Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A3 F50 I3 R1
|
160 |
117.2 |
4331776 |
85.4% |
3699336 |
149.7 |
Breseq alignment
BRESEQ :: Evidence
|
| evidence |
seq id |
position |
mutation |
annotation |
gene |
description |
| RA |
NC_000913 |
2,733,986 |
T→C |
D63G (GAT→GGT) |
clpB ← |
protein disaggregation chaperone |
|
| |
seq id |
position |
ref |
new |
freq |
score (cons/poly) |
reads |
annotation |
genes |
product |
| * | NC_000913 | 2,733,986 | 0 | T | C | 99.0%
| 374.5
/ NA
| 97 | D63G (GAT→GGT) | clpB | protein disaggregation chaperone |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (1/0); new base C (62/34); total (63/34) |
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 |
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 |
ACAGTTCTGACGAGATAAAGTTATCACCACGTTTTTGCGCCAGCTTGTCGCAAAGATTAAGAACGCGCACCAGATCCTGTGATGGCTGGACATCACCACCAGTACCTTCAACCTGCGGTAAACGATTTAATGCCTGATTGATATCTGTGCGCAACTGGCCAGCATTTATGCCAGCGGATGTTAATAAAGGACTAACCGAACCCCCTTCCTGATTCAGCAGGGCGCTCATTAAATGAAGTGGTTCGATAAATTGGTTGTCGTGCCCGAGTGCAAGTGATTGGGCATCGGCA > NC_000913/2733843‑2734132
|
acAGTTCTGACGAGATAAAGTTATCACCACGTTTTTGCGCCAGCTTGTCGCAAAGATTAAGAACGCGCACCAGATCCTGTGATGGCTGGACATCACCACCAGTACCTTCAACCTGCGGTAAACGATTTAATGCCTGATTGATACCTGTgcg > 4:371055/1‑151 (MQ=255)
cAGTTCTGACGAGATAAAGTTATCACCACGTTTTTGCGCCAGCTTGTCGCAAAGATTAAGAACGCGCACCAGATCCTGTGATGGCTGGACATCACCACCAGTACCTTCAACCTGCGGTAAACGATTTAATGCCTGATTGATACCTGTgcgc > 3:253247/1‑151 (MQ=255)
aGTTCTGACGAGATAAAGTTATCACCACGTTTTTGCGCCAGCTTGTCGCAAAGATTAAGAACGCGCACCAGATCCTGTGATGGCTGGACATCACCACCAGTACCTTCAACCTGCGGTAAACGATTTAATGCCTGATTGATACCTGTgcgc > 2:293844/1‑150 (MQ=255)
aGTTCTGACGAGATAAAGTTATCACCACGTTTTTGCGCCAGCTTGTCGCAAAGATTAAGAACGCGCACCAGATCCTGTGATGGCTGGACATCACCACCAGTACCTTCAACCTGCGGTAAACGATTTAATGCCTGATTGATACCTGTgcgc > 2:441925/1‑150 (MQ=255)
ttCTGACGAGATAAAGTTATCACCACGTTTTTGCGCCAGCTTGTCGCAAAGATTAAGAACGCGCACCAGATCCTGTGATGGCTGGACATCACCACCAGTACCTTCAACCTGCGGTAAACGATTTAATGCCTGATTGATACCTGTGCGCAAc > 2:1020752/1‑151 (MQ=255)
tCTGACGAGATAAAGTTATCACCACGTTTTTGCGCCAGCTTGTCGCAAAGATTAAGAACGCGCACCAGATCCTGTGATGGCTGGACATCACCACCAGTACCTTCAACCTGCGGTAAACGATTTAATGCCTGATTGATACCTGTGCGCAACt > 4:589610/1‑151 (MQ=255)
tGACGAGATAAAGTTATCACCACGTTTTTGCGCCAGCTTGTCGCAAAGATTAAGAACGCGCACCAGATCCTGTGATGGCTGGACATCACCACCAGTACCTTCAACCTGCGGTAAACGATTTAATGCCTGATTGATACCTGTGCGCAACTgg > 2:1585306/1‑151 (MQ=255)
