Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A8 F50 I3 R1
|
168 |
141.0 |
4346284 |
99.6% |
4328898 |
150.4 |
Breseq alignment
BRESEQ :: Evidence
|
| evidence |
seq id |
position |
mutation |
annotation |
gene |
description |
| RA |
NC_000913 |
3,623,539 |
T→C |
G47G (GGT→GGC) |
yhhH → |
putative NTF2 fold immunity protein for polymorphic toxin RhsB |
|
| |
seq id |
position |
ref |
new |
freq |
score (cons/poly) |
reads |
annotation |
genes |
product |
| * | NC_000913 | 3,623,539 | 0 | T | C | 100.0%
| 669.0
/ NA
| 165 | G47G (GGT→GGC) | yhhH | putative NTF2 fold immunity protein for polymorphic toxin RhsB |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (0/0); new base C (84/81); total (84/81) |
Only 100 of 165 total aligned reads displayed.
CCTAATGTCTGCAGAGTTCATGGTAATATGTAAAAAAATATTGTTTAGGAACTGTGTCATTGTATCTTTGTTTGTTTTTACATACAACACATGGGCGCAGTGTAATAATAATATTAAAATAATGCGCAAGTATGAAAGTGAAGGTAAATATACCGTTAGAAATTTGGTTAAAAATAAAGCTATAGCATTGGAATTAGCTGAGATATATGTTAAGAATCGTTATGGACAGGATGCCGCAGAAGAAGAAAAACCATACGAAATCACTGAGTTAACAACAAGTTGGGTTGTTGAA > NC_000913/3623395‑3623686
|
ccTAATGTCTGCAGAGTTCATGGTAATATGTAAAAAAATATTGTTTAGGAACTGTGTCATTGTATCTTTGTTTGTTTTTACATACAACACATGGGCGCAGTGTAATAATAATATTAAAATAATGCGCAAGTATGAAAGTGAAGGCAAatat > 1:657739/1‑151 (MQ=255)
ccTAATGTCTGCAGAGTTCATGGTAATATGTAAAAAAATATTGTTTAGGAACTGTGTCATTGTATCTTTGTTTGTTTTTACATACAACACATGGGCGCAGTGTAATAATAATATTAAAATAATGCGCAAGTATGAAAGTGAAGGCAAatat < 1:799394/151‑1 (MQ=255)
aaTGTCTGCAGAGTTCATGGTAATATGTAAAAAAATATTGTTTAGGAACTGTGTCATTGTATCTTTGTTTGTTTTTACATACAACACATGGGCGCAGTGTAATAATAATATAAAAATAATGCGCAAGTATGAAAGTGAAGGCAAATATAcc < 2:757037/151‑1 (MQ=255)
aTGTCTGCAGAGTTCATGGTAATATGTAAAAAAATATTGTTTAGGAACTGTGTCATTGTATCTTTGTTTGTTTTTACATACAACACATGGGCGCAGTGTAATAATAATATTAAAATAATGCGCAAGTATGAAAGTGAAGGCAAATATACCg > 1:1073964/1‑151 (MQ=255)
aTGTCTGCAGAGTTCATGGTAATATGTAAAAAAATATTGTTTAGGAACTGTGTCATTGTATCTTTGTTTGTTTTTACATACAACACATGGGCGCAGTGTAATAATAATATTAAAATAATGCGCAAGTATGAAAGTGAAGGCAAATATACCg < 1:29613/151‑1 (MQ=255)
cTGCAGAGTTCATGGTAATATGTAAAAAAATATTGTTTAGGAACTGTGTCATTGTATCTTTGTTTGTTTTTACATACAACACATGGGCGCAGTGTAATAATAATATTAAAATAATGCGCAAGTATGAAAGTGAAGGCAAATATACCGtt > 1:1590904/1‑149 (MQ=255)
cAGAGTTCATGGTAATATGTAAAAAAATATTGTTTAGGAACTGTGTCATTGTATCTTTGTTTGTTTTTACATACAACACATGGGCGCAGTGTAATAATAATATTAAAATAATGCGCAAGTATGAAAGTGAAGGCAAATATACCGTTAGaa > 1:1909825/1‑150 (MQ=255)
