Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A20 F30 I1 R1
|
25 |
54.5 |
1844758 |
99.1% |
1828155 |
139.4 |
Breseq alignment
BRESEQ :: Evidence
|
| evidence |
seq id |
position |
mutation |
annotation |
gene |
description |
| RA |
NC_000913 |
4,505,167 |
C→A |
G370G (GGC→GGA) |
yjhB → |
putative sialic acid transporter |
|
| |
seq id |
position |
ref |
new |
freq |
score (cons/poly) |
reads |
annotation |
genes |
product |
| * | NC_000913 | 4,505,167 | 0 | C | A | 100.0%
| 290.2
/ NA
| 83 | G370G (GGC→GGA) | yjhB | putative sialic acid transporter |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (0/0); new base A (59/24); total (59/24) |
GGGTTGGTTCCAAAATTTATATATGATTACTTTCCAACAAAATTAAGAGGATTAGGGACCGGTCTTATTTATAACTTAGGGGCAACTGGAGGAATGGCCGCACCTGTATTAGCTACATACATTTCAGGATATTATGGCTTAGGTGTTTCATTATTCATTGTTACGGTTGCATTCTCTGCCTTATTAATTTTGTTAGTTGGTTTTGATATTCCAGGTAAAATTTATAAACTATCCGTGGCTAAATGATTGGAGGCTTTATGATTAATTATGGC > NC_000913/4505030‑4505301
|
gggTTGGTTCCAAAATTTATATATGATTACTTTCCAACAAAATTAAGAGGATTAGGTACCGGTCTTATTTATAACTTAGGGGCAACTGGAGGAATGGCCGCACCTGTATTAGCTACATACATTTCAGGATATTATGGAtt < 2:49168/140‑1 (MQ=255)
gttggttCCAAAATTTATATATGATTACTTTCCAACAAAATTAAGAGGATTAGGGACCGGTCTTATTTATAACTTAGGGGCAACTGGAGGAATGGCCGCACCTGTATTAGCTACATACATTTCAGGATATTATGGATTAg < 1:123583/140‑1 (MQ=255)
ttggttCCAAAATTTATATATGATTACTTTCCAACAAAATTAAGAGGATTAGGGACCGGTCTTATTTATAACTTAGGGGCAACTGGAGGAATGGCCGCACCTGTATTAGCTACATACATTTCAGGATATTATGGATTAgg > 1:732941/1‑140 (MQ=255)
ggttCCAAAATTTATATATGATTACTTTCCAACAAAATTAAGAGGATTAGGGACCGGTCTTATTTATAACTTAGGGGCAACTGGAGGAATGGCCGCACCTGTATTAGCTACATACATTTCAGGATATTATGGATTAGgtg < 2:28083/140‑1 (MQ=255)
tCCAAAATTTATATATGATTACTTTCCAACAAAATTAAGAGGATTAGGGACCGGTCTTATTTATAACTTAGGGGCAACTGGAGGAATGGCCGCACCTGTATTAGCTACATACATTTCAGGATATTATGGATTAGGTGttt > 1:812527/1‑140 (MQ=255)
cAAAATTTATATATGATTACTTTCCAACAAAATTAAGAGGATTAGGGACCGGTCTTATTTATAACTTAGGGGCAACTGGAGGAATGGCCGCACCTGTATTAGCTACATACATTTCAGGATATTATGGATTAGGTGTTTCa < 1:720274/140‑1 (MQ=255)
