Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A6 F108 I1 R1
|
14 |
112.8 |
3657430 |
96.2% |
3518447 |
148.9 |
Breseq alignment
BRESEQ :: Evidence
|
| evidence |
seq id |
position |
mutation |
annotation |
gene |
description |
| RA |
NC_000913 |
3,950,469 |
T→G |
intergenic (+49/‑38) |
ilvL → / → ilvX |
ilvG operon leader peptide/uncharacterized protein |
|
| |
seq id |
position |
ref |
new |
freq |
score (cons/poly) |
reads |
annotation |
genes |
product |
| * | NC_000913 | 3,950,469 | 0 | T | G | 100.0%
| 341.8
/ NA
| 98 | intergenic (+49/‑38) | ilvL/ilvX | ilvG operon leader peptide/uncharacterized protein |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (0/0); new base G (52/46); total (52/46) |
Only 100 of 107 total aligned reads displayed.
GACAGCCCTTCTACGAGTGATTAGCCTGGTCGTGATTAGCGTGGTGGTGATTATTATCCCACCGTGCGGGGCTGCACTTGGACGAGGAAAGGCTTAGAGATCAAGCCTTAACGAACTAAGACCCCCGCACCGAAAGGTCCGGGGGTTTTTTTTGACCTTAAAAACATAACCGAGGAGCAGACAATGAATAACAGCACAAAATTCTGTTTCTCAAGATTCAGGACGGGGAACTAACTATGAATGGCGCACAGTGGGTGGTACATGCGTTGCGGGCACAGGGTGTGA > NC_000913/3950324‑3950608
|
gACAGCCCTTCTACGAGTGATTAGCCTGGTCGTGATTAGCGTGGTGGTGATTATTATCCCACCGTGCGGGGCTGCACTTGGACGAGGAAAGGCTTAGAGATCAAGCCTTAACGAACTAAGACCCCCGGACCTTTCGGTGCGGGGGtctt < 1:288085/149‑1 (MQ=255)
cAGCCCTTCTACGAGTGATTAGCCTGGTCGTGATTAGCGTGGTGGTGATTTTTATCCCACCGTGCGGGGCTGCACTTGGACGAGGAAAGGCTTAGAGATCAAGCCTTAACGAACTAAGACCCCCGGACCTTTCGGTGCGGGGGtcttag < 2:129788/149‑3 (MQ=255)
cAGCCCTTCTACGAGGGATTAGCCTGGTCGTGATTAGCGGGGTGGGGATTATTATCCCACCGTGCGGGGCTGCACTTGGACGAGGAAAGGCTTAGAGATCAAGCCTTAACGAACTAAGACCCCCGGACCTTTCGGTGCGGGGGtcttag < 2:1749514/149‑3 (MQ=255)
cgCCCTTCTACGAGTGATTAGCCTGGGCGTGATTAGCGTGGTGGTGATTATTATCCCACCGTGCGGGGCTGCACTTGGACGAGGAAAGGCTTAGAGATCAAGCCTTAACGAACTAAGACCCCCGCACCGAAAGGTCCGGGGGgtttttt < 1:1233701/148‑1 (MQ=255)
aGCCCTTCTACGAGTGATTAGCCTGGTCGTGATTAGCGTGGTGGTGATTATTATCCCACCGTGCGGGGCTGCACTTGGACGAGGAAAGGCTTAGAGATCAAGCCTTAACGCACTAAGACCCCCGCACCGAAAGGTCCGGGGGgtttttt > 1:884997/1‑149 (MQ=255)
gCCCTTCTACGAGTGATTAGCCTGGGCGTGATTAGCGTGGTGGTGATTATTATCCCACCGTGCGGGGCTGCACTTGGACGAGGAAAGGCTTAGAGATCAAGCCTTAACGAACTAAGACCCCCGCACCGAAAGGTCCGGGGGgttttttt < 1:171877/149‑1 (MQ=255)
ccccTTCTACGAGTGATTAGCCTGGTCGTGATTAGCGTGGTGGTGATTATTATCCCACCGTGCGGGGCTGCACTTGGACGAGGAAAGGCTTAGAGATCAAGCCTTAACGAACTAAGACCCCCGCACCGAAAGGTCCGGGGGgttttttt < 2:94924/148‑1 (MQ=255)
