Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A3 F210 I1 R1
|
4927 |
250.2 |
4002508 |
96.7% |
3870425 |
266.6 |
Breseq alignment
BRESEQ :: Evidence
|
| evidence |
seq id |
position |
mutation |
annotation |
gene |
description |
| RA |
CP042583 |
1,532,384 |
3 bp→TCG |
intergenic (–/–) |
– / – |
–/– |
|
| |
seq id |
position |
ref |
new |
freq |
score (cons/poly) |
reads |
annotation |
genes |
product |
| * | CP042583 | 1,532,384 | 0 | A | T | 99.6%
| 579.1
/ NA
| 249 | intergenic (–/–) | –/– | –/– |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (1/0); new base T (118/129); total (119/130) |
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 4.80e-01 |
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 |
| * | CP042583 | 1,532,385 | 0 | G | C | 98.8%
| 565.0
/ NA
| 249 | intergenic (–/–) | –/– | –/– |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (1/2); new base C (118/128); total (119/130) |
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 |
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 |
| * | CP042583 | 1,532,386 | 0 | C | G | 99.6%
| 589.8
/ NA
| 249 | intergenic (–/–) | –/– | –/– |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (0/1); new base G (118/129); total (119/130) |
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 |
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 |
Only 100 of 249 total aligned reads displayed.
ATCTGGTGGTTACTGGATTTCCACGCCAGCTAATTACATTGTGGCTAACCCCAGCACCCTGACCGGTTCTATCGGTATCTTCGGCGTGATCACCACCGTAGAAAATAGTCTGGATAGCATTGGTGTTCATACTGATGGTGTCAGTACTAGTCCGCTGGCGGATGTTTCTATCACCAGGGCACTGCCGCCGGAAGCGCAGCTGATGATGCAGTTAAGCATTGAGAATGGCTATAAACGCTTTATCACGCTGGTTGCTGATGCGCGTCATAGCACGCCGGAGCAGATTGATAAAATTGCCCAGGGCCACGTCTGGACCGGTCAGGATGCAAAAGCTAACGGGCTGGTCGATAGTCTCGGGGATTTCGATGATGCGGTCGCCAAAGCAGCAGAGCTGGCAAAAGTGAAACAGTGGCATCTGGAATATTACGTTGATGAACCGACCTTCTTCGACAAAGTGATGGACAACATGTCTGGTTCTGTCCGGGCAATGTTGCCAGATGCGTTCCAGGCCATGTTACCTGCACCGCTGGCCAGCGTAGCCTCTACCGTT > CP042583/1532116‑1532665
|||
atCTGGGGGTTACTGGATTGCCAATGCAGCTAATTACATTGTGGCTAAACCCAGCACCCTGACCGGTTCTATCGGTATCTTCGGCGTGATCACCACCGTAGAAAATAGTCTGGATTCGATTGGTGTTCATACTGATGGTGTCTCAACTTCACCGCTGGCGGATGTTTCTATCACCAGGGCACTGCCGCCGGAAGCGCAGCTGATGATGCAGTTAAGCATTGAGAATGGCTATAAACGCTTTATCACGCTGGTTGCTGATGCGCGTCATTCGACGCCGGAGCAGATTGa < 2:1666499/288‑1 (MQ=255)
ttACTGGATTTCCACGCCAGCTAATTACATTGTGGCTAACCCCAGCACCCTGACCGGTTCTATCGGTATCTTCGGCGTGATCACCACCGTAGAAAATAGTCTGGATTCGATTGGTGTTCATACTGATGGTGTCTCAACTTCACCGCTGGCGGATGTTTCTATCACCAGGGCACTGCCGCCGGAAGCGCAGCTGATGATGCAGTTAAGCATTGAGAATGGCTATAAACGCTTTATCACGCTGGTTGCTGATGCGCGTCATTCGACGCCGGAGCAGATTGATAAAATTGcc < 2:719676/289‑1 (MQ=255)
tGGATTTCCACGCCAGCTAATTACATTGTGGCTAACCCCAGCACCCTGACCGGTTCTATCGGTATCTTCGGCGTGATCACCACCGTAGAAAATAGTCTGGATTCGATTGGTGTTCATACTGATGGTGTCTCAACTTCACCGCTGGCGGATGTTTCTATCACCAGGGCACTGCCGCCGGAAGCGCAGCTGATGATGCAGTTAAGCATTGAGAATGGCTATAAACGCTTTATCACGCTGGTTGCTGATGCGCGTCATTCGACGCCGGAGCAGATTGATAAAATTGCCCAgg > 1:1027582/1‑289 (MQ=255)
aTTTCCACGCCAGCTAATTACATTGTGGCTAACCCCAGCACGCTGGCCGGTTGTTTCGGTATCTTCGGCGTGATCACCACCGTAGAAAATAGTCTGGATTCGATTGGTGTTCATACTGATGGTGTCTCAACTTCACCGCTGGCGGATGTTTCTATCACCAGGGCACTGCCGCCGGAAGCGCAGCTGATGATGCAGTTAAGCATTGAGAATGGCTATAAACGCTTTATCACGCTGGTTGCTGATGCGCGTCATTCGACGCCGGAGCAGATTGATAAAATTGCCCAGGGc < 2:1489290/288‑1 (MQ=255)
aTTTCCACGCCAGCTAATTACATTGTGGCTAACCCCAGCACCCTGACCGGTTCTATCGGTATCTTCGGCGTGGTCACCACCGTAGAAAATAGTCTGGATTCGATTGGTGTTCATACTGATGGTGTCTCAACTTCACCGCTGGCGGATGTTTCTATCACCAGGGCACTGCCGCCGGAAGCGCAGCTGATGATGCAGTTAAGCATTGAGAATGGCTATAAACGCTTTATCACGCTGGTTGCTGATGCGCGTCATTCGACGCCGGAGCAGATTGATAAAATTGCCCAGGGc < 2:53145/288‑1 (MQ=255)
aTTTCCACGCCAGCTAATTACATTGTGGCTAACCCCAGCACCCTGACCGGTTCTATCGGTATCTTCGGCGTGATCACCACCGTAGAAAATAGTCTGGATTCGATTGGTGTTCATACTGATGGTGTCTCAACTTCACCGCTGGCGGATGTTTCTATCACCAGGGCACTGCCGCCGGAAGCGCAGCTGATGATGCAGTTAAGCATTGAGAATGGCTATAAACGCTTTATCACGCTGGTTGCTGATGCGCGTCATTCGACGCCGGAGCAGATTGATAAAATTGCCCAGGGc < 1:433459/288‑1 (MQ=255)
aTTTCCACGCCAGCTAATTACATTGTGGCTAACCCCAGCACCCTGACCGGTTCTATCGGTATCTTCGGCGTGATCACCACCGTAGAAAATAGTCTGGATTCGATTGGTGTTCATACTGATGGTGTCTCAACTTCACCGCTGGCGGATGTTTCTATCACCAGGGCACTGCCGCCGGAAGCGCAGCTGATGATGCAGTTAAGCATTGAGAATGGCTATAAACGCTTTATCACGCTGGTTGCTGATGCGCGTCATTCGACGCCGGAGCAGATTGATAAAATTGCCCAGGGc < 2:940977/288‑1 (MQ=255)