agagTTCATGGTAATATGTAAAAAAATATTGTTTAGGAACTGTGTCATTGTATCTTTGTTTGTTTTTACATACAACACATGGGCGCAGTGTAATAATAATATTAAAATAATGCGCAAGTATGAAAGTGAAGGCAAATATACCGTTAGAAAt > 2:1584166/1‑151 (MQ=255)
gTTCATGGTAATATGTAAAAAAATATTGTTTAGGAACTGTGTCATTGTATCTTTGTTTGTTTTTACATACAACACATGGGCGCAGTGTAATAATAATATTAAAATAATGCGCAAGTATGAAAGTGAAGGCAAATATACCGTTAGAAATTTg < 1:958727/151‑1 (MQ=255)
gTTCATGGTAATATGTAAAAAAATATTGTTTAGGAACTGTGTCATTGTATCTTTGTTTGTTTTTACATACAACACATGGGCGCAGTGTAATAATAATATTAAAATAATGCGCAAGTATGAAAGTGAAGGCAAATATACCGTTAGAAATTTg > 1:2017307/1‑151 (MQ=255)
cATGGTAATATGTAAAAAAATATTGTTTAGGAACTGTGTCATTGTATCTTTGTTTGTTTTTACATACAACACATGGGCGCAGTGTAATAATAATATTAAAATAATGCGCAAGTATGAAAGTGAAGGCAAATATACCGTTAGAAATTTGGtt > 2:122774/1‑151 (MQ=255)
cATGGTAATATGTAAAAAAATATTGTTTAGGAACTGTGTCATTGTATCTTTGTTTGTTTTTACATACAACACATGGGCGCAGTGTAATAATAATATTAAAATAATGCGCAAGTATGAAAGTGAAGGCAAATATACCGTTAGAAATTTGGt < 1:1864225/150‑1 (MQ=255)
aTGGTAATATGTAAAAAAATATTGTTTAGGAACTGTGTCATTGTATCTTTGTTTGTTTTTACATACAACACATGGGCGCAGTGTAATAATAATATTAAAATAATGCGCAAGTATGAAAGTGAAGGCAAATATACCGTTAGAAATTTGGtt > 2:1115234/1‑150 (MQ=255)
gTAATATGTAAAAAAATATTGTTTAGGAACTGTGTCATTGTATCTTTGTTTGTTTTTACATACAACACATGGGCGCAGTGTAATAATAATATTAAAATAATGCGCAAGTATGAAAGTGAAGGCAAATATACCGTTAGAAATTTGGTTaaaa < 1:1387317/151‑1 (MQ=255)
gTAATATGTAAAAAAATATTGTTTAGGAACTGTGTCATTGTATCTTTGTTTGTTTTTACATACAACACATGGGCGCAGTGTAATAATAATATTAAAATAATGCGCAAGTATGAAAGTGAAGGCAAATATACCGTTAGAAATTTGGTTaaa > 2:1562014/1‑150 (MQ=255)
tAATATGTAAAAAAATATTGTTTAGGAACTGTGTCATTGTATCTTTGTTTGTTTTTACATACAACACATGGGCGCAGTGTAATAATAATATTAAAATAATGCGCAAGTATGAAAGTGAAGGCAAATATACCGTTAGAAATTTGGTTaaaa > 1:1200849/1‑150 (MQ=255)
tAATATGTAAAAAAATATTGTTTAGGAACTGTGTCATTGTATCTTTGTTTGTTTTTACATACAACACATGGGCGCAGTGTAATAATAATATTAAAATAATGCGCAAGTATGAAAGTGAAGGCAAATATACCGTTAGAAATTTGGTTaaaa > 1:2084550/1‑150 (MQ=255)
aaTATGTAAAAAAATATTGTTTAGGAACTGTGTCATTGTATCTTTGTTTGTTTTTACATACAACACATGGGCGCAGTGTAATAATAATATTAAAATAATGCGCAAGTATGAAAGTGAAGGCAAATATACCGTTAGAAATTTGGTTAAAAAt > 1:1509219/1‑151 (MQ=255)
aaTATGTAAAAAAATATTGTTTAGGAACTGTGTCATTGTATCTTTGTTTGTTTTTACATACAACACATGGGCGCAGTGTAATAATAATATTAAAATAATGCGCAAGTATGAAAGTGAAGGCAAATATACCGTTAGAAATTTGGTTAAAAAt < 1:931821/151‑1 (MQ=255)
atGTAAAAAAATATTGTTTAGGAACTGTGTCATTGTATCTTTGTTTGTTTTTACATACAACACATGGGCGCAGTGTAATAATAATATTAAAATAATGCGCAAGTATGAAAGTGAAGGCAAATATACCGTTAGAAATTTGGTTAAAAATaaa < 2:1390874/151‑1 (MQ=255)
aaaaaaTATTGTTTAGGAACTGTGTCATTGTATCTTTGTTTGTTTTTACATACAACACATGGGCGCAGTGTAATAATAATATTAAAATAATGCGCAAGTATGAAAGTGAAGGCAAATATACCGTTAGAAATTTGGTTAAAAATAAAGCtat < 2:1242096/151‑1 (MQ=255)
