Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A3 F28 I1 R1
|
169 |
80.7 |
2736954 |
99.0% |
2709584 |
138.6 |
Breseq alignment
BRESEQ :: Evidence
|
| evidence |
seq id |
position |
mutation |
annotation |
gene |
description |
| RA |
NC_000913 |
2,467,734 |
T→C |
intergenic (+32/‑121) |
intS → / → yfdG |
CPS‑53 (KpLE1) prophage; prophage CPS‑53 integrase/CPS‑53 (KpLE1) prophage; putative bactoprenol‑linked glucose translocase |
|
| |
seq id |
position |
ref |
new |
freq |
score (cons/poly) |
reads |
annotation |
genes |
product |
| * | NC_000913 | 2,467,734 | 0 | T | C | 100.0%
| 385.6
/ NA
| 105 | intergenic (+32/‑121) | intS/yfdG | CPS‑53 (KpLE1) prophage; prophage CPS‑53 integrase/CPS‑53 (KpLE1) prophage; putative bactoprenol‑linked glucose translocase |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (0/0); new base C (50/55); total (50/55) |
Only 100 of 105 total aligned reads displayed.
ACGGCGGATCTGTGCGTGGGATTTACAACCATGCTCAGTATCTCGATAAACGCAGAGAAATGATGCAATGGTGGGCGGACTGGCTTGATGAGAAGGTGGAGTGAGCGACCTTAACAACTATCGAATAGCACAAAGTCTTGCAATCCAGTGCAAAGCTTTGTGTGTATAAGTTTTGTCTCATCAACCACAGCAAGTATCGATCGATTAAGACTTGGATGATAGACTTCATTCCTTTGATTATTAGCTGATAGAAGAAATGTTAAAGCTATTTG > NC_000913/2467599‑2467870
|
aCGGCGGATCTGTGCGTGGGATTTACAACCATGCTCAGTATCTCGATAAACGCAGAGAAATGATGCAATGGTGGGCGGACTGGCTTGATGAGAAGGTGGAGTGAGCGACCTTAACAACTATCGAATAGCACAAAGCCTTg < 2:1348600/140‑1 (MQ=255)
cggcggATCTGTGCGTGGGATTTACAACCATGCTCAGTATCTCGATAAACGCAGAGAAATGATGCAATGGTGGGCGGACTGGCTTGATGAGAAGGTGGAGTGAGCGACCTTAACAACTATCGAATAGCACAAAACCTTGc > 2:675517/1‑140 (MQ=255)
cggATCTGTGCGTGGGATTTACAACCATGCTCAGTATCTCGATAAACGCAGAGAAATGATGCAATGGTGGGCGGACTGGCTTGATGAGAAGGTGGAGTGAGCGACCTTAACAACTATCGAATAGCACAAAGCCTTGCAAt > 2:479586/1‑140 (MQ=255)
ggATCTGTGCGTGGGATTTACAACCATGCTCAGTATCTCGATAAACGCAGAGAAATGATGCAATGGTGGGCGGACTGGCTTGATGAGAAGGTGGAGTGAGCGACCTTAACAACTATCGAATAGCACAAAGCCTTGCAATc < 2:77068/140‑1 (MQ=255)
gATCTGTGCGTGGGATTTACAACCATGCTCAGTATCTCGATAAGCGCAGAGAAATGATGCAATGGTGGGCGGACTGGCTTGATGAGAAGGTGGAGTGAGCGACCTTAACAACTATCGAATAGGACAAAGCCTTGCAATcc > 2:1215058/1‑140 (MQ=255)
gtgCGTGGGATTTACAACCATGCTCAGTATCTCGATAAACGCAGAGAAATGATGCAATGGTGGGCGGACTGGCTTGATGAGAAGGTGGAGTGAGCGACCTTAACAACTATCGAATAGCACAAAGCCTTGCAATCCAGTGc < 1:202344/140‑1 (MQ=255)
