Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A37 F30 I1 R1
|
27 |
143.0 |
4857240 |
99.3% |
4823239 |
138.7 |
Breseq alignment
BRESEQ :: Evidence
|
| evidence |
seq id |
position |
mutation |
annotation |
gene |
description |
| RA |
NC_000913 |
2,439,543 |
G→T |
A193D (GCC→GAC) |
yfcJ ← |
putative transporter YfcJ |
|
| |
seq id |
position |
ref |
new |
freq |
score (cons/poly) |
reads |
annotation |
genes |
product |
| * | NC_000913 | 2,439,543 | 0 | G | T | 99.1%
| 408.3
/ ‑3.2
| 115 | A193D (GCC→GAC) | yfcJ | putative transporter YfcJ |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (1/0); new base T (58/56); total (59/56) |
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 |
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 2.60e-01 |
Only 100 of 117 total aligned reads displayed.
CGAAAGTCCCGATAACAGCAAAACCAACGCCTTGTAGTGCCAGACCTAACCCTGGTTTCCAGATAAGCCCGACAACGCTCCACAGCGATGGACGTTCTCCCGCCAGGGCCGGTACTTTGCGCACTGTGCCGTTACAGGCCCACGCCAGTACGGGTAATACCATTGTGGTGATCGCCAGTGCGGCAAAACCGTAATGGCTATGAATCAACAGGCCAAGCGGAGCACCAACAGCGAGGGCACCGTAAATCGCCATTCCGTTCCATGACATCACTTTGC > NC_000913/2439406‑2439681
|
cgaaaGTCCCGATAACAGCAAAACCAACGCCTTGTAGTGCCAGACCTAACCCTGGTTTCCAGATAAGCCCGACAACGCTCCACAGCGATGGACGTTCTCCCGCCAGGGCCGGTACTTTGCGCACTGTGCCGTTACAGTcc > 1:989542/1‑140 (MQ=255)
aaGTCCCGATAACAGCAAAACCAACGCCTTGTAGTGCCAGACCTAACCCTGGTTTCCAGATAAGCCCGACAACGCTCCACAGCGATGGACGTTCTCCCGCCAGGGCCGGTACTTTGCGCACTGTGCCGTTACAGTCCCAc > 2:1913149/1‑140 (MQ=255)
aGTCCCGATAACAGCAAAACCAACGCCTTGTAGTGCCAGACCTAACCCTGGTTTCCAGATAAGCCCGACAACGCTCCACAGCGATGGACGTTCTCCCGCCAGGGCCGGTACTTTGCGCACTGTGCCGTTACAGTCCCACg < 1:487025/140‑1 (MQ=255)
aGTCCCGATAACAGCAAAACCAACGCCTTGTAGTGCCAGACCTAACCCTGGTTTCCAGATAAGCCCGACAACGCTCCACAGCGATGGACGTTCTCCCGCCAGGGCCGGTACTTTGCGCACTGTGCCGTTACAGTCCCACg < 2:959853/140‑1 (MQ=255)
gTCCCGATAACAGCAAAACCAACGCCTTGTAGTGCCAGACCTAACCCTGGTTTCCAGATAAGCCCGACAACGCTCCACAGCGATGGACGTTCTCCCGCCAGGGCCGGTACTTTGCGCACTGTGCCGTTACAGTCCCACGc < 2:1197986/140‑1 (MQ=255)
gATAACAGCAAAACCAGCGCCTTGTAGTGCCAGACCTAACCCTGGTTTCCAGATAAGCCCGACAACGCTCCACAGCGATGGACGTTCTCCCGCCAGGGCCGGTACTTTGCGCACTGTGCCGTTACAGTCCCACGCCAGTa < 2:348377/140‑1 (MQ=255)
gATAACAGCAAAACCAACGCCTTGTAGTGTCAGACCTAACCCTGGTTTCCAGATAAGCCCGACAACGCTCCACAGCGATGGACGTTCTCCCGCCAGGGCCGGTACTTTGCGCACTGTGCCGTTACAGTCCCACGCCAGTa < 2:1859372/140‑1 (MQ=255)