cAAAATTTATATATGATTACTTTCCAACAAAATTAAGAGGATTAGGGACCGGTCTTATTTATAACTTAGGGGCAACTGGAGGAATGGCCGCACCTGTATTAGCTACATACATTTCAGGATATTATGGATTAGGTGTTTCa < 1:401407/140‑1 (MQ=255)
aaaTTTATATATGATTACTTTCCAACAAAATTAAGAGGATTAGGGACCGGTCTTATTTATAACTTAGGGGCAACTGGAGGAATGGCCGCACCTGTATTAGCTACATACATTTCAGGATATTATGGATTAGGTGTTTCatt > 1:81202/1‑140 (MQ=255)
tttATATATGATTACTTTCCAACAAAATTAAGAGGATTAGGGACCGGTCTTATTTATAACTTAGGGGCAACTGGAGGAATGGCCGCACCTGTATTAGCTACATACATTTCAGGATATTATGGATTAGGTGTTTCattatt < 1:327407/140‑1 (MQ=255)
tGATTACTTTCCAACAAAATTAAGAGGATTAGGGACCGGTCTTATTTATAACTTAGGGGCAACTGGAGGAATGGCCGCACCTGTATTAGCTACATACATTTCAGGATATTATGGATTAGGTGTTTCATTATTCATTGTTa < 1:283130/140‑1 (MQ=255)
aTTACTTTCCAACAAAATTAAGAGGATTAGGGGCCGGTCTTATTTATAACTTAGGGGCAACTGGAGGAATGGCCGCACCTGTATTAGCTACATACATTTCAGGATATTATGGATTAGGTGTTTCATTATTCATTGTTACg < 1:121969/140‑1 (MQ=255)
aTTACTTTCCAACAAAATTAAGAGGATTAGGGACCGGTCTTATTTATAACTTAGGGGCAACTGGAGGAATGGCCGCACCTGTATTAGCTACATACATTTCAGGATATTATGGATTAGGTGTTTCATTATTCATTGTTACg < 2:600480/140‑1 (MQ=255)
aTTACTTTCCAACAAAATTAAGAGGATTAGGGACCGGTCTTATTTATAACTTAGGGGCAACTGGAGGAATGGCCGCACCTGTATTAGCTACATACATTTCAGGATATTATGGATTAGGTGTTTCATTATTCATTGTTACg > 2:204381/1‑140 (MQ=255)
aTTACTTTCCAACAAAATTAAGAGGATTAGGGACCGGTCTTATTTATAACTTAGGGGCAACTGGAGGAATGGCCGCACCTGTATTAGCTACATACATTTCAGGATATTATGGATTAGGTGTTTCATTATTCATTGTTACg > 2:250823/1‑140 (MQ=255)
aTTACTTTCCAACAAAATTAAGAGGATTAGGGACCGGTCTTATTTATAACTTAGGGGCAACTGGAGGAATGGCCGCACCTGTATTAGCTACATACATTTCAGGATATTATGGATTAGGTGTTTCATTATTCATTGTTACg > 1:358267/1‑140 (MQ=255)
cTTTCCAACAAAATTAAGAGGATTAGGGACCGGTCTTATTTATAACTTAGGGGCAACTGGAGGAATGGCCGCACCTGTATTAGCTACATACATTTCAGGATATTATGGATTAGGTGTTTCATTATTCATTGTTACGGTTg > 1:552852/1‑140 (MQ=255)
tCCAACAAAATTAAGAGGATTAGGGACCGGTCTTATTTATAACTTAGGGGCAACTGGAGGAATGGCCGCACCTGTATTAGCTACATACATTTCAGGATATTATGGATTAGGTGTTTCATTATTCATTGTTACGGTTGCAt > 2:316571/1‑140 (MQ=255)
