Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A0 F0 I1 R1
|
4926 |
296.4 |
4517418 |
96.8% |
4372860 |
264.2 |
Breseq alignment
BRESEQ :: Evidence
|
| evidence |
seq id |
position |
mutation |
annotation |
gene |
description |
| RA |
CP042583 |
1,622,424 |
3 bp→TGA |
intergenic (–/–) |
– / – |
–/– |
|
| |
seq id |
position |
ref |
new |
freq |
score (cons/poly) |
reads |
annotation |
genes |
product |
| * | CP042583 | 1,622,424 | 0 | A | T | 100.0%
| 648.6
/ NA
| 268 | intergenic (–/–) | –/– | –/– |
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| * | CP042583 | 1,622,425 | 0 | C | G | 100.0%
| 643.3
/ NA
| 268 | intergenic (–/–) | –/– | –/– |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (0/0); new base G (141/127); total (141/127) |
| * | CP042583 | 1,622,426 | 0 | T | A | 100.0%
| 647.3
/ NA
| 268 | intergenic (–/–) | –/– | –/– |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (0/0); new base A (141/127); total (141/127) |
Only 100 of 268 total aligned reads displayed.
GGCTCACTGGCTTCAGGTAAGAGGCTACGAATTTCGTTCTGTTCCAGCTCAATGGTTTTGACAATTGGCGTGGCATCACGGTGATAAACATAAGGCCGCCAGACAGCGACGGCCAGAGTAAGAACGGTGAGGCTCCCCAACATAACGCGGTGTGGTCGCGGTAAATTATTAAACGCCAGGGCGACAGAGCGGGCTATCTGTTGCACGTAATCACTTCCTCATTAATCTCCTTTCAGGCAGCTCGCATACTGGTTGGCTAATTGACTCAGGAATTCACTATAGCTTGTTTTACCCAGTTTGATATTCGTCCCCAGGGGATCCAACGTTCCCATACGAACGGATGTCCCTCGTGCGACGCTCTCAACGACCGCTGGCCTGAACTGTGGCTCAGCAAAAACGCAGGTTGCTTTTTGCTCAACCAACTGTGTTCTTATTTCATGTAAACGCTGCGCGCCAGGTTGAATCTCAGGGTTAACGGTAAAATGACCAAGCGGTGTCAGTCCAAACTGTTTTTCGAAATAGCCGTAAGCATCGTGAAAAACGAAATAACCTT > CP042583/1622149‑1622701
|||
tCACTGGCTTCAGGTAAGAGCGAACGAATTTCGTTCTGTTCCAGCTCAATGGTTTTGACAATTGGCGTGGCATCACGGTGATAAACATAAGGCCGCCAGACAGCGACGGCCAGAGTAAGAACGGTGAGCGACCCCAACATAACGCGGTGTGGTCGCGGTAAATTATTAAACGCCAGGGCGACAGAGCGGGCTATCTGTTGCACGTAATCACTTCCTCATTAATCTCCTTTCAGGCAGCTCGCATACTGGTTGGCTAATTGACTCAGGAATTCTGAATAGCTTGTTTTAc < 1:520782/289‑1 (MQ=255)
gttCAGGTAAGAGCGAACGAATTTCGTTCTGTTCCAGCTCAATGGTTTTGACAATTGGCGTGGCATCACGGTGATAAACATAAGGCCGCCAGACAGCGACGGCCAGAGTAAGAACGGTGAGCGACCCCAACATAACGCGGTGTGGTCGCGGTAAATTATTAAACGCCAGGGCGACAGAGCGGGCTATCTGTTGCACGTAATCACTTCCTCATTAATCTCCTTTCAGGCAGCTCGCATACTGGTTGGCTAATTGACTCAGGAATTCTGAATAGCTTGTTTTACCCAGtt < 1:418164/287‑1 (MQ=255)