gATAACAGCAAAACCAACGCCTTGTAGTGCCAGACCTAACCCTGGTTTCCAGATAAGCCCGACAACGCTCCACAGCGATGGACGTTCTCCCGCCAGGGCCGGTACTTTGCGCACTGTGCCGTTACAGTCCCACGCCAGTa < 1:617850/140‑1 (MQ=255)
gATAACAGCAAAACCAACGCCTTGTAGTGCCAGACCTAACCCTGGTTTCCAGATAAGCCCGACAACGCTCCACAGCGATGGACGTTCTCCCGCCAGGGCCGGTACTTTGCGCACTGTGCCGTTACAGTCCCACGCCAGTa < 2:1303291/140‑1 (MQ=255)
aCAGCAAAACCAACGCCTTGTAGTGCCAGACCTAACCCTGGTTTCCAGATAAGCCCGACAACGCTCCACAGCGATGGACGTTCTCCCGCCAGGGCCGGTACTTTGCGCACTGTGCCGTTACAGTCCCACGCCAGTACggg < 1:850082/140‑1 (MQ=255)
aCAGCAAAACCAACGCCTTGTAGTGCCAGACCTAACCCTGGTTTCCAGATAAGCCCGACAACGCTCCACAGCGATGGACGTTCTCCCGCCAGGGCCGGTACTTTGCGCACTGTGCCGTTACAGTCCCACGCCAGTACggg < 2:464575/140‑1 (MQ=255)
aGCAAAACCAACGCCTTGTAGTGCCAGACCTAACCCTGGTTTCCAGATAAGCCCGACAACGCTCCACAGCGATGGACGTTCTCCCGCCAGGGCCGGTACTTTGCGCACTGTGCCGTTACAGTCCCACGCCAGTa > 2:802087/1‑134 (MQ=255)
aGCAAAACCAACGCCTTGTAGTGCCAGACCTAACCCTGGTTTCCAGATAAGCCCGACAACGCTCCACAGCGATGGACGTTCTCCCGCCAGGGCCGGTACTTTGCGCACTGTGCCGTTACAGTCCCACGCCAGTa < 1:802087/134‑1 (MQ=255)
aGCAAAACCAACGCCTTGTAGTGCCAGACCTAACCCTGGTTTCCAGATAAGCCCGACAACGCTCCACAGCGATGGACGTTCTCCCGCCAGGGCCGGTACTTTGCGCACTGTGCCGTTACAGTCCCACGCCAGTa > 1:1331379/1‑134 (MQ=255)
aGCAAAACCAACGCCTTGTAGTGCCAGACCTAACCCTGGTTTCCAGATAAGCCCGACAACGCTCCACAGCGATGGACGTTCTCCCGCCAGGGCCGGTACTTTGCGCACTGTGCCGTTACAGTCCCACGCCAGTa < 2:1331379/134‑1 (MQ=255)
aGCAAAACCAACGCCTTGTAGTGCCAGACCTAACCCTGGTTTCCAGATAAGCCCGACAACGCTCCACAGCGATGGACGTTCTCCCGCCAGGGCCGGTACTTTGCGCACTGTGCCGTTACAGTCCCACGCCAGTa < 1:1622322/134‑1 (MQ=255)
gCAAAACCAACGCCTTGTAGTGCCAGACCTAACCCTGGTTTCCAGATAAGCCCGACAACGCTCCACAGCGATGGACGTTCTCCCGCCAGGGCCGGTACTTTGCGCACTGTGCCGTTACAGTCCCACGCCAGTACGGGTaa < 2:989542/140‑1 (MQ=255)
aaaaCCAACGCCTTGTAGTGCCAGACCTAACCCTGGTTTCCAGATAAGCCCGACAACGCTCCACAGCGATGGACGTTCTCCCGCCAGGGCCGGTACTTTGCGCACTGTGCCGTTACAGTCCCACGCCAGTACGGGTAATa < 1:1023701/140‑1 (MQ=255)
aaaCCAACGCCTTGTAGTGCCAGACCTAACCCTGGTTTCCAGATAAGCCCGACAACGCTCCACAGCGATGGACGTTCTCCCGCCAGGGCCGGTACTTTGCGCACTGTGCCGTTACAGTCCCACGCCAGTACGGGTAATAc < 2:1755823/140‑1 (MQ=255)
aaaCCAACGCCTTGTAGTGCCAGACCTAACCCTGGTTTCCAGATAAGCCCGACAACGCCCCACAGCGATGGACGTTCTCCCGCCAGGGCCGGTACTTTGCGCACTGTGCCGTTACAGTCCCACGCCAGTACGGGTAATAc < 2:1366609/140‑1 (MQ=255)
