Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A3 F50 I3 R1
|
160 |
117.2 |
4331776 |
85.4% |
3699336 |
149.7 |
Breseq alignment
BRESEQ :: Evidence
|
| evidence |
seq id |
position |
mutation |
annotation |
gene |
description |
| RA |
NC_000913 |
3,545,025 |
T→C |
H48H (CAT→CAC) |
gntX → |
DNA catabolic protein |
|
| |
seq id |
position |
ref |
new |
freq |
score (cons/poly) |
reads |
annotation |
genes |
product |
| * | NC_000913 | 3,545,025 | 0 | T | C | 100.0%
| 502.0
/ NA
| 131 | H48H (CAT→CAC) | gntX | DNA catabolic protein |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (0/0); new base C (67/64); total (67/64) |
Only 100 of 131 total aligned reads displayed.
AACATATGCTAACAGTACCGGGATTATGCTGGCTATGCCGAATGCCACTGGCGTTAGGTCATTGGGGGATTTGTTCGGTCTGTTCACGCGCCACCCGCACAGATAAAACGTTATGCCCACAATGTGGATTACCCGCCACACACTCCCATCTTCCCTGCGGTCGCTGCCTGCAAAAACCGCCGCCCTGGCAAAGACTGGTCACGGTTGCCGACTATGCGCCGCCGTTAAGTCCGCTTATCCACCAGCTTAAATTTTCCCGGCGCAGTGAAATCGCCAGCGCCCTGTCACGTCTGTT > NC_000913/3544877‑3545171
|
aaCATATGCTAACAGTACCGGGATTATGCTGGCTATGCCGAATGCCACTGGCGTTAGGTCATTGGGGGATTTGTTCGGTCTGTTCACGCGCCCCCCGCACAGATAAAACGTTATGCCCACAATGTGGATTCCCCGCCACACACTCCCACCt < 4:175690/151‑1 (MQ=255)
cATATGCTAACAGTACCGCGATTATGCTGGCTATGCCGAATGCCACTGGCGTTAGGTCATTGGGGGATTTGTTCGGTCTGTTCACGCGCCACCCGCACAGATAAAACGTTATGCCCACAATGTGGATTACCCGCCACACACTCCCACCTTc > 2:748510/1‑151 (MQ=255)
atatGCTAACAGTACCGGGATTATGCTGGCTATGCCGAATGCCACTGGCGTTAGGTCATTGGGGGATTTGTTCGGTCTGTTCACGCGCCACCCGCACAGATAAAACGTTATGCCCACAATGTGGATTACCCGCCACACACTCCCACCTTcc > 3:410167/1‑151 (MQ=255)
atatGCAAACAGTACCGGGTTTATGCGGGCTAGGCCAAATGCCACTGGCGTTAGGTCATGGGGGGATTTGTTCGGTCTGTTCCCGCCCCCCCCGCACAGATAAACCGTTATGCCCACAATGTGGATTACCCGCCACACACTCCCACCTTc < 2:1628202/150‑1 (MQ=255)
tatGCTAACAGTACCGGGATTATGCTGGCTATGCCGAATGCCACTGGCGTTAGGTCATTGGGGGATTTGTTCGGTCTGTTCACGCGCCACCCGCACAGATAAAACGTTATGCCCACAATGTGGATTACCCGCCACACACTCCCACCTTccc > 2:1003113/1‑151 (MQ=255)
tGCTAACAGTACCGGGATTATGCTGGCTATGCCGAATGCCACTGGCGTTAGGTCATTGGGGGATTTGTTCGGTCTGTTCACGCGCCACCCGCACAGATAAAACGTTATGCCCACAATGTGGATTACCCGCCACACACTCCCACCTTCCCTg > 1:221593/1‑151 (MQ=255)
tAACAGTACCGGGCTTATGCTGGCTATGCCGTATGCCACTGGCGTTAGGTCATTGGGGGATTTGTTTGGTCTGTTCACGCCCCACCAGCACAGATAAAACGTTATGCCCACAATGTGGATTACCCGCCACACACTCCCACCTTCCCTGc > 1:199145/1‑149 (MQ=255)
aaCAGTACCGGGATTATGCTGGCTATGCCGAATGCCACTGGCGTTAGGTCATTGGGGGATTTGTTCGGTCTGTTCACGCGCCCCCCGCACAGATAAACCGTTATGCCCACAATGTGGATTACCCGCCACACACTCCCACCTTCCCTGCg < 2:1269696/149‑1 (MQ=255)