tCCAACAAAATTAAGAGGATTAGGGACCGGTCTTATTTATAACTTAGGGGCAACTGGAGGAATGGCCGCACCTGTATTAGCTACATACATTTCAGGATATTATGGATTAGGTGTTTCATTATTCATTGTTACGGTTGCAt > 1:490003/1‑140 (MQ=255)
caacaaAATTAAGAGGATTAGGGACCGGTCTTATTTATAACTTAGGGGCAACTGGAGGAATGGCCGCACCTGTATTAGCTACATACATTTCAGGATATTATGGATTAGGTGTTTCATTATTCATTGTTACGGTTGCATtc > 1:278929/1‑140 (MQ=255)
aacaaAATTAAGAGGATTAGGGACCGGTCTTATTTATAACTTAGGGGCAACTGGAGGAATGGCCGCACCTGTATTAGCTACATACATTTCAGGATATTATGGATTAGGTGTTTCATTACTCATTGTTACGGTTGCATtct < 1:268173/140‑1 (MQ=255)
caaAATTAAGAGGATTAGGGACCGGTCTTATTTATAACTTAGGGGCAACTGGAGGAATGGCCGCACCTGTATTAGCTACATACATTTCAGGATATTATGGATTAGGTGTTTCATTATTCATTGTTACGGTTGCATTctct > 2:33057/1‑140 (MQ=255)
aaaaTTAAGAGGATTAGGGACCGGTCTTATTTATAACTTAGGGGCAACTGGAGGAATGGCCGCACCTGTATTAGCTACATACATTTCAGGATATTATGGATTAGGTGTTTCATTATTCATTGTTACGGTTGCATTCTCTg < 2:81202/140‑1 (MQ=255)
aaTTCAGAGGATTAGGGACCGGTCTTATTTATAACTTAGGGGCAACTGGAGGAATGGCCGCACCTGTATTAGCTACATACATTTCAGGATATTATGGATTAGGTGTTTCATTATTCATTGTTACGGTTGCATTCTCTGcc > 2:686208/1‑140 (MQ=255)
gagGATTAGGGACCGGTCTTATTTATAACTTAGGGGCAACTGGAGGAATGGCCGCACCTGTATTAGCTACATACATTTCAGGATATTATGGATTAGGTGTTTCATTATTCATTGTTACGGTTGCATTCTCTGCCttatta < 2:85107/140‑1 (MQ=255)
gACCGGTCTTATTTATAACTTAGGGGCAACTGGAGGAATGGCCGCACCTGTATTAGCTACATACATTTCAGGATATTATGGATTAGGTGTTTCATTATTCATTGTTACGGTTGCATTCTCTGCCTTATTAATTTTGTTAg < 1:728251/140‑1 (MQ=255)
ggTCTTATTTATAACTTAGGGGCAACTGGAGGAATGGCCGCACCTGTATTAGCTACATACATTTCAGGATATTATGGATTAGGTGTTTCATTATTCATTGTTACGGTTGCATTCTCTGCCTTATTAATTTTGTTAGTTgg > 1:248740/1‑140 (MQ=255)
ggTCTTATTTATAACTTAGGGGCAACTGGAGGAATGGCCGCACCTGTATTAGCTACATACATTTCAGGATATTATGGATTAGGTGTTTCATTATTCATTGTTACGGTTGCATTCTCTGCCTTATTAATTTTGTTAGTTgg < 2:742926/140‑1 (MQ=255)
ggTCTTATTTATAACTTAGGGGCAACTGGAGGAATGGCCGCACCTGTATTAGCTACATACATTTCAGGATATTATGGATTAGGTGTTTCATTATTCATTGTTACGGTTGCATTCTCTGCCTTATTAATTTTGTTAGTTgg > 2:916838/1‑140 (MQ=255)
ggTCTTATTTATAACTTAGGGGCAACTGGAGGAATGGCCGCACCTGTATTAGCTACATACATTTCAGGATATTATGGATTAGGTGTTTCATTATTCATTGTTACGGTTGCATTCTCTGCCTTATTAATTTTGTTAGTTgg > 1:145534/1‑140 (MQ=255)
