Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A3 F210 I1 R1
|
4927 |
250.2 |
4002508 |
96.7% |
3870425 |
266.6 |
Breseq alignment
BRESEQ :: Evidence
|
| evidence |
seq id |
position |
mutation |
annotation |
gene |
description |
| RA |
CP042583 |
1,492,636 |
3 bp→TCG |
intergenic (–/–) |
– / – |
–/– |
|
| |
seq id |
position |
ref |
new |
freq |
score (cons/poly) |
reads |
annotation |
genes |
product |
| * | CP042583 | 1,492,636 | 0 | A | T | 99.6%
| 541.0
/ NA
| 228 | intergenic (–/–) | –/– | –/– |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (0/0); major base T (88/139); minor base G (0/1); total (88/140) |
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 |
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 |
| * | CP042583 | 1,492,637 | 0 | G | C | 99.6%
| 535.5
/ NA
| 228 | intergenic (–/–) | –/– | –/– |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (0/0); major base C (87/140); minor base T (1/0); total (88/140) |
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 3.86e-01 |
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 |
| * | CP042583 | 1,492,638 | 0 | C | G | 99.6%
| 535.0
/ NA
| 228 | intergenic (–/–) | –/– | –/– |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (0/0); major base G (88/139); minor base A (0/1); total (88/140) |
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 |
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 |
Only 100 of 228 total aligned reads displayed.
CGCCCGCGCTTTTGGGCATCGTGGTTTTACCCACAGTCTGCTGGCGGTATTTGCGCTGCTGGCAACCTTTTACCTTAAGGTTCCGGAAGGCTGGTTCATTCCGGCTGATGCGCTACAAGGAATGGTGCTGGGTTATTTGAGCCACAT‑ACTTGCCGATATGCTGACACCCGCCGGTGTTCCCCTGCTCTGGCCATGCCGCTGGCGTTTCCGCTTGCCTATCCTGGTTCCCCAAAAGGGCAACCAACTGGAACGTTTTATCTGCATGGCATTATTTGTCTGGAGCGTATGGATGCCCCATAGTTTACCCGAGAACAGCGCTGTTCGTTGGAGTAGCCAAATGATCAATACCTTGCAGATCCAGTTTCATCGGCTTATTAAGCATCAGGTTGAATACTAAAAAGGCAAAAATCACCTTTCTGGAATAAGCAATTCCATTTGAATATAAGAGCCAGCTCACAGTTCTGTTAATCTTGCGCCAACACTATGACTGCTACGCAGTGATAGAAATAATAAGATCAGGAGAACGGGGATGAACTTTCCATTAATTGCGAACATCGTGGT > CP042583/1492356‑1492916
|||
cGCCCGCGCTTTTGGGCATCGTGGTTTTACCCACAGTCTGCTGGCGGTATTTGCGCTGCTGGCAACCTTTTACCTTAAGGTTCCGGAAGGCTGGTTCATTCCGGCTGATGCGCTACAAGGAATGGTGCTGGGTTATTTGAGCCACAT‑ACTTGCCGATATGCTGACACCCGCCGGTGTTCCCCTGCTCTGGCCATGCCGCTGGCGTTTCCGCTTGCCTATCCTGGTTCCCCAAAAGGGCAACCAACTGGAACGTTTTATCTGCATGGCATTATTTGTCTGGTCGGTATgg < 1:1487568/289‑1 (MQ=255)
cccGCGCTTTTGGGCATCGTGGTTTTACCCACAGTCTGCTGGCGGTATTTGCGCTGCTGGCAACCTTTTACCTTAAGGTTCCGGAAGGCTGGTTCATTCCGGCTGATGCGCTACAAGGAATGGTGCTGGGTTATTTGAGCCACAT‑ACTTGCCGATATGCTGACACCCGCCGGTGTTCCCCTGCTCTGGCCATGCCGCTGGCGTTTCCGCTTGCCTATCCTGGTTCCCCAAAAGGGCAACCAACTGGAACGTTTTATCTGCATGGCATTATTTGTCTGGTCGGTATGGAt < 1:1997471/289‑1 (MQ=255)
gggCATCGTGGTTTTACCCACAGTCTGCTGGCGGTATTTGCGCTGCTGGCAACCTTTTACCTTAAGGTTCCGGAAGGCTGGTTCATTCCGGCTGATGCGCTACAAGGAATGGTGCTGGGTTATTTGAGCCACAT‑ACTTGCCGATATGCTGACACCCGCCGGTGTTCCCCTGCTCTGGCCATGCCGCTGGCGTTTCCGCTTGCCTATCCTGGTTCCCCAAAAGGGCCACCAACTGGAACGGTTTATCTGCCTGGCATTATTTGTCTGGTCGGTATGGATTCCCCAttcat > 2:1129837/1‑285 (MQ=255)
gggCATCGTGGTTTTACCCACAGTCTGCTGGCGGTATTTGCGCTGCTGGCAACCTTTTACCTTAAGGTTCCGGAAGGCTGGTTCATTCCGGCTGATGCGCTACAAGGAATGGTGCTGGGTTATTTGAGCCACAT‑ACTTGCCGATATGCTGACACCCGCCGGTGTTCCCCTGCTCTGGCCATGCCGCTGGCGTTTCCGCTTGCCTATCCTGGTTCCCCAAAAGGGCAACCAACTGGAACGTTTTATCTGCATGGCATTATTTGTCTGGTCGGTATGGATGCCCCAttcat < 1:456790/289‑5 (MQ=255)
