Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A1 F50 I1 R1
|
157 |
93.7 |
2947622 |
98.1% |
2891617 |
150.3 |
Breseq alignment
BRESEQ :: Evidence
|
| evidence |
seq id |
position |
mutation |
annotation |
gene |
description |
| RA |
NC_000913 |
3,086,618 |
A→G |
intergenic (+216/‑88) |
yqgC → / → metK |
uncharacterized protein/S‑adenosylmethionine synthetase |
|
| |
seq id |
position |
ref |
new |
freq |
score (cons/poly) |
reads |
annotation |
genes |
product |
| * | NC_000913 | 3,086,618 | 0 | A | G | 99.0%
| 381.3
/ ‑4.1
| 101 | intergenic (+216/‑88) | yqgC/metK | uncharacterized protein/S‑adenosylmethionine synthetase |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (0/1); new base G (44/56); total (44/57) |
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 |
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 5.49e-01 |
Only 100 of 101 total aligned reads displayed.
ATTGTCAGGAAAAATTTCCAGCCACGTTTTTAACAGAATGAGACACGATTCAAAAAAAAGTGGAAATAGGGTGAAGAATTGACCTAAAATAGCCATCCAGATGTTAATCCATCCATACCGATTAACACTCAGACTGCCAGTGTTTTTAACCTGCAGAGTCGTGGTAGGATCCGCTACCACAGAAAATCCACACAACAGTTTGAGCTAACCAAATTCTCTTTAGGTGATATTAAATATGGCAAAACACCTTTTTACGTCCGAGTCCGTCTCTGAAGGGCATCCTGACAAAATTGC > NC_000913/3086471‑3086764
|
aTTGTCAGGAAAAATTTCCAGCCACGTTTTTAACAGAATGAGACACGATTCAAAAAAAAGTGGAAATAGGGTGAAGAATTGACCTAAAATAGCCATCCAGATGTTAATCCATCCATACCGATTAACACTCAGACTGCCAGTGTTTTTGAcc > 1:159630/1‑151 (MQ=255)
gTCAGGAAAAATTTCCAGCCACGTTTTTAACAGAATGAGACACGATTCAAAAAAAAGTGGAAATAGGGTGAAGAATTGACCTAAAATAGCCATCCAGATGTTAATCCATCCATACCGATTAACACTCAGACTGCCAGTGTTTTTGACCTGc < 2:112946/151‑1 (MQ=255)
gAAAAATTTCCAGCCACGTTTTTAACAGAATGAGACACGATTCAAAAAAAAGTGGAAATAGGGTGAAGAATTGACCTAAAATAGCCATCCAGATGTTAATCCATCCATACCGATTAACACTCAGACTGCCAGTGTTTTTGACCTGCAGAGt > 1:54425/1‑151 (MQ=255)
gAAAAATTTCCAGCCACGTTTTTAACAGAATGAGACACGATTCAAAAAAAAGTGGAAATAGGGTGAAGAATTGACCTAAAATAGCCATCCAGATGTTAATCCATCCATACCGATTAACACTCAGACTGCCAGTGTTTTTGACCTGCAGAGt > 1:1317654/1‑151 (MQ=255)
aaaaaTTTCCAGCCACGTTTTTAACAGAATGAGACACGATTCAAAAAAAAGTGGAAATAGGGTGAAGAATTGACCTAAAATAGCCATCCAGATGTTAATCCATCCATACCGATTAACACTCAGACTGCCAGTGTTTTTGACCTGCAGAGTc > 2:621611/1‑151 (MQ=255)
aaaaTTTCCAGCCACGTTTTTAACAGAATGAGACACGATTCAAAAAAAAGTGGAAATAGGGTGAAGAATTGACCTAAAATAGCCATCCAGATGTTAATCCATCCATACCGATTAACACTCAGACTGCCAGTGTTTTTGACCTGCAGAGTCg > 1:787599/1‑151 (MQ=255)
aaTTTCCAGCCACGTTTTTAACAGAATGAGACACGATTCAAAAAAAAGTGGAAATAGGGTGAAGAATTGACCTAAAATAGCCATCCAGATGTTAATCCATCCATACCGATTAACACTCAGACTGCCAGTGTTTTTGACCTGCAGAGTCGTg < 1:467806/151‑1 (MQ=255)