aaaaaaTATTGTTTAGGAACTGTGTCATTGTATCTTTGTTTGTTTTTACATACAACACATGGGCGCAGTGTAATAATAATATTAAAATAATGCGCAAGTATGAAAGTGAAGGCAAATATACCGTTAGAAATTTGGTTAAAAATAAAGCtat > 1:1961285/1‑151 (MQ=255)
aaaaaTATTGTTTAGGAACTGTGTCATTGTATCTTTGTTTGTTTTTACATACAACACATGGGCGCAGTGTAATAATAATATTAAAATAATGCGCAAGTATGAAAGTGAAGGCAAATATACCGTTAGAAATTTGGTTAAAAATAAAGCtata < 2:251808/151‑1 (MQ=255)
aaaaTATTGTTTAGGAACTGTGTCATTGTATCTTTGTTTGTTTTTACATACAACACATGGGCGCAGTGTAATAATAATATTAAAATAATGCGCAAGTATGAAAGTGAAGGCAAATATACCGTTAGAAATTTGGTTAAAAATAAAGCtat > 2:2123756/1‑149 (MQ=255)
aaaaTATTGTTTAGGAACTGTGTCATTGTATCTTTGTTTGTTTTTACATACAACACATGGGCGCAGTGTAATAATAATATTAAAATAATGCGCAAGTATGAAAGTGAAGGCAAATATACCGTTAGAAATTTGGTTAAAAATAAAGCtat > 1:1218966/1‑149 (MQ=255)
aaaTATTGTTTAGGAACTGTGTCATTGTATCTTTGTTTGTTTTTACATACAACACATGGGCGCAGTGTAATAATAATATTAAAATAATGCGCAAGTATGAAAGTGAAGGCAAATATACCGTTAGAAATTTGGTTAAAAATAAAGCTATAGc > 1:879822/1‑151 (MQ=255)
aaaTATTGTTTAGGAACTGTGTCATTGTATCTTTGTTTGTTTTTACATACAACACATGGGCGCAGTGTAATAATAATATTAAAATAATGCGCAAGTATGAAAGTGAAGGCAAATATACCGTTAGAAATTTGGTTAAAAATAAAGCTATAGc > 2:1632462/1‑151 (MQ=255)
aaTATTGTTTAGGAACTGTGTCATTGTATCTTTGTTTGTTTTTACATACAACACATGGGCGCAGTGTAATAATAATATTAAAATAATGCGCAAGTATGAAAGTGAAGGCAAATATACCGTTAGAAATTTGGTTAAAAATAAAGCTATAGc > 1:1442578/1‑150 (MQ=255)
aaTATTGTTTAGGAACTGTGTCATTGTATCTTTGTTTGTTTTTACATACAACACATGGGCGCAGTGTAATAATAATATTAAAATAATGCGCAAGTATGAAAGTGAAGGCAAATATACCGTTAGAAATTTGGTTAAAAATAAAGCTATAGCa < 1:190216/151‑1 (MQ=255)
tatTGTTTAGGAACTGTGTCATTGTATCTTTGTTTGTTTTTACATACAACACATGGGCGCAGTGTAATAATAATATTAAAATAATGCGCAAGTATGAAAGTGAAGGCAAATATACCGTTAGAAATTTGGTTAAAAATAAAGCTATAGCAtt > 2:1823493/1‑151 (MQ=255)
atTGTTTAGGAACTGTGTCATTGTATCTTTGTTTGTTTTTACATACAACACATGGGCGCAGTGTAATAATAATATTAAAATAATGCGCAAGTATGAAAGTGAAGGCAAATATACCGTTAGAAATTTGGTTAAAAATAAAGCTATAGCATTg < 2:81/151‑1 (MQ=255)
gTTTAGGAACTGTGTCATTGTATCTTTGTTTGTTTTTACATACAACACATGGGCGCAGTGTAATAATAATATTAAAATAATGCGCAAGTATGAAAGTGAAGGCAAATATACCGTTAGAAATTTGGTTAAAAATAAAGCTATAGCATTGGaa < 2:1038937/151‑1 (MQ=255)
ttAGGAACTGTGTCATTGTATCTTTGTTTGTTTTTACATACAACACATGGGCGCAGTGTAATAATAATATTAAAATAATGCGCAAGTATGAAAGTGAAGGCAAATATACCGTTAGAAATTTGGTTAAAAATAAAGCTATAGCATTGGAAtt > 2:1228423/1‑151 (MQ=255)
ttAGGAACTGTGTCATTGTATCTTTGTTTGTTTTTACATACAACACATGGGCGCAGTGTAATAATAATATTAAAATAATGCGCAAGTATGAAAGTGAAGGCAAATATACCGTTAGAAATTTGGTTAAAAATAAAGCTATAGCATTGGAAtt > 1:200/1‑151 (MQ=255)
