Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A0 F0 I1 R1
|
4926 |
296.4 |
4517418 |
96.8% |
4372860 |
264.2 |
Breseq alignment
BRESEQ :: Evidence
|
| evidence |
seq id |
position |
mutation |
annotation |
gene |
description |
| RA |
CP042583 |
1,622,745 |
3 bp→TGA |
intergenic (–/–) |
– / – |
–/– |
| |
seq id |
position |
ref |
new |
freq |
score (cons/poly) |
reads |
annotation |
genes |
product |
| * | CP042583 | 1,622,745 | 0 | A | T | 99.7%
| 800.6
/ NA
| 332 | intergenic (–/–) | –/– | –/– |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (0/0); major base T (169/162); minor base G (1/0); total (170/162) |
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 |
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 |
| * | CP042583 | 1,622,746 | 0 | C | G | 99.7%
| 782.2
/ NA
| 332 | intergenic (–/–) | –/– | –/– |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (1/0); new base G (169/162); total (170/162) |
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 |
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.99e-01 |
| * | CP042583 | 1,622,747 | 0 | T | A | 99.7%
| 789.8
/ NA
| 332 | intergenic (–/–) | –/– | –/– |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (0/0); major base A (170/161); minor base G (0/1); total (170/162) |
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 4.88e-01 |
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.99e-01 |
Only 100 of 332 total aligned reads displayed.
TCCAACGTTCCCATACGAACGGATGTCCCTCGTGCGACGCTCTCAACGACCGCTGGCCTGAACTGTGGCTCAGCAAAAACGCAGGTTGCTTTTTGCTCAACCAACTGTGTTCTTATTTCATGTAAACGCTGCGCGCCAGGTTGAATCTCAGGGTTAACGGT‑‑AAAATGACCAAGCGGTGTCAGTCCAAACTGTTTTTCGAAATAGCCGTAAGCATCGTGAAAAACGAAATAACCTTTCCCCTTGAGCGGCGCGAGCTCGTTACCAACCTGCGTTTCGGTACTGGCTAATTGTGCCTCAAAATCCTTCAGGTTGGCGTCAAGTTTGGCTCGACTTTGCGGCATAAGTTCCACTAATTTTCCATGGATTGCAACCGCTGTAGCCCGCGCTATCTCTGGGGAAAGCCAAAGATGCATGTTGAAATCGCCGTGATGGTGATCTTCGTCACTTTTTTCCGCGTGGTCGTGATCATCATCATCGCCGTGAATACTTTTCATCAGTAGCGGTTTCACATCTTCAAGCTGCGCAATCGTTACCTGCTTCGCTCCTGGTAATTTGCTTAC > CP042583/1622467‑1623026
|||
aCGGATGTCCCTCGTGCGACGCTCTCAACGACCGCTGGCCTGAACTGTGGCTCAGCAAAAACGCAGGTTGCTTTTTGCTCAACCAACTGTGTTCTTATTTCATGTAAACGCTGCGCGCCAGGTTGAATCTCAGGGTTAACGGT‑‑AAAATGACCAAGCGGTGTCAGTCCAAACTGTTTTTCGAAATAGCCGTAAGCATCGTGAAAAACGAAATAACCTTTCCCCTTGAGCGGCGCGAGCTCGTTACCAACCTGCGTTTCGGTTGAGGCTAATTGTGCCTCAAAATCCTTCa > 1:1182465/1‑289 (MQ=255)
aCGGATGTCCCTCGTGCGACGCTCTCAACGACCGCTGGCCTGAACTGTGGCTCAGCAAAAACGCAGGTTGCTTTTTGCTCAACCAACTGTGTTCTTATTTCATGTAAACGCTGCGCGCCAGGTTGAATCTCAGGGTTAACGGT‑‑AAAATGACCAAGCGGTGTCAGTCCAAACTGTTTTTCGAAATAGCCGTAAGCATCGTGAAAAACGAAATAACCTTTCCCCTTGAGCGGCGCGAGCTCGTTACCAACCTGCGTTTCGGTTGAGGCTAATTGTGCCTCAAAATCCTTCa > 1:59838/1‑289 (MQ=255)
ggATGTCCCTCGTGCGACGCTCTCAACGACCGCTGGCCTGAACTGTGGCTCAGCAAAAACGCAGGTTGCTTTTTGCTCAACCAACTGTGTTCTTATTTCATGTAAACGCTGCGCGCCAGGTTGAATCTCAGGGTTAACGGT‑‑AAAATGACCAAGCGGTGTCAGTCCAAACTGTTTTTCGAAATAGCCGTAAGCATCGTGAAAAACGAAATAACCTTTCCCCTTGAGTGGCGCGAGCTCGTTACCAACCCGCGTTTCGGTTGAGGCTAAGTGTTGCGCAAAATCCTTCCgg > 2:666299/1‑289 (MQ=255)
tGTCCCTCGTGCGACGCTCTCAACGACCGCTGGCCTGAACTGTGGCTCAGCAAAAACGCAGGTTGCTTTTTGCTCAACCAACTGTGTTCTTATTTCATGTAAACGCTGCGCGCCAGGTTGAATCTCAGGGTTAACGGT‑‑AAAATGACCAAGCGGTGTCAGTCCAAACTGTTTTTCGAAATAGCCGTAAGCATCGTGAAAAACGAAATAACCTTTCCCCTTGAGCGGCGCGAGCTCGTTACCAACCTGCGTTTCGGTTGAGGCTAATTGTGCCTCAAAATCCTTCAGGTTg > 1:1304867/1‑289 (MQ=255)
gTCCCTCGTGCGACGCTCTCAACGACCGCTGGCCTGAACTGTGGCTCAGCAAAAACGCAGGTTGCTTTTTGCTCAACCAACTGTGTTCTTATTTCATGTAAACGCTGCGCGCCAGGTTGAATCTCAGGGTTAACGGT‑‑AAAATGACCAAGCGGTGTCAGTCCAAACTGTTTTTCGAAATAGCCGTAAGCATCGTGAAAAACGAAATAACCTTTCCCCTTGAGCGGCGCGAGCTCGTTACCAACCTGCGTTTCGGTTGAGGCTAATTGTGCCTCAAAATCCTTCAGGTTg > 1:890910/1‑288 (MQ=255)
gTGCGACGCTCTCAACGACCGCTGGCCTGAACTGTGGCTCAGCAAAAACGCAGGTTGCTTTTTGCTCAACCAACTGTGTTCTTATTTCATGTAAACGCTGCGCGCCAGGTTGAATCTCAGGGTTAACGGT‑‑AAAATGACCAAGCGGTGTCAGTCCAAACTGTTTTTCGAAATAGCCGTAAGCATCGTGAAAAACGAAATAACCTTTCCCCTTGAGCGGCGCGAGCTCGTTACCAACCTGCGTTTCGGTTGAGGCTAATGGTTCCTCAACATTCTTCAGGTTGGCGTCAAg > 2:1969301/1‑289 (MQ=255)
