Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A3 F50 I3 R1
|
160 |
117.2 |
4331776 |
85.4% |
3699336 |
149.7 |
Breseq alignment
BRESEQ :: Evidence
|
| evidence |
seq id |
position |
mutation |
annotation |
gene |
description |
| RA |
NC_000913 |
4,181,472 |
C→T |
G76G (GGC→GGT) |
rpoB → |
RNA polymerase, beta subunit |
|
| |
seq id |
position |
ref |
new |
freq |
score (cons/poly) |
reads |
annotation |
genes |
product |
| * | NC_000913 | 4,181,472 | 0 | C | T | 99.2%
| 462.6
/ ‑4.6
| 120 | G76G (GGC→GGT) | rpoB | RNA polymerase, beta subunit |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (0/1); new base T (61/58); total (61/59) |
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 4.92e-01 |
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.93e-01 |
Only 100 of 120 total aligned reads displayed.
CCTTTCTATCCAGCTTGACTCGTTTCAGAAATTTATCGAGCAAGATCCTGAAGGGCAGTATGGTCTGGAAGCTGCTTTCCGTTCCGTATTCCCGATTCAGAGCTACAGCGGTAATTCCGAGCTGCAATACGTCAGCTACCGCCTTGGCGAACCGGTGTTTGACGTCCAGGAATGTCAAATCCGTGGCGTGACCTATTCCGCACCGCTGCGCGTTAAACTGCGTCTGGTGATCTATGAGCGCGAAGCGCCGGAAGGCACCGTAAAAGACATTAAAGAACAAGAAGTCTAC > NC_000913/4181325‑4181613
|
ccTTTCTATCCAGCTTGACTCGTTTCAGAAATTTATCGAGCAAGATCCTGAAGGGCAGTATGGTCTGGAAGCTGCTTTCCGTTCCGTATTCCCGATTCAGAGCTACAGCGGTAATTCCGAGCTGCAATACGTCAGCTACCGCCTTGGTGa > 1:201957/1‑150 (MQ=255)
ttCTATCCAGCTTGACTCGTTTCAGAAATTTATCGAGCAAGATCCTGAAGGGCAGTATGGTCTGGAAGCTGCTTTCCGTTCCGTATTCCCGATTCAGAGCTACAGCGGTAATTCCGAGCTGCAATACGTCAGCTACCGCCTTGGTGAAc < 3:314929/149‑1 (MQ=255)
ttCTATCCAGCTTGACTCGTTTCAGAAATTTATCGAGCAAGATCCTGAAGGGCAGTATGGTCTGGAAGCTGCTTTCCGTTCCGTATTCCCGATTCAGAGCTACAGCGGTAATTCCGAGCTGCAATACGTCAGCTACCGCCTTGGTGAACCg > 2:505128/1‑151 (MQ=255)
cTATCCAGCTTGACTCGTTTCAGAAATTTATCGAGCAAGATCCTGAAGGGCAGTATGGTCTGGAAGCTGCTTTCCGTTCCGTATTCCCGATTCAGAGCTACAGCGGTAATTCCGAGCTGCAATACGTCAGCTACCGCCTTGGTGAACCGgt > 2:984505/1‑151 (MQ=255)
aTCCAGCTTGACTCGTTTCAGAAATTTATCGAGCAAGATCCTGAAGGGCAGTATGGTCTGGAAGCTGCTTTCCGTTCCGTATTCCCGATTCAGAGCTACAGCGGTAATTCCGAGCTGCAATACGTCAGCTACCGCCTTGGTGAACCGgt < 2:1556306/149‑1 (MQ=255)
aCTCGTTTCAGAAATTTATCGAGCAAGATCCTGAAGGGCAGTATGGTCTGGAAGCTGCTTTCCGTTCCGTATTCCCGATTCAGAGCTACAGCGGTAATTCCGAGCTGCAATACGTCAGCTACCGCCTTGGTGAACCGGTGTTTGACGTCCa < 2:1648977/151‑1 (MQ=255)
cTCGTTTCAGAAATTTATCGAGCAAGATCCTGAAGGGCAGTATGGTCTGGAAGCTGCTTTCCGTTCCGTATTCCCGATTCAGAGCTACAGCGGTAATTCCGAGCTGCAATACGTCAGCTACCGCCTTGGTGAACCGGTGTTTGACGTcc > 4:803419/1‑149 (MQ=255)
