Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A3 F50 I1 R1
|
144 |
141.8 |
4677362 |
93.6% |
4378010 |
150.0 |
Breseq alignment
BRESEQ :: Evidence
|
| evidence |
seq id |
position |
mutation |
annotation |
gene |
description |
| RA |
NC_000913 |
4,453,330 |
A→G |
N254D (AAC→GAC) |
ytfT → |
putative sugar ABC transporter permease |
|
| |
seq id |
position |
ref |
new |
freq |
score (cons/poly) |
reads |
annotation |
genes |
product |
| * | NC_000913 | 4,453,330 | 0 | A | G | 99.1%
| 409.3
/ ‑4.1
| 115 | N254D (AAC→GAC) | ytfT | putative sugar ABC transporter permease |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (0/1); new base G (58/56); total (58/57) |
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 4.96e-01 |
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 3.77e-01 |
Only 100 of 117 total aligned reads displayed.
TCGAAGCCGTTGGTATCAACATTCGGGCGGCAAAAAATGCCGGGGTAAACACGCGAATCATCGTCATGCTCACTTATGTGTTGAGCGGGCTGTGTGCGGCGATTGCGGGCATTATCGTGGCGGCGGATATTCGCGGTGCCGATGCCAACAACGCTGGGTTATGGCTGGAGCTGGACGCCATTCTCGCGGTGGTGATTGGCGGCGGATCGCTGATGGGCGGGCGCTTTAACCTGCTACTTTCGGTGGTGGGGGCGCTGATTATTCAGGGGATGAACACCGGAATTTTGCTTTCGG > NC_000913/4453184‑4453477
|
tCGAAGCCGTTGGTATCAACATTCGGGCGGCAAAAAATGCCGGGGTAAACACGCGAATCATCGTCATGCTCACTTATGTGTTGAGCGGGCTGTGTGCGGCGATTGCGGGCATTATCGTGGCGGCGGATATTCGCGGTGCCGATGCcgaca > 4:476608/1‑150 (MQ=255)
cGAAGCCGTTGGTATCAACATTCGGGCGGCAAAAAATGCCGGGGTAAACACGCGAATCATCGTCATGCTCACTTATGTGTTGAGCGGGCTGTGTGCGGCGATTGCGGGCATTATCGTGGCGGCGGATATTCGCGGTGCCGATGCcgacaa < 1:1048300/150‑1 (MQ=255)
gAAGCCGTTGGTATCAACATTCGGGCGGCAAAAAATGCCGGGGTAAACACGCGAATCATCGTCATGCTCACTTATGTGTTGAGCGGGCTGTGTGCGGCGATTGCGGGCATTATCGTGGCGGCGGATATTCGCGGTGCCGATGCCGACAACg < 2:1364559/151‑1 (MQ=255)
aGCCGTTGGTATCAACATTCGGGCGGCAAATAATGCCGGGGTAAACACGCGAATCATCGTCATGCTCACTTATGTGTTGAGCGGGCTGTGTGCGGCGATTGCGGGCATTATCGTGGCGGCGGATATTCGCGGTGCCGATGCCGACAACGCt > 1:561132/1‑151 (MQ=255)
aGCCGTTGGTATCAACATTCGGGCGGCAAAAAATGCCGGGGTAAACACGCGAATCATCGTCATGCTCACTTATGTGTTGAGCGGGCTGTGTGCGGCGATTGCGGGCATTATCGTGGCGGCGGATATTCGCGGTGCCGATGCCGACAACGCt > 2:999395/1‑151 (MQ=255)
gCCGTTGGTATCAACATTCGGGCGGCAAAAAATGCCGGGGTAAACACGCGAATCATCGTCATGCTCACTTATGTGTTGAGCGGGCTGTGTGCGGCGATTGCGGGCATTATCGTGGCGGCGGATATTCGCGGTGCCGATGCCGACAACGCTg < 2:671394/151‑1 (MQ=255)
ccGTTGGTATCAACATTCGGGCGGCAAAAAATGCCGGGGTAAACACGCGAATCATCGTCATGCTCACTTATGTGTTGAGCGGGCTGTGTGCGGCGATTGCGGGCATTATCGTGGCGGCGGATATTCGCGGTGCCGATGCCGACAACGCTgg > 2:1433209/1‑151 (MQ=255)