gCTCTCAACGACCGCTGGCCTGAACTGTGGCTCAGCAAAAACGCAGGTTGCTTTTTGCTCAACCAACTGTGTTCTTATTTCATGTAAACGCTGCGCGCCAGGTTGAATCTCAGGGTTAACGGT‑‑AAAATGACCAAGCGGTGTCAGTCCAAACTGTTTTTCGAAATAGCCGTAAGCATCGTGAAAAACGAAATAACCTTTCCCCTTGAGCGGCGCGAGCTCGTTACCAACCTGCGTTTCGGTTGAGGCTAATTGTGCCTCAAAATCCTTCAGGTTGGCGTCAAGTTTGGCt < 1:339392/289‑1 (MQ=255)
tcAACGACCGCTGGCCTGAACTGTGGCTCAGCAAAAACGCAGGTTGCTTTTTGCTCAACCAACTGTGTTCTTATTTCATGTAAACGCTGCGCGCCAGGTTGAATCTCAGGGTTAACGGT‑‑AAAATGACCAAGCGGTGTCAGTCCAAACTGTTTTTCGAAATAGCCGTAAGCATCGTGAAAAACGAAATAACCTTTCCCCTTGAGCGGCGCGAGCTCGTTACCAACCTGCGTTTCGGTTGAGGCTAATTGTGCCTCaaaa > 2:607294/1‑258 (MQ=255)
aCGACCGCTGGCCTGAACTGTGGCTCAGCAAAAACGCAGGTTGCTTTTTGCTCAACCAACTGTGTTCTTATTTCATGTAAACGCTGCGCGCCAGGTTGAATCTCAGGGTTAACGGTAAAAAATGACCAAGCGGTGTCAGTCCAAACTGTTTTTCGAAATAGCCGTAAGCATCGTGAAAAACGAAATAACCTTTCCCCTTGAGCGGCGCGAGCTCGTTACCAACCTGCGTTTCGGTTGAGGCTAATTGTGCCTCAAAATCCTTCAGGTTGGCGTCAAGTTTGGCTCGACt > 1:711313/1‑289 (MQ=255)
ccGCTGGCCTGAACTGTGGCTCAGCAAAAACGCAGGTTGCTTTTTGCTCAACCAACTGTGTTCTTATTTCATGTAAACGCTGCGCGCCAGGTTGAATCTCAGGGTTAACGGT‑‑AAAATGACCAAGCGGTGTCAGTCCAAACTGTTTTTCGAAATAGCCGTAAGCATCGTGAAAAACGAAATAACCTTTCCCCTTGAGCGGCGCGAGCTCGTTACCAACCTGCGTTTCGGTTGAGGCTAATtgtg < 1:678536/243‑1 (MQ=255)
ccGCTGGCCTGAACTGTGGCTCAGCAAAAACGCAGGTTGCTTTTTGCTCAACCAACTGTGTTCTTATTTCATGTAAACGCTGCGCGCCAGGTTGAATCTCAGGGTTAACGGT‑‑AAAATGACCAAGCGGTGTCAGTCCAAACTGTTTTTCGAAATAGCCGTAAGCATCGTGAAAAACGAAATAACCTTTCCCCTTGAGCGGCGCGAGCTCGTTACCAACCTGCGTTTCGGTTGAGGCTAATTGTGCCTCAAAATCCTTCAGGTTGGCGTCAAGTTTGGCTCGACTTTTCg > 2:1233823/1‑288 (MQ=255)
cGCTGGCCTGAACTGTGGCTCAGCAAAAACGCAGGTTGCTTTTTGCTCAACCAACTGTGTTCTTATTTCATGTAAACGCTGCGCGCCAGGTTGAATCTCAGGGTTAACGGT‑‑AAAATGACCAAGCGGTGTCAGTCCAAACTGTTTTTCGAAATAGCCGTAAGCATCGTGAAAAACGAAATAACCTTTCCCCTTGAGCGGCGCGAGCTCGTTACCAACCTGCGTTTCGGTTGAGGCTAATTGTGCCTCAAAATCCTTCAGGtt < 2:1655810/261‑1 (MQ=255)
cTGGCCTGAACTGTGGCTCAGCAAAAACGCAGGTTGCTTTTTGCTCAACCAACTGTGTTCTTATTTCATGTAAACGCTGCGCGCCAGGTTGAATCTCAGGGTTAACGGT‑‑AAAATGACCAAGCGGTGTCAGTCCAAACTGTTTTTCGAAATAGCCGTAAGCATCGTGAAAAACGAAATAACCTTTCCCCTTGAGCGGCGCGAGCTCGTTACCAACCTGCGTTTCGGTTGAGGCTAATTGTGCCTCAAAATCCTTCAGGTTGGCGTCAAGTTTGGCTCGACTTTGCGGCAt > 1:1489603/1‑289 (MQ=255)
tgGCTCAGCAAAAACGCAGGTTGCTTTTTGCTCAACCAACTGTGTTCTTATTTCATGTAAACGCTGCGCGCCAGGTTGAATCTCAGGGTTAACGGT‑‑AAAATGACCAAGCGGTGTCAGTCCAAACTGTTTTTCGAAATAGCCGTAAGCATCGTGAAAAACGAAATAACCTTTCCCCTTGAGCGACGTGAGCTCGTTACCAACCTGCGTTTCGGTTGAGGCTAATTGTGCCTCAAACTCCTTCAGGTTGGCGTCCAGTTTGGCTCCACTTTTCGGCATAAGTTCCACTAAt > 1:1634633/1‑289 (MQ=255)
tgGCTCAGCAAAAACGCAGGTTGCTTTTTGCTCAACCAACTGTGTTCTTATTTCATGTAAACGCTGCGCGCCAGGTTGAATCTCAGGGTTAACGGT‑‑AAAATGACCAAGCGGTGTCAGTCCAAACTGATTTTCGAAATAGCCGTAAGCATCGTGAAAAACGAAATAACCTTTCCCCTTGAGCGGCGCGAGCTCGGTACCAACCTGCGTTTCGGTTGATGCTAATTGTGCCTCAAAATGCTTCAGGTTGTCTTCAAGGTTGGTTCGATCTTGACGCGTAACTTTCATTAAt > 2:2139913/1‑289 (MQ=255)
ggCTCAGCAAAAACGCAGGTTGCTTTTTGCTCAACCAACTGTGTTCTTATTTCATGTAAACGCTGCGCGCCAGGTTGAATCTCAGGGTTAACGGT‑‑AAAATGACCAAGCGGTGTCAGTCCAAACTGTTTTTCGAAATAGCCGTAAGCATCGTGAAAAACGAAATAACCTTTCCCCTTGAGCGGCGCGAGCTCGTTACCAACCTGCGTTTCGGTTGAGGCTAATTGTGCCTCAAAATCCTTCAGGTTGGCGTCAAGTTTGGCTCGACTTTg < 2:953575/269‑1 (MQ=255)
cAGCAAAAACGCAGGTTGCTTTTTGCTCAACCAACTGTGTTCTTATTTCATGTAAACGCTGCGCGCCAGGTTGAATCTCAGGGTTAACGGT‑‑AAAATGACCAAGCGGTGTCAGTCCAAACTGTTTTTCGAAATAGCCGTAAGCATCGTGAAAAACGAAATAACCTTTCCCCTTGAGCGGCGCGAGCTCGTTACCAACCTGCGTTTCGGTTGAGGCTAATTGTGCCTCAAAATCCTTCAGGTTGGCGTCAAGTTTGGCTCGACTTTGCGGCATAAGTTCCACTAATTTTc > 2:258686/1‑288 (MQ=255)
cAGCAAAAACGCAGGTTGCTTTTTGCTCAACCAACTGTGTTCTTATTTCATGTAAACGCTGCGCGCCAGGTTGAATCTCAGGGTTAACGGT‑‑AAAATGACCAAGCGGTGTCAGTCCAAACTGTTTTTCGAAATAGCCGTAAGCATCGTGAAAAACGAAATAACCTTTCCCCTTGAGCGGCGCGAGCTCGTTACCAACCTGCGTTTCGGTTGAGGCTAATTGTGCCTCAAAATACTTCAGGTTGGCGTCAATTTTGGCTCGACTTTGCGGCCTAAGTCCCACTAATTTTcc > 2:1405679/1‑289 (MQ=255)
aaaaaCGCAGGTTGCTTTTTGCTCAACCAACTGTGTTCTTATTTCATGTAAACGCTGCGCGCCAGGTTGAATCTCAGGGTTAACGGT‑‑AAAATGACCAAGCGGTGTCAGTCCAAACTGTTTTTCGAAATAGCCGTAAGCATCGTGAAAAACGAAATAACCTTTCCCCTTGAGCGGCGCGAGCTCGTTACCAACCTGCGTTTCGGTTGAGGCTAATTGTGCCTCAAAATCCTTCAGGTTGGCGTCAAGTTTGGCTCGACTTTGCGGCATAAGTTCCACTAATTTTCCa < 1:1410036/286‑1 (MQ=255)
