Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A3 F50 I3 R1
|
160 |
117.2 |
4331776 |
85.4% |
3699336 |
149.7 |
Breseq alignment
BRESEQ :: Evidence
|
| evidence |
seq id |
position |
mutation |
annotation |
gene |
description |
| RA |
NC_000913 |
3,987,439 |
G→A |
A148A (GCC→GCT) |
hemY ← |
putative protoheme IX synthesis protein |
|
| |
seq id |
position |
ref |
new |
freq |
score (cons/poly) |
reads |
annotation |
genes |
product |
| * | NC_000913 | 3,987,439 | 0 | G | A | 99.1%
| 423.9
/ NA
| 108 | A148A (GCC→GCT) | hemY | putative protoheme IX synthesis protein |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (0/1); new base A (49/58); total (49/59) |
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 |
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 |
Only 100 of 111 total aligned reads displayed.
TACGCCTGTTCCGCCAGACGTAATACTTCCGGATGGCGTGGCGTAACTTCCAGCAGCTTATCCACGCCGTGGCGTGCAGCATGGTTTTCATTACGGGCCAGTTGCAGACGTACGCGGGTGATTTCTACCGGAATGGTGTCGTTGCCGGCCAGCTCCGCTGCGCGTTCCAGATGTTGGTTGGCGCGTGCTTCATCACCACGTTGTTGCGCGGCTTCGGCAGCCAGTAGATAGTTCACCACCGGTTGTTCCGCGTGATCGGCATTTTTCGCCATCAGCTTTTCAACTTGCTGATAA > NC_000913/3987293‑3987586
|
taCGCCTGTTCCGCCAGACGTAATACTTCCGGATGGCGTGGCGTAACTTCCAGCAGCTTATCCACGCCGTGGCGTGCAGCATGGTTTTCATTACGGGCCAGTTGCAGACGTACGCGGGTGATTTCTACCGGAATGGTGTCGTTGCCAGcc > 2:233062/1‑150 (MQ=255)
aCGCCTGTTCCGCCAGACGTAATACTTCCGGATGGCGTGGCGTAACTTCCAGCAGCTTATCCACGCCGTGGCGTGCAGCATGGTTTTCATTACGGGCCAGTTGCAGACGTACGCGGGTGATTTCTACCGGAATGGTGTCGTTgccagcca < 2:1488623/150‑1 (MQ=255)
aCGCCTGTTCCGCCAGACGTAATACTTCCGGATGGCGTGGCGTAACTTCCAGCAGCTTATCCACGCCGTGGCGTGCAGCATGGTTTTCATTACGGGCCAGTTGCAGACGTACGCGGGTGATTTCTACCGGAATGGTGTCGTTgccagcca < 2:1239262/150‑1 (MQ=255)
tGTTCCGCCAGACGTAATACTTCCGGATGGCGTGGCGTAACTTCCAGCAGCTTATCCACGCCGTGGCGTGCAGCATGGTTTTCATTACGGGCCAGTTGCAGACGTACGCGGGTGATTTCTACCGGAATGGTGTCGTTGCCAGCCAGCTCCg > 2:363464/1‑151 (MQ=255)
gTTCCGCCAGACGTAATACTTCCGGATGGCGTGGCGTAACTTCCAGCAGCTTATCCACGCCGTGGCGTGCAGCATGGTTTTCATTACGGGCCAGTTGCAGACGTACGCGGGTGATTTCTACCGGAATGGTGTCGTTGCCAGCCAGCTCCg < 1:230695/150‑1 (MQ=255)
tCCGCCAGACGTAATACTTCCGGATGGCGTGGCGTAACTTCCAGCAGCTTATCCACGCCGTGGCGTGCAGCATGGTTTTCATTACGGGCCAGTTGCAGACGTACGCGGGTGATTTCTACCGGAATGGTGTCGTTGCCAGCCAGCTCCGCt < 4:294283/150‑1 (MQ=255)
ccGCCAGACGTAATACTTCCGGATGGCGTGGCGTAACTTCCAGCAGCTTATCCACGCCGTGGCGTGCAGCATGGTTTTCATTACGGGCCAGTTGCAGACGTACGCGGGTGATTTCTACCGGAATGGTGTCGTTGCCAGCCAGCTCCGCTg < 2:1558308/150‑1 (MQ=255)
