Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A2 F210 I1 R1
|
4928 |
368.7 |
6392010 |
97.5% |
6232209 |
231.9 |
Breseq alignment
BRESEQ :: Evidence
|
| evidence |
seq id |
position |
mutation |
annotation |
gene |
description |
| RA |
CP042583 |
1,531,040 |
3 bp→TCG |
intergenic (–/–) |
– / – |
–/– |
|
| |
seq id |
position |
ref |
new |
freq |
score (cons/poly) |
reads |
annotation |
genes |
product |
| * | CP042583 | 1,531,040 | 0 | A | T | 99.7%
| 882.1
/ NA
| 368 | intergenic (–/–) | –/– | –/– |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (0/0); major base T (186/181); minor base G (1/0); total (187/181) |
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 |
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.99e-01 |
| * | CP042583 | 1,531,041 | 0 | G | C | 99.7%
| 869.2
/ NA
| 368 | intergenic (–/–) | –/– | –/– |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (0/0); major base C (187/180); minor base A (0/1); total (187/181) |
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 4.92e-01 |
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 |
| * | CP042583 | 1,531,042 | 0 | C | G | 100.0%
| 874.1
/ NA
| 368 | intergenic (–/–) | –/– | –/– |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (0/0); new base G (187/181); total (187/181) |
Only 100 of 368 total aligned reads displayed.
AAATTAACACGAGAGTGGATTTTGTTACAGCACAGTCCGCAATTCCTGCTGACAAGTACCGGTTGGGTCATTACGATAACCACATCTATTGCGCCTGTGACAGGTGTGACCTTAAGTTGGGAGAATACATGCGAACCCTTTGGCGATTTATTGCCGGATTTTTTAAATGGACGTGGCGTCTGCTGAATTTCGTCCGTGAAATGGTACTTAACCTGTTCTTTATTTTCCTCGTACTGGTTGGTGTGGGGATTTGGATGCAGGTCAGTGGTGGTGATAGCAAAGAAACGGCCAGTCGTG‑‑GCGCACTGCTGCTGGACATTTCTGGTGTGATCGTCGATAAACCCGACAGTTCTCAGCGGTTTAGTAAATTAAGCCGCCAGCTGCTTGGTGCCAGTTCCGATCGTCTGCAGGAAAACAGTCTGTTTGATATCGTCAACACTATTCGCCAGGCGAAGGACGACCGCAATATCACCGGTATTGTGATGGATCTGAAAAACTTCGCAGGCGGCGACCAACCGTCTATGCAGTACATCGGCAAAGCTCTGAAAGAGTTTCGTGA > CP042583/1530765‑1531320
|||
aaaTTAACACGAGAGTGGATTTTGTTACAGCACAGTCCGCAATTCCTGCTGACAAGTACCGGTTGGGTCATTACGATAACCACATCTATTGCGCCTGTGATAGGTGTGACCTTAAGTTGGGAGAATACATGCGAACCCTTTGGCGATTTATTGCCGGATTTTTTAAATGGACGTGGCGTCTGCTGAATTTCGTCCGTGAAATGGTACTTAACCTGTTCTTTATTTTCCTCGTACTGGTTGGTGTGGGGATTTGGATGCAGGTCAGTGGTGGTGATTCGAAAGAAACGGc < 1:1975262/289‑1 (MQ=255)