cTCGTTTCAGAAATTTATCGAGCAAGATCCTGAAGGGCAGTATGGTCTGGAAGCTGCTTTCCGTTCCGTATTCCCGATTCAGAGCTACAGCGGTAATTCCGAGCTGCAATACGTCAGCTACCGCCTTGGTGAACCGGTGTTTGACGTcc > 2:458467/1‑149 (MQ=255)
ttCAGAAATTTATCGAGCAAGATCCTGAAGGGCAGTATGGTCTGGAAGCTGCTTTCCGTTCCGTATTCCCGATTCAGAGCTACAGCGGTAATTCCGAGCTGCAATACGTCAGCTACCGCCTTGGTGAACCGGTGTTTGACGTCCAGGAAt < 2:1484148/150‑1 (MQ=255)
cAGAAATTTATCGAGCAAGATCCTGAAGGGCAGTATGGTCTGGAAGCTGCTTTCCGTTCCGTATTCCCGATTCAGAGCTACAGCGGTAATTCCGAGCTGCAATACGTCAGCTACCGCCTTGGTGAACCGGTGTTTGACGTCCAGGAATGt < 2:1194984/150‑1 (MQ=255)
cAGAAATTTATCGAGCAAGATCCTGAAGGGCAGTATGGTCTGGAAGCTGCTTTCCGTTCCGTATTCCCGATTCAGAGCTACAGCGGTAATTCCGAGCTGCAATACGTCAGCTACCGCCTTGGTGAACCGGTGTTTGACGTCCAGGAATGTc > 4:1464764/1‑151 (MQ=255)
aGAAATTTATCGAGCAAGATCCTGAAGGGCAGTATGGTCTGGAAGCTGCTTTCCGTTCCGTATTCCCGATTCAGAGCTACAGCGGTAATTCCGAGCTGCAATACGTCAGCTACCGCCTTGGTGAACCGGTGTTTGACGTCCAGGAATGTCa < 1:295073/151‑1 (MQ=255)
aGAAATTTATCGAGCAAGATCCTGAAGGGCAGTATGGTCTGGAAGCTGCTTTCCGTTCCGTATTCCCGATTCAGAGCTACAGCGGTAATTCCGAGCTGCAATACGTCAGCTACCGCCTTGGTGAACCGGTGTTTGACGTCCAGGAATGTCa < 2:84573/151‑1 (MQ=255)
aTTTATCGAGCAAGATCCTGAAGGGCAGTATGGTCTGGAAGCTGCTTTCCGTTCCGTATTCCCGATTCAGAGCTACAGCGGTAATTCCGAGCTGCAATACGTCAGCTACCGCCTTGGTGAACCGGTGTTTGACGTCCAGGAATGTCAAATc > 4:1311303/1‑151 (MQ=255)
aTTTATCGAGCAAGATCCTGAAGGGCAGTATGGTCTGGAAGCTGCTTTCCGTTCCGTATTCCCGATTCAGAGCTACAGCGGTAATTCCGAGCTGCAATACGTCAGCTACCGCCTTGGTGAACCGGTGTTTGACGTCCAGGAATGTCAAATc < 2:970701/151‑1 (MQ=255)
ttATCGAGCAAGATCCTGAAGGGCAGTATGGTCTGGAAGCTGCTTTCCGTTCCGTATTCCCGATTCAGAGCTACAGCGGTAATTCCGAGCTGCAATACGTCAGCTACCGCCTTGGTGAACCGGTGTTTGACGTCCAGGAATGTCAAATCCg > 2:1615909/1‑151 (MQ=255)
ttATCGAGCAAGATCCTGAAGGGCAGTATGGTCTGGAAGCTGCTTTCCGTTCCGTATTCCCGATTCAGAGCTACAGCGGTAATTCCGAGCTGCAATACGTCAGCTACCGCCTTGGTGAACCGGTGTTTGACGTCCAGGAATGTCAAATCCg > 2:1546432/1‑151 (MQ=255)
gAGCAAGATACTGAAGGGCAGTATGGTCTGGAAGCTGCTTTCCGTTCCGTATTCCCGATTCAGAGCTACAGCGGTAATTCCGAGCTGCAATACGTCAGCTACCGCCTTGGTGAACCGGTGTTTGACGTCCAGGAATGTCAAATCCGTGGCg > 2:1112219/1‑151 (MQ=255)
aGCAAGATCCTGAAGGGCAGTATGGTCTGGAAGCTGCTTTCCGTTCCGTATTCCCGATTCAGAGCTACAGCGGTAATTCCGAGCTGCAATACGTCAGCTACCGCCTTGGTGAACCGGTGTTTGACGTCCAGGAATGTCAAATCCGTGGCGt < 4:1599408/151‑1 (MQ=255)
cAAGATCCTGAAGGGCAGTATGGTCTGGAAGCTGCTTTCCGTTCCGTATTCCCGATTCAGAGCTACAGCGGTAATTCCGAGCTGCAATACGTCAGCTACCGCCTTGGTGAACCGGTGTTTGACGTCCAGGAATGTCAAATCCGTGGCGTg < 2:1660684/150‑1 (MQ=255)
cAAGATCCTGAAGGGCAGTATGGTCTGGAAGCTGCTTTCCGTTCCGTATTCCCGATTCAGAGCTACAGCGGTAATTCCGAGCTGCAATACGTCAGCTACCGCCTTGGTGAACCGGTGTTTGACGTCCAGGAATGTCAAATCCGTGGCGTGa < 4:151662/151‑1 (MQ=255)
aaGATCCTGAAGGGCAGTATGGTCTGGAAGCTGCTTTCCGTTCCGTATTCCCGATTCAGAGCTACAGCGGTAATTCCGAGCTGCAATACGTCAGCTACCGCCTTGGTGAACCGGTATTTGACGTCCAGGAATGTCAAATCCGTGGCGTGAc < 3:14710/151‑1 (MQ=255)
aGATCCTGAAGGGCAGTATGGTCTGGAAGCTGCTTTCCGTTCCGTATTCCCGATTCAGAGCTACAGCGGTAATTCCGAGCTGCAATACGTCAGCTACCGCCTTGGTGAACCGGTGTTTGACGTCCAGGAATGTCAAATCCGTGGCGTGAcc > 2:706484/1‑151 (MQ=255)
aTCCTGAAGGGCAGTATGGTCTGGAAGCTGCTTTCCGTTCCGTATTCCCGATTCAGAGCTACAGCGGTAATTCCGAGCTGCAATACGTCAGCTACCGCCTTGGTGAACCGGTGTTTGACGTCCAGGAATGTCAAATCCGTGGCGTGACCt > 2:1654787/1‑150 (MQ=255)
aTCCTGAAGGGCAGTATGGTCTGGAAGCTGCTTTCCGTTCCGTATTCCCGATTCAGAGCTACAGCGGTAATTCCGAGCTGCAATACGTCAGCTACCGCCTTGGTGAACCGGTGTTTGACGTCCAGGAATGTCAAATCCGTGGCGTGACCTa < 3:224256/151‑1 (MQ=255)
ccTGAAGGGCAGTATGGTCTGGAAGCTGCTTTCCGTTCCGTATTCCCGATTCAGAGCTACAGCGGTAATTCCGAGCTGCAATACGTCAGCTACCGCCTTGGTGAACCGGTGTTTGACGTCCAGGAATGTCAAATCCGTGGCGTGACCTAtt < 2:1428054/151‑1 (MQ=255)
gAAGGGCAGTATGGTCTGGAAGCTGCTTTCCGTTCCGTATTCCCGATTCAGAGCTACAGCGGTAATTCCGAGCTGCAATACGTCAGCTACCGCCTTGGTGAACCGGTGTTTGACGTCCAGGAATGTCAAATCCGTGGCGTGACCTATTCCg < 1:295767/151‑1 (MQ=255)
aaGGGCAGTATGGTCTGGAAGCTGCTTTCCGTTCCGTATTCCCGATTCAGAGCTACAGCGGTAATTCCGAGCTGCAATACGTCAGCTACCGCCTTGGTGAACCGGTGTTTGACGTCCAGGAATGTCAAATCCGTGGCGTGACCTATTCCGc < 2:729015/151‑1 (MQ=255)
aGGGCAGTATGGTCTGGAAGCTGCTTTCCGTTCCGTATTCCCGATTCAGAGCTACAGCGGTAATTCCGAGCTGCAATACGTCAGCTACCGCCTTGGTGAACCGGTGTTTGACGTCCAGGAATGTCAAATCCGTGGCGTGACCTATTCCGc > 4:1192759/1‑150 (MQ=255)
gCAGTATGGTCTGGAAGCTGCTTTCCGTTCCGTATTCCCGATTCAGAGCTACAGCGGTAATTCCGAGCTGCAATACGTCAGCTACCGCCTTGGTGAACCGGTGTTTGACGTCCAGGAATGTCAAATCCGTGGCGTGACCTATTCCGCACCg > 2:560710/1‑151 (MQ=255)
cAGTATGGTCTGGAAGCTGCTTTCCGTTCCGTATTCCCGATTCAGAGCTACAGCGGTAATTCCGAGCTGCAATACGTCAGCTACCGCCTTGGTGAACCGGTGTTTGACGTCCAGGAATGTCAAATCCGTGGCGTGACCTATTCCGCACCGc < 2:1173508/151‑1 (MQ=255)
cAGTATGGTCTGGAAGCTGCTTTCCGTTCCGTATTCCCGATTCAGAGCTACAGCGGTAATTCCGAGCTGCAATACGTCAGCTACCGCCTTGGTGAACCGGTGTTTGACGTCCAGGAATGTCAAATCCGTGGCGTGACCTATTCCGCACCGc > 2:1472821/1‑151 (MQ=255)
tATGGTCTGGAAGCTGCTTTCCGTTCCGTATTCCCGATTCAGAGCTACAGCGGTAATTCCGAGCTGCAATACGTCAGCTACCGCCTTGGTGAACCGGTGTTTGACGTCCAGGAATGTCAAATCCGTGGCGTGACCTATTCCGCACCGCTgc > 2:859316/1‑151 (MQ=255)
tATGGTCTGGAAGCTGCTTTCCGTTCCGTATTCCCGATTCAGAGCTACAGCGGTAATTCCGAGCTGCAATACGTCAGCTACCGCCTTGGTGAACCGGTGTTTGACGTCCAGGAATGTCAAATCCGTGGCGTGACCTATTCCGCACCGCTgc > 2:718840/1‑151 (MQ=255)