taagagcgaaCGAATTTCGTTCTGTTCCAGCTCAATGGTTTTGACAATTGGCGTGGCATCACGGTGATAAACATAAGGCCGCCAGACAGCGACGGCCAGAGTAAGAACGGTGAGCGACCCCAACATAACGCGGTGTGGTCGCGGTAAATTATTAAACGCCAGGGCGACAGAGCGGGCTATCTGTTGCACGTAATCACTTCCTCATTAATCTCCTTTCAGGCAGCTCGCATACTGGTTGGCTAATTGACTCAGGAATTCTGAATAGCTTGTTTTACCCAGTTTGATAtt < 2:197775/279‑1 (MQ=255)
agcgaaCGAATTTCGTTCTGTTCCAGCTCAATGGTTTTGACAATTGGCGTGGCATCACGGTGATAAACATAAGGCCGCCAGACAGCGACGGCCAGAGTAAGAACGGTGAGCGACCCCAACATAACGCGGTGTGGTCGCGGTAAATTATTAAACGCCAGGGCGACAGAGCGGGCTATCTGTTGCACGTAATCACTTCCTCATTAATCTCCTTTCAGGCAGCTCGCATACTGGTTGGCTAATTGACTCAGGAATTCTGAATAGCTTGTTTTACCCAGTTTGATATTCGTc > 1:486248/6‑288 (MQ=255)
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gCTCAATGGTTTTGACAATTGGCGTGGCATCACGGTGATAAACATAAGGCCGCCAGACAGCGACGGCCAGAGTAAGAACGGTGAGCGACCCCAACATAACGCGGTGTGGTCGCGGTAAATTATTAAACGCCAGGGCGACAGAGCGGGCTATCTGTTGCACGTAATCACTTCCTCATTAATCTCCTTTCAGGCAGCTCGCATACTGGTTGGCTAATTGACTCAGGAATTCTGAATAGCTTGTTTTACCCAGTTTGATATTCGTCCCCAGGGGATCCAACGTTCCCATACg > 1:1577296/1‑289 (MQ=255)
tCAATGGTTTTGACAATTGGCGTGGCATCACGGTGATAAACATAAGGCCGCCAGACAGCGACGGCCAGAGTAAGAACGGTGAGCGACCCCAACATAACGCGGTGTGGTCGCGGTAAATTATTAAACGCCAGGGCGACAGAGCGGGCTATCTGTTGCACGTAATCCCTTCCTCATTAATCTCCTTTCAGGCAGCTCGCATACTGGTTGGCTAATTGACTCAGGAATTCTGAATAGCTTGTTTTACCCAGTTTGATATTCGTCCCCAGGGGATCCAACGTTCCCATACg < 2:365149/287‑1 (MQ=255)
aTGGTTTTGACAATTGGCGTGGCATCACGGTGATAAACATAAGGCCGCCAGACAGCGACGGCCAGAGTAAGAACGGTGAGCGACCCCAACATAACGCGGTGTGGTCGCGGTAAATTATTAAACGCCAGGGCGCCAAAGCGGGCTATCTGTTGCACGTAATCACTTCCTCATTAATCTCCTTTCAGGCAGCTCGCATACTGGTTGGCTAATTGACTCAGGAATTCTGAATAGCTTGTTTTACCCAGTTTGATATTCGTCCCCAGGGGATCCAACGTTCCCATACGAACgg > 2:585028/1‑289 (MQ=255)
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ttGGCGTGGCATCACGGTGATAAACATAAGGCCGCCAGACAGCGACGGCCAGAGTAAGAACGGTGAGCGACCCCAACATAACGCGGTGTGGTCGCGGTAAATTATTAAACGCCAGGGCGACAGAGCGGGCTATCTGTTGCACGTAATCACTTCCTCATTAATCTCCTTTCAGGCAGCTCGCATACTGGTTGGCTAATTGACTCAGGAATTCTGAATAGCTTGTTTTACCCAGTTTGATATTCGTCCCCAGGGGATCCAACGTTCCCATACGAACGGATGTCCCTCGTg > 2:1071134/1‑288 (MQ=255)