aaCGCCTTGTAGTGCCAGACCTAACCCTGGTTTCCAGATAAGCCCGACAACGCTCCACAGCGATGGACGTTCTCCCGCCAGGGCCGGTACTTTGCGCACTGTGCCGTTACAGTCCCACGCCAGTACGGGTAATACCATtg < 2:616834/140‑1 (MQ=255)
aCGCCTTGTAGTGCCAGACCTAACCCTGGTTTCCAGATAAGCCCGACAACGCTCCACAGCGATGGACGTTCTCCCGCCAGGGCCGGTACTTTGCGCACTGTGCCGTTACAGTCCCACGCCAGTACGGGTAATACCATtgt > 1:809680/1‑140 (MQ=255)
aCGCCTTGTAGTGCCAGACCTAACCCTGGTTTCCAGATAAGCCCGACAACGCTCCACAGCGATGGACGTTCTCCCGCCAGGGCCGGTACTTTGCGCACTGTGCCGTTACAGTCCCACGCCAGTACGGGTAATACCATtgt > 1:1986886/1‑140 (MQ=255)
cGCCTTGTAGTGCCAGACCTAACCCTGGTTTCCAGATAAGCCCGACAACGCTCCACAGCGATGGACGTTCTCCCGCCAGGGCCGGTACTTTGCGCACTGTGCCGTTACAGTCCCACGCCAGTACGGGTAATACCATtgtg < 2:423873/140‑1 (MQ=255)
gCCAGACCTAACCCTGGTTTCCAGATAAGCCCGACAACGCTCCACAGCGATGGACGTTCTCCCGCCAGGGCCGGTACTTTGCGCACTGTGCCGTTACAGTCCCACGCCAGTACGGGTAGTACCATTGTGGTGATCGCCAg > 1:2240706/1‑140 (MQ=255)
ccAGACCTAACCCTGGTTTCCAGATAAGCCCGACAACGCTCCACAGCGATGGACGTTCTCCCGCCAGGGCCGGTACTTTGCGCACTGTGCCGTTACAGTCCCACGCCAGTACGGGTAATACCATTGTGGTGATCGCCAGt > 1:1916611/1‑140 (MQ=255)
gACCTAACCCTGGTTTCCAGATAAGCCCGACAACGCTCCACAGCGATGGACGTTCTCCCGCCAGGGCCGGTACTTTGCGCACTGTGCCGTTACAGTCCCACGCCAGTACGGGTAATACCATTGTGGTGATCGCCAGTGCg > 2:2409017/1‑140 (MQ=255)
gACCTAACCCTGGTTTCCAGATAAGCCCGACAACGCTCCACAGCGATGGACGTTCTCCCGCCAGGGCCGGTACTTTGCGCACTGTGCCGTTACAGTCCCACGCCAGTACGGGTAATACCATTGTGGTGATCGCCAGTGCg > 2:1824495/1‑140 (MQ=255)
gACCTAACCCTGGTTTCCAGATAAGCCCGACAACGCTCCACAGCGATGGACGTTCTCCCGCCAGGGCCGGTACTTTGCGCACTGTGCCGTTACAGTCCCACGCCAGTACGGGTAATACCATTGTGGTGATCGCCAGTGCg > 1:651318/1‑140 (MQ=255)
gACCTAACCCTGGTTTCCAGATAAGCCCGACAACGCTCCACAGCGATGGACGTTCTCCCGCCAGGGCCGGTACTTTGCGCACTGTGCCGTTACAGTCCCACGCCAGTACGGGTAATACCATTGTGGTGATCGCCAGTGCg > 1:1922454/1‑140 (MQ=255)
ccTAACCCTGGTTTCCAGATAAGCCCGACAACGCTCCACAGCGATGGACGTTCTCCCGCCAGGGCCGGTACTTTGCGCACTGTGCCGTTACAGTCCCACGCCAGTACGGGTAATACCATTGTGGTGATCGCCAGTGCGGc > 2:2105787/1‑140 (MQ=255)
ccTAACCCTGGTTTCCAGATAAGCCCGACAACGCTCCACAGCGATGGACGTTCTCCCGCCAGGGCCGGTACTTTGCGCACTGTGCCGTTACAGTCCCACGCCAGTACGGGTAATACCATTGTGGTGATCGCCAGTGCGGc > 2:2360622/1‑140 (MQ=255)
ccTAACCCTGGTTTCCAGATAAGCCCGACAACGCTCCACAGCGATGGACGTTCTCCCGCCAGGGCCGGTACTTTGCGCACTGTGCCGTTACAGTCCCACGCCAGTACGGGTAATACCATTGTGGTGATCGCCAGTGCGGc > 1:1461780/1‑140 (MQ=255)