cAGACGTAATCCTTCCGGATGGCGTGGCGTAACTTCCAGCAGCTTATCCACGCCGTGGCGTGCAGCATGGTTTTCATTACGGGCCAGTTGCAGACGTACGCGGGTGATTTCTACCGGAATGGTGTCGTTGCCAGCCAGCTCCGCTgcgc < 1:329580/149‑1 (MQ=255)
gACGTAATACTTCCGGATGGCGTGGCGTAACTTCCAGCAGCTTATCCACGCCGTGGCGTGCAGCATGGTTTTCATTACGGGCCAGTTGCAGACGTACGCGGGTGATTTCTACCGGAATGGTGTCGTTGCCAGCCAGCTCCGCTGCGCGTTc > 2:1148236/1‑151 (MQ=255)
cGTAATACTTCCGGATGGCGTGGCGTAACTTCCAGCAGCTTATCCACGCCGTGGCGTGCAGCATGGTTTTCATTACGGGCCAGTTGCAGACGTACGCGGGTGATTTCTACCGGAATGGTGTCGTTGCCAGCCAGCTCCGCTGCGCGTTcc > 3:446211/1‑150 (MQ=255)
tCCGGATGGCGTGGCGTAACTTCCAGCAGCTTATCCACGCCGTGGCGTGCAGCATGGTTTTCATTACGGGCCAGTTGCAGACGTACGCGGGTGATTTCTACCGGAATGGTGTCGTTGCCAGCCAGCTCCGCTGCGCGTTCCAGATgttggt > 2:241968/1‑151 (MQ=255)
tCCGGATGGCGTGGCGTAACTTCCAGCAGCTTATCCACGCCGTGGCGTGCAGCATGGTTTTCATTACGGGCCAGTTGCAGACGTACGCGGGTGATTTCTACCGGAATGGTGTCGTTGCCAGCCAGCTCCGCTGCGCGTTCCAGATgttggt > 2:601223/1‑151 (MQ=255)
tCCGGATGGCGTGGCGTAACTTCCAGCAGCTTATCCACGCCGTGGCGTGCAGCATGGTTTTCATTACGGGCCAGTTGCAGACGTACGCGGGTGATTTCTACCGGAATGGTGTCGTTGCCAGCCAGCTCCGCTGCGCGTTCCAGATgttggt > 4:1153206/1‑151 (MQ=255)
tCCGGATGGCGTGGCGTAACTTCCAGCAGCTTATCCACGCCGTGGCGTGCAGCATGGTTTTCATTACGGGCCAGTTGCAGACGTACGCGGGTGATTTCTACCGGAATGGTGTCGTTGCCAGCCAGCTCCGCTGCGCGTTCCAGATgttggt > 3:49198/1‑151 (MQ=255)
ccGGATGGCGTGGCGTAACTTCCAGCAGCTTATCCACGCCGTGGCGTGCAGCATGGTTTTCATTACGGGCCAGTTGCAGACGTACGCGGGTGATTTCTACCGGAATGGTGTCGTTGCCAGCCAGCTCCGCTGCGCGTTCCAGATgttggtt > 2:1301451/1‑151 (MQ=255)
gATGGCGTGGCGTAACTTCCAGCAGCTTATCCACGCCGTGGCGTGCAGCATGGTTTTCATTACGGGCCAGTTGCAGACGTACGCGGGTGATTTCTACCGGAATGGTGTCGTTGCCAGCCAGCTCCGCTGCGCGTTCCAGATGTTGGTTGgc > 1:32488/1‑151 (MQ=255)
aTGGCGTGGCGTAACTTCCAGCAGCTTATCCACGCCGTGGCGTGCAGCATGGTTTTCATTACGGGCCAGTTGCAGACGTACGCGGGTGATTTCTACCGGAATGGTGTCGTTGCCAGCCAGCTCCGCTGCGCGTTCCAGATGTTGGTTGgcg > 1:427043/1‑151 (MQ=255)
aTGGCGTGGCGTAACTTCCAGCAGCTTATCCACGCCGTGGCGTGCAGCATGGTTTTCATTACGGGCCAGTTGCAGACGTACGCGGGTGATTTCTACCGGAATGGTGTCGTTGCCAGCCAGCTCCGCTGCGCGTTCCAGATGTTGGTTGgcg > 2:608897/1‑151 (MQ=255)
ggcgtggcgtAACTTCCAGCAGCTTATCCACGCCGTGGCGTGCAGCATGGTTTTCATTACGGGCCAGTTGCAGACGTACGCGGGTGATTTCTACCGGAATGGTGTCGTTGCCAGCCAGCTCCGCTGCGCGTTCCAGATGTTGGTTGGcgcg > 4:577711/1‑151 (MQ=255)
cgttgcttAACTTCCAACAGCTTATCCACGCCGTGGCTTGCAGCATGGTTTTCATTACGGGCTCGTTTCTTTCTTTTACGGGTGAATTCTCCCCGAATGGTTTCCTTTCCGGCCATCTCCTCTCCCCCTACCAGCCGTTGGTCGgcgc < 2:1598844/148‑1 (MQ=255)
cgttgcgtAACTTCCAGCAGCTTATCCACGCCGTGGCGTGGAGCATGTTTTTCATTACGGGCCAGTTGCAGACGTACGCGGGTGATTTCTACCGGAATGGTGTCGTTGCCAGTCAGCTCCGCTGCGCGTTCCAGATGTTGGTTGGcgcg < 4:1537530/149‑1 (MQ=255)
