Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A3 F50 I3 R1
|
160 |
117.2 |
4331776 |
85.4% |
3699336 |
149.7 |
Breseq alignment
BRESEQ :: Evidence
|
| evidence |
seq id |
position |
mutation |
annotation |
gene |
description |
| RA |
NC_000913 |
3,832,490 |
T→C |
H683R (CAC→CGC) |
yicI ← |
putative alpha‑glucosidase |
|
| |
seq id |
position |
ref |
new |
freq |
score (cons/poly) |
reads |
annotation |
genes |
product |
| * | NC_000913 | 3,832,490 | 0 | T | C | 97.2%
| 365.0
/ ‑4.7
| 108 | H683R (CAC→CGC) | yicI | putative alpha‑glucosidase |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (0/3); new base C (50/54); total (50/58) |
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 2.46e-01 |
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.99e-01 |
Only 100 of 110 total aligned reads displayed.
CTTCGCCTCGCCCGCACCAGTCACAGTAATCGTGTTGCCAGTACGTGCTGCTTTTAAAGTAAAGATCACCGATCCGTCAGCAGCGGGCACTTCACAGACGGCTTCATGCCCGTCTTGCAGATTGAAGAGGTGGAATGCCGTGCCTTCGTGCCACACGTAATCGGGACGTTGATCGTTGTTGCCCAGCGCCAGTAGAGTGTTATCACGCACATAAACGGGCAGACTCAGGAAGCCGTGCTGCTGTTTATGCCAGCGACTACCGTCGAGTTCATCGTTGTGCCACAGGTGTGTCCAGC > NC_000913/3832342‑3832637
|
cttcGCCTCGCCCGCACCAGTCACAGTAATCGTGTTGCCAGTACGTGCTGCTTTTAAAGTAAAGATCACCGATCCGTCAGCAGCGGGCACTTCACAGACGGCTTCATGCCCGTCTTGCAGATTGAAGAGGTGGAATGCCGTGCCTTCgcgc > 4:905971/1‑151 (MQ=255)
cttcGCCTCGCCCGCACCAGTCACAGTAATCGTGTTGCCAGTACGTGCTGCTTTTAAAGTAAAGATCACCGATCCGTCAGCAGCGGGCACTTCACAGACGGCTTCATGCCCGTCTTGCAGATTGAAGAGGTGGAATGCCGTGCCTTCgcgc > 4:306817/1‑151 (MQ=255)
ttcGCCTCGCCCGCACCAGTCACAGTAATCGTGTTGCCAGTACGTGCTGCTTTTAAAGTAAAGATCACCGATCCGTCAGCAGCGGGCACTTCACAGACGGCTTCATGCCCGTCTTGCAGATTGAAGAGGTGGAATGCCGTGCCTTCGCGcc > 2:908411/1‑151 (MQ=255)
cctcgccCGCACCAGTCACAGTAATCGTGTTGCCAGTACGTGCTGCTTTTAAAGTAAAGATCACCGATCCGTCAGCAGCGGGCACTTCACAGACGGCTTCATGCCCGTCTTGCAGATTGAAGAGGTGGAATGCCGTGCCTTCGCGCCacac < 4:1211327/151‑1 (MQ=255)
gccCGCACCAGTCACAGTAATCGTGTTGCCAGTACGTGCTGCTTTTAAAGTAAAGATCACCGATCCGTCAGCAGCGGGCACTTCACAGACGGCTTCATGCCCGTCTTGCAGATTGAAGAGGTGGAATGCCGTGCCTTCGCGCCACACGTaa < 2:1629909/151‑1 (MQ=255)
gccCGCACCAGTCACAGTAATCGTGTTGCCAGTACGTGCTGCTTTTAAAGTAAAGATCACCGATCCGTCAGCAGCGGGCACTTCACAGACGGCTTCATGCCCGTCTTGCAGATTGAAGAGGTGGAATGCCGTGCCTTCGCGCCACACGTa > 1:166790/1‑150 (MQ=255)