tgCGTGGGATTTACAACCATGCTCAGTATCTCGATAAACGCAGAGAAATGATGCAATGGTGGGCGGACTGGCTTGATGAGAAGGTGGAGTGAGCGACCTTAACAACTATCGAATAGCACAAAGCCTTGCAATCCAGTGCa > 2:65305/1‑140 (MQ=255)
gCGTGGGATTTACAACCATGCTCAGTATCTCGATAAACGCAGAGAAATGATGCAATGGTGGGCGGACTGGCTTGATGAGAAGGTGGAGTGAGCGACCTTAACAACTATCGAATAGCACAAAGCCTTGCAATCCAGTGCaa < 1:1042830/140‑1 (MQ=255)
tGGGATTTACAACCATGCTCAGTATCTCGATAAACGCAGAGAAATGATGCAATGGTGGGCGGACTGGCTTGATGAGAAGGTGGAGTGAGCGACCTTAACAACTATCGAATAGCACAAAGCCTTGCAATCCAGTGCAAAGc > 2:280242/1‑140 (MQ=255)
tGGGATTTACAACCATGCTCAGTATCTCGATAAACGCAGAGAAATGATGCAATGGTGGGCGGACTGGCTTGATGAGAAGGTGGAGTGAGCGACCTTAACAACTATCGAATAGCACAAAGCCTTGCAATCCAGTGCAAAGc > 1:509639/1‑140 (MQ=255)
gggATTTACAACCATGCTCAGTATCTCGATAAACGCAGAGAAATGATGCAATGGTGGGCGGACTGGCTTGATGAGAAGGTGGAGTGAGCGACCTTAACAACTATCGAATAGCACAAAGCCTTGCAATCCAGTGCAAAGCt > 2:228536/1‑140 (MQ=255)
gATTTACAACCATGCTCAGTATCTCGATAAACGCAGAGAAATGTTGCAATGGTGGGCGGACTGGCTTGATGAGAAGGTGGAGTGAGCGACCTTAACAACTATCGAATAGCACAAAGCCTTGCAATCCAGTGCAAAGCttt < 1:340473/140‑1 (MQ=255)
gATTTACAACCATGCTCAGTATCTCGATAAACGCAGAGAAATGATGCAATGGTGGGCGGACTGGCTTGATGAGAAGGTGGAGTGAGCGACCTTAACAACTATCGAATAGCACAAAGCCTTGCAATCCAGTGCAAAGCttt < 1:848174/140‑1 (MQ=255)
gATTTACAACCATGCTCAGTATCTCGATAAACGCAGAGAAATGATGCAATGGTGGGCGGACTGGCTTGATGAGAAGGTGGAGTGAGCGACCTTAACAACTATCGAATAGCACAAAGCCTTGCAATCCAGTGCAAAGCttt < 1:833750/140‑1 (MQ=255)
gATTTACAACCATGCTCAGTATCTCGATAAACGCAGAGAAATGATGCAATGGTGGGCGGACTGGCTTGATGAGAAGGTGGAGTGAGCGACCTTAACAACTATCGAATAGCACAAAGCCTTGCAATCCAGTGCAAAGCttt > 2:848174/1‑140 (MQ=255)
aTTTACAACCATGCTCAGTATCTCGATAAACGCAGAGAAATGATGCAATGGTGGGCGGACTGGCTTGATGAGAAGGTGGAGTGAGCGACCTTAACAACTATCGAATAGCACAAAGCCTTGCAATCCAGTGCAAAGCTTtg < 2:768331/140‑1 (MQ=255)
tttACAACCATGCTCAGTATCTCGATAAACGCAGAGAAATGATGCAATGGTGGGCGGACTGGCTTGATGAGAAGGTGGAGTGAGCGACCTTAACAACTATCGAATAGCACAAAGCCTTGCAATCCAGTGCAAAGCTTtgt < 1:290875/140‑1 (MQ=255)
ttACAACCATGCTCAGTATCTCGATAAACGCAGAGAAATGATGCAATGGTGGGCGGACTGGCTTGATGAGAAGGTGGAGTGAGCGACCTTAACAACTATCGAATAGCACAAAGCCTTGCAATCCAGTGCAAAGCTTtgtg < 2:508619/140‑1 (MQ=255)
tACAACCATGCTCAGTATCTCGATAAACGCAGAGAAATGATGCAATGGTGGGCGGACTGGCTTGATGAGAAGGTGGAGTGAGCGACCTTAACAACTATCGAATAGCACAAAGCCTTGCAATCCAGTGCAAAGCTTtgtgt > 1:778845/1‑140 (MQ=255)
aaCCATGCTCAGTATCTCGATAAACGCAGAGAAATGATGCAATGGTGGGCGGACTGGCTTGATGAGAAGGTGGAGTGAGCGACCTTAACAACTATCGAATAGCACAAAGCCTTGCAATCCAGTGCAAAGCTTTGTGTGta < 1:1215058/140‑1 (MQ=255)