ccAGCCACGTTTTTAACAGAATGAGCCACGATTCAAAAAAAAGTGGAAATAGGGTGAAGAATTGACCTAAAATAGCCATCCAGATGTTAATCCATCCATACCGATTAACACTCAGACTGCCAGTGTTTTTGACCTGCAGAGTCGTGGTAg < 1:446944/150‑1 (MQ=255)
gCCACGTTTTTAACAGAATGAGACACGATTCAAAAAAAAGTGGAAATAGGGTGAAGAATTGACCTAAAATAGCCATCCAGATGTTAATCCATCCATACCGATTAACACTCAGACTGCCAGTGTTTTTGACCTGCAGAGTCGTGGTAGGATc < 1:168940/151‑1 (MQ=255)
ccACGTTTTTAACAGAATGAGACACGATTCAAAAAAAAGTGGAAATAGGGTGAAGAATTGACCTAAAATAGCCATCCAGATGTTAATCCATCCATACCGATTAACACTCAGACTGCCAGTGTTTTTGACCTGCAGAGTCGTGGTAGGATcc < 1:483898/151‑1 (MQ=255)
tttttAACAGAATGAGACACGATTCAAAAAAAAGTGGAAATAGGGTGAAGAATTGACCTAAAATAGCCATCCAGATGTTAATCCATCCATACCGATTAACACTCAGACTGCCAGTGTTTTTGACCTGCAGAGTCGTGGTAGGATCCGCTAc > 2:908214/1‑151 (MQ=255)
aGAATGAGACACGATTCAAAAAAAAGTGGAAATAGGGTGAAGAATTGACCTAAAATAGCCATCCAGATGTTAATCCATCCATACCGATTAACACTCAGACTGCCAGTGTTTTTGACCTGCAGAGTCGTGGTAGGATCCGCTACCACAGaaa < 1:980416/151‑1 (MQ=255)
aGAATGAGACACGATTCAAAAAAAAGTGGAAATAGGGTGAAGAATTGACCTAAAATAGCCATCCAGATGTTAATCCATCCATACCGATTAACACTCAGACTGCCAGTGTTTTTGACCTGCAGAGTCGTGGTAGGATCCGCTACCACAGaa > 2:198380/1‑150 (MQ=255)
aTGAGACACGATTCAAAAAAAAGTGGAAATAGGGTGAAGAATTGACCTAAAATAGCCATCCAGATGTTAATCCATCCATACCGATTAACACTCAGACTGCCAGTGTTTTTGACCTGCAGAGTCGTGGTAGGATCCGCTACCACAGAAAATc < 2:159609/151‑1 (MQ=255)
aTGAGACACGATTCAAAAAAAAGTGGAAATAGGGTGAAGAATTGACCTAAAATAGCCATCCAGATGTTAATCCATCCATACCGATTAACACTCAGACTGCCAGTGTTTTTGACCTGCAGAGTCGTGGTAGGATCCGCTACCACAGAAAATc < 1:694664/151‑1 (MQ=255)
aTGAGACACGATTCAAAAAAAAGTGGAAATAGGGTGAAGAATTGACCTAAAATAGCCATCCAGATGTTAATCCATCCATACCGATTAACACTCAGACTGCCAGTGTTTTTGACCTGCAGAGTCGTGGTAGGATCCGCTACCACAGAAAATc < 1:1424522/151‑1 (MQ=255)
aTGAGACACGATTCAAAAAAAAGTGGAAATAGGGTGAAGAATTGACCTAAAATAGCCATCCAGATGTTAATCCATCCATACCGATTAACACTCAGACTGCCAGTGTTTTTGACCTGCAGAGTCGTGGTAGGATCCGCTACCACAGAAAATc > 1:36133/1‑151 (MQ=255)
tGAGACACGATTCAAAAAAAAGTGGAAATAGGGTGAAGAATTGACCTAAAATAGCCATCCAGATGTTAATCCATCCATACCGATTAACACTCAGACTGCCAGTGTTTTTGACCTGCAGAGTCGTGGTAGGATCCGCTACCACAGAAAATcc > 2:995019/1‑151 (MQ=255)
gagaCACGATTCAAAAAAAAGTGGAAATAGGGTGAAGAATTGACCTAAAATAGCCATCCAGATGTTAATCCATCCATACCGATTAACACTCAGACTGCCAGTGTTTTTGACCTGCAGAGTCGTGGTAGGATCCGCTACCACAGAAAATcc < 2:223758/150‑1 (MQ=255)
gagaCACGATTCAAAAAAAAGTGGAAATAGGGTGAAGAATTGACCTAAAATAGCCATCCAGATGTTAATCCATCCATACCGATTAACACTCAGACTGCCAGTGTTTTTGACCTGCAGAGTCGTGGTAGGATCCGCTACCACAGAAAATcc > 1:515345/1‑150 (MQ=255)