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cACGGTGATAAACATAAGGCCGCCAGACAGCGACGGCCAGAGTAAGAACGGTGAGCGACCCCAACATAACGCGGTGTGGTCGCGGTAAATTATTAAACGCCAGGGCGACAGAGCGGGCTATCTGTTGCACGTAATCACTTCCTCATTAATCTCCTTTCAGGCAGCTCGCATACTGGTTGGCTAATTGACTCAGGAATTCTGAATAGCTTGTTTTACCCAGTTTGATATTCGTCCCCAGGGGATCCAACGTTCCCATACGAACGGATGTCCCTCGTGCGACGCTCTCAAc < 2:1769810/289‑1 (MQ=255)
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tAAACATAAGGCCGCCAGACAGCGACGGCCAGAGTAAGAACGGTGAGCGACCCCAACATAACGCGGTGTGGTCGCGGTAAATTATTAAACGCCAGGGCGACAGAGCGGGCTATCTGTTGCACGTAATCACTTCCTCATTAATCTCCTTTCAGGCAGCTCGCATACTGGTTGGCTAATTGACTCAGGAATTCTGAATAGCTTGTTTTACCCAGTTTGATATTCGTCCCCAGGGGATCCAACGTTCCCATACGAACGGATGTCCCTCGTGCGACGCTCTCAACGACCg < 2:938117/286‑1 (MQ=255)
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aaGGCCGCCAGACAGCGACGGCCAGAGTAAGAACGGTGAGCGACCCCAACATAACGCGGTGTGGTCGCGGTAAATTATTAAACGCCAGGGCGACAGAGCGGGCTATCTGTTGCACGTAATCACTTCCTCATTAATCTCCTTTCAGGCAGCTCGCATACTGGTTGGCTAATTGACTCAGGAATTCTGAATAGCTTGTTTTACCCAGTTTGATATTCGTCCCCAGGGGATCCAACGTTCCCATACGAACGGa > 1:692415/1‑250 (MQ=255)
aaGGCCGCCAGACAGCGACGGCCAGAGTAAGAACGGTGAGCGACCCCAACATAACGCGGTGTGGTCGCGGTAAATTATTAAACGCCAGGGCGACAGAGCGGGCTATCTGTTGCACGTAATCACTTCCTCATTAATCTCCTTTCAGGCAGCTCGCATACTGGTTGGCTAATTGACTCAGGAATTCTGAATAGCTTGTTTTACCCAGTTTGATATTCGTCCCCAGGGGATCCAACGTTCCCATACGAACGGATGTCCCTCGTGCGACGCTCTCAACGACCGCt > 1:452610/1‑281 (MQ=255)
aaGGCCGCCAGACAGCGACGGCCAGAGTAAGAACGGTGAGCGACCCCAACATAACGCGGTGTGGTCGCGGTAAATTATTAAACGCCAGGGCGACAGAGCGGGCTATCTGTTGCACGTAATCACTTCCTCATTAATCTCCTTTCAGGCAGCTCGCATACTGGTTGGCTAATTGACTCAGGAATTCTGAATAGCTTGTTTTACCCAGTTTGATATTCGTCCCCAGGGGATCCAACGTTCCCATACGAACGGATGTCCCTCGTGCGACGCTCTCAACGACCGCTGGCCTGa > 2:1622881/1‑288 (MQ=255)
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ggCCGCCAGACAGCGACGGCCAGAGTAAGAACGGTGAGCGACCCCAACATAACGCGGTGTGGTCGCGGTAAATTATTAAACGCCAGGGCGACAGAGCGGGCTATCTGTTGCACGTAATCACTTCCTCATTAATCTCCTTTCAGGCAGCTCGCATACTGGTTGGCTAATTGACTCAGGAATTCTGAATAGCTTGTTTTACCCAGTTTGATATTCGTCCCCAGGGGATCCAACGTTCCCATACGAACGGATGTCCCTCGTGCGACGCTCTCAACGACCGCTGGCCTGa > 1:2022352/1‑286 (MQ=255)