gccCGCACAAGTCACAGTAATCGTGTTGCCAGTACGTGCTGCTTTTAAAGTAAAGATCACCGATCCGTCAGCAGCGGGCACTTCACAGACGGCTTCATGCCCGTCTTGCAGATTGAAGAGGTGGAATGCCGTGCCTTCGCGCCACACGTa > 2:1218636/1‑150 (MQ=255)
cGCACCAGTCACAGTAATCGTGTTGCCAGTACGTGCTGCTTTTAAAGTAAAGATCACCGATCCGTCAGCAGCGGGCACTTCACAGACGGCTTCATGCCCGTCTTGCAGATTGAAGAGGTGGAATGCCGTGCCTTCGCGCCACACGTAATCg < 3:232080/151‑1 (MQ=255)
cGCACCAGTAACAGTAATCGTGTTGCCAGTACGTGCTGCTTTTAAAGTAAAGATCACCGATCCGTCAGAAGCGGGCACTTCACAGACGGCTTCATGCCCGTCTTGCAGATTGCAGAGGTGGAATGCCGTGCCTTCGCGCCACACGTAATCg > 2:1503226/1‑151 (MQ=255)
gCACCAGTCACAGTAATCGTGTTGCCAGTACGTGCTGCTTTTAAAGTAAAGATCACCGATCCGTCAGCAGCGGGCACTTCACAGACGGCTTCATGCCCGTCTTGCAGATTGAAGAGGTGGAATGCCGTGCCTTCGCGCCACACGTAATCgg > 4:1561791/1‑151 (MQ=255)
gCACCAGTCACAGTAATCGTGTTGCCAGTACGTGCTGCTTTTAAAGTAAAGATCACCGATCCGTCAGCAGCGGGCACTTCACAGACGGCTTCATGCCCGTCTTGCAGATTGAAGAGGTGGAATGCCGTGCCTTCGCGCCACACGTAATCgg < 3:166804/151‑1 (MQ=255)
cacaGTAATCGTGTTGCCAGTACGTGCTGCTTTTAAAGTAAAGATCACCGATCCGTCAGCAGCGGGCACTTCACAGACGGCTTCATGCCCGTCTTGCAGATTGAAGAGGTGGAATGCCGTGCCTTCGCGCCACACGTAATCGGGACGTTg > 4:126136/1‑150 (MQ=255)
cacaGTAATCGTGTTGCCAGTACGTGCTGCTTTTAAAGTAAAGATCACCGATCCGTCAGCAGCGGGCACTTCACAGACGGCTTCATGCCCGTCTTGCAGATTGAAGAGGTGGAATGCCGTGCCTTCGCGCCACACGTAATCGGGACGTTGa < 4:662559/151‑1 (MQ=255)
acaGTAATCGTGTTGCCAGTACGTGCTGCTTTTAAAGTAAAGATCACCGATCCGTCAGCAGCGGGCACTTCACAGACGGCTTCATGCCCGTCTTGCAGATTGAAGAGGTGGAATGCCGTGCCTTCGCGCCACACGTAATCGGGACGTTGAt > 4:833674/1‑151 (MQ=255)
caGTAATCGTGTTGCCAGTACGTGCTGCTTTTAAAGTAAAGATCACCGATCCGTCAGCAGCGGGCACTTCACAGACGGCTTCATGCCCGTCTTGCAGATTGAAGAGGTGGAATGCCGTGCCTTCGCGCCACACGTAATCGGGACGTTGAt > 2:607707/1‑150 (MQ=255)
caGTAATCGTGTTGCCAGTACGTGCTGCTTTTAAAGTAAAGATCACCGATCCGTCAGCAGCGGGCACTTCACAGACGGCTTCATGCCCGTCTTGCAGATTGAAGAGGTGGAATGCCGTGCCTTCGCGCCACACGTAATCGGGACGTTGATc < 4:737764/151‑1 (MQ=255)
gTAATCGTGTTGCCAGTACGTGCTGCTTTTAAAGTAAAGATCACCGATCCGTCAGCAGCGGGCACTTCACAGACGGCTTCATGCCCGTCTTGCAGATTGAAGAGGTGGAATGCCGTGCCTTCGCGCCACACGTAATCGGGACGTTGATCgt < 4:400976/151‑1 (MQ=255)
gTAATCGTGTTGCCAGTACGTGCTGCTTTTAAAGTAAAGATCACCGATCCGTCAGCAGCGGGCACTTCACAGACGGCTTCATGCCCGTCTTGCAGATTGAAGAGGTGGAATGCCGTGCCTTCGCGCCACACGTAATCGGGACGTTGATCgt < 2:556314/151‑1 (MQ=255)