aaaaaCGCAGGTTGCTTTTTGCTCAACCAACTGTGTTCTTATTTCATGTAAACGCTGCGCGCCAGGTTGAATCTCAGGGTTAACGGT‑‑AAAATGACCAAGCGGTGTCAGTCCAAACTGTTTTTCGAAATAGCCGTAAGCATCGTGAAAAACGAAATAACCTTTCCCCTTGAGCGGCGCGAGCTCGTTACCAACCTGCGTTTCGGTTGAGGCTAATTGTGCCTCAAAATCCTTCAGGTTGGCGTCAAGTTTGGCTCGACTTTGCGGCATAAGTTCCACTAATTTTCCa < 1:2127632/286‑1 (MQ=255)
aaaaaCGCAGGTTGCTTTTTGCTCAACCAACTGTGTTCTTATTTCATGTAAACGCTGCGCGCCAGGTTGAATCTCAGGGTTAACGGT‑‑AAAATGACCAAGCGGTGTCAGTCCAAACTGTTTTTCGAAATAGCCGTAAGCATCGTGAAAAACGAAATAACCTTTCCCCTTGAGCGGCGCGAGCTCGTTACCAACCTGCGTTTCGGTTGAGGCTAATTGTGCCTCAAAATCCTTCAGGTTGGCGTCAAGTTTGGCTCGACTTTGCGGCATAAGTTCCACTAATTTTCCa < 1:252602/286‑1 (MQ=255)
cGCAGGTTGCTTTTTGCTCAACCAACTGTGTTCTTATTTCATGTAAACGCTGCGCGCCAGGTTGAATCTCAGGGTTAACGGT‑‑AAAATGACCAAGCGGTGTCAGTCCAAACTGTTTTTCGAAATAGCCGTAAGCATCGTGAAAAACGAAATAACCTTTCCCCTTGAGCGGCGCGAGCTCGTTACCAACCTGCGTTTCGGTTGAGGCTAATTGTGCCTCAAAATCCTTCAGGTTGGCGTCAAGTTTGGCTCGACTTTGCGGCATAAGTTCCACTAATTTTCCATGGATTGc < 1:1336706/289‑1 (MQ=255)
acggtGCTTTTTGCGCAACCAACTGTCGTCTTATATGAGATAAACGCTGCGCGCCAGGTTGAATCTCAGGGTTAACGGT‑‑AAAATGACCAAGCGGGGTCAGTCCAAACTGTTTTTCGAAATAGCCGTAAGCATCGTGAAAAACGAAATAACCTTTCCCCTTGAGCGGCGCGAGCTCGTTACCAACCTGCGTTTCGGTTGAGGCTAATTGTGCCTCAAAATCCTTCAGGTTGGCGTCAAGTTTGGCTCGACTTTGCGGCATAAGTTCCACTAATTTTCCATGGATTGCaa < 2:1317028/284‑1 (MQ=255)
aGGTTGTTTTTTGCTTAACCAACTGTGTTCTATTTTCATGGAACCGCTGCGAGCCAGGTTGAATCTCAGGGTTAACGGT‑‑AAAATGACCAAGCGGTGTCAGTCCAAACTGTTTTTCGAAATAGCCGTAAGCATCGTGAAAAACGAAATAACCTTTCCCCTTGAGCGGCGCGAGCTCGTTACCAACCTGCGTTTCGGTTGAGGCTAATTGTGCCTCAAAATCCTTCAGGTTGGCGTCAAGTTTGGCTCGACTTTGCGGCATAAGTTCCACTAATTTTCCATGGATTGCaa < 2:1490464/288‑1 (MQ=255)
ggTTGCTTTTTGCTCAACCAACTGTGTTCTTATTTCATGTAAACGCTGCGCGCCAGGTTGAATCTCAGGGTTAACGGT‑‑AAAATGACCAAGCGGTGTCAGTCCAAACTGTTTTTCGAAATAGCCGTAAGCATCGTGAAAAACGAAATAACCTTTCCCCTTGAGCGGCGCGAGCTCGTTACCAACCTGCGTTTCGGTTGAGGCTAATTGTGCCTCAAAATCCTTCAGGTTGGCGTCAAGTTTGGCTCGACTTTGCGGCATAAGTTCCACTAATTTTCCATGGATTGCAAc > 2:1544650/1‑288 (MQ=255)
ttGCTTAACCAACTGTGTTCTTATTTCATGTAAACGCTGCGCGCCAGGTTGAATCTCAGGGTTAACGGT‑‑AAAATGACCAAGCGGTGTCAGTCCAAACTGTTTTTCGAAATAGCCGTAAGCATCGTGAAAAACGAAATAACCTTTCCCCTTGAGCGGCGCGAGCTCGTTACCAACCTGCGTTTCGGTTGAGGCTAATTGTGCCTCAAAATCCTTCAGGTTGGCGTCAAGTTTGGCTCGACTTTGCGGCATAAGTTCCACTAATTTTCCATGGATTGCAACCGCTGTAGcc < 2:918629/289‑1 (MQ=255)
ttGCTCAACCAACTGTGTACTTATTTCATGTAAACGCTGCGCGCCAGGTTGAATCTCAGGGTTAACGGT‑‑AAAATGACCAAGCGGTGTCAGTCCAAACTGTTTTTCGAAATAGCCGTAAGCATCGTGAAAAACGAAATAACCTTTCCCCTTGAGCGGCGCGAGCTCGTTACCAACCTGCGTTTCGGTTGAGGCTAATTGTGCCTCAAAATCCTTCAGGTTGGCGTCAAGTTTGGCTCGACTTTGCGGCATAAGTTCCACTAATTTTCCATGGATTGCAACCGCTGTAGcc < 1:833115/289‑1 (MQ=255)
tCAACCAACTGTGTTCTTATTTCATGTAAACGCTGCGCGCCAGGTTGAATCTCAGGGTTAACGGT‑‑AAAATGACCAAGCGGTGTCAGTCCAAACTGTTTTTCGAAATAGCCGTAAGCATCGTGAAAAACGAAATAACCTTTCCCCTTGAGCGGCGCGAGCTCGTTACCAACCTGCGTTTCGGTTGAGGCTAATTGTGCCTCAAAATCCTTCAGGTTGGCGTCAAGTTTGGCTCGACTTTGCGGCATAAGTTCCACTAATTTTCCATGGATTGCAACCGCTGTAGCCcgcg < 2:1672942/289‑1 (MQ=255)
caaccaacTGTGTTCTTATTTCATGTAAACGCTGCGCGCCAGGTTGAATCTCAGGGTTAACGGT‑‑AAAATGACCAAGCGGTGTCAGTCCAAACTGTTTTTCGAAATAGCCGTAAGCATCGTGAAAAACGAAATAACCTTTCCCCTTGAGCGGCGCGAGCTCGTTACCAACCTGCGTTTCGGTTGAGGCTAATTGTGCCTCAAAATCCTTCAGGTTGGCGTCAAGTTTGGCTCGACTTTGCGGCATAAGTTCCACTAATTTTCCATGGATTGCAACCGCTGTAGCCCgcgc < 2:1738603/289‑1 (MQ=255)
aacTGTGTTCTTATTTCATGTAAACGCTGCGCGCCAGGTTGAATCTCAGGGTTAACGGT‑‑AAAATGACCAAGCGGTGTCAGTCCAAACTGTTTTTCGAAATAGCCGTAAGCATCGTGAAAAACGAAATAACCTTTCCCCTTGAGCGGCGCGAGCTCGTTACCAACCTGCGTTTCGGTTGAGGCTAATTGTGCCTCAAAATCCTTCAGGTTGGCGTCAAGTTTGGCTCGACTTTGCGGCATAAGTTCCACTAATTTTCCATGGATTGCAACCGCTGTAGCCCGCGCTAtct < 2:8210/289‑1 (MQ=255)
acTGTGTTCTTATTTCATGTAAACGCTGCGCGCCAGGTTGAATCTCAGGGTTAACGGT‑‑AAAATGACCAAGCGGTGTCAGTCCAAACTGTTTTTCGAAATAGCCGTAAGCATCGTGAAAAACGAAATAACCTTTCCCCTTGAGCGGCGCGAGCTCGTTACCAACCTGCGTTTCGGTTGAGGCTAATTGTGCCTCAAAATCCTTCAGGTTGGCGTCAAGTTTGGCTCGACTTTGCGGCATAAGTTCCACTAATTTTCCATGGATTGCAACCGCTGTAGcc > 1:222156/1‑278 (MQ=255)
tCTTATTTCATGGAAACGCTGCGCGCAAGGTTGAATCTCAGGGTTAACGGT‑‑AAAATGACCAAGCGGTGTCAGTCCAAACTGTTTTTCGAAATAGCCGTAAGCATCGTGAAAAACGAAATAACCTTTCCCCTTGAGCGGCGCGAGCTCGTTACCAACCTGCGTTTCGGTTGAGGCTAATTGTGCCTCAAAATCCTTCAGGTTGGCGTCAAGTTTGGCTCGACTTTGCGGCATAAGTTCCACTAATTTTCCATGGATTGCAACCGCTGTAGCCCGCGCTATCTCTGGGGaa < 2:1699782/289‑1 (MQ=255)