gTACCGGGATTATGCTGGCTATGCCGAATGCCACTGGCGTTAGGTCATTGGGGGATTTGTTCGGTCTGTTCACGCGCCCCCCGCACAGATAAAACGTTATGCCCACAATGTGGATTACCCGCCACACACTCCCACCTTCCCTGCGGTCGct < 2:379447/151‑1 (MQ=255)
gTACCGGGATTATGCTGGCTATGCCGAATGCCACTGGCGTTAGGTCATTGGGGGATTTGTTCGGTCTGTTCACGCGCCACCCGCACAGATAAAACGTTATGCCCACAATGTGGATTACCCGCCACACACTCCCACCTTCCCTGCGGTCGct > 4:760178/1‑151 (MQ=255)
tACCGGGATTATGCTGGCTATGCCGAATGCCACTGGCGTTAGGTCATTGGGGGATTTGTTCGGTCTGTTCACGCGCCACCCGCACAGATAAAACGTTATGCCCACAATGTGGATTACCCGCCACACACTCCCACCTTCCCTGCGGTCGctg > 4:1380396/1‑151 (MQ=255)
aCCGGGATTATGCTGGCTATGCCGAATGCCACTGGCGTTAGGTCATTGGGGGATTTGTTCGGTCTGTTCACGCGCCACCCGCACAGATAAAACGTTATGCCCACAATGTGGATTACCCGCCACACACTCCCACCTTCCCTGCGGTCGctgc > 4:672735/1‑151 (MQ=255)
ggATTATGCTGGCTATGCCGAATGCCACTGGCGTTAGGTCATTGGGGGATTTGTTCGGTCTGTTCACGCGCCACCCGCACAGATAAAACGTTATGCCCACAATGTGGATTACCCGCCACACACTCCCACCTTCCCTGCGGTCGctgcctga < 2:1661300/151‑2 (MQ=255)
gATTATGCTGGCTTTGCCGAATGCCACTGGCGTTAGGTCCTTGGGGGTTTTGTTCGGTCTGTTCCCGCCCCCCCCGCACAGATAACCCGTTCCGCCCACAATGTGGATTACCCGCCACGCACTCCCACCTTCCCTGCGGTCGCTGCCTGCa < 1:146724/151‑1 (MQ=255)
tttttttgcctttcccGAATGCCACTGGCTTTTGTTCATTGGGGTTTTTTTTCGGTCTGTCCCCGCCCCCCCCGCACAGATAAATTGTTATGCCCACATTTTGGATTCCCCGCCACACACTCCCGCCTTCCCTGCGGTCGctgcctgc < 4:38292/134‑1 (MQ=255)
ttATGCTGGCTATGCCGAATGCCACTGGCGTTAGGTCATTGGGGGATTTGTTCGGTCTGTTCACGCGCCACCCGCACAGATAAAACGTTATGCCCACAATGTGGATTACCCGCCACACACTCCCACCTTCCCTGCGGTCGCTGCCTGCaa > 1:288415/1‑150 (MQ=255)
gCTGGCTATGCCGAATGCCACTGGCGTTAGGTCATTGGGGGATTTGTTCGGTCTGTTCACGCGCCCCCCGCACAGATAAACCGTTATGCCCACAATGTGGATTACCCGCCACACACTCCCACCTTCCCTGCGGTCGCTGCCTGCAAAAAc < 1:436516/150‑1 (MQ=255)
tATGCCGAATGCCACTGGCGTTAGGTCATTGGGGGATTTGTTCGGTCTGTTCACGCGCCACCCGCACAGATAAAACGTTATGCCCACAATGTGGATTACCCGCCACACACTCCCACCTTCCCTGCGGTCGCTGCCTGCAAAAACCgccgcc > 4:552381/1‑151 (MQ=255)
gCCGAATGCCCCGGGCGTTAGGTCATTGGGGTATTTGTTCGGTCTTTCCACGCCCCCCCCGCCCAGATAAAGCGTTAGGCCCACAATGTGGATACCCCGCCACACACTCCCACCTTCCCTGCGGTCGCTGCCTGCAAAAACCGCCGCCCt < 1:190973/150‑1 (MQ=255)
gCCGAATGCCACTGGCGTTAGGTCATTGGGGGATTTGTTCGGTCTGTTCACGCGCCACCCGCACAGATAAAACGTTATGCCCACAATGTGGATTACCCGCCACACACTCCCACCTTCCCTGCGGTCGCTGCCTGCAAAAACCGCCGCCCTg > 1:206782/1‑151 (MQ=255)
ccGAATGCCACTGGCGTTAGGTCATTGGGGGATTTGTTCGGTCTGTTCACGCGCCCCCCGCACAGATAAAACGTTATGCCCACAATGTGGATTACCCGCCACACACTCCCACCTTCCCTGCGGTCGCTGCCTGCAAAAACCGCCGCCCTgg < 4:1592771/151‑1 (MQ=255)