gTCTTATTTATAACTTAGGGGCAACTGGAGGAATGGCCGCACCTGTATTAGCTACATACATTTCAGGATATTATGGATTAGGTGTTTCATTATTCATTGTTACGGTTGCATTCTCTGCCTTATTAATTTTGTTAGTTGGt > 1:154300/1‑140 (MQ=255)
aaCTTAGGGGCAACTGGAGGAATGGCCGCACCTGTATTAGCTACATACATTTCAGGATATTATGGATTAGGTGTTTCATTATTCATTGTTACGGTTGCATTCTCTGCCTTATTAATTTTGTTAGTTGGTTTTGATATTcc > 1:423158/1‑140 (MQ=255)
aaCTTAGGGGCAACTGGAGGAATGGCCGCACCTGTATTAGCTACATACATTTCAGGATATTATGGATTAGGTGTTTCATTATTCATTGTTACGGTTGCATTCTCTGCCTTATTAATTTTGTTAGTTGGTTTTGATATTcc > 2:457283/1‑140 (MQ=255)
aaCTTAGGGGCAACTGGAGGAATGGCCGCACCTGTATTAGCTACATACATTTCAGGATATTATGGATTAGGTGTTTCATTATTCATTGTTACGGTTGCATTCTCTGCCTTATTAATTTTGTTAGTTGGTTTTGATATTcc > 1:305029/1‑140 (MQ=255)
aaCTTAGGGGCAACTGGAGGAATGGCCGCACCTGTATTAGCTACATACATTTCAGGATATTATGGATTAGGTGTTTCATTATTCATTGTTACGGTTGCATTCTCTGCCTTATTAATTTTGTTAGTTGGTTTTGATATTcc > 2:332661/1‑140 (MQ=255)
aaCTTAGGGGCAACTGGAGGAATGGCCGCACCTGTATTAGCTACATACATTTCAGGATATTATGGATTAGGTGTTTCATTATTCATTGTTACGGTTGCATTCTCTGCCTTATTAATTTTGTTAGTTGGTTTTGATATTcc > 2:890751/1‑140 (MQ=255)
aaCTTAGGGGCAACTGGAGGAATGGCCGCACCTGTATTAGCTACATACATTTCAGGATATTATGGATTAGGTGTTTCATTATTCATTGTTACGGTTGCATTCTCTGCCTTATTAATTTTGTTAGTTGGTTTTGATATTcc > 2:337954/1‑140 (MQ=255)
cTTAGGGGCAACTGGAGGAATGGCCGCACCTGTATTAGCTACATACATTTCAGGATATTATGGATTAGGTGTTTCATTATTCATTGTTACGGTTGCATTCTCTGCCTTATTAATTTTGTTAGTTGGTTTTGATATTcctg > 1:648924/1‑138 (MQ=255)
aGGGGCAACTGGAGGAATGGCCGCACCTGTATTAGCTACATACATTTCAGGATATTATGGATTAGGTGTTTCATTATTCATTGTTACGGTTGCATTCTCTGCCTTATTAATTTTGTTAGTTGGTTTTGATATTCCAGGTa > 2:234166/1‑140 (MQ=255)
aGGGGCAACTGGAGGAATGGCCGCACCTGTATTAGCTACATACATTTCAGGATATTATGGATTAGGTGTTTCATTATTCATTGTTACGGTTGCATTCTCTGCCTTATTAATTTTGTTAGTTGGTTTTGATATTCCAGGTa > 2:921173/1‑140 (MQ=255)
aGGGGCAACTGGAGGAATGGCCGCACCTGTATTAGCTACATACATTTCAGGATATTATGGATTAGGTGTTTCATTATTCATTGTTACGGTTGCATTCTCTGCCTTATTAATTTTGTTAGTTGGTTTTGATATTCCAGGTa > 1:229278/1‑140 (MQ=255)