ggCATCGTGGTTTTACCCGCGCTTGGTTGGTGGTGTTTGCGTTGCTGGCAACCTTTTACCTTAAGGTTCCGGAAGGTTGGTTCATTCCGGCTGATGCGCTACAAGGAATGGGGCTGGGTTATTTGAGCCACAT‑ACTTGCCGATATGCTGACACCCGCCGGTGTTCCCCTGCTCTGGCCATGCCGCTGGCGTTTCCGCTTGCCTATCCTGGTTCCCCAAAAGGGCAACCAACTGGAACGTTTTATCTGCATGGCATTATTTGTCTGGTCGGTATGGATGCCCCAttcat < 2:1794707/288‑5 (MQ=255)
gtgTGGTTTTACCCACAGTCTGCTGTCGGTATTTTCGCTTCTGCCAACCTTTTACCTTAAGGTTCCGGAAGGCTGGTTCATTCCGGATGATGCCCTACAAGGAATGGTGCTGGGTTATTTGAGCCACAT‑ACTTGCCGATATGCTGACACCCGCCGGTGTTCCCCTGCTCTGGCCATGCCGCTGGCGTTTCCGCTTGCCTATCCTGGTTCCCCAAAAGGGCAACCAACTGGAACGTTTTATCTGCATGGCATTATTTGTCTGGTCGGTATGGATGCCCCATTCATTAccc < 2:1469267/287‑1 (MQ=255)
aCCCACAGTCTGCTGGCGGTATTTGCGCTGCTGGCAACCTTTTACCTTAAGGTTCCGGAAGGCTGGTTCATTCCGGCTGATGCGCTACAAGGAATGGTGCTGGGTTATTTGAGCCACGT‑ACTTGCCGATATGCTGACACCCGCCGGTGTTCCCCTGCTCTGGCCATGCCGCTGGCGTTTCCGCTTGCCTATCCTGGTTCCCCAAAAGGGCAACCAACTGGAACGTTTTATCTGCATGGCATTATTTGTCTGGTCGGTATGGATGCCCCATTCATTACCCGAGAACAgcg < 1:1122750/289‑1 (MQ=255)
aCCCACAGTCTGCTGGCGGTATTTGCGCTGCTGGCAACCTTTTACCTTAAGGTTCCGGAAGGCTGGTTCATTCCGGCTGATGCGCTACAAGGAATGGTGCTGGGTTATTTGAGCCACAT‑ACTTGCCGATATGCTGACACCCGCCGGTGTTCCCCTGCTCTGGCCATGCCGCTGGCGTTTCCGCTTGCCTATCCTGGTTCCCCAAAAGGGCAACCAACTGGAACGTTTTATCTGCATGGCATTATTTGTCTGGTCGGTATGGATGCCCCATTCATTACCCGAGAACAgcg < 1:166543/289‑1 (MQ=255)
aCCCACAGTCTGCTGGCGGTATTTGCGCTGCTGGCAACCTTTTACCTTAAGGTTCCGGAAGGCTGGTTCATTCCGGCTGATGCGCTACAAGGAATGGTGCTGGGTTATTTGAGCCACAT‑ACTTGCCGATATGCTGACACCCGCCGGTGTTCCCCTGCTCTGGCCATGCCGCTGGCGTTTCCGCTTGCCTATCCTGGTTCCCCAAAAGGGCAACCAACTGGAACGTTTTATCTGCATGGCATTATTTGTCTGGTCGGTATGGATGCCCCATTCATTACCCGAGAACAgcg < 1:409856/289‑1 (MQ=255)
ccACAGTCTGCTGGCGGTATTTGCGCTGCTGGCAACCTTTTACCTTAAGGTTCCGGAAGGCTGGTTCATTCCGGCTGATGCGCTACAAGGAATGGTGCTGGGTTATTTGAGCCACAT‑ACTTGCCGATATGCTGACACCCGCCGGTGTTCCCCTGCTCTGGCCATGCCGCTGGCGTTTCCGCTTGCCTATCCTGGTTCCCCAAAAGGGCAACCAACTGGAACGTTTTATCTGCATGGCATTATTTGTCTGGTCGGTATGGATGCCCCATTCATTACCCGAGAACAGCGCt < 1:1288993/289‑1 (MQ=255)
aGTCTGCTGGCGGTATTTGCGCTGCTGGCAACCTTTTACCTTAAGGTTCCGGAAGGCTGGTTCATTCCGGCTGATGCGCTACAAGGAATGGTGCTGGGTTATTTGAGCCACAT‑ACTTGCCGATATGCTGACACCCGCCGGTGTTCCCCTGCTCTGGCCATGCCGCTGGCGTTTCCGCTTGCCTATCCTGGTTCCCCAAAAGGGCAACCAACTGGAACGTTTTATCTGCATGGCATTATTTGTCTGGTCGGTATGGATGCCCCATTCATTACCCGAGAACAGCGCTGTTc > 2:1593502/1‑289 (MQ=255)
tCTGCTGGCGGTATTTGCGCTGCTGGCAACCTTTTACCTGAAGGTTCCGGAAGGCTGGTTCATTCCGGCTGATGCGCTACAAGGAATGGTGCTGGGTTATTTGAGCCACAT‑ACTTGCCGATATGCTGACACCCGCCGGTGTTCCCCTGCTCTGGCCATGCCGCTGGCGTTTCCGCTTGCCTATCCTGGTTCCCCAAAAGGGCAACCAACTGGAACGTTTTATCTGCATGGCATTATTTGTCTGGTCGGTATGGATGCCCCATTCATTACCCGAGAACAGCGCTGTTCg < 2:772467/288‑1 (MQ=255)
cGGTATTTGCGCTGCTGGCAACCTTTTACCTTAAGGTTCCGGAAGGCTGGTTCATTCCGGCTGATGCGCTACAAGGAATGGTGCTGGGTTATTTGAGCCACAT‑ACTTGCCGATATGCTGACACCCGCCGGTGTTCCCCTGCTCTGGCCATGCCGCTGGCGTTTCCGCTTGCCTATCCTGGTTCCCCAAAAGGGCAACCAACTGGAACGTTTTATCTGCATGGCATTATTTGTCTGGTCGGTATGGATGCCCCATTCATTACCCGAGAACAGCGCTGTTCGTTggtcat < 2:1338298/288‑5 (MQ=255)
gTATTTGCGCTGCTGGCAACCTTTTACCTTAAGGTTCCGGAAGGCTGGTTCATTCCGGCTGATGCGCTACAAGGAATGGTGCTGGGTTATTTGAGCCACAT‑ACTTGCCGATATGCTGACACCCGCCGGTGTTCCCCTGCTCTGGCCATGCCGCTGGCGTTTCCGCTTGCCTATCCTGGTTCCCCAAAAGGGCAACCAACTGGAACGTTTTATCTGCATGGCATTATTTGTCTGGTCGGTATGGATGCCCCATTCATTACCCGAGAACAGCGCTGTTCGTTggtcatcgc > 1:1873100/1‑282 (MQ=255)
ttttGCGCTGCTGGCAACCTTTTACCTTAAGGTTCCGGAAGGCTGGTTCATTCCGGCTGATGCGCTACAAGGAATGGTGCTGGGTTATTTGAGCCACAT‑ACTTGCCGATATGCTGACACCCGCCGGTGTTCCCCTGCTCTGGCCATGCCGCTGGCGTTTCCGCTTGCCTATCCTGGTTCCCCAAAAGGGCAACCAACTGGAACGTTTTATCTGCATGGCATTATTTGTCTGGTCGGTATGGATGCCCCATTCATTACCCGAGAACAGCGCTGTTCGTTggtcatcgcaa < 1:1461096/288‑10 (MQ=255)
