Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate | Predicted Mutations | Mean Coverage | Total Reads | Percent Mapped | Mapped Reads | Average Read Length |
|---|---|---|---|---|---|---|
| A11 F42 I1 R1 | 9 | 71.3 | 1690596 | 89.4% | 1511392 | 136.4 |
Breseq alignment
| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| RA | CP000730 | 849,783 | (A)6→7 | coding (909/912 nt) coding (1/996 nt) |
yvcJ → yvcK → |
ATP‑binding protein hypothetical protein |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | CP000730 | 849,777 | 1 | . | A | 92.0% | 245.2 / 14.5 | 76 | coding (903/912 nt) | yvcJ | ATP‑binding protein |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base . (2/4); new base A (28/41); total (31/45) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
CAATTAGTAATTGCCATCGGTTGTACGGGTGGACAACATCGATCTGTAGCATTAGCAGAACGACTAGGTAATTATCTAAATGAAGTATTTGAATATAATGTTTATGTGCATCATAGGGACGCACATATTGAAAGTGG‑C‑GA‑G‑AAAA‑A‑ATGAGACAAATAAAAGTTGTACTTATCGGTGGTGGCACTGGCTTATCAGTTATGGCTAGGGGATTAAGAGAATTCCCAATTGATATTACGGCGATTGTAACAGTTGCTGATAATGGTGGGAGTACAGGGA > CP000730/849637‑849912 | cAATTAGTAATTGCCATCGGTTGTACGGGTGGACAACATCGATCTGTAGCATTAGCAGAACGACTAGGTAATTATCTAAATGAAGTATTTGAATATAATGTTTATGTGCATCATAGGGACGCACATATTGAAAGTGG‑C‑ga‑g < 2:51999/141‑1 (MQ=255)cAATTAGTAATTGCCATCGGTTGTACGGGTGGACAACATCGATCTGTAGCATTAGCAGAACGACTAGGTAATTATCTAAATGAAGTATTTGAATATAATGTTTATGTGCATCATAGGGACACACATATTGAAAGTGG‑C‑ga‑g > 2:508575/1‑141 (MQ=255) tactAATTGCCATCGGTTGTACGGGTGGACAACATCTATCTGCAGCATTAGCAGAACGACTAGGTAATTATCTAAATGAAGTATTTGAATATTATGTTTATATGCCACATACGGGCGCACATTTTTAAAGTTG‑C‑GA‑G‑aaaa > 1:47865/4‑141 (MQ=255) gTAATTGCCATCGGTTGTACGGGTGGACAACATCGATCTGTAGCATTAGCAGAACGACTAGGTAATTATCTAAATGAAGTATTTGAATATAATGTTTATGTGCATCATAGGGACGCACATATTGAAAGTGG‑C‑GA‑G‑aaaa‑a‑a > 1:556299/1‑141 (MQ=255) aaTTGCCATCGGTTGTACGGGTGGACAACATCGATCTGTAGCATTAGCAGAACGACTAGGTAATTATCTAAATGAAGTATTTGAATATAATGTTTATGTGCATCATAGGGACGCACATATTGAAAGTGG‑C‑GA‑G‑aaaa‑a‑aat > 1:274538/1‑139 (MQ=255) ttGCCATCGGTTGTACGGGTGGACAACATCGATCTGTAGCATTAGCAGAACGACTAGGTAATTATCTAAATGAAGTATTTGAATATAATGTTTATGTGCATCATAGGGACGCACATATTGAAAGTGG‑C‑GA‑G‑aaaa‑a‑aatga > 2:646314/1‑137 (MQ=255) ccATCGGTTGTACGGGTGGACAACATCGATCTGTAGCATTAGCAGAGCGACTAGGTAATTATCTAAATGAAGTATTTGAATATAATGTTTATGTGCATCATAGGGACGCACATATTGAAAGTGG‑C‑GA‑GAAAAA‑A‑ATGAGAc > 2:605596/1‑141 (MQ=255) aTCGGTTGTACGGGTGGACAACATCGATCTGTAGCATTAGCAGAACGACTAGGTAATTATCTAAATGAAGTATTTGAATATAATGTTTATGTGCATCATAGGGACGCACATATTGAAAGTGG‑C‑GA‑GAAAAA‑A‑ATGAGACaa < 2:150603/141‑1 (MQ=255) tCGGTTGTACGGGTGGACAACATCGATCTGTAGCATTAGCAGAACGACTAGGTAATTATCTAGATGAAGTATTTGAATATAATGTTTATGTGCATCATAGGGACGCACATATTGAAAGTGG‑C‑GA‑GAAAAA‑A‑ATGAGACaaa < 2:313153/141‑1 (MQ=255) ggTTGTACGGGTGGACAACATCGATCTGTAGCATTAGCAGAACGACTAGGTAATTATCTAAATGAAGTATTTGAATATAATGTTTATGTGCATCATAGGGACGCACATATTGAAAGTGG‑C‑GA‑GAAAAA‑A‑ATGAGACAAATa < 1:645546/141‑1 (MQ=255) ttGTACGGGTGGACAACATCGATCTGTAGCATTAGCAGAACGACTAGGTAATTATCTAAATGAAGTATTTGAATATAATGTTTATGTGCATCATAGGGACGCACATATTGAAAGTGG‑C‑GA‑GAAAAA‑A‑ATGAGACAAATaaa > 1:688360/1‑141 (MQ=255) gTACGGGTGGACAACATCGATCTGTAGCATTAGCAGAACGACTAGGTAATTATCTAAATGAAGTATTTGAATATAATGTTTATGTGCATCATAGGGACGCACATATTGAAAGTGG‑C‑GA‑GAAAAA‑A‑ATGAGACAAATAAAAg > 2:781662/1‑141 (MQ=255) gTACGGGAGGAAAAAATAGATGTGTAGAATTAGCAGAATGAGTAGGTAATTATCTAAATGAAGTATTTGAATATAATGTTTATGTGCATCATAGGGACGCACATATTGAAAAAAAAA‑AA‑A‑AAAA‑A‑ATGAGACAAATAAAAg < 2:394466/141‑1 (MQ=255) tACGGGTGGACAACATCGATCTGTAGCATTAGCAGAACGACTAGGTAATTATCTAAATGAAGTATTTGAATATAATGTTTATGTGCATCATAGGGACGCACATATTGAAAGTGG‑C‑GA‑GAAAAA‑A‑ATGAGACAAATAAAAGt > 1:368088/1‑141 (MQ=255) aaaggTGAACAAGATAGATCAGTATCATTAGGATAACGAATAAGTAATTATCTAAATGAAGTATTTGAATATAATGTTTATGTGCATCATAGGGACGCACATATTGAAAAAAA‑AAAA‑A‑AAAA‑A‑ATGAGACAAATAAAAGtt < 2:591163/138‑1 (MQ=255) aCGGGTGGACAACATCGATCTGTAGCATTAGCAGAACGACTAGGTAATTATCTAAATGAAGTATTTGAATATAATGTTTATGTGCATCATAGGGACGCACATATTGAAAGTGG‑C‑GA‑GAAAAA‑A‑ATGAGACAAATAAAAGtt < 1:736996/141‑1 (MQ=255) cGGGTGGACAACATCGATCTGTAGCATTAGCAGAACGACTAGGTAATTATCTAAATGAAGTATTTGAATATAATGTTTATGTGCATCATAGGGACGCACATATTGAAAGTGG‑C‑GA‑GAAAAA‑A‑ATGAGACAAATAAAAGTTg < 2:687865/141‑1 (MQ=255) cGGGTGGACAACATCGATCTGTAGCACTAGCAGAACGACGAGGTAGTTATCTAAATGAAGTAGTTGAATATAATGTTTATGTGCATCATAGGGACGCACATATTGCAAGTGG‑C‑GA‑GCAAAA‑A‑ATGAGACAAATAAAAGTTg > 2:506621/1‑141 (MQ=255) ggTGGGCAACATCGATCTGTAGCATTAGCAGATCGTCGAGGTGATTATCTAAATGAAGTATTTGAATATAATGTTTATGTGCATCATAGGGACGCACATATTGAAAGTGG‑C‑GA‑G‑AAAA‑AGATGAGTCAAATAAAAGTTGTa < 2:604754/141‑1 (MQ=255) gTGGACAACATCGATCTGTAGCATTAGCAGAACGACTAGGTAATTATCTAAATGAAGTATTTGAATATAATGTTTATGTGCATCATAGGGACGCACATATTGAAAGTGG‑C‑GA‑GAAAAA‑A‑ATGAGACAAATAAAAGTTGTAc < 1:653029/141‑1 (MQ=255) gACCACATCGATCTGTAGCATTAGCAGCACGACTAGGTAATTATCTAAATGAAGTCATTGAATATCATGTTTATGTGCATCATAGGGACGCACATATTGAAAGTGG‑C‑GAGG‑AAAA‑A‑ATGAGACAAATAAAAGTTGTACTTa > 2:841792/1‑141 (MQ=255) gACAACATCGATCTGTAGCATTAGCAGAACGACTAGGTAATTATCTAAATGAAGTAGTTGAATATAATGTTTATGTGCATCATAGGGACGCACATATTGAAAGTGG‑C‑GA‑GAAAAA‑A‑ATGAGACAAATAAAAGTTGTACTTa > 2:334764/1‑141 (MQ=255) caacaTCGATCTGTAGCATTAGCAGAACGACTAGGTAATTATCTAAATGAAGTATTTGAATATAATGTTTATGTGCATCATAGGGACGCACATATTGAAAGTGG‑C‑GA‑GAAAAA‑A‑ATGAGACAAATAAAAGTTGTACTTATc > 1:843828/1‑141 (MQ=255) aTCGATCTGTAGCATTAGCAGAACGACTAGGTAATTATCTAAATGAAGTATTTGAATATAATGTTTATGTGCATCATAGGGACGCACATATTGAAAGTGG‑C‑GA‑GAAAAA‑A‑ATGAGACAAATAAAAGTTGTACTTATCggtg > 1:157319/1‑141 (MQ=255) aTCGATCTGTAGCATTAGCAGAACGACTAGGTAATTATCTAAATGAAGTATTTGAATATAATGTTTATGTGCATCATAGGGACGCACATATTGAAAGTGG‑C‑GA‑GAAAAA‑A‑ATGAGACAAATAAAAGTTGTACTTATCggtg > 1:174228/1‑141 (MQ=255) cGATCTGTAGCATTAGCAGAACGACTAGGTAATTATCTAAATGAAGTATTTGAATATAATGTTTATGTGCATCATAGGGACGCACATATTGAAAGTGG‑C‑GA‑GAAAAA‑A‑ATGAGACAAATAAAAGTTGTACTTATCggtggt < 1:195954/141‑1 (MQ=255) gATCTGTAGCATTAGCAGAACGACTAGGTAATTATCTAAATGAAGTATTTGAATATAATGTTTATGTGCATCATAGGGACGCACATATTGAAAGTGG‑C‑GA‑GAAAAA‑A‑ATGAGACAAATAAAAGTTGTACTTATCGgtggtg > 1:695967/1‑141 (MQ=255) gATCTGTAGCATTAGCAGAACGACTAGGTAATTATCTAAATGAAGTATTTGAATATAATGTTTATGTGCATCATAGGGACGCACATATTGAAAGTGG‑C‑GA‑GAAAAA‑A‑ATGAGACAAATAAAAGTTGTACTTATCGgtggtg > 1:467326/1‑141 (MQ=255) tGTAGCATTAGCAGAACAACAAGGTAATTATCTAAATGAAGTATTTGAATATAATGTTTATGTGCATCATAGGGACGCACATATTGAAAGTGG‑C‑GA‑GAAAAA‑A‑ATGAGACAAATAAAAGTTGTACTTATCGGTGGTGGCAc < 1:7227/141‑1 (MQ=255) 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(MQ=255) cAGAACGACTAGGTAATTATCTAAATGAAGTATTTGAATATAATGTTTATGTGCATCATAGGGACGCACATATTGAAAGTGG‑C‑GA‑GAAAAA‑A‑ATGAGACAAATAAAAGTTg < 1:778769/111‑1 (MQ=255) aCTAGGTAATTATCTAAATGAAGTATATGAATATAATGTTTATGTGCATCATAGGGACGCACATATTGAAAGTGG‑C‑GA‑GAAAAA‑A‑ATGAGACAAATAAAAGTTGTACTTATCGGTGGTGGCACTGGCTTATCAGTTATGGc < 2:474263/141‑1 (MQ=255) cTAGGTAATTATCTAAATGAAGTATTTGAATATAATGTTTATGTGCATCATAGGGACGCACATATTGAAAGTGG‑C‑GA‑GAAAAA‑A‑ATGAGACAAATAAAAGTTGTACTTATCGGTGGTGGCACTGGCTTATCAGTTATGGCt > 1:595879/1‑141 (MQ=255) agttAATTAGCTAAATGAAGTATTTGAATATAATGTTTATGTGCATCATAGGGACGCACATATTGAAAGTGG‑C‑GA‑GAAAAA‑A‑ATGAGACAAATAAAAGTTGTACTTATCGGTGGTGGCACTGGCTTATCAGTTATGGCTAg < 1:513442/138‑1 (MQ=255) ggTAATTATCTAAATGAAGTATTTGAATATAATGTTTATGTGCATCATAGGGACGCACATATTGAAAGTGG‑C‑GA‑GAAAAA‑A‑ATGAGACAAATAAAAGTTGTACTTATCGGTGGTGGCACTGGCTTATCAGTTATGGCTAgg < 1:74453/141‑1 (MQ=255) gTAATTATCTAAATGAAGTATTTGAATATAATGTTTATGTGCATCATAGGGACGCACATATTGAAAGTGG‑C‑GA‑GAAAAA‑A‑ATGAGACAAATAAAAGTTGTACTTATCGGTGGTGGCACTGGCTTATCAGTTATGGCTAggg > 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aTCTAAATGAAGTATTTGAATATAATGTTTATGTGCATCATAGGGACGCACATATTGAAAGTGG‑C‑GA‑GAAAAA‑A‑ATGAGACAAATAAAAGTTGTACTTATCGGTGGTGGCACTGGCTTATCAGTTATGGCTAGGGGATTaa < 2:174228/141‑1 (MQ=255) tCTAAATGAAGTATTTGAATATAATGTTTATGTGCATCATTGGGACGCACATATTGAAAGTGG‑C‑GA‑GAAAAA‑A‑ATGAGACAAATAAAAGTTGTACTTATCGGTGGTGGCACTGGCTTATCAGTTATGGCTAGGGGATTAag < 1:526922/141‑1 (MQ=255) aaaTGAAGTATTTGAATATAATGTTTATGTGCATCATAGGGACGCACATATTGAAAGTGG‑C‑GA‑GAAAAA‑A‑ATGAGACAAATAAAAGTTGTACTTATCGGTGGTGGCACTGGCTTATCAGTTATGGCTAGGGGATTAAgaga < 1:128175/141‑1 (MQ=255) aaTGAAGTATTTGAATATAATGTTTATGTGCATCATAGGGACGCACATATTGAAAGTGG‑C‑GA‑GAAAAA‑A‑ATGAGACAAATAAAAGTTGTACTTATCGGTGGTGGCACTGGCTTATCAGTTATGGCTAGGGGATTAAGAGaa < 1:488302/141‑1 (MQ=255) aGTATTTGAATATAATGTTTATGTGCATCATAGGGACGCACATATTGAAAGTGG‑C‑GA‑GAAAAA‑A‑ATGAGACATATAAAAGTTGTACTTATCGGTGGTGGCACTGGCTTATCAGTTATGGc > 1:121915/1‑120 (MQ=255) aGTATTTGAATATAATGTTTATGTGCATCATAGGGACGCACATATTGAAAGTGG‑C‑GA‑GAAAAA‑A‑ATGAGACATATAAAAGTTGTACTTATCGGTGGTGGCACTGGCTTATCAGTTATGGc < 2:121915/120‑1 (MQ=255) aGTATTTGAATATAATGTTTATGTGCATCATAGGGACGCACATATTGAAAGTGG‑C‑GA‑GAAAAA‑A‑ATGAGACAAATAAAAGTTGTACTTATCGGTGGTGGCACTGGCTTATCAGTTATGGCTAGGGGATTAAGAGAATTccc > 2:604724/1‑141 (MQ=255) tATTTGAATATAATGTTTATGTGCATCATAGGGACGAACATATTGAAAGTGG‑C‑GA‑GAAAAA‑A‑ATGAGACAAATAAAAGTTGTACTTATCGGTGGTGGCACTGGCTTATCAGTTATGGCTAGGGGATTAAGAGAATTCCCaa < 2:741441/141‑1 (MQ=255) aTTTGAATATAATGTTTATGTGCATCATAGGGACGCACATATTGAAAGTGG‑C‑GA‑GAAAAA‑A‑ATGAGACAAATAAAAGTTGTACTTATCGGTGGTGGCACTGGCTTATCAGTTa > 1:839857/1‑113 (MQ=255) aTTTGAATATAATGTTTATGTGCATCATAGGGACGCACATATTGAAAGTGG‑C‑GA‑GAAAAA‑A‑ATGAGACAAATAAAAGTTGTACTTATCGGTGGTGGCACTGGCTTATCAGTTa < 2:839857/113‑1 (MQ=255) tttGAATATAATGTTTATGTGCTTCTTAGGGACGAACATATTGAAAGTGG‑C‑GATA‑AAAA‑A‑ATGAGACAAATAAAAGTTGTACTTATCGGTGGTGGCACTGGCTTATCAGTTATGGCTAGGGGATTAAGAGAATTCCCAAtt < 1:328873/141‑1 (MQ=255) ttGAATATAATGTTTATGTGCATCATAGGGACGCACATATTGAAAGTGG‑C‑GA‑GAAAAA‑A‑ATGAGACAAATAAAAGTTGTACTTATCGGTGGTGGCACTGGCTTATCAGTTATGGCTAGGGGATTAAGAGAATTCCCAATTg > 2:216837/1‑141 (MQ=255) 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atAGGGACGCACATATTGAAAGTGG‑C‑GA‑GAAAAA‑A‑ATGAGACAAATAAAAGTTGTACTTATCGGTGGTGGCACTGGCTTATCAGTTATGGCTAGGGGATTAAGAGAATTCCCAATTGATATTACGGCGATTGTAACAGTTg < 1:205985/141‑1 (MQ=255) gggACGCAGATATTGAAAGGGG‑C‑GA‑GAAAAA‑A‑ATGAGACAAATAAAAGTTGTACTTATCGGTGGTGGCACTGGCTTATCAGTTATGGCTAGGGGATTAAGAGAATTCCCAATTGATATTACGGCGATTGTAACAGTTGCTg < 2:537332/141‑1 (MQ=255) gggACGCACATATTGAAAGTGG‑C‑GA‑GAAAAA‑A‑ATGAGACAAATAAAAGTTGTACTTATCGGTGGTGGCACTGGCTTATCAGTTATGGCTAGGGGATTAAGAGAATTCCCAATTGATATTACGGCGATTGTAACAGTTGCTg < 1:334764/141‑1 (MQ=255) gggACGCACATATTGAAAGTGG‑C‑GA‑GAAAAA‑A‑ATGAGACAAATAAAAGTTGTACTTATCGGTGGTGGCACTGGCTTATCAGTTATGGCTAGGGGATTAAGAGAATTCCCAATTGATATTACGGCGATTGTAACAGTTGCTg < 1:305011/141‑1 (MQ=255) gACGCACATATTGAAAGTGG‑C‑GA‑GAAAAA‑A‑ATGAGACAAATAAAAGTTGTACTTATCGGTGGTGGCACTGGCTTATCAGTTATGGCTAGGGGATTAAGAGAATTCCCAATTGATATTACGGCGATTGTAACAGTTGCTGAt < 1:260389/141‑1 (MQ=255) aCGCACATATTGAAAGTGG‑C‑GA‑GAAAAA‑A‑ATGAGACAAATAAAAGTTGTACTTATCGGTGGTGGCACTGGCTTATCAGTTATGGCTAGGGGATTAAGAGAATTCCCAATTGATATTACGGCGATTGTa < 1:482181/128‑1 (MQ=255) aCGCACATATTGAAAGTGG‑C‑GA‑GAAAAA‑A‑ATGAGACAAATAAAAGTTGTACTTATCGGTGGTGGCACTGGCTTATCAGTTATGGCTAGGGGATTAAGAGAATTCCCAATTGATATTACGGCGATTGTa > 2:482181/1‑128 (MQ=255) aCGCACATATTGAAAGTGG‑C‑GA‑GAAAAA‑A‑ATGAGACAAATAAAAGTTGTACTTATCGGTGGTGGCACTGGCTTATCAGTTATGGCTAGGGGATTAAGAGAATTCCCAATTGATATTACGGCGATTGTAACAGTTGCTGATa > 1:540843/1‑141 (MQ=255) atTGAAAGTGG‑C‑GA‑GAAAAA‑A‑ATGAGACAAATAAAAGTTGTACTTATCGGTGGTGGCACTGGCTTATCAGTTATGGCTAGGGGATTAAGAGAATTCCCAATTGATATTACGGCGATTGTAACAGTTGCTGATAATGGTggg < 1:586656/141‑1 (MQ=255) atTGAAAGTGG‑C‑GA‑GAAAAA‑A‑ATGAGACAAATAAAAGTTGTACTTATCGGTGGTGGCACTGGCTTATCAGTTATGGCTAGGGGATTAAGAGAATTCCCAATTGATATTACGGCGATTGTAACAGTTGCTGATAATGGTggg < 1:489113/141‑1 (MQ=255) aaGTGG‑C‑GA‑GAAAAA‑A‑ATGAGACAAATAAAAGTTGTACTTATCGGTGGTGGCACTGGCTTATCAGTTATGGCTAGGGGATTAAGAGAATTCCCAATTGATATTACGGCGATTGTAACAGTTGCTGATAATGGTGGGAGTAc > 2:498074/1‑141 (MQ=255) aGTGG‑C‑GA‑GAAAAA‑A‑ATGAGACAAATAAAAGTTGTACTTATCGGTGGTGGCACTGGCTTATCAGTTATGGCTAGGGGATTAAAATAATTCCCAATTGATATTACGGCGATTGTAACAGTTGCTGATAATGGTGGGAGTACa > 1:818268/1‑141 (MQ=255) tggg‑C‑GA‑GAAAAA‑A‑ATGAGACAAATAAAAGTTGTACTTATCGGTGGGGGCACTGGCTTATCAGTTATGGCTAGGGGATTAAGAGAATTCCCAATTGTTATTACGGCGATTGTAACAGTTGCTGATAATGGTGGGAGTACAg < 2:47865/139‑1 (MQ=255) gTGG‑C‑GA‑GAAAAA‑A‑ATGAGACAAATAAAAGTTGTACTTATCGGTGGTGGCACTGGCTTATCAGTTATGGCTAGGGGATTAAGAGAATTCCCAATTGATATTACGGCGATTGTAACAGTTGCTGATAATGGTGGGAGTACAg > 2:87589/1‑141 (MQ=255) tGG‑C‑GA‑GAAAAA‑A‑ATGAGACAAATAAAAGTTGTACTTATCGGTGGTGGCACTGGCTTATCAGTTATGGCTAGGGGATTAAGAGAATTCCCAATTGATATTACGGCGATTGTAACAGTTGCTGATAATGGTGGGAGTACAgg < 2:744069/141‑1 (MQ=255) gg‑C‑GA‑GAAAAA‑A‑ATGAGACAAATAAAAGTTGTACTTATCGGTGGTGGCACTGGCTTATCAGTTATGGCTAGGGGATTAAGAGAATTCCCAATTGATATTACGGCGATTGTAACAGTTGCTGATAATGGTGGGAGTACAggg > 1:702816/1‑141 (MQ=255) gg‑C‑GA‑GAAAAA‑A‑ATGAGACAAATAAAAGTTGTACTTATCGGTGGTGGCACTGGCTTATCAGTTATGGCTAGGGGATTAAGAGAATTCCCAATTGATATTACGGCGATTGTAACAGTTGCTGATAATGGTGGGAGTACAggg < 1:135419/141‑1 (MQ=255) gg‑C‑GA‑GAAAAA‑A‑ATGAGACAAATAAAAGTTGTACTTATCGGTGGTGGCACTGGCTTATCAGTTATGGCTAGGGGATTAAGAGAATTCCCAATTGATATTACGGCGATTGTAACAGTTGCTGATAATGGTGGGAGTACAggg < 2:4323/141‑1 (MQ=255) g‑C‑GA‑GAAAAA‑A‑ATGAGACAAATAAAAGTTGTACTTATCGGTGGTGGCACTGGCTTATCAGTTATGGCTAGGGGATTAAGAGAATTCCCAATTGATATTACGGCGATTGTAACAGTTGCTGATAATGGTGGGAGTACAGGGa < 1:508575/141‑1 (MQ=255) | CAATTAGTAATTGCCATCGGTTGTACGGGTGGACAACATCGATCTGTAGCATTAGCAGAACGACTAGGTAATTATCTAAATGAAGTATTTGAATATAATGTTTATGTGCATCATAGGGACGCACATATTGAAAGTGG‑C‑GA‑G‑AAAA‑A‑ATGAGACAAATAAAAGTTGTACTTATCGGTGGTGGCACTGGCTTATCAGTTATGGCTAGGGGATTAAGAGAATTCCCAATTGATATTACGGCGATTGTAACAGTTGCTGATAATGGTGGGAGTACAGGGA > CP000730/849637‑849912 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |