Sample Resequencing Stats

Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
ALE, Flask, Isolate Predicted Mutations Mean Coverage Total Reads Percent Mapped Mapped Reads Average Read Length
A4 F28 I3 R1 10 35.2 319432 24.6% 78580 50.8

Breseq alignment

BRESEQ :: Evidence
Predicted mutation
evidence seq id position mutation annotation gene description
RA minE 2,288,163 A→G L208L (CTA→CTG)  argE → acetylornithine deacetylase

Read alignment evidence...
  seq id position ref new freq score (cons/poly) reads annotation genes product
*minE2,288,1630AG100.0% 2323.2 / NA 766L208L (CTA→CTG) argEacetylornithine deacetylase
Reads supporting (aligned to +/- strand):  ref base A (0/0);  new base G (766/0);  total (766/0)

Only 100 of 766 total aligned reads displayed.

AGCGATCCAGCACGCGGAGTTAACGCTATCGAACTAATGCACGACGCCATCGGGCATATTTTGC  >  minE/2288128‑2288191
                                   |                            
aGCGATCCAGCATGCGGAGTTAACGCTATCGAACTGATGCACGACGCCATAGGGCATAttt     >  1:51272/1‑61 (MQ=255)
aGCGATCCAGCACGCGGAGTTAACGCTATCGAACTGATGc                          >  1:279436/1‑40 (MQ=255)
aGCGATCCAGCACGCGGAGTTAACGCTATCGAACTGATGCacgacg                    >  1:36454/1‑46 (MQ=255)
aGCGATCCAGCACGCGGAGTTAACGCTATCGAACTGATGCac                        >  1:146735/1‑42 (MQ=255)
aGCGATCCAGCACGCGGAGTTAACGCTATCGAACTGATGCACGACGcc                  >  1:45287/1‑48 (MQ=255)
aGCGATCCAGCACGCGGAGTTAACGCTATCGAACTGATGCACGACGCCa                 >  1:25561/1‑49 (MQ=255)
aGCGATCCAGCACGCGGAGTTAACGCTATCGAACTGATGCACGACGCCATAGGGCatatat     >  1:116248/1‑59 (MQ=255)
aGCGATCCAGCACGCGGAGTTAACGCTATCGAACTGATGCACGACGCCATAGGGCat         >  1:206238/1‑57 (MQ=255)
aGCGATCCAGCACGCGGAGTTAACGCTATCGAACTGATGCACGACGCCATAGGGCa          >  1:283759/1‑56 (MQ=255)
aGCGATCCAGCACGCGGAGTTAACGCTATCGAACTGATGCACGACGCCATAGGGCATAttt     >  1:285856/1‑61 (MQ=255)
aGCGATCCAGCACGCGGAGTTAACGCTATCGAACTGATGCACGACGCCATAGGGCATAttt     >  1:308241/1‑61 (MQ=255)
aGCGATCCAGCACGCGGAGTTAACGCTATCGAACTGATGCACGACGCCATAGGGCATAttt     >  1:303260/1‑61 (MQ=255)
aGCGATCCAGCACGCGGAGTTAACGCTATCGAACTGATGCACGACGCCATAGGGCATAttt     >  1:296721/1‑61 (MQ=255)
aGCGATCCAGCACGCGGAGTTAACGCTATCGAACTGATGCACGACGCCATAGGGCATAttt     >  1:3375/1‑61 (MQ=255)
aGCGATCCAGCACGCGGAGTTAACGCTATCGAACTGATGCACGACGCCATAGGGCATAttt     >  1:294794/1‑61 (MQ=255)
aGCGATCCAGCACGCGGAGTTAACGCTATCGAACTGATGCACGACGCCATAGGGCATAttt     >  1:292529/1‑61 (MQ=255)
aGCGATCCAGCACGCGGAGTTAACGCTATCGAACTGATGCACGACGCCATAGGGCATAttt     >  1:259519/1‑61 (MQ=255)
aGCGATCCAGCACGCGGAGTTAACGCTATCGAACTGATGCACGACGCCATAGGGCATAttt     >  1:260833/1‑61 (MQ=255)