acacGATTCAAAAAAAAGTGGAAATAGGGTGAAGAATTGACCTAAAATAGCCATCCAGATGTTAATCCATCCATACCGATTAACACTCAGACTGCCAGTGTTTTTGACCTGCAGAGTCGTGGTAGGATCCGCTACCACAGAAAATCcacac > 1:735566/1‑151 (MQ=255)
cacGATTCAAAAAAAAGTGGAAATAGGGTGAAGAATTGACCTAAAATAGCCATCAAGATGTTAATCCATCCATACCGATTAACACTCAGACTGCCAGTGTTTTTGACCTGCAGAGTCGTGGTAGGATCCGCTACCACAGAAAATCcacac > 2:1265589/1‑150 (MQ=255)
cGATTCAAAAAAAAGTGGAAATAGGGTGAAGAATTGACCTAAAATAGCCATCCAGATGTTAATCCATCCATACCGATTAACACTCAGACTGCCAGTGTTTTTGACCTGCAGAGTCGTGGTAGGATCCGCTACCACAGAAAATCCACacaac < 2:890010/151‑1 (MQ=255)
cGATTCAAAAAAAAGTGGAAATAGGGTGAAGAATTGACCTAAAATAGCCATCCAGATGTTAATCCATCCATACCGATTAACACTCAGACTGCCAGTGTTTTTGACCTGCAGAGTCGTGGTAGGATCCGCTACCACAGAAAATCCACacaac > 1:173728/1‑151 (MQ=255)
cGATTCAAAAAAAAGTGGAAATAGGGTGAAGAATTGACCTAAAATAGCCATCCAGATGTTAATCCATCCATACCGATTAACACTCAGACTGCCAGTGTTTTTGACCTGCAGAGTCGTGGTAGGATCCGCTACCACAGAAAATCCACacaac > 1:701073/1‑151 (MQ=255)
aTTCAAAAAAAAGTGGAAATAGGGTGAAGAATTGACCTAAAATAGCCATCCAGATGTTAATCCATCCATACCGATTAACACTCAGACTGCCAGTGTTTTTGACCTGCAGAGTCGTGGTAGGATCCGCTACCACAGAAAATCCACacaaca < 1:962760/150‑1 (MQ=255)
aTTCAAAAAAAAGTGGAAATAGGGTGAAGAATTGACCTAAAATAGCCATCCAGATGTTAATCCATCCATACCGATTAACACTCAGACTGCCAGTGTTTTTGACCTGCAGAGTCGTGGTAGGATCCGCTACCACAGAAAATCCACacaac > 1:382749/1‑149 (MQ=255)
aTTCAAAAAAAAGTGGAAATAGGGTGAAGAATTGACCTAAAATAGCCATCCAGATGTTAATCCATCCATACCGATTAACACTCAGACTGCCAGTGTTTTTGACCTGCAGAGTCGTGGTAGGATCCGCTACCACAGAAAATCCACacaac > 1:1078920/1‑149 (MQ=255)
aTTCAAAAAAAAGTGGAAATAGGGTGAAGAATTGACCTAAAATAGCCATCCAGATGTTAATCCATCCATACCGATTAACACTCAGACTGCCAGTGTTTTTGACCTGCAGAGTCGTGGTAGGATCCGCTACCACAGAAAATCCACACAACAg < 1:1116417/151‑1 (MQ=255)
ttCAAAAAAAAGTGGAAATAGGGTGAAGAATTGACCTAAAATAGCCATCCAGATGTTAATCCATCCATACCGATTAACACTCAGACTGCCAGTGTTTTTGACCTGCAGAGTCGTGGTAGGATCCGCTACCACAGAAAATCCACACAACAGt > 1:1156334/1‑151 (MQ=255)
cAAAAAAAAGTGGAAATAGGGTGAAGAATTGACCTAAAATAGCCATCCAGATGTTAATCCATCCATACCGATTAACACTCAGACTGCCAGTGTTTTTGACCTGCAGAGTCGTGGTAGGATCCGCTACCACAGAAAATCCACACAACAGttt < 1:932153/151‑1 (MQ=255)
aaaaaaGTGGAAATAGGGTGAAGAATTGACCTAAAATAGCCATCCAGATGTTAATCCATCCATACCGATTAACACTCAGACTGCCAGTGTTTTTGACCTGCAGAGTCGTGGTAGGATCCGCTACCACAGAAAATCCACACAACAGTTTg > 1:452785/1‑149 (MQ=255)
aaaaaGTGGAAATAGGGTGAAGAATTGACCTAAAATAGCCATCCAGATGTTAATCCATCCATACCGATTAACACTCAGACTGCCAGTGTTTTTGACCTGCAGAGTCGTGGTAGGATCCGCTACCACAGAAAATCCACACAACAGTTTGAGc > 2:612095/1‑151 (MQ=255)
aaaaaGTGGAAATAGGGTGAAGAATTGACCTAAAATAGCCATCCAGATGTTAATCCATCCATACCGATTAACACTCAGACTGCCAGTGTTTTTGACCTGCAGAGTCGTGGTAGGATCCGCTACCACAGAAAATCCACACAACAGTTTGAGc > 2:856460/1‑151 (MQ=255)
