Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A3 F50 I3 R1
|
160 |
117.2 |
4331776 |
85.4% |
3699336 |
149.7 |
Breseq alignment
BRESEQ :: Evidence
|
| evidence |
seq id |
position |
mutation |
annotation |
gene |
description |
| RA |
NC_000913 |
2,712,443 |
A→G |
W108R (TGG→CGG) |
trmN ← |
tRNA1(Val) (adenine(37)‑N6)‑methyltransferase |
|
| |
seq id |
position |
ref |
new |
freq |
score (cons/poly) |
reads |
annotation |
genes |
product |
| * | NC_000913 | 2,712,443 | 0 | A | G | 100.0%
| 382.0
/ NA
| 96 | W108R (TGG→CGG) | trmN | tRNA1(Val) (adenine(37)‑N6)‑methyltransferase |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (0/0); new base G (56/40); total (56/40) |
CGCCGCACAGGTCAGCAACGATGGGTGATCAAGCGTAGTGGTATAGCGAGCCTGTTCCCGTTGAGGTGTCGAGCACTCTACTCCCTGCTGATAGTAAGGTGGGTTACTGATGATTAAATCGAAGCGTACTGTCTGCTGTGTGATCCACTGCTGAATATCCGCCGTATGGACGTTAATCCGCTCTGCCCACGGGGACTGGTTGATATTTTCCTGCGCCTGCGCGGCAGCTTCACTTTCCAGTTCAACTGCATCAATCATCACGCTGTCATCGGTTCGCTGCGCCAGCATT > NC_000913/2712297‑2712585
|
cgccgcACAGGTCAGCAACGATGGGTGATCAAGCGTAGTGGTATAGCGAGCCTGTTCCCGTTGAGGTGTCGAGCACTCTACTCCCTGCTGATAGTAAGGTGGGTTACTGATGATTAAATCGAAGCGTACTGTCTGCTGTGTGATCCGctgc < 4:76410/151‑1 (MQ=255)
cgccgcACAGGTCAGCAACGATGGGTGATCAAGCGTAGTGGTATAGCGAGCCTGTTCCCGTTGAGGTGTCGAGCACTCTACTCCCTGCTGATAGTAAGGTGGGTTACTGATGATTAAATCGAAGCGTACTGTCTGCTGTGTGATCCGctgc < 2:567606/151‑1 (MQ=255)
cgccgcACAGGTCAGCAACGATGGGTGATCAAGCGTAGTGGTATAGCGAGCCTGTTCCCGTTGAGGTGTCGAGCACTCTACTCCCTGCTGATAGTAAGGTGGGTTACTGATGATTAAATCGAAGCGTACTGTCTGCTGTGTGATCCGctgc > 2:487748/1‑151 (MQ=255)
cgccgcACAGGTCAGCAACGATGGGTGATCAAGCGTAGTGGTATAGCGAGCCTGTTCCCGTTGAGGTGTCGAGCACTCTACTCCCTGCTGATAGTAAGGTGGGTTACTGATGATTAAATCGAAGCGTACTGTCTGCTGTGTGATCCGctgc > 2:254743/1‑151 (MQ=255)
gccgcACAGGTCAGCAACGATGGGTGATCAAGCGTAGTGGTATAGCGAGCCTGTTCCCGTTGAGGTGTCGAGCACTCTACTCCCTGCTGATAGTAAGGTGGGTTACTGATGATTAAATCGAAGCGTACTGTCTGCTGTGTGATCCgctgct > 3:370238/1‑151 (MQ=255)
cgcACAGGTCAGCAACGATGGGTGATCAAGCGTAGTGGTATAGCGAGCCTGTTCCCGTTGAGGTGTCGAGCACTCTACTCCCTGCTGATAGTAAGGTGGGTTACTGATGATTAAATCGAAGCGTACTGTCTGCTGTGTGATCCGctgctg > 4:1333914/1‑150 (MQ=255)
caGGTCAGCAACGATGGGTGATCAAGCGTAGTGGTATAGCGAGCCTGTTCCCGTTGAGGTGTCGAGCACTCTACTCCCTGCTGATAGTAAGGTGGGTTACTGATGATTAAATCGAAGCGTACTGTCTGCTGTGTGATCCGCTGCTGAatat > 2:1518488/1‑151 (MQ=255)