cccTTCTACGAGTGATTAGCCTGGTCGTGATTAGCGTGGTGGTGATTATTATCCCACCGTGCGGGGCTGCACTTGGACGAGGAAAGGCTTAGAGATCAAGCCTTAACGAACTAAGACCCCCGCACCGAAAGGTCCGGGGGGTTTTTTTg > 1:1300004/1‑149 (MQ=255)
ccTTCTACGAGTGATTAGCCTGGTGGTTTTTAGCGTGGTGGTGTTTATTATCCCACCGTGCGGGGCTGCACTTGGACGAGGAAAGGCTTAGAGATCAAGCCTTAACGATCTTAGACCCCCGGACCGAAAGGTCCGGGGGGTTTTTTTGa < 2:524739/149‑1 (MQ=255)
cTTCTACGAGTGATTAGCCTGGTCGTGATTTGCGTGGTGGTGATTTTTTTCCCACCGTGGGGGGCTGCACTTGGACGAGGAAAGGCGTAGAGATAAAGCCGTAACGAACTAAGACCCCCCCCCCGAAAGGGACGGGGGggtttttttgc > 1:700680/1‑146 (MQ=255)
cTTCTACGAGTGATTAGCCTGGTCGTGATTAGCGTGGTGGTGATTATTATCCCACCGTGCGGGGCTGCACTTGGACGAGGAAAGGCTTAGAGATAAAGCCTTTACGAACTAAGACCCCCGCACCGAAACGTCCGGGGGGTTTTTTTGAc > 1:1658795/1‑149 (MQ=255)
cTTCTACGAGTGATTAGCCTGGTCGTGATTAGCGTGGTGGTGATTATTATCCCACCGTGCGGGGCTGCACATGGACGAGGAAAGGCTTAGAGATCAAGCCTTAACGAACTAAGACCCCCGCACCGAAAGGTCAGGGGGGTTTTTTTGAc > 2:1164335/1‑149 (MQ=255)
ttCTACGAGTGATTAGCCTGGTCGTGATTTGCGTGGTGGTTATTATTATACCAACGTGCCGGGCTGCACTTGGACGAGGAAACGCTTAGAGATCAAACCTTAACGAACAAATACCCCCCCACCGAAACGAGAGGGGGGTTTGTTTGAcc > 2:945059/1‑149 (MQ=255)
ttCTACGAGTGATTAGCCTGGTCGTGATTAGCGTGGTGGTGATTATTATCCCACCGTGCGGGGCTGCACTTGGACGAGGAAAGGCTTAGAGATCAAGCCTTAACGAACTAAGACCCCCGCACCGAAAGGTCCGGGGGGTTTTTTTGAcc > 2:661273/1‑149 (MQ=255)
tACGAGTGATTAGCCTGGTCGTGATTAGCGTGGTGGTGATTATTATCCCACCGTGCGGGGCTGCACTTGGACGAGGAAAGGCTTAGAGATCAAGCCTTAACGAACTAAGACCCCCGCACCGAAAGGTCCGGGGGGTTTTTTTGACCTTa > 1:1243476/1‑149 (MQ=255)
cGAGTGATTAGCCTGGTCGTGATTAGCGTGGTGGTGATTATTATCCCACCGTGCGGGGCTGCACTTGGACGAGGAAAGGCTTAGAGATCAAGCCTTAACGAACTAAGACCCCCGCCCCGAAAGGTCCGGGGGGGTTTTTTGACCTTaaa > 1:1013279/1‑149 (MQ=255)
gAGTGATTAGCCTGGTCGTGATTAGCGTGGTGGTGATTATTATCCCACCGTGCGGGGCTGCACTTGGACGAGGAAAGGCTTAGAGATCAAGCCTTAACGAACTAAGACCCCCGCACCGAAAGGTCCGGGGGGTTTTTTTGACCTTaaaa < 1:1755785/149‑1 (MQ=255)
tgTGATTTGCCTGGGCGTTATTAGCGTGGTGGTGATTATTATCCCACCGGGCGGGGCGGCCCTTGGACGAGGAAAGGCTTAGAGAACAAGCCTTAACGAACTAACACCCCCGCACCGAAAGGTCCGGGGGGTTTTTTTGACCTTaaaaa < 1:1287033/148‑1 (MQ=255)
aGTGATTAGCCTGGTCGTGATTAGCGTGGTGGTGATTATTATCCCACCGTGCGGGGCTGCACTTGGACGAGGAAAGGCTTAGAGATCAAGCCTTAACGAACTAAGACCCCCGCACCGAAAGGTCCGGGGGGTTTTTTTGACCTTaaaaa < 1:1294748/149‑1 (MQ=255)
ttAGCCTGGTCGTGATTAGCGTGGTGGTGATTATTATCCCACCGTGCGGGGCTGCACTTGGACGAGGAAAGGCTTAGAGATCAAGCCTTAACGAACTAAGACCCCCGCACCGAAAGGTCCGGGGGGTTTTTTTGACCTTAAAAACATaa > 1:722808/1‑149 (MQ=255)
ttAGCCTGGTCGTGATTAGCGTGGTGGTGATTATTATCCCACCGTGCGGGGCTGCACTTGGACGAGGAAAGGCTTAGAGATCAAGCCTTAACGAACTAAGACCCCCGCACCGAAAGGTCCGGGGGGTTTTTTTGACCTTAAAAACATaa > 2:898696/1‑149 (MQ=255)
tAGCCTGGTCGTGATTAGCGTGGTGGTGATTATTATCCCACCGTGCGGGGCTGCACTTGGACGAGGAAAGGCTTAGAGATCAAGCCTTAACGAACTAAGACCCCCGCACCGAAAGGTCCGGGGGGTTTTTTTGACCTTAAAAACATAAc < 1:625813/149‑1 (MQ=255)
gCCTGGTCGTGATTAGCGTGGTGGTGATTATTATCCCACCGTGCGGGGCTGCACTTGGACGAGGAAAGGCTTAGAGATCAAGCCTTAACGAACTAAGACCCCCGCACCGAAAGGTCCGGGGGGTTTTTTTGACCTTAAAAACATACCCg > 1:603960/1‑149 (MQ=255)
ccTGGTCGTGATTAGCGTGGTGGTGATTATTATCCCACCGTGCGGGGCTGCACTTGGACGAGGAAAGGCTTAGAGATCAAGCCTTAACGAACTAAGACCCCCGCACCGAAAGGTCCGGGGGGTTTTTTTGACCTTAAAAACATAACCga < 2:40976/149‑1 (MQ=255)
cTGGTCGTGATTAGCGTGGTGGTGATTATTATCCCACCGTGCGGGGCTGCACTTGGACGAGGAAAGGCTTAGAGATCAAGCCTTAACGAACTAAGACCCCCGCACCGAAAGGTCCGGGGGGTTTTTTTGACCTTAAAAACATAACCgag < 1:140167/149‑1 (MQ=255)
tGGTCGTGATTAGCGTGGTGGTGATTATTATCCCACCGTGCGGGGCTGCACTTGGACGAGGAAAGGCTTAGAGATCAAGCCTTAACGAACTAAGACCCCCGCACCGAAAGGTCCGGGGGGTTTTTTTGACCTTAAAAACATAACCgagg > 2:32229/1‑149 (MQ=255)
gTGATTAGCGTGGTGGTGATTATTATCCCACCGTGCGGGGCTGCACTTGGACGAGGAAAGGCTTAGAGATCAAGCCTTAACGAACTAAGACCCCCGCACCGAAAGGTCCGGGGGGTTTTTTTGACCTTAAAAACAAAACCGAGGAGCAg > 1:1760023/1‑149 (MQ=255)
gATTAGCGTGGTGGTGATTATTATCCCACCGTGCGGGGCTGCACTTGGACGAGGAAAGGCTTAGAGATCAAGCCTTAACGAACTAAGACCCCCGCACCGAAAGGTCCGGGGGGTTTTTTTGACCTTAAAAACATACCCGAGGAGCAGAc > 1:520887/1‑149 (MQ=255)
ttAGGGTGGGGCTGATTTTTATCCCACCGGGCGTGGCGGAACTTGGACGTGGAAAGGGTTAGATATCAAGCCTTAACTAAATACGACCCCCGCACCGAAAGGTCCGGGGGGTTTTTTTGACCTTAAAAACATAACCGAGGAGCAGACaa < 1:1160069/149‑1 (MQ=255)
ttAGCGTGGTGGTGATTATTATCCCACCGTGCGGGGCTGCACTTGGACGAGGAAAGGCTTAGAGATCAAGCCTTAACGAACTAAGACCCCCGCACCGAAAGGTCCGGGGGGTTTTTTTGACCTTAAAAACATAACCGAGGAGCAGACaa < 1:745752/149‑1 (MQ=255)
tAGCGTGGTGGTGATTATTATCCCACCGTGCGGGGCTGCACTTGGACGAGGAAAGGCTTAGAGATCAAGCCTTAACGAACTAAGACCCCCGCACCGAAAGGTCCGGGGGGTTTTTTTGACCTTAAAAACATAACCGAGGAGCAGACAAt > 1:1608826/1‑149 (MQ=255)
ggtggtgATTATTATCCCACCGTGTGGGGCTGCACTTGGACGAGGAAAGGCTTAGAGATCAAGCCTTAACGAACTAAGACCCCCGCACCGAAAGGTCCGGGGGGTTTTTTTGACCTTAAAAACATAACCGAGGAGCAGACAATGAATaa < 1:615379/149‑1 (MQ=255)
gtggtgATTATTATCCCACCGTGCGGGGCTGCACTTGGACGAGGAAAGGCTTAGAGATCAAGCCTTAACGAACTAAGACCCCCGCACCGAAAGGTCCGGGGGGTTTTTTTGACCTTAAAAACATAACCGAGGAGCAGACAATGAATAAc < 2:496204/149‑1 (MQ=255)
tggtgATTATTATCCCACCGTGCGGGGCTGCACTTGGACGAGGAAAGGCTTAGAGATCAAGCCTTAACGAACTAAGACCCCCGCACCGAAAGGTCCGGGGGGTTTTTTTGACCTTAAAAACATAACCGAGGAGCAGACAATGAATAACa > 2:805343/1‑149 (MQ=255)
ggtgATTATTATCCCACCGTGCGGGGCTGCACTTGGACGAGGAAAGGCTTAGAGATCAAGCCTTAACGAACTAAGACCCCCGCACCGAAAGGTCCGGGGGGTTTTTTTGCCCTTAAAAACATAACCGAGGAGCAGACAATGAATAACAg > 1:894452/1‑149 (MQ=255)
gATTATTATCCCACCGTGCGGGGCTGCACTTGGACGAGGAAAGGCTTAGAGATCAAGCCTTAACGAACTAAGACCCCCGCACCGAAAGGTCCGGGGGGTTTTTTTGACCTTAAAAACATAACCGAGGAGCAGACAATGAATAACAGcac > 1:726506/1‑149 (MQ=255)
attattATCCCACCGTGCGGGGCTGCACTTGGACGAGGAAAGGCTTAGAGATCAAGCCTTAACGAACTAAGACCCCCGCACCGAAAGGTCCGGGGGGTTTTTTTGACCTTAAAAACATAACCGAGGAGCAGACAATGAATAACAGcaca > 1:1793870/1‑149 (MQ=255)
attattATCCCACCGTGCGGGGCTGCACTTGGACGAGGAAAGGCTTAGAGATCAAGCCTTAACGAACTAAGACCCCCGCACCGAAAGGTCCGGGGGGTTTTTTTGACCTTAAAAACATAACCGAGGAGCAGACAATGAATAACAGcaca > 1:1109209/1‑149 (MQ=255)
tatCCCACCGTGCGGGGCTGCACTTGGACGAGGAAAGGCTTAGAGATCAAGCCTTAACGAACTAAGACCCCCGCACCGAAAGGTCCGGGGGGTTTTTTTGACCTTAAAAACATAACCGAGGAGCAGACAATGAATAACAGCACAAAAtt > 2:46955/1‑149 (MQ=255)
tCCCACCGTGCGGGGCTGCACTTGGACGAGGAAAGGCTTAGAGATCAAGCCTTAACGAACTAAGACCCCCGCACCGAAAGGTCCGGGGGGTTTTTTTGACCTTAAAAACATAACCGAGGAGCAGACAATGAATAACAGCACAAAATTCt > 2:1670241/1‑149 (MQ=255)
tCCCACCGTGCGGGGCTGCACTTGGACGAGGAAAGGCTTAGAGATCAAGCCTTAACGAACTAAGACCCCCGCACCGAAAGGTCCGGGGGGTTTTTTTGACCTTAAAAACATAACCGAGGAGCAGACAATGAATAACAGCACAAAATTCt < 1:538499/149‑1 (MQ=255)
tCCCACCGTGCGGGGCAGCACTTGGACGAGGAAAGGCTTAGACAACAAGCCTTAACGACCTAAGACCCCCGCACCGAAAGGTCCGGGGGGTTTTTTTGACCTTAAAAACATAACCGAGGAGCAGACAATGAATAACAGCACAAAATTCt < 2:259781/149‑1 (MQ=255)
acccACCGTGCGGGGCTGCACTTGGACGAGGAAAGGCTTAGAGATCAAGCCTTAACGAACTAAGACCCCCGCACCGAAAGGTCCGGGGGGTTTTTTTGACCTTAAAAACATAACCGAGGAGCAGACAATGAATAACAGCACAAAATTCt < 1:492364/148‑1 (MQ=255)
ccACCGTGCGGGGCTGCACTTGGACGAGGAAAGGCTTAGAGATCAAGCCTTAACGAACTAAGACCCCCGCACCGAAAGGTCCGGGGGGTTTTTTTGACCTTAAAAACATAACCGAGGAGCAGACAATGAATAACAGCACAAAATTCTGt < 1:234500/149‑1 (MQ=255)
ccACCGGGCGGGGCGGCACTTGGACGAGGAAAGGCTTAGAGATCAAGCCTTAACGAACTAAGACCCCCGCACCGAAAGGTCCGGGGGGTTTTTTTGACCTTAAAAACATAACCGAGGAGCAGACAATGAATAACAGCACAAAATTCTGt < 1:449956/149‑1 (MQ=255)
cccGTGCGGGGCTGCACTTGGACGAGGAAAGGCTTAGAGATCAAGCCTTAACGAACTAAGACCCCCGCACCGAAAGGTCCGGGGGGTTTTTTTGACCTTAAAAACATAACCGAGGAGCAGACAATGAATAACAGCACAAAATTCTGttt < 2:334166/148‑1 (MQ=255)
ggCGGGGCTGCCCTTGGACGAGGAAAGGCTTAGAGATCAAGCCTTAACGAACAAAGACCCCCGCACCGAAAGGTCCGGGGGGTTTTTTTGACCTTAAAAACATAACCGAGGAGCAGACAATGAATAACAGCACAAAATTCTGTTTCTCa < 2:894541/148‑1 (MQ=255)
ggCGGGGCTGCACTTGGACGAGGAAAGGCTTAGAGATCAAGCCTTAACGAACTAAGACCCCCGCACCGAAAGGTCCGGGGGGTTTTTTTGACCTTAAAAACATAACCGAGGAGCAGACAATGAATAACAGCACAAAATTCTGTTTCTCa < 2:590967/148‑1 (MQ=255)