cgtAACTTCCAGCAGCTTATCCACGCCGTGGCGTGCAGCATGGTTTTCATTACGGGCCAGTTGCAGACGTACGCGGGTGATTTCTACCGGAATGGTGTCGTTGCCAGCCAGCTCCGCTGCGCGTTCCAGATGTTGGTTGGCGCGTGCTtca < 4:1175491/151‑1 (MQ=255)
gtAACTTCCAGCAGCTTATCCACGCCGTGGCGTGCAGCATGGTTTTCATTACGGGCCAGTTGCAGACGTACGCGGGTGATTTCTACCGGAATGGTGTCGTTGCCAGCCAGCTCCGCTGCGCGTTCCAGATGTTGGTTGGCGCGTGCTtcat > 2:569013/1‑151 (MQ=255)
gtAACTTCCAGCAGCTTATCCACGCCGTGGCGTGCAGCATGGTTTTCATTACGGGCCAGTTGCAGACGTACGCGGGTGATTTCTACCGGAATGGTGTCGTTGCCAGCCAGCTCCGCTGCGCGTTCCAGATGTTGGTTGGCGCGTGCTtcat < 4:382087/151‑1 (MQ=255)
aaCTTCCAGCAGCTTATCCACGCCGTGGCGTGCAGCATGGTTTTCATTACGGGCCAGTTGCAGACGTACGCGGGTGATTTCTACCGGAATGGTGTCGTTGCCAGCCAGCTCCGCTGCGCGTTCCAGATGTTGGTTGGCGCGTGCTtcatca < 3:428972/151‑1 (MQ=255)
aCTTCCAGCAGCTTATCCACGCCGTGGCGTGCAGCATGGTTTTCATTACGGGCCAGTTGCAGACGTACGCGGGTGATTTCTACCGGAATGGTGTCGTTGCCAGCCAGCTCCGCTGCGCGTTCCAGATGTTGGTTGGCGCGTGCTTCATcac > 2:1018728/1‑151 (MQ=255)
tCCAGCAGCTTATCCACGCCGTGGCGTGCAGCATGGTTTTCATTACGGGCCAGTTGCAGACGTACGCGGGTGATTTCTACCGGAATGGTGTCGTTGCCAGCCAGCTCCGCTGCGCGTTCCAGATGTTGGTTGGCGCGTGCTTCATcacc < 4:1315173/149‑1 (MQ=255)
ccAGCAGCTTATCCACGCCGTGGCGTGCAGCATGGTTTTCATTACGGGCCAGTTGCAGACGTACGCGGGTGATTTCTACCGGAATGGTGTCGTTGCCAGCCAGCTCCGCTGCGCGTTCCAGATGTTGGTTGGCGCGTGCTTCATcaccac < 2:395470/150‑1 (MQ=255)
ccAGCAGCTTATCCACGCCGTGGCGTGCAGCATGGTTTTCATTACGGGCCAGTTGCAGACGTACGCGGGTGATTTCTACCGGAATGGTGTCGTTGCCAGCCAGCTCCGCTGCGCGTTCCAGATGTTGGTTGGCGCGTGCTTCATCACCACg > 4:933798/1‑151 (MQ=255)
agcagcTTATCCACGCCGTGGCGTGCAGCATGGTTTTCATTACGGGCCAGTTGCAGACGTACGCGGGTGATTTCTACCGGAATGGTGTCGTTGCCAGCCAGCTCCGCTGCGCGTTCCAGATGTTGGTTGGCGCGTGCTTCATCACCACgtt < 3:212429/151‑1 (MQ=255)
cagcTTATCCACGCCGTGGCGTGCAGCATGGTTTTCATTACGGGCCAGTTGCAGACGTACGCGGGTGATTTCTACCGGAATGGTGTCGTTGCCAGCCAGCTCCGCTGCGCGTTCCAGATGTTGGTTGGCGCGTGCTTCATCACCACgttgt > 3:369471/1‑151 (MQ=255)
agcTTATCCACGCCGTGGCGTGCAGCATGGTTTTCATTACGGGCCAGTTGCAGACGTACGCGGGTGATTTCTACCGGAATGGTGTCGTTGCCAGCCAGCTCCGCTGCGCGTTCCAGATGTTGGTTGGCGCGTGCTTCATCACCACgttgtt < 3:427061/151‑1 (MQ=255)
cTTATCCACGCCGTGGCGTGCAGCATGGTTTTCATTACGGGCCAGTTGCAGACGTACGCGGGTGATTTCTACCGGAATGGTGTCGTTGCCAGCCAGCTCCGCTGCGCGTTCCAGATGTTGGTTGGCGCGTGCTTCATCACCACGTTGTTgc > 2:1554884/1‑151 (MQ=255)
aTCCACGCCGTGGCGTGCAGCATGGTTTTCATTACGGGCCAGTTGCAGACGTACGCGGGTGATTTCTACCGGAATGGTGTCGTTGCCAGCCAGCTCCGCTGCGCGTTCCAGATGTTGGTTGGCGCGTGCTTCATCACCACGTTGTTGcgcg < 4:1516489/151‑1 (MQ=255)