aaaGTGGAAATAGGGTGAAGAATTGACCTAAAATAGCCATCCAGATGTTAATCCATCCATACCGATTAACACTCAGACTGCCAGTGTTTTTGACCTGCAGAGTCGTGGTAGGATCCGCTACCACAGAAAATCCACACAACAGTTTGAGCt > 1:624542/1‑150 (MQ=255)
aaGTGGAAATAGGGTGAAGAATTGACCTAAAATAGCCATCCAGATGTTAATCCATCCATACCGATTAACACTCAGACTGCCAGTGTTTTTGACCTGCAGAGTCGTGGTAGGATCCGCTACCACAGAAAATCCACACAACAGTTTGAGCTaa < 1:1289167/151‑1 (MQ=255)
aaGTGGAAATAGGGTGAAGAATTGACCTAAAATAGCCATCCAGATGTTAATCCATCCATACCGATTAACACTCAGACTGCCAGTGTTTTTGACCTGCAGAGTCGTGGTAGGATCCGCTACCACAGAAAATCCACACAACAGTTTGAGCTaa < 1:1216075/151‑1 (MQ=255)
aaGTGGAAATAGGGTGAAGAATTGACCTAAAATAGCCATCCAGATGTTAATCCATCCATACCGATTAACACTCAGACTGCCAGTGTTTTTGACCTGCAGAGTCGTGGTAGGATCCGCTACCACAGAAAATCCACACAACAGTTTGAGCTa > 1:1104407/1‑150 (MQ=255)
aGTGGAAATAGGGTGAAGAATTGACCTAAAATAGCCATCCAGATGTTAATCCATCCATACCGATTAACACTCAGACTGCCAGTGTTTTTGACCTGCAGAGTCGTGGTAGGATCCGCTACCACAGAAAATCCACACAACAGTTTGAGCTAAc > 1:1450540/1‑151 (MQ=255)
gTGGAAATAGGGTGAAGAATTGACCTAAAATAGCCATCCAGATGTTAATCCATCCATACCGATTAACACTCAGACTGCCAGTGTTTTTGACCTGCAGAGTCGTGGTAGGATCCGCTACCACAGAAAATCCACACAACAGTTTGAGCTAAcc < 2:422686/151‑1 (MQ=255)
tGGAAATAGGGTGAAGAATTGACCTAAAATAGCCATCCAGATGTTAATCCATCCATACCGATTAACACTCAGACTGCCAGTGTTTTTGACCTGCAGAGTCGTGGTAGGATCCGCTACCACAGAAAATCCACACAACAGTTTGAGCTAAcc > 2:1437140/1‑150 (MQ=255)
gAAATAGGGTGAAGAATTGACCTAAAATAGCCATCCAGAAGTTAATCCATCCATACCGATTAACACTCAGACTGCCAGTGTTTTTGACCTGCAGAGTCGTGGTAGGATCCGCTACCACAGAAAATCCACACAACAGTTTGAGCTAACCaaa < 2:114831/151‑1 (MQ=255)
aGGGTGAAGAATTGACCTAAAATAGCCATCCAGATGTTAATCCATCCATACCGATTAACACTCAGACTGCCAGTGTTTTTGACCTGCAGAGTCGTGGTAGGATCCGCTACCACAGAAAATCCACACAACAGTTTGAGCTAACCAAATtct < 1:936836/150‑1 (MQ=255)
gTGAAGAATTGACCTAAAATAGCCATCCAGATGTTAATCCATCCATACCGATTAACACTCAGACTGCCAGTGTTTTTGACCTGCAGAGTCGTGGTAGGATCCGCTACCACAGAAAATCCACACAACAGTTTGAGCTAACCAAATTCTCttt > 2:957651/1‑151 (MQ=255)
tGAAGAATTGACCTAAAATAGCCATCCAGATGTTAATCCATCCATACCGATTAACACTCAGACTGCCAGTGTTTTTGACCTGCAGAGTCGTGGTAGGATCCGCTACCACAGAAAATCCACACAACAGTTTGAGCTAACCAAATTCTCttt < 2:1096583/150‑1 (MQ=255)
gaagaaTTGACCTAAAATAGCCATCCAGATGTTAATCCATCCATACCGATTAACACTCAGACTGCCAGTGTTTTTGACCTGCAGAGTCGTGGTAGGATCCGCTACCACAGAAAATCCACACAACAGTTTGAGCTAACCAAATTCTCttt > 1:471247/1‑149 (MQ=255)
gaagaaTTGACCTAAAATAGCCATCCAGATGTTAATCCATCCATACCGATTAACACTCAGACTGCCAGTGTTTTTGACCTGCAGAGTCGTGGTAGGATCCGCTACCACAGAAAATCCACACAACAGTTTGAGCTAACCAAATTCTCTTTa < 2:1243823/150‑1 (MQ=255)
gaagaaTTGACCTAAAATAGCCATCCAGATGTTAATCCATCCATACCGATTAACACTCAGACTGCCAGTGTTTTTGACCTGCAGAGTCGTGGTAGGATCCGCTACCACAGAAAATCCACACAACAGTTTGAGCTAACCAAATTCTCTTTa < 2:1165735/150‑1 (MQ=255)