tAACACGAGAGTGGATTTTGTTACAGCACAGTCCGCAATTCCTGCTGACAAGTACCGGTTGGGTCATTACGATAACCACATCTATTGCGCCTGTGACAGGTGTGACCTTAAGTTGGGAGAATACATGCGAACCCTTTGGCGATTTATTGCCGGATTTTTTAAATGGACGTGGCGTCTGCTGAATTTCGTCCGTGAAATGGTACTTAACCTGTTCTTTATTTTCCTCGTACTGGTTGGTGTGGGGATTTGGATGCAGGTCAGTGGTGGTGATTCGAAAGAAACGGCCAg > 1:2709887/1‑288 (MQ=255)
aTTTTGTTACAGCACAGTCCGCAATTCCTGCTGACAAGTACCGGTTGGGTCATTACGATAACCACATCTATTGCGCCTGTGACAGGTGTGACCTTAAGTTGGGAGAATACATGCGAACCCTTTGGCGATTTATTGCCGGATTTTTTAAATGGACGTGGCGTCTGCTGAATTTCGTCCGTGAAATGGTACTTAACCTGTTCTTTATTTTCCTCGTACTGGTTGGTGTGGGGATTTGGATGCAGGTCAGTGGTGGTGATTCGAAAGAAACGGCCAGTCg < 2:844109/277‑1 (MQ=255)
ttACAGCACAGGCCGCAATTCCTGCTGACAAGTACCGGTTGGGTCATTACGATAACCACATCTATTGCGCCTGTGACAGGTGTGACCTTAAGTTGGGAGAATACATGCGAACCCTTTGGCGATTTATTGCCGGATTTTTTAAATGGACGTGGCGTCTGCTGAATTTCGTCCGTGAAATGGTACTTAACCTGTTCTTTATTTTCCTCGTACTGGTTGGTGTGGGGATTTGGATGCAGGTCAGTGGTGGTGATTCGAAAGAAACGGCCAGTCGTG‑‑GCGCACTGCTGCTGGa < 1:2850393/289‑1 (MQ=255)
cacaGTCCGCAATTCCTGCTGACAAGTACCGGTTGGGTCATTACGATAACCACATCTATTGCGCCTGTGACAGGTGTGACCTTAAGTTGGGAGAATACATGCGAACCCTTTGGCGATTTATTGCCGGATTTTTTAAATGGACGTGGCGTCTGCTGAATTTCGTCCGTGAAATGGTACTTAACCTGTTCTTTATTTTCCTCGTACTGGTTGGTGTGGGGATTTGGATGCAGGTCAGTGGTGGTGATTCGAAAGAAACGGCCAGTCGTG‑‑GCGCACTGCTGCTGGACAtt > 1:3102262/1‑287 (MQ=255)
cacaGTCCGCAATTCCTGCTGACAAGTACCGGTTGGGTCATTACGATAACCACATCTATTGCGCCTGTGAAAGGTGTGACCTTAAGTTGGGAGAATACATGCGAACCCTTTGGCGATTTATTGCCGGATTTTGTAAATGGACGTGGCGTCTGCTGAATTTCGTCCGTGAAATGGTACTTAACCTGTTCTTTATTTTCCTCGTACTGGTTGGTGTGGGGATTTGGATGCAGGTCAGTGGTGGTGATTCGAAAGAAACGGCCAGTCGTG‑‑GCGCAc < 1:540256/273‑1 (MQ=255)
caGTCCGCAATTCCTGCTGACAAGTACCGGTTGGGTCATTACGATAACCACATCTATTGCGCCTGTGACAGGTGTGACCTTAAGTTGGGAGAATACATGCGAACCCTTTGGCGATTTATTGCCGGATTTTTTAAATGGACGTGGCGTCTGCTGAATTTCGTCCGTGAAATGGTACTTAACCTGTTCTTTATTTTCCTCGTACTGGTTGGTGTGGGGATTTGGATGCAGGTCAGTGGTGGTGATTCGAAAGAAACGGCCAGTCGTG‑‑GCGCACTGCTGCTGGACa < 2:2099937/283‑1 (MQ=255)