ttAGGAACTGTGTCATTGTATCTTTGTTTGTTTTTACATACAACACATGGGCGCAGTGTAATAATAATATTAAAATAATGCGCAAGTATGAAAGTGAAGGCAAATATACCGTTAGAAATTTGGTTAAAAATAAAGCTATAGCATTGGAAt < 2:1846143/150‑1 (MQ=255)
tAGGAACTGTGTCATTGTATCTTTGTTTGTTTTTACATACAACACATGGGCGCAGTGTAATAATAATATTAAAATAATGCGCAAGTATGAAAGTGAAGGCAAATATACCGTTAGAAATTTGGTTAAAAATAAAGCTATAGCATTGGAAtt < 2:1961220/150‑1 (MQ=255)
aGGAACTGTGTCATTGTATCTTTGTTTGTTTTTACATACAACACATGGGCGCAGTGTAATAATAATATTAAAATAATGCGCAAGTATGAAAGTGAAGGCAAATATACCGTTAGAAATTTGGTTAAAAATAAAGCTATAGCATTGGAAtt > 1:1775788/1‑149 (MQ=255)
ggAACTGTGTCATTGTATCTTTGTTTGTTTTTACATACAACACATGGGCGCAGTGTAATAATAATATTAAAATAATGCGCAAGTATGAAAGTGAAGGCAAATATACCGTTAGAAATTTGGTTAAAAATAAAGCTATAGCATTGGAATTAGc > 2:1568568/1‑151 (MQ=255)
gAACTGTGTCATTGTATCTTTGTTTGTTTTTACATACAACACATGGGCGCAGTGTAATAATAATATTAAAATAATGCGCAAGTATGAAAGTGAAGGCAAATATACCGTTAGAAATTTGGTTAAAAATAAAGCTATAGCATTGGAATTAGCt > 2:1800789/1‑151 (MQ=255)
aCTGTGTCATTGTATCTTTGTTTGTTTTTACATACAACACATGGGCGCAGTGTAATAATAATATTAAAATAATGCGCAAGTATGAAAGTGAAGGCAAATATACCGTTAGAAATTTGGTTAAAAATAAAGCTATAGCATTGGAATTAGCTga < 2:1097153/151‑1 (MQ=255)
aCTGTGTCATTGTATCTTTGTTTGTTTTTACATACAACACATGGGCGCAGTGTAATAATAATATTAAAATAATGCGCAAGTATGAAAGTGAAGGCAAATATACCGTTAGAAATTTGGTTAAAAATAAAGCTATAGCATTGGAATTAGCTg > 1:1401426/1‑150 (MQ=255)
tgtgTCATTGTATCTTTGTTTGTTTTTACATACAACACATGGGCGCAGTGTAATAATAATATTAAAATAATGCGCAAGTATGAAAGTGAAGGCAAATATACCGTTAGAAATTTGGTTAAAAATAAAGCTATAGCATTGGAATTAGCTg > 1:1117562/1‑148 (MQ=255)
gtgtCATTGTATCTTTGTTTGTTTTTACATACAACACATGGGCGCAGTGTAATAATAATATTAAAATAATGCGCAAGTATGAAAGTGAAGGCAAATATACCGTTAGAAATTTGGTTAAAAATAAAGCTATAGCATTGGAATTAGCTGAGat < 2:962500/151‑1 (MQ=255)
gtgtCATTGTATCTTTGTTTGTTTTTACATACAACACATGGGCGCAGTGTAATAATAATATTAAAATAATGCGCAAGTATGAAAGTGAAGGCAAATATACCGTTAGAAATTTGGTTAAAAATAAAGCTATAGCATTGGAATTAGCTGAGat < 2:694038/151‑1 (MQ=255)
tCATTGTATCTTTGTTTGTTTTTACATACAACACATGGGCGCAGTGTAATAATAATATTAAAATAATGCGCAAGTATGAAAGTGAAGGCAAATATACCGTTAGAAATTTGGTTAAAAATAAAGCTATAGCATTGGAATTAGCTGAGatat > 1:1333616/1‑150 (MQ=255)
tCATTGTATCTTTGTTTGTTTTTACATACAACACATGGGCGCAGTGTAATAATAATATTAAAATAATGCGCAAGTATGAAAGTGAAGGCAAATATACCGTTAGAAATTTGGTTAAAAATAAAGCTATAGCATTGGAATTAGCTGAGatat > 1:2116568/1‑150 (MQ=255)
cATTGTATCTTTGTTTGTTTTTACATACAACACATGGGCGCAGTGTAATAATAATATTAAAATAATGCGCAAGTATGAAAGTGAAGGCAAATATACCGTTAGAAATTTGGTTAAAAATAAAGCTATAGCATTGGAATTAGCTGAGatata < 1:873415/150‑1 (MQ=255)
aTTGTATCTTTGTTTGTTTTTACATACAACACATGGGCGCAGTGTAATAATAATATTAAAATAATGCGCAAGTATGAAAGTGAAGGCAAATATACCGTTAGAAATTTGGTTAAAAATAAAGCTATAGCATTGGAATTAGCTGAGATATATg > 2:76623/1‑151 (MQ=255)
