Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A4 F210 I1 R1
|
4930 |
262.8 |
3829204 |
96.6% |
3699011 |
272.9 |
Breseq alignment
BRESEQ :: Evidence
|
| evidence |
seq id |
position |
mutation |
annotation |
gene |
description |
| RA |
CP042583 |
1,622,745 |
3 bp→TGA |
intergenic (–/–) |
– / – |
–/– |
| |
seq id |
position |
ref |
new |
freq |
score (cons/poly) |
reads |
annotation |
genes |
product |
| * | CP042583 | 1,622,745 | 0 | A | T | 99.6%
| 621.4
/ NA
| 259 | intergenic (–/–) | –/– | –/– |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (0/0); major base T (134/124); minor base G (0/1); total (134/125) |
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 4.83e-01 |
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 |
| * | CP042583 | 1,622,746 | 0 | C | G | 99.2%
| 599.5
/ NA
| 259 | intergenic (–/–) | –/– | –/– |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (2/0); new base G (131/124); total (134/125) |
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 4.99e-01 |
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 |
| * | CP042583 | 1,622,747 | 0 | T | A | 99.6%
| 613.6
/ NA
| 259 | intergenic (–/–) | –/– | –/– |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (0/0); major base A (132/125); minor base G (1/0); total (134/125) |
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 |
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 |
Only 100 of 259 total aligned reads displayed.
GGGATCCAACGTTCCCATACGAACGGATGTCCCTCGTGCGACGCTCTCAACGACCGCTGGCCTGAACTGTGGCTCAGCAAAAACGCAGGTTGCTTTTTGCTCAACCAACTGTGTTCTTATTTCATGTAAACGCTGCGCGCCAGGTTGAATCTCAGGGTTAACGGTAAAATGACCAAGCGGTGTCAGTCCAAACTGTTTTTCGAAATAGCCGTAAGCATCGTGAAAAACGAAATAACCTTTCCCCTTGAGCGGCGCGAGCTCGTTACCAACCTGCGTTTCGGTACTGGCTAATTGTGCCTCAAAATCCTTCAGGTTGGCGTCAAGTTTGGCTCGACTTTGCGGCATAAGTTCCACTAATTTTCCATGGATTGCAACCGCTGTAGCCCGCGCTATCTCTGGGGAAAGCCAAAGATGCATGTTGAAATCGCCGTGATGGTGATCTTCGTCACTTTTTTCCGCGTGGTCGTGATCATCATCATCGCCGTGAATACTTTTCATCAGTAGCGGTTTCACATCTTCAAGCTGCGCAATCGTTACCTGCTTCGCTCCTGGTAATTTGCTTA > CP042583/1622463‑1623025
|||
gggATCCAACGTTCCCATACGAACGGATGTCCCTCGTGCGACGCTCTCAACGACCGCTGGCCTGAACTGTGGCTCAGCAAAAACGCAGGTTGCTTTTTGCTCAACCAACTGTGTTCTTATTTCATGTAAACGCTGCGCGCCAGGTTGAATCTCAGGGTTAACGGTAAAATGACCAAGCGGTGGCAGTCCAAACTGTTTTTCGAAATAGCCGTAAGCATCGTGAAAAACGAAATAACCTTTCCCCTTGAGCGGCGCGAGCTCGTTACCAACCTGCGTTTCGGTTCAGGcc > 1:1245108/1‑288 (MQ=255)
tCCAACGTTCCCATACGAACGGATGTCCCTCGTGCGACGCTCTCAACGACCGCTGGCCTGAACTGTGGCTCAGCAAAAACGCAGGTTGCTTTTTGCTCAACCAACTGTGTTCTTATTTCATGTAAACGCTGCGCGCCAGGTTGAATCTCAGGGTTAACGGTAAAATGACCAAGCGGTGTCAGTCCAAACTGTTTTTCGAAATAGCCGTAAGCATCGTGAAAAACGAAATAACCTTTCCCCTTGAGCGGCGCGAGCTCGTTACCAACCTGCGTTTCGGTTGAGGCTAAtt > 2:539068/1‑289 (MQ=255)
tCCAACGTTCCCATACGAACGGATGTCCCTCGTGCGACGCTCTCAACGACCGCTGGCCTGAACTGTGGCTCAGCAAAAACGCAGGTTGCTTTTTGCTCAACCAACTGTGTTCTTATTTCATGTAAACGCTGCGCGCCAGGTTGAATCTCAGGGTTAACGGTAAAATGACCAAGCGGTGTCAGTCCAAACTGTTTTTCGAAATAGCCGTAAGCATCGTGAAAAACGAAATAACCTTTCCCCTTGAGCGGCGCGAGCTCGTTACCAACCTGCGTTTCGGTTGAGGCTAAtt > 2:951358/1‑289 (MQ=255)
tCCAACGTTCCCATACGAACGGATGTCCCTCGTGCGACGCTCTCAACGACCGCTGGCCTGAACTGTGGCTCAGCAAAAACGCAGGTTGCTTTTTGCTCAACCAACTGTGTTCTTATTTCATGTAAACGCTGCGCGCCAGGTTGAATCTCAGGGTTAACGGTAAAATGACCAAGCGGTGTCAGTCCAAACTGTTTTTCGAAATAGCCGTAAGCATCGTGAAAAACGAAATAACCTTTCCCCTTGAGCGGCGCGAGCTCGTTACCAACCTGCGTTTCGGTTGAGGCTAAtt > 1:574599/1‑289 (MQ=255)