cATGCTCAGTATCTCGATAAACGCAGAGAAATGATGCAATGGTGGGCGGACTGGCTTGATGAGAAGGTGGAGTGAGCGACCTTAACAACTATCGAATAGCACAAAGCCTTGCAATCCAGTGCAAAGCTTTGTGTGTATaa > 2:33461/1‑140 (MQ=255)
cATGCTCAGTATCTCGATAAACGCAGAGAAATGATGCAATGGTGGGCGGACTGGCTTGATGAGAAGGTGGAGTGAGCGACCTTAACAACTATCGAATAGCACAAAGCCTTGCAATCCAGTGCAAAGCTTTGTGTGTATaa > 2:39102/1‑140 (MQ=255)
cATGCTCAGTATCTCGATAAACGCAGAGAAATGATGCAATGGTGGGCGGACTGGCTTGATGAGAAGGTGGAGTGAGCGACCTTAACAACTATCGAATAGCACAAAGCCTTGCAATACAGTGCAAAGCTTTGTGTGTATaa > 2:609423/1‑140 (MQ=255)
aTGCTCAGTATCTCGATAAACGCAGAGAAATGATGCAATGGTGGGCGGACTGGCTTGATGAGAAGGTGGAGTGAGCGACCTTAACAACTATCGAATAGCACAAAGCCTTGCAATCCAGTGCAAAGCttt < 2:495591/129‑1 (MQ=255)
aTGCTCAGTATCTCGATAAACGCAGAGAAATGATGCAATGGTGGGCGGACTGGCTTGATGAGAAGGTGGAGTGAGCGACCTTAACAACTATCGAATAGCACAAAGCCTTGCAATCCAGTGCAAAGCttt > 1:495591/1‑129 (MQ=255)
tGCTCAGTATCTCGATAAACGCAGAGAAATGATGCAATGGTGGGCGGACTGGCTTGATGAGAAGGTGGAGTGAGCGACCTTAACAACTATCGAATAGCACAAAGCCTTGCAATCCAGTGCAAAGCTTtgtgtg < 2:1073977/133‑1 (MQ=255)
tGCTCAGTATCTCGATAAACGCAGAGAAATGATGCAATGGTGGGCGGACTGGCTTGATGAGAAGGTGGAGTGAGCGACCTTAACAACTATCGAATAGCACAAAGCCTTGCAATCCAGTGCAAAGCTTtgtgtg > 1:1073977/1‑133 (MQ=255)
tGCTCAGTATCTCGATAAACGCAGAGAAATGATGCAATGGTGGGCGGACTGGCTTGATGAGAAGGTGGAGTGAGCGACCTTAACAACTATCGAATAGCACAAAGCCTTGCAATCCAGTGCAAAGCTTTGTGTGTATAAGt > 2:1240768/1‑140 (MQ=255)
tGCTCAGTATCTCGATAAACGCAGAGAAATGATGCAATGGTGGGCGGACTGGCTTGATGAGAAGGTGGAGTGAGCGACCTTAACAACTATCGAATAGCACAAAGCCTTGCAATCCAGTGCAAAGCTTTGTGTGTATAAGt > 2:428252/1‑140 (MQ=255)
tGCTCAGTATCTCGATAAACGCAGAGAAATGATGCAATGGTGGGCGGACTGGCTTGATGAGAAGGTGGAGTGAGCGACCTTAACAACTATCGAATAGCACAAAGCCTTGCAATCCAGTGCAAAGCTTTGTGTGTATAAGt > 1:1278268/1‑140 (MQ=255)
tGCTCAGTATCTCGATAAACGCAGAGAAATGATGCAATGGTGGGCGGACTGGCTTGATGAGAAGGTGGAGTGAGCGACCTTAACAACTATCGAATAGCACAAAGCCTTGCAATCCAGTGCAAAGCTTTGTGTGTATAAGt > 1:1312065/1‑140 (MQ=255)
tGCTCAGTATCTCGATAAACGCAGAGAAATGATGCAATGGTGGGCGGACTGGCTTGATGAGAAGGTGGAGTGAGCGACCTTAACAACTATCGAATAGCACAAAGCCTTGCAATCCAGTGCAAAGCTTTGTGTGTATAAGt < 2:627257/140‑1 (MQ=255)
tGCTCAGTATCTCGATAAACGCAGAGAAATGATGCAATGGTGGGCGGACTGGCTTGATGAGAAGGTGGAGTGAGCGACCTTAACAACTATCGAATAGCACAAAGCCTTGCAATCCAGTGCAAAGCTTTGTGTGTATAAGt > 1:169868/1‑140 (MQ=255)
tCAGTATCTCGATAAACGCAGAGAAATGATGCAATGGTGGGCGGACTGGCTTGATGAGAAGGTGGAGTGAGCGACCTTAACAACTATCGAATAGCACAAAGCCTTGCAATCCAGTGCAAAGCTTTGTGTGTATAAGtttt > 1:46328/1‑140 (MQ=255)