aTTGTATCTTTGTTTGTCTTTACATACAACACATGGGCGCAGTGTAATAATAATATTAAAATAATGCGCAAGTATGAAAGTGAAGGCAAATATACCGTTAGAAATTTGGTTAAAAATAAAGCTATAGCATTGGAATTAGCTGAGatatat < 2:406752/150‑1 (MQ=255)
aTCTTTGTTTGTTTTTACATACAACACATGGGCGCAGTGTAATAATAATATTAAAATAATGCGCAAGTATGAAAGTGAAGGCAAATATACCGTTAGAAATTTGGTTAAAAATAAAGCTATAGCATTGGAATTAGCTGAGATATATGTTa > 1:74435/1‑149 (MQ=255)
cTTTGTTTGTTTTTACATACAACACATGGGCGCAGTGTAATAATAATATTAAAATAATGCGCAAGTATGAAAGTGAAGGCAAATATACCGTTAGAAATTTGGTTAAAAATAAAGCTATAGCATTGGAATTAGCTGAGATATATGTTAAGa > 2:5529/1‑150 (MQ=255)
tttgtttgTTTTTACATACAACACATGGGCGCAGTGTAATAATAATATTAAAATAATGCGCAAGTATGAAAGTGAAGGCAAATATACCGTTAGAAATTTGGTTAAAAATAAAGCTATAGCATTGGAATTAGCTGAGATATATGTTAAGAAt > 1:42721/1‑151 (MQ=255)
tgtttgttTTTACATACAACACATGGGCGCAGTGTAATAATAATATTAAAATAATGCGCAAGTATGAAAGTGAAGGCAAATATACCGTTAGAAATTTGGTTAAAAATAAAGCTATAGCATTGGAATTAGCTGAGATATATGTTAAGAATc < 1:1417621/150‑1 (MQ=255)
tgtttgttTTTACATACAACACATGGGCGCAGTGTAATAATAATATTAAAATAATGCGCAAGTATGAAAGTGAAGGCAAATATACCGTTAGAAATTTGGTTAAAAATAAAGCTATAGCATTGGAATTAGCTGAGATATATGTTAAGAATCg > 1:2005027/1‑151 (MQ=255)
gtttgtttTTACATACAACACATGGGCGCAGTGTAATAATAATATTAAAATAATGCGCAAGTATGAAAGTGAAGGCAAATATACCGTTAGAAATTTGGTTAAAAATAAAGCTATAGCATTGGAATTAGCTGAGATATATGTTAAGAATCg < 1:343059/150‑1 (MQ=255)
ttgtttTTACATACAACACATGGGCGCAGTGTAATAATAATATTAAAATAATGCGCAAGTATGAAAGTGAAGGCAAATATACCGTTAGAAATTTGGTTAAAAATAAAGCTATAGCATTGGAATTAGCTGAGATATATGTTAAGAATCGtt < 1:549231/150‑1 (MQ=255)
ttgtttTTACATACAACACATGGGCGCAGTGTAATAATAATATTAAAATAATGCGCAAGTATGAAAGTGAAGGCAAATATACCGTTAGAAATTTGGTTAAAAATAAAGCTATAGCATTGGAATTAGCTGAGATATATGTTAAGAATCGtt < 2:514311/150‑1 (MQ=255)
gtttTTACATACAACACATGGGCGCAGTGTAATAATAATATTAAAATAATGCGCAAGTATGAAAGTGAAGGCAAATATACCGTTAGAAATTTGGTTAAAAATAAAGCTATAGCATTGGAATTAGCTGAGATATATGTTAAGAATCGTTATg > 2:936127/1‑151 (MQ=255)
ttttACATACAACACATGGGCGCAGTGTAATAATAATATTAAAATAATGCGCAAGTATGAAAGTGAAGGCAAATATACCGTTAGAAATTTGGTTAAAAATAAAGCTATAGCATTGGAATTAGCTGAGATATATGTTAAGAATCGTTATgg > 1:1585174/1‑150 (MQ=255)
ttttACATACAACACATGGGCGCAGTGTAATAATAATATTAAAATAATGCGCAAGTATGAAAGTGAAGGCAAATATACCGTTAGAAATTTGGTTAAAAATAAAGCTATAGCATTGGAATTAGCTGAGATATATGTTAAGAATCGTTATgg > 2:199474/1‑150 (MQ=255)
tttACATACAACACATGGGCGCAGTGTAATAATAATATTAAAATAATGCGCAAGTATGAAAGTGAAGGCAAATATACCGTTAGAAATTTGGTTAAAAATAAAGCTATAGCATTGGAATTAGCTGAGATATATGTTAAGAATCGTTATGGa < 2:1909790/150‑1 (MQ=255)
tttACATACAACACATGGGCGCAGTGTAATAATAATATTAAAATAATGCGCAAGTATGAAAGTGAAGGCAAATATACCGTTAGAAATTTGGTTAAAAATAAAGCTATAGCATTGGAATTAGCTGAGATATATGTTAAGAATCGTTATGGa < 1:469364/150‑1 (MQ=255)