tCCCATACGAACGGATGTCCCTCGTGCGACGCTCTCAACGACCGCTGGCCTGAACTGTGGCTCAGCAAAAACGCAGGTTGCTTTTTGCTCAACCAACTGTGTTCTTATTTCATGTAAACGCTGCGCGCCAGGTTGAATCTCAGGGTTAACGGTAAAATGACCAAGCGGTGTCAGTCCAAACTGTTTTTCGAAATAGCCGTAAGCATCGTGAAAAACGAAATAACCTTTCCCCTTGAGCGGCGCGAGCTCGTTACCAACCTGCGTTTCGGTTGAGGCTAATTGTGCCTCa > 1:446263/1‑289 (MQ=255)
cccATACGAACGGATGTCCCTCGTGCGACGCTCTCAACGACCGCTGGCCTGAACTGTGGCTCAGCAAAAACGCAGGTTGCTTTTTGCTCAACCAACTGTGTTCTTATTTCATGTAAACGCTGCGCGCCAGGTTGAATCTCAGGGTTAACGGTAAAATGACCAAGCGGTGTCAGTCCAAACTGTTTTTCGAAATAGCCGTAAGCATCGTGAAAAACGAAATAACCTTTCCCCTTGAGCGGCGCGAGCTCGTTACCAACCTGCGTTTCGGTTGAGGCTAATTGTGCCTCaa < 2:186654/289‑1 (MQ=255)
ccATACGAACGGATGTCCCTCGTGCGACGCTCTCAACGACCGCTGGCCTGAACTGTGGCTCAGCAAAAACGCAGGTTGCTTTTTGCTCAACCAACTGTGTTCTTATTTCATGTAAACGCTGCGCGCCAGGTTGAATCTCAGGGTTAACGGTAAAATGACCAAGCGGTGTCAGTCCAAACTGTTTTTCGAAATAGCCGTAAGCATCGTGAAAAACGAAATAACCTTTCCCCTTGAGCGGCGCGAGCTCGTTACCAACCTGCGTTTCGGTTGAGGCTAATTGTGCCTCaaa < 1:130412/289‑1 (MQ=255)
aaCGGATGTCCCTCGTGCGACGCTCTCAACGACCGCTGGCCTGAACTGTGGCTCAGCAAAAACGCAGGTTGCTTTTTGCTCAACCAACTGTGTTCTTATTTCATGTAAACGCTGCGCGCCAGGTTGAATCTCAGGGTTAACGGTAAAATGACCAAGCGGTGTCAGTCCAAACTGTTTTTCGAAATAGCCGTAAGCATCGTGAAAAACGAAATAACCTTTCCCCTTGAGCGGCGCGAGCTCGTTACCAACCTGCGTTTCGGTTGAGGCTAATTGTGCCTCAAAATCCtt > 1:516501/1‑288 (MQ=255)
aCGGATGTCCCTCGTGCGACGCTCTCAACGACCGCTGGCCTGAACTGTGGCTCAGCAAAAACGCAGGTTGCTTTTTGCTCAACCAACTGTGTTCTTATTTCATGTAAACGCTGCGCGCCAGGTTGAATCTCAGGGTTAACGGTAAAATGACCAAGCGGTGTCAGTCCAAACTGTTTTTCGAAATAGCCGTAAGCATCGTGAAAAACGAAATAACCTTTCCCCTTGAGCGGCGCGAGCTCGTTACCAACCTGCGTTTCGGTTGAGGCTAATTGTGCCTCAAAATCCTTCa > 1:262889/1‑289 (MQ=255)
tGTCCCTCGTGCGACGCTCTCAACGACCGCTGGCCTGAACTGTGGCTCAGCAAAAACGCAGGTTGCTTTTTGCTCAACCAACTGTGTTCTTATTTCATGTAAACGCTGCGCGCCAGGTTGAATCTCAGGGTTAACGGTAAAATGACCAAGCGGTGTCAGTCCAAACTGTTTTTCGAAATAGCCGTAAGCATCGTGAAAAACGAAATAACCTTTCCCCTTGAGCGGCGCGAGCTCGTTACCAACCTGCGTTTCGGTTGAGGCTAATTGTGCCTCAAAATCCTTCAGGtt < 1:929893/288‑1 (MQ=255)
ccTCGTGCGACGCTCTCAACGACCGCTGGCCTGAACTGTGGCTCAGCAAAAACGCAGGTTGCTTTTTGCTCAACCAACTGTGTTCTTATTTCATGTAAACGCTGCGCGCCAGGTTGAATCTCAGGGTTAACGGTAAAATGACCAAGCGGTGTCAGTCCAAACTGTTTTTCGAAATAGCCGTAAGCATCGTGAAAAACGAAATAACCTTTCCCCTTGAGCGGCGCGAGCTCGTTACCAACCTGCGTTTCGGTTGAGGCTAATTGTGCCTCAAAATCCTTCAGGTTGGCg > 1:1116501/1‑288 (MQ=255)
ccTCGTGCGACCCTCTCAACGACCGCGGGCCTGAACTGTGGGTCAGCAAAATCGCAGGTTGCTTTTTCCTCAACCACCTGTGTTCTTCTTTCATGTAAACGCTTCGCGCCAGGTTGAATCCAAGGGTTAACGGTAAAATGACCAAGCGGTGTCAGTACACACTGTTTGTAGAAATATCCGTAACCATCCTGAAAAACGAAATAACCTTCCCCCTTGAGCGTACCCAGCCCGTTCACAACATGCCTTTCAGTTCGGCCTACTTTTGCCTCAAAAACCtctatgttttct > 2:1481086/1‑277 (MQ=255)
aCGCTCTCAACGACCGCTGGCCTGAACTGTGGCTCAGCAAAAACGCAGGTTGCTTTTTGCTCAACCAACTGTGTTCTTATTTCATGTAAACGCTGCGCGCCAGGTTGAATCTCAGGGTTAACGGTAAAATGACCAAGCGGTGTCAGTCCAAACTGTTTTTCGAAATAGCCGTAAGCATCGTGAAAAACGAAATAACCTTTCCCCTTGAGCGGCGCGAGCTCGTTACCAACCTGCGTTTCGGTTGAGGCTAATTGTGCCTCAAAATCCTTCAGGTTGGCGTCAAGTTTgg > 2:1647026/1‑289 (MQ=255)
gCTCTCAACGACCGCTGGCCTGAACTGTGGCTCAGCAAAAACGCAGGTTGCTTTTTGCTCAACCAACTGTGTTCTTATTTCATGTAAACGCTGCGCGCCAGGTTGAATCTCAGGGTTAACGGTAAAATGACCAAGCGGTGTCAGTCCAAACTGTTTTTCGAAATAGCCGTAAGCATCGTGAAAAACGAAATAACCTTTCCCCTTGAGCGGCGCGAGCTCGTTACCAACCTGCGTTTCGGTTGAGGCTAATTGTGCCTCAAAATCCTTCAGGTTGGCGTCAAGTTTGGCt < 2:258660/289‑1 (MQ=255)