ttATTTCATGTAAACGCTGCGCGCCAGGTTGAATCTCAGGGTTAACGGT‑‑AAAATGACCAAGCGGTGTCAGTCCAAACTGTTTTTCGAAATAGCCGTAAGCATCGTGAAAAACGAAATAACCTTTCCCCTTGAGCGGCGCGAGCTCGTTACCAACCTGCGTTTCGGTTGAGGCTAATTGTGCCTCAAAATCCTTCAGGTTGGCGTCAAGTTTGGCTCGACTTTGCGGCATAAGTTCCACTAATTTTCCATGGATTGCAACCGCTGTAGCCCGCGCTATCTCTGGGGaaa > 1:137937/1‑288 (MQ=255)
aTGTAAACGCTGCGCGCCAGGTTGAATCTCAGGGTTAACGGT‑‑AAAATGACCAAGCGGTGTCAGTCCAAACTGTTTTTCGAAATAGCCGTAAGCATCGTGAAAAACGAAATAACCTTTCCCCTTGAGCGGCGCGAGCTCGTTACCAACCTGCGTTTCGGTTGAGGCTAATTGTGCCTCAAAATCCTTCAGGTTGGCGTCAAGTTTGGCTCGACTTTGCGGCATAAGTTCCACTAATTTTCCATGGATTGCAACCGCTGTAACACGCGCTATCCCTGGGGAAAGCCAAAGa > 2:1580943/1‑289 (MQ=255)
gTAAACGCTGCGCGCCAGGTTGAATCTCAGGGTTAACGGT‑‑AAAATGACCAAGCGGTGTCAGTCCAAACTGTTTTTCGAAATAGCCGTAAGCATCGTGAAAAACGAAATAACCTTTCCCCTTGAGCGGCGCGAGCTCGTTACCAACCTGCGTTTCGGTTGAGGCTAATTGTGCCTCAAAATCCTTCAGGTTGGCGTCAAGTTTGGCTCGACTTTGCGGCATAAGTTCCACTAATTTTCCATGGATTGCAACCGCTGTAGCCCGCGCTATCTCTGGGGAAAGCCAAAGATg < 1:446392/289‑1 (MQ=255)
gTAAACGCTGCGCGCCAGGTTGAATCTCAGGGTTAACGGT‑‑AAAATGACCAAGCGGTGTCAGTCCAAACTGTTTTTCGAAATAGCCGTAAGCATCGTGAAAAACGAAATAACCTTTCCCCTTGAGCGGCGCGAGCTCGTTACCAACCTGCGTTTCGGTTGAGGCTAATTGTGCCTCAAAATCCTTCAGGTTGGCGTCAAGTTTGGCTCGACTTTGCGGCATAAGTTCCACTAATTTTCCATGGATTGCAACCGCTGTAGCCCGCGCTATCTCTGGGGAAAGCCAAAGATg < 1:1851735/289‑1 (MQ=255)
aaCGCTGCGCGCCAGGTTGAATCTCAGGGTTAACGGT‑‑AAAATGACCAAGCGGTGTCAGTCCAAACTGTTTTTCGAAATAGCCGTAAGCATCGTGAAAAACGAAATAACCTTTCCCCTTGAGCGGCGCGAGCTCGTTACCAACCTGCGTTTCGGTTGAGGCTAATTGTGCCTCAAAATCCTTCAGGTTGGCGTCAAGTTTGGCTCGACTTTGCGGCATAAGTTCCACTAATTTTCCATGGATTGCAACCGCTGTAGCCCGCGCTATCTCTGGGGAAAGCCAAAGATGc > 1:1433698/1‑287 (MQ=255)
gcgcgcCAGGTTGAATCTCAGGGTTAACGGT‑‑AAAATGACCAAGCGGTGTCAGTCCAAACTGTTTTTCGAAATAGCCGTAAGCATCGTGAAAAACGAAATAACCTTTCCCCTTGAGCGGCGCGAGCTCGTTACCAACCTGCGTTTCGGTTGAGGCTAATTGTGCCTCAAAATCCTTCAGGTTGGCGTCAAGTTTGGCTCGACTTTGCGGCATAAGTTCCACTAATTTTCCATGGATTGCAACCGCTGTAGCCCGCGCTATCTCTGGGGAAAGCCAAAGATGCATGTTGaa > 2:1292154/1‑289 (MQ=255)
cgcgcCAGGTTGAATCTCAGGGTTAACGGT‑‑AAAATGACCAAGCGGTGTCAGTCCAAACTGTTTTTCGAAATAGCCGTAAGCATCGTGAAAAACGAAATAACCTTTCCCCTTGAGCGGCGCGAGCTCGTTACCAACCTGCGTTTCGGTTGAGGCTAATTGTGCCTCAAAATCCTTCAGGTTGGCGTCAAGTTTGGCTCGACTTTGCGGCATAAGTTCCACTAATTTTCCATGGATTGCAACCGCTGTAGCCCGCGCTATCTCTGGGGAAAGCCAAAGATGCATGTTGaaa > 1:585778/1‑289 (MQ=255)
cAGGTTGAATCTCAGGGTTAACGGT‑‑AAAATGACCAAGCGGTGTCAGTCCAAACTGTTTTTCGAAATAGCCGTAAGCATCGTGAAAAACGAAATAACCTTTCCCCTTGAGCGGCGCGAGCTCGTTACCAACCTGCGTTTCGGTTGAGGCTAATTGTGCCTCAAAATCCTTCAGGTTGGCGTCAAGTTTGGCTCGACTTTGCGGCATAAGTTCCACTAATTTTCCATGGATTGCAACCGCTGTAGCCCGCGCTATCTCTGGGGAAAGCCAAAGATGCATGTTGAAATCGcc < 2:1709872/289‑1 (MQ=255)
ggTTGAATCTCAGGGTTAACGGT‑‑AAAATGACCAAGCGGTGTCAGTCCAAACTGTTTTTCGAAATAGCCGTAAGCATCGTGAAAAACGAAATAACCTTTCCCCTTGAGCGGCGCGAGCTCGTTACCAACCTGCGTTTCGGTTGAGGCTAATTGTGCCTCAAAATCCTTCAGGTTGGCGTCAAGTTTGGCTCGACTTTGCGGCATAAGTTCCACTAATTTTCCATGGATTGCAACCGCTGTAGCCCgcgc < 1:1837148/248‑1 (MQ=255)
aaTCTCAGGGTTAACGGT‑‑AAAATGACCAAGCGGTGTCAGTCCAAACTGTTTTTCGAAATAGCCGTAAGCATCGTGAAAAACGAAATAACCTTTCCCCTTGAGCGGCGCGAGCTCGTTACCAACCTGCGTTTCGGTTGAGGCTAATTGTGCCTCAAAATCCTTCAGGTTGGCGTCAAGTTTGGCTCGACTTTGCGGCATAAGTTCCACTAATTTTCCATGGATTGCAACCGCTGTAGCCCGCGCTATCTCTGGGGAAAGCCAAAGATGCATGTTGAAATCGCCGTGATgg > 2:465098/1‑289 (MQ=255)
cAGGGTTAACGGT‑‑AAAATGACCAAGCGGTGTCAGTCCAAACTGTTTTTCGAAATAGCCGTAAGCATCGTGAAAAACGAAATAACCTTTCCCCTTGAGCGGCGCGAGCTCGTTACCAACCTGCGTTTCGGTTGAGGCTAATTGTGCCTCAAAATCCTTCAGGTTGGCGTCAAGTTTGGCTCGACTTTGCGGCATAAGTTCCACTAATTTTCCATGGATTGCAACCGCTGTAGCCCGCGCTATCTCTGGGGAAAGCCAAAGATGCATGTTGAAATCGCCGTGATGGTGa > 1:2175899/1‑287 (MQ=255)
aGGGTTAACGGT‑‑AAAATGACCAAGCGGTGTCAGTCCAAACTGTTTTTCGAAATAGCCGTAAGCATCGTGAAAAACGAAATAACCTTTCCCCTTGAGCGGCGCGAGCTCGTTACCAACCTGCGTTTCGGTTGAGGCTAATTGTGCCTCAAAATCCTTCAGGTTGGCGTCAAGTTTGGCTCGACTTTGCGGCATAAGTTCCACTAATTTTCCATGGATTGCAACCGCTGTAGCCCGCGCTATCTCTGGGGaa > 2:562026/1‑250 (MQ=255)
ttAACGGT‑‑AAAATGACCAAGCGGTGTCAGTCCAAACTGTTTTTCGAAATAGCCGTAAGCATCGTGAAAAACGAAATAACCTTTCCCCTTGAGCGGCGCGAGCTCGTTACCAACCTGCGTTTCGGTTGAGGCTAATTGTGCCTCAAAATCCTTCAGGTTGGCGTCAAGTTTGGCTCGACTTTGCGGCATAAGTTCCACTACTTTGCCATGGATTGCAACCGCTGTCGCCCGCGCTTTCTCTGGGGAAGCCCAAAGTGGCATTTTGAAATCGCCGTGATggcggacgtct > 2:410699/1‑279 (MQ=255)
