Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A7 F1 I1 R1
|
776 |
60.0 |
3074904 |
90.1% |
2770488 |
104.4 |
Breseq alignment
BRESEQ :: Evidence
|
| evidence |
seq id |
position |
mutation |
annotation |
gene |
description |
| RA |
NC_000913 |
3,456,797 |
G→C |
A141P (GCC→CCC) |
gspD → |
general secretory pathway component, cryptic |
|
| |
seq id |
position |
ref |
new |
freq |
score (cons/poly) |
reads |
annotation |
genes |
product |
| * | NC_000913 | 3,456,797 | 0 | G | C | 100.0%
| 280.8
/ NA
| 79 | A141P (GCC→CCC) | gspD | general secretory pathway component, cryptic |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (0/0); new base C (38/41); total (38/41) |
TTTTCTGAAAGTGGTTCGCTCAGCTAATGTAAAAACATCGCCAGGGATGATTGCTGACAGTTCTCGTCCAGGCGTAGGTGATGAGTTGGTCACCCGAATTGTACCGCTTGAGAACGTTCCTGCTCGTGAC‑‑CTGGCCCCCCTGCTCCGCCAGATGATGGATGCGGGTAGCGTCGGTAATGTTGTGCATTATGAACCCTCCAACGTTCTTATTCTGACCGGTCGTGCCTCCACCATTAATAAACTGATTGAAGTCATA > NC_000913/3456664‑3456919
|
ttttCTGAAAGTGGTTCGCTCAGCTAATGTAAAAACATCGCCAGGGATGATTGCTGACAGTTCTCGTCCAGGCGTAGGTGATGAGTTGGTCACCCGAATTGTACCGCTTGAGAACGTTCCTGCTCGTGAC‑‑CTGcccccc < 1:1046383/139‑1 (MQ=255)
ttCTGAAAGTGGTTCGCTCAGCTAATGTAAAAACATCGCCAGGGATGATTGCTGACAGTTCTCGTCCAGGCGTAGGTGATGAGTTGGTCACCCGAATTGTACCGCTTGAGAACGTTCCTGCTCGTGAC‑‑CTGCCCCCCCt > 1:284791/1‑139 (MQ=255)
ttCTGAAAGTGGTTCGCTCAGCTAATGTAAAAACATCGCCAGGGATGATTGCTGACAGTTCTCGTCCAGGCGTAGGTGATGAGTTGGTCACCCGAATTGTACCGCTTGAGAACGTTCCTGCTCGTGAC‑‑CTGCCCCCCCt > 1:149234/1‑139 (MQ=255)
aaaGTGGTTCGCTCAGCTAATGTAAAAACATCGCCAGGGATGATTGCTGACAGTTCTCGTCCAGGCGTAGGTGATGAGTTGGTCACCCGAATTGTACCGCTTGAGAACGTTCCTGCTCGTGAC‑‑CTGCCCCCCCTGCTcc < 1:994558/139‑1 (MQ=255)
aGTGGTTCGCTCAGCTAATGTAAAAACATCGCCAGGGATGATTGCTGACAGTTCTCGTCCAGGCGTAGGTGATGAGTTGGTCACCCGAATTGTACCGCTTGAGAACGTTCCTGCTCGTGAC‑‑CTGCCCCCCCTGCTCCGc < 1:1338222/139‑1 (MQ=255)