caGTCCGCAATTCCTGCTGACAAGTACCGGTTGGGTCATTACGATAACCACATCTATTGCGCCTGTGACAGGTGTGACCTTAAGTTGGGAGAATACATGCGAACCCTTTGGCGATTTATTGCCGGATTTTTTAAATGGACGTGGCGTCTGCTGAATTTCGTCCGTGAAATGGTACTTAACCTGTTCTTTATTTTCCTCGTACTGGTTGGTGTGGGGATTTGGATGCAGGTCAGTGGTGGTGATTCGAAAGAAACGGCCAGTCGTG‑‑GCGCACTGCTGCTGGACATTTCTg > 1:2629019/1‑289 (MQ=255)
gTCCGCAATTCCTGCTGACAAGTACCGGTTGGGTCATTACGATAACCACATCTATTGCGCCTGTGACAGGTGTGACCTTAAGTTGGGAGAATACATGCGAACCCTTTGGCGATTTATTGCCGGATTTTTTAAATGGACGTGGCGTCTGCTGAATTTCGTCCGTGAAATGGTACTTAACCTGTTCTTTATTTTCCTCGTACTGGTTGGTGTGGGGATTTGGATGCAGGTCAGTGGTGGTGATTCGAAAGAAACGGCCAGTCGTG‑‑GCGCACTGCTGCTGGACATTTCTGgt > 1:2365754/1‑289 (MQ=255)
tCCGCAATTCCTGCTGACAAGTACCGGTTGGGTCATTACGATAACCACATCTATTGCGCCTGTGACAGGTGTGACCTTAAGTTGGGAGAATACATGCGAACCCTTTGGCGATTTATTGCCGGATTTTTTAAATGGACGTGGCGTCTGCTGAATTTCGTCCGTGAAATGGTACTTAACCTGTTCTTTATTTTCCTCGTACTGGTTGGTGTGGGGATTTGGATGCAGGTCAGTGGTGGTGATTCGAAAGAAACGGCCAg > 2:3112431/1‑257 (MQ=255)
tCCGCAATTCCTGCTGACAAGTACCGGTTGGGTCATTACGATAACCACATCTATTGCGCCTGTGACAGGTGTGACCTTAAGTTGGGAGAATACATGCGAACCCTTTGGCGATTTATTGCCGGATTTTTTAAATGGACGTGGCGTCTGCTGAATTTCGTCCGTGAAATGGTACTTAACCTGTTCTTTATTTTCCTCGTACTGGTTGGTGTGGGGATTTGGATGCAGGTCAGTGGTGGTGATTCGAAAGAAACGGCCAGTCGTG‑‑GCGCACTGCTGCTGGACATTTCTGgtg > 2:882397/1‑289 (MQ=255)
tCCGCAATTCCTGCTGACAAGTACCGGTTGGGTCATTACGATAACCACATCTATTGCGCCTGTGACAGGTGTGACCTTAAGTTGGGAGAATACATGCGAACCCTTTGGCGATTTATTGCCGGATTTTTTAAATGGACGTGGCGTCTGCTGAATTTCGTCCGTGAAATGGTACTTAACCTGTTCTTTATTTTCCTCGTACTGGTTGGTGGGGGGATTTGGATGCAGGTCAGTGGTGGTGATTCGAAAGAAACGGCCAGTCGTG‑‑GCGCACTGCTGCTGGACATTTCTGgtg > 1:1260406/1‑289 (MQ=255)
tCCGCAATTCCTGCTGACAAGTACCGGTTGGGTCATTACGATAACCACATCGATTGCGCCTGAGACACGTGTGACCTTAAGTTGGGAGAATACATGCGAACCCTTTGGCGATTTATTGCAGGATTTTATAAATGGACGTGGCGTCTGCTGAATTTCGTCCGCGAAATGGTACTTAACATGTTCTTTATTTTCCTCGTACTGGGTGGTGTGGGGCTGTGGATGCAGGTCAGTGGTGGTGATTCGAAAGAAACGGCTAGTCGTG‑‑GCGCACTGCCGCTGGACATTACTGgtg > 2:2759084/1‑289 (MQ=255)
aaTTCCTGCTGACAAGTACCGGTTGGGTCATTACGATAACCACATCTATTGCGCCTGTGACAGGTGTGACCTTAAGTTGCGAGAATACATGCGAACCCTTTGGCGATTTATTGCCGGATTTTTTAAATGGACGTGTCGTCTGCTGAATTTCGTCCGTGAAATGGTCATTAACCTGTTCTTTACTTTCCTCGTACTGGATGGTGTGGGGATTTGGATGCAGGTCAGTGGTGGTGATTCGAAAGAATGGGCCAGTCGTG‑‑GCGCCGTGCTGCTGGa > 2:540256/1‑273 (MQ=255)