aaCGGT‑‑AAAATGACCAAGCGGTGTCAGTCCAAACTGTTTTTCGAAATAGCCGTAAGCATCGTGAAAAACGAAATAACCTTTCCCCTTGAGCGGCGCGAGCTCGTTACCAACCTGCGTTTCGGTTGAGGCTAATTGTGCCTCAAAATCCTTCAGGTTGGCGTCAAGTTTGGCTCGACTTTGCGGCATAAGTTCCACTAATTTTCCATGGATTGCAACCGCTGTAGCCCGCGCTATCTCTGGGGAAAGCCAAAGATGCATGTTGAAATCGCCGTGATGGTGATCTTCGTc > 1:1216327/1‑288 (MQ=255)
aaCGGT‑‑AAAATGACCAAGCGGTGTCAGTCCAAACTGTTTTTCGAAATAGCCGTAAGCATCGTGAAAAACGAAATAACCTTTCCCCTTGAGCGGCGCGAGCTCGTTACCAACCTGCGTTTCGGTTGAGGCTAATTGTGCCTCAAAATCCTTCAGGTTGGCGTCAAGTTTGGCTCGACTTTGCGGCATAAGTTCCACTAATTTTCCATGGATTGCAACCGCTGTAGCCCGCGCTATCTCTGGGGAAAGCCAAAGATGCATGTTGAAATCGCCGTGATGGTGATCTTCGTc > 2:310355/1‑288 (MQ=255)
aCGGT‑‑AAAATGACCAAGCGGTGTCAGTCCAAACTGTTTTTCGAAATAGCCGTAAGCATCGTGAAAAACGAAATAACCTTTCCCCTTGAGCGGCGCGAGCTCGTTACCAACCTGCGTTTCGGTTGAGGCTAATTGTGCCTCAAAATCCTTCAGGTTGGCGTCAAGTTTGGCTCGACTTTGCGGCATAAGTTCCACTAATTTTcc > 2:1027089/1‑203 (MQ=255)
aaaaTGACCAAGCGGTGTCAGTCCAAACTGTTTTTCGAAATAGCCGTAAGCATCGTGAAAAACGAAATAACCTTTCCCCTTGAGCGGCGCGAGCTCGTTACCAACCTGCGTTTCGGTTGAGGCTAATTGTGCCTCAAAATCCTTCAGGTTGGCGTCAAGTTTGGCTCGACTTTGCGGCATATGTTACCCTAATCTTCCATGGATTGCAACCGCTGTAGCACGCGCTACACCTGGTGAAGTCCAAAGATGTATGTTGCAATCGCGTTGTGGGTGTTCTTATGCACttttt > 2:2199242/1‑289 (MQ=255)
aaaaTGACCAAGCGGTGTCAGTCCAAACTGTTTTTCGAAATAGCCGTAAGCATCGTGAAAAACGAAATAACCTTTCCCCTTGAGCGGCGCGAGCTCGTTACCAACCTGCGTTTCGGTTGAGGCTAATTGTGCCTCAAAATCCTTCAGGTTGGCGTCAAGTTTGGCTCGACTTTGCGGCATAAGTTCCACTAATTTTCCATGGATTGCAACCGCTGTAGCCCGCGCTATCTCTGGGGAAAGCCAAAGAt < 2:1074974/248‑1 (MQ=255)
aaaaTGACCAAGCGGTGTCAGTCCAAACTGTTTTTCGAAATAGCCGTAAGCATCGTGAAAAACGAAATAACCTTTCCCCTTGAGCGGCGCGAGCTCGTTACCAACCTGCGTTTCGGTTGAGGCTAATTGTGCCTCAAAATCCTTCAGGTTGGCGTCAAGTTTGGCTCGACTTTGCGGCATAAGTTCCACTAATTTTCCATGGATTGCAACCGCTGTAGCCCGCGCTATCTCTGGGGAAAGCCAAAGAt > 1:1074974/1‑248 (MQ=255)
aaaaTGACCAAGCGGTGTCAGTCCAAACTGTTTTTCGAAATAGCCGTAAGCATCGTGAAAAACGAAATAACCTTTCCCCTTGAGCGGCGCGAGCTCGTTACCAACCTGCGTTTCGGTTGAGGCTAATTGTGCCTCAAAATCCTTCAGGTTGGCGTCAAGTTTGGCTCGACTTTGCGGCATAAGTTCCACTAATTTTCCATGGATTGCAACCGCTGTAGCCCGCGCTATCTCTGGGGAAAGCCAAAGATGCATGTTGAAATCGCCGTGATGGTGATCTTCGTCCCttttt > 1:1262249/1‑289 (MQ=255)
aaaTGACCAAGCGGTGTCAGTCCAAACTGTTTTTCGAAATAGCCGTAAGCATCGTGAAAAACGAAATAACCTTTCCCCTTGAGCGGCGCGAGCTCGTTACCAACCTGCGTTTCGGTTGAGGCTAATTGTGCCTCAAAATCCTTCAGGTTGGCGTCAAGTTTGGCTCGACTTTGCGGCATAAGTTCCACTAATTTTCCATGGATTGCAACCGCTGTAGCCCgcgc > 2:1914062/1‑224 (MQ=255)
aaaTGACCAAGCGGTGTCAGTCCAAACTGTTTTTCGAAATAGCCGTAAGCATCGTGAAAAACGAAATAACCTTTCCCCTTGAGCGGCGCGAGCTCGTTACCAACCTGCGTTTCGGTTGAGGCTAATTGTGCCTCAAAATCCTTCAGGTTGGCGTCAAGTTTGGCTCGACTTTGCGGCATAAGTTCCACTAATTTTCCATGGATTGCAACCGCTGTAGCCCGCGCTATCTCTGGGGAAAGCCAAAGATGCATGTTGAAATCGCCGTGATGGTGATCTTCGTCACtttttt > 2:770235/1‑289 (MQ=255)
aCCAAGCGGTGTCAGTCCAAACTGTTTTTCGAAATAGCCGTAAGCATCGTGAAAAACGAAATAACCTTTCCCCTTGAGCGGCGCGAGCTCGTTACCAACCTGCGTTTCGGTTGAGGCTAATTGTGCCTCAAAATCCTTCAGGTTGGCGTCAAGTTTGGCTCGACTTTGCGGCATAAGTTCCACTAATTTTCCATGGATTGCAACCGCTGTAGc < 1:963831/213‑1 (MQ=255)
aCCAAGCGGTGTCAGTCCAAACTGTTTTTCGAAATAGCCGTAAGCATCGTGAAAAACGAAATAACCTTTCCCCTTGAGCGGCGCGAGCTCGTTACCAACCTGCGTTTCGGTTGAGGCTAATTGTGCCTCAAAATCCTTCAGGTTGGCGTCAAGTTTGGCTCGACTTTGCGGCATAAGTTCCACTAATTTTCCATGGATTGCAACCGCTGTAGCCCGCGCTATCTCTGGGGAAAGCCAAAGATGCATGTTGAAATCGc < 1:1689759/257‑1 (MQ=255)
ccagtcGGTGTCAGTCCAAACTGGTTTTCGACATAGCCGTAAGCATCGTGAAAAACGAAATAACCTTTCCCCTTGAGCGGCGCGGGCTCGTTACCAACCTGCGTTTCGGTTGAGGCTAATTGTGCCTCAAAATCCTTCAGGTTGGCGTCAAGTTTGGCTCGACTTTGCGGCATAAGTTCCACTAATTTTCCATGGATTGCAACCGCTGTAGCCCGCGCTATCTCTGGGGAAAGCCAAAGATGCATGTTGAAATCGCCGTGATGGTGATCTTCGTCACTTTTTTCcgcg < 2:205988/283‑1 (MQ=255)
ccAAGCGGTGTCAGTCCAAACTGTTTTTCGAAATAGCCGTAAGCATCGTGAAAAACGAAATAACCTTTCCCCTTGAGCGGCGCGAGCTCGTTACCAACCTGCGTTTCGGTTGAGGCTAATTGTGCCTCAAAATCCTTCAGGTTGGCGTCAAGTTTGGCTCGACTTTGCGGCATAAGTTCCACTAATTTTCCATGGATTGCAACCGCTGTAGCCCGCGCTATCTCTGGGGAAAGCCAAAGATGCATGTTGAAATCGCCGTGATGGTGATCTTCGTCACTTTTTTCcgcg < 2:391008/288‑1 (MQ=255)
ccAAGCGGTGTCAGTCCAAACTGTTTTTCGAAATAGCCGTAAGCATCGTGAAAAACGAAATAACCTTTCCCCTTGAGCGGCGCGAGCTCGTTACCAACCTGCGTTTCGGTTGAGGCTAATTGTGCCTCAAAATCCTTCAGGTTGGCGTCAAGTTTGGCTCGACTTTGCGGCATAAGTTCCACTAATTTTCCATGGATTGCAACCGCTGTAGCCCGCGCTATCTCTGGGGAAAGCCAAAGATGCATGTTGAAATCGCCGTGATGGTGATCTTCGTCACTTTTTTCcgcg > 2:523013/1‑288 (MQ=255)