aGGGGCAACTGGAGGAATGGCCGCACCTGTATTAGCTACATACATTTCAGGATATTATGGATTAGGTGTTTCATTATTCATTGTTACGGTTGCATTCTCTGCCTTATTAATTTTGTTAGTTGGTTTTGATATTCCAGGTa > 1:631969/1‑140 (MQ=255)
aGGGGCAACTGGAGGAATGGCCGCACCTGTATTAGCTACATACATTTCAGGATATTATGGATTAGGTGTTTCATTATTCATTGTTACGGTTGCATTCTCTGCCTTATTAATTTTGTTAGTTGGTTTTGATATTCCAGGTa > 1:588405/1‑140 (MQ=255)
aGGGGCAACTGGAGGAATGGCCGCACCTGTATTAGCTACATACATTTCAGGATATTATGGATTAGGTGTTTCATTATTCATTGTTACGGTTGCATTCTCTGCCTTATTAATTTTGTTAGTTGGTTTTGATATTCCAGGTa > 1:545009/1‑140 (MQ=255)
ggggCAACTGGAGGAATGGCCGCACCTGTATTAGCTACATACATTTCAGGATATTATGGATTAGGTGTTTCATTATTCATTGTTACGGTTGCATTCTCTGCCTTATTAATTTTGTTAGTTGGTTTTGATATTCCAGGTaa < 2:423158/140‑1 (MQ=255)
cTGGAGGAATGGCCGCACCTGTATTAGCTACATACATTTCAGGATATTATGGATTAGGTGTTTCATTATTCATTGTTACGGTTGCATTCTCTGCCTTATTAATTTTGTTAGTTGGTTTTGATATTCCAGGTAAAATTtat > 1:108934/1‑140 (MQ=255)
gaggaATGGCCGCACCTGTATTAGCTACATACATTTCAGGATATTATGGATTAGGTGTTTCATTATTCATTGTTACGGTTGCATTCTCTGCCTTATTAATTTTGTTAGTTGGTTTTGATATTCCAGGTAAAATTTATaaa < 1:301304/140‑1 (MQ=255)
aggaATGGCCGCACCTGTATTAGCTACATACATTTCAGGATATTATGGATTAGGTGTTTCATTATTCATTGTTACGGTTGCATTCTCTGCCTTATTAATTTTGTTAGTTGGTTTTGATATTCCAGGTAAAATTTATAAAc > 2:467141/1‑140 (MQ=255)
tGGCCGCACCTGTATTAGCTACATACATTTCAGGATATTATGGATTAGGTGTTTCATTATTCATTGTTACGGTTGCATTCTCTGCCTTATTAATTTTGTTAGTTGGTTTTGATATTCCAGGTAAAATTTATAAACTATcc < 1:640745/140‑1 (MQ=255)
ggCCGCACCTGTATTAGCTACATACATTTCAGGATATTATGGATTAGGTGTTTCATTATTCATTGTTACGGTTGCATTCTCTGCCTTATTAATTTTGTTAGTTGGTTTTGATATTCCAGGTAAAATTTATAAACTATCCg > 2:106810/1‑140 (MQ=255)
gCCGCACCTGTATTAGCTACATACATTTCAGGATATTATGGATTAGGTGTTTCATTATTCATTGTTACGGTTGCATTCTCTGCCTTATTAATTTTGTTAGTTGGTTTTGATATTCCAGGTAAAATTTATAAACTATCCGt > 2:152439/1‑140 (MQ=255)
gCCGCACCTGTATTAGCTACATACATTTCAGGATATTATGGATTAGGTGTTTCATTATTCATTGTTACGGTTGCATTCTCTGCCTTATTAATTTTGTTAGTTGGTTTTGATATTCCAGGTAAAATTTATAAACTATCCGt > 1:324189/1‑140 (MQ=255)
gCCGCACCTGTATTAGCTACATACATTTCAGGATATTATGGATTAGGTGTTTCATTATTCATTGTTACGGTTGCATTCTCTGCCTTATTAATTTTGTTAGTTGGTTTTGATATTCCAGGTAAAATTTATAAACTATCCGt > 2:352387/1‑140 (MQ=255)