aTTTGCGGTGCTGGCAACCTTTTACCTTAAGGTTCCGGAAGGCTGGTTCATTCCGGCTGATGCGCTACAAGTAATGGTGCTGGTTTCTTTGAGCCACAT‑ACTTGCCGATATGCTGCAACCCGCCGGTGTTCCCCTGCTCTGGCCATGCCGCTGGCGTTTCCGCTTGCCTATCCTGGTTCCCCAAAAGGGCAACCAACTGGAACGTTTTATCTGCATGGCATTATTTGTCTGGTCGGTATGGATGCCCCATTCATTACCCGAGAACAGCGCTGTTCGTTggtcatcgcaa < 2:1582478/289‑10 (MQ=255)
aTTTGCGCTGCTGGCAACCTTTTACCTTAAGGTTCCGGAAGGCTGTTTCATTCCGGCTGATGCGCTACAAGGAATGGTGCTGGGTTATTTGAGCCACAT‑ACTTGCCGATATGCTGACACCCGCCGGTGTTCCCCTGCTCTGGCCATGCCGCTGGCGTTTCCGCTTGCCTATCCTGGTTCCCCAAAAGGGCAACCAACTGGAACGTTTTATCTGCATGGCATTATTTGTCTGGTCGGTATGGATGCCCCATTCATTACCCGAGAACAGCGCTGTTCGTTggtcatcgcaa < 1:109904/289‑10 (MQ=255)
aTTTGCGCTGCTGGCAACCTTTTACCTTAAGGTTCCGGAAGGCTGGTTCATTCCGGCTGATGCGCTACAAGGAATGGTGCTGGGTTATTTGAGCCACAT‑ACTTGCCGATATGCTGACACCCGCCGGTGTTCCCCTGCTCTGGCCATGCCGCTGGCGTTTCCGCTTGCCTATCCTGGTTCCCCAAAAGGGCAACCAACTGGAACGTTTTATCTGCATGGCATTATTTGTCTGGTCGGTATGGATGCCCCAttcat > 2:1717290/1‑250 (MQ=255)
aTTTGCGCTGCTGGCAACCTTTTACCTTAAGGTTCCGGAAGGCTGGTTCATTCCGGCTGATGCGCTACAAGGAATGGTGCTGGGTTATTTGAGCCACAT‑ACTTGCCGATATGCTGACACCCGCCGGTGTTCCCCTGCTCTGGCCATGCCGCTGGCGTTTCCGCTTGCCTATCCTGGTTCCCCAAAAGGGCAACCAACTGGAACGTTTTATCTGCATGGCATTATTTGTCTGGTCGGTATGGATGCCCCATTCATTACCCGAGAACAGCGCTGTTCGTTggtcatcgcaa < 1:649344/289‑10 (MQ=255)
aTTTGCGCTGCTGGCAACCTTTTACCTTAAGGTTCCGGAAGGCTGGTTCATTCCGGCTGATGCGCTACAAGGAATGGTGCTGGGTTATTTGAGCCACAT‑ACTTGCCGATATGCTGACACCCGCCGGTGTTCCCCTGCTCTGGCCATGCCGCTGGCGTTTCCGCTTGCCTATCCTGGTTCCCCAAAAGGGCAACCAACTGGAACGTTTTATCTGCATGGCATTATTTGTCTGGTCGGTATGGATGCCCCATTCATTACCCGAGAACAGCGCTGTTCGTTggtcatcgcaa < 1:111539/289‑10 (MQ=255)
aTTTGCGCTGCTGGCAACCTTTTACCTTAAGGTTCCGGAAGGCTGGTTCATTCCGGCTGATGCGCTACAAGGAATGGTGCTGGGTTATTTGAGCCACAT‑ACTTGCCGATATGCTGACACCCGCCGGTGTTCCCCTGCTCTGGCCATGCCGCTGGCGTTTCCGCTTGCCTATCCTGGTTCCCCAAAAGGGCAACCAACTGGAACGTTTTATCTGCATGGCATTATTTGTCTGGTCGGTATGGATGCCCCATTCATTACCCGAGAACAGCGCTGTTCGTTggtcatcgcaa < 1:574601/289‑10 (MQ=255)
cgcTGCTGGCAACCTTTTACCTTAAGGTTCCGGAAGGCTGGTTCATTCCGGCTGATGCGCTACAAGGAATGGTGCTGGGTTATTTGAGCCACAT‑ACTTGCCGATATGCTGACACCCGCCGGTGTTCCCCTGCTCTGGCCATGCCGCTGGCGTTTCCGCTTGCCTATCCTGGTTCCCCAAAAGGGCAACCAACTGGAACGTTTTATCTGCATGGCATTATTTGTCTGGTCGGTATGGATGCCCCATTCATTACCCGAGAACAGCGCTGTTCGTTggtcatcgcaa < 1:1020352/284‑10 (MQ=255)
gctgctGGCAACCTTTTACCTTAAGGTTCCGGAAGGCTGGTTCATTCCGGCTGATGCGCTACAAGGAATGGTGCTGGGTTATTTGAGCCACAT‑ACTTGCCGATATGCTGACACCCGCCGGTGTTCCCCTGCTCTGGCCATGCCGCTGGCGTTTCCGCTTGCCTATCCTGGTTCCCCAAAAGGGCAACCAACTGGAACGTTTTATCTGCATGGCATTATTTGTCTGGTCGGTATGGATGCCCCATTCATTACCCGAGAACAGCGCTGTTCGTTggtcatcgcaaatgat < 1:715791/288‑15 (MQ=255)
gctgGCAACCTTTTACCTTAAGGTTCCGGAAGGCTGGTTCATTCCGGCTGATGCGCTACAAGGAATGGTGCTGGGTTATTTGAGCCACAT‑ACTTGCCGATATGCTGACACCCGCCGGTGTTCCCCTGCTCTGGCCATGCCGCTGGCGTTTCCGCTTGCCTATCCTGGTTCCCCAAAAGGGCAACCAACTGGAACGTTTTATCTGCATGGCATTATTTGTCTGGTCGGTATGGATGCCCCATTCATTACCCGAGAACAGCGCTGTTCGTTGGTCATCGCAAATGATCAAt < 1:1635233/289‑1 (MQ=255)
gctgGCAACCTTTTACCTTAAGGTTCCGGAAGGCTGGTTCATTCCGGCTGATGCGCTACAAGGAATGGTGCTGGGTTATTTGAGCCACAT‑ACTTGCCGATATGCTGACACCCGCCGGTGTTCCCCTGCTCTGGCCATGCCGCTGGCGTTTCCGCTTGCCTATCCTGGTTCCCCAAAAGGGCAACCAACTGGAACGTTTTATCTGCATGGCATTATTTGTCTGGTCGGTATGGATGCCCCATTCATTACCCGAGAACAGCGCTGTTCGTTGGTCATCGCAAATGATCAAt > 1:690994/1‑289 (MQ=255)
tgGCAACCTTTTACCTTAAGGTTCCGGAAGGCTGGTTCATTCCGGCTGATGCGCTACAAGGAATGGTGCTGGGTTATTTGAGCCACAT‑ACTTGCCGATATGCTGACACCCGCCGGTGTTCCCCTGCTCTGGCCATGCCGCTGGCGTTTCCGCTTGCCTATCCTGGTTCCCCAAAAGGGCAACCAACTGGAACGTTTTATCTGCATGGCATTATTTGTCTGGTCGGTATGGATGCCCCATTCATTACCCGAGAACAGCGCTGTTCGTTggtcatcgcaa > 1:1235387/1‑269 (MQ=255)