ctcGATAAACGCAGAGAAATGATGCAATGGTGGGCGGACTGGCTTGATGAGAAGGTGGAGTGAGCGACCTTAACAACTATCGAATAGCACAAAGCCTTGCAATACAGTGCAAAGCTTTGTGTGTATAAGTTTTGTCtcat < 1:609423/140‑1 (MQ=255)
cGATAAACGCAGAGAAATGATGCAATGGTGGGCGGACTGGCTTGATGAGAAGGTGGAGTGAGCGACCTTAACAACTATCGAATAGCACAAAGCCTTGCAATCCAGTGCAAAGCTTTGTGTGTATAAGTTTTGTCtcatca > 1:916451/1‑140 (MQ=255)
cGATAAACGCAGAGAAATGATGCAATGGTGGGCGGACTGGCTTGATGAGAAGGTGGAGTGAGCGACCTTAACAACTATCGAATAGCACAAAGCCTTGCAATCCAGTGCAAAGCTTTGTGTGTATAAGTTTTGTCtcatca > 1:647063/1‑140 (MQ=255)
cGATAAACGCAGAGAAATGATGCAATGGTGGGCGGACTGGCTTGATGAGAAGGTGGAGTGAGCGACCTTAACAACTATCGAATAGCACAAAGCCTTGCAATCCAGTGCAAAGCTTTGTGTGTATAAGTTTTGTCtcatca > 1:1190096/1‑140 (MQ=255)
aTAAACGCAGAGAAATGATGCAATGGTGGGCGGACTGGCTTGATGAGAAGGTGGAGTGAGCGACCTTAACAACTATCGAATAGCACAAAGCCTTGCAATCCAGTGCAAAGCTTTGTGTGTATAAGTTTTGTCTCATCAAc < 1:973841/140‑1 (MQ=255)
tAAACGCAGAGAAATGATGCAATGGTGGGCGGACTGGCTTGATGAGAAGGTGGAGTGAGCGACCTTAACAACTATCGAATAGCACAAAGCCTTGCAATCCAGTGCAAAGCTTTGTGTGTATAAGTTTTGTCTCATCAAcc < 1:479586/140‑1 (MQ=255)
tAAACGCAGAGAAATGATGCAATGGTGGGCGGACTGGCTTGATGAGAAGGTGGAGTGAGCGACCTTAACAACTATCGAATAGCACAAAGCCTTGCAATCCAGTGCAAAGCTTTGTGTGTATAAGTTTTGTCTCATCAAcc < 1:1120360/140‑1 (MQ=255)
tAAACGCAGAGAAATGATGCAATGGTGGGCGGACTGGCTTGATGAGAAGGTGGAGTGAGCGACCTTAACAACTATCGAATAGCACAAAGCCTTGCAATCCAGTGCAAAGCTTTGTGTGTATAAGTTTTGTCTCATCAAcc > 2:1120360/1‑140 (MQ=255)
aaCGCAGAGAAATGATGCAATGGTGGGCGGACTGGCTTGATGAGAAGGTGGAGTGAGCGACCTTAACAACTATCGAATAGCACAAAGCCTTGCAATCCAGTGCAAAGCTTTGTGTGTATAAGTTTTGTCTCATCAACcac > 2:378009/1‑140 (MQ=255)
cGCAGAGAAATGATGCAATGGTGGGCGGACTGGCTTGATGAGAAGGTGGAGTGAGCGACCTTAACAACTATCGAATAGCACAAAGCCTTGCAATCCAGTGCAAAGCTTTGTGTGTATAAGTTTTGTCTCATCAAcc < 1:387789/136‑1 (MQ=255)
cGCAGAGAAATGATGCAATGGTGGGCGGACTGGCTTGATGAGAAGGTGGAGTGAGCGACCTTAACAACTATCGAATAGCACAAAGCCTTGCAATCCAGTGCAAAGCTTTGTGTGTATAAGTTTTGTCTCATCAAcc > 2:387789/1‑136 (MQ=255)
cGCAGAGAAATGATGCAATGGTGGGCGGACTGGCTTGATGAGAAGGTGGAGTGAGCGACCTTAACAACTATCGAATAGCACAAAGCCTTGCAATCCAGTGCAAAGCTTTGTGTGTATAAGTTTTGTCTCATCAACCACAg > 2:508195/1‑140 (MQ=255)
gCAGAGAAATGATGCAATGGTGGGCGGACTGGCTTGATGAGAAGGTGGAGTGAGCGACCTTAACAACTATCGAATAGCACAAAGCCTTGCAATCCAGTGCAAAGCTTTGTGTGTATAAGTTTTGTCTCATCAACCACAGc < 2:1278268/140‑1 (MQ=255)