gTTGGTATCAACATTCGGGCGGCAAAAAATGCCGGGGTAAACACGCGAATCATCGTCATGCTCACTTATGTGTTGAGCGGGCTGTGTGCGGCGATTGCGGGCATTATCGTGGCGGCGGATATTCGCGGTGCCGATGCCGACAACGCTGGGt < 2:1033385/151‑1 (MQ=255)
tATCAACATTCGGGCGGCAAAAAATGCCGGGGTAAACACGCGAATCATCGTCATGCTCACTTATGTGTTGAGCGGGCTGTGTGCGGCGATTGCGGGCATTATCGTGGCGGCGGATATTCGCGGTGCCGATGCCGACAACGCTGGGTTATgg > 2:795990/1‑151 (MQ=255)
aTCAACATTCGGGCGGCAAAAAATGCCGGGGTAAACACGCGAATCATCGTCATGCTCACTTATGTGTTGAGCGGGCTGTGTGCGGCGATTGCGGGCATTATCGTGGCGGCGGATATTCGCGGTGCCGATGCCGACAACGCTGGGTTATGgc > 1:518742/1‑151 (MQ=255)
cAACATTCGGGCGGCAAAAAATGCCGGGGTAAACACGCGAATCATCGTCATGCTCACTTATGTGTTGAGCGGGCTGTGTGCGGCGATTGCGGGCATTATCGTGGCGGCGGATATTCGCGGTGCCGATGCCGACAACGCTGGGTTATGgctg > 2:1201886/1‑151 (MQ=255)
cAACATTCGGGCGGCAAAAAATGCCGGGGTAAACACGCGAATCATCGTCATGCTCACTTATGTGTTGAGCGGGCTGTGTGCGGCGATTGCGGGCATTATCGTGGCGGCGGATATTCGCGGTGCCGATGCCGACAACGCTGGGTTATGgctg > 1:965546/1‑151 (MQ=255)
aaCATTCGGGCGGCAAAAAATGCCGGGGTAAACACGCGAATCATCGTCATGCTCACTTATGTGTTGAGCGGGCTGTGTGCGGCGATTGCGGGCATTATCGTGGCGGCGGATATTCGCGGTGCCGATGCCGACAACGCTGGGTTATGgctgg > 4:216334/1‑151 (MQ=255)
aCATTCGGGCGGCAAAAAATGCCGGGGTAAACACGCGAATCATCGTCATGCTCACTTATGTGTTGAGCGGGCTGTGTGCGGCGATTGCGGGCATTATCGTGGCGGCGGATATTCGCGGTGCCGATGCCGACAACGCTGGGTTATGgctgga < 3:112402/151‑1 (MQ=255)
cATTCGGGCGGCAAAAAATGCCGGGGTAAACACGCGAATCATCGTCATGCTCACTTATGTGTTGAGCGGGCTGTGTGCGGCGATTGCGGGCATTATCGTGGCGGCGGATATTCGCGGTGCCGATGCCGACAACGCTGGGTTATGgctggag < 4:6225/151‑1 (MQ=255)
aTTCGGGCGGCAAAAAATGCCGGGGTAAACACGCGAATCATCGTCATGCTCACTTATGTGTTGAGCGGGCTGTGTGCGGCGATTGCGGGCATTATCGTGGCGGCGGATATTCGCGGTGCCGATGCCGACAACGCTGGGTTATGgctggagc > 1:811840/1‑151 (MQ=255)
ggcggcAAAAAATGCCGGGGTAAACACGCGAATCATCGTCATGCTCACTTATGTGTTGAGCGGGCTGTGTGCGGCGATTGCGGGCATTATCGTGGCGGCGGATATTCGCGGTGCCGATGCCGACAACGCTGGGTTATGGCTGGAGCTGGAc > 1:562279/1‑151 (MQ=255)
ggcAAAAAATGCCGGGGTAAACACGCGAATCATCGTCATGCTCACTTATGTTTTGAGCTGGCTGTGTGCGGCGATTGCGGGCATTATCGTGGCGGTGGATATTCGCGGTGCCGTTGCCGACAACGCTGGGTTATGGCTGGAGCTGGACGca < 1:1699502/151‑2 (MQ=255)
cAAAAAATGCCGGGGTAAACACGCGAATCATCGTCATGCTCACTTATGTGTTGAGCGGGCTGTGTGCGGCGATTGCGGGCATTATCGTGGCGGCGGATATTCGCGGTGCCGATGCCGACAACGCTGGGTTATGGCTGGAGCTGGACGCCAt < 2:1671635/151‑1 (MQ=255)
cAAAAAATGCCGGGGTAAACACGCGAATCATCGTCATGCTCACTTATGTGTTGAGCGGGCTGTGTGCGGCGATTGCGGGCATTATCGTGGCGGCGGATATTCGCGGTGCCGATGCCGACAACGCTGGGTTATGGCTGGAGCTGGACGCCAt > 2:1062947/1‑151 (MQ=255)
aaTGCCGGGGTAAACACGCGAATCATCGTCATGCTCACTTATGTGTTGAGCGGGCTGTGTGCGGCGATTGCGGGCATTATCGTGGCGGCGGATATTCGCGGTGCCGATGCCGACAACGCTGGGTTATGGCTGGAGCTGGACGCCATTCTcg < 1:1020262/151‑1 (MQ=255)