caGGTCAGCAACGATGGGTGATCAAGCGTAGTGGTATAGCGAGCCTGTTCCCGTTGAGGTGTCGAGCACTCTACTCCCTGCTGATAGTAAGGTGGGTTACTGATGATTAAATCGAAGCGTACTGTCTGCTGTGTGATCCGCTGCTGAata < 1:24142/150‑1 (MQ=255)
cAGCAACGATGGGTGATCAAGCGTAGTGGTATAGCGAGCCTGTTCCCGTTGAGGTGTCGAGCACTCTACTCCCTGCTGATAGTAAGGTGGGTTACTGATGATTAAATCGAAGCGTACTGTCTGCTGTGTGATCCGCTGCTGAATATccgcc < 2:601394/151‑1 (MQ=255)
cAGCAACGATGGGTGATCAAGCGTAGTGGTATAGCGAGCCTGTTCCCGTTGAGGTGTCGAGCACTCTACTCCCTGCTGATAGTAAGGTGGGTTACTGATGATTAAATCGAAGCGTACTGTCTGCTGTGTGATCCGCTGCTGAATATccgc < 1:105981/150‑1 (MQ=255)
cAGCAACGATGGGTGATCAAGCGTAGTGGTATAGCGAGCCTGTTCCCGTTGAGGTGTCGAGCACTCTACTCCCTGCTGATAGTAAGGTGGGTTACTGATGATTAAATCGAAGCGTACTGTCTGCTGTGTGATCCGCTGCTGAATATccgc < 4:407544/150‑1 (MQ=255)
cAGCAACGATGGGTGATCAAGCGTAGTGGTATAGCGAGCCTGTTCCCGTTGAGGTGTCGAGCACTCTACTCCCTGCTGATAGTAAGGTGGGTTACTGATGATTAAATCGAAGCGTACTGTCTGCTGTGTGATCCGCTGCTGAATATccgc < 3:369523/150‑1 (MQ=255)
gCAACGATGGGTGATCAAGCGTAGTGGTATAGCGAGCCTGTTCCCGTTGAGGTGTCGAGCACTCTACTCCCTGCTGATAGTAAGGTGGGTTACTGATGATTAAATCGAAGCGTACTGTCTGCTGTGTGATCCGCTGCTGAATATCCGCCGt > 4:646912/1‑151 (MQ=255)
cAACGATGGGTGATCAAGCGTAGTGGTATAGCGAGCCTGTTCCCGTTGAGGTGTCGAGCACTCTACTCCCTGCTGATAGTAAGGTGGGTTACTGATGATTAAATCGAAGCGTACTGTCTGCTGTGTGATCCGCTGCTGAATATCCGCCGt > 2:814318/1‑150 (MQ=255)
aaCGATGGGTGATCAACCGTAGTGGTATAGCGAGCCTGTTCCCGTTGAGGTGTCGAGCACTCTACTCCCTGCTGATAGTAAGGCGGGTTACTGATGATTAAATCGAAGCGTACTGTCTGCTGTGTGATCCGCTGCTGAATATCCGCCGTAt > 2:1340109/1‑151 (MQ=255)
aCGATGGGTGATCAAGCGTAGTGGTATAGCGAGCCTGTTCCCGTTGAGGTGTCGAGCACTCTACTCCCTGCTGATAGTAAGGTGGGTTACTGATGATTAAATCGAAGCGTACTGTCTGCTGTGTGATCCGCTGCTGAATATCCGCCGTATg > 4:435355/1‑151 (MQ=255)
gATGGGTGATCAAGCGTAGTGGTATAGCGAGCCTGTTCCCGTTGAGGTGTCGAGCACTCTACTCCCTGCTGATAGTAAGGTGGGTTACTGATGATTAAATCGAAGCGTACTGTCTGCTGTGTGATCCGCTGCTGAATATCCGCCGTATgg > 2:1606362/1‑150 (MQ=255)
tCAAGCGTAGTGGTATAGCGAGCCTGTTCCCGTTGAGGTGTCGAGCACTCTACTCCCTGCTGATAGTAAGGTGGGTTACTGATGATTAAATCGAAGCGTACTGTCTGCTGTGTGATCCGCTGCTGAATATCCGCCGTATGGACGTTAATcc > 2:1135201/1‑151 (MQ=255)
cAAGCGTAGTGGTATAGCGAGCCTGTTCCCGTTGAGGTGTCGAGCACTCTACTCCCTGCTGATAGTAAGGTGGGTTACTGATGATTAAATCGAAGCGTACTGTCTGCTGTGTGATCCGCTGCTGAATATCCGCCGTATGGACGTTAATCCg > 2:386189/1‑151 (MQ=255)
aaGCGTAGTGGTATAGCGAGCCTGTTCCCGTTGAGGTGTCGAGCACTCTACTCCCTGCTGATAGTAAGGTGGGTTACTGATGATTAAATCGAAGCGTACTGTCTGCTGTGTGATCCGCTGCTGAATATCCGCCGTATGGACGTTAATCCGc > 4:896440/1‑151 (MQ=255)
aaGCGTAGTGGTATAGCGAGCCTGTTCCCGTTGAGGTGTCGAGCACTCTACTCCCTGCTGATAGTAAGGTGGGTTACTGATGATTAAATCGAAGCGTACTGTCTGCTGTGTGATCCGCTGCTGAATATCCGCCGTATGGACGTTAATCCGc > 2:408466/1‑151 (MQ=255)