aGCGGTGTCAGTCCAAACTGTTTTTCGAAATAGCCGTAAGCATCGTGAAAAACGAAATAACCTTTCCCCTTGAGCGGCGCGAGCTCGTTACCAACCTGCGTTTCGGTTGAGGCTAATTGTGCCTCAAAATCCTTCAGGTTGGCGTCAAGTTTGGCTCGACTTTGCGGCATAAGTTCCACTAATTTTCCATGGATTGCAACCGCTGTAGCCCGCGCTATCTCTGGGGAAAGCCAAAGATGCATGTTGAAATCGCCGTGATGGTGATCTTCGTCACTTTTTTCCGCGTGGt < 1:310355/289‑1 (MQ=255)
ggggtCAGTCCAAACTGTTTTTCGAAGTAGCCGTAAGAATGCGGAAAAACGAAATAGCCTGTCCCCTTGAGCGGCGGGAGCTCGTTACCAACCTGCGTTTCGGTTGAGGCTAATTGTGCCTCAAAATCCTTCAGGTTGGCGTCAAGTTTGGCTCGACTTTGCGGCATAAGTTCCACTAATTTTCCATGGATTGCAACCGCTGTAGCCCGCGCTATCTCTGGGGAAAGCCAAAGATGCATGTTGAAATCGCCGTGATGGTGATCTTCGTCACTTTTTTCCGCGTGGTCg < 2:2157806/285‑1 (MQ=255)
ggTGTCAGTCCAAACTGTTTTTCGAAATAGCCGTAAGCATCGTGAAAAACGAAATAACCTTTCCCCTTGAGCGGCGCGAGCTCGTTACCAACCTGCGTTTCGGTTGAGGCTAATTGTGCCTCAAAATCCTTCAGGTTGGCGTCAAGTTTGGCTCGACTTTGCGGCATAAGTTCCACTAATTTTCCATGGATTGCAACCGCTGTAGCCCGCGCTATCTCTgggg > 1:784856/1‑223 (MQ=255)
tgtCAGTCCAAACTGTTTTTCGAAATAGCCGTAAGCATCGTGAAAAACGAAATAACCTTTCCCCTTGAGCGGCGCGAGCTCGTTACCAACCTGCGTTTCGGTTGAGGCTAATTGTGCCTCAAAATCCTTCAGGTTGGCGTCAAGTTTGGCTCGACTTTGCGGCATAAGTTCCACTAATTTTCCATGGATTGc > 1:1037900/1‑192 (MQ=255)
tggcAGTCCAAACGGTTTTTCGAAATGGCCGTAAGCATCGTGAAAAACGAAATAACCTTTCCACTTGAGCGGCGCGAGCGCGTTACCAACCTGCGTTTCGGTTGAGGCTAATTGTGCCTCAAAATCCTTCAGGTTGGCGTCAAGTTTGGCTCGACTTTGCGGCATAAGTTCCACTAATTTTCCATGGATTGCAACCGCTGTAGCCCGCGCTATCTCTGGGGAAAGCCAAAGATGCATGTTGAAATCGCCGTGATGGTGATCTTCGTCACTTTTTTCCGCGTGGTCGTg < 2:2103204/285‑1 (MQ=255)
tCCAAACTGTTTTTCGAAATAGCCGTAAGCATCGTGAAAAACGAAATAACCTTTCCCCTTGAGCGGCGCGAGCTCGTTACCAACCTGCGTTTCGGTTGAGGCTAATTGTGCCTCAAAATCCTTCAGGTTGGCGTCAAGTTTGGCTCGACTTTGCGGCATAAGTTCCACTAATTTTCCATGGATTGCAACCGCTGTAGCCCGCGCTATCTCTGGGGCAAGCCAAAGATGCAGGTTGAAATCGCCTTGATGGTCATCTTCGTACCTTTTTTCCGCGTGGTCGTGatcatca > 2:638982/1‑289 (MQ=255)
ccAAACTGTTTTTCGAAATAGCCGTAAGCATCGTGAAAAACGAAATAACCTTTCCCCTTGAGCGGCGCGAGCTCGTTACCAACCTGCGTTTCGGTTGAGGCTAATTGTGCCTCAAAATCCTTCAGGTTGGCGTCAAGTTTGGCTCGACTTTGCGGCATAAGTTCCACTAATTTTCCATGGATTGCAACCGCTGTAGCCCGCGCTATCTCTGGGGAAAGCCAAAGATGCATGTTGAAATCGCCGTGATGGTGATCTTCGTCACTTTTTTCCGCGTGGTCGTGatcat < 2:1216327/286‑1 (MQ=255)
aaCTGTTTTTCGAAATAGCCGTAAGCATCGTGAAAAACGAAATAACCTTTCCCCTTGAGCGGCGCGGGCTCGTTACCAACCTGCGTTTCGGTTGAGGCTAATTGTGCCTCAAAATCCTTCAGGTTGGCGTCAAGTTTGGCTCGACTTTGCGGCATAAGTTCCACTAATTTTCCATGGATTGCAACCGCTGTAGCCCGCGCTATCTCTGGGGAAAGCCAAAGATGCATGTTGAAATCGCCGTGATGGTGATCTTCGTCACTTTTTTCCGCGTGGTCGTGatcatcatca > 1:2014455/1‑288 (MQ=255)
aaCTGTTTTTCGAAATAGCCGTAAGCATCGTGAAAAACGAAATAACCTTTCCCCTTGAGCGGCGCGAGCTCGTTACCAACCTGCGTTTCGGTTGAGGCTAATTGTGCCTCAAAATCCTTCAGGTTGGCGTCAAGTTTGGCTCGACTTTGCGGCATAAGTTCCACTa > 1:880470/1‑166 (MQ=255)
aaCTGTTTTTCGAAATAGCCGTAAGCATCGTGAAAAACGAAATAACCTTTCCCCTTGAGCGGCGCGAGCTCGTTACCAACCTGCGTTTCGGTTGAGGCTAATTGTGCCTCAAAATCCTTCAGGTTGGCGTCAAGTTTGGCTCGACTTTGCGGCATAAGTTCCACTAATTTTCCATGGATTGCAACCGCTGTAGCCCGCGCt > 2:1454001/1‑201 (MQ=255)
aaCTGTTTTTCGAAATAGCCGTAAGCATCGTGAAAAACGAAATAACCTTTCCCCTTGAGCGGCGCGAGCTCGTTACCAACCTGCGTTTCCGTTCAGGCTAATTGTCCCTCAACATCCTTCAGGTTGGCGTCAAGTTTGGCCCTACTTTGCGGCATAAGTTCCACGAATTTTCCATGGATTGCAACCGCTGTAGCCCGCGCTATCTCTGGGGAAAGCCAAAGATGCATGTTGAAATCGCCTTGATGGTGACCTCCGTCACTTTTTTCCGCGTGGTCGTGaccctcatca > 2:1790973/1‑288 (MQ=255)
aaCTGTTTTTCGAAATAGCCGTAAGCATCGTGAAAAACGAAATAACCTTTCCCCTTGAGCGGCGCGAGCTCGTTACCAAACTGCGTTTCGGTTGAGGCTAATTGTGCCTCAAAATCCTTCAGGTTGGCGTCAAGTTTGGCTCGACTTTGCGGCATAAGTTCCACTAATTTTCCATGGATTGCAACCGCTGTAGCCCGCGCTATCTCTGGGGAAAGCCAAAGATGCATGTTGAAATCGCCGTGATGGTGATCTTCGTCACTTTTTTCCGCGTGGTCGTGatcatcatca > 1:393966/1‑288 (MQ=255)
aCTGTTTTTCGAAATAGCCGTAAGCATCGTGAAAAACGAAATAACCTTTCCCCTTGAGCGGCGCGAGCTCGTTACCAACCTGCGTTTCGGTTGAGGCTAATTGTGCCTCAAAATCCTTCAGGTTGGCGTCAAGTTTGGCTCGACTTTGCGGCATAAGTTCCACTAATTTTCCATGGATTGCAACCGCTGTAGCCCGCGCTATCTCTGGGGAAAGCCAAAGATGCATGTTGAAATCGCCGTGATGGTGATCTTCGTCACTTTTTTCCGCGTGGTCGTGatcatcatcatc < 1:255820/289‑1 (MQ=255)
aCTGTTTTTCGAAATAGCCGTAAGCATCGTGAAAAACGAAATAACCTTTCCCCTTGAGCGGCGCGAGCTCGTTACCAACCTGCGTTTCGGTTGAGGCTAATTGTGCCTCAAAATCCTTCAGGTTGGCGTCAAGTTTGGCTCGACTTTGCGGCATAAGTTCCACTAATTTTCCATGGATTGCAACCGCTGTAGCCCGCGCTATCTCTGGGGAAAGCCAAAGATGCATGTTGAAATCGCCGTGATGGTGATCTTCGTCACTTTTTTCCGCGTGGTCGTGatcatcatcatc < 2:1175191/289‑1 (MQ=255)