ccGAATCCCCCTGGCGTTAGGTCATTGGGGGATTTGTTCGGTCTGTTCACGCCCCCCCCGCACAGATAAACCGTTATGCCCACAATGTGGATTACCCGCCACACACTCCCACCTTCCCTGCGGTCGCTGCCTGCAAAAACCGCCGCCCTgg < 2:859821/151‑1 (MQ=255)
aaTGCCACTGGCGTTAGTTCATTGGGGGATTTGTTCGGTCTGTTCACGCGCCACCCGCACAGAAAAAACGTTAGGCCCACAATGTGGTTTACCCGCCACACACTCCCACCTTCCCTGCGGTCGCTGCCTGCAAAAACCGCCGCCCTGGc < 4:1431338/149‑1 (MQ=255)
aaTGCCACTGGCGTTAGGTCATTGGGGGATTTGTTCGGTCTGTTCACGCGCCACCCGCACAGATAAAACGTTATGCCCACAATGTGGATTACCCGCCACACACTCCCACCTTCCCTGCGGTCGCTGCCTGCAAAAACCGCCGCCCTGGCaa < 4:239798/151‑1 (MQ=255)
aaTCCCACTGGTGTTAGGTCATTGGGGTATTTGTGCGGTTTGTGCCCGCGCCCCCCGCACAAAAAAAACTTAATCCCCACAAGGTGAATTACCCGCGACACACTCCCACCTTCCCTGCGGTCGCTGCCTGCAAAAACCGCCGCCCTgg < 4:1273883/148‑1 (MQ=255)
ggggtaaGGTCATTGGGGGATTTGTTCGTTCTGTTCACGCCCCACCCGCACAGAAAAACCTTTATGCCCAAAATGTGGATTACCCGCCACACACTCCCACCTTCCCTGCGGTCGCTGCCTGCAAAAACCGCCGCCCTGGCAAAGACTGGTc < 2:465421/145‑1 (MQ=255)
ggCGTTAGGTCATTGGGGGATTTGTTCGGTCTGTTCACGCGCCCCCCGCACAGATAAAACGTTATGCCCACAATGTGGATTACCCGCCACACACTCCCACCTTCCCTGCGGTCGCTGCCTGCAAAAACCGCCGCCCTGGCAAAGACTGGt < 2:803946/150‑1 (MQ=255)
tAGGTCATTGGGGGATTTGTTCGGTCTGTTCACGCGCCACCCGCACAGATAAAACGTTATGCCCACAATGTGGATTACCCGCCACACACTCCCACCTTCCCTGCGGTCGCTGCCTGCAAAAACCGCCGCCCTGGCAAAGACTGGTCACGGt > 4:715715/1‑151 (MQ=255)
gTCATTGGGGGATTTGTTCGGTCTGTTCACGCGCCACCCGCACAGATAAAACGTTATGCCCACAATGTGGATTACCCGCCACACACTCCCACCTTCCCTGCGGTCGCTGCCTGCAAAAACCGCCGCCCTGGCAAAGACTGGTCACGGTTGc > 2:865630/1‑151 (MQ=255)
gTCATTGGGGGATTTGTTCGGTCTGTTCACGCGCCACCCGCACAGATAAAACGTTATGCCCACAATGTGGATTACCCGCCACACACTCCCACCTTCCCTGCGGTCGCTGCCTGCAAAAACCGCCGCCCTGGCAAAGACTGGTCACGGTTGc > 4:446703/1‑151 (MQ=255)
cATTGGGGGATTTGTTCGGTCTGTTCACGCGCCCCCCGCACAGATAAAACGTTATGCCCACAATGTGGATTACCCGCCACACACTCCCACCTTCCCTGCGGTCGCTGCCTGCAAAAACCGCCGCCCTGGCAAAGACTGGTCACGGTTGcc < 4:128873/150‑1 (MQ=255)
cATTGGGGGATTTGTTCGGTCTGTTCACGCGCCACCCGCACAGATAAAACGTTATGCCCACAATGTGGATTACCCGCCACACACTCCCACCTTCCCTGCGGTCGCTGCCTGCAAAAACCGCCGCCCTGGCAAAGACTGGTCACGGTTGCCg > 3:290931/1‑151 (MQ=255)
cATGGGGGGATTTGTTCGGTCTGTTCACGCGCCCCCCGCACAGATAAACCGTTATGCCCACAATGTGGATTCCCCGCCACACACTCCCACCTTCCCTGCGGTCGCTGCCTGCAAAAACCGCCGCCCTGGCAAAGACTGGTCACGGTTGcc < 4:388093/150‑1 (MQ=255)
gggggATTTTTTCGGTCTTTTCACGCGCCCCCCGCACAAAAAAAACTTTATGCCCAAAATGTGGATTCCCCGCCACACACTCCCACCTTCCCTGCGGTCGCTGCCTGCAAAAACCGCCGCCCCGGCAAAGACTGGTCACGGTTGCCGACt < 4:128557/150‑1 (MQ=255)
gggggATTTGTTCGGTCTGTTCACGCGCCCCCCGCACAGATAAAACGTTATGCCCACAATGTGGATTACCCGCCACACACTCCCACCTTCCCTGCGGTCGCTGCCTGCAAAAACCGCCGCCCTGGCAAAGACTGGTCACGGTTGCCGACt < 4:1072645/150‑1 (MQ=255)