ttCGCTCAGCTAATGTAAAAACATCGCCAGGGATGATTGCTGACAGTTCTCGTCCAGGCGTAGGTGATGAGTTGGTCACCCGAATTGTACCGCTTGAGAACGTTCCTGCTCGTGAC‑‑CTGCCCCCCCTg > 1:1108738/1‑128 (MQ=255)
ttCGCTCAGCTAATGTAAAAACATCGCCAGGGATGATTGCTGACAGTTCTCGTCCAGGCGTAGGTGATGAGTTGGTCACCCGAATTGTACCGCTTGAGAACGTTCCTGCTCGTGAC‑‑CTGCCCCCCCTg < 2:1108738/128‑1 (MQ=255)
ttCGCTCAGCTAATGTAAAAACATCGCCAGGGATGATTGCTGACAGTTCTCGTCCAGGCGTAGGTGATGAGTTGGTCACCCGAATTGTACCGCTTGAGAACGTTCCTGCTCGTGAC‑‑CTGCCCCCCCTGCTCCGCCAgat > 2:6481/1‑139 (MQ=255)
cGCTCAGCTAATGTAAAAACATCGCCAGGGATGATTGCTGACAGTTCTCGTCCAGGCGTAGGTGATGAGTTGGTCACCCGAATTGTACCGCTTGAGAACGTTCCTGCTCGTGAC‑‑CTGCCCCCCCTGCTCCGCCAgatga < 2:1302145/139‑1 (MQ=255)
aGCTAATGTAAAAACATCGCCAGGGATGATTGCTGACAGTTCTCGTCCAGGCGTAGGTGATGAGTTGGTCACCCGAATTGTACCGCTTGAGAACGTTCCTGCTCGTGAC‑‑CTGCCCCCCCTGCTCCGCCAGATgatggat < 2:512988/139‑1 (MQ=255)
cTAATGTAAAAACATCGCCAGGGATGATTGCTGACAGTTCTCGTCCAGGCGTAGGTGATGAGTTGGTCACCCGAATTGTACCGCTTGAGAACGTTCCTGCTCGTGAC‑‑CTGCCCCCCCTGCTCCGCCAGATGATGGATGc > 2:537462/1‑139 (MQ=255)
tGTAAAAACATCGCCAGGGATGATTGCTGACAGTTCTCGTCCAGGCGTAGGTGATGAGTTGGTCACCCGAATTGTACCGCTTGAGAACGTTCCTGCTCGTGAC‑‑CTGCCCCCCCTGCTCCGCCAGATGATGGATGCGGGt > 1:739651/1‑139 (MQ=255)
aaaaaCATCGCCAGGGATGATTGCTGACAGTTCTCGTCCAGGCGTAGGTGATGAGTTGGTCACCCGAATTGTACCGCTTGAGAACGTTCCTGCTCGTGAC‑‑CTGCCCCCCCTGCTCCGCCAGATGATGGATGCGGGTAGc < 1:537462/139‑1 (MQ=255)
aaaaaCATCGCCAGGGATGATTGCTGACAGTTCTCGTCCAGGCGTAGGTGATGAGTTGGTCACCCGAATTGTACCGCTTGAGAACGTTCCTGCTCGTGAC‑‑CTGCCCCCCCTGCTCCGCCAGATGATGGATGCGGGTAGc < 2:1519310/139‑1 (MQ=255)
aTCGCCAGGGATGATTGCTGACAGTTCTCGTCCAGGCGTAGGTGATGAGTTGGTCACCCGAATTGTACCGCTTGAGAACGTTCCTGCTCGTGAC‑‑CTGCCCCCCCTGCTCCGCCAGATGATGGATGCGGGTAGCGTCGGt < 2:1111723/139‑1 (MQ=255)
cGCCAGGGATGATTGCTGACAGTTCTCGTCCAGGCGTAGGTGATGAGTTGGTCACCCGAATTGTACCGCTTGAGAACGTTCCTGCTCGTGAC‑‑CTGCCCCCCCTGCTCCGCCAGATGATGGATGCGGGTAGCGTCGGTaa > 1:752081/1‑139 (MQ=255)
