Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A18 F70 I0 R1
|
504 |
105.3 |
3845710 |
98.0% |
3768795 |
140.7 |
Breseq alignment
BRESEQ :: Evidence
|
| evidence |
seq id |
position |
mutation |
freq |
annotation |
gene |
description |
| RA |
NC_000913 |
3,703,252 |
T→G |
5.1% |
L199L (CTA→CTC) |
dppD ← |
dipeptide/heme ABC transporter ATPas |
|
| |
seq id |
position |
ref |
new |
freq |
score (cons/poly) |
reads |
annotation |
genes |
product |
| * | NC_000913 | 3,703,252 | 0 | T | G | 5.1%
| 345.3
/ 10.0
| 98 | L199L (CTA→CTC) | dppD | dipeptide/heme ABC transporter ATPas |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (44/49); new base G (3/2); total (47/51) |
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 6.69e-01 |
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 7.01e-01 |
ACGGGTGACGCGGCGCATGGAAGATGGCGTGCGCATCACCGGTTTCCACCACCTGGCCTGCATACATCACGATGATTTTATGTGCCGCTTCCGCCACCAGCGCCAGGTCATGGGTAATTAACACCAGCGCCATGTTCTCTTTCTGCTGTAGCTCCAGCAGTAGTTCGATGATTTGCGCCTGAATGGTCACGTCCAGCGCGGTGGTCGGTTCATCGGCAATCAGCAGTTTTGGCCGACAGGCAATCGCCATGGCGATCATCACGCGCTGGCTCATGCCGCCGGAAAGCTGATGCGGG > NC_000913/3703104‑3703399
|
aCGGGTGACGCGGCGCATGGAAGATGGCGTGCGCATCACCGGTTTCCACCACCTGGCCTGCATACATCACGATGATTTTATGTGCCGCTTCCGCCACCAGCGCCAGGTCATGGGTAATTAACACCAGCGCCATGTTCTCTTTCTGCTGt < 4:760033/149‑1 (MQ=255)
gggTGACGCGGCGCATGGAAGATGGCGTGCGCATCACCGGTTTCCACCACCTGGCCTGCATACATCACGATGATTTTATGTGCCGCTTCCGCCACCAGCGCCAGGTCATGGGTAATTAACACCAGCGCCATGTTCTCTTTCTGCTGTAg > 4:5739/1‑149 (MQ=255)
cgcgGCGCATGGAAGATGGCGTGCGCATCACCGGTTTCCACCACCTGGCCTGCATACATCACGATGATTTTATGTGCCGCTTCCGCCACCAGCGCCAGGTCATGGGTAATTAACACCAGCGCCATGTTCTCTTTCTGCTGTAGCTCca < 1:326476/148‑1 (MQ=255)
tGGAAGATGGCGTGCGCATCACCGGTTTCCACCACCTGGCCTGCATACATCACGATGATTTTATGTGCCGCTTCCGCCACCAGCGCCAGGTCATGGGTAATTAACACCAGCGCCATGTTCTCTTTCTGCTGTAGCTCCAGCAGTAGTTc > 4:536808/1‑149 (MQ=255)
ggAAGATGGCGTGCGCATCACCGGTTTCCACCACCTGGCCTGCATACATCACGATGATTTTATGTGCCGCTTCCGCCACCAGCGCCAGGTCATGGGTAATTAACACCAGCGCCATGTTCTCTTTCTGCTGTAGCTCCAGCAGTAGTTc > 2:620393/1‑148 (MQ=255)
gAAGATGGCGTGCGCATCACCGGTTTCCACCACCTGGCCTGCATACATCACGATGATTTTATGTGCCGCTTCCGCCACCAGCGCCAGGTCATGGGTAATTAACACCAGCGCCATGTTCTCTTTCTGCTGTAGCTCCAGCAGTAGTTCga < 3:89171/149‑1 (MQ=255)
aaGATGGCGTGCGCATCACCGGTTTCCACCACCTGGCCTGCATACATCACGATGATTTTATGTGCCGCTTCCGCCACCAGCGCCAGGTCATGGGTAATTAACACCAGCGCCATGTTCTCTTTCTGCTGTAGCTCCAGTAGTAGTTCgat < 3:720468/149‑1 (MQ=255)