gCGGGGCTGCACTTGGACGAGGAAAGGCTTAGAGATCAAGCCTTAACGAACTAAGACCCCCGCACCGAAAGGTCCGGGGGGTTTTTTTGACCTTAAAAACATAACCGAGGAGCAGACAATGAATAACAGCACAAAATTCTGTTTCTCaa < 2:1243024/149‑1 (MQ=255)
ggggCTGCACTTGGACGAGGAAAGGCTTAGAGATCAAGCCTTAACGAACTAAGACCCCCGCACCGAAAGGTCCGGGGGGTTTTTTTGACCTTAAAAACATAACCGAGGAGCAGACAATGAATAACAGCACAAAATTCTGTTTCTCAAGa > 1:1183670/1‑149 (MQ=255)
gCTGCAATTGTACGATGAAAGGCTTAGAGATCAAGCCTTAACTAACTAAGACCCCCGCACCGAAAGGTCCGGTGGGTTTTTTTGACCTTAAAAACATAACCGAGGAGCAGACAATGAATAACAGCACAAAATTCTGTTTCTCAAGATTc < 1:945059/149‑1 (MQ=255)
tGCACTTGGACGAGGAAAGGCTTAGAGATCAAGCCTTAACGAACTAAGACCCCCGCACCGAAAGGTCCGGGGGGTTTTTTTGACCTTAAAAACATAACCGAGGAGCAGACAATGAATAACAGCACAAAATTCTGTTTCTCAAGATTCAg > 2:932868/1‑149 (MQ=255)
tGCACTTGGACGAGGAAAGGCTTAGAGATCAAGCCTTAACGAACTAAGACCCCCGCACCGAAAGGTCCGGGGGGTTTTTTTGACCTTAAAAACATAACCGAGGAGCAGACAATGAATAACAGCACAAAATACTGTTTCTCAAGATTCAg > 1:707152/1‑149 (MQ=255)
tGCACTTGGACGAGGAAAGGCTTAGAGATCAAGCCTTAACGAACTAAGACCCCCGCACAGAAAGGTCCGGGGGGTTTTTTTGACCGTAAAAACAGAACCGAGGAGCAGACAATGAATAACAGCACAAAATTCTGTTTCTCAAGATTCat > 2:1205941/1‑148 (MQ=255)
cACTTGGACGAGGAAAGGCTTAGAGATCAAGCCTTAACGAACTAAGACCCCCGCACCGAAAGGTCCGGGGGGTTTTTTTGACCTTAAAAACATAACCGAGGAGCAGACAATGAATAACAGCACAAAATTCTGTTTCTCAAGATTCAGGa > 2:476373/1‑149 (MQ=255)
cACTTGGACGAGGAAAGGCTTAGAGATCAAGCCTTAACGAACTAAGACCCCCGCACCGAAAGGTCCGGGGGGTTTTTTTGACCTTAAAAACATAACCGAGGAGCAGACAATGAATAACAGAACAAAATTCTGTTTCTCAAGATTCAGGa > 1:307870/1‑149 (MQ=255)
ttGGACGAGGAAAGGCTTAGAGATCAAGCCTTAACGAACTAAGACCCCCGCACCGAAAGGTCCGGGGGGTTTTTTTGACCTTAAAAACATAACCGAGGAGCAGACAATGAATAACAGCACAAAATTCTGTTTCTCAAGATTCAGGACgg > 1:598042/1‑149 (MQ=255)
ggACGAGGAAAGGCTTAGAGATCAAGCCTTAACGAACTAAGACCCCCGCACCGAAAGGTCCGGGGGGTTTTTTTGACCTTAAAAACATAACCGAGGAGCAGACAATGAATAACAGCACAAAATTCTGTTTCTCAAGATTCAGGACgggg < 2:550317/149‑1 (MQ=255)
gACGAGGAAAGGCTTAGAGATCAAGCCTTAACGAACTAAGACCCCCGCACCGAAAGGTCCGGGGGGTTTTTTTGACCTTAAAAACATAACCGAGGAGCAGACAATGAATAACAGCACAAAATTCTGTTTCTCAAGATTCAGGACGGGGa > 2:904164/1‑149 (MQ=255)
aCGAGGAAAGGCTTAGAGATCAAGCCTTAACGAACTAAGACCCCCGCACCGAAAGGTCCGGGGGGTTTTTTTGACCTTAAAAACATAACCGAGGAGCAGACAATGAATAACAGCACAAAATTCTGTTTCTCAAGATTCAGGACGGGGaa > 1:1689463/1‑149 (MQ=255)
aCGAGGAAAGGCTTAGAGATCAAGCCTTAACGAACTAAGACCCCCGCACCGAAAGGTCCGGGGGGTTTTTTTGACCTTAAAAACATAACCGAGGAGCAGACAATGAATAACAGCACAAAATTCTGTTTCTCAAGATTCAGGACGGGGaa < 1:1422876/149‑1 (MQ=255)
aCGAGGAAAGGCTTAGAGATCAAGCCTTAACGAACTAAGACCCCCGCACCGAAAGGTCCGGGGGGTTTTTTTGACCTTAAAAACATAACCGAGGAGCAGACAATGAATAACAGCACAAAATTCTGTTTCTCAAGATTCAGGACGGGGaa < 2:706667/149‑1 (MQ=255)
aCGAGGAAAGGCTTAGAGATCAAGCCTTAACGAACTAAGACCACCGCACCGAAAGGGCCGGGGGGTTTTTTTGACCTTAAAAACATAACCGAGGAGCAGACAATGAATAACAGCACAAAATTCTGTTTCTCAAGATTCAGGACGGGGaa < 2:590886/149‑1 (MQ=255)
gAGGAAAGGCTTAGAGATCAAGCCTTAACGAACTAAGACCCCCGCACCGAAAGGTCCGGGGGGTTTTTTTGACCTTAAAAACATAACCGAGGAGCAGACAATGAATAACAGCACAAAATTCTGTTTCTCAAGATTCAGGACGGGGaact > 2:911451/1‑149 (MQ=255)
gAAAGGCTTAGAGATCAAGCCTTAACGAACTAAGACCCCCGCACCGAAAGGTCCGGGGGGTTTTTTTGCCCTTAAAAACATAACCGAGGAGCAGACAATGAATAACAGCACAAAATTCTGTTTCTCAAGATTCAGGCCGGGGaactaac > 1:248304/1‑149 (MQ=255)
aaGGCTTAGAGATCAAGCCTTAACGAACTAAGACCCCCGCACCGAAAGGTCCGGGGGGTTTTTTTGACCTTAAAAACATAACCGAGGAGCAGACAATGAATAACAGCACAAAATTCTGTTTCTCAAGATTCAGGACGGGGAactaacta < 1:1771711/149‑1 (MQ=255)
atgaatAGAGATCAATCATTATCGAACTACGACCCCCGCACCGAAAGGTCCGGTGGGTTTTTTTGACCTTAAAAACATAACCGAGTAGCAGACAATGAATAACAGCACAAAATTCTGTTTCTCAAGATTCAGGACGGGGAACTAACTAt < 1:421614/144‑1 (MQ=255)
gCTTAGAGATCAAGCCTTAACGAACTAAGACCCCCGCACCGAAAGGTCCGGGGGGTTTTTTTGACCTTAAAAACATAACCGAGGAGCAGACAATGAATAACAGCACAAAATTCTGTTTCTCAAGATTCAGGACGGGGAACTAACTATGa < 2:1235444/149‑1 (MQ=255)
gCTTAGAGATCAAGCCTTAACGAACTAAGACCCCCGCACCGAAAGGTCCGGGGGGTTTTTTTGACCTTAAAAACATAACCGAGGAGCAGACAATGAATAACAGCACAAAATTCTGTTTCTCAAGATTCAGGACGGGGAACTAACTATGa < 1:32229/149‑1 (MQ=255)
ttAGAGATCAAGCCTTAACGAACTAAGACCCCCGCACCGAAAGGTCCGGGGGGTTTTTTTGACCTTAAAAACATAACCGAGGAGCAGACAATGAATAACAGCACAAAATTCTGTTTCTCAAGATTCAGGACGGGGAACTAACTATGAAt > 2:100385/1‑149 (MQ=255)
ttAGAGATCAAGCCTTAACGAACTAAGACCCCCGCACCGAAAGGTCCGGGGGGTTTTTTTGACCTTAAAAACATAACCGAGGAGCAGACAATGAATAACAGCACAAAATTCTGTTTCTCAAGATTCAGGACGGGGAACTAACTATGAAt > 1:756374/1‑149 (MQ=255)
tAGAGATCAAGCCTTAACGAACTAAGACCCCCGCACCGAAAGGTCCGGGGGGTTTTTTTGACCTTAAAAACATAACCGAGGAGCAGACAATGAATAACAGCAAAAAATTCTGTTTCTCAAGATTCAGGACGGGGAACTAACTATGAATg > 1:69187/1‑149 (MQ=255)
agagATCAAGCCTTAACGAACTAAGACCCCCGCACCGAAAGGTCCGGGGGGTTTTTTTGACCTTAAAAACATAACCGAGGAGCAGACAATGAATAAAAGCACAAAATTCTGTTTCTAAAGATTCAGGACGGGGAACTAACTATGAATgg > 1:838659/1‑149 (MQ=255)
gagaTCAAGCCTTAACGAACTAAGACCCCCGCACCGAAAGGTCCGGGGGGTTTTTTTGACCTTAAAAACATAACCGAGGAGCAGACAATGAATAACAGCACAAAATTCTGTTTCTCGAGATTCAGGACGGGGAACTAACTATGAATGgc < 1:27542/149‑1 (MQ=255)
gagaTCAAGCCTTAACGAACTAAGACCCCCGCACCGAAAGGTCCGGGGGGTTTTTTTGACCTTAAAAACATAACCGAGGAGCAGACAATGAATAACAGCACAAAATTCTGTTTCTCAAGATTCAGGACGGGGAACTAACTATGAATGgc > 2:648181/1‑149 (MQ=255)