aTGGTCTGGAAGCTGCTTTCCGTTCCGTATTCCCGATTCAGAGCTACAGCGGTAATTCCGAGCTGCAATACGTCAGCTACCGCCTTGGTGAACCGGTGTTTGACGTCCAGGAATGTCAAATCCGTGGCGTGACCTATTCCGCACCGCTgcg > 2:525149/1‑151 (MQ=255)
aTGGTCTGGAAGCTGCTTTCCGTTCCGTATTCCCGATTCAGAGCTACAGCGGTAATTCCGAGCTGCAATACGTCAGCTACCGACTTGGTGAACAGGTGTTTGACGTCCAGGAATGTCAAATCCGTGGCGTGACCTATTCCGCACAGCTgcg > 1:375417/1‑151 (MQ=255)
ggTCTGGAAGCTGCTTTCCGTTCCGTATTCCCGATTCAGAGCTACAGCGGTAATTCCGAGCTGCAATACGTCAGCTACCGCCTTGGTGAACCGGTGTTTGACGTCCAGGAATGTCAAATCCGTGGCGTGACCTATTCCGCACCGCTgcgc < 2:1574136/150‑1 (MQ=255)
tGGAAGCTGCTTTCCGTTCCGTATTCCCGATTCAGAGCTACAGCGGTAATTCCGAGCTGCAATACGTCAGCTACCGCCTTGGTGAACCGGTGTTTGACGTCCAGGAATGTCAAATCCGTGGCGTGACCTATTCCGCACCGCTGCGCGTTa > 4:137981/1‑150 (MQ=255)
ggAAGCTGCTTTCCGTTCCGTATTCCCGATTCAGAGCTACAGCGGTAATTCCGAGCTGCAATACGTCAGCTACCGCCTTGGTGAACCGGTGTTTGACGTCCAGGAATGTCAAATCCGTGGCGTGACCTATTCCGCACCGCTGCGCGTTaaa < 2:1047466/151‑1 (MQ=255)
ggAAGCTGCTTTCCGTTCCGTATTCCCGATTCAGAGCTACAGCGGTAATTCCGAGCTGCAATACGTCAGCTACCGCCTTGGTGAACCGGTGTTTGACGTCCAGGAATGTCAAATCCGTGGCGTGACCTATTCCGCACCGCTGCGCGTTaa < 4:1202623/150‑1 (MQ=255)
ggAAGCTGCTTTCCGTTCCGTATTCCCGATTCAGAGCTACAGCGGTAATTCCGAGCTGCAATACGTCAGCTACCGCCTTGGTGAACCGGTGTTTGACGTCCAGGAATGTCAAATCCGTGGCGTGACCTATTCCGCACCGCTGCGCGTTaa < 1:298387/150‑1 (MQ=255)
ggAAGCTGCTTTCCGTTCCGTATTCCCGATTCAGAGCTACAGCGGTAATTCCGAGCTGCAATACGTCAGCTACCGCCTTGGTGAACCGGTGTTTGACGTCCAGGAATGTCAAATCCGTGGCGTGACCTATTCCGCACCGCTGCGCGTTa < 2:577110/149‑1 (MQ=255)
gAAGCTGCTTTCCGTTCCGTATTCCCGATTCAGAGCTACAGCGGTAATTCCGAGCTGCAATACGTCAGCTACCGCCTTGGTGAACCGGTGTTTGACGTCCAGGAATGTCAAATCCGTGGCGTGACCTATTCCGCACCGCTGCGCGTTAAAc < 4:1664890/151‑1 (MQ=255)
gAAGCTGCTTTCCGTTCCGTATTCCCGATTCAGAGCTACAGCGGTAATTCCGAGCTGCAATACGTCAGCTACCGCCTTGGTGAACCGGTGTTTGACGTCCAGGAATGTCAAATCCGTGGCGTGACCTATTCCGCACCGCTGCGCGTTAAAc > 2:1351146/1‑151 (MQ=255)
aaGCTGCTTTCCGTTCCGTATTCCCGATTCAGAGCTACAGCGGTAATTCCGAGCTGCAATACGTCAGCTACCGCCTTGGTGAACCGGTGTTTGACGTCCAGGAATGTCAAATCCGTGGCGTGACCTATTCCGCACCGCTGCGCGTTAAACt > 4:108667/1‑151 (MQ=255)
aGCTGCTTTCCGTTCCGTATTCCCGATTCAGAGCTACAGCGGTAATTCCGAGCTGCAATACGTCAGCTACCGCCTTGGTGAACCGGTGTTTGACGTCCAGGAATGTCAAATCCGTGGCGTGACCTATTCCGCACCGCTGCGCGTTAAACTg > 2:1080252/1‑151 (MQ=255)
ctgctTTCCGTTCCGTATTCCCGATTCAGAGCTACAGCGGTAATTCCGAGCTGCAATACGTCAGCTACCGCCTTGGTGAACCGGTGTTTGACGTCCAGGAATGTCAAATCCGTGGCGTGACCTATTCCGCACCGCTGCGCGTTAAACTGCg > 2:746673/1‑151 (MQ=255)
gctTTCCGTTCCGTATTCCCGATTCAGAGCTACAGCGGTAATTCCGAGCTGCAATACGTCAGCTACCGCCTTGGTGAACCGGTGTTTGACGTCCAGGAATGTCAAATCCGTGGCGTGACCTATTCCGCACCGCTGCGCGTTAAACTGCGt < 1:72737/150‑1 (MQ=255)