aaGATGGCGTGCGCATCACCGGTTTCCACCACCTGGCCTGCATACATCACGATGATTTTATGTGCCGCTTCCGCCACCAGCGCCAGGTCATGGGTAATTAACACCAGCGCCATGTTCTCTTTCTGCTGTAGCTCCAGCAGTAGTTCga > 1:248337/1‑148 (MQ=255)
aaGATGGCGTGCGCATCACCGGTTTCCACCACCTGGCCTGCATACATCACGATGATTTTATGTGCCGCTTCCGCCACCAGCGCCAGGTCATGGGTAATTAACACCAGCGCCATGTTCTCTTTCTGCTGTAGCTCCAGCAGTAGTTCga < 2:330907/148‑1 (MQ=255)
aaGATGGCGTGCGCATCACCGGTTTCCACCACCTGGCCTGCATACATCACGATGATTTTATGTGCCGCTTCCGCCACCAGCGCCAGGTCATGGGTAATTAACACCAGCGCCATGTTCTCTTTCTGCTGTAGCTCCAGCAGTAGTTCga < 1:813799/148‑1 (MQ=255)
aTGGCGTGCGCATCACCGGTTTCCACCACCTGGCCTGCATACATCACGATGATTTTATGTGCCGCTTCCGCCACCAGCGCCAGGTCATGGGTAATTAACACCAGCGCCATGTTCTCTTTCTGCTGTAGCTCCAGCAGTAGTTCgatga > 2:496563/1‑148 (MQ=255)
tGGCGTGCGCATCACCGGTTTCCACCACCTGGCCTGCATACATCACGATGATTTTATGTGCCGCTTCCGCCACCAGCGCCAGGTCATGGGTAATTAACACCAGCGCCATGTTCTCTTTCTGCTGTAGCTCCAGCAGTAGTTCgatgat < 1:393828/148‑1 (MQ=255)
tGGCGTGCGCATCACCGGTTTCCACCACCTGGCCTGCATACATCACGATGATTTTATGTGCCGCTTCCGCCACCAGCGCCAGGTCATGGGTAATTAACACCAGCGCCATGTTCTCTTTCTGCTGTAGCTCCAGCAGTAGTTCGATGAtt < 4:829625/149‑1 (MQ=255)
cGTGCGCATCACCGGTTTCCACCACCTGGCCTGCATACATCACGATGATTTTATGTGCCGCTTCCGCCACCAGCGCCAGGTCATGGGTAATTAACACCAGCGCCATGTTCTCTTTCTGCTGTAGCTCCAGCAGTAGTTCGATGATTTgc < 4:4586/149‑1 (MQ=255)
gcgcATCACCGGTTTCCACCACCTGGCCTGCATACATCACGATGATTTTATGTGCCGCTTCCGCCACCAGCGCCAGGTCATGGGTAATTAACACCAGCGCCATGTTCTCTTTCTGCTGTAGCTCCAGCAGTAGTTCGATGATTTgcgc > 1:235794/1‑148 (MQ=255)
cgcATCACCGGTTTCCACCACCTGGCCTGCATACATCACGATGATTTTATGTGCCGCTTCCGCCACCAGCGCCAGGTCATGGGTAATTAACACCAGCGCCATGTTCTCTTTCTGCTGTAGCTCCAGCAGTAGTTCGATGATTTGCGCCt < 4:525522/149‑1 (MQ=255)
gcATCACCGGTTTCCACCACCTGGCCTGCATACATCACGATGATTTTATGTGCCGCTTCCGCCACCAGCGCCAGGTCATGGGTAATTAACACCAGCGCCATGTTCTCTTTCTGCTGTAGCTCCAGCAGTAGTTCGATGATTTGCGCCTg > 3:111701/1‑149 (MQ=255)
cATCACCGGTTTCCACCACCTGGCCTGCATACATCACGATGATTTTATGTGCCGCTTCCGCCACCAGCGCCAGGTCATGGGTAATTAACACCAGCGCCATGTTCTCTTTCTGCTGTAGCTCCAGCAGTAGTTCGATGATTTGCGCCTg > 1:785117/1‑148 (MQ=255)
aTCACCGGTTTCCACCACCTGGCCTGCATACATCACGATGATTTTATGTGCCGCTTCCGCCACCAGCGCCAGGTCATGGGTAATTAACACCAGCGCCATGTTCTCTTTCTGCTGTAGCTCCAGCAGTAGTTCGATGATTTGCGCCTGaa < 3:500926/149‑1 (MQ=255)
cACCGGTTTCCACCACCTGGCCTGCATACATCACGATGATTTTATGTGCCGCTTCCGCCACCAGCGCCAGGTCATGGGTAATTAACACCAGCGCCATGTTCTCTTTCTGCTGTAGCTCCAGCAGTAGTTCGATGATTTGCGCCTGAAt > 2:649940/1‑148 (MQ=255)