aTTTCCACGCCAGCTAATTACATTGTGGCTAACCCCAGCACCCTGACCGGTTCTATCGGTATCTTCGGCGTGATCACCACCGTAGAAAATAGTCTGGATTCGATTGGTGTTCATACTGATGGTGTCTCAACTTCACCGCTGGCGGATGTTTCTATCACCAGGGCACTGCCGCCGGAAGCGCAGCTGATGATGCAGTTAAGCATTGAGAATGGCTATAAACGCTTTATCACGCTGGTTGCTGATGCGCGTCATTCGACGCCGGAGCAGATTGATAAAATTGCCCAGGGc < 2:321609/288‑1 (MQ=255)
aTTTCCAAGCCAGCTAATTACATTGTGACTAACCCCAGCAACCTGCCCGGTTCGATTGTGATCTTCGGCGTGATCACCACCGTAGAAAATAGTCTGGATTCGATTGGTGTTCATACAGATGGTGTCTCAACTTCACCGCTGGCGGATGTTTCTATCACCAGGGCACTGCCGCCGGAAGCGCAGCTGATGCTGCAGTTAAGCATTGAGAATGGCTATAAACGCTTTATCACGCTGGTTGCTGATGCGCGTCATTCGACGCCGGAGCAGATTGATAAAATTGCCCAGGGc < 2:237513/288‑1 (MQ=255)
ttCCACGCCAGCTAATTACATTGTGGCTAACCCCAGCACCCTGACCGGTTCTATCGGTATCTTCGGCGTGATCACCACCGTAGAAAATAGTCTGGATTCGATTGGTGTTCATACTGATGGTGTGTCAACTTCACCGCTGGCGGATGTTTCTATCACCAGGGCACTGCCGCCGGAAGCGCAGCTGATGATGCAGTTAAGCATTGAGAATGGCTATAAACGCTTTATCACGCTGGTTGCTGATGCGCGTCATTCGACGCCGGAGCAGATTGATAAAATTGCCCAGGGCCa > 2:1800406/1‑288 (MQ=255)
aGCTAATTACATTGTGGCTAACCCCAGCACCCTGACCGGTTCTATCGGTATCTTCGGCGTGATCACCACCGTAGAAAATAGTCTGGATTCGATTGGTGTTCATACTGATGGTGTCTCAACTTCACCGCTGGCGGATGTTTCTATCACCAGGGCACTGCCGCCGGAAGCGCAGCTGATGATGCAGTTAAGCATTGAGAATGGCTATAAACGCTTTATCACGCTGGTTGCTGATGCGCGTCATTCGACGCCGGAGCAGATTGATAAAATTGCCCAGGGCCACGTCTGGAcc > 1:1135555/1‑289 (MQ=255)
cTAATTACATTGTGGCTAACCCCAGCACCCTGACCGGTTCTATCGGTATCTTCGGCGTGATCACCACCGTAGAAAATAGTCTGGATTCGATTGGTGTTCATACTGATGGTGTCTCAACTTCACCGCTGGCGGATGTTTCTATCACCAGGGCACTGCCGCCGGAAGCGCAGCTGATGATGCAGTTAAGCATTGAGAATGGCTATAAACGCTTTATCACGCTGGTTGCTGATGCGCGTCATTCGACGCCGGAGCAGATTGATAAAATTGCCCAGGGCCACGTCTGGACCgg > 1:999063/1‑289 (MQ=255)
aTTACATTGTGGATAACCCCAGCACCCTGACCGGTTCTATCGGTATCTTCGGCGTGATCACCGCCGTAGAAAATAGTCTGGATTCGATTGGTGTTCATACTGATGGTGTCTCAACTTCACCGCTGGCGGATGTTTCTATCACCAGGGCACTGCCGCCGGAAGCGCAGCTGATGATGCAGTTAAGCATTGAGAATGGCTATAAACGCTTTATCACGCTGGTTGCTGATGCGCGTCATTCGACGCCGGAGCAGATTGATAAAATTGCCCAGGGCCACGTCTGGACCGGTCa < 2:56324/289‑1 (MQ=255)
tgtgGCTAACCCCAGCACCCTGACCGGTTCTATCGGTATCTTCGGCGTGATCACCACCGTAGAAAATAGTCTGGATTCGATTGGTGTTCATACTGATGGTGTCTCAACTTCACCGCTGGCGGATGTTTCTATCACCAGGGCACTGCCGCCGGAAGCGCAGCTGATGATGCAGTTAAGCATTGAGAATGGCTATAAACGCTTTATCACGCTGGTTGCTGATGCGCGTCATTCGACGCCGGAGCAGATTGATAAAATTGCCCAGGGCCACGTCTGGACCGGTCAGGATGCa > 2:1446498/1‑289 (MQ=255)
gCTAACCCCAGCACCCTGACCGGTTCTATCGGTATCTTCGGCGTGATCACCACCGTAGAAAATAGTCTGGATTCGATTGGTGTTCATACTGATGGTGTCTCAACTTCACCGCTGGCGGATGTTTCTATCACCAGGGCACTGCCGCCGGAAGCGCAGCTGATGATGCAGTTAAGCATTGAGAATGGCTATAAACGCTTTATCACGCTGGTTGCTGATGCGCGTCATTCGACGCCGGAGCAGATTGATAAAATTGCCCAGGGCCACGTCTGGACCGGTCAGGATGCAAAAg > 2:844522/1‑289 (MQ=255)
aCCCCAGCACCCTGACCGGTTCTATCGGTATCTTCGGCGTGATCACCACCGTAGAAAATAGTCTGGATTCGATTGGTGTTCATACTGATGGTGTCTCAACTTCACCGCTGGCGGATGTTTCTATCACCAGGGCACTGCCGCCGGAAGCGCAGCTGATGATGCAGTTAAGCATTGAGAATGGCTATAAACGCTTTATCACGCTGGTTGCTGATGCGCGTCATTCGACGCCGGAGCAGATTGATAAAATTGCCCAGGGCCACGTCTGGACCGGTCAGGCTGCAAAAGCTaa > 2:1850615/1‑289 (MQ=255)
aCCCCAGCACCCTGACCGGTTCTATCGGTATCTTCGGCGTGATCACCACCGTAGAAAATAGTCTGGATTCGATTGGTGTTCATACTGATGGTGTCTCAACTTCACCGCTGGCGGATGTTTCTATCACCAGGGCACTGCCGCCGGAAGCGCAGCTGATGATGCAGTTAAGCATTGAGAATGGCTATAAACGCTTTATCACGCTGGTTGCTGATGCGCGTCATTCGACGCCGGAGCAGATTGATAAAATTGCCCAGGGCCACGTCTGGACCGGTCAGGATGCAAAAGCTaa < 1:460518/289‑1 (MQ=255)
aCCCCAGCACCCTGACCGGTTCTATCGGTATCTTCGGCGTGATCACCACCGTAGAAAATAGTCTGGATTCGATTGGTGTTCATACTGATGGTGTCTCAACTTCACCGCTGGCGGATGTTTCTATCACCAGGGCACTGCCGCCGGAAGCGCAGCTGATGATGCAGTTAAGCATTGAGAATGGCTATAAACGCTTTATCACGCTGGTTGCTGATGCGCGTCATTCGACGCCGGAGCAGATTGATAAAATTGCCCAGGGCCACGTCTGGACCGGTCAGGATGCAAAAGCTa > 1:1992552/1‑288 (MQ=255)
cAGCACCCTGACCGGTTCTATCGGTATCTTCGGCGTGATCACCACCGTAGAAAATAGTCTGGATTCGATTGGTGTTCATACTGATGGTGTCTCAACTTCACCGCTGGCGGATGTTTCTATCACCAGGGCACTGCCGCCGGAAGCGCAGCTGATGATGCAGTTAAGCATTGAGAATGGCTATAAACGCTTTATCACGCTGGTTGCTGATGCGCGTCATTCGACGCCGGAGCAGATTGATAAAATTGCCCAGGGCCACGTCTGGACCGGTCAGGATGCAAAAGCTAACggg < 1:120635/289‑1 (MQ=255)
gCACCCTGACCGGTTCTATCGGTATCTTCGGCGTGATCACCACCGTAGAAAATAGTCTGGATTCGATTGGTGTTCATACTGATGGTGTCTCAACTTCACCGCTGGCGGATGTTTCTATCACCAGGGCACTGCCGCCGGAAGCGCAGCTGATGATGCAGTTAAGCATTGAGAATGGCTATAAACGCTTTATCACGCTGGTTGCTGATGCGCGTCATTCGACGCCGGAGCAGATTGATAAAATTGCCCAGGGc > 1:1510468/1‑251 (MQ=255)