ctgctgACAAGTACCGGTTGGGTCATTACGATAACCACATCTATTGCGCCTGTGACAGGTGTGACCTTAAGTTGGGAGAATACATGCGAACCCTTTGGCGATTTATTGCCGGATTTTTTAAATGGACGTGGCGTCTGCTGAATTTCGTCCGTGAAATGGTACTTAACCTGTTCTTTATTTTCCTCGTACTGGTTGGTGTGGGGATTTGGATGCAGGTCAGTGGTGGTGATTCGAAAGAAACGGc > 2:2958270/1‑244 (MQ=255)
ctgctgACAAGTACCGGTTGGGTCATTACGATAACCACATCTATTGCGCCTGTGACAGGTGTGACCTTAAGTTGGGAGAATACATGCGAACCCTTTGGCGATTTATTGCCGGATTTTTTAAATGGACGTGGCGTCTGCTGAATTTCGTCCGTGAAATGGTACTTAACCTGTTCTTTATTTTCCTCGTACTGGTTGGTGTGGGGATTTGGATGCAGGTCAGTGGTGGTGATTCGAAAGAAACGGc < 1:2958270/244‑1 (MQ=255)
ctgctgACAAGTACCGGTTGGGTCATTACGATAACCACATCTATTGCGCCTGTGACAGGTGTGACCTTAAGTTGGGAGAATACATGCGAACCCTTTGGCGATTTATTGCCGGATTTTTTAAATGGACGTGGCGTCTGCTGAATTTCGTCCGTGAAATGGTACTTAACCTGTTCTTTATTTTCCTCGTACTGGTTGGTGTGGGGATTTGGATGCAGGTCAGTGGTGGTGATTCGAAAGAAACGGCCAGTCGTG‑‑gcg > 2:2020627/1‑255 (MQ=255)
ctgctgACAAGTACCGGTTGGGTCATTACGATAACCACATCTATTGCGCCTGTGACAGGTGTGACCTTAAGTTGGGAGAATACATGCGAACCCTTTGGCGATTTATTGCCGGATTTTTTAAATGGACGTGGCGTCTGCTGAATTTCGTCCGTGAAATGGTACTTAACCTGTTCTTTATTTTCCTCGTACTGGTTGGTGTGGGGATTTGGATGCAGGTCAGTGGTGGTGATTCGAAAGAAACGGCCAGTCGTG‑‑GCGCACTGCTGCTGGACATTTCTGGTGTGATCGTCGa > 1:894044/1‑289 (MQ=255)
aGTACCGGTTGGGTCATTACGATAACCACATCTATTGCGCCTGTGACAGGTGTGACCTTAAGTTGGGAGAATACATGCGAACCCTTTGGCGATTTATTGCCGGATTTTTTAAATGGACGTGGCGTCTGCTGAATTTCGTCCGTGAAATGGTACTTAACCTGTTCTTTATTTTCCTCGTACTGGTTGGTGTGGGGATTTGGATGCAGGTCAGTGGTGGTGATTCGAAAGAAACGGCCAGTCGTG‑‑GCGCACTGCTGCTGGACATTTCTGGTGTGATCGTCGATAAACCCGa < 1:435352/289‑1 (MQ=255)
gTTGGGTCATTACGATAACCACATCTATTGCGCCTGTGACAGGTGTGACCTTAAGTTGGGAGAATACATGCGAACCCTTTGGCGATTTATTGCCGGATTTTTTAAATGGACGTGGCGTCTGCTGAATTTCGTCCGTGAAATGGTACTTAACCTGTTCTTTATTTTCCTCGTACTGGTTGGTGTGGGGATTTGGATGCAGGTCAGTGGTGGTGATTCGAAAGAAACGGCCAGTCGTG‑‑GCGCACTGCTGCTGGACATTTCTGGTGTGAtc < 2:149047/268‑1 (MQ=255)
tGGGTCATTACGATAACCACATCTATTGCGCCTGTGACAGGTGTGACCTTAAGTTGGGAGAATACATGCGAACCCTTTGGCGATTTATTGCCGGATTTTTTAAATGGACGTGGCGTCTGCTGAATTTCGTCCGTGAAATGGTACTTAACCTGTTCTTTATTTTCCTCGTACTGGTTGGTGTGGGGATTTGGATGCAGGTCAGTGGTGGTGATTCGAAAGAAACGGCCAGTCGTG‑‑GCGCACTGCTGCTGGa < 2:791027/250‑1 (MQ=255)