ccAGGGATGATTGCTGACAGTTCTCGTCCAGGCGTAGGTGATGAGTTGGTCACCCGAATTGTACCGCTTGAGAACGTTCCTGCTCGTGAC‑‑CTGCCCCCCCTGCTCCGCCAGATGATGGATGCggg < 2:1485392/125‑1 (MQ=255)
ccAGGGATGATTGCTGACAGTTCTCGTCCAGGCGTAGGTGATGAGTTGGTCACCCGAATTGTACCGCTTGAGAACGTTCCTGCTCGTGAC‑‑CTGCCCCCCCTGCTCCGCCAGATGATGGATGCggg > 1:1485392/1‑125 (MQ=255)
ccAGGGATGATTGCTGACAGTTCTCGTCCAGGCGTAGGTGATGAGTTGGTCACCCGAATTGTACCGCTTGAGAACGTTCCTGCTCGTGAC‑‑CTGCCCCCCCTGCTCCGCCAGATGATGGATGCGGGTAGCGTCGGTAAtg < 1:457680/139‑1 (MQ=255)
cAGGGATGATTGCTGACAGTTCTCGTACAGGCGTAGGTGATGAGTTGGTCACCCGAATTGTACCGCTTGAGAACGTTCCTGCTCGTGAC‑‑CTGCCCCCCCTGCTCCGCCAGATGATGGATGCGGGTAGCGTCGGTAAtgt < 1:1207639/139‑1 (MQ=255)
ggATGATTGCTGACAGTTCTCGTCCAGGCGTAGGTGATGAGTTGGTCACCCGAATTGTACCGCTTGAGAACGTTCCTGCTCGTGAC‑‑CTGCCCCCCCTGCTCCGCCAGATGATGGATGCGGGTAGCGTCGGTAAtgttgt < 2:752081/139‑1 (MQ=255)
atgatTGCTGACAGTTCTCGTCCAGGCGTAGGTGATGAGTTGGTCACCCGAATTGTACCGCTGGAGAACGTTCCTGCTCGTGAC‑‑CTGCCCCCCCTGCTCCGCCAGATGATGGATGCGGGTAGCGTCGGTAATGTTGTGc < 2:1053070/139‑1 (MQ=255)
atTGCTGACAGTTCTCGTCCAGGCGTAGGTGATGAGTTGGTCACCCGAATTGTACCGCTTGAGAACGTTCCTGCTCGTGAC‑‑CTGCCCCCCCTGCTCCGCCAGATGATGGATGCGGGTAGCGTCGGTAATGTTGTGCAtt > 2:836857/1‑139 (MQ=255)
tGCTGACAGTTCTCGTCCAGGCGTAGGTGATGAGTTGGTCACCCGAATTGTACCGCTTGAGAACGTTCCTGCTCGTGAC‑‑CTGCCCCCCCTGCTCCGCCAGATGATGGATGCGGGTAGCGTCGGTAATGTTGTGCATTAt > 1:333251/1‑139 (MQ=255)
cTGACAGTTCTCGTCCAGGCGTAGGTGATGAGTTGGTCACCCGAATTGTACCGCTTGAGAACGTTCCTGCTCGTGAC‑‑CTGCCCCCCCTGCTCCGCCAGATGATGGATGCGGGTAGCGTCGGTAATGTTGTGCATTATGa > 1:1078862/1‑139 (MQ=255)
ttCTCGTCCAGGCGTAGGTGATGAGTTGGTCACCCGAATTGTACCGCTTGAGAACGTTCCTGCTCGTGAC‑‑CTGCCCCCCCTGCTCCGCCAGATGATGGATGCGGGTAGCGTCGGTAATGTTGTGCATTATGAACCCTcc > 1:1353633/1‑139 (MQ=255)
tctcGTCCAGGCGTAGGTGATGAGTTGGTCACCCGAATTGTACCGCTTGAGAACGTTCCTGCTCGTGAC‑‑CTGCCCCCCCTGCTCCGCCAGATGATGGATGCGGGTAGCGTCGGTAATGTTGTGCATTATGAACCCTCCa > 2:374374/1‑139 (MQ=255)
ctcGTCCAGGCGTAGGTGATGAGTTGGTCACCCGAATTGTACCGCTTGAGAACGTTCCTGCTCGTGAC‑‑CTGCCCCCCCTGCTCCGCCAGATGATGGATGCGGGTAGCGTCGGTAATGTTGTGCATTATGAACCCTCCaa < 2:739651/139‑1 (MQ=255)