tttCCGTTCCGTATTCCCGATTCAGAGCTACAGCGGTAATTCCGAGCTGCAATACGTCAGCTACCGCCTTGGTGAACCGGTGTTTGACGTCCAGGAATGTCAAATCCGTGGCGTGACCTATTCCGCACCGCTGCGCGTTAAACTGCGTCTg > 1:334820/1‑151 (MQ=255)
tttCCGTTCCGTATTCCCGATTCAGAGCTACAGCGGTAATTCCGAGCTGCAATACGTCAGCTACCGCCTTGGTGAACCGGTGTTTGACGTCCAGGAATGTCAAATCCGTGGCGTGACCTATTCCGCACCGCTGCGCGTTAAACTGCGTCTg > 4:856970/1‑151 (MQ=255)
ttccgttccgTATTCCCGATTCAGAGCTACAGCGGTAATTCCGAGCTGCAATACGTCAGCTACCGCCTTGGTGAACCGGTGTTTGACGTCCAGGAATGTCAAATCCGTGGCGTGACCTATTCCGCACCGCTGCGCGTTAAACTGCGTCt < 1:36457/149‑1 (MQ=255)
ttccgttccgTATTCCCGATTCAGAGCTACAGCGGTAATTCCGAGCTGCAATACGTCAGCTACCGCCTTGGTGAACCGGTGTTTGACGTCCAGGAATGTCAAATCCGTGGCGTGACCTATTCCGCACCGCTGCGCGTTAAACTGCGTCTgg > 1:392930/1‑151 (MQ=255)
gttccgtATTCCCGATTCAGAGCTACAGCGGTAATTCCGAGCTGCAATACGTCAGCTACCGCCTTGGTGAACCGGTGTTTGACGTCCAGGAATGTCAAATCCGTGGCGTGACCTATTCCGCACCGCTGCGCGTTAAACTGCGTCTGGTGAt > 1:378672/1‑151 (MQ=255)
gttccgtATTCCCGATTCAGAGCTACAGCGGTAATTCCGAGCTGCAATACGTCAGCTACCGCCTTGGTGAACCGGTGTTTGACGTCCAGGAATGTCAAATCCGTGGCGTGACCTATTCCGCACCGCTGCGCGTTAAACTGCGTCTGGTGAt > 4:712283/1‑151 (MQ=255)
ttccgtATTCCCGATTCAGAGCTACAGCGGTAATTCCGAGCTGCAATACGTCAGCTACCGCCTTGGTGAACCGGTGTTTGACGTCCAGGAATGTCAAATCCGTGGCGTGACCTATTCCGCACCGCTGCGCGTTAAACTGCGTCTGGTGATc > 2:582701/1‑151 (MQ=255)
ccgtATTCCCGATTCAGAGCTACAGCGGTAATTCCGAGCTGCAATACGTCAGCTACCGCCTTGGTGAACCGGTGTTTGACGTCCAGGAATGTCAAATCCGTGGCGTGACCTATTCCGCACCGCTGCGCGTTAAACTGCGTCTGGTGATCt < 2:1625789/150‑1 (MQ=255)
ccgtATTCCCGATTCAGAGCTACAGCGGTAATTCCGAGCTGCAATACGTCAGCTACCGCCTTGGTGAACCGGTGTTTGACGTCCAGGAATGTCAAATCCGTGGCGTGACCTATTCCGCACCGCTGCGCGTTAAACTGCGTCTGGTGATCTa < 2:1533324/151‑1 (MQ=255)
gtATTCCCGATTCAGAGCTACAGCGGTAATTCCGAGCTGCAATACGTCAGCTACCGCCTTGGTGAACCGGTGTTTGACGTCCAGGAATGTCAAATCCGTGGCGTGACCTATTCCGCACCGCTGCGCGTTAAACTGCGTCTGGTGATCTATg < 2:1012785/151‑1 (MQ=255)
tATTCCCGATTCAGAGCTACAGCGGTAATTCCGAGCTGCAATACGTCAGCTACCGCCTTGGTGAACCGGTGTTTGACGTCCAGGAATGTCAAATCCGTGGCGTGACCTATTCCGCACCGCTGCGCGTTAAACTGCGTCTGGTGATCTATg > 4:65349/1‑150 (MQ=255)
tCCCGATTCAGAGCTACAGCGGTAATTCCGAGCTGCAATACGTCAGCTACCGCCTTGGTGAACCGGTGTTTGACGTCCAGGAATGTCAAATCCGTGGCGTGACCTATTCCGCACCGCTGCGCGTTAAACTGCGTCTGGTGATCTATGAgcg > 2:1579113/1‑151 (MQ=255)
cccGATTCAGAGCTACAGCGGTAATTCCGAGCTGCAATACGTCAGCTACCGCCTTGGTGAACCGGTGTTTGACGTCCAGGAATGTCAAATCCGTGGCGTGACCTATTCCGCACCGCTGCGCGTTAAACTGCGTCTGGTGATCTATGAgcg < 4:965133/150‑1 (MQ=255)
cGATTCAGAGCTACAGCGGTAATTCCGAGCTGCAATACGTCAGCTACCGCCTTGGTGAACCGGTGTTTGACGTCCAGGAATGTCAAATCCGTGGCGTGACCTATTCCGCACCGCTGCGCGTTAAACTGCGTCTGGTGATCTATGAGcgcg > 4:986676/1‑150 (MQ=255)
