%
| 215.2
/ NA
| 68 | D214N (GAC→AAC) | brpA | LytR family transcriptional regulator |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (0/1); new base T (31/36); total (31/37) |
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 |
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 |
CAGAGTTAGTTAAATTATGCTTTGCATTTTTACCTACAATTTGAATCACGTTATCAAGTTTATCAATAGAATCAACTTCCTGTGCTTTTTGGAATAAAATCTTAATTAATTCCATTTGACGTTGTCCACGTTTTAAGTCTGAATCATGATGTCTAGTTCTAGCAACTGCTAAAGCCTCATCACCATTTAATTTTTGGTACCCTTTTTTAATTTTAATCTTACCAGTATCATCTGTGTTAGGTTCATTTAAGTCGTATGGCACATCATAGTATATGC > CP000730/1063711‑1063986
|
cAGAGTTAGTTAAATTATGCTTTGCATTTTTACCTACAATTTGAATCACGTTATCAAGTTTATCAATAGAATCAACTTCCTGTGCTTTTTGGAATAAAATCTTAATTAATTCCATTTGACGTTGTCCACGTTTTAGGTTTg > 1:124309/1‑141 (MQ=255)
agagTTAGTTAAATTATGCTTTGCATTTTTACCTACAATTTGAATCACGTTATCAAGTTTATCAATAGAATCAACTTCCTGTGCTTTTTGGAATAAAATCTTAATTAATTCCATTTGACGTTGTCCACGTTTTAAGTTTGa > 2:613080/1‑141 (MQ=255)
agttagttAAATTATGCTTTGCATTTTTACCTACAATTTGAATCACGTTATCAAGTTTATCAATAGAATCAACTTCCTGTGCTTTTTGGAATAAAATCTTAATTAATTCCATTTGACGTTGTCCACGTTTTAAGTTTGAAt < 1:323915/141‑1 (MQ=255)
agttaAATTATGCTTTGCATTTTTACCTACAATTTGAATCACGTTATCAAGTTTATCAATAGAATCAACTTCCTGTGCTTTTTGGAATAAAATCTTAATTAATTCCATTTGACGTTGTCCACGGTTTAAGTTGGAATCatg > 1:269348/1‑141 (MQ=255)
gttaAATTAAGCTTTGCATTTTTACCTACAAGTTGAATCACGTTATCAAGTTTATCACTTGAATAAAATTCTTGTGATTTTTGGATTAAAATCTTATTTAAATCAATTTGAAGTTGTCCACGTTTCAAGTTTGAATCatgt > 2:268992/1‑140 (MQ=255)
ttaAATTATGCTTTGCATTTTTACCTACAATTTGAATCACGTTATCAAGTTTATCAATAGAATCAACTTCCTGTGCTTTTTGGAATAAAATCTTAATTAATTCCATTTGACGTTGTCCACGTTTTAAGTTTGAATCatgat < 1:143085/141‑1 (MQ=255)
aaaTTATGCTTTGCATTTTTACCTACAATTTGAATCACGTTATCAAGTTTATCAATAGAATCAACTTCCTGTGCTTTTTGGAATAAAATCTTAATTAATTCCATTTGACGTTGTCCACGTTTTAAGTTTGAATCATGATGt < 2:751653/141‑1 (MQ=255)
gCTTTGCATTGTTACCTACATTTTGAATCACGTTATCAAGTTTATCAATAGAATCAACTTCCTGTGCTTTTTGGAATAAAATCTTAATTAATTCCATTTGACGTTGTCCACGTTTTAAGTTTGAATCATGATGTCTATTTc > 2:337375/1‑141 (MQ=255)
gCATTTTTACCTACAATTTGAATCACGTTATCAAGTTTATCAATAGAATCAACTTCCTGTGCTTTTTGGAATAAAATCTTAATTAATTCCATTTGACGTTGTCCACGTTTTAAGTTTGAATCATGATGTCTAGTTCTAGCa < 1:297761/141‑1 (MQ=255)