aGCGATCCAGCACGCGGAGTTAACGCTATCGAACTGATGCACGACGCCATAGGGCATAttt     >  1:287763/1‑61 (MQ=255)
aGCGATCCAGCACGCGGAGTTAACGCTATCGAACTGATGCACGACGCCATAGGGCATAttt     >  1:284474/1‑61 (MQ=255)
aGCGATCCAGCACGCGGAGTTAACGCTATCGAACTGATGCACGACGCCATAGGGCATAttt     >  1:263454/1‑61 (MQ=255)
aGCGATCCAGCACGCGGAGTTAACGCTATCGAACTGATGCACGACGCCATAGGGCATAttt     >  1:281150/1‑61 (MQ=255)
aGCGATCCAGCACGCGGAGTTAACGCTATCGAACTGATGCACGACGCCATAGGGCATAttt     >  1:266556/1‑61 (MQ=255)
aGCGATCCAGCACGCGGAGTTAACGCTATCGAACTGATGCACGACGCCATAGGGCATAttt     >  1:277552/1‑61 (MQ=255)
aGCGATCCAGCACGCGGAGTTAACGCTATCGAACTGATGCACGACGCCATAGGGCATAttt     >  1:275475/1‑61 (MQ=255)
aGCGATCCAGCACGCGGAGTTAACGCTATCGAACTGATGCACGACGCCATAGGGCATAttt     >  1:271826/1‑61 (MQ=255)
aGCGATCCAGCACGCGGAGTTAACGCTATCGAACTGATGCACGACGCCATAGGGCATAttt     >  1:270835/1‑61 (MQ=255)
aGCGATCCAGCACGCGGAGTTAACGCTATCGAACTGATGCACGACGCCATAGGGCATAttt     >  1:270202/1‑61 (MQ=255)
aGCGATCCAGCACGCGGAGTTAACGCTATCGAACTGATGCACGACGCCATAGGGCATAttt     >  1:6607/1‑61 (MQ=255)
aGCGATCCAGCACGCGGAGTTAACGCTATCGAACTGATGCACGACGCCATAGGGCATAttt     >  1:100264/1‑61 (MQ=255)
aGCGATCCAGCACGCGGAGTTAACGCTATCGAACTGATGCACGACGCCATAGGGCATAttt     >  1:94082/1‑61 (MQ=255)
aGCGATCCAGCACGCGGAGTTAACGCTATCGAACTGATGCACGACGCCATAGGGCATAttt     >  1:9301/1‑61 (MQ=255)
aGCGATCCAGCACGCGGAGTTAACGCTATCGAACTGATGCACGACGCCATAGGGCATAttt     >  1:90049/1‑61 (MQ=255)
aGCGATCCAGCACGCGGAGTTAACGCTATCGAACTGATGCACGACGCCATAGGGCATAttt     >  1:85244/1‑61 (MQ=255)
aGCGATCCAGCACGCGGAGTTAACGCTATCGAACTGATGCACGACGCCATAGGGCATAttt     >  1:83260/1‑61 (MQ=255)
aGCGATCCAGCACGCGGAGTTAACGCTATCGAACTGATGCACGACGCCATAGGGCATAttt     >  1:7993/1‑61 (MQ=255)
aGCGATCCAGCACGCGGAGTTAACGCTATCGAACTGATGCACGACGCCATAGGGCATAttt     >  1:75562/1‑61 (MQ=255)
aGCGATCCAGCACGCGGAGTTAACGCTATCGAACTGATGCACGACGCCATAGGGCATAttt     >  1:73756/1‑61 (MQ=255)
aGCGATCCAGCACGCGGAGTTAACGCTATCGAACTGATGCACGACGCCATAGGGCATAttt     >  1:71665/1‑61 (MQ=255)
aGCGATCCAGCACGCGGAGTTAACGCTATCGAACTGATGCACGACGCCATAGGGCATAttt     >  1:68479/1‑61 (MQ=255)
aGCGATCCAGCACGCGGAGTTAACGCTATCGAACTGATGCACGACGCCATAGGGCATAttt     >  1:310598/1‑61 (MQ=255)
aGCGATCCAGCACGCGGAGTTAACGCTATCGAACTGATGCACGACGCCATAGGGCATAttt     >  1:64788/1‑61 (MQ=255)
aGCGATCCAGCACGCGGAGTTAACGCTATCGAACTGATGCACGACGCCATAGGGCATAttt     >  1:59880/1‑61 (MQ=255)
aGCGATCCAGCACGCGGAGTTAACGCTATCGAACTGATGCACGACGCCATAGGGCATAttt     >  1:5646/1‑61 (MQ=255)
aGCGATCCAGCACGCGGAGTTAACGCTATCGAACTGATGCACGACGCCATAGGGCATAttt     >  1:52727/1‑61 (MQ=255)
aGCGATCCAGCACGCGGAGTTAACGCTATCGAACTGATGCACGACGCCATAGGGCATAttt     >  1:49245/1‑61 (MQ=255)