cGACCGCTGGCCTGAACTGTGGCTCAGCAAAAACGCAGGTTGCTTTTTGCTCAACCAACTGTGTTCTTATTTCATGTAAACGCTGCGCGCCAGGTTGAATCTCAGGGTTAACGGTAAAATGACCAAGCGGTGTCAGTCCAAACTGTTTTTCGAAATAGCCGTAAGCATCGTGAAAAACGAAATAACCTTTCCCCTTGAGCGGCGCGAGCTCGTTACCAACCTGCGTTTCGGTTGAGGCTAATTGTGCCTCAAAATCCTTCAGGTTGGCGTCAAGTTTGGCTCGACTTTg < 2:83663/289‑1 (MQ=255)
cGACCGCTGGCCTGAACTGTGGCTCAGCAAAAACGCAGGTTGCTTTTTGCTCAACCAACTGTGTTCTTATTTCATGTAAACGCTGCGCGCCAGGTTGAATCTCAGGGTTAACGGTAAAATGACCAAGCGGTGTCAGTCCAAACTGTTTTTCGAAATAGCCGTAAGCATCGTGAAAAACGAAATAACCTTTCCCCTTGAGCGGCGCGAGCTCGTTACCAACCTGCGTTTCGGTTGAGGCTAATTGTGCCTCAAAATCCTTCAGGTTGGCGTCAAGTTTGGCTCGACTTTg < 1:1426614/289‑1 (MQ=255)
cGACCGCTGGCCTGAACTGTGGCTCAGCAAAAACGCAGGTTGCTTTTTGCTCAACCAACTGTGTTCTTATTTCATGTAAACGCTGCGCGCCAGGTTGAATCTCAGGGTTAACGGTAAAATGACCAAGCGGTGTCAGTCCAAACTGTTTTTCGAAATAGCCGTAAGCATCGTGAAAAACGAAATAACCTTTCCCCTTGAGCGGCGCGAGCTCGTTACCAACCTGCGTTTCGGTTGAGGCTAATTGTGCCTCAAAATCCTTCAGGTTGGCGTCAAGTTTGGCTCGACTTTg < 1:1151941/289‑1 (MQ=255)
cTGGCCTGAACTGTGGCTCAGCAAAAACGCAGGTTGCTTTTTGCTCAACCAACTGTGTTCTTATTTCATGTAAACGCTGCGCGCCAGGTTGAATCTCAGGGTTAACGGTAAAATGACCAAGCGGTGTCAGTCCAAACTGTTTTTCGAAATAGCCGTAAGCATCGTGAAAAACGAAATAACCTTTCCCCTTGCGCGGCGCGAGCTCGTTACCAACCTGCGTTTCGGTTGAGGCTAATTGTGCCTCAAAATCCTTCAGGTTGGCGTCAAGTTTGGCTCGACTTTGCGGCAt > 1:1358181/1‑289 (MQ=255)
cTGGCCTGAACTGTGGCTCAGCAAAAACGCAGGTTGCTTTTTGCTCAACCAACTGTGTTCTTATTTCATGTAAACGCTGCGCGCCAGGTTGAATCTCAGGGTTAACGGTAAAATGACCAAGCGGTGTCAGTCCAAACTGTTTTTCGAAATAGCCGTAAGCATCGTGAAAAACGAAATAACCTTTCCCCTTGAGCGGCGCGAGCTCGTTACCAACCTGCGTTTCGGTTGAGGCTAATTGTGCCTCCAAATGCTTCAGCTTGGCGTGAAGTTTGGCTCGACCTTGCGGCAt > 2:574041/1‑289 (MQ=255)
cTGGCCTGAACTGTGGCTCAGCAAAAACGCAGGTTGCTTTTTGCTCAACCAACTGTGTTCTTATTTCATGTAAACGCTGCGCGCCAGGTTGAATCTCAGGGTTAACGGTAAAATGACCAAGCGGTGTCAGTCCAAACTGTTTTTCGAAATAGCCGTAAGCATCGTGAAAAACGAAATAACCTTTCCCCTTGAGCGGCGCGAGCTCGTTACCAACCTGCGTTTCGGTTGAGGCTAATTGTGCCTCAAAATCCTTCAGGTTGGCGTCAAGGTTTGCTCGCCTTTGCGGCAt > 2:819917/1‑289 (MQ=255)
tGGCCTGAACTGTGGCTCAGCAAAAACGCAGGTTGCTTTTTGCTCAACCAACTGTGTTCTTATTTCATGTAAACGCTGCGCGCCAGGTTGAATCTCAGGGTTAACGGTAAAATGACCAAGCGGTGTCAGTCCAAACTGTTTTTCGAAATAGCCGTAAGCATCGTGAAAAACGAAATAACCTTTCCCCTTGAGCGGCGCGAGCTCGTTACCAACCTGCGTTTCGGTTGAGGCTAATTGTGCCTCAAAATCCTTCAGGTTGGCGTCAAGTTTGGCTCGACTTTGCGGCAt < 1:733338/288‑1 (MQ=255)
tGGCCTGAACTGTGGCTCAGCAAAAACGCAGGTTGCTTTTTGCTCAACCAACTGTGTTCTTATTTCATGTAAACGCTGCGCGCCAGGTTGAATCTCAGGGTTAACGGTAAAATGACCAAGCGGTGTCAGTCCAAACTGTTTTTCGAAATAGCCGTAAGCATCGTGAAAAACGAAATAACCTTTCCCCTTGAGCGGCGCGAGCTCGTTACCAACCTGCGTTTCGGTTGAGGCTAATTGTGCCTCAAAATCCTTCAGGTTGGCGTCAAGTTTGGCTCGACTTTGCGGCAt < 2:66041/288‑1 (MQ=255)
ccTGAACTGTGGCTCAGCAAAAACGCAGGTTGCTTTTTGCTCAACCAACTGTGTTCTTATTTCATGTAAACGCTGCGCGCCAGGTTGAATCTCAGGGTTAACGGTAAAATGACCAAGCGGTGTCAGTCCAAACTGTTTTTCGAAATAGCCGTAAGCATCGTGAAAAACGAAATAACCTTTCCCCTTGAGCGGCGCGAGCTCGTTACCAACCTGCGTTTCGGTTGAGGCTAATTGTGCCTCAAAATCCTTCAGGTTGGCGTCAAGTTTGGCTCGACTTTGCGGCATAAg < 2:357497/288‑1 (MQ=255)
ttaaCTGTGGCTTAGCAAAAACCAAGGTTGTTTTTTGCTCAACCAACTGTGTTCTTATTTCATGTAAACGCTGCGCGCCAGGTTGAATCTCAGGGTTAACGGTAAAATGACCAAGCGGTGTCAGTCCAAACTGTTTTTCGAAATAGCCGTAAGCATCGTGAAAAGCGAAATAACCTTTCCCCTTGAGCGGCGCGAGCTCGTTACCAACCTGCGTTTCGGTTGAGGCTAATTGTGCCTCAAAATCCTTCAGGTTGGCGTCAAGTTTGGCTCGACTTTGCGGCATAAGTTc < 2:808106/287‑1 (MQ=255)