aTGCCGGGGTAAACACGCGAATCATCGTCATGCTCACTTATGTGTTGAGCGGGCTGTGTGCGGCGATTGCGGGCATTATCGTGGCGGCGGATATTCGCGGTGCCGATGCCGACAACGCTGGGTTATGGCTGGAGCTGGACGCCATTCTcgc > 1:920807/1‑151 (MQ=255)
aTGCCGGGGTAAACACGCGAATCATCGTCATGCTCACTTATGTGTTGAGCGGGCTGTGTGCGGCGATTGCGGGCATTATCGTGGCGGCGGATATTCGCGGTGCCGATGCCGACAACGCTGGGTTATGGCTGGAGCTGGACGCCATTCTcgc < 1:1209303/151‑1 (MQ=255)
gCCGGGGTAAACACGCGAATCATCGTCATGCTCACTTTTGTGTTGAGCGGGCTGTGTGCGGCGATTGCGGGCATTATCGTGGCGGCGGATATTCGCGGTGCCGATGCCGACAACGCTGGGTTATGGCTGGGGCTGGACGCCATTCTCGCgg > 1:266569/1‑151 (MQ=255)
gCCGGGGTAAACACGCGAATCATCGTCATGCTCACTTATGTGTTGAGCGGGCTGTGTGCGGCGATTGCGGGCATTATCGTGGCGGCGGATATTCGCGGTGCCGATGCCGACAACGCTGGGTTATGGCTGGAGCTGGACGCCATTCTcgcg < 1:472005/150‑1 (MQ=255)
ccGGGGTAAACACGCGAATCATCGTCATGCTCACTTATGTGTTGAGCGGGCTGTGTGCGGCGATTGCGGGCATTATCGTGGCGGCGGATATTCGCGGTGCCGATGCCGACAACGCTGGGTTATGGCTGGAGCTGGACGCCATTCTCGCggt < 3:478509/151‑1 (MQ=255)
ccGGGGTAAACACGCGAATCATCGTCATGCTCACTTATGTGTTGAGCGGGCTGTGTGCGGCGATTGCGGGCATTATCGTGGCGGCGGATATTCGCGGTGCCGATGCCGACAACGCTGGGTTATGGCTGGAGCTGGACGCCATTCTCGCgg > 1:348163/1‑150 (MQ=255)
cGGGGTAAACACGCGAATCATCGTCATGCTCACTTATGTGTTGAGCGGGCTGTGTGCGGCGATTGCGGGCATTATCGTGGCGGCGGATATTCGCGGTGCCGATGCCGACATCGCTGGGTTATGGCTGGAGCTGGACGCCATTCTCGCggt < 2:1129012/150‑1 (MQ=255)
ggggTAAACACGCGAATCATCGTCATGCTCACTTATGTGTTGAGCGGGCTGTGTGCGGCGATTGCGGGCATTATCGTGGCGGCGGATATTCGCGGTGCCGATGCCGACAACGCTGGGTTATGGCTGGAGCTGGACGCCATTCTCGCggtgg > 2:1569057/1‑151 (MQ=255)
aaaCACGCGAATCATCGTCATGCTCACTTATGTGTTGAGCGGGCTGTGTGCGGCGATTGCGGGCATTATCGTGGCGGCGGATATTCGCGGTGCCGATGCCGACAACGCTGGGTTATGGCTGGAGCTGGACGCCATTCTCGCggtggt > 1:826306/1‑147 (MQ=255)
acacGCGAATCATCGTCATGCTCACTTATGTGTTGAGCGGGCTGTGTGCGGCGATTGCGGGCATTATCGTGGCGGCGGATATTCGCGGTGCCGATGCCGACAACGCTGGGTTATGGCTGGAGCTGGACGCCATTCTCGCGGTGGTGATTgg < 2:1113371/151‑1 (MQ=255)
cgcgAATCATCGTCATGCTCACTTATGTGTTGAGCGGGCTGTGTGCGGCGATTGCGGTCATTATCGTGGCGGCGGATATTCGCGGTGTCGATGCCGACAACGCTGGGTTATGGCTGGAGGCTGACGGCCTTCTCGCGGTGGGGATTggggg > 1:26980/1‑151 (MQ=255)
cgAATCATCGTCATGCTCACTTATGTGTTGAGCGGGCTGTGTGCGGCGATTGCGGGCATTATCGTGGCGGCGGATATTCGCGGTGCCGATGCCGACAACGCTGGGTTATGGCTGGAGCTGGACGCCATTCTCGCGGTGGTGATTGgcggcg > 2:764092/1‑151 (MQ=255)
cgAATCATCGTCATGCTCACTTATGTGTTGAGCGGGCTGTGTGCGGCGATTGCGGGCATTATCGTGGCGGCGGATATTCGCGGTGCCGATGCCGACAACGCTGGGTTATGGCTGGAGCTGGACGCCATTCTCGCGGTGGTGATTGgcggcg < 2:1281960/151‑1 (MQ=255)