gggggATTTGTTCGGTCTGTTCACGCGCCACCCGCACAGATAAAACGTTATGCCCACAATGTGGATTACCCGCCACACACTCCCACCTTCCCTGCGGTCGCTGCCTGCAAAAACCGCCGCCCTGGCAAAGACTGGTCACGGTTGCCGACt > 1:403077/1‑150 (MQ=255)
ggggaATTTGTTCGGTCTGTTCACGCGCCCCCCGCACAAATAAAACTTTATGCCCACATTGGGGATTACCCGCCACACACTCCCACCTTCCCTGCGGTCGCTGCCTGCAAAAACCGCCGCCCTGGCAAAGACTGGTCACGGTTGCCGACTa < 3:403094/151‑1 (MQ=255)
gggATTTGTTCGGTCTGTTCACGCGCCCCCCGCACAGATAAAACGTTATGCCCACAATGTGGATTACCCGCCACACACTCCCACCTTCCCTGCGGTCGCTGCCTGCAAAAACCGCCGCCCTGGCAAAGACTGGTCACGGTTGCCGACTATg < 4:1451467/151‑1 (MQ=255)
tGTTCGGTCTGTTCACGCGCCACCCGCACAGATAAAACGTTATGCCCACAATGTGGATTACCCGCCACACACTCCCACCTTCCCTGCGGTCGCTGCCTGCAAAAACCGCCGCCCTGGCAAAGACTGGTCACGGTTGCCGACTATGcgccgc > 4:140612/1‑151 (MQ=255)
tGTTCGGTCTGTTCACGCGCCACCCGCACAGATAAAACGTTATGCCCACAATGTGGATTACCCGCCACACACTCCCACCTTCCCTGCGGTCGCTGCCTGCAAAAACCGCCGCCCTGGCAAAGACTGGTCACGGTTGCCGACTATGcgccgc > 3:108189/1‑151 (MQ=255)
ttCGGTCTTTTCACGCCCCCCCCGCACAGATAAAACGTTATGCCCACAATGTGGATTACCCGCCACACACTCCCACCTTCCCTGCGGTCGCTGCCTGCAAAAACCGCCGCCCTGGCAAAGACTGGTCACGGTTGCCGACTATGCgccgcc < 4:291944/150‑1 (MQ=255)
tCGGTCTGTTCACGCGCCACCCGCACAGATAAAACGTTATGCCCACAATGTGGATTACCCGCCACACACTCCCACCTTCCCTGCGGTCGCTGCCTGCAAAAACCGCCGCCCTGGCAAAGACTGGTCACGGTTGCCGACTATGCGCCGCCGt > 2:588429/1‑151 (MQ=255)
ggTCTGTTCACGCGCCACCCGCACAGATAAAACGTTATGCCCACAATGTGGATTACCCGCCACACACTCCCACCTTCCCTGCGGTCGCTGCCTGCAAAAACCGCCGCCCTGGCAAAGACTGGTCACGGTTGCCGACTATGCGCCGCCGtt > 2:370937/1‑150 (MQ=255)
gTTCACGCGCCACCCGCACAGATAAAACGTTATGCCCACAATGTGGATTACCCGCCACACACTCCCACCTTCCCTGCGGTCGCTGCCTGCAAAAACCGCCGCCCTGGCAAAGACTGGTCACGGTTGCCGACTATGCGCCGCCGTTAAGTcc > 4:267322/1‑151 (MQ=255)
caggcccccccccCACAGAAAAAACGTTATCCCCAAAGTGTGGATTACCCGCCACACCCTCCCACCTTCCCGGCGGTCGCTGCCTGCAAAAACCGCCGCCCTGGCAAAGACTGGTCACGGTTGCCGACTATGCGCCGCCGTTAAGTCCGCt < 2:1538579/142‑1 (MQ=255)
cACGCCCCCCCCGCACAGATAAACCGTTATGCCCACAATGTGGATTCCCCGCCACACACTCCCACCTTCCCTGCGGTCGCTGCCTGCAAAAACCGCCGCCCTGGCAAAGACTGGTCACGGTTGCCGACTATGCGCCGCCGTTAAGTCCGc < 4:1376569/150‑1 (MQ=255)
cACGCCCCCCCCGCACAGAAAAACCTTTAGGCCCAAAATGTGGATTACCCGCCACACACTCCCACCTTCCCTGCGGTCGCTGCCTGCAAAAACCGCCGCCCTGGCAAAGACTGGTCACGGTTGCCGACTATGCGCCGCCGTTAAGTCCg < 2:583599/149‑1 (MQ=255)
cACGCCCCCCCCCCACAGATAAAACTTTATGCCCACAATGGGGATTCCCCGCCACACACTCCCACCTTCCCTGCGGTCGCTGCCTGCAAAAACCGCCGCCCTGGCAAAGACTGGTCACGGTTGCCGACTATGCGCCGCCGTTAAGTCCGc < 1:6820/150‑1 (MQ=255)