gCACCCTGACCGGTTCTATCGGTATCTTCGGCGTGATCACCACCGTAGAAAATAGTCTGGATTCGATTGGTGTTCATACTGATGGTGTCTCAACTTCACCGCTGGCGGATGTTTCTATCACCAGGGCACTGCCGCCGGAAGCGCAGCTGATGATGCAGTTAAGCATTGAGAATGGCTATAAACGCTTTATCACGCTGGTTGCTGATGCGCGTCATTCGACGCCGGAGCAGATTGATAAAATTGCCCAGGGc < 2:1510468/251‑1 (MQ=255)
aCCCTGACCGGTTCTATCGGTATCTTCGGCGTGATCACCACCGTAGAAAATAGTCTGGATTCGATTGGTGTTCATACTGATGGTGTCTCAACTTCACCGCTGGCGGATGTTTCTATCACCAGGGCACTGCCGCCGGAAGCGCAGCTGATGATGCAGTTAAGCATTGAGAATGGCTATAAACGCTTTATCACGCTGGTTGCTGATGCGCGTCATTCGACGCCGGAGCAGATTGATAAAATTGCCCAGGGCCACGTCTGGACCGGTCAGGATGCAAAAGCTAACGGGCt < 1:562558/287‑1 (MQ=255)
tGACCGGTTCTATCGGTATCTTCGGCGTGATCACCACCGTAGAAAATAGTCTGGATTCGATTGGTGTTCATACTGATGGTGTCTCAACTTCACCGCTGGCGGATGTTTCTATCACCAGGGCACTGCCGCCGGAAGCGCAGCTGATGATGCAGTTAAGCATTGAGAATGGCTATAAACGCTTTATCACGCTGGTTGCTGATGCGCGTCATTCGACGCCGGAGCAGATTGATAAAATTGCCCAGGGc > 1:1401665/1‑245 (MQ=255)
tGACCGGTTCTATCGGTATCTTCGGCGTGATCACCACCGTAGAAAATAGTCTGGATTCGATTGGTGTTCATACTGATGGTGTCTCAACTTCACCGCTGGCGGATGTTTCTATCACCAGGGCACTGCCGCCGGAAGCGCAGCTGATGATGCAGTTAAGCATTGAGAATGGCTATAAACGCTTTATCACGCTGGTTGCTGATGCGCGTCATTCGACGCCGGAGCAGATTGATAAAATTGCCCAGGGc < 2:1401665/245‑1 (MQ=255)
tGACCGGTTCTATCGGTATCTTCGGCGTGATCACCACCGTAGAAAATAGTCTGGATTCGATTGGTGTTCATACTGATGGTGTCTCAACTTCACCGCTGGCGGATGTTTCTATCACCAGGGCACTGCCGCCGGAAGCGCAGCTGATGATGCAGTTAAGCATTGAGAATGGCTATAAACGCTTTATCACGCTGGTTGCTGATGCGCGTCATTCGACGCCGGAGCAGATTGATAAAATTGCCCAGGCCCACGTCTGGACCGCTCAGCATGCAAAAGCTAACGGGCCGGTCgc > 2:670665/1‑288 (MQ=255)
tCTATCGGTATCTTCGGCGTGATCACCACCGTAGAAAATAGTCTGGATTCGATTGGTGTTCATACTGATGGTGTCTCAACTTCACCGCTGGCGGATGTTTCTATCACCAGGGCACTGCCGCCGGAAGCGCAGCTGATGATGCAGTTAAGCATTGAGAATGGCTATAAACGCTTTATCACGCTGGTTGCTGATGCGCGTCATTCGACGCCGGAGCAGATTGATAAAATTGCCCAGGGCCACGTCTGGACCGGTCAGGATGCAAAAGCTAACGGGCTGGTCGATAGTCTCg < 2:680090/289‑1 (MQ=255)
aTCTTCGGCGTGATCACCACCGTAGAAAATAGTCTGGATTCGATTGGTGTTCATACTGATGGTGTCTCAACTTCACCGCTGGCGGATGTTTCTATCACCAGGGCACTGCCGCCGGAAGCGCAGCTGATGATGCAGTTAAGCATTGAGAATGGCTATAAACGCTTTATCACGCTGGTTGCTGATGCGCGTCATTCGACGCCGGAGCAGATTGATAAAATTGCCCAGGGCCACGTCTGGACCGGTCAGGATGCAAAAGCTAACGGGCTGGTCGATAGTCTCGGGGATTTCg > 2:1375956/1‑289 (MQ=255)
aTCTTCGGCGTGATCACCACCGTAGAAAATAGTCTGGATTCGATTGGTGTTCATACTGATGGTGTCTCAACTTCACCGCTGGCGGATGTTTCTATCACCAGGGCACTGCCGCCGGAAGCGCAGCTGATGATGCAGTTAAGCATTGAGAATGGCTATAAACGCTTTATCACGCTGGTTGCTGATGCGCGTCATTCGACGCCGGAGCAGATTGATAAAATTGCCCAGGGCCACGTCTGGACCGGTCAGGATGCAAAAGCTAACGGGCTGGTCGATAGTCCCGGGGATTTCg > 1:1744063/1‑289 (MQ=255)
aTCTTCGGCGTGATCACCACCGTAGAAAATAGTCTGGATTCGATTGGTGTTCATACTGATGGTGTCTCAACTTCACCGCTGGCGGATGTTTCTATCACCAGGGCACTGCCGCCGGAAGCGCAGCTGATGATGCAGTTAAGCATTGAGAATGGCTATAAACGCTTTATCACGCTGGTTGCTGATGCGCGTCATTCGACGCCGGAGCAGATTGATAAAATTGCCCAGGGCCACGTCTGGACCGGTCAGGATGCAAAAGCTAACGGGCTGGTCGATAGTCCCGGGGATTTCg > 1:1467890/1‑289 (MQ=255)
aTCACCACCGTAGAAAATAGTCTGGATTCGATTGGTGTTCATACTGATGGTGTCTCAACTTCACCGCTGGCGGATGTTTCTATCACCAGGGCACTGCCGCCGGAAGCGCAGCTGATGATGCAGTTAAGCATTGAGAATGGCTATAAACGCTTTATCACGCTGGTTGCTGATGCGCGTCATTCGACGCCGGAGCAGATTGATAAAATTGCCCAGGGc > 1:1850380/1‑216 (MQ=255)
aTCACCACCGTAGAAAATAGTCTGGATTCGATTGGTGTTCATACTGATGGTGTCTCAACTTCACCGCTGGCGGATGTTTCTATCACCAGGGCACTGCCGCCGGAAGCGCAGCTGATGATGCAGTTAAGCATTGAGAATGGCTATAAACGCTTTATCACGCTGGTTGCTGATGCGCGTCATTCGACGCCGGAGCAGATTGATAAAATTGCCCAGGGCCACGTCTGGACCGGTCAGGATGCAAAAGCTAACGGGCTGGTCGATAGTCTCGGGGATTTCGATGATGCGGTc > 1:1107736/1‑288 (MQ=255)
tCACCACCGTAGAAAATAGTCTGGATTCGATTGGTGTTCATACTGATGGTGTCTCAACTTCACCGCTGGCGGATGTTTCTATCACCAGGGCACTGCCGCCGGAAGCGCAGCTGATGATGCAGTTAAGCATTGAGAATGGCTATAAACGCTTTATCACGCTGGTTGCTGATGCGCGTCATTCGACGCCGGAGCAGATTGATAAAATTGCCCAGGGCCACGTCTGGACCGGTCAGGATGCAAAAGCTAACGGGCTGGTCGATAGTCTCGGGGATTTCGATGATGCGGTCg > 1:401223/1‑288 (MQ=255)
tAGAAAATAGTCTGGATTCGATTGGTGTTCATACTGATGGTGTCTCAACTTCACCGCTGGCGGATGTTTCTATCACCAGGGCACTGCCGCCGGAAGCGCAGCTGATGATGCAGTTAAGCATTGAGAATGGCTATAAACGCTTTATCACGCTGGTTGCTGATGCGCGTCATTCGACGCCGGAGCAGATTGATAAAATTGCCCAGGGCCACGTCTGGACCGGTCAGGATGCAAAAGCTAACGGGCTGGTCGATAGTCTCGGGGATTTCGATGATGCGGTCGc < 1:1672059/280‑1 (MQ=255)