tttACCTACAATTTTAATCACGTTATCAAGTTTATCAACAGAAGCAACTTCCTGTGCTTTTTGGAATAAAATCTTAATTAATTCCATTTGACGTTGTCCACGTTTTAAGTTTGAATCATGATGTCTAGTTCTAGCAACTGc < 2:393439/141‑1 (MQ=255)
ttACCTACAATTTGAATCACGTTATCAAGTTTATCAATAGAATCAACTTCCTGTGCTTTTTGGAATAAAATCTTAATTAATTCCATTTGACGTTGTCCACGTTTTAAGTTTGAATCATGATGTCTAGTTCTAGCAACTGCt > 1:416828/1‑141 (MQ=255)
aCCTACAATTTGAATCACGTTATCAAGTTTATCAATAGAATCAACTTCCTGTGCTTTTTGGAATAAAATCTTAATTAATTCCATTTGACGTTGTCCACGTTTTAAGTTTGAATCATGATGTCTAGTTCTAGCAACTGCTaa < 1:249072/141‑1 (MQ=255)
aCCTACAATTTGAATCACGTTATCAAGTTTATCAATAGAATCAACTTCCTGTGCTTTTTGGAATAAAATCTTAATTAATTCCATTTGACGTTGTCCACGTTTTAAGTTTGAATCATGATGTCTAGTTCTAGCAACTGCTaa < 2:160155/141‑1 (MQ=255)
tGAATCACGTTATCAAGTTTATCAATAGAATCAACTTCCTGTGCGTTTTGGAATAAAATCTTAATTAATTCCATTTGACGTTGTCCACGTTTTAAGTTTGAATCATGATGTCCAGTTCTAGCAACTGCTCAAGCCtcatca > 1:562581/1‑141 (MQ=255)
aaTCACGTTATCAAGTTTATCAATAGAATCAACTTCCTGTGCTTTTTGGAATAAAATCTTAATTAATTCCATTTGACGTTGTCCACGTTTTAAGTTTGAATCATGATGTCTAGTTCTAGCAACTGCTAAAGCCTCATCAcc > 1:834594/1‑141 (MQ=255)
accgcGTTATCAAGTTTATCAATAGAATCAACTTCCTGTGCTTTTTGGAATAAAATCTTAATTAATTCCATTTGACGTTGTCCACGTTTTAAGTTTGAATCATGATGTCTAGTTCTAGCAACTGCTAAAGCCTCATCACCa < 2:562581/137‑1 (MQ=255)
aTCACGTTATCAAGTTTATCAATAGAATCAACTTCCTGTGCTTTTTGGAGTAAAATCTTAATTAATTGCATTCGCCGTTGTACACGTTTTTAGTTTGAATAGTGATGTCTAGTTCTAGTAACTGCTAAGGTTtcatcaacc > 1:446464/1‑138 (MQ=255)
aTCACGTTATCAAGTTTATCAATAGAATCAACTTCCTGTGCTTTTTGGAATAACATCTTAATTAATTCCATTTGACGTTGTCCACGTTTTAAGTTTGAATCATGATGTCTAGTTCTAGCAACTGCTAAGGCCTCATCACCa > 1:981660/1‑141 (MQ=255)
aTCACGTTATCAAGTTTATCAATAGAATCAACTTCCTGTGCTTTTTGGAATAAAATCTTAATTAATTCCATTTGACGTTGTCCACGTTTTAAGTTTGAATCATGATGTCTAGTTCTAGCAACTGCTAAAGCCTCATCACCa > 1:910467/1‑141 (MQ=255)
aTCACGTTATCAAGTTTATCAATAGAATCAACTTCCTGTGCTTTTTGGAATAAAATCTTAATTAATTCCATTTGACGTTGTCCACGTTTTAAGTTTGAATCATGATGTCTAGTTCTAGCAACTGCTAAAGCCTCATCACCa > 2:115840/1‑141 (MQ=255)
aTCACGTTATCAAGTTTATCAATAGAATCAACTTCCTGTGCTTTTTGGAATAAAATCTTAATTAATTCCATTTGACGTTGTCCACGTTTTAAGTTTGAATCATGATGTCTAGTTCTAGCAACTGCTAAAGCCTCATCACCa > 1:956906/1‑141 (MQ=255)