tGAACTGTGGCTCAGCAAAAACGCAGGTTGCTTTTTGCTCAACCAACTGTGTTCTTATTTCATGTAAACGCTGCGCGCCAGGTTGAATCTCAGGGTTAACGGTAAAATGACCAAGCGGTGTCAGTCCAAACTGTTTTTCGAAATAGCCGTAAGCATCGTGAAAAACGAAATAACCTTTCCCCTTGAGCGGCGCGAGCTCGTTACCAACCTGCGTTTCGGTTGAGGCTAATTGTGCCTCAAAATCCTTCAGGTTGGCGTCAAGTTTGGCTCGACTTTGCGGCATAAGTTc < 2:910614/289‑1 (MQ=255)
aaCTGTGGCTCAGCAAAAACGCAGGTTGCTTTTTGCTCAACCAACTGTGTTCTTATTTCATGTAAACGCTGCGCGCCAGGTTGAATCTCAGGGTTAACGGTAAAATGACCAAGCGGTGTCAGTCCAAACTGTTTTTCGAAATAGCCGTAAGCATCGTGAAAAACGAAATAACCTTTCCCCTTGAGCGGCGCGAGCTCGTTACCAACCTGCGTTTCGTTTGAGGCTAATTGTGCCTCAAAATCCTTCAGGTTGGCGTCAAGTTTGGCTCGACTTTGCGGCATAAGTTcc > 2:1259165/1‑288 (MQ=255)
tgGCTCAGCAAAAACGCAGGTTGCTTTTTGCTCAACCAACTGTGTTCTTATTTCATGTAAACGCTGCGCGCCAGGTTGAATCTCAGGGTTAACGGTAAAATGACCAAGCGGTGTCAGTCCAAACTGTTTTTCGAAATAGCCGTAAGCATCGTGAAAAACGAAATAACCTTTCCCCTTGAGCGGCGCGAGCTCGTTACCAACCTGCGTTTCGGTTGAGGCTAATTGTGCCTCAAAATCCTTCAGGTTGGCGTCAAGTTTGGCTCGACTTTGCGGCATAAGTTCCACTAAt > 1:156913/1‑289 (MQ=255)
tgGCTCAGCAAAAACGCAGGTTGCTTTTTGCTCAACCAACTGTGTTCTTATTTCATGTAAACGCTGCGCGCCAGGTTGAATCTCAGGGTTAACGGTAAAATGACCAAGCGGTGTCAGTCCAAACTGTTTTTCGAAATAGCCGTAAGCATCGTGAAAAACGAAATAACCTTTCCCCTTGAGCGGCGCGAGCTCGTTACCAACCTGCGTTTCGGTTGAGGCTAATTGTGCCTCAAAATCCTTCAGGTTGGCGTCAAGTTTGGCTCGACTTTGCGGCATAAGTTCCACTAAt > 1:1265584/1‑289 (MQ=255)
cAGCAAAAACGCAGGTTGCTTTTTGCTCAACCAACTGTGTTCTTATTTCATGTAAACGCTGCGCGCCAGGTTGAATCTCAGGGTTAACGGTAAAATGACCAAGCGGTGTCAGTCCAAACTGTTTTTCGAAATAGCCGTAAGCATCGTGAAAAACGAAATAACCTTTCCCCTTGAGCGGCGCGAGCTCGTTACCAACCTGCGTTTCGGTTGAGGCTAATTGTGCCTCAAAATCCTTCAGGTTGGCGTCAAGTTTGGCTCGACTTTGCGGCATAAGTTCCACTAATTTTcc < 1:348231/289‑1 (MQ=255)
aGCAAAAACGCAGGTTGCTTTTTGCTCAACCAACTGTGTTCTTATTTCATGTAAACGCTGCGCGCCAGGTTGAATCTCAGGGTTAACGGTAAAATGACCAAGCGGTGTCAGTCCAAACTGTTTTTCGAAATAGCCGTAAGCATCGTGAAAAACGAAATAACCTTTCCCCTTGAGCGGCGCGAGCTCGTTACCAACCTGCGTTTCGGTTGAGGCTAATTGTGCCTCAAAATCCTTCAGGTTGGCGTCAAGTTTGGCTCGACTTTGCGGCATAAGTTCCACTAATTTTCCa > 1:985337/1‑289 (MQ=255)
aGCAAAAACGCAGGTTGCTTTTTGCTCAACCAACTGTGTTCTTATTTCATGTAAACGCTGCGCGCCAGGTTGAATCTCAGGGTTAACGGTAAAATGACCAAGCGGTGTCAGTCCAAACTGTTTTTCGAAATAGCCGTAAGCATCGTGAAAAACGAAATAACCTTTCCCCTTGAGCGGCGCGAGCTCGTTACCAACCTGCGTTTCGGTTGAGGCTAATTGTGCCTCAAAATCCTTCAGGTTGGCGTCAAGTTTGGCTCGACTTTGCGGCATAAGTTCCACTAATTTTCCa > 1:428404/1‑289 (MQ=255)
aGCAAAAACGCAGGTTGCTTTTTGCTCAACCAACTGTGTTCTTATTTCATGTAAACGCTGCGCGCCAGGTTGAATCTCAGGGTTAACGGTAAAATGACCAAGCGGTGTCAGTCCAAACTGTTTTTCGAAATAGCCGTAAGCATCGTGAAAAACGAAATAACCTTTCCCCTTGAGCGGCGCGAGCTCGTTACCAACCTGCGTTTCGGTTGAGGCTAATTGTGCCCCAAAATCCTTCAGGTTGGCGTCAAGTTTGGCTCGACTTTGCGGCTTACGTTTCACTAATTTTCCa > 2:48090/1‑289 (MQ=255)
cAAAAACGCAGGTTGCTTTTTGCTCAACCAACTGTGTTCTTATTTCATGTAAACGCTGCGCGCCAGGTTGAATCTCAGGGTTAACGGTAAAATGACCAAGCGGTGTCAGTCCAAACTGTTTTTCGAAATAGCCGTAAGCATCGTGAAAAACGAAATAACCTTTCCCCTTGAGCGGCGCGAGCTCGTTACCAACCTGCGTTTCGGTTGAGGCTAATTGTGCCTCAAAATCCTTCAGGTTGGCGTCAAGTTTGGCTCGACTTTGTGGCCTAAGTTCCACTAATTTTCCATg > 2:1849722/1‑289 (MQ=255)
aaaaaCGCAGTTTGCTTTTTGCTCAACCAACTGTGTTCTTATTTCATGTAAACGCTGCGCGCCAGGTTGAATCTCAGGGTTAACGGTAAAATGACCAAGCGGTGTCAGTCCAAACTGTTTTTCGAAATAGCCGTAAGCATCGTGAAAAACGAAATAACCTTTCCCCTTGAGCGGCGCGAGCTCGTTACCAACCTGCGTTTCGGTTGAGGCTAATTGTGCCTCAAAATCCTTCAGGTTGGCGTCAAGTTTGGCTCGACTTTGCGGCATAAGTTCCACTAATTTTCCa < 2:1229170/286‑1 (MQ=255)