aTCGTGTTGCCAGTACGTGCTGCTTTTAAAGTAAAGATCACCGATCCGTCAGCAGCGGGCACTTCACAGACGGCTTCATGCCCGTCTTGCAGATTGAAGAGGTGGAATGCCGTGCCTTCGCGCCACACGTAATCGGGACGTTGATCgttgt < 2:1150771/151‑1 (MQ=255)
cGTGTTGCCAGTACGTGCTGCTTTTAAAGTAAAGATCACCGATCCGTCAGCAGCGGGCACTTCACAGACGGCTTCATGCCCGTCTTGCAGATTGAAGAGGTGGAATGCCGTGCCTTCGCGCCACACGTAATCGGGACGTTGATCGttgttg > 2:284661/1‑151 (MQ=255)
gtgtTGCCAGTACGTGCTGCTTTTAAAGTAAAGATCACCGATCCGTCAGCAGCGGGCACTTCACAGACGGCTTCATGCCCGTCTTGCAGATTGAAGAGGTGGAATGCCGTGCCTTCGCGCCACACGTAATCGGGACGTTGATCGTTGTTGc < 4:229005/151‑1 (MQ=255)
gtTGCCAGTACGTGCTGCTTTTAAAGTAAAGATCACCGATCCGTCAGCAGCGGGCACTTCACAGACGGCTTCATGCCCGTCTTGCAGATTGAAGAGGTGGAATGCCGTGCCTTCGCGCCACACGTAATCGGGACGTTGATCGTTGTTGccc < 4:68398/151‑1 (MQ=255)
tGCCAGTACGTGCTGCTTTTAAAGTAAAGATCACCGATCCGTCAGCAGCGGGCACTTCACAGACGGCTTCATGCCCGTCTTGCAGATTGAAGAGGTGGAATGCCGTGCCTTCGCGCCACACGTAATCGGGACGTTGATCGTTGTTGccc > 4:297569/1‑149 (MQ=255)
gCCAGTACGTGCTGCTTTTAAAGTAAAGATCACCGATCCGTCAGCAGCGGGCACTTCACAGACGGCTTCATGCCCGTCTTGCAGATTGAAGAGGTGGAATGCCGTGCCTTCGCGCCACACGTAATCGGGACGTTGATCGTTGTTGCCCAgc < 2:712420/151‑1 (MQ=255)
cAGTACGTGCTGCTTTTAAAGTAAAGATCACCGATCCGTCAGCAGCGGGCACTTCACAGACGGCTTCATGCCCGTCTTGCAGATTGAAGAGGTGGAATGCCGTGCCTTCGCGCCACACGTAATCGGGACGTTGATCGTTGTTGCCCAgcgc > 4:1522595/1‑151 (MQ=255)
cAGTACGTGCTGCTTTTAAAGTAAAGATCACCGATCCGTCAGCAGCGGGCACTTCACAGACGGCTTCATGCCCGTCTTGCAGATTGAAGAGGTGGAATGCCGTGCCTTCGCGCCACACGTAATCGGGACGTTGATCGTTGTTGCCCAgcg < 3:360037/150‑1 (MQ=255)
aGTACGTGCTGCTTTTAAAGTAAAGATCACCGATCCGTCAGCAGCGGGCACTTCACAGACGGCTTCATGCCCGTCTTGCAGATTGAAGAGGTGGAATGCCGTGCCTTCGCGCCACACGTAATCGGGACGTTGATCGTTGTTGCCCAGCGcc > 4:375156/1‑151 (MQ=255)
aGTACGTGCTGCTTTTAAAGTAAAGATCACCGATCCGTCAGCAGCGGGCACTTCACAGACGGCGTCATGCCCGTCTTGCAGATTGAAGAGGTGGAATGCCGTGCCTTCGCGCCACACGTAATCGGGACGTTGATCGTTGTTGCCCAGCGcc < 2:962418/151‑1 (MQ=255)
gTACGTGCTGCTTTTAAAGTAAAGATCACCGATCCGTCAGCAGCGGGCACTTCACAGACGGCTTCATGCCCGTCTTGCAGATTGAAGAGGTGGAATGCCGTGCCTTCGCGCCACACGTAATCGGGACGTTGATCGTTGTTGCCCAGCGcc > 2:1629268/1‑150 (MQ=255)
aCGTGCTGCTTTTAAAGTAAAGATCACCGATCCGTCAGCAGCGGGCACTTCACAGACGGCTTCATGCCCGTCTTGCAGATTGAAGAGGTGGAATGCCGTGCCTTCGCGCCACACGTAATCGGGACGTTGATCGTTGTTGCCCAGCGCCAGt < 2:304467/151‑1 (MQ=255)
cGTTCTGATTTGAAAGTAAACATCATCGTTTCTTCAGCAGCCGTCCCTTCTCAGACGGGTGCATGCCCGTCTTGCAGATTGAAGAGGCGTCATGCTTTCCCTGCGTGCTACACGTAACCTCTTCGTTGATCGTTGTTGCGCTGCGCCTGTa < 2:1165264/151‑1 (MQ=255)