cAGAGAAATGATGCAATGGTGGGCGGACTGGCTTGATGAGAAGGTGGAGTGAGCGACCTTAACAACTATCGAATAGCACAAAGCCTTGCAATCCAGTGCAAAGCTTTGTGTGTATAAGTTTTGTCTCATCAAcc < 1:551455/134‑1 (MQ=255)
cAGAGAAATGATGCAATGGTGGGCGGACTGGCTTGATGAGAAGGTGGAGTGAGCGACCTTAACAACTATCGAATAGCACAAAGCCTTGCAATCCAGTGCAAAGCTTTGTGTGTATAAGTTTTGTCTCATCAAcc > 2:551455/1‑134 (MQ=255)
gagaAATGATGCAATGGTGGGCGGACTGGCTTGATGAGAAGGTGGAGTGAGCGACCTTAACAACTATCGAATAGCACAAAGCCTTGCAATCCAGTGCAAAGCTTTGTGTGTATAAGTTTTGTCTCATCAACCACAGCAAg > 2:506676/1‑140 (MQ=255)
tgatgCAATGGTGGGCGGACTGGCTTGATGAGAAGGTGGAGTGAGCGACCTTAACAACTATCGAATAGCACAAAGCCTTGCAATCCAGTGCAAAGCTTTGTGTGTATAAGTTTTGTCTCATCAACCACAGCAAGTatcga < 2:1065941/140‑1 (MQ=255)
tgatgCAATGGTGGGCGGACTGGCTTGATGAGAAGGTGGAGTGAGCGACCTTAACAACTATCGAATAGCACAAAGCCTTGCAATCCAGTGCAAAGCTTTGTGTGTATAAGTTTTGTCTCATCAACCACAGCAAGTatcga < 2:907479/140‑1 (MQ=255)
tgatgCAATGGTGGGCGGACTGGCTTGATGAGAAGGTGGAGTGAGCGACCTTAACAACTATCGAATAGCACAAAGCCTTGCAATCCAGTGCAAAGCTTTGTGTGTATAAGTTTTGTCTCATCAACCACAGCAAGTatcga < 1:1240768/140‑1 (MQ=255)
gatgCAATGGTGGGCGGACTGGCTTGATGAGAAGGTGGAGTGAGCGACCTTAACAACTATCGAATAGCACAAAGCCTTGCAATCCAGTGCAAAGCTTTGTGTGTATAAGTTTTGTCTCATCAACCACAGCAAGTatcgat < 1:65305/140‑1 (MQ=255)
gatgCAATGGTGGGCGGACTGGCTTGATGAGAAGGTGGAGTGAGCGACCTTAACAACTATCGAATAGCACAAAGCCTTGCAATCCAGTGCAAAGCTTTGTGTGTATAAGTTTTGTCTCATCAACCACAGCAAGTatcgat < 2:916451/140‑1 (MQ=255)
gatgCAATGGTGGGCGGACTGGCTTGATGAGAAGGTGGAGTGAGCGACCTTAACAACTATCGAATAGCACAAAGCCTTGCAATCCAGTGCAAAGCTTTGTGTGTATAAGTTTTGTCTCATCAACCACAGCAAGTatcgat < 2:1190096/140‑1 (MQ=255)
gatgCAATGGTGGGCGGACTGGCTTGATGAGAAGGTGGAGTGAGCGACCTTAACAACTATCGAATAGCACAAAGCCTTGCAATCCAGTGCAAAGCTTTGTGTGTATAAGTTTTGTCTCATCAACCACAGCAAGTatcgat < 2:567006/140‑1 (MQ=255)
gatgCAATGGTGGGCGGACTGGCTTGATGAGAAGGTGGAGTGAGCGACCTTAACAACTATCGAATAGCACAAAGCCTTGCAATCCAGTGCAAAGCTTTGTGTGTATAAGTTTTGTCTCATCAACCACAGCAAGTatcgat < 2:647063/140‑1 (MQ=255)
atgCAATGGTGGGCGGACTGGCTTGATGAGAAGGTGGAGTGAGCGACCTTAACAACTATCGAATAGCACAAAGCCTTGCAATCCAGTGCAAAGCTTTGTGTGTATAAGTTTTGTCTCATCAACCACAGCAAGTatcgatc > 2:190378/1‑140 (MQ=255)
aaTGGTGGGCGGACTGGCTTGATGAGAAGGTGGAGTGAGCGACCTTAACAACTATCGAATAGCACAAAGCCTTGCAATCCAGTGCAAAGCTTTGTGTGTATAAGTTTTGTCTCATCAACCACAGCAAGTATCGATCGAtt < 1:506676/140‑1 (MQ=255)
ggCGGACTGGCTTGATGAGAAGGTGGAGTGAGCGACCTTAACAACTATCGAATAGCACAAAGCCTTGCAATCCAGTGCAAAGCTTTGTGTGTATAAGTTTTGTCTCATCAACCACAGCAAGTATCGATCGATTAAGACtt < 2:1055666/140‑1 (MQ=255)