gcgcCACCCGCACAGATAAAACGTTATGCCCACAATGTGGATTACCCGCCACACACTCCCACCTTCCCTGCGGTCGCTGCCTGCAAAAACCGCCGCCCTGGCAAAGACTGGTCACGGTTGCCGACTATgc > 3:117712/1‑130 (MQ=255)
cgcCCCCCGCACAGATAAAACGTTATGCCCACAATGTGGATTACCCGCCACACACTCCCACCTTCCCTGCGGTCGCTGCCTGCAAAAACCGCCGCCCTGGCAAAGACTGGTCACGGTTGCCGACTATgc < 1:117698/129‑1 (MQ=255)
cgcCCCCCCCACAAAAAAACCGTTAGCCCCAAAATGTGGTTACCCCGCCACACACTCCCACCTTCCCTGCGGTCGCTGCCTGCAAAAACCGCCGCCCTGGCAAAGACTGGTCACGGTTGCCGACTATGCGCCGCCGtt < 2:1378677/138‑1 (MQ=255)
ccACCCGCACAGATAAAACGTTATGCCCACAATGTGGATTACCCGCCACACACTCCCACCTTCCCTGCGGTCGCTGCCTGCAAAAACCGCCGCCCTGGCAAAGACTGGTCACGGTTGCCGACTATGCGCCGCCGTTAAGTCCGCTTATcc > 2:1575937/1‑150 (MQ=255)
cACCCGCACAGATAAAACGTTATGCCCACAATGTGGATTACCCGCCACACACTCCCACCTTCCCTGCGGTCGCTGCCTGCAAAAACCGCCGCCCTGGCAAAGACTGGTCACGGTTGCCGACTATGCGCCGCCGTTAAGTCCGCTTATccac > 2:1147324/1‑151 (MQ=255)
cACCCGCACAGATAAAACGTTATGCCCACAATGTGGATTACCCGCCACACACTCCCACCTTCCCTGCGGTCGCTGCCTGCAAAAACCGCCGCCCTGGCAAAGACTGGTCACGGTTGCCGACTATGCGCCGCCGTTAAGTCCGCTTATccac > 1:268926/1‑151 (MQ=255)
cACCCGCACAGATAAAACGTTATGCCCACAATGTGGATTACCCGCCACACACTCCCACCTTCCCTGCGGTCGCTGCCTGCAAAAACCGCCGCCCTGGCAAAGACTGGTCACGGTTGCCGACTATGCGCCGCCGTTAAGTCCGCTTATccac > 2:682812/1‑151 (MQ=255)
aCCCGCACAGATAAAACGTTATGCCCACAATGTGGATTACCCGCCACACACTCCCACCTTCCCTGCGGTCGCTGCCTGCAAAAACCGCCGCCCTGGCAAAGACTGGTCACGGTTGCCGACTATGCGccgccg > 2:838010/1‑132 (MQ=255)
ccccCAAAGATAAAACTTTAGGCCCACAATGTGGATTCCCCGCCACACACTCCCCCCTTCCCTGCGGTCGCTGCCTGCAAAAACCGCCGCCCTGGCAAAGACTGGTCACGGTTGCCGACTATGCGCCGCCGTTAAGTCCGCTTATccacca < 4:158615/151‑1 (MQ=255)
cccGCACAGATAAAACGTTATGCCCACAATGTGGATTACCCGCCACACACTCCCACCTTCCCTGCGGTCGCTGCCTGCAAAAACCGCCGCCCTGGCAAAGACTGGTCACGGTTGCCGACTATGCGccgccg < 4:839111/131‑1 (MQ=255)
cccGCACAGATAAAACGTTATCCCCACAATGTGGATTCCCCGCCACACACTCCCACCTTCCCTGCGGTCGCTGCCTGCAAAAACCGCCGCCCTGGCAAAGACTGGTCACGGTTGCCGACTATGCGCCGCCGTTAAGTCCGCTTATccacc < 2:542310/150‑1 (MQ=255)
cacaGATAAAACGTTATGCCCACAATGTGGATTACCCGCCACACACTCCCACCTTCCCTGCGGTCGCTGCCTGCAAAAACCGCCGCCCTGGCAAAGACTGGTCACGGTTGCCGACTATGCGCCGCCGTTAAGTCCGCTTATCCACCAGCtt > 4:394032/1‑151 (MQ=255)
acaGATAAAACGTTATGCCCACAATGGGGATTACCCGCCACACACTCCCACCTTCCCTGCGGTCGCTGCCTGCAAAAACCGCCGCCCTGGCAAAGACTGGTCACGGTTGCCGACTATGCGCCGCCGTTAAGTCCGCTTATCCACCAGCtt < 4:643996/150‑1 (MQ=255)
aGATAAAACTTTATGCCCACAATGTGGATTCCCCGCCACACACTCCCACCTTCCCTGCGGTCGCTGCCTGCAAAAACCGCCGCCCTGGCAAAGACTGGTCACGGTTGCCGACTATGCGCCGCCGTTAAGTCCGCTTATCCACCAGCTTaaa < 3:296839/151‑1 (MQ=255)