tAGAAAATAGTCTGGATTCGATTGGTGTTCATACTGATGGTGTCTCAACTTCACCGCTGGCGGATGTTTCTATCACCAGGGCACTGCCGCCGGAAGCGCAGCTGATGATGCAGTTAAGCATTGAGAATGGCTATAAACGCTTTATCACGCTGGTTGCTGATGCGCGTCATTCGACGCCGGAGCAGATTGATAAAATTGCCCAGGGCCACGTCTGGACCGGTCAGGATGCAAAAGCTAACGGGCTGGTCGATAGTCTCGGGGATTTCGATGATGCGGTCGCCAAagcagc > 1:1049889/1‑289 (MQ=255)
tAGAAAATAGTCTGGATTCGATTGGTGTTCATACTGATGGTGTCTCAACTTCACCGCTGGCGGATGTTTCTATCACCAGGGCACTGCCGCCGGAAGCGCAGCTGATGATGCAGTTAAGCATTGAGAATGGCTATAAACGCTTTATCACGCTGGTTGCTGATGCGCGTCATTCGACGCCGGAGCAGATTGATAAAATTGCCCAGGGCCACGTCTGGACCGGTCAGGATGCAAAAGCTAACGGGCTGGTCGATAGTCTCGGGGATTTCGATGATGCGGTCGCCAAagcagc > 2:1331367/1‑289 (MQ=255)
aGTCTGGATTCGATTGGTGTTCATACTGATGGTGTCTCAACTTCACCGCTGGCGGATGTTTCTATCACCAGGGCACTGCCGCCGGAAGCGCAGCTGATGATGCAGTTAAGCATTGAGAATGGCTATAAACGCTTTATCACGCTGGTTGCTGATGCGCGTCATTCGACGCCGGAGCAGATTGATAAAATTGCCCAGGGCCACGTCTGGACCGGTCAGGATGCAAAAGCTAACGGGCTGGTCGATAGTCTCGGGGATTTCGATGATGCGGTCGCCAAAGCAGCAGAGCTgg > 2:1582803/1‑289 (MQ=255)
aGTCTGGATTCGATTGGTGTTCATACTGATGGTGTCTCAACTTCACCGCTGGCGGATGTTTCTATCACCAGGGCACTGCCGCCGGAAGCGCAGCTGATGATGCAGTTAAGCATTGAGAATGGCTATAAACGCTTTATCACGCTGGTTGCTGATGCGCGTCATTCGACGCCGGAGCAGATTGATAAAATTGCCCAGGGCCACGTCTGGACCGGTCAGGATGCAAAAGCTAACGGGCTGGTCGATAGTCTCGGGGATTTCGATGATGCGGTCGCCAAAGCAGCAGAGCTgg > 2:1169247/1‑289 (MQ=255)
ctggattcgaTTGGTGTTCATACTGATGGTGTCTCAACTTCACCGCTGGCGGATGTTTCTATCACCAGGGCACTGCCGCCGGAAGCGCAGCTGATGATGCAGTTAAGCATTGAGAATGGCTATAAACGCTTTATCACGCTGGTTGCTGATGCGCGTCATTCGACGCCGGAGCAGATTGATAAAATTGCCCAGGGCCACGTCTGGACCGGTCAGGATGCAAAAGCTAACGGGCTGGTCGATAGTCTCGGGGATTTCGATGATGCGGTCGCCAAAGCAGCAGAGCTGGCaa < 1:670665/280‑1 (MQ=255)
attcgaTTGGTGTTCATACTGATGGTGTCTCAACTTCACCGCTGGCGGATGTTTCTATCACCAGGGCACTGCCGCCGGAAGCGCAGCTGATGATGCAGTTAAGCATTGAGAATGGCTATAAACGCTTTATCACGCTGGTTGCTGATGCGCGTCATTCGACGCCGGAGCAGATTGATAAAATTGCCCAGGGCCACGTCTGGACCGGTCAGGATGCAAAAGCTAACGGGCTGGTCGATAGTCTCGGGGATTTCGATGATGCGGTCGCCAAAGCAGCAGAGCTGGCAAAAg < 1:933632/283‑1 (MQ=255)
attcgaTTGGTGTTCATACTGATGGTGTCTCAACTTCACCGCTGGCGGATGTTTCTATCACCAGGGCACTGCCGCCGGAAGCGCAGCTGATGATGCAGTTAAGCATTGAGAATGGCTATAAACGCTTTATCACGCTGGTTGCTGATGCGCGTCATTCGACGCCGGAGCAGATTGATAAAATTGCCCAGGGCCACGTCTGGACCGGTCAGGATGCAAAAGCTAACGGGCTGGTCGATAGTCTCGGGGATTTCGATGATGCGGTCGCCAAAGCAGCAGAGCTGGCAAAAg < 1:1375956/283‑1 (MQ=255)
aTTGGTGTTCATACTGATGGTGTCTCAACTTCACCGCTGGCGGATGTTTCTATCACCAGGGCACTGCCGCCGGAAGCGCAGCTGATGATGCAGTTAAGCATTGAGAATGGCTATAAACGCTTTATCACGCTGGTTGCTGATGCGCGTCATTCGACGCCGGAGCAGATTGATAAAATTGCCCAGGGCCACGTCTGGACCGGTCAGGATGCAAAAGCTAACGGGCTGGTCGATAGTCTCGGGGATTTCGATGATGCGGTCGCCAAAGCAGCAGAGCTGGc > 1:1798371/1‑278 (MQ=255)
ggTGTTCATACTGATGGTGTCTCAACTTCACCGCTGGCGGATGTTTCTATCACCAGGGCACTGCCGCCGGAAGCGCAGCTGATGATGCAGTTAAGCATTGAGAATGGCTATAAACGCTTTATCACGCTGGTTGCTGATGCGCGTCATTCGACGCCGGAGCAGATTGATAAAATTGCCCAGGGCCACGTCTGGACCGGTCAGGATGCAAAAGCTAACGGGCTGGTCGATAGTCTCGGGGATTTCGATGATGCGGTCGCCAAAGCAGCAGAGCTGGCAAAAGTGAAACAGt < 1:548289/289‑1 (MQ=255)
gtgtTCATACTGATGGTGTCTCAACTTCACCGCTGGCGGATGTTTCTATCACCAGGGCACTGCCGCCGGAAGCGCAGCTGATGATGCAGTTAAGCATTGAGAATGGCTATAAACGCTTTATCACGCTGGTTGCTGATGCGCGTCATTCGACGCCGGAGCAGATTGATAAAATTGCCCAGGGCCACGTCTGGACCGGTCAGGATGCAAAAGCTAACGGGCTGGTCGATAGTCTCGGGGATTTCGATGATGCGGTCGCCAAAGCAGCAGAGCTGGCAAAAGTGAAACAGTg > 2:174985/1‑289 (MQ=255)
ttCATACTGATGGTGTCTCAACTTCACCGCTGGCGGATGTTTCTATCACCAGGGCACTGCCGCCGGAAGCGCAGCTGATGATGCAGTTAAGCATTGAGAATGGCTATAAACGCTTTATCACGCTGGTTGCTGATGCGCGTCATTCGACGCCGGAGCAGATTGATAAAATTGCCCAGGGCCACGTCTGGACCGGTCAGGATGCAAAAGCTAACGGGCTGGTCGATAGTCTCGGGGATTTCGATGATGCGGTCGCCAAAGCAGCAGAGCTGGCAAAAGTGAAACAGTGGCa > 1:463493/1‑289 (MQ=255)
cATCCTGATGGTGTCTCAACTTCACCGCTGGCGGATGTTTCTATCACCAGGGCACTGCCGCCGGAAGCGCAGCTGATGATGCAGTTAAGCATTGAGAATGGCTATAAACGCTTTATCACGCTGGTTGCTGATGCGCGTCATTCGACGCCGGAGCAGATTGATAAAATTGCCCAGGGCCACGTCTGGACCGGTCAGGATGCAAAAGCTAACGGGCTGGTCGATAGTCTCGGGGATTTCGATGATGCGGTCGCCAAAGCAGCAGAGCTGGc < 2:637367/269‑1 (MQ=255)
cATACTGATGGTGTCTCAACTTCACCGCTGGCGGATGTTTCTATCACCAGGGCACTGCCGCCGGAAGCGCAGCTGATGATGCAGTTAAGCATTGAGAATGGCTATAAACGCTTTATCACGCTGGTTGCTGATGCGCGTCATTCGACGCCGGAGCAGATTGATAAAATTGCCCAGGGc < 1:1033584/177‑1 (MQ=255)
tGATGGTGTCTCAACTTCACCGCTGGCGGATGTTTCTATCACCAGGGCACTGCCGCCGGAAGCGCAGCTGATGATGCAGTTAAGCATTGAGAATGGCTATAAACGCTTTATCACGCTGGTTGCTGATGCGCGTCATTCGACGCCGGAGCAGATTGATAAAATTGCCCAGGGCCACGTCTGGACCGGTCAGGATGCAAAAGCTAACGGGCTGGTCGATAGTCTCGGGGATTTCGATGATGCGGTCGCCAAAGCAGCAGAGCTGGCAAAAGTGAAACAGTGGCATCTGGaa < 2:1107736/289‑1 (MQ=255)