gATTCAGAGCTACAGCGGTAATTCCGAGCTGCAATACGTCAGCTACCGCCTTGGTGAACCGGTGTTTGACGTCCAGGAATGTCAAATCCGTGGCGTGACCTATTCCGCACCGCTGCGCGTTAAACTGCGTCTGGTGATCTATGAGCGCGaa < 4:993824/151‑1 (MQ=255)
aTTCAGAGCTACAGCGGTAATTCCGAGCTGCAATACGTCAGCTACCGCCTTGGTGAACCGGTGTTTGACGTCCAGGAATGTCAAATCCGTGGCGTGACCTATTCCGCACCGCTGCGCGTTAAACTGCGTCTGGTGATCTATGAGCGCGa > 3:426594/1‑149 (MQ=255)
ttCAGAGCTACAGCGGTAATTCCGAGCTGCAATACGTCAGCTACCGCCTTGGTGAACCGGTGTTTGACGTCCAGGAATGTCAAATCCGTGGCGTGACCTATTCCGCACCGCTGCGCGTTAAACTGCGTCTGGTGATCTATGAGCGCGAAgc > 3:236315/1‑151 (MQ=255)
tCAGAGCTACAGCGGTAATTCCGAGCTGCAATACGTCAGCTACCGCCTTGGTGAACCGGTGTTTGACGTCCAGGAATGTCAAATCCGTGGCGTGACCTATTCCGCACCGCTGCGCGTTAAACTGCGTCTGGTGATCTATGAGCGCGAAgcg > 2:1402931/1‑151 (MQ=255)
tCAGAGCTACAGCGGTAATTCCGAGCTGCAATACGTCAGCTACCGCCTTGGTGAACCGGTGTTTGACGTCCAGGAATGTCAAATCCGTGGCGTGACCTATTCCGCACCGCTGCGCGTTAAACTGCGTCTGGTGATCTATGAGCGCGAAgc < 2:933440/150‑1 (MQ=255)
cAGAGCTACAGCGGTAATTCCGAGCTGCAATACGTCAGCTACCGCCTTGGTGAACCGGTGTTTGACGTCCAGGAATGTCAAATCCGTGGCGTGACCTATTCCGCACCGCTGCGCGTTAAACTGCGTCTGGTGATCTATGAGCGCGAAgcg < 2:1403959/150‑1 (MQ=255)
agCTACAGCGGTAATTCCGAGCTGCAATACGTCAGCTACCGCCTTGGTGAACCGGTGTTTGACGTCCAGGAATGTCAAATCCGTGGCGTGACCTATTCCGCACCGCTGCGCGTTAAACTGCGTCTGGTGATCTATGAGCGCGAAGCGCCgg > 4:772520/1‑151 (MQ=255)
aCAGCGGTAATTCCGAGCTGCAATACGTCAGCTACCGCCTTGGTGAACCGGTGTTTGACGTCCAGGAATGTCAAATCCGTGGCGTGACCTATTCCGCACCGCTGCGCGTTAAACTGCGTCTGGTGATCTATGAGCGCGAAGCGCCGGAAgg < 4:985620/151‑1 (MQ=255)
aCAGCGGTAATTCCGAGCTGCAATACGTCAGCTACCGCCTTGGTGAACCGGTGTTTGACGTCCAGGAATGTCAAATCCGTGGCGTGACCTATTCCGCACCGCTGCGCGTTAAACTGCGTCTGGTGATCTATGAGCGCGAAGCGCCGGAAgg < 2:893320/151‑1 (MQ=255)
aCAGCGGTAATTCCGAGCTGCAATACGTCAGCTACCGCCTTGGTGAACCGGTGTTTGACGTCCAGGAATGTCAAATCCGTGGCGTGACCTATTCCGCACCGCTGCGCGTTAAACTGCGTCTGGTGATCTATGAGCGCGAAGCGCCGGAAg < 4:505831/150‑1 (MQ=255)
aGCGGTAATTCCGAGCTGCAATACGTCAGCTACCGCCTTGGTGAACCGGTGTTTGACGTCCAGGAATGTCAAATCCGTGGCGTGACCTATTCCGCACCGCTGCGCGTTAAACTGCGTCTGGTGATCTATGAGCGCGAAGCGCCGGAAGGCa < 4:901612/151‑1 (MQ=255)
cGGTAATTCCGAGCTGCAATACGTCAGCTACCGCCTTGGTGAACCGGTGTTTGACGTCCAGGAATGTCAAATCCGTGGCGTGACCTATTCCGCACCGCTGCGCGTTAAACTGCGTCTGGTGATCTATGAGCGCGAAGCGCCGGAAGGCAcc < 4:804079/151‑1 (MQ=255)
ggTAATTCCGAGCTGCAATACGTCAGCTACCGCCTTGGTGAACCGGTGTTTGACGTCCAGGAATGTCAAATCCGTGGCGTGACCTATTCCGCACCGCTGCGCGTTAAACTGCGTCTGGTGATCTATGAGCGCGAAGCGCCGGAAGGCACCg < 4:1474666/151‑1 (MQ=255)