aCCGGTTTCCACCACCTGGCCTGCATACATCACGATGATTTTATGTGCCGCTTCCGCCACCAGCGCCAGGTCATGGGTAATTAACACCAGCGCCATGTTCTCTTTCTGCTGTAGCTCCAGCAGTAGTTCGATGATTTGCGCCTGAATgg > 4:379075/1‑149 (MQ=255)
ccGGTTTCCACCACCTGGCCTGCATACATCACGATGATTTTATGTGCCGCTTCCGCCACCAGCGCCAGGTCATGGGTAATTAACACCAGCGCCATGTTCTCTTTCTGCTGTAGCTCCAGCAGTAGTTCGATGATTTGCGCCTGAATgg > 2:841182/1‑148 (MQ=255)
ccGGTTTCCACCACCTGGCCTGCATACATCACGATGATTTTATGTGCCGCTTCCGCCACCAGCGCCAGGTCATGGGTAATTAACACCAGCGCCATGTTCTCTTTCTGCTGTAGCTCCAGCAGTAGTTCGATGATTTGCGCCTGAATgg > 1:180294/1‑148 (MQ=255)
cGGTTTCCACCACCTGGCCTGCATACATCACGATGATTTTATGTGCCGCTTCCGCCACCAGCGCCAGGTCATGGGTAATTAACACCAGCGCCATGTTCTCTTTCTGCTGTAGCTCCAGCAGTAGTTCGATGATTTGCGCCTGAATGGt < 2:559898/148‑1 (MQ=255)
ggTTTCCACCACCTGGCCTGCATACATCACGATGATTTTATGTGCCGCTTCCGCCACCAGCGCCAGGTCATGGGTAATTAACACCAGCGCCATGTTCTCTTTCTGCTGTAGCTCCAGCAGTAGTTCGATGATTTgc < 2:493132/136‑1 (MQ=255)
ggTTTCCACCACCTGGCCTGCATACATCACGATGATTTTATGTGCCGCTTCCGCCACCAGCGCCAGGTCATGGGTAATTAACACCAGCGCCATGTTCTCTTTCTGCTGTAGCTCCAGCAGTAGTTCGATGATTTgc > 1:493132/1‑136 (MQ=255)
ccaccaCCTGGCCTGCATACATCACGATGATTTTATGTGCCGCTTCCGCCACCAGCGCCAGGTCATGGGTAATTAACACCAGCGCCATGTTCTCTTTCTGCTGTAGCTCCAGCAGTAGTTCGATGATTTGCGCCTGAATGGTCACGTcc < 4:855140/149‑1 (MQ=255)
accaccTGGCCTGCATACATCACGATGATTTTATGTGCCGCTTCCGCCACCAGCGCCAGGTCATGGGTAATTAACACCAGCGCCATGTTCTCTTTCTGCTGTAGCTCCAGCAGTAGTTCGATGATTTGCGCCTGAATGGTCACGTCCAg > 4:244013/1‑149 (MQ=255)
ccaccTGGCCTGCATACATCACGATGATTTTATGTGCCGCTTCCGCCACCAGCGCCAGGTCATGGGTAATTAACACCAGCGCCATGTTCTCTTTCTGCTGTAGCTCCAGCAGTAGTTCga < 1:545868/120‑1 (MQ=255)
ccaccTGGCCTGCATACATCACGATGATTTTATGTGCCGCTTCCGCCACCAGCGCCAGGTCATGGGTAATTAACACCAGCGCCATGTTCTCTTTCTGCTGTAGCTCCAGCAGTAGTTCga > 2:545868/1‑120 (MQ=255)
ccaccTGGCCTGCATACATCACGATGATTTTATGTGCCGCTTCCGCCACCAGCGCCAGGTCATGGGTAATTAACACCAGCGCCATGTTCTCTTTCTGCTGTAGCTCCAGCAGTAGTTCGATGATTTGCGCCTGAATGGTCACGTCCAg > 1:613384/1‑148 (MQ=255)
ccaccTGGCCTGCATACATCACGATGATTTTATGTGCCGCTTCCGCCACCAGCGCCAGGTCATGGGTAATTAACACCAGCGCCATGTTCTCTTTCTGCTGTAGCTCCAGCAGTAGTTCGATGATTTGCGCCTGAATGGTCACGTCCAg > 2:35408/1‑148 (MQ=255)
ccaccTGGCCTGCATACATCACGATGATTTTATGTGCCGCTTCCGCCACCAGCGCCAGGTCATGGGTAATTAACACCAGCGCCATGTTCTCTTTCTGCTGTAGCTCCAGCAGTAGTTCGATGATTTGCGCCTGAATGGTCACGTCCAg > 2:270613/1‑148 (MQ=255)