gtctcaacttcaccGCTGGCGGATGTTTCTATCACCAGGGCACTGCCGCCGGAAGCGCAGCTGATGATGCAGTTAAGCATTGAGAATGGCTATAAACGCTTTATCACGCTGGTTGCTGATGCGCGTCATTCGACGCCGGAGCAGATTGATAAAATTGCCCAGGGCCACGTCTGGACCGGTCAGGATGCAAAAGCTAACGGGCTGGTCGATAGTCTCGGGGATTTCGATGATGCGGTCGCCAAAGCAGCAGAGCTGGCAAAAGTGAAACAGTGGCATCTGGAATATTACg < 2:892653/277‑1 (MQ=255)
ctcaacttcaccGCTGGCGGATGTTTCTATCACCAGGGCACTGCCGCCGGAAGCGCAGCTGATGATGCAGTTAAGCATTGAGAATGGCTATAAACGCTTTATCACGCTGGTTGCTGATGCGCGTCATTCGACGCCGGAGCAGATTGATAAAATTGCCCAGGGCCACGTCTGGACCGGTCAGGATGCAAAAGCTAACGGGCTGGTCGATAGTCTCGGGGATTTCGATGATGCGGTCGCCAAAGCAGCAGAGCTGGCAAAAGTGAAACAGTGGCATCTGGAATATTACGtt < 1:943547/279‑1 (MQ=255)
aacttcaccGCTGGCGGATGTTTCTATCACCAGGGCACTGCCGCCGGAAGCGCAGCTGATGATGCAGTTAAGCATTGAGAATGGCTATAAACGCTTTATCACGCTGGTTGCTGATGCGCGTCATTCGACGCCGGAGCAGATTGATAAAATTGCCCAGGGCCACGTCTGGACCGGTCAGGATGCAAAAGCTAACGGGCTGGTCGATAGTCTCGGGGATTTCGATGATGCGGTCGCCAAAGCAGCAGAGCTGGCAAAAGTGAAACAGTGGCATc > 2:943093/8‑272 (MQ=255)
aacttcaccGCTGGCGGATGTTTCTATCACCAGGGCACTGCCGCCGGAAGCGCAGCTGATGATGCAGTTAAGCATTGAGAATGGCTATAAACGCTTTATCACGCTGGTTGCTGATGCGCGTCATTCGACGCCGGAGCAGATTGATAAAATTGCCCAGGGCCACGTCTGGACCGGTCAGGATGCAAAAGCTAACGGGCTGGTCGATAGTCTCGGGGATTTCGATGATGCGGTCGCCAAAGCAGCAGAGCTGGCAAAAGTGAAACAGTGGCATCTGGAATATTACGTtgat > 1:758684/8‑289 (MQ=255)
ttcaccGCTGGCGGATGTTTCTATCACCAGGGCACTGCCGCCGGAAGCGCAGCTGATGATGCAGTTAAGAATTGAGAATGGCCATAAACGCTTTATCACGCTGGTTGCTGATGCGCGTCATTCGACGCCGGAGCAGATTGATAAAATTGCCCAGGGCCACGTCTGGACCGGTCAGGATGCAAAAGCTAACGGGCTGGTCGATAGTCTCGGGGATTTCGATGATGCCGTCGCCAAAGCAGCAGAACTGGCAAAAGTGAAACAGTGGCTGCTGGAAGATTACGTcgttga > 2:1798280/5‑288 (MQ=255)
tGTTTCTATCACCAGGGCACTGCCGCCGGAAGCGCAGCTGATGATGCAGTTAAGCATTGAGAATGGCTATAAACGCTTTATCACGCTGGTTGCTGATGCGCGTCATTCGACGCCGGAGCAGATTGATAAAATTGCCCAGGGCCACGTCTGGACCGGTCAGGATGCAAAAGCTAACGGGCTGGTCGATAGTCTCGGGGATTTCGATGATGCGGTCGCCAAAGCAGCAGAGCTGGCAAAAGTGAAACAGTGGCATCTGGAATATTACGTTGATGAACCGACCTTCTTCGa < 2:1464782/288‑1 (MQ=255)
gTTTCTATCACCAGGGCACTGCCGCCGGAAGCGCAGCTGATGATGCAGTTAAGCATTGAGAATGGCTATAAACGCTTTATCACGCTGGTTGCTGATGCGCGTCATTCGACGCCGGAGCAGATTGATAAAATTGCCCAGGGCCACGTCTGGACCGGTCAGGATGCAAAAGCTAACGGGCTGGTCGATAGTCTCGGGGATTTCGATGATGCGGTCGCCAAAGCAGCAGAGCTGGCAAAAGTGAAACAGTGGCATCTGGAATATTACGTTGATGAACCGACCTTCTTCGACa < 1:1458404/289‑1 (MQ=255)
gTTTCTATCACCAGGGCACTGCCGCCGGAAGCGCAGCTGATGATGCAGTTAAGCATTGAGAATGGCTATAAACGCTTTATCACGCTGGTTGCTGATGCGCGTCATTCGACGCCGGAGCAGATTGATAAAATTGCCCAGGGCCACGTCTGGACCGGTCAGGATGCAAAAGCTAACGGGCTGGTCGATAGTCTCGGGGATTTCGATGATGCGGTCGCCAAAGCAGCAGAGCTGGCAAAAGTGAAACAGTGGCATCTGGAATATTACGTTGATGAACCGACCTTCTTCGACa < 1:1797617/289‑1 (MQ=255)
gTTTCTATAACCGGGGCAGTGCCGCCGGAAGCGCTACTGATGATGGAGTTAAGCATTGAGAAGTGCTATAAACGCTTTATCACGCTGGTTGCTGAGGCGCGGCATTCGACGCCGGAGCAGATTGATAAAATTGCCCGGGGCCACGTCTGGACCGGTCAGGATGCAAAAGCTAACGGGCTGGTCGATAGTCTCGGGGATTTCGATGATGCGGTCGCCAAAGCAGCAGAGCTGGCAAAAGTGAAACAGTGGCATCTGGAATATTACGTTGATGAACCGACCTTCTTCGACa < 2:1881032/289‑1 (MQ=255)
tATCACCAGGGACCTGCCGCCGGAAGCGCAGCTGATGTGGCAGTTAAGCATTGGGAATGGCTATAAACGCTTTATCACGCTGGTTGCTGATGCGCGTCATTCGACGCCGGAGCAGATTGATAAAATTGCCCAGGGCCACGTCTGGACCGGTCAGGATGCAAAAGCTAACGGGCTGGTCGATAGTCTCGGGGATTTCGATGATGCGGTCGCCAAAGCAGCAGAGCTGGCAAAAGTGAAACAGTGGCATCTGGATTATTACGTTGATGAACCGACCTTCTTCGACAAAGTg < 2:1135555/289‑1 (MQ=255)
acACCAGGGCACTGGCGCCGGAAGCGCAGCTGATGATGCAGTTAAGCATTGAGAATGGCTATAAACGCTTTATCACGCTGGTTGCTGATGCGCGTCATTCGACGCCGGAGCAGATTGATAAAATTGCCCAGGGCCACGTCTGGACCGGTCAGGATGCAAAAGCTAACGGGCTGGTCGATAGTCTCGGGGATTTCGATGATGCGGTCGCCAAAGCAGCAGAGCTGGCAAAAGTGAAACAGTGGCATCTGGAATATTACGTTGATGAACCGACCTTCTTCGACAAAGTGAt < 2:814505/288‑1 (MQ=255)
cAGGGCACTGCCGCCGGAAGGTCAGCTGATGATGCAGTTAGGCATTGAGAATGGCTTTAAACGCTTTATCACGCTGGTTGCGGATGCGCGTCATTCGACGCCGGAGCAGATTGATAAAATTGCCCAGGGCCACGTCTGGACCGGTCAGGATGCAAAAGCTAACGGGCTGGTCGATAGTCTCGGGGATTTCGATGATGCGGTCGCCAAAGCAGCAGAGCTGGCAAAAGTGAAACAGTGGCATCTGGAATATTACGTTGATGAACCGACCTTCTTCGACAAAGTGATGGac < 2:370498/289‑1 (MQ=255)
ggCACTGCCGCCGGAAGCGCAGCTGATGATGCAGTTAAGCATTGAGAATGGCTATAAACGCTTTATCACGCTGGTTGCTGATGCGCGTCATTCGACGCCGGAGCAGATTGATAAAATTGCCCAGGGCCACGTCTGGACCGGTCAGGATGCAAAAGCTAACGGGCTGGTCGATAGTCTCGGGGATTTCGATGATGCGGTCGCCAAAGCAGCAGAGCTGGCAAAAGTGAAACAGTGGCATCTGGAATATTa > 2:623424/1‑249 (MQ=255)