aTCACGTTATCAAGTTTATCAATAGAATCAAAATCCTGTGCTTTTTGGAATAAAATCTTAATTAATTCCATTTGACGTTGTCAACGTTTTAAGTTTGAATCATGATGTCTAGTTCTAGCAACTGCTAAAGCCTCATCACCa > 2:654581/1‑141 (MQ=255)
cACGTTATCAAGTTTATCAATAGAATCAACTTCCTGTGCTTTTTGGAATAAAATCTTAATTAATTCCATTTGACGTTGTCCACGTTTTAAGTTTGAATCATGATGTCTAGTTCTAGCAACTGCTAAAGCCTCATCACCAtt < 2:906169/141‑1 (MQ=255)
aTCAAGTTTATCAATAGAATCAACTTCCTGTGCTTTTTGGAATAAAATCTTAATTAATTCCATTTGACGTTGTCCACGTTTTAAGTTTGAATCATGATGTCTAGTTCTAGCAACTGCTAAAGCCTCATCACCATTTAAttt > 1:621378/1‑141 (MQ=255)
aTCAAGTTTATCAATAGAATCAACTTCCTGTGCTTTTTGGAATAAAATCTTAATTAATTCCATTTGACGTTGTCCACGTTTTAAGTTTGAATCATGATGTCTAGTTCTAGCAACTGCTAAAGCCCCATCACCATTTACttt > 2:663032/1‑141 (MQ=255)
aGTTTATCAATAGAATCAACTTCCTGTGCTTTTTGGAATAAAATCTTAATTAATTCCATTTGACGTTGTCCACGTTTTAAGTTTGAATCATGATGTCTAGTTCTAGCAACTGCTAAAGCCTCATCACCATTTAATTTTTgg < 2:327461/141‑1 (MQ=255)
tATCAATAGAATCAACTTCCTGTGCTTTTTGGAATAAAATCTTAATTAATTCCATTTGACGTTGTCCACGTTTTAAGTTTGAATCATGATGTCTAGTTCTAGCAACTGCTAAAGCCTCATCACCATTTAATTTTTGGTAcc < 1:859605/141‑1 (MQ=255)
tATCAATAGAAGCAACTTCCTGGGCTTTTTGGAATAAAATCTTAATTAATTCCATTTGACGTTGTCCACGTTTTAAGTTTGAATCATGATGTCTAGTTCTAGCAACTGCTAAAGCCTCATCACCATTTAATTTTTGGTAcc < 1:744706/141‑1 (MQ=255)
tCAATAGGATCAACTTCCTGTGCTTTTTGGAATAAAATCTTAATTAATTCCATTTGACGTTGTCCACGTTTTAAGTTTGAATCATGATGTCTAGTTCTAGCAACTGCTAAAGCCTCATCACCATTTAATTTTTGGTACCCt < 2:708568/141‑1 (MQ=255)
tCAATAGAATCAACTTCCTGTGCTTTTTGGAATAAAATCTTAATTAATTCCATTTGACGTTGTCCACGTTTTAAGTTTGAATCATGATGTCTAGTTCTAGCAACTGCTAAAGCCTCATCACCATTTAATTTTTGGTACCCt < 2:877545/141‑1 (MQ=255)
tCAATAGAATCAACTTCCTGTGCTTTTTGGAATAAAATCTTAATTAATTCCATTTGAAGTTGTCCACGTTTTAAGTTTGAATCATGATGTCTAGTTCTAGGAACTGCTAAAGCCTCATCACCATTTTATTTTTGGTACCCt < 2:286816/141‑1 (MQ=255)
tCAATAGAATCAACCTCCTGTGCTTTTTGGAATAAAATCTTAATTAATTCCATTTGACGTTGTCCCCGTATAAAGTCTAATACTTATTTATTAGGTCTAGCAACTTCTGAAGCCTCATCACCATTTCATATTTGGGACCCt < 2:209374/141‑1 (MQ=255)
aGAATCAACTTCCTGTGCTTTTTGGAATAAATTCTTAATTAATTCCATTTGACGTTGTATTTGTTTTATGTTTGAATCATGATGTCTAGTTCTGGCATCTGCTAATGTGTTTTCATATTTTTTTTTTTGGTGCTCtttttt > 2:102130/1‑141 (MQ=255)