accTGGCCTGCATACATCACGATGATTTTATGTGCCGCTTCCGCCACCAGCGCCAGGTCATGGGTAATTAACACCAGCGCCATGTTCTCTTTCTGCTGTAGCTCCAGCAGTAGTTCGATGATTTGCGCCTGAATGGTCACGTCCAgcg > 1:460613/1‑148 (MQ=255)
ccTGGCCTGCATACATCACGATGATTTTATGTGCCGCTTCCGCCACCAGCGCCAGGTCATGGGTAATTAACACCAGCGCCATGTTCTCTTTCTGCTGTAGCTCCAGCAGTAGTTCGATGATTTGCGCCTGAATgg < 2:101714/135‑1 (MQ=255)
ccTGGCCTGCATACATCACGATGATTTTATGTGCCGCTTCCGCCACCAGCGCCAGGTCATGGGTAATTAACACCAGCGCCATGTTCTCTTTCTGCTGTAGCTCCAGCAGTAGTTCGATGATTTGCGCCTGAATgg > 1:101714/1‑135 (MQ=255)
tGGCCTGCATACATCACGATGATTTTATGTGCCGCTTCCGCCACCAGCGCCAGGTCATGGGTAATTAACACCAGCGCCATGTTCTCTTTCTGCTGTAGCTCCAGCAGTAGTTCGATGATTTGCGCCTGAATGGTCACGTCCAGCGCgg < 1:270667/148‑1 (MQ=255)
gCCTGCATACATCACGATGATTTTATGTGCCGCTTCCGCCACCAGCGCCAGGTCATGGGTAATTAACACCAGCGCCATGTTCTCTTTCTGCTGTAGCTCCAGCAGTAGTTCGATGATTTGCGCCTGAATGGTCACGTCCAGCGCggtg < 1:496563/148‑1 (MQ=255)
gCATACATCACGATGATTTTATGTGCCGCTTCCGCCACCAGCGCCAGGTCATGGGTAATTAACACCAGCGCCATGTTCTCTTTCTGCTGTAGCTCCAGCAGTAGTTCGATGATTTGCGCCTGAATGGTCACGTCCAGCGCGGTGGTCg < 2:248337/148‑1 (MQ=255)
gCATACATCACGATGATTTTATGTGCCGCTTCCGCCACCAGCGCCAGGTCATGGGTAATTAACACCAGCGCCATGTTCTCTTTCTGCTGTAGCTCCAGCAGTAGTTCGATGATTTGCGCCTGAATGGTCACGTCCAGCGCGGTGGTCg < 1:87725/148‑1 (MQ=255)
aTACATCACGATGATTTTATGTGCCGCTTCCGCCACCAGCGCCAGGTCATGGGTAATTAACACCAGCGCCATGTTCTCTTTCTGCTGTAGCTCCAGCAGTAGTTCGATGATTTGCGCCTGAATGGTCACGTCCAGCGCGGTGGTCGGtt < 3:181070/149‑1 (MQ=255)
tACATCACGATGATTTTATGTGCCGCTTCCGCCACCAGCGCCAGGTCATGGGTAATTAACACCAGCGCCATGTTCTCTTTCTGCTGTAGCTCCAGCAGTAGTTCGATGATTTGCGCCTGAATGGTCACGTCCAGCGCGGTGGTCGGtt < 2:722274/148‑1 (MQ=255)
tCACGATGATTTTATGTGCCGCTTCCGCCACCAGCGCCAGGTCATGGGTAATTAACACCAGCGCCATGTTCTCTTTCTGCTGTAGCTCCAGCAGTAGTTCGATGATTTGCGCCTGAATGGTCACGTCCAGCGCGGTGGTCGGTTCATc > 2:558060/1‑148 (MQ=255)
aCGATGATTTTATGTGCCGCTTCCGCCACCAGCGCCAGGTCATGGGTAATTAACACCAGCGCCATGTTCTCTTTCTGCTGTAGCTCCAGCAGTAGTTCGATGATTTGCGCCTGAATGGTCACGTCCAGCGCGGTGGTCGGTTCATCGGc > 3:300360/1‑149 (MQ=255)
cGATGATTTTATGTGCCGCTTCCGCCACCAGCGCCAGGTCATGGGTAATTAACACCAGCGCCATGTTCTCTTTCTGCTGTAGCTCCAGCAGTAGTTCGATGATTTGCGCCTGAATGGTCACGTCCAGCGCGGTGGTCGGTTCATCGGc < 2:460613/148‑1 (MQ=255)
gatTTTATGTGCCGCTTCCGCCACCAGCGCCAGGTCATGGGTAATTAACACCAGCGCCATGTTCTCTTTCTGCTGTAGCTCCAGCAGTAGTTCGATGATTTGCGCCTGAATGGTCACGTCCAGCGCGGTGGTCGGTTCATCGGCAATca < 4:756363/149‑1 (MQ=255)