ttttACCTTAAGGTTCCGGAAGGCTGGTTCATTCCGGCTGATGCGCTACAAGGAATGGTGCTGGGTTATTTGAGCCACAT‑ACTTGCCGATATGCTGACACCCGCCGGTGTTCCCCTGCTCTGGCCATGCCGCTGGCGTTTCCGCTTGCCTATCCTGGTTCCCCAAAAGGGCAACCAACTGGAACGTTTTATCTGCATGGCATTATTTGTCTGGTCGGTATGGATGCCCCATTCATTACCCGAGAACAGCGCTGTTCGTTGGTCATCGCAAATGATCAATACCTTGCAGa < 2:1963410/289‑1 (MQ=255)
aaGGTTCCGGAAGGCTGGTTCATTCCGGCTGATGCGCTACAAGGAATGGTGCTGGGTTATTTGAGCCACAT‑ACTTGCCGATATGCTGACACCCGCCGGTGTTCCCCTGCTCTGGCCATGCCGCTGGCGTTTCCGCTTGCCTATCCTGGTTCCCCAAAAGGGCAACCAACTGGAACGTTTTATCTGCATGGCATTATTTGTCTGGTCGGTATGGATGCCCCATTCATTACCCGAGAACAGCGCTGTTCGTTGGTCATCGCAAATGATCAATACCTTGCAGATCCAGTTTc > 1:276894/1‑289 (MQ=255)
aGGGTCCGGAAGGCTGGTTCATTCCGGCTGATGCGCTACAAGGAGTGTTGCTTGGTTATTTGAGCCACAT‑ACTTGCCGGTATGCTGACACCCGCCGGTGTGCCCCTGCTCTGGCCCTGCCGCTGGCGTTGCCGCTTGCCTATCCTGGTTCCCCAAAAGGGCAACCAACTGGAACGTTTTATCTGCATGGCATTATTTGTCTGGTCGGTCTGGATGCCCCATTCATTACCCGAGAACAGCGCTGTTCGTTGGTCATCGCAAATGATCAATACCTTGCAGATCCAGTTTCa < 2:1382795/289‑1 (MQ=255)
gtcccGGAGGGCTGGTTCATTCCGGCTAATGCTCTACAAGGAAGGGTGCTGGGTTATTTGAGCCACAT‑ACTTGCCGATATGCTGACACCCGCCGGTGTTCCCCTGCTCTGGCCATGCCGCTGGCGTTTCCGCTTGCCTATCCTGGTTCCCCAAAAGGGCAACCAACTGGAACGTTTTATCTGCATGGCATTATTTGTCTGGTCGGTATGGATGCCCCATTCATTACCCGAGAACAGCGCTGTTCGTTGGTCATCGCAAATGATCAATACCTTGCAGATCCAGTTTCAt < 2:1485713/285‑1 (MQ=255)
tCCGGAAGGCTGGTTCATGCCGGCTGATGCGCTACAAGGAATGGTGCTGGGTTATTTGAGCCACAT‑ACTTGCCGATATGCTGACACCCGCCGGTGTTCCCCTGCTCTGGCCATGCCGCTGGCGTTTCCGCTTGCCTATCCTGGTTCCCCAAAAGGGCAACCAACTGGAACGTTTTATCTGCATGGCATTATTTGTCTGGTCGGTATGGATGCCCCATTCATTACCCGAGAACAGCGCTGTTCGTTGGTCATCGCAAATGATCAATACCTTGCAGATCCAGTTTCATCgg < 1:1620317/289‑1 (MQ=255)
cGGAAGGCTGGTTCATTCCGGCTGATGCGCTACAAGGAATGGTGCTGGGTTATTTGAGCCACAT‑ACTTGCCGATATGCTGACACCCGCCGGTGTTCCCCTGCTCTGGCCATGCCGCTGGCGTTTCCGCTTGCCTATCCTGGTTCCCCAAAAGGGCAACCAACTGGAACGTTTTATCTGCATGGCATTATTTGTCTGGTCGGTATGGATGCCCCATTCATTACCCGAGAACAGCGCTGTTCGTTGGTCATCGCAAATGATCAATACCTTGCAGATCCAGTTTCATCGGc > 2:386306/1‑288 (MQ=255)
cGGAAGGCTGGTTCATTCCGGCTGATGCGCTACAAGGAATGGTGCTGGGTTATTTGAGCCACAT‑ACTTGCCGATATGCTGACACCCGCCGGTGTTCCCCTGCTCTGGCCATGCCGCTGGCGTTTCCGCTTGCCTATCCTGGTTCCCCAAAAGGGCAACCAACTGGAACGTTTTATCTGCATGGCATTATTTGTCTGGTCGGTATGGATGCCCCATTCATTACCCGAGAACAGCGCTGTTCGTTGGTCATCGCAAATGATCAATACCTTGCAGATCCAGTTTCATCGGc < 1:386306/288‑1 (MQ=255)
cGGAAGGCTGGTTCATTCCGGCTGATGCGCTACAAGGAATGGTGCTGGGTTATTTGAGCCACAT‑ACTTGCCGATATGCTGACACCCGCCGGTGTTCCCCTGCTCTGGCCATGCCGCTGGCGTTTCCGCTTGCCTATCCTGGTTCCCCAAAAGGGCAACCAACTGGAACGTTTTATCTGCATGGCATTATTTGTCTGGTCGGTATGGATGCCCCATTCATTACCCGAGAACAGCGCTGTTCGTTGGTCATCGCAAATGATCAATACCTTGCAGAACCAAGTTCCTCGGCt > 2:1745790/1‑289 (MQ=255)
aGGCTGGTTCATTCCGGCTGATGCGCTACAAGGAATGGTGCTGGGTTATTTGAGCCACAT‑ACTTGCCGATATGCTGACACCCGCCGGTGTTCCCCTGCTCTGGCCATGCCGCTGGCGTTTCCGCTTGCCTATCCTGGTTCCCCAAAAGGGCAACCAACTGGAACGTTTTATCTGCATGGCATTATTTGTCTGGTCGGTATGGATGCCCCATTCATTACCCGAGAACAGCGCTGTTCGTTGGTCATCGCAAATGATCAATACCTTGCAGATCCAGTTTCATCGGCttatt < 1:95516/289‑1 (MQ=255)
aGGCTGGTTCATTCCGGCTGATGCGCTACAAGGAATGGTGCTGGGTTATTTGAGCCACAT‑ACTTGCCGATATGCTGACACCCGCCGGTGTTCCCCTGCTCTGGCCATGCCGCTGGCGTTTCCGCTTGCCTATCCTGGTTCCCCAAAAGGGCAACCAACTGGAACGTTTTATCTGCATGGCATTATTTGTCTGGTCGGTATGGATGCCCCATTCATTACCCGAGAACAGCGCTGTTCGTTGGTCATCGCAAATGATCAATACCTTGCAGATCCAGTTTCATCGGCttatt < 1:1354485/289‑1 (MQ=255)