cGTGCTGCTTTTAAAGTAAAGATCACCGATCCGTCAGCAGCGGGCACTTCACAGACGGCTTCATGCCCGTCTTGCAGATTGAAGAGGTGGAATGCCGTGCCTTCGCGCCACACGTAATCGGGACGTTGATCGTTGTTGCCCAGCGCCAGt > 3:305835/1‑150 (MQ=255)
gTGCTGCTTTTAAAGTAAAGATCACCGATCCGTCAGCAGCGGGCACTTCACAGACGGCTTCATGCCCGTCTTGCAGATTGAAGAGGTGGAATGCCGTGCCTTCGCGCCACACGTAATCGGGACGTTGATCGTTGTTGCCCAGCGCCAGTag < 2:350863/151‑1 (MQ=255)
gctgctTTTAAAGTAAAGATCACCGTTCCTTCAGCAGCGGGCACTTCACAGACGGCTTCATGCCCGTCTTGCAGATTGAAGAGGTGTAATGCCGTGCCTTCGCGCCACTCGTAATCGGTACGTTGATCGTTGTTGCCCAGCGCCAGTaga < 2:418687/150‑1 (MQ=255)
gctgctTTTAAAGTAAAGATCACCGATCCGTCAGCAGCGGGCACTTCACAGACGGCTTCATGCCCGTCTTGCAGATTGAAGAGGTGGAATGCCGTGCCTTCGCGCCACACGTAATCGGGACGTTGATCGTTGTTGCCCAGCGCCAGTaga < 2:1118871/150‑1 (MQ=255)
ctgctTTTAAAGTAAAGATCACCGATCCGTCAGCAGCGGGCACTTCACAGACGGCTTCATGCCCGTCTTGCAGATTGAAGAGGTGGAATGCCGTGCCTTCGCGCCACACGTAATCGGGACGTTGATCGTTGTTGCCCAGCGCCAGTAGAgt > 2:665389/1‑151 (MQ=255)
ttAAAGTAAAGATCACCGATCCGTCAGCAGCGGGCACTTCACAGACGGCTTCATGCCCGTCTTGCAGATTGAAGAGGTGGAATGCCGTGCCTTCGCGCCACACGTAATCGGGACGTTGATCGTTGTTGCCCAGCGCCAGTAGAGTGTTATc > 4:1251738/1‑151 (MQ=255)
taaagtaaagATCACCGATCCGTCAGCAGCGGGCACTTCACAGACGGCTTCATGCCCGTCTTGCAGATTGAAGAGGTGGAATGCCGTGCCTTCGCGCCACACGTAATCGGGACGTTGATCGTTGTTGCCCAGCGCCAGTAGAGTGTTATc < 2:479237/150‑1 (MQ=255)
aaagtaaagATCACCGATCCGTCAGCAGCGGGCACTTCACAGACGGCTTCATGCCCGTCTTGCAGATTGAAGAGGTGGAATGCCGTGCCTTCGCGCCACACGTAATCGGGACGTTGATCGTTGTTGCCCAGCGCCAGTAGAGTGTTATCAc < 3:370741/151‑1 (MQ=255)
agtaaagATCACCGATCCGTCAGCAGCGGGCACTTCACAGACGGCTTCATGCCCGTCTTGCAGATTGAAGAGGTGGAATGCCGTGCCTTCGCGCCACACGTAATCGGGACGTTGATCGTTGTTGCCCAGCGCCAGTAGAGTGTTATCACGc > 2:826526/1‑151 (MQ=255)
gtaaagATCACCGATCCGTCAGCAGCGGGCACTTCACAGACGGCTTCATGCCCGTCTTGCAGATTGAAGAGGTGGAATGCCGTGCCTTCGCGCCACACGTAATCGGGACGTTGATCGTTGTTGCCCAGCGCCAGTAGAGTGTTATCACGc > 2:60383/1‑150 (MQ=255)
aagATCACCGATCCGTCAGCAGCGGGCACTTCACAGACGGCTTCATGCCCGTCTTGCAGATTGAAGAGGTGGAATGCCGTGCCTTCGCGCCACACGTAATCGGGACGTTGATCGTTGTTGCCCAGCGCCAGTAGAGTGTTATCACGCACAt > 2:822548/1‑151 (MQ=255)
gATCACCGATCCGTCAGCAGCGGGCACTTCACAGACGGCTTCATGCCCGTCTTGCAGATTGAAGAGGTGGAATGCCGTGCCTTCGCGCCACACGTAATCGGGACGTTGATCGTTGTTGCCCAGCGCCAGTAGAGTGTTATCACGCACATaa < 4:875652/151‑1 (MQ=255)