cgcctgTTGCTTTTTCATCAACCACCTGTTTTCTTTTTGCATGTAAACGCTGGGCGCCAGTTTGAATCTCAGGGTTAACGGTAAAATGACCAAGCGGTGTCAGTCCAAACTGTTTTTCGAAATAGCCGTAAGCATCGTGAAAAACGAAATAACCTTTCCCCTTGAGCGGCGCGAGCTCGTTACCAACCTGCGTTTCGTTTGAGGCTAATTGTGCCTCAAAATCCTTCAGTTTGGCGTCAAGTTTGGCTCGACTTTGCGGCATAAGTTCCACTAATTTTCCATGGATTGc < 2:305939/284‑1 (MQ=255)
cGCAGGTTGCTTTTTGCTCAACCAACTGTGTTCTTATTTCATGGACACGCTGCGCGCCAGGTTGATTCTCAGGGTTAACGGTAAAATGACCAAGCGGGGTCAGTCCCAACTGTTTTTCGAAATAGCCGTAAGCATCGTGAAAAACGAAATAACCTTTCCCCTTGAGCGGCGCGAGCTCGTTACCAACCTGCGTTTCGGTTGAGGCTAATTGTGCCTCAAAATCCTTCAGGTTGGCGTCAAGTTTGGCTCGACTTTGCGGCATAAGTTCCACTAATTTTCCATGGATTGc < 1:1446520/289‑1 (MQ=255)
aGGTTGCTTTTTGCTCAACCAACTGTGTTCTTATTTCATTTAAACGCTGCGCGCCAGGTTGAATCTCAGGGTTAACGGTAAAATGACCAAGCGGTGTCAGTCCAAACTGTTTTTCGAAATAGCCGTAAGCATCGTGAAAAACGAAATAACCTTTCCCCTTGAGCGGCGCGAGCTCGTTACCAACCTGCGTTTCGGTTGAGGCTAATTGTGCCTCAAAATCCTTCAGGTTGGCGTCAAGTTTGGCTCGACTTTGCGGCATAAGTTCCACTAATTTTCCATGGATTGCaa < 1:1706312/288‑1 (MQ=255)
aGGTTGCTTTTTGCTCAACCAACTGTGTTCTTATTTCATGTAAACGCTGCGCGCCAGGTTGAATCTCAGGGTTAACGGTAAAATGACCAAGCGGTGTCAGTCCAAACTGTTTTTCGAAATAGCCGTAAGCATCGTGAAAAACGAAATAACCTTTCCCCTTGAGCGGCGCGAGCTCGTTACCAACCTGCGTTTCGGTTGAGGCTAATTGTGCCTCAAAATCCTTCAGGTTGGCGTCAAGTTTGGCTCGACTTTGCGGCATAAGTTCCACTAATTTTCCATGGATTGCaa < 2:1247266/288‑1 (MQ=255)
tcaccaaacTGTGTTCTTATTTCATGTAAACGCTGCGCGCCAGGTTGAATCTCAGGGTTAACGGTAAAATGACCAAGCGGTGTCAGTCCAAACTGTTTTTCGAAATAGCCGTAAGCATCGTGAAAAACGAAATAACCTTTCCCCTTGAGCGGCGCGAGCTCGTTACCAACCTGCGTTTCGGTTGAGGCTAATTGTGCCTCAAAATCCTTCAGGTTGGCGTCAAGTTTGGCTCGACTTTGCGGCATAAGTTCCACTAATTTTCCATGGATTGCAACCGCTGTAGCCcgcg < 2:566294/283‑1 (MQ=255)
tCAACCAACTGTGTTCTTATTTCATGTAAACGCTGCGCGCCAGGTTGAATCTCAGGGTTAACGGTAAAATGACCAAGCGGTGTCAGTCCAAACTGTTTTTCGAAATAGCCGTAAGCATCGTGAAAAACGAAATAACCTTTCCCCTTGAGCGGCGCGAGCTCGTTACCAACCTGCGTTTCGGTTGAGGCTAATTGTGCCTCAAAATCCTTCAGGTTGGCGTCAAGTTTGGCTCGACTTTGCGGCATAAGTTCCACTAATTTTCCATGGATTGCAACCGCTGTAGCCcgcg < 2:1557562/289‑1 (MQ=255)
caaccaacTGTGTTCTTATTTCATGTAAACGCTGCGCGCCAGGTTGAATCTCAGGGTTAACGGTAAAATGACCAAGCGGTGTCAGTCCAAACTGTTTTTCGAAATAGCCGTAAGCATCGTGAAAAACGAAATAACCTTTCCCCTTGAGCGGCGCGAGCTCGTTACCAACCTGCGTTTCGGTTGAGGCTAATTGTGCCTCAAAATCCTTCAGGTTGGCGTCAAGTTTGGCTCGACTTTGCGGCATAAGTTCCACTAATTTTCCATGGATTGCAACCGCTGTAGCCCgcgc < 2:745304/289‑1 (MQ=255)
tgtgTTCTTATTTCATGTAAACGCTGCGCGCCAGGTTGAATCTCAGGGTTAACGGTAAAATGACCAAGCGGTGTCAGTCCAAACTGTTTTTCGAAATAGCCGTAAGCATCGTGAAAAACGAAATAACCTTTCCCCTTGAGCGGCGCGAGCTCGTTACCAACCTGCGTTTCGGTTGAGGCTAATTGTGCCTCAAAATCCTTCAGGTTGGCGTCAAGTTTGGCTCGACTTTGCGGCATAAGTTCCACTACTTTTCCATGGATTGCAACCGCTGTAGCCCGGCCTACCTCTg > 2:1073537/1‑289 (MQ=255)
tttCTTATTTCATGTCAACGCTGCGCGCCAGGTTGAATCTCAGGGTTAACGGTAAAATGACCAAGTGGTGTCAGTCCAAACTGTTTTTCGAAATAGCCGTAAGCATCGTGAAAAACGAAATAACCTTTCCCCTTCAGCGGCGCGAGCTCGTTACCAACCTGCGTTTCGGTTGAGGCTAATTGTGCCTCAAAATCCTTCCGGTTGGCGTCCAGTTTGGCTCGACTTTGCGGCATAAGTACCACTAATTTTCCATGGATTGCAACCGCTGTAGCCCGCGCTATCTCTgggg < 2:632251/288‑1 (MQ=255)
gtTCTTATTTCATGTAAACGCTGCGCGCCAGGTTGAATCTCAGGGTTAACGGTAAAATGACCAAGCGGTGTCAGTCCAAACTGTTTTTCGAAATAGCCGTAAGCATCGTGAAAAACGAAATAACCTTTCCCCTTGAGCGGCGCGAGCTCGTTACCAACCTGCGTTTCGGTTGAGGCTAATTGTGCCTCAAAATCCTTCAGGTTGGCGTCAAGTTTGGCTCGACTTTGCGGCATAAGTTCCACTAATTTTCCa < 2:492274/252‑1 (MQ=255)