aTTAGCTACATACATTTCAGGATATTATGGATTAGGTGTTTCATTATTCATTGTTACGGTTGCATTCTCTGCCTTATTAATTTTGTTAGTTGGTTTTGATATTCCAGGTAAAATTTATAAACTATCCGTGGCTAAATGAt > 2:213964/1‑140 (MQ=255)
aGCTACATACATTTCAGGATATTATGGATTAGGTGTTTCATTATTCATTGTTACGGTTGCATTCTCTGCCTTATTAATTTTGTTAGTTGGTTTTGATATTCCAGGTAAAATTTATAAACTATCCGTGGCTAAATGATTgg < 2:248740/140‑1 (MQ=255)
gCTACATACATTTCAGGATATTATGGATTAGGTGTTTCATTATTCATTGTTACGGTTGCATTCTCTGCCTTATTAATTTTGTTAGTTGGTTTTGATATTCCAGGTAAAATTTATAAACTATCCGTGGCTAAATGATTGGa > 2:156596/1‑140 (MQ=255)
gCTACATACATTTCAGGATATTATGGATTAGGTGTTTCATTATTCATTGTTACGGTTGCATTCTCTGCCTTATTAATTTTGTTAGTTGGTTTTGATATTCCAGGTAAAATTTATAAACTATCCGTGGCTAAATGATTGGa > 2:81738/1‑140 (MQ=255)
gCTACATACATTTCAGGATATTATGGATTAGGTGTTTCATTATTCATTGTTACGGTTGCATTCTCTGCCTTATTAATTTTGTTAGTTGGTTTTGATATTCCAGGTAAAATTTATAAACTATCCGTGGCTAAATGATTGGa > 2:655914/1‑140 (MQ=255)
gCTACATACATTTCAGGATATTATGGATTAGGTGTTTCATTATTCATTGTTACGGTTGCATTCTCTGCCTTATTAATTTTGTTAGTTGGTTTTGATATTCCAGGTAAAATTTATAAACTATCCGTGGCTAAATGATTGGa > 2:263681/1‑140 (MQ=255)
gCTACACACATTTCAGGATATTATGGATTAGGTGTTTCATTATTCATTGTTACGGTTGCATTCTCTGCCTTATTAATTTTGTTAGTTGGTTTTGATATTCCAGGTAAAATTTATAAACTATCCg > 1:67534/1‑124 (MQ=255)
gCTACACACATTTCAGGATATTATGGATTAGGTGTTTCATTATTCATTGTTACGGTTGCATTCTCTGCCTTATTAATTTTGTTAGTTGGTTTTGATATTCCAGGTAAAATTTATAAACTATCCg < 2:67534/124‑1 (MQ=255)
cTACATACATTTCAGGATATTATGGATTAGGTGTTTCATTATTCATTGTTACGGTTGCATTCTCTGCCTTATTAATTTTGTTAGTTGGTTTTGATATTCCAGGTAAAATTTATAAACTATCCGTGGCTAAATGATTGGAg < 2:145534/140‑1 (MQ=255)
catacatTTCAGGATATTATGGATTAGGTGTTTCATTATTCATTGTTACGGTTGCATTCTCTGCCTTATTAATTTTGTTAGTTGGTTTTGATATTCCAGGTAAAATTTATAAACTATCCGTGGCTAAATGATTGGAGGCt < 2:42525/140‑1 (MQ=255)
atacatTTCAGGATATTATGGATTAGGTGTTTCATTATTCATTGTTACGGTTGCATTTTCTGCCTTATTAATTTTGTTAGTTGGTTTTGATATTCCAGGTAAAATTTATAAACTATCCGTGGCTAAATGATTGGAGGCtt > 1:756729/1‑140 (MQ=255)