ctcGTCCAGGCGTAGGTGATGAGTTGGTCACCCGAATTGTACCGCTTGAGAACGTTCCTGCTCGTGAC‑‑CTGCCCCCCCTGCTCCGCCAGATGATGGATGCGGGTAGCGTCGGTAATGTTGTGCATTATGAACCCTCCaa < 1:836857/139‑1 (MQ=255)
ggCGTAGGTGATGAGTTGGTCACCCGAATTGTACCGCTTGAGAACGTTCCTGCTCGTGAC‑‑CTGCCCCCCCTGCTCCGc < 2:128269/78‑1 (MQ=255)
ggCGTAGGTGATGAGTTGGTCACCCGAATTGTACCGCTTGAGAACGTTCCTGCTCGTGAC‑‑CTGCCCCCCCTGCTCCGc > 1:128269/1‑78 (MQ=255)
ggCGTAGGTGATGAGTTGGTCACCCGAATTGTACCGCTTGAGAACGTTCCTGCTCGTGAC‑‑CTGCCCCCCCTGCTCCGCCAGATGATGGATGCGGGTAGCGTCGGTAATGTTGTGCATTATGAACCCTCCAACGTTCTTa > 2:409001/1‑139 (MQ=255)
aGGTGATGAGTTGGTCACCCGAATTGTACCGCTTGAGAACGTTCCTGCTCGTGAC‑‑CTGCCCCCCCTGCTCCGCCAGATGATGGATGCGGGTAGCGTCGGTAATGTTGTGCATTATGa > 1:1253761/1‑117 (MQ=255)
aGGTGATGAGTTGGTCACCCGAATTGTACCGCTTGAGAACGTTCCTGCTCGTGAC‑‑CTGCCCCCCCTGCTCCGCCAGATGATGGATGCGGGTAGCGTCGGTAATGTTGTGCATTATGa < 2:1253761/117‑1 (MQ=255)
ggTGATGAGTTGGTCACCCGAATTGTACCGCTTGAGAACGTTCCTGCTCGTGAC‑‑CTGCCCCCCCTGCTCCGCCAGATGATGGATGCGGGTAGCGTCGGTAATGTTGTGCATTATGAACCCTCCAACGtt > 2:668322/1‑129 (MQ=255)
ggTGATGAGTTGGTCACCCGAATTGTACCGCTTGAGAACGTTCCTGCTCGTGAC‑‑CTGCCCCCCCTGCTCCGCCAGATGATGGATGCGGGTAGCGTCGGTAATGTTGTGCATTATGAACCCTCCAACGtt < 1:668322/129‑1 (MQ=255)
tgaGTTGGTCACCCGAATTGTACCGCTTGAGAACGTTCCTGCTCGTGAC‑‑CTGCCCCCCCTGCTCCGCCAGATGATGGATGCGGGTAGCGTCGGTAATGTTGTGCAtt < 1:1530048/107‑1 (MQ=255)
tgaGTTGGTCACCCGAATTGTACCGCTTGAGAACGTTCCTGCTCGTGAC‑‑CTGCCCCCCCTGCTCCGCCAGATGATGGATGCGGGTAGCGTCGGTAATGTTGTGCAtt > 2:1530048/1‑107 (MQ=255)
tgaGTTGGTCACCCGAATTGTACCGCTTGAGAACGTTCCTGCTCGTGAC‑‑CTGCCCCCCCTGCTCCGCCAGATGATGGATGCGGGTAGCGTCGGTAATGTTGTGCATTATGAACCCTCCAACGTTCTTATTCTGACCGGt > 2:1429558/1‑139 (MQ=255)
tgaGTTGGTCACCCGAATTGTACCGCTTGAGAACGTTCCTGCTCGTGAC‑‑CTGCCCCCCCTGCTCCGCCAGATGATGGATGCGGGTAGCGTCGGTAATGTTGTGCATTATGAACCCTCCAACGTTCTTATTCTGACCGGt > 2:790707/1‑139 (MQ=255)