aGCGTAGTGGTATAGCGAGCCTGTTCCCGTTGAGGTGTCGAGCACTCTACTCCCTGCTGATAGTAAGGTGGGTTACTGATGATTAAATCGAAGCGTACTGTCTGCTGTGTGATCCGCTGCTGAATATCCGCCGTATGGACGTTAATCCGc > 4:1377283/1‑150 (MQ=255)
gCGTAGTGGTATAGCGAGCCTGTTCCCGTTGAGGTGTCGAGCACTCTACTCCCTGCTGATAGTAAGGTGGGTTACTGATGATTAAATCGAAGCGTACTGTCTGCTGTGTGATCCGCTGCTGAATATCCGCCGTATGGACGTTAATCCGctc > 4:647752/1‑151 (MQ=255)
tAGTGGTATAGCGAGCCTGTTCCCGTTGAGGTGTCGAGCACTCTACTCCCTGCTGATAGTAAGGTGGGTTACTGATGATTAAATCGAAGCGTACTGTCTGCTGTGTGATCCGCTGCTGAATATCCGCCGTATGGACGTTAATCCGCTCTGc > 2:58607/1‑151 (MQ=255)
tGGTATAGCGAGCCTGTTCCCGTTGAGGTGTCGAGCACTCTACTCCCTGCTGATAGTAAGGTGGGTTACTGATGATTAAATCGAAGCGTACTGTCTGCTGTGTGATCCGCTGCTGAATATCCGCCGTATGGACGTTAATCCGCTCTGccc > 2:1179261/1‑150 (MQ=255)
ataGCGAGCCTGTTCCCGTTGAGGTGTCGAGCACTCTACTCCCTGCTGATAGTAAGGTGGGTTACTGATGATTAAATCGAAGCGTACTGTCTGCTGTGTGATCCGCTGCTGAATATCCGCCGTATGGACGTTAATCCGCTCTGCCCACggg < 4:1474515/151‑1 (MQ=255)
ataGCGAGCCTGTTCCCGTTGAGGTGTCGAGCACTCTACTCCCTGCTGATAGTAAGGTGGGTTACTGATGATTAAATCGAAGCGTACTGTCTGCTGTGTGATCCGCTGCTGAATATCCGCCGTATGGACGTTAATCCGCTCTGCCCACggg < 4:1522605/151‑1 (MQ=255)
ataGCGAGCCTGTTCCCGTTGAGGTGTCGAGCACTCTACTCCCTGCTGATAGTAAGGTGGGTTACTGATGATTAAATCGAAGCGTACTGTCTGCTGTGTGATCCGCTGCTGAATATCCGCCGTATGGACGTTAATCCGCTCTGCCCACggg > 2:1480747/1‑151 (MQ=255)
aGCGAGCCTGTTCCCGTTGAGGTGTCGAGCACTCTACTCCCTGCTGATAGTAAGGTGGGTTACTGATGATTAAATCGAAGCGTACTGTCTGCTGTGTGATCCGCTGCTGAATATCCGCCGTATGGACGTTAATCCGCTCTGCCCACgggg < 2:848561/150‑1 (MQ=255)
tgAGCCTGTTCCCGTTGAGGTGTCGAGCACTCTACTCCCTGCTGATAGTAAGGTGGGTTACTGATGATTAAATCGAAGCGTACTGTCTGCTGTGTGATCCGCTGCTGAATATCCGCCGTATGGACGTTAATCCGCTCTGCCCACGGGGACt > 2:616933/2‑151 (MQ=255)
gAGCCTGTTCCCGTTGAGGTGGCGAGCACTCTGCTCCCTGCTGATAGTAAGGTGGGTTACTGATGATTAAATCGAAGCGTACTGCCTGCTGCGTGATCCGCTGCTGAATATTCGCCGTATGGACGCTAATCCGCTCTGCCTACGGGGACTg > 1:296022/1‑151 (MQ=255)
tGTTCCCGTTGAGGTGTCGAGCACTCTACTCCCTGCTGATAGTAAGGTGGGTTACTGATGATTAAATCGAAGCGTACTGTCTGCTGTGTGATCCGCTGCTGAATATCCGCCGTATGGACGTTAATCCGCTCTGCCCACGGGGACTGGTTg > 1:341616/1‑150 (MQ=255)
ttCCCGTTGAGGTGTCGAGCACTCTACTCCCTGCTGATAGTAAGGTGGGTTACTGATGATTAAATCGAAGCGTACTGTCTGCTGTGTGATCCGCTGCTGAATATCCGCCGTATGGACGTTAATCCGCTCTGCCCACGGGGACTGGTTGat > 4:210572/1‑150 (MQ=255)
tCCCGTTGAGGTGTCGAGCACTCTACTCCCTGCTGATAGTAAGGTGGGTTACTGATGATTAAATCGAAGCGTACTGTCTGCTGTGTGATCCGCTGCTGAATATCCGCCGTATGGACGTTAATCCGCTCTGCCCACGGGGACTGGTTGatat > 2:782869/1‑151 (MQ=255)