gATCACCGATCCGTCAGCAGCGGGCACTTCACAGACGGCTTCATGCCCGTCTTGCAGATTGAAGAGGTGGAATGCCGTGCCTTCGAGCCACACGTAATCGGGACGTTGATCGTTGTTGCCCAGCGCCAGTAGAGTGTTATCACGCACATaa < 4:1567465/151‑1 (MQ=255)
aTCACCGATCCGTCAGCAGCGGGCACTTCACAGACGGCTTCATGCCCGTCTTGCAGATTGAAGAGGTGGAATGCCGTGCCTTCGCGCCACACGTAATCGGGACGTTGATCGTTGTTGCCCAGCGCCAGTAGAGTGTTATCACGCACATaa > 4:1072439/1‑150 (MQ=255)
tCACCGATCCGTCAGCAGCGGGCACTTCACAGACGGCTTCATGCCCGTCTTGCAGATTGAAGAGGTGGAATGCCGTGCCTTCGCGCCACACGTAATCGGGACGTTGATCGTTGTTGCCCAGCGCCAGTAGAGTGTTATCACGCACATAAAc > 3:253406/1‑151 (MQ=255)
cGATCCGTCAGCAGCGGGCACTTCACAGACGGCTTCATGCCCGTCTTGCAGATTGAAGAGGTGGAATGCCGTGCCTTCGCGCCACACGTAATCGGGACGTTGATCGTTGTTGCCCAGCGCCAGTAGAGTGTTATCACGCACATAAACGGGc > 4:305045/1‑151 (MQ=255)
aTCCGTCAGCAGCGGGCACTTCACAGACGGCTTCATGCCCGTCTTGCAGATTGAAGAGGTGGAATGCCGTGCCTTCGCGCCACACGTAATCGGGACGTTGATCGTTGTTGCCCAGCGCCAGTAGAGTGTTATCACGCACATAAACgg > 4:57028/1‑147 (MQ=255)
aTCCGTCAGCAGCGGGCACTTCACAGACGGCTTCATGCCCGTCTTGCAGATTGAAGAGGTGGAATGCCGTGCCTTCGCGCCACACGTAATCGGGACGTTGATCGTTGTTGCCCAGCGCCAGTAGAGTGTTATCACGCACATAAACGGGc > 4:1063/1‑149 (MQ=255)
ccGTCAGCAGCGGGCACTTCACAGACGGCTTCATGCCCGTCTTGCAGATTGAAGAGGTGGAATGCCGTGCCTTCGCGCCACACGTAATCGGGACGTTGATCGTTGTTGCCCAGCGCCAGTAGAGTGTTATCACGCACATAAACGGGCAGa < 2:1576486/150‑1 (MQ=255)
ccGTCAGCAGCGGGCACTTCACAGACGGCTTCATGCCCGTCTTGCAGATTGAAGAGGTGGAATGCCGTGCCTTCGCGCCACACGTAATCGGGACGTTGATCGTTGTTGCCCAGCGCCAGTAGAGTGTTATCACGCACATAAACGGGCAGAc > 1:306173/1‑151 (MQ=255)
cGTCAGCAGCGGGCACTTCACAGACGGCTTCATGCCCGTCTTGCAGATTGAAGAGGTGGAATGCCGTGCCTTCGCGCCACACGTAATCGGGACGTTGATCGTTGTTGCCCAGCGCCAGTAGAGTGTTATCACGCACATAAACGGGCAGACt > 4:1600978/1‑151 (MQ=255)
gTCAGCAGCGGGCACTTCACAGACGGCTTCATGCCCGTCTTGCAGATTGAAGAGGTGGAATGCCGTGCCTTCGCGCCACACGTAATCGGGACGTTGATCGTTGTTGCCCAGCGCCAGTAGAGTGTTATCACGCACATAAACGGGCAGACTc < 2:1172262/151‑1 (MQ=255)
cagcagCGGGCACTTCACAGACGGCTTCATGCCCGTCTTGCAGATTGAAGAGGTGGAATGCCGTGCCTTCGCGCCACACGTAATCGGGACGTTGATCGTTGTTGCCCAGCGCCAGTAGAGTGTTATCACGCACATAAACGGGCAGACTCa < 1:109818/150‑1 (MQ=255)
agcagcGGGCACTTCACAGACGGCTTCATGCCCGTCTTGCAGATTGAAGAGGTGGAATGCCGTGCCTTCGCGCCACACGTAATCGGGACGTTGATCGTTGTTGCCCAGCGCCAGTAGAGTGTTATCACGCACATAAACGGGCAGACTCAgg > 1:350291/1‑151 (MQ=255)
agcagcGGGCACTTCACAGACGGCTTCATGCCCGTCTTGCAGATTGAAGAGGTGGAATGCCGTGCCTTCGCGCCACACGTAATCGGGACGTTGATCGTTGTTGCCCAGCGCCAGTAGAGTGTTATCACGCACATAAACGGGCAGACTCAgg < 4:829834/151‑1 (MQ=255)