tttATGTGCCGCTTCCGCCACCAGCGCCAGGTCATGGGTAATTAACACCAGCGCCATGTTCTCTTTCTGCTGTAGCTCCAGCAGTAGTTCGATGATTTGCGCCTGAATGGTCACGTCCAGCGCGGTGGTCGGTTCATCGGCAATcagc > 1:102165/1‑148 (MQ=255)
tttATGTGCCGCTTCCGCCACCAGCGCCAGGTCATGGGTAATTAACACCAGCGCCATGTTCTCTTTCTGCTGTAGCTCCAGCAGTAGTTCGATGATTTGCGCCTGAATGGTCACGTCCAGCGCGGTGGTCGGTTCATCGGCAATcagc > 1:757039/1‑148 (MQ=255)
tttATGTGCCGCTTCCGCCACCAGCGCCAGGTCATGGGTAATTAACACCAGCGCCATGTTCTCTTTCTGCTGTAGCTCCAGCAGTAGTTCGATGATTTGCGCCTGAATGGTCACGTCCAGCGCGGTGGTCGGTTCATCGGCAATcagc < 1:649940/148‑1 (MQ=255)
tATGTGCCGCTTCCGCCACCAGCGCCAGGTCATGGGTAATTAACACCAGCGCCATGTTCTCTTTCTGCTGTAGCTCCAGCAGTAGTTCGATGATTTGCGCCTGAATGGTCACGTCCAGCGCGGTGGTCGGTTCATCGGCAATcagcag < 2:613384/148‑1 (MQ=255)
ccGCTTCCGCCACCAGCGCCAGGTCATGGGTAATTAACACCAGCGCCATGTTCTCTTTCTGCTGTAGCTCCAGCAGTAGTTCGATGATTTGCGCCTGAATGGTCACGTCCAGCGCGGTGGTCGGTTCATCGGCAATCAGCAGTTTTgg < 2:716608/148‑1 (MQ=255)
ccGCTTCCGCCACCAGCGCCAGGTCATGGGTAATTAACACCAGCGCCATGTTCTCTTTCTGCTGTAGCTCCAGCAGTAGTTCGATGATTTGCGCCTGAATGGTCACGTCCAGCGCGGTGGTCGGTTCATCGGCAATCAGCAGTTTTGGc > 3:855439/1‑149 (MQ=255)
ttCCGCCACCAGCGCCAGGTCATGGGTAATTAACACCAGCGCCATGTTCTCTTTCTGCTGTAGCTCCAGCAGTAGTTCGATGATTTGCGCCTGAATGGTCACGTCCAGCGCggtg > 3:523149/1‑115 (MQ=255)
ttCCGCCACCAGCGCCAGGTCATGGGTAATTAACACCAGCGCCATGTTCTCTTTCTGCTGTAGCTCCAGCAGTAGTTCGATGATTTGCGCCTGAATGGTCACGTCCAGCGCggtg < 4:523149/115‑1 (MQ=255)
ccGCCACCAGCGCCAGGTCATGGGTAATTAACACCAGCGCCATGTTCTCTTTCTGCTGTAGCTCCAGCAGTAGTTCGATGATTTGCGCCTGAATGGTCACGTCCAGCGCGGTGGTCGGTTCATCGGCAATCAGCAGTTTTGGCCGACa < 1:694494/148‑1 (MQ=255)
cGCCACCAGCGCCAGGTCATGGGTAATTAACACCAGCGCCATGTTCTCTTTCTGCTGTAGCTCCAGCAGTAGTTCGATGATTTGCGCCTGAATGGTCACGTCCAGCGCGGTGGTCGGTTCATCGGCAATCAGCAGTTTTGGCCGACAgg < 3:916623/149‑1 (MQ=255)
ccaccaGCGCCAGGTCATGGGTAATTAACACCAGCGCCATGTTCTCTTTCTGCTGTAGCTCCAGCAGTAGTTCGATGATTTGCGCCTGAATGGTCACGTCCAGCGCGGTGGTCGGTTCATCGGCAATCAGCAGTTTTGGCCGACAGGc > 2:804904/1‑148 (MQ=255)
ccaGCGCCAGGTCATGGGTAATTAACACCAGCGCCATGTTCTCTTTCTGCTGTAGCTCCAGCAGTAGTTCGATGATTTGCGCCTGAATGGTCACGTCCAGCGCGGTGGTCGGTTCATCGGCAATCAGCAGTTTTGGCCGACAGGCAAt < 2:455828/148‑1 (MQ=255)
gcgcCAGGTCATGGGTAATTAACACCAGCGCCATGTTCTCTTTCTGCTGTAGCTCCAGCAGTAGTTCGATGATTTGCGCCTGAATGGTCACGTCCAGCGCGGTGGTCGGTTCATCGGCAATCAGCAGTTTTGGCCGACAGGCAATCGc > 2:305142/1‑148 (MQ=255)
cgcCAGGTCATGGGTAATTAACACCAGCGCCATGTTCTCTTTCTGCTGTAGCTCCAGCAGTAGTTCGATGATTTGCGCCTGAATGGTCACGTCCAGCGCGGTGGTCGGTTCATCGGCAATCAGCAGTTTTGGCCGACAGGCAATCGcc < 2:235794/148‑1 (MQ=255)