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cGGCCAGAGTAAGAACGGTGAGCGACCCCAACATAACGCGGTGTGGTCGCGGTAAATTATTAAACGCCAGGGCGACAGAGCGGGCTATCTGTTGCACGTAATCACTTCCTCATTAATCTCCTTTCAGGCAGCTCGCATACTGGTTGGCTAATTGACTCAGGAATTCTGAATAGCTTGTTTTACCCAGTTTGATATTCGTCCCCAGGGGATCCAACGTTCCCATACGAACGGATGTCCCTCGTGCGACg < 1:582064/248‑1 (MQ=255)
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gtgagcgaccccAACATAACGCGGTGTGGTCGCGGTAAATTATTAAACGCCAGGGCGACAGAGCGGGCTATCTGTTGCACGTAATCACTTCCTCATTAATCTCCTTTCAGGCAGCTCGCATACTGGTTGGCTAATTGACTCAGGAATTCTGAATAGCTTGTTTTACCCAGTTTGATATTCGTCCCCAGGGGATCCAACGTTCCCATACGAACGGATGTCCCTCGTGCGACGCTCTCAACGACCGCTGGCCTGAACTGTGGCTCAGCAAAAACGCAGGTTGCTTTTTGc > 1:356434/9‑288 (MQ=255)
ccccAACACAACGCGTTGTGGTGGCGGTAAATTATTAAACGCCAGGGCGACAGAGCGGGCTATCTGTTGCACGTAATCACTTCCTCATTAATCTCCTTTCAGGCAGCTCGCATACTGGTTGGCTAATTGACTCAGGAATTCTGAATAGCTTGTTTTACCCAGTTTGATATTCGTCCCCAGGGGATCCAACGTTCCCATACGAACGGATGTCCCTCGTGCGACGCTCTCAACGACCGCTGGCCTGAACTGTGGCTCAGCAAAAACGCAGGTTGCTTTTTGCTcaaccaac < 2:1571622/289‑1 (MQ=255)
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cccAACATAACGCGGTGTGGTCGCGGTAAATTATTAAACGCCAGGGCGACAGAGCGGGCTATCTGTTGCACGTAATCACTTCCTCATTAATCTCCTTTCAGGCAGCTCGCATACTGGTTGGCTAATTGACTCAGGAATTCTGAATAGCTTGTTTTACCCAGTTTGATATTCGTCCCCAGGGGATCCAACGTTCCCATACGAACGGATGTCCCTCGTGCGACGCTCTCAACGACCGCTGGCCTGAACTGTGGCTCAGCAAAAACGCAGGTTGCTTTTTGCTCAACCAACt < 1:954772/289‑1 (MQ=255)
aCGCGGTGTGGTCGCGGTAAATTATTAAACGCCAGGGCGACAGAGCGGGCTATCTGTTGCACGTAATCACTTCCTCATTAATCTCCTTTCAGGCAGCTCGCATACTGGTTGGCTAATTGACTCAGGAATTCTGAATAGCTTGTTTTACCCAGTTTGATATTCGTCCCCAGGGGATCCa < 2:149690/178‑1 (MQ=255)
aCGCGGTGTGGTCGCGGTAAATTATTAAACGCCAGGGCGACAGAGCGGGCTATCTGTTGCACGTAATCACTTCCTCATTAATCTCCTTTCAGGCAGCTCGCATACTGGTTGGCTAATTGACTCAGGAATTCTGAATAGCTTGTTTTACCCAGTTTGATATTCGTCCCCAGGGGATCCa > 1:149690/1‑178 (MQ=255)
cgcgGTGTGGTCGCGGTAAATTATTAAACGCCAGGGCGACAGAGCGGGCTATCTGTTGCACGTAATCACTTCCTCATTAATCTCCTTTCAGGCAGCTCGCATACTGGTTGGCTAATTGACTCAGGAATTCTGAATAGCTTGTTTTACCCAGTTTGATATTCGTCCCCAGGGGATCCAACGTTCCCATACGAACGGATGTCCCTCGTGCGACGCTCTCAACGACCGCTGGCCTGAACTGTGGCTCAGCAAAAACGCAGGTTGCTTTTTGCTCAACCAACTGTGTTCTTAt > 2:1742192/1‑289 (MQ=255)