gagaTCAAGCCTTAACGAACTAAGACCCCCGCACCGAAAGGTCCGGGGGGTTTTTTTGACCTTAAAAACATAACCGAGGAGCAGACAATGAATAACAGCACAAAATTCTGTTTCTCAAGATTCAGGACGGGGAACTAACTATGAATGgc < 2:1300004/149‑1 (MQ=255)
agaTCAAGCCTTAACGAACTAAGACCCCCGCACCGAAAGGTCCGGGGGGTTTTTTTGACCTTAAAAACATAACCGAGGAGCAGACAATGAATAACAGCACAAAATTCTGTTTCTCAAGATTCAGGACGGGGAACTAACTATGAATGgcg > 2:669011/1‑149 (MQ=255)
gaTCAAGCCTTAACGAACTAAGACCCCCGCACCGAAAGGTCCGGGGGGTTTTTTTGACCTTAAAAACATAACCGAGGAGCAGACAATGAATAACAGCACAAAATTCTGTTTCTCAAGATTCAGGACGGGGAACTAACTATGAATGgcgc > 2:28641/1‑149 (MQ=255)
gCCTTAACGAACTAAGACCCCCGCACCGAAAGGTCCGGGGGGTTTTTTTGACCTTAAAAACATAACCGAGGAGCAGACAATGAATAACAGCACAAAATTCTGTTTCTCAAGATTCAGGACGGGGAACTAACTATGAATGGCGCACAgtg < 2:1034964/149‑1 (MQ=255)
cccTTAACGAACTAAGACCCCCGCACCGAAAGGTCCGGGGGGTTTTTTTGACCTTAAAAACATAACCGAGGAGCAGACAATGAATAACAGCACAAAATTCTGTTTCTCAAGATTCAGGACGGGGAACTAACTATGAATGGCGCACAgtg < 1:1021513/148‑1 (MQ=255)
cccTTAACGAACTAAGACCCCCGCACCGAAAGGTCCGGGGGGTTTTTTTGACCTTAAAAACATAACCGAGGAGCAGACAATGAATAACAGCACAAAATTCTGTTTCTCAAGATTCAGGACGGGGAACTAACTATGAATGGCGCACAgtg < 1:367635/148‑1 (MQ=255)
aactaactAAGACCCCCGCTACGTATGGTCCGGTGGGTTTTTTTGACCTTAATAACATAACCTAGGATCAGACAATGAATATCAGCACAAAATTCTGTTTCTCTAGTTTCAGGACGGGGAAATAAGTATGAATGGCGCACTgtggttgg < 2:288687/149‑1 (MQ=255)
aCGAACTAAGACCCCCGCACCGAAAGGTCCGGGGGGTTTTTTTGACCTTAAAAACATAACCGAGGAGCAGACAATGAATAACAGCACAAAATTCTGTTTCTCAAGATTCAGGACGGGGAACTAACTATGAATGGCGCACAGTGggtggt > 1:28959/1‑149 (MQ=255)
cGAACTAAGACCCCCGCACCGAAAGGTCCGGGGGGTTTTTTTGACCTTAAAAACATAACCGAGGAGCAGACAATGAATAACAGCACAAAATTCTGTTTCTCAAGATTCAGGACGGGGAACTAACTATGAATGGCGCACAGTGGGTGGTa > 1:885255/1‑149 (MQ=255)
gAACTAAGACCCCCGCACCGAAAGGTCCGGGGGGTTTTTTTGACCTTAAAAACATAACCGAGGAGCAGACAATGAATAACAGCACAAAATTCTGTTTCTCAAGATTCAGGACGGGGAACTAACTATGAATGGCGCACAGTGGGTGGTAc > 1:1339485/1‑149 (MQ=255)
gAACTAAGACCCCCGCACCGAAAGGTCCGGGGGGTTTTTTTGACCTTAAAAACATAACCGAGGAGCAGACAATGAATAACAGCACAAAATTCTGTTTCTCAAGATTCAGGACGGGGAACTAACTATGAATGGCGCACAGTGGGTGGTAc < 2:726506/149‑1 (MQ=255)
ccccGCACCGAAAGGTCCGGGGGGTTTTTTTGACCTTAAAAACATAACCGAGGAGCAGACAATGAATAACAGCACAAAATTCTGTTTCTCAAGATTCAGGACGGGGAACTAACTATGAATGGCGCGCAGTGGGTGGTACATGCGTTGCg > 2:1763341/1‑149 (MQ=255)
ccccGCACCGAAAGGTCCGGGGGGTTTTTTTGACCTTAAAAACATAACCGAGGAGCAGACAATGAATAACAGCACAAAATTCTGTTTCTCAAGATTCAGGAAGGGGAACTAACTATGAATGGCGCACAGTGGGTGGTTCATGCGTTGCg > 2:1793609/1‑149 (MQ=255)
cccGCACCGAAAGGTCCGGGGGGTTTTTTTGACCTTAAAAACATAACCGCGGAGCAGACAATGAATAACAGCCCAAAATTCTGTTTCTCAAGATTCAGGACGGGGAAGGAACTATGAATGGCGCACAGTGGGTGGTACATGCGTTGCgg > 1:383676/1‑149 (MQ=255)