gACGAGATAAAGTTATCACCACGTTTTTGCGCCAGCTTGTCGCAAAGATTAAGAACGCGCACCAGATCCTGTGATGGCTGGACATCACCACCAGTACCTTCAACCTGCGGTAAACGATTTAATGCCTGATTGATACCTGTGCGCAACTGGc > 4:333336/1‑151 (MQ=255)
gagaTAAAGTTATCACCACGTTTTTGCGCCAGCTTGTCGCAAAGATTAAGAACGCGCACCAGATCCTGTGATGGCTGGACATCACCACCAGTACCTTCAACCTGCGGTAAACGATTTAATGCCTGATTGATACCTGTGCGCAACTGGcc > 4:155051/1‑149 (MQ=255)
gagaTAAAGTTATCACCACGTTTTTGCGCCAGCTTGTCGCAAAGATTAAGAACGCGCACCAGATCCTGTGATGGCTGGACATCACCACCAGTACCTTCAACCTGCGGTAAACGATTTAATGCCTGATTGATACCTGTGCGCAACTGGcc > 4:1029234/1‑149 (MQ=255)
gagaTAAAGTTATCACCACGTTTTTGCGCCAGCTTGTCGCAAAGATTAAGAACGCGCACCAGATCCTGTGATGGCTGGACATCACCACCAGTACCTTCAACCTGCGGTAAACGATTTAATGCCTGATTGATACCTGTGCGCAACTGGcc > 2:1467668/1‑149 (MQ=255)
tAAAGTTATCACCACGTTTTTGCGCCAGCTTGTCGCAAAGATTAAGAACGCGCACCAGATCCTGTGATGGCTGGACATCACCACCAGTACCTTCAACCTGCGGTAAACGATTTAATGCCTGATTGATACCTGTGCGCAACTGGCCAGCAtt > 4:1225360/1‑151 (MQ=255)
tAAAGTTATCACCACGTTTTTGCGCCAGCTTGTCGCAAAGATTAAGAACGCGCACCAGATCCTGTGATGGCTGGACATCACCACCAGTACCTTCAACCTGCGGTAAACGATTTAATGCCTGATTGATACCTGTGCGCAACTGGCCAGCAtt > 2:1484627/1‑151 (MQ=255)
aaaGTTATCACCACGTTTTTGCGCCAGCTTGTCGCAAAGATTAAGAACGCGCACCAGATCCTGTGATGGCTGGACATCACCACCAGTACCTTCAACCTGCGGTAAACGATTTAATGCCTGATTGATACCTGTGCGCAACTGGCCAGCAttt > 2:280470/1‑151 (MQ=255)
ttATCACCACGTTTTTGCGCCAGCTTGTCGCAAAGATTAAGAACGCGCACCAGATCCTGTGATGGCTGGACATCACCACCAGTACCTTCAACCTGCGGTAAACGATTTAATGCCTGATTGATACCTGTGCGCAACTGGCCAGCATTTATGc > 4:1043191/1‑151 (MQ=255)
ttATCACCACGTTTTTGCGCCAGCTTGTCGCAAAGATTAAGAACGCGCACCAGATCCTGTGATGGCTGGACATCACCACCAGTACCTTCAACCTGCGGTAAACGATTTAATGCCTGATTGATACCTGTGCGCAACTGGCCAGCATTTATGc > 1:245195/1‑151 (MQ=255)
aTCACCACGTTTTTGCGCCAGCTTGTCGCAAAGATTAAGAACGCGCACCAGATCCTGTGATGGCTGGACATCACCACCAGTACCTTCAACCTGCGGTAAACGATTTAATGCCTGATTGATACCTGTGCGCAACTGGCCAGCATTTATGcc > 1:330138/1‑150 (MQ=255)
aTCACCACGTTTTTGCGCCAGCTTGTCGCAAAGATTAAGAACGCGCACCAGATCCTGTGATGGCTGGACATCACCACCAGTACCTTCAACCTGCGGTAAACGATTTAATGCCTGATTGATACCTGTGCGCAACTGGCCAGCATTTATGcc < 4:118117/150‑1 (MQ=255)
accacGTTTTTGCGCCAGCTTGTCGCAAAGATTAAGAACGCGCACCAGATCCTGTGATGGCTGGACATCACCACCAGTACCTTCAACCTGCGGCAAACGATTTAATGCCTGATTGATACCTGTGCGCAACTGGCCAGCATTTATGCCAGc > 2:136636/1‑150 (MQ=255)
ccacGTTTTTGCGCCAGCTTGTCGCAAAGATTAAGAACGCGCACCAGATCCTGTGATGGCTGGACATCACCACCAGTACCTTCAACCTGCGGTAAACGATTTAATGCCTGATTGATACCTGTGCGCAACTGGCCAGCATTTATGCCAGCgg > 3:263349/1‑151 (MQ=255)