gaagaaTTGACCTAAAATAGCCATCCAGATGTTAATCCATCCATACCGATTAACACTCAGACTGCCAGTGTTTTTGACCTGCAGAGTCGTGGTAGGATCCGCTACCACAGAAAATCCACACAACAGTTTGAGCTAACCAAATTCTCTTTAg < 2:1369726/151‑1 (MQ=255)
aagaaTTGACCTAAAATAGCCATCCAGATGTTAATCCATCCATACCGATTAACACTCAGACTGCCAGTGTTTTTGACCTGCAGAGTCGTGGTAGGATCCGCTACCACAGAAAATCCACACAACAGTTTGAGCTAACCAAATTCTCTTTAgg < 2:936995/151‑1 (MQ=255)
aagaaTTGACCTAAAATAGCCATCCAGATGTTAATCCATCCATACCGATTAACACTCAGACTGCCAGTGTTTTTGACCTGCAGAGTCGTGGTAGGATCCGCTACCACAGAAAATCCACACAACAGTTTGAGCTAACCAAATTCTCTTTAgg > 1:1246591/1‑151 (MQ=255)
aaTTGACCTAAAATAGCCATCCAGATGTTAATCCATCCATACCGATTAACACTCAGACTGCCAGTGTTTTTGACCTGCAGAGTCGTGGTAGGATCCGCTACCACAGAAAATCCACACAACAGTTTGAGCTAACCAAATTCTCTTTAGGTg > 2:1264902/1‑150 (MQ=255)
aaTTGACCTAAAATAGCCATCCAGATGTTAATCCATCCATACCGATTAACACTCAGACTGCCAGTGTTTTTGACCTGCAGAGTCGTGGTAGGATCCGCTACCACAGAAAATCCACACAACAGTTTGAGCTAACCAAATTCTCTTTAGGTg < 1:755990/150‑1 (MQ=255)
tGACCTAAAATAGCCATCCAGATGTTAATCCATCCATACCGATTAACACTCAGACTGCCAGTGTTTTTGACCTGCAGAGTCGTGGTAGGATCCGCTACCACAGAAAATCCACACAACAGTTTGAGCTAACCAAATTCTCTTTAGGTGatat > 1:158384/1‑151 (MQ=255)
gACCTAAAATAGCCATCCAGATGTTAATCCATCCATACCGATTAACACTCAGACTGCCAGTGTTTTTGACCTGCAGAGTCGTGGTAGGATCCGCTACCACAGAAAATCCACACAACAGTTTGAGCTAACCAAATTCTCTTTAGGTGatat < 1:1424375/150‑1 (MQ=255)
gACCTAAAATAGCCATCCAGATGTTAATCCATCCATACCGATTAACACTCAGACTGCCAGTGTTTTTGACCTGCAGAGTCGTGGTAGGATCCGCTACCACAGAAAATCCACACAACAGTTTGAGCTAACCAAATTCTCTTTAGGTGATAtt < 2:962821/151‑1 (MQ=255)
ccTAAAATAGCCATCCAGATGTTAATCCATCCATACCGATTAACACTCAGACTGCCAGTGTTTTTGACCTGCAGAGTCGTGGTAGGATCCGCTACCACAGAAAATCCACACAACAGTTTGAGCTAACCAAATTCTCTTTAGGTGATATTaa < 2:770001/151‑1 (MQ=255)
ccTAAAATAGCCATCCAGATGTTAATCCATCCATACCGATTAACACTCAGACTGCCAGTGTTTTTGACCTGCAGAGTCGTGGTAGGATCCGCTACCACAGAAAATCCACACAACAGTTTGAGCTAACCAAATTCTCTTTAGGTGATATTaa < 1:6149/151‑1 (MQ=255)
ccTAAAATAGCCATCCAGATGTTAATCCATCCATACCGATTAACACTCAGACTGCCAGTGTTTTTGACCTGCAGAGTCGTGGTAGGATCCGCTACCACAGAAAATCCACACAACAGTTTGAGCTAACCAAATTCTCTTTAGGTGATATTaa < 1:1058065/151‑1 (MQ=255)
cTAAAATAGCCATCCAGATGTTAATCCATCCATACCGATTAACACTCAGACTGCCAGTGTTTTTGACCTGCAGAGTCGTGGTAGGATCCGCTACCACAGAAAATCCACACAACAGTTTGAGCTAACCAAATTCTCTTTAGGTGATATTaa > 2:643939/1‑150 (MQ=255)
aaaaTAGCCATCCAGATGTTAATCCATCCATACCGATTAACACTCAGACTGCCAGTGTTTTTGACCTGCAGAGTCGTGGTAGGATCCGCTACCACAGAAAATCCACACAACAGTTTGAGCTAACCAAATTCTCTTTAGGTGATATTAAat < 2:54418/150‑1 (MQ=255)