gaaaaacCGTGATGCCCACAATGAGACTTCCCCGCCACACACTCCCACCTTCCCTGCGGTCGCTGCCTGCAAAAACCGCCGCCCTGGCAAAGACTGGTCACGGTTGCCGACTATGCGCCGCCGTTAAGTCCGCTTATCCACCAGCtt < 2:212909/144‑1 (MQ=255)
gATAAAACGTTATGCCCACAATGTGGATTACCCGCCACACACTCCCACCTTCCCTGCGGTCGCTGCCTGCAAAAACCGCCGCCCTGGCAAAGACTGGTCACGGTTGCCGACTATGCGCCGCCGTTAAGTCCGCTTATCCACCAGCTTAAAt > 1:244317/1‑151 (MQ=255)
aTAAAACGTTATGCCCACAATGTGGATTACCCGCCACACACTCCCACCTTCCCTGCGGTCGCTGCCTGCAAAAACCGCCGCCCTGGCAAAGACTGGTCACGGTTGCCGACTATGCGCCGCCGTTAAGTCCGCTTATCCACCAGCTTAAAtt > 4:742270/1‑151 (MQ=255)
aTAAAACGTTATGCCCACAATGTGGATTACCCGCCACACACTCCCACCTTCCCTGCGGTCGCTGCCTGCAAAAACCGCCGCCCTGGCAAAGACTGGTCACGGTTGCCGACTATGCGCCGCCGTTAAGTCCGCTTATCCACCAGCTTAAAtt > 4:869510/1‑151 (MQ=255)
tAAAACGTTATGCCCACAATGTGGATTACCCGCCACACACTCCCACCTTCCCTGCGGTCGCTGCCTGCAAAAACCGCCGCCCTGGCAAAGACTGGTCACGGTTGCCGACTATGCGCCGCCGTTAAGTCCGCTTATCCACCAGCTTAAAttt > 1:38397/1‑151 (MQ=255)
aaacCGTTATGCCCAAAATGTGGATTACCCGCCACACACTCCCACCTTCCCTGCGGTCGCTGCCTGCAAAAACCGCCGCCCTGGCAAAGACTGGTCACGGTTGCCGACTATGCGCCGCCGTTAAGTCCGCTTATCCACCAGCTTAAAtttt < 4:374699/151‑1 (MQ=255)
aaaagttattccccAAAATGGGCATTCCCCGCCACACACTCCCACCTTCCCTGCGGTCGCTGCCTGCAAAAACCGCCGCCCTGGCAAAGACTGGTCACGGTTGCCGACTATGCGCCGCCGTTAAGTCCGCTTATCCACCAGCTTAAAttt < 2:255285/139‑1 (MQ=255)
aaCGTTATGCCCACAATGTGGATTACCCGCCACACACTCCCACCTTCCCTGCGGTCGCTGCCTGCAAAAACCGCCGCCCTGGCAAAGACTGGTCACGGTTGCCGACTATGCGCCGCCGTTAAGTCCGCTTATCCACCAGCTTAAATTTTcc > 4:250041/1‑151 (MQ=255)
cGTTATGCCCACAATGTGGATTACCCGCCACACACTCCCACCTTCCCTGCGGTCGCTGCCTGCAAAAACCGCCGCCCTGGCAAAGACTGGTCACGGTTGCCGACTATGCGCCGCCGTTAAGTCCGCTTATCCACCAGCTTAAATTTTCCCg > 2:1283781/1‑151 (MQ=255)
ttATGCCCACAATGTGGATTACCCGCCACACACTCCCACCTTCCCTGCGGTCGCTGCCTGCAAAAACCGCCGCCCTGGCAAAGACTGGTCACGGTTGCCGACTATGCGCCGCCGTTAAGTCCGCTTATCCACCAGCTTAAATTTTCCCGgc > 4:776335/1‑151 (MQ=255)
ttATCCCCAAAATGTGGTTTCCCCGCCACACACTCCCACCTTCCCTGCGGTCGCTGCCTGCAAAAACCGCCGCCCTGGCAAAGACTGGTCACGGTTGCCGACTATGCGCCGCCGTTAAGTCCGCTTATCCACCAGCTTAAATTTTccc < 4:884711/148‑1 (MQ=255)
cccAAATTGTGGTTTCCCCGCCACACACTCCCACCTTCCCTGCGGTCGCTGCCTGCAAAAACCGCCGCCCTGGCAAAGACTGGTCACGGTTGCCGACTATGCGCCGCCGTTAAGTCCGCTTATCCACCAGCTTAAATTTTCCCGGCGCAg < 2:1163250/150‑1 (MQ=255)
ccACAATGTGGATTACCCGCCACACACTCCCACCTTCCCTGCGGTCGCTGCCTGCAAAAACCGCCGCCCTGGCAAAGACTGGTCACGGTTGCCGACTATGCGCCGCCGTTAAGTCCGCTTATCCACCAGCTTAAATTTTCCCGGCGCAGTg < 3:38399/151‑1 (MQ=255)
ccACAAGGTGGATTACCCGCCACACACCCCCCCCTTCCCTGCGGTCGCTGCCTGCAAAAACCGCCGCCCTGGCAAAGACTGTTCACGGTTGCCGACTATGCGCCGCCGTTAAGTCCGCTTATCCACCAGCTTAAATTTTCCCGGCGCa < 4:1125336/148‑1 (MQ=255)