ccacGTTTTTGCGCCAGCTTGTCGCAAAGATTAAGAACGCGCACCAGATCCTGTGATGGCTGGACATCACCACCAGTACCTTCAACCTGCGGTAAACGATTTAATGCCTGATTGATACCTGTGCGCAACTGGCCAGCATTTATGCCAGCgg > 2:1211498/1‑151 (MQ=255)
gTTTTTGCGCCAGCTTGTCGCAAAGATTAAGAACGCGCACCAGATCCTGTGATGGCTGGACATCACCACCAGTACCTTCAACCTGCGGTAAACGATTTAATGCCTGATTGATACCTGTGCGCAACTGGCCAGCATTTATGCCAGCGGATg > 2:1429855/1‑150 (MQ=255)
gTTTTTGCGCCAGCTTGTCGCAAAGATTAAGAACGCGCACCAGATCCTGTGATGGCTGGACATCACCACCAGTACCTTCAACCTGCGGTAAACGATTTAATGCCTGATTGATACCTGTGCGCAACTGGCCAGCATTTATGCCAGCGGATGt > 1:463244/1‑151 (MQ=255)
ttttGCGCCAGCTTGTCGCAAAGATTAAGAACGCGCACCAGATCCTGTGATGGCTGGACATCACCACCAGTACCTTCAACCTGCGGTAAACGATTTAATGCCTGATTGATACCTGTGCGCAACTGGCCAGCATTTATGCCAGCGGATGtt < 2:963923/150‑1 (MQ=255)
ttttGCGCCAGCTTGTCGCAAAGATTAAGAACGCGCACCAGATCCTGTGATGGCTGGACATCACCACCAGTACCTTCAACCTGCGGTAAACGATTTAATGCCTGATTGATACCTGTGCGCAACTGGCCAGCATTTATGCCAGCGGAGGtt > 1:102801/1‑150 (MQ=255)
gattGCGCCAGCGTGGGGCAAGGAAAAAGAGGGGGCACCAGATGTTGTGATGGCTGGGCACCGCCACCATTAAAAAAAAACTGACGTAAACGATTAAATGCCTGATTGATATCTGTGCGCAACTGGCAAGCATTTATGCCAGCGGATg > 2:628080/3‑148 (MQ=255)
tttGCGCCAGCTTGTCGCAAAGATTAAGAACGCGCACCAGATCCTGTGATGGCTGGACATCACCACCAGTACCTTCAACCTGCGGTAAACGATTTAATGCCTGATTGATACCTGTGCGCAACTGGCCAGCATTTATGCCAGCGGATGTta > 4:1595996/1‑150 (MQ=255)
tGCGCCAGCTTGTCGCAAAGATTAAGAACGCGCACCAGATCCTGTGATGGCTGGACATCACCACCAGTACCTTCAACCTGCGGTAAACGATTTAATGCCTGATTGATACCTGTGCGCAACTGGCCAGCATTTATGCCAGCGGATGTtaat > 2:988784/1‑150 (MQ=255)
tGCGCCAGCTTGTCGCAAAGATTAAGAACGCGCACCAGATCCTGTGATGGCTGGACATCACCACCAGTACCTTCAACCTGCGGTAAACGATTTAATGCCTGATTGATACCTGTGCGCAACTGGCCAGCATTTATGCCAGCGGATGTtaat > 2:664244/1‑150 (MQ=255)
gcgcCAGCTTGTCGCAAAGATTAAGAACGCGCACCAGATCCTGTGATGGCTGGACATCACCACCAGTACCTTCAACCTGCGGTAAACGATTTAATGCCTGATTGATACCTGTGCGCAACTGGCCAGCATTTATGCCAGCGGATGTtaata < 3:49922/150‑1 (MQ=255)
gcCAGCTTGTCGCAAAGATTAAGAACGCGCACCAGATCCTGTGATGGCTGGACATCACCACCAGTACCTTCAACCTGCGGTAAACGATTGAATGCCTGATTGATACCTGTGCTCAAAGGGCCAGCATTTATGGCAGCGGATGTtaataa < 4:1597007/149‑1 (MQ=255)
gCTTGTCGCAAAGATTAAGAACGCGCACCAGATCCTGTGATGGCTGGACATCACCACCAGTACCTTCAACCTGCGGTAAACGATTTAATGCCTGATTGATACCTGTGCGCAACTGGCCAGCATTTATGCCAGCGGATGTTAATAAAGGACt > 3:438493/1‑151 (MQ=255)
cTTGTCGCAAAGATTAAGAACGCGCACCAGATCCTGTGATGGCTGGACATCACCACCAGTACCTTCAACCTGCGGTAAACGATTTAATGCCTGATTGATACCTGTGCGCAACTGGCCAGCATTTATGCCAGCGGATGTTAATAAAGGACt > 3:251073/1‑150 (MQ=255)
ttGTCGCAAAGATTAAGAACGCGCACCAGATCCTGTGATGGCTGGACATCACCACCAGTACCTTCAACCTGCGGTAAACGATTTAATGCCTGATTGATACCTGTGCGCAACTGGCCAGCATTTATGCCAGCGGATGTTAATAAAGGACTa > 2:512816/1‑150 (MQ=255)