ccGCACCGAAAGGTCCGGGGGGTTTTTTTGACCTTAAAAACATAGCCGAGGAGCTGACAATGAATAACAGCACAATTTTCTGTTTCTCAAGATTCTGGACGGGGAACTAAGTATGATTGGCGGACAGTGGGTGGTACATGCGTGGCggg > 2:1806482/1‑149 (MQ=255)
cGCACCGAAAGGTCCGGGGGGTTTTTTTGACCTTAAAAACATAACCGAGGAGCAGACAATGAATAACAGCACAAAATTCTGTTTCTCAAGATTCAGGACGGGGAACTAACTATGAATGGCGCACAGTGGGTGGTACATGCGTTGCGGGc < 1:1164335/149‑1 (MQ=255)
aCCGAAAGGTCCGGGGGGTTTTTTTGACCTTAAAAACATAACCGAGGAGCAGACAATGAATAACAGCACAAAATTCTGTTTCGCAAGATTCAGGACGGGGAACTAACTATGAATGGCGCACAGTGGCTGGTACATGCGTTGCGGGcaca > 2:126680/1‑149 (MQ=255)
ccGAAAGGTCCGGGGGGTTTTTTTGCCCTTAAAAACATAACCGAGGAGCAGACAATGAATAACAGCACAAAATTCTGTTTCTCAAGATTCAGGACGGGGAACTAACTATGAATGGCGCACAGTGGGTGGTACATGCGTTGCGGGCACAg > 2:1415205/1‑149 (MQ=255)
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cGAAAGGTCCGGGGGGTTTTTTTGACCTTAAAAACATAACCGAGGAGCAGACAATGAATAACAGCACAAAATTCTGTTTCTCAAGATTCAGGACGGGGAACTAACTATGAATGGCGCACAGGGGGTGTTACATGCGTTGGGGGCACAgg > 2:358268/1‑149 (MQ=255)
cGAAAGGTCCGGGGGGTTTTTTTGACCTTAAAAACATAACCGAGGAGCAGACAATGAATAACAGCACAAAATTCTGTTTCTAAAGATTCAGGACGGGGAACTAACTATGAATGGCGCACAGTGGGTGGTACATGCGTTGCGGGCACAgg < 2:1243476/149‑1 (MQ=255)
aaaGGTCCGGGGGGTTTTTTTGACCTTAAAAACATAACCGAGGAGCAGACAATGAATAACAGCACAAAATTCTGTTTCTCAAGATTCAGGACGGGGAACTAACTATGAATGGCGCACAGTGGGTGGTACATGCGTTGCGGGCACAGGgt > 1:261089/1‑149 (MQ=255)
aaaGGTCCGGGGGGTTTTTTTGACCTTAAAAACATAACCGAGGAGCAGACAATGAATAACAGCACAAAATTCTGTTTCTCAAGATTCAGGACGGGGAACTAACTATGAATGGCGCACAGTGGGCGGTACATGCGTTGCGGGCACAGGgt < 1:1262398/149‑1 (MQ=255)
ggTCCGGGGGGTTTTTTTGACCTTAAAAACATAACCGAGGAGCAGACAATGAATAACAGCACAAAATTCTGTTTCTCAAGATTCAGGACGGGGAACTAACTATGAATGGCGCACAGTGGGTGGTACATGCGTTGCGGGCACAGGGtgtg < 1:904164/149‑1 (MQ=255)
gTCCGGGGGGTTTTTTTGACCTTAAAACCATAACCGAGGAGCAGACAATGAATAACAGCACAAAATTCTGTTTCTCAAGAGTCAGGCCGGGGCACTAACTATGAATGGCGCACAGTGGGTGGTACATGCGTTGCGGGCACAGGGTGTGa > 1:188779/1‑149 (MQ=255)
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GACAGCCCTTCTACGAGTGATTAGCCTGGTCGTGATTAGCGTGGTGGTGATTATTATCCCACCGTGCGGGGCTGCACTTGGACGAGGAAAGGCTTAGAGATCAAGCCTTAACGAACTAAGACCCCCGCACCGAAAGGTCCGGGGGTTTTTTTTGACCTTAAAAACATAACCGAGGAGCAGACAATGAATAACAGCACAAAATTCTGTTTCTCAAGATTCAGGACGGGGAACTAACTATGAATGGCGCACAGTGGGTGGTACATGCGTTGCGGGCACAGGGTGTGA > NC_000913/3950324‑3950608
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| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 15 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
GATK/CNVnator alignment
N/A