gcagcGGGCACTTCACAGACGGCTTCATGCCCGTCTTGCAGATTGAAGAGGTGGAATGCCGTGCCTTCGCGCCACACGTAATCGGGACGTTGATCGTTGTTGCCCAGCGCCAGTAGAGTGTTATCACGCACATAAACGGGCAGACTCAgg > 3:36490/1‑150 (MQ=255)
gcagcGGGCACTTCACAGACGGCTTCATGCCCGTCTTGCAGATTGAAGAGGTGGAATGCCGTGCCTTCGCGCCACACGTAATCGGGACGTTGATCGTTGTTGCCCAGCGCCAGTAGAGTGTTATCACGCACATAAACGGGCAGACTCAGGa < 2:75189/151‑1 (MQ=255)
cGGGCACTTCACAGACGGCTTCATGCCCGTCTTGCAGATTGAAGAGGTGGAATGCCGTGCCTTCGCGCCACACGTAATCGGGACGTTGATCGTTGTTGCCCAGCGCCAGTAGAGTGTTATCACGCACATAAACGGGCAGACTCAGGAAGcc < 4:742832/151‑1 (MQ=255)
cGGGCACTTCACAGACGGCTTCATGCCCGTCTTGCAGATTGAAGAGGTGGAATGCCGTGCCTTCGCGCCACACGTAATCGGGACGTTGATCGTTGTTGCCCAGCGCCAGTAGAGTGTTATCACGCACATAAACGGGCAGACTCAGGAAGcc < 2:123441/151‑1 (MQ=255)
cGGGCACTTCACAGACGGCTTCATGCCCGTCTTGCAGATTGAAGAGGTGGAATGCCGTGCCTTCGCGCCACACGTAATCGGGACGTTGATCGTTGTTGCCCAGCGCCAGTAGAGTGTTATCACGCACATAAACGGGCAGACTCAGGAAGcc < 4:1035053/151‑1 (MQ=255)
ggCACTTCACAGACGGCTTCATGCCCGTCTTGCAGATTGAAGAGGTGGAATGCCGTGCCTTCGCGCCACACGTAATCGGGACGTTGATCGTTGTTGCCCAGCGCCAGTAGAGTGTTATCACGCACATAAACGGGCAGACTCAGGAAGCCGt < 4:1300394/151‑1 (MQ=255)
aCTTCACAGACGGCTTCATGCCCGTCTTGCAGATTGAAGAGGTGGAATGCCGTGCCTTCGCGCCACACGTAATCGGGACGTTGATCGTTGTTGCCCAGCGCCAGTAGAGTGTTATCACGCACATAAACGGGCAGACTCAGGAAGCCGtgct > 2:1435481/1‑151 (MQ=255)
ttCACAGACGGCTTCATGCCCGTCTTGCAGATTGAAGAGGTGGAATGCCGTGCCTTCGCGCCACACGTAATCGGGACGTTGATCGTTGTTGCCCAGCGCCAGTAGAGTGTTATCACGCACATAAACGGGCAGACTCAGGAAGCCGtgctgc > 2:978436/1‑151 (MQ=255)
ttCACAGACGGCTTCATGCCCGTCTTGCAGATTGAAGAGGTGGAATGCCGTGCCTTCGCGCCACACGTAATCGGGACGTTGATCGTTGTTGCCCAGCGCCAGTAGAGTGTTATCACGCACATAAACGGGCAGACTCAGGAAGCCGtgctgc > 4:1277222/1‑151 (MQ=255)
ttCACAGACGGCTTCATGCCCGTCTTGCAGATTGAAGAGGTGGAATGCCGTGCCTTCGCGCCACACGTAATCGGGACGTTGATCGTTGTTGCCCAGCGCCAGTAGAGTGTTATCACGCACATAAACGGGCAGACTCAGGAAGCCGtgctgc > 3:449279/1‑151 (MQ=255)
cacaGACGGCTTCATGCCCCTCTTGGAGATTGAAGAGGTGGAATGCCGCGCCCTCGTGCCGCACGTAATCGGGACGTTGATCGTTGTTGACCAGCGCCAGTAGAGTATTATCACGCCCATAATCGGGCCGACTCAGGAAGACGCGctgctg < 2:1472692/151‑1 (MQ=255)
caGACGGCTTCATGCCCGTCTTGCAGATTGAAGAGGTGGAATGCCGTGCCTTCGCGCCACACGTAATCGGGACGTTGATCGTTGTTGCCCAGCGCCAGTAGAGTGTTATCACGCACATAAACGGGCAGACTCAGGAAGCCGTGCTGCTGtt < 4:1431469/151‑1 (MQ=255)