tGTCGCAAAGATTAAGAACGCGCACCAGATCCTGTGATGGCTGGACATCACCACCAGTACCTTCAACCTGCGGTAAACGATTTAATGCCTGATTGATACCTGTGCGCAACTGGCCAGCATTTATGCCAGCGGATGTTAATAAAGGACTaa < 2:602221/150‑1 (MQ=255)
tGTCGCAAAGATTAAGAACGCGCACCAGATCCTGTGATGGCTGGACATCACCACCAGTACCTTCAACCTGCGGTAAACGATTTAATGCCTGATTGATACCTGTGCGCAACTGGCCAGCATTTATGCCAGCGGATGTTAATAAAGGACTa < 1:300775/149‑1 (MQ=255)
tCGCAAAGATTAAGAACGCGCACCAGATCCTGTGATGGCTGGACATCACCACCAGTACCTTCAACCTGCGGTAAACGATTTAATGCCTGATTGATACCTGTGCGCAACTGGCCAGCATTTATGCCAGCGGATGTTAATAAAGGACTAACCg > 2:568850/1‑151 (MQ=255)
tCGCAAAGATTAAGAACGCGCACCAGATCCTGTGATGGCTGGACATCACCACCAGTACCTTCAACCTGCGGTAAACGATTTAATGCCTGATTGATACCTGTGCGCAACTGGCCAGCATTTATGCCAGCGGATGTTAATAAAGGACTAACCg > 2:66517/1‑151 (MQ=255)
tCGCAAAGATTAAGAACGCGCACCAGATCCTGTGATGGCTGGACATCACCACCAGTACCTTCAACCTGCGGTAAACGATTTAATGCCTGATTGATACCTGTGCGCAACTGGCCAGCATTTATGCCAGCGGATGTTAATAAAGGACTAACCg > 2:847485/1‑151 (MQ=255)
tCGCAAAGATTAAGAACGCGCACCAGATCCTGTGATGGCTGGACATCACCACCAGTACCTTCAACCTGCGGTAAACGATTTAATGCCTGATTGATACCTGTGCGCAACTGGCCAGCATTTATGCCAGCGGATGTTAATAAAGGACTAACCg > 2:1230268/1‑151 (MQ=255)
cGCAAAGATTAAGAACGCGCACCAGATCCTGTGATGGCTGGACATCACCACCAGTACCTTCAACCTGCGGTAAACGATTTAATGCCTGATTGATACCTGTGCGCAACTGGCCAGCATTTATGCCAGCGGATGTTAATAAAGGACTAACCg < 2:588794/150‑1 (MQ=255)
aaaGATTAAGAACGCGCACCAGATCCTGTGATGGCTGGACATCACCACCAGTACCTTCAACCTGCGGTAAACGATTTAATGCCTGATTGATACCTGTGCGCAACTGGCCAGCATTTATGCCAGCGGATGTTAATAAAGGACTAACCGAAcc > 4:572935/1‑151 (MQ=255)
aGATTAAGAACGCGCACCAGATCCTGTGATGGCTGGACATCACCACCAGTACCTTCAACCTGCGGTAAACGATTTAATGCCTGATTGATACCTGTGCGCAACTGGCCAGCATTTATGCCAGCGGATGTTAATAAAGGACTAACCGAAcccc > 2:1254704/1‑151 (MQ=255)
aGATTAAGAACGCGCACCAGATCCTGTGATGGCTGGACATCACCACCAGTACCTTCAACCTGCGGTAAACGATTTAATGCCTGATTGATACCTGTGCGCAACTGGCCAGCATTTATGCCAGCGGATGTTAATAAAGGACTAACCGAAcccc > 1:76134/1‑151 (MQ=255)
aGATTAAGAACGCGCACCAGATCCTGTGATGGCTGGACATCACCACCAGTACCTTCAACCTGCGGTAAACGATTTAATGCCTGATTGATACCTGTGCGCAACTGGCCAGCATTTATGCCAGCGGATGTTAATAAAGGACTAACCGAAcccc < 4:886171/151‑1 (MQ=255)
aTTAAGAACGCGCACCAGATCCTGTGATGGCTGGACATCACCACCAGTACCTTCAACCTGCGGTAAACGATTTAATGCCTGATTGATACCTGTGCGCAACTGGCCAGCATTTATGCCAGCGGATGTTAATAAAGGAc < 3:151565/137‑1 (MQ=255)
aTTAAGAACGCGCACCAGATCCTGTGATGGCTGGACATCACCACCAGTACCTTCAACCTGCGGTAAACGATTTAATGCCTGATTGATACCTGTGCGCAACTGGCCAGCATTTATGCCAGCGGATGTTAATAAAGGAc > 1:151551/1‑137 (MQ=255)