acaATGTGGTTTACCCGCCACACACTCCCACCTTCCCTGCGGTCGCTGCCTGCAAAAACCGCCGCCCTGGCAAAGACTGGTCACGGTTGCCGACTATGCGCCGCCGTTAAGTCCGCTTATCCACCAGCTTAAATTTTCCCGGCGCAGTGaa < 2:812291/151‑1 (MQ=255)
acaATGTGGATTCCCCGCCACACACTCCCACCTTCCCTGCGGTCGCTGCCTGCAAAAACCGCCGCCCTGGCAAAGACTGGTCACGGTTGCCGACTATGCGCCGCCGTTAAGTCCGCTTATCCACCAGCTTAAATTTTCCCGGCGCAGTGaa < 4:1491021/151‑1 (MQ=255)
acaATGTGGATTCCCCGCCACACACTCCCACCTTCCCTGCGGTCGCTGCCTGCAAAAACCGCCGCCCTGGCAAAGACTGGTCACGGTTGCCGACTATGCGCCGCCGTTAAGTCCGCTTATCCACCAGCTTAAATTTTCCCGGCGCAGTGaa < 4:1417189/151‑1 (MQ=255)
caATGTGGATTACCCGCCACACACTCCCACCTTCCCTGCGGTCGCTGCCTGCAAAAACCGCCGCCCTGGCAAAGACTGGTCACGGTTGCCGACTATGCGCCGCCGTTAAGTCCGCTTATCCACCAGCTTAAATTTTCCCGGCGCAGTGaa > 2:864468/1‑150 (MQ=255)
aaTGTGGATTCCCCGCCACACACTCCCACCTTCCCTGCGGTCGCTGCCTGCAAAAACCGCCGCCCTGGCAAAGACTGGTCACGGTTGCCGACTATGCGCCGCCGTTAAGTCCGCTTATCCACCAGCTTAAATTTTCCCGGCGCAGTGaaa < 4:1215559/150‑1 (MQ=255)
aTGTGGATTACCCGCCACACACTCCCACCTTCCCTGCGGTCGCTGCCTGCAAAAACCGCCGCCCTGGCAAAGACTGGTCACGGTTGCCGACTATGCGCCGCCGTTAAGTCCGCTTATCCACCAGCTTAAATTTTCCCGGCGCAGTGAAATc > 2:507510/1‑151 (MQ=255)
gtgGATTACCCGCCACACACTCCCACCTTCCCTGCGGTCGCTGCCTGCAAAAACCGCCGCCCTGGCAAAGACTGGTCACGGTTGCCGACTATGCGCCGCCGTTAAGTCCGCTTATCCACCAGCTTAAATTTTCCCGGCGCAGTGAAATCGc > 4:1508800/1‑151 (MQ=255)
gtgGATTACCCGCCACACACTCCCACCTTCCCTGCGGTCGCTGCCTGCAAAAACCGCCGCCCTGGCAAAGACTGGTCACGGTTGCCGACTATGCGCCGCCGTTAAGTCCGCTTATCCACCAGCTTAAATTTTCCCGGCGCAGTGAAATCGc < 3:122706/151‑1 (MQ=255)
ggtttccccGCCACACACTCCCACCTTCCCTGCGGTCGCTGCCTGCAAAAACCGCCGCCCTGGCAAAGACTGGTCACGGTTGCCGACTATGCGCCGCCGTTAAGTCCGCTTATCCACCAGCTTAAATTTTCCCGGCGCAGTGAAATCGCCa < 4:1456486/145‑1 (MQ=255)
ggATTACCCGCCACACACTCCCACCTTCCCTGCGGTCGCTGCCTGCAAAAACCGCCGCCCTGGCAAAGACTGGTCACGGTTGCCGACTATGCGCCGCCGTTAAGTCCGCTTATCCACCAGCTTAAATTTTCCCGGCGCAGTGAAATCg < 4:1313042/148‑1 (MQ=255)
ggATTACCCGCCACACACTCCCACCTTCCCTGCGGTCGCTGCCTGCAAAAACCGCCGCCCTGGCAAAGACTGGTCACGGTTGCCGACTATGCGCCGCCGTTAAGTCCGCTTATCCACCAGCTTAAATTTTCCCGGCGCAGTGAAATCGcc > 2:423768/1‑150 (MQ=255)
tACCCGCCACACACTCCCACCTTCCCTGCGGTCGCTGCCTGCAAAAACCGCCGCCCTGGCAAAGACTGGTCACGGTTGCCGACTATGCGCCGCCGTTAAGTCCGCTTATCCACCAGCTTAAATTTTCCCGGCGCAGTGAAATCGCCAgcgc > 2:1314242/1‑151 (MQ=255)
aCCCGCCACACACTCCCACCTTCCCTGCGGTCGCTGCCTGCAAAAACCGCCGCCCTGGCAAAGACTGGTCACGGTTGCCGACTATGCGCCGCCGTTAAGTCCGCTTATCCACCAGCTTAAATTTTCCCGGCGCAGTGAAATCGCCAGCGcc > 2:1025834/1‑151 (MQ=255)