cGGACTGGCTTGATGAGAAGGTGGAGTGAGCGACCTTAACAACTATCGAATAGCACAAAGCCTTGCAATCCAGTGCAAAGCTTTGTGTGTATAAGTTTTGTCTCATCAACCACAGCAAGTATCGATCGATTAAGACTTgg > 1:258488/1‑140 (MQ=255)
aCTGGCTTGATGAGAAGGTGGAGTGAGCGACCTTAACAACTATCGAATAGCACAAAGCCTTGCAATCCAGTGCAAAGCTTTGTGTGTATAAGTTTTGTCTCATCAACCACAGCAAGTATCGATCGATTAAGACTTGgatg > 2:1099448/1‑140 (MQ=255)
tGGCTTGATGAGAAGGTGGAGTGAGCGACCTTAACAACTATCGAATAGCACAAAGCCTTGCAATCCAGTGCAAAGCTTTGTGTGTATAAGTTTTGTCTCATCAACCACAGCAAGTATCGATCGATTAAGACTTGgatgat < 1:1099448/140‑1 (MQ=255)
ggCTTGATGAGAAGGTGGAGTGAGCGACCTTAACAACTATCGAATAGCACAAAGCCTTGCAATCCAGTGCAAAGCTTTGTGTGTATAAGTTTTGTCTCATCAACCACAGCAAGTATCGATCGATTAAGACTTGGATGATa < 2:760850/140‑1 (MQ=255)
aaGGTGGAGTGAGCGACCTTAACAACTATCGAATAGCACAAAGCCTTGCAATCCAGTGCAAAGCTTTGTGTGTATAAGTTTTGTCTCATCAACCACAGCAAGTATCGATCGATTAAGACTTGGATGATAGACTTCATTcc > 1:1085588/1‑140 (MQ=255)
ggTGGAGTGAGCGACCTTAACAACTATCGAATAGCACAAAGCCTTGCAATCCAGTGCAAAGCTTTGTGTGTATAAGTTTTGTCTCATCAACCACAGCAAGTATCGATCGATTAAGACTTGga < 2:1163001/122‑1 (MQ=255)
ggTGGAGTGAGCGACCTTAACAACTATCGAATAGCACAAAGCCTTGCAATCCAGTGCAAAGCTTTGTGTGTATAAGTTTTGTCTCATCAACCACAGCAAGTATCGATCGATTAAGACTTGga > 1:1163001/1‑122 (MQ=255)
ggTGGAGTGAGCGACCTTAACAACTATCGAATAGCACAAAGCCTTGCAATCCAGTGCAAAGCTTTGTGTGTATAAGTTTTGTCTCATCAACCACAGCAAGTATCGATCGATTAAGACTTGGATGATAGACTTCATTCCtt < 1:675517/140‑1 (MQ=255)
ggAGTGAGCGACCTTAACAACTATCGAATAGCACAAAGCCTTGCAATCCAGTGCAAAGCTTTGTGTGTATAAGTTTTGTCTCATCAACCACAGCAAGTATCGATCGATTAAGACTTGGATGATAGACTTCATTCCTTTGa > 1:309693/1‑140 (MQ=255)
gAGTGAGCGACCTTAACAACTATCGAATAGCACAAAGCCTTGCAATCCAGTGCAAGGCTTTGTGTGTATAAGTTTTGTCTCATCAACCACAGCAAGTATCGATCGATTAAGACTTGGATGATAGACTTCATTCCTTTGat < 1:997104/140‑1 (MQ=255)
gTGAGCGACCTTAACAACTATCGAATAGCACAAAGCCTTGCAATCCAGTGCAAAGCTTTGTGTGTATAAGTTTTGTCTCATCAACCACAGCAAGTATCGATCGATTAAGACTTGGATGATAGACTTCATTCCTTTGatta < 1:39102/140‑1 (MQ=255)
gAGCGACCTTAACAACTATCGAATAGCACAAAGCCTTGCAATCCAGTGCAAAGCTTTGTGTGTATAAGTTTTGTCTCATCAACCACAGCAAGTATCGATCGATTAAGACTTGGATGATAGACTTCATTCCTTTGattatt > 1:1238041/1‑140 (MQ=255)
aGCGACCTTAACAACTATCGAATAGCACAAAGCCTTGCAATCCAGTGCAAAGCTTTGTGTGTATAAGTTTTGTCTCATCAACCACAGCAAGTATCGATCGATTAAGACTTGGATGATAGACTTCATTCCTTTGAttatta < 1:1186781/140‑1 (MQ=255)
gCGACCTTAACAACTATCGAATAGCACAAAGCCTTGCAATCCAGTGCAAAGCTTTGTGTGTATAAGTTTTGTCTCATCAACCACAGCAAGTATCGATCGATTAAGACTTGGATGATAGACTTCATTCCTTTGATTATTAg < 2:290179/140‑1 (MQ=255)