aTTAAGAACGCGCACCAGATCCTGTGATGGCTGGACATCACCACCAGTACCTTCAACCTGCGGTAAACGATTTAATGCCTGATTGATACCTGTGCGCAACTGGCCAGCATTTATGCCAGCGGATGTTAATAAAGGACTAACCGAACCCCCt < 4:394385/151‑1 (MQ=255)
gAACGCGCACCAGATCCTGTGATGGCTGGACATCACCACCAGTACCTTCAACCTGCGGTAAACGATTTAATGCCTGATTGATACCTGTGCGCAACTGGCCAGCATTTATGCCAGCGGATGTTAATAAAGGACTAACCGAACCCCCTTCCTg < 4:1215065/151‑1 (MQ=255)
gAACGCGCACCAGATCCTGTGATGGCTGGACATCACCACCAGTACCTTCAACCTGCGGTAAACGATTTAATGCCTGATTGATACCTGTGCGCAACTGGCCAGCATTTATGCCAGCGGATGTTAATAAAGGACTAACCGAACCCCCTTCCTg < 2:25167/151‑1 (MQ=255)
gAACGCGCACCAGATCCTGTGATGGCTGGACATCACCACCAGTACCTTCAACCTGCGGTAAACGATTTAATGCCTGATTGATACCTGTGCGCAACTGGCCAGCATTTATGCCAGCGGATGTTAATAAAGGACTAACCGAACCCCCTTCCTg < 1:378/151‑1 (MQ=255)
aCGCGCACCAGATCCTGTGATGGCTGGACATCACCACCAGTACCTTCAACCTGCGGTAAACGATTTAATGCCTGATTGATACCTGTGCGCAACTGGCCAGCATTTATGCCAGCGGATGTTAATAAAGGACTAACCGAACCCCCTTCCTGAt > 1:327748/1‑151 (MQ=255)
cgcgCACCAGATCCTGTGATGGCTGGACATCACCACCAGTACCTTCAACCTGCGGTAAACGATTTAATGCCTGATTGATACCTGTGCGCAACTGGCCAGCATTTATGCCAGCGGATGTTAATAAAGGACTAACCGAACCCCCTTCCTGAtt > 4:836836/1‑151 (MQ=255)
gcACCAGATCCTGTGATGGCTGGACATCACCACCAGTACCTTCAACCTGCGGTAAACGATTTAATGCCTGATTGATACCTGTGCGCAACTGGCCAGCATTTATGCCAGCGGATGTTAATAAAGGACTAACCGAACCCCCTTCCTGATTc > 1:258928/1‑149 (MQ=255)
gATCCTGTGATGGCTGGACATCACCACCAGTACCTTCAACCTGCGGTAAACGATTTAATGCCTGATTGATACCTGTGCGCAACTGGCCAGCATTTATGCCAGCGGATGTTAATAAAGGACTAACCGAACCCCCTTCCTGATTCAGCAGGgc > 4:295207/1‑151 (MQ=255)
ccTGTGATGGCTGGACATCACCACCAGTACCTTCAACCTGCGGTAAACGATTTAATGCCTGATTGATACCTGTGCGCAACTGGCCAGCATTTATGCCAGCGGATGTTAATAAAGGACTAACCGAACCCCCTTCCTGATTCAGCAGGGCGCt < 1:334788/151‑1 (MQ=255)
ccTGTGATGGCTGGACATCACCACCAGTACCTTCAACCTGCGGTAAACGATTTAATGCCTGATTGATACCTGTGCGCAACTGGCCAGCATTTATGCCAGCGGATGTTAATAAAGGACTAACCGAACCCCCTTCCTGATTCAGCAGGGCGCt > 4:429798/1‑151 (MQ=255)
gtgATGGCTGGACATCACCACCAGTACCTTCAACCTGCGGTAAACGATTTAATGCCTGATTGATACCTGTGCGCAACTGGCCAGCATTTATGCCAGCGGATGTTAATAAAGGACTAACCGAACCCCCTTCCTGATTCAGCAGGGCGCTCAt < 2:709777/151‑1 (MQ=255)
gATGGCTGGACATCACCACCAGTACCTTCAACCTGCGGTAAACGATTTAATGCCTGATTGATACCTGTGCGCAACTGGCCAGCATTTATGCCAGCGGATGTTAATAAAGGACTAACCGAACCCCCTTCCTGATTCAGCAGGGCGCTCAtt > 4:496131/1‑150 (MQ=255)
gATGGCTGGACATCACCACCAGTACCTTCAACCTGCGGTAAACGATTTAATGCCTGATTGATACCTGTGCGCAACTGGCCAGCATTTATGCCAGCGGATGTTAATAAAGGACTAACCGAACCCCCTTCCTGATTCAGCAGGGCGCTCAtt < 4:684069/150‑1 (MQ=255)
gATGGCTGGACATCACCACCAGTACCTTCAACCTGCGGTAAACGATTTAATGCCTGATTGATACCTGTGCGCAACTGGCCAGCATTTATGCCAGCGGATGTTAATAAAGGACTAACCGAACCCCCTTCCTGATTCAGCAGGGCGCTCAtt < 2:774782/150‑1 (MQ=255)