ggTAATTCCGAGCTGCAATACGTCAGCTACCGCCTTGGTGAACCGGTGTTTGACGTCCAGGAATGTCAAATCCGTGGCGTGACCTATTCCGCACCGCTGCGCGTTAAACTGCGTCTGGTGATCTATGAGCGCGAAGCGCCGGAAGGCACCg < 2:926915/151‑1 (MQ=255)
tAATTCCGAGCTGCAATACGTCAGCTACCGCCTTGGTGAACCGGTGTTTGACGTCCAGGAATGTCAAATCCGTGGCGTGACCTATTCCGCACCGCTGCGCGTTAAACTGCGTCTGGTGATCTATGAGCGCGAAGCGCCGGAAGGCACCGt > 4:185153/1‑150 (MQ=255)
aaTTCCGAGCTGCAATACGTCAGCTACCGCCTTGGTGAACCGGTGTTTGACGTCCAGGAATGTCAAATCCGTGGCGTGACCTATTCCGCACCGCTGCGCGTTAAACTGCGTCTGGTGATCTATGAGCGCGAAGCGCCGGAAGGCACCGTa < 4:1595126/150‑1 (MQ=255)
aaTTCCGAGCTGCAATACGTCAGCTACCGCCTTGGTGAACCGGTGTTTGACGTCCAGGAATGTCAAATCCGTGGCGTGACCTATTCCGCACCGCTGCGCGTTAAACTGCGTCTGGTGATCTATGAGCGCGAAGCGCCGGAAGGCACCGTa < 3:304325/150‑1 (MQ=255)
ttCCGAGCTGCAATACGTCAGCTACCGCCTTGGTGAACCGGTGTTTGACGTCCAGGAATGTCAAATCCGTGGCGTGACCTATTCCGCACCGCTGCGCGTTAAACTGCGTCTGGTGATCTATGAGCGCGAAGCGCCGGAAGGCACCGTaaa > 4:374344/1‑150 (MQ=255)
ccGAGCTGCAATACGTCAGCTACCGCCTTGGTGAACCGGTGTTTGACGTCCAGGAATGTCAAATCCGTGGCGTGACCTATTCCGCACCGCTGCGCGTTAAACTGCGTCTGGTGATCTATGAGCGCGAAGCGCCGGAAGGCACCGTaaa > 2:187095/1‑148 (MQ=255)
cGAGCTGCAATACGTCAGCTACCGCCTTGGTGAACCGGTGTTTGACGTCCAGGAATGTCAAATCCGTGGCGTGACCTATTCCGCACCGCTGCGCGTTAAACTGCGTCTGGTGATCTATGAGCGCGAAGCGCCGGAAGGCACCGTAAAAGAc > 4:1291873/1‑151 (MQ=255)
gAGCTGCAATACGTCAGCTACCGCCTTGGTGAACCGGTGTTTGACGTCCAGGAATGTCAAATCCGTGGCGTGACCTATTCCGCACCGCTGCGCGTTAAACTGCGTCTGGTGATCTATGAGCGCGAAGCGCCGGAAGGCACCGTAAAAGACa < 2:1554193/151‑1 (MQ=255)
aGCTGCAATACGTCAGCTACCGCCTTGGTGAACCGGTGTTTGACGTCCAGGAATGTCAAATCCGTGGCGTGACCTATTCCGCACCGCTGCGCGTTAAACTGCGTCTGGTGATCTATGAGCGCGAAGCGCCGGAAGGCACCGTAAAAGACAt > 2:905884/1‑151 (MQ=255)
aGCTGCAATACGTCAGCTACCGCCTTGGTGAACCGGTGTTTGACGTCCAGGAATGTCAAATCCGTGGCGTGACCTATTCCGCACCGCTGCGCGTTAAACTGCGTCTGGTGATCTATGAGCGCGAAGCGCCGGAAGGCACCGTAAAAGACAt < 2:1443164/151‑1 (MQ=255)
gCTGCAATACGTCAGCTACCGCCTTGGTGAACCGGTGTTTGACGTCCAGGAATGTCAAATCCGTGGCGTGACCTATTCCGCACCGCTGCGCGTTAAACTGCGTCTGGTGATCTATGAGCGCGAAGCGCCGGAAGGCACCGTAAAAGACAtt > 4:461950/1‑151 (MQ=255)
gCAATACGTCAGCTACCGCCTTGGTGAACCGGTGTTTGACGTCCAGGAATGTCAAATCCGTGGCGTGACCTATTCCGCACCGCTGCGCGTTAAACTGCGTCTGGTGATCTATGAGCGCGAAGCGCCGGAAGGCACCGTAAAAGACATTaaa < 3:378689/151‑1 (MQ=255)
aaTACGTCAGCTACCGCCTTGGTGAACCGGTGTTTGACGTCCAGGAATGTCAAATCCGTGGCGTGACCTATTCCGCACCGCTGCGCGTTAAACTGCGTCTGGTGATCTATGAGCGCGAAGCGCCGGAAGGCACCGTAAAAGACATTaa > 3:196898/1‑148 (MQ=255)
aaTACGTCAGCTACCGCCTTGGTGAACCGGTGTTTGACGTCCAGGAATGTCAAATCCGTGGCGTGACCTATTCCGCACCGCTGCGCGTTAAACTGCGTCTGGTGATCTATGAGCGCGAAGCGCCGGAAGGCACCGTAAAAGACATTAAAGa < 2:802363/151‑1 (MQ=255)