tttACATACAACACATGGGCGCAGTGTAATAATAATATTAAAATAATGCGCAAGTATGAAAGTGAAGGCAAATATACCGTTAGAAATTTGGTTAAAAATAAAGCTATAGCATTGGAATTAGCTGAGATATATGTTAAGAATCGTTATGGa < 2:104831/150‑1 (MQ=255)
tttACATACAACACATGGGCGCAGTGTAATAATAATATTAAAATAATGCGCAAGTATGAAAGTGAAGGCAAATATACCGTTAGAAATTTGGTTAAAAATAAAGCTATAGCATTGGAATTAGCTGAGATATATGTTAAGAATCGTTATGGAc > 1:1780885/1‑151 (MQ=255)
tttACATACAACACATGGGCGCAGTGTAATAATAATATTAAAATAATGCGCAAGTATGAAAGTGAAGGCAAATATACCGTTAGAAATTTGGTTAAAAATAAAGCTATAGCATTGGAATTAGCTGAGATATATGTTAAGAATCGTTATGGAc > 2:462898/1‑151 (MQ=255)
tttACATACAACACATGGGCGCAGTGTAATAATAATATTAAAATAATGCGCAAGTATGAAAGTGAAGGCAAATATACCGTTAGAAATTTGGTTAAAAATAAAGCTATAGCATTGGAATTAGCTGAGATATATGTTAAGAATCGTTATGGAc > 2:1962799/1‑151 (MQ=255)
tacatacaACACATGGGCGCAGTGTAATAATAATATTAAAATAATGCGCAAGTATGAAAGTGAAGGCAAATATACCGTTAGAAATTTGGTTAAAAATAAAGCTATAGCATTGGAATTAGCTGAGATATATGTTAAGAATCGTTATGGAc > 2:399439/1‑149 (MQ=255)
tacatacaACACATGGGCGCAGTGTAATAATAATATTAAAATAATGCGCAAGTATGAAAGTGAAGGCAAATATACCGTTAGAAATTTGGTTAAAAATAAAGCTATAGCATTGGAATTAGCTGAGATATATGTTAAGAATCGTTATGGACa < 2:1440701/150‑1 (MQ=255)
caacaCATGGGCGCAGTGTAATAATAATATTAAAATAATGCGCAAGTATGAAAGTGAAGGCAAATATACCGTTAGAAATTTGGTTAAAAATAAAGCTATAGCATTGGAATTAGCTGAGATATATGTTAAGAATCGTTATGGACAGGATGcc < 2:131795/151‑1 (MQ=255)
caTGGGCGCAGTGTAATAATAATATTAAAATAATGCGCAAGTATGAAAGTGAAGGCAAATATACCGTTAGAAATTTGGTTAAAAATAAAGCTATAGCATTGGAATTAGCTGAGATATATGTTAAGAATCGTTATGGACAGGATGCCGCaga < 1:40034/151‑1 (MQ=255)
gcgcAGTGTAATAATAATATTAAAATAATGCGCAAGTATGAAAGTGAAGGCAAATATACCGTTAGAAATTTGGTTAAAAATAAAGCTATAGCATTGGAATTAGCTGAGATATATGTTAAGAATCGTTATGGACAGGATGCCGCagaaga > 2:1725960/1‑149 (MQ=255)
cgcAGTGTAATAATAATATTAAAATAATGCGCAAGTATGAAAGTGAAGGCAAATATACCGTTAGAAATTTGGTTAAAAATAAAGCTATAGCATTGGAATTAGCTGAGATATATGTTAAGAATCGTTATGGACAGGATGCCGCagaagaaga < 1:2157481/151‑1 (MQ=255)
gcAGTGTAATAATAATATTAAAATAATGCGCAAGTATGAAAGTGAAGGCAAATATACCGTTAGAAATTTGGTTAAAAATAAAGCTATAGCATTGGAATTAGCTGAGATATATGTTAAGAATCGTTATGGACAGGATGCCGCagaagaaga > 1:1471893/1‑150 (MQ=255)
gcAGTGTAATAATAATATTAAAATAATGCGCAAGTATGAAAGTGAAGGCAAATATACCGTTAGAAATTTGGTTAAAAATAAAGCTATAGCATTGGAATTAGCTGAGATATATGTTAAGAATCGTTATGGACAGGATGCCGCAgaagaagaa < 1:1381693/151‑1 (MQ=255)
aGTGTAATAATAATATTAAAATAATGCGCAAGTATGAAAGTGAAGGCAAATATACCGTTAGAAATTTGGTTAAAAATAAAGCTATAGCATTGGAATTAGCTGAGATATATGTTAAGAATCGTTATGGACAGGATGCCGCAGAAGAAGaaaa < 2:530119/151‑1 (MQ=255)