aTGGCTGGACATCACCACCAGTACCTTCAACCTGCGGTAAACGATTTAATGCCTGATTGATACCTGTGCGCAACTGGCCAGCATTTATGCCAGCGGATGTTAATAAAGGACTAACCGAACCCCCTTCCTGATTCAGCAGGGCGCTCATTaa < 2:215887/151‑1 (MQ=255)
ggCTGGACATCACCACCAGTACCTTCAACCTGCGGTAAACGATTTAATGCCTGATTGATACCTGTGCGCAACTGGCCAGCATTTATGCCAGCGGATGTTAATAAAGGACTAACCGAACCCCCTTCCTGATTCAGCAGGGCGCTCATTAAAt < 2:1502792/151‑1 (MQ=255)
ggCTGGACATCACCACCAGTACCTTCAACCTGCGGTAAACGATTTAATGCCTGATTGATACCTGTGCGCAACTGGCCAGCATTTATGCCAGCGGATGTTAATAAAGGACTAACCGAACCCCCTTCCTGATTCAGCAGGGCGCTCATTAAAt > 2:1671229/1‑151 (MQ=255)
cTGGACATCACCACCAGTACCTTCAACCTGCGGTAAACGATTTAATGCCTGATTGATACCTGTGCGCAACTGGCCAGCATTTATGCCAGCGGATGTTAATAAAGGACTAACCGAACCCCCTTCCTGATTCAGCAGGGCGCTCATTAAATg > 2:1146854/1‑150 (MQ=255)
ggACATCACCACCAGTACCTTCAACCTGCGGTAAACGATTTAATGCCTGATTGATACCTGTGCGCAACTGGCCAGCATTTATGCCAGCGGATGTTAATAAAGGACTAACCGAACCCCCTTCCTGATTCAGCAGGGCGCTCATTAAATGa < 2:935368/149‑1 (MQ=255)
aCATCACCACCAGTACCTTCAACCTGCGGTAAACGATTTAATGCCTGATTGATACCTGTGCGCAACTGGCCAGCATTTATGCCAGCGGATGTTAATAAAGGACTAACCGAACCCCCTTCCTGATTCAGCAGGGCGCTCATTAAATGAAGTg < 4:955979/151‑1 (MQ=255)
aCATCACCACCAGTAACTTCAACCTGCGGTAAACGATTTAATGCATGATTGATACCTGTGCGCAACTGGCCAGCATTTATGCGAGCGGATGTTAATAAAGGACTAACCGAACCCCCTTCTTGATTGAGTAGGTCGCTCATTAAATGAAGt > 4:1260240/1‑150 (MQ=255)
cATCACCACCAGTACCTTCAACCTGCGGTAAACGATTTAATGCCTGATTGATACCTGTGCGCAACTGGCCAGCATTTATGCCAGCGGATGTTAATAAAGGACTAACCGAACCCCCTTCCTGATTCAGCAGGGCGCTCATTAAATGAAGTgg < 2:370502/151‑1 (MQ=255)
cATCACCACCAGTACCTTCAACCTGCGGTAAACGATTTAATGCCTGATTGATACCTGTGCGCAACTGGCCAGCATTTATGCCAGCGGATGTTAATAAAGGACTAACCGAACCCCCTTCCTGATTCAGCAGGGCGCTCATTAAATGAAGTgg > 4:1615142/1‑151 (MQ=255)
aTCACCACCAGTACCTTCAACCTGCGGTAAACGATTTAATGCCTGATTGATACCTGTGCGCAACTGGCCAGCATTTATGCCAGCGGATGTTAATAAAGGACTAACCGAACCCCCTTCCTGATTCAGCAGGGCGCTCATTAAATGAAGTGGt < 4:1275414/151‑1 (MQ=255)
aTCACCACCAGTACCTTCAACCTGCGGTAAACGATTTAATGCCTGATTGATACCTGTGCGCAACTGGCCAGCATTTATGCCAGCGGATGTTAATAAAGGACTAACCGAACCCCCTTCCTGATTCAGCAGGGCGCTCATTAAATGAAGTGGt > 1:442281/1‑151 (MQ=255)
accaccAGTACCTTCAACCTGCGGTAAACGATTTAATGCCTGATTGATACCTGTGCGCAACTGGCCAGCATTTATGCCAGCGGATGTTAATAAAGGACTAACCGAACCCCCTTCCTGATTCAGCAGGGCGCTCATTAAATGAAGTGGTTCg > 1:163539/1‑151 (MQ=255)
accaccAGTACCTTCAACCTGCGGTAAACGATTTAATGCCTGATTGATACCTGTGCGCAACTGGCCAGCATTTATGCCAGCGGATGTTAATAAAGGACTAACCGAACCCCCTTCCTGATTCAGCAGGGCGCTCATTAAATGAAGTGGTTCg > 4:294287/1‑151 (MQ=255)