ggCACTGCCGCCGGAAGCGCAGCTGATGATGCAGTTAAGCATTGAGAATGGCTATAAACGCTTTATCACGCTGGTTGCTGATGCGCGTCATTCGACGCCGGAGCAGATTGATAAAATTGCCCAGGGCCACGTCTGGACCGGTCAGGATGCAAAAGCTAACGGGCTGGTCGATAGTCTCGGGGATTTCGATGATGCGGTCGCCAAAGCAGCAGAGCTGGCAAAAGTGAAACAGTGGCATCTGGAATATTACGTTGATGAACCGACCTTCTTCGACAAAGTGATGGacaac > 1:822401/1‑289 (MQ=255)
gCACTGCCGCCGGAAGCGCAGCTGATGATGCAGTTAAGCATTGAGAATGGCTATAAACGCTTTATCACGCTGGTTGCTGATGCGCGTCATTCGACGCCGGAGCAGATTGATAAAATTGCCCAGGGCCACGTCTGGACCGGTCAGGATGCAAAAGCTAACGGGCTGGTCGATAGTCTCGGGGATTTCGATGATGCGGTCGCCAAAGCAGCAGAGCTGGCAAAAGTGAAACAGTGGCATCTGGAATATTACGTTGATGAACCGACCTTCTTCGACAAAGTGATGGacaac < 1:377180/288‑1 (MQ=255)
tGCCGCCGGAAGCGCAGCTGATGATGCAGTTAAGCATTGAGAATGGCTATAAACGCTTTATCACGCTGGTTGCTGATGCGCGTCATTCGACGCCGGAGCAGATTGATAAAATTGCCCAGGGCCACGTCTGGACCGGTCAGGATGCAAAAGCTAACGGGCTGGTCGATAGTCTCGGGGATTTCGATGATGCGGTCGCCAAAgcagca > 2:1931481/1‑206 (MQ=255)
tGCCGCCGGAAGCGCAGCTGATGATGCAGTTAAGCATTGAGAATGGCTATAAACGCTTTATCACGCTGGTTGCTGATGCGCGTCATTCGACGCCGGAGCAGATTGATAAAATTGCCCAGGGCCACGTCTGGACCGGTCAGGATGCAAAAGCTAACGGGCTGGTCGATAGTCTCGGGGATTTCGATGATGCGGTCGCCAAAGCAGCAGAGCTGGCAAAAGTGAAACAGTGGCATCTGGAATATTa > 1:652966/1‑244 (MQ=255)
tGCCGCCGGAAGCGCAGCTGATGATGCAGTTAAGCATTGAGAATGGCTATAAACGCTTTATCACGCTGGTTGCTGATGCGCGTCATTCGACGCCGGAGCAGATTGATAAAATTGCCCAGGGCCACGTCTGGACCGGTCAGGATGCAAAAGCTAACGGGCTGGTCGATAGTCTCGGGGATTTCGATGATGCGGTCGCCAAAGCAGCAGAGCTGGCAAAAGTGAAACAGTGGCATCTGGAATATTACGTTGATGAACCGACCTTCTTCGACAACGTGATGGACAACCTgac > 2:1824575/1‑287 (MQ=255)
tGCCGCCGGAAGCGCAGCTGATGATGCAGTTAAGCATTGAGAATGGCTATAAACGCTTTATCACGCTGGTTGCTGATGCGCGTCATTCGACGCCGGAGCAGATTGATAAAATTGCCCAGGGCCACGTCTGGACCGGTCAGGATGCAAAAGCTAACGGGCTGGTCGATAGTCTCGGGGATTTCGATGATGCGGTCGCCAAAGCAGCAGAGCTGGCAAAAGTGAAACAGTGGCATCTGGAATATTACGTTGATGAACCGACCTTCTTCGACAAAGTGATGGACAACATg > 2:1544287/1‑287 (MQ=255)
cgGAAGCGCAGCTGATGATGCAGTTAAGCATTGAGAATGGCTATAAACGCTTTATCACGCTGGTTGCTGATGCGCGTCATTCGACGCCGGAGCAGATTGATAAAATTGCCCAGGGCCACGTCTGGACCGGTCAGGATGCAAAAGCTAACGGGCTGGTCGATAGTCTCGGGGATTTCGATGATGCGGTCGCCAAAGCAGCAGAGCTGGCAAAAGTGAAACAGTGGCATCTGGAATATTACGTTGATGAACCGACCTTCTTCGACAAAGTGATGGACAACATGTCTGGtt < 1:1582803/288‑1 (MQ=255)
cgcAGCTGATGATGCAGTTAAGCATTGAGAATGGCTATAAACGCTTTATCACGCTGGTTGCTGATGCGCGTCATTCGACGCCGGAGCAGATTGATAAAATTGCCCAGGGCCACGTCTGGACCGGt < 1:672273/125‑1 (MQ=255)
tgCAGTTAAGCATTGTGAATGGCTATAAACGCTTTACCAAGCTGGTTGCGGATGCGCGTCATTCGACGCCGAAGCAGATTGATAAAATTGCCCAGGGCCACGTCTGGACCGGTCAGGATGCAAAAGCTAACGGGCTGGTCGATAGTCTCGGGGATTTCGATGATGCGGTCGCCAAAGCAGCAGAGCTGGCAAAAGTGAAACAGTGGCATCTGGAATATTACGTTGATGAACCGACCTTCTTCGACAAAGTGATGGACAACATGTCTGGTTCTGTCCGGGCAATGTTGc < 2:401223/288‑1 (MQ=255)
gCAGTTAAGCATTGAGAATGGCTATAAACGCTTTATCACGCTGGTTGCTGATGCGCGTCATTCGACGCCGGAGCAGATTGATAAAATTGCCCAGGGCCACGTCTGGACCGGTCAGGATGCAAAAGCTAACGGGCTGGTCGATAGTCTCGGGGATTTCGATGATGCGGTCGCCAAAGCAGCAGAGCTGGCAAAAGTGAAACAGTGGCATCTGGAATATTACGTTGATGAACCGACCTTCTTCGACa < 1:1328052/245‑1 (MQ=255)
tAAGCATTGAGAATGGCTATAAACGCTTTATCACGCTGGTTGCTGATGCGCGTCATTCGACGCCGGAGCAGATTGATAAAATTGc > 2:445717/1‑85 (MQ=255)
cATTGAGAATGGCTATAAACGCTTTATCACGCTGGTTGCTGATGCGCGTCATTCGACGCCGGAGCAGATTGATAAAATTGCCCAGGGCCACGTCTGGACCGGTCAGGATGCAAAAGCTAACGGGCTGGTCGATAGTCTCGGGGATTTCGATGATGCGGTCGCCAAAGCAGCAGAGCTGGCAAAAGTGAAACAGTGGCATCTGGAATATTACGTTGATGAACCGACCTTCTTCGACAAAGTGATGGACAACATGTCTGGTTCTGTCCGGGCAATGTTGCCAGATGCGtt > 1:905269/1‑288 (MQ=255)
aTTGGGAATGGCTATAAACGCGTTATCACGCTGGTTGCTGATGCGCGTCATGCGACGCCGGAGCAGATTGATAAAATTGCCCAGGGCCACGTCTGGACCGGTCAGGATGCAAAAGCTAACGGGCTGGTCGATAGTCTCGGGGATTTCGATGATGCGGTCGCCAAAGCAGCAGAGCTGGCAAAAGTGAAACAGTGGCATCTGGAATATTACGTTGATGAACCGACCTTCTTCGACAAAGTGATGGACAACATGTCTGGTTCTGTCCGGGCAATGTTGCCAGATGCGTTc < 2:733541/288‑1 (MQ=255)
tGAGAATGGCTATAAACGCTTTATCACGCTGGTTGCTGATGCGCGTCATTCGACGCCGGAGCAGATTGATAAAATTGCCCAGGGCCACGTCTGGACCGGTCAGGATGCAAAAGCTAACGGGCTGGTCGATAGTCTCGGGGATTTCGATGATGCGGTCGCCAAAGCAGCAGAGCTGGCAAAAGTGAAACAGTGGCATCTGGAATATTACGTTGATGAACCGACCTTCTTCGACAAAGTg < 2:1202154/238‑1 (MQ=255)
tGAGAATGGCTATAAACGCTTTATCACGCTGGTTGCTGATGCGCGTCATTCGACGCCGGAGCAGATTGATAAAATTGCCCAGGGCCACGTCTGGACCGGTCAGGATGCAAAAGCTAACGGGCTGGTCGATAGTCTCGGGGATTTCGATGATGCGGTCGCCAAAGCAGCAGAGCTGGCAAAAGTGAAACAGTGGCATCTGGAATATTACGTTGATGAACCGACCTTCTTCGACAAAGTGATGGACAACATGTCTGGTTCTGTCCGGGCAATGTTACCAGATGCGTTCCAg > 1:1711765/1‑289 (MQ=255)