aTCCACGCCGTGGCGTGCAGCATGGTTTTCATTACGGGCCAGTTGCAGACGTAAGCGGGTGATTTCTACCGGAATGGTGTCGTTGCCAGCCAGCTCCGCTGCGCGTTCCAGATGTTGGTTGGCGCGTGCTTCATCACCACGTTGTTGcgcg < 4:837448/151‑1 (MQ=255)
ccACGCCGTGGCGTGCAGCATGGTTTTCATTACGGGCCAGTTGCAGACGTACGCGGGTGATTTCTACCGGAATGGTGTCGTTGCCAGCCAGCTCCGCTGCGCGTTCCAGATGTTGGTTGGCGCGTGCTTCATCACCACGTTGTTGCGCGGc > 1:229523/1‑151 (MQ=255)
ccACGCCGTGGCGTGCAGCATGGTTTTCATTACGGGCCAGTTGCAGACGTACGCGGGTGATTTCTACCGGAATGGTGTCGTTGCCAGCCAGCTCCGCTGCGCGTTCCAGATGTTGGTTGGCGCGTGCTTCATCACCACGTTGTTGCGCGGc < 4:106575/151‑1 (MQ=255)
cACGCCGTGGCGTGCAGCATGGTTTTCATTACGGGCCAGTTGCAGACGTACGCGGGTGATTTCTACCGGAATGGTGTCGTTGCCAGCCAGCTCCGCTGCGCGTTCCAGATGTTGGTTGGCGCGTGCTTCATCACCACGTTGTTGCGCGGCt > 2:916623/1‑151 (MQ=255)
gCCGTGGCGTGCAGCATGGTTTTCATTACGGGCCAGTTGCAGACGTACGCGGGTGATTTCTACCGGAATGGTGTCGTTGCCAGCCAGCTCCGCTGCGCGTTCCAGATGTTGGTTGGCGCGTGCTTCATCACCACGTTGTTGCGCGGCTTCg > 2:274241/1‑151 (MQ=255)
gCCGTGGCGTGCAGCATGGTTTTCATTACGGGCCAGTTGCAGACGTACGCGGGTGATTTCTACCGGAATGGTGTCGTTGCCAGCCAGCTCCGCTGCGCGTTCCAGATGTTGGTTGGCGCGTGCTTCATCACCACGTTGTTGCGCGGCTTCg > 3:37410/1‑151 (MQ=255)
ccGTGGCGTGCAGCATGGTTTTCATTACGGGCCAGTTGCAGACGTACGCGGGTGATTTCTACCGGAATGGTGTCGTTGCCAGCCAGCTCCGCTGCGCGTTCCAGATGTTGGTTGGCGCGTGCTTCATCACCACGTTGTTGCGCGGCTTCgg > 2:322784/1‑151 (MQ=255)
gCGTGCAGCATGGTTTTCATTACGGGCCAGTTGCAGACGTACGCGGGTGATTTCTACCGGAATGGTGTCGTTGCCAGCCAGCTCCGCTGCGCGTTCCAGATGTTGGTTGGCGCGTGCTTCATCACCACGTTGTTGCGCGGCTTCGGCAGcc < 1:284537/151‑1 (MQ=255)
gCGTGCAGCATGGTTTTCATTACGGGCCAGTTGCAGACGTACGCGGGTGATTTCTACCGGAATGGTGTCGTTGCCAGCCAGCTCCGCTGCGCGTTCCAGATGTTGGTTGGCGCGTGCTTCATCACCACGTTGTTGCGCGGCTTCGGCAGcc > 2:1401678/1‑151 (MQ=255)
cGTGCAGCATGGTTTTCATTACGGGCCAGTTGCAGACGTACGCGGGTGATTTCTACCGGAATGGTGTCGTTGCCAGCCAGCTCCGCTGCGCGTTCCAGATGTTGGTTGGCGCGTGCTTCATCACCACGTTGTTGCGCGGCTTCGGCAGCCa < 4:1293535/151‑1 (MQ=255)
cGTGCAGCATGGTTTTCATTACGGGCCAGTTGCAGACGTACGCGGGTGATTTCTACCGGAATGGTGTCGTTGCCAGCCAGCTCCGCTGCGCGTTCCAGATGTTGGTTGGCGCGTGCTTCATCACCACGTTGTTGCGCGGCTTCGGCAGCCa < 2:1353984/151‑1 (MQ=255)
gcagcaTGGTTTTCATTACGGGCCAGTTGCAGACGTACGCGGGTGATTTCTACCGGAATGGTGTCGTTGCCAGCCAGCTCCGCTGCGCGTTCCAGATGTTGGTTGGCGCGTGCTTCATCACCACGTTGTTGCGCGGCTTCGGCAGCCAGTa < 3:401536/151‑1 (MQ=255)
cagcaTGGTTTTCATTACGGGCCAGTTGCAGACGTACGCGGGTGATTTCTACCGGAATGGTGTCGTTGCCAGCCAGCTCCGCTGCGCGTTCCAGATGTTGGTTGGCGCGTGCTTCATCACCACGTTGTTGCGCGGCTTCGGCAGCCAGt > 2:10024/1‑149 (MQ=255)
gcaTGGTTTTCATTACGGGCCAGTTGCAGACGTACGCGGGTGATTTCTACCGGAATGGTGTCGTTGCCAGCCAGCTCCGCTGCGCGTTCCAGATGTTGGTTGGCGCGTGCTTCATCACCACGTTGTTGCGCGGCTTCGGCAGCCAGTAGAt < 4:610707/151‑1 (MQ=255)