cGACCTTAACAACTATCGAATAGCACAAAGCCTTGCAATCCAGTGCAAAGCTTTGTGTGTATAAGTTTTGTCTCATCAACCACAGCAAGTATCGATCGATTAAGACTTGGATGATAGACTTCATTCCTTTGATTATTAGc > 2:1277344/1‑140 (MQ=255)
gACCTTAACAACTATCGAATAGCACAAAGCCTTGCAATCCAGTGCAAAGCTTTGTGTGTATAAGTTTTGTCTCATCAACCACAGCAAGTATCGATCGATTAAGACTTGGATGATAGACTTCATTCCTTTGATTATTAGCt < 2:309693/140‑1 (MQ=255)
aCCTTAACAACTATCGAATAGCACAAAGCCTTGCAA‑CCAGTGCAAAGCTTTGTGTGTATAAGTTTTGTCTCATCAACCACAGCAAGTATCGATCGATTAAGACTTGGATGATAGACTTCATTCCTTTGATTATTAGCTGa < 1:1102472/140‑1 (MQ=255)
ccTTAACAACTATCGAATAGCACAAAGCCTTGCAATCCAGTGCAAAGCTTTGTGTGTATAAGTTTTGTCTCATCAACCACAGCAAGTATCGATCGATTAAGACTTGGATGATAGACTTCATTCCtt > 1:883009/1‑126 (MQ=255)
ccTTAACAACTATCGAATAGCACAAAGCCTTGCAATCCAGTGCAAAGCTTTGTGTGTATAAGTTTTGTCTCATCAACCACAGCAAGTATCGATCGATTAAGACTTGGATGATAGACTTCATTCCtt < 2:883009/126‑1 (MQ=255)
ccTTAACAACTATCGAATAGCACAAAGCCTTGCAATCCAGTGCAAAGCTTTGTGTGTATAAGTTTTGTCTCATCAACCACAGCAAGTATCGATCGATTAAGACTTGGATGATAGACTTCATTCCTTTGATTATTAGCTGa < 2:536092/140‑1 (MQ=255)
tAACAACTATCGAATAGCACAAAGCCTTGCAATCCAGTGCAAAGCTTTGTGTGTATAAGTTTTGTCTCATCAACCACAGCAAGTATCGATCGATTAAGACTTGGATGATAGACTTCATTCCTTTGATTATTAGCTGATag < 2:46328/140‑1 (MQ=255)
aacTATCGAATAGCACAAAGCCTTGCAATCCAGTGCAAAGCTTTGTGTGTATAAGTTTTGTCTCATCAACCACAGCAAGTATCGATCGATTAAGACTTGGATGATAGACTTCATTCCTTTGATTATTAGCTGATagaaga < 2:97245/140‑1 (MQ=255)
aacTATCGAATAGCACAAAGCCTTGCAATCCAGTGCAAAGCTTTGTGTGTATAAGTTTTGTCTCATCAACCACAGCAAGTATCGATCGATTAAGACTTGGATGATAGACTTCATTCCTTTGATTATTAGCTGATagaaga < 1:1277344/140‑1 (MQ=255)
acTATCGAATAGCACAAAGCCTTGCAATCCAGTGCAAAGCTTTGTGTGTATAAGTTTTGTCTCATCAACCACAGCAAGTATCGATCGATTAAGACTTGGATGATAGACTTCATTCCTTTGATTATTAGCTGATAgaagaa < 1:228536/140‑1 (MQ=255)
tATCGAATAGCACAAAGCCTTGCAATCCAGTGCAAAGCTTTGTGTGTATAAGTTTTGTCTCATCAACCACAGCAAGTATCGATCGATTAAGACTTGGATGATAGACTTCATTCCTTTGATTATTAGCTGATAGAAGAAAt > 2:487056/1‑140 (MQ=255)
aTCGAATAGCACAAAGCCTTGCAATCCAGTGCAAAGCTTTGTGTGTATAAGTTTTGTCTCATCAACCACAGCAAGTATCGATCGATTAAGACTTGGATGATAGACTTCATTCCTTTGAttatta > 2:1171384/1‑124 (MQ=255)
aTCGAATAGCACAAAGCCTTGCAATCCAGTGCAAAGCTTTGTGTGTATAAGTTTTGTCTCATCAACCACAGCAAGTATCGATCGATTAAGACTTGGATGATAGACTTCATTCCTTTGAttatta < 1:1171384/124‑1 (MQ=255)