cAGGTCATGGGTAATTAACACCAGCGCCATGTTCTCTTTCTGCTGTAGCTCCAGCAGTAGTTCGATGATTTGCGCCTGAATGGTCACGTCCAGCGCGGTGGTCGGTTCATCGGCAATCAGCAGTTTTGGCCGACAGGCAATCGCCATgg > 3:251307/1‑149 (MQ=255)
cAGGTCATGGGTAATTAACACCAGCGCCATGTTCTCTTTCTGCTGTAGCTCCAGCAGTAGTTCGATGATTTGCGCCTGAATGGTCACGTCCAGCGCGGTGGTCGGTTCATCGGCAATCAGCAGTTTTGGCCGACAGGCAATCGCCATg < 1:305142/148‑1 (MQ=255)
atCAAGGGTAATTAACACCCGCGCCATGTTCTCATTCGACTGTAGCTCCAGCAGTAGTTCTATGTTTTGCGCCTGACTGGTCACGTCCAGCGCGGTGGTCGGTTCATCGGCAATCGGCAGTTTTGGCCCACAAGCAATCGCCATGGCg < 2:693198/147‑1 (MQ=255)
tCATGGGTAATTAACACCAGCGCCATGTTCTCTTTCTGCTGTAGCTCCAGCAGTAGTTCGATGATTTGCGCCTGAATGGTCAc > 3:102020/1‑83 (MQ=255)
tCATGGGTAATTAACACCAGCGCCATGTTCTCTTTCTGCTGTAGCTCCAGCAGTAGTTCGATGATTTGCGCCTGAATGGTCACGTCCAGCGCGGTGGTCGGTTCATCGGCAATc > 2:120438/1‑114 (MQ=255)
tCATGGGTAATTAACACCAGCGCCATGTTCTCTTTCTGCTGTAGCTCCAGCAGTAGTTCGATGATTTGCGCCTGAATGGTCACGTCCAGCGCGGTGGTCGGTTCATCGGCAATc < 1:120438/114‑1 (MQ=255)
tCATGGGTAATTAACACCAGCGCCATGTCCTCTTTCTGCTGTAGCTCCAGCAGTAGTTCGATGATTTGCGCCTGAATGGTCAc < 4:102020/83‑1 (MQ=255)
aTGGGTAATTAACACCAGCGCCATGTTCTCTTTCTGCTGTAGCTCCAGCAGTAGTTCGATGATTTGCGCCTGAATGGTCACGTCCAGCGCGGTGGTCGGTTCATCGGCAATCAGCAGTTTTGGCCGACAGGCAATCGCCATGGCGatc < 2:719174/148‑1 (MQ=255)
gggTAATTCACACCAGCGCCATGTTCTCTTTCTGCTGTAGCTCCAGCAGTAGTTCGATGATTTGCGCCTGAATGGTCACGTCCAGCGCGGTGGTCGGTTCATCGGCAATCAGCAGTTTTGGCCGACAGGCAATCGCCATGGCGatcatc > 4:83696/1‑149 (MQ=255)
gggTAATTAACACCAGCGCCATGTTCTCTTTCTGCTGTAGCTCCAGCAGTAGTTCGATGATTTGCGCCTGAATGGTCAc > 4:864545/1‑79 (MQ=255)
gggTAATTAACACCAGCGCCATGTTCTCTTTCTGCTGTAGCTCCAGCAGTAGTTCGATGATTTGCGCCTGAATGGTCAc < 3:864545/79‑1 (MQ=255)
gggTAATTAACACCAGCGCCATGTTCTCTTTCTGCTGTAGCTCCAGCAGTAGTTCGATGATTTGCGCCTGAATGGTCACGTCCAGCGCGGTGGTCGGTTCATCGGCAATCAGCAGTTTTGGCCGACAGGCAATCGCCATGGCGatcat < 1:804904/148‑1 (MQ=255)
ggTAATTAACACCAGCGCCATGTTCTCTTTCTGCTGTAGCTCCAGCAGTAGTTCGATGATTTGCGCCTGAATGGTCACGTCCAGCGCGGTGGTCGGTTCATCGGCAATCAGCAGTTTTGGCCGACAGGCAATCGCCATGGCGAtcatca > 3:18645/1‑149 (MQ=255)
aaTTAACACCAGCGCCATGTTCTCTTTCTGCTGTAGCTCCAGCAGTAGTTCGATGATTTGCGCCTGAATGGTCACGTCCAGCGCGGTGGTCGGTTCATCGGCAATCAGCAGTTTTGGCCGACAGGCAATCGCCATGGCGATCATCAcgc < 3:480069/149‑1 (MQ=255)
ttAACACCAGCGCCATGTTCTCTTTCTGCTGTAGCTCCAGCAGTAGTTCGATGATTTGCGCCTGAATGGTCACGTCCAGCGCGGTGGTCGGTTCATCGGCAATCAGCAGTTTTGGCCGACAGGCAATCGCCATGGCGATCATCACgcgc > 4:894350/1‑149 (MQ=255)