caGACGGCTTCATGCCCGTCTTGCAGATTGAAGAGGTGGAATGCCGTGCCTTCGCGCCACACGTAATCGGGACGTTGATCGTTGTTGCCCAGCGCCAGTAGAGTGTTATCACGCACATAAACGGGCAGACTCAGGAAGCCGTGCTGCTGtt > 1:384693/1‑151 (MQ=255)
aGACGGCTTCATGCCCGTCTTGCAGATTGAAGAGGTGGAATGCCGTGCCTTCGCGCCACACGTAATCGGGACGTTGATCGTTGTTGCCCAGCGCCAGTAGAGTGTTATCACGCACATAAACGGGCAGACTCAGGAAGCCGTGCTGCTGttt > 2:1292374/1‑151 (MQ=255)
aGACGGCTTCATGCCCGTCTTGCAGATTGAAGAGGTGGAATGCCGTGCCTTCGCGCCACACGTAATCGGGACGTTGATCGTTGTTGCCCAGCGCCAGTAGAGTGTTATCACGCACATAAACGGGCAGACTCAGGAAGCCGTGCTGCTGttt > 1:135926/1‑151 (MQ=255)
aCGGCTTCATGCCCGTCTTGCAGATTGAAGAGGTGGAATGCCGTGCCTTCGCGCCACACGTAATCGGGACGTTGATCGTTGTTGCCCAGCGCCAGTAGAGTGTTATCACGCACATAAACGGGCAGACTCAGGAAGCCGTGCTGCTGTTTAt < 2:1456622/151‑1 (MQ=255)
cGGCTTCATGCCCGTCTTGCAGATTGAAGAGGTGGAATGCCGTGCCTTCGCGCCACACGTAATCGGGACGTTGATCGTTGTTGCCCAGCGCCAGTAGAGTGTTATCACGCACATAAACGGGCAGACTCAGGAAGCCGTGCTGCTGTTTATg > 4:1190416/1‑151 (MQ=255)
cGGCTTCATGCCCGTCTTGCAGATTGAAGAGGTGGAATGCCGTGCCTTCGCGCCACACGTAATCGGGACGTTGATCGTTGTTGCCCAGCGCCAGTAGAGTGTTATCACGCACATAAACGGGCAGACTCAGGAAGCCGTGCTGCTGTTTATg < 2:822048/151‑1 (MQ=255)
cGGCTTCATGCCCGTCTTGCAGATTGAAGAGGTGGAATGCCGTGCCTTCGCGCCACACGTAATCGGGACGTTGATCGTTGTTGCCCAGCGCCAGTAGAGTGTTATCACGCACATAAACGGGCAGACTCAGGAAGCCGTGCTGCTGTTTATg > 3:179403/1‑151 (MQ=255)
aTGCCCGTCTTGCAGATTGAAGAGGTGGAATGCCGTGCCTTCGCGCCACACGTAATCGGGACGTTGATCGTTGTTGCCCAGCGCCAGTAGAGTGTTATCACGCACATAAACGGGCAGACTCAGGAAGCCGTGCTGCTGTTTATGCCAGCg > 2:473095/1‑150 (MQ=255)
aTGCCCGTCTTGCAGATTGAAGAGGTGGAATGCCGTGCCTTCGCGCCACACGTAATCGGGACGTTGATCGTTGTTGCCCAGCGCCAGTAGAGTGTTATCACGCACATAAACGGGCAGACTCAGGAAGCCGTGCTGCTGTTTATGCCAGCGa < 4:258851/151‑1 (MQ=255)
gCCCGTCTTGCAGATTGAAGAGGTGGAATGCCGTGCCTTCGCGCCACACGTAATCGGGACGTTGATCGTTGTTGCCCAGCGCCAGTAGAGTGTTATCACGCACATAAACGGGCAGACTCAGGAAGCCGTGCTGCTGTTTATGCCAGCGACt < 3:406888/151‑1 (MQ=255)
gTCTTGCAGATTGAAGAGGTGGAATGCCGTGCCTTCGCGCCACACGTAATCGGGACGTTGATCGTTGTTGCCCAGCGCCAGTAGAGTGTTATCACGCACATAAACGGGCAGACTCAGGAAGCCGTGCTGCTGTTTATGCCAGCGACTAc < 1:166575/149‑1 (MQ=255)
tCTTGCAGATTGAAGAGGTGGAATGCCGTGCCTTCGCGCCACACGTAATCGGGACGTTGATCGTTGTTGCCCAGCGCCAGTAGAGTGTTATCACGCACATAAACGGGCAGACTCAGGAAGCCGTGCTGCTGTTTATGCCAGCGACTACCGt > 2:154778/1‑151 (MQ=255)
aGATTGAAGAGGTGGAATGCCGTGCCTTCGCGCCACACGTAATCGGGACGTTGATCGTTGTTGCCCAGCGCCAGTAGAGTGTTATCACGCACATAAACGGGCAGACTCAGGAAGCCGTGCTGCTGTTTATGCCAGCGACTACCGTCGAGtt < 2:780876/151‑1 (MQ=255)