aGTGTAATAATAATATTAAAATAATGCGCAAGTATGAAAGTGAAGGCAAATATACCGTTAGAAATTTGGTTAAAAATAAAGCTATAGCATTGGAATTAGCTGAGATATATGTTAAGAATCGTTATGGACAGGATGCCGCAGAAGAAGaaa > 2:1256046/1‑150 (MQ=255)
gtAATAATAATATTAAAATAATGCGCAAGTATGAAAGTGAAGGCAAATATACCGTTAGAAATTTGGTTAAAAATAAAGCTATAGCATTGGAATTAGCTGAGATATATGTTAAGAATCGTTATGGACAGGATGCCGCAGAAGAAGAAAAAcc > 2:1130326/1‑151 (MQ=255)
gtAATAATAATATTAAAATAATGCGCAAGTATGAAAGTGAAGGCAAATATACCGTTAGAAATTTGGTTAAAAATAAAGCTATAGCATTGGAATTAGCTGAGATATATGTTAAGAATCGTTATGGACAGGATGCCGCAGAAGAAGAAAAAc < 1:1862705/150‑1 (MQ=255)
gtAATAATAATATTAAAATAATGCGCAAGTATGAAAGTGAAGGCAAATATACCGTTAGAAATTTGGTTAAAAATAAAGCTATAGCATTGGAATTAGCTGAGATATATGTTAAGAATCGTTATGGACAGGATGCCGCAGAAGAAGAAAAAc < 2:280937/150‑1 (MQ=255)
ataataataTTAAAATAATGCGCAAGTATGAAAGTGAAGGCAAATATACCGTTAGAAATTTGGTTAAAAATAAAGCTATAGCATTGGAATTAGCTGAGATATATGTTAAGAATCGTTATGGACAGGATGCCGCAGAAGAAGAAAAACCAt > 1:449389/1‑150 (MQ=255)
aataataTTAAAATAATGCGCAAGTATGAAAGTGAAGGCAAATATACCGTTAGAAATTTGGTTAAAAATAAAGCTATAGCATTGGAATTAGCTGAGATATATGTTAAGAATCGTTATGGACAGGATGCCGCAGAAGAAGAAAAACCATACg > 1:1927405/1‑151 (MQ=255)
ataataTTAAAATAATGCGCAAGTATGAAAGTGAAGGCAAATATACCGTTAGAAATTTGGTTAAAAATAAAGCTATAGCATTGGAATTAGCTGAGATATATGTTAAGAATCGTTATGGACAGGATGCCGCAGAAGAAGAAAAACCATACg > 1:535705/1‑150 (MQ=255)
taataTTAAAATAATGCGCAAGTATGAAAGTGAAGGCAAATATACCGTTAGAAATTTGGTTAAAAATAAAGCTATAGCATTGGAATTAGCTGAGATATATGTTAAGAATCGTTATGGACAGGATGCCGCAGAAGAAGAAAAACCATACGa > 2:989294/1‑150 (MQ=255)
aataTTAAAATAATGCGCAAGTATGAAAGTGAAGGCAAATATACCGTTAGAAATTTGGTTAAAAATAAAGCTATAGCATTGGAATTAGCTGAGATATATGTTAAGAATCGTTATGGACAGGATGCCGCAGAAGAAGAAAAACCATACGaaa < 1:1268715/151‑1 (MQ=255)
atatTAAAATAATGCGCAAGTATGAAAGTGAAGGCAAATATACCGTTAGAAATTTGGTTAAAAATAAAGCTATAGCATTGGAATTAGCTGAGATATATGTTAAGAATCGTTATGGACAGGATGCCGCAGAAGAAGAAAAACCATACGAAAt < 1:1483702/151‑1 (MQ=255)
tatTAAAATAATGCGCAAGTATGAAAGTGAAGGCAAATATACCGTTAGAAATTTGGTTAAAAATAAAGCTATAGCATTGGAATTAGCTGAGATATATGTTAAGAATCGTTATGGACAGGATGCCGCAGAAGAAGAAAAACCATACGAAATc > 1:1037956/1‑151 (MQ=255)
atTAAAATAATGCGCAAGTATGAAAGTGAAGGCAAATATACCGTTAGAAATTTGGTTAAAAATAAAGCTATAGCATTGGAATTAGCTGAGATATATGTTAAGAATCGTTATGGACAGGATGCCGCAGAAGAAGAAAAACCATACGAAATCa < 1:666769/151‑1 (MQ=255)
tAAAATAATGCGCAAGTATGAAAGTGAAGGCAAATATACCGTTAGAAATTTGGTTAAAAATAAAGCTATAGCATTGGAATTAGCTGAGATATATGTTAAGAATCGTTATGGACAGGATGCCGCAGAAGAAGAAAAACCATACGAAATCACt > 1:276507/1‑151 (MQ=255)
tAAAATAATGCGCAAGTATGAAAGTGAAGGCAAATATACCGTTAGAAATTTGGTTAAAAATAAAGCTATAGCATTGGAATTAGCTGAGATATATGTTAAGAATCGTTATGGACAGGATGCCGCAGAAGAAGAAAAACCATACGAAATCACt > 1:374207/1‑151 (MQ=255)