gAATCATCGTCATGCTCACTTATGTGTTGAGCGGGCTGTGTGCGGCGATTGCGGGCATTATCGTGGCGGCGGATATTCGCGGTGCCGATGCCGACAACGCTGGGTTATGGCTGGAGCTGGACGCCATTCTCGCGGTGGTGATTGGcggcgg > 2:1353385/1‑151 (MQ=255)
gAATCATCGTCATGCTCACTTATGTGTTGAGCGGGCTGTGTGCGGCGATTGCGGGCATTATCGTGGCGGCGGATATTCGCGGTGCCGATGCCGACAACGCTGGGTTATGGCTGGAGCTGGACGCCATTCTCGCGGTGGTGATTGGcggcgg < 2:1296242/151‑1 (MQ=255)
gAATCATCGTCATGCTCACTTATGTGTTGAGCGGGCTGTGTGCGGCGATTGCGGGCATTATCGTGGCGGCGGATATTCGCGGTGCCGATGCCGACAACGCTGGGTTATGGCTGGAGCTGGACGCCATTCTCGCGGTGGTGATTGGcggcgg > 3:382257/1‑151 (MQ=255)
gAATCATCGTCATGCTCACTTATGTGTTGAGCGGGCTGTGTGCGGCGATTGCGGGCATTATCGTGGCGGCGGATATTCGCGGTGCCGATGCCGACAACGCTGGGTTATGGCTGGAGCTGGACGCCATTCTCGCGGGGGTGATTGGcggcgg > 2:119004/1‑151 (MQ=255)
atcatcGTCATGCTCACTTATGTGTTGAGCGGGCTGTGTGCGGCGATTGCGGGCATTATCGTGGCGGCGGATATTCGCGGTGCCGATGCCGACAACGCTGGGTTATGGCTGGAGCTGGACGCCATTCTCGCGGTGGTGATTGGCGGCGGAt > 3:296529/1‑151 (MQ=255)
tcatcGTCATGCTCACTTATGTGTTGAGCGGGCTGTGTGCGGCGATTGCGGGCATTATCGTGGCGGCGGATATTCGCGGTGCCGATGCCGACAACGCTGGGTTATGGCTGGAGCTGGACGCCATTCTCGCGGTGGTGATTGGCGGCGGATc > 2:1655325/1‑151 (MQ=255)
catcGTCATGCTCACTTATGTGTTGAGCGGGCTGTGTGCGGCGATTGCGGGCATTATCGTGGCGGCGGATATTCGCGGTGCCGATGCCGACAACGCTGGGTTATGGCTGGAGCTGGACGCCATTCTCGCGGTGGTGATTGGCGGCGGATc < 1:160894/150‑1 (MQ=255)
cGTCATGCTCACTTATGTGTTGAGCGAGCTGTGTGCGGCGATTGCGGGCATTATCGTGGCGGCGGATATTCGCGGTGCCGATGCCGACAACGCTGGGTTATGGCTGGAGCTGGACGCCATTCTCGCGGTGGTGATTGGCGGCGGATCGCTg < 2:1135250/151‑1 (MQ=255)
tCATGCTCACTTATGTGTTGAGCGGGCTGTGTGCGGCGATTGCGGGCATTATCGTGGCGGCGGATATTCGCGGTGCCGATGCCGACAACGCTGGGTTATGGCTGGAGCTGGACGCCATTCTCGCGGTGGGGATTGGCGGCGGATCGCTg > 4:311743/1‑149 (MQ=255)
cATGCTCACTTATGTGTTGAGCGGGCTGTGTGCGGCGATTGCGGGCATTATCGTGGCGGCGGATATTCGCGGTGCCGATGCCGACAACGCTGGGTTATGGCTGGAGCTGGACGCCATTCTCGCGGTGGTGATTGGCGGCGGATCGCTGATg < 2:614578/151‑1 (MQ=255)
cATGCTCACTTATGTGTTGAGCGGGCTGTGTGCGGCGATTGCGGGCATTATCGTGGCGGCGGATATTCGCGGTGCCGATGCCGACAACGCTGGGTTATGGCTGGAGCTGGACGCCATTCTCGCGGTGGTGATTGGCGGCGGATCGCTGATg < 1:789458/151‑1 (MQ=255)
aTGCTCACTTAGGGGTTGAGCGGGCTGTGTGCGGCGATTGCGGGCATTATCGTGGCGGCGGGTATTCGCGGTGCCGAGGCCGACAACGCTGGTGTATGGCTGGAGCTGGGCGGCCTTCTGGCGGTGGTGATTGGCGGCGGAAAGCTGATgg > 1:729072/1‑151 (MQ=255)
tGCTCACTTATGTGTTGAGCGGGCTGTGTGCGGCGATTGCGGGCATTATCGTGGCGGCGGATATTCGCGGTGCCGATGCCGACAACGCTGGGATATGGCTGGAGCTGGACGCCATTCTCGCGGTGGGGATTGGCGGCGGCGCGCTGATggg > 1:1069361/1‑151 (MQ=255)
gCTCACTTATGTGTTGAGCGGGCTGTGTGCGGCGATTGCGGGCATTATCGTGGCGGCGGATATTCGCGGTGCCGATGCCGACAACGCTGGGTTATGGCTGGGGCTGGACGCCATTCTCGCGGTGGTGATTGGCGGCGGGTCGGTGCTggg > 1:1019664/1‑150 (MQ=255)