aaaaTAGCCATCCAGATGTTAATCCATCCATACCGATTAACACTCAGACTGCCAGTGTTTTTGACCTGCAGAGTCGTGGTAGGATCCGCTACCACAGAAAATCCACACAACAGTTTGAGCTAACCAAATTCTCTTTAGGTGATATTAAat > 1:661718/1‑150 (MQ=255)
aaaaTAGCCATCCAGATGTTAATCCATCCATACCGATTAACACTCAGACTGCCAGTGTTTTTAACCTGCAGAGTCGTGGTAGGATCCGCTACCACAGAAAATCCACACAACAGTTTGAGCTAACCAAATTCTCTTTAGGTGATATTAAat < 1:797461/150‑1 (MQ=255)
aaTAGCCATCCAGATGTTAATCCATCCATACCGATTAACACTCAGACTGCCAGTGTTTTTGACCTGCAGAGTCGTGGTAGGATCCGCTACCACAGAAAATCCACACAACAGTTTGAGCTAACCAAATTCTCTTTAGGTGATATTAAATATg > 2:440848/1‑151 (MQ=255)
aaTAGCCATCCAGATGTTAATCCATCCATACCGATTAACACTCAGACTGCCAGTGTTTTTGACCTGCAGAGTCGTGGTAGGATCCGCTACCACAGAAAATCCACACAACAGTTTGAGCTAACCAAATTCTCTTTAGGTGATATTAAATATg > 2:1407369/1‑151 (MQ=255)
aaTAGCCATCCAGATGTTAATCCATCCATACCGATTAACACTCAGACTGCCAGTGTTTTTGACCTGCAGAGTCGTGGTAGGATCCGCTACCACAGAAAATCCACACAACAGTTTGAGCTAACCAAATTCTCTTTAGGTGATATTAAATATg < 2:1135971/151‑1 (MQ=255)
aTAGCCATCCAGATGTTAATCCATCCATACCGATTAACACTCAGACTGCCAGTGTTTTTGACCTGCAGAGTCGTGGTAGGATCCGCTACCACAGAAAATCCACACAACAGTTTGAGCTAACCAAATTCTCTTTAGGTGATATTAAATATgg > 1:179282/1‑151 (MQ=255)
aTAGCCATCCAGATGTTAATCCATCCATACCGATTAACACTCAGACTGCCAGTGTTTTTGACCTGCAGAGTCGTGGTAGGATCCGCTACCACAGAAAATCCACACAACAGTTTGAGCTAACCAAATTCTCTTTAGGTGATATTAAATATgg < 2:1441040/151‑1 (MQ=255)
gCCATCCAGATGTTAATCCATCCATACCGATTAACACTCAGACTGCCAGTGTTTTTGACCTGCAGAGTCGTGGTAGGATCCGCTACCACAGAAAATCCACACAACAGTTTGAGCTAACCAAATTCTCTTTAGGTGATATTAAATATGGCaa < 2:392864/151‑1 (MQ=255)
ccATCCAGATGTTAATCCATCCATACCGATTAACACTCAGACTGCCAGTGTTTTTGACCTGCAGAGTCGTGGTAGGATCCGCTACCACAGAAAATCCACACAACAGTTTGAGCTAACCAAATTCTCTTTAGGTGATATTAAATATGGCaa > 2:505228/1‑150 (MQ=255)
cATCCAGATGTTAATCCATCCATACCGATTAACACTCAGACTGCCAGTGTTTTTGACCTGCAGAGTCGTGGTAGGATCCGCTACCACAGAAAATCCACACAACAGTTTGAGCTAACCAAATTCTCTTTAGGTGATATTAAATATGGCaaa > 1:751660/1‑150 (MQ=255)
aTCCAGATGTTAATCCATCCATACCGATTAACACTCAGACTGCCAGTGTTTTTGACCTGCAGAGTCGTGGTAGGATCCGCTACCACAGAAAATCCACACAACAGTTTGAGCTAACCAAATTCTCTTTAGGTGATATTAAATATGGCAAAac > 1:544688/1‑151 (MQ=255)
ccAGATGTTAATCCATCCATACCGATTAACACTCAGACTGCCAGTGTTTTTGACCTGCAGAGTCGTGGTAGGATCCGCTACCACAGAAAATCCACACAACAGTTTGAGCTAACCAAATTCTCTTTAGGTGATATTAAATATGGCAAAaca < 2:1275489/150‑1 (MQ=255)
aGATGTTAATCCATCCATACCGATTAACACTCAGACTGCCAGTGTTTTTGACCTGCAGAGTCGTGGTAGGATCCGCTACCACAGAAAATCCACACAACAGTTTGAGCTAACCAAATTCTCTTTAGGTGATATTAAATATGGCAAAACAccg < 2:1294939/151‑2 (MQ=255)
aGATGTTAATCCATCCATACCGATTAACACTCAGACTGCCAGTGTTTTTGACCTGCAGAGTCGTGGTAGGATCCGCTACCACAGAAAATCCACACAACAGTTTGAGCTAACCAAATTCTCTTTAGGTGATATTAAATATGGCAAAACACCt < 1:159462/151‑1 (MQ=255)