ttGGTCACCCGAATTGTACCGCTTGAGAACGTTCCTGCTCGTGAC‑‑CTGCCCCCCCTGCt < 2:685659/59‑1 (MQ=255)
ttGGTCACCCGAATTGTACCGCTTGAGAACGTTCCTGCTCGTGAC‑‑CTGCCCCCCCTGCt > 1:685659/1‑59 (MQ=255)
ggTCACCCGAATTGTACCGCTTGAGAACGTTCCTGCTCGTGAC‑‑CTGCCCCCCCTGCTCGGCCAGATGATGGATGCGGGt < 2:1359569/79‑1 (MQ=255)
ggTCACCCGAATTGTACCGCTTGAGAACGTTCCTGCTCGTGAC‑‑CTGCCCCCCCTGCTCGGCCAGATGATGGATGCGGGt > 1:1359569/1‑79 (MQ=255)
ggTCACCCGAATTGTACCGCTTGAGAACGTTCCTGCTCGTGAC‑‑CTGCCCCCCCTGCTCCGCCAGATGATGGATGCGGGTAGCGTCGGTAATGTTGTGCATTATGAACCCTCCAACGTTCTTATTCTGACCGGTCGTGcc > 1:155525/1‑139 (MQ=255)
gTCACCCGAATTGTACCGCTTGAGAACGTTCCTGCTCGTGAC‑‑CTGCCCCCCCTGCTCCGCCAGATGATGGATGCGGGTAGCGTCGGTAATGTTGTGCATTATGAACCCTCCAACGTTCTTATTCTGACCGGTCGTGCCt < 1:1274976/139‑1 (MQ=255)
gTCACCCGAATTGTACCGCTTGAGAACGTTCCTGCTCGTGAC‑‑CTGCCCCCCCTGCTCCGCCAGATGATGGATGCGGGTAGCGTCGGTAATGTTGTGCATTATGAACCCTCCAACGTTCTTATTCTGACCGGTCGTGCCt > 1:1350549/1‑139 (MQ=255)
tCACCCGAATTGTACCGCTTGAGAACGTTCCTGCTCGTGAC‑‑CTGCCCCCCCTGCTCCGCCAGATGATGGATGCGGGTAGCGTCGGTAATGTTGTGCATTATGAACCCTCCAACGTTCTTATTCTGACCGGTCGTGCCTc < 1:409001/139‑1 (MQ=255)
cACCCGAATTGTACCGCTTGAGAACGTTCCTGCTCTTGAC‑‑CTGCCCCCCCTGCTCCGCCAGATGATGGATGCGGGTAGCGTCGGTAATGTTGTGCATTATGAACCCTCCAACGTTCTTATTCTGACCGGTCGTGCCTcc < 2:1078862/139‑1 (MQ=255)
cACCCGAATTGTACCGCTTGAGAACGTTCCTGCTCGTGAC‑‑CTGCCCCCCCTGCTCCGCCAGATGATGGATGCGGGTAGCGTCGGTAATGTTGTGCATTATGAACCCTCCAACGTTCTTATTCTGACCGGt < 2:526255/130‑1 (MQ=255)
cACCCGAATTGTACCGCTTGAGAACGTTCCTGCTCGTGAC‑‑CTGCCCCCCCTGCTCCGCCAGATGATGGATGCGGGTAGCGTCGGTAATGTTGTGCATTATGAACCCTCCAACGTTCTTATTCTGACCGGt > 1:526255/1‑130 (MQ=255)
cccGAATTGTACCGCTTGAGAACGTTCCTGCTCGTGAC‑‑CTGCCCCCCCTGCTCCGCCAGATGATGGATGCGGGTAGCGTCGGTAATGTTGTGCATTATGAACCCTCCAACGTTCTTATTCTGACCGGTCGTGCCTccac < 1:1429558/139‑1 (MQ=255)
cccGAATTGTACCGCTTGAGAACGTTCCTGCTCGTGAC‑‑CTGCCCCCCCTGCTCCGCCAGATGATGGATGCGGGTAGCGTCGGTAATGTTGTGCATTATGAACCCTCCAACGTTCTTATTCTGACCGGTCGTGCCTccac < 2:155525/139‑1 (MQ=255)