ccGTTGAGGTGTCGAGCACTCTACTCCCTGCTGATAGTAAGGTGGGTTACTGATGATTAAATCGAAGCGTACTGTCTGCTGTGTGATCCGCTGCTGAATATCCGCCGTATGGACGTTAATCCGCTCTGCCCACGGGGACTGGTTGATAttt < 4:426363/151‑1 (MQ=255)
cGTTGAGGTGTCGAGCACTCTACTCCCTGCTGATAGTAAGGTGGGTTACTGATGATTAAATCGAAGCGTACTGTCTGCTGTGTGATCCGCTGCTGAATATCCGCCGTATGGACGTTAATCCGCTCTGCCCACGGGGACTGGTTGATAtttt < 4:682644/151‑1 (MQ=255)
cGTTGAGGTGTCGAGCACTCTACTCCCTGCTGATAGTAAGGTGGGTTACTGATGATTAAATCGAAGCGTACTGTCTGCTGTGTGATCCGCTGCTGAATATCCGCCGTATGGACGTTAATCCGCTCTGCCCACGGGGACTGGTTGATAtttt > 3:145319/1‑151 (MQ=255)
tGAGGTGTCGAGCACTCTACTCCCTGCTGATAGTAAGGTGGGTTACTGATGATTAAATCGAAGCGTACTGTCTGCTGTGTGATCCGCTGCTGAATATCCGCCGTATGGACGTTAATCCGCTCTGCCCACGGGGACTGGTTGATATTTTcct > 2:124247/1‑151 (MQ=255)
aGGTGTCGAGCACTCTACTCCCTGCTGATAGTAAGGTGGGTTACTGATGATTAAATCGAAGCGTACTGTCTGCTGTGTGATCCGCTGCTGAATATCCGCCGTATGGACGTTAATCCGCTCTGCCCACGGGGACTGGTTGATATTTTcctgc < 4:498699/151‑1 (MQ=255)
ggTGTCGAGCACTCTACTCCCTGCTGATAGTAAGGTGGGTTACTGATGATTAAATCGAAGCGTACTGTCTGCTGTGTGATCCGCTGCTGAATATCCGCCGTATGGACGTTAATCCGCTCTGCCCACGGGGACTGGTTGATATTTTcctgcg < 3:402251/151‑1 (MQ=255)
ggTGTCGAGCACTCTACTCCCTGCTGATAGTAAGGTGGGTTACTGATGATTAAATCGAAGCGTACTGTCTGCTGTGTGATCCGCTGCTGAATATCCGCCGTATGGACGTTAATCCGCTCTGCCCACGGGGACTGGTTGATATTTTcctgcg > 3:49021/1‑151 (MQ=255)
ggTGTCGAGCACTCTACTCCCTGCTGATAGTAAGGTGGGTTACTGATGATTAAATCGAAGCGTACTGTCTGCTGTGTGATCCGCTGCTGAATATCCGCCGTATGGACGTTAATCCGCTCTGCCCACGGGGACTGGTTGATATTTTcctgcg < 3:336450/151‑1 (MQ=255)
gtCGAGCACTCTACTCCCTGCTGATAGTAAGGTGGGTTACTGATGATTAAATCGAAGCGTACTGTCTGCTGTGTGATCCGCTGCTGAATATCCGCCGTATGGACGTTAATCCGCTCTGCCCACGGGGACTGGTTGATATTTTcctgcgcct < 2:1005925/151‑1 (MQ=255)
gAGCACTCTACTCCCTGCTGATAGTAAGGTGGGTTACTGATGATTAAATCGAAGCGTACTGTCTGCTGTGTGATCCGCTGCTGAATATCCGCCGTATGGACGTTAATCCGCTCTGCCCACGGGGACTGGTTGATATTTTcctgcgcctgcg > 1:41695/1‑151 (MQ=255)
aGCACTCTTCTCCCTGCTGAAAGTAAGGTGGGTTACTGATGATTAAATCGAAGCGTACTGTCTGCTGTGTGATCCGCTGCTGAATATCCGCCGTATGGACGTTAATCCGCTCTGCCCACGGGGACTGGTTGATATTTTCctgcgcctgcgc < 4:1077415/151‑1 (MQ=255)
gCACTCTACTCCCTGCTGATAGTAAGGTGGGTTACTGATGATTAAATCGAAGCGTACTGTCTGCTGTGTGATCCGCTGCTGAATATCCGCCGTATGGACGTTAATCCGCTCTGCCCACGGGGACTGGTTGATATTTTCctgcgcctgcgct < 2:461869/151‑2 (MQ=255)
aCTCTACTCCCTGCTGATAGTAAGGTGGGTTACTGATGATTAAATCGAAGCGTACTGTCTGCTGTGTGATCCGCTGCTGAATATCCGCCGTATGGACGTTAATCCGCTCTGCCCACGGGGACTGGTTGATATTTTCCTGCGCCTGCGCGGc < 4:1339661/151‑1 (MQ=255)