tAACCCTGGTTTCCAGATAAGCCCGACAACGCTCCACAGCGATGGACGTTCTCCCGCCAGGGCCGGTACTTTGCGCACTGTGCCGTTACAGTCCCACGCCAGTACGGGTAATACCATTGTGGTGATCGCCAGTGCGGCaa < 2:595653/140‑1 (MQ=255)
aaCCCTGGTTTCCAGATAAGCCCGACAACGCTCCACAGCGATGGACGTTCTCCCGCCAGGGCCGGTACTTTGCGCACTGTGCCGTTACAGTCCCACGCCAGTACGGGTAATACCATTGTGGTGATCGCCAGTGCGGCaaa > 2:340021/1‑140 (MQ=255)
ggTTTCCGTATAAGCCGGACAACGCTCCACAGCGATGGCCGTTCTCCCGCCAGGGCCGGTACTTTGCGCACGGTGCCGTTACAGTCCCACGCCAGTACGGGTAATACCATTGTGGTGATCGCCAGTGCGGCAAAACCGTa < 2:729631/140‑1 (MQ=255)
ggTTTCCAGATAAGCCCGACAACGCTCCACAGCGATGGACGTTCTCCCGCCAGGGCCGGTACTTTGCGCACTGTGCCGTTACAGTCCCACGCCAGTACGGGTAATACCATTGTGGTGATCGCCAg < 1:2427869/125‑1 (MQ=255)
ggTTTCCAGATAAGCCCGACAACGCTCCACAGCGATGGACGTTCTCCCGCCAGGGCCGGTACTTTGCGCACTGTGCCGTTACAGTCCCACGCCAGTACGGGTAATACCATTGTGGTGATCGCCAg > 2:2427869/1‑125 (MQ=255)
ggTTTCCAGATAAGCCCGACAACGCTCCACAGCGATGGACGTTCTCCCGCCAGGGCCGGTACTTTGCGCACTGTGCCGTTACAGTCCCACGCCAGTACGGGTAATACCATTGTGGTGATCGCCAGTGCGGCAAAACCGTa < 1:2283420/140‑1 (MQ=255)
ggTTTCCAGATAAGCCCGACAACGCTCCACAGCGATGGACGTTCTCCCGCCAGGGCCGGTACTTTGCGCACTGTGCCGTTACAGTCCCACGCCAGTACGGGTAATACCATTGTGGTGATCGCCAGTGCGGCAAAACCGTa > 1:1977466/1‑140 (MQ=255)
ggTTTCCAGATAAGCCCGACAACGCTCCACAGCGATGGACGTTCTCCCGCCAGGGCCGGTACTTTGCGCACTGTGCCGTTACAGTCCCACGCCAGTACGGGTAATACCATTGTGGTGATCGCCAGTGCGGCAAAACCGTa < 1:298778/140‑1 (MQ=255)
gTTTCCAGATAAGCCCGACAACGCTCCACAGCGATGGACGTTCTCCCGCCAGGGCCGGTACTTTGCGCACTGTGCCGTTACAGTCCCACGCCAGTACGGGTAATACCATTGTGGTGATCGCCAGTGCGGCAAAACCGTaa > 1:1467376/1‑140 (MQ=255)
gTTTCCAGATAAGCCCGACAACGCTCCACAGCGATGGACGTTCTCCCGCCAGGGCCGGTACTTTGCGCACTGTGCCGTTACAGTCCCACGCCAGTACGGGTAATACCATTGTGGTGATCGCCAGTGCGGCAAAACCGTaa < 2:1367878/140‑1 (MQ=255)
tttCCAGATAAGCCCGACAACGCTCCACAGCGATGGACGTTCTCCCGCCAGGGCCGGTACTTTGCGCACTGTGCCGTTACAGTCCCACGCCAGTACGGGTAATACCATTGTGGTGATCGCCAGTGCGGCAAAACCGTAAt < 1:1043206/140‑1 (MQ=255)
tttCCAGATAAGCCCGACAACGCTCCACAGCGATGGACGTTCTCCCGCCAGGGCCGGTACTTTGCGCACTGTGCCGTTACAGTCCCACGCCAGTACGGGTAATACCATTGTGGTGATCGCCAGTGCGGCAAAACCGTAAt < 2:1922454/140‑1 (MQ=255)
tttCCAGATAAGCCCGACAACGCTCCACAGCGATGGACGTTCTCCCGCCAGGGCCGGTACTTTGCGCACTGTGCCGTTACAGTCCCACGCCAGTACGGGTAATACCATTGTGGTGATCGCCAGTGCGGCAAAACCGTAAt < 2:2240706/140‑1 (MQ=255)
ccAGATAAGCCCGACAACGCTCCACAGCGATGGACGTTCTCCCGCCAGGGCCGGTACTTTGCGCACTGTGCCGTTACAGTCCCACGCCAGTACGGGTAATACCATTGTGGTGATCGCCAGTGCGGCAAAACCGTAATGGc < 1:1824495/140‑1 (MQ=255)