cacCAGCGCCATGTTCTCTTTCTGCTGTAGCTCCAGCAGTAGTTCGATGATTTGCGCCTGAATGGTCACGTCCAGCGCGGTGGTCGGTTCATCGGCAATCAGCAGTTTTGGCCGACAGGCAATCGCCATGGCGATCATCACGCGCTGGc < 3:83696/149‑1 (MQ=255)
acCAGCGCCATGTTCTCTTTCTGCTGTAGCTCCAGCAGTAGTTCGATGATTTGCGCCTGAATGGTCACGTCCAGCGCGGTGGTCGGTTCATCGGCAATcagca > 3:191159/1‑103 (MQ=255)
acCAGCGCCATGTTCTCTTTCTGCTGTAGCTCCAGCAGTAGTTCGATGATTTGCGCCTGAATGGTCACGTCCAGCGCGGTGGTCGGTTCATCGGCAATcagca < 4:191159/103‑1 (MQ=255)
acCAGCGCCATGTTCTCTTTCTGCTGTAGCTCCAGCAGTAGTTCGATGATTTGCGCCTGAATGGTCACGTCCAGCGCGGTGGTCGGTTCATCGGCAATCAGCAGTTTTGGCCGACAGGCAATCGCCATGGCGATCATCACGCGCTGGCt > 3:386154/1‑149 (MQ=255)
gcgcCATGTTCTCTTTCTGCTGTAGCTCCAGCAGTAGTTCGATGATTTGCGCCTGAATGGTCACGTCCAGCGCGGTGGTCGGTTCATCGGCAATCAGCAGTTTTGGCCGACAGGCAATCGCCATGGCGATCATCACGCGCTGGCTCAt > 1:434820/1‑148 (MQ=255)
gcgcCATGTTCTCTTTCTGCTGTAGCTCCAGCAGTAGTTCGATGATTTGCGCCTGAATGGTCACGTCCAGCGCGGTGGTCGGTTCATCGGCAATCAGCAGTTTTGGCCGACAGGCAATCGCCATGGCGATCATCACGCGCTGGCTCATg > 4:559139/1‑149 (MQ=255)
cATGTTCTCTTTCTGCTGTAGCTCCAGCAGTAGTTCGATGATTTGCGCCTGAATGGTCACGTCCAGCGCGGTGGTCGGTTCATCGGCAATCAGCAGTTTTGGCCGACAGGCAATCGCCATGGCGATCATCACGCGCTGGCTCATgccgc > 3:397782/1‑149 (MQ=255)
tGTTCTCTTTCTGCTGTAGCTCCAGCAGTAGTTCGATGATTTGCGCCTGAATGGTCACGTCCAGCGCGGTGGTCGGTTCATCGGCAATCAGCAGTTTTGGCCGACAGGCAATCGCCATGGCGATCATCACGCGCTGGCTCATgccgcc < 1:73890/148‑1 (MQ=255)
aactactgctgGAGCTACAGCAGTAGTTCGATGATTTGCGCCTGAATGGTCACGTCCAGCGCGGTGGTCGGTTCATCGGCAATCAGCAGTTTTGGCCGACAGGCAATCGCCATGGCGATCATCAcgc > 4:304815/6‑127 (MQ=255)
aactactgctgGAGCTACAGCAGTAGTTCGATGATTTGCGCCTGAATGGTCACGTCCAGCGCGGTGGTCGGTTCATCGGCAATCAGCAGTTTTGGCCGACAGGCAATCGCCATGGCGATCATCAcgc < 3:304815/122‑1 (MQ=255)
aactactgctgGAGCTACAGCAGTAGTTCGATGATTTGCGCCTGAATGGTCACGTCCAGCGCGGTGGTCGGTTCATCGGCAATCAGCAGTTTTGGCCGACAGGCAATCGCCATGGCGATCATCACGCGCTGGCTCATGCCGCCGGaaa > 1:642710/6‑148 (MQ=255)
ctTTCTGCTGTAGCTCCAGCAGTAGTTCGATGATTTGCGCCTGAATGGTCACGTCCAGCGCGGTGGTCGGTTCATCGGCAATCAGCAGTTTTGGCCGACAGGCAATCGCCATGGCGATCATCACGCGCTGGCTCATGCCGCCGGAAAg > 2:879975/1‑148 (MQ=255)
ctTTCTGCTGTAGCTCCAGCAGTAGTTCGATGATTTGCGCCTGAATGGTCACGTCCAGCGCGGTGGTCGGTTCATCGGCAATCAGCAGTTTTGGCCGACAGGCAATCGCCATGGCGATCATCACGCGCTGGCTCATGCCGCCGGAAAg > 1:375543/1‑148 (MQ=255)
ctTTCTGCTGTAGCTCCAGCAGTAGTTCGATGATTTGCGCCTGAATGGTCACGTCCAGCGCGGTGGTCGGTTCATCGGCAATCAGCAGTTTTGGCCGACAGGCAATCGCCATGGCGATCATCACGCGCTGGCTCATGCCGCCGGAAAGc < 3:244013/149‑1 (MQ=255)