aCCCGCCACACACTCCCACCTTCCCTGCGGTCGCTGCCTGCAAAAACCGCCGCCCTGGCAAAGACTGGTCACGGTTGCCGACTATGCGCCGCCGTTAAGTCCGCTTATCCACCAGCTTAAATTTTCCCGGCGCAGTGAAATCGCCAGCGcc > 2:1296465/1‑151 (MQ=255)
cccGCCACACCCTCCCACCTTCCCTGCGGTCGCTGCCTGCAAAAACCGCCGCCCTGGCAAAGACTGGTCACGGTTGCCGACTATGCGCCGCCGTTAAGTCCGCTTATCCACCAGCTTAAATTTTCCCGGCGCAGTGAAATCGCCAgcg < 2:1557058/148‑1 (MQ=255)
ccGCCACACACTCCCACCTTCCCTGCGGTCGCTGCCTGCAAAAACCGCCGCCCTGGCAAAGACTGGTCACGGTTGCCGACTATGCGCCGCCGTTAAGTCCGCTTATCCACCAGCTTAAATTTTCCCGGCGCAGTGAAATCGCCAGCGCCCt > 4:322799/1‑151 (MQ=255)
tgCCACACACTCCCACCTTCCCTGCGGTCGCTGCCTGCAAAAACCGCCGCCCTGGCAAAGACTGGTCACGGTTGCCGACTATGCGCCGCCGTTAAGTCCGCTTATCCACCAGCTTAAATTTTCCCGGCGCAGTGAAATCGCCAGCGCCCTg > 2:101715/2‑151 (MQ=255)
ccACACACTCCCACCTTCCCTGCGGTCGCTGCCTGCAAAAACCGCCGCCCTGGCAAAGACTGGTCACGGTTGCCGACTATGCGCCGCCGTTAAGTCCGCTTATCCACCAGCTTAAATTTTCCCGGCGCAGTGAAATCGCCAGCGCCCTGTc < 4:1652943/151‑1 (MQ=255)
ccACACACTCCCACCTTCCCTGCGGTCGCTGCCTGCAAAAACCGCCGCCCTGGCAAAGACTGGTCACGGTTGCCGACTATGCGCCGCCGTTAAGTCCGCTTATCCACCAGCTTAAATTTTCCCGGCGCAGTGAAATCGCCAGCGCCCTGTc > 3:287735/1‑151 (MQ=255)
acTCCCACCTTCCCTGCGGTCGCTGCCTGCAAAAACCGCCGCCCTGGCAAAGACTGGTCACGGTTGCCGACTATGCGCCGCCGTTAAGTCCGCTTATCCACCAGCTTAAATTTTCCCGGCGCAGTGAAATCGCCAGCGCCCTGTCACGTCt > 2:1622015/1‑151 (MQ=255)
cTCCCACCTTCCCTGCGGTCGCTGCCTGCAAAAACCGCCGCCCTGGCAAAGACTGGTCACGGTTGCCGACTATGCGCCGCCGTTAAGTCCGCTTATCCACCAGCTTAAATTTTCCCGGCGCAGTGAAATCGCCAGCGCCCTGTCACGTCTg > 3:367034/1‑151 (MQ=255)
tCCCACCTTCCCTGCGGTCGCTGCCTGCAAAAACCGCCGCCCTGGCAAAGACTGGTCACGGTTGCCGACTATGCGCCGCCGTTAAGTCCGCTTATCCACCAGCTTAAATTTTCCCGGCGCAGTGAAATCGCCAGCGCCCTGTCACGTCTGt > 4:485372/1‑151 (MQ=255)
tCCCACCTTCCCTGCGGTCGCTGCCTGCAAAAACCGCCGCCCTGGCAAAGACTGGTCACGGTTGCCGACTATGCGCCGCCGTTAAGTCCGCTTATCCACCAGCTTAAATTTTCCCGGCGCAGTGAAATCGCCAGCGCCCTGTCACGTCTGt > 2:1498622/1‑151 (MQ=255)
cccACCTTCCCTGCGGTCGCTGCCTGCAAAAACCGCCGCCCTGGCAAAGACTGGTCACGGTTGCCGACTATGCGCCGCCGTTAAGTCCGCTTATCCACCAGCTTAAATTTTCCCGGCGCAGTGAAATCGCCAGCGCCCTGTCACGTCTGtt < 2:1495191/151‑1 (MQ=255)
|
AACATATGCTAACAGTACCGGGATTATGCTGGCTATGCCGAATGCCACTGGCGTTAGGTCATTGGGGGATTTGTTCGGTCTGTTCACGCGCCACCCGCACAGATAAAACGTTATGCCCACAATGTGGATTACCCGCCACACACTCCCATCTTCCCTGCGGTCGCTGCCTGCAAAAACCGCCGCCCTGGCAAAGACTGGTCACGGTTGCCGACTATGCGCCGCCGTTAAGTCCGCTTATCCACCAGCTTAAATTTTCCCGGCGCAGTGAAATCGCCAGCGCCCTGTCACGTCTGTT > NC_000913/3544877‑3545171
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 13 ≤ ATCG/ATCG < 17 ≤ ATCG/ATCG < 35 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
GATK/CNVnator alignment
N/A