gTTTTTCGAAATAGCCGTAAGCATCGTGAAAAACGAAATAACCTTTCCCCTTGAGCGGCGCGAGCTCGTTACCAACCTGCGTTTCGGTTGAGGCTAATTGTGCCTCAAAATCCTTCAGGTTGGCGTCAAGTTTGGCTCGACTTTGCGGCATAAGTTCCACTAATTTTCCATGGATTGCAACCGCTGTAGCCCGCGCTATCTCTGGGGAAAGCCAAAGATGCATGTTGAAATCGCCGTGATGGTGATCTTCGTCACTTTTTTCCGCGTGGTCGTGATCATCATCATCGcc < 2:1843729/289‑1 (MQ=255)
cGTAAGCATCGTGAAAAACGAAATAACCTTTCCCCTTGAGCGGCGCGAGCTCGTTACCAACCTGCGTTTCGGTTGAGGCTAATTGTGCCTCAAAATCCTTCAGGTTGGCGTCAAGTTTGGCTCGACTTTGCGGCATAAGTTCCACTAATTTTCCATGGATTGCAACCGCTGTAGCCCGCGCTATCTCTGGGGAAAGCCAAAGATGCATGTTGAAATCGCCGTGATGGTGATCTTCGTCACTTTTTTCCGCGTGGTCGTGATCATCATCATCGCCGTGAATACTTTtc < 1:1006565/287‑1 (MQ=255)
aGCATCGTGAAAAACGAAATAACCTTTCCCCTTGAGCGGCGCGAGCTCGTTACCAACCTGCGTTTCGGTTGAGGCTAATTGTGCCTCAAAATCCTTCAGGTTGGCGTCAAGTTTGGCTCGACTTTGCGGCATAAGTTCCACTAATTTTCCATGGATTGCAACCGCTGTAGCCCGCGCTATCTCTGGGGAAAGCCAAAGATGCATGTGGAAATCGCCTTGATGGTGATCTTCGTCACTTTTTTCCGCGTGGTCGTGATCATCATCATCGCCGTGACTACTTTTCTTCTGt > 2:1167061/1‑289 (MQ=255)
aTCGTGAAAAACGAAATAACCTTTCCCCTTGAGCGGCGCGAGCTCGTTACCAACCTGCGTTTCGGTTGAGGCTAATTGTGCCTCAAAATCCTTCAGGTTGGCGTCAAGTTTGGCTCGACTTTGCGGCATAAGTTCCACTAATTTTCCATGGATTGCAACCGCTGTAGCCCGCGCTATCTCTGGGGAAAGCCAAAGATGCATGTTGAAATCGCCGTGATGGTGATCTTCGTCACTTTTTTCCGCGTGGTCGTGATCATCATCATCGCCGTGAATACTTTTCATCAGTAg < 1:1872361/288‑1 (MQ=255)
cGTGAAAAACGAAATAACCTTTCCCCTTGAGCGGCGCGAGCTCGTTACCAACCTGCGTTTCGGTTGAGGCTAATTGTGCCTCAAAATCCTTCAGGTTGGCGTCAAGTTTGGCTCGACTTTGCGGCATAAGTTCCACTAATTTTCCATGGATTGCAACCGCTGTAGCCCGCGCTATCTCTGGGGAAAGCCa > 2:407108/1‑190 (MQ=255)
aaaaCGAACAAACCTTTCCCCTTGGGCGGCGCGAGCTCGTTACCAACCTGCGTTTCGGTTGAGGCTAATTGGGCCTCAAAATCCTTCAGGTTGGCGTCAAGTTTGGCTCGACTTTGCAGCATAAGTTCCACTAATTTTCCATGGATTGCAACCGCTGTAGCCCGCGCTATCTCTGGGGAAAGCCAAAGATGCATGTTGAAATCGCCGTGATGGTGATCTTCGTCACTTTTTTCCGCGTGGTCGTGATCATCATCATCGCCGTGAATACTTTTCATCAGTAGCGGTTTca < 2:291251/289‑1 (MQ=255)
aaaaCGAAATACCCTTTCCCCTTGTGCGGCGGGAGAGCGTTACCAACCTGCGTTTCGGTTGAGGCTAATTGTGCCTCAAAATCCTTCAGGTTGGCGTCAAGTTTGGCTCGACTTTGCGGCATAAGTTCCACTAATTTTCCATGGATTGCAACCGCTGTAGCCCGCGCTATCTCTGGGGAAAGCCAAAGATGCATGTTGAAATCGCCGTGATGGTGATCTTCGTCACTTTTTTCCGCGTGGTCGTGATCATCATCATCGCCGTGAATACTTTTCATCAGTAGCGGTTTca < 2:2215006/289‑1 (MQ=255)
aaaaCGAAATAACCTTTCCCCTTGAGCGGCGCGAGCTCGTTACCAACCTGCGTTTCGGTTGAGGCTAATTGTGCCTCAAAATCCTTCAGGTTGGCGTCAAGTTTGGCTCGACTTTGCGGCATAAGTTCCACTAATTTTCCATGGATTGCAACCGCTGTAGCCCGCGCTATCTCTGGGGAAAGCCAAAGATGCATGTTGAAATCGCCGTGATGGTGATCTTCGTCACTTTTTTCCGCGTGGTCGTGATCATCATCATCGCCGTGAATACTTTTCATCAGTAGCGGtttaa < 1:279086/289‑3 (MQ=255)
aaaaCGAAATAACCTTTCCCCTTGAGCGGCGCGAGCTCGTTACCAACCTGCGTTTCGGTTGAGGCTAATTGTGCCTCAAAATCCTTCAGGTTGGCGTCAAGTTTGGCTCGACTTTGCGGCATAAGTTCCACTAATTTTCCATGGATTGCAACCGCTGTAGCCCGCGCTATCTCTGGGGAAAGCCAAAGATGCATGTTGAAATCGCCGTGATGGTGATCTTCGTCACTTTTTTCCGCGTGGTCGTGATCATCATCATCGCCGTGAATACTTTTCATCAGTAGCGGTTTca < 1:1545453/289‑1 (MQ=255)
aaaaCGAAATAACCTTTCCCCTTGAGCGGCGCGAGCTCGTTACCAACCTGCGTTTCGGTTGAGGCTAATTGTGCCTCAAAATCCTTCAGGTTGGCGTCAAGTTTGGCTCGACTTTGCGGCATAAGTTCCACTAATTTTCCATGGATTGCAACCGCTGTAGCCCGCGCTATCTCTGGGGAAAGCCAAAGATGCATGTTGAAATCGCCGTGATGGTGATCTTCGTCACTTTTTTCCGCGTGGTCGTGATCATCATCATCGCCGTGAATACTTTTCATCAGTAGCGGTTTca < 2:1993045/289‑1 (MQ=255)
atccTTTCCCCTTGAGCGGCGCGAGCTCGTTACCAACCTGCGTTTCGGTTGAGTCTAATTGTGCCTCAAAATCCTTCAGGTTGGCGTCAAGTTTGGCTCGACTTTGCGGCATAAGTTCCACTAATTTTCCATGGATTGCACCCGCTGTAGCCCGCGCTATCTCTGGGGAAAGCCAAAGATGCATGTTGAAATCGCCGTGATGGTGATCTTCGTCACTTTTTTCCGCGTGGTCGTGATCATCATCATCGCCGTGAATACTTTTCATCAGTAGCGGTTGCACATCTTCAAg < 1:2139913/287‑1 (MQ=255)
ttCCCCTTGAGCGGCGCGAGCTCGTTACCAACCTGCGTTTCGGTTGAGGCTAATTGTGCCTCAAAATCCTTCAGGTTGGCGTCAAGTTTGGCTCGACTTTGCGGCATAAGTTCCACTAATTTTCCATGGATTGCAACCGCTGTAGCCCGCGCTATCTCTGGGGAAAGCCAAAGATGCATGTTGAAATCGCCGTGATGGTGATCTTCGTCACTTTTTTCCGCGTGGTCGTGATCATCATCATCGCCGTGAATACTTTTCATCAGTAGCGGTTTCACATCTTCAAGCTgcg < 1:999306/289‑1 (MQ=255)
tCCCCTTGAGCGGCGCGAGCTCGTTACCAACCTGCGTTTCGGTTGAGGCTAATTGTGCCTCAAAATCCTTCAGGTTGGCGTCAAGTTTGGCTCGACTTTGCGGCATAAGTTCCACTAATTTTCCATGGATTGCAACCGCTGTAGCCCGCGCTATCTCTGGGGAAAGCCAAAGATGCATGTTGAAATCGCCGTGATGGTGATCTTCGTCACTTTTTTCCGCGTGGTCGTGATCATCATCATCGCCGTGAATACTTTTCATCAGTAGCGGTTTCACATCTTCAAGCTgcgc > 1:650781/1‑289 (MQ=255)