aGAATCAACTTCCTGTGCTTTTTGGAATAAAATCTTAATTAATTCCATTTGACGTTGTCCACGTTTTAAGTTTGAATCATGATGTCTAGTTCTAGCAACTGCTAAAGCCTCATCACCATTTAATTTTTGGTACCCtttttt > 2:970085/1‑141 (MQ=255)
aCTTCCTGTGCTTTTTTTTTTTTTTTCTTAATTAATTCCATTTGACGTTGTCCACGTTTTAAGTTTGAATCATGATGTCTAGTTCTAGCAACTGCTAAAGCCTCATCACCATTTATTTTTTGTTACCCTTttttaatttta > 2:755602/1‑141 (MQ=255)
cTTCCTGTGCTTTTTGGAATAAAATCTTAATTAATTCCATTTGACGTTGTCCACGTTTTAAGTTTGAATCATGATGTCTAGGTCTAGCAACTGCTAAAGCCTCATCACCATTTAATTTTTGGTACCCTTttttaattttaa < 1:448527/141‑1 (MQ=255)
ttCCTGTGCTTTTTGGAATAAAATCTTAATTAATTCCATTTGACGTTGTCCACGTTTTAAGTTTGAATCATGATGTCTAGTTCTAGCAACTGCTAAAGCCTCATCACCATTTAATTTTTGGTACCCTTTtttaattttaat > 2:496837/1‑141 (MQ=255)
tCCTGTGCTTTTTGGAATAAAATCTTAATTAATTCCATTTGACGTTGTCCACGTTTTAAGTTTGAATCATGATGTCTAGTTCTAGCAACTGCTAAAGCCTCATCACCATTTAATTTTTGGTACCCTTTTTTAATTTTAATc > 1:781947/1‑141 (MQ=255)
ccTGTGCTTTTTGGAATAAAATCTTAATTAATTCCATTTGACGTTGTCCACGTTTTAAGTTTGAATCATGATGTCTAGTTCTAGCAACTGCTAAAGCCTCATCACCATTTAATTTTTGGTACCCTTTTTTAATTTTAATCt > 1:619788/1‑141 (MQ=255)
cTGTGCTTTTTGGAATAAACTCTTAAGTAATTCCATTTGACGTTGTCCACTTTTTAAGTTTGAATCATGATGTCTAGTTCTAGCAACTGCTAATGCCTCCTCACCATTTATTTTTTGGTACCCTTTTTTTATTTTAATCtt < 2:160167/141‑1 (MQ=255)
cTGTGCTTTTTGGAATAAAATCTTCATTAATTCCATTTGACGTTGTCCACGTTTTAAGTTTGAATCATGATGTCTAGTTCTAGCAACTGCTAAAGCCTCATCACCATTTAATTTTTGGTACCCTTTTTTAATTTTAATCtt < 2:160151/141‑1 (MQ=255)
gtgCTTTTTGGAATAAAATCTTAATTAATTCCATTTGACGTTGTCCACGTTTTAGGTTTGAATCATGATGTCTAGTTCTAGCAACTGCTAAAGCCTCATCACCATTTAATTTTTGGTACCCTtttttatttttatttttat > 2:589331/1‑140 (MQ=255)
cTTTTTGGACTAAAATCTTAATTAATTCCATTTGACGTTGTCCACGTTTTAAGTTTGAATCATGATGTCTAGTTCTAGCAACTGCTAAAGCCTCATCACCATTTAATTTTTGGTACCCTTTTTTAATTTTAATCTTACCAg < 2:690388/141‑1 (MQ=255)
cTTTTTGGAATAAAATCTTAATTAATTCCATTTGACGTTGTCCACGTTTTAAGTTTGAATCATGATGTCTAGTTCTAGCAACTGCTAAAGCCTCATCACCATTTAATTTTTGGTACCCTTTTTTAATTTTAATCTTACCAg < 2:233886/141‑1 (MQ=255)
tttttGGAATAAAATCTTAATTAATTCCATTTGACGTTGTCCACGTTTTAAGTTTGAATCATGATGTCTAGTTCTAGCAACTGCTAAAGCCTCATCACCATTTAATTTTTGGTACCCTTTTTTAATTTTACTCTTACCTGt < 2:834594/141‑1 (MQ=255)
tttttGGAATAAAATCTTAATTAATTCCATTTGACGTTGTCCACGTTTTAAGTTTGAATCATGATGTCTAGTTCTAGCAACTGCTAAAGCCTCATCACCATTTAATTTTTGGTACCCTTTTTTAATTTTAATCTTACCAGt < 1:38854/141‑1 (MQ=255)