aTACGTCAGCTACCGCCTTGGTGAACCGGTGTTTGACGTCCAGGAATGTCAAATCCGTGGCGTGACCTATTCCGCACCGCTGCGCGTTAAACTGCGTCTGGTGATCTATGAGCGCGAAGCGCCGGAAGGCACCGTAAAAGACATTAAAGa > 4:1678943/1‑150 (MQ=255)
cGTCAGCTACCGCCTTGGTGAACCGGTGTTTGACGTCCAGGAATGTCAAATCCGTGGCGTGACCTATTCCGCACCGCTGCGCGTTAAACTGCGTCTGGTGATCTATGAGCGCGAAGCGCCGGAAGGCACCGTAAAAGACATTAAAGAACa > 4:168695/1‑150 (MQ=255)
tCAGCTACCGCCTTGGTGAACCGGTGTTTGACGTCCAGGAATGTCAAATCCGTGGCGTGACCTATTCCGCACCGCTGCGCGTTAAACTGCGTCTGGTGATCTATGAGCGCGAAGCGCCGGAAGGCACCGTAAAAGACATTAAAGAACa > 2:573385/1‑148 (MQ=255)
taGCTACCGCCTTGGTGAACCGGTGTTTGACGTCCAGGAATGTCAAATCCGTGGCGTGACCTATTCCGCACCGCTGCGCGTTAAACTGCGTCTGGTGATCTATGAGCGCGAAGCGCCGGAAGGCACCGTAAAAGACATTAAAGAACaaga > 2:864447/2‑150 (MQ=255)
cAGCTACCGCCTTGGTGAACCGGTGTTTGACGTCCAGGAATGTCAAATCCGTGGCGTGACCTATTCCGCACCGCTGCGCGTTAAACTGCGTCTGGTGATCTATGAGCGCGAAGCGCCGGAAGGCACCGTAAAAGACATTAAAGAACaaga < 3:469990/150‑1 (MQ=255)
cTACCGCCTTGGTGAACCGGTGTTTGACGTCCAGGAATGTCAAATCCGTGGCGTGACCTATTCCGCACCGCTGCGCGTTAAACTGCGTCTGGTGATCTATGAGCGCGAAGCGCCGGAAGGCACCGTAAAAGACATTAAAGAACAAGAAGTc > 4:625724/1‑151 (MQ=255)
aCCGCCTTGGTGAACCGGTGTTTGACGTCCAGGAATGTCAAATCCGTGGCGTGACCTATTCCGCACCGCTGCGCGTTAAACTGCGTCTGGTGATCTATGAGCGCGAAGCGCCGGAAGGCACCGTAAAAGACATTAAAGAACAAGAAGTc < 2:190289/149‑1 (MQ=255)
aCCGCCTTGGTGAACCGGTGTTTGACGTCCAGGAATGTCAAATCCGTGGCGTGACCTATTCCGCACCGCTGCGCGTTAAACTGCGTCTGGTGATCTATGAGCGCGAAGCGCCGGAAGGCACCGTAAAAGACATTAAAGAACAAGAAGTc < 3:420287/149‑1 (MQ=255)
aCCGCCTTGGTGAACCGGTGTTTGACGTCCAGGAATGTCAAATCCGTGGCGTGACCTATTCCGCACCGCTGCGCGTTAAACTGCGTCTGGTGATCTATGAGCGCGAAGCGCCGGAAGGCACCGTAAAAGACATTAAAGAACAAGAAGTCt > 2:1262964/1‑150 (MQ=255)
ccGCCTTGGTGAACCGGTGTTTGACGTCCAGGAATGTCAAATCCGTGGCGTGACCTATTCCGCACCGCTGCGCGTTAAACTGCGTCTGGTGATCTATGAGCGCGAAGCGCCGGAAGGCACCGTAAAAGACATTAAAGAACAAGAAGTCTAc < 4:985785/151‑1 (MQ=255)
cGCCTTGGTGAACCGGTGTTTGACGTCCAGGAATGTCAAATCCGTGGCGTGACCTATTCCGCACCGCTGCGCGTTAAACTGCGTCTGGTGATCTATGAGCGCGAAGCGCCGGAAGGCACCGTAAAAGACATTAAAGAACAAGAAGTCTAc > 2:270919/1‑150 (MQ=255)
|
CCTTTCTATCCAGCTTGACTCGTTTCAGAAATTTATCGAGCAAGATCCTGAAGGGCAGTATGGTCTGGAAGCTGCTTTCCGTTCCGTATTCCCGATTCAGAGCTACAGCGGTAATTCCGAGCTGCAATACGTCAGCTACCGCCTTGGCGAACCGGTGTTTGACGTCCAGGAATGTCAAATCCGTGGCGTGACCTATTCCGCACCGCTGCGCGTTAAACTGCGTCTGGTGATCTATGAGCGCGAAGCGCCGGAAGGCACCGTAAAAGACATTAAAGAACAAGAAGTCTAC > NC_000913/4181325‑4181613
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 35 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
GATK/CNVnator alignment
N/A