tGGGTCATTACGATAACCACATCTATTGCGCCTGTGACAGGTGTGACCTTAAGTTGGGAGAATACATGCGAACCCTTTGGCGATTTATTGCCGGATTTTTTAAATGGACGTGGCGTCTGCTGAATTTCGTCCGTGAAATGGTACTTAACCTGTTCTTTATTTTCCTCGTACTGGTTGGTGTGGGGATTTGGATGCAGGTCAGTGGTGGTGATTCGAAAGAAACGGCCAGTCGTG‑‑GCGCACTGCTGCTGGACATTTCTGGTGTGATCGTCGATAAACCCGACAGTTCTCa > 1:2256714/1‑289 (MQ=255)
tGGGTCATTACGATAACCACATCTATTGCGCCTGTGACAGGTGTGACCTTAAGTTGGGAGAATACATGCGAACCCTTTGGCGATTTATTGCCGGATTTTTTAAATGGACGTGGCGTCTGCTGAATTTCGTCCGTGAAATGGTACTTAACCTGTTCTTTATTTTCCTCGTACCGGTTGGTGTGGGGATTTGGATGCAGGTCAGTGGTGGTGATTCGAAAGAAACGGCCAGTCGTG‑‑GCGCACTGCTGCTGGACATTTCTGGTGTGATCGTCGATAAACCCGACAGTTCTCa > 2:362255/1‑289 (MQ=255)
gTCATTACGATAACCACATCTATTGCGCCTGTGACAGGTGTGACCTTAAGTTGGGAGAATACATGCGAACCCTTTGGCGATTTATTGCCGGATTTTTTAAATGGACGTGGCGTCTGCTGAATTTCGTCCGTGAAATGGTACTTAACCTGTTCTTTATTTTCCTCGTACTGGTTGGTGTGGGGATTTGGATGCAGGTCAGTGGTGGTGATTCGAAAGAAACGGCCAGTCGTG‑‑GCGCActgctgct > 2:1912711/1‑244 (MQ=255)
gTCATTACGATAACCACATCTATTGCGCCTGTGACAGGTGTGACCTTAAGTTGGGAGAATACATGCGAACCCTTTGGCGATTTATTGCCGGATTTTTTAAATGGACGTGGCGTCTGCTGAATTTCGTCCGTGAAATGGTACTTAACCTGTTCTTTATTTTCCTCGTACTGGTTGGTGTGGGGATTTGGATGCAGGTCAGTGGTGGTGATTCGAAAGAAACGGCCAGTCGTG‑‑GCGCACTGCTGCTGGACATTTCTGGTGTGATCGTCGATAAACCCGACAGTTCTCAg < 1:2487815/287‑1 (MQ=255)
cATTACGATAACCACATCTATTGCGCCTGTGACAGGTGTGACCTTAAGTTGGGAGAATACATGCGAACCCTTTGGCGATTTATTGCCGGATTTTTTAAATGGACGTGGCGTCTGCTGAATTTCGTCCGTGAAATGGTACTTAACCTGTTCTTTATTTTCCTCGTACTGGTTGGTGTGGGGATTTGGATGCAGGTCAGTGGTGGTGATTCGAAAGAAACGGCCAGTCGTG‑‑GCGCACTGCTGCTGGACATTTCTGGTGTGATCGTCGATAAACCCGACAGTTCTCAGCgg < 1:1567741/288‑1 (MQ=255)
tACGATAACCACATCTATTGCGCCTGTGACAGGTGTGACCTTAAGTTGGGAGAATACATGCGAACCCTTTGGCGATTTATTGCCGGATTTTTTAAATGGACGTGGCGTCTGCTGAATTTCGTCCGTGAAATGGTACTTAACCTGTTCTTTATTTTCCTCGTACTGGTTGGTGTGGGGATTTGGATGCAGGTCAGTGGTGGTGATTCGAAAGAAACGGCCAGTCGTG‑‑GCGCACTGCTGCTGGACATTTCTGGTGTGATCGTCGATaaa > 2:1767106/1‑267 (MQ=255)
tACGATAACCACATCTATTGCGCCTGTGACAGGTGTGACCTTAAGTTGGGAGAATACATGCGAACCCTTTGGCGATTTATTGCCGGATTTTTTAAATGGACGTGGCGTCTGCTGAATTTCGTCCGTGAAATGGTACTTAACCTGTTCTTTATTTTCCTCGTACTGGTTGGTGTGGGGATTTGGATGCAGGTCAGTGGTGGTGATTCGAAAGAAACGGCCAGTCGTG‑‑GCGCACTGCTGCTGGACATTTCTGGTGTGATCGTCGATaaa < 1:1767106/267‑1 (MQ=255)