taatGCGCAAGTATGAAAGTGAAGGCAAATATACCGTTAGAAATTTGGTTAAAAATAAAGCTATAGCATTGGAATTAGCTGAGATATATGTTAAGAATCGTTATGGACAGGATGCCGCAGAAGAAGAAAAACCATACGAAATCACTGAGtt > 2:67523/1‑151 (MQ=255)
atGCGCAAGTATGAAAGTGAAGGCAAATATACCGTTATAAATTTGGTTAAAAATAAAGCTATAGCATTGGAATTAGCTGAGATATATGTTAAGAATCGTTATGGACAGGATGCCGCAGAAGAAGAAAAACCATACGAAATCACTGAGtt > 2:367302/1‑149 (MQ=255)
atGCGCAAGTATGAAAGTGAAGGCAAATATACCGTTAGAAATTTGGTTAAAAATAAAGCTATAGCATTGGAATTAGCTGAGATATATGTTAAGAATCGTTATGGACAGGATGCCGCAGAAGAAGAAAAACCATACGAAATCACTGAGTTaa < 2:221766/151‑1 (MQ=255)
gcgcAAGTATGAAAGTGAAGGCAAATATACCGTTAGAAATTTGGTTAAAAATAAAGCTATAGCATTGGAATTAGCTGAGATATATGTTAAGAATCGTTATGGACAGGATGCCGCAGAAGAAGAAAAACCATACGAAATCACTGAGTTaaca < 2:751730/151‑1 (MQ=255)
gcgcAAGTATGAAAGTGAAGGCAAATATACCGTTAGAAATTTGGTTAAAAATAAAGCTATAGCATTGGAATTAGCTGAGATATATGTTAAGAATCGTTATGGACAGGATGCCGCAGAAGAAGAAAAACCATACGAAATCACTGAGTTaaca < 1:1815098/151‑1 (MQ=255)
gcgcAAGTATGAAAGTGAAGGCAAATATACCGTTAGAAATTTGGTTAAAAATAAAGCTATAGCATTGGAATTAGCTGAGATATATGTTAAGAATCGTTATGGACAGGATGCCGCAGAAGAAGAAAAACCATACGAAATCACTGAGTTaac < 2:2083794/150‑1 (MQ=255)
cAAGTATGAAAGTGAAGGCAAATATACCGTTAGAAATTTGGTTAAAAATAAAGCTATAGCATTGGAATTAGCTGAGATATATGTTAAGAATCGTTATGGACAGGATGCCGCAGAAGAAGAAAAACCATACGAAATCACTGAGTTAacaaca < 1:1066448/151‑1 (MQ=255)
aaGTGAAGGCAAATATACCGTTAGAAATTTGGTTAAAAATAAAGCTATAGCATTGGAATTAGCTGAGATATATGTTAAGAATCGTTATGGACAGGATGCCGCAGAAGAAGAAAAACCATACGAAATCACTGAGTTAACAACAAGTTGGgtt > 2:335207/1‑151 (MQ=255)
tGAAGGCAAATATACCGTTAGAAATTTGGTTAAAAATAAAGCTATAGCATTGGAATTAGCTGAGATATATGTTAAGAATCGTTATGGACAGGATGCCGCAGAAGAAGAAAAACCATACGAAATCACTGAGTTAACAACAAGTTGGgttgtt > 1:1562935/1‑151 (MQ=255)
aaGGCAAATATACCGTTAGAAATTTGGTTAAAAATAAAGCTATAGCATTGGAATTAGCTGAGATATATGTTAAGAATCGTTATGGACAGGATGCCGCAGAAGAAGAAAAACCATACGAAATCACTGAGTTAACAACAAGTTGGGTTGTTGa < 2:334316/151‑1 (MQ=255)
aGGCAAATATACCGTTAGAAATTTGGTTAAAAATAAAGCTATAGCATTGGAATTAGCTGAGATATATGTTAAGAATCGTTATGGACAGGATGCCGCAGAAGAAGAAAAACCATACGAAATCACTGAGTTAACAACAAGTTGGGTTGTTGa > 2:1656825/1‑150 (MQ=255)
|
CCTAATGTCTGCAGAGTTCATGGTAATATGTAAAAAAATATTGTTTAGGAACTGTGTCATTGTATCTTTGTTTGTTTTTACATACAACACATGGGCGCAGTGTAATAATAATATTAAAATAATGCGCAAGTATGAAAGTGAAGGTAAATATACCGTTAGAAATTTGGTTAAAAATAAAGCTATAGCATTGGAATTAGCTGAGATATATGTTAAGAATCGTTATGGACAGGATGCCGCAGAAGAAGAAAAACCATACGAAATCACTGAGTTAACAACAAGTTGGGTTGTTGAA > NC_000913/3623395‑3623686
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
GATK/CNVnator alignment
N/A