ggCTGATGCGCTACAAGGAATGGTGCTGGGTTATTTGAGCCACAT‑ACTTGCCGATATGCTGACACCCGCCGGTGTTCCCCTGCTCTGGCCATGCCGCTGGCGTTTCCGCTTGCCTATCCTGGTTCCCCAAAAGGGCAACCAACTGGAACGTTTTATCTGCATGGCATTATTTGTCTGGTCGGTATGGATGCCCCATTCATTACCCGAGAACAGCGCTGTTCGTTGGTCATCGCAAATGATCAATACCTTGCAGATCCAGTTTCATCGGCTTATTAAGCATCAGGTTGaa < 1:965190/289‑1 (MQ=255)
gCTGATGCGCTACAAGGAATGGTGCTGGGTTATTTGAGCCACAT‑ACTTGCCGATATGCTGACACCCGCCGGTGTTCCCCTGCTCTGGCCATGCCGCTGGCGTTTCCGCTTGCCTATCCTGGTTCCCCAAAAGGGCAACCAACTGGAACGTTTTATCTGCATGGCATTATTTGTCTGGTCGGTATGGATGCCCCATTCATTACCCGAGAACAGCGCTGTTCGTTGGTCATCGCAAATGATCAATACCTTGCAGATCCAGTTTCATCGGCTTATTAAGCATCAGGTTGAAt > 2:617989/1‑289 (MQ=255)
aaTGGTGCTGGGTTATTTGAGCCACAT‑ACTTGCCGATATGCTGACACCCGCCGGTGTTCCCCTGCTCTGGCCATGCCGCTGGCGTTTCCGCTTGCCTATCCTGGTTCCCCAAAAGGGCAACCAACTGGAACGTTTTATCTGCATGGCATTATTTGTCTGGTCGGTATGGATGCCCCATTCATTACCCGAGAACAGCGCTGTTCGTTGGTCATCGCAAATGATCAATACCTTGCAGATCCAGTTTCATCGGCTTATTAAGCATCAGGTTGAATACTAAAAAGGCaaaaa > 2:219087/1‑288 (MQ=255)
tgTGCTGTGTTATTTG‑GCCCCATCACTTTCCGATATGCTTACCCCCGCCGGTGTTCCCCTGCTCTGGCCATGCCGCTGGCGTTTCCGCTTGCCTTTCCTGGTTCCCCAAAAGGGCAACCAACTGGAACGTTTTTTCTGCATGGCATTATTTGTCTGGTCGGTATGGATGCCCCATTCATTACCCGAGAACAGCGCTGTTCGTTGGTCATCGCAAATGATCAATACCTTGCAGATCCAGTTTCATCGGCTTATTAAGCATCAGGTTGAATACTAAAAAGGCAAAAATCAc < 1:473740/288‑1 (MQ=255)
ggTTATTTGAGCCACAT‑ACTTGCCGATATGCTGACACCCGCCGGTGTTCCCCTGCTCTGGCCATGCCGCTGGCGTTTCCGCTTGCCTATCCTGGTTCCCCAAAAGGGCAACCAACTGGAACGTTTTATCTGCATGGCATTATTTGTCTGGTCGGTATGGATGCCCCATTCATTACCCGAGAACAGCGCTGTTCGTTGGTCATCGCAAATGATCAATACCTTTCAGATCCAGTTTCATCGGCTTATTAAGCAGACGGTTGAATACTAAAAAGGCAAAAATCCCCTTTCTg > 2:833828/1‑289 (MQ=255)
tATTTGAGCCACAT‑ACTTGCCGATATGCTGACACCCGCCGGTGTTCCCCTGCTCTGGCCATGCCGCTGGCGTTTCCGCTTGCCTATCCTGGTTCCCCAAAAGGGCAACCAACTGGAACGTTTTATCTGCATGGCATTATTTGTCTGGTCGGTATGGATGCCCCATTCATTACCCGAGAACAGCGCTGTTCGTTGGTCATCGCAAATGATCAATACCTTGCAGATCCAGTTTCATCGGCTTATTAAGCATCAGGTTGAATACTAAAAAGGCAAAAATCACCTTTCTGGa < 1:720235/288‑1 (MQ=255)
tttGAGCCACAT‑ACTTGCCGATATGCTGACACCCGCCGGTGTTCCCCTGCTCTGGCCATGCCGCTGGCGTTTCCGCTTGCCTATCCTGGTTCCCCACAAGGGCAACCAACTGGAACGTTTTATCTGCATGGCATTATTTGTCTGGTCGGTATGGATGCCCCATTCATTACCCGAGAACAGCGCTGTTCGTTGGTCATCGCAAATGATCAATACCTTGCAGATCCAGTTTCATCGGCTTATTAAGCATCAGGTTGAATACTAAAAAGGCAAAAATCACCTTTCTGGAATa > 2:1188321/1‑289 (MQ=255)
tttGAGCCACAT‑ACTTGCCGATATGCTGACACCCGCCGGTGTTCCCCTGCTCTGGCCATGCCGCTGGCGTTTCCGCTTGCCTATCCTGGTTCCCCAAAAGGGCAACCAACTGGAACGTTTTATCTGCATGGCATTATTTGTCTGGTCGGTATGGATGCCCCATTCATTACCCGAGAACAGCGCTGTTCGTTggtcatcgcaa < 1:552964/202‑10 (MQ=255)
tttGAGCCACAT‑ACTTGCCGATATGCTGACACCCGCCGGTGTTCCCCTGCTCTGGCCATGCCGCTGGCGTTTCCGCTTGCCTATCCTGGTTCCCCAAAAGGGCAACCAACTGGAACGTTTTATCTGCATGGCATTATTTGTCTGGTCGGTATGGATGCCCCATTCATTACCCGAGAACAGCGCTGTTCGTTggtcatcgcaa > 2:552964/1‑193 (MQ=255)
tttGAGCCACAT‑ACTTGCCGATATGCTGACACCCGCCGGTGTTCCCCTGCTCTGGCCATGCCGCTGGCGTTTCCGCTTGCCTATCCTGGTTCCCCAAAAGGGCAACCAACTGGAACGTTTTATCTGCATGGCATTATTTGTCTGGTCGGTATGGATGCCCCATTCATTACCCGAGAACAGCGCTGTTCGTTGGTCATCGCAAATGATCAATAc > 2:188041/1‑213 (MQ=255)
tttGAGCCACAT‑ACTTGCCGATATGCTGACACCCGCCGGTGTTCCCCTGCTCTGGCCATGCCGCTGGCGTTTCCGCTTGCCTATCCTGGTTCCCCAAAAGGGCAACCAACTGGAACGTTTTATCTGCATGGCATTATTTGTCTGGTCGGTATGGATGCCCCATTCATTACCCGAGAACAGCGCTGTTCGTTGGTCATCGCAAATGATCAATACCTTGCAGATCCAGTTTCATCGGCTTATTAAGCATCAGGTTGAATACTAAAAAGGCAAAAATCACCTTTCTGGAATa > 1:1148822/1‑289 (MQ=255)
tttGAGCCACAT‑ACTTGCCGATATGCTGACACCCGCCGGTGTTCCCCTGCTCTGGCCATGCCGCTGGCGTTTCCGCTTGCCTATCCTGGTTCCCCAAAAGGGCAACCAACTGGAACGTTTTATCTGCATGGCATTATTTGTCTGGTCGGTATGGATGCCCCATTCATTACCCGAGAACAGCGCTGTTCGTTGGTCATCGCAAATGATCAATACCTTGCAGATCCAGTTTCATCGGCTTATTAAGCATCAGGTTGAATACTAAAAAGGCAAAAATCACCTTTCTGGAATa > 2:682903/1‑289 (MQ=255)