aGCGATCCAGCACGCGGAGTTAACGCTATCGAACTGATGCACGACGCCATAGGGCATAttt     >  1:4318/1‑61 (MQ=255)
aGCGATCCAGCACGCGGAGTTAACGCTATCGAACTGATGCACGACGCCATAGGGCATAttt     >  1:41165/1‑61 (MQ=255)
aGCGATCCAGCACGCGGAGTTAACGCTATCGAACTGATGCACGACGCCATAGGGCATAttt     >  1:9653/1‑61 (MQ=255)
aGCGATCCAGCACGCGGAGTTAACGCTATCGAACTGATGCACGACGCCATAGGGCATAttt     >  1:31849/1‑61 (MQ=255)
aGCGATCCAGCACGCGGAGTTAACGCTATCGAACTGATGCACGACGCCATAGGGCATAttt     >  1:314675/1‑61 (MQ=255)
aGCGATCCAGCACGCGGAGTTAACGCTATCGAACTGATGCACGACGCCATAGGGCATAttt     >  1:134958/1‑61 (MQ=255)
aGCGATCCAGCACGCGGAGTTAACGCTATCGAACTGATGCACGACGCCATAGGGCATAttt     >  1:251891/1‑61 (MQ=255)
aGCGATCCAGCACGCGGAGTTAACGCTATCGAACTGATGCACGACGCCATAGGGCATAttt     >  1:174277/1‑61 (MQ=255)
aGCGATCCAGCACGCGGAGTTAACGCTATCGAACTGATGCACGACGCCATAGGGCATAttt     >  1:172153/1‑61 (MQ=255)
aGCGATCCAGCACGCGGAGTTAACGCTATCGAACTGATGCACGACGCCATAGGGCATAttt     >  1:168364/1‑61 (MQ=255)
aGCGATCCAGCACGCGGAGTTAACGCTATCGAACTGATGCACGACGCCATAGGGCATAttt     >  1:164578/1‑61 (MQ=255)
aGCGATCCAGCACGCGGAGTTAACGCTATCGAACTGATGCACGACGCCATAGGGCATAttt     >  1:162152/1‑61 (MQ=255)
aGCGATCCAGCACGCGGAGTTAACGCTATCGAACTGATGCACGACGCCATAGGGCATAttt     >  1:159372/1‑61 (MQ=255)
aGCGATCCAGCACGCGGAGTTAACGCTATCGAACTGATGCACGACGCCATAGGGCATAttt     >  1:155937/1‑61 (MQ=255)
aGCGATCCAGCACGCGGAGTTAACGCTATCGAACTGATGCACGACGCCATAGGGCATAttt     >  1:150379/1‑61 (MQ=255)
aGCGATCCAGCACGCGGAGTTAACGCTATCGAACTGATGCACGACGCCATAGGGCATAttt     >  1:148425/1‑61 (MQ=255)
aGCGATCCAGCACGCGGAGTTAACGCTATCGAACTGATGCACGACGCCATAGGGCATAttt     >  1:139334/1‑61 (MQ=255)
aGCGATCCAGCACGCGGAGTTAACGCTATCGAACTGATGCACGACGCCATAGGGCATAttt     >  1:178113/1‑61 (MQ=255)
aGCGATCCAGCACGCGGAGTTAACGCTATCGAACTGATGCACGACGCCATAGGGCATAttt     >  1:133210/1‑61 (MQ=255)
aGCGATCCAGCACGCGGAGTTAACGCTATCGAACTGATGCACGACGCCATAGGGCATAttt     >  1:13083/1‑61 (MQ=255)
aGCGATCCAGCACGCGGAGTTAACGCTATCGAACTGATGCACGACGCCATAGGGCATAttt     >  1:127703/1‑61 (MQ=255)
aGCGATCCAGCACGCGGAGTTAACGCTATCGAACTGATGCACGACGCCATAGGGCATAttt     >  1:122636/1‑61 (MQ=255)
aGCGATCCAGCACGCGGAGTTAACGCTATCGAACTGATGCACGACGCCATAGGGCATAttt     >  1:120988/1‑61 (MQ=255)
aGCGATCCAGCACGCGGAGTTAACGCTATCGAACTGATGCACGACGCCATAGGGCATAttt     >  1:114144/1‑61 (MQ=255)
aGCGATCCAGCACGCGGAGTTAACGCTATCGAACTGATGCACGACGCCATAGGGCATAttt     >  1:109680/1‑61 (MQ=255)
aGCGATCCAGCACGCGGAGTTAACGCTATCGAACTGATGCACGACGCCATAGGGCATAttt     >  1:108101/1‑61 (MQ=255)
aGCGATCCAGCACGCGGAGTTAACGCTATCGAACTGATGCACGACGCCATAGGGCATAttt     >  1:106507/1‑61 (MQ=255)
aGCGATCCAGCACGCGGAGTTAACGCTATCGAACTGATGCACGACGCCATAGGGCATAttt     >  1:103073/1‑61 (MQ=255)