tGAGCGGCGCGAGCTCGTTACCAACCTGCGTTTCGGTTGAGGCTAATTGTGCCTCAAAATCCTTCAGGTTGGCGTCAAGTTTGGCTCGACTTTGCGGCATAAGTTCCACTAATTTTCCATGGATTGCAACCGCTGTAGCCCGCGCTATCTCTGGGGAAAGCCAAAGATGCATGTTGAAATCGCCGTGATGGTGATCTTCGTCACTTTTTTCCGCGTGGTCGTGATCATCATCATCGCCGTGAATACTTTTCATCAGTAGCGGTTTCACATCTTCAAGCTGCGCAATCGt > 1:2033393/1‑289 (MQ=255)
gAGCGGCGCGAGCTCGTTACCAACCTGCGTTTCGGTTGAGGCTAATTGTGCCTCAAAATCCTTCAGGTTGGCGTCAAGTTTGGCTCGACTTTGCGGCATAAGTTCCACTAATTTTCCATGGATTGCAACCGCTGTAGCCCGCGCTATCTCTGGGGAAAGCCAAAGATGCATGTTGAAATCGCCGTGATGGTGATCTTCGTCACTTTTTTCCGCGTGGTCGTGCTCACCATCATCGCCGTGAATACTTTTCATCAGTCGCGGTTTCACATCTTCAAGCTCCCCaacctgt > 2:2225219/1‑284 (MQ=255)
cggcgCGAGCTCGTTACCAACCTGCGTTTCGGTTGAGGCTAATTGTGCCTCAAAATCCTTCAGGTTGGCGTCAAGTTTGGCTCGACTTTGCGGCATAAGTTCCACTAATTTTCCATGGATTGCAACCGCTGTAGCCCGCGCTATCTCTGGGGAAAGCCAAAGATGCATGTTGAAATCGCCGTGATGGTGATCTTCGTCACTTTTTTCcg < 1:1708130/209‑1 (MQ=255)
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cgcgAGCTCGTTACCAACCTGCGTTTCGGTTGAGGCTAATTGTGCCTCAAAATCCTTCAGGTTGGCGTCAAGTTTGGCTCGACTTTGCGGCATAAGTTCCACTAATTTTCCATGGATTGCAACCGCTGTAGCCCGCGCTATCTCTGGGGAAAGCCAAAGATGCATGTTGAAATCGCCGTGATGGTGATCTTCGTCACTTTTTTCCGCGTGGTCGTGATCATCATCATCGCCGTGAATACTTTTCATCAGTAGCGGTTTCACATCTTCAAGCTGCGCAATCGTTACCt > 1:513403/1‑287 (MQ=255)
gaggtggTTACCACCCTGCGTTTCGTTTGAGGCTAATTCTGCCTCAAAATCCTTCAGGTTGGCGTCAAGTTTGGCTCGACTTTGCGGCATAAGTTCCACTAATTTTCCATGGATTGCAACCGCTGTAGCCCGCGCTATCGCTGGGGAAAGCCAAAGATGCATGTTGAAATCGCCGTGATGGTGATCTTCGTCACTTTTTTCCGCGTGGTCGTGATCATCATCATCGCCGTGAATACTTTTCATCAGTAGCGGTTTCACATCTTCAAGCTGCGCAATCGTTACCTGCtt < 2:135586/282‑1 (MQ=255)
aCCAACCTGCGTTTCGGTTGAGGCTAATTGTGCCTCAAAATCCTTCAGGTTGGCGTCAAGTTTGGCTCGACTTTGCGGCATAAGTTCCACTAATTTTCCATGGATTGCAACCGCTGTAGCCCGCGCTATCTCTGGGGAAAGCCAAAGATGCATGTTGAAATCGCCGTGATGGTGATCTTCGTCACTTTTTTCcgcg > 1:1739410/1‑196 (MQ=255)
ccTGCGTTTCGGTTGAGGCTAATTGTGCCTCAAAATCCTTCAGGTTGGCGTCAAGTTTGGCTCGACTTTGCGGCATAAGTTCCACTAATTTTCCATGGATTGCAACCGCTGTAGCCCGCGCTATCTCTGGGGAAAGCCAAAGATGCATGTTGAAATCGCCGTGATGGTGATCTTCGTCACTTTTTTCCGCGTGGTCGTGATCATCATCATCGCCGTGAATACTTTTCATCAGTAGCGGTTTCACATCTTCAAGCTGCGCAATCGTTACCTGCTTCGCTCCTGGTAAttt > 1:2214802/1‑289 (MQ=255)
cGTTTCGGTTGAGGCTAATTGTGCCTCAAAATCCTTCAGGTTGGCGTCAAGTTTGGCTCGACTTTGCGGCATAAGTTCCACTAATTTTCCATGGATTGCAACCGCTGTAGCCCGCGCTATCTCTGGGGa < 1:1940811/129‑1 (MQ=255)
cGTTTCGGTTGAGGCTAATTGTGCCTCAAAATCCTTCAGGTTGGCGTCAAGTTTGGCTCGACTTTGCGGCATAAGTTCCACTAATTTTCCATGGATTGCAACCGCTGTAGCCCGCGCTATCTCTGGGGAAAGCCAAAGATGCATGTTGAAATCGCCGTGATGGTGATCTTCGTCACTTTTTTCCGCGTGGTCGTGATCATCATCATCGCCGTGaa < 2:696684/215‑1 (MQ=255)
cGTTTCGGTTGAGGCTAATTGTGCCTCAAAATCCTTCAGGTTGGCGTCAAGTTTGGCTCGACTTTGCGGCATAAGTTCCACTAATTTTCCATGGATTGCAACCGCTGTAGCCCGCGCTATCTCTGGGGAAAGCCAAAGATGCATGTTGAAATCGCCGTGATGGTGATCTTCGTCACTTTTTTCCGCGTGGTCGTGATCATCATCATCGCCGTGAATACTTTTCATCAGTAGCGGTTTCACATCTTCAAGCTGCGCAATCGTTACCTGCTTCGCTCCTGGTAATTTGCtt > 1:1663998/1‑289 (MQ=255)
cGTTTCGGTTGAGGCTAATTGTGCCTCAAAATCCTTCAGGTTGGCGTCAAGTTTGGCTCGACTTTGCGGCATAAGTTCCACTAATTTTCCATGGATTGCAACCGCTGTAGCCCGCGCTATCTCTGGGGAAAGCCAAAGATGCATGTTGAAATCGCCGTGATGGTGATCTTCGTCACTTTTTTCCGCGTGGTCGTGATCATCATAATCGCCGTGAATACTTTTCATCAGTAGCGGTTTca < 1:927774/239‑1 (MQ=255)
tttCGGTTGAGGCTAATTGTGCCTCAAAATCCTTCAGGTTGGCGTCAAGTTTGGCTCGACTTTGCGGCATAAGTTCCACTAATTTTCCATGGATTGCAACCGCTGTAGCCCGCGCTATCTCTGGGGAAAGCCAAAGATGCATGTTGAAATCGCCGTGATGGTGATCTTCGTCACTTTTTTCCGCGTGGTCGTGATCATCATCATCGCCGTGAATACTTTTCATCAGTAGCGGTTTCACATCTTCAAGCTGCGCAATCGTTACCTGCTTCGCTCCTGGTAATTTGCTTAc < 2:940911/289‑1 (MQ=255)
|||
TCCAACGTTCCCATACGAACGGATGTCCCTCGTGCGACGCTCTCAACGACCGCTGGCCTGAACTGTGGCTCAGCAAAAACGCAGGTTGCTTTTTGCTCAACCAACTGTGTTCTTATTTCATGTAAACGCTGCGCGCCAGGTTGAATCTCAGGGTTAACGGT‑‑AAAATGACCAAGCGGTGTCAGTCCAAACTGTTTTTCGAAATAGCCGTAAGCATCGTGAAAAACGAAATAACCTTTCCCCTTGAGCGGCGCGAGCTCGTTACCAACCTGCGTTTCGGTACTGGCTAATTGTGCCTCAAAATCCTTCAGGTTGGCGTCAAGTTTGGCTCGACTTTGCGGCATAAGTTCCACTAATTTTCCATGGATTGCAACCGCTGTAGCCCGCGCTATCTCTGGGGAAAGCCAAAGATGCATGTTGAAATCGCCGTGATGGTGATCTTCGTCACTTTTTTCCGCGTGGTCGTGATCATCATCATCGCCGTGAATACTTTTCATCAGTAGCGGTTTCACATCTTCAAGCTGCGCAATCGTTACCTGCTTCGCTCCTGGTAATTTGCTTAC > CP042583/1622467‑1623026
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 11 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
GATK/CNVnator alignment
N/A