aTGTTAATCCATCCATACCGATTAACACTCAGACTGCCAGTGTTTTTGACCTGCAGAGTCGTGGTAGGATCCGCTACCACAGAAAATCCACACAACAGTTTGAGCTAACCAAATTCTCTTTAGGTGATATTAAATATGGCAAAACACCttt < 1:992883/151‑1 (MQ=255)
gTTAATCCATCCATACCGATTAACACTCAGACTGCCAGTGTTTTTGACCTGCAGAGTCGTGGTAGGATCCGCTACCACAGAAAATCCACACAACAGTTTGAGCTAACCAAATTCTCTTTAGGTGATATTAAATATGGCAAAACACCttttt < 1:836766/151‑1 (MQ=255)
aaTCCATCCATACCGATTAACACTCAGACTGCCAGTGTTTTTGACCTGCAGAGTCGTGGTAGGATCCGCTACCACAGAAAATCCACACAACAGTTTGAGCTAACCAAATTCTCTTTAGGTGATATTAAATATGGCAAAACACCTTTTTAc < 1:664331/150‑1 (MQ=255)
aaTCCATCCATACCGATTAACACTCAGACTGCCAGTGTTTTTGACCTGCAGAGTCGTGGTAGGATCCGCTACCACAGAAAATCCACACAACAGTTTGAGCTAACCAAATTCTCTTTAGGTGATATTAAATATGGCAAAACACCTTTTTACg < 2:930872/151‑1 (MQ=255)
atccatccATACCGATTAACACTCAGACTGCCAGTGTTTTTGACCTGCAGAGTCGTGGTAGGATCCGCTACCACAGAAAATCCACACAACAGTTTGAGCTAACCAAATTCTCTTTAGGTGATATTAAATATGGCAAAACACCTTTTTAc > 1:536017/1‑149 (MQ=255)
tccatccaTACCGATTAACACTCAGACTGCCAGTGTTTTTGACCTGCAGAGTCGTGGTAGGATCCGCTACCACAGAAAATCCACACAACAGTTTGAGCTAACCAAATTCTCTTTAGGTGATATTAAATATGGCAAAACACCTTTTTACGTc > 2:1289628/1‑151 (MQ=255)
catccatACCGATTAACACTCAGACTGCCAGTGTTTTTGACCTGCAGAGTCGTGGTAGGATCCGCTACCACAGAAAATCCACACAACAGTTTGAGCTAACCAAATTCTCTTTAGGTGATATTAAATATGGCAAAACACCTTTTTACGTCCg < 1:723875/151‑1 (MQ=255)
ccatACCGATTAACACTCAGACTGCCAGTGTTTTTGACCTGCAGAGTCGTGGTAGGATCCGCTACCACAGAAAATCCACACAACAGTTTGAGCTAACCAAATTCTCTTTAGGTGATATTAAATATGGCAAAACACCTTTTTACGTCCGAGt < 1:991098/151‑1 (MQ=255)
tACCGATTAACACTCAGACTGCCAGTGTTTTTGACCTGCAGAGTCGTGGTAGGATCCGCTACCACAGAAAATCCACACAACAGTTTGAGCTAACCAAATTCTCTTTAGGTGATATTAAATATGGCAAAACACCTTTTTACGTCCGAGTCCg > 1:950687/1‑151 (MQ=255)
gATTAACACTCAGACTGCCAGTGTTTTTGACCTGCAGAGTCGTGGTAGGATCCGCTACCACAGAAAATCCACACAACAGTTTGAGCTAACCAAATTCTCTTTAGGTGATATTAAATATGGCAAAACACCTTTTTACGTCCGAGTCCGtctc < 2:1226056/151‑1 (MQ=255)
cacTCAGACTGCCAGTGTTTTTGACCTGCAGAGTCGTGGTAGGATCCGCTACCACAGAAAATCCACACAACAGTTTGAGCTAACCAAATTCTCTTTAGGTGATATTAAATATGGCAAAACACCTTTTTACGTCCGAGTCCGTCTCTGAAgg < 1:671299/151‑1 (MQ=255)
cacTCAGACTGCCAGTGTTTTTGACCTGCAGAGTCGTGGTAGGATCCGCTACCACAGAAAATCCACACAACAGTTTGAGCTAACCAAATTCTCTTTAGGTGATATTAAATATGGCAAAACACCTTTTTACGTCCGAGTCCGTCTCTGAAgg < 1:198402/151‑1 (MQ=255)
cacTCAGACTGCCAGTGTTTTTGACCTGCAGAGTCGTGGTAGGATCCGCTACCACAGAAAATCCACACAACAGTTTGAGCTAACCAAATTCTCTTTAGGTGATATTAAATATGGCAAAACACCTTTTTACGTCCGAGTCCGTCTCTGAAgg < 1:624725/151‑1 (MQ=255)
cacTCAGACTGCCAGTGTTTTTGACCTGCAGAGTCGTGGTAGGATCCGCTACCACAGAAAATCCACACAACAGTTTGAGCTAACCAAATTCTCTTTAGGTGATATTAAATATGGCAAAACACCTTTTTACGTCCGAGTCCGTCTCTGAAgg < 2:787521/151‑1 (MQ=255)