atacatTTCAGGATATTATGGATTAGGTGTTTCATTATTCATTGTTACGGTTGCATTCTCTGCCTTATTAATTTTGTTAGTTGGTTTTGATATTCCAGGTAAAATTTATAAACTATCCGTGGCTAAATGATTGGAGGCtt > 2:395096/1‑140 (MQ=255)
atacatTTCAGGATATTATGGATTAGGTGTTTCATTATTCATTGTTACGGTTGCATTCTCTGCCTTATTAATTTTGTTAGTTGGTTTTGATATTCCAGGTAAAATTTATAAACTATCCGTGGCTAAATGATTGGAGGCtt > 2:6858/1‑140 (MQ=255)
atacatTTCAGGATATTATGGATTAGGTGTTTCATTATTCATTGTTACGGTTGCATTCTCTGCCTTATTAATTTTGTTAGTTGGTTTTGATATTCCAGGTAAAATTTATAAACTATCCGTGGCTAAATGATTGGAGGCtt > 1:629385/1‑140 (MQ=255)
atacatTTCAGGATATTATGGATTAGGTGTTTCATTATTCATTGTTACGGTTGCATTCTCTGCCTTATTAATTTTGTTAGTTGGTTTTGATATTCCAGGTAAAATTTATAAACTATCCGTGGCTAAATGATTGGAGGCtt > 2:133623/1‑140 (MQ=255)
atTTCAGGATATTATGGATTAGGTGTTTCATTATTCATTGTTACGGTTGCATTCTCTGCCTTATTAATTTTGTTAGTTGGTTTTGATATTCCAGGTAAAATTTATAAACTATCCGTGGCTAAATGATTGGAGGCTTTATg < 1:152439/140‑1 (MQ=255)
tttCAGGATATTATGGATTAGGTGTTTCATTATTCATTGTTACGGTTGCATTCTCTGCCTTATTAATTTTGTTAGTTGGTTTTGATATTCCAGGTAAAATTTATAAACTATCCGTGGCTAAATGATTGGAGGCTTTATGa > 1:912262/1‑140 (MQ=255)
ttCAGGATATTATGGATTAGGTGTTTCATTATTCATTGTTACGGTTGCATTCTCTGCCTTATTAATTTTGTTAGTTGGTTTTGATATTCCAGGTAAAATTTATAAACTATCCGTGGCTAAATGATTGGAGGCTTTATGat > 2:502342/1‑140 (MQ=255)
ttCAGGATATTATGGATTAGGTGTTTCATTATTCATTGTTACGGTTGCATTCTCTGCCTTATTAATTTTGTTAGTTGGTTTTGATATTCCAGGTAAAATTTATAAACTATCCGTGGCTAAATGATTGGAGGCTTTATGat > 2:650526/1‑140 (MQ=255)
ttCAGGATATTATGGATTAGGTGTTTCATTATTCATTGTTACGGTTGCATTCTCTGCCTTATTAATTTTGTTAGTTGGTTTTGATATTCCAGGT‑AAATTTATAAACTATTCGTTGCTTAATGGTTTGAGGCTTTATGatt > 2:36644/1‑140 (MQ=255)
aGGATATTATGGATTAGGTGTTTCATTATTCATTGTTACGGTTGCATTCTCTGCCTTATTAATTTTGTTAGTTGGTTTTGATATTCCAGGTAAAATTTATAAACTATCCGTGGCTAAATGATTGGa > 1:874347/1‑126 (MQ=255)
aGGATATTATGGATTAGGTGTTTCATTATTCATTGTTACGGTTGCATTCTCTGCCTTATTAATTTTGTTAGTTGGTTTTGATATTCCAGGTAAAATTTATAAACTATCCGTGGCTAAATGATTGGa < 2:874347/126‑1 (MQ=255)
aGGATATTATGGATTAGGTGTTTCATTATTCATTGTTACGGTTGCATTCTCTGCCTTATTAATTTTGTTAGTTGGTTTTGATATTCCAGGTAAAATTTATAAACTATCCGTGGCTAAATGATTGGAGGCTTTATGattaa > 2:434112/1‑140 (MQ=255)