caTGGTTTTCATTACGGGCCAGTTGCAGACGTACGCGGGTGATTTCTACCGGAATGGTGTCGTTGCCAGCCAGCTCCGCTGCGCGTTCCAGATGTTGGTTGGCGCGTGCTTCATCACCACGTTGTTGCGCGGCTTCGGCAGCCAGTAGAt > 3:239878/1‑150 (MQ=255)
caTGGTTTTCATTACGGGCCAGTTGCAGACGTACGCGGGTGATTTCTACCGGAATGGTGTCGTTGCCAGCCAGCTCCGCTGCGCGTTCCAGATGTTGGTTGGCGCGTGCTTCATCACCACGTTGTTGCGCGGCTTCGGCAGCCAGTAGATa < 1:369454/151‑1 (MQ=255)
aTGGTTTTCATTACGGGCCAGTTGCAGACGTACGCGGGTGATTTCTACCGGAATGGTGTCGTTGCCAGCCAGCTCCGCTGCGCGTTCCAGATGTTGGTTGGCGCGTGCTTCATCACCACGTTGTTGCGCGGCTTCGGCAGCCAGTAGATAg < 2:926489/151‑1 (MQ=255)
ggTTTTCATTACGGGCCAGTTGCAGACGTACGCGGGTGATTTCTACCGGAATGGTGTCGTTGCCAGCCAGCTCCGCTGCGCGTTCCAGATGTTGGTTGGCGCGTGCTTCATCACCACGTTGTTGCGCGGCTTCGGCAGCCAGTAGATAGtt < 2:573105/151‑1 (MQ=255)
ggTTTTCATTACGGGCCAGTTGCAGACGTACGCGGGTGATTTCTACCGGAATGGTGTCGTTGCCAGCCAGCTCCGCTGCGCGTTCCAGATGTTGGTTGGCGCGTGCTTCATCACCACGTTGTTGCGCGGCTTCGGCAGCCAGTAGATAGtt < 4:1619463/151‑1 (MQ=255)
ggTTTTCATTACGGGCCAGTTGCAGACGTACGCGGGTGATTTCTACCGGAATGGTGTCGTTGCCAGCCAGCTCCGCTGCGCGTTCCAGATGTTGGTTGGCGCGTGCTTCATCACCACGTTGTTGCGCGGCTTCGGCAGCCAGTAGATAGt < 4:1062701/150‑1 (MQ=255)
cttttCATTACGGGCCAGTTGCAGACGTACGCGGGTGATTTCTACCGGAATGGTGTCGTTGCCAGCCAGCTCCGCTGCGCGTTCCAGATGTTGGTTGGCGCGTGCTTCATCACCACGTTGTTGCGCGGCTTCGGCAGCCAGTAGATAGTTc > 4:744954/2‑151 (MQ=255)
ttttCATTACGGGCCAGTTGCAGACGTACGCGGGTGATTTCTACCGGAATGGTGTCGTTGCCAGCCAGCTCCGCTGCGCGTTCCAGATGTTGGTTGGCGCGTGCTTCATCACCACGTTGTTGCGCGGCTTCGGCAGCCAGTAGATAGTTc > 4:1376201/1‑150 (MQ=255)
cATTACGGGCCAGTTGCAGACGTACGCGGGTGATTTCTACCGGAATGGTGTCGTTGCCAGCCAGCTCCGCTGCGCGTTCCAGATGTTGGTTGGCGCGTGCTTCATCACCACGTTGTTGCGCGGCTTCGGCAGCCAGTAGATAGTTcacca < 2:1209449/150‑1 (MQ=255)
tACGGGCCAGTTGCAGACGTACGCGGGTGATTTCTACCGGAATGGTGTCGTTGCCAGCCAGCTCCGCTGCGCGTTCCAGATGTTGGTTGGCGCGTGCTTCATCACCACGTTGTTGCGCGGCTTCGGCAGCCAGTAGATAGTTCACCACCg < 3:265836/150‑1 (MQ=255)
cGGGCCAGTTGCAGACGTACGCGGGTGATTTCTACCGGAATGGTGTCGTTGCCAGCCAGCTCCGCTGCGCGTTCCAGATGTTGGTTGGCGCGTGCTTCATCACCACGTTGTTGCGCGGCTTCGGCAGCCAGTAGATAGTTCACCACCGgtt < 2:454563/151‑1 (MQ=255)
ccAGTTGCAGACGTACGCGGGTGATTTCTACCGGAATGGTGTCGTTGCCAGCCAGCTCCGCTGCGCGTTCCAGATGTTGGTTGGCGCGTGCTTCATCACCACGTTGTTGCGCGGCTTCGGCAGCCAGTAGATAGTTCACCACCGgttgtt > 1:334165/1‑150 (MQ=255)
ccAGTTGCAGACGTACGCGGGTGATTTCTACCGGAATGGTGTCGTTGCCAGCCAGCTCCGCTGCGCGTTCCAGATGTTGGTTGGCGCGTGCTTCATCACCACGTTGTTGCGCGGCTTCGGCAGCCAGTAGATAGTTCACCACCGgttgtt < 3:334182/150‑1 (MQ=255)