ggTGTTGTGGCGGTAAATTATTAAACGCCAGGTCGACATGTCGGGCTATCTGTTGCACGTAATCACTTCCTCATTAATATCCTTTCAGGCAGCTCGCATACTGGTTGGCTAATTGACTCAGGAATTCTGAATAGCTTGTTTTACCCAGTTTGATATTCGTCCCCAGGGGATCCAACGTTCCCATACGAACGGATGTCCCTCGTGCGACGCTCTCAACGACCGCTGGCCTGAACTGTGGCTCAGCAAAAACGCAGGTTGCTTTTTGCTCAACCAACTGTGTTCTTAttt < 2:293843/288‑1 (MQ=255)
ggTGTGGTCGCGGTAAATTATTAAACGCCAGGGCGACAGAGCGGGCTATCTGTTGCACGTAATCACTTCCTCATTAATATCCTTTCAGGCAGCTCGCATACTGGTTGGCTAATTGACTCAGGAATTCTGAATAGCTTGTTTTACCCAGTTTGATATTCGTCCCCAGGGGATCCAACGTTCCCATACGAACGGATGTCCCTCGTGCGACGCTCTCAACGACCGCTGGCCTGAACTGTGGCTCAGCAAAAACGCAGGTTGCTTTTTGCTCAACCAACTGTGTTCTTATTTc > 2:47981/1‑289 (MQ=255)
gtgtgtGCGCGTTAAATGATTAAGCGCCAGGACGCCAGAGCGTGCTCTCTGTTGCAAGTAATCACTTCCTCATTAATCCCCTTTCCGGCCGCTCGCATACTGGTTGGCTAATTGACTCAGGAATTCTGAATAGCTTGTTTTACCCAGTTTGATATTCGTCCCCAGGGGTTCCAACGTCCCCATACGAACGGATGTCCCTCGTGCGACGCTCTCAACGACCGCTGGCCTGAACTGTGGCTCAGCAAAAACGCAGGTTGCTTTTTGCTCAACCAACTGTGTTCTTATTTCa < 2:1783131/289‑1 (MQ=255)
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tgtgGTCGCGGTAAATTATTAAACGCCAGGGCGACAGAGCGGGCTATCTGTTGCACGTAATCACTTCCTCATTAATCTCCTTTCAGGCAGCTCGCATACTGGTTGGCTAATTGACTCAGGAATTCTGAATAGCTTGTTTTACCCAGTTTGatat < 2:2043185/154‑1 (MQ=255)
tgtgGTCGCGGTAAATTATTAAACGCCAGGGCGACAGAGCGGGCTATCTGTTGCACGTAATCACTTCCTCATTAATCTCCTTTCAGGCAGCTCGCATACTGGTTGGCTAATTGACTCAGGAATTCTGAATAGCTTGTTTTACCCAGTTTGATATTCGTCCCCAGGGGATCCAACGTTCCCATACGAACGGATGTCCCTCGTGCGACGCTCTCAACGACCGCTGGCCTGAACTGTGGCTCAGCAAAAACGCAGGTTGCTTTTTGCTCAACCAACTGTGTTCTTATTTCAt > 2:73395/1‑289 (MQ=255)
tgtgGTCGCGGTAAATTATTAAACGCCAGGGCGACAGAGCGGGCTATCTGTTGCACGTAATCACTTCCTCATTAATCTCCTTTCAGGCAGCTCGCATACTGGTTGGCTAATTGACTCAGGAATTCTGAATAGCTTGTTTTACCCAGTTTGATATTCGTCCCCAGGGGATCCAACGTTCCCATACGAACGGATGTCCCTCGTGCGACGCTCTCAACGACCGCTGGCCTGAACTGTGGCTCAGCAAAAACGCAGGTTGCTTTTTGCTCAACCAACTGTGTTCTTATTTCAt > 1:126205/1‑289 (MQ=255)