tAACCACATCTATTGCGCCTGTGACAGGTGTGACCTTAAGTTGGGAGAATACATGCGAACCCTTTGGCGATTTATTGCCGGATTTTTTAAATGGACGTGGCGTCTGCTGAATTTCGTCCGTGAAATGGTACTTAACCTGTTCTTTATTTTCCTCGTACTGGTTGGTGTGGGGATTTGGATGCAGGTCAGTGGTGGTGATTCGAAAGAAACGGCCAGTCGTG‑‑GCGCACTGCTGCTGGACATTTCTGGTGTGATCGTCGATAAACCCGACAGTTCTCAg < 2:2154163/277‑1 (MQ=255)
tAACCACATCTATTGCGCCTGTGACAGGTGTGACCTTAAGTTGGGAGAATACATGCGAACCCTTTGGCGATTTATTGCCGGATTTTTTAAATGGACGTGGCGTCTGCTGAATTTCGTCCGTGAAATGGTACTTAACCTGTTCTTTATTTTCCTCGTACTGGTTGGTGTGGGGATTTGGATGCAGGTCAGTGGTGGTGATTCGAAAGAAACGGCCAGTCGTG‑‑GCGCACTGCTGCTGGACATTTCTGGTGTGATCGTCGATAAACCCGACAGTTCTCAGCGGTTTAGTaaa > 1:3040155/1‑289 (MQ=255)
acaTCTATTGCGCCTGTGACAGGTGTGACCTTAAGTTGGGAGAATACATGCGAACCCTTTGGCGATTTATTGCCGGATTTTTTAAATGGACGTGGCGTCTGCTGAATTTCGTCCGTGAAATGGTACTTAACCTGTTCTTTATTTTCCTCGTACTGGTTGGTGTGGGGATTTGGATGCAGGTCAGTGGTGGTGATTCGAAAGCAACGGCCAGTCGTG‑‑GCGCACTGCTGCGGGACATTTCTGGTGTGATCGGCGCTATACCCGACAGTTCTCTGCGGTTTAGTAAATTaac > 2:500394/1‑288 (MQ=255)
aTCTATTGCGCCTGTGACAGGTGTGACCTTAAGTTGGGAGAATACATGCGAACCC‑TTGGCGATTTATTGCCGGATTTTTTAAATGGACGTGGCGTCTGCTGAATTTCGTCCGTGAAATGGTACTTAACCTGTTCTTTATTTTCCTCGTACTGGTTGGTGTGGGGATTTGGATGCAGGTCAGTGGTGGTGATTCGAAAGAAACGGc < 1:778155/205‑1 (MQ=255)
aTCTATTGCGCCTGTGACAGGTGTGACCTTAAGTTGGGAGAATACATGCGAACCC‑TTGGCGATTTATTGCCGGATTTTTTAAATGGACGTGGCGTCTGCTGAATTTCGTCCGTGAAATGGTACTTAACCTGTTCTTTATTTTCCTCGTACTGGTTGGTGTGGGGATTTGGATGCAGGTCAGTGGTGGTGATTCGAAAGAAACGGc > 2:778155/1‑205 (MQ=255)
tCTATTGCGCCTGTGACAGGTGTGACCTTAAGTTGGGAGAATACATGCGAACCCTTTGGCGATTTATTGCCGGATTTTTTAAATGGACGTGGCGTCTGCTGAATTTCGTCCGTGAAATGGTACTTAACCTGTTCTTTATTTTCCTCGTACTGGTTGGTGTGGGGATTTGGATGCAGGTCAGTGGTGGTGATTCGAAAGAAACGGCCAGTCGTG‑‑GCGCACTGCTGCTGGACATTTCTGgtg < 1:2796097/240‑1 (MQ=255)
tGCGCCTGTGACAGGTGTGACCTTAAGTTGGGAGAATACATGCGAACCCTTTGGCGATTTATTGCCGGATTTTTTAAATGGACGTGGCGTCTGCTGAATTTCGTCCGTGAAATGGTACTTAACCTGTTCTTTATTTTCCTCGTACTGGTTGGTGTGGGGATTTGGATGCAGGTCAGTGGTGGTGATTCGAAAGAAACGGc < 1:872410/200‑1 (MQ=255)
gcgcCTGTGACAGGTGTGACCTTAAGTTGGGAGAATACATGCGAACCCTTTGGCGATTTATTGCCGGATTTTTTAAATGGACGTGGCGTCTGCTGAATTTCGTCCGTGAAATGGTACTTAACCTGTTCTTTATTTTCCTCGTACTGGTTGGTGTGGGGATTTGGATGCAGGTCAGTGGTGGTGATTCGAAAGAAACGGCCAGTCGTG‑‑GCGCACTGCTGCTGGACATTTCTGGTGTGATCGTCGATAAACCCGACAGTTCTCAGCGGTTTAGTAAATTAAGCCGCCa > 2:2311517/1‑286 (MQ=255)