cAGACTGCCAGTGTTTTTGACCTGCAGAGTCGTGGTAGGATCCGCTACCACAGAAAATCCACACAACAGTTTGAGCTAACCAAATTCTCTTTAGGTGATATTAAATATGGCAAAACACCTTTTTACGTCCGAGTCCGTCTCTGAAGGGCa < 1:612168/150‑1 (MQ=255)
cAGACTGCCAGTGTTTTTGACCTGCAGAGTCGTGGTAGGATCCGCTACCACAGAAAATCCACACAACAGTTTGAGCTAACCAAATTCTCTTTAGGTGATATTAAATATGGCAAAACACCTTTTTACGTCCGAGTCCGTCTCTGAAGGGCa < 1:767135/150‑1 (MQ=255)
cTGCCAGTGTTTTTGCCCTGCAGAGTCGTGCTAGGATCCGCTACCACAGAAAATCCACACAACAGTTTGAGCTAACCTAATTCTCTTTATGTGATATTAAATATGGCAAAACTCCTTTTTACGTCCGAGTCCGTCTCTGAAGGGCATCCt < 2:1168150/150‑1 (MQ=255)
gCCAGTGTTTTTGACCTGCAGAGTCGTGGTAGGATCCGCTACCACAGAAAATCCACACAACAGTTTGAGCTAACCAAATTCTCTTTAGGTGATATTAAATATGGCAAAACACCTTTTTACGTCCGAGTCCGTCTCTGAAGGGCATCCTg < 1:1423535/149‑1 (MQ=255)
ccAGTGTTTTTGACCTGCAGAGTCGTGGTAGGATCCGCTACCACAGAAAATCCACACAACAGTTTGAGCTAACCAAATTCTCTTTAGGTGATATTAAATATGGCAAAACACCTTTTTACGTCCGAGTCCGTCTCTGAAGGGCATCCTGAc > 2:592771/1‑150 (MQ=255)
ccAGTGTTTTTGACCTGCAGAGTCGTGGTAGGATCCGCTACCACAGAAAATCCACACAACAGTTTGAGCTAACCAAATTCTCTTTAGGTGATATTAAATATGGCAAAACACCTTTTTACGTCCGAGTCCGTCTCTGAAGGGCATCCTGACa < 1:1023093/151‑1 (MQ=255)
cAGTGTTTTTGACCTGCAGAGTCGTGGTAGGATCCGCTACCACAGAAAATCCACACAACAGTTTGAGCTAACCAAATTCTCTTTAGGTGATATTAAATATGGCAAAACACCTTTTTACGTCCGAGTCCGTCTCTGAAGGGCATCCTGACaa < 1:702739/151‑1 (MQ=255)
aGTGTTTTTGACCTGCAGAGTCGTGGTAGGATCCGCTACCACAGAAAATCCACACAACAGTTTGAGCTAACCAAATTCTCTTTAGGTGATATTAAATATGGCAAAACACCTTTTTACGTCCGAGTCCGTCTCTGAAGGGCATCCTGACaa > 1:69507/1‑150 (MQ=255)
aGTGTTTTTGACCTGCAGAGTCGTGGTAGGATCCGCTACCACAGAAAATCCACACAACAGTTTGAGCTAACCAAATTCTCTTTAGGTGATATTAAATATGGCAAAACACCTTTTTACGTCCGAGTCCGTCTCTGAAGGGCATCCTGACaa > 1:1242560/1‑150 (MQ=255)
gtTTTTGACCTGCAGAGTCGTGGTAGGATCCGCTACCACAGAAAATCCACACAACAGTTTGAGCTAACCAAATTCTCTTTAGGTGATATTAAATATGGCAAAACACCTTTTTACGTCCGAGTCCGTCTCTGAAGGGCATCCTGACAAAAtt < 2:700993/151‑1 (MQ=255)
ttttGACCTGCAGAGTCGTGGTAGGATCCGCTACCACAGAAAATCCACACAACAGTTTGAGCTAACCAAATTCTCTTTAGGTGATATTAAATATGGCAAAACACCTTTTTACGTCCGAGTCCGTCTCTGAAGGGCATCCTGACAAAATTGc > 1:1434765/1‑151 (MQ=255)
|
ATTGTCAGGAAAAATTTCCAGCCACGTTTTTAACAGAATGAGACACGATTCAAAAAAAAGTGGAAATAGGGTGAAGAATTGACCTAAAATAGCCATCCAGATGTTAATCCATCCATACCGATTAACACTCAGACTGCCAGTGTTTTTAACCTGCAGAGTCGTGGTAGGATCCGCTACCACAGAAAATCCACACAACAGTTTGAGCTAACCAAATTCTCTTTAGGTGATATTAAATATGGCAAAACACCTTTTTACGTCCGAGTCCGTCTCTGAAGGGCATCCTGACAAAATTGC > NC_000913/3086471‑3086764
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
GATK/CNVnator alignment
N/A