gCTCACTTATGTGTTGAGCGGGCTGTGTGCGGCGATTGCGGGCATTATCGTGGCGGCGGATATTCGCGGTGCCGATGCCGACAACGCTGGGTTATGGCTGGAGCTGGACGCCATTCTCGCGGTGGTGATTGGCGGCGGCTCCCTGATggg > 1:13113/1‑150 (MQ=255)
tCACTTATGGGTTGAGCGGGCTGTGTGCGGCGATTGCGGGCATTATCGTGGCGGCTGTTATTCGCGGTGCCGATGCCGACAACGCTGGGTTATGGCTGGAGCTGGACGCCATTCTCGCGGTGGTGATTGGCGGGGGATCGCTGGTgggcgg > 1:1587029/1‑151 (MQ=255)
cACTTATGTGTTGAGCGGGCTGTGTGCGGCGATTGCGGGCATTATCGTGGCGGCGGATATTCGCGGTGCCGATGCCGACAACGCTGGGTTATGGCTGGAGCTGGACGCCATTCTCGCGGTGGTGATTGGCGGCGGATCGCTGATgggcggg > 3:257776/1‑151 (MQ=255)
tATGTGTTGAGCGGGCTGTGTGCGGCGATTGCGGGCATTATCGTGGCGGCGGATATTCGCGGTGCCGATGCCGACAACGCTGGGTTATGGCTGGAGCTGGACGCCATTCTCGCGGTGGTGATTGGCGGCGGATCGCTGATGGGCGGgcgc < 2:192175/150‑1 (MQ=255)
tgtgTTGAGCGGGCTGTGTGCGGCGATTGCGGGCATTATCGTGGCGGCGGATATTCGCGGTGCCGATGCCGACAACGCTGGGTTATGGCTGGAGCTGGACGCCATTCTCGCGGTGGTGATTGGCGGCGGATCGCTGATGGGCGGGCGCttt > 2:128655/1‑151 (MQ=255)
gtgtTGAGCGGGCTGTGTGCGGCGATTGCGGGCATTATCGTGGCGGCGGATATTCGCGGTGCCGATGCCGACAACGCTGGGTTATGGCTGGAGCTGGACGCCATTCTCGCGGTGGTGATTGGCGGCGGATCGCTGATGGGCGGGCGCttt < 2:1376533/150‑1 (MQ=255)
ttGAGCGGGCTGTGTGCGGCGATTGCGGGCATTATCGTGGCGGCGGATATTCGCGGTGCCGATGCCGACAACGCTGGGTTATGGCTGGAGCTGGACGCCATTCTCGCGGTGGTGATTGGCGGCGGATCGCTGATGGGCGGGGGCTTTAAcc > 1:1201153/1‑151 (MQ=255)
ttGAGCGGGCTGTGTGCGGCGATTGCGGGCATTATCGTGGCGGCGGATATTCGCGGTGCCGATGCCGACAACGCTGGGTTATGGCTGGAGCTGGACGCCATTCTCGCGGTGGTGATTGGCGGCGGATCGCTGATGGGCGGGCGCTTTTAcc > 1:1510875/1‑151 (MQ=255)
ttGAGCGGGCTGTGTGCGGCGATTGCGGGCATTATCGTGGCGGCGGATATTCGCGGTGCCGATGCCGACAACGCTGGGTTATGGCTGGAGCTGGACGCCATTCTCGCGGTGGTGATTGGCGGCGGATCGCTGATGGGCGGGCGCTTTAAcc > 3:379963/1‑151 (MQ=255)
tGAGCGGGCTGTGTGCGGCGATTGCGGGCATTATCGTGGCGGCGGATATTCGCGGTGCCGATGCCGACAACGCTGGGTTATGGCTGGAGCTGGACGCCATTCTCGCGGTGGTGATTGGCGGCGGATCGCTGATGGGCGGGCGCTTTAAcc < 1:1721337/150‑1 (MQ=255)
gcggtgtgCGGCGATTGCGGGCATTATCGTGGCGGCGGATATTCGCGGTGCCGATGCCGAGAACGTTGGGTTATGGCTGGAGCTGGATGCCATTCTCGCGGTGGTGATTGGCGGCGGATCTCTGATGGGCTGGCTCGTTAACCTGCTAttt < 1:892214/148‑1 (MQ=255)
cTGTGTGCGGCGATTGCGGGCATTATCGTGGCGGCGGATATTCGCGGTGCCGATGCCGACAACGCTGGGTTATGGCTGGAGCTGGACGCCATTCTCGCGGTGGTGATTGGCGGCGGATCGCTGATGGGCGGGCGCTTTAACCTGCTACttt > 1:5115/1‑151 (MQ=255)
gcggcgATTGCGGGCATTATCGTGGCGGCGGATATTCGCGGTGCCGATGCCGACAACGCTGGGTTATGGCTGGAGCTGGACGCCATTCTCGCGGTGGTGATTGGCGGCGGATCGCTGATGGGCGGGCGCTTTAACCTGCTACTTTCggtgg < 4:594142/151‑1 (MQ=255)