ccAGATAAGCCCGACAACGCTCCACAGCGATGGACGTTCTCCCGCCAGGGCCGGTACTTTGCGCACTGTGCCGTTACAGTCCCACGCCAGTACGGGTAATACCATTGTGGTGATCGCCAGTGCGGCAAAACCGTAATGGc < 1:2054043/140‑1 (MQ=255)
cAGATAAGCCCGACAACGCTCCACAGCGATGGACGTTCTCCCGCCAGGGCCGGTACTTTGCGCACTGTGCCGTTACAGTCCCACGCCAGTACGGGTAATACCATTGTGGTGATCGCCAGTGCGGCAAAACCGTAATGGCt > 1:712217/1‑140 (MQ=255)
aGATAAGCCCGACAACGCTCCACAGCGATGGACGTTCTCCCGCCAGGGCCGGTACTTTGCGCACTGTGCCGTTACAGTCCCACGCCAGTACGGGTAATACCATTGTGGTGATCGCCAGTGCGGCAAAACCGTAATGGCTa < 1:2409017/140‑1 (MQ=255)
tAAGCCCGACAACGCTCCACAGCGATGGACGTTCTCCCGCCAGGGCCGGTACTTTGCGCACTGTGCCGTTACAGTCCCACGCCAGTACGGGTAATACCATTGTGGTGATCGCCAGTGCGGCAAAACCGTAATGGCTATGa < 1:681627/140‑1 (MQ=255)
tAAGCCCGACAACGCTCCACAGCGATGGACGTTCTCCCGCCAGGGCCGGTACTTTGCGCACTGTGCCGTTACAGTCCCACGCCAGTACGGGTAATACCATTGTGGTGATCGCCAGTGCGGCAAAACCGTAATGGCTATGa < 1:2105787/140‑1 (MQ=255)
cccGACAACGCTCCACAGCGATGGACGTTCTCCCGCCAGGGCCGGTACTTTGCGCACTGTGCCGTTACAGTCCCACGCCAGTACGGGTAATACCATTGTGGTGATCGCCAGTGCGGCAAAACCGTa > 2:989088/1‑126 (MQ=255)
cccGACAACGCTCCACAGCGATGGACGTTCTCCCGCCAGGGCCGGTACTTTGCGCACTGTGCCGTTACAGTCCCACGCCAGTACGGGTAATACCATTGTGGTGATCGCCAGTGCGGCAAAACCGTa < 1:989088/126‑1 (MQ=255)
cccGACAACGCTCCACAGCGATGGACGTTCTCCCGCCAGGGCCGGTACTTTGCGCACTGTGCCGTTACAGTCCCACGCCAGTACGGGTAATACCATTGTGGTGATCGCCAGTGCGGCAAAACCGTAATGGCTATGAATCa > 2:2213146/1‑140 (MQ=255)
cccGACAACGCTCCACAGCGATGGACGTTCTCCCGCCAGGGCCGGTACTTTGCGCACTGTGCCGTTACAGTCCCACGCCAGTACGGGTAATACCATTGTGGTGATCGCCAGTGCGGCAAAACCGTAATGGCTATGAATCa > 1:935405/1‑140 (MQ=255)
cTCCACAGCGATGGACGTTCTCCCGCCAGGGCCGGTACTTTGCGCACTGTGCCGTTACAGTCCCACGCCAGTACGGGTAATACCATTGTGGTGATCGCCAGTGCGGCAAAACCGTAATGGCTATGAATCAACAGGCCAAg > 1:99166/1‑140 (MQ=255)
cTCCACAGCGATGGACGTTCTCCCGCCAGGGCCGGTACTTTGCGCACTGTGCCGTTACAGTCCCACGCCAGTACGGGTAATACCATTGTGGTGATCGCCAGTGCGGCAAAACCGTAATGGCTATGAATCAACAGGCCAAg < 2:1467376/140‑1 (MQ=255)
caGCGATGGACGTTCTCCCTCCAGGGCCGGTACTTTGCGCACTGTGCCGTTACAGTCCCACGCCAGTACGGGTAATACCATTGTGGTGATCGCCAGTGCGGCAAAACCGTAATGGCTATGAATCAACAGGCCAAGCGGAg > 1:1121822/1‑140 (MQ=255)
caGCGATGGACGTTCTCCCGCCAGGGCCGGTACTTTGCGCACTGTGCCGTTACAGTCCCACGCCAGTACGGGTAATACCATTGTGGTGATCGCCAGTGCGGCAAAACCGTAATGGCTATGAATCAACAGGCCAAGCGGAg < 2:935405/140‑1 (MQ=255)