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gCCACAT‑ACTTGCCGATATGCTGACACCCGCCGGTGTTCCCCTGCTCTGGCCATGCCGCTGGCGTTTCCGCTTGCCTATCCTGGTTCCCCAAAAGGGCAACCAACTGGAACGTTTTATCTGCATGGCATTATTTGTCTGGTCGGTATGGATGCCCCATTCATTACCCGAGAAAAGCGCTGTTCGTTGGTCATCGCACATGATCAATACCTTGCAGATCAAGTTACATCGTCTCATTAAGCAATAGGTCAAATACCAAAACGGAAAAAATCACCTTTCAGTAAAAAGCaa > 2:1944990/1‑289 (MQ=255)
tccTTGCCGAAATGCTGCCACCCGCCGGTGTTCCCCTGCTCTGGCCATGCCGCTGGCGTTTCCGCTTGCCTATCCTGGTTCCCCAAAAGGGCAACCAACTGGAACGTTTTATCTGCATGGCATTATTTGTCTGGTCGGTATGGATGCCCCATTCATTACCCGAGAACAGCGCTGTTCGTTGGTCATCGCAAATGATCAATACCTTGCAGATCCAGTTTCATCGGCTTATTAAGCATCAGGTTGAATACTAAAAAGGCAAAAATCACCTTTCTGGAATAAGCAATTCCAt < 2:317471/287‑1 (MQ=255)
tGCCGATATGCTGACACCCGCCGGTGTTCCCCTGCTCTGGCCATGCCGCTGGCGTTTCCGCTTGCCTATCCTGGTTCCCCAAAAGGGCAACCAACTGGAACGTTTTATCTGCATGGCATTATTTGTCTGGTCGGTATGGATGCCCCATTCATTACCCGAGAACAGCGCTGTTCGTTGGTCATCGCAAATGATCAATACCTTGCAGATCCAGTTTCATCGGCTTATTAAGCATCAGGTTGAATACTAAAAAGGCAAAAATCACCTTTCTGGAATAAGCAATTCCATTTGa < 1:999483/289‑1 (MQ=255)
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gCTGACACCCGCCGGTGTTCCCCTGCTCTGGCCATGCCGCTGGCGTTTCCGCTTGCCTATCCTGGTTCCCCAAAAGGGCAACCAACTGGAACGTTTTATCTGCATGGCATTATTTGTCTGGTCGGTATGGATGCCCCATTCATTACCCGAGAACAGCGCTGTTCGTTGGTCATCGCAAATGATCAATACCTTGCAGATCCAGTTTCATCGGCTTATTAAGCATCAGGTTGAATACTAAAAAGGCAAAAATCACCTTTCTGGAATAAGCAATTCCATTTGAATATAaga > 1:1884511/1‑288 (MQ=255)
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cgccgGTGTTCCCCTGCTCTGGCCATGCCGCTGGCGTTTCCGCTTGCCTATCCTGGTTCCCCAAAAGGGCAACCAACTGGAACGTTTTATCTGCATGGCATTATTTGTCTGGTCGGTATGGATGCCCCATTCATTACCCGAGAACAGCGCTGTTCGTTGGTCATCGCAAATGATCAATACCTTGCAGATCCAGTTTCATCGGCTTATTAAGCATCAGGTTGAATACTAAAAAGGCAAAAATCACCTTTCTGGAATAAGCAATTCCATTTGAATATAAGAGCCAGCTcac > 1:181081/1‑289 (MQ=255)
cgccgGTGTGCCCGTGGGCTGTCCATGCCGGTGGCGTTACCGCTTGCCTATCCTGGTTCCCCAAAAGGGCAACGAACGGGAACGATTAACCTGCATGTCATTATTTGTCTGGGCGGTATGGATGCCCCAGTCATTACCCGAGAAGAGCGCTGTTCGTTGGTCATCGCAAATGATCAATACCTTGCAGATCCAGTTTCATCGGCTTATTAAGCATCAGGTTGAATACTAAAAAGGCAAAAATCACCTTTCTGGAATAAGCAATTCCATTTGAATATAAGAGCCAGCTca < 2:503475/288‑1 (MQ=255)
ccgGTGTTCCCCTGCTCTGGCCATGCCGCTGGCGTTTCCGCTTGCCTATCCTGGTTCCCCAAAAGGGCAACCAACTGGAACGTTTTATCTGCATGGCATTATTTGTCTGGTCGGTATGGATGCCCCATTCATTACCCGAGAACAGCGCTGTTCGTTGGTCATCGCAAATGATCAATACCTTGCAGATCCAGTTTCATCGGCTTATTAAGCATCAGGTTGAATACTAAAAAGGCAAAAATCACCttt < 1:1725935/246‑1 (MQ=255)
ccgGTGTTCCCCTGCTCTGGCCATGCCGCTGGCGTTTCCGCTTGCCTATCCTGGTTCCCCAAAAGGGCAACCAACTGGAACGTTTTATCTGCATGGCATTATTTGTCTGGTCGGTATGGATGCCCCATTCATTACCCGAGAACAGCGCTGTTCGTTGGTCATCGCAAATGATCAATACCTTGCAGATCCAGTTTCATCGGCTTATTAAGCATCAGGTTGAATACTAAAAAGGCAAAAATCACCTTTCTGGAATAAGCAATTCCATTTGAATATAAGAGCCAGCt > 2:1652861/1‑284 (MQ=255)
ccgGTGTTCCCCTGCTCTGGCCATGCCGCTGGCGTTTCCGCTTGCCTATCCTGGTTCCCCAAAAGGGCAACCAACTGGAACGTTTTATCTGCATGGCATTATTTGTCTGGTCGGTATGGATGCCCCATTCATTACCCGAGAACAGCGCTGTTCGTTGGTCATCGCAAATGATCAATACCTTGCAGATCCAGTTTCATCGGCTTATTAAGCATCAGGTTGAATACTAAAAAGGCAAAAATCACCTTTCTGGAATAAGCAATTCCATTTGAATATAAGAGCCAGCTCACAg < 1:1244422/289‑1 (MQ=255)
ccgGTGTTCCCCTGCTCTGGCCATGCCGCTGGCGTTTCCGCTTGCCTATCCTGGTTCCCCAAAAGGGCAACCAACTGGAACGTTTTATCTGCATGGCATTATTTGTCTGGTCGGTATGGATGCCCCATTCATTACCCGAGAACAGCGCTGTTCGTTGGTCATCGCAAATGATCAATACCTTGCAGATCCAGTTTCATCGGCTTATTAAGCATCAGGTTGAATACTAAAAAGGCAAAAATCACCTTTCTGGAATAAGCAATTCCATTTGAATATAAGAGCCACTTCACAg > 2:338379/1‑289 (MQ=255)