gcggcgATTGCGGGCATTATCGTGGCGGCGGATATTCGCGGTGCCGATGCCGACAACGCTGGGTTATGGCTGGAGCTGGACGCCATTCTCGCGGTGGTGATTGGCGGCGGATCGCTGATGGGCGGGCGCTTTAACCTGCTACTTTCggtg < 2:998231/150‑1 (MQ=255)
cggcgATTGCGGGCATTATCGTGGCGGCGGATATTCGCGGTGCCGATGCCGACAACGCTGGGTTATGGCTGGAGCTGGACGCCATTCTCGCGGTGGTGATTGGCGGCGGATCGCTGATGGGCGGGCGCTTTAACCTGCTACTTTCggtggt < 2:216298/151‑1 (MQ=255)
gATTGCGGGCATTATCGTGGCGGCGGATATTCGCGGTGCCGATGCCGACAACGCTGGGTTATGGCTGGAGCTGGACGCCATTCTCGCGGTGGTGATTGGCGGCGGATCGCTGATGGGCGGGCGCTTTAACCTGCTACTTTCGGTGGTgggg > 4:520598/1‑151 (MQ=255)
gCGGGCATTATCGTGGCGGCGGATATTCGCGGTGCCGATGCCGACAACGCTGGGTTATGGCTGGAGCTGGACGCCATTCTCGCGGTGGTGATTGGCGGCGGATCGCTGATGGGCGGGCGCTTTAACCTGCTACTTTCGGTGGTGGGGgcgc < 4:552201/151‑1 (MQ=255)
gggCATTATCGTGGCGGCGGATATTCGCGGTGCCGATGCCGACAACGCTGGGTTATGGCTGGAGCTGGACGCCATTCTCGCGGTGGTGATTGGCGGCGGATCGCTGATGGGCGGGCGCTTTAACCTGCTACTTTCGGTGGTGGGGGCGCt < 2:1292912/150‑1 (MQ=255)
gggCATTATCGTGGCGGCGGATATTCGCGGTGCCGATGCCGACAACGCTGGGTTATGGCTGGAGCTGGACGCCATTCTCGCGGTGGTGATTGGCGGCGGATCGCTGATGGGCGGGCGCTTTAACCTGCTACTTTCGGTGGTGGGGGCGCTg < 3:461742/151‑1 (MQ=255)
ggCATTATCGTGGCGGCGGATATTCGCGGTGCCGATGCCGACAACGCTGGGTTATGGCTGGAGCTGGACGCCATTCTCGCGGTGGTGATTGGCGTCGGATCGCTGATGGGCGGGGGCTTTAACCTGCTCCTTTCGGTGGTGGGGGCGCTGa < 4:53557/151‑1 (MQ=255)
ttATCGTGGCGGCGGATATTCGCGGTGCCGATGCCGACAACGCTGGGTTATGGCTGGAGCTGGACGCCATTCTCGCGGTGGTGATTGGCGGCGGATCGCTGATGGGCGGGCGCTTTAACCTGCTACTTTCGGTGGTGGGGGCGCTGattat > 2:950928/1‑151 (MQ=255)
ttATCGTGGCGGCGGATATTCGCGGTGCCGATGCCGACAACGCTGGGTTATGGCTGGAGCTGGACGCCATTCCCGCGGGGGTGATTGGCGGCGGATCGCTGATGGGCGGGCGCTTTAACCTGTTTCTTTCGGCGGTGGGGGCGCTGttt > 1:235072/1‑149 (MQ=255)
tATCGTGGCGGCGGATATTCGCGGTGCCGATGCCGACAACGCTGGGTTATGGCTGGAGCTGGACGCCATTCTCGCGGTGGTGATTGGCGGCGGATCGCTGATGGGCGGGCGCTTTAACCTGCTACTTTCGGTGGTGGGGGCGCTGattat < 4:394557/150‑1 (MQ=255)
aTCGTGGCGGCGGATATTCGCGGTGCCGATGCCGACAACGCTGGGTTATGGCTGGAGCTGGACGCCATTCTCGCGGTGGTGATTGGCGGCGGATCGCTGATGGGCGGGCGCTTTAACCTGCTACTTTCGGTGGTGGGGGCGCTGATTATTc > 2:1048117/1‑151 (MQ=255)
cGTGGCGGCGGATATTCGCGGTGCCGATGCCGACAACGCTGGGTTATGGCTGGAGCTGGACGCCATTCTCGCGGTGGTGATTGGCGGCGGATCGCTGATGGGCGGGCGCTTTAACCTGCTACTTTCGGTGGTGGGGGCGCTGATTATTc > 1:684255/1‑149 (MQ=255)
cGTGGCGGCGGATATTCGCGGTGCCGATGCCGACAACGCTGGGTTATGGCTGGAGCTGGACGCCATTCTCGCGGTGGTGATTGGCGGCGGATCGCTGATGGGCGGGCGCTTTAACCTGCTACTTTCGGTGGTGGGGGCGCTGATTATTCa < 2:90878/150‑1 (MQ=255)
cGTGGCGGCGGATATTCGCGGTGCCGATGCCGACAACGCTGGGTTATGGCTGGAGCTGGACGCCATTCTCGCGGTGGTGATTGGCGGCGGATCGCTGATGGGCGGGCGCTTTAACCTGCTACTTTCGGTGGTGGGGGCGCTGATTATTCa < 1:503637/150‑1 (MQ=255)