tttGGAATAAAATCTTAATTAATTCCATTTGACGTTGTCCACGTTTTAAGTTTGAATCATGATGTCTAGTTCTAGCAACTGCTAAAGCCTCATCACCATTTAATTTTTGGTACCCTTTTTTAATTTTAATCTTACCAGTat < 1:878864/141‑1 (MQ=255)
ggAATAAAATCTTAATTAATTCCATTTGACGTTGTCCACGTTTTAAGTTTGAATCATGATGTCTAGTTCTAGCAACTGCTAAAGCCCCATCACCATTTAATTTTTGGTACCCTTTTTTAATTTTAATCTTACCAGTctcat > 2:586003/1‑141 (MQ=255)
aaTAAAATCTTAATTAATTCCATTTGACGTTGTCCACGTTTTAAGTTTGAATCATGATGTCTAGTTCTAGCAACTGCTAAAGCCTCATCACCATTTAATTTTTGGTACCCTTTTTTAATTTTAATCTTACCAGTATCATCt > 2:905498/1‑141 (MQ=255)
aaTAAAATCTTAATTAATTCCATTTGACGTTGTCCACGTTTTAAGTTTGAATCATGATGTCTAGTTCTAGCAACTGCTAAAGCCTCATCACCATTTAATTTTTGGTACCCTTTTTTAATTTTAATCTTACCAGTATCATCt < 1:613080/141‑1 (MQ=255)
aaTAAAATCTTAATAAATTCCATTTGACGTTGTCCACGTTTTAAGTTTGAATCATGATGTCTAGTTCTAGCAACTGCTAAAGCCTCATCACCATTTAATTTTTGGTACCCTTTTTTAATTTTAATCTTACTAGTTTCATCt > 2:673805/1‑141 (MQ=255)
tAAAATCTTAATTAATTCCATTTGACGTTGTCCACGTTTTAAGTTTGAATCATGATGTCTAGTTCTAGCAACTGCTAAAGCCTCATCACCATTTAATTTTTGGTACCCTTTTTTAATTTTAATCTTACCAGTATCATCtgt < 1:990686/141‑1 (MQ=255)
tAAAATCTTAATTAATTCCATTTGACGTTGTCCACGTTTTAAGTTTGAATCATGATGTCTAGTTCTAGCAACTGCTAAAGCCTCATCACCATTTAATTTTTGGTACCCTTTTTTAATTTTAATCTTACCAGTATCATCtgt < 1:446231/141‑1 (MQ=255)
tAAAATCTTAATTAATTCCATTTGACGTTGCCCACGTTTTAAGTTTGAATCATGATGTCTAGTTCTAGCAACTGCTAAAGCCTCATCACCATTTAATTTTTGGTACCCTTTTTTAATTTTAATCTTACCAGTATCATCtgt < 1:263802/141‑1 (MQ=255)
tAAAACTTTAATTAATTCCATGTGACGTTGTCCACGGGTTATGTTTGAAGCATGATGTCTAGTACTAGCAACTGCTAAAGCCTCACCACCATTTAATTTTTGGTACCCTTTTTTAATTTTAATCTTACCAGTATCATCtgt < 1:622961/141‑1 (MQ=255)
ttaattCCATTTGACGTTGTCCACGTTTTAAGTTTGAATCATGATGTCTAGTTCTAGCAACTGCTAAAGCCTCATCACCATTTAATTTTTGGTACCCTTTTTTAATTTTAATCTTACCAGTATCATCTGTGTTAGGTTCAt < 2:18043/141‑1 (MQ=255)
ttaattCCATTTGACGTTGTCCACGTTTTAAGTTTGAATCATGATGTCTAGTTCTAGCAACTGCTAAAGCCTCATCACCATTTAATTTTTGGTACCCTTTTTTAATTTTAATCTTACCAGTATCATCTGTGTTAGGTTCAt < 2:292036/141‑1 (MQ=255)
attCCATTTGACGTTGTCCACGTTTTAAGTTTGAATCATGATGTCTAGTTCTAGCAACTGCTAAAGCCTCATCACCATTTAATTTTTGGTACCCTTTTTTAATTTTAATCTTACCAGTATCATCTGTGTTAGGTTCATTTa < 2:981660/141‑1 (MQ=255)