gtTCTTATTTCATGTAAACGCTGCGCGCCAGGTTGAATCTCAGGGTTAACGGTAAAATGACCAAGCGGTGTCAGTCCAAACTGTTTTTCGAAATAGCCGTAAGCATCGTGAAAAACGAAATAACCTTTCCCCTTGAGCGGCGCGAGCTCGTTACCAACCTGCGTTTCGGTTGAGGCTAATTGTGCCTCAAAATCCTTCAGGTTGGCGTCAAGTTTGGCTCGACTTTGCGGCATAAGTTCCACTAATTTTCCa > 1:492274/1‑252 (MQ=255)
tCTTATTTCATGTAAACGCTGCGCGCCAGGTTGAATCTCAGGGTTAACGGTAAAATGACCAAGCGGTGTCAGTCCAAACTGTTTTTCGAAATAGCCGTAAGCATCGTGAAAAACGAAATAACCTTTCCCCTTGAGCGGCGCGAGCTCGTTACCAACCTGCGTTTCGGTTGAGGCTAATTGTGCCTCAAAATCCTTCAGGTTGGCGTCAAGTTTGGCTCGACTTTGCGGCATAAGTTCCACTAATTTTCCATGGATTGCAACCGCTGTAGCCCGCGCTATCTCTGGGGa < 1:99038/288‑1 (MQ=255)
aTTTCATGTAAACGCTGCGCGCCAGGTTGAATCTCAGGGTTAACGGTAAAATGACCAAGCGGTGTCAGTCCAAACTGTTTTTCGAAATAGCCGTAAGCATCGTGAAAAACGAAATAACCTTTCCCCTTGAGCGGCGCGAGCTCGTTACCAACCTGCGTTTCGGTTGAGGCTAATTGTGCCTCAAAATCCTTCAGGTTGGCGTCAAGTTTGGCTCGACTTTGCGGCATAAGTTCCACTAATTTTCCATGGATTGCAACCGCTGTAGCCCGCGCTATCTCTGGGGAAAGcc > 1:177415/1‑289 (MQ=255)
tCATGTAAACGCTGCGCGCCAGGTTGAATCTCAGGGTTAACGGTAAAATGACCAAGCGGTGTCAGTCCAAACTGTTTTTCGAAATAGCCGTAAGCATCGTGAAAAACGAAATAACCTTTCCCCTTGAGCGGCGCGAGCTCGTTACCAACCTGCGTTTCGGTTGAGGCTAATTGTGCCTCAAAATCCTTCAGGTTGGCGTCAAGTTTGGCTCGACTTTGCGGCATAAGTTCCACTAATTTTCCa > 2:1730270/1‑243 (MQ=255)
tCATGTAAACGCTGCGCGCCAGGTTGAATCTCAGGGTTAACGGTAAAATGACCAAGCGGTGTCAGTCCAAACTGTTTTTCGAAATAGCCGTAAGCATCGTGAAAAACGAAATAACCTTTCCCCTTGAGCGGCGCGAGCTCGTTACCAACCTGCGTTTCGGTTGAGGCTAATTGTGCCTCAAAATCCTTCAGGTTGGCGTCAAGTTTGGCTCGACTTTGCGGCATAAGTTCCACTAATTTTCCATGGATTGCAACCGCTGTAGCCCGCGCTATCTCTGGGGAAAGCCaaa < 1:845409/289‑1 (MQ=255)
aTGTAAACGCTGCGCGCCAGGTTGAATCTCAGGGTTAACGGTAAAATGACCAAGCGGTGTCAGTCCAAACTGTTTTTCGAAATAGCCGTAAGCATCGTGAAAAACGAAATAACCTTTCCCCTTGAGCGGCGCGAGCTCGTTACCAACCTGCGTTTCGGTTGAGGCTAATTGTGCCTCAAAATCCTTCAGGTTGGCGTCAAGTTTGGCTCGACTTTGCGGCATAAGTTCCACTAATTTTCCATGGATTGCAACCGCTGTAGCCCGCGCTATCTCTgggg > 1:1645003/1‑278 (MQ=255)
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gcgcgcCAGGTTGAATCTCAGGGTTAACGGTAAAATGACCAAGCGGTGTCAGTCCAAACTGTTTTTCGAAATAGCCGTAAGCATCGTGAAAAACGAAATAACCTTTCCCCTTGAGCGGCGCGAGCTCGTTACCAACCTGCGTTTCGGTTGAGGCTAATTGTGCCTCAAAATCCTTCAGGTTGGCGTCAAGTTTGGCTCGACTTGTCGGCATAAGTTCCACTAATTTTCAATGGCTCGCAACTGCCGTAGCGCTCGCTATCTTTGGGGTAAGCCAAAGCTGCAAGATGaa > 2:762910/1‑289 (MQ=255)
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aaCGGTAAAATGACCAAGCGGTGTCAGTCCAAACTGTTTTTCGAAATAGCCGTAAGCATCGTGAAAAACGAAATAACCTTTCCCCTTGAGCGGCGCGAGCTCGTTACCAACCTGCGTTTCGGTTTAGGCTAATTGTGCCTCAAAATCCTTCAGGTTGGCGTCAAGTTTGGCTCGACTTTGCGGCATAAGTTCCACTAATTTTCCATGGATTGCAACCGCTGTAGCCCGCGCTATCTCTGGGGAAAGCCAAAGATGCATGTTGAAATCGCCGTGATGGGGATCTTCGTc > 2:1046651/1‑288 (MQ=255)
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tCCAAACTGTTTTTCGAAATAGCCGTAAGCATCGTGAAAAACGAAATAACCTTTCCCCTTGAGCGGCGCGAGCTCGTTACCAACCTGCGTTTCGGTTGAGGCTAATTGTGCCTCAAAATCCTTCAGGTTGGCGTCAAGTTTGGCTCGACTTTGCGGCATAAGTTCCACTAATTTTCCATGGATTGCAACCGCTGTAGCCCGCGCTATCTCTGGGGAAAGCCAAAGATGCATGTTGAAATCGCCGTGATGGTGATCTTCGTCACTTTTTTCCGCGTGGTCGTGatcatca > 1:1381770/1‑289 (MQ=255)
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aaCTGTTTTTCGAAATAGCCGTAAGCATCGTGAAAAACGAAATAACCTTTCCCCTTTAGCGGCGCGAGCTCGTTACCAACCTGCGTTTCGGTTGAGGCTAATTGTGCCTCAAAATCCTTCAGGTTGGCGTCAAGTTTGGCTCGACTTTGCGGCATAAGTTCCACTAATTTTCCATGGATTGCAACCGCTGTAGCCCGCGCTATCTCTGGGGAAAGCCAAAGATGCATGTTGAAATCGCCGTGATGGTGATCTTCGTCACTTTTTTCCGCGTGGTCGTGatcatcatca > 1:1162064/1‑288 (MQ=255)