tACTCCCTGCTGATAGTAAGGTGGGTTACTGATGATTAAATCGAAGCGTACTGTCTGCTGTGTGATCCGCTGCTGAATATCCGCCGTATGGACGTTAATCCGCTCTGCCCACGGGGACTGGTTGATATTTTCCTGCGCCTGCGCGGCAGCt > 3:17009/1‑151 (MQ=255)
cTCCCTGCTGATAGTAAGGTGGGTTACTGATGATTAAATCGAAGCGTACTGTCTGCTGTGTGATCCGCTGCTGAATATCCGCCGTATGGACGTTAATCCGCTCTGCCCACGGGGACTGGTTGATATTTTCCTGCGCCTGCGCGGCAGCtt < 1:213003/150‑1 (MQ=255)
tCCCTGCTGATAGTAAGGTGGGTTACTGATGATTAAATCGAAGCGTACTGTCTGCTGTGTGATCCGCTGCTGAATATCCGCCGTATGGACGTTAATCCGCTCTGCCCACGGGGACTGGTTGATATTTTCCTGCGCCTGCGCGGCAGCTTc > 2:177009/1‑150 (MQ=255)
gTAAGGTGGGTTACTGATGATTAAATCGAAGCGTACTGTCTGCTGTGTGATCCGCTGCTGAATATCCGCCGTATGGACGTTAATCCGCTCTGCCCACGGGGACTGGTTGATATTTTCCTGCGCCTGCGCGGCAGCTTCACTTTCCAGTTc > 1:478627/1‑150 (MQ=255)
aaGGTGGGTTACTGATGATTAAATCGAAGCGTACTGTCTGCTGTGTGATCCGCTGCTGAATATCCGCCGTATGGACGTTAATCCGCTCTGCCCACGGGGACTGGTTGATATTTTCCTGCGCCTGCGCGGCAGCTTCACTTTCCAGTTCAAc > 3:210360/1‑151 (MQ=255)
aGGTGGGTTACTGATGATTAAATCGAAGCGTACTGTCTGCTGTGTGATCCGCTGCTGAATATCCGCCGTATGGACGTTAATCCGCTCTGCCCACGGGGACTGGTTGATATTTTCCTGCGCCTGCGCGGCAGCTTCACTTTCCAGTTCAACt > 4:1160746/1‑151 (MQ=255)
ggTGGGTTACTGATGATTAAATCGAAGCGTACTGTCTGCTGTGTGATCCGCTGCTGAATATCCGCCGTATGGACGTTAATCCGCTCTGCCCACGGGGACTGGTTGATATTTTCCTGCGCCTGCGCGGCAGCTTCACTTTCCAGTTCAACTg < 4:58718/151‑1 (MQ=255)
tGGGTTACTGATGATTAAATCGAAGCGTACTGTCTGCTGTGTGATCCGCTGCTGAATATCCGCCGTATGGACGTTAATCCGCTCTGCCCACGGGGACTGGTTGATATTTTCCTGCGCCTGCGCGGCAGCTTCACTTTCCAGTTCAACTGc > 1:316836/1‑150 (MQ=255)
gggTTACTGATGATTAAATCGAAGCGTACTGTCTGCTGTGTGATCCGCTGCTGAATATCCGCCGTATGGACGTTAATCCGCTCTGCCCACGGGGACTGGTTGATATTTTCCTGCGCCTGCGCGGCAGCTTCACTTTCCAGTTCAACTGCat < 2:1329192/151‑1 (MQ=255)
ggTTACTGATGATTAAATCGAAGCGTACTGTCTGCTGTGTGATCCGCTGCTGAATATCCGCCGTATGGACGTTAATCCGCTCTGCCCACGGGGACTGGTTGATATTTTCCTGCGCCTGCGCGGCAGCTTCACTTTCCAGTTCAACTGCatc < 2:362613/151‑1 (MQ=255)
tACTGATGATTAAATCGAAGCGTACTGTCTGCTGTGTGATCCGCTGCTGAATATCCGCCGTATGGACGTTAATCCGCTCTGCCCACGGGGACTGGTTGATATTTTCCTGCGCCTGCGCGGCAGCTTCACTTTCCAGTTCAACTGCatcaat > 2:568037/1‑151 (MQ=255)
tACTGATGATTAAATCGAAGCGTACTGTCTGCTGTGTGATCCGCTGCTGAATATCCGCCGTATGGACGTTAATCCGCTCTGCCCACGGGGACTGGTTGATATTTTCCTGCGCCTGCGCGGCAGCTTCACTTTCCAGTTCAACTGCatcaat > 3:22201/1‑151 (MQ=255)
tACTGATGATTAAATCGAAGCGTACTGTCTGCTGTGTGATCCGCTGCTGAATATCCGCCGTATGGACGTTAATCCGCTCTGCCCACGGGGACTGGTTGATATTTTCCTGCGCCTGCGCGGCAGCTTCACTTTCCAGTTCAACTGCatcaat > 2:921445/1‑151 (MQ=255)