tttCTGCTGTAGCTCCAGCAGTAGTTCGATGATTTGCGCCTGAATGGTCACGTCCAGCGCGGTGGTCGGTTCATCGGCAATCAGCAGTTTTGGCCGACAGGCAATCGCCATGGCGATCATCACGCGCTGGCTCATGCCGCCGGAAAGc > 2:399891/1‑148 (MQ=255)
actgctgGAGCTACAGCAGTAGTTCGATGATTTGCGCCTGAATGGTCACGTCCAGCGCGGTGGTCGGTTCATCGGCAATCAGCAGTTTTGGCCGACAGGCAATCGCCATGGCGATCATCACGCGCTGGCTCATGCCGCCGGAAAg < 1:252799/144‑1 (MQ=255)
actgctgGAGCTACAGCAGTAGTTCGATGATTTGCGCCTGAATGGTCACGTCCAGCGCGGTGGTCGGTTCATCGGCAATCAGCAGTTTTGGCCGACAGGCAATCGCCATGGCGATCATCACGCGCTGGCTCATGCCGCCGGAAAg > 2:252799/2‑145 (MQ=255)
gctgTAGCTCCAGCAGTAGTTCGATGATTTGCGCCTGAATGGTCACGTCCAGCGCGGTGGTCGGTTCATCGGCAATCAGCAGTTTTGGCCGACAGGCAATCGCCATGGCGATCATCACGCGCTGGCTCATGCCGCCGGAAAGCTGATg < 1:841182/148‑1 (MQ=255)
tgTAGCTCCAGCAGTAGTTCGATGATTTGCGCCTGAATGGTCACGTCCAGCGCGGTGGTCGGTTCATCGGCAATCAGCAGTTTTGGCCGACAGGCAATCGCCATGGCGATCATCACGCGCTGGCTCATGCCGCCGGAAAGCTGATGCgg < 4:251307/149‑1 (MQ=255)
tgTAGCTCCAGCAGTAGTTCGATGATTTGCGCCTGAATGGTCACGTCCAGCGCGGTGGTCGGTTCATCGGCAATCAGCAGTTTTGGCCGACAGGCAATCGCCATGGCGATCATCACGCGCTGGCTCATGCCGCCGGAAAGCTGATGCgg < 3:946555/149‑1 (MQ=255)
tgTAGCTCCAGCAGTAGTTCGATGATTTGCGCCTGAATGGTCACGTCCAGCGCGGTGGTCGGTTCATCGGCAATCAGCAGTTTTGGCCGACAGGCAATCGCCATGGCGATCATCACGCGCTGGCTCATGCCGCCGGAAAGCTGATGCgg < 3:536808/149‑1 (MQ=255)
tgTAGCTCCAGCAGTAGTTCGATGATTTGCGCCTGAATGGTCACGTCCAGCGCGGTGGTCGGTTCATCGGCAATCAGCAGTTTTGGCCGACAGGCAATCGCCATGGCGATCATCACGCGCTGGCTCATGCCGCCGGAAAGCTGATGCg < 1:483571/148‑1 (MQ=255)
tgTAGCTCCAGCAGTAGTTCGATGATTTGCGCCTGAATGGTCACGTCCAGCGCGGTGGTCGGTTCATCGGCAATCAGCAGTTTTGGCCGACAGGCAATCGCCATGGCGATCATCACGCGCTGGCTCATGCCGCCGGAAAGCTGATGCg < 1:715208/148‑1 (MQ=255)
gTAGCTCCAGCAGTAGTTCGATGATTTGCGCCTGAATGGTCACGTCCAGCGCGGTGGTCGGTTCATCGGCAATCAGCAGTTTTGGCCGACAGGCAATCGCCATGGCGATCATCACGCGCTGGCTCATGCCGCCGGAAAGCTGATGCggg > 3:916819/1‑149 (MQ=255)
|
ACGGGTGACGCGGCGCATGGAAGATGGCGTGCGCATCACCGGTTTCCACCACCTGGCCTGCATACATCACGATGATTTTATGTGCCGCTTCCGCCACCAGCGCCAGGTCATGGGTAATTAACACCAGCGCCATGTTCTCTTTCTGCTGTAGCTCCAGCAGTAGTTCGATGATTTGCGCCTGAATGGTCACGTCCAGCGCGGTGGTCGGTTCATCGGCAATCAGCAGTTTTGGCCGACAGGCAATCGCCATGGCGATCATCACGCGCTGGCTCATGCCGCCGGAAAGCTGATGCGGG > NC_000913/3703104‑3703399
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 35 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
GATK/CNVnator alignment
N/A