gtTCCCCTGCTCTGGCCATGCCGCTGGCGTTTCCGCTTGCCTATCCTGGTTCCCCAAAAGGGCAACCAACTGGAACGTTTTATCTGCATGGCATTATTTGTCTGGTCGGTATGGATGCCCCATTCATTACCCGAGAACAGCGCTGTTCGTTGGTCATCGCAAATGATCAATACCTTGCAGATCCAGTTTCATCGGCTTATTAAGCATCAGGTTGAATACTAAAAAGGCAAAAATCACCTTTCTGGAATAAGCAATTCCATTTGAATATAAGAGCCAGCTCACAGt > 1:609179/1‑285 (MQ=255)
ctctGGCCATGCCGCTGGCGTTTCCGCTTGCCTATCCTGGTTCCCCAAAAGGGCAACCAACTGGAACGTTTTATCTGCATGGCATTATTTGTCTGGTCGGTATGGATGCCCCATTCATTACCCGAGAACAGCGCTGTTCGTTGGTCATCGCAAATGATCAATACCTTGCAGATCCAGTTTCATCGGCTTATTAAGCATCAGGTTGAATACTAAAAAGGCAAAAATCACCTTTCTGGAATAAg < 2:125421/242‑1 (MQ=255)
ctctGGCCATGCCGCTGGCGTTTCCGCTTGCCTATCCTGGTTCCCCAAAAGGGCAACCAACTGGAACGTTTTATCTGCATGGCATTATTTGTCTGGTCGGTATGGATGCCCCATTCATTACCCGAGAACAGCGCTGTTCGTTGGTCATCGCAAATGATCAATACCTTGCAGATCCAGTTTCATCGGCTTATTAAGCATCAGGTTGAATACTAAAAAGGCAAAAATCACCTTTCTGGAATAAGCAATTCCAttt < 2:1704154/253‑1 (MQ=255)
ctGGCCATGCCGCTGGCGTTTCCGCTTGCCTATCCTGGTTCCCCAAAAGGGCAACCAACTGGAACGTTTTATCTGCATGGCATTATTTGTCTGGTCGGTATGGATGCCCCATTCATTACCCGAGAACAGCGCTGTTCGTTGGTCATCGCAAATGATCAATACCTTGCAGATCCAGTTTCATCGGCTTATTAAGCATCAGGTTGAATACTAAAAAGGCAAAAATCACCTTTCTGGAATAAGCAATTCCATTTGAATATAAGAGCCAGCTCACAGTTCTGTTAATCTTgc > 2:1666155/1‑288 (MQ=255)
tGGCCATGCCGCTGGCGTTTCCGCTTGCCTATCCTGGTTCCCCAAAAGGGCAACCAACTGGAACGTTTTATCTGCATGGCATTATTTGTCTGGTCGGTATGGATGCCCCATTCATTACCCGAGAACAGCGCTGTTCGTTGGTCATCGCAAATGATCAATACCTTGCAGATCCAGTTTCATCGGCTTATTAAGCATCAGGTTGAATACTAAAAAGGCAAAAATCACCTTTCTGGAATAAGCAATTCCATTTGAATATAAGAGCCAGCTCACAGTTCTGTTAATCTTgcg > 1:1912795/1‑288 (MQ=255)
ggCCATGCCGCTGTCGTTTCCGCTTACCTACCCTGGTTCCCCAAAATGGCAACCAACTGGAACGTTTTATCTGCATGGCATTATTTGTCTGGTCGGTATGGATGCCCCATTCATTACCCGAGAACAGCGCTGTTGGTTGGTCATCGCAAATGATCAATACCTTGCAGATCCAGTTTCATCGGCTTATTAAGCATCAGGTTGAATACTAAAAAGGCAAAAATCACCTTTCTGGAATAAGCAATTCCATTTGAATATAAGAGCCAGCTCACAGTTCTGTTAATCTTGCGcc < 1:1567197/289‑1 (MQ=255)
ggCCATGCCGCTGGCGTTTCCGCTTGCCTATCCTGGTTCCCCAAAAGGGCAACCAACTGGAACGTTTTATCTGCATGGCATTATTTGTCTGGTCGGTATGGATGCCCCATTCATTACCCGAGAACAGCGCTGTTCGTTGGTCATCGCAAATGATCAATACCTTGCAGATCCAGTTTCATCGGCTTATTAAGCATCAGGTTGAATACTAAAAAGGCAAAAATCACCTTTCTGGAATAAGCAATTCCATTTGAATATAAGAGCCAGCTCACAGTTCTGTTAATCTTGCGcc < 2:1015423/289‑1 (MQ=255)
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gCCATGCCGCTGGCGTTTCCGCTTGCCTATCCTGGTTCCCCAAAAGGGCAACCAACTGGAACGTTTTATCTGCATGGCATTATTTGTCTGGTCGGTATGGATGCCCCATTCATTACCCGAGAACAGCGCTGTTCGTTGGTCATCGCAAATGATCAATACCTTGCAGATCCAGTTTCATCGGCTTATTAAGCATCAGGTTGAATACTAAAAAGGCAAAAATCACCTTTCTGGAATAAGCAATTCCATTTGAatat > 1:171688/1‑254 (MQ=255)
gCCATGCCGCTGGCGTTTCCGCTTGCCTATCCTGGTTCCCCAAAAGGGCAACCAACTGGAACGTTTTATCTGCATGGCATTATTTGTCTGGTCGGTATGGATGCCCCATTCATTACCCGAGAACAGCGCTGTTCGTTGGTCATCGCAAATGATCAATACCTTGCAGATCCAGTTTCATCGGCTTATTAAGCATCAGGTTGAATACTAAAAAGGCAAAAATCACCTTTCTGGAATAAGCAATTCCATTTGAATATAAGAGCCAGCTCACAGTTCTGTTAATCt > 1:1003028/1‑282 (MQ=255)
gCCATGCCGCTGGCGTTTCCGCTTGCCTATCCTGGTTCCCCAAAAGGGCAACCAACTGGAACGTTTTATCTGCATGGCATTATTTGTCTGGTCGGTATGGATGCCCCATTCATTACCCGAGAACAGCGCTGTTCGTTGGTCATCGCAAATGATCAATACCTTGCAGATCCAGTTTCATCGGCTTATTAAGCATCAGGTTGAATACTAAAAAGGCAAAAATCACCTTTCTGGAATAAGCAATTCCATTTGAATATAAGAGCCAGCTCACAGTTCTGTTAATCTTGCGcc < 2:1271715/288‑1 (MQ=255)
gCCATCCCGCTGGCGTTTCCGGTTGCCTATCCCGGTTCCCCAAAAGGGCAACCAACTGGAACGTTTTATCTGCATGGCATTATTTGGCTGGTCGGTATGGATGCCCCATTCATTACCCGAGAACAGCGCTGTTCGTTGGTCATCGCAAATGATCAATACCTTGCAGATCCAGTTTCATCGGCTTATTAAGCATCAGGTTGAATACTAAAAAGGCAAAAATCACCTTTCTGGAATAAGCAATTCCATTTGAATATAAGAGCCAGCTCACAGTTCTGTTAATCTTGCGcc < 2:29290/288‑1 (MQ=255)