gATATTATGGATTAGGTGTTTCATTATTCATTGTTACGGTTGCATTCTCTGCCTTATTAATTTTGTTAGTTGGTTTTGATATTCCAGGTAAAATTTATAAACTATCCGTGGCTAAATGATTGGAGGCTTTATGattaatt > 1:170748/1‑140 (MQ=255)
gATATTATGGATTAGGTGTTTCATTATTCATTGTTACGGTTGCATTCTCTGCCTTATTAATTTTGTTAGTTGGTTTTGATATTCCAGGTAAAATTTATAAACTATCCGTGGCTAAATGATTGGAGGCTTTATGattaatt > 1:71768/1‑140 (MQ=255)
gATATTATGGATTAGGTGTTTCATTATTCATTGTTACGGTTGCATTCTCTGCCTTATTAATTTTGTTAGTTGGTTTTGATATTCCAGGTAAAATTTATAAACTATCCGTGGCTAAATGATTGGAGGCTTTATGattaatt > 2:34743/1‑140 (MQ=255)
ttatGGATTAGGTGTTTCATTATTCATTGTTACGGTTGCATTCTCTGCCTTATTAATTTTGTTAGTTGGTTTTGATATTCCAGGTAAAATTTATAAACTATCCGTGGCTAAATGATTGGAGGCTTTATGATTAATTATgg < 2:324189/140‑1 (MQ=255)
tatGGATTAGGTGTTTCATTATTCATTGTTACGGTTGCATTCTCTGCCTTATTAATTTTGTTAGTTGGTTTTGATATTCCAGGTAAAATTTATAAACTATCCGTGGCTAAATGATTGGAGGCTTTATGATTAATTATGGc > 2:588876/1‑140 (MQ=255)
tatGGATTAGGTGTTTCATTATTCATTGTTACGGTTGCATTCTCTGCCTTATTAATTTTGTTAGTTGGTTTTGATATTCCAGGTAAAATTTATAAACTATCCGTGGCTAAATGATTGGAGGCTTTATGATTAATTATGGc > 2:566915/1‑140 (MQ=255)
tatGGATTAGGTGTTTCATTATTCATTGTTACGGTTGCATTCTCTGCCTTATTAATTTTGTTAGTTGGTTTTGATATTCCAGGTAAAATTTATAAACTATCCGTGGCTAAATGATTGGAGGCTTTATGATTAATTATGGc > 2:249818/1‑140 (MQ=255)
tatGGATTAGGTGTTTCATTATTCATTGTTACGGTTGCATTCTCTGCCTTATTAATTTTGTTAGTTGGTTTTGATATTCCAGGTAAAATTTATAAACTATCCGTGGCTAAATGATTGGAGGCTTTATGATTAATTATGGc > 2:291247/1‑140 (MQ=255)
tatGGATTAGGTGTTTCATTATTCATTGTTACGGTTGCATTCTCTGCCTTATTAATTTTGTTAGTTGGTTTTGATATTCCAGGTAAAATTTATAAACTATCCGTGGCTAAATGATTGGAGGCTTTATGATTAATTATGGc > 1:111356/1‑140 (MQ=255)
|
GGGTTGGTTCCAAAATTTATATATGATTACTTTCCAACAAAATTAAGAGGATTAGGGACCGGTCTTATTTATAACTTAGGGGCAACTGGAGGAATGGCCGCACCTGTATTAGCTACATACATTTCAGGATATTATGGCTTAGGTGTTTCATTATTCATTGTTACGGTTGCATTCTCTGCCTTATTAATTTTGTTAGTTGGTTTTGATATTCCAGGTAAAATTTATAAACTATCCGTGGCTAAATGATTGGAGGCTTTATGATTAATTATGGC > NC_000913/4505030‑4505301
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
GATK/CNVnator alignment
N/A