ccaGTACCTTCAACCTGCGGTAAACGATTTAATGCCTGATTGATACCTGTGCGCAACTGGCCAGCATTTATGCCAGCGGATGTTAATAAAGGACTAACCGAACCCCCTTCCTGATTCAGCAGGGCGCTCATTAAATGAAGTGGTTCGATaa < 2:1285426/151‑1 (MQ=255)
tCAACCTGCGGTAAACGATTTAATGCCTGATTGATACCTGTGCGCAACTGGCCAGCATTTATGCCAGCGGATGTTAATAAAGGACTAACCGAACCCCCTTCCTGATTCAGCAGGGCGCTCATTAAATGAAGTGGTTCGATAAATTGGTTGt > 1:58757/1‑151 (MQ=255)
cAACCTGCTGTAAACGATTGAATGCCTGATTGATACCTGTGCGCAACTGGCCAGCATTTATGCCAGCGGATGTTAATAAAGGACTAACCGAACCCCCTTCCTGATTCAGCAGGGCGCTCATTAAATGAAGTGGTTCGATAAATTGGTTg < 2:1175087/149‑1 (MQ=255)
cAACCTGCGGTAAACGATTTAATGCCTGATTGATACCTGTGCGCAACTGGCCAGCATTTATGCCAGCGGATGTTAATAAAGGACTAACCGAACCCCCTTCCTGATTCAGCAGGGCGCTCATTAAATGAAGTGGTTCGATAAATTGGTTGt < 4:257069/150‑1 (MQ=255)
ccTGCGGTAAACGATTTAATGCCTGATTGATACCTGTGCGCAACTGGCCAGCATTTATGCCAGCGGATGTTAATAAAGGACTAACCGAACCCCCTTCCTGATTCAGCAGGGCGCTCATTAAATGAAGTGGTTCGATAAATTGGTTGTCGTg > 2:1564899/1‑151 (MQ=255)
ccTGCGGTAAACGATTTAATGCCTGATTGATACCTGTGCGCAACTGGCCAGCATTTATGCCAGCGGATGTTAATAAAGGACTAACCGAACCCCCTTCCTGATTCAGCAGGGCGCTCATTAAATGAAGTGGTTCGATAAATTGGTTGTCGTg > 4:440386/1‑151 (MQ=255)
ccTGCGGTAAACGATTTAATGCCTGATTGATACCTGTGCGCAACTGGCCAGCATTTATGCCAGCGGATGTTAATAAAGGACTAACCGAACCCCCTTCCTGATTCAGCAGGGCGCTCATTAAATGAAGTGGTTCGATAAATTGGTTGTCGTg > 2:143465/1‑151 (MQ=255)
gCGGTAAACGATTTAATGCCTGATTGATACCTGTGCGCAACTGGCCAGCATTTATGCCAGCGGATGTTAATAAAGGACTAACCGAACCCCCTTCCTGATTCAGCAGGGCGCTCATTAAATGAAGTGGTTCGATAAATTGGTTGTCGTGccc > 2:1177962/1‑151 (MQ=255)
ggTAAACGATTTAATGCCTGATTGATACCTGTGCGCAACTGGCCAGCATTTATGCCAGCGGATGTTAATAAAGGACTAACCGAACCCCCTTCCTGATTCAGCAGGGCGCTCATTAAATGAAGTGGTTCGATAAATTGGTTGTCGTGCCCGa < 4:670428/151‑1 (MQ=255)
tAAACGATTTAATGCCTGATTGATACCTGTGCGCAACTGGCCAGCATTTATGCCAGCGGATGTTAATAAAGGACTAACCGAACCCCCTTCCTGATTCAGCAGGGCGCTCATTAAATGAAGTGGTTCGATAAATTGGTTGTCGTGCCCGAGt > 4:260493/1‑151 (MQ=255)
aTTTAATGCCTGATTGATACCTGTGCGCAACTGGCCAGCATTTATGCCAGCGGATGTTAATAAAGGACTAACCGAACCCCCTTCCTGATTCAGCAGGGCGCTCATTAAATGAAGTGGTTCGATAAATTGGTTGTCGTGCCCGAGTGCAAGt < 4:280916/151‑1 (MQ=255)
ttAATGCCTGATTGATACCTGTGCGCAACTGGCCAGCATTTATGCCAGCGGATGTTAATAAAGGACTAACCGAACCCCCTTCCTGATTCAGCAGGGCGCTCATTAAATGAAGTGGTTCGATAAATTGGTTGTCGTGCCCGAGTGCAAGTg > 1:273226/1‑150 (MQ=255)
aaTGCCTGATTGATACCTGTGCGCAACTGGCCAGCATTTATGCCAGCGGATGTTAATAAAGGACTAACCGAACCCCCTTCCTGATTCAGCAGGGCGCTCATTAAATGAAGTGGTTCGATAAATTGGTTGTCGTGCCCGAGTGCAAGTGAtt < 1:436142/151‑1 (MQ=255)