ccTGTGACAGGTGTGACCTTAAGTTGGGAGAATACATGCGAACCCTTTGGCGATTTATTGCCGGATTTTTTAAATGGACGTGGCGTCTGCTGAATTTCGTCCGTGAAATGGTACTTAACCTGTTCTTTATTTTCCTCGTACTGGTTGGTGTGGGGATTTGGATGCAGGTCAGTGGTGGTGATTCGAAAGAAACGGCCAGTCGTG‑‑GCGCACTGCTGCTGGACATTTCTGGTGTGATCGTCGATAAAcc > 1:769387/1‑247 (MQ=255)
ccTGTGACAGGTGTGACCTTAAGTTGGGAGAATACATGCGAACCCTTTGGCGATTTATTGCCGGATTTTTTAAATGGACGTGGCGTCTGCTGAATTTCGTCCGTGAAATGGTACTTAACCTGTTCTTTATTTTCCTCGTACTGGTTGGTGTGGGGATTTGGATGCAGGTCAGTGGTGGTGATTCGAAAGAAACGGCCAGTCGTG‑‑GCGCACTGCTGCTGGACATTTCTGGTGTGATCGTCGATAAACCCGACAGTTCTCAGCGGTTTAGTAAATTAAGCCGCCAgctgct > 2:1654495/1‑289 (MQ=255)
ccTGTGACAGGTGTGACCTTAAGTTGGGAGAATACATGCGAACCCTTTGGCGATTTATTGCCGGATTTTTTAAATGGACGTGGCGTCTGCTGAATTTCGTCCGTGAAATGGTACTTAACCTGTTCTTTATTTTCCTCGTACTGGTTGGTGTGGGGATTTGGATGCAGGTCAGTGGTGGTGATTCGAAAGAAACGGCCAGTCGTG‑‑GCGCACTGCTGCTGGACATTTCTGGTGTGATCGTCGATAAACCCGACAGTTCTCAGCGGTTTAGTAAATTAAGCCGCCAgctgct > 1:1658742/1‑289 (MQ=255)
tgtgACAGGTGTGACCTTAAGTTGGGAGAATACATGCGAACCCTTTGGCGATTTATTGCCGGATTTTTTAAATGGACGTGGCGTCTGCTGAATTTCGTCCGTGAAATGGTACTTAACCTGTTCTTTATTTTCCTCGTACTGGTTGGTGTGGGGATTTGGATGCAGGTCAGTGGTGGTGATTCGAAAGAAACGGCCAGTCGTG‑‑GCGCACTGCTGCTGGa > 1:666109/1‑218 (MQ=255)
tgtgACAGGTGTGACCTTAAGTTGGGAGAATACATGCGAACCCTTTGGCGATTTATTGCCGGATTTTTTAAATGGACGTGGCGTCTGCTGAATTTCGTCCGTGAAATGGTACTTAACCTGTTCTTTATTTTCCTCGTACTGGTTGGTGTGGGGATTTGGATGCAGGTCAGTGGTGGTGATTCGAAAGAAACGGCCAGTCGTG‑‑GCGCACTGCTGCTGGa < 2:1683006/218‑1 (MQ=255)
tgtgACCTTAAGTTGGGAGAATACATGCGAACCCTTTGGCGATTTATTGCCGGATTTTTTAAATGGACGTGGCGTCTGCTGAATTTCGTCCGTGAAATGGTACTTAACCTGTTCTTTATTTTCCTCGTACTGGTTGGTGTGGGGATTTGGATGCAGGTCAGTGGTGGTGATTCGAAAGAAACGGCCAGTCGTG‑‑GCGCACTGCTGCTGGACATTTCTGGTGTGATCGTCGATAAACCCGACAGTTCTCAGCGGTTTAGTAAATTAAGCCGCCAGCTGCTTGGTGCCAGt > 1:3003425/1‑288 (MQ=255)
tgACCTTAAGTTGGGAGAATACATGCGAACCCTTTGGCGATTTATTGCCGGATTTTTTAAATGGACGTGGCGTCTGCTGAATTTCGTCCGTGAAATGGTACTTAACCTGTTCTTTATTTTCCTCGTACTGGTTGGTGTGGGGATTTGGATGCAGGTCAGTGGTGGTGATTCGAAAGAAACGGCCAGTCGTG‑‑GCGCACTGCTGCTGGACATTTCTGGTGTGATCGTCGATAAACCCGACAGTTCTCAGCGGTTTAGTAAATTAAGCCGCCAGCTGCtt > 1:2539358/1‑277 (MQ=255)