gtagaATGGCTAGAAACTCTTTATCGAGCTGGTTGTTGATGGCCTGCATTCGAGGCCGGAGCAAATTGGTAAAATTGCCCAGGGCCCCTTCTGGACCGGTCAGGATGCAAAAGCTAACGGGCTGGTCGATAGTGTCGGGGATTTCGATGATGCGGTCGCCAAAGCAGCAGAGCTGGCAAAAGTGAAACAGTGGCATCTGGAATATTACGTTGATGAACCGACCTTCTTCGACAAAGGGATGGACAACATGTCTGGTTCTGTCCGGGCAATGTTGCCAGATGCGTTCCAg < 2:1711765/287‑1 (MQ=255)
agaATGGCTATAAACGCTTTATCACGCTGGTTGCTGATGCGCGTCATTCGACGCCGGAGCAGATTGATAAAATTGCCCAGGGCCACGTCTGGACCGGTCAGGATGCAAAAGCTAACGGGCTGGTCGATAGTCTCGGGGATTTCGATGATGCGGTCGCCAAAGCAGCAGAGCTGGCAAAAGTGAAACAGTGGCATCTGGAATATTACGTTGATGAACCGa > 1:481647/1‑219 (MQ=255)
agaATGGCTATAAACGCTTTATCACGCTGGTTGCTGATGCGCGTCATTCGACGCCGGAGCAGATTGATAAAATTGCCCAGGGCCACGTCTGGACCGGTCAGGATGCAAAAGCTAACGGGCTGGTCGATAGTCTCGGGGATTTCGATGATGCGGTCGCCAAAGCAGCAGAGCTGGCAAAAGTGAAACAGTGGCATCTGGAATATTACGTTGATGAACCGACCTTCTTCGACAAAGTGATGGaca < 2:1871201/243‑1 (MQ=255)
agaATGGCTATAAACGCTTTATCACGCTGGTTGCTGATGCGCGTCATTCGACGCCGGAGCAGATTGATAAAATTGCCCAGGGCCACGTCTGGACCGGTCAGGATGCAAAAGCTAACGGGCTGGTCGATAGTCTCGGGGATTTCGATGATGCGGTCGCCAAAGCAGCAGAGCTGGCAAAAGTGAAACAGTGGCATCTGGAATATTACGTTGATGAACCGACCTTCTTCGACAAAGTGATGGaca > 1:1871201/1‑243 (MQ=255)
agaATGGCTATAAACGCTTTATCACGCTGGTTGCTGATGCGCGTCATTCGACGCCGGAGCAGATTGATAAAATTGCCCAGGGCCACGTCTGGACCGGTCAGGATGCAAAAGCTAACGGGCTGGTCGATAGTCTCGGGGATTTCGATGATGCGGTCGCCAAAGCAGCAGAGCTGGCAAAAGTGAAACAGTGGCATCTGGAATATTACGTTGATGAACCGACCTTCTTCGACAAAGTGATGGACAACATGTCTGGTTCTGTCCGGGCAATGTTGCCAGATGCGTTCCAgg > 1:129058/1‑288 (MQ=255)
agaATGGCTATAAACGCTTTATCACGCTGGTTGCTGATGCGCGTCATTCGACGCCGGAGCAGATTGATAAAATTGCCCAGGGCCACGTCTGGACCGGTCAGGATGCAAAAGCTAACGGGCTGGTCGATAGTCTCGGGGATTTCGATGATGCGGTCGCCAAAGCAGCAGAGCTGGCAAAAGTGAAACAGTGGCATCTGGAATATTACGTTGATGAACCGACCTTCTTCGACAAAGTGATGGACAACATGTCTGGTTCTGTCCGGGCAATGTTGCCAGATGCGTTCCAgg > 2:428183/1‑288 (MQ=255)
agaATGGCTATAAACGCTTTATCACGCTGGTTGCTGATGCGCGTCATTCGACGCCGGAGCAGATTGATAAAATTGCCCAGGGCCACGTCTGGACCGGTCAGGATGCAAAAGCTAACGGGCTGGTCGATAGTCGCGGGGATTTCGATGATGCGGTCGCCAAAGCAGCAGAGCTGGCAAACGTGAAACAGTGGCATCTGGAATATTACGGTGATGAACCGACCTTCTTCGACAAAGTGATGGACAACATGTCTGGTTCTGTCCGGGCAATGTTGCCAGATGCGTTCCAgg > 2:304414/1‑288 (MQ=255)
aaTGGCTATAAACGCTTTATCACGCTGGTTGCTGATGCGCGTCATTCGACGCCGGAGCAGATTGATAAAATTGCCCAGGGCCACGTCTGGACCGGTCAGGATGCAAAAGCTAACGGGCTGGTCGATAGTCTCGGGGATTTCGATGATGCGGTCGCCAAAGCAGCAGAGCTGGCAAAAGTGAAACAGTGGCATCTGGAATATTACGTTGATGAACCGACCTTCTTCGACAAAGTGATGGACAACATGTCTGGTTCTGTCCGGGCAATGTTGCCAGATGCGTTCCAGGcc < 2:758684/288‑1 (MQ=255)
aTGGCTATACACGCTGTATCACGGTGGTTGCTGCTGCGCGTCATTCGACGCCGGAGCAGATTGATAAGATTGCCCAGGGCCACGTCTGGACCGGTCAGGATGCAAAAGCTAACGGGCTGTTCGATAGTCTCGGGGATTTCGATGAGGCGGTCGCCAAAGCATCAGAGCTGGCAAAAGTGAAACAGTGGCATCTGGAATATTACGTTGATGAACCGACCTTCTTCGACAAAGTGATGGACAACATGTCTGGTTCTGTCCGTGCAATGTTGCCAGATGCGTTCCAGGCCAt < 1:1935683/289‑1 (MQ=255)
aTGGCTATAAACGCTTTATCACGCTGGTTGCTGATGCGCGTCATTCGACGCCGGAGCAGATTGATAAAATTGCCCAGGGCCACGTCTGGACCGGTCAGGATGCAAAAGCTAACGGGCTGGTCGATAGTCTCGGGGATTTCGATGATGCGGTCGCCAAAGCAGCAGAGCTGGCAAAAGTGAAACAGTGGCATCTGGAATATTACGTTGATGAACCGACCTTCTTCGACAAAGTGATGGACAACATGTCTGGTTCTGTCCGGGCAATGTTGCCAGATGCGTTCCAGGCCAt < 1:720000/289‑1 (MQ=255)
aTGGCTATAAACGCTTTATCACGCTGGTTGCTGATGCGCGTCATTCGACGCCGGAGCAGATTGATAAAATTGCCCAGGGCCACGTCTGGACCGGTCAGGATGCAAAAGCTAACGGGCTGGTCGATAGTCTCGGGGATTTCGATGATGCGGTCGCCAAAGCAGCAGAGCTGGCAAAAGTGAAACAGTGGCATCTGGAATATTACGTTGATGAACCGACCTTCTTCGACAAAGTGATGGACAACATGTCTGGTTCTGTCCGGGCAATGTTGCCAGATGCGTTCCAGGCCAt < 1:1544287/289‑1 (MQ=255)
aaaCGCTTTATCACGCTGGTTGCTGATGCGCGTCATTCGACGCCGGAGCAGATTGATAAAATTGCCCAGGGCCACGTCTGGACCGGTCAGGATGCAAAAGCTAACGGGCTGGTCGATAGTCTCGGGGATTTCGATGATGCGGTCGCCAAAGCAGCAGAGCTGGCAAAAGTGAAACAGTGGCATCTGGAATATTACGTTGATGAACCGACCTTCTTCGACAAAGTGATGGACAACATGTCTGGTTCTGTCCGGGCAATGTTGCCAGATGCGTTCCAGGCCATGTTACCTg < 1:629727/289‑1 (MQ=255)
aaaCGCTTTATCACGCTGGTTGCTGATGCGCGTCATTCGACGCCGGAGCAGATTGATAAAATTGCCCAGGGCCACGTCTGGACCGGTCAGGATGCAAAAGCTAACGGGCTGGTCGATAGTCTCGGGGATTTCGATGATGCGGTCGCCAAAGCAGCAGAGCTGGCAAAAGTGAAACAGTGGCATCTGGAATATTACGTTGATGAACCGACCTTCTTCGACAAAGTGATGGACAACATGTCTGGTTCTGTCCGGGCAATGTTGCCAGATGCGTTCCAGGCCATGTTACCTg < 1:436354/289‑1 (MQ=255)