aTTTGACGTTGTCCACGTTTTAAGTTTGAATCATGATGTCTAGTTCTAGCAACTGCTAAAGCCTCATCACCATTTAATTTTTGGTACCCTTTTTTAATTTTAATCTTACCGGTATCATCTGTGTTAGGTTCATTTAAGTCg > 1:766007/1‑141 (MQ=255)
aTTTGACGTTGTCCACGTTTTAAGTTTGAATCATGATGTCTAGTTCTAGCAACTGCTAAAGCCTCATCACCATTTAATTTTTGGTACCCTTTTTTAATTTTAATCTTACCAGTATCATCTTTGTTAGGTGCTTTTagttct > 1:441818/1‑136 (MQ=255)
tGACGTTGTCCACGTGGTAAGTTTGAATCATGATGTCTAGTTCTAGCAACAGCTTAAGCCTCATCACCATGTAATCTGTGGTACCCTTTTTTAATTTTAATCTTACCAGTATCATCTGTGTTAGGTTCATTTAAGTCGTAt > 1:197011/1‑141 (MQ=255)
gACGTTGTCCACTTTTTAAGTTTGAATCATGATGTCTAGTTCTAGCAACTGCTAAAGCCTCATCACCATTTAATTTTTGGTACCCTTTTTTAATTTTAATCTTACCAGTATCATCTGTGTTAGGTTCATTTAAGTCGTATg < 2:558768/141‑1 (MQ=255)
gACGTTGTCCACGTTTTAAGTTTGAATCATGATGTCTAGTTCTAGCAACTGCTAAAGCCTCATCACCATTTAATTTTTGGTACCCTTTTTTAATTTTAATCTTACCAGTATCATCTGTGTTAGGTTCATTTAAGTCGTATg < 2:188183/141‑1 (MQ=255)
ccACGTTTTAAGTTTGAATCATGATGTCTAGTTCTAGCAACTGCTAAAGCCTCATCACCATTTAATTTTTGGTACCCTTTTTTAATTTTAATCTTACCAGTATCATCTGTGTTAGGTTCATTTAAGTCGTATGGCAcatca > 2:985064/1‑141 (MQ=255)
cACGTTTTAAGTTTGAATCATGATGTCTAGTTCTAGCAACTGCTAAAGCCTCATCACCATTTAATTTTTGGTACCCTTTTTTAATTTTAATCTTACCAGTATCATCTGAGTTAGGTTCATTTAAGTCGTATGGcacacaca > 2:765494/1‑137 (MQ=255)
tAAGTTTGAATCATGATGTCTAGTTCTAGCAACTGCTAAAGCCTCATCACCATTTAATTTTTGGTACCCTTTTTTAATTTTAATCTTACCAGTATCATCTGTGTTAGGTTCATTTAAGTCGTATGGCACATCATAGTatat < 1:613034/141‑1 (MQ=255)
tAAGTTTGAATCATGATGTCTAGTTCTAGCAACTGCTAAAGCCTCATCACCATTTAATTTTTGGTACCCTTTTTTAATTTTAATCTTACCAGTATCATCTGTGTTAGGTTCATTTAAGTCGTATGGCACATCATAGTatat < 1:114841/141‑1 (MQ=255)
aGTTTGAATCATGATGTCTAGTTCGAGCAACTGCTAAAGCCTCATCACCATTTAATTTTTGGTACCCTTTTTTAATTTTAATCTTACCAGTATCATCTGTGTTAGGTTCATTTAAGTCGTATGGCACATCATAGTATATGc < 1:403790/141‑1 (MQ=255)
|
CAGAGTTAGTTAAATTATGCTTTGCATTTTTACCTACAATTTGAATCACGTTATCAAGTTTATCAATAGAATCAACTTCCTGTGCTTTTTGGAATAAAATCTTAATTAATTCCATTTGACGTTGTCCACGTTTTAAGTCTGAATCATGATGTCTAGTTCTAGCAACTGCTAAAGCCTCATCACCATTTAATTTTTGGTACCCTTTTTTAATTTTAATCTTACCAGTATCATCTGTGTTAGGTTCATTTAAGTCGTATGGCACATCATAGTATATGC > CP000730/1063711‑1063986
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
GATK/CNVnator alignment
N/A