tGGACGTTCTCCCGCCAGGGCCGGTACTTTGCGCACTGTGCCGTTACAGTCCCACGCCAGTACGGGTAATACCATTGTGGTGATCGCCAGTGCGGCAAAACCGTAATGGCTATGAATCAACAGGCCAAGCGGAGCAc < 2:2187178/137‑1 (MQ=255)
tGGACGTTCTCCCGCCAGGGCCGGTACTTTGCGCACTGTGCCGTTACAGTCCCACGCCAGTACGGGTAATACCATTGTGGTGATCGCCAGTGCGGCAAAACCGTAATGGCTATGAATCAACAGGCCAAGCGGAGCAc > 1:2187178/1‑137 (MQ=255)
tGGACGTTCTCCCGCCAGGGCCGGTACTTTGCGCACTGTGCCGTTACAGTCCCACGCCAGTACGGGTAATACCATTGTGGTGATCGCCAGTGCGGCAAAACCGTAATGGCTATGAATCAACAGGCCAAGCGGAGCACCa > 2:1239634/1‑139 (MQ=255)
tGGACGTTCTCCCGCCAGGGCCGGTACTTTGCGCACTGTGCCGTTACAGTCCCACGCCAGTACGGGTAATACCATTGTGGTGATCGCCAGTGCGGCAAAACCGTAATGGCTATGAATCAACAGGCCAAGCGGAGCACCa < 1:1239634/139‑1 (MQ=255)
ggACGTTCTCCCGCCAGGGCCGGTACTTTGCGCACTGTGCCGTTACATTCCCACGCCAGTACGGGTAATACCATTGTGGTGATCGCCAGTGCGGCAAAACCGTAATGGCTATGAATCAACAGGCCAAGCGGAGCACCAAc < 1:1213009/140‑1 (MQ=255)
tctcCCGCCAGGGCCGGTACTTTGCGCACTGTGCCGTTACAGTCCCACGCCAGTACGGGTAATACCATTGTGGTGATCGCCAGTGCGGCAAAACCGTAATGGCTATGAATCAACAGGCCAAGCGGAGCACCAACAGCGAg > 2:1912760/1‑140 (MQ=255)
ctcCCGCCAGGGCCGGTACTTTGCGCACTGTGCCGTTACAGTCCCACGCCAGTACGGGTAATACCATTGTGGTGATCGCCAGTGCGGCAAAACCGTAATGGCTATGAATCAACAGGCCAAGCGGAGCACCAACAGCGAgg < 2:809680/140‑1 (MQ=255)
ctcCCGCCAGGGCCGGTACTTTGCGCACTGTGCCGTTACAGTCCCACGCCAGTACGGGTAATACCATTGTGGTGATCGCCAGTGCGGCAAAACCGTAATGGCTATGAATCAACAGGCCAAGCGGAGCACCAACAGCGAgg < 1:1912760/140‑1 (MQ=255)
ctcCCGCCAGGGCCGGTACTTTGCGCACTGTGCCGTTACAGTCCCACGCCAGTACGGGTAATACCATTGTGGTGATCGCCAGTGCGGCAAAACCGTAATGGCTATGAATCAACAGGCCAAGCGGAGCACCAACAGCGAgg < 2:712217/140‑1 (MQ=255)
tcCCGCCAGGGCCGGTACTTTGCGCACTGTGCCGTTACAGTCCCACGCCAGTACGGGTAATACCATTGTGGTGATCGCCAGTGCGGCAAAACCGTAATGGCTATGAATCAACAGGCCAAGCGGAGCACCAACAGCGAggg > 1:1323308/1‑140 (MQ=255)
tcCCGCCAGGGCCGGTACTTTGCGCACTGTGCCGTTACAGTCCCACGCCAGTACGGGTAATACCATTGTGGTGATCGCCAGTGCGGCAAAACCGTAATGGCTATGAATCAACAGGCCAAGCGGAGCACCAACAGCGAggg < 2:1265101/140‑1 (MQ=255)
gggCCGGTACTTTGCGCACTGTGCCGTTACAGTCCCACGCCAGTACGGGTAATACCATTGTGGTGATCGCCAGTGCGGCAAAACCGTAATGGCTATGAATCAACAGGCCAAGCGGAGCACCAACAGCGAGGGCACCGTaa > 2:2028462/1‑140 (MQ=255)
ggCCGGTACTTTGCGCACTGTGCCGTTACAGTCCCACGCCAGTACGGGTAATACCATTGTGGTGATCGCCAGTGCGGCAAAACCGTAATGGCTATGAATCAACAGGCCAAGCGGAGCACCAACAGCGAgg < 2:92726/130‑1 (MQ=255)
ggTACTTTGCGCACTGTGCCGTTACAGTCCCACGCCAGTACGGGTAATACCATTGTGGTGATCGCCAGTGCGGCAAAACCGTAATGGCTATGAATCAACAGGCCAAGCGGAGCACCAACAGCGAGGGCACCGTAAATCGc > 1:2377298/1‑140 (MQ=255)