ccGAATTGTACCGCTTGAGAACGTTCCTGCTCGTGAC‑‑CTGCCCCCCCTg > 2:701498/1‑49 (MQ=255)
ccGAATTGTACCGCTTGAGAACGTTCCTGCTCGTGAC‑‑CTGCCCCCCCTg < 1:701498/49‑1 (MQ=255)
ccGAATTGTACCGCTTGAGAACGTTCCTGCTCGTGAC‑‑CTGCCCCCCCTGCTCCGCCAGATGATGGATGCGGGTAGCGTCGGTAAtgtt > 2:1195582/1‑88 (MQ=255)
ccGAATTGTACCGCTTGAGAACGTTCCTGCTCGTGAC‑‑CTGCCCCCCCTGCTCCGCCAGATGATGGATGCGGGTAGCGTCGGTAAtgtt < 1:1195582/88‑1 (MQ=255)
tACCGCTTGAGAACGTTCCTGCTCGTGAC‑‑CTGCCCCCCCTGCTCCGCCAGATGATGGATGCGGGTAGCGTCGGTAATGTTGTGCATTATGAACCCTCCAACGTTCTTATTCTGACCGGTCGTGCCTCCACCATtaataa < 1:374374/139‑1 (MQ=255)
ccGCTTGAGAACGTTCCTGCTCGTGAC‑‑CTGCCCCCCCTGCTCCGCCAGATGATGGATGCGGGTAGCGTCGGTAATGTTGTGCATTATGAACCCTCCAACGtt < 2:581307/102‑1 (MQ=255)
ccGCTTGAGAACGTTCCTGCTCGTGAC‑‑CTGCCCCCCCTGCTCCGCCAGATGATGGATGCGGGTAGCGTCGGTAATGTTGTGCATTATGAACCCTCCAACGtt > 1:581307/1‑102 (MQ=255)
cTTGAGAATGTTCCTGCTCGTGAC‑‑CTGCCCCCCCTGCTCCGCCAGATGATGGATGCggg > 1:999355/1‑59 (MQ=255)
cTTGAGAACGTTCCTGCTCGTGAC‑‑CTGCCCCCCCTGCTCCGCCAGATGATGGATGCggg < 2:999355/59‑1 (MQ=255)
cTTGAGAACGTTCCTGCTCGTGAC‑‑CTGCCCCCCCTGCTCCGCCAGATGATGGATGCGGGTAGCGTCGGTAATGTTGTGCATTATGAACCCTCCAACGTTCTTATTCTGACCGGTCGTGCCTccac > 2:334473/1‑125 (MQ=255)
cTTGAGAACGTTCCTGCTCGTGAC‑‑CTGCCCCCCCTGCTCCGCCAGATGATGGATGCGGGTAGCGTCGGTAATGTTGTGCATTATGAACCCTCCAACGTTCTTATTCTGACCGGTCGTGCCTccac < 1:334473/125‑1 (MQ=255)
ttGAGAACGTTCCTGCTCGTGAC‑‑CTGCCCCCCCTGCTCCGCCAGATGATGGATGCGGGTAGCGTCGGTAATGTTGTGCATTATGAACCCTCCAACGTTCTTATTCTGACCGGTCGTGCCTCCACCATTAATAAACTGAt < 1:1172642/139‑1 (MQ=255)
tGAGAACGTTCCTGCTCGTGAC‑‑CTGCCCCCCCTGCTCCGCCAGATGATGGATGCGGGTAGc > 2:1280338/1‑61 (MQ=255)
tGAGAACGTTCCTGCTCGTGAC‑‑CTGCCCCCCCTGCTCCGCCAGATGATGGATGCGGGTAGc < 1:1280338/61‑1 (MQ=255)
gaACGTTCCTGCTCGTGAC‑‑CTGCCCCCCCTGCTCCGCCAGATGATGGATGCGGGTAGCGTCGGTAATGTTGTGCATTATGAACCCTCCAACGTTCTTATTCTGACCGGTCGTGCCTCCACCATTAATAAACTGATTGaa > 2:163318/1‑139 (MQ=255)