aCTGATGATTAAATCGAAGCGTACTGTCTGCTGTGTGATCCGCTGCTGAATATCCGCCGTATGGACGTTAATCCGCTCTGCCCACGGGGACTGGTTGATATTTTCCTGCGCCTGCGCGGCAGCTTCACTTTCCAGTTCAACTGCatcaatc > 2:932194/1‑151 (MQ=255)
aCTGATGATTAAATCGAAGCGTACTGTCTGCTGTGTGATCCGCTGCTGAATATCCGCCGTATGGACGTTAATCCGCTCTGCCCACGGGGACTGGTTGATATTTTCCTGCGCCTGCGCGGCAGCTTCACTTTCCAGTTCAACTGCatcaatc > 4:877577/1‑151 (MQ=255)
gatgatTAAATCGAAGCGTACTGTCTGCTGTGTGATCCGCTGCTGAATATCCGCCGTATGGACGTTAATCCGCTCTGCCCACGGGGACTGGTTGATATTTTCCTGCGCCTGCGCGGCAGCTTCACTTTCCAGTTCAACTGCATCAatcatc < 3:341633/151‑1 (MQ=255)
gatTAAATCGAAGCGTACTGTCTGCTGTGTGATCCGCTGCTGAATATCCGCCGTATGGACGTTAATCCGCTCTGCCCACGGGGACTGGTTGATATTTTCCTGCGCCTGCGCGGCAGCTTCACTTTCCAGTTCAACTGCATCAATCATCACg < 4:255149/151‑1 (MQ=255)
gatTAAATCGAAGCGTACTGTCTGCTGTGTGATCCGCTGCTGAATATCCGCCGTATGGACGTTAATCCGCTCTGCCCACGGGGACTGGTTGATATTTTCCTGCGCCTGCGCGGCAGCTTCACTTTCCAGTTCAACTGCATCAATCATCACg < 4:527764/151‑1 (MQ=255)
atTAAATCGAAGCGTACTGTCTGCTGTGTGATCCGCTGCTGAATATCCGCCGTATGGACGTTAATCCGCTCTGCCCACGGGGACTGGTTGATATTTTCCTGCGCCTGCGCGGCAGCTTCACTTTCCAGTTCAACTGCATCAATCATCACGc > 4:251019/1‑151 (MQ=255)
atTAAATCGAAGCGTACTGTCTGCTGTGTGATCCGCTGCTGAATATCCGCCGTATGGACGTTAATCCGCTCTGCCCACGGGGACTGGTTGATATTTTCCTGCGCCTGCGCGGCAGCTTCACTTTCCAGTTCAACTGCATCAATCATCACGc > 2:211809/1‑151 (MQ=255)
tAAATCGAAGCGTACTGTCTGCTGTGTGATCCGCTGCTGAATATCCGCCGTATGGACGTTAATCCGCTCTGCCCACGGGGACTGGTTGATATTTTCCTGCGCCTGCGCGGCAGCTTCACTTTCCAGTTCAACTGCATCAATCATCACGCt < 4:1625651/150‑1 (MQ=255)
tAAATCGAAGCGTACTGTCTGCTGTGTGATCCGCTGCTGAATATCCGCCGTATGGACGTTAATCCGCTCTGCCCACGGGGACTGGTTGATATTTTCCTGCGCCTGCGCGGCAGCTTCACTTTCCAGTTCAACTGCATCAATCATCACGCTg > 4:1219405/1‑151 (MQ=255)
aaaTCGAAGCGTACTGTCTGCTGTGTGATCCGCTGCTGAATATCCGCCGTATGGACGTTAATCCGCTCTGCCCACGGGGACTGGTTGATATTTTCCTGCGCCTGCGCGGCAGCTTCACTTTCCAGTTCAACTGCATCAATCATCACGCTg < 3:367717/150‑1 (MQ=255)
aaaTCGAAGCGTACTGTCTGCTGTGTGATCCGCTGCTGAATATCCGCCGTATGGACGTTAATCCGCTCTGCCCACGGGGACTGGTTGATATTTTCCTGCGCCTGCGCGGCAGCTTCACTTTCCAGTTCAACTGCATCAATCATCACGCTg < 2:1077160/150‑1 (MQ=255)
ctCGAAGCGTACTGTCTGCTGTGTGATCCGCTGCTGAATATCCGCCGTATGGACGTTAATCCGCTCTGCCCACGGGGACTGGTTGATATTTTCCTGCGCCTGCGCGGCAGCTTCACTTTCCAGTTCAACTGCATCAATCATCACGCTGTc > 4:1566965/2‑150 (MQ=255)
aTCGAAGCGTACTGTCTGCTGTGTGATCCGCTGCTGAATATCCGCCGTATGGACGTTAATCCGCTCTACCCACGGGGACTGGTTGATATTTTCCTGCGCCTGCGCGGCAGCTTCACTTTCCAGTTCAACTGCATCAATCATCACGCTGTc > 2:751734/1‑150 (MQ=255)