cTTTGCGCACTGTGCCGTTACAGTCCCACGCCAGTACGGGTAATACCATTGTGGTGATCGCCAGTGCGGCAAAACCGTAATGGCTATGAATCAACAGGCCAAGCGGAGCACCAACAGCGAGGGCACCGTAAATCGCCAtt < 1:158376/140‑1 (MQ=255)
tttGCGCACTGTGCCGTTACAGTCCCACGCCAGTACGGGTAATACCATTGTGGTGATCGCCAGTGCGGCAAAACCGTAATGGCTATGAATCAACAGGCCAAGCGGAGCACCAACAGCGAGGGCACCGTAAATCGCCATTc < 1:57027/140‑1 (MQ=255)
ttGCGCACTGTGCCGTTACAGTCCCACGCCAGTACGGGTAATACCATTGTGGTGATCGCCAGTGCGGCAAAACCGTAATGGCTATGAATCAACAGGCCAAGCGGAGCACCAACAGCGAGGGCACCGTAAATCGCCATTcc > 1:19543/1‑140 (MQ=255)
tGCGCACTGTGCCGTTACAGTCCCACGCCAGTACGGGTAATACCATTGTGGTGATCGCCAGTGCGGCAAAACCGTAATGGCTATGAATCAACAGGCCAAGCGGAGCACCAACAGCGAGGGCACCGTAAATCGCCATTCCg > 2:784133/1‑140 (MQ=255)
cgcACTGTGCCGTTACAGTCCCACGCCAGTACGGGTAATACCATTGTGGTGATCGCCAGTGCGGCAAAACCGTAATGGCTATGAATCAACAGGCCAAGCGGAGCACCAACAGCGAGGGCACCGTAAATCGCCATTCCGtt > 1:541629/1‑140 (MQ=255)
aCTGTGCCGTTACAGTCCCACGCCAGTACGGGTAATACCATTGTGGTGATCGCCAGTGCGGCAAAACCGTAATGGCTATGAATCAACAGGCCAAGCGGAGCACCAACAGCGAGGGCACCGTAAATCGCCATTCCGTTCCa > 1:789157/1‑140 (MQ=255)
tgtgCCGTTACAGTCCCACGCCAGTACGGGTAATACCATTGTGGTGATCGCCAGTGCGGCAAAACCGTAATGGCTATGAATCAACAGGCCAAGCGGAGCACCAACAGCGAGGGCACCGTAAATCGCCATTCCGTTCCa < 1:2269612/138‑1 (MQ=255)
tgtgCCGTTACAGTCCCACGCCAGTACGGGTAATACCATTGTGGTGATCGCCAGTGCGGCAAAACCGTAATGGCTATGAATCAACAGGCCAAGCGGAGCACCAACAGCGAGGGCACCGTAAATCGCCATTCCGTTCCATg > 1:1521780/1‑140 (MQ=255)
tgtgCCGTTACAGTCCCACGCCAGTACGGGTAATACCATTGTGGTGATCGCCAGTGCGGCAAAACCGTAATGGCTATGAATCAACAGGCCAAGCGGAGCACCAACAGCGAGGGCACCGTAAATCGCCATTCCGTTCCATg > 1:983052/1‑140 (MQ=255)
gtgCCGTTACAGTCCCACGCCAGTACGGGTAATACCATTGTGGTGATCGCCAGTGCGGCAAAACCGTAATGGCTATGAATCAACAGGCCAAGCGGAGCACCAACAGCGAGGGCACCGTAAATCGCCATTCCGTTCCa < 1:1020907/137‑1 (MQ=255)
gtgCCGTTACAGTCCCACGCCAGTACGGGTAATACCATTGTGGTGATCGCCAGTGCGGCAAAACCGTAATGGCTATGAATCAACAGGCCAAGCGGAGCACCAACAGCGAGGGCACCGTAAATCGCCATTCCGTTCCATGa > 2:28007/1‑140 (MQ=255)
gtgCCGTTACAGTCCCACGCCAGTACGGGTAATACCATTGTGGTGATCGCCAGTGCGGCAAAACCGTAATGGCTATGAATCAACAGGCCAAGCGGAGCACCAACAGCGAGGGCACCGTAAATCGCCATTCCGTTCCATGa > 1:1857226/1‑140 (MQ=255)
gtgCCGTTACAGTCCCACGCCAGTACGGGTAATACCATTGTGGTGATCGCCAGTGCGGCAAAACCGTAATGGCTATGAATCAACAGGCCAAGCGGAGCACCAACAGCGAGGGCACCGTAAATCGCCATTCCGTTCCATGa > 1:402860/1‑140 (MQ=255)