aGCGATCCAGCACGCGGAGTTAACGCTATCGAACTGATGCACGACGCCATAGGGCATAttt     >  1:216323/1‑61 (MQ=255)
aGCGATCCAGCACGCGGAGTTAACGCTATCGAACTGATGCACGACGCCATAGGGCATAttt     >  1:250175/1‑61 (MQ=255)
aGCGATCCAGCACGCGGAGTTAACGCTATCGAACTGATGCACGACGCCATAGGGCATAttt     >  1:248268/1‑61 (MQ=255)
aGCGATCCAGCACGCGGAGTTAACGCTATCGAACTGATGCACGACGCCATAGGGCATAttt     >  1:246024/1‑61 (MQ=255)
aGCGATCCAGCACGCGGAGTTAACGCTATCGAACTGATGCACGACGCCATAGGGCATAttt     >  1:236704/1‑61 (MQ=255)
aGCGATCCAGCACGCGGAGTTAACGCTATCGAACTGATGCACGACGCCATAGGGCATAttt     >  1:227208/1‑61 (MQ=255)
aGCGATCCAGCACGCGGAGTTAACGCTATCGAACTGATGCACGACGCCATAGGGCATAttt     >  1:224131/1‑61 (MQ=255)
aGCGATCCAGCACGCGGAGTTAACGCTATCGAACTGATGCACGACGCCATAGGGCATAttt     >  1:221754/1‑61 (MQ=255)
aGCGATCCAGCACGCGGAGTTAACGCTATCGAACTGATGCACGACGCCATAGGGCATAttt     >  1:21949/1‑61 (MQ=255)
aGCGATCCAGCACGCGGAGTTAACGCTATCGAACTGATGCACGACGCCATAGGGCATAttt     >  1:181468/1‑61 (MQ=255)
aGCGATCCAGCACGCGGAGTTAACGCTATCGAACTGATGCACGACGCCATAGGGCATAttt     >  1:21019/1‑61 (MQ=255)
aGCGATCCAGCACGCGGAGTTAACGCTATCGAACTGATGCACGACGCCATAGGGCATAttt     >  1:201959/1‑61 (MQ=255)
aGCGATCCAGCACGCGGAGTTAACGCTATCGAACTGATGCACGACGCCATAGGGCATAttt     >  1:200239/1‑61 (MQ=255)
aGCGATCCAGCACGCGGAGTTAACGCTATCGAACTGATGCACGACGCCATAGGGCATAttt     >  1:197208/1‑61 (MQ=255)
aGCGATCCAGCACGCGGAGTTAACGCTATCGAACTGATGCACGACGCCATAGGGCATAttt     >  1:194159/1‑61 (MQ=255)
aGCGATCCAGCACGCGGAGTTAACGCTATCGAACTGATGCACGACGCCATAGGGCATAttt     >  1:190597/1‑61 (MQ=255)
aGCGATCCAGCACGCGGAGTTAACGCTATCGAACTGATGCACGACGCCATAGGGCATAttt     >  1:186029/1‑61 (MQ=255)
aGCGATCCAGCACGCGGAGTTAACGCTATCGAACTGATGCACGACGCCATAGGGCATAttt     >  1:182828/1‑61 (MQ=255)
aGCGATCCAGCACGCGGAGTTAACGCTATCGAACTGATGCACGACGCCATAGGGCATAtt      >  1:212691/1‑60 (MQ=255)
aGCGATCCAGCACGCGGAGTTAACGCTATCGAACTGATGCACGACGCCATAGGGCATAtt      >  1:78076/1‑60 (MQ=255)
aGCGATCCAGCACGCGGAGTTAACGCTATCGAACTGATGCACGACGCCATAGGGCATAtt      >  1:233129/1‑60 (MQ=255)
aGCGATCCAGCACGCGGAGTTAACGCTATCGAACTGATGCACGACGCCATAGGGCATAtt      >  1:239710/1‑60 (MQ=255)
aGCGATCCAGCACGCGGAGTTAACGCTATCGAACTGATGCACGACGCCATAGGGCATAtt      >  1:241385/1‑60 (MQ=255)
aGCGATCCAGCACGCGGAGTTAACGCTATCGAACTGATGCACGACGCCATAGGGCATAtt      >  1:37902/1‑60 (MQ=255)
aGCGATCCAGCACGCGGAGTTAACGCTATCGAACTGATGCACGACGCCATAGGGCACAttt     >  1:306930/1‑61 (MQ=255)
aGCGATCCAGCACGCGGAGTTAACGCTATCCAACTGATGCACGACGCCATAGGGCATAttt     >  1:152211/1‑61 (MQ=255)
                                   |                            
AGCGATCCAGCACGCGGAGTTAACGCTATCGAACTAATGCACGACGCCATCGGGCATATTTTGC  >  minE/2288128‑2288191

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑

GATK/CNVnator alignment

N/A