cGAAGCGTACTGTCTGCTGTGTGATCCGCTGCTGAATATCCGCCGTATGGACGTTAATCCGCTCTGCCCACGGGGACTGGTTGATATTTTCCTGCGCCTGCGCGGCAGCTTCACTTTCCAGTTCAACTGCATCAATCATCACGCTGTCATc < 2:758639/151‑1 (MQ=255)
gAAGCGTACTGTCTGCTGTGTGATCCGCTGCTGAATATCCGCCGTATGGACGTTAATCCGCTCTGCCCACGGGGACTGGTTGATATTTTCCTGCGCCTGCGCGGCAGCTTCACTTTCCAGTTCAACTGCATCAATCATCACGCTGTCATCg < 3:140110/151‑1 (MQ=255)
gAAGCGTACTGTCTGCTGTGTGATCCGCTGCTGAATATCCGCCGTATGGACGTTAATCCGCTCTGCCCACGGGGACTGGTTGATATTTTCCTGCGCCTGCGCGGCAGCTTCACTTTCCAGTTCAACTGCATCAATCATCACGCTGCCATCg < 2:646040/151‑1 (MQ=255)
aGCGTACTGTCTGCTGTGTGATCCGCTGCTGAATATCCGCCGTATGGACGTTAATCCGCTCTGCCCACGGGGACTGGTTGATATTTTCCTGCGCCTGCGCGGCAGCTTCACTTTCCAGTTCAACTGCATCAATCATCACGCTGTCATCGGt < 4:793326/151‑1 (MQ=255)
gCGTACTGTCTGCTGTGTGATCCGCTGCTGAATATCCGCCGTATGGACGTTAATCCGCTCTGCCCACGGGGACTGGTTGATATTTTCCTGCGCCTGCGCGGCAGCTTCACTTTCCAGTTCAACTGCATCAATCATCACGCTGTCATCGGtt > 4:1114129/1‑151 (MQ=255)
gCGTACTGTCTGCTGTGTGATCCGCTGCTGAATATCCGCCGTATGGACGTTAATCCGCTCTGCCCACGGGGACTGGTTGATATTTTCCTGCGCCTGCGCGGCAGCTTCACTTTCCAGTTCAACTGCATCAATCATCACGCTGTCATCGGtt < 4:798901/151‑1 (MQ=255)
cGTACTGTCTGCTGTGTGATCCGCTGCTGAATATCCGCCGTATGGACGTTAATCCGCTCTGCCCACGGGGACTGGTTGATATTTTCCTGCGCCTGCGCGGCAGCTTCACTTTCCAGTTCAACTACATCAATCATCACGCTGTCATCGGTTc < 2:434750/151‑1 (MQ=255)
tACTGTCTGCTGTGTGATCCGCTGCTGAATATCCGCCGTATGGACGTTAATCCGCTCTGCCCACGGGGACTGGTTGATATTTTCCTGCGCCTGCGCGGCAGCTTCACTTTCCAGTTCAACTGCATCAATCATCACGCTGTCATCGGTTCGc > 1:182120/1‑151 (MQ=255)
aCTGTCTGCTGTGTGATCCGCTGCTGAATATCCGCCGTATGGACGTTAATCCGCTCTGCCCACGGGGACTGGTTGATATTTTCCTGCGCCTGCGCGGCAGCTTCACTTTCCAGTTCAACTGCATCAATCATCACGCTGTCATCGGTTCGCt > 4:429810/1‑151 (MQ=255)
aCTGTCTGCTGTGTGATCCGCTGCTGAATATCCGCCGTATGGACGTTAATCCGCTCTGCCCACGGGGACTGGTTGATATTTTCCTGCGCCTGCGCGGCAGCTTCACTTTCCAGTTCAACTGCATCAATCATCACGCTGTCATCGGTTCGCt < 4:1619331/151‑1 (MQ=255)
aCTGTCTGCTGTGTGATCCGCTGCTGAATATCCGCCGTATGGACGTTAATCCGCTCTGCCCACGGGGACTGGTTGATATTTTCCTGCGCCTGCGCGGCAGCTTCACTTTCCAGTTCAACTGCATCAATCATCACGCTGTCATCGGTTCGCt > 3:231975/1‑151 (MQ=255)
cTGTCTGCTGTGTGTTCCGCTGCTGAATATCCGCCGTATGGACGTTAATCCGCTCTGCCCACGGGGACTGGTTGATATTTTCCTGCGCCTGCGCGGCAGCTTCACTTTCCAGTTCAACTGCATCAATCATCACGCTGTCATCGGTTCGCTg > 2:241528/1‑151 (MQ=255)
gTCTGCTGTGTGATCCGCTGCTGAATATCCGCCGTATGGACGTTAATCCGCTCTGCCCACGGGGACTGGTTGATATTTTCCTGCGCCTGCGCGGCAGCTTCACTTTCCAGTTCAACTGCATCAATCATCACGCTGTCATCGGTTCGCTgcg > 4:1245860/1‑151 (MQ=255)