aaCGTTCCTGCTCGTGACCTCTGCCCCCCCTGCTCCGCCAGATGATGGATGCGGGTAGCGTCGGTAATGTTGTGCATTATGAACCCTCCAACGTTCTTATTCTGACCGGTCGTGCCTCCACCATTAATAAACTGATTGa > 2:201156/1‑139 (MQ=255)
cGTTCCTGCTCGTGAC‑‑CTGCCCCCCCTGCTCCGCCAGATGATGGATGCGGGTAGCGTCGGTAATGTTGTGCATTATGAACCCTCCAACGTTCTTATTCTGACCGGTCGTGCCTCCACCATTAATAAACTGATTg < 2:1460420/134‑1 (MQ=255)
cGTTCCTGCTCGTGAC‑‑CTGCCCCCCCTGCTCCGCCAGATGATGGATGCGGGTAGCGTCGGTAATGTTGTGCATTATGAACCCTCCAACGTTCTTATTCTGACCGGTCGTGCCTCCACCATTAATAAACTGATTg > 1:1460420/1‑134 (MQ=255)
ttCCTGCTCGTGAC‑‑CTGCCCCCCCTGCTCCGCCAGATGATGGATGCGGGTAGCGTCGGTAAtgttgt > 1:772990/1‑67 (MQ=255)
ttCCTGCTCGTGAC‑‑CTGCCCCCCCTGCTCCGCCAGATGATGGATGCGGGTAGCGTCGGTAAtgttgt < 2:772990/67‑1 (MQ=255)
tCCTGCTCGTGAC‑‑CTGCCCCCCCTGCTCCGCCAGATGATGGATGCGGGTAGCGTCGGTAATGTTGTGCATTATGAACCCTCCaa > 1:994589/1‑84 (MQ=255)
tCCTGCTCGTGAC‑‑CTGCCCCCCCTGCTCCGCCAGATGATGGATGCGGGTAGCGTCGGTAATGTTGTGCATTATGAACCCTCCaa < 2:994589/84‑1 (MQ=255)
tCCTGCTCGTGAC‑‑CTGCCCCCCCTGCTCCGCCAGATGATGGATGCGGGTAGCGTCGGTAATGTTGTGCATTATGAACCCTCCAACGTTCTTATTCTGACCGGTCGTGCCTCCACCATTAATAAACTGATTGAAGTCATa < 2:1353633/139‑1 (MQ=255)
cTCGTGAC‑‑CTGCCCCCCCTGCTCCGCCAGATGATGGATGCGGGTAGCGTCGGTa > 2:1327365/1‑54 (MQ=255)
cTCGTGAC‑‑CTGCCCCCCCTGCTCCGCCAGATGATGGATGCGGGTAGCGTCGGTa < 1:1327365/54‑1 (MQ=255)
gAC‑‑CTGCCCCCCCTGCTCCGCCAGATGATGGATGCGGGTAGCGTCGGTAATGTTGTGCATTATGAACCCTCCaa > 2:1125087/1‑74 (MQ=255)
gAC‑‑CTGCCCCCCCTGCTCCGCCAGATGATGGATGCGGGTAGCGTCGGTAATGTTGTGCATTATGAACCCTCCaa < 1:1125087/74‑1 (MQ=255)
|
TTTTCTGAAAGTGGTTCGCTCAGCTAATGTAAAAACATCGCCAGGGATGATTGCTGACAGTTCTCGTCCAGGCGTAGGTGATGAGTTGGTCACCCGAATTGTACCGCTTGAGAACGTTCCTGCTCGTGAC‑‑CTGGCCCCCCTGCTCCGCCAGATGATGGATGCGGGTAGCGTCGGTAATGTTGTGCATTATGAACCCTCCAACGTTCTTATTCTGACCGGTCGTGCCTCCACCATTAATAAACTGATTGAAGTCATA > NC_000913/3456664‑3456919
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 35 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
GATK/CNVnator alignment
N/A