aaCGCTTTATCACGCTGGTTGCTGATGCGCGTCATTCGACGCCGGAGCAGATTGATAAAATTGCCCAGGGCCACGTCTGGACCGGTCAGGATGCAAAAGCTAACGGGCTGGTCGATAGTCTCGGGGATTTCGATGATGCGGTCGCCAAAGCAGCAGAGCTGGCAAAAGTGAAACAGTg < 1:1898949/178‑1 (MQ=255)
cTTTATCACGCTGGTTGCTGATGCGCGTCATTCGACGCCGGAGCAGATTGATAAAATTGCCCAGGGCCACGTCTGGACCGGTCAGGATGCAAAAGCTAACGGGCTGGTCGATAGTCTCGGGGATTTCGATGATGCGGTCGCCAAAGCAGCAGAGCTGGCAAAAGTGAAACAGTGGCATCTGGAATATTACg > 2:1039824/1‑191 (MQ=255)
cTTTATCACGCTGGTTGCTGATGCGCGTCATTCGACGCCGGAGCAGATTGATAAAATTGCCCAGGGCCACGTCTGGACCGGTCAGGATGCAAAAGCTAACGGGCTGGTCGATAGTCTCGGGGATTTCGATGATGCGGTCGCCAAAGCAGCAGAGCTGGCAAAAGTGAAACAGTGGCATCTGGAATATTACGTTGATGAACCGACCTTCTTCGACAAAGTGATGGACAACATGTCTGGTTCTGTCCGGGCAATGTTGCCAGAt < 1:1802716/262‑1 (MQ=255)
tCACGCGGGTTGCTGGTGGGGGTGATTCGAAGCCGGAGGAAATTGTTAAAATGGCCGCGGGCCAGGTGTGGACCGGGCGGGAGGAAAAAGCTAGCGGGCGGGTCGATAGACGCGGGGATTTGGGTGATGCGGTCGCCAAATATGCAGAGGTGGCAAAAGTGGAACAGTGGCATCTGGAATATTACGTTGATGAACCGACCTTCTTCGGCAAAGTGATGAACAACATGTCTGGTTCTGTCCGGGCAATGTTGCCAGATGCGTTCCAGGCCATGTTACCTGCACCGCTGGc < 2:1965615/289‑1 (MQ=255)
gtggtgtcTGAGGCGCGTCATTCGACGCCGGAGCAGATTACTAAAATTGCCCAGGGCCACGTCTGGACCGGTCAGGATGCAAAAGCTAACGGGCTGGTCGATAGTCTCGGGGATTTCGATGATGCGGTCGCCAAAGCAGCAGAGCTGGCAAAAGTGAAACAGTGGCATCTGGAATATTACGTTGATGAACCGACCTTCTTCGACAAAGTGATGGACAACATGTCTGGTTCTGTCCGGGCAATGTTGCCAGATGCGTTCCAGGCCATGTTACCTGCACCGCTGGcctcg < 2:470019/281‑4 (MQ=255)
gTTGCTGATGCGCGTCATTCGACGCCGGAGCAGATTGATAAAATTGCCCAGGGCCACGTCTGGACCGGTCAGGATGCAAAAGCTAACGGGCTGGTCGATAGTCTCGGGGATTTCGATGATGCGGTCGCCAAAGCAGCAGAGCTGGCAAAAGTGAAACAGTGGCATCTGGAATATTACGTTGATGAACCGACCTTCTTCGACAAAGTGATGGACAACATGTCTGGTTCTGTCCGGGCAATGTTGCCAGATGCGTTCCAGGCCATGTTACCTGCACCGCTgg < 1:577564/280‑1 (MQ=255)
gTTGCTGATGCGCGTCATTCGACGCCGGAGCAGATTGATAAAATTGCCCAGGGCCACGTCTGGACCGGTCAGGATGCAAAAGCTAACGGGCTGGTCGATAGTCTCGGGGATTTCGATGATGCGGTCGCCAAAGCAGCAGAGCTGGCAAAAGTGAAACAGTGGCATCTGGAATATTACGTTGATGAACCGACCTTCTTCGACAAAGTGATGGACAACATGTCTGGTTCTGTCCGGGCAATGTTGCCAGATGCGTTCCAGGCCATGTTACCTGCACCGCTGGcctcggta > 2:333432/1‑282 (MQ=255)
gTTGCTGATGCGCGTCATTCGACGCCGGAGCAGATTGATAAAATTGCCCAGGGCCACGTCTGGACCGGTCAGGATGCAAAAGCTAACGGGCTGGTCGATAGTCTCGGGGATTTCGATGATGCGGTCGCCAAAGCAGCAGAGCTGGCAAAAGTGAAACAGTGGCATCTGGAATATTACGTTGATGAACCGACCTTCTTCGACAAAGTGATGGACAACATGTCTGGTTCTGTCCGGGCAATGTTGCCAGATGCGTTCCAGGCCATGTTACCTGCACCGCTGGcctcg > 2:1229511/1‑282 (MQ=255)
gCTGATGCGCGTCATTCGACGCCGGAGCAGATTGATAAAATTGCCCAGGGCCACGTCTGGACCGGTCAGGATGCAAAAGCTAACGGGCTGGTCGATAGTCTCGGGGATTTCGATGATGCGGTCGCCAAAGCAGCAGAGCTGGCAAAAGTGAAACAGTGGCATCTGGAATATTACGTTGATGAACCGACCTTCTTCGACAAAGTGATGGACAACATGTCTGGTTCTGTCCGGGCAATGTTGCCAGATGCGTTCCAGGCCATGTTACCTGCACCGCTGGCCTCGGTAGCct < 1:844522/289‑1 (MQ=255)
cgcgTCATTCGACGCCGGAGCAGATTGATAAAATTGCCCAGGGCCACGTCTGGACCGGTCAGGATGCAAAAGCTAACGGGCTGGTCGATAGTCTCGGGGATTTCGATGATGCGGTCGCCAAAGCAGCAGAGCTGGCAAAAGTGAAACAGTGGCAt > 2:1960203/1‑155 (MQ=255)
cgcgTCATTCGACGCCGGAGCAGATTGATAAAATTGCCCAGGGCCACGTCTGGACCGGTCAGGATGCAAAAGCTAACGGGCTGGTCGATAGTCTCGGGGATTTCGATGATGCGGTCGCCAAAGCAGCAGAGCTGGCAAAAGTGAAACAGTGGCATCTGGAATATTACGTTGATGAACCGACCTTCTTCGACAAAGTGATGGACAACATGTCTGGTTCTGTCCGGGCAATGTTGCCAGATGCGTTCCAGGCCATGTTACCTGCACCGCTGGCCTCGGTAGCCTCTACCGt > 1:1178658/1‑289 (MQ=255)
cgcgTCATTCGACGCCGGAGCAGATTGATAAAACTGCCCAGGGCCACGTCTGGACCGGTCAGGATGCAAAAGCTAACGGGCTGGTCGATAGTCTCGGGGATTTCGATGATGCGGTCGCCAAAGCAGCAGAGCTGGCAAAAGTGAAACAGTGGCATCTGGAATATTACGTTGATGAACCGACCTTCTTCGACAAAGTGATGGACAACATGTCTGGTTCTGTCCGGGCAATGTTGCCAGATGCGTTCCAGGCCATGTTACCTGCACCGCTgg > 2:1316518/1‑270 (MQ=255)
|||
ATCTGGTGGTTACTGGATTTCCACGCCAGCTAATTACATTGTGGCTAACCCCAGCACCCTGACCGGTTCTATCGGTATCTTCGGCGTGATCACCACCGTAGAAAATAGTCTGGATAGCATTGGTGTTCATACTGATGGTGTCAGTACTAGTCCGCTGGCGGATGTTTCTATCACCAGGGCACTGCCGCCGGAAGCGCAGCTGATGATGCAGTTAAGCATTGAGAATGGCTATAAACGCTTTATCACGCTGGTTGCTGATGCGCGTCATAGCACGCCGGAGCAGATTGATAAAATTGCCCAGGGCCACGTCTGGACCGGTCAGGATGCAAAAGCTAACGGGCTGGTCGATAGTCTCGGGGATTTCGATGATGCGGTCGCCAAAGCAGCAGAGCTGGCAAAAGTGAAACAGTGGCATCTGGAATATTACGTTGATGAACCGACCTTCTTCGACAAAGTGATGGACAACATGTCTGGTTCTGTCCGGGCAATGTTGCCAGATGCGTTCCAGGCCATGTTACCTGCACCGCTGGCCAGCGTAGCCTCTACCGTT > CP042583/1532116‑1532665
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 11 ≤ ATCG/ATCG < 24 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
GATK/CNVnator alignment
N/A