aaCTGTTTTTCGAAATAGCCGTAAGCATCGTGAAAAACGAAATAACCTTTCCCCTTGAGCGGCGCGAGCTCGTTACCAACCTGCGTTTCGGTTGAGGCTAATTGTGCCTCAAAATCCTTCAGGTTGGCGTCAAGTTTGGCTCGACTTTGCGGCATAAGTTCCACTAATTTTCCATGGATTGCAACCGCTGTAGCCCGCGCTATCTCTGGGGaa < 1:709933/213‑1 (MQ=255)
aaCTGTTTTTCGAAATAGCCGTAAGCATCGTGAAAAACGAAATAACCTTTCCCCTTGAGCGGCGCGAGCTCGTTACCAACCTGCGTTTCGGTTGAGGCTAATTGTGCCTCAAAATCCTTCAGGTTGGCGTCAAGTTTGGCTCGACTTTGCGGCATAAGTTCCACTAATTTTCCATGGATTGCAACCGCTGTAGCCCGCGCTATCTCTGGGGAAAGCCAAAGATGCATGTTGAAATCGCCGTGATGGTGATCTTCGTCACTTTTTTCCGCGTGGTCGTGatcatcatca > 1:1677723/1‑288 (MQ=255)
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ttttCGAAATAGCCGTAAGCATCGTGAAAAACGAAATAACCTTTCCCCTTGAGCGGCGCGAGCTCGTTACCAACCTGCGTTTCGGTTGAGGCTAATTGTGCCTCAAAATCCTTCAGGTTGGCGTCAAGTTTGGCTCGACTTTGCGGCATAAGTTCCACTAATTTTCCATGGATTGCAACCGCTGTAGCCCGCGCTATCTCTGGGGAAAGCCAAAGATGCATGTGGAAATCGCCTTGATGGTGATCTTCGTCACTTTTTTCCGCGTGGTCGTTATCATCATCATCGCCGt > 2:1266675/1‑289 (MQ=255)
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ccGTAAGCATCGTGAAAAACGAAATAACCTTTCCCCTTGAGCGGCGCGAGCTCGTTACCAACCTGCGTTTCGGTTGAGGCTAATTGTGCCTCAAAATCCTTCAGGTTGGCGTCAAGTTTGGCTCGACTTTGCGGCATAAGTTCCACTAATTTTCCATGGATTGCAACCGCTGTAGCCCGCGCTATCTCTGGGGAAAGCCAAAGATGCATGTTGAAATCGCCGTGATGGTGATCTTCGTCACTTTTTTCCGCGTGGTCGTGATCATCATCATCGCCGTGAATACTTTtca > 2:1389909/1‑289 (MQ=255)
aTCGTGAAAAACGAAATAACCTTTCCCCTTGAGCGGCGCGAGCTCGTTACCAACCTGCGTTTCGGTTGAGGCTAATTGTGCCTCAAAATCCTTCAGGTTGGCGTCAAGTTTGGCTCGACTTTGCGGCATAAGTTCCACTAATTTTCCATGGATTGCAACCGCTGTAGCCCGCGCTATCTCTGGGGAAAGCCAAAGATGCATGTTGAAATCGCCGTGATGGTGATCTTCGTCACTTTTTTCCGCGTGGTCGTGATCATCATCATCGCCGTGAATACTTTTCATCAGTAg < 1:407543/288‑1 (MQ=255)
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cGTGAAAAACGAAATAACCTTTCCCCTTGAGCGGCGCGAGCTCGTTACCAACCTGCGTTTCGGTTGAGGCTAATTGTGCCTCAAAATCCTTCAGGTTGGCGTCAAGTTTGGCTCGACTTTGCGGCATAAGTTCCACTAATTTTCCATGGATTGCAACCGCTGTAGCCCGCGCTa < 2:687813/174‑1 (MQ=255)
cGTGAAAAACGAAATAACCTTTCCCCTTGAGCGGCGCGAGCTCGTTACCAACCTGCGTTTCGGTTGAGGCTAATTGTGCCTCAAAATCCTTCAGGTTGGCGTCAAGTTTGGCTCGACTTTGCGGCATAAGTTCCACTAATTTTCCATGGATTGCAACCGCTGTAGCCCGCGCTATCTCTGGGGAAAGCCAAAGATGCATGTTGAAATCGCCGTGATGGTGATCTTCGTCACTTTTTTCCGCGTGGTCGTGATCATCATCATCGCCGTGAATACTTTTCATCAGTAGCgg > 1:806268/1‑289 (MQ=255)
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tGAAAAACGAAATAACCTTTCCCCTTGAGCGGCGCGAGCTCGTTACCAACCTGCGTTTCGGTTGAGGCTAATTGTGCCTCAAAATCCTTCAGGTTGGCGTCAAGTTTGGCTCGACTTTGCGGCATAAGTTCCACTAATTTTCCATGGATTGCAACCGCTGTAGCCCGCGCTATCTCTGGGGAAAGCCAAAGATGCATGTTGAAATCGCCGTGATGGTGATCTTCGTCACTTTTTTCCGCGTGGTCGTGATCATCATCATCGCCGTGAATACTTTTCATCAGTAGCGGtt > 2:118474/1‑289 (MQ=255)
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tGAGCGGCGCGAGCTCGTTACCAACCTGCGTTTCGGTTGAGGCTAATTGTGCCTCAAAATCCTTCAGGTTGGCGTCAAGTTTGGCTCGACTTTGCGGCATAAGTTCCACTAATTTTCCATGGATTGCAACCGCTGTAGCCCGCGCTATCTCTGGGGAAAGCCAAAGATGCATGTTGAAATCGCCGTGATGGTGATCTTCGTCACTTTTTTCCGCGTGGTCGTGATCATCATCATCGCCGTGAATACTTTTCATCAGTAGCGGTTTCACATCTTCAAGCTGCGCAATCGt > 1:962843/1‑289 (MQ=255)