cgcgGTAAATTATTAAACGCCAGGGCGACAGAGCGGGCTATCTGTTGCACGTAATCACTTCCTCATTAATCTCCTTTCAGGCAGCTCGCATACTGGTTGGCTAATTGACTCAGGAATTCTGAATAGCTTGTTTTACCCAGTTTGATATTCGTCCCCAGGGGATCCAACGTTCCCATACGAACGGATGTCCCTCGTGCGACGCTCTCAACGACCGCTGGCCTGAACTGTGGCTCAGCAAAAACGCAGGTTGCTTTTTGCTCAACCAACTGTGTTCTTATTTCATGTaaa < 1:1130927/288‑1 (MQ=255)
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cgGTAAATTATTAAACGCCAGGGCGACAGAGCGGGCTATCTGTTGCACGTAATCACTTCCTCATTAATCTCCTTTCAGGCAGCTCGCATACTGGTTGGCTAATTGACTCAGGAATTCTGAATAGCTTGTTTTACCCAGTTTGATATTCGTCCCCAGGGGATCCAACGTTCCCATACGAACGGa < 2:1547165/183‑1 (MQ=255)
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aaTTATTAAACGCCAGGGCGACAGAGCGGGCTATCTGTTGCACGTAATCACTTCCTCATTAATCTCCTTTCAGGCAGCTCGCATACTGGTTGGCTAATTGACTCAGGAATTCTGAATAGCTTGTTTTACCCAGTTTGATATTCGTCCCCAGGGGATCCAACGTTCCCATACGAACGGATGTCCCTCGTGCGACGCTCTCAACGACCGCTGGCCTGAAC‑‑TGGCTCAGCAAAAACGCAGGTTGCTTTTTGCTCAACCAACTGTGTTCTTATTTCATGTAAACGCTgcgcgc < 1:307887/289‑1 (MQ=255)
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aTTAATCTCCTTTCAGGCAGCTCGCATACTGGTTGGCTAATTGACTCAGGAATTCTGAATAGCTTGTTTTACCCAGTTTGATATTCGTCCCCAGGGGATCCAACGTTCCCATACGAACGGATGTCCCTCGTGCGACGCTCTCAACGACCGCTGGCCTGAACTGTGGCTCAGCAAAAACGCAGGTTGCTTTTTGCTCAACCAACTGTGTTCTTATTTCATGTAAACGCTGCGCGCCAGGTTGAATCTCAGGGTTAACGGTAAAATGACCAAGCGTTGTCAGTCCaa > 1:1636993/1‑285 (MQ=255)
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aTCTCCTTTCAGGCAGCTCGCATACTGGTTGGCTAATTGACTCAGGAATTCTGAATAGCTTGTTTTACCCAGTTTGATATTCGTCCCCAGGGGATCCAACGTTCCCATACGAACGGATGTCCCTCGTGCGACGCTCTCAACGACCGCTGGCCTGAACTGTGGCTCAGCAAAAACGCAGGTTGCTTTTTGCTCAACCAACTGTGTTCTTATTTCATGTAAACGCTGCGCGCCAGGTTGAATCTCAGGGTTAACGGTAAAATGACCAAGCGGTGTCAGTCCAAACTGtttt > 2:1851735/1‑289 (MQ=255)
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tttCAGGCAGCTCGCATACTGGTTGGCTAATTGACTCAGGAATTCTGAATAGCTTGTTTTACCCAGTTTGATATTCGTCCCCAGGGGATCCAACGTTCCCATACGAACGGATGTCCCTCGTGCGACGCTCTCAACGACCGCTGGCCTGAACTGTGGCTCAGCAAAAACGCAGGTTGCTTTTTGCTCAACCAACTGTGTTCTTATTTCATGTAAACGCTGCGCGCCAGGTTGAATCTCAGGGTTAACGGTAAAATGACCAAGCGGTGTCAGTCCAAACTGTTTTTCGaaa < 2:538018/289‑1 (MQ=255)
tttCAGGCAGCTCGCATACTGGTTGGCTAATTGACTCAGGAATTCTGAATAGCTTGTTTTACCCAGTTTGATATTCGTCCCCAGGGGATCCAACGTTCCCATACGAACGGATGTCCCTCGTGCGACGCTCTCAACGACCGCTGGCCTGAACTGTGGCTCAGCAAAAACGCAGGTTGCTTTTTGCTCAACCAACTGTGTTCTTATTTCATGTAAACGCTGCGCGCCAGGTTGAATCTCAGGGTTAACGGTAAAATGACCAAGCGGTGTCAGTCCAAACTGTTTTTCGaaa > 1:2197980/1‑289 (MQ=255)