gTGGCGGCGGATATTCGCGGTGCCGATGCCGACAACGCTGGGTTATGGCTGGAGCTGGACGCCATTCTCGCGGTGGTGATTGGCGGCGGATCGCTGATGGGCGGGCGCTTTAACCTGCTACTTTCGGTGGTGGGGGCGCTGATTATTCAgg < 1:996970/151‑1 (MQ=255)
gTGGCGGCGGATATTCGCGGTGCCGATGCCGACAACGCTGGGTTATGGCTGGAGCTGGACGCCATTCTCGCGGTGGTGATTGGCGGCGGATCGCTGATGGGCGGGCGCTTTAACCTGCTACTTTCGGTGGTGGGGGCGCTGATTATTCAgg < 3:6878/151‑1 (MQ=255)
tGGCGGCGGATATTCGCGGTGCCGATGCCGACAACGCTGGGTTATGGCTGGAGCTGGACGCCATTCTCGCGGTGGTGATTGGCGGCGGATCGCTGATGGGCGGGCGCTTTAACCTGCTACTTTCGGTGGTGGGGGCGCTGATTATTCAggg > 2:965723/1‑151 (MQ=255)
ggcggcGGATATTCGCGGTGCCGATGCCGACAACGCTGGGTTATGGCTGGAGCTGGACGCCATTCTCGCGGTGGTGATTGGCGGCGGATCGCTGATGGGCGGGCGCTTTAACCTGCTACTTTCGGTGGTGGGGGCGCTGATTATTCAgggg < 1:1351978/151‑1 (MQ=255)
ggcggcGGATATTCGCGGTGCCGATGCCGACAACGCTGGGTTATGGCTGGAGCTGGACGCCATTCTCGCGGTGGTGATTGGCGGCGGATCGCTGATGGGCGGGCGCTTTAACCTGCTACTTTCGGTGGTGGGGGCGCTGATTATTCAgggg < 1:128125/151‑1 (MQ=255)
cggcggATATTCGCGGTGCCGATGCCGACAACGCTGGGTTATGGCTGGAGCTGGACGCCATTCTCGCGGTGGTGATTGGCGGCGGATCGCTGATGGGCGGGCGCTTTAACCTGCTACTTTCGGTGGTGGGGGCGCTGATTATTCAGGGGAt < 3:377872/151‑1 (MQ=255)
ggcggATATTCGCGGTGCCGATGCCGACAACGCTGGGTTATGGCTGGAGCTGGACGCCATTCTCGCGGTGGTGATTGGCGGCGGATCGCTGATGGGCGGGCGCTTTAACCTGCTACTTTCGGTGGTGGGGGCGCTGATTATTCAGGGGATg < 2:1630022/151‑1 (MQ=255)
gATATTCGCGGTGCCGATGCCGACAACGCTGGGTTATGGCTGGAGCTGGACGCCATTCTCGCGGTGGTGATTGGCGGCGGATCGCTGATGGGCGGGCGCTTTAACCTGCTACTTCCGGTGGTGGGGGCGCTGATTATTCAGGGGATGAaca < 1:125309/151‑1 (MQ=255)
tatTCGCGGTGCCGATGCCGACAACGCTGGGTTATGGCTGGAGCTGGACGCCATTCTCGCGGTGGTGATTGGCGGCGGATCGCTGATGGGCGGGCGCTTTAACCTGCTGCTTTCGGTGGTGGGGGCGCTGATTATTCAGGGGATGAacac < 1:1263271/150‑1 (MQ=255)
atTCGCGGTGCCGATGCCGACAACGCTGGGTTATGGCTGGAGCTGGACGCCATTCTCGCGGTGGTGATTGGCGGCGGATCGCTGATGGGCGGGCGCTTTAACCTGCTACTTTCGGTGGTGGGGGCGCTGATTATTCAGGGGATGAACACCg < 2:175554/151‑1 (MQ=255)
atTCGCGGTGCCGATGCCGACAACGCTGGGTTATGGCTGGAGCTGGACGCCATTCTCGCGGTGGTGATTGGCGGCGGATCGCTGATGGGCGGGCGCTTTAACCTGCTACTTTCGGTGGTGGGGGCGCTGATTATTCAGGGGATGAACACCg < 4:389091/151‑1 (MQ=255)
atTCGCGGTGCCGATGCCGACAACGCTGGGTTATGGCTGGAGCTGGACGCCATTCTCGCGGTGGTGATTGGCGGCGGATCGCTGATGGGCGGGCGCTTTAACCTGCTACTTTCGGTGGTGGGGGCGCTGATTATTCAGGGGATGAACACCg < 4:236830/151‑1 (MQ=255)
ttCGCGGTGCCGATGCCGACAACGCTGGGTTATGGCTGGAGCTGGACGCCATTCTCGCGGTGGTGATTGGCGGCGGATCGCTGATGGGCGGGCGCTTTAACCTGCTACTTTCGGTGGTGGGGGCGCTGATTATTCAGGGGATGAACACCgg > 1:1364435/1‑151 (MQ=255)
ttCGCGGTGCCGATGCCGACAACGCTGGGTTATGGCTGGAGCTGGACGCCATTCTCGCGGTGGTGATTGGCGGCGGATCGCTGATGGGCGGGCGCTTTAACCTGCTACTTTCGGTGGGGGGGGCGCTGATTATTCAGGGGATGAACACCgg > 1:1292303/1‑151 (MQ=255)