cAGTTGCAGACGTACGCGGGTGATTTCTACCGGAATGGTGTCGTTGCCAGCCAGCTCCGCTGCGCGTTCCAGATGTTGGTTGGCGCGTGCTTCATCACCACGTTGTTGCGCGGCTTCGGCAGCCAGTAGATAGTTCACCACCGGTTGTTcc > 2:1258154/1‑151 (MQ=255)
cAGTTGCAGACGTACGCGGGTGATTTCTACCGGAATGGTGTCGTTGCCAGCCAGCTCCGCTGCGCGTTCCAGATGTTGGTTGGCGCGTGCTTCATCACCACGTTGTTGCGCGGCTTCGGCAGCCAGTAGATAGTTCACCACCGGTTGTTcc < 2:1684399/151‑1 (MQ=255)
aGTTGCAGACGTACGCGGGTGATTTCTACCGGAATGGTGTCGTTGCCAGCCAGCTCCGCTGCGCGTTCCAGATGTTGGTTGGCGCGTGCTTCATCACCACGTTGTTGCGCGGCTTCGGCAGCCAGTAGATAGTTCACCACCGGTTGTTc < 4:170072/149‑1 (MQ=255)
aGTTGCAGACGTACGCGGGTGATTTCTACCGGAATGGTGTCGTTGCCAGCCAGCTCCGCTGCGCGTTCCAGATGTTGGTTGGCGCGTGCTTCATCACCACGTTGTTGCGCGGCTTCGGCAGCCAGTAGATAGTTCACCACCGGTTGTTCcg < 4:1019884/151‑1 (MQ=255)
gTTGCAGACGTACGCGGGTGATTTCTACCGGAATGGTGTCGTTGCCAGCCAGCTCCGCTGCGCGTTCCAGATGTTGGTTGGCGCGTGCTTCATCACCACGTTGTTGCGCGGCTTCGGCAGCCAGTAGATAGTTCACCACCGGTTGTTCcgc < 4:612295/151‑1 (MQ=255)
ttGCAGACGTACGCGGGTGATTTCTACCGGAATGGTGTCGTTGCCAGCCAGCTCCGCTGCGCGTTCCAGATGTTGGTTGGCGCGTGCTTCATCACCACGTTGTTGCGCGGCTTCGGCAGCCAGTAGATAGTTCACCACCGGTTGTTCcgcg > 4:1114328/1‑151 (MQ=255)
gCAGACGTACGCGGGTGATTTCTACCGGAATGGTGTCGTTGCCAGCCAGCTCCGCTGCGCGTTCCAGATGTTGGTTGGCGCGTGCTTCATCACCACGTTGTTGCGCGGCTTCGGCAGCCAGTAGATAGTTCACCACCGGTTGTTCCGCGTg < 4:1149695/151‑1 (MQ=255)
gACGTACGCGGGTGATTTCTACCGGAATGGTGTCGTTGCCAGCCAGCTCCGCTGCGCGTTCCAGATGTTGGTTGGCGCGTGCTTCATCACCACGTTGTTGCGCGGCTTCGGCAGCCAGTAGATAGTTCACCACCGGTTGTTCCGCGTGAt < 1:465088/150‑1 (MQ=255)
gACGTACGCGGGTGATTTCTACCGGAATGGTGTCGTTGCCAGCCAGCTCCGCTGCGCGTTCCAGATGTTGGTTGGCGCGTGCTTCATCACCACGTTGTTGCGCGGCTTCGGCAGCCAGTAGATAGTTCACCACCGGTTGTTCCGCGTGATc > 2:307953/1‑151 (MQ=255)
gACGTACGCGGGTGATTTCTACCGGAATGGTGTCGTTGCCAGCCAGCTCCGCTGCGCGTTCCAGATGTTGGTTGGCGCGTGCTTCATCACCACGTTGTTGCGCGGCTTCGGCAGCCAGTAGATAGTTCACCACCGGTTGTTCCGCGTGATc > 4:469864/1‑151 (MQ=255)
gACGTACGCGGGTGATTTCTACCGGAATGGTGTCGTTGCCAGCCAGCTCCGCTGCGCGTTCCAGATGTTGGTTGGCGCGTGCTTCATCACCACGTTGTTGCGCGGCTTCGGCAGCCAGTAGATAGTTCACCACCGGTTGTTCCGCGTGATc > 3:448490/1‑151 (MQ=255)
aCGTACGCGGGTGATTTCTACCGGAATGGTGTCGTTGCCAGCCAGCTCCGCTGCGCGTTCCAGATGTTGGTTGGCGCGTGCTTCATCACCACGTTGTTGCGCGGCTTCGGCAGCCAGTAGATAGTTCACCACCGGTTGTTCCGCGTGATCg > 4:1320038/1‑151 (MQ=255)
gTACGCGGGTGATTTCTACCGGAATGGTGTCGTTGCCAGCCAGCTCCGCTGCGCGTTCCAGATGTTGGTTGGCGCGTGCTTCATCACCACGTTGTTGCGCGGCTTCGGCAGCCAGTAGATAGTTCACCACCGGTTGTTCCGCGTGATCGGc < 3:112813/151‑1 (MQ=255)
tACGCGGGTGATTTCTACCGGAATGGTGTCGTTGCCAGCCAGCTCCGCTGCGCGTTCCAGATGTTGGTTGGCGCGTGCTTCATCACCACGTTGTTGCGCGGCTTCGGCAGCCAGTAGATAGTTCACCACCGGTTGTTCCGCGTGATCGGc > 2:181948/1‑150 (MQ=255)