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aTTGACTCAGGAATTCTGAATAGCTTGTTTTACCCAGTTTGATATTCGTCCCCAGGGGATCCAACGTTCCCATACGAACGGATGTCCCTCGTGCGACGCTCTCAACGACCGCTGGCCTGAACTGTGGCTCAGCAAAAACGCAGGTTGCTTTTTGCTCAACCAACTGTGTTCTTATTTCATGTAAACGCTGCGCGCCAGGTTGAATCTCAGGGTTAACGGTAAAATGACCAAGCGGTGTCAGTCCAAACTGTTTTTCGAAATAGCCGTAAGCATCGTGAAAAACGAAATa < 1:907731/289‑1 (MQ=255)
aTTGACTCAGGAATTCTGAATAGCTTGTTTTACCCAGTTTGATATTCGTCCCCAGGGGATCCAACGTTCCCATACGAACGGATGTCCCTCGTGCGACGCTCTCAACGACCGCTGGCCTGAACTGTGGCTCAGCAAAAACGCAGGTTGCTTTTTGCTCAACCAACTGTGTTCTTATTTCATGTAAACGCTGCGCGCCAGGTTGAATCCCAGGGTTAACGGTAAAATGACCAAGCGGTGTCAGTCCAAACTGTTTTTCGAAATAGCCGTAAGCATCGTGAAAAAAGAAATa > 1:2103204/1‑289 (MQ=255)
ttGACTCAGGAATTCTGAATAGCTTGTTTTACCCAGTTTGATATTCGTCCCCAGGGGATCCAACGTTCCCATACGAACGGATGTCCCTCGTGCGACGCTCTCAACGACCGCTGGCCTGAACTGTGGCTCAGCAAAAACGCAGGTTGCTTTTTGCTCAACCAACTGTGTTCTTATTTCATGTAAACGCTGCGCGCCAGGTTGAATCTCAGGGTTAACGGTAAAATGAc < 2:1464152/227‑1 (MQ=255)
cTCAGGAATTCTGAATAGCTTGTTTTACCCAGTTTGATATTCGTCCCCAGGGGATCCAACGTTCCCATACGAACGGATGTCCCTCGTGCGACGCTCTCAACGACCGCTGGCCTGAACTGTGGCTCAGCAAAAACGCAGGTTGCTTTTTGCTCAACCAACTGTGTTCTTATTTCATGTAAACGCTGCGCGCCAGGTTGAATCTCAGGGTTAACGGTAAAATGACCAAGCGGTGTCAGTCCAAACTGTTTTTCGAAATAGCCGTAAGCATCGTGAAAAACGAAATAACCtt < 1:15567/289‑1 (MQ=255)
|||
GGCTCACTGGCTTCAGGTAAGAGGCTACGAATTTCGTTCTGTTCCAGCTCAATGGTTTTGACAATTGGCGTGGCATCACGGTGATAAACATAAGGCCGCCAGACAGCGACGGCCAGAGTAAGAACGGTGAGGCTCCCCAACATAACGCGGTGTGGTCGCGGTAAATTATTAAACGCCAGGGCGACAGAGCGGGCTATCTGTTGCACGTAATCACTTCCTCATTAATCTCCTTTCAGGCAGCTCGCATACTGGTTGGCTAATTGACTCAGGAATTCACTATAGCTTGTTTTACCCAGTTTGATATTCGTCCCCAGGGGATCCAACGTTCCCATACGAACGGATGTCCCTCGTGCGACGCTCTCAACGACCGCTGGCCTGAACTGTGGCTCAGCAAAAACGCAGGTTGCTTTTTGCTCAACCAACTGTGTTCTTATTTCATGTAAACGCTGCGCGCCAGGTTGAATCTCAGGGTTAACGGTAAAATGACCAAGCGGTGTCAGTCCAAACTGTTTTTCGAAATAGCCGTAAGCATCGTGAAAAACGAAATAACCTT > CP042583/1622149‑1622701
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
GATK/CNVnator alignment
N/A