gTCTGCTGTGTGATCCGCTGCTGAATATCCGCCGTATGGACGTTAATCCGCTCTGCCCACGGGGACTGGTTGATATTTTCCTGCGCCTGCGCGGCAGCTTCACTTTCCAGTTCAACTGCATCAATCATCACGCTGTCATCGGTTCGCTgcg > 1:456989/1‑151 (MQ=255)
gctgTGTGATCCGCTGCTGAATATCCGCCGTATGGACGTTAATCCGCTCTGCCCACGGGGACTGGTTGATATTTTCCTGCGCCTGCGCGGCAGCTTCACTTTCCAGTTCAACTGCATCAATCATCACGCTGTCATCGGTTCGCTGCGcc > 4:1527149/1‑149 (MQ=255)
gctgTGTGATCCGCTGCTGAATATCCGCCGTATGGACGTTAATCCGCTCTGCCCACGGGGACTGGTTGATATTTTCCTGCGCCTGCGCGGCAGCTTCACTTTCCAGTTCAACTGCATCAATCATCACGCTGTCATCGGTTCGCTGCGcc < 4:922627/149‑1 (MQ=255)
gctgTGTGATCCGCTGCTGAATATCCGCCGTATGGACGTTAATCCGCTCTGCCCACGGGGACTGGTTGATATTTTCCTGCGCCTGCGCGGCAGCTTCACTTTCCAGTTCAACTGCATCAATCATCACGCTGTCATCGGTTCGCTGCGCCa < 4:191336/150‑1 (MQ=255)
gctgTGTGATCCGCTGCTGAATATCCGCCGTATGGACGTTAATCCGCTCTGCCCACGGGGACTGGTTGATATTTTCCTGCGCCTGCGCGGCAGCTTCACTTTCCAGTTCAACTGCATCAATCATCACGCTGTCATCGGTTCGCTGCGCCAg < 3:182134/151‑1 (MQ=255)
ctgTGTGATCCGCTGCTGAATATCCGCCGTATGGACGTTAATCCGCTCTGCCCACGGGGACTGGTTGATATTTTCCTGCGCCTGCGCGGCAGCTTCACTTTCCAGTTCAACTGCATCAATCATCACGCTGTCATCGGTTCGCTGCGCCAGc > 4:724803/1‑151 (MQ=255)
tgtgtgATCCGCTGCTGAATATCCGCCGTATGGACGTTAATCCGCTCTGCCCACGGGGACTGGTTGATATTTTCCTGCGCCTGCGCGGCAGCTTCACTTTCCAGTTCAACTGCATCAATCATCACGCTGTCATCGGTTCGCTGCGCCAGc > 4:474600/1‑150 (MQ=255)
tgtgtgATCCGCTGCTGAATATCCGCCGTATGGACGTTAATCCGCTCTGCCCACGGGGACTGGTTGATATTTTCCTGCGCCTGCGCGGCAGCTTCACTTTCCAGTTCAACTGCATCAATCATCACGCTGTCATCGGTTCGCTGCGCCAGc > 2:775978/1‑150 (MQ=255)
gtgtgATCCGCTGCTGAATATCCGCCGTATGGACGTTAATCCGCTCTGCCCACGGGGACTGGTTGATATTTTCCTGCGCCTGCGCGGCAGCTTCACTTTCCAGTTCAACTGCATCAATCATCACGCTGTCATCGGTTCGCTGCGCCAGCAt < 2:48634/151‑1 (MQ=255)
gtgtgATCCGCTGCTGAATATCCGCCGTATGGACGTTAATCCGCTCTGCCCACGGGGACTGGTTGATATTTTCCTGCGCCTGCGCGGCAGCTTCACTTTCCAGTTCAACTGCATCAATCATCACGCTGTCATCGGTTCGCTGCGCCAGCAt > 2:241785/1‑151 (MQ=255)
gtgATCCGCTGCTGAATATCCGCCGTATGGACGTTAATCCGCTCTGCCCACGGGGACTGGTTGATATTTTCCTGCGCCTGCGCGGCAGCTTCACTTTCCAGTTCAACTGCATCAATCATCACGCTGTCATCGGTTCGCTGCGCCAGCAtt > 3:391089/1‑150 (MQ=255)
|
CGCCGCACAGGTCAGCAACGATGGGTGATCAAGCGTAGTGGTATAGCGAGCCTGTTCCCGTTGAGGTGTCGAGCACTCTACTCCCTGCTGATAGTAAGGTGGGTTACTGATGATTAAATCGAAGCGTACTGTCTGCTGTGTGATCCACTGCTGAATATCCGCCGTATGGACGTTAATCCGCTCTGCCCACGGGGACTGGTTGATATTTTCCTGCGCCTGCGCGGCAGCTTCACTTTCCAGTTCAACTGCATCAATCATCACGCTGTCATCGGTTCGCTGCGCCAGCATT > NC_000913/2712297‑2712585
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 30 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
GATK/CNVnator alignment
N/A