tACGCGGGTGATTTCTACCGGAATGGTGTCGTTGCCAGCCAGCTCCGCTGCGCGTTCCAGATGTTGGTTGGCGCGTGCTTCATCACCACGTTGTTGCGCGGCTTCGGCAGCCAGTAGATAGTTCACCACCGGTTGTTCCGCGTGATCGGc > 2:892830/1‑150 (MQ=255)
aCGCGGGTGATTTCTACCGGAATGGTGTCGTTGCCAGCCAGCTCCGCTGCGCGTTCCAGATGTTGGTTGGCGCGTGCTTCATCACCACGTTGTTGCGCGGCTTCGGCAGCCAGTAGATAGTTCACCACCGGTTGTTCCGCGTGATCGGCa < 2:576913/150‑1 (MQ=255)
cgcgGGTGATTTCTACCGGAATGGTGTCGTTGCCAGCCAGCTCCGCTGCGCGTTCCAGATGTTGGTTGGCGCGTGCTTCATCACCACGTTGTTGCGCGGCTTCGGCAGCCAGTAGATAGTTCACCACCGGTTGTTCCGCGTGATCGGCAtt < 1:253354/151‑1 (MQ=255)
cgcgGGTGATTTCTACCGGAATGGTGTCGTTGCCAGCCAGCTCCGCTGCGCGTTCCAGAGGTTGGTTGGCGCGTGCTTCATCACCACGTTGTTGCGCGGCTTCGGCAGCCAGTAGATAGTTCACCACCGGTTGTTCCGCGTGATCGGCAtt < 2:700403/151‑1 (MQ=255)
cgGGTGATTTCTACCGGAATGGTGTCGTTGCCAGCCAGCTCCGCTGCGCGTTCCAGATGTTGGTTGGCGCGTGCTTCATCACCACGTTGTTGCGCGGCTTCGGCAGCCAGTAGATAGTTCACCACCGGTTGTTCCGCGTGATCGGCAtttt < 4:47878/151‑1 (MQ=255)
gggTGATTTCTACCGGAATGGTGTCGTTGCCAGCCAGCTCCGCTGCGCGTTCCAGATGTTGGTTGGCGCGTGCTTCATCACCACGTTGTTGCGCGGCTTCGGCAGCCAGTAGATAGTTCACCACCGGTTGTTCCGCGTGATCGGCAttttt > 2:1032642/1‑151 (MQ=255)
gggTGATTTCTACCGGAATGGTGTCGTTGCCAGCCAGCTCCGCTGCGCGTTCCAGATGTTGGTTGGCGCGTGCTTCATCACCACGTTGTTGCGCGGCTTCGGCAGCCAGTAGATAGTTCACCACCGGTTGTTCCGCGTGATCGGCAttttt < 4:1090/151‑1 (MQ=255)
gggTGATTTCTACCGGAATGGTGTCGTTGCCAGCCAGCTCCGCTGCGCGTTCCAGATGTTGGTTGGCGCGTGCTTCATCACCACGTTGTTGCGCGGCTTCGGCAGCCAGTAGATAGTTCACCACCGGTTGTTCCGCGTGATCGGCAttttt > 4:686984/1‑151 (MQ=255)
ggTGATTTCTACCGGAATGGTGTCGTTGCCAGCCAGCTCCGCTGCGCGTTCCAGATGTTGGTTGGCGCGTGCTTCATCACCACGTTGTTGCGCGGCTTCGGCAGCCAGTAGATAGTTCACCACCGGTTGTTCCGCGTGATCGGCATTTTTc < 4:384440/151‑1 (MQ=255)
gATTTCTACCGGAATGGTGTCGTTGCCAGCCAGCTCCGCTGCGCGTTCCAGATGTTGGTTGGCGCGTGCTTCATCACCACGTTGTTGCGCGGCTTCGGCAGCCAGTAGATAGTTCACCACCGGTTGTTCCGCGTGATCGGCATTTTTCGcc > 1:164132/1‑151 (MQ=255)
gATTTCTACCGGAATGGTGTCGTTGCCAGCCAGCTCCGCTGCGCGTTCCAGATGTTGGTTGGCGCGTGCTTCATCACCACGTTGTTGCGCGGCTTCGGCAGCCAGTAGATAGTTCACCACCGGTTGTTCCGCGTGATCGGCATTTTTCGcc > 2:1047313/1‑151 (MQ=255)
aTTTCTACCGGAATGGTGTCGTTGCCAGCCAGCTCCGCTGCGCGTTCCAGATGTTGGTTGGCGCGTGCTTCATCACCACGTTGTTGCGCGGCTTCGGCAGCCAGTAGATAGTTCACCACCGGTTGTTCCGCGTGATCGGCATTTTTCGCCa < 2:916743/151‑1 (MQ=255)
tACCGGAATGGTGTCGTTGCCAGCCAGCTCCGCTGCGCGTTCCAGATGTTGGTTGGCGCGTGCTTCATCACCACGTTGTTGCGCGGCTTCGGCAGCCAGTAGATAGTTCACCACCGGTTGTTCCGCGTGATCGGCATTTTTCGCCATCAGc > 3:296457/1‑151 (MQ=255)
aCCGGAATGGTGTCGTTGCCAGCCAGCTCCGCTGCGCGTTCCAGATGTTGGTTGGCGCGTGCTTCATCACCTCGTTGTTGCGCGGCTTCGGCAGCCAGTAGATAGTTCACCACCGGTTGTTCCGCGTGATCGGCATTTTTCGCCATCa < 1:85186/148‑1 (MQ=255)