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aTTGAAGAGGTGGAATGCCGTGCCTTCGCGCCACACGTAATCGGGACGTTGATCGTTGTTGCCCAGCGCCAGTAGAGTGTTATCACGCACATAAACGGGCAGACTCAGGAAGCCGTGCTGCTGTTTATGCCAGCGACTACCGTCGAGTTCa < 2:1240928/151‑1 (MQ=255)
tGAAGAGGTGGAATGCCGTGCCTTCGCGCCACACGTAATCGGGACGTTGATCGTTGTTGCCCAGCGCCAGTAGAGTGTTATCACGCACATAAACGGGCAGACTCAGGAAGCCGTGCTGCTGTTTATGCCAGCGACTACCGTCGAGTTCAt < 2:444748/150‑1 (MQ=255)
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agagGTGGAATGCCGTGCCTTCGCGCCACACGTATTCGGGACGTTGATCGTTGTTGCCCAGCGCCAGTAGAGTGTTATCACGCACATAAACGGGCAGACTCCGGAAGCCGTGCTGCTGTTTATGCAAGCGACTGCCGTCGAGTTCATCGtt < 2:1319977/151‑1 (MQ=255)
agGTGGAATGCCGTGCCTTCGCGCCACACGTAATCGGGACGTTGATCGTTGTTGCCCAGCGCCAGTAGAGTGTTATCACGCACATAAACGGGCAGACTCAGGAAGCCGTGCTGCTGTTTATGCCAGCGACTACCGTCGAGTTCATCGTtgt < 1:42133/151‑1 (MQ=255)
agGTGGAATGCCGTGCCTTCGCGCCACACGTAATCGGGACGTTGATCGTTGTTGCCCAGCGCCAGTAGAGTGTTATCACGCACATAAACGGGCAGACTCAGGAAGCCGTGCTGCTGTTTATGCCAGCGACTACCGTCGAGTTCATCGTtgt > 2:1642923/1‑151 (MQ=255)
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aaTGCCGTGCCTTCGCGCCACACGTAATCGGGACGTTGATCGTTGTTGCCCAGCGCCAGTAGAGTGTTATCACGCACATAAACGGGCAGACTCAGGAAGCCGTGCTGCTGTTTATGCCAGCGACTACCGTCGAGTTCATCGTTGTGCcac > 2:500969/1‑150 (MQ=255)
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aTGCCGTGCCTTCGCGCCACACGTAATCGGGACGTTGATCGTTGTTGCCCAGCGCCAGTAGAGTGTTATCACGCACATAAACGGGCAGACTCAGGAAGCCGTGCTGCTGTTTATGCCAGCGACTACCGTCGAGTTCATCGTTGTGCCACAg < 2:1250162/151‑1 (MQ=255)
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tCGCGCCACACGTAATCGGGACGTTGATCGTTGTTGCCCAGCGCCAGTAGAGTGTTATCACGCACATAAACGGGCAGACTCAGGAAGCCGTGCTGCTGTTTATGCCAGCGACTACCGTCGAGTTCATCGTTGTGCCACAGGTGTGTCCAGc > 1:462745/1‑151 (MQ=255)
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CTTCGCCTCGCCCGCACCAGTCACAGTAATCGTGTTGCCAGTACGTGCTGCTTTTAAAGTAAAGATCACCGATCCGTCAGCAGCGGGCACTTCACAGACGGCTTCATGCCCGTCTTGCAGATTGAAGAGGTGGAATGCCGTGCCTTCGTGCCACACGTAATCGGGACGTTGATCGTTGTTGCCCAGCGCCAGTAGAGTGTTATCACGCACATAAACGGGCAGACTCAGGAAGCCGTGCTGCTGTTTATGCCAGCGACTACCGTCGAGTTCATCGTTGTGCCACAGGTGTGTCCAGC > NC_000913/3832342‑3832637
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 16 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
GATK/CNVnator alignment
N/A