aTCGAATAGCACAAAGCCTTGCAATCCAGTGCAAAGCTTTGTGTGTATAAGTTTTGTCTCATCAACCACAGCAAGTATCGATCGATTAAGACTTGGATGATAGACTTCATTCCTTTGATTATTAGCTGATAGAAGAAATg > 2:292224/1‑140 (MQ=255)
tCGAATAGCACAAAGCCTTGCAATCCAGTGCAAAGCTTTGTGTGTATAAGTTTTGTCTCATCAACCACAGCAAGTATCGATCGATTAAGACTTGGATGATAGACTTCATTCCTTTGATTATTAGCTGATAGAAGAAATGt > 2:603780/1‑140 (MQ=255)
tCGAATAGCACAAAGCCTTGCAATCCAGTGCAAAGCTTTGTGTGTATAAGTTTTGTCTCATCAACCACAGCAAGTATCGATCGATTAAGACTTGGATGATAGACTTCATTCCTTTGATTATTAGCTGATAGAAGAAATGt > 2:875210/1‑140 (MQ=255)
tAGCACAAAGCCTTGCAATCCAGTGCAAAGCTTTGTGTGTATAAGTTTTGTCTCATCAACCACAGCAAGTATCGATCGATTAAGACTTGGATGATAGACTTCATTCCTTTGATTATTAGCTGATagaaga > 1:658609/1‑130 (MQ=255)
tAGCACAAAGCCTTGCAATCCAGTGCAAAGCTTTGTGTGTATAAGTTTTGTCTCATCAACCACAGCAAGTATCGATCGATTAAGACTTGGATGATAGACTTCATTCCTTTGATTATTAGCTGATagaaga < 2:658609/130‑1 (MQ=255)
tAGCACAAAGCCTTGCAATCCAGTGCAAAGCTTTGTGTGTATAAGTTTTGTCTCATCAACCACAGCAAGTATCGATCGATTAAGACTTGGATGATAGACTTCATTCCTTTGATTATTAGCTGATAGAAGAAATGTTAAAg > 2:401058/1‑140 (MQ=255)
tAGCACAAAGCCTTGCAATCCAGTGCAAAGCTTTGTGTGTATAAGTTTTGTCTCATCAACCACAGCAAGTATCGATCGATTAAGACTTGGATGATAGACTTCATTCCTTTGATTATTAGCTGATAGAAGAAATGTTAAAg > 2:1152706/1‑140 (MQ=255)
gCACAAAGCCTTGCAATCCAGTGCAAAGCTTTGTGTGTATAAGTTTTGTCTCATCAACCACAGCAAGTATCGATCGATTAAGACTTGGATGATAGACTTCATTCCTTTGATTATTAGCTGATag > 2:535793/1‑124 (MQ=255)
gCACAAAGCCTTGCAATCCAGTGCAAAGCTTTGTGTGTATAAGTTTTGTCTCATCAACCACAGCAAGTATCGATCGATTAAGACTTGGATGATAGACTTCATTCCTTTGATTATTAGCTGATag < 1:535793/124‑1 (MQ=255)
gCACAAAGCCTTGCAATCCAGTGCAAAGCTTTGTGTGTATAAGTTTTGTCTCATCAACCACAGCAAGTATCGATCGATTAAGACTTGGATGATAGACTTCATTCCTTTGATTATTAGCTGATAGAAGAAATGTTAAAGCt < 1:33461/140‑1 (MQ=255)
caAAGCCTTGCAATCCAGTGCAAAGCTTTGTGTGTATAAGTTTTGTCTCATCAACCACAGCAAGTATCGATCGATTAAGACTTGGATGATAGACTTCATTCCTTTGATTATTAGCTGATAGAAGAAATGTTAAAGCTAtt > 1:552564/1‑140 (MQ=255)
aaGCCTTGCAATCCAGTGCAAAGCTTTGTGTGTATAAGTTTTGTCTCATCAACCACAGCAAGTATCGATCGATTAAGACTTGGATGATAGACTTCATTCCTTTGATTATTAGCTGATAGAAGAAATGTTAAAGCTATTTg < 1:508195/140‑1 (MQ=255)
|
ACGGCGGATCTGTGCGTGGGATTTACAACCATGCTCAGTATCTCGATAAACGCAGAGAAATGATGCAATGGTGGGCGGACTGGCTTGATGAGAAGGTGGAGTGAGCGACCTTAACAACTATCGAATAGCACAAAGTCTTGCAATCCAGTGCAAAGCTTTGTGTGTATAAGTTTTGTCTCATCAACCACAGCAAGTATCGATCGATTAAGACTTGGATGATAGACTTCATTCCTTTGATTATTAGCTGATAGAAGAAATGTTAAAGCTATTTG > NC_000913/2467599‑2467870
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
GATK/CNVnator alignment
N/A