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tCCTGGTTCCCCAAAAGGGCAACCAACTGGAACGTTTTATCTGCATGGCATTATTTGTCTGGTCGGTATGGATGCCCCATTCATTACCCGAGAACAGCGCTGTTCGTTGGTCATCGCAAATGATCAATACCTTGCAGATCCAGTTTCATCGGCTTATTAAGCATCAGGTTGAATACTAAAAAGGCAAAAATCACCTTACTGGa < 1:971561/203‑1 (MQ=255)
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ccAAAAGGGCAACCAACTGGAACGTTTTATCTGCATGGCATTATTTGTCTGGTCGGTATGGATGCCCCATTCATTACCCGAGAACAGCGCTGTTCGTTGGTCATCGCAAATGATCAATACCTTGCAGATCCAGTTTCATCGGCTTATTAAGCATCAGGTTGAATACTAAAAAGGCAAAAATCACCTTTCTGGAATAAGCAATTCCATTTGAATATAAGAGCCAGCTCACAGTTCTGTTAATCTTGCGCCAACACTATGACTGCTACGCAGTGATAGAAATAATAAGATc > 1:150519/1‑289 (MQ=255)
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ttttATCTGCATGGCATTATTTGTCTGGTCGGTATGGATGCCCCATTCATTACCCGAGAACAGCGCTGTTCGTTGGTCATCGCAAATGATCAATACCTTGCAGATCCAGTTTCATCGGCTTATTAAGCATCAGGTTGAATACTAAAAAGGCAAAAATCACCTTTCTGGAATAAGCAATTCCAt < 2:421314/183‑1 (MQ=255)
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ttttATCTGCATGGCATTATTTGTCTGGTCGGTATGGATGCCCCATTCATTACCCGAGAACAGCGCTGTTCGTTGGTCATCGCAAATGATCAATACCTTGCAGATCCAGTTTCATCGGCTTATTAAGCATCAGGTTGAATACTAAAAAGGCAAAAATCACCTTTCTGGAATAAGCAATTCCATTTGAATATAAGAGCCAGCTCACAGTTCTGTTAATCTTGCGCCAACACTATGACTGCTACg < 1:244265/243‑1 (MQ=255)
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cATGGCATTATTTGTCTGGTCGGTATGGATGCCCCATTCATTACCCGAGAACAGCGCTGTTCGTTGGTCATCGCAAATGATCAATACCTTGCAGATCCAGTTTCATCGGCTTATTAAGCATCAGGTTGAATACTAAAAAGGCAAAAATCACCTTTCTGGAATAAGCAATTCCATTTGAATATAAGAGCCAGCTCACAGTTCTGTTAATCTTGCGCCAACACTATGACTGCTACGCAGTGATAGAAATAATAAGATCAGGAGAACGGGGATGAACTTTCCATTAATTGCg > 1:1213396/1‑289 (MQ=255)
aTGGCATTATTTGTCTGGTCGGTATGGATGCCCCATTCATTACCCGAGAACAGCGCTGTTCGTTGGTCATCGCAAATGATCAATACCTTGCAGATCCAGTTTCATCGGCTTATTAAGCATCAGGTTGAATACTAAAAAGGCAAAAATCACCTTTCTGGAATAAGCAATTCCATTTGAATATAAGAGCCAGCTCACAGTTCTGTTAATCTTGCGCCAACACTATGACTGCTACGCAGTGATAGAAATAATAAGATCAGGAGAACGGGGATGAACTTTCCATTAATTGCGa > 1:1031400/1‑289 (MQ=255)
tttGTCTGGTCGGTATGGATGCCCCATTCATTACCCGAGAACAGCGCTGTTCGTTGGTCATCGCAAATGATCAATACCTTGCAGATCCAGTTTCATCGGCTTATTAAGCATCAGGTTGAATACTAAAAAGGCAAAAATCACCTTTCTGGAATAAGCAATTCCATTTGAATATAAGAGCCAGCTCACAGTTCTGTTAATCTTGCGCCAACACTATGACTGCTACGCAGTGATAGAAATAATAAGATCAGGAGAACGGGGATGAACTTTCCATTAATTGCGAACATCgtgg > 1:165060/1‑289 (MQ=255)
ttGTCTGGTCGGTATGGATGCCCCATTCATTACCCGAGAACAGCGCTGTTCGTTGGTCATCGCAAATGATCAATACCTTGCAGATCCAGTTTCATCGGCTTATTAAGCATCAGGTTGAATACTAAAAAGGCAAAAATCACCTTTCTGGAATAAGCAATTCCATTTGAATATAAGAGCCAGCTCACAGTTCTGTTAATCTTGCGCCAACACTATGACTGCTACGCAGTGATAGAAATAATAAGATCAGGAGAACGGGGATGAACTTTCCATTAATTGCGAACATCgtggt < 2:1900898/289‑1 (MQ=255)
|||
CGCCCGCGCTTTTGGGCATCGTGGTTTTACCCACAGTCTGCTGGCGGTATTTGCGCTGCTGGCAACCTTTTACCTTAAGGTTCCGGAAGGCTGGTTCATTCCGGCTGATGCGCTACAAGGAATGGTGCTGGGTTATTTGAGCCACAT‑ACTTGCCGATATGCTGACACCCGCCGGTGTTCCCCTGCTCTGGCCATGCCGCTGGCGTTTCCGCTTGCCTATCCTGGTTCCCCAAAAGGGCAACCAACTGGAACGTTTTATCTGCATGGCATTATTTGTCTGGAGCGTATGGATGCCCCATAGTTTACCCGAGAACAGCGCTGTTCGTTGGAGTAGCCAAATGATCAATACCTTGCAGATCCAGTTTCATCGGCTTATTAAGCATCAGGTTGAATACTAAAAAGGCAAAAATCACCTTTCTGGAATAAGCAATTCCATTTGAATATAAGAGCCAGCTCACAGTTCTGTTAATCTTGCGCCAACACTATGACTGCTACGCAGTGATAGAAATAATAAGATCAGGAGAACGGGGATGAACTTTCCATTAATTGCGAACATCGTGGT > CP042583/1492356‑1492916
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 11 ≤ ATCG/ATCG < 26 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
GATK/CNVnator alignment
N/A