gcgGTGCCGATGCCAACAACGCTGGGTTATGGCTGGAGCTGGACGCCATTCTCGCGGTGGTGATTGGCGGCGGATCGCTGATGGGCGGGCGCTTTAACCTGCTACTTTCGGTGGTGGGGGCGCTGATTATTCAGGGGATGAACACCGGAAt < 3:44027/151‑1 (MQ=255)
ggTGCCGATGCCGACAACGCTGGGTTATGGCTGGAGCTGGACGCCATTCTCGCGGTGGTGATTGGCGGCGGATCGCTGATGGGCGGGCGCTTTAACCTGCTACTTTCGGTGGTGGGGGCGCTGATTATTCAGGGGATGAACACCGGAAttt < 1:664232/151‑1 (MQ=255)
gTGCCGATGCCGACAACGCTGGGTTATGGCTGGAGCTGGCCGCCATTCTCGAGGTGGTGATGGGCGGCGGATCGCTGATGGGCGGGCGCTTTAACCTGCTACTTTCGGTGGTGGGGGCGCTGATTATTCAGGGGATGAACACCGGAAttt < 3:596525/150‑1 (MQ=255)
ccGATGCCGACAACGCTGGGTTATGGCTGGAGCTGGACGCCATTCTCGCGGTGGTGATTGGCGGCGGATCGCTGATGGGCGGGCGCTTTAACCTGCTACTTTCGGTGGTGGGGGCGCTGATTATTCAGGGGATGAACACCGGAATTTTGCt > 2:804156/1‑151 (MQ=255)
cGATGCCGACAACGCTGGGTTATGGCTGGAGCTGGACGCCATTCTCGCGGTGGTGATTGGCGGCGGATCGCTGATGGGCGGGCGCTTTAACCTGCTACTTTCGGTGGTGGGGGCGCTGATTATTCAGGGGATGAACACCGGAATTTTGCtt > 1:1263396/1‑151 (MQ=255)
gATGCCGACAACGCTGGGTTATGGCTGGAGCTGGACGCCATTCTCGCGGTGGTGATTGGCGGCGGATCGCTGATGGGCGGGCGCTTTAACCTGCTACTTTCGGTGGTGGGGGCGCTGATTATTCAGGGGATGAACACCGGAATTTTGCttt > 2:817281/1‑151 (MQ=255)
gATGCCGACAACGCTGGGTTATGGCTGGAGCTGGACGCCATTCTCGCGGTGGTGATTGGCGGCGGATCGCTGATGGGCGGGCGCTTTAACCTGCTACTTTCGGTGGTGGGGGCGCTGATTATTCAGGGGATGAACACCGGAATTTTGCtt < 1:1568897/150‑1 (MQ=255)
aTGCCGACAACGCTGGGTTATGGCTGGAGCTGGACGCCATTCTCGCGGTGGTGATTGGCGGCGGATCGCTGATGGGCGGGCGCTTTAACCTGCTACTTTCGGTGGTGGGGGCGCTGATTATTCAGGGGATGAACACCGGAATTTTGCTTTc < 3:425931/151‑1 (MQ=255)
aTGCCGACAACGCTGGGTTATGGCTGGAGCTGGACGCCATTCTCGCGGTGGTGATTGGCGGCGGATCGCTGATGGGCGGGCGCTTTAACCTGCTACTTTCGGTGGTGGGGGCGCTGATTATTCAGGGGATGAACACCGGAATTTTGCTTTc > 2:1358143/1‑151 (MQ=255)
tGCCGACAACGCTGGGTTATGGCTGGAGCTGGACGCCATTCTCGCGGTGGTGATTGGCGGCGGATCGCTGATGGGCGGGCGCTTTAACCTGCTACTTTCGGTGGTGGGGGCGCTGATTATTCAGGGGATGAACACCGGAATTTTGCTTTCg > 3:279232/1‑151 (MQ=255)
gCCGACAACGCTGGGTTATGGCTGGAGCTGGACGCCATTCTCGCGGTGGTGATTGGCGGCGGATCGCTGATGGGCGGGCGCTTTAACCTGCTACTTTCGGTGGTGGGGGCGCTGATTATTCAGGGGATGAACACCGGAATTTTGCTTTCgg > 2:1246685/1‑151 (MQ=255)
|
TCGAAGCCGTTGGTATCAACATTCGGGCGGCAAAAAATGCCGGGGTAAACACGCGAATCATCGTCATGCTCACTTATGTGTTGAGCGGGCTGTGTGCGGCGATTGCGGGCATTATCGTGGCGGCGGATATTCGCGGTGCCGATGCCAACAACGCTGGGTTATGGCTGGAGCTGGACGCCATTCTCGCGGTGGTGATTGGCGGCGGATCGCTGATGGGCGGGCGCTTTAACCTGCTACTTTCGGTGGTGGGGGCGCTGATTATTCAGGGGATGAACACCGGAATTTTGCTTTCGG > NC_000913/4453184‑4453477
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
GATK/CNVnator alignment
N/A