aTGCCTGATTGATACCTGTGCGCAACTGGCCAGCATTTATGCCAGCGGATGTTAATAAAGGACTAACCGAACCCCCTTCCTGATTCAGCAGGGCGCTCATTAAATGAAGTGGTTCGATAAATTGGTTGTCGTGCCCGAGTGCAAGTGATTg < 4:1182897/151‑1 (MQ=255)
aTGCCTGATTGATACCTGTGCGCAACTGGCCAGCATTTATGCCAGCGGATGTTAATAAAGGACTAACCGAACCCCCTTCCTGATTCAGCAGGGCGCTCATTAAATGAAGTGGTTCGATAAATTGGTTGTCGTGCCCGAGTGCAAGTGATTg < 2:154788/151‑1 (MQ=255)
aTGCCTGATTGATACCTGTGCGCAACTGGCCAGCATTTATGCCAGCGGATGTTAATAAAGGACTAACCGAACCCCCTTCCTGATTCAGCAGGGCGCTCATTAAATGAAGTGGTTCGATAAATTGGTTGTCGTGCCCGAGTGCAAGTGATTg > 3:333731/1‑151 (MQ=255)
tGCCTGATTGATACCTGTGCGCAACTGGCCAGCATTTATGCCAGCGGATGTTAATAAAGGACTAACCGAACCCCCTTCCTGATTCAGCAGGGCGCTCATTAAATGAAGTGGTTCGATAAATTGGTTGTCGTGCCCGAGTGCAAGTGATTgg > 2:268218/1‑151 (MQ=255)
gCCTGATTGATACCTGTGCGCAACTGGCCAGCATTTATGCCAGCGGATGTTAATAAAGGACTAACCGAACCCCCTTCCTGATTCAGCAGGGCGCTCATTAAATGAAGTGGTTCGATAAATTGGTTGTCGTGCCCGAGTGCAAGTGATTgg < 2:471314/150‑1 (MQ=255)
ccTGATTGATACCTGTGCGCAACTGGCCAGCATTTATGCCAGCGGATGTTAATAAAGGACTAACCGAACCCCCTTCCTGATTCAGCAGGGCGCTCATTAAATGAAGTGGTTCGATAAATTGGTTGTCGTGCCCGAGTGCAAGTGATTGGGc < 4:1439445/151‑1 (MQ=255)
gattgatACCTGTGCGCAACTGGCCAGCATTTATGCCAGCGGATGTTAATAAAGGACTAACCGAACCCCCTTCCTGATTCAGCAGGGCGCTCATTAAATGAAGTGGTTCGATAAATTGGTTGTCGTGCCCGAGTGCAAGTGATTGGGCa < 4:136866/149‑1 (MQ=255)
gattgatACCTGTGCGCAACTGGCCAGCATTTATGCCAGCGGATGTTAATAAAGGACTAACCGAACCCCCTTCCTGATTCAGCAGGGCGCTCATTAAATGAAGTGGTTCGATAAATTGGTTGTCGTGCCCGAGTGCAAGTGATTGGGCATc > 1:467428/1‑151 (MQ=255)
tgatACCTGTGCGCAACTGGCCAGCATTTATGCCAGCGGATGTTAATAAAGGACTAACCGAACCCCCTTCCTGATTCAGCAGGGCGCTCATTAAATGAAGTGGTTCGATAAATTGGTTGTCGTGCCCGAGTGCAAGTGATTGGGCATCGGc > 2:1185381/1‑151 (MQ=255)
gatACCTGTGCGCAACTGGCCAGCATTTATGCCAGCGGATGTTAATAAAGGACTAACCGAACCCCCTTCCTGATTCAGCAGGGCGCTCATTAAATGAAGTGGTTCGATAAATTGGTTGTCGTGCCCGAGTGCAAGTGATTGGGCATCGGc > 4:1443152/1‑150 (MQ=255)
atacCTGTGCGCAACTGGCCAGCATTTATGCCAGCGGATGTTAATAAAGGACTAACCGAACCCCCTTCCTGATTCAGCAGGGCGCTCATTAAATGAAGTGGTTCGATAAATTGGTTGTCGTGCCCGAGTGCAAGTGATTGGGCATCGGCa > 2:1568031/1‑150 (MQ=255)
|
ACAGTTCTGACGAGATAAAGTTATCACCACGTTTTTGCGCCAGCTTGTCGCAAAGATTAAGAACGCGCACCAGATCCTGTGATGGCTGGACATCACCACCAGTACCTTCAACCTGCGGTAAACGATTTAATGCCTGATTGATATCTGTGCGCAACTGGCCAGCATTTATGCCAGCGGATGTTAATAAAGGACTAACCGAACCCCCTTCCTGATTCAGCAGGGCGCTCATTAAATGAAGTGGTTCGATAAATTGGTTGTCGTGCCCGAGTGCAAGTGATTGGGCATCGGCA > NC_000913/2733843‑2734132
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 16 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
GATK/CNVnator alignment
N/A