gAGCGGCGCGAGCTCGTTACCAACCTGCGTTTCGGTTGAGGCTAATTGTGCCTCAAAATCCTTCAGGTTGGCGTCAAGTTTGGCTCGACTTTGCGGCATAAGTTCCACTAATTTTCCATGGATTGCAACCGCTGTAGCCCGCGCTATCTCTGGGGAAAGCCAAAGATGCATGTTGAAATCGCCGTGATGGTGATCTTCGTCACTTTTTTCcgcg > 2:12429/1‑214 (MQ=255)
gAGCGGCGCGAGCTCGTTACCAACCTGCGTTTCGGTTGAGGCTAATTGTGCCTCAAAATCCTTCAGGTTGGCGTCAAGTTTGGCTCGACTTTGCGGCATAAGTTCCACTAATTTTCCATGGATTGCAACCGCTGTAGCCCGCGCTATCTCTGGGGAAAGCCAAAGATGCATGTTGAAATCGCCGTGATGGTGATCTTCGTCACTTTTTTCCGCGTGGTCGTGATCATCATCATCGCCGTGAATACTTTTCATCAGTAGCGGTTTCACATCTTCAAGCTGCGCAATCGtt > 2:1091592/1‑289 (MQ=255)
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gcgAGCTCGTTACCAACCTGCGTTTCGGTTGAGGCTAATTGTGCCTCAAAATCCTTCAGGTTGGCGTCAAGTTTGGCTCGACTTTGCGGCATAAGTTCCACTAATTTTCCATGGATTGCAACCGCTGTAGCCCGCGCTATCTCTGGGGAAAGCCAAAGATGCATGTTGAAATCGCCGTGATGGTGATCTTCGTCACTTTTTTCCGCGTGGTCGTGATCATCATCATCGCCGTGAATACTTTtcat < 2:406844/245‑1 (MQ=255)
gCTCGTTACCAACCTGCGTTTCGGTTGAGGCTAATTGTGCCTCAAAATCCTTCAGGTTGGCGTCAAGTTTGGCTCGACTTTGCGGCATAAGTTCCACTAATTTTCCATGGATTGCAACCGCTGTAGCCCGCGCTATCTCTGGGGAAAGCCAAAGATGCATGTTGAAATCGCCGTGATGGTGATCTTCGTCACTTTTTTCCGCGTGGTCGTGATCATCATCATCGCCGTGAATACTTTTCATCAGTAGCGGTTTCACATCTTCAAGCTGCGCACTCGTTACCTGCTTc > 1:625622/1‑287 (MQ=255)
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aaCCTGCGTTTCGGTTGAGGCTAATTGTGCCTCAAAATCCTTCAGGTTGGCGTCAAGTTTGGCTCGACTTTGCGGCATAAGTTCCACTAATTTTCCATGGATTGCAACCGCTGTAGCCCGCGCTATCTCTGGGGAAAGCCAAAGATGCATGTTGAAATCGCCGTGATGGTGATCTTCGTCACTTTTTTCCGCGTGGTCGTGATCATCATCATCGCCGTGAATACTTTTCATCAGTAGCGGTTTCACATCTTCAAGCTGCGCAATCGTTACCTGCTTCGCTCCTGGTAAt > 1:169469/1‑289 (MQ=255)
aaCCTCCGTTTCGGTGGAGGCTAATGAGGCCTCAAAATCCTTCAGGTTGGCGTCAAGTTTGGCTCGACTTTGCGGCATAAGTTCCACTAATTTTCCATGGATTGCAACCGCTGTAGCCCGCGCTATCTCTGGGGAAAGCCAAAGATGCATGTTGAAATCGCCGTGATGGTGATCTTCGTCACTTTTTTCCGCGTGGTCGTGATCATCATCATCGCCGTGAATACTTTTCATCAGTAGCGGTTTCACATCTTCAAGCTGCGCAATCGTTACCTGCTTCGCTCCTGGTAAt < 2:428404/289‑1 (MQ=255)
ccTGCGTTTCGGTTGAGGCTAATTGTGCCTCAAAATCCTTCAGGTTGGCGTCAAGTTTGGCTCGACTTTGCGGCATAAGTTCCACTAATTTTCCATGGATTGCAACCGCTGTAGCCCGCGCTATCTCTGGGGAAAGCCAAAGATGCATGTTGAAATCGCCGTGATGGTGATCTTCGTCACTTTTTTCCGCGTGGTCGTGATCATCATCATCGCCGTGAATACTTTTCATCAGTAGCGGTTTCACATCTTCAAGCTGCGCAATCGTTACCTGCTTCGCTCCTGGTAAttt > 2:1769543/1‑289 (MQ=255)
cGTTTCGGTTGAGGCTAATTGTGCCTCAAAATCCTTCAGGTTGGCGTCAAGTTTGGCTCGACTTTGCGGCATAAGTTCCACTAATTTTCCATGGATTGCAACCGCTGTAGCCCGCGCTATCTCTGGGGAAAGCCAAAGATGCATGTTGAAATCGCCGTGATGGTGATCTTCGTCACTTTTTTCCGCGTGGTCGTGATCATCATCATCGCCGTGAATACTTTTCATCAGTAGCGGTTTCACATCTTCAAGCTGCGCAATCGTTACCTGCTTCGCTCCTGGTAATTTGCtt > 1:1626993/1‑289 (MQ=255)
|||
GGGATCCAACGTTCCCATACGAACGGATGTCCCTCGTGCGACGCTCTCAACGACCGCTGGCCTGAACTGTGGCTCAGCAAAAACGCAGGTTGCTTTTTGCTCAACCAACTGTGTTCTTATTTCATGTAAACGCTGCGCGCCAGGTTGAATCTCAGGGTTAACGGTAAAATGACCAAGCGGTGTCAGTCCAAACTGTTTTTCGAAATAGCCGTAAGCATCGTGAAAAACGAAATAACCTTTCCCCTTGAGCGGCGCGAGCTCGTTACCAACCTGCGTTTCGGTACTGGCTAATTGTGCCTCAAAATCCTTCAGGTTGGCGTCAAGTTTGGCTCGACTTTGCGGCATAAGTTCCACTAATTTTCCATGGATTGCAACCGCTGTAGCCCGCGCTATCTCTGGGGAAAGCCAAAGATGCATGTTGAAATCGCCGTGATGGTGATCTTCGTCACTTTTTTCCGCGTGGTCGTGATCATCATCATCGCCGTGAATACTTTTCATCAGTAGCGGTTTCACATCTTCAAGCTGCGCAATCGTTACCTGCTTCGCTCCTGGTAATTTGCTTA > CP042583/1622463‑1623025
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 11 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
GATK/CNVnator alignment
N/A