gtgCCGTTACAGTCCCACGCCAGTACGGGTAATACCATTGTGGTGATCGCCAGTGCGGCAAAACCGTAATGGCTATGAATCAACAGGCCAAGCGGAGCACCAACAGCGAGGGCACCGTAAATCGCCATTCCGTTCCATGa > 2:747239/1‑140 (MQ=255)
gtgCCGTTACAGTCCCACGCCAGTACGGGTAATACCATTGTGGTGATCGCCAGTGCGGCAAAACCGTAATGGCTATGAATCAACAGGCCAAGCGGAGCACCAACAGCGAGGGCACCGTAAATCGCCATTCCGTTCCATGa > 1:784200/1‑140 (MQ=255)
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gtgCCGTTACA‑GTCCACGCCAGTACGGGTAATACCATTGTGGTGATCGCCAGTGCGGCAAAACCGTAATGGCTATGAATCAACAGGCCAAGCGGAGCACCAACAGCGAGGGCACCGTAAATCGCCATTCCGTTCCATGAc > 2:1484649/1‑140 (MQ=255)
tgCCGTTACAGTCCCACGCCAGTACGGGTAATACCATTGTGGTGATCGCCAGTGCGGCAAAACCGTAATGGCTATGAATCAACAGGCCAAGCGGAGCACCAACAGCGAGGGCACCGTAAATCGCCATTCCGTTCCATGAc > 2:2127516/1‑140 (MQ=255)
tgCCGTTACAGTCCCACGCCAGTACGGGTAATACCATTGTGGTGATCGCCAGTGCGGCAAAACCGTAATGGCTATGAATCAACAGGCCAAGCGGAGCACCAACAGCGAGGGCACCGTAAATCGCCATTCCGTTCCATGAc < 1:747239/140‑1 (MQ=255)
tgCCGTTACAGTCCCACGCCAGTACGGGTAATACCATTGTGGTGATCGCCAGTGCGGCAAAACCGTAATGGCTATGAATCAACAGGCCAAGCGGAGCACCAACAGCGAGGGCACCGTAAATCGCCATTCCGTTCCAGGAc < 2:2377298/140‑1 (MQ=255)
gTTACAGTCCCACGCCAGTACGGGTAATACCATTGTGGTGATCGCCAGTGCGGCAAAACCGTAATGGCTATGAATCAACAGGCCAAGCGGAGCACCAACAGCGAGGGCACCGTAAATCGCCATTCCGTTCCATGACATCa < 1:1960541/140‑1 (MQ=255)
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cAGTCCCACGCCAGTACGGGTAATACCATTGTGGTGATCGCCAGTGCGGCAAAACCGTAATGGCTATGAATCAACAGGCCAAGCGGAGCACCAACAGCGAGGGCACCGTAAATCGCCATTCCGTTCCATGACATCACttt > 2:1550703/1‑140 (MQ=255)
cAGTCCCACGCCAGTACGGGTAATACCATTGTGGTGATCGCCAGTGCGGCAAAACCGTAATGGCTATGAATCAACAGGCCAAGCGGAGCACCAACAGCGAGGGCACCGTAAATCGCCATTCCGTTCCATGACATCACttt > 2:1471612/1‑140 (MQ=255)
ggCCCCCGGCAGGTCGGGTAATACCATTGTGGTGATCGCCAGTGCGGCAAAACCGTAATGGCTATGAATCAACAGGCCAAGCGGAGCACCAACAGCGAGGGCACCGTAAATCGCCATTCCGTTCCATGACATCACTTTGc < 1:1020150/140‑1 (MQ=255)
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CGAAAGTCCCGATAACAGCAAAACCAACGCCTTGTAGTGCCAGACCTAACCCTGGTTTCCAGATAAGCCCGACAACGCTCCACAGCGATGGACGTTCTCCCGCCAGGGCCGGTACTTTGCGCACTGTGCCGTTACAGGCCCACGCCAGTACGGGTAATACCATTGTGGTGATCGCCAGTGCGGCAAAACCGTAATGGCTATGAATCAACAGGCCAAGCGGAGCACCAACAGCGAGGGCACCGTAAATCGCCATTCCGTTCCATGACATCACTTTGC > NC_000913/2439406‑2439681
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| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
GATK/CNVnator alignment
N/A