aCCGGAATGGTGTCGTTGCCAGCCAGCTCCGCTGCGCGTTCCAGATGTTGGTTGGCGCGTGCTTCATCACCACGTTGTTGCGCGGCTTCGGCAGCCAGTAGATAGTTCACCACCGGTTGTTCCGCGTGATCGGCATTTTTCGCCATCAGCt < 2:1068201/151‑1 (MQ=255)
ccGGAATGGTGTCGTTGCCAGCCAGCTCCGCTGCGCGTTCCAGATGTTGGTTGGCGCGTGCTTCATCACCACGTTGTTGCGCGGCTTCGGCAGCCAGTAGATAGTTCACCACCGGTTGTTCCGCGTGATCGGCATTTTTCGCCATCAGCtt < 4:242354/151‑1 (MQ=255)
ccGGAATGGTGTCGTTGCCAGCCAGCTCCGCTGCGCGTTCCAGATGTTGGTTGGCGCGTGCTTCATCACCACGTTGTTGCGCGGCTTCGGCAGCCAGTAGATAGTTCACCACCGGTTGTTCCGCGTGATCGGCATTTTTCGCCATCAGCtt < 4:364006/151‑1 (MQ=255)
cGGAATGGTGTCGTTGCCAGCCAGCTCCGCTGCGCGTTCCAGATGTTGGTTGGCGCGTGCTTCATCACCACGTTGTTGCGCGGCTTCGGCAGCCAGTAGATAGTTCACCACCGGTTGTTCCGCGTGATCGGCATTTTTCGCCATCAGCttt < 4:833771/151‑1 (MQ=255)
agAATGGTGTCGTTGCCAGCCAGCTCCGCTGCGCGTTCCAGATGTTGGTTGGCGCGTGCTTCATCACCACGTTGTTGCGCGGCTTCGGCAGCCAGTAGATAGTTCACCACCGGTTGTTCCGCGTGATCGGCATTTTTCGCCATCAGCtttt > 2:389706/2‑151 (MQ=255)
gtgtCGTTGCCAGCCAGCTCCGCTGCGCGTTCCAGATGTTGGTTGGCGCGTGCTTCATCACCACGTTGTTGCGCGGCTTCGGCAGCCAGTAGATAGTTCACCACCGGTTGTTCCGCGTGATCGGCATTTTTCGCCATCAGCTTTTCAACtt < 1:392475/151‑1 (MQ=255)
gtgtCGTTGCCAGCCAGCTCCGCTGCGCGTTCCAGATGTTGGTTGGCGCGTGCTTCATCACCACGTTGTTGCGCGGCTTCGGCAGCCAGTAGATAGTTCACCACCGGTTGTTCCGCGTGATCGGCATTTTTCGCCATCAGCTTTTCAACtt < 4:1214475/151‑1 (MQ=255)
tgtCGTTGCCAGCCAGCTCCGCTGCGCGTTCCAGATGTTGGTTGGCGCGTGCTTCATCACCACGTTGTTGCGCGGCTTCGGCAGCCAGTAGATAGTTCACCACCGGTTGTTCCGCGTGATCGGCATTTTTCGCCATCAGCTTTTCAACTTg > 3:78758/1‑151 (MQ=255)
tGCCAGCCAGCTCCGCTGCGCGTTCCAGATGTTGGTTGGCGCGTGCTTCATCACCACGTTGTTGCGCGGCTTCGGCAGCCAGTAGATAGTTCACCACCGGTTGTTCCGCGTGATCGGCATTTTTCGCCATCa > 4:636765/1‑132 (MQ=255)
tGCCAGCCAGCTCCGCTGCGCGTTCCAGATGTTGGTTGGCGCGTGCTTCATCACCACGTTGTTGCGCGGCTTCGGCAGCCAGTAGATAGTTCACCACCGGTTGTTCCGCGTGATCGGCATTTTTCGCCATCa < 2:635906/132‑1 (MQ=255)
tGCCAGCCAGCTCCGCTGCGCGTTCCAGATGTTGGTTGGCGCGTGCTTCATCACCACGTTGTTGCGCGGCTTCGGCAGCCAGTAGATAGTTCACCACCGGTTGTTCCGCGTGATCGGCATTTTTCGCCATCAGCTTTTCAACTTGCTGAt < 4:1238587/150‑1 (MQ=255)
|
TACGCCTGTTCCGCCAGACGTAATACTTCCGGATGGCGTGGCGTAACTTCCAGCAGCTTATCCACGCCGTGGCGTGCAGCATGGTTTTCATTACGGGCCAGTTGCAGACGTACGCGGGTGATTTCTACCGGAATGGTGTCGTTGCCGGCCAGCTCCGCTGCGCGTTCCAGATGTTGGTTGGCGCGTGCTTCATCACCACGTTGTTGCGCGGCTTCGGCAGCCAGTAGATAGTTCACCACCGGTTGTTCCGCGTGATCGGCATTTTTCGCCATCAGCTTTTCAACTTGCTGATAA > NC_000913/3987293‑3987586
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
GATK/CNVnator alignment
N/A