cTTAAATTGGGATAAGACAGGCGAACCCGTGGGCGATTTATTTGCGGGTTTTTTAAATGGACGTGGCGTCTGCGGAATTTCGTCCGTGAAATGGTACTTAACCTGTTCTTTATTTTCCTCGGACTGGTTGGTGTGGGGATTTGGATGCAGGTCAGTGGTGGTGATTCGAAAGAAACGGCCAGTCGTG‑‑GCGCACTGCTGCTGGACATTTCTGGTGTGATCGTCGATAAACCCGACAGTTCTCAGCGGTTTAGTAAATTAAGCCGCCAGCTGCTTGGTGCCAGTTCCGATc < 2:1374975/289‑1 (MQ=255)
aaGTTGGGAGAATACATGCGAACCCTTTGGCGATTTATTGCCGGATTTTTTAAATGGACGTGGCGTCTGCTGAATTTCGTCCGTGAAATGGTACTTAACCTGTTCTTTATTTTCCTCGTACTGGTTGGTGTGGGGATTTGGATGCAGGTCAGTGGTGGTGATTCGAAAGAAACGGCCAGTCGTG‑‑GCGCACTGCTGCTGGACATTTCTGGTGTGATCGTCGATAAACCCGACAGTTCTCAGCGGTTTAGTAAATTAAGCCGCCAGCTGCTTGGTGCCAGTTCCGATCGTc < 1:1047157/289‑1 (MQ=255)
aaGTTGGGAGAATACATGCGAACCCTTTGGCGATTTATTGCCGGATTTTTTAAATGGACGTGGCGTCTGCTGAATTTCGTCCGTGAAATGGTACTTAACCTGTTCTTTATTTTCCTCGTACTGGTTGGTGTGGGGATTTGGATGCAGGTCAGTGGTGGTGATTCGAAAGAAACGGCCAGTCGTG‑‑GCGACCTGCTGCTGGACATTTCTGGTGTGATCGTCGATAAACCCGACAGTTCTCAGCGGTGTAGTAAATTAAGCCGCCAGCTGCTTGGTGCCAGTTcggtccg > 2:2276354/1‑281 (MQ=255)
aaGTTGGGAGAATACATGCGAACCCTTTGGCGATTTATTGCCGGATTTTTTAAATGGACGTGGCGTCTGCTGAATTTCGTCCGTGAAATGGTACTTAACCAGTTCTTTATTTTCCTCGTACTGGTTGGTGTGGGGATTTGGATGCAGGTCAGTGGTGGTGATTCGAAAGAAACGGCCAGTCGTG‑‑GCGCACTGCTGCTGGACATTTCTGGTGTGATCGTCGATAAACCCGACAGTTCTCAGCGGTTTAGTAAATTAAGCCGCCAGCTGCTTGGTGCCAGTTCCGATCg > 1:1882031/1‑287 (MQ=255)
aGTTGGGAGAATACATGCGAACCCTTTGGCGATTTATTGCCGGATTTTTTAAATGGACGTGGCGTCTGCTGAATTTCGTCCGTGAAATGGTACTTAACCTGTTCTTTATTTTCCTCGTACTGGTTGGTGTGGGGATTTGGATGCAGGTCAGTGGTGGTGATTCGAAAGAAACGGCCAGTCGTG‑‑GCGCACTGCTGCTGGACAt > 1:1310237/1‑202 (MQ=255)
aGTTGGGAGAATACATGCGAACCCTTTGGCGATTTATTGCCGGATTTTTTAAATGGACGTGGCGTCTGCTGAATTTCGTCCGTGAAATGGTACTTAACCTGTTCTTTATTTTCCTCGTACTGGTTGGTGTGGGGATTTGGATGCAGGTCAGTGGTGGTGATTCGAAAGAAACGGCCAGTCGTG‑‑GCGCACTGCTGCTGGACATTTCTGGTGTGATCGTCGATaaa < 2:1232680/224‑1 (MQ=255)
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|||
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|
| Alignment Legend |
|---|
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Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
GATK/CNVnator alignment
N